lowQualScore : 111111 3333333333 11 11 1 1111 111111 11111111111111111111 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11111111 1111 1111111111111 33333333333333333 22222222 111
lowQualScore : 666666 5 0000000000 5 1 7 1 55 11 3 00 7777 777 1 3 3 3333 666 4 7 4 6 888888 0 33 33333333333333333333 2 6666666666 222 0 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11 55555555555555 1 4444444 222 3 88888888 44444444 1 66 33333 5 2 1 2 666666 7777 2222 0000000000000 1 11111111111111111 44444 1 1 44444444 666666666 111 1 1 1 4 333333 444444444 9
lowQualScore : ...... . .......... . . . . .. .. . .. .... ... . . . .... ... . . . . ...... . .. .................... . .......... ... . .......................................................................................... .. .............. . ....... ... . ........ ........ . .. ..... . . . . ...... .... .... ............. . ................. ..... . . ........ ......... ... . . . . ...... ......... .
lowQualScore : 444444 7 7777777777 0 9 0 6 55 00 6 00 7777 777 7 6 6 9999 444 5 2 4 7 999999 7 99 99999999999999999999 2 3333333333 666 7 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 88 33333333333333 3 2222222 333 9 77777777 77777777 3 33 11111 0 4 9 4 888888 5555 8888 6666666666666 2 88888888888888888 11111 5 1 11111111 111111111 555 2 2 2 7 444444 777777777 0
consensus : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGATTCTGTAATTATAGATGTATAAATA--C--CATGACTGCTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------AT--GTGAT--ATG--------T-A-T-GT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TN-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
Reference ( gi|93578 ) : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAACTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTGTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGATTCTGTAATTATAGATGTATAAATA--A--CATGACTGCTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------AT--GTGAT--ATG--------T-A-T-GT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93579 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGATTCTGTAATTATAGATGTATAAATA--A--CATGACTGCTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------AT--GTGAT--ATG--------A-A-T-GT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTG-AA
gi|93580 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGT-T-ATGATT-A--TA---AATGATTCTGTAATTATAGATGTATAAATA--C--CATGACTGCTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------AT--GTGAT--ATG--------T-A-T-GT-A-TTCA-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-G--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTATATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GTT---TTGCTGAAA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93581 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-CAATCTGGCAAAATTTATAACCTAAGCTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGATTTTGTAATTATAGATGTATACATA--C--CATGACTGCTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------AT--GTGAT--ATG--------T-A-T-GT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GAT---TTGCTGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93582 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAAA---------TATTTG-TAATCTGGCAAAACTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGATTCTGTAATTATAGATGTATAAATA--C--CATGACTGTTTC--AG-T----T-------------TG-AAT--------------------------------A-T-GT-G----------GTAT-------------------------------------------------G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-GTTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGG-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TT
gi|93583 : ATGAAGGAAAAAAG------A-AAA----------TATTTA-TAATCTTGCAAATTTCATGACCAAAGCTCAAAAGATTAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CACTTTACTT-TGTTGATTCTTGA-T-ATGATT-T--TA---TATGCTTTTGTTATTTTAGATGTTTAAATACCATCCATCACTGCTGC--AG-T----T-------------TG-ATT--------AT--GTGAT--ATG--------T----------------T-TGTAT---T--AA------------------------A----T---T--T-T--G--TT--TGTA------T------T-TC-------A---TAA-TT-----------------------TTG-----T-AT-GTCTATG-TCAT------A----T----TT----G---AAT-TA-AT-TGGA-A---TT-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---GAT---ATGCTGATA---TGCC-A-G-T-AG------T------C-TTGTAAATTT
gi|93584 : ATCAAGAAATAAAATAAAATA-AAGAGAATTTGCGTATTTG-CAATTTACCATAATTTATAACGGAAGCTCAAAATCTAAGGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----ATTT-GCTTGATTCTTGA-T-ATGCTT-T--TA---AATGATTAAGTAAT
gi|93585 : TCATGGAATTAAA------ATAAA----------T-TTTGACAATCTGGAGAAATATTTAGC------TCAAACGCTCAAGCAAGA--A--ACTTTAA-A--CA----GTGT-ATTTGATTCTTGA-T-ACGATC-T--TA---AATGATTTTGTAATAGTAGATGTTTGTATT--C--CATGACTGTTTT--CC-T----T-------------TG-ATT--------TT--GTGAT--ATG--------T-G-T-GT-A-TTT--AT-T--------------------------------------------------------TA--TG------------G--T-TT-------G---GTT-TT-----C-A--------T-ACT-AGTG-----T-AT-GTTTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TT-----T-----GTATATAGCAATAGAC-G-A------T---GAC---TGGCTGATA---TCCC-A-A-T-AA------A------C-TTGTAAACT
gi|93586 : G-TAATACATCAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCTAAG--AAAA--ACTACCTTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAA-C-TTTATTCACTTA---AATAA-------ATTATTGA-----AAATA--T--AATGTCT-------AGAT----T-------------TG-A-T--------AT--CTTAC--A----------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGTA------T-T-A--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATG-CCAT------A----TATGTTT----A---AAT----AT-TC-------TT-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93587 : CAAGATCTATTACTGAGGCTTTTACGCTAAGA-AAAACTA--ACTTGAATA--CA----AT-------GCTTCTTAACT-ATATTT-ACTTA---AATGA-------ATTATTGA-----AAATA--T--AATGTCT-------AGAT----T-------------TG-A-T--------AT--CTTAC--A----------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------------------T-T--G--TG--AATA------T-CT---T-AC-------G---TATGTT-----T-A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT---------------GT-TTGA-A---TATTCTTT-----GTAAATGGCCATAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-AA------A------C--TG-AA
gi|93588 : GCTAAG--AAAA--ACTACCTTAA-ATACA----AT---GACTGATTCT------AT-ACT-A--TATTCACTGAAT-TG-AATTATTGA-----AAATA--C--AATGTCT-------AG----------------------------------AT--TTGAT--ATG--------T-A-C-ATTG-TTTG-AC-TGT-T---T--AC------------------------GAGTCTA--TAAC-C-----TA--TGT-----------------T-------A---AAT-T-----------------------ATTG-----T-GT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT---------------GT-TTAA-A---TA-----TTATTGGTAAATGGCCATAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTGGTTA---GGCC-A-A-TCAA------A------C--TG-AAACT
gi|93591 : caatatttattactcgggcttttatTAA-G--CA----ATTTTAATTGTTTCGTGA-TTACGATT-C--GA---AATGAGTTTGTAACTGTAGATGTATAAATA--C--AATGACTGCTTC--AA-T----T-------------TG-ATT--------AT--GTGATTTACGAATTTGTCT-A-T-GT-A-TTT--AT-TTTGT---C--ACTGACTTAATAAGATCTACATCAATA----TA--TGTT-T--A--TA--TGTC------T-TTGGTT-TT-------G---TAT-TT-----C-A-----------------------T-GT-GTCCATG-CAAT-----------T----TT----A---AAT-TA-CT-TT
gi|93592 : TGT-TAAATG--C--CATGACTGCTTC--AA-T----T-------------TG-AA-------------------------------T-A-T-GT-G----------------------------------------------------A--TA---T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-GA-----C-A--------T-ATA-AGTG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---ATT---TTGCTGATA---TGCC-A-A-T-AA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93593 : AATA--A--AATGACTGCTTCTTAG-T----TATATTCACTTAATTG-AATTATTGAAAAT--ATAAT--ATC--------T-A---G--A-TTTA-ATATCTA-------AC------------------------A-----A--TATT-T--G--AC--TGT---------CTG--T-GA-------G---TAT-TT-----T-ACCAATGTTT-ATATATTG-----T-GT-GTTTATG-CCAT------ATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TT-----T-----GTAAACGGTCACAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-AAAACTTCA------T-TTG-AAACT
gi|93594 : ATGAATGCTTT--AA-TAACTT-------------TGCAAA--------ATTAATGAT--ATG--------C-T-T-GTCG-TTTA-GT-T-TGT---T---C------------------------A----TA--TGTT-T--AA-TA--TGTG------C-TT-----TT-------G---TAT-TA-----C-A--------T-GTA-ATTG-----T-AT-TGCTGTG-TCAT------T----T----TT----ATGCAAT-CATAT------A---T------T-----GTGAATGTCCTAAGGC-A-T------C---ATC---TTGCTGGTT---TGCT-A-A-T-AA------AAACAATC-TCG-AAACTT
gi|93595 : TGACTGTTTC----------T-------------T--AAT-------------TTAT--AT-------------T-CT-ACTTTG-AT-CATATATTT--AC-----------------------------TA--CCAT-T--G--TA--TTTA------A-CTG--T--------------------------------------ATA----G-----T-ATTGTCTTTG-TCAT------A----T----TT----C-----TGTA-AT-C----A---TG-----------GTAAATGGCCAAAGGC-A-AT-----T---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-A-A-T-AA------A------CTTTG-AAACTT
gi|93596 : ----T-------------TG-CAA--------AT--GTAAT--GTC--------T-A---G--A-TTTG-AT--GTCT---T--AC------------------------A-----A--TCTT-T--GACTA--TTTAAGAGGCTATTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATACA--G-----T-AT-GTCTATG-CCAT------ATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TT-----T-----GTAAATGGCCGTAGAT-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-ATT-AA------A------C--TG-AAACT
gi|93597 : -------------TG-AAT--------A------AT--ATT--------T-ACT-GT-----TG-TT-TATAT---TCTAC------------------------A----TA--TATT-T--AA-TG--TGTA------T-CAA--T-TT-------G---TAT-TT-----TTG--------T-ATATATTG-----T--T-TTCTTTG-CCAT------A----T----CT----C---ATT-TA-AT-TTTA-T---TT-----T-----GTAAATGACCAATGGC-A-T------T---TTA---TTGCCGATT---TACA-A-G-TAAA------A------C-TTT-AAAATT
gi|93598 : -AAT--------AA--GAGAT--ATG--------T-T-T-GTTG-TTTATAT-TGTAT---TGTAC------------------------A----TA--TACT-T--A---------A------T-TTG--T-AT-----------CAT-TT----------------T-GTA-ATTG-----T-AT-GTCTTTT-CTAT------A----T----CT----C---ATG-TA-AT----A-A---TATTT--T-----GTAAATGACCAAAGGC-A-T------T---CTG---TTGCCGATA---TGCT-A-A-TAAA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93590 : -AAA--------AT--GTGAT--ATA--------T-C-T-GG-A-TTTG-AT--ATCT---T--AC------------------------A-----A--TGTT-T--G-------GC----------TG--T-TT-------A---TATATT-----T-A--------T-ATA--TTT-----T-AT-GTCTTTG-CCAC------A----T----TT----G---TTT-TA-AT---AA-A---CA-----TT----GTAAATGACCACAGAA-A-AATA---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-AA------C------A-ATG-AAACT
gi|93600 : aagctccaagcaaaggtaaactgtgaatactattgtttttaaacagttatttattccttttgaatagattttttttaacatgaaaacatgataatttcactggaatataaattatcT--------AT--GTTATTTATG--------TTA-T-AT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-T--C--AAACTGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTG-CCAT------A----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGGC-ATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-A-A-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93599 : T--------AT--GTTATCTATG--------TTA-T-AT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTG-CCAT------A----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGGC-ATA------T----TT---TTACTGATAGTTTGCC-A-A-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93601 : T--------AT--GTTATCTATG--------TTA-T-AT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTG-CCAT------A----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T------T-----GTTAATGGCCAAAGGC-ATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-A-A-T-AA------A------T-TTG-AA
gi|93604 : --------AT--ATGAT--ATG--------T-G-T-GT-A-TTTG-
gi|93605 : --------AT--GTGAT--ATG--------T-G-T-GT-A-TCTT-TT-TGTAT---T--ttttagttttgtatttcacaatagtgtatgtctatgccatatttaaattaatttgattttgtaaatggccataggcaattatttgctgatatgtcaataaacttataaactt
gi|93589 : --------AT--TTGAT--ATC--------TTA-CAGT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGT-------C-TTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATG-CCAT------A----T----TTGTTTA---AAT----AT-TC-------TT-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-AA------A------A-CTG-AAGCTtaatattattgtttgtctatgccatatttgagtttatttcgatttgtaaatggccataagcatttaattgatgatatgttaataaacgtgtaaactt
gi|93602 : caagatatattactgaggcttttacgccaagaaaaactaccttgaatacaatgactgcttcttaactatattcacttaattgaattactgaaaatataatatcgag-A-TTTG-AT--ATCT---T--ACCAT---------------------A----TG--TGAC-T--G--TC--TGTG------A-GTA--T-TT-------TAACTATGTT-----T-A--------T-ATA-GT-G-----T-AT-GTCTATG-CCAT------ATTTGT----TT----A---AAT----AT-TTT------TT-----T-----GTAAATGGTCATAGGC-A-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC---A-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93603 : -TGTCC---T--AC------------------------A----TA--TA------G--AA--C--A------A-TTG--T-TT-------G---TAT-AT-----C-A--------T-ATT-ATTG-----T-AT-GTGTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TG-----T-----GCAAATGGCCATTGGA-A-A------T---GAT---TTACTGATA---TGCC-A-A-T-AA------
gi|93604 : ------------------------A----TA--TGATAT--G--TG--TGTA------T-TTG--T-TTTAGTTTTG---TAT-TT-----C-A--------CAATA-G-TG-----T-AT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TT-----T-----GTAAATGGCCATAGGC-A-A------T---TAT---TTGCTGATA---TGTC-A-A-T-AA------A------C-TTATAAACTT
gi|93605 : ------------------------A----TG--TGATAT--G--TG--TGTA------T-CTT--T-TT-------G---TAT-TT-----A-A--------T-ATT-ATTG-----T-TT-GTCTATG-CCAT------A----T----TT----G---AGT-TT-AT-TTCG-A---TT-----T-----GTAAATGGCCATAAGC-A-------------TTTAATTGATGATA---TGTT-A-A-T-AA------A------C-GTGTAAACTT
gi|93606 : -T--A--TA--TTTA------T-TTG--CATT-------G---TAT-TTAAAAGT-A--------T-ATA-ATTG-----T----GTTT--G-CCAT------A----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGGC-A-AATTTTAT---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-A-A-T-AA------A------CTTTG-AAA
gi|93607 : --TA--TATA------T-TTA--T-TT-------G---CAT-TG-----T-A--------T-TTA-AGTGAATATT-ATTGTCT--G-CCAT------A----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGGC-A-AG-----T---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-A-A-T-AA------A------CTTTG-AA
gi|93608 : A--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTG-CCAT------A----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGGC-ATA------T----TT---TTGTTGATAGTTTGCC-A-A-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93609 : --TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTT-ATTG-----T-CA-GTCTTTT-CCAT------A----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T------T-----GTAAATGGCCAAAGAC-ATA------T---G-T---TTGCTGACAGTTTGCC-A-A-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93610 : -TTG--T-T--------G---TAT-T--------A--------T-ATA-GT----------------ATG-CCGT------A----T----TT----A---TAT-AA-ATATCCATA---TA-----T-----ATAAATAGCCATAAGC-A-A------TAGTGTA---TTGTCGTTA---TGCC-A-A-T-GA------A------C--CG-AAACT
gi|93611 : TCG-----T-AT-G-----G-CCAT------A----T----TT----A-----------T-TTAA-AAACTT-----T-----GTAAATAGCCAAAGGCAA-A------T---G-T---TTGCCGAAAT--TGCC-A-A-TAAA------A------T-TTG-AA
gi|93579 : T-GCCTATGGCCATTTACACA----T----TC----A---AAT-TA-AT-TTAA-A---T----------------ATGG-CATAGAC-A-
gi|93592 : atcaaggaataaaaaaagtatttgtaatctggcaaaatttataaccgaagctcaaaagctaaggcaagaaactttaaacaatttgattgattattgatatgattataaatgattctgtaattatagatgtataaataacatgactgcttcagtttgaatatgtgatatgaatgtatttgattgtattacatataattgtatgtatttgtttgtatttcatataattgtaT-GCCTATGGCCATTTACACA----T----TC----A---AAT-TA-AT-TTAA-A---T----------------ATGG-CATAGAC-A--------------T---ACACTTATA---TGTC-ATA-C-AA------A------C-atgttttgctgatatgccaataaacttgaa
gi|93612 : tgttaaatgccatgactgcttcaatttgaatatgtgatatgtatgtattt---TG-----T-----GTAAATGACCAAAGGC-A-A------A---CTT---TT-CCGAT----TGCTGA-A-T-AA------A------C-TTG-AAACTatattttgctgatatgccaataaacttgtaaactt
gi|93613 : TAAATTGCCATATGA-A-A------T---GAT---TTGCTGATT---TACC-A-A-T-AA------A------C-TTGTAAAATT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222222 11 1111111 11 111 1111 111111111111 111111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 111 222222222222 22222222 111
lowQualScore : 444444 5 6666666666 4 0 0 4 33 77777 44 55 0000000 2 11 6666 000 5 2 2222 555 44 77 8888 6666 0 22 000000000000 2 666666666 22 1 333333333333333333 5 1 0 33 1 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 55555555555555 1 4444444 222 3 66666666 44444444 1 66 33333 4 2 3 555555555 2222 222 000 1 777777777777 44444 1 22222222 444444444 111 1 1 4 333333 44444444 8
lowQualScore : ...... . .......... . . . . .. ..... .. .. ....... . .. .... ... . . .... ... .. .. .... .... . .. ............ . ......... .. . .................. . . . .. . . ....................................................... .. .............. . ....... ... . ........ ........ . .. ..... . . . ......... .... ... ... . ............ ..... . ........ ......... ... . . . ...... ........ .
lowQualScore : 444444 0 9999999999 4 9 8 2 66 77777 22 88 0000000 9 88 1111 999 7 9 9999 000 44 55 5555 1111 7 22 222222222222 0 777777777 44 2 444444444444444444 0 7 1 77 6 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88 22222222222222 2 1111111 222 8 55555555 55555555 2 11 00000 8 4 0 222222222 6666 111 555 2 888888888888 22222 8 88888888 444444444 555 2 2 7 444444 66666666 8
consensus : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
Reference ( family-572 ) : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93578 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAACTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTGTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93579 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------A-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AA
gi|93580 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGT-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTCA-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-G--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTATATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGAAA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93581 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-CAATCTGGCAAAATTTATAACCTAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-TTGTAATTATAGATGTATACATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93582 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAAA---------TATTTG-TAATCTGGCAAAACTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGTTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGGT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAGT-T--G--TA--TG------------------T-------C---TAT-GC-----C-A--------T-AT-------------------------------------TT----A---AAT-TA-AT-TTGG-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TT
gi|93583 : ATGAAGGAAAAAAG------A-AAA----------TATTTA-TAATCTTGCAAATTTCATGACCAAAGCTCAAAAGATTAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CACTTTACTT-TGTTGATTCTTGA-T-ATGATT-T--TA---TATGC-TT-TTGTTATTTTAGATGTTTAAATACCATCCATCACTGCTGCA-----G-T----TTG-ATT-------AT--GTGAT--ATG--------T---------------T-TGTAT---T--A-----------------------------------AAT---------------------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-AAT-TTTG-----T-AT-GTCTATGTCATA----T----TT----G---AAT-TA-AT-TGGA-A---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---ATGCTGATA---TGCC-AG-T-AG------T------C-TTGTAAATTT
gi|93584 : ATCAAGAAATAAAATAAAATA-AAGAGAATTTGCGTATTTG-CAATTTACCATAATTTATAACGGAAGCTCAAAATCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GCTTGATTCTTGA-T-ATGCTT-T--TA---AATGA-TT-AAGTAAT
gi|93585 : TCATGGAATTAAA------ATAAA----------T-TTTGACAATCTGGAGAAATATTTA------GCTCAAACGCTCAAGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----GTGT-ATTTGATTCTTGA-T-ACGATC-T--TA---AATGA-TT-TTGTAATAGTAGATGTTTGTATT----CCATGACTGTTTTC-----C-T----TTG-ATT-------TT--GTGAT--ATG--------T-G-TGT-A-TTT--AT-T--------------------------------------------------------TA--TG------------G--T-TT-------G---GTT-TT-----C-A--------T-ACT-AGTG-----T-AT-GTTTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTATATAGCAATAGACG-A------T---GAC---TGGCTGATA---TCCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACT
gi|93586 : G-TAATACATCAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAA-C-TTTATTCACTTA---AATAA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGTA------T-T-A--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----TATGTTT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93587 : CAAGATCTATTACTGAGGCTTTTACGCTAAGA-AA-----AACTA--ACT-------TGAATA--CA----AT-------GCTTCTTAACT-ATATTT-ACTTA---AATGA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------------------T-T--G--TG--AATA------T-CT---T-AC-------G---TATGTT-----T-A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTCTATGCCATA----T----TT----G-----------T-TTGA-A---TATTCTTTGTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------C--TG-AA
gi|93588 : CAATATTTATTACTCGGGCTTTTATGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTAA-ATACA----AT---GACTGATTCT------AT-ACT-A--TATTCACTGA-AT--TG-AATTATTGA-----AAATA----CAATGTCT-----A-----G--------------------AT--TTGAT--ATG--------T-A-CATTG-TTTG-AC-TGT-T---T--AC------------------------GAGTCTA--TAAC-C-----TA--TGT-----------------T-------A---AAT-T-----------------------ATTG-----T-GT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-T----A---TTG-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTGGTTA---GGCC-AA-TCAA------A------C--TG-AAACT
gi|93589 : CAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCCAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAACT-ATATTC-ACTTA---ATTGAATTACTGAAAATATA---------ATA----TCGAGA---------------T----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------GT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGT-------C-TTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----T----TTGTTTA---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAGCT
gi|93590 : AAGCTCCAA-GCAAAGGTAAACTGTGA--AT-ACTATTGTTTTTAA-A--CA----GTT---ATTTATTCCT---T-TTGA---A--TA------GA-TT-TTTT--TTA-ACATG---AAA-A----C-ATGATAATTTCACTGGAA-T----ATA-AATTATCAAAAT--GTGAT--ATA--------T-C-TGG-A-TTTG-AT--ATCT---T--AC------------------------A-----A--TGTT-T--G-------GC----------TG--T-TT-------A---TATATT-----T-A--------T-ATA--TTT-----T-AT-GTCTTTGCCACA----T----TT----G---TTT-TA-AT---AA-A---CATT----GTAAATGACCACAGAAA-AATA---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------C------A-ATG-AAACT
gi|93591 : TAA-G--CA----ATTTTAATTGTTTCGTGA-TTACGATT-C--GA---AATGA-GT-TTGTAACTGTAGATGTATAAATA----CAATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-ATT-------AT--GTGATTTACGAATTTGTCT-A-TGT-A-TTT--AT-TTTGT---C--ACTGACTTAATAAGATCTACATCAATA----TA--TGTT-T--A--TA--TGTC------T-TTGGTT-TT-------G---TAT-TT-----C-A-----------------------T-GT-GTCCATGCAAT-----T----TT----A---AAT-TA-CT-TT
gi|93592 : TGT-TAAATG----CCATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-AA------------------------------T-A-TGT-G----------------------------------------------------A--TA---T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-GA-----C-A--------T-ATA-AGTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---ATT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93593 : ----TTG-AAA-------AT--ATAAT--ATC--------T-A--G--A-TTTA-ATATCTA-------AC------------------------A-----A--TATT-T--G--AC--TGT---------CTG--T-GA-------G---TAT-TT-----T-ACCAATGTTT-ATATATTG-----T-GT-GTTTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAACGGTCACAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AAAACTTCA------T-TTG-AAACT
gi|93594 : aataaaatgactgcttcttagttatattcacttaattgaattaATGAATGCTTTA-----A-TAACTTTGCAAA-------ATTAATGAT--ATG--------C-T-TGTCG-TTTA-GT-T-TGT---T---C------------------------A----TA--TGTT-T--AA-TA--TGTG------C-TT-----TT-------G---TAT-TA-----C-A--------T-GTA-ATTG-----T-AT-TGCTGTGTCATT----T----TT----ATGCAAT-CATAT------A---T-T-----GTGAATGTCCTAAGGCA-T------C---ATC---TTGCTGGTT---TGCT-AA-T-AA------AAACAATC-TCG-AAACTT
gi|93595 : TGACTGTTTC-------------TT--AAT------------TTAT--AT-------------TCT-ACTTTG-AT-CATATATTT--AC-----------------------------TA--CCAT-T--G--TA--TTTA------A-CTG--T--------------------------------------ATA----G-----T-ATTGTCTTTGTCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-C----A---TG------GTAAATGGCCAAAGGCA-A------TT--GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAACTT
gi|93596 : ----TTG-CAA-------AT--GTAAT--GTC--------T-A--G--A-TTTG-AT--GTCT---T--AC------------------------A-----A--TCTT-T--GACTA--TTTAAGAGGCTATTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATACA--G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCGTAGATA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AATT-AA------A------C--TG-AAACT
gi|93597 : TG-AAT-------A------AT--ATT--------T-ACTGT-----TG-TT-TATAT---TCTAC------------------------A----TA--TATT-T--AA-TG--TGTA------T-CAA--T-TT-------G---TAT-TT-----TTG--------T-ATATATTG-----T--T-TTCTTTGCCATA----T----CT----C---ATT-TA-AT-TTTA-T---TTT-----GTAAATGACCAATGGCA-T------T---TTA---TTGCCGATT---TACA-AG-TAAA------A------C-TTT-AAAATT
gi|93598 : -AAT-------AA--GAGAT--ATG--------T-T-TGTTG-TTTATAT-TGTAT---TGTAC------------------------A----TA--TACT-T--A---------A------T-TTG--T-AT-----------CAT-TT----------------T-GTA-ATTG-----T-AT-GTCTTTTCTATA----T----CT----C---ATG-TA-AT----A-ATATTTT-----GTAAATGACCAAAGGCA-T------T---CTG---TTGCCGATA---TGCT-AA-TAAA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93599 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTACTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93600 : T-------AT--GTTATTTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-T--C--AAACTGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93601 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTTAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------T-TTG-AA
gi|93602 : -A-TTTG-AT--ATCT---T--ACCAT---------------------A----TG--TGAC-T--G--TC--TGTG------A-GTA--T-TT-------TAACTATGTT-----T-A--------T-ATA-GT-G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TTT------TTT-----GTAAATGGTCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC--A-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93603 : -TGTCC---T--AC------------------------A----TA--TA------G--AA--C--A------A-TTG--T-TT-------G---TAT-AT-----C-A--------T-ATT-ATTG-----T-AT-GTGTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GCAAATGGCCATTGGAA-A------T---GAT---TTACTGATA---TGCC-AA-T-AA------
gi|93604 : ------------------------A----TA--TGATAT--G--TG--TGTA------T-TTG--T-TTTAGTTTTG---TAT-TT-----C-A--------CAATA-G-TG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---TAT---TTGCTGATA---TGTC-AA-T-AA------A------C-TTATAAACTT
gi|93605 : ------------------------A----TG--TGATAT--G--TG--TGTA------T-CTT--T-TT-------G---TAT-TT-----A-A--------T-ATT-ATTG-----T-TT-GTCTATGCCATA----T----TT----G---AGT-TT-AT-TTCG-A---TTT-----GTAAATGGCCATAAGCA-------------TTTAATTGATGATA---TGTT-AA-T-AA------A------C-GTGTAAACTT
gi|93606 : -T--A--TA--TTTA------T-TTG--CATT-------G---TAT-TTAAAAGT-A--------T-ATA-ATTG-----T----GTTT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AATTTTAT---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAA
gi|93607 : --TA--TATA------T-TTA--T-TT-------G---CAT-TG-----T-A--------T-TTA-AGTGAATATT-ATTGTCT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AG-----T---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AA
gi|93608 : A--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGTTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93609 : --TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTT-ATTG-----T-CA-GTCTTTTCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGACATA------T---G-T---TTGCTGACAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93610 : -TTG--T-T--------G---TAT-T--------A--------T-ATA-GT----------------ATGCCGTA----T----TT----A---TAT-AA-ATATCCATA---TAT-----ATAAATAGCCATAAGCA-A------TAGTGTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-GA------A------C--CG-AAACT
gi|93611 : TCG-----T-AT-G-----GCCATA----T----TT----A-----------T-TTAA-AAACTTT-----GTAAATAGCCAAAGGCA-AA-----T---GTT---T-GCCGAAAT--TGCC-AA-TAAA------A------T-TTG-AA
gi|93612 : ---TGT-----GTAAATGACCAAAGGCA-A------A---CTT---TT-CCGAT----TGCTGAA-T-AA------A------C-TTG-AAACT
gi|93613 : TAAATTGCCATATGAA-A------T---GAT---TTGCTGATT---TACC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAAATT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222222 11 1111111 11 111 1111 111111111111 111111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 111 222222222222 22222222 111
lowQualScore : 444444 5 6666666666 4 0 0 4 33 77777 44 55 0000000 2 11 6666 000 5 2 2222 555 44 77 8888 6666 0 22 000000000000 2 666666666 22 1 333333333333333333 5 1 0 33 1 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 55555555555555 1 4444444 222 3 66666666 44444444 1 66 33333 4 2 3 555555555 2222 222 000 1 777777777777 44444 1 22222222 444444444 111 1 1 4 333333 44444444 8
lowQualScore : ...... . .......... . . . . .. ..... .. .. ....... . .. .... ... . . .... ... .. .. .... .... . .. ............ . ......... .. . .................. . . . .. . . ....................................................... .. .............. . ....... ... . ........ ........ . .. ..... . . . ......... .... ... ... . ............ ..... . ........ ......... ... . . . ...... ........ .
lowQualScore : 444444 0 9999999999 4 9 8 2 66 77777 22 88 0000000 9 88 1111 999 7 9 9999 000 44 55 5555 1111 7 22 222222222222 0 777777777 44 2 444444444444444444 0 7 1 77 6 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88 22222222222222 2 1111111 222 8 55555555 55555555 2 11 00000 8 4 0 222222222 6666 111 555 2 888888888888 22222 8 88888888 444444444 555 2 2 7 444444 66666666 8
consensus : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
Reference ( family-572 ) : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93578 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAACTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTGTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93579 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------A-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AA
gi|93580 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGT-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTCA-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-G--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTATATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGAAA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93581 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-CAATCTGGCAAAATTTATAACCTAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-TTGTAATTATAGATGTATACATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93582 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAAA---------TATTTG-TAATCTGGCAAAACTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGTTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGGT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAGT-T--G--TA--TG------------------T-------C---TAT-GC-----C-A--------T-AT-------------------------------------TT----A---AAT-TA-AT-TTGG-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TT
gi|93583 : ATGAAGGAAAAAAG------A-AAA----------TATTTA-TAATCTTGCAAATTTCATGACCAAAGCTCAAAAGATTAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CACTTTACTT-TGTTGATTCTTGA-T-ATGATT-T--TA---TATGC-TT-TTGTTATTTTAGATGTTTAAATACCATCCATCACTGCTGCA-----G-T----TTG-ATT-------AT--GTGAT--ATG--------T---------------T-TGTAT---T--A-----------------------------------AAT---------------------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-AAT-TTTG-----T-AT-GTCTATGTCATA----T----TT----G---AAT-TA-AT-TGGA-A---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---ATGCTGATA---TGCC-AG-T-AG------T------C-TTGTAAATTT
gi|93584 : ATCAAGAAATAAAATAAAATA-AAGAGAATTTGCGTATTTG-CAATTTACCATAATTTATAACGGAAGCTCAAAATCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GCTTGATTCTTGA-T-ATGCTT-T--TA---AATGA-TT-AAGTAAT
gi|93585 : TCATGGAATTAAA------ATAAA----------T-TTTGACAATCTGGAGAAATATTTA------GCTCAAACGCTCAAGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----GTGT-ATTTGATTCTTGA-T-ACGATC-T--TA---AATGA-TT-TTGTAATAGTAGATGTTTGTATT----CCATGACTGTTTTC-----C-T----TTG-ATT-------TT--GTGAT--ATG--------T-G-TGT-A-TTT--AT-T--------------------------------------------------------TA--TG------------G--T-TT-------G---GTT-TT-----C-A--------T-ACT-AGTG-----T-AT-GTTTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTATATAGCAATAGACG-A------T---GAC---TGGCTGATA---TCCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACT
gi|93586 : G-TAATACATCAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAA-C-TTTATTCACTTA---AATAA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGTA------T-T-A--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----TATGTTT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93587 : CAAGATCTATTACTGAGGCTTTTACGCTAAGA-AA-----AACTA--ACT-------TGAATA--CA----AT-------GCTTCTTAACT-ATATTT-ACTTA---AATGA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------------------T-T--G--TG--AATA------T-CT---T-AC-------G---TATGTT-----T-A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTCTATGCCATA----T----TT----G-----------T-TTGA-A---TATTCTTTGTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------C--TG-AA
gi|93588 : CAATATTTATTACTCGGGCTTTTATGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTAA-ATACA----AT---GACTGATTCT------AT-ACT-A--TATTCACTGA-AT--TG-AATTATTGA-----AAATA----CAATGTCT-----A-----G--------------------AT--TTGAT--ATG--------T-A-CATTG-TTTG-AC-TGT-T---T--AC------------------------GAGTCTA--TAAC-C-----TA--TGT-----------------T-------A---AAT-T-----------------------ATTG-----T-GT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-T----A---TTG-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTGGTTA---GGCC-AA-TCAA------A------C--TG-AAACT
gi|93589 : CAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCCAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAACT-ATATTC-ACTTA---ATTGAATTACTGAAAATATA---------ATA----TCGAGA---------------T----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------GT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGT-------C-TTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----T----TTGTTTA---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAGCT
gi|93590 : AAGCTCCAA-GCAAAGGTAAACTGTGA--AT-ACTATTGTTTTTAA-A--CA----GTT---ATTTATTCCT---T-TTGA---A--TA------GA-TT-TTTT--TTA-ACATG---AAA-A----C-ATGATAATTTCACTGGAA-T----ATA-AATTATCAAAAT--GTGAT--ATA--------T-C-TGG-A-TTTG-AT--ATCT---T--AC------------------------A-----A--TGTT-T--G-------GC----------TG--T-TT-------A---TATATT-----T-A--------T-ATA--TTT-----T-AT-GTCTTTGCCACA----T----TT----G---TTT-TA-AT---AA-A---CATT----GTAAATGACCACAGAAA-AATA---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------C------A-ATG-AAACT
gi|93591 : TAA-G--CA----ATTTTAATTGTTTCGTGA-TTACGATT-C--GA---AATGA-GT-TTGTAACTGTAGATGTATAAATA----CAATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-ATT-------AT--GTGATTTACGAATTTGTCT-A-TGT-A-TTT--AT-TTTGT---C--ACTGACTTAATAAGATCTACATCAATA----TA--TGTT-T--A--TA--TGTC------T-TTGGTT-TT-------G---TAT-TT-----C-A-----------------------T-GT-GTCCATGCAAT-----T----TT----A---AAT-TA-CT-TT
gi|93592 : TGT-TAAATG----CCATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-AA------------------------------T-A-TGT-G----------------------------------------------------A--TA---T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-GA-----C-A--------T-ATA-AGTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---ATT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93593 : ----TTG-AAA-------AT--ATAAT--ATC--------T-A--G--A-TTTA-ATATCTA-------AC------------------------A-----A--TATT-T--G--AC--TGT---------CTG--T-GA-------G---TAT-TT-----T-ACCAATGTTT-ATATATTG-----T-GT-GTTTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAACGGTCACAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AAAACTTCA------T-TTG-AAACT
gi|93594 : aataaaatgactgcttcttagttatattcacttaattgaattaATGAATGCTTTA-----A-TAACTTTGCAAA-------ATTAATGAT--ATG--------C-T-TGTCG-TTTA-GT-T-TGT---T---C------------------------A----TA--TGTT-T--AA-TA--TGTG------C-TT-----TT-------G---TAT-TA-----C-A--------T-GTA-ATTG-----T-AT-TGCTGTGTCATT----T----TT----ATGCAAT-CATAT------A---T-T-----GTGAATGTCCTAAGGCA-T------C---ATC---TTGCTGGTT---TGCT-AA-T-AA------AAACAATC-TCG-AAACTT
gi|93595 : TGACTGTTTC-------------TT--AAT------------TTAT--AT-------------TCT-ACTTTG-AT-CATATATTT--AC-----------------------------TA--CCAT-T--G--TA--TTTA------A-CTG--T--------------------------------------ATA----G-----T-ATTGTCTTTGTCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-C----A---TG------GTAAATGGCCAAAGGCA-A------TT--GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAACTT
gi|93596 : ----TTG-CAA-------AT--GTAAT--GTC--------T-A--G--A-TTTG-AT--GTCT---T--AC------------------------A-----A--TCTT-T--GACTA--TTTAAGAGGCTATTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATACA--G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCGTAGATA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AATT-AA------A------C--TG-AAACT
gi|93597 : TG-AAT-------A------AT--ATT--------T-ACTGT-----TG-TT-TATAT---TCTAC------------------------A----TA--TATT-T--AA-TG--TGTA------T-CAA--T-TT-------G---TAT-TT-----TTG--------T-ATATATTG-----T--T-TTCTTTGCCATA----T----CT----C---ATT-TA-AT-TTTA-T---TTT-----GTAAATGACCAATGGCA-T------T---TTA---TTGCCGATT---TACA-AG-TAAA------A------C-TTT-AAAATT
gi|93598 : -AAT-------AA--GAGAT--ATG--------T-T-TGTTG-TTTATAT-TGTAT---TGTAC------------------------A----TA--TACT-T--A---------A------T-TTG--T-AT-----------CAT-TT----------------T-GTA-ATTG-----T-AT-GTCTTTTCTATA----T----CT----C---ATG-TA-AT----A-ATATTTT-----GTAAATGACCAAAGGCA-T------T---CTG---TTGCCGATA---TGCT-AA-TAAA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93599 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTACTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93600 : T-------AT--GTTATTTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-T--C--AAACTGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93601 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTTAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------T-TTG-AA
gi|93602 : -A-TTTG-AT--ATCT---T--ACCAT---------------------A----TG--TGAC-T--G--TC--TGTG------A-GTA--T-TT-------TAACTATGTT-----T-A--------T-ATA-GT-G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TTT------TTT-----GTAAATGGTCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC--A-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93603 : -TGTCC---T--AC------------------------A----TA--TA------G--AA--C--A------A-TTG--T-TT-------G---TAT-AT-----C-A--------T-ATT-ATTG-----T-AT-GTGTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GCAAATGGCCATTGGAA-A------T---GAT---TTACTGATA---TGCC-AA-T-AA------
gi|93604 : ------------------------A----TA--TGATAT--G--TG--TGTA------T-TTG--T-TTTAGTTTTG---TAT-TT-----C-A--------CAATA-G-TG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---TAT---TTGCTGATA---TGTC-AA-T-AA------A------C-TTATAAACTT
gi|93605 : ------------------------A----TG--TGATAT--G--TG--TGTA------T-CTT--T-TT-------G---TAT-TT-----A-A--------T-ATT-ATTG-----T-TT-GTCTATGCCATA----T----TT----G---AGT-TT-AT-TTCG-A---TTT-----GTAAATGGCCATAAGCA-------------TTTAATTGATGATA---TGTT-AA-T-AA------A------C-GTGTAAACTT
gi|93606 : -T--A--TA--TTTA------T-TTG--CATT-------G---TAT-TTAAAAGT-A--------T-ATA-ATTG-----T----GTTT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AATTTTAT---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAA
gi|93607 : --TA--TATA------T-TTA--T-TT-------G---CAT-TG-----T-A--------T-TTA-AGTGAATATT-ATTGTCT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AG-----T---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AA
gi|93608 : A--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGTTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93609 : --TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTT-ATTG-----T-CA-GTCTTTTCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGACATA------T---G-T---TTGCTGACAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93610 : -TTG--T-T--------G---TAT-T--------A--------T-ATA-GT----------------ATGCCGTA----T----TT----A---TAT-AA-ATATCCATA---TAT-----ATAAATAGCCATAAGCA-A------TAGTGTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-GA------A------C--CG-AAACT
gi|93611 : TCG-----T-AT-G-----GCCATA----T----TT----A-----------T-TTAA-AAACTTT-----GTAAATAGCCAAAGGCA-AA-----T---GTT---T-GCCGAAAT--TGCC-AA-TAAA------A------T-TTG-AA
gi|93612 : ---TGT-----GTAAATGACCAAAGGCA-A------A---CTT---TT-CCGAT----TGCTGAA-T-AA------A------C-TTG-AAACT
gi|93613 : TAAATTGCCATATGAA-A------T---GAT---TTGCTGATT---TACC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAAATT
blockSeqs : TAAAAT T AGAATTTGCG A A GC ACTGT CT CT ATTGTTT T TA CTTT TTT C T CACT TTC AT AC TGTA CCAT GC CTGGAAT C ATTATCAAA TA G TTACGAATTTGTCTAT T C AT A G GTCACTGACTTAATAAGATCTACATCAATATATGTTTAT AC AAGAGGCTATTA A TAGTTTT AAC G TAAAAGT CCAATGTT A TA AATAT T T A TATGT GTTT TGC TGT T TTAAAAACTT TCTTT T AATTTTA AGTGTA GTT G T C AACTTC AACAATC T
blockSeqs : . . A . A GC . . CT . . TA . TT C . ACT . T C TGTA . GC ATAACT . AT . G CTATGTTAT C . G . G GATACTTAAACAATTCAAA . CTTTGGT . . . A TTT . . CA . T T A TTTGT . . TGT . ATCCATATA T T ATTG TTTAA GTT . . A . CT T
blockSeqs : . . . . A GC . . CT . . TA . TT . . ACT . T C TGTA . GC GAT . AT . G TTATGTTAT T . A . G GATACTTAAACAATTCAAA . ATTTG . . . G TC . . TA . T . A TTTGT . . TGT . TTGAATG . T ATTG TGTC GTT . . A . CT T
blockSeqs : . . . . A GC . . T . . . . TT . . A . T T TGTA . GT GAT . AT . G CTATGTTAT . . G . G ATTCTACATATATTTAAT . ATTTG . . . . TC . . A . T . A TTTGT . . TT . TTGAATG . T ATTG GTT GTT . . A . CT T
blockSeqs : . . . . A GC . . . . . . . TT . . A . T C TGTT . GC GT . AT . G ATTTACT . . G . G CTTACCATATGTGACTGT . ATTTG . . . . TC . . A . . . A TTTGT . . TT . TTGAATG . T ATTG GTT GTT . . . . C T
blockSeqs : . . . . A GC . . . . . . . TT . . A . T T TGTT . GT GT . TT . G ATGAAT . . G . G TTACGAGTCTATAACCT . ATTTG . . . . CC . . A . . . A TGAT . . TT . TTGGATG . T AATA GAT T . . . . C T
blockSeqs : . . . . C GC . . . . . . . TT . . A . T A TGTA . AT GT . TT . T ATGTAT . . G . G ATATTTACTACCATTGT . AACTG . . . . TC . . T . . . A TGAT . . TT . TGGAATT . T ATTG GTT . . . . . C T
blockSeqs : . C GT . . . . . . . GT . . T . T T TGT . GC GT . TT . T ATGTAT . . G . G GATACTTAAACAATTCA . ATCAA . . . . TC . . A . . . A TGAT . . TT . TTGATTT . T ATTG GAT . . . . . C .
blockSeqs : C A . . . . . . . T . . T . A T TG . GC GT . AA . G ATGTAT . . G . G CTTACAATCTTTGACT . ATTTG . . . . TT . . A . . . A TGAT . . TT . TTGAATA . T ATTG GAC . . . . . C .
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . T . T T . . GC CT . AA . T ATGTGT . . G . A ATTGTACATATACTTA . GAGTA . . . . TT . . A . . . T TGAT . . TT . TTGAATG . T TA GTA . . . . . C .
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . A . G . . . GT AT . AT . G ATGTAC . . A . T ATTACATATAATTGT . AATTG . . . . TC . . A . . . A T . . TT . TTTATTT . C TA GTA . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AT . AA . G ATATCT . . A . C ATTACATATAATGGT . ATTTG . . . . AC . . A . . . A T . . TT . AATATTT . T TA GTA . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . G . AT . A ATGCTT . . G . A ATTTCATATAATTGT . ATCTT . . . . TT . . A . . . A T . . TC . TTGAATG . C AG GTA . . . . . C .
blockSeqs : . T . AT . G ATGTTT . . G . G ATTTCATATAGTTGT . ATTTG . . . . AC . . A . . . G T . . TT . TTGATTT . A TA GTA . . . . . A .
blockSeqs : . . . T . T ATCTA . . G . A GTTCATATGTTTAAT . ATTTA . . . . TT . . A . . . T T . . GT . TTCGATT . A TA ATT . . . . . A .
blockSeqs : . T . A GTCTA . . G . G CTTACAATGTTTG . TTTG . . . . TC . . G . . . A T . . TT . AAACA . T AA GTA . . . . . C .
blockSeqs : . T . G ATGT . . . . A AACAATATTTGA . ATTA . . . . TC . . A . . . T T . . TT . TTTTT . A A ATC . . . . . T .
blockSeqs : . A . T TAT . . . . A CCTACATATAGA . ATCT . . . . TA . . G . . . T T . . TT . TCTT . A A GTA . . . . . C .
blockSeqs : . . . T ATT . . . . A TTGTTTGTGA . CTTA . . . . GT . . A . . . T T . . TA . TATT . A A TTA . . . . . C .
blockSeqs : . T A . . . . A TTGTTTGTGA . GCTT . . . . T . . A . . . T T . . T . TCTT . A A CTG . . . . . C .
blockSeqs : . . A . . . . G TTGTTTGT . ATTG . . . . T . . A . . . T T . . T . TCTT . A A GTA . . . . . A .
blockSeqs : . . A . . . . . ATTAAAT . ATTG . . . . T . . A . . . A T . . T . CATG . T A GAT . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . ATATGT . ATTG . . . . T . . A . . . A T . . T . TCTT . T A TAT . . . . . T .
blockSeqs : . . T . ATTG . . . . . . . G . . . A T . . T . TAT . T T GTC . . . . . A .
blockSeqs : . ATTG . . . . . . . . . . . A T . . T . TAT . T A GTC . . . . . C .
blockSeqs : . CTG . . . . . . . . . . . T T . . . . AT . A T GTT . . . . . C .
blockSeqs : . TG . . . . . . . . . . . T T . . . . AT . A T CTT . . . . . A .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . A T . . . . AT . A A GAT . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AT . A A TT . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . AT . T A TT . . . . . T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . AT . A A TT . . . . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . A A TT . . . . . C
blockSeqs : T . GT . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
finalCons : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
Alignments
lowQualScore : 111111 2222222222 11 1111111 11 111 1111 111111111111 111111111111111111 3333333333333333333333333333333333333333333333333333333 11111111 111111111 111 222222222222 22222222 111
lowQualScore : 444444 5 6666666666 4 0 0 4 33 77777 44 55 0000000 2 11 6666 000 5 2 2222 555 44 77 8888 6666 0 22 000000000000 2 666666666 22 1 333333333333333333 5 1 0 33 1 1 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444 11 55555555555555 1 4444444 222 3 66666666 44444444 1 66 33333 4 2 3 555555555 2222 222 000 1 777777777777 44444 1 22222222 444444444 111 1 1 4 333333 44444444 8
lowQualScore : ...... . .......... . . . . .. ..... .. .. ....... . .. .... ... . . .... ... .. .. .... .... . .. ............ . ......... .. . .................. . . . .. . . ....................................................... .. .............. . ....... ... . ........ ........ . .. ..... . . . ......... .... ... ... . ............ ..... . ........ ......... ... . . . ...... ........ .
lowQualScore : 444444 0 9999999999 4 9 8 2 66 77777 22 88 0000000 9 88 1111 999 7 9 9999 000 44 55 5555 1111 7 22 222222222222 0 777777777 44 2 444444444444444444 0 7 1 77 6 5 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888 88 22222222222222 2 1111111 222 8 55555555 55555555 2 11 00000 8 4 0 222222222 6666 111 555 2 888888888888 22222 8 88888888 444444444 555 2 2 7 444444 66666666 8
consensus : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
Reference ( family-572 ) : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTCTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TNT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCCGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93578 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAACTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTGTTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93579 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----ACATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------A-A-TGT-A-TTTG-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AA
gi|93580 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-TAATCTGGCAAAATTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGT-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTCA-AT-TGTAT---T--AC------------------------A----TA--TAAT-G--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTATATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGAAA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93581 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAG----------TATTTG-CAATCTGGCAAAATTTATAACCTAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-TTGTAATTATAGATGTATACATA----CCATGACTGCTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGAT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAAT-T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-ATA-ATTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTG-AAACTT
gi|93582 : ATCAAGGAATAAAA------A-AAAA---------TATTTG-TAATCTGGCAAAACTTATAACCGAAGCTCAAAAGCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GATTGATTATTGA-T-ATGATT-A--TA---AATGA-TT-CTGTAATTATAGATGTATAAATA----CCATGACTGTTTCA-----G-T----TTG-AAT-------AT--GTGGT--ATG--------T-A-TGT-A-TTTG-TT-TGTAT---T--TC------------------------A----TA--TAGT-T--G--TA--TG------------------T-------C---TAT-GC-----C-A--------T-AT-------------------------------------TT----A---AAT-TA-AT-TTGG-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GTT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TT
gi|93583 : ATGAAGGAAAAAAG------A-AAA----------TATTTA-TAATCTTGCAAATTTCATGACCAAAGCTCAAAAGATTAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CACTTTACTT-TGTTGATTCTTGA-T-ATGATT-T--TA---TATGC-TT-TTGTTATTTTAGATGTTTAAATACCATCCATCACTGCTGCA-----G-T----TTG-ATT-------AT--GTGAT--ATG--------T---------------T-TGTAT---T--A-----------------------------------AAT---------------------T-TTG--T-TT-------G---TAT-TT-----C-A--------T-AAT-TTTG-----T-AT-GTCTATGTCATA----T----TT----G---AAT-TA-AT-TGGA-A---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---GAT---ATGCTGATA---TGCC-AG-T-AG------T------C-TTGTAAATTT
gi|93584 : ATCAAGAAATAAAATAAAATA-AAGAGAATTTGCGTATTTG-CAATTTACCATAATTTATAACGGAAGCTCAAAATCTAAGGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----ATTT-GCTTGATTCTTGA-T-ATGCTT-T--TA---AATGA-TT-AAGTAAT
gi|93585 : TCATGGAATTAAA------ATAAA----------T-TTTGACAATCTGGAGAAATATTTA------GCTCAAACGCTCAAGCAA-----GA--A--ACT-------TTAA-A--CA----GTGT-ATTTGATTCTTGA-T-ACGATC-T--TA---AATGA-TT-TTGTAATAGTAGATGTTTGTATT----CCATGACTGTTTTC-----C-T----TTG-ATT-------TT--GTGAT--ATG--------T-G-TGT-A-TTT--AT-T--------------------------------------------------------TA--TG------------G--T-TT-------G---GTT-TT-----C-A--------T-ACT-AGTG-----T-AT-GTTTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTATATAGCAATAGACG-A------T---GAC---TGGCTGATA---TCCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACT
gi|93586 : G-TAATACATCAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAA-C-TTTATTCACTTA---AATAA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGTA------T-T-A--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----TATGTTT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93587 : CAAGATCTATTACTGAGGCTTTTACGCTAAGA-AA-----AACTA--ACT-------TGAATA--CA----AT-------GCTTCTTAACT-ATATTT-ACTTA---AATGA---------ATTATTGA-----AAATA----TAATGTCT-----A-----GAT----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------AT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------------------T-T--G--TG--AATA------T-CT---T-AC-------G---TATGTT-----T-A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTCTATGCCATA----T----TT----G-----------T-TTGA-A---TATTCTTTGTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------C--TG-AA
gi|93588 : CAATATTTATTACTCGGGCTTTTATGCTAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTAA-ATACA----AT---GACTGATTCT------AT-ACT-A--TATTCACTGA-AT--TG-AATTATTGA-----AAATA----CAATGTCT-----A-----G--------------------AT--TTGAT--ATG--------T-A-CATTG-TTTG-AC-TGT-T---T--AC------------------------GAGTCTA--TAAC-C-----TA--TGT-----------------T-------A---AAT-T-----------------------ATTG-----T-GT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-T----A---TTG-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTGGTTA---GGCC-AA-TCAA------A------C--TG-AAACT
gi|93589 : CAAGATATATTACTGAGGCTTTTACGCCAAG--AA-----AA--ACTACC-------TTGA-ATACA----AT---GACTGCTTCTTAACT-ATATTC-ACTTA---ATTGAATTACTGAAAATATA---------ATA----TCGAGA---------------T----TTG-A-T-------AT--CTTAC--A---------------GT-A-TTTG-AC-TGT-T---T--GT------------------------T----TG--TGA---------A--TGT-------C-TTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATA--TTG-----T-GT-GTTTATGCCATA----T----TTGTTTA---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------A------A-CTG-AAGCT
gi|93590 : AAGCTCCAA-GCAAAGGTAAACTGTGA--AT-ACTATTGTTTTTAA-A--CA----GTT---ATTTATTCCT---T-TTGA---A--TA------GA-TT-TTTT--TTA-ACATG---AAA-A----C-ATGATAATTTCACTGGAA-T----ATA-AATTATCAAAAT--GTGAT--ATA--------T-C-TGG-A-TTTG-AT--ATCT---T--AC------------------------A-----A--TGTT-T--G-------GC----------TG--T-TT-------A---TATATT-----T-A--------T-ATA--TTT-----T-AT-GTCTTTGCCACA----T----TT----G---TTT-TA-AT---AA-A---CATT----GTAAATGACCACAGAAA-AATA---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AA------C------A-ATG-AAACT
gi|93591 : TAA-G--CA----ATTTTAATTGTTTCGTGA-TTACGATT-C--GA---AATGA-GT-TTGTAACTGTAGATGTATAAATA----CAATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-ATT-------AT--GTGATTTACGAATTTGTCT-A-TGT-A-TTT--AT-TTTGT---C--ACTGACTTAATAAGATCTACATCAATA----TA--TGTT-T--A--TA--TGTC------T-TTGGTT-TT-------G---TAT-TT-----C-A-----------------------T-GT-GTCCATGCAAT-----T----TT----A---AAT-TA-CT-TT
gi|93592 : TGT-TAAATG----CCATGACTGCTTCA-----A-T----TTG-AA------------------------------T-A-TGT-G----------------------------------------------------A--TA---T--G--TA--TGTA------T-TTG--T-TT-------G---TAT-GA-----C-A--------T-ATA-AGTG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---ATT---TTGCTGATA---TGCC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93593 : ----TTG-AAA-------AT--ATAAT--ATC--------T-A--G--A-TTTA-ATATCTA-------AC------------------------A-----A--TATT-T--G--AC--TGT---------CTG--T-GA-------G---TAT-TT-----T-ACCAATGTTT-ATATATTG-----T-GT-GTTTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAACGGTCACAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-AAAACTTCA------T-TTG-AAACT
gi|93594 : aataaaatgactgcttcttagttatattcacttaattgaattaATGAATGCTTTA-----A-TAACTTTGCAAA-------ATTAATGAT--ATG--------C-T-TGTCG-TTTA-GT-T-TGT---T---C------------------------A----TA--TGTT-T--AA-TA--TGTG------C-TT-----TT-------G---TAT-TA-----C-A--------T-GTA-ATTG-----T-AT-TGCTGTGTCATT----T----TT----ATGCAAT-CATAT------A---T-T-----GTGAATGTCCTAAGGCA-T------C---ATC---TTGCTGGTT---TGCT-AA-T-AA------AAACAATC-TCG-AAACTT
gi|93595 : TGACTGTTTC-------------TT--AAT------------TTAT--AT-------------TCT-ACTTTG-AT-CATATATTT--AC-----------------------------TA--CCAT-T--G--TA--TTTA------A-CTG--T--------------------------------------ATA----G-----T-ATTGTCTTTGTCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-C----A---TG------GTAAATGGCCAAAGGCA-A------TT--GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAACTT
gi|93596 : ----TTG-CAA-------AT--GTAAT--GTC--------T-A--G--A-TTTG-AT--GTCT---T--AC------------------------A-----A--TCTT-T--GACTA--TTTAAGAGGCTATTA--T-CT-------A---TGT-TT-------A--------T-ATACA--G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TC-------TTT-----GTAAATGGCCGTAGATA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC-AATT-AA------A------C--TG-AAACT
gi|93597 : TG-AAT-------A------AT--ATT--------T-ACTGT-----TG-TT-TATAT---TCTAC------------------------A----TA--TATT-T--AA-TG--TGTA------T-CAA--T-TT-------G---TAT-TT-----TTG--------T-ATATATTG-----T--T-TTCTTTGCCATA----T----CT----C---ATT-TA-AT-TTTA-T---TTT-----GTAAATGACCAATGGCA-T------T---TTA---TTGCCGATT---TACA-AG-TAAA------A------C-TTT-AAAATT
gi|93598 : -AAT-------AA--GAGAT--ATG--------T-T-TGTTG-TTTATAT-TGTAT---TGTAC------------------------A----TA--TACT-T--A---------A------T-TTG--T-AT-----------CAT-TT----------------T-GTA-ATTG-----T-AT-GTCTTTTCTATA----T----CT----C---ATG-TA-AT----A-ATATTTT-----GTAAATGACCAAAGGCA-T------T---CTG---TTGCCGATA---TGCT-AA-TAAA------A------C-TTGTAAACTT
gi|93599 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTACTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93600 : T-------AT--GTTATTTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-T--C--AAACTGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93601 : T-------AT--GTTATCTATG--------TTA-TAT-A-T----AC-TATGA---T--AC------------------------T----TAAACAAT-TCAA--AA--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTTAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGCTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------T-TTG-AA
gi|93602 : -A-TTTG-AT--ATCT---T--ACCAT---------------------A----TG--TGAC-T--G--TC--TGTG------A-GTA--T-TT-------TAACTATGTT-----T-A--------T-ATA-GT-G-----T-AT-GTCTATGCCATATTTGT----TT----A---AAT----AT-TTT------TTT-----GTAAATGGTCATAGGCA-ATTG---T---GTA---TTGTCGTTA---TGCC--A-T-AA------A------A-CTG-AAACT
gi|93603 : -TGTCC---T--AC------------------------A----TA--TA------G--AA--C--A------A-TTG--T-TT-------G---TAT-AT-----C-A--------T-ATT-ATTG-----T-AT-GTGTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-A---TGT-----GCAAATGGCCATTGGAA-A------T---GAT---TTACTGATA---TGCC-AA-T-AA------
gi|93604 : ------------------------A----TA--TGATAT--G--TG--TGTA------T-TTG--T-TTTAGTTTTG---TAT-TT-----C-A--------CAATA-G-TG-----T-AT-GTCTATGCCATA----T----TT----A---AAT-TA-AT-TTGA-T---TTT-----GTAAATGGCCATAGGCA-A------T---TAT---TTGCTGATA---TGTC-AA-T-AA------A------C-TTATAAACTT
gi|93605 : ------------------------A----TG--TGATAT--G--TG--TGTA------T-CTT--T-TT-------G---TAT-TT-----A-A--------T-ATT-ATTG-----T-TT-GTCTATGCCATA----T----TT----G---AGT-TT-AT-TTCG-A---TTT-----GTAAATGGCCATAAGCA-------------TTTAATTGATGATA---TGTT-AA-T-AA------A------C-GTGTAAACTT
gi|93606 : -T--A--TA--TTTA------T-TTG--CATT-------G---TAT-TTAAAAGT-A--------T-ATA-ATTG-----T----GTTT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AATTTTAT---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AAA
gi|93607 : --TA--TATA------T-TTA--T-TT-------G---CAT-TG-----T-A--------T-TTA-AGTGAATATT-ATTGTCT--GCCATA----T----TT----C-----TGTA-AT-T----A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCA-AG-----T---GTC---TTGCCGAGT---TGCT-AA-T-AA------A------CTTTG-AA
gi|93608 : A--TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTA-ATTG-----TTAT-GTCTTTGCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGGCATA------T----TT---TTGTTGATAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93609 : --TGTA------T-T-G--A-TT-------G---TAA-T--------A--------T-GTT-ATTG-----T-CA-GTCTTTTCCATA----TGAT-TT----A---AA---A-AT------A---T-T-----GTAAATGGCCAAAGACATA------T---G-T---TTGCTGACAGTTTGCC-AA-T-AA------A------A-TTG-AA
gi|93610 : -TTG--T-T--------G---TAT-T--------A--------T-ATA-GT----------------ATGCCGTA----T----TT----A---TAT-AA-ATATCCATA---TAT-----ATAAATAGCCATAAGCA-A------TAGTGTA---TTGTCGTTA---TGCC-AA-T-GA------A------C--CG-AAACT
gi|93611 : TCG-----T-AT-G-----GCCATA----T----TT----A-----------T-TTAA-AAACTTT-----GTAAATAGCCAAAGGCA-AA-----T---GTT---T-GCCGAAAT--TGCC-AA-TAAA------A------T-TTG-AA
gi|93612 : ---TGT-----GTAAATGACCAAAGGCA-A------A---CTT---TT-CCGAT----TGCTGAA-T-AA------A------C-TTG-AAACT
gi|93613 : TAAATTGCCATATGAA-A------T---GAT---TTGCTGATT---TACC-AA-T-AA------A------C-TTGTAAAATT