lowQualScore : 1 1 1 5555555
lowQualScore : 3 6 44 4 77777777777777 333333 1 1 3 0 11 6 1 11 333333 222 1 2222 2222 11 11 555 1 4 777 1 6666666 44 3333
lowQualScore : . . .. . .............. ...... . . . . .. . . .. ...... ... . .... .... .. .. ... . . ... . ....... .. ....
lowQualScore : 9 5 11 0 88888888888888 888888 3 3 9 3 88 3 3 88 777777 333 3 8888 8888 88 88 555 3 6 111 4 4444444 88 9999
consensus : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTACGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---TT-TTTTGCAC--ATCC-CC----TG-T--TTTTTAA----CTTTAATA
Reference ( gi|100352 ) : CAGTGTTTTACATTAACGCT-TGCCCGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TTGGTACAGACA--AAT-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---TT-TTATGCAT--ATCC-CCAA--T--T--TTTTTAA----CTTTAATA
gi|100350 : CAGAGCTTTACATTAACGCT-CGCCTGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-TCA-TGGGTACGGACA--AAT-AAAA--TA------TAAAACTTC---TA-GCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAACCATGG--CATC--TC---TT-TTATGCAC--ATCCTCTGG--G--T--TTTTTAA----CTTTAATA
gi|100355 : CAGGGCTTTATATTAACACT-TGCCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTACAAACA--AGT-AAAA--TG------TAAAGCTGC---TT-GCCCAATTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---TT-TTATGCA---ATAC-CC----T--T--TTTTTAA----CTTTAATAaa
gi|100349 : CAGGGCTTTACATTAACATT-CACCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTACGGACA--AGT-AAAA--TACATGTATAAAGCTGC---TT-GCCCGACTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---TT-TTTTGCAT--GTCC-TC----TG-T--TTTTTAA----CTTTAATAaa
gi|100353 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGATCA--------------ACT------GAA-TCG-TCATTACAGACA--AGT-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCCGACTGGACAAGCGAAAATTC----AAA----AATTAAACATGG--CATC--TC---TT-TTTTGCAC--ATTC-CCaa
gi|100356 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-CCG-TGGGTAAGGACA--AGT-AACA--TA------TAAGGCTGC---TA-GCCTGACAGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---TT-TTTCACAA--ATTC-CCTG--C--T--TTTTTAA----CTTtgtct
gi|100351 : CAGGGCTTTACAGTAATGCT-CGCACGACTGTCCGCAACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTACAGACA--AGT-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCAGAC-AGACAAGTGAAAGTTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---TT-CTTTGCAC--AT----TAA--CTGT--TTTTTAA----CTTTAATAgataaa
gi|100354 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCGAACGGCCTAG-ACA--------------ACT------GAA-TCA-TGGGTACAGACA--AGT-AAAA--TA------TAAGGCTGC---AA-GCCCGACTGGATGAGTGAAAATTC----AGA----AATT-AACATGG--CATC--TC---AA-TTTTGCAC--ATCC-CC----TG-T--TTTTTAA----CTTTAATAaa
gi|100357 : CAGGGCTTTACATTAAAGCT-CATCCAACTGTCAAAGACA--------------ATT------GAA-CCG-TGGGTACGGACA--AGT-AAAA--TA------TAA-GCTGC---TA-GCCCGTCTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACAG--CATC--TC---TT-TTTCGCTA--ATCC-CTG------T--TTTTTAA----CCTTGATAaa
gi|100360 : CAGAGCTTTACATTAATGCT-TGCTTAACTGTCTACGACA--------------ACT------GAA-TCA-TGGGTATGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAAATTGC---TA-GCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----CTA----ATTTAAACATGG--CATC--TCT--TT-TTTTGCAT--ATCC-CCTG--T--T--TTaa
gi|100358 : CAGGGCTTTATATTAATGCT-AATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-CTG-TGGGTACGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAGGCTGCAACTAAGCCCGACTGGACAACTGAAAATTC----AGA----AATTATACACGG--CATC--TC---TT-TTTCGCAA--ATCC-CCTGTTT--T--TTTTTAA----CCTTGATAgggacttttgataaa
gi|100361 : CAGGGATTTACATTAATGCT-TGCACGACTGTCCGGGACA--------------ACT------CAA-TCA-T--GTAGGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAGGTTGC---TA-GCCCATATGGACAAGTGAAAATTT----ACA----AATTAAACACTG--CATC--TC---TTATTTTGCAC--ATCC-CACA--TG-T--TTTTTAA----TTTTAATAaa
gi|100359 : CAGGGCTTAACATTAATGCT-CACCCGACTCCCCGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-GGGGCACAGACT--AGT-AAAA--TA------TAAGGCGGC---TA-G-CTGACTGGACAAGCGAAAATTC----AGA----AATTTAACATAG--CATC--TCTTTTT-TTTTGCAC--ATCC-CC-------C--TCTTTAA----CTTTAATAga
gi|100363 : CAGGGCTTAACATTAACGCA-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-ACA-TGGGTATGGACA--AGT-TGAA--TG------TAAAGCTGC---TA-GCCCGACTGGACTTGTGCAAAATC----AGA----AATTAAACACGGATC-TC--TC---TT-TTTTGCAA--ATCC-Caa
gi|100367 : CAGGGCTTTACATTA--GCT-TGCCCAACTGTCCGGCCCA--------------ACT------GAA-TAAACTGGTACAGACA--AGT-AAAA--CA------TAAAGCTGC---TA-GCCCAACTGGACAAGTGAAAAATT----AGA----AATTAAACACCG--TGTA--TT---TT-TTttgtcttgtatttgtgattttttaataaa
gi|100366 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CACCCGACTGTTTGGGACA--------------AAT------GAA-TCA-TGGGAACAGACA--AGT-GAAA--CA------TAACGTTTC---TA-GCCTGACTAGACAAGTGAAAATTA----AGAAATTAATTAAACATGG--AATA--TC---TT-Ttt
gi|100365 : CAGGGCTCTACATTAACACT-TGCCAGACTGTCTGAGACA--------------ACT------GAA-TCT-TGGGTACGGAGATTAGT-AAAC--TA-------AAAG--GC---TG-G------TGGACAAG-GAAAATTCATAAATA----AATTAAACACAG--CATC--TG---TT-TT-TGAAC--ATCC-CC----TG-T--TTTTGAA----CTCTAATA
gi|100364 : CAGGGCTTTACATTAATGCT-CGACAGACTGTCCAGGA-------------------------------------------CA--ACT-GAAT--CA------TGGA--TGC---TA-GCCAGAGTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATCTATT---TT-TTTTGCAC--AATG-CCAG--T--T--TTTTAAA----CTTTAATAaa
gi|100371 : AGGGCTTTACATTAATGCT-CGCCTGACTGTCCGGAACA--------------ACT------GAA-TTG-TGGGTACAGACA--AAT-AAAA--TA------TAAGGCTGC---TA-aa
gi|100370 : AGTGCTTTACATTAACTCT-CATCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-TTG-TGGGTACGGACA--AGTGGAAA--TT------CAAA
gi|100374 : GCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCAGGACA--------------AAT------GAA-TCA-TGGGTATGGACA--AGT-AAAA--CA------TAAAACTGC---TA-GCTCGAATGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAATAATGG--CATC--TT---TT-TTTTGCAT--ATCC-CC-------TGGTTTTGAA----CTTGAATAaattaaacacagcatcttctttttgtacatccccagtttatttaggtgtttttaata
gi|100373 : GCTTTACATCAAGG-T-TGCCCAAATGTCCAGGACA--------------ACT------GAT-TCA-TGGGAACGGACA--AGT-AA----TA------TAAAGCTGC---TA-GCCTGACAGGACAAGTAAAAATTC----AGA----AATTAAGCATGG--CATC--TCTA-TT-TTATGCATACATCC-C--G--T--T--TTTTTAA----aa
gi|100369 : ggTTTACATTTACACT-TGCCCGACTGTCCCGGTCA--------------ACT------GAA-TCA-CGGGTACGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAGGCTGC---TA-GCCTGATTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AGTTAAACACAA--CATC--TC---TT-TTTTGCAC--ATCG-TC----TG-T--TTTTTAA----CTTTAATAaggcaataaa
gi|100362 : aggacTTTACATTAATGCT-CGCCCGACTGTCCGAGACA--------------ATT------GAA-TTG-AGGGTATGGACA--A---------------------GCTGC---TA-GCTGGACTGGACAAGTGAAATTTC----AGA----AATTAAA-------CATC--TC---TT-TTCTGTAT--ATCC-CC----TG-T--TTTTGAA----CTTTAATAaa
gi|100375 : caggccTTTATATTAACGCT-CGACTGACTGTCTGCGGCA--------------AGT------GAA-TCA-TGGGTACAGACA--AGT-AAAAAATA------TAAAACTGC---CA-GCCCAACTGGAGAAGTGAAATTTC----AAA----AATTACACACAG--CATC--AA---TT-TTGTAAAT---TCC-Ca
gi|100372 : TTAACATTAAGGGT-AGCTCGACTGTCCGGGACAGGTAAAGATCAGGTACCCGCAGAGAAGTCA-CTGATACAGGCA--AGT-GAAA--TA------AAAAGCTAA---TA-ATCCAGCAGGACAAAATAAAACTC----TGA----AATTTAACAt
gi|100376 : aagacTACATTAATGCT-CACCAGATTATCCTGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGTTATGGACA--AGA-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GTCCGACTGGACAAGTGAAAAATC----GGA----AATTAAACACGG--CTTT--TC---TT-TTTTGCAT--ATGC-CC
gi|100377 : ACATCAAAACTGTGCTCGGCTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTACAGACA--ATT-TAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCCAACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---TT-GTTTGTAC--ATCC-CC----TG-T--TTTTTAA----CTTTAATcg
gi|100368 : ACATTAATGCT-CGTCTGACTGTCTGG---------------------------------------TACAGGCA--TGT-GAAA--CA------TAAAGTTGC---CA-GCCCAGCTGAACAAgaa
gi|100378 : caggactcgCATTAACGCT-CAACCGACTGTT-----CA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTATGGACA--AGT-GAAA--TA------TGAAGCTGC---TA-TCCTGACTGGAC------AAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---TT-TTTTGCAA--ATTC-CCaagtaa
gi|100379 : T-CGCCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-TCG-TGGGTATGGACA--AGT-AAAA--TA------TAAAGCTGC---TA-GCCAAACAGGACTTGTAAAAGTGT----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---TT-TCTTGCAT--ATCC-CC----TG-T--TTTTGAA----CTTAAATAtgtct
gi|100380 : GACA--AA----AA--TA------TAAAGCTGC---AA-GCCCTACTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AACTAAACTTGG--CATC--TC---TA-TTTTGCAT--ATCC-CC-------TGGTTTTGAA----CTTTAATaa
gi|100370 : GGACAAGTGGAAATTC----AAA----AATTAAACACAG--CATC--TT---CT-TTTTGTAC--ATCC-CCAG--T--T--TATTTAGGTGTTTTTAATAtaaa
gi|100381 : agtgctttacattaactctcatccgactgtccaggacaactgaattgtgggtac----AGA----AATTAAACACGT--CATC--TC---TT-TTTCGCAA--ATCC-CC----TG-T--TTTTTAA----CCTTGATA
gi|100382 : TTAAACACGG--CATA--TC---TT-TTTCGCAA--ATCC-CT----TG-T--TTTTTAA----CCTTGATAaa
Alignments
lowQualScore : 1 0 77777777777777 333333 1 222 11 33 333333 222 1 2222 2222 11 11 333 1 1 1 11 3 1 33 11 333 1 1 3333
lowQualScore : . . .............. ...... . ... .. .. ...... ... . .... .... .. .. ... . . . .. . . .. .. ... . . ....
lowQualScore : 3 3 66666666666666 777777 3 333 77 00 666666 333 3 7777 7777 88 88 555 3 3 3 99 0 4 33 99 999 5 6 5555
consensus : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
Reference ( family-600 ) : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100349 : CAGGGCTTTACATTAACATT-CACCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATACATGTATAAAGCTG---CT-TGCCCGACTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ATGTCCT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100350 : CAGAGCTTTACATTAACGCT-CGCCTGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACGGACA--AAT--AAAATA------TAAAACTT---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAACCATGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ACATCCT-C--TGGG---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100351 : CAGGGCTTTACAGTAATGCT-CGCACGACTGTCCGCAACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAGAC-AGACAAGTGAAAGTTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-CTT-TGC--ACATTAA-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100352 : CAGTGTTTTACATTAACGCT-TGCCCGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTTGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ATATCCC-CAAT------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100353 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGATCA--------------ACT------GAA-T---CGTCATTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGCGAAAATTC----AAA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATTCC-C--T--G---TCT-
gi|100354 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCGAACGG-CCTAGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CA-AGCCCGACTGGATGAGTGAAAATTC----AGA----AATT-AACATGG--CATC--TC---A-A-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100355 : CAGGGCTTTATATTAACACT-TGCCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAAACA--AGT--AAAATG------TAAAGCTG---CT-TGCCCAATTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--A-ATACC-C--T------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100356 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---CGTGGGTAAGGACA--AGT--AACATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CAC--AAATTCC-C--T--GC--TTT-TTT-AA----CTTaa
gi|100357 : CAGGGCTTTACATTAAAGCT-CATCCAACTGTCAAAGACA--------------ATT------GAA-C---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAA-GCTG---CT-AGCCCGTCTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACAG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--TAAT-CC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAgataaa
gi|100358 : CAGGGCTTTATATTAATGCT-AATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---TGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTGCAACTAAGCCCGACTGGACAACTGAAAATTC----AGA----AATTATACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--GTTTTTT-TTT-AA----CCTTGATAaa
gi|100359 : CAGGGCTTAACATTAATGCT-CACCCGACTCCCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGGGGGCACAGACT--AGT--AAAATA------TAAGGCGG---CT-AG-CTGACTGGACAAGCGAAAATTC----AGA----AATTTAACATAG--CATC--TCTTTT-T-TTT-TGC--ACATCCC-C---------CTC-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100360 : CAGAGCTTTACATTAATGCT-TGCTTAACTGTCTACGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAATTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----CTA----ATTTAAACATGG--CATC--TCT--T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TGG-GA----CTTTaa
gi|100361 : CAGGGATTTACATTAATGCT-TGCACGACTGTCCGGGACA--------------ACT------CAA-T---CATG--TAGGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGTTG---CT-AGCCCATATGGACAAGTGAAAATTT----ACA----AATTAAACACTG--CATC--TC---T-TATTT-TGC--ACATCCCACA-T--G---TTT-TTT-AA----TTTTAATAtgataaa
gi|100362 : CAGGCCTTTACATTAATGCT-CGCCCGACTGTCCGAGACA--------------ATT------GAA-T---TGAGGGTATGGACA--AG--------------------CTG---CT-AGCTGGACTGGACAAGTGAAATTTC----AGA----AATTAAA-------CATC--TC---T-T-TTC-TGT--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTTAATAga
gi|100363 : CAGGGCTTAACATTAACGCA-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-A---CATGGGTATGGACA--AGT--TGAATG------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACTTGTGCAAAATC----AGA----AATTAAACACGGATC-TC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATCCC-T--T--G---TCT-TGT-Aa
gi|100364 : CAGGGCTTTACATTAATGCT-CGACAGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGAT---------------------------------G---CT-AGCCAGAGTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATCTATT---T-T-TTT-TGC--ACAATGC-C--A--G---TTT-TTTAAA----CTTTAATAtttgtgattttttaataaa
gi|100365 : CAGGGCTCTACATTAACACT-TGCCAGACTGTCTGAGACA--------------ACT------GAA-T---CTTGGGTACGGAGATTAGT--AAACTA-------AAAG--G---CT-GG------TGGACAAG-GAAAATTCATAAATA----AATTAAACACAG--CATC--T----G-T-TTT-TGA--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTCTAATAaa
gi|100366 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CACCCGACTGTTTGGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGAACAGACA--AGT--GAAACA------TAACGTTT---CT-AGCCTGACTAGACAAGTGAAAATTA----AGAAATTAATTAAACATGG--AATA--TC---T-T-Taa
gi|100367 : CAGGGCTTTACATTA--GCT-TGCCCAACTGTCCGGCCCA--------------ACT------GAA-TAAAC-TGG-TACAGACA--AGT--AAAACA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAAATT----AGA----AATTAAACACCG--TGTA--TT---T-T-TTT-T
gi|100368 : CAGGACTCGACATTAATGCT-CGTCTGACTGTCT-----------------------------------------GGTACAGGCA--TGT--GAAACA------TAAAGTTG---CC-AGCCCAGCTGAACAA
gi|100369 : AGGACTTTACATTTACACT-TGCCCGACTGTCCCGGTCA--------------ACT------GAA-T---CACGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGATTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AGTTAAACACAA--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCGT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaagtaa
gi|100370 : AGTGCTTTACATTAACTCT-CATCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACGGACA--AGTG-GAAATT------CAAAaa
gi|100370 : GGACAAGTGGAAATTC----AAA----AATTAAACACAG--CATC--TT---C-T-TTT-TGT--ACATCCC-C--A--G---TTTATTT-AGGTGTTTTTAATAaattaaacacagcatcttctttttgtacatccccagtttatttaggtgtttttaata
gi|100371 : agtgctttacattaactctcatccgactgtccaggacaactgaattgtgggtacAGGGCTTTACATTAATGCT-CGCCTGACTGTCCGGAACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-A
gi|100372 : AAGACTTAACATTAAGGGT-AGCTCGACTGTCCGGGACAGGTAAAGATCAGGTACCCGCAGAGAAGT---CACTGATACAGGCA--AGT--GAAATA------AAAAGCTA---AT-AATCCAGCAGGACAAAATAAAACTC----TGA----AATTTAACA
gi|100373 : GGGCTTTACATCAAGGTT--GCCCAAATGTCCAGGACA--------------ACT------GAT-T---CATGGGAACGGACA--AGT--AA--TA------TAAAGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTAAAAATTC----AGA----AATTAAGCATGG--CATC--TC---TAT-TTTATGCATACATCCC-G--T------TTT-TTT-AA----
gi|100374 : GCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCAGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAACA------TAAAACTG---CT-AGCTCGAATGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAATAATGG--CATC--TT---T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTGAATAaggcaataaa
gi|100375 : TTTATATTAACGCT-CGACTGACTGTCTGCGGCA--------------AGT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGTAAAAAATA------TAAAACTG---CC-AGCCCAACTGGAGAAGTGAAATTTC----AAA----AATTACACACAG--CATC--AA-------TTT-TGT--AAATTCC-C--T--aa
gi|100376 : TACATTAATGCT-CACCAGATTATCCTGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGTTATGGACA--AGA--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGTCCGACTGGACAAGTGAAAAATC----GGA----AATTAAACACGG--CTTT--TC---T-T-TTT-TGC--ATATGCC-C--C--G---
gi|100377 : ACATCAAAACTGTGCTCGGCTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--ATT--TAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-GTT-TGT--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAAT
gi|100378 : CATTAACGCT-CAACCGACTGTTC-----A--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--GAAATA------TGAAGCTG---CT-ATCCTGACTGGAC------AAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATTCC-C--T--G---TCT-gaa
gi|100379 : T-CGCCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAAACAGGACTTGTAAAAGTGT----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TCT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTAAATA
gi|100380 : GACA--A-----AAATA------TAAAGCTG---CA-AGCCCTACTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AACTAAACTTGG--CATC--TC---T-A-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTTAATaa
gi|100381 : ----AGA----AATTAAACACGT--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAtaaa
gi|100382 : TTAAACACGG--CATA--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-T--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAaa
Alignments
lowQualScore : 1 0 77777777777777 333333 1 222 11 33 333333 222 1 2222 2222 11 11 333 1 1 1 11 3 1 33 11 333 1 1 3333
lowQualScore : . . .............. ...... . ... .. .. ...... ... . .... .... .. .. ... . . . .. . . .. .. ... . . ....
lowQualScore : 3 3 66666666666666 777777 3 333 77 00 666666 333 3 7777 7777 88 88 555 3 3 3 99 0 4 33 99 999 5 6 5555
consensus : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
Reference ( family-600 ) : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100349 : CAGGGCTTTACATTAACATT-CACCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATACATGTATAAAGCTG---CT-TGCCCGACTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ATGTCCT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100350 : CAGAGCTTTACATTAACGCT-CGCCTGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACGGACA--AAT--AAAATA------TAAAACTT---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAACCATGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ACATCCT-C--TGGG---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100351 : CAGGGCTTTACAGTAATGCT-CGCACGACTGTCCGCAACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAGAC-AGACAAGTGAAAGTTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-CTT-TGC--ACATTAA-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100352 : CAGTGTTTTACATTAACGCT-TGCCCGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTTGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ATATCCC-CAAT------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100353 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGATCA--------------ACT------GAA-T---CGTCATTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGCGAAAATTC----AAA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATTCC-C--T--G---TCT-
gi|100354 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCGAACGG-CCTAGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CA-AGCCCGACTGGATGAGTGAAAATTC----AGA----AATT-AACATGG--CATC--TC---A-A-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100355 : CAGGGCTTTATATTAACACT-TGCCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAAACA--AGT--AAAATG------TAAAGCTG---CT-TGCCCAATTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--A-ATACC-C--T------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100356 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---CGTGGGTAAGGACA--AGT--AACATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CAC--AAATTCC-C--T--GC--TTT-TTT-AA----CTTaa
gi|100357 : CAGGGCTTTACATTAAAGCT-CATCCAACTGTCAAAGACA--------------ATT------GAA-C---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAA-GCTG---CT-AGCCCGTCTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACAG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--TAAT-CC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAgataaa
gi|100358 : CAGGGCTTTATATTAATGCT-AATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---TGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTGCAACTAAGCCCGACTGGACAACTGAAAATTC----AGA----AATTATACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--GTTTTTT-TTT-AA----CCTTGATAaa
gi|100359 : CAGGGCTTAACATTAATGCT-CACCCGACTCCCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGGGGGCACAGACT--AGT--AAAATA------TAAGGCGG---CT-AG-CTGACTGGACAAGCGAAAATTC----AGA----AATTTAACATAG--CATC--TCTTTT-T-TTT-TGC--ACATCCC-C---------CTC-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100360 : CAGAGCTTTACATTAATGCT-TGCTTAACTGTCTACGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAATTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----CTA----ATTTAAACATGG--CATC--TCT--T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TGG-GA----CTTTaa
gi|100361 : CAGGGATTTACATTAATGCT-TGCACGACTGTCCGGGACA--------------ACT------CAA-T---CATG--TAGGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGTTG---CT-AGCCCATATGGACAAGTGAAAATTT----ACA----AATTAAACACTG--CATC--TC---T-TATTT-TGC--ACATCCCACA-T--G---TTT-TTT-AA----TTTTAATAtgataaa
gi|100362 : CAGGCCTTTACATTAATGCT-CGCCCGACTGTCCGAGACA--------------ATT------GAA-T---TGAGGGTATGGACA--AG--------------------CTG---CT-AGCTGGACTGGACAAGTGAAATTTC----AGA----AATTAAA-------CATC--TC---T-T-TTC-TGT--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTTAATAga
gi|100363 : CAGGGCTTAACATTAACGCA-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-A---CATGGGTATGGACA--AGT--TGAATG------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACTTGTGCAAAATC----AGA----AATTAAACACGGATC-TC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATCCC-T--T--G---TCT-TGT-Aa
gi|100364 : CAGGGCTTTACATTAATGCT-CGACAGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGAT---------------------------------G---CT-AGCCAGAGTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATCTATT---T-T-TTT-TGC--ACAATGC-C--A--G---TTT-TTTAAA----CTTTAATAtttgtgattttttaataaa
gi|100365 : CAGGGCTCTACATTAACACT-TGCCAGACTGTCTGAGACA--------------ACT------GAA-T---CTTGGGTACGGAGATTAGT--AAACTA-------AAAG--G---CT-GG------TGGACAAG-GAAAATTCATAAATA----AATTAAACACAG--CATC--T----G-T-TTT-TGA--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTCTAATAaa
gi|100366 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CACCCGACTGTTTGGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGAACAGACA--AGT--GAAACA------TAACGTTT---CT-AGCCTGACTAGACAAGTGAAAATTA----AGAAATTAATTAAACATGG--AATA--TC---T-T-Taa
gi|100367 : CAGGGCTTTACATTA--GCT-TGCCCAACTGTCCGGCCCA--------------ACT------GAA-TAAAC-TGG-TACAGACA--AGT--AAAACA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAAATT----AGA----AATTAAACACCG--TGTA--TT---T-T-TTT-T
gi|100368 : CAGGACTCGACATTAATGCT-CGTCTGACTGTCT-----------------------------------------GGTACAGGCA--TGT--GAAACA------TAAAGTTG---CC-AGCCCAGCTGAACAA
gi|100369 : AGGACTTTACATTTACACT-TGCCCGACTGTCCCGGTCA--------------ACT------GAA-T---CACGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGATTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AGTTAAACACAA--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCGT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaagtaa
gi|100370 : AGTGCTTTACATTAACTCT-CATCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACGGACA--AGTG-GAAATT------CAAAaa
gi|100370 : GGACAAGTGGAAATTC----AAA----AATTAAACACAG--CATC--TT---C-T-TTT-TGT--ACATCCC-C--A--G---TTTATTT-AGGTGTTTTTAATAaattaaacacagcatcttctttttgtacatccccagtttatttaggtgtttttaata
gi|100371 : agtgctttacattaactctcatccgactgtccaggacaactgaattgtgggtacAGGGCTTTACATTAATGCT-CGCCTGACTGTCCGGAACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-A
gi|100372 : AAGACTTAACATTAAGGGT-AGCTCGACTGTCCGGGACAGGTAAAGATCAGGTACCCGCAGAGAAGT---CACTGATACAGGCA--AGT--GAAATA------AAAAGCTA---AT-AATCCAGCAGGACAAAATAAAACTC----TGA----AATTTAACA
gi|100373 : GGGCTTTACATCAAGGTT--GCCCAAATGTCCAGGACA--------------ACT------GAT-T---CATGGGAACGGACA--AGT--AA--TA------TAAAGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTAAAAATTC----AGA----AATTAAGCATGG--CATC--TC---TAT-TTTATGCATACATCCC-G--T------TTT-TTT-AA----
gi|100374 : GCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCAGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAACA------TAAAACTG---CT-AGCTCGAATGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAATAATGG--CATC--TT---T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTGAATAaggcaataaa
gi|100375 : TTTATATTAACGCT-CGACTGACTGTCTGCGGCA--------------AGT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGTAAAAAATA------TAAAACTG---CC-AGCCCAACTGGAGAAGTGAAATTTC----AAA----AATTACACACAG--CATC--AA-------TTT-TGT--AAATTCC-C--T--aa
gi|100376 : TACATTAATGCT-CACCAGATTATCCTGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGTTATGGACA--AGA--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGTCCGACTGGACAAGTGAAAAATC----GGA----AATTAAACACGG--CTTT--TC---T-T-TTT-TGC--ATATGCC-C--C--G---
gi|100377 : ACATCAAAACTGTGCTCGGCTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--ATT--TAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-GTT-TGT--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAAT
gi|100378 : CATTAACGCT-CAACCGACTGTTC-----A--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--GAAATA------TGAAGCTG---CT-ATCCTGACTGGAC------AAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATTCC-C--T--G---TCT-gaa
gi|100379 : T-CGCCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAAACAGGACTTGTAAAAGTGT----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TCT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTAAATA
gi|100380 : GACA--A-----AAATA------TAAAGCTG---CA-AGCCCTACTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AACTAAACTTGG--CATC--TC---T-A-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTTAATaa
gi|100381 : ----AGA----AATTAAACACGT--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAtaaa
gi|100382 : TTAAACACGG--CATA--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-T--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAaa
blockSeqs : G GGTAAAGATCAGGT CGCAGA G AAA TT AA . CAA A ATAA AATT AT TA TTT A A A AT C A AA GG TTT A A GTGT
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . . . T . . . . C . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : ******
originalCons : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
finalCons : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
Alignments
lowQualScore : 1 0 77777777777777 333333 1 222 11 33 333333 222 1 2222 2222 11 11 333 1 1 1 11 3 1 33 11 333 1 1 3333
lowQualScore : . . .............. ...... . ... .. .. ...... ... . .... .... .. .. ... . . . .. . . .. .. ... . . ....
lowQualScore : 3 3 66666666666666 777777 3 333 77 00 666666 333 3 7777 7777 88 88 555 3 3 3 99 0 4 33 99 999 5 6 5555
consensus : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
Reference ( family-600 ) : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100349 : CAGGGCTTTACATTAACATT-CACCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATACATGTATAAAGCTG---CT-TGCCCGACTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ATGTCCT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100350 : CAGAGCTTTACATTAACGCT-CGCCTGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACGGACA--AAT--AAAATA------TAAAACTT---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAACCATGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ACATCCT-C--TGGG---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100351 : CAGGGCTTTACAGTAATGCT-CGCACGACTGTCCGCAACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAGAC-AGACAAGTGAAAGTTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-CTT-TGC--ACATTAA-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100352 : CAGTGTTTTACATTAACGCT-TGCCCGACTGTCTGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTTGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--ATATCCC-CAAT------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100353 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCGGATCA--------------ACT------GAA-T---CGTCATTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGCGAAAATTC----AAA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATTCC-C--T--G---TCT-
gi|100354 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CGCCGAACGG-CCTAGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CA-AGCCCGACTGGATGAGTGAAAATTC----AGA----AATT-AACATGG--CATC--TC---A-A-TTT-TGC--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATA
gi|100355 : CAGGGCTTTATATTAACACT-TGCCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAAACA--AGT--AAAATG------TAAAGCTG---CT-TGCCCAATTGGACAAATGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTA-TGC--A-ATACC-C--T------TTT-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100356 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---CGTGGGTAAGGACA--AGT--AACATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CAC--AAATTCC-C--T--GC--TTT-TTT-AA----CTTaa
gi|100357 : CAGGGCTTTACATTAAAGCT-CATCCAACTGTCAAAGACA--------------ATT------GAA-C---CGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAA-GCTG---CT-AGCCCGTCTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACAG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--TAAT-CC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAgataaa
gi|100358 : CAGGGCTTTATATTAATGCT-AATCCGACTGTCCAAGACA--------------ACT------GAA-C---TGTGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTGCAACTAAGCCCGACTGGACAACTGAAAATTC----AGA----AATTATACACGG--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--GTTTTTT-TTT-AA----CCTTGATAaa
gi|100359 : CAGGGCTTAACATTAATGCT-CACCCGACTCCCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGGGGGCACAGACT--AGT--AAAATA------TAAGGCGG---CT-AG-CTGACTGGACAAGCGAAAATTC----AGA----AATTTAACATAG--CATC--TCTTTT-T-TTT-TGC--ACATCCC-C---------CTC-TTT-AA----CTTTAATAaa
gi|100360 : CAGAGCTTTACATTAATGCT-TGCTTAACTGTCTACGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAATTG---CT-AGCCCGACTGGACAAGTGAAAATTC----CTA----ATTTAAACATGG--CATC--TCT--T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TGG-GA----CTTTaa
gi|100361 : CAGGGATTTACATTAATGCT-TGCACGACTGTCCGGGACA--------------ACT------CAA-T---CATG--TAGGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGTTG---CT-AGCCCATATGGACAAGTGAAAATTT----ACA----AATTAAACACTG--CATC--TC---T-TATTT-TGC--ACATCCCACA-T--G---TTT-TTT-AA----TTTTAATAtgataaa
gi|100362 : CAGGCCTTTACATTAATGCT-CGCCCGACTGTCCGAGACA--------------ATT------GAA-T---TGAGGGTATGGACA--AG--------------------CTG---CT-AGCTGGACTGGACAAGTGAAATTTC----AGA----AATTAAA-------CATC--TC---T-T-TTC-TGT--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTTAATAga
gi|100363 : CAGGGCTTAACATTAACGCA-CGCCCGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-A---CATGGGTATGGACA--AGT--TGAATG------TAAAGCTG---CT-AGCCCGACTGGACTTGTGCAAAATC----AGA----AATTAAACACGGATC-TC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATCCC-T--T--G---TCT-TGT-Aa
gi|100364 : CAGGGCTTTACATTAATGCT-CGACAGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---CATGGAT---------------------------------G---CT-AGCCAGAGTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATCTATT---T-T-TTT-TGC--ACAATGC-C--A--G---TTT-TTTAAA----CTTTAATAtttgtgattttttaataaa
gi|100365 : CAGGGCTCTACATTAACACT-TGCCAGACTGTCTGAGACA--------------ACT------GAA-T---CTTGGGTACGGAGATTAGT--AAACTA-------AAAG--G---CT-GG------TGGACAAG-GAAAATTCATAAATA----AATTAAACACAG--CATC--T----G-T-TTT-TGA--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTCTAATAaa
gi|100366 : CAGGGCTTTACATTAACGCT-CACCCGACTGTTTGGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGAACAGACA--AGT--GAAACA------TAACGTTT---CT-AGCCTGACTAGACAAGTGAAAATTA----AGAAATTAATTAAACATGG--AATA--TC---T-T-Taa
gi|100367 : CAGGGCTTTACATTA--GCT-TGCCCAACTGTCCGGCCCA--------------ACT------GAA-TAAAC-TGG-TACAGACA--AGT--AAAACA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAAATT----AGA----AATTAAACACCG--TGTA--TT---T-T-TTT-T
gi|100368 : CAGGACTCGACATTAATGCT-CGTCTGACTGTCT-----------------------------------------GGTACAGGCA--TGT--GAAACA------TAAAGTTG---CC-AGCCCAGCTGAACAA
gi|100369 : AGGACTTTACATTTACACT-TGCCCGACTGTCCCGGTCA--------------ACT------GAA-T---CACGGGTACGGACA--AGT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-AGCCTGATTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AGTTAAACACAA--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--ACATCGT-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAATAaagtaa
gi|100370 : AGTGCTTTACATTAACTCT-CATCCGACTGTCCAGGACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACGGACA--AGTG-GAAATT------CAAAaa
gi|100370 : GGACAAGTGGAAATTC----AAA----AATTAAACACAG--CATC--TT---C-T-TTT-TGT--ACATCCC-C--A--G---TTTATTT-AGGTGTTTTTAATAaattaaacacagcatcttctttttgtacatccccagtttatttaggtgtttttaata
gi|100371 : agtgctttacattaactctcatccgactgtccaggacaactgaattgtgggtacAGGGCTTTACATTAATGCT-CGCCTGACTGTCCGGAACA--------------ACT------GAA-T---TGTGGGTACAGACA--AAT--AAAATA------TAAGGCTG---CT-A
gi|100372 : AAGACTTAACATTAAGGGT-AGCTCGACTGTCCGGGACAGGTAAAGATCAGGTACCCGCAGAGAAGT---CACTGATACAGGCA--AGT--GAAATA------AAAAGCTA---AT-AATCCAGCAGGACAAAATAAAACTC----TGA----AATTTAACA
gi|100373 : GGGCTTTACATCAAGGTT--GCCCAAATGTCCAGGACA--------------ACT------GAT-T---CATGGGAACGGACA--AGT--AA--TA------TAAAGCTG---CT-AGCCTGACAGGACAAGTAAAAATTC----AGA----AATTAAGCATGG--CATC--TC---TAT-TTTATGCATACATCCC-G--T------TTT-TTT-AA----
gi|100374 : GCTTTACATTAACGCT-CGCCCGACTGTCCAGGACA--------------AAT------GAA-T---CATGGGTATGGACA--AGT--AAAACA------TAAAACTG---CT-AGCTCGAATGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAATAATGG--CATC--TT---T-T-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTGAATAaggcaataaa
gi|100375 : TTTATATTAACGCT-CGACTGACTGTCTGCGGCA--------------AGT------GAA-T---CATGGGTACAGACA--AGTAAAAAATA------TAAAACTG---CC-AGCCCAACTGGAGAAGTGAAATTTC----AAA----AATTACACACAG--CATC--AA-------TTT-TGT--AAATTCC-C--T--aa
gi|100376 : TACATTAATGCT-CACCAGATTATCCTGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGTTATGGACA--AGA--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGTCCGACTGGACAAGTGAAAAATC----GGA----AATTAAACACGG--CTTT--TC---T-T-TTT-TGC--ATATGCC-C--C--G---
gi|100377 : ACATCAAAACTGTGCTCGGCTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTACAGACA--ATT--TAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCCAACTGGACAAGTGAAAATTC----AGA----AATTAAACACGG--CATC--TC---T-T-GTT-TGT--ACATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CTTTAAT
gi|100378 : CATTAACGCT-CAACCGACTGTTC-----A--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--GAAATA------TGAAGCTG---CT-ATCCTGACTGGAC------AAATTC----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TTT-TGC--AAATTCC-C--T--G---TCT-gaa
gi|100379 : T-CGCCTGACTGTCCGGGACA--------------ACT------GAA-T---CGTGGGTATGGACA--AGT--AAAATA------TAAAGCTG---CT-AGCCAAACAGGACTTGTAAAAGTGT----AGA----AATTAAACATGG--CATC--TC---T-T-TCT-TGC--ATATCCC-C--T--G---TTT-TTG-AA----CTTAAATA
gi|100380 : GACA--A-----AAATA------TAAAGCTG---CA-AGCCCTACTGGAAAAGTGAAAATTC----AGA----AACTAAACTTGG--CATC--TC---T-A-TTT-TGC--ATATCCC-C--T--G---GTT-TTG-AA----CTTTAATaa
gi|100381 : ----AGA----AATTAAACACGT--CATC--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-C--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAtaaa
gi|100382 : TTAAACACGG--CATA--TC---T-T-TTT-CGC--AAATCCC-T--T--G---TTT-TTT-AA----CCTTGATAaa