lowQualScore : 22
lowQualScore : 66
lowQualScore : ..
lowQualScore : 55
consensus : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
Reference ( gi|28565 ) : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28568 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28567 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28564 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28569 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28566 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28581 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28570 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28582 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28571 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28585 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28574 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28586 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28575 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28588 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28577 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28583 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28572 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28590 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28579 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28591 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28580 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28587 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28576 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28589 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28578 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28584 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28573 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28594 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28592 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28595 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28593 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28597 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT
gi|28596 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
Reference ( family-594 ) : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28564 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28565 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28566 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28567 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28568 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28569 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28570 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28571 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28572 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28573 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28574 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28575 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28576 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28577 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28578 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28579 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28580 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28581 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28582 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28583 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28584 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28585 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28586 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28587 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28588 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28589 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28590 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28591 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28592 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28593 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28594 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28595 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28596 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT
gi|28597 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT
blockSeqCons :
originalCons : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
finalCons : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
Alignments
lowQualScore :
lowQualScore :
lowQualScore :
consensus : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
Reference ( family-594 ) : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28564 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28565 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28566 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28567 : AGTGTAGTATTTGACATAAACGATAAATATGACAATGTAATATATGTGTTTATGTCTAGTATA
gi|28568 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTCTATATGTGTTTATGTGTAGTATA
gi|28569 : AGTGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTTATATATGTAT
gi|28570 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28571 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28572 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28573 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28574 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28575 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28576 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28577 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28578 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28579 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28580 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28581 : GTGTAGTATTTGACATTAACAATAAGTATGACACTGTAATATATGTGTTTATGTGAAGTATA
gi|28582 : GTGTGGTATATGACATCAACAATAGATATGACATTGTTATATATGTGTTTACGTGTGATAT
gi|28583 : GTGAAATATTTGCCATTAACAATAAATATGACATTGTAATATATGTGTTTATATGTAGTAT
gi|28584 : GTTTATTATTTGACACAAACAATTAATATGACAATGTGATATATGTGTTGATGTGAAGTAT
gi|28585 : GTGTGATATTAGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATGTATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28586 : GTTTATTATTTGACATCAACAATAAATATGACACTGTAATATAAGTGTTTATGTGTATTAT
gi|28587 : GTGTATTATTTGACATCAACAATACATATGATATTGTAATATATGTGTTTATGT
gi|28588 : GTTTATTATTTGACGTCAACAATAAATATGGCACTGTAATATATGTGTTTAAGTGTAGTAT
gi|28589 : GTGTGGTATATGACATAAACAATAAATATGAAACTGTAATATATGGGTTGATTTGTAGTAT
gi|28590 : GTGAAGTATTTGACATCAATAATAAATATGACACTGAAACATATCTGTTTATGTGTGGTATA
gi|28591 : GTGTAGTATATGACATCAGCAATGAATATGGAACTGTAATATATGCGTTTATGAGTAGTAT
gi|28592 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28593 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28594 : TGTAGTATGTAACATCAACAATAAATATGGCATTGTAATATATGTGTTTATGTGTAGTAT
gi|28595 : TGTAGTATTTGACATCAACAATAAATATGAGTTTGTAATATATGTCTTTATGTGTGGTATA
gi|28596 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT
gi|28597 : GTAGTATTTTACATCAACAAATAATATGACACTGTCATATATGTGTTAATGTTTATTAT