lowQualScore                  :                                                    1                                                           111                   4444                  222222222                                       1111111                1111   11            222222222222                                        1                                          111                                                                                  33333333       1  11111               22222222222                                                                22222         1       11     1   111                   11111  1                               1          3333333      1      11111111                      22    1   111                                                      11                              11                                                     2222222222  11                                                                                                                                                                                                                                 22222222222       111                                          1                                                                                             1                  1     1                                
lowQualScore                  :    6                                     0         5                                         6       6   99    111                   1111  3   999   66    000000000         6666  555  666      555    44 0000000   77777  33 2  1111   22     33 2 0 666666666666  55   2        888     33      5 4     0  33      99         99999999999    2 22  777   5                 2         2  2 2       999999         44       3 7      33   00000000   555 2  44444    3   77777  22222222222  44  0 555  3    22             22 44             2 3  3 3     44444   0     2 0     88     3   888      2 9  5  44   88888  1 0       5   3      3 22  2    3    3     6666666   3  1      00000000 7777        3  0     22    6   222            77777    2       77777         5       5  00  1 77        1   7777  4     00  1  33       0      555             888  77     4 2 1111111111  22     2      5555   5555 9999     0   2   33  3 44     7777                  1   5               2          44     3                    555  3       3        0                                   7    8888         888   33      22222222222       333             777    6666 1    5555        2                 33 33  66            2          2  66666                   444              8              555 4 2   3                             1  
lowQualScore                  :    .                                     .         .                                         .       .   ..    ...                   ....  .   ...   ..    .........         ....  ...  ...      ...    .. .......   .....  .. .  ....   ..     .. . . ............  ..   .        ...     ..      . .     .  ..      ..         ...........    . ..  ...   .                 .         .  . .       ......         ..       . .      ..   ........   ... .  .....    .   .....  ...........  ..  . ...  .    ..             .. ..             . .  . .     .....   .     . .     ..     .   ...      . .  .  ..   .....  . .       .   .      . ..  .    .    .     .......   .  .      ........ ....        .  .     ..    .   ...            .....    .       .....         .       .  ..  . ..        .   ....  .     ..  .  ..       .      ...             ...  ..     . . ..........  ..     .      ....   .... ....     .   .   ..  . ..     ....                  .   .               .          ..     .                    ...  .       .        .                                   .    ....         ...   ..      ...........       ...             ...    .... .    ....        .                 .. ..  ..            .          .  .....                   ...              .              ... . .   .                             .  
lowQualScore                  :    0                                     8         0                                         7       0   22    777                   2222  6   222   33    888888888         2222  666  888      888    66 8888888   55555  77 9  9999   55     99 9 1 111111111111  99   7        444     22      1 8     6  44      99         77777777777    2 99  444   3                 2         8  2 2       666666         33       9 9      33   44444444   666 3  22222    1   77777  00000000000  22  6 444  1    22             88 22             2 1  1 1     66666   4     9 2     33     3   111      6 8  7  22   33333  4 2       2   3      2 99  2    4    0     5555555   1  2      22222222 1111        3  4     99    7   888            11111    5       11111         7       7  11  2 22        4   1111  3     77  9  99       8      444             777  77     4 7 3333333333  44     4      7777   7777 3333     9   9   99  3 66     1111                  8   1               9          22     1                    444  1       1        4                                   3    2222         555   99      00000000000       999             999    1111 9    3333        9                 11 11  11            2          5  22222                   777              5              000 3 9   3                             5  
consensus                     : AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTAAAAAG--GT-TAA---TTCGNGGATNGC-N----TTTTTGTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC--ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAANG--TT--AAAAAACAAACTACAAGTCGCT-CAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTA-TAACT-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNA--AACAACTAAGACTNA-AT-C-ATGTT---CNTAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAACNTATCTTCANGANAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCNCACGCGGTTTAGNGAAAG-------TAA-TTTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAGTTT-ACGACATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCAAATGTCTACATTCTTAAGATTTC---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AATTTTT-TAAAAAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
Reference ( gi|116238 )       : AAAATTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGGGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTAAAAAAAAGT-TAA---TTCGCGGATTGC-T----TTTTTATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTT--ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--CAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTAGTA-TAAC--------CTG--TG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAA--AACAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTT---AATAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAAATTATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTGTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------AGTCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTAAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCAAATGTCTACATTCTTAACATTTC---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AATTTTT-TAAAAAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCTTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAAATATTTTACTTATTT---A-T-TTTATTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116239                     : AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGAAAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTTAAAA-AAGT-TAA---TTCGCGGATTGC-T----TTTTTATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC--ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTGCAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACAATT---C-TTATTCAACTTATCACCAAGGTCTAGTA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---T-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTCA--AACAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTT---TTTAATATTTTCCGTGGCA--CCGCG-CCAACATATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AGGGGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAGTTG-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTAAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCAAATGTCTACAAACTTAACATTTC---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AATTTTTAAAAAAAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCTGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTTATGGG-TTATACCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTAATCATCATCAT
gi|116240                     : AAAGTTCAGACAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAAT-CCGTCCCAGGAAAAGATCAAATATTTAGGATAAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGCTAAAA--AAGT-TAA---TTTGCGGATTGC-A----TTTTTATGT---CGA--AACTGTTGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAGGTC--ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAGGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGA-TAG-----AA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTCGAGGACAGAGTAA--AACAACTAAGACTTG-AT-C-ATGTT---TTTAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAACATATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCATACGGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTTTATA-TG-------CGGAACGCATGCTAAAGAGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--TTAG-CTCCTCG-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----GTGAAAATATTTCTTGTATTGTAAAC--CTCATATGTT-TTACTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATGGGTTT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCAAATGTCTACATTCTTAAGATTTA---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AAACTTT-TAAAAAAATCACAAT---TTTA----AGGAAA----GGGACCCCATTGGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTCATGGG-TTATCCCAGG-TT----------ATCTTTAATTTTTA---GATGATTACAATAATTATTTTACTTATTT---ATT-TTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116241                     : AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGAAAATGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTAAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTAAAAAA--GT-TAA---TTCGAGGATTGCAT----TTTTTATAT---GGA--AAATGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAA--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAAGTC--ATTTT--GATTAT-CCTGTTC------------CAGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTA-TAAC--------CGG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-CAA---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGA-AGAGTAA--ATCAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTT---TTTAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCCACTTATCTT------------C-----CATAGGGTGTCTTTTA-TTCATTACCGCACAAAGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTTTATAGTT-------A----CGCATTCT-AAGAGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGAT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTT-ACGAT-TTGAAGAAATTA-AGCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---TAAAAACATTTAT--GTAG-CTCCTCG-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTATTGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCATTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATTTCAAATGTCTATATTCTTAAGATTTC---ATGTATA-----ACT--TTTTTT-------TAA-AATTCTT-TAAAAAA--CACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCTCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATGTTACTTATAT---ATT-TTTCTTGATTTATTAATGTTATTATATCATCATGAT
gi|116242                     : AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAACTATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTAAAA--AAGT-TAA---TTCGCGGATTGC-T----TTTTTATAC---CGA--AACTTTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-TAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC--ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAA--AACAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTT---TTTAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAACATATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAAGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAGTTT--CGAT-TCGGCCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-CTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------GGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-CTATTCAGTT--ATTCA-GGATATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATATTAACAAGTTTATATCAAATGTTTACATTCTTAACATTTC---ATATATATC---ATA--TTTTTT-------T---AAGTTTT-TAA
gi|116243                     : AAAGTGCAGTCATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTAAAATA--GT-TAA---TTCGCGGATTGC-A----TTTTTATAT---CAA--AACTGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-T-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC--ATTTT--GATTATTAGTGCTCGTCT-TGGTATGCTGGTCTTACT----------ACAGAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTTGTA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGTGGGTCGAGGATAGAGTAA--ATCAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTA---TTTAATATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAAAACATCTTCA-----------------ATAGGGTGTCATCTA-TTTATGCTCCTA-GCAGGTTAGAGAAAA-------T---TTGAATATTT-------
gi|116244                     :                                                                          TAAATAATGATAAATATTTATAATGGTGAGGCTCAATATATGTTGACTCAAT-GTTAAAAAAACGTGTAAATTTTCGAGTAAAG-------TTTTTATAT---CGA--AACTTTAATAGCAAGTATC--ACATATT-CCATATATCT-AACAAG-T-ACT--TTAAT--ACAGT---G--------TCA-TTTGGATTAT-TTCAACTTTCAGATTATT--------TCT-TCGTATATCGGCCTCACT----------TCAAAG--TTACCAAATAT--ACCTCAAACCACA-CAAAGTAATGTT-G-TTAGATG---G-GTA-CTAA------ACCAATTTCTCGTATTAAT--------ATG--CGACT-----AACTCTAG-------------------T--AA-G---TG-TTAAGAGTTGAGGACAGAATGA--AACCACTAATAC-TA-AT-TAATGTTTTCAACAAT-TTTa
gi|116245                     :                                                                                                                            ATTGTTAAAAAG--GT-AAA---TTCTAGAATAAA-A----TTTTTGTAT---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATCC-----CT-TA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-ATT------------CT--TTGATACAGTGTC--ATTTT--AATTATGCATGTTCTTCA-TGGTATAGTAGTCTTACA----------GAAACG--TT--AAAGAAAAAGCTACAAGTTGTT-CAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCCATG-ATAGTA-GAGCTA------CTT--TGTCT-----GCGT-CAA-----AATTTA-AAGATCTTGGAATA---C--TTGA-CATTGAAAATAGAAATA--GACAATTAAGATTGA-AT-C-AAGTT---CATAAGATTTT---TAACAATTCTTGTCCATCTTATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTTTTAA-TTTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTTACAACATCA---ACGTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTAGAAT-CAATTACACCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCATTAATTT--TTAAAAA-GAAGTG---AAGAA----TTAT--CTAT--TCGT-G-CAAATGGAA--AATGTAGAG-AAATGT----GA----------ATTCACTTT-TTA--
gi|116246                     :                                                                                                                            ATTGTTAAAAA---GG-TAAC--TTCTAGAATAAA-T----ATTTTGTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTTAGAAC---------GA---CT-----------CT--TTG-T--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC--ATTTT--TATTATGCATGTTCTTCA-TGGTATAGTGGTCTTACA----------AAAATG--TT--TAAGAAAAAGTTACAAGTTGCA-CAAAATACA-------ATGATTAAAG-TTAT---AC---TCAGCTATG-ATAGTA-GAGCTATTTTGTCTG--CG-CCGTCAAATTT-TAA-----AG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATA--GACAATTAAGATCGA-AT-C-AAGTT---CATAAGATTTT-TACGAT---TCATGTCCATCTTATCTTCA--AGAAT-TTTTTTTACA-AAGGTGTC--AAA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAAGAAGTACTTT-TAA-TTTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTAACAACATCG---ACTTTCTTTTAT-----ATTGGCATTTTG-----GATCGGAAT-CAATTAC-CTC-TTAATATTAAGGAAATTA-GAAAAAAAGCATCAA--T--TTAAAAAAGAAGTG---AAGAAATATCTAT--------TCGT-G-C----------AAT----GGAAAATGTAGAGGAA----TGTTAATTTATTTT-TTATTAA-TTAATTTGTTTTTTGAAAA-ACCTTTTTTATTGT----TATTTATGTGGATTTAT--AGCT--GT-----GATACAA-AT--TTTAA----------ATATACTTGATAAA---TAACAAA---GTAT--AATTTC-ATATGTTTTGCA-------ATAAATGCCA--ATA--TTTTT-------------ATCT----------ATGACAGTATTTTTA----A--AAA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTTAA-GGG-TTATCCttaaattttttctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttttgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaacttatgggttatcctgtgaaatatatatgttctcaaaattattattattattgtgttatttgt
gi|116247                     :                                                                                                                            ATTGTTAAAAAG--GT-AAA---TTCTAGAATAAA-A----AGTTTGTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTAA--A-----T-TTATC---CTTAA-GAC-AGACTA-TTTGT--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC--ATTTT--GATTATGCATGTCCTTCA-TGGTAAAGTGGTA-TACA----------AAAACG--TT--------TAAGCTATAAGTTGCT-CAAAATAAAATG-A-TTGGATT---T-ATACTCAGCT----ACGA-----TAGTA-GAGCTACT----TTGTCTG-CTTCAA-ATTT-TAA-----AG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGA--AATGAACAATTAAGATTGA-AT-C-AAGTT---CATAAGATTTT---TAACAATTCAAT-CCATGTAATCTTCAAGAAAATGTTA-----CA-ACGGTG---TCTAGTTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTT-TAG-TTTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTTACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATG-----GCTTTTTGGATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTAGAAAAAAAAACA--TAAAT--TTAAAAAAGAAG-T---GAAAAATATCTATTCGTG--CTAATGGAA----------AATGTAGAG-GAATGT----GAA----T-----TT--ATTT-TTT--AT-T--AAATT----TTT----TATTTTTTG-AA---AAACT-TTTTTAT-TA-TTATTAAAATGGATTTATAGCTGT--GATA---C-ATA---TT-T----TA---GATATA-TTTGATGA----ATAACAAA-ATATACTTTCTTAA-GTTTTGCAATAAATGTCAATATA--TTTATCCATGACAT---ATTTTTT-TAAAAAAA-----------------------------GGACCCCATTGGAAATAAG
gi|116248                     :                                                                                                                              TGTTAAAAAG--GT-TAA---TTCTAGAATAAA-A----TTTTTGTAC---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATCC-----CT-TA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-ATT------------CT--TTGATACAGTGTC--ATTTT--GATTATGCATGTTCTACA-TGGTATAGTAGTCTTACA----------AAAACG--TT--AAAGAAAAAGCTACAAGTTGCT-CAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCTATG-ATAGTA-GAGCTA------CTT--TGTCT-----GCGT-CAA-----AATTTA-AAGATCTT--GGGA---TACTTGA-CATTGAAAATAGAAATA--GACAATTAAGATTGA-AT-C-AAGTT---CATAAGATTTT---TAACAATTCTTGTCCATCTTATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTGACACCATCATACAA-CTAGAGGAAG-------TAC-TTTTA-AGTTTATTGTGC----CATGTGTT-AATAGTTTTACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGT-------GAACA---AT---TAT-CTTTTCG-TGCAAATGGAAAATGTAGAG-AAATGT----GAA----TTC--ATTT--TTTATTA--AATT--ATTTA----TTT---ATTTTTCTTTTTA---AAATC-TTTTTAT-TG-TTATT
gi|116249                     :                                                                                                                              TGTTAAAAA------TAA---TTC-CAG---GC-TGAAGTTTCTGTGTAGACAA--CACCGTAATTG----TTTA--AA---TA-TGAAC---CT-CA-GAA-A-AAG--GTTATGCA-ACT------------CT--TTAATACAATGTC--ATTTG--GAGTATGCATCCTCACCT-TGGTA---CAGTC--ACTGTGGTATCTCAAAACA--TT--AAGAAACAGATTACAAACTATT-C-AAACAAAGTT-G-TCAGATT---aatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaactttatgggttatcc
gi|116250                     :                                                                                                                                              AA---TTCACGTCTTAT-A----TTTTTGTTT---CGATTAGCCA--GCTTC---TTAG--AT---TT-TATAA---CT-AA-AA--A-ATG--TTAAT-----GTTCTG--------CC--CCGATATAATGTC--ATTTG--GACTATTCATATTCTTCT-TGGTAC-CCAAGCTTA------------AAAGGG--TT--AAGAAACAAACTCCAAA--ATTGTAAAATAAAATT-GCTAC-AT------TTATT
gi|116251                     :                                                                                                                                                                                                                     AAA---CT-AA--AG--------TTAAT--A-AAT---GGTAAAATACTGATTGATACAATGCC--ATTTG--GACTATTCATGTTCTTCT-TGGTAC-CCAAGCTTAAA----------ACAAAGGCTT--AAGAAACAAATTTCAAATCTGT-AAAAATAAAAGT-G-TTAGATT---CATTA
gi|116252                     :                                                                                                                                                                                                                                -GAGCA-ACTCCTTATC--A-TGT------------CT--TTGATTCAATGTC--ACTAT--GATTATGCCTGCTCTTTA-TGGTATAACGGTCTGACT----------CAGGTT--TT--GAAAAATAAACTGCAAACAACT-CAGAAT-AAGTTAA-TACGATT---atggtgtgggacatagagaaagtgccaacaatggtagtctaatgctgatatgtctttgttgaatgtaaaaaatataaattagcaattacatcttaaccatgtttttaaaatt
gi|116253                     :                                                                                                                                                                                                                                                            --------CC--TTATT-CAATGTC--GGTTT--GACTACACTTGCTCTTTC-AGGTATTCTGGGTTTACT----------AAAAAA--TT--AATAAATAAACT
gi|116254                     :                                                                                                                                                                                                                                                                      --TTA-TACAGTGTC--ATTTT--GATTATGCATATTCTTCA-TGGTATA---GTCTTACA----------AAAACG--TT--AAAGAAAAAGTTACAAGCGGCT-TAAAATAAAATT-A-TTAGATT---T-ATACTCAACT--------ATG-ATAGTA-GAACTT------CTT--TGTCT-----GCGT-CAAATTTTAA---A-GAT---TT----TGGAATA-CTTAACATTGAAAATAGAAATA--GACAATTAAGATTGA-AT-C-ATGTT---CATAATAATTT---TAACAATTCATGTCCATCTTTTCATCAAGAAAAT-TTTA----CA-AAGGTGTCT--TA-TTCACATCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACATT-TAA-TTTTGTTGTG-------C----CATGTATT-AATAGTTTTACAACATCAAAATTCTTTTAT--------AATGGCTTTTTT-----GATTTGAAT-CAATTACACT--ATAATATTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCAT-AAATTAATTAA
gi|116255                     :                                                                                                                                                                                                                                                                               AATGTC--ACTAC--GACTATGCCTGCTC-TATATGGTATTATGGTCTGACT----------CAGGTT--TT--GAAAAATAAACTGCAGACAACT-CAGAATAATATA-A-TACGATT---
gi|116256                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ATTTTTGTTTTTGT-TGGTATGTCGGTTTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAAAAATGTT-G-TACAATT---C-TTTTCTAACTTATCACCAAGGTCTAGTA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAA--AACAACTAAGACTAAGACAC-ATGTT---TTTAAAATTGTCCATGGCA--CCGCG-CCAACATATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTG-TTTATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------TAA-TTTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAACAAGTTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTCATTTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACCTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTAA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCATATGTCTACATTCTTAACATTCC---ATGTATATC---GTA--TTTATT-------T-----TTTTT------AAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAA------TCTCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATCTTTA---GATGATAACTATAATTATTCTACTTATCT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116257                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                    TCCTGCTCGTCT-TGGTATGCCGGTCTTACT----------AAAAAG--TT--AAAACACAAACTACAAGTCACT-CAAAATAAAGTT-G-TACGTTT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAATA-TAAC--------CTG--CG-CT-----ATGT-TAG-----AA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAA--AACAACTAAGACTTA-AT-C-ATGTC---TTTAATATTTTACATGGCA--CCGCG-CCAACATATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAT-------TAA-TTTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAGTTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTAA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAT-CTCCTCG-C----------AGGCAAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGAGAGCCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTTAACAAGTTTATATCAAATGTCTACATTCGTAACATTTC---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AATTTTT-AGAAAAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTGTTTTACTTATTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116258                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TGAAGA-------TAACTTG-GTAGTT-------C----CCAATGTT-TAGAGTTT--TGAG-TTAAGTTCTTTTTATTGT-----GGTGAAATTGAA-----TACTGGAAC-AACCTGT-AT--AC-AT--------AATTA----AATAA--A--A--TT--TTAAACATGAGGTT---AGAAAACACTGGT--TTAA-CTC--TG-C----------GG----------ATTT----GAATTGTT----GTTTAGTGT-TTA--
gi|116259                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTATCGCTTTTAAATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TCGAAGAAATTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTTAAAAAAAAACATTGAT--GTAT-CTCCTGG-C----------AGGCTACAGAAAATTT----GAA----T----ATT-------------------TATG----TTGAAAATATTTCTTATATTGTGAACCACATATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG----T-TTTTGTA-TTGTTACATTT--ACAAGTTTATATCAAATGTCTACATTCTTAAGATTTA---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T-----TT--------AAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----AGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTT----GATGATTGCTATACTTATTTTACTTATTT---ATT-TTTCTTGATTTATTTCTGTTATTTTATCATCAT
gi|116260                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTGCTGT-----TTTGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-GTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAGTAAG
gi|116261                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAGTA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTAT--GTAG-CTCCTCA-C----------AGGCTAGAGAAAATTT----GAC----T----ATTTAA--T-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATG---------AATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG---TT-TTTTGTA-TTGTTAC---------------------ATGTCTACATTCTTAAGCTTTA---ATGTATATC---ATA--TTTTTT-------T---AATTTTT-TAAA--------------------------AA----GGGACCCTGTTGGAAACAAGCGTGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---ATT-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116243                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CATCTAT--TTATGCTCCTAG-C----------AGGTTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTA
gi|116262                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaagtgcagtcatttacagttacatgcaacggtcatgaaattccgtcacaggaaaaggtcaaatatttaggattaactattgacaagttactaaacggtgaggcgatagttgactccattgttaaaatagttaattcgcggattgcatttttatatcaaaactgtcgttattttaaccttcaaactaagagtactttaataagtgccttagtacaatgtcattttgattattagtgctcgtcttggtatgctggtcttactacagagttaaaacacaaactacaagtcactcaaaataaagttgtacgattcttatttaacttatcaccaatgtcttgtataacctgcgctatgttagaaatagttaatgtattgtgggtcgaggatagagtaaatcaactaagacttaatcatgtatttaatattttccatggcaccgcgccaaaacatcttcaatagggtgtCATCTAT--TTATGCTCCTAG-C----------AGGTTAGAGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGAATTGTGAACCACTTATATGTA-TAATTCAATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCACTG---TTATTTTGTA-TTGTAACATTTTAACAAGTGTATTTCAAATGTCTACATTCTTAAAATTTC---ATGTACATC---ATA--TTTTTT-------TTTAAATTTT----AGAAAATCACAAT---CTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGTGTT--T--GT--TGCTTAAAAGGG-TCGTCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---AATGATTACTATAA-----TTATTTAT-------T-TTTCTTGATTTGTTACTGTTATTTTATTTTCATGAT
gi|116263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-AGGTACAAGATAATTCAATG---CT-TTTTGGA-TTGTTACATTTGAACAAGTTCATAGCAAATTTCTACATTCTTACGATTTA---ATGTATATC---ATA--TTTAACAAAAC--T---AATTTTT--AAAAATATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATCAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA-----TTTATTTATTTTACA-TATTTACTGTTTTATTACTGTTATTTTATTATCATGAT
gi|116264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ACTTAT------TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAAT----TT-TTTTGTA-TTGTTACATTTCAACAAGTTTATATCAAATGTAAACATTCTTAAGATTTA---AT--ATATC---ATATTTTTTTT-------T---AATATTT---AAAAAATCACAAT---TTTA----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCACGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---ATT-TTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116265                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        A--TTTATT-------TCA-AACTAAT-TACAAAATTCACAACA--TTTATATTAATGAACTTGAGGACCCCTTTGAAAACAAGCGCATTTAT--GT--TGCTTTAATGGG-TCA-CCAAGG-TTGCGAGACAACATATTTATTTATTA----ATAAT
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  T---TTTA----A---AA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTT-ATGGG-TTATCC
gi|116266                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tgttaaaaaggttaattctagaataaaatttttgtacagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttgattatgcatgttctacatggtatagtagtcttacaaaaacgttaaagaaaaagctacaagttgctcaaaataaaatgattagatttattctcagctatgatagtagagctactttgtctgcgtcaaaatttaaagatcttgggatacttgacattgaaaatagaaatagacaattaagattgaatcaagttcataagatttttaacaattcttgtccatcttatcttcaagaaaattttacaacggtgtctaattgacaccatcatacaactagaggaagtacttttaagtttattgtgccatgtgttaatagttttacaacatcaactttcttttataatggcattttggattggaatcaattaccccatactattaaggaaattagaaaaaagcataaatttaaaaaagaagtgaacaattatcttttcgtgcaaatggaaaatgtagagaaatgtgaattcattttttattaaattatttatttatttttctttttaaaatctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatA----GGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116267                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   A----GGGACCT-TGTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTATTT---A-T-TTTCTTGACTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116268                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACCCCATTCGAATTAAGCGCATT--TATGT--TGCTTTAATGGG-TCATCTCAGGTTT-----GTGAGATC
gi|116269                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CCCCGTTGAAAATAAGCGCATG--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCGAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATAATTATTTTACTTTTTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATTATCATCAT
gi|116270                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTAGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGGATTATCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATTTTTAATAGATGATTACTATAATTATTTCACTTTTTT---A-T-TTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111                     11111                                                                                  111   11            222222222222                                                                                                                                                                111  33333333          11111          11111111111                                                                         11      11     11                         111111                                             222222222222222222           11111111                       22   22                                                             1                              11                                                          11111              1111        1111                                                                                                                                                                                 111                            11111111111        11      1111111111111                                                                                                                                                              1                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            5           77    000               3     55555        33    1 33     3    555   444  999      555    44  888888  1  555  2  2   000   11     33 2 2 000000000000  55   1         2     33      3 3     2  2      88          8888888888 2   1 2      1         2     1           0  2 2        8888         3        3 4        555  77777777    33 2  33333    2     77777777777  33    555  2    00             11              1 2  2      11   33     00      22     66   2 1  3      5  6   3  777777  9         88  3      1  1  1    6    1     000000000000000000  2        00000000 6666        3     9   77   11   666            66666    1       66666         5       5   0  0 66    0       4444  3     00  1  33       0      555             5   2      33   999  33333    2         1111   5555 5555     0   2   33  3 44     6666                  1                   2          33     2                    444  2                         33               33     2      5555    000         777 66666  33      88888888888     2  00      4444444444444   5555   33  777   2 5555 1    5555                          22 22  55            2          2  55555                   444             444 2                3                                  0  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           ..    ...               .     .....        ..    . ..     .    ...   ...  ...      ...    ..  ......  .  ...  .  .   ...   ..     .. . . ............  ..   .         .     ..      . .     .  .      ..          .......... .   . .      .         .     .           .  . .        ....         .        . .        ...  ........    .. .  .....    .     ...........  ..    ...  .    ..             ..              . .  .      ..   ..     ..      ..     ..   . .  .      .  .   .  ......  .         ..  .      .  .  .    .    .     ..................  .        ........ ....        .     .   ..   ..   ...            .....    .       .....         .       .   .  . ..    .       ....  .     ..  .  ..       .      ...             .   .      ..   ...  .....    .         ....   .... ....     .   .   ..  . ..     ....                  .                   .          ..     .                    ...  .                         ..               ..     .      ....    ...         ... .....  ..      ...........     .  ..      .............   ....   ..  ...   . .... .    ....                          .. ..  ..            .          .  .....                   ...             ... .                .                                  .  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            7           99    000               3     22222        88    0 88     1    444   555  111      444    22  333333  6  000  9  7   000   77     77 7 7 444444444444  66   9         2     11      1 7     0  0      44          8888888888 0   0 0      8         1     4           3  1 1        8888         2        0 9        000  66666666    99 9  22222    9     77777777777  99    000  9    66             33              0 9  9      99   66     11      77     55   8 0  1      1  2   1  666666  8         88  1      0  0  2    5    0     999999999999999999  9        22222222 5555        1     2   33   00   222            77777    7       77777         3       3   7  5 11    2       7777  4     00  1  77       1      000             0   7      77   333  33333    7         3333   7777 0000     3   7   77  1 22     5555                  8                   9          99     9                    777  7                         77               77     7      1111    777         333 77777  44      11111111111     5  44      7777777777777   7777   77  333   7 7777 1    0000                          99 99  88            1          4  99999                   444             777 7                3                                  7  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNATTTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---ACT-------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAACNTA-TCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
Reference ( family-605 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAG----GTTAATTCGNGGATNGCNTTTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---ACT-------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTCNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAACNTA-TCTTCANGANAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCNCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGACATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116238                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGGGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAAAA--GTTAATTCGCGGATTGCTTTTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTT-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTCAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAATGTCTAGTATA---AC--------CTGT--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTAATAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAAATTA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TGTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GT-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTAAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCTTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-ATATTTTACTTATTTA-TTTTATTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116239                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGAAAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTTAAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTTTTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTGC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACAATTC---TTATTCAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---T-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTCAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCGTGGCA--CCGCG--CCAACATA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AGGGG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAGTTG-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTAAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAA-ACTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TTAAAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCTGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTTATGGG-TTATACCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTAATCATCATCAT
gi|116240                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGACAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAAT-CCGTCCCAGGAAAAGATCAAATATTTAGGATAAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGCT-AAAAAA----GTTAATTTGCGGATTGCATTTTT-ATGT---CGA--AACTGTTGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAGGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAGGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGA-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTCGAGGACAGAGTAAAACAACTAAGACTTG-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAACATA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCATACGGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TTTATA-TG-------CGGAACGCATGCTAAAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATTTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----GTGAAAATATTTCTTGTATTGTAAAC--CTCATATGTT-TTACTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATGGGTTT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAACT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGAAA----GGGACCCCATTGGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTCATGGG-TTATCCCAGG-TT----------ATCTTTAATTTTTA---GATGATTACAATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116241                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGAAAATGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTAAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGAGGATTGCATTTTTTATAT---GGA--AAATGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-A-ACT--TTAAA--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAAGTC-ATTTT--GATTATCC-TGTTC-----------CAGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC--------CGGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAA---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGA-AGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCCACTTA-TCTTC-----------------CATAGGGTGTCTTTTA-TTCATTACCGCACAAAGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------A----CGCATTCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGAT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTT-ACGAT-TTGAAGAAATTA-AGCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---TAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTATTGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCATTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATTTCAAATGTC--TATAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATA-----A-----CT--TTTTTT-------TAA-AATTC-TT-TAAAAAA---------------C----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCTCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATGTTACTTATATATTTTTCTTGATTTATTAATGTTATTATATCATCATGAT
gi|116242                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAACTATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTTTTTT-ATAC---CGA--AACTTTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-TAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAACATA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAAGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGCCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-CTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCG---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-CTATTCAGTT--ATTCA-GGATATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATATTAACAAG--TTTATATCAAATGTT--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATATATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAGTT-TT-TAA
gi|116243                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTGCAGTCATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAATA----GTTAATTCGCGGATTGCATTTTT-ATAT---CAA--AACTGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---CT-AA-GAG-T-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACT----------A-CAGAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATTC---TTATTTAACTTATCACCAATGTCTTGTATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGTGGGTCGAGGATAGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTATTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG--CCAAAACA-TCTTCA-----------------ATAGGGTGTCATCTA-TTTATGCTCCTA-GCAGGTTAGAGAAAA-------TTTGA------ATATTTA
gi|116244                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAAATAATGATAAATATTTATAATGGTGAGGCTCAATATATGTTGACTCAAT-GTT-AAAAAAACGTGTAAATTTTCGAGTAAAGTTTTT-ATAT---CGA--AACTTTAATAGCAAGTATC--ACATATT-CCATATATCT-AACAAG-T-ACT--TTAAT--ACAGT---G--------TCA-TTTGGATTATTTCAACTTTCAGATTAT--------TTCTTCGTATATCGGCCTCACT----------T-CAAAG-TTACCAAATATACCTC-AAACCACACAAAGTAATGTT-G-TTAGATGG---GTA-CTAA------ACCAATTTCTCGTATT---AAT-------ATGC--GACT-----AACTCTAG--------------T--AA-G---TG-TTAAGAGTTGAGGACAGAATGAAACCACTAATACTAA-TT-AATGTTTTCAACAATTTT
gi|116245                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAATTTTT-GTAT---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---CT-TA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--AATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACA----------G-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGTTCAAAATAAA-------ATGATTA----GATTTA--TTCTCAGCCATG-ATAGTAGAGCTACT-------TTGT----CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTTGGAATA---C--TTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGT-CCATCTTA-TCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTTTT---A------AT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACGTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTAGAAT-CAATTACACCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCATTAATTT--TTAAAAA-GAAGTG---AAGAA----TTATCTAT--TCGT---GCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GA----------ATTCACTTT-TTA--
gi|116246                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAACTTCTAGAATAAATATTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTTAGAAC---------GA---CT-----------CT--TTG-T--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--TATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACA----------A-AAATG-TTTAAGAAAAAGTTAC-AAGTTGCACAAAATACAAT-------GATTAAAGTTAT---ACT---CAGCTATG-ATAGTAGA---GCTATTTTGTCTGC--G-CCGTCAAATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATCGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTTT-ACGAT---TCATGT-CCATCTTA-TCTTCAAGA--AT-TTTTTTTACA-AAGGTGTC--AAA-TTCACACCATCATGCAACT-AGAAGAAG-------T---ACTTTTAAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAG-TTTAACAACATCG---ACTTTCTTTTAT-----ATTGGCATTTTG-----GATCGGAAT-CAATTAC-CTC-TTAATATTAAGGAAATTA-GAAAAAAAGCATCAA--T--TTAAAAAAGAAGTG---AAGAAATATCTAT---------TC--GT-----G-----CAAT-GGAAAATGTAGAGGAA----TGTTAATTTATTTT-TTATTAA-TTAATTTGTTTTTTGAAAA-ACCTTTTTTATTGT----TATTTATGTGGATTTAT--AGCT--GT-----GATACAA-AT--TTTAA------------ATA----TAC---TTGATAA------ATAACAAA-GTA--TAATT-TCATATG---TTTTGCAATAAATGCCA--A-----TA--TTTTT-------------ATCT------------------------ATG----ACA--GTATTTTT-A----A--AAA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTTAA-GGG-TTATCCttaaattttttctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttttgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaacttatgggttatcctgtgaaatatatatgttctcaaaattattattattattgtgttatttgt
gi|116247                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAAGTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTAA--A-----T-TTATC---CTTAA-GAC-AGACTA-TTTGT--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTAT-ACA----------A-AAACG-TT------TAAGCTAT-AAGTTGCTCAAAATAAAATG-A-TTGGATTT---ATACTCAGCT----ACGA-----TAGTAGAGCTACT-------TTGTCTG-CTTCAA-ATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATGAACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACA--ATTCAATCCA-TGTAATCTTCAAGAAAATGTTA-----CA-ACGGTGTCT---AGTTCACACCATCATGCAACT-AGAGGAAG-------T---ACTTTTAGT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAG-TTTTACAACATCAACTTTCTTTTAT--------AATG-----GCTTTTTGGATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTAGAAAAAAAAACA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGTG---AAAAA---------TAT-CTATTC--GT-----G-----CTAATGGAAAATGTAGAGGAA----TGTGAATTT-ATTT-TTT--AT-T--AAATT----TTT----TATTTTTTGAAA----AACT-TTTTTAT-TA-TTATTAAAATGGATTTATAGCTGT--GATA---C-ATA---TT-T----TA--GATATA-TTTGATGA------ATAACAAA-ATA--TACTT-TCTTAAG---TTTTGCAATAAATGTCAATA-----TA--TTTATCCATGACAT---ATTTT-TT-TAAAAAA-------------A------------------------------------GGACCCCATTGGAAATAAG
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTT-AAAAAG----GTTAATTCTAGAATAAAATTTTT-GTAC---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---CT-TA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGCTCAAAATAAA-------ATGATTA----GATTTA--TTCTCAGCTATG-ATAGTAGAGCTACT-------TTGT----CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTT--GGGA---TACTTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGT-CCATCTTA-TCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTGACACCATCATACAA-CTAGAGGAAG-------T---A------CT-TTTA-AGTTTATTGTGC----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGT-------GAACA---AT-TAT-CTTTTCGTGCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GAA----TTC--ATTT--TTTATTA--AATT--ATTTA----TTT---ATTTTTCTT
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTAAAA---TC-TTTT-TATTGTTA----TTAATGTGGATTTATAGC---TG-CGATACATATTTTAAATATATTT-G-ATGAATAAC---AAAGAATA--ATTTCA-------T---AAGTTATG-TAATAAATGCCAATATATTTATCCATGACATTAT---TTTTA----A---AA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTT-ATGGG-TTATCCtttaaaatctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaactttatgggttatcc
gi|116249                     : tgttaaaaaggttaattctagaataaaatttttgtacagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttgattatgcatgttctacatggtatagtagtcttacaaaaacgttaaagaaaaagctacaagttgctcaaaataaaatgattagatttattctcagctatgatagtagagctactttgtctgcgtcaaaatttaaagatcttgggatacttgacattgaaaatagaaatagacaattaagattgaatcaagttcataagatttttaacaattcttgtccatcttatcttcaagaaaattttacaacggtgtctaattgacaccatcatacaactagaggaagtacttttaagtttattgtgccatgtgttaatagttttacaacatcaactttcttttataatggcattttggattggaatcaattaccccatactattaaggaaattagaaaaaagcataaatttaaaaaagaagtgaacaattatcttttcgtgcaaatggaaaatgtagagaaatgtgaattcattttttattaaattatttatttatttttcttTGTT-AAAAA-------TAATTCCAGGCTGAAGTTTCT-GTGTAGACAA--CACCGTAATTG----TTTA--AA---TA-TGAAC---CT-CA-GAA-A-AAG--GTTATGCA-ACT------------CT--TTAATACAATGTC-ATTTG--GAGTATGCATCCTCACCTTGGTA---CAGTC--ACTGTGGTATCTCA-AAACA-TTAAGAAACAGATTAC-AAACTATTC-AAACAAAGTT-G-TCAGATT
gi|116250                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTCACGTCTTATATTTTT-GTTT---CGATTAGCCA--GCTTC---TTAG--AT---TT-TATAA---CT-AA-AA--A-ATG--TTAAT-----GTTCTG--------CC--CCGATATAATGTC-ATTTG--GACTATTCATATTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTA------------A-AAGGG-TTAAGAAACAAACTCCAAAATTG--TAAAATAAAATT-GCTAC-AT-----TTATT
gi|116251                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AAA---CT-AA--AG--------TTAAT--A-AAT---GGTAAAATACTGATTGATACAATGCC-ATTTG--GACTATTCATGTTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTAAA----------ACAAAGGCTTAAGAAACAAATTTC-AAATCTGTAAAAATAAAAGT-G-TTAGATTCA--TTA
gi|116252                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -GAGCA-ACTCCTTATC--A-TGT------------CT--TTGATTCAATGTC-ACTAT--GATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AAACAACTCAGAAT-AAGTTAA-TACGATTatggtgtgggacatagagaaagtgccaacaatggtagtctaatgctgatatgtctttgttgaatgtaaaaaatataaattagcaattacatcttaaccatgtttttaaaatt
gi|116253                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --------CC--TTATT-CAATGTC-GGTTT--GACTACACTTGCTCTTTCAGGTATTCTGGGTTTACT----------A-AAAAA-TTAATAAATAAACT
gi|116254                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --TTA-TACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATATTCTTCATGGTATA---GTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGTTAC-AAGCGGCTTAAAATAAAATT-A-TTAGATTT---ATACTCAACT-ATGA--------TAGTAGA---ACTTCTTTGTCTGC--G-TC-----AAAT-TTTAA---A-GAT---TT----TGGAATA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CATGTTCATAAT-AATTT---TAACAATTCATGT-CCATCTTT-TCATCAAGAAAAT-TTTA----CA-AAGGTGTCT--TA-TTCACATCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACATT-T---A------AT-TTTGTTGTG-------C----CATGTATT-AATAGTTTT-ACAACATCAAAATTCTTTTAT--------AATGGCTTTTTT-----GATTTGAAT-CAATTACACT--ATAATATTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCAT-AAATTAATTAA
gi|116255                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AATGTC-ACTAC--GACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AGACAACTCAGAATAATATA-A-TACGATT
gi|116256                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTTTTGTTTTTGTTGGTATGTCGGTTTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAAAAATGTT-G-TACAATTC---TTTTCTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTAAGACACATGTTTTTAAA-ATTGTCCATGGCA--CCGCG--CCAACATA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTG-TTTATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAACAAGTTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTCATTTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACCTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTAA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCATATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTC-C-ATGTATATC---G-----TA--TTTATT-------T-----TTT-TT------AA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAA------TCTCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATCTTTA---GATGATAACTATA---A-TTATTCTACTTATCTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116257                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGTTTC---TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAATATA---AC--------CTGC--G-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTCTTTAAT-ATTTTACATGGCA--CCGCG--CCAACATA-TCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAT-------T---A------AT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTAA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CAAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGAGAGCCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCGTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-AGAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTGTTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116258                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tGAAGA-------T---A------AC-TTGGTAGTT-------C----CCAATGTT-TAGAG-TTT--TGA-GTTAAGTTCTTTTTATTGT-----GGTGAAATTGAA-----TACTGGAAC-AACCTG---TATAC-AT--------AATTA----AATAA--A--A--TT--TTAAACATGAGGTT---AGAAAACACTGGTTTAA-CTC--T--GCG---G----------------ATTT----GAATTGTT----GTTTAGTGT-TTA--
gi|116259                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               tTTTTATCGCTTTTAAATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TCGAAGAAATTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTTAAAAAAAAACATTGATGTAT-CTCCTG--GCA---GG-----CTAC-AGAAAATTT----GAA----T----ATT-------------------TATG----TTGAAAATATTTCTTATATTGTGAACCACATATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG----T-TTTTGTATTGTTACATTT--ACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T-----TT---------AAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----AGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTT----GATGATTGCTATA---C-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTTCTGTTATTTTATCATCAT
gi|116260                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTTGCTGT-----TTTGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-GTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAGTAAG
gi|116261                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TAAGTA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--ACA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAC----T----ATTTAATTT---A--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATG---------AATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG---TT-TTTTGTATTGTTACAT-----------------------GTC--TACAT-TCTTAAG---CTTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAA--------------------------------------------------GGGACCCTGTTGGAAACAAGCGTGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116262                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CATCTATTTATGCTCCTA--GCA---GG-----TTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGAATTGTGAACCACTTATATGTA-TAATTCAATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCACTG---TTATTTTGTATTGTAACATTTTAACAAG--TGTATTTCAAATGTC--TACAT-TCTTAAA---ATTT-C-ATGTACATC---A-----TA--TTTTTT-------TTTAAATTT-T----AGAAA-------------ATC----ACA--AT---CTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGTGTT--T--GT--TGCTTAAAAGGG-TCGTCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---AATGATTACTATA---A-TTAT-----TTAT----TTTTCTTGATTTGTTACTGTTATTTTATTTTCATGAT
gi|116263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-AGGTACAAGATAATTCAATG---CT-TTTTGGATTGTTACATTTGAACAAG--TTCATAGCAAATTTC--TACAT-TCTTACG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTAACAAAAC--T---AATTT-TT--AAAAAT-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATCAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATATTTATTTATTTTACATATTTA-CTGT-----TTTATTACTGTTATTTTATTATCATGAT
gi|116264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ACTTAT------TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAAT----TT-TTTTGTATTGTTACATTTCAACAAG--TTTATATCAAATGTA--AACAT-TCTTAAG---ATTT-A-AT--ATATC---A-----TATTTTTTTT-------T---AATAT-TT---AAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCACGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116265                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A--TTTATT-------TCA-AACTA-AT-TACAAAA-------------TTC----ACA--ACA--TTT-ATATTAATGAACTTGAGGACCCCTTTGAAAACAAGCGCATTTAT--GT--TGCTTTAATGGG-TCA-CCAAGG-TTGCGAGACAACATATTTATTTATTA----ATAAT
gi|116266                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A----GGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116267                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         A----GGGACCTTGT-GGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGACTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116268                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACCCCATTCGAATTAAGCGCATT--TATGT--TGCTTTAATGGG-TCATCTCAGGTTT-----GTGAGATC
gi|116269                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  CCCCGTTGAAAATAAGCGCATG--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCGAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATTATCATCAT
gi|116270                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTTAGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGGATTATCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATTTTTAATAGATGATTACTATA---A-TTATTTCACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111                     11111                                                                                   111   11            222222222222                                                                                                                                                                 111  333333333333333          11111          11111111111                                                                         1       11     1                             111111                                  1          3333333                11111111                   1   22   11                                                             1                              11                                                          11111              1111        1111                                                                                                                                                                                 111                            11111111111        11      1111111111111                                                                                                                                                              1                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            5           77    000               3     11111        44    333  3    3    555   444  999      555    44  888888   1 555 2   2   000   11     33 2 2 000000000000  55   1         2     33      3 3     2  2      88          8888888888 2   1 2      1         2     1           2  2 2       777777         1        3 4        555  777777777777777   33  2  33333    2     77777777777  33    555  2    00             11              1 2  2       1   33     1       22  0  2    44 1 555       5  4   3  777777  9         4   3      1  1  1    1    1     3333333 555   2        00000000 6666        3     2   44   99   999            66666    1       66666         5       5   0  0 66    0       4444  3     00  1  33       0      555             5   2      33   999  33333    2         1111   5555 5555     0   2   33  3 44     6666                  1                   2          33     2                    444  2                         33               33     2      5555    000         777 66666  33      88888888888     2  00      4444444444444   5555   33  777   2 5555 1    5555                          22 22  55            2          2  55555                   444             444 2                3                                  0  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           ..    ...               .     .....        ..    ...  .    .    ...   ...  ...      ...    ..  ......   . ... .   .   ...   ..     .. . . ............  ..   .         .     ..      . .     .  .      ..          .......... .   . .      .         .     .           .  . .       ......         .        . .        ...  ...............   ..  .  .....    .     ...........  ..    ...  .    ..             ..              . .  .       .   ..     .       ..  .  .    .. . ...       .  .   .  ......  .         .   .      .  .  .    .    .     ....... ...   .        ........ ....        .     .   ..   ..   ...            .....    .       .....         .       .   .  . ..    .       ....  .     ..  .  ..       .      ...             .   .      ..   ...  .....    .         ....   .... ....     .   .   ..  . ..     ....                  .                   .          ..     .                    ...  .                         ..               ..     .      ....    ...         ... .....  ..      ...........     .  ..      .............   ....   ..  ...   . .... .    ....                          .. ..  ..            .          .  .....                   ...             ... .                .                                  .  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            7           99    000               3     88888        33    222  1    1    444   555  111      444    22  333333   0 000 9   7   000   77     77 7 7 444444444444  66   9         2     11      1 7     0  0      44          8888888888 0   0 0      8         1     4           1  1 1       999999         4        0 9        000  666666666666666   99  9  22222    9     77777777777  99    000  9    66             33              0 9  9       0   66     2       77  2  3    22 0 444       1  5   1  666666  8         2   1      0  5  2    7    0     9999999 000   9        22222222 5555        1     3   22   11   555            77777    7       77777         3       3   7  5 11    2       7777  4     00  1  77       1      000             0   7      77   333  33333    7         3333   7777 0000     3   7   77  1 22     5555                  8                   9          99     9                    777  7                         77               77     7      1111    777         333 77777  44      11111111111     5  44      7777777777777   7777   77  333   7 7777 1    0000                          99 99  88            1          4  99999                   444             777 7                3                                  7  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
Reference ( family-605 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116238                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGGGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAAAA--GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTT-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTCAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTAGTATA---AC---------------CTG--TG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTAATAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--ATT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TGTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GT-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTAAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCTTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-ATATTTTACTTATTTA-TTTTATTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116239                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGAAAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTTAAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTGC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACAATT---C-TTATTCAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---T-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTCAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCGTGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AGGGG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAGTTG-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTAAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAA-ACTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TTAAAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCTGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTTATGGG-TTATACCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTAATCATCATCAT
gi|116240                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGACAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAAT-CCGTCCCAGGAAAAGATCAAATATTTAGGATAAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGCT-AAAAAA----GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGT---CGA--AACTGTTGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAGGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAGGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGA-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTCGAGGACAGAGTAAAACAACTAAGACTTG-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCATACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATA-TG-------CGGAACGCATGCTAAAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATTTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----GTGAAAATATTTCTTGTATTGTAAAC--CTCATATGTT-TTACTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATGGGTTT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAACT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGAAA----GGGACCCCATTGGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTCATGGG-TTATCCCAGG-TT----------ATCTTTAATTTTTA---GATGATTACAATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116241                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGAAAATGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTAAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATAT---GGA--AAATGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAA--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAAGTC-ATTTT--GATTATCC-TGTTC-----------CAGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CGG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAA---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGA-AGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCCA--CTT---ATCTTC-----------------CATAGGGTGTCTTTTA-TTCATTACCGCACAAAGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------A----CGCATTCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGAT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTT-ACGAT-TTGAAGAAATTA-AGCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---TAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTATTGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCATTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATTTCAAATGTC--TATAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATA-----A-----CT--TTTTTT-------TAA-AATTC-TT-TAAAAAA---------------C----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCTCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATGTTACTTATATATTTTTCTTGATTTATTAATGTTATTATATCATCATGAT
gi|116242                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAACTATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAC---CGA--AACTTTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-TAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAAGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGCCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-CTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCG---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-CTATTCAGTT--ATTCA-GGATATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATATTAACAAG--TTTATATCAAATGTT--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATATATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAGTT-TT-TAA
gi|116243                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTGCAGTCATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAATA----GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATAT---CAA--AACTGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-T-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACT----------A-CAGAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTTGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGTGGGTCGAGGATAGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTATTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--AAC---ATCTTCA-----------------ATAGGGTGTCATCTA-TTTATGCTCCTA-GCAGGTTAGAGAAAA-------TTTGAATATTTA
gi|116244                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAAATAATGATAAATATTTATAATGGTGAGGCTCAATATATGTTGACTCAAT-GTT-AAAAAAACGTGTAAATTTTCGAGTAAAGT-TTTT-ATAT---CGA--AACTTTAATAGCAAGTATC--ACATATT-CCATATATC-TAACAAG-T-ACT--TTAAT--ACAGT---G--------TCA-TTTGGATTATTTCAACTTTCAGATTAT--------TTCTTCGTATATCGGCCTCACT----------T-CAAAG-TTACCAAATATACCTC-AAACCACACAAAGTAATGTT-G-TTAGATG---G-GTA-CTAA------ACCAATTTCTCGTATT---AA-------T-------ATG--CGACT-----AACTCTAG--------------T--AA-G---TG-TTAAGAGTTGAGGACAGAATGAAACCACTAATACTAA-TT-AATGTTTTCAACAATTTT
gi|116245                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAT---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--AATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACA----------G-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGTTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCCATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTTGGAATA---C--TTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTTTT---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACGTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTAGAAT-CAATTACACCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCATTAATTT--TTAAAAA-GAAGTG---AAGAA----TTATCTAT--TCGT---GCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GA----------ATTCACTTT-TTA--
gi|116246                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAACTTCTAGAATA-AATATTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTTAGAAC---------GA---C-T----------CT--TTG-T--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--TATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACA----------A-AAATG-TTTAAGAAAAAGTTAC-AAGTTGCACAAAATACA-------ATGATTAAAG-TTAT---AC---TCAGCTATG-ATAGTAGA---GCTATTTTGT-------CTG--CG-CCGTCAAATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATCGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT-TACGAT---TCATGTCCAT--CTT---ATCTTCAAG--AAT-TTTTTTTACA-AAGGTGTC--AAA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAAGAAGTACTTT-T---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAG-TTTAACAACATCG---ACTTTCTTTTAT-----ATTGGCATTTTG-----GATCGGAAT-CAATTAC-CTC-TTAATATTAAGGAAATTA-GAAAAAAAGCATCAA--T--TTAAAAAAGAAGTG---AAGAAATATCTAT---------TC--GT-----G-----CAAT-GGAAAATGTAGAGGAA----TGTTAATTTATTTT-TTATTAA-TTAATTTGTTTTTTGAAAA-ACCTTTTTTATTGT----TATTTATGTGGATTTAT--AGCT--GT-----GATACAA-AT--TTTAA------------ATA----TAC---TTGATAA------ATAACAAA-GTA--TAATT-TCATATG---TTTTGCAATAAATGCCA--A-----TA--TTTTT-------------ATCT------------------------ATG----ACA--GTATTTTT-A----A--AAA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTTAA-GGG-TTATCCttaaattttttctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttttgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaacttatgggttatcctgtgaaatatatatgttctcaaaattattattattattgtgttatttgt
gi|116247                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTAA--A-----T-TTATC---CTTAA-GAC-AGACTA-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACA----------A-AAACG-TT------TAAGCTAT-AAGTTGCTCAAAATAAAATG-A-TTGGATT---T-ATACTCAGCT----ACGA-----TAGTAGAGCTAC-------T-------TTGTCTG-CTTCAA-ATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATGAACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACA--AT----TCAATCCATGTAATCTTCAAGAAAATGTTA-----CA-ACGGTG---TCTAGTTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTT-T---AGT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATG-----GCTTTTTGGATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTAGAAAAAAAAACA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGTG---AAAAA---------TAT-CTATTC--GT-----G-----CTAATGGAAAATGTAGAGGAA----TGTGAATTT-ATTT-TTT--AT-T--AAATT----TTT----TATTTTTTGAAA----AACT-TTTTTAT-TA-TTATTAAAATGGATTTATAGCTGT--GATA---C-ATA---TT-T----TA--GATATA-TTTGATGA------ATAACAAA-ATA--TACTT-TCTTAAG---TTTTGCAATAAATGTCAATA-----TA--TTTATCCATGACAT---ATTTT-TT-TAAAAAA-------------A------------------------------------GGACCCCATTGGAAATAAG
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTT-AAAAAG----GTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAC---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATCC-----C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-ATT------------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGCTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCTATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTT--GGGA---TACTTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTGACACCATCATACAA-CTAGAGGAAG-------T---ACT-TTTA-AGTTTATTGTGC----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGT-------GAACA---AT-TAT-CTTTTCGTGCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GAA----TTC--ATTT--TTTATTA--AATT--ATTTA----TTT---ATTTTTCTT
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTAAAA---TC-TTTT-TATTGTTA----TTAATGTGGATTTATAGC---TG-CGATACATATTTTAAATATATTT-G-ATGAATAAC---AAAGAATA--ATTTCA-------T---AAGTTATG-TAATAAATGCCAATATATTTATCCATGACATTAT---TTTTA----A---AA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTT-ATGGG-TTATCCtttaaaatctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaactttatgggttatcc
gi|116249                     : tgttaaaaaggttaattctagaataaaatttttgtacagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttgattatgcatgttctacatggtatagtagtcttacaaaaacgttaaagaaaaagctacaagttgctcaaaataaaatgattagatttattctcagctatgatagtagagctactttgtctgcgtcaaaatttaaagatcttgggatacttgacattgaaaatagaaatagacaattaagattgaatcaagttcataagatttttaacaattcttgtccatcttatcttcaagaaaattttacaacggtgtctaattgacaccatcatacaactagaggaagtacttttaagtttattgtgccatgtgttaatagttttacaacatcaactttcttttataatggcattttggattggaatcaattaccccatactattaaggaaattagaaaaaagcataaatttaaaaaagaagtgaacaattatcttttcgtgcaaatggaaaatgtagagaaatgtgaattcattttttattaaattatttatttatttttcttTGTT-AAAAA-------TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAA--CACCGTAATTG----TTTA--AA---TA-TGAAC---C-TCA-GAA-A-AAG--GTTATGCA-ACT------------CT--TTAATACAATGTC-ATTTG--GAGTATGCATCCTCACCTTGGTA---CAGTC--ACTGTGGTATCTCA-AAACA-TTAAGAAACAGATTAC-AAACTATTC-AAACAAAGTT-G-TCAGATT---
gi|116250                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTCACGTCTTATAT-TTTT-GTTT---CGATTAGCCA--GCTTC---TTAG--AT---TT-TATAA---C-TAA-AA--A-ATG--TTAAT-----GTTCTG--------CC--CCGATATAATGTC-ATTTG--GACTATTCATATTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTA------------A-AAGGG-TTAAGAAACAAACTCCAAAATTG--TAAAATAAAATT-GCTAC-AT------TTATT
gi|116251                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA---C-TAA--AG--------TTAAT--A-AAT---GGTAAAATACTGATTGATACAATGCC-ATTTG--GACTATTCATGTTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTAAA----------ACAAAGGCTTAAGAAACAAATTTC-AAATCTGTAAAAATAAAAGT-G-TTAGATT---CATTA
gi|116252                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GAGCA-ACTCCTTATC--A-TGT------------CT--TTGATTCAATGTC-ACTAT--GATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AAACAACTCAGAAT-AAGTTAA-TACGATT---atggtgtgggacatagagaaagtgccaacaatggtagtctaatgctgatatgtctttgttgaatgtaaaaaatataaattagcaattacatcttaaccatgtttttaaaatt
gi|116253                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --------CC--TTATT-CAATGTC-GGTTT--GACTACACTTGCTCTTTCAGGTATTCTGGGTTTACT----------A-AAAAA-TTAATAAATAAACT
gi|116254                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TTA-TACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATATTCTTCATGGTATA---GTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGTTAC-AAGCGGCTTAAAATAAAATT-A-TTAGATT---T-ATACTCAACT-ATGA--------TAGTAGA---AC-------TTCTTTGTCTG--CG-TC-----AAAT-TTTAA---A-GAT---TT----TGGAATA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CATGTTCATAAT-AATTT---TAACAATTCATGTCCAT--CTT---TTCATCAAGAAAAT-TTTA----CA-AAGGTGTCT--TA-TTCACATCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACATT-T---AAT-TTTGTTGTG-------C----CATGTATT-AATAGTTTT-ACAACATCAAAATTCTTTTAT--------AATGGCTTTTTT-----GATTTGAAT-CAATTACACT--ATAATATTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCAT-AAATTAATTAA
gi|116255                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGTC-ACTAC--GACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AGACAACTCAGAATAATATA-A-TACGATT---
gi|116256                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTTGTTTTTGTTGGTATGTCGGTTTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAAAAATGTT-G-TACAATT---C-TTTTCTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTAAGACACATGTTTTTAAA-ATTGTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTG-TTTATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAACAAGTTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTCATTTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACCTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTAA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCATATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTC-C-ATGTATATC---G-----TA--TTTATT-------T-----TTT-TT------AA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAA------TCTCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATCTTTA---GATGATAACTATA---A-TTATTCTACTTATCTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116257                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGTTT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAATATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTCTTTAAT-ATTTTACATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAT-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTAA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CAAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGAGAGCCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCGTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-AGAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTGTTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116258                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGAAGA-------T---AAC-TTGGTAGTT-------C----CCAATGTT-TAGAG-TTT--TGA-GTTAAGTTCTTTTTATTGT-----GGTGAAATTGAA-----TACTGGAAC-AACCTG---TATAC-AT--------AATTA----AATAA--A--A--TT--TTAAACATGAGGTT---AGAAAACACTGGTTTAA-CTC--T--GCG---G----------------ATTT----GAATTGTT----GTTTAGTGT-TTA--
gi|116259                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTTTATCGCTTTTAAATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TCGAAGAAATTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTTAAAAAAAAACATTGATGTAT-CTCCTG--GCA---GG-----CTAC-AGAAAATTT----GAA----T----ATT-------------------TATG----TTGAAAATATTTCTTATATTGTGAACCACATATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG----T-TTTTGTATTGTTACATTT--ACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T-----TT---------AAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----AGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTT----GATGATTGCTATA---C-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTTCTGTTATTTTATCATCAT
gi|116260                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTGCTGT-----TTTGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-GTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAGTAAG
gi|116261                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAGTA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--ACA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAC----T----ATTTAATTT---A--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATG---------AATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG---TT-TTTTGTATTGTTACAT-----------------------GTC--TACAT-TCTTAAG---CTTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAA--------------------------------------------------GGGACCCTGTTGGAAACAAGCGTGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116262                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATCTATTTATGCTCCTA--GCA---GG-----TTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGAATTGTGAACCACTTATATGTA-TAATTCAATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCACTG---TTATTTTGTATTGTAACATTTTAACAAG--TGTATTTCAAATGTC--TACAT-TCTTAAA---ATTT-C-ATGTACATC---A-----TA--TTTTTT-------TTTAAATTT-T----AGAAA-------------ATC----ACA--AT---CTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGTGTT--T--GT--TGCTTAAAAGGG-TCGTCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---AATGATTACTATA---A-TTAT-----TTAT----TTTTCTTGATTTGTTACTGTTATTTTATTTTCATGAT
gi|116263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-AGGTACAAGATAATTCAATG---CT-TTTTGGATTGTTACATTTGAACAAG--TTCATAGCAAATTTC--TACAT-TCTTACG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTAACAAAAC--T---AATTT-TT--AAAAAT-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATCAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATATTTATTTATTTTACATATTTA-CTGT-----TTTATTACTGTTATTTTATTATCATGAT
gi|116264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTTAT------TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAAT----TT-TTTTGTATTGTTACATTTCAACAAG--TTTATATCAAATGTA--AACAT-TCTTAAG---ATTT-A-AT--ATATC---A-----TATTTTTTTT-------T---AATAT-TT---AAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCACGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116265                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--TTTATT-------TCA-AACTA-AT-TACAAAA-------------TTC----ACA--ACA--TTT-ATATTAATGAACTTGAGGACCCCTTTGAAAACAAGCGCATTTAT--GT--TGCTTTAATGGG-TCA-CCAAGG-TTGCGAGACAACATATTTATTTATTA----ATAAT
gi|116266                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116267                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCTTGT-GGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGACTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116268                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACCCCATTCGAATTAAGCGCATT--TATGT--TGCTTTAATGGG-TCATCTCAGGTTT-----GTGAGATC
gi|116269                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCCCGTTGAAAATAAGCGCATG--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCGAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATTATCATCAT
gi|116270                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTAGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGGATTATCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATTTTTAATAGATGATTACTATA---A-TTATTTCACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111                     11111                                                                                   111   11            222222222222                                                                                                                                                                 111  333333333333333          11111          11111111111                                                                         1       11     1                             111111                                  1          3333333                11111111                   1   22   11                                                             1                              11                                                          11111              1111        1111                                                                                                                                                                                 111                            11111111111        11      1111111111111                                                                                                                                                              1                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            5           77    000               3     11111        44    333  3    3    555   444  999      555    44  888888   1 555 2   2   000   11     33 2 2 000000000000  55   1         2     33      3 3     2  2      88          8888888888 2   1 2      1         2     1           2  2 2       777777         1        3 4        555  777777777777777   33  2  33333    2     77777777777  33    555  2    00             11              1 2  2       1   33     1       22  0  2    44 1 555       5  4   3  777777  9         4   3      1  1  1    1    1     3333333 555   2        00000000 6666        3     2   44   99   999            66666    1       66666         5       5   0  0 66    0       4444  3     00  1  33       0      555             5   2      33   999  33333    2         1111   5555 5555     0   2   33  3 44     6666                  1                   2          33     2                    444  2                         33               33     2      5555    000         777 66666  33      88888888888     2  00      4444444444444   5555   33  777   2 5555 1    5555                          22 22  55            2          2  55555                   444             444 2                3                                  0  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           ..    ...               .     .....        ..    ...  .    .    ...   ...  ...      ...    ..  ......   . ... .   .   ...   ..     .. . . ............  ..   .         .     ..      . .     .  .      ..          .......... .   . .      .         .     .           .  . .       ......         .        . .        ...  ...............   ..  .  .....    .     ...........  ..    ...  .    ..             ..              . .  .       .   ..     .       ..  .  .    .. . ...       .  .   .  ......  .         .   .      .  .  .    .    .     ....... ...   .        ........ ....        .     .   ..   ..   ...            .....    .       .....         .       .   .  . ..    .       ....  .     ..  .  ..       .      ...             .   .      ..   ...  .....    .         ....   .... ....     .   .   ..  . ..     ....                  .                   .          ..     .                    ...  .                         ..               ..     .      ....    ...         ... .....  ..      ...........     .  ..      .............   ....   ..  ...   . .... .    ....                          .. ..  ..            .          .  .....                   ...             ... .                .                                  .  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            7           99    000               3     88888        33    222  1    1    444   555  111      444    22  333333   0 000 9   7   000   77     77 7 7 444444444444  66   9         2     11      1 7     0  0      44          8888888888 0   0 0      8         1     4           1  1 1       999999         4        0 9        000  666666666666666   99  9  22222    9     77777777777  99    000  9    66             33              0 9  9       0   66     2       77  2  3    22 0 444       1  5   1  666666  8         2   1      0  5  2    7    0     9999999 000   9        22222222 5555        1     3   22   11   555            77777    7       77777         3       3   7  5 11    2       7777  4     00  1  77       1      000             0   7      77   333  33333    7         3333   7777 0000     3   7   77  1 22     5555                  8                   9          99     9                    777  7                         77               77     7      1111    777         333 77777  44      11111111111     5  44      7777777777777   7777   77  333   7 7777 1    0000                          99 99  88            1          4  99999                   444             777 7                3                                  7  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
Reference ( family-605 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116238                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGGGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAAAA--GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTT-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTCAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTAGTATA---AC---------------CTG--TG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTAATAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--ATT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TGTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GT-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTAAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCTTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-ATATTTTACTTATTTA-TTTTATTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116239                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGAAAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTTAAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTGC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACAATT---C-TTATTCAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---T-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTCAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCGTGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AGGGG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAGTTG-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTAAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAA-ACTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TTAAAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCTGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTTATGGG-TTATACCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTAATCATCATCAT
gi|116240                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGACAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAAT-CCGTCCCAGGAAAAGATCAAATATTTAGGATAAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGCT-AAAAAA----GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGT---CGA--AACTGTTGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAGGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAGGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGA-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTCGAGGACAGAGTAAAACAACTAAGACTTG-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCATACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATA-TG-------CGGAACGCATGCTAAAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATTTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----GTGAAAATATTTCTTGTATTGTAAAC--CTCATATGTT-TTACTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATGGGTTT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAACT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGAAA----GGGACCCCATTGGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTCATGGG-TTATCCCAGG-TT----------ATCTTTAATTTTTA---GATGATTACAATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116241                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGAAAATGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTAAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATAT---GGA--AAATGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAA--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAAGTC-ATTTT--GATTATCC-TGTTC-----------CAGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CGG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAA---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGA-AGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCCA--CTT---ATCTTC-----------------CATAGGGTGTCTTTTA-TTCATTACCGCACAAAGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------A----CGCATTCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGAT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTT-ACGAT-TTGAAGAAATTA-AGCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---TAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTATTGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCATTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATTTCAAATGTC--TATAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATA-----A-----CT--TTTTTT-------TAA-AATTC-TT-TAAAAAA---------------C----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCTCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATGTTACTTATATATTTTTCTTGATTTATTAATGTTATTATATCATCATGAT
gi|116242                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAACTATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAC---CGA--AACTTTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-TAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAAGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGCCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-CTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCG---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-CTATTCAGTT--ATTCA-GGATATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATATTAACAAG--TTTATATCAAATGTT--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATATATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAGTT-TT-TAA
gi|116243                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTGCAGTCATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAATA----GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATAT---CAA--AACTGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-T-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACT----------A-CAGAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTTGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGTGGGTCGAGGATAGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTATTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--AAC---ATCTTCA-----------------ATAGGGTGTCATCTA-TTTATGCTCCTA-GCAGGTTAGAGAAAA-------TTTGAATATTTA
gi|116244                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAAATAATGATAAATATTTATAATGGTGAGGCTCAATATATGTTGACTCAAT-GTT-AAAAAAACGTGTAAATTTTCGAGTAAAGT-TTTT-ATAT---CGA--AACTTTAATAGCAAGTATC--ACATATT-CCATATATC-TAACAAG-T-ACT--TTAAT--ACAGT---G--------TCA-TTTGGATTATTTCAACTTTCAGATTAT--------TTCTTCGTATATCGGCCTCACT----------T-CAAAG-TTACCAAATATACCTC-AAACCACACAAAGTAATGTT-G-TTAGATG---G-GTA-CTAA------ACCAATTTCTCGTATT---AA-------T-------ATG--CGACT-----AACTCTAG--------------T--AA-G---TG-TTAAGAGTTGAGGACAGAATGAAACCACTAATACTAA-TT-AATGTTTTCAACAATTTT
gi|116245                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAT---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--AATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACA----------G-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGTTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCCATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTTGGAATA---C--TTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTTTT---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACGTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTAGAAT-CAATTACACCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCATTAATTT--TTAAAAA-GAAGTG---AAGAA----TTATCTAT--TCGT---GCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GA----------ATTCACTTT-TTA--
gi|116246                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAACTTCTAGAATA-AATATTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTTAGAAC---------GA---C-T----------CT--TTG-T--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--TATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACA----------A-AAATG-TTTAAGAAAAAGTTAC-AAGTTGCACAAAATACA-------ATGATTAAAG-TTAT---AC---TCAGCTATG-ATAGTAGA---GCTATTTTGT-------CTG--CG-CCGTCAAATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATCGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT-TACGAT---TCATGTCCAT--CTT---ATCTTCAAG--AAT-TTTTTTTACA-AAGGTGTC--AAA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAAGAAGTACTTT-T---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAG-TTTAACAACATCG---ACTTTCTTTTAT-----ATTGGCATTTTG-----GATCGGAAT-CAATTAC-CTC-TTAATATTAAGGAAATTA-GAAAAAAAGCATCAA--T--TTAAAAAAGAAGTG---AAGAAATATCTAT---------TC--GT-----G-----CAAT-GGAAAATGTAGAGGAA----TGTTAATTTATTTT-TTATTAA-TTAATTTGTTTTTTGAAAA-ACCTTTTTTATTGT----TATTTATGTGGATTTAT--AGCT--GT-----GATACAA-AT--TTTAA------------ATA----TAC---TTGATAA------ATAACAAA-GTA--TAATT-TCATATG---TTTTGCAATAAATGCCA--A-----TA--TTTTT-------------ATCT------------------------ATG----ACA--GTATTTTT-A----A--AAA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTTAA-GGG-TTATCCttaaattttttctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttttgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaacttatgggttatcctgtgaaatatatatgttctcaaaattattattattattgtgttatttgt
gi|116247                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTAA--A-----T-TTATC---CTTAA-GAC-AGACTA-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACA----------A-AAACG-TT------TAAGCTAT-AAGTTGCTCAAAATAAAATG-A-TTGGATT---T-ATACTCAGCT----ACGA-----TAGTAGAGCTAC-------T-------TTGTCTG-CTTCAA-ATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATGAACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACA--AT----TCAATCCATGTAATCTTCAAGAAAATGTTA-----CA-ACGGTG---TCTAGTTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTT-T---AGT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATG-----GCTTTTTGGATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTAGAAAAAAAAACA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGTG---AAAAA---------TAT-CTATTC--GT-----G-----CTAATGGAAAATGTAGAGGAA----TGTGAATTT-ATTT-TTT--AT-T--AAATT----TTT----TATTTTTTGAAA----AACT-TTTTTAT-TA-TTATTAAAATGGATTTATAGCTGT--GATA---C-ATA---TT-T----TA--GATATA-TTTGATGA------ATAACAAA-ATA--TACTT-TCTTAAG---TTTTGCAATAAATGTCAATA-----TA--TTTATCCATGACAT---ATTTT-TT-TAAAAAA-------------A------------------------------------GGACCCCATTGGAAATAAG
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTT-AAAAAG----GTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAC---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATCC-----C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-ATT------------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGCTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCTATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTT--GGGA---TACTTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTGACACCATCATACAA-CTAGAGGAAG-------T---ACT-TTTA-AGTTTATTGTGC----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGT-------GAACA---AT-TAT-CTTTTCGTGCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GAA----TTC--ATTT--TTTATTA--AATT--ATTTA----TTT---ATTTTTCTT
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTAAAA---TC-TTTT-TATTGTTA----TTAATGTGGATTTATAGC---TG-CGATACATATTTTAAATATATTT-G-ATGAATAAC---AAAGAATA--ATTTCA-------T---AAGTTATG-TAATAAATGCCAATATATTTATCCATGACATTAT---TTTTA----A---AA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTT-ATGGG-TTATCCtttaaaatctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaactttatgggttatcc
gi|116249                     : tgttaaaaaggttaattctagaataaaatttttgtacagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttgattatgcatgttctacatggtatagtagtcttacaaaaacgttaaagaaaaagctacaagttgctcaaaataaaatgattagatttattctcagctatgatagtagagctactttgtctgcgtcaaaatttaaagatcttgggatacttgacattgaaaatagaaatagacaattaagattgaatcaagttcataagatttttaacaattcttgtccatcttatcttcaagaaaattttacaacggtgtctaattgacaccatcatacaactagaggaagtacttttaagtttattgtgccatgtgttaatagttttacaacatcaactttcttttataatggcattttggattggaatcaattaccccatactattaaggaaattagaaaaaagcataaatttaaaaaagaagtgaacaattatcttttcgtgcaaatggaaaatgtagagaaatgtgaattcattttttattaaattatttatttatttttcttTGTT-AAAAA-------TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAA--CACCGTAATTG----TTTA--AA---TA-TGAAC---C-TCA-GAA-A-AAG--GTTATGCA-ACT------------CT--TTAATACAATGTC-ATTTG--GAGTATGCATCCTCACCTTGGTA---CAGTC--ACTGTGGTATCTCA-AAACA-TTAAGAAACAGATTAC-AAACTATTC-AAACAAAGTT-G-TCAGATT---
gi|116250                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTCACGTCTTATAT-TTTT-GTTT---CGATTAGCCA--GCTTC---TTAG--AT---TT-TATAA---C-TAA-AA--A-ATG--TTAAT-----GTTCTG--------CC--CCGATATAATGTC-ATTTG--GACTATTCATATTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTA------------A-AAGGG-TTAAGAAACAAACTCCAAAATTG--TAAAATAAAATT-GCTAC-AT------TTATT
gi|116251                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA---C-TAA--AG--------TTAAT--A-AAT---GGTAAAATACTGATTGATACAATGCC-ATTTG--GACTATTCATGTTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTAAA----------ACAAAGGCTTAAGAAACAAATTTC-AAATCTGTAAAAATAAAAGT-G-TTAGATT---CATTA
gi|116252                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GAGCA-ACTCCTTATC--A-TGT------------CT--TTGATTCAATGTC-ACTAT--GATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AAACAACTCAGAAT-AAGTTAA-TACGATT---atggtgtgggacatagagaaagtgccaacaatggtagtctaatgctgatatgtctttgttgaatgtaaaaaatataaattagcaattacatcttaaccatgtttttaaaatt
gi|116253                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --------CC--TTATT-CAATGTC-GGTTT--GACTACACTTGCTCTTTCAGGTATTCTGGGTTTACT----------A-AAAAA-TTAATAAATAAACT
gi|116254                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TTA-TACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATATTCTTCATGGTATA---GTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGTTAC-AAGCGGCTTAAAATAAAATT-A-TTAGATT---T-ATACTCAACT-ATGA--------TAGTAGA---AC-------TTCTTTGTCTG--CG-TC-----AAAT-TTTAA---A-GAT---TT----TGGAATA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CATGTTCATAAT-AATTT---TAACAATTCATGTCCAT--CTT---TTCATCAAGAAAAT-TTTA----CA-AAGGTGTCT--TA-TTCACATCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACATT-T---AAT-TTTGTTGTG-------C----CATGTATT-AATAGTTTT-ACAACATCAAAATTCTTTTAT--------AATGGCTTTTTT-----GATTTGAAT-CAATTACACT--ATAATATTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCAT-AAATTAATTAA
gi|116255                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGTC-ACTAC--GACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AGACAACTCAGAATAATATA-A-TACGATT---
gi|116256                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTTGTTTTTGTTGGTATGTCGGTTTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAAAAATGTT-G-TACAATT---C-TTTTCTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTAAGACACATGTTTTTAAA-ATTGTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTG-TTTATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAACAAGTTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTCATTTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACCTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTAA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCATATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTC-C-ATGTATATC---G-----TA--TTTATT-------T-----TTT-TT------AA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAA------TCTCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATCTTTA---GATGATAACTATA---A-TTATTCTACTTATCTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116257                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGTTT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAATATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTCTTTAAT-ATTTTACATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAT-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTAA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CAAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGAGAGCCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCGTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-AGAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTGTTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116258                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGAAGA-------T---AAC-TTGGTAGTT-------C----CCAATGTT-TAGAG-TTT--TGA-GTTAAGTTCTTTTTATTGT-----GGTGAAATTGAA-----TACTGGAAC-AACCTG---TATAC-AT--------AATTA----AATAA--A--A--TT--TTAAACATGAGGTT---AGAAAACACTGGTTTAA-CTC--T--GCG---G----------------ATTT----GAATTGTT----GTTTAGTGT-TTA--
gi|116259                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTTTATCGCTTTTAAATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TCGAAGAAATTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTTAAAAAAAAACATTGATGTAT-CTCCTG--GCA---GG-----CTAC-AGAAAATTT----GAA----T----ATT-------------------TATG----TTGAAAATATTTCTTATATTGTGAACCACATATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG----T-TTTTGTATTGTTACATTT--ACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T-----TT---------AAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----AGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTT----GATGATTGCTATA---C-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTTCTGTTATTTTATCATCAT
gi|116260                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTGCTGT-----TTTGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-GTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAGTAAG
gi|116261                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAGTA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--ACA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAC----T----ATTTAATTT---A--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATG---------AATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG---TT-TTTTGTATTGTTACAT-----------------------GTC--TACAT-TCTTAAG---CTTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAA--------------------------------------------------GGGACCCTGTTGGAAACAAGCGTGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116262                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATCTATTTATGCTCCTA--GCA---GG-----TTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGAATTGTGAACCACTTATATGTA-TAATTCAATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCACTG---TTATTTTGTATTGTAACATTTTAACAAG--TGTATTTCAAATGTC--TACAT-TCTTAAA---ATTT-C-ATGTACATC---A-----TA--TTTTTT-------TTTAAATTT-T----AGAAA-------------ATC----ACA--AT---CTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGTGTT--T--GT--TGCTTAAAAGGG-TCGTCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---AATGATTACTATA---A-TTAT-----TTAT----TTTTCTTGATTTGTTACTGTTATTTTATTTTCATGAT
gi|116263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-AGGTACAAGATAATTCAATG---CT-TTTTGGATTGTTACATTTGAACAAG--TTCATAGCAAATTTC--TACAT-TCTTACG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTAACAAAAC--T---AATTT-TT--AAAAAT-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATCAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATATTTATTTATTTTACATATTTA-CTGT-----TTTATTACTGTTATTTTATTATCATGAT
gi|116264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTTAT------TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAAT----TT-TTTTGTATTGTTACATTTCAACAAG--TTTATATCAAATGTA--AACAT-TCTTAAG---ATTT-A-AT--ATATC---A-----TATTTTTTTT-------T---AATAT-TT---AAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCACGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116265                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--TTTATT-------TCA-AACTA-AT-TACAAAA-------------TTC----ACA--ACA--TTT-ATATTAATGAACTTGAGGACCCCTTTGAAAACAAGCGCATTTAT--GT--TGCTTTAATGGG-TCA-CCAAGG-TTGCGAGACAACATATTTATTTATTA----ATAAT
gi|116266                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116267                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCTTGT-GGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGACTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116268                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACCCCATTCGAATTAAGCGCATT--TATGT--TGCTTTAATGGG-TCATCTCAGGTTT-----GTGAGATC
gi|116269                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCCCGTTGAAAATAAGCGCATG--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCGAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATTATCATCAT
gi|116270                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTAGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGGATTATCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATTTTTAATAGATGATTACTATA---A-TTATTTCACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT


blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T           TC    TAT               T     AACGT        GC    TGC  A    T    AGA   TTA  TGT      AAG    GA  ATATT    A TAT T   C   AG    CC     GC C G GGTAAAATA     GA   G         A     CA      T C     G  T      GC          GTGGTATCTC C   A C      C         A     A           G  A C       AAAGT          T        G T        GCT  TATTTTGT          TC  A  GTCAA    C     TTTAAAGATC   GG    GAA  C                   TC              T G  A       T   CA     C       AT     T    TC A GTA       T  T   G  TTTTTA  T         T   G      A  G  C    T    T     TACTTTT TTG   A        TTATTGTG GGAA        A     T   AA   CA   GGC            TTTTA    C       TTTTG         C       A   T    TA            GAAA  T     TT  C  AA              AAA             G   G      GT   AAT  AAAAT    T         AGAG   TTGT GTTA         A   TT  T TA     TTTT                  A                   T          GG     T                    GGT  A                         GA               GA     A      ATAT    GCA         AAT AAGAA  TT      CATGACAT        A  AA      TGCCAATATATTT   CATG   TT  ATT   T TATT G    CTTG                          TA AT  AA            A          T  GCGAG                   ATA             TTT T                T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           .     .                 .     A            GC    TGC  .    .    .     A    TGT      .      .   TTA      A .   .   .   AG    C      .  . G TCTG          A    G         .     .       T C     G  T      GC          .          .   A .      C         .     A           G  . .       CAT            T        G T        GCT  TTCTTTGT          .   .  TCAA     .     TTTAAAGATC   .     .    .                   TA              T .  .       T   T      C       AT     T    .  A .         T  T   .  TA      T         T   .      A  G  T    T    T     TACTTT  .     .        T        .           .     T   A    CA   GGC            .        C       .             C       A   T    TA            ACC   T     TC  C  .               .               T   .      .    AAT  AAAAT    .         AGAG   .    GTGA         .   .   . .      .                     T                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      C       GCA         A   .      .       AAAACT          .  T       .               .      .   A     . .    G    .                             .  .   AA            .          .  .                       .               .   .                T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           .     .                 .     A            GA    TGC  .    .    .     A    TGT      .      .   TTA      A .   .   .   AG    A      .  . G G             .    G         .     .       C C     G  T      GC          .          .   A .      C         .     A           G  . .       CT             T        G T        GCT  T                 .   .  .        .     TCAG         .     .    .                   TA              T .  .       T   T      C       AT     T    .  T .         T  T   .  TA      T         T   .      A  G  C    T    T     TACTTT  .     .        G        .           .     T   A    CA   GGC            .        C       .             .       .   T    T             ACC   T     T   C  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    TC           .   .   . .      .                     T                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       C           .   .      .       TTTA            .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           .     .                 .     A            GC    TGC  .    .    .     A    TTT      .      .   CT       A .   .   .   CA    C      .  . G G             .    G         .     .       T G     G  T      GC          .          .   A .      C         .     A           G  . .       CT             T        G T        .    T                 .   .  .        .     ACAG         .     .    .                   TA              T .  .       T   T      C       .      T    .  A .         A  A   .  TA      T         T   .      A  G  C    T    T     TACATT  .     .        T        .           .     T   A    CA   GCC            .        C       .             .       .   T    T             AGC   T     .   C  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     A                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       A           .   .      .       TAA             .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           .     .                 .     A            GC    TGC  .    .    .     A    TGT      .      .   CT       A .   .   .   A     .      .  . G G             .    G         .     .       T A     T  T      AT          .          .   A .      C         .     A           G  . .       CT             T        T T        .    T                 .   .  .        .     ACAA         .     .    .                   TA              T .  .       T   T      C       .      .    .  A .         A  A   .  C       T         T   .      C  C  T    G    A     .       .     .        T        .           .     .   A    CA   AAA            .        G       .             .       .   .    T             ACC   A     .   T  .               .               C   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     T                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      C       C           .   .      .       TCA             .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                T
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           .     .                 .     A            TC    AAA  .    .    .     A    TTT      .      .   CT       T .   .   .   A     .      .  . G G             .    G         .     .       G A     T  A      AG          .          .   A .      A         .     A           G  . .       CT             T        T T        .    T                 .   .  .        .     ATAG         .     .    .                   TG              A .  .       T   T      C       .      .    .  T .         A  A   .  C       T         T   .      C  T  T    T    A     .       .     .        G        .           .     .   .    T    GGC            .        G       .             .       .   .    T             GAA   A     .   A  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     A                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       C           .   .      .       T               .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     G            TA    AAA  .    .    .     A    AAA      .      .   CT       G .   .   .   A     .      .  . T G             .    A         .     .       G A     T  A      AG          .          .   C .      A         .     G           A  . .       CT             T        T T        .    .                 .   .  .        .     ATAG         .     .    .                   AT              G .  .       A   G      A       .      .    .  T .         A  A   .  C       T         T   .      C  T  T    T    A     .       .     .        G        .           .     .   .    T    GGC            .        G       .             .       .   .    T             GAA   T     .   A  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     A                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       G           .   .      .       T               .  A       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     G            TA    AAA  .    .    .     C    AAA      .      .   CT       T .   .   .   A     .      .  . T G             .    A         .     .       G A     T  A      AG          .          .   T .      A         .     G           G  . .       GG             T        T T        .    .                 .   .  .        .     AGAT         .     .    .                   AT              G .  .       A   G      .       .      .    .  A .         A  T   .  A       .         T   .      C  T  T    .    A     .       .     .        G        .           .     .   .    T    AGT            .        G       .             .       .   .    T             GAA   T     .   A  .               .               T   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     A                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      C       C           .   .      .       T               .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     G            TA    AAA  .    .    .     C    AAA      .      .   TA       A .   .   .   T     .      .  . C T             .    A         .     .       G A     T  A      AG          .          .   C .      A         .     G           A  . .       TA             T        T .        .    .                 .   .  .        .     ACAG         .     .    .                   AT              G .  .       A   G      .       .      .    .  T .         T  T   .  C       .         .   .      C  T  T    .    A     .       .     .        G        .           .     .   .    T    .              .        C       .             .       .   .    T             GAA   T     .   C  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     T                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      C       C           .   .      .       T               .  T       .               .      .   .     . .    G    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     G            TA    GAA  .    .    .     C    AAA      .      .   TT       A .   .   .   T     .      .  . G T             .    A         .     .       G A     A  T      AA          .          .   C .      A         .     G           A  . .       TA             .        G .        .    .                 .   .  .        .     ACAG         .     .    .                   AT              G .  .       A   G      .       .      .    .  T .         T  .   .  C       .         .   .      T  T  C    .    A     .       .     .        T        .           .     .   .    T    .              .        C       .             .       .   .    T             ACT   T     .   C  .               .               G   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     A                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       A           .   .      .       T               .  .       .               .      .   .     . .    A    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .     .            CA    TAT  .    .    .     C    CGT      .      .   T        A .   .   .   A     .      .  . A .             .    A         .     .       T A     T  T      TC          .          .   C .      A         .     A           G  . .       CT             .        G .        .    .                 .   .  .        .     ATC          .     .    .                   AT              G .  .       A   T      .       .      .    .  A .         .  .   .  .       .         .   .      A  G  C    .    T     .       .     .        T        .           .     .   .    T    .              .        A       .             .       .   .    T             ACC   T     .   C  .               .               T   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                     T                   .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       A           .   .      .       T               .  .       .               .      .   .     . .    .    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AC    AA   .    .    .     C    CA       .      .   .        . .   .   .   A     .      .  . G .             .    A         .     .       T C     T  T      TA          .          .   G .      A         .     G           A  . .       CT             .        . .        .    .                 .   .  .        .     ATC          .     .    .                   TA              A .  .       T   A      .       .      .    .  A .         .  .   .  .       .         .   .      A  G  .    .    T     .       .     .        T        .           .     .   .    G    .              .        C       .             .       .   .    .             ACT   T     .   C  .               .               .   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .   . .      .                                         .          .      .                    .    .                         .                .      .      A       C           .   .      .       T               .  .       .               .      .   .     . .    .    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                . .   .   .   .     .      .  . . .             .    A         .     .       G T     T  A      GT          .          .   G .      A         .     T           A  . .       A              .        . .        .    .                 .   .  .        .     .            .     .    .                   TA              T .  .       T   T                                                                                                      .       .     .                                                                .        C       .             .       .   .    .             ACC   .     .   .  .               .               .   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .                                                      .          .      .                    .    .                         .                .      .      G       A           .   .      .       T               .  .       .               .      .   .     . .    .    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          .   .     .      .  . . .             .    A         .     .       A A     T  C      GC          .          .   T .      A         .     A           G  . .       A                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  .        .       .             .       .   .    .             .     .     .   .  .                               .   .      .    .    .        .         .      .    .            .   .                                                                                             .    .                         .                .      .      G       A           .   .      .       T               .  .       .               .      .   .     . .    .    .                             .  .   .             .          .  .                       .               .   .                .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .    T         .     .       G C     T  A      C           .          .   A .      A         .     G           G  . .       T                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .       .               .  .                                                    .                             .  .   .             .          .  .                       .                                     
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                .    .         .     .       G T     T  A      C           .          .   C .      A         .     A           .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           .                             .  .   .             .          .  .                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .     .       T C     T  T      C           .          .   T .      C         .     A           .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .   .             .                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             . .     G  T      A           .          .   A .      C         .     A           .  . .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         .  .   .             .                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               .     .  .      .           .          .   A .      .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      G****
originalCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
finalCons                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAG----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              111                     11111                                                                                   111   11            111111111111                                                                                                                                                                 111  333333333333333          11111          11111111111                                                                         1       11     1                             111111                                  1          3333333                11111111                   1   22   11                                                             1                              11                                                          11111              1111        1111                                                                                                                                                                                 111                            11111111111        11      1111111111111                                                                                                                                                              1                                     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            5           77    000               3     55555        44    333  3    3    555   444  999      555    44  888888  1  555 2   2   000   11     33 2 4 888888888888  55   1         2     33      3 3     2  2      88          8888888888 2   1 2      1         2     1           2  2 2       777777         1        3 4        555  777777777777777   33  2  33333    2     77777777777  33    555  2    00             11              1 2  2       1   33     1       22  0  2    44 1 555       5  4   3  777777  9         4   3      1  1  1    1    1     3333333 555   2        00000000 6666        3     2   44   99   999            66666    1       66666         5       5   0  0 66    0       4444  3     00  1  33       0      555             5   2      33   999  33333    2         1111   5555 5555     0   2   33  3 44     6666                  1                   2          33     2                    444  2                         33               33     2      5555    000         777 66666  33      88888888888     2  00      4444444444444   5555   33  777   2 5555 1    5555                          22 22  55            2          2  55555                   444             444 2                3                                  0  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            .           ..    ...               .     .....        ..    ...  .    .    ...   ...  ...      ...    ..  ......  .  ... .   .   ...   ..     .. . . ............  ..   .         .     ..      . .     .  .      ..          .......... .   . .      .         .     .           .  . .       ......         .        . .        ...  ...............   ..  .  .....    .     ...........  ..    ...  .    ..             ..              . .  .       .   ..     .       ..  .  .    .. . ...       .  .   .  ......  .         .   .      .  .  .    .    .     ....... ...   .        ........ ....        .     .   ..   ..   ...            .....    .       .....         .       .   .  . ..    .       ....  .     ..  .  ..       .      ...             .   .      ..   ...  .....    .         ....   .... ....     .   .   ..  . ..     ....                  .                   .          ..     .                    ...  .                         ..               ..     .      ....    ...         ... .....  ..      ...........     .  ..      .............   ....   ..  ...   . .... .    ....                          .. ..  ..            .          .  .....                   ...             ... .                .                                  .  
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            7           99    000               3     22222        33    222  1    1    444   555  111      444    22  333333  6  000 9   7   000   77     77 7 4 777777777777  66   9         2     11      1 7     0  0      44          8888888888 0   0 0      8         1     4           1  1 1       999999         4        0 9        000  666666666666666   99  9  22222    9     77777777777  99    000  9    66             33              0 9  9       0   66     2       77  2  3    22 0 444       1  5   1  666666  8         2   1      0  5  2    7    0     9999999 000   9        22222222 5555        1     3   22   11   555            77777    7       77777         3       3   7  5 11    2       7777  4     00  1  77       1      000             0   7      77   333  33333    7         3333   7777 0000     3   7   77  1 22     5555                  8                   9          99     9                    777  7                         77               77     7      1111    777         333 77777  44      11111111111     5  44      7777777777777   7777   77  333   7 7777 1    0000                          99 99  88            1          4  99999                   444             777 7                3                                  7  
consensus                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
Reference ( family-605 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAG----GTTAATTCGCGGATNGNAT-TTTT-GTAT---CGA--AACCGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATNCNTGCTCTTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAANG-TTAAAAAACAAACTAC-AAGTCGCTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAANGTCTAGTATA---AC-------T-------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTNAAACAACTAAGACTNA-AT-CATGTTTNTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CNT---ATCTTCANGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATANCCGCACGCGGTTTAGNGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCGTGCT-AAGAG-TTT-ACGATATCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116238                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAATTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGCAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGGGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAAAA--GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTT-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTCAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTAGTATA---AC---------------CTG--TG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTAATAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--ATT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TGTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GT-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTAAACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCTTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-ATATTTTACTTATTTA-TTTTATTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116239                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGAAAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTTTAAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAT---CGA--AACTGTCGTTAC---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTGC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACAATT---C-TTATTCAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---T-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTCAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCGTGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AGGGG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAGGAAGTTG-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-TTATTAAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAA-ACTTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TTAAAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCTGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTTATGGG-TTATACCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTAATCATCATCAT
gi|116240                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGACAATTACGGTAACATACAATGGTCATAAAAT-CCGTCCCAGGAAAAGATCAAATATTTAGGATAAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGCT-AAAAAA----GTTAATTTGCGGATTGCAT-TTTT-ATGT---CGA--AACTGTTGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAGGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAGGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGA-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTCGAGGACAGAGTAAAACAACTAAGACTTG-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCATACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATA-TG-------CGGAACGCATGCTAAAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATTTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----GTGAAAATATTTCTTGTATTGTAAAC--CTCATATGTT-TTACTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATGGGTTT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAACT-TT-TAAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGAAA----GGGACCCCATTGGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTCATGGG-TTATCCCAGG-TT----------ATCTTTAATTTTTA---GATGATTACAATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116241                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCCATGGAAAATGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTAAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGAGGATTGCAT-TTTTTATAT---GGA--AAATGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-A-ACT--TTAAA--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAAAGTC-ATTTT--GATTATCC-TGTTC-----------CAGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CGG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAA---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGA-AGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCCA--CTT---ATCTTC-----------------CATAGGGTGTCTTTTA-TTCATTACCGCACAAAGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------A----CGCATTCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGAT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTT-ACGAT-TTGAAGAAATTA-AGCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---TAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTATTGTGAACCACTTATATGTA-TTATTCATTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATTTCAAATGTC--TATAT-TCTTAAG---ATTT-C-ATGTATA-----A-----CT--TTTTTT-------TAA-AATTC-TT-TAAAAAA---------------C----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCTCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATGTTACTTATATATTTTTCTTGATTTATTAATGTTATTATATCATCATGAT
gi|116242                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTTCAGTCATTTACGGTTACATGCAAAGGTCATGAAATTCCGTCCCAGGAAAAGGTCAACTATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAAAA----GTTAATTCGCGGATTGCTT-TTTT-ATAC---CGA--AACTTTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-TAG-A-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTCCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTTTTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAAGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGCCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-CTGAAGAAGTTA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCG---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATGTA-CTATTCAGTT--ATTCA-GGATATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATATTAACAAG--TTTATATCAAATGTT--TACAT-TCTTAAC---ATTT-C-ATATATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AAGTT-TT-TAA
gi|116243                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGTGCAGTCATTTACAGTTACATGCAACGGTCATGAAATTCCGTCACAGGAAAAGGTCAAATATTTAGGATTAACTATTGACAAGTTACTA-AACGGTGAGGC--GATA---GTTGACTCCATTGTT-AAAATA----GTTAATTCGCGGATTGCAT-TTTT-ATAT---CAA--AACTGTCGTTAT---TTTA--AC---CT-TCAAA---C-TAA-GAG-T-ACT--TTAAT--A-AGT---G--------CC--TTAGTACAATGTC-ATTTT--GATTATTAGTGCTCGTCTTGGTATGCTGGTCTTACT----------A-CAGAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGATT---C-TTATTTAACTTATCACCAATGTCTTGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-TAG---TT--AATG---TA-TTGTGGGTCGAGGATAGAGTAAATCAACTAAGACTTA-AT-CATGTATTTAAT-ATTTTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--AAC---ATCTTCA-----------------ATAGGGTGTCATCTA-TTTATGCTCCTA-GCAGGTTAGAGAAAA-------TTTGAATATTTA
gi|116244                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAAATAATGATAAATATTTATAATGGTGAGGCTCAATATATGTTGACTCAAT-GTT-AAAAAAACGTGTAAATTTTCGAGTAAAGT-TTTT-ATAT---CGA--AACTTTAATAGCAAGTATC--ACATATT-CCATATATC-TAACAAG-T-ACT--TTAAT--ACAGT---G--------TCA-TTTGGATTATTTCAACTTTCAGATTAT--------TTCTTCGTATATCGGCCTCACT----------T-CAAAG-TTACCAAATATACCTC-AAACCACACAAAGTAATGTT-G-TTAGATG---G-GTA-CTAA------ACCAATTTCTCGTATT---AA-------T-------ATG--CGACT-----AACTCTAG--------------T--AA-G---TG-TTAAGAGTTGAGGACAGAATGAAACCACTAATACTAA-TT-AATGTTTTCAACAATTTT
gi|116245                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAT---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--AATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTAGTCTTACA----------G-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGTTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCCATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTTGGAATA---C--TTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTTTT---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACGTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTAGAAT-CAATTACACCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCATTAATTT--TTAAAAA-GAAGTG---AAGAA----TTATCTAT--TCGT---GCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GA----------ATTCACTTT-TTA--
gi|116246                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAACTTCTAGAATA-AATATTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTTAGAAC---------GA---C-T----------CT--TTG-T--A-ATT------------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--TATTATGCATGTTCTTCATGGTATAGTGGTCTTACA----------A-AAATG-TTTAAGAAAAAGTTAC-AAGTTGCACAAAATACA-------ATGATTAAAG-TTAT---AC---TCAGCTATG-ATAGTAGA---GCTATTTTGT-------CTG--CG-CCGTCAAATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATCGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT-TACGAT---TCATGTCCAT--CTT---ATCTTCAAG--AAT-TTTTTTTACA-AAGGTGTC--AAA-TTCACACCATCATGCAA-CTAGAAGAAGTACTTT-T---AAT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAG-TTTAACAACATCG---ACTTTCTTTTAT-----ATTGGCATTTTG-----GATCGGAAT-CAATTAC-CTC-TTAATATTAAGGAAATTA-GAAAAAAAGCATCAA--T--TTAAAAAAGAAGTG---AAGAAATATCTAT---------TC--GT-----G-----CAAT-GGAAAATGTAGAGGAA----TGTTAATTTATTTT-TTATTAA-TTAATTTGTTTTTTGAAAA-ACCTTTTTTATTGT----TATTTATGTGGATTTAT--AGCT--GT-----GATACAA-AT--TTTAA------------ATA----TAC---TTGATAA------ATAACAAA-GTA--TAATT-TCATATG---TTTTGCAATAAATGCCA--A-----TA--TTTTT-------------ATCT------------------------ATG----ACA--GTATTTTT-A----A--AAA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTTAA-GGG-TTATCCttaaattttttctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttttgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaacttatgggttatcctgtgaaatatatatgttctcaaaattattattattattgtgttatttgt
gi|116247                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ATTGTT-AAAAAG----GTAAATTCTAGAATAAAAA-GTTT-GTAT---AGA--CATAAACACTAC---TTAA--A-----T-TTATC---CTTAA-GAC-AGACTA-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTAATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTCCTTCATGGTAAAGTGGTA-TACA----------A-AAACG-TT------TAAGCTAT-AAGTTGCTCAAAATAAAATG-A-TTGGATT---T-ATACTCAGCT----ACGA-----TAGTAGAGCTAC-------T-------TTGTCTG-CTTCAA-ATTT-TAAAG---ATC-----TT--GGAA---TA-CTTAACATTGAAAATAGAAATGAACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACA--AT----TCAATCCATGTAATCTTCAAGAAAATGTTA-----CA-ACGGTG---TCTAGTTCACACCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACTTT-T---AGT-TTTATTGTG-------C----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATG-----GCTTTTTGGATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTAGAAAAAAAAACA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGTG---AAAAA---------TAT-CTATTC--GT-----G-----CTAATGGAAAATGTAGAGGAA----TGTGAATTT-ATTT-TTT--AT-T--AAATT----TTT----TATTTTTTGAAA----AACT-TTTTTAT-TA-TTATTAAAATGGATTTATAGCTGT--GATA---C-ATA---TT-T----TA--GATATA-TTTGATGA------ATAACAAA-ATA--TACTT-TCTTAAG---TTTTGCAATAAATGTCAATA-----TA--TTTATCCATGACAT---ATTTT-TT-TAAAAAA-------------A------------------------------------GGACCCCATTGGAAATAAG
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TGTT-AAAAAG----GTTAATTCTAGAATAAAAT-TTTT-GTAC---AGA--CACAAACACTAC---TTAA--AT---TTATC--C---C-TTA-GAA-AGACTC-TTTGT--A-A-T---T--------CT--TTGATACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATGTTCTACATGGTATAGTAGTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGCTAC-AAGTTGCTCAAAATAAA-------ATGATT---A--GATTTA--TTCTCAGCTATG-ATAGTAGAGCTAC-------T-------TTG--T--CT-----GCGT-CAAAATTTA-AAGATCTT--GGGA---TACTTGA-CATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CAAGTTCATAAG-ATTTT---TAACAATTCTTGTCCAT--CTT---ATCTTCAAGAAAAT-TTTA----CA-ACGGTGTCT--AA-TTGACACCATCATACAA-CTAGAGGAAG-------T---ACT-TTTA-AGTTTATTGTGC----CATGTGTT-AATAGTTTT-ACAACATCA---ACTTTCTTTTAT-----AATGGCATTTTG-----GATTGGAATCAATTACC-CCATACTA--TTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCA--TAAAT--TTAAAAAAGAAGT-------GAACA---AT-TAT-CTTTTCGTGCAAATGGAAAATGTAG-AG-AAATGT----GAA----TTC--ATTT--TTTATTA--AATT--ATTTA----TTT---ATTTTTCTT
gi|116248                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTTAAAA---TC-TTTT-TATTGTTA----TTAATGTGGATTTATAGC---TG-CGATACATATTTTAAATATATTT-G-ATGAATAAC---AAAGAATA--ATTTCA-------T---AAGTTATG-TAATAAATGCCAATATATTTATCCATGACATTAT---TTTTA----A---AA----AGGACCCCATTGGAAATAAG-----T--T--GTAAAACTTT-ATGGG-TTATCCtttaaaatctttttattgttattaatgtggatttatagctgcgatacatattttaaatatatttgatgaataacaaagaataatttcataagttatgtaataaatgccaatatatttatccatgacattatttttaaaaaggaccccattggaaataagttgtaaaactttatgggttatcc
gi|116249                     : tgttaaaaaggttaattctagaataaaatttttgtacagacacaaacactacttaaatttatcccttagaaagactctttgtaattctttgatacagtgtcattttgattatgcatgttctacatggtatagtagtcttacaaaaacgttaaagaaaaagctacaagttgctcaaaataaaatgattagatttattctcagctatgatagtagagctactttgtctgcgtcaaaatttaaagatcttgggatacttgacattgaaaatagaaatagacaattaagattgaatcaagttcataagatttttaacaattcttgtccatcttatcttcaagaaaattttacaacggtgtctaattgacaccatcatacaactagaggaagtacttttaagtttattgtgccatgtgttaatagttttacaacatcaactttcttttataatggcattttggattggaatcaattaccccatactattaaggaaattagaaaaaagcataaatttaaaaaagaagtgaacaattatcttttcgtgcaaatggaaaatgtagagaaatgtgaattcattttttattaaattatttatttatttttcttTGTT-AAAAA-------TAATTCCAGGCTGAAGT-TTCT-GTGTAGACAA--CACCGTAATTG----TTTA--AA---TA-TGAAC---C-TCA-GAA-A-AAG--GTTATGCA-ACT------------CT--TTAATACAATGTC-ATTTG--GAGTATGCATCCTCACCTTGGTA---CAGTC--ACTGTGGTATCTCA-AAACA-TTAAGAAACAGATTAC-AAACTATTC-AAACAAAGTT-G-TCAGATT---
gi|116250                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              AATTCACGTCTTATAT-TTTT-GTTT---CGATTAGCCA--GCTTC---TTAG--AT---TT-TATAA---C-TAA-AA--A-ATG--TTAAT-----GTTCTG--------CC--CCGATATAATGTC-ATTTG--GACTATTCATATTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTA------------A-AAGGG-TTAAGAAACAAACTCCAAAATTG--TAAAATAAAATT-GCTAC-AT------TTATT
gi|116251                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAA---C-TAA--AG--------TTAAT--A-AAT---GGTAAAATACTGATTGATACAATGCC-ATTTG--GACTATTCATGTTCTTCTTGGTAC-CCAAGCTTAAA----------ACAAAGGCTTAAGAAACAAATTTC-AAATCTGTAAAAATAAAAGT-G-TTAGATT---CATTA
gi|116252                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GAGCA-ACTCCTTATC--A-TGT------------CT--TTGATTCAATGTC-ACTAT--GATTATGCCTGCTCTTTATGGTATAACGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AAACAACTCAGAAT-AAGTTAA-TACGATT---atggtgtgggacatagagaaagtgccaacaatggtagtctaatgctgatatgtctttgttgaatgtaaaaaatataaattagcaattacatcttaaccatgtttttaaaatt
gi|116253                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      --------CC--TTATT-CAATGTC-GGTTT--GACTACACTTGCTCTTTCAGGTATTCTGGGTTTACT----------A-AAAAA-TTAATAAATAAACT
gi|116254                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                --TTA-TACAGTGTC-ATTTT--GATTATGCATATTCTTCATGGTATA---GTCTTACA----------A-AAACG-TTAAAGAAAAAGTTAC-AAGCGGCTTAAAATAAAATT-A-TTAGATT---T-ATACTCAACT-ATGA--------TAGTAGA---AC-------TTCTTTGTCTG--CG-TC-----AAAT-TTTAA---A-GAT---TT----TGGAATA-CTTAACATTGAAAATAGAAATAGACAATTAAGATTGA-AT-CATGTTCATAAT-AATTT---TAACAATTCATGTCCAT--CTT---TTCATCAAGAAAAT-TTTA----CA-AAGGTGTCT--TA-TTCACATCATCATGCAA-CTAGAGGAAGTACATT-T---AAT-TTTGTTGTG-------C----CATGTATT-AATAGTTTT-ACAACATCAAAATTCTTTTAT--------AATGGCTTTTTT-----GATTTGAAT-CAATTACACT--ATAATATTAAGGAAATTA-GAAAA-AAGCAT-AAATTAATTAA
gi|116255                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AATGTC-ACTAC--GACTATGCCTGCTCTATATGGTATTATGGTCTGACT----------C-AGGTT-TTGAAAAATAAACTGC-AGACAACTCAGAATAATATA-A-TACGATT---
gi|116256                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATTTTTGTTTTTGTTGGTATGTCGGTTTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAAAAATGTT-G-TACAATT---C-TTTTCTAACTTATCACCAAGGTCTAGTATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTAAGACACATGTTTTTAAA-ATTGTCCATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTG-TTTATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAG-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAACAAGTTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTCATTTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACCTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTAA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCATATGTC--TACAT-TCTTAAC---ATTC-C-ATGTATATC---G-----TA--TTTATT-------T-----TTT-TT------AA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAA------TCTCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATCTTTA---GATGATAACTATA---A-TTATTCTACTTATCTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116257                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              CCTGCTCGTCTTGGTATGCCGGTCTTACT----------A-AAAAG-TTAAAACACAAACTAC-AAGTCACTCAAAATAAAGTT-G-TACGTTT---C-TTATTTAACTTATCACCAAGGTCTAATATA---AC---------------CTG--CG-CT-----ATGT-TAGAA---A-CAG---TT--AATG---TA-TTGAGGGTTGAGGATAGAGTAAAACAACTAAGACTTA-AT-CATGTCTTTAAT-ATTTTACATGGCA--CCGCG-CCAA--CAT---ATCTTTATGATAAC-TTC-----CATAGGGTGTCTTCTA-TTCATAACCGCACACGGTTTAGTGAAAT-------T---AAT-TTTATAGTT-------C----CGCATGCT-AAGAG-TTT--CGAT-TCGGGCACCTTTTATTGC-----AATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TTGAAGAAGTAA-ACCAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAT-CTCCTC--GCA---GG-----CAAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGAGAGCCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCAATG---TT-TTTTGTATTGTTACATTTTAACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCGTAAC---ATTT-C-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-AGAAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTGTTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116258                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tGAAGA-------T---AAC-TTGGTAGTT-------C----CCAATGTT-TAGAG-TTT--TGA-GTTAAGTTCTTTTTATTGT-----GGTGAAATTGAA-----TACTGGAAC-AACCTG---TATAC-AT--------AATTA----AATAA--A--A--TT--TTAAACATGAGGTT---AGAAAACACTGGTTTAA-CTC--T--GCG---G----------------ATTT----GAATTGTT----GTTTAGTGT-TTA--
gi|116259                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTTTTATCGCTTTTAAATGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-CTA-ACGAT-TCGAAGAAATTA-ACTAATAAGCA--AACTT--TTAAACGTGAAGTTAAAAAAAAACATTGATGTAT-CTCCTG--GCA---GG-----CTAC-AGAAAATTT----GAA----T----ATT-------------------TATG----TTGAAAATATTTCTTATATTGTGAACCACATATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG----T-TTTTGTATTGTTACATTT--ACAAG--TTTATATCAAATGTC--TACAT-TCTTAAG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T-----TT---------AAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----AGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTT----GATGATTGCTATA---C-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTTCTGTTATTTTATCATCAT
gi|116260                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTTTGCTGT-----TTTGCAATTGCT-----GACTGGAAT-AATTTGC-GTA-ACGAT-TTGAAGAAATTA-ACCAGTAAG
gi|116261                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TAAGTA--AACTT--TTAAACGTGAAGTT---AAAAAACATTTATGTAG-CTCCTC--ACA---GG-----CTAG-AGAAAATTT----GAC----T----ATTTAATTT---A--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGTAATGTGAACCACTTATATG---------AATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAATG---TT-TTTTGTATTGTTACAT-----------------------GTC--TACAT-TCTTAAG---CTTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTTTT-------T---AATTT-TT-TAAAAA--------------------------------------------------GGGACCCTGTTGGAAACAAGCGTGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116262                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CATCTATTTATGCTCCTA--GCA---GG-----TTAG-AGAAAATTT----GAA----T----ATTTAATTT-TTA--AG-T--ATATG----TTGAAAATATTTCTTGAATTGTGAACCACTTATATGTA-TAATTCAATT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTCACTG---TTATTTTGTATTGTAACATTTTAACAAG--TGTATTTCAAATGTC--TACAT-TCTTAAA---ATTT-C-ATGTACATC---A-----TA--TTTTTT-------TTTAAATTT-T----AGAAA-------------ATC----ACA--AT---CTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCGTGTT--T--GT--TGCTTAAAAGGG-TCGTCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---AATGATTACTATA---A-TTAT-----TTAT----TTTTCTTGATTTGTTACTGTTATTTTATTTTCATGAT
gi|116263                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACCACTTATATGTA-TTATTCAGTT--ATTCA-AGGTACAAGATAATTCAATG---CT-TTTTGGATTGTTACATTTGAACAAG--TTCATAGCAAATTTC--TACAT-TCTTACG---ATTT-A-ATGTATATC---A-----TA--TTTAACAAAAC--T---AATTT-TT--AAAAAT-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATCAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATATTTATTTATTTTACATATTTA-CTGT-----TTTATTACTGTTATTTTATTATCATGAT
gi|116264                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ACTTAT------TTATTCAGTT--ATTCA-GGGTATAAGATAATTAAAT----TT-TTTTGTATTGTTACATTTCAACAAG--TTTATATCAAATGTA--AACAT-TCTTAAG---ATTT-A-AT--ATATC---A-----TATTTTTTTT-------T---AATAT-TT---AAAAA-------------ATC----ACA--AT---TTT-A----AGGGAA----GGGACCCCGTTGGAAATAAGCACGTT--T--GC--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTATTTTTCTTGATTTTTTACTGTTATTTTATCATCATGAT
gi|116265                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A--TTTATT-------TCA-AACTA-AT-TACAAAA-------------TTC----ACA--ACA--TTT-ATATTAATGAACTTGAGGACCCCTTTGAAAACAAGCGCATTTAT--GT--TGCTTTAATGGG-TCA-CCAAGG-TTGCGAGACAACATATTTATTTATTA----ATAAT
gi|116266                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCCCGTTTGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116267                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               A----GGGACCTTGT-GGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCCAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTATTTA-TTTTCTTGACTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT
gi|116268                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ACCCCATTCGAATTAAGCGCATT--TATGT--TGCTTTAATGGG-TCATCTCAGGTTT-----GTGAGATC
gi|116269                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCCCGTTGAAAATAAGCGCATG--T--GT--TGCTTTAATGGG-TTATCCGAGG-TT-----ATAAGATCTTTAATTTTTA---GATGATTACTATA---A-TTATTTTACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATTATCATCAT
gi|116270                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTAGAAATAAGCGCGTT--T--GT--TGCTTTAATGGGATTATCCCAGG-TT-----ATAACATCTTTAATTTTTAATAGATGATTACTATA---A-TTATTTCACTTTTTTA-TTTTCTTGATTTATTACTGTTATTTTATCATCATCAT