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Reference ( gi|114163 ) : TCCCAGTAATCGCAATCAAAACAAACATTGATTTATTACCT-TGTCAATTATCACAGTCGG-CACG--CAT---AAT-----TTTT-C--AAAA-ATATAAAAATAGACCA--G-T---GT-----AC-A-TTTTCTG--AAAA--T----AG-A-GTTGAC-----CTA----GAT-T----TTTCTA-----GAAAAT--TC-CATGAC--CTCGC-----GTGATCACTG-G-CA---TGG---G----TA----TTT---A-CGATTGG-----ACGCTATT-----------TTC-----------A------------AAT---GTAAC-C-TATGGTGTCATGCATAATA----TT-ACTGCACGG-ACTGCTATGCCACTCGAATA--------------TAAACA-AC-CGGTC--CTTG-AAAAATAAATGTATAAATATATAATATATATTGTTTTT
gi|114154 : TCCCAGTAATTGCAATCAAAACAAACATTGATTTATTACCA-TGTCAATTATCACAG-----CACG--CAT---GAT-----TTTT-C--AAAA-ATATAAAAATAGACCA--C-T---GT-----AC-A-TTTTCGG--AAAA--T----AG-A-GTTGAC-----CTA----GAT-C----TTTCTT-----GAAAAT--TC-CATGAC--CTCGT-----GTGATCACTG-G-CA---TGG---G----TA----TTT---A-CGATTGG-----ACACTATT-----------TTT-----------A------------AAT---GTAAC-C-TATGGTGTCATGCATAGTA----TT-ACTGCACGG-ACTGCTATGCTATGCGAATA--------------TAAACA-AC-CGGTC--TTTG-AAAAATAAATATATA-------AATATATATTGTTTT
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gi|114154 : TACCCATGCCAGTGATCACA--CG---AGGT-CATGG-AAT-----T-TT-C--AAGA-A---AGATCTAGGTCA--A-C----T-----CT-A-TTTTCCG--AAAATGT----AC-A-G-TGGT-----CT------AT-T----TTTATATTTTTGAAAAA--T--CATG----CGTGCT----GTGATAATTG-A-CA---TGG---cgcgcaaatcatggaaaattctagcactttctagacagggcgatgacctcgcttgatcacgcttgacccgtatgttcgattggactgaacgctatttttataaaaactttaaatagtaacactatgatgtcatgggtaattttacttagggaaatgttattttacacaaatttaatcttcctgtcgcggaaaatgaagttgatgagtgttattttt
gi|114155 : atcccagtaattgcaatcaaaacaaacattgatttattaTACCCATGCCAGTGATCACG--CG---AGG--TATTGGAAT-----TTTT-C--AGAA-AGAT----CTAGGTCA--A-----AT-----AT-A-TTTTCAG--AAAATGT----AC-A-GCGGTCTATTTTTA----TAT-T----TTTTTA------AAAATCATG-CATGCCGACT--------GTGATAATTG-A-CA---CGG---tttacgattggacactatttttaaatgtaacctatggtgtcatgcatagtattactgcacggactgctatgctatgcgaatataaacaaccggtctttgaaaaataaatatataaatatatattgtttt
gi|114157 : atcctcttaaccgcaatcaaaacaaatattgatttattaTACCCATGCCAGCGATCAC-----G-CAAGGTCATGG-AAT-----TTTC-C--AGAA-A----GAAATAGGTCA--A-C----------ACTA-TTTTCCG--AAAA--T----GT-ACATCGGC-----ATATTTTGAT-T----TTTTTG-----AAAAAT-----CATG----CGTGCTGACTGTGATAATTG-A-CA---CGG---tttacgattggatgctattttcaaatctaacctatggtgtcatgcataattttactgcgcggactgctatgctacgcgaatataaataaccggtccttgaacaataaatgtataaatgtataatatatgttgttttt
gi|114156 : atcccagtaatcacaatcaaaacaaacaatgatttattaTACCCATGCCAGTGATCACAGGAGGTCATG--GAT-----T-----TTTC-C--AGAA-GGGTC----TAGGTCA--AAT---AT-----AT-T-TTTTCTG--AAAA--TGTACAG-C-GTT--------CTA------T-T----TTTATATTATTGAAAAA--TCATGTGTG--CTAACT----GTGATCATTG-A-CA---TGG---tttacgattggacggtatttttaaatgtaacctatggtgccatgcatagttttactacaagaactgcaatgctacacgaatattaacacctgtcattgaaaaataaattgaaacctattgttttt
gi|114169 : atcctaattatcgcaatcaaaacaaacattgaattattaACCG-TGTCAATTATCACAATCGG-CACG--CAT---GAT-----TTTT-C--AAAA-AAATAAAAATAGACCA--C-T---GT-----AC-A-TTTTCGG--AAAA--T----AG-A-GTTGAC-----CTA----GAC-C----TTTCTG-----GAAAAT--TC-CATGAC--CTCGC-----GTG--CCCT---------TG---------------------A-CGATTAG-----ACGCTATT-----------TTC-----------A------------AAT---GTAAC-C-TATGGTGTCATGAATAATA----TT-ACTGCGCGG-ACTGCTATGCCACGCAAATA--------------TAAATA-AC-CGGTC--CTTG-AAAAATAAATGTATAAATATATAATATATATTGTTTTTtttacgattggacgctatttaaatgtaacctatggtgtcatgcataattttactgccaaactgcaatgctacacaaatataaacaaccagtccttgaaaaataaatatatcttgttttt
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gi|114166 : aacatagttttgttttc--CAT---GAT-----TTGCGC--GGGA-ATCTAAAAATAAATCG--G-G---GTCAAATAC-AATTTTCTG--AAAA--C----AG-A-AGCAGT-----CTA----TTT-TCGTGTTTTTG-----GAAATG--TG-CAT-----CCCGC-----GTGACCTTTG-G-CA---gaaaattctagcactttctagacagggcgatgacctcgcttgatcacgcttgacccgtatgttcgattggactgaacgctatttttataaaaactttaaatagtaacactatgatgtcatgggtaattttacttagggaaatgttattttacacaaatttaatcttcctgtcgcggaaaatgaagttgatgagtgttattttt
gi|114160 : aaacatagttttattttc---AAT-----TTTC-C--AGAA-A----GAACTAGGTCA--A-T---TT-----TT---TTTTCTG--AAAA--TGT--AC-A-GCTG-T-----CTA------T-T----TTTATATATTTGAAAATCATG-CATG----CTGACT----GTGATCACTG-A-CA---T-G---G----TA----ATT---A-gaaaattctagcactttacataatgcgactgggcgatgaccttgcttgatcacgcttgacccgtatgttcgcttggacgctatttttataaaaactttaaatagtaacactatgatgtcatgggtaattttacttggggaaatgttattttacacaaatgtaaacttcctgtcgcggaaaatgatgtttatgtgtgttattttt
gi|114167 : atcccaattaccgcaatcaaaacaaacatttat----TTTCTA-----GACAGG--GC-GATGAC--CTCGC-----TTGATCAC---G-CT---TGACCCG----TA----TGT---T-CGATTGGACTGAACGCTATTTTTATAAAAACTTT-----------A------------AATA--GTAACAC-TATGATGTCATGGGTAATT----TT-ACT-TAGGGAAATGTTATTTTACACAAATT--------------TAATCT-TC-CTGTCG-C--G-GAAAATGAAccatgacctcgcatgttcattggcatgggtatttacaattggacgctatttttaaatgtaacctatggtgtcatgcataattttactgtgtggactgcaatggtacactacacagcccttgaaaaataaatatgttgttttt
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Alignments
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gi|114167 : aaacatagttttattttctgccaaaggtcacgcgggatgcacatttccaaaaacacgaaaatagactgcttctgttttcagaaaattgtatttgaccccgatttatttttagattcccgcgcaaatcatggaaaattctagcactttacataatgcgactgggcgAACATAGTTTTGTTTTC-TGCCA---AAGGTCA-CG--CAGGATGCAC--A-------TTTCC--AAAA-ACACG------AAAATAGACTGCT-TCTGTTTTCAG--AAAA-TTGTATTTGACCT--CGATA--TATTTTTAGATTCCCGCGCAAATCATGGAA-AATTCTAGCACTTTCTAGACAGGGCGATGACCTCGCTTGAT-C-AC----G-C-T---TGACCCG----TA----TGT---T-CGATTGGACTGAACGCTAT-------TTTTATAAAAACT--T-----------TA------------AATA--GTAACAC-TATGATGTCATGGGTAAT---T-TTACTTAGGGAAATGTTATTTTACACAAATTTAATCT-TCC--------------TGTCG-C--G-GAAAATGAA
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gi|114167 : aaacatagttttattttctgccaaaggtcacgcgggatgcacatttccaaaaacacgaaaatagactgcttctgttttcagaaaattgtatttgaccccgatttatttttagattcccgcgcaaatcatggaaaattctagcactttacataatgcgactgggcgAACATAGTTTTGTTTTC-TGCCA---AAGGTCA-CG--CAGGATGCAC--A-------TTTCC--AAAA-ACACG------AAAATAGACTGCT-TCTGTTTTCAGAAAA--TTGTATTTGACCT--CGATA--TATTTTTAGATTCCCGCGCAAATCATGGAA-AATTCTAGCACTTTCTAGACAGGGCGATGACCTCGCTTGAT-C-AC----G-C-T---TGACCCG----TA----TGT---T-CGATTGGACTGAACGCTAT-------TTTTATAAAAACT--T-----------TA------------AATA--GTAACAC-TATGATGTCATGGGTAAT---T-TTACTTAGGGAAATGTTATTTTACACAAATTTAATCT-TCC--------------TGTCG-C--G-GAAAATGAA-GT-TG-----ATGA---GTGTTATTTTT
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gi|114180 : TC------------TGGTC-AATTCAA--------------------TGACGTCGCGTGGT-C-ACT-G-A-T-A---TGA---CAC--TA----TGT---G-CAAATAG-----ACGCAAT-------T-----------T--T-----------TATAAAAACTTTA-AATA--GTAAC-CATATTATGTCTTCCGTAAA---T-TTACTTTGTGAAATGTTGCACTACACGAATATAAACT-TAC--------------GATC--TCTG-AAAAATAAAT-----------TAAAAGGTGTTGTTTTT
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gi|114184 : AT-T-ACT-GTGTC-A---TGG---G----TA----TTT---A-CGTTTGG-----ATGCTAT-------T-----------T--T-----------TA------------AAT---GTAAC-C-TATGGTGTCATGCATAAT---A-TAACTGAGCGGA-TGCTATACTACGCGAATACAAATA-ACT--------------GGTC--CTTG-AAGAATAAATGTATA-------GATATATATTGTTTTT
gi|114185 : -C-A---TGG---G----TA----TTT---A-CGTTTGG-----ACGCTAT-------T-----------T--T-----------CA------------AAT---GTAAC-C-TATAGTGCCATGCATAAT---A-TTGCTGCAGG--CTGCTATGCCACGCGAATATAAACA-ACC--------------GGTT--CTTG-AAAAATAAATGTATA-------AATATATA
gi|114186 : -----ACGCTAT-------A-----------T--T-----------TA------------ATT---CTAAC-C-TCTGATGTCTTGCATAAT---T-TAACTGTGTGAAATGCAATGCTACACGAACATAAACA-TCC--------------GGTC--CTTG-AAAAATAAAT
gi|114187 : A------------GAT---GTAAC-C-TATGGTGTCATGCATAAT---A-TTATTGCACGGACTGCTATGCCACGCGAATATAAACA-ACC--------------GGTC--CTCG--AAAATAAATGTATA-------AATATATATTGTTTTTtgaaatgtgtttctttt