lowQualScore : 1 222222 3333333 1
lowQualScore : 8 0 3333 1 3 0 2 1 3 333333 44 1 4 1 2222 1 5 0 888 1 11 1 333333 7 2222 0 444444 0 1 11 33333 444 333333 1 4444 222 1111111 11 1 2 999 1 222 44
lowQualScore : . . .... . . . . . . ...... .. . . . .... . . . ... . .. . ...... . .... . ...... . . .. ..... ... ...... . .... ... ....... .. . . ... . ... ..
lowQualScore : 7 2 5555 7 4 3 3 7 3 222222 77 7 7 1 9999 4 9 2 888 4 55 4 333333 0 9999 6 333333 4 7 77 22222 000 777777 8 0000 333 2222222 88 4 7 222 4 555 11
consensus : TTTCNGTTTGANCATTTT----TATTAA-TTACGAT-A-ANC----C-GGC-CCTTGAGNTTTGAA----CCGCACA-AATAAAT--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTCA--T---TCAAT----TCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GC-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TTA------TGT--ATCA-ATATGTCTG-N-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
Reference ( gi|42783 ) : TTTCGGTTTGAACATTTT----TATTAA-TCACGAT-A-ATA----C-AGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AACAAAC--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCA--T---TCATT----TCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATTTCTG-T-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42781 : TTTCGGTTTGAACATTTT----TATTAA-TCTTGAT-A-ATA----C-AGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AACAAAC--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCA--T---TCATT----TCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATTTCTG-T-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42768 : aTTTCGGTTTGAACATTTT----TATTAA-TCTTGAT-A-ATA----C-AGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AACAAAC--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCA--T---TCATT----TCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATTTCTG-T-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42769 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----TATCAA-AAACGAT-A-ATA----C-AGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AACAAAC--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCA--C---TCATTCAATTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAAATTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATTTCTG-T-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42770 : gaTTTCTGTTCGAACATTTT----TATTTA-TTACGAT-A-AAA----C-GGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AACAAAC--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTTATTACTCA--T---TCAAT----TCCCACAGATAGTGAGACACTCAAAGGCTATTAGAAATTTCTTAAG--GT-----AT---ATAC------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATGTCTG-T-CTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TAAAAAAAA
gi|42771 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----TACCAA-TTACGAT-A-AGC----C-GGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AATAAAT--TATCT-GGATTG-GGTGGGCACTGTTCGCTACTCA--T---TCAAT----TCTCACAGACAGTGAGACACTCAGTGGCTTTTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TTG------TGT--ATTA-ATATGTCTG-A-TTTTGTT-CAAC---TAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAA
gi|42772 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----TACTAA-TTACGAT-A-AAC----C-GGC-CCTTGAGATTTGGA----CTACACA-AATAAAT--TATCT-GGATTT-AATGAGC--TGTTCATTACTCA--T---TCAAT----TTCCACTAACAGTGAGACACTCAATGGTTATTAGAAGTTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TTG------TGT--ATCA-ATATGTCTG-A-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42773 : gaTTTCTGTTTGAGGATTTT----CGCTTA-TTACGAT-A-AAA----C-GGC-CCTTGAGCTTTGAA----CTACACA-AACAAAT--TATCT-GAACTT-AGTGGGCACTGTTCGGTAATCA--T---TCAGT----TCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAGCT----AC---TTG------TGT--ATCG-ATATGTCTG-A-TTTTGTA-AAAC---AAAATTG-AAT-AAAGT--TACAAAAAA
gi|42774 : gaTTTCTGTTTGAATATTTT----TATTAA-ATACGAT-A-ATC----C-GGC-CCTTGAGATTTAAA----CTACACA-AATAAAC--T----------------------GTTTGTTACTGA--C---TCAAT----TCCCACAGCCAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCG-ATATGTCTG-T-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGATATAAAAAT--TACAAAAAA
gi|42775 : gaTTTCTGTTTGAACATTGT----TACTAA-TTACGAT-A-AAC----C-CTC-CCTTGAGATTTAAA----CTACATA-AATTAAT--TATCT-GGATTT-AGTGGGCACTGTTCATTACTAA--T---TCAAT----ACCCGCAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAAT--AT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAAAT----AT---TTG------TGT--ATCA-ATATGTCTG-G-TTTTGTA-
gi|42784 : gaTTCCTGTTTGATCATGTT----TATCAA-TTACGTT-A-AAC----C-GGC-CCTTGAGCCTTGTA----CCGCACA-AATAAAT--CATCT-GGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTCA--T---TCAAT----TCTAACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAAT--GC-----AA---ATAT------AATTGTCATTAACT----AT---TTATTTA--TGT--ATCA-ACATGTTTG-A-TTATGTA-AAAC---TAAATTTAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42785 : TTCCTGTTTGATCATGTT----TATTAA-TTACGTT-A-AAC----C-GGC-CCTTGAGCCTTGTA----CCACACA-ATTAAAT--CATCT-GGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTCA--T---TCAAT----TCTCACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAAT--GC-----AA---ATAT------AATTGTCATTAACT----AT---TTATTTA--TGT--ATCA-ACATGTGTG-A-TTATGTA-AAAT---T-AATTGAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42786 : TTCCTGTTTGGTCATTTT----TATTAA-TTACGTTTA-AC-----C-GGC-CCTTGTGCCTTGAA----CCACATA-AATAAGA--TATCT-GGATT--AGTGAGCAATCTTCGTTACTCA--T---TCAAT----TCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTCCTGAATAATTCTAAAT--GC-----AA---ATAT------AATTGACATGCACT----AT---TTA------TGT--ATCA-ACATGTCTG-A-CTATGTG-AATC---TAAATTGAAATAAAAGT--TACACAAA
gi|42787 : TTCCTGTTTGATCATTTT----TATTAA-TTACTTT-A-AAC----C-GGC-CCTTGAGTTTCGAA----CCACACA-AATAAAG--TATCT-GGATTA-AGTGAGTACTGTTCGTTACTTA--T---TCAAT----TCTCACAGACAGTGAGCTACTCAATAGCTATTGAATGTTTCTAAAT--GC-----AA---ATAC------AATTGCCAAGAACTC---AT---TA-------TGT--ATCA-ACATGTCTG-A-CTATGTA-ACAC---TAAATTGAAATAATAATGATACA
gi|42789 : TTTCAGTTTGA---TTTT----TTTTTA-TCA-AAT-ATGTAAAACC-GGC-CCCTGAGTTGTGAA----TCGCACT-AATAAA------------TTT-AGTAGGCACTGCTATTTACTCA--A---TCATT----TCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAAT--GC-----AT---ATA--------ATTGTCATGAGAT----AC---TTA------TGT--ATCA-ATATGTCTGAT-TTTTGTA-CAAC---TCAATTGAAATAAAAAT--TACAAAAA
gi|42788 : TTTCAGTTTGATTATTTT----TATTAA-TTATGTG-A-AAC----C-AGC-CCTTAAGCTTCGAG----CCACACA-AATACAT--TATCC-GGATTT-AGTGGGAACTGTT
gi|42790 : TTTCAGTTTGA---TTTT----TTTTTA-TCA-AAT-ATGTAAAACC-GGC-CCCTGAGTTGTGAA----TCGCACT-AATAAA------------TTT-AGTAGGCACTGCTATTTACTCA--A---TCATT----TCTCACAGACAATA--------AATGGTAGTTAGAAATTATTAAAT--G-------C---ATAT------AATTGTCATGAAAT----AC---TTA------TGT--ATCA-ATATGTCTGAT-TTTTGTA-CAAC---TCAGTTATAATAAAAAA--TACAAAAAccgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaacactgtttgttactcattcaattctcacatacattaattttaatggctattagaaatttattaatgcatatataattgtcatgaaatatttatgtaatactatatctgtttttgtacaataaattgaaatgaaagttacaaaaaa
gi|42777 : TTTCAGTTTGATAATCTT----CATTAG-ATACGTG-A-AT-----C-GGC-CCTTGAGCTTTTAG----TGGCTCA-AATACAT--GACCT-GGAATG-AGTGGGAACTGCTTGTTCCTCA--A---TCATT----TTTCACAGACACTG----ACTGGTTGGCTGTTAGAAATTACTGAAT--GC----------------------------TGAAAT----AT---TTC------TGT--ATCA-ACATGTCTT-A-TTTTGT---AAC---TAAATTGAAA-ACAAAT--TACAA
gi|42779 : gaTCTCAGTTTGATTGTTTG----TTTTAA-ACAAGTT-A-AAG----C-AGCTCCTTG-GTTCTGAG----CGGCATA-AA-ATACA-TTTCTTAAATTG-ACTGGGTACTGTTCACTGCTCA--T---CCATT----TCTCTC------TGA--CATTTAATGGCTATCAGAAATTGCAAAAT--TC-----ACAA-ATAT------AATTGTCATGAAAT----GT---TTATA----TGT--ACCA-ACATGTCTG-TATTTTGTA-TAAC---GAATTGGAAATAAAAG---TAGAAAAAA
gi|42791 : gaTTTTTGTTTGA-TATTTTCTTTTATAAA-ATACGTT-A-AAC----C-GAC-CCCTGAGCATTGAA----CCGCACA-AATACAG--TATCT-GGATTG-AGCGGGCACTGCTCGTTA-------------TT----TCTCACAGACA--------CTTAATGGCTATCAGAAATTAATAAAT--GC-----AT---ATAT------AACTGCCATGA------------TT-------TA---ATCATATA------------CGTATCAACACATCAGTTAAAAT-ACGGT--TACAAAAAA
gi|42778 : TTTTAGTTTGATTATTTT----TATTAA-TTACG-T-A-AAA----CCGGC-ACTTGAACTTTGAG----CCACAC---------------T-GGACTT-AGTGGGCACTGTTAGTTACTCT--T---TCAAT----CCTCACAGA------------------CTATTAGAAATTACT-ATT--GC-----AA---ATAT------AATTGTCATGAAAT----AT---Taaactaaatattgaacttgataacttaagtta
gi|42780 : gaTTTCTCTTTGAACATTTT----TATTAA-TAAAGAA-A-ATC----C-GGT-CCTTGAGATTTAAA----CTTCACA-AATACAC--TATCT-GGATTT-AGT
gi|42782 : gaTCAGTTTGGGAGTATT----TATTAAATTAGGGA-A-ACT----G-ACC-CCATG-GTTCTGAC----CGGCACA-GG-AAACATTATTT-GTATTG-AGAGGGCACTGCTTGCTACTCA-----------------------AC-------CACTTAATGGCTATCGGAAATTACTAAAT--ATACATCAC---ATAT------AATTGTCATGA--C----ATGCGTA-------TGT--ACCA-AAATGTATA-T-ATTTGTA-TAAC---TGATTTGAAATAAATGT--TAAAA
gi|42776 : ataTTAATCATTTT----TATTAA-TTACGAT-A-AAC----C-GGC-CGTCGAGCTATCAA----CCACACA-AGTACAT--CATCA-GGATAT-AGAGGACACTGTTCGTTACTCA--T---TTAAT----TCTCACAAACATTG------T--ATGGCTATTAGAAATTTTTGAAT--GC-----AT---ATAT------AATTGTCATGAAAT----AT---TTA------TGT--ATCA-ACATGTCTG-A-TTTTGTC-TGAC---TAAATTGAAATGAAAG----ATAAAAAA
gi|42792 : gatttctcTTT----TACTTA-TTAGGAT-A-A-A----C-CGG-CCTTGACATTTCAA----CTACACA-AATAAAT--GATCT-GGATTT-AGTTGGCATCGTACGTTATTCA--T----CAAC----TCCCACAGACA------------ATGGCTATTAGAAATTTCTAAAC--GT-----AT---ATAT------AATTATCATGAACTATTAAT---TT-------TGTGCATCA-ATATGTCTG-A-TTTTGTA-CAAC---TAAATTGAAATAAAAAT--
gi|42793 : TGA-ATTTAAATAATCT-CA-A-AATACAT--TATCT-GGATTT-AGTGGGCAATGTTCGTTATTCA--T---TCAAT----TCTCAC--------AGACACTTAATGGCTATAAGAAATTACTGAAT--GC-----AT---ATAT------AATTGTCGTGAAAT----AG---TTAA-----TGT--ATGA-G------------TTTGTA-CAAC---TAAACTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42794 : AGCTTTGAG----TTGCACA-AATACAT--TACCT-GGATTG-AGTGTGTACTGCTTGTTACTAA--TAAGTGAT--------CAC--------AGATACTTAATGGCAGTCAGAAATTACTAAAT--GC-----AT---ATAT------AATTGTCATCAAAT----AT---TTA------TGT--ATCA-ACATGTCTG-A-TTTTGTA-CAAC---TAAACTAAAATAAAAGTAATACAAAAAA
gi|42795 : GATTCAA------CACA-A-AATATAT--TATCC-GGATTTGAGTGCGCATTGCGCATCTCTCA--A---TCAAT----TCTCACAG--------ACGCTTAATGGCAATCAG--------------GC-----AT---G---------AATTATCATGAACT----AT---TTATAACCATGT--ATCA-ACATATTAG-A-TTCTGTA-CAAC---TAAACTGAAATTAAA-----ACGAAAAA
gi|42796 : AAA----CTGAA-A-AATAAAA--TGCTT-GGATTT-AGTG-------TTTGTTACTCA--T---TCAAT----TCCCACAGATAGTGAGAGACTCAATGGCTATTAAAAATTTCTTATT--GT-----AT---ATAT------AATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATGTCTG-T-TTTTGTA-CAAA---TGAATTAA
gi|42797 : ----CTGCACAGAATACGT--TAATT-GGATTG-AGTGGGTACTGCACGCTACTCA--A---ACATT----TCCC--------TCAGACACTTACTGGCTATCAGAAATTACTGTAT--G
gi|42798 : -AATAGACACTGCTTGCTACTCAACT---TTTTC----TCCCA----------GACACTCAATGTCTATCAGAAACTGCTTTATTCAT-----ATAAAATAT------AATTGTCACGAAAT----GC---TC-------TAT--AT
gi|42788 : CACTGTTTGTTACTCA--T---TCAAT----TCTCACATACATTAAT---TTTAATGGCTATTAGAAATTTATTAAT--GC-----AT---ATAT------AATTGTCATGAAAT----AT---TTA------TGT--AATA-CTATATCTG-T-TTTTGTA-CAA----TAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAA
gi|42799 : tttcagtttgattatttttattaattatgtgaaaccagcccttaagcttcgagccacacaaatacattatccggatttagtgggaactgttccgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaaTGTCTATCAGAAATTACTAAAT--AC-----AT---AT--------------TATGA-TT----AT---TTA------TGT--ATCA-ACATGTCT------------CAAC---TTAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAA
gi|42800 : AATTTCTAAAT--GT-----AT---ATAA------AATTGTCATGAAAT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATGTCTG-T-TTTTGT---AAC---TAAATTAAAATAAAATT--TACAAAAAA
gi|42801 : TAAAT--GT-----AT---ATATACATATAATTGTCATGAACT----AT---TT-------TGT--ATCA-ATATGTCTG-T-TTTTGT----AC---TAAATTGAAATAAAAGT--AAAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 1 1 3333 3 1 4 1 1 1 1 22 1 2 1 1 2222 11 1 3 0 0 0 1 33333 44444 333333 2222 66666 33333 11 2222222 55 33
lowQualScore : . . .... . . . . . . . .. . . . . .... .. . . . . . . ..... ..... ...... .... ..... ..... .. ....... .. ..
lowQualScore : 0 0 4444 2 6 0 0 6 6 0 00 3 7 3 3 8888 88 3 6 8 6 1 4 00000 88888 666666 7777 22222 22222 88 8888888 99 99
consensus : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
Reference ( family-592 ) : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGATAANCCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42768 : TTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42769 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATCAA-AAACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCACTCA--TTCAATTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAAATTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42770 : gaTTTCTGTTCGAACATTTT----T-ATTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTATTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGACACTCAAAGGCTATTAGAAATTTCTTAAGG-----TAT-----ATACA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TCTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TAAAAAAAA
gi|42771 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACCAA-TTACGATAAGCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTG-GGTGGGCACTGTTCGCTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAGTGGCTTTTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATTAATATGTCTG-ATTTTGTTCAACTAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAA
gi|42772 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACTAA-TTACGATAAACCGGC-CCT-TGAGATTTGGACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AATGAGC--TGTTCATTACTC----A--TTCAATTTCCACTAACAGTGAGACACTCAATGGTTATTAGAAGTTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42773 : gaTTTCTGTTTGAGGATTTT----C-GCTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGCTTTGAACTACACA-AA-CAA-ATTATCTGAACTT-AGTGGGCACTGTTCGGTAATC----A--TTCAGTTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----GC----TA-----CT--T------GTGTATCGATATGTCTG-ATTTTGTAAAACAAAATTG-AAT-AAAGT--TACAAAAAA
gi|42774 : gaTTTCTGTTTGAATATTTT----T-ATTAA-ATACGATAATCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-A---------------------CTGTTTGTTACTG----A--CTCAATTCCCACAGCCAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCGATATGTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGATATAAAAAT--TACAAAAAA
gi|42775 : gaTTTCTGTTTGAACATTGT----T-ACTAA-TTACGATAAACCCTC-CCT-TGAGATTTAAACTACATA-AA-TTA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCATTACTA----A--TTCAATACCCGCAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATA-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-GTTTTGTA
gi|42776 : gaTTTCT-CTTAATCATTTT----T-ATTAA-TTACGATAAACCGGC-CGT-CGAGCTATCAACCACACA-AG-TAC-ATCATCAGGATAT-AGAGGACACTGTTCGTTACTC----A--TTTAATTCTCACAAACATTG------T--ATGGCTATTAGAAATTTTTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTCTGACTAAATTGAAATGAAAG----ATAAAAAA
gi|42777 : gaTTTCAGTTTGATAATCTT----C-ATTAG-ATACG-TGAATCGGC-CCT-TGAGCTTTTAGTGGCTCA-AA-TAC-ATGACCTGGAATG-AGTGGGAACTGCTTGTTCCTC----A--ATCATTTTTCACAGACACTG----ACTGGTTGGCTGTTAGAAATTACTGAATG-----C-------------------------TGA----AA----TA-----TT--T------CTGTATCAACATGTCTT-ATTTTGT--AACTAAATTGAAA-ACAAAT--TACAA
gi|42778 : gaTTTTAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTACGTAAAACCGGC-ACT-TGAACTTTGAGCCACAC---------------TGGACTT-AGTGGGCACTGTTAGTTACTC----T--TTCAATCCTCACAGA------------------CTATTAGAAATTACT-ATTG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--
gi|42779 : gaTCTCAGTTTGATTGTTTG----T-TTTAA-ACAAGTTAAAGCAGCTCCT-TG-GTTCTGAGCGGCATA-AAATAC-ATTTCTTAAATTG-ACTGGGTACTGTTCACTGCTC----A--TCCATTTCTCTC------T--GACATTTAATGGCTATCAGAAATTGCAAAATT-----CACAA---ATATA------ATTGTCATGA----AA----TG-----TTTAT------ATGTACCAACATGTCTGTATTTTGTATAACGAATTGGAAATAAAAG---TAGAAAAAA
gi|42780 : gaTTTCTCTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TAAAGAAAATCCGGT-CCT-TGAGATTTAAACTTCACA-AA-TAC-ACTATCTGGATTT-AGT
gi|42781 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42782 : aTCAGTTTGGGAGTATT----T-ATTAAATTAGGG-AAACTGAC-CCCATG-GTTCTGACCGGCACA-GG-AAACATTATTTGTATTG-AGAGGGCACTGCTTGCTACTC----A----------------AC-------CACTTAATGGCTATCGGAAATTACTAAATATACATCAC-----ATATA------ATTGTCATGA----CA----TG-----CG--T------ATGTACCAAAATGTATA-TATTTGTATAACTGATTTGAAATAAATGT--TAAAA
gi|42783 : ataTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42784 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATCAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCGCACA-AA-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTAACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTTTG-ATTATGTAAAACTAAATTTAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42785 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATTAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCACACA-AT-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTCACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTGTG-ATTATGTAAAATT-AATTGAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42786 : TTCCTGTTTGGTCATTTT----T-ATTAA-TTACGTTTAACCGGC-CCT-TGTGCCTTGAACCACATA-AA-TAA-GATATCTGGATT--AGTGAGCAATCTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTCCTGAATAATTCTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGACATGC----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTGAATCTAAATTGAAATAAAAGT--TACACAAA
gi|42787 : TTCCTGTTTGATCATTTT----T-ATTAA-TTACTTTAAACCGGC-CCT-TGAGTTTCGAACCACACA-AA-TAA-AGTATCTGGATTA-AGTGAGTACTGTTCGTTACTT----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGCTACTCAATAGCTATTGAATGTTTCTAAATG-----CAA-----ATACA------ATTGCCAAGA----AC----TC-----AT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTAACACTAAATTGAAATAATAATGATACA
gi|42788 : TTTCAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTATGTGAAACCAGC-CCT-TAAGCTTCGAGCCACACA-AA-TAC-ATTATCCGGATTT-AGTGGGAACTGTTC
gi|42788 : CACTGTTTGTTACTC----A--TTCAATTCTCACATACATTAAT---TTTAATGGCTATTAGAAATTTATTAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTAATACTATATCTG-TTTTTGTACAA-TAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAAcgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaacactgtttgttactcattcaattctcacatacattaattttaatggctattagaaatttattaatgcatatataattgtcatgaaatatttatgtaatactatatctgtttttgtacaataaattgaaatgaaagttacaaaaaa
gi|42789 : tttcagtttgattatttttattaattatgtgaaaccagcccttaagcttcgagccacacaaatacattatccggatttagtgggaactgttccgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaaTTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----GA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAATTGAAATAAAAAT--TACAAAAA
gi|42790 : TTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----AA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAGTTATAATAAAAAA--TACAAAAA
gi|42791 : TTTTTGTTTGAT-ATTTTCTTTT-ATAAA-ATACGTTAAACCGAC-CCC-TGAGCATTGAACCGCACA-AA-TAC-AGTATCTGGATTG-AGCGGGCACTGCTCGTTATT--------------TCTCACAGACA--------CTTAATGGCTATCAGAAATTAATAAATG-----CAT-----ATATA------ACTGCCATGATTTAAT----CA-----TA--T------ACGTATCAACACATC-----------------AGTTAAAATACG-GT--TACAAAAAA
gi|42792 : TTT----T-ACTTA-TTAGGATAAACCGGC-C-T-TGACATTTCAACTACACA-AA-TAA-ATGATCTGGATTT-AGTTGGCATCGTACGTTATTC----A--T-CAACTCCCACAGACA------------ATGGCTATTAGAAATTTCTAAACG-----TAT-----ATATA------ATTATCATGA----AC----TATTAATTT--T------GTGCATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAAT--aaactaaatattgaacttgataacttaagtta
gi|42793 : AATCTCA-A-AA-TAC-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCAATGTTCGTTATTC----A--TTCAATTCTCAC--------AGACACTTAATGGCTATAAGAAATTACTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCGTGA----AA----TA-----GT--T------A---------ATGTATG-AGTTTGTACAACTAAACTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42794 : tgaatttaaatAGCTTTGAGTTGCACA-AA-TAC-ATTACCTGGATTG-AGTGTGTACTGCTTGTTACTA----A---TAAGTGATCAC--------AGATACTTAATGGCAGTCAGAAATTACTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATCA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAACTAAAATAAAAGTAATACAAAAAA
gi|42795 : CACA-AAATAT-ATTATCCGGATTTGAGTGCGCATTGCGCATCTCTC----A--ATCAATTCTCAC--------AGACGCTTAATGGCAATCAG------------G-----CAT-----G---A------ATTATCATGA----AC----TA-----TT--TATAACCATGTATCAACATATTAG-ATTCTGTACAACTAAACTGAAATTAAA-----ACGAAAAA
gi|42796 : gattcaaAACTGAA-A-AA-TAA-AATGCTTGGATTT-AGTG-------TTTGTTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGAGACTCAATGGCTATTAAAAATTTCTTATTG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGTACAAATGAATTAA
gi|42797 : aCTGCACAGAA-TAC-GTTAATTGGATTG-AGTGGGTACTGCACGCTACTC----A--AACATTTCCC--------TCAGACACTTACTGGCTATCAGAAATTACTGTATG-----
gi|42798 : -AATAGACACTGCTTGCTACTC----AACTTT--TTCTCCCAGAC--------ACTCAATGTCTATCAGAAACTGCTTTATT-----CATATAAAATATA------ATTGTCACGA----A
gi|42799 : TGTCTATCAGAAATTACTAAATA-----CAT-----AT--------------TATGA-----T----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCT----------CAACTTAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAatgctctatat
gi|42800 : AATTTCTAAATG-----TAT-----ATAAA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT--AACTAAATTAAAATAAAATT--TACAAAAAA
gi|42801 : TAAATG-----TAT-----ATATACATATAATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT---ACTAAATTGAAATAAAAGT--AAAAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 1 1 3333 3 1 2 1 1 1 22 1 2 1 1 2222 11 1 3 0 0 0 1 33333 44444 333333 2222 66666 33333 11 2222222 55 33
lowQualScore : . . .... . . . . . . .. . . . . .... .. . . . . . . ..... ..... ...... .... ..... ..... .. ....... .. ..
lowQualScore : 0 0 4444 2 6 6 6 6 0 00 3 7 3 3 8888 88 3 6 8 6 1 4 00000 88888 666666 7777 22222 22222 88 8888888 99 99
consensus : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
Reference ( family-592 ) : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42768 : TTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42769 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATCAA-AAACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCACTCA--TTCAATTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAAATTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42770 : gaTTTCTGTTCGAACATTTT----T-ATTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTATTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGACACTCAAAGGCTATTAGAAATTTCTTAAGG-----TAT-----ATACA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TCTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TAAAAAAAA
gi|42771 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACCAA-TTACGATAAGCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTG-GGTGGGCACTGTTCGCTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAGTGGCTTTTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATTAATATGTCTG-ATTTTGTTCAACTAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAA
gi|42772 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACTAA-TTACGATAAACCGGC-CCT-TGAGATTTGGACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AATGAGC--TGTTCATTACTC----A--TTCAATTTCCACTAACAGTGAGACACTCAATGGTTATTAGAAGTTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42773 : gaTTTCTGTTTGAGGATTTT----C-GCTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGCTTTGAACTACACA-AA-CAA-ATTATCTGAACTT-AGTGGGCACTGTTCGGTAATC----A--TTCAGTTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----GC----TA-----CT--T------GTGTATCGATATGTCTG-ATTTTGTAAAACAAAATTG-AAT-AAAGT--TACAAAAAA
gi|42774 : gaTTTCTGTTTGAATATTTT----T-ATTAA-ATACGATAATCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-A---------------------CTGTTTGTTACTG----A--CTCAATTCCCACAGCCAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCGATATGTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGATATAAAAAT--TACAAAAAA
gi|42775 : gaTTTCTGTTTGAACATTGT----T-ACTAA-TTACGATAAACCCTC-CCT-TGAGATTTAAACTACATA-AA-TTA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCATTACTA----A--TTCAATACCCGCAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATA-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-GTTTTGTA
gi|42776 : gaTTTCT-CTTAATCATTTT----T-ATTAA-TTACGATAAACCGGC-CGT-CGAGCTATCAACCACACA-AG-TAC-ATCATCAGGATAT-AGAGGACACTGTTCGTTACTC----A--TTTAATTCTCACAAACATTG------T--ATGGCTATTAGAAATTTTTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTCTGACTAAATTGAAATGAAAG----ATAAAAAA
gi|42777 : gaTTTCAGTTTGATAATCTT----C-ATTAG-ATACG-TGAATCGGC-CCT-TGAGCTTTTAGTGGCTCA-AA-TAC-ATGACCTGGAATG-AGTGGGAACTGCTTGTTCCTC----A--ATCATTTTTCACAGACACTG----ACTGGTTGGCTGTTAGAAATTACTGAATG-----C-------------------------TGA----AA----TA-----TT--T------CTGTATCAACATGTCTT-ATTTTGT--AACTAAATTGAAA-ACAAAT--TACAA
gi|42778 : gaTTTTAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTACGTAAAACCGGC-ACT-TGAACTTTGAGCCACAC---------------TGGACTT-AGTGGGCACTGTTAGTTACTC----T--TTCAATCCTCACAGA------------------CTATTAGAAATTACT-ATTG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--
gi|42779 : gaTCTCAGTTTGATTGTTTG----T-TTTAA-ACAAGTTAAAGCAGCTCCT-TG-GTTCTGAGCGGCATA-AAATAC-ATTTCTTAAATTG-ACTGGGTACTGTTCACTGCTC----A--TCCATTTCTCTC------T--GACATTTAATGGCTATCAGAAATTGCAAAATT-----CACAA---ATATA------ATTGTCATGA----AA----TG-----TTTAT------ATGTACCAACATGTCTGTATTTTGTATAACGAATTGGAAATAAAAG---TAGAAAAAA
gi|42780 : gaTTTCTCTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TAAAGAAAATCCGGT-CCT-TGAGATTTAAACTTCACA-AA-TAC-ACTATCTGGATTT-AGT
gi|42781 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42782 : aTCAGTTTGGGAGTATT----T-ATTAAATTAGGG-AAACTGAC-CCCATG-GTTCTGACCGGCACA-GG-AAACATTATTTGTATTG-AGAGGGCACTGCTTGCTACTC----A----------------AC-------CACTTAATGGCTATCGGAAATTACTAAATATACATCAC-----ATATA------ATTGTCATGA----CA----TG-----CG--T------ATGTACCAAAATGTATA-TATTTGTATAACTGATTTGAAATAAATGT--TAAAA
gi|42783 : ataTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42784 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATCAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCGCACA-AA-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTAACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTTTG-ATTATGTAAAACTAAATTTAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42785 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATTAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCACACA-AT-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTCACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTGTG-ATTATGTAAAATT-AATTGAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42786 : TTCCTGTTTGGTCATTTT----T-ATTAA-TTACGTTTAACCGGC-CCT-TGTGCCTTGAACCACATA-AA-TAA-GATATCTGGATT--AGTGAGCAATCTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTCCTGAATAATTCTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGACATGC----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTGAATCTAAATTGAAATAAAAGT--TACACAAA
gi|42787 : TTCCTGTTTGATCATTTT----T-ATTAA-TTACTTTAAACCGGC-CCT-TGAGTTTCGAACCACACA-AA-TAA-AGTATCTGGATTA-AGTGAGTACTGTTCGTTACTT----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGCTACTCAATAGCTATTGAATGTTTCTAAATG-----CAA-----ATACA------ATTGCCAAGA----AC----TC-----AT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTAACACTAAATTGAAATAATAATGATACA
gi|42788 : TTTCAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTATGTGAAACCAGC-CCT-TAAGCTTCGAGCCACACA-AA-TAC-ATTATCCGGATTT-AGTGGGAACTGTTC
gi|42788 : CACTGTTTGTTACTC----A--TTCAATTCTCACATACATTAAT---TTTAATGGCTATTAGAAATTTATTAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTAATACTATATCTG-TTTTTGTACAA-TAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAAcgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaacactgtttgttactcattcaattctcacatacattaattttaatggctattagaaatttattaatgcatatataattgtcatgaaatatttatgtaatactatatctgtttttgtacaataaattgaaatgaaagttacaaaaaa
gi|42789 : tttcagtttgattatttttattaattatgtgaaaccagcccttaagcttcgagccacacaaatacattatccggatttagtgggaactgttccgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaaTTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----GA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAATTGAAATAAAAAT--TACAAAAA
gi|42790 : TTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----AA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAGTTATAATAAAAAA--TACAAAAA
gi|42791 : TTTTTGTTTGAT-ATTTTCTTTT-ATAAA-ATACGTTAAACCGAC-CCC-TGAGCATTGAACCGCACA-AA-TAC-AGTATCTGGATTG-AGCGGGCACTGCTCGTTATT--------------TCTCACAGACA--------CTTAATGGCTATCAGAAATTAATAAATG-----CAT-----ATATA------ACTGCCATGATTTAAT----CA-----TA--T------ACGTATCAACACATC-----------------AGTTAAAATACG-GT--TACAAAAAA
gi|42792 : TTT----T-ACTTA-TTAGGATAAACCGGC-C-T-TGACATTTCAACTACACA-AA-TAA-ATGATCTGGATTT-AGTTGGCATCGTACGTTATTC----A--T-CAACTCCCACAGACA------------ATGGCTATTAGAAATTTCTAAACG-----TAT-----ATATA------ATTATCATGA----AC----TATTAATTT--T------GTGCATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAAT--aaactaaatattgaacttgataacttaagtta
gi|42793 : AATCTCA-A-AA-TAC-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCAATGTTCGTTATTC----A--TTCAATTCTCAC--------AGACACTTAATGGCTATAAGAAATTACTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCGTGA----AA----TA-----GT--T------A---------ATGTATG-AGTTTGTACAACTAAACTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42794 : tgaatttaaatAGCTTTGAGTTGCACA-AA-TAC-ATTACCTGGATTG-AGTGTGTACTGCTTGTTACTA----A---TAAGTGATCAC--------AGATACTTAATGGCAGTCAGAAATTACTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATCA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAACTAAAATAAAAGTAATACAAAAAA
gi|42795 : CACA-AAATAT-ATTATCCGGATTTGAGTGCGCATTGCGCATCTCTC----A--ATCAATTCTCAC--------AGACGCTTAATGGCAATCAG------------G-----CAT-----G---A------ATTATCATGA----AC----TA-----TT--TATAACCATGTATCAACATATTAG-ATTCTGTACAACTAAACTGAAATTAAA-----ACGAAAAA
gi|42796 : gattcaaAACTGAA-A-AA-TAA-AATGCTTGGATTT-AGTG-------TTTGTTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGAGACTCAATGGCTATTAAAAATTTCTTATTG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGTACAAATGAATTAA
gi|42797 : aCTGCACAGAA-TAC-GTTAATTGGATTG-AGTGGGTACTGCACGCTACTC----A--AACATTTCCC--------TCAGACACTTACTGGCTATCAGAAATTACTGTATG-----
gi|42798 : -AATAGACACTGCTTGCTACTC----AACTTT--TTCTCCCAGAC--------ACTCAATGTCTATCAGAAACTGCTTTATT-----CATATAAAATATA------ATTGTCACGA----A
gi|42799 : TGTCTATCAGAAATTACTAAATA-----CAT-----AT--------------TATGA-----T----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCT----------CAACTTAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAatgctctatat
gi|42800 : AATTTCTAAATG-----TAT-----ATAAA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT--AACTAAATTAAAATAAAATT--TACAAAAAA
gi|42801 : TAAATG-----TAT-----ATATACATATAATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT---ACTAAATTGAAATAAAAGT--AAAAAAAAA
blockSeqs : G A CTTT T A A T A A TA G A C G ACTC AC A G T TACAT ATAAA CATATA TTTA CTATT TTAAT TA ATAACCA TA GA
blockSeqs : T A . T . A . . A TA . A . . . . A G T . AA . . CTATT . . G AT AA
blockSeqs : T G . . . A . . A TA . . . . . . A G T . . . . C . . G AT .
blockSeqs : T G . . . A . . A TA . . . . . . A G T . . . . C . . G T .
blockSeqs : T G . . . A . . C TA . . . . . . G G T . . . . C . . G T .
blockSeqs : T A . . . A . . A TA . . . . . . A G T . . . . C . . A A .
blockSeqs : T A . . . A . . A TA . . . . . . A G T . . . . C . . C A .
blockSeqs : T T . . . A . . C CA . . . . . . A T T . . . . C . . A A .
blockSeqs : A T . . . T . . C GG . . . . . . T C A . . . . A . . A T .
blockSeqs : A T . . . T . . C CA . . . . . . A G A . . . . A . . A G .
blockSeqs : A T . . . A . . T GG . . . . . . T G G . . . . A . . A A .
blockSeqs : T A . . . A . . A TT . . . . . . T G T . . . . A . . A A .
blockSeqs : G A . . . G . . A TA . . . . . . T G A . . . . A . . A T .
blockSeqs : A G . . . A . . T GG . . . . . . A G T . . . . C . . A T .
blockSeqs : G A . . . T . . A TA . . . . . . A G T . . . . A . . A T .
blockSeqs : T T . . . T . . C CG . . . . . . A T T . . . . C . . A A .
blockSeqs : T T . . . T . . C CA . . . . . . A A T . . . . C . . A A .
blockSeqs : T T . . . T . . C CA . . . . . . A A T . . . . C . . G A .
blockSeqs : T T . . . T . . T CA . . . . . . T G T . . . . A . . A A .
blockSeqs : A T . . . T . . C CA . . . . . . T . A . . . . A . . A T .
blockSeqs : A T . . . T . . T CG . . . . . . A . A . . . . A . . A A .
blockSeqs : A T . . . T . . T CG . . . . . . A . A . . . . T . . . A .
blockSeqs : T T . . . A . . C CG . . . . . . G . T . . . . C . . . A .
blockSeqs : . . . . . . A TA . . . . . . A . A . . . . A . . . A .
blockSeqs : C CT . . . . . . A . A . . . . A . . . T .
blockSeqs : TG . . . . . . T . T . . . . C . . . T .
blockSeqs : TG . . . . . . . . A . . . . C . . . T .
blockSeqs : TG . . . . . . . . G . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . .
blockSeqs : . T . . . . C . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : A******
originalCons : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
finalCons : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--TA------TGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
Alignments
lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 1 1 3333 3 1 2 1 1 1 22 1 2 1 1 2222 11 1 3 0 0 0 1 33333 44444 333333 2222 66666 33333 11 2222222 55 33
lowQualScore : . . .... . . . . . . .. . . . . .... .. . . . . . . ..... ..... ...... .... ..... ..... .. ....... .. ..
lowQualScore : 0 0 4444 2 6 6 6 6 0 00 3 7 3 3 8888 88 3 6 8 6 1 4 00000 88888 666666 7777 22222 22222 88 8888888 99 99
consensus : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
Reference ( family-592 ) : TTTCNGTTTGANCATTTT----T-ATTAA-TTACGNTAAACCGGC-CCT-TGAGNTTTGAACCGCACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAATATGTCTG-NTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42768 : TTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42769 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATCAA-AAACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTCACTCA--TTCAATTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAAATTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42770 : gaTTTCTGTTCGAACATTTT----T-ATTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTATTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGACACTCAAAGGCTATTAGAAATTTCTTAAGG-----TAT-----ATACA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TCTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TAAAAAAAA
gi|42771 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACCAA-TTACGATAAGCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTG-GGTGGGCACTGTTCGCTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAGTGGCTTTTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATTAATATGTCTG-ATTTTGTTCAACTAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAA
gi|42772 : gaTTTCTGTTTGAGCATTTT----T-ACTAA-TTACGATAAACCGGC-CCT-TGAGATTTGGACTACACA-AA-TAA-ATTATCTGGATTT-AATGAGC--TGTTCATTACTC----A--TTCAATTTCCACTAACAGTGAGACACTCAATGGTTATTAGAAGTTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42773 : gaTTTCTGTTTGAGGATTTT----C-GCTTA-TTACGATAAAACGGC-CCT-TGAGCTTTGAACTACACA-AA-CAA-ATTATCTGAACTT-AGTGGGCACTGTTCGGTAATC----A--TTCAGTTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----GC----TA-----CT--T------GTGTATCGATATGTCTG-ATTTTGTAAAACAAAATTG-AAT-AAAGT--TACAAAAAA
gi|42774 : gaTTTCTGTTTGAATATTTT----T-ATTAA-ATACGATAATCCGGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-TAA-A---------------------CTGTTTGTTACTG----A--CTCAATTCCCACAGCCAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCGATATGTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGATATAAAAAT--TACAAAAAA
gi|42775 : gaTTTCTGTTTGAACATTGT----T-ACTAA-TTACGATAAACCCTC-CCT-TGAGATTTAAACTACATA-AA-TTA-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTCATTACTA----A--TTCAATACCCGCAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATA-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------GTGTATCAATATGTCTG-GTTTTGTA
gi|42776 : gaTTTCT-CTTAATCATTTT----T-ATTAA-TTACGATAAACCGGC-CGT-CGAGCTATCAACCACACA-AG-TAC-ATCATCAGGATAT-AGAGGACACTGTTCGTTACTC----A--TTTAATTCTCACAAACATTG------T--ATGGCTATTAGAAATTTTTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTCTGACTAAATTGAAATGAAAG----ATAAAAAA
gi|42777 : gaTTTCAGTTTGATAATCTT----C-ATTAG-ATACG-TGAATCGGC-CCT-TGAGCTTTTAGTGGCTCA-AA-TAC-ATGACCTGGAATG-AGTGGGAACTGCTTGTTCCTC----A--ATCATTTTTCACAGACACTG----ACTGGTTGGCTGTTAGAAATTACTGAATG-----C-------------------------TGA----AA----TA-----TT--T------CTGTATCAACATGTCTT-ATTTTGT--AACTAAATTGAAA-ACAAAT--TACAA
gi|42778 : gaTTTTAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTACGTAAAACCGGC-ACT-TGAACTTTGAGCCACAC---------------TGGACTT-AGTGGGCACTGTTAGTTACTC----T--TTCAATCCTCACAGA------------------CTATTAGAAATTACT-ATTG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--
gi|42779 : gaTCTCAGTTTGATTGTTTG----T-TTTAA-ACAAGTTAAAGCAGCTCCT-TG-GTTCTGAGCGGCATA-AAATAC-ATTTCTTAAATTG-ACTGGGTACTGTTCACTGCTC----A--TCCATTTCTCTC------T--GACATTTAATGGCTATCAGAAATTGCAAAATT-----CACAA---ATATA------ATTGTCATGA----AA----TG-----TTTAT------ATGTACCAACATGTCTGTATTTTGTATAACGAATTGGAAATAAAAG---TAGAAAAAA
gi|42780 : gaTTTCTCTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TAAAGAAAATCCGGT-CCT-TGAGATTTAAACTTCACA-AA-TAC-ACTATCTGGATTT-AGT
gi|42781 : gaTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCTTGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42782 : aTCAGTTTGGGAGTATT----T-ATTAAATTAGGG-AAACTGAC-CCCATG-GTTCTGACCGGCACA-GG-AAACATTATTTGTATTG-AGAGGGCACTGCTTGCTACTC----A----------------AC-------CACTTAATGGCTATCGGAAATTACTAAATATACATCAC-----ATATA------ATTGTCATGA----CA----TG-----CG--T------ATGTACCAAAATGTATA-TATTTGTATAACTGATTTGAAATAAATGT--TAAAA
gi|42783 : ataTTTCGGTTTGAACATTTT----T-ATTAA-TCACGATAATACAGC-CCT-TGAGATTTAAACTACACA-AA-CAA-ACTATCTGGATTT-AGTGGGCACTGTTTGTTACTC----A--TTCATTTCCCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTATTAGAAATTTCTAAATG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATTTCTG-TTTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42784 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATCAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCGCACA-AA-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTAACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTTTG-ATTATGTAAAACTAAATTTAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42785 : TTCCTGTTTGATCATGTT----T-ATTAA-TTACGTTAAACCGGC-CCT-TGAGCCTTGTACCACACA-AT-TAA-ATCATCTGGATTT-AGTTGGCACTGTTCGTTCCTC----A--TTCAATTCTCACAGATAGTGAGACACTCAATGGCTACTAAATATTTTTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGTCATTA----ACTATTTA-----TT--T------ATGTATCAACATGTGTG-ATTATGTAAAATT-AATTGAAATAAAAGT--TACAAAA
gi|42786 : TTCCTGTTTGGTCATTTT----T-ATTAA-TTACGTTTAACCGGC-CCT-TGTGCCTTGAACCACATA-AA-TAA-GATATCTGGATT--AGTGAGCAATCTTCGTTACTC----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGACACTCAATGGCTCCTGAATAATTCTAAATG-----CAA-----ATATA------ATTGACATGC----AC----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTGAATCTAAATTGAAATAAAAGT--TACACAAA
gi|42787 : TTCCTGTTTGATCATTTT----T-ATTAA-TTACTTTAAACCGGC-CCT-TGAGTTTCGAACCACACA-AA-TAA-AGTATCTGGATTA-AGTGAGTACTGTTCGTTACTT----A--TTCAATTCTCACAGACAGTGAGCTACTCAATAGCTATTGAATGTTTCTAAATG-----CAA-----ATACA------ATTGCCAAGA----AC----TC-----AT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ACTATGTAACACTAAATTGAAATAATAATGATACA
gi|42788 : TTTCAGTTTGATTATTTT----T-ATTAA-TTATGTGAAACCAGC-CCT-TAAGCTTCGAGCCACACA-AA-TAC-ATTATCCGGATTT-AGTGGGAACTGTTC
gi|42788 : CACTGTTTGTTACTC----A--TTCAATTCTCACATACATTAAT---TTTAATGGCTATTAGAAATTTATTAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T------ATGTAATACTATATCTG-TTTTTGTACAA-TAAATTGAAATGAAAGT--TACAAAAAAcgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaacactgtttgttactcattcaattctcacatacattaattttaatggctattagaaatttattaatgcatatataattgtcatgaaatatttatgtaatactatatctgtttttgtacaataaattgaaatgaaagttacaaaaaa
gi|42789 : tttcagtttgattatttttattaattatgtgaaaccagcccttaagcttcgagccacacaaatacattatccggatttagtgggaactgttccgaatttcaaatgaataccggggtatatgaaataaaactaaaTTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----GA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAATTGAAATAAAAAT--TACAAAAA
gi|42790 : TTTCAGTTTGATTTTTTT----TTATCAA-ATATGTAAAACCGGC-CCC-TGAGTTGTGAATCGCACT-AA-TAA-ATT---------T-AGTAGGCACTGCTATTTACTC----A--ATCATTTCTCACAGACAATAA--------ATGGTAGTTAGAAATTATTAAATG-----CAT-----AT--A------ATTGTCATGA----AA----TA-----CT--T------ATGTATCAATATGTCTGATTTTTGTACAACTCAGTTATAATAAAAAA--TACAAAAA
gi|42791 : TTTTTGTTTGAT-ATTTTCTTTT-ATAAA-ATACGTTAAACCGAC-CCC-TGAGCATTGAACCGCACA-AA-TAC-AGTATCTGGATTG-AGCGGGCACTGCTCGTTATT--------------TCTCACAGACA--------CTTAATGGCTATCAGAAATTAATAAATG-----CAT-----ATATA------ACTGCCATGATTTAAT----CA-----TA--T------ACGTATCAACACATC-----------------AGTTAAAATACG-GT--TACAAAAAA
gi|42792 : TTT----T-ACTTA-TTAGGATAAACCGGC-C-T-TGACATTTCAACTACACA-AA-TAA-ATGATCTGGATTT-AGTTGGCATCGTACGTTATTC----A--T-CAACTCCCACAGACA------------ATGGCTATTAGAAATTTCTAAACG-----TAT-----ATATA------ATTATCATGA----AC----TATTAATTT--T------GTGCATCAATATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAATTGAAATAAAAAT--aaactaaatattgaacttgataacttaagtta
gi|42793 : AATCTCA-A-AA-TAC-ATTATCTGGATTT-AGTGGGCAATGTTCGTTATTC----A--TTCAATTCTCAC--------AGACACTTAATGGCTATAAGAAATTACTGAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCGTGA----AA----TA-----GT--T------A---------ATGTATG-AGTTTGTACAACTAAACTGAAATAAAAGT--TACAAAAAA
gi|42794 : tgaatttaaatAGCTTTGAGTTGCACA-AA-TAC-ATTACCTGGATTG-AGTGTGTACTGCTTGTTACTA----A---TAAGTGATCAC--------AGATACTTAATGGCAGTCAGAAATTACTAAATG-----CAT-----ATATA------ATTGTCATCA----AA----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCTG-ATTTTGTACAACTAAACTAAAATAAAAGTAATACAAAAAA
gi|42795 : CACA-AAATAT-ATTATCCGGATTTGAGTGCGCATTGCGCATCTCTC----A--ATCAATTCTCAC--------AGACGCTTAATGGCAATCAG------------G-----CAT-----G---A------ATTATCATGA----AC----TA-----TT--TATAACCATGTATCAACATATTAG-ATTCTGTACAACTAAACTGAAATTAAA-----ACGAAAAA
gi|42796 : gattcaaAACTGAA-A-AA-TAA-AATGCTTGGATTT-AGTG-------TTTGTTACTC----A--TTCAATTCCCACAGATAGTGAGAGACTCAATGGCTATTAAAAATTTCTTATTG-----TAT-----ATATA------ATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGTACAAATGAATTAA
gi|42797 : aCTGCACAGAA-TAC-GTTAATTGGATTG-AGTGGGTACTGCACGCTACTC----A--AACATTTCCC--------TCAGACACTTACTGGCTATCAGAAATTACTGTATG-----
gi|42798 : -AATAGACACTGCTTGCTACTC----AACTTT--TTCTCCCAGAC--------ACTCAATGTCTATCAGAAACTGCTTTATT-----CATATAAAATATA------ATTGTCACGA----A
gi|42799 : TGTCTATCAGAAATTACTAAATA-----CAT-----AT--------------TATGA-----T----TA-----TT--T------ATGTATCAACATGTCT----------CAACTTAATTGAAATAAAAGT--TACAAAAAatgctctatat
gi|42800 : AATTTCTAAATG-----TAT-----ATAAA------ATTGTCATGA----AA----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT--AACTAAATTAAAATAAAATT--TACAAAAAA
gi|42801 : TAAATG-----TAT-----ATATACATATAATTGTCATGA----AC----TA-----TT--T-------TGTATCAATATGTCTG-TTTTTGT---ACTAAATTGAAATAAAAGT--AAAAAAAAA