lowQualScore : 2 22222222222 1 11
lowQualScore : 1 2 1 44444 5 222 1 11 55 55 2 77777 1 8888888888888888 1 33 11 4444 11 1 1 8 1 44444444444 2 1 444444 1 11 77 1 555 2 1 33 99
lowQualScore : . . . ..... . ... . .. .. .. . ..... . ................ . .. .. .... .. . . . . ........... . . ...... . .. .. . ... . . .. ..
lowQualScore : 3 5 2 33333 0 222 2 77 22 00 4 77777 2 0000000000000000 3 22 88 2222 88 3 3 0 3 77777777777 4 4 000000 4 99 44 4 222 8 4 11 11
consensus : TGTT-TCAACATCG-CACA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTCN-AAACATAGTTCAA
Reference ( gi|132738 ) : TGTT-TCAACATCA-CACA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-T-T-TACAACG---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACTTTTCT-AAATATAGTTCAA
gi|132737 : TGTT-TCAACATCT-CACA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--ATGAC--TTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---AT-AT-GCACTCTTCT-AAATATAGTTCAA
gi|132741 : TGTT-TCGACATCA-CACA-T-ATAAA-CTAGAAACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGTTTCT-AAACACATTTTAAa
gi|132746 : TGTT-TCAACATCA-CAGG-C-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTCCT----T--ACA-T-TAT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--ACTTCTA--GT-TACAC---AT-AC-GCACGCTTCT-AAACATAGTTCAAa
gi|132748 : TGTT-ACAACATCA-CACG-T-A---A-CTA---ACATAGAAA--GC--AGGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT----------ACA-C-CAT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-GCACGCTTCT-AAACATTGTTCAAa
gi|132744 : TGTT-TCAACATCA-CACA-T-A---A-CTA---GCACAGAAA--GC--AAGAC---TT-AT-----A-TATA----------------TA-T--AT--ATTTCT----T--ACT-T-TGT-TACAATT---G------TCACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTATA--TT-AACAC---AA-AT-GCGCTTTTCTAAAATATAGTTCAAa
gi|132745 : TGTT-TCAACATCA-CAGA-C-C---A-TTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TGTA----------------TA-T--TT--ATTCCT----T--ACA-T-TAT-TGCAACT---G------TCA-TTT-AAACTTAAAGTTTGA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GTACGCTTCT-AAACATGGTTCAAa
gi|132751 : TGTT-TCAACATCA-CATA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT--T-----ATTATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-TAA-T-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAT------TTTAA-TG--GATTATA--TT-TACAC---AT-AT-GCCCGCTTCT-AAACATAATTCa
gi|132739 : TGTT-TCAACATCG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAA--AC--AGCA---TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACCACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-ACACTTTCGT-AAATAT-CTTCAA
gi|132752 : TGTT-TCAACATCA-CACA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--TGGAC--TTA-AT-----A-TAAA----------------AA-T------ATTTCT----T--ACA-T-TAT-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTGA-TC--AATTTTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCCTCT-AAACATAa
gi|132742 : TGTT-TCAACACCA-CACA-T-A---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AAGAC--TTT-CT-----A-TATATATATATATATATGTATA-T--CT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TTACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---ATAAT-GCATGCTTCTAAAATAAAGTTCAA
gi|132750 : TGTT-TCAACATCA-TACA-T-A---G-CTA---ACACAGGAA--GC--ATGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTTT----T--ACATT-T-T-TATAAT-----------TCA-TAT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---TT-ATCGAACGCTTCTAAAATATAGTTCAAa
gi|132734 : TGTT-TCATCATCG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAC--AC--ACGAA--TTT-CT-----A-TGTA----------------CA-T--TT--ATTTTT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTAT-TT-AACAC---AT-GT-GCAGTTTCTA-AAATATAGTTCAAa
gi|132735 : TGTT-TCACCATCG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAC--AC--ACGTT--TTTTCT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TTCAACAC---AT-GT-GCA-TTTTCTAAAATATAGATCAAa
gi|132736 : TGTT-TCACCATCA-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAC--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT----T--ATA-T-TGT-CCCAACT---G------TCATTTT-TAAC------TTTAA-TG--AATTATGT-TT-AACGC---AT-GT-GCAGTTTCTA-AAATATAGTTCAAa
gi|132743 : TGTT-TCAACATCA-TGCC-T-C---A-TTA---ACACATAAA--GC--TGGAG--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTC-----T--A----------ACAGCT---G------TCA-TTGAAAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT--T-GCAGTTTCTA-AAATATAGTTCAAa
gi|132740 : TGTT-TCACTATCG-TTCA-T-C---A-TTA---ACACATAAA--CC--ACGA---TTT-CG-----A-TATC----------------TA-T--TTTTATTTCT----T--ACA-T-TGT-TTCAACT---G------TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCCT--TT-GACAC---AT-AT-GCAGTTTCTA-AAATATAGTTAAAa
gi|132747 : TGTT-TCACCATCG-CACA-T-C---A-TTT---ACACATAAC--GC--ACGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT----T--ACA-T-TGT-TACAACT---G------TCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTT---------CAT---AT-A--G-----TTCA-AAATACGATTCAAa
gi|132753 : TGTT-TCAACATCA-CATA-C-A---AACTA---ACA-AAAAC--GC--ATTTCCTTTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTT------T--ACA-T-TAT-TACATAT---T------TCG-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACTC---AT-AT-GCATGCTTCT-AAACCTAGTTCAAa
gi|132749 : TGTT-CCAACATCA-CACA-C-A---AACC-----CACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATA----------------TA-C--TT--AT--AC----T--ACA-T-T----ACAACA---TATT---TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--CT-AACAC---AT-GT-GAACGGTTCA-AAACATAGTTCAAa
gi|132757 : TGTT-CCAACATCA-CACA-C-A---A-AAA---AAACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATT----------------TA-C--TT--ATTC------T--ACA-T-T----ATAACA---TATT---TCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACTA---AT-GT-GTACGCTTCA-AAACAAAGTTCAAa
gi|132755 : TGTT-CTAACATCA--ACA-T-A---AACTA---ACA--GAAA--GC---GCAG--TTT-CTTTTCAA-TATA----------------TA-T--TT--ATTCTT----TCTACA-T-TAT-TATAACATCTA------TCT-TTT-AGAC------TTTGA-TT--AATTCTA--TT-AACAC---CC-AT-GTACGCTTCA-AAACATAGTTTAa
gi|132764 : TGTT-TCAACATCA-CACA-T-T---A-CTA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA-----------------A-T--TT--TTTCCTG---T--GTA-T-T-T-T
gi|132763 : TGTT-CCAACATCAACACA---A---A-CTA---ACA--GAAATCGC--AGTTC--CTT-TTTG---A-TATA----------------AA-T--TT--ATTC------T--ACA-T-T-TGTACATCT---T------TCA-GTT-AGAC------TTAAA-TG--AATTTTA--TC-AACAC---AT-AT-GTACGCTTCA-AAACAAAGATCAAggcttacatgacatcccaaa
gi|132754 : TGTT-TCAACATCA-CTCACT-T---G-CTA---ACACAGAAT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-CATA----------------CATT--TT--ATTTCT----T--ACA-T--------AATG---ACATATTTTATTTT-AAAC------TGTAATTGTCAATACT---TA-AACACG--AT-AT---ACGTTTCA-AAACATAGTTTAa
gi|132762 : TGTT-TTACCATTATCGCA-G-A---A-CTA---ACAACGAAA--GCGTAGAAT--TTTTCT-----A-TACA----------------GC-TG-TT--ATTCCTACTTT--AT--T-T-T-TACATCT---A------TCG-TTT-GAAC------TTTAA-TG--AATTCTT--TT-AACAC---AT-AC-ATACGATTCA-AAACATATTTCAAga
gi|132758 : TGTTATCA-CATCA-CACA-CGA---A-CTA----CACATAGT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-AATA----------------TA-T--TT--TATTCT----T--ACA-T-TGT-TACATCT---T------TCCTTTT-AAAC------TGTAA-TT--GTCACTAC-TT-AA-ACTCGAT-AT-ACGC--TTCA-AAACATAGTTCAa
gi|132756 : TGGT-CCAGCATCA-CGCA-C-A---AACTA----CACAAAAC--GC--AGGAC--TTT-AT-----A-TATA----------------CA-T--AT--AATTCT----T--ACA-T-TAT-TACATCT---T------TCATTTT-AAAG------TGTAA-TT--GTCACTACTTT-AATACG--AT-AT-ACGC--TTCA-AAACAAAGTTCAga
gi|132760 : TGTT-TCAACATTG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------Tga
gi|132759 : TGTT-TCAACATTG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132761 : TGTT-TGAACATTG-CACA-T-C---A-TTA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132765 : TCA-CACA---A---C-CTA---ACATA-AAA--GC---GTAG--TTT-CTTTTCGA-TATA----------------TA-T--CT--ATT-CT----T--ACA-T-TAT-TACATCT---T------TCA-TAT-TAAC------TGTAA-TG--GTCACTAC-TT-AA-AC---ATGAT-GCACGCTTCT-AAACATAATTCA
gi|132766 : -CATA-T-A---A-ACA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--ATT-CT-----A-TATA----------------TA-TAATT--ATTTCT----T--ACA-T-TAC-TACAACT---G------TCA-TTT-AAAG------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACAC---AT-TT-GCACGCTTCT-AAATGTTGTTCAAga
gi|132767 : --TTT-CG-----A-TATT----------------AA-T--TC--ATTT------T--ACA-T-TAT-TACATCT---T------TCA-TTT-AAAC------CTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-GT-ATACGCGTCA-AAACATAGTTCGAa
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 5555 1 55555 2 1 222 0 11 55 44 2 77777 1 7777777777777777 1 33 11 222 11 222 444 1 444 9 2 333333 1 11 77 1 555 2 1 00 11
lowQualScore : . .... . ..... . . ... . .. .. .. . ..... . ................ . .. .. ... .. ... ... . ... . . ...... . .. .. . ... . . .. ..
lowQualScore : 3 8888 2 11111 4 2 111 8 77 00 99 4 55555 2 8888888888888888 3 11 88 333 88 333 999 3 777 3 7 888888 3 88 22 3 000 7 3 33 88
consensus : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
Reference ( family-597 ) : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
gi|132734 : TGTT-TCATCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGAA--TTT-CT-----A-TGTA----------------CA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTAT-TT-AACAC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAA
gi|132735 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGTT--TTTTCT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TTCAACAC---AT-GT-GCATTTTCT-AAAATAT--AGATCAAa
gi|132736 : TGTT-TCACCATC--A-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AT---ATTG--TCCCA-AC---TGTCATTTT-TAAC------TTTAA-TG--AATTATGT-TT-AACGC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132737 : TGTT-TCAACATC--T-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--ATGAC--TTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---AT-AT-GCACTCTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132738 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATT---TTACA-AC---GGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACTTTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132739 : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--AC--AGCA---TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACC-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-ACAC-TTTCGTAAATAT---CTTCAA
gi|132740 : TGTT-TCACTATC--G-TTCA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--CC--ACGA---TTT-CG-----A-TATC----------------TA-T--TTTTATTTCT---T--AC---ATTG--TTTCA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCCT--TT-GACAC---AT-AT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTAAAa
gi|132741 : TGTT-TCGACATC--A-CACA-T-ATAAA-C-TAGAAACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGTTTC-TAAACAC--ATTTTAAa
gi|132742 : TGTT-TCAACACC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AAGAC--TTT-CT-----A-TATATATATATATATATGTATA-T--CT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTTACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---ATAAT-GCATGCTTC-TAAA-ATAAAGTTCAAa
gi|132743 : TGTT-TCAACATC--A-TGCC-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--GC--TGGAG--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTC----T--A------------ACA-GC---TGTCA-TTGAAAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT--T-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132744 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---GCACAGAAA--GC--AAGAC---TT-AT-----A-TATA----------------TA-T--AT--ATTTCT---T--AC---TTTG--TTACA-AT---TGTCACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTATA--TT-AACAC---AA-AT-GCGCTTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132745 : TGTT-TCAACATC--A-CAGA-C-C---A-T-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TGTA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTGCA-AC---TGTCA-TTT-AAACTTAAAGTTTGA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-TAAACAT--GGTTCAAa
gi|132746 : TGTT-TCAACATC--A-CAGG-C-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--ACTTCTA--GT-TACAC---AT-AC-GCACGCTTC-TAAACAT--AGTTCAAa
gi|132747 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TT---ACACATAAC--GC--ACGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTTTAAAC------TTTAA-TG--AATTT-----------C---AT-AT-A---G-TTC-AAAATAC--GATTCAAa
gi|132748 : TGTT-ACAACATC--A-CACG-T-A---A-C-TA---ACATAGAAA--GC--AGGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT---------AC---ACCA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-GCACGCTTC-TAAACAT--TGTTCAAa
gi|132749 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---AAC-C-----CACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATA----------------TA-C--TT--AT--AC---T--AC---ATT-----ACA-ACATATTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--CT-AACAC---AT-GT-GAACGGTTC-AAAACAT--AGTTCAAa
gi|132750 : TGTT-TCAACATC--A-TACA-T-A---G-C-TA---ACACAGGAA--GC--ATGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTT--TTATA-AT-----TCA-TAT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---TT-ATCGAACGCTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132751 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT--T-----ATTATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAT------TTTAA-TG--GATTATA--TT-TACAC---AT-AT-GCCCGCTTC-TAAACAT--AATTCa
gi|132752 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--TGGAC--TTA-AT-----A-TAAA----------------AA-T------ATTTCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTGA-TC--AATTTTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCCTC-TAAACAT--
gi|132753 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-CAA---A-C-TA---ACA-AAAAC--GC--ATTTCCTTTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT--T---T--AC---ATTA--TTACA-TA---TTTCG-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACTC---AT-AT-GCATGCTTC-TAAACCT--AGTTCAA
gi|132754 : TGTT-TCAACATC--A-CTCACT-T---G-C-TA---ACACAGAAT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-CATA----------------CATT--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TGACATAT---TTTAT-TTT-AAAC------TGTAATTGTCAATACT---TA-AACACG--AT-AT---ACGTTTC-AAAACAT--AGTTTAa
gi|132755 : TGTT-CTAACATC--A--ACA-T-A---AAC-TA---ACA--GAAA--GC---GCAG--TTT-CTTTTCAA-TATA----------------TA-T--TT--ATTCTT---TCTAC---ATTA--TTATA-ACATCTATCT-TTT-AGAC------TTTGA-TT--AATTCTA--TT-AACAC---CC-AT-GTACGCTTC-AAAACAT--AGTTTAga
gi|132756 : TGGT-CCAGCATCACG-CACA---A---A-C-TA----CACAAAAC--GC--AGGAC--TTT-AT-----A-TATA----------------CA-T--AT--AATTCT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCATTTT-AAAG------TGTAA-TT--GTCACTACTTT-AATACG--AT-AT---ACGCTTC-AAAACAA--AGTTCA
gi|132757 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---A-A-AA---AAACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATT----------------TA-C--TT--ATTC-----T--AC---ATTA--TAACA-TA---TTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACTA---AT-GT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGTTCAAga
gi|132758 : TGTTATCA-CATC--A-CACA-CGA---A-C-TA----CACATAGT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-AATA----------------TA-T--TT--TATTCT---T--AC---ATTG--TTACA-TC---TTTCCTTTT-AAAC------TGTAA-TT--GTCACTAC-TT-AA-ACTCGAT-AT---ACGCTTC-AAAACAT--AGTTCAa
gi|132759 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------Tga
gi|132760 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132761 : TGTT-TGAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132762 : TGTT-TTACCATT--ATCGCA-G-A---A-C-TA---ACAACGAAA--GCGTAGAAT--TTTTCT-----A-TACA----------------GC-TG-TT--ATTCCT------ACTTTATTT--TTACA-TC---TATCG-TTT-GAAC------TTTAA-TG--AATTCTT--TT-AACAC---AT-AC-ATACGATTC-AAAACAT--ATTTCAA
gi|132763 : TGTT-CCAACATC--AACACA---A---A-C-TA---ACA--GAAATCGC--AGTTC--CTT-TTTG---A-TATA----------------AA-T--TT--ATTC-----T--AC---ATTT--GTACA-TC---TTTCA-GTT-AGAC------TTAAA-TG--AATTTTA--TC-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGATCAAa
gi|132764 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-T---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA-----------------A-T--TT--TTTCCTGTGT--AT---TTTGGCTTACA-a
gi|132765 : -CACA-C-A---A-CCTA---ACATA-AAA--GC---GTAG--TTT-CTTTTCGA-TATA----------------TA-T--CT--ATT-CT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TAT-TAAC------TGTAA-TG--GTCACTAC-TT-AA-AC---ATGAT-GCACGCTTC-TAAACAT--AATTCAtgacatcccaaa
gi|132766 : t-CATA-T-A---A-A-CA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--ATT-CT-----A-TATA----------------TA-TAATT--ATTTCT---T--AC---ATTA--CTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAG------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACAC---AT-TT-GCACGCTTC-TAAATGT--TGTTCAAga
gi|132767 : --TTT-CG-----A-TATT----------------AA-T--TC--ATTT-----T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TTT-AAAC------CTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-GT-ATACGCGTC-AAAACAT--AGTTCGAa
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 5555 1 55555 2 1 222 0 11 55 44 2 77777 1 7777777777777777 1 33 11 222 11 222 444 1 444 9 2 333333 1 11 77 1 555 2 1 00 11
lowQualScore : . .... . ..... . . ... . .. .. .. . ..... . ................ . .. .. ... .. ... ... . ... . . ...... . .. .. . ... . . .. ..
lowQualScore : 3 8888 2 11111 4 2 111 8 77 00 99 4 55555 2 8888888888888888 3 11 88 333 88 333 999 3 777 3 7 888888 3 88 22 3 000 7 3 33 88
consensus : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
Reference ( family-597 ) : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
gi|132734 : TGTT-TCATCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGAA--TTT-CT-----A-TGTA----------------CA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTAT-TT-AACAC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAA
gi|132735 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGTT--TTTTCT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TTCAACAC---AT-GT-GCATTTTCT-AAAATAT--AGATCAAa
gi|132736 : TGTT-TCACCATC--A-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AT---ATTG--TCCCA-AC---TGTCATTTT-TAAC------TTTAA-TG--AATTATGT-TT-AACGC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132737 : TGTT-TCAACATC--T-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--ATGAC--TTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---AT-AT-GCACTCTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132738 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATT---TTACA-AC---GGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACTTTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132739 : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--AC--AGCA---TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACC-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-ACAC-TTTCGTAAATAT---CTTCAA
gi|132740 : TGTT-TCACTATC--G-TTCA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--CC--ACGA---TTT-CG-----A-TATC----------------TA-T--TTTTATTTCT---T--AC---ATTG--TTTCA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCCT--TT-GACAC---AT-AT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTAAAa
gi|132741 : TGTT-TCGACATC--A-CACA-T-ATAAA-C-TAGAAACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGTTTC-TAAACAC--ATTTTAAa
gi|132742 : TGTT-TCAACACC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AAGAC--TTT-CT-----A-TATATATATATATATATGTATA-T--CT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTTACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---ATAAT-GCATGCTTC-TAAA-ATAAAGTTCAAa
gi|132743 : TGTT-TCAACATC--A-TGCC-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--GC--TGGAG--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTC----T--A------------ACA-GC---TGTCA-TTGAAAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT--T-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132744 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---GCACAGAAA--GC--AAGAC---TT-AT-----A-TATA----------------TA-T--AT--ATTTCT---T--AC---TTTG--TTACA-AT---TGTCACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTATA--TT-AACAC---AA-AT-GCGCTTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132745 : TGTT-TCAACATC--A-CAGA-C-C---A-T-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TGTA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTGCA-AC---TGTCA-TTT-AAACTTAAAGTTTGA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-TAAACAT--GGTTCAAa
gi|132746 : TGTT-TCAACATC--A-CAGG-C-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--ACTTCTA--GT-TACAC---AT-AC-GCACGCTTC-TAAACAT--AGTTCAAa
gi|132747 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TT---ACACATAAC--GC--ACGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTTTAAAC------TTTAA-TG--AATTT-----------C---AT-AT-A---G-TTC-AAAATAC--GATTCAAa
gi|132748 : TGTT-ACAACATC--A-CACG-T-A---A-C-TA---ACATAGAAA--GC--AGGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT---------AC---ACCA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-GCACGCTTC-TAAACAT--TGTTCAAa
gi|132749 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---AAC-C-----CACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATA----------------TA-C--TT--AT--AC---T--AC---ATT-----ACA-ACATATTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--CT-AACAC---AT-GT-GAACGGTTC-AAAACAT--AGTTCAAa
gi|132750 : TGTT-TCAACATC--A-TACA-T-A---G-C-TA---ACACAGGAA--GC--ATGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTT--TTATA-AT-----TCA-TAT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---TT-ATCGAACGCTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132751 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT--T-----ATTATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAT------TTTAA-TG--GATTATA--TT-TACAC---AT-AT-GCCCGCTTC-TAAACAT--AATTCa
gi|132752 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--TGGAC--TTA-AT-----A-TAAA----------------AA-T------ATTTCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTGA-TC--AATTTTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCCTC-TAAACAT--
gi|132753 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-CAA---A-C-TA---ACA-AAAAC--GC--ATTTCCTTTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT--T---T--AC---ATTA--TTACA-TA---TTTCG-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACTC---AT-AT-GCATGCTTC-TAAACCT--AGTTCAA
gi|132754 : TGTT-TCAACATC--A-CTCACT-T---G-C-TA---ACACAGAAT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-CATA----------------CATT--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TGACATAT---TTTAT-TTT-AAAC------TGTAATTGTCAATACT---TA-AACACG--AT-AT---ACGTTTC-AAAACAT--AGTTTAa
gi|132755 : TGTT-CTAACATC--A--ACA-T-A---AAC-TA---ACA--GAAA--GC---GCAG--TTT-CTTTTCAA-TATA----------------TA-T--TT--ATTCTT---TCTAC---ATTA--TTATA-ACATCTATCT-TTT-AGAC------TTTGA-TT--AATTCTA--TT-AACAC---CC-AT-GTACGCTTC-AAAACAT--AGTTTAga
gi|132756 : TGGT-CCAGCATCACG-CACA---A---A-C-TA----CACAAAAC--GC--AGGAC--TTT-AT-----A-TATA----------------CA-T--AT--AATTCT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCATTTT-AAAG------TGTAA-TT--GTCACTACTTT-AATACG--AT-AT---ACGCTTC-AAAACAA--AGTTCA
gi|132757 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---A-A-AA---AAACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATT----------------TA-C--TT--ATTC-----T--AC---ATTA--TAACA-TA---TTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACTA---AT-GT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGTTCAAga
gi|132758 : TGTTATCA-CATC--A-CACA-CGA---A-C-TA----CACATAGT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-AATA----------------TA-T--TT--TATTCT---T--AC---ATTG--TTACA-TC---TTTCCTTTT-AAAC------TGTAA-TT--GTCACTAC-TT-AA-ACTCGAT-AT---ACGCTTC-AAAACAT--AGTTCAa
gi|132759 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------Tga
gi|132760 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132761 : TGTT-TGAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132762 : TGTT-TTACCATT--ATCGCA-G-A---A-C-TA---ACAACGAAA--GCGTAGAAT--TTTTCT-----A-TACA----------------GC-TG-TT--ATTCCT------ACTTTATTT--TTACA-TC---TATCG-TTT-GAAC------TTTAA-TG--AATTCTT--TT-AACAC---AT-AC-ATACGATTC-AAAACAT--ATTTCAA
gi|132763 : TGTT-CCAACATC--AACACA---A---A-C-TA---ACA--GAAATCGC--AGTTC--CTT-TTTG---A-TATA----------------AA-T--TT--ATTC-----T--AC---ATTT--GTACA-TC---TTTCA-GTT-AGAC------TTAAA-TG--AATTTTA--TC-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGATCAAa
gi|132764 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-T---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA-----------------A-T--TT--TTTCCTGTGT--AT---TTTGGCTTACA-a
gi|132765 : -CACA-C-A---A-CCTA---ACATA-AAA--GC---GTAG--TTT-CTTTTCGA-TATA----------------TA-T--CT--ATT-CT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TAT-TAAC------TGTAA-TG--GTCACTAC-TT-AA-AC---ATGAT-GCACGCTTC-TAAACAT--AATTCAtgacatcccaaa
gi|132766 : t-CATA-T-A---A-A-CA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--ATT-CT-----A-TATA----------------TA-TAATT--ATTTCT---T--AC---ATTA--CTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAG------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACAC---AT-TT-GCACGCTTC-TAAATGT--TGTTCAAga
gi|132767 : --TTT-CG-----A-TATT----------------AA-T--TC--ATTT-----T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TTT-AAAC------CTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-GT-ATACGCGTC-AAAACAT--AGTTCGAa
blockSeqs : A ACG C ATAA A C GAA TC GC CT T TTTCA T TATATATATATATGTA T AA TT GTG CT TTT GGC T ATA T A TTAAAG T TC CT C TCG A C TA AA
blockSeqs : . AT . AA A . . . GC CT T TTTCG . . . G . . . . G . ATC T T . . . T . G G . GT .
blockSeqs : . AA . GA . . . . GT CT . TG . . . . . . . . G . . C . . . . C . G . . TA .
blockSeqs : . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . C . . . . TA .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . TA .
blockSeqs : . T . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . TA .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . A . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . G . C . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T .
blockSeqs : . G . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . A . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : ** N*
originalCons : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
finalCons : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTCN-AAACAT--AGTTCAA
Alignments
lowQualScore : 11
lowQualScore : 1 5555 1 55555 2 1 222 0 11 55 44 2 77777 1 7777777777777777 1 33 11 222 11 222 444 1 444 9 2 333333 1 11 77 1 555 2 1 00 11
lowQualScore : . .... . ..... . . ... . .. .. .. . ..... . ................ . .. .. ... .. ... ... . ... . . ...... . .. .. . ... . . .. ..
lowQualScore : 3 8888 2 11111 4 2 111 8 77 00 99 4 55555 2 8888888888888888 3 11 88 333 88 333 999 3 777 3 7 888888 3 88 22 3 000 7 3 33 88
consensus : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
Reference ( family-597 ) : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCTTC-NAAACAT--AGTTCAA
gi|132734 : TGTT-TCATCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGAA--TTT-CT-----A-TGTA----------------CA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTAT-TT-AACAC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAA
gi|132735 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--AC--ACGTT--TTTTCT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCATTTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TTCAACAC---AT-GT-GCATTTTCT-AAAATAT--AGATCAAa
gi|132736 : TGTT-TCACCATC--A-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAC--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AT---ATTG--TCCCA-AC---TGTCATTTT-TAAC------TTTAA-TG--AATTATGT-TT-AACGC---AT-GT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132737 : TGTT-TCAACATC--T-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--ATGAC--TTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---AT-AT-GCACTCTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132738 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATT---TTACA-AC---GGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACTTTTC-TAAATAT--AGTTCAAa
gi|132739 : TGTT-TCAACATC--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--AC--AGCA---TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACC-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-ACAC-TTTCGTAAATAT---CTTCAA
gi|132740 : TGTT-TCACTATC--G-TTCA-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--CC--ACGA---TTT-CG-----A-TATC----------------TA-T--TTTTATTTCT---T--AC---ATTG--TTTCA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCCT--TT-GACAC---AT-AT-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTAAAa
gi|132741 : TGTT-TCGACATC--A-CACA-T-ATAAA-C-TAGAAACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGTTTC-TAAACAC--ATTTTAAa
gi|132742 : TGTT-TCAACACC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AAGAC--TTT-CT-----A-TATATATATATATATATGTATA-T--CT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTTACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---ATAAT-GCATGCTTC-TAAA-ATAAAGTTCAAa
gi|132743 : TGTT-TCAACATC--A-TGCC-T-C---A-T-TA---ACACATAAA--GC--TGGAG--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTC----T--A------------ACA-GC---TGTCA-TTGAAAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT--T-GCA-GTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132744 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---GCACAGAAA--GC--AAGAC---TT-AT-----A-TATA----------------TA-T--AT--ATTTCT---T--AC---TTTG--TTACA-AT---TGTCACTTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTATA--TT-AACAC---AA-AT-GCGCTTTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132745 : TGTT-TCAACATC--A-CAGA-C-C---A-T-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TGTA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTGCA-AC---TGTCA-TTT-AAACTTAAAGTTTGA-TA--AATTCTA--TT-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-TAAACAT--GGTTCAAa
gi|132746 : TGTT-TCAACATC--A-CAGG-C-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTCCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--ACTTCTA--GT-TACAC---AT-AC-GCACGCTTC-TAAACAT--AGTTCAAa
gi|132747 : TGTT-TCACCATC--G-CACA-T-C---A-T-TT---ACACATAAC--GC--ACGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------CA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATTG--TTACA-AC---TGTCA-TTTTAAAC------TTTAA-TG--AATTT-----------C---AT-AT-A---G-TTC-AAAATAC--GATTCAAa
gi|132748 : TGTT-ACAACATC--A-CACG-T-A---A-C-TA---ACATAGAAA--GC--AGGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT---------AC---ACCA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TA--AATTCTA--TT-AACAT---AT-AT-GCACGCTTC-TAAACAT--TGTTCAAa
gi|132749 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---AAC-C-----CACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATA----------------TA-C--TT--AT--AC---T--AC---ATT-----ACA-ACATATTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--CT-AACAC---AT-GT-GAACGGTTC-AAAACAT--AGTTCAAa
gi|132750 : TGTT-TCAACATC--A-TACA-T-A---G-C-TA---ACACAGGAA--GC--ATGAC--TTT-CT-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATTTTT---T--AC---ATTT--TTATA-AT-----TCA-TAT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--AT-AACAC---TT-ATCGAACGCTTCTAAAATAT--AGTTCAAa
gi|132751 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT--T-----ATTATA----------------TA-T--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAT------TTTAA-TG--GATTATA--TT-TACAC---AT-AT-GCCCGCTTC-TAAACAT--AATTCa
gi|132752 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-A---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--TGGAC--TTA-AT-----A-TAAA----------------AA-T------ATTTCT---T--AC---ATTA--TTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAC------TTTGA-TC--AATTTTA--TT-AACAC---AT-AT-GCACGCCTC-TAAACAT--
gi|132753 : TGTT-TCAACATC--A-CATA-CAA---A-C-TA---ACA-AAAAC--GC--ATTTCCTTTT-CA-----A-TATA----------------TA-T--TT--ATT--T---T--AC---ATTA--TTACA-TA---TTTCG-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACTC---AT-AT-GCATGCTTC-TAAACCT--AGTTCAA
gi|132754 : TGTT-TCAACATC--A-CTCACT-T---G-C-TA---ACACAGAAT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-CATA----------------CATT--TT--ATTTCT---T--AC---ATAA--TGACATAT---TTTAT-TTT-AAAC------TGTAATTGTCAATACT---TA-AACACG--AT-AT---ACGTTTC-AAAACAT--AGTTTAa
gi|132755 : TGTT-CTAACATC--A--ACA-T-A---AAC-TA---ACA--GAAA--GC---GCAG--TTT-CTTTTCAA-TATA----------------TA-T--TT--ATTCTT---TCTAC---ATTA--TTATA-ACATCTATCT-TTT-AGAC------TTTGA-TT--AATTCTA--TT-AACAC---CC-AT-GTACGCTTC-AAAACAT--AGTTTAga
gi|132756 : TGGT-CCAGCATCACG-CACA---A---A-C-TA----CACAAAAC--GC--AGGAC--TTT-AT-----A-TATA----------------CA-T--AT--AATTCT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCATTTT-AAAG------TGTAA-TT--GTCACTACTTT-AATACG--AT-AT---ACGCTTC-AAAACAA--AGTTCA
gi|132757 : TGTT-CCAACATC--A-CACA-C-A---A-A-AA---AAACAGAAA--GCGCAGTTCCTTTT-CG-----A-TATT----------------TA-C--TT--ATTC-----T--AC---ATTA--TAACA-TA---TTTCA-TTT-AAAC------TTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACTA---AT-GT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGTTCAAga
gi|132758 : TGTTATCA-CATC--A-CACA-CGA---A-C-TA----CACATAGT--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-AATA----------------TA-T--TT--TATTCT---T--AC---ATTG--TTACA-TC---TTTCCTTTT-AAAC------TGTAA-TT--GTCACTAC-TT-AA-ACTCGAT-AT---ACGCTTC-AAAACAT--AGTTCAa
gi|132759 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------Tga
gi|132760 : TGTT-TCAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132761 : TGTT-TGAACATT--G-CACA-T-C---A-T-TA---ACACATAAT--GC--ACGAT--TTT-CT-----A-TATA----------------T
gi|132762 : TGTT-TTACCATT--ATCGCA-G-A---A-C-TA---ACAACGAAA--GCGTAGAAT--TTTTCT-----A-TACA----------------GC-TG-TT--ATTCCT------ACTTTATTT--TTACA-TC---TATCG-TTT-GAAC------TTTAA-TG--AATTCTT--TT-AACAC---AT-AC-ATACGATTC-AAAACAT--ATTTCAA
gi|132763 : TGTT-CCAACATC--AACACA---A---A-C-TA---ACA--GAAATCGC--AGTTC--CTT-TTTG---A-TATA----------------AA-T--TT--ATTC-----T--AC---ATTT--GTACA-TC---TTTCA-GTT-AGAC------TTAAA-TG--AATTTTA--TC-AACAC---AT-AT-GTACGCTTC-AAAACAA--AGATCAAa
gi|132764 : TGTT-TCAACATC--A-CACA-T-T---A-C-TA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--TTT-CT-----A-TATA-----------------A-T--TT--TTTCCTGTGT--AT---TTTGGCTTACA-a
gi|132765 : -CACA-C-A---A-CCTA---ACATA-AAA--GC---GTAG--TTT-CTTTTCGA-TATA----------------TA-T--CT--ATT-CT---T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TAT-TAAC------TGTAA-TG--GTCACTAC-TT-AA-AC---ATGAT-GCACGCTTC-TAAACAT--AATTCAtgacatcccaaa
gi|132766 : t-CATA-T-A---A-A-CA---ACACAGAAA--GC--AGGAC--ATT-CT-----A-TATA----------------TA-TAATT--ATTTCT---T--AC---ATTA--CTACA-AC---TGTCA-TTT-AAAG------TTTAA-TG--AATTATA--TT-AACAC---AT-TT-GCACGCTTC-TAAATGT--TGTTCAAga
gi|132767 : --TTT-CG-----A-TATT----------------AA-T--TC--ATTT-----T--AC---ATTA--TTACA-TC---TTTCA-TTT-AAAC------CTTAA-TG--AATTCTA--TT-AACAC---AT-GT-ATACGCGTC-AAAACAT--AGTTCGAa