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lowQualScore                  :          1      44444        5            1                 3         1         1  0 0  333 1   2 1 66666666666       3  1       9   33                   
lowQualScore                  :          .      .....        .            .                 .         .         .  . .  ... .   . . ...........       .  .       .   ..                   
lowQualScore                  :          7      00000        0            4                 4         2         2  2 1  777 3   7 3 55555555555       3  4       2   66                   
consensus                     : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
Reference ( gi|97285 )        : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97284                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTTAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97286                      : ACATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTTTAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97288                      : ATAATCAGA-ATAGAG-----ACGTTGTACAAGTTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTATA---TTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-ATT---T-------TATATGTAAT-ATGTTGATTACA-AATAAATACTGTTTAAACT
gi|97287                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ATTTTGTACAAGCTAGACATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TATCCAATATA-TGT-A-T---TACA----TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97290                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-TCTTTCTTGGAAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---G-------TACATGT-AT-ATG
gi|97291                      : ATATTAATA-AAAGGGCAGTAACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATCCTGTTGCTATGT-ATCCCTGTG-TATTTAAT--ATTAT-A-T---TACG----TATATGCATT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97289                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----AATT-GTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTC---TGCTGTAT-ATCGA---A-TAT---A---A-TAT-A-TA--T-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAA
gi|97293                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----A--------------------------CTTCTCAATTCTATTGTTATGT-TTCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTTAAAACG-AATAAAAATTGTTAAAACT
gi|97292                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ACATTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTCCTTCTCAATTATGTTGTTATAT-ATC-------TATGTAA---A-TG--------T-------TATATG-AGT-A---TCAGA----AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97294                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGTAAGAAATACCCTTTTCTCTCAACTCTGTTGAAATGT-ATCGCTGTG-T-TATGT---A-TAT-A-T---G-------TTTTTGTAAT-ATGTTGATAA
gi|97295                      :   ATTCA-A-ACAGAT------CTTTATAGAAG--AGAAA----CTTTGTAC--AATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTATA-TA-TTGA---A-TAT-A-T---G-------TACA
gi|97296                      :    TTTAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAGGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCT--------------GCTGTA-TA-TTGA---A-TAT-A-TGTAT-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTCAACT
gi|97297                      :    TTAAGATAGAGAG-----ACGTTGTACTAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAACATTGTTGCCATGT-ATCGCTGTG-TA-ACAA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-TTGTTAATAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97299                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATT
gi|97298                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTactactacatgtat
gi|97300                      :     TCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCATTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCACTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACTactactacatgtat
gi|97301                      :     TTAGA-AGAG-------ACTTTGTACAGGCTATAAATA-GCTTTATTCTCAACTCCGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TA-TCGA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTTAT-ATGTTGATAAAA-AATAAATATTGTTTAAA
gi|97302                      :      CAGA-ACAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTTTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCACTGTA-TA-TTGA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATAGTG-TTAAA
gi|97303                      :      CAGA-AGAGA-------CTTTGAACAAGCAAGAAATA-GCTTTCTTATCAATTCTACTGT---------GCTGTG-TA-ATGA---A-TAT-A-T---G-------TATA--TAAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97304                      :       AAA-AAAGAG-----ACTTTGTACAAGCCAGAAAAA-GCTT-CTTCTTAATTCTGTTGTAATGT-ATCACTGTA-TATA-GA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATCTTGAAAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97307                      :       AGA-AGAGAG-----ACTTTGTACACGTTAGAAATT-ACTTTCTTCTCAATTATGTTGCTATGT-ATCACTGTG-TAATAG----A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-ATTACATATTGTTTAA
gi|97305                      :       AGA-AAAGAG-----ACGTCGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGGTGTA-TA-TCGA---A-TATAA-T---TATTTATGTATATGTTAT-ATGCTGGTAACACAAT-AATATTGTTTAAATT
gi|97306                      :       AGA-AGAGAG-----ACCTTGTACAAGCTAGACAT-----TTCTTCTCATTTCTGTTGTTATTTTGTTGCTGTT-TATT-GA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAACT
gi|97308                      :       AGA-AGAGAT-----ACTTTATACATGTCA---AT----TTTCTTCTAAGTTCTGATGTTAAGT-ATCGCTGTG-TA-ATGA---A-TAA-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTGGTAA-G-AATAACTATTGTTTAAAC
gi|97309                      :              GAG-----ACTTTGTACAAGCTAGCAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TA-ATGA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAAC
gi|97310                      :                         TTGTACAATATAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TA-ATGA---A-TAT-A-T---T-------TATTTTT--T-ATATTGATAACA-AATACATATTGTTTAAAC
gi|97311                      :                                 GCTAGAAATA-GATTTCTTCTAAATTCTGTTGTTATGA-AACGCTGTA-TA-TTGA---A-ACT-A-T---G-------TATATGTTAT-ATGTTGATAGCA-AAT-AATATTGATTAAACT
gi|97312                      :                                       AATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TA-TCAA---A-TAT-A-T---G-------TATATGTTATAATGCTGATTACA-AATAAATATTGTTTAA
gi|97313                      :                                                   TCTCAATTCTATTGTTCTGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAACATTGTTTAAACT
gi|97314                      :                                                    CTCATTTCTATTGTTTTTT-ATCTCTGTA-AATT-GA---A-TATTA-T---G-------TATATGTAAT-ATGGTGATAAAA-AATAAATATTGTATAAAC
gi|97315                      :                                                                   ATGT-ATCGCTGTA-TATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTTAT-ACGTCAAA
gi|97316                      :                                                                      T-ATCACTAAAATATTTGA---A-TAT-A-T---T-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT





Alignments
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lowQualScore                  :          1      33333                     1                           1         1  2222  2222   55555555 1 1  7777777       3  1            1                   
lowQualScore                  :          .      .....                     .                           .         .  ....  ....   ........ . .  .......       .  .            .                   
lowQualScore                  :          6      88888                     4                           2         2  8888  6666   66666666 2 2  3333333       8  3            5                   
consensus                     : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
Reference ( family-604 )      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97284                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97285                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97286                      : ACATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTTTAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97287                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ATTTTGTACAAGCTAGACATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TATC-C-A----ATA--------T-A-TGTATTACATATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97288                      : ATAATCAGA-ATAGAG-----ACGTTGTACAAGTTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTA---TATTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-ATTT-------TATATGTAAT-ATGTTGATTACA-AATAAATACTGTTTAAACT
gi|97289                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----AATT-GTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGCTG---TAT-ATCGA---A-TAT----A----ATA--------T-A-TAT------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAA
gi|97290                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-TCTTTCTTGGAAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TACATGT-AT-ATG
gi|97291                      : ATATTAATA-AAAGGGCAGTAACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATCCTGTTGCTATGT-ATCCCTGTG-TATT-TAATATTATAT-------T-A-CG-------TATATGCATT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97292                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ACATTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTCCTTCTCAATTATGTTGTTATAT-ATC------------------------------T-A-TG-------TAAATGTTAT-ATGAGTATCAGA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97293                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTT--------------------------CTCAATTCTATTGTTATGT-TTCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTTAAAACG-AATAAAAATTGTTAAAACT
gi|97294                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGTAAGAAATACCCTTTTCTCTCAACTCTGTTGAAATGT-ATCGCTGTG-T-TA-TGT----ATA--------T-A-TG-------TTTTTGTAAT-ATGTTGATAA
gi|97295                      :   ATTCA-A-ACAGAT------CTTTATAGAAG--AGAAA----CTTTGTAC--AATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTATA-TA-T-TGA----ATA--------T-A-TG-------TACA
gi|97296                      :    TTTAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAGGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCT--------------GCTGTA-TA-T-TGA----ATA--------T-A-TGTAT----TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTCAACT
gi|97297                      :    TTAAGATAGAGAG-----ACGTTGTACTAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAACATTGTTGCCATGT-ATCGCTGTG-TA-A-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-TTGTTAATAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97298                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97299                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97300                      :     TCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCATTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCACTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97301                      :     TTAGA-AGAG-------ACTTTGTACAGGCTATAAATA-GCTTTATTCTCAACTCCGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TA-T-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAAAA-AATAAATATTGTTTAAA
gi|97302                      :      CAGA-ACAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTTTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCACTGTA-TA-T-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATAGTG-TTAAA
gi|97303                      :      CAGA-AGAGA-------CTTTGAACAAGCAAGAAATA-GCTTTCTTATCAATTCTACTGT---------GCTGTG-TA-A-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATA--TAAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97304                      :       AAA-AAAGAG-----ACTTTGTACAAGCCAGAAAAA-GCTT-CTTCTTAATTCTGTTGTAATGT-ATCACTGTA-TATA--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATCTTGAAAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97305                      :       AGA-AAAGAG-----ACGTCGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGGTGTA-TA-T-CGA----ATATAATTATTT-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGGTAACACAAT-AATATTGTTTAAATT
gi|97306                      :       AGA-AGAGAG-----ACCTTGTACAAGCTAGACAT-----TTCTTCTCATTTCTGTTGTTATTTTGTTGCTGTT-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAACT
gi|97307                      :       AGA-AGAGAG-----ACTTTGTACACGTTAGAAATT-ACTTTCTTCTCAATTATGTTGCTATGT-ATCACTGTG-TAAT-AG-----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-ATTACATATTGTTTAA
gi|97308                      :       AGA-AGAGAT-----ACTTTATACATGTCA---AT----TTTCTTCTAAGTTCTGATGTTAAGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------A-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGGTAA-G-AATAACTATTGTTTAAAC
gi|97309                      :              GAG-----ACTTTGTACAAGCTAGCAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TA-A-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAAC
gi|97310                      :                         TTGTACAATATAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TA-A-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATTTTT--T-ATATTGATAACA-AATACATATTGTTTAAAC
gi|97311                      :                                 GCTAGAAATA-GATTTCTTCTAAATTCTGTTGTTATGA-AACGCTGTA-TA-T-TGA----AAC--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAGCA-AAT-AATATTGATTAAACT
gi|97312                      :                                       AATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TA-T-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTATAATGCTGATTACA-AATAAATATTGTTTAA
gi|97313                      :                                                   TCTCAATTCTATTGTTCTGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAACATTGTTTAAACT
gi|97314                      :                                                    CTCATTTCTATTGTTTTTT-ATCTCTGTA-AATT--GA----ATA--------TTA-TG-------TATATGTAAT-ATGGTGATAAAA-AATAAATATTGTATAAAC
gi|97315                      :                                                                   ATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ACGT
gi|97316                      :                                                                      T-ATCACTAAAATATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACTcaaa





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                      11                                                                         
lowQualScore                  :          1      33333                     1                           1         2  1 66  2222   55555555 1 1  7777777       3  1           22                   
lowQualScore                  :          .      .....                     .                           .         .  . ..  ....   ........ . .  .......       .  .           ..                   
lowQualScore                  :          6      88888                     4                           2         4  6 77  6666   66666666 2 2  3333333       8  3           77                   
consensus                     : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
Reference ( family-604 )      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97284                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97285                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97286                      : ACATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTTTAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97287                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ATTTTGTACAAGCTAGACATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TATC-C-A----ATA--------T-A-TGTATTACATATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97288                      : ATAATCAGA-ATAGAG-----ACGTTGTACAAGTTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTA---TATTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-ATTT-------TATATGTAAT-ATGTTGATTACA-AATAAATACTGTTTAAACT
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gi|97290                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-TCTTTCTTGGAAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TACATGT-AT-ATG
gi|97291                      : ATATTAATA-AAAGGGCAGTAACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATCCTGTTGCTATGT-ATCCCTGTG-TATT-TAATATTATAT-------T-A-CG-------TATATGCATT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97292                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ACATTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTCCTTCTCAATTATGTTGTTATAT-ATC------------------------------T-A-TG-------TAAATGTTAT-ATGAGTATCAGA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97293                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTT--------------------------CTCAATTCTATTGTTATGT-TTCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTTAAAACG-AATAAAAATTGTTAAAACT
gi|97294                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGTAAGAAATACCCTTTTCTCTCAACTCTGTTGAAATGT-ATCGCTGTGTTAT---GT----ATA--------T-A-TG-------TTTTTGTAAT-ATGTTGATAA
gi|97295                      :   ATTCA-A-ACAGAT------CTTTATAGAAG--AGAAA----CTTTGTAC--AATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTATA-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TACA
gi|97296                      :    TTTAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAGGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCT--------------GCTGTA-TATT--GA----ATA--------T-A-TGTAT----TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTCAACT
gi|97297                      :    TTAAGATAGAGAG-----ACGTTGTACTAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAACATTGTTGCCATGT-ATCGCTGTG-TA-A-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-TTGTTAATAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97298                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97299                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97300                      :     TCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCATTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCACTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97301                      :     TTAGA-AGAG-------ACTTTGTACAGGCTATAAATA-GCTTTATTCTCAACTCCGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TA-T-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAAAA-AATAAATATTGTTTAAA
gi|97302                      :      CAGA-ACAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTTTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCACTGTA-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATAGTG-TTAAA
gi|97303                      :      CAGA-AGAGA-------CTTTGAACAAGCAAGAAATA-GCTTTCTTATCAATTCTACTGT---------GCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATA--TAAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97304                      :       AAA-AAAGAG-----ACTTTGTACAAGCCAGAAAAA-GCTT-CTTCTTAATTCTGTTGTAATGT-ATCACTGTA-TAT--AGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATCTTGAAAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97305                      :       AGA-AAAGAG-----ACGTCGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGGTGTA-TA-T-CGA----ATATAATTATTT-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGGTAACACAAT-AATATTGTTTAAATT
gi|97306                      :       AGA-AGAGAG-----ACCTTGTACAAGCTAGACAT-----TTCTTCTCATTTCTGTTGTTATTTTGTTGCTGTT-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAACT
gi|97307                      :       AGA-AGAGAG-----ACTTTGTACACGTTAGAAATT-ACTTTCTTCTCAATTATGTTGCTATGT-ATCACTGTG-TAAT-AG-----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-ATTACATATTGTTTAA
gi|97308                      :       AGA-AGAGAT-----ACTTTATACATGTCA---AT----TTTCTTCTAAGTTCTGATGTTAAGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------A-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGGTAA-G-AATAACTATTGTTTAAAC
gi|97309                      :              GAG-----ACTTTGTACAAGCTAGCAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAAC
gi|97310                      :                         TTGTACAATATAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TT-------TATTTTT--T-ATATTGATAACA-AATACATATTGTTTAAAC
gi|97311                      :                                 GCTAGAAATA-GATTTCTTCTAAATTCTGTTGTTATGA-AACGCTGTA-TATT--GA----AAC--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAGCA-AAT-AATATTGATTAAACT
gi|97312                      :                                       AATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TA-T-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTATAATGCTGATTACA-AATAAATATTGTTTAA
gi|97313                      :                                                   TCTCAATTCTATTGTTCTGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAACATTGTTTAAACT
gi|97314                      :                                                    CTCATTTCTATTGTTTTTT-ATCTCTGTA-AATT--GA----ATA--------TTA-TG-------TATATGTAAT-ATGGTGATAAAA-AATAAATATTGTATAAAC
gi|97315                      :                                                                   ATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ACGT
gi|97316                      :                                                                      T-ATCACTAAAATATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACTcaaa


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blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         A  T AC  .      T        . .  TAT           A  .           G 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  T             T  .           G 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  .             A  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T C   .      .        . .  .             T  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  .             A  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  .             T  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  .             A  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T T   .      .        . .  .             A  .           G 
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blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  A .   .      .        . .  .             T  .           A 
blockSeqs                     :          .      .                         .                           .         .  T .   .      .        . .  .             T  .           A 
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blockSeqs                     :                 .                         .                           .         .  T .   .      .        . .  .             A  .           A 
blockSeqs                     :                                           .                           .         .  T .   .      .        . .  .             T  .           G 
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blockSeqs                     :                                                                       .         .  . .   .      .        . .  .                              
blockSeqs                     :                                                                       .         .  . .   .      .        . .  .                              
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
finalCons                     : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT





Alignments
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lowQualScore                  :          1      33333                     1                           1         2  1 66  2222   55555555 1 1  7777777       3  1           22                   
lowQualScore                  :          .      .....                     .                           .         .  . ..  ....   ........ . .  .......       .  .           ..                   
lowQualScore                  :          6      88888                     4                           2         4  6 77  6666   66666666 2 2  3333333       8  3           77                   
consensus                     : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
Reference ( family-604 )      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97284                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97285                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97286                      : ACATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTTTAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97287                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ATTTTGTACAAGCTAGACATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TATC-C-A----ATA--------T-A-TGTATTACATATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97288                      : ATAATCAGA-ATAGAG-----ACGTTGTACAAGTTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTA---TATTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-ATTT-------TATATGTAAT-ATGTTGATTACA-AATAAATACTGTTTAAACT
gi|97289                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----AATT-GTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGCTG---TAT-ATCGA---A-TAT----A----ATA--------T-A-TAT------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAA
gi|97290                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-TCTTTCTTGGAAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TACATGT-AT-ATG
gi|97291                      : ATATTAATA-AAAGGGCAGTAACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATCCTGTTGCTATGT-ATCCCTGTG-TATT-TAATATTATAT-------T-A-CG-------TATATGCATT-ATGTTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97292                      : ATATTCAGA-AGAAAG-----ACATTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTCCTTCTCAATTATGTTGTTATAT-ATC------------------------------T-A-TG-------TAAATGTTAT-ATGAGTATCAGA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97293                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTT--------------------------CTCAATTCTATTGTTATGT-TTCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTTAAAACG-AATAAAAATTGTTAAAACT
gi|97294                      : ATATTCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGTAAGAAATACCCTTTTCTCTCAACTCTGTTGAAATGT-ATCGCTGTGTTAT---GT----ATA--------T-A-TG-------TTTTTGTAAT-ATGTTGATAA
gi|97295                      :   ATTCA-A-ACAGAT------CTTTATAGAAG--AGAAA----CTTTGTAC--AATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTATA-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TACA
gi|97296                      :    TTTAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAGGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCT--------------GCTGTA-TATT--GA----ATA--------T-A-TGTAT----TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTCAACT
gi|97297                      :    TTAAGATAGAGAG-----ACGTTGTACTAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAACATTGTTGCCATGT-ATCGCTGTG-TA-A-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-TTGTTAATAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97298                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97299                      :    TCCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAACA-GATTTCTTCTCAAAACTGTTGTTATGT-GTCACTGTA-TATTACTA----CTA--------C-A-TG-------TAT
gi|97300                      :     TCAGA-AGAGAG-----ACTTTGTATAAGCTAGAAATA-GCATTCTTCTCAATTCTATTGTTATGT-ATCACTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACT
gi|97301                      :     TTAGA-AGAG-------ACTTTGTACAGGCTATAAATA-GCTTTATTCTCAACTCCGTTGTTATAT-ATCGCTGTA-TA-T-CGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAAAA-AATAAATATTGTTTAAA
gi|97302                      :      CAGA-ACAGAG-----ACTTTGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTTTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCACTGTA-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATAGTG-TTAAA
gi|97303                      :      CAGA-AGAGA-------CTTTGAACAAGCAAGAAATA-GCTTTCTTATCAATTCTACTGT---------GCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATA--TAAT-ATGCTGATAACA-AATAAATATTGTTTTAAC
gi|97304                      :       AAA-AAAGAG-----ACTTTGTACAAGCCAGAAAAA-GCTT-CTTCTTAATTCTGTTGTAATGT-ATCACTGTA-TAT--AGA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATCTTGAAAACA-AATAAATATTGTTTAAAC
gi|97305                      :       AGA-AAAGAG-----ACGTCGTACAAGCTAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATAT-ATCGGTGTA-TA-T-CGA----ATATAATTATTT-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGGTAACACAAT-AATATTGTTTAAATT
gi|97306                      :       AGA-AGAGAG-----ACCTTGTACAAGCTAGACAT-----TTCTTCTCATTTCTGTTGTTATTTTGTTGCTGTT-TATT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGCTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAACT
gi|97307                      :       AGA-AGAGAG-----ACTTTGTACACGTTAGAAATT-ACTTTCTTCTCAATTATGTTGCTATGT-ATCACTGTG-TAAT-AG-----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-ATTACATATTGTTTAA
gi|97308                      :       AGA-AGAGAT-----ACTTTATACATGTCA---AT----TTTCTTCTAAGTTCTGATGTTAAGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------A-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGGTAA-G-AATAACTATTGTTTAAAC
gi|97309                      :              GAG-----ACTTTGTACAAGCTAGCAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTAAT-ATGTTGATAACA-AATAAATGTTGTTTAAAC
gi|97310                      :                         TTGTACAATATAGAAATA-GCTTTCTTCTCAATTATGTTGTTATGT-ATCGCTGTG-TAAT--GA----ATA--------T-A-TT-------TATTTTT--T-ATATTGATAACA-AATACATATTGTTTAAAC
gi|97311                      :                                 GCTAGAAATA-GATTTCTTCTAAATTCTGTTGTTATGA-AACGCTGTA-TATT--GA----AAC--------T-A-TG-------TATATGTTAT-ATGTTGATAGCA-AAT-AATATTGATTAAACT
gi|97312                      :                                       AATA-GCTTTCTTCTCAATTCTGTTGTTATGT-ATCGCTGTA-TA-T-CAA----ATA--------T-A-TG-------TATATGTTATAATGCTGATTACA-AATAAATATTGTTTAA
gi|97313                      :                                                   TCTCAATTCTATTGTTCTGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAACATTGTTTAAACT
gi|97314                      :                                                    CTCATTTCTATTGTTTTTT-ATCTCTGTA-AATT--GA----ATA--------TTA-TG-------TATATGTAAT-ATGGTGATAAAA-AATAAATATTGTATAAAC
gi|97315                      :                                                                   ATGT-ATCGCTGTA-TATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTTAT-ACGT
gi|97316                      :                                                                      T-ATCACTAAAATATT-TGA----ATA--------T-A-TT-------TATATGTAAT-ATGTTGAAAACG-AATAAATATTGTTTAAACTcaaa