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gi|113576 : ---ACA------TA-GAAACGTCAC-ATTG-TTTA----C--ATAT---TG--ACGCTGA----TGACTTCGC-----GT-----T-G------T-T------T-TACTC--AAG--T-G-CGG----GTCAAGGAGGTTG------------TGGT-GAAATTATGGTGGAACT-AT-GA----AT--CAT----AA--ATTTAA--T-----T---TATTAA-----AAG-CAGCGATTTC----------T----TATTCAA----------G----------AT-ATGCAGGTAATTCATCAT-TTTCAATATGTTTAGTGG----AGAACAGCC------ATTC-AACTGTTACAA-AAA
gi|113577 : A-ATGGCATAAATATTA-TATG----C--ATAT---TG--AAGTTGA----TTG-----T-----GT-----C-A------T-T------TTGC-TC--AAG--C-A-CTG----ATCCAGAAGGTAGT---TA-AATACTAAT--AGAATGA------ACT-CT-GA----GT--A------AA--TT---A--T-----TTACT-T--------CAGTCAAAGAAT------------
gi|113578 : TAGT---TA-GATACTGGT-GACATTGC------ATT-CT-AA----AT--AGTTCG-AC--AT---A--T-----T---T-T--------ACGTCAGAGAAT------------A----TATGAAG----------G----------CT-ATGAATGTAAGCC-TATTAGTGGAATTTG-TTAGTGG-------------------------AAGGCTACGA-AAA
gi|113579 : ----------TT-AGGAATGTAACAC-T------TGGAATTA-TTAGTGG----AGAATAAAC------ATTC-AAGGGTTACGA-AAA
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blockSeqs : . . . . . . T . . ACG TT T GTC . . . G T TTA . GG . CT CTTCG . CGGTATG . . TGA T AC . . A T . . . C T . TG A . GG C . . . TAC . GTGA ATTAT GTAATTCATCA . CC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CA . . GTC . . . G G A . . . . . . TGT . . TGA . A . . A T . . . C T . TG A . AG . . . . TG . ATAA ATTAT GTCGTTCTTCA . TC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . CA . . . . . . G G . . . . . . . TGG . . TGC . A . . G T . . . C C . TG A . GA . . . . A . TAA TCT G . CC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G A . . . . . . . TGT . . TAC . G . . C T . . . C T . TG A . CG . . . . . . . A G . CG A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . A A . . . . . . . TAT . . TGC . G . . A T . . . A A . TG A . AA . . . . . . . A G . CC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . TAT . . AA . A . . G G . . . A A . CA T . AA . . . . . . . A G . CC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . T A . . . . . . . TGT . . GA . T . . G G . . . A T . CT A . GA . . . . . . . A G . CC G A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . A G . . . . . . . CCA . . GA . C . . G G . . . C T . TG A . GG . . . . . . . A T . CA A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . G . . . . . . A G . . . . . . . CTG . . GC . T . . C T . . . C T . CG A . GG . . . . . . . A A . CA A T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . C A . . . . . . . TGT . . GC . G . . C T . . . C T . TG A . GG . . . . . . . A G . CC A A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . CTT . . GC . A . . C T . . . C T . TG A . TA . . . . . . . A A . AC C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . TG . . GA . A . . T T . . . C T . TA G . GG . . . . . . . A G . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . TG . . GA . A . . C T . . . C A . GG G . AA . . . . . . . A G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . TG . . GA . A . . C T . . . A T . CG A . AA . . . . . . . C . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G G . . . . . . . TA . . GA . A . . G G . . . C A . TT A . TG . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . A . . . . . . G T . . . . . . . TG . . TA . A . . A T . . . A A . TG G . AA . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . T G . . . . . . . TA . . TA . A . . T A . . . A A . TG G . CG . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . G A . . . . . . . TA . . AG . G . . G G . . . A T . TA A . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . T C . . . . . . . TG . . GA . C . . G A . . . A A . C G . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . A G . . . . . . . CG . . GG . T . . G T . . . A C . C A . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . T C . . . . . . . CA . . TA . C . . G G . . . A . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . A A . . . . . . . TG . . GC . T . . G G . . . A . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . T C . . . . . . . TG . . GC . C . . G G . . . A . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . A A . . . . . . . TG . . AC . C . . G G . . . G . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . A A . . . . . . . CA . . GC . C . . G G . . . C
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . A A . . . . . . . . . . GC . T . . A G . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . A . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
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finalCons : ACA-ATTAA-A-C---CATTT-TC-----C-ACAA-C-TGAT-A--T--G--T----TT---ATA------TA-ATGACGTCAG-GTTG-TATA----C--GTAT---TG--GCGTTGA----TGA-----C-----GT-----T-G------T-T------TGA--TC--AAG--N-G-CGG----ATCCAGGANGTAGC---TA-AATACTGGT-GANATTGT------ACT-TC-GA----AT--AGTTGG-AA--AT---A--T-----T---T-T--------AAGTCAGAGAAT------------A----TATGAAG----------G----------TT-AGGAATGTAACCC-TAATAGTTGAATTTG-TTAGTGG----AGAACAGAC------ATAC-AAAGGCTACGA-AAA
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Reference ( family-579 ) : ACA-ATTAA-A-C---CATTT-TC-----C-ACAA-C-TGAT-A--T--G--T----TT---ATA------TA-ATGACGTCAG-GTTG-TATA----C--GTAT---TG--GCGTTGA----TGA-----C-----GT-----T-G------T-T------T-GA-TC--AAG--N-G-CGG----ATCCAGGANGTAGC---TA-AATACTGGT-GANATTGT------ACT-TC-GA----AT--AGTTGG-AA--AT---A--T-----T---T-T--------AAGTCAGAGAAT------------A----TATGAAG----------G----------TT-AGGAATGTAACCC-TAATAGTTGAATTTG-TTAGTGG----AGAACAGAC------ATAC-AAAGGCTACGA-AAA
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gi|113558 : atatagtgACA-ATTAA-A-C---TATTT-TC-----C-ACAA-C-TAAT-A--T--G--T----TT---TTA------TA-ATGACGTCAG-GTTG-TATA----C--GTTT---TG--GCGTTGG----TGA-----C-----GT-----T-AT-----T-T------T-GA-TC--AAG--A-G-CGG----ATCCAGCATGTAGC---TA-AATACTGGT-AACATTGT------ACT-TT-GA----AT--AGTTGA-CA--AT---A--T-----T---T-T--------AAATATGAAAAT------------A----TAtaccgg
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gi|113567 : TAA-C-C---TATTC-TT-----C-ACAA-T-TCGT-ACTT--G--T----T----ATA------TA-ATGGTGTCAG---TC-TAAA---------AT----G--ACGTTGA----TGA-----T-----GT-----C-A------A-T------A-TA-CC--AAG--ACG-TGG----GTCCAGGGGATACT---TA-AATGCCAGT-GAAATTA--------------AA----ATAGAGTTAATAAGTAT---A--T-----T---T-TATAA----AAGTCAGTGAAT------------
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gi|113572 : ATTTGTC-----T-ACAG-C---AT-T--T--G--T----CT---ATAATTATGTATATGACATCAG-TTCA-TATA----C--ATAT---CT--ACGTTAA----TGA-----C-----AT-----T-G------A-T---------A-CCT-AGG--T-G-CTT----ATCCAGGAGGTGGT---TA-AATGCCGGT-GAAA-TGA------AAT-TCAGA----GT--AGTTAA-AA--AT---A--T-----TTACT-T--------AAGTCAG
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