lowQualScore : 2222 111 111 1111 111 111111 222222222222222222222 11111111 1 1 1111 1 1 22 11111111 1111 2222222222 22222222222 3333333333333333333333333333 11111111 222222222222222222222222222 3333 33333333 1111111 222 11111111 222222222
lowQualScore : 1 222 222 44 4 0 1 3333 666 4 1 666 22 22 1 1 3333 44444 66666666 2 555 3333 777 1 0 3 22 44 111 888888 111111 9999 0 7 444444444444444444444 2 6 88 55 77777777 1 0 1 6 4444 8 1 2 6 6 4 4 333 77 55555 0 22 4 88888888 4 6666 5 7777777777 33 2 11111111111 33 1 888888 555 7777777777777777777777777777 33 3 3 22222222 0 9999999 2 666 99 2 000000000000000000000000000 333 1 0 4444 1111 0 2 3 00000000 66 66 7777777 77777777 333 1 2 33 2 77777777 5555 333333333 2
lowQualScore : . ... ... .. . . . .... ... . . ... .. .. . . .... ..... ........ . ... .... ... . . . .. .. ... ...... ...... .... . . ..................... . . .. .. ........ . . . . .... . . . . . . . ... .. ..... . .. . ........ . .... . .......... .. . ........... .. . ...... ... ............................ .. . . ........ . ....... . ... .. . ........................... ... . . .... .... . . . ........ .. .. ....... ........ ... . . .. . ........ .... ......... .
lowQualScore : 4 777 777 33 6 7 6 6666 222 1 5 222 11 00 5 4 6666 88888 99999999 3 444 5555 111 7 1 3 33 22 333 000000 999999 8888 9 2 111111111111111111111 8 3 55 33 88888888 2 9 9 0 1111 8 9 3 0 0 7 2 777 77 77777 8 99 2 44444444 7 4444 0 4444444444 44 5 77777777777 44 6 222222 000 9999999999999999999999999999 66 1 1 66666666 3 2222222 9 999 66 9 999999999999999999999999999 777 3 9 5555 2222 4 1 7 99999999 55 55 4444444 00000000 333 8 6 11 4 44444444 0000 000000000 5
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGCGATAT---CANAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN--ATTTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAAT----TT-----TTAT--T-TGTAAG-ACAGT--ATC--GT-TA-GTAACCGTATATACCAGCGTACCA-NCAGTAATTGTCAATAGTAAGANCATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAA-C---CCCCAAC--A--ATATT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT--A--CG--T--GACTT-AAA--A-GGGTN--T--GGCTGCACAGG------T---A-------T------T------T------AAGT-GA-A-CG-AAGT---TTTA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT--------TAA-T-------A-GT---CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCCNA--TGATACTAATAA-CATCGAT-----TGACATTCCC-TANAACCA--TTATACAGTAGT-------GTTTAC--TGTTAATG--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA-GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( gi|138766 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC------TG-CG---CACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAAT----TT-----TTAT--T-TGTAAG-ACAGT--ATC--AT-TA-GCAACCGTATATACCA-CATACAG-ACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAA-C---CGGCAAC--A--ATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT--A--CG--T--GACTT-AAA--A-GAATA--T--GGCTACACAGG------T---A-------T------T------T------AAGT-GA-A-TG-AAGT---TTTA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT--------TGA-T-------C-GT---CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCCCT--TGATACTAATAA-CATCGAT-----TGACATTCCT-TAAAACCA--TTACACAGTAGT-------ATTTAC--AGTTAGTG--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC-GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------AGACTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC------AG-TG---CACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-----TT-----TTAT--T-TGTAAG-ACGGT--ATC--AT-TA-GCAACCGTGTATTCCA-CACACAA-ACAGTAATTGTCAATA-AAAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAA-C---CCCCAAC--A--ATATT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT--A--CG--T--GACTTAAAA--A-GAATA--T--GGCTACACAGGTATCTAT---A-------T------T------T------AAGT-GA-A-TG-AAGT---TTTA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT--------TAA-T-------C-GT---CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCCCT--TGATACTAATAA-CATTGAT-----TGACATTCCC-TAAAACT-----------TAGT-------ATTTAC--TGTTAATG--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC-ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATAT---CATAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTCCCGC-T--GAT-TGT-T-TATC------TG-TG---CACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATAT----TT-----T-AT--T-TGTATG-ACAGT--ACC--GT-TA-GCAACCGTATATACCA-CATACAG-AAAGTAATTGTCAATA-TATAAATATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAA-C---CAGCAAC--A--ATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT--A--CT--T--GACTT-AAA--A-GAATA--T--GGCTACACAGG------T---A-------T------TAATGTTT------AAGT-AA-A-TG-AGGT---TTCA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T-CAGT--------CGA-T-------C-GT---CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCCTA--TGATACTAATAA-CATCAAT-----TGACATTCTC-TAAAACCA--TTATACAGTAGT-------ATTTAC--TGTTAATG--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC-GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATAT---CATAAGC-G---TC--CG--A-CCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTCCCGC-T--GAC-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATAT----TT-----TTAT--T-TGTATG-ACAGT--ACC--GT-TA-GCAACCGTATATACCA-CACACAG-ACAGTAATTGTCAATA-TAAGAACATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAA-C---CGGCAAC--A--ATATT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC--A--CG--T--GACTT-TAA--A-GAATA--T--GGCTACACAGG------T---A-------T------T------TATATTCAAGT-GA-A-TG-ATAT---TTCA--TGT--ATTAG-TC--TATT--T-T-CAGT--------TGA-T-------C-GT---CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCCTA--TGATACTAATAA-CATCGAT-----TGACATTCCC-TAAAACCA---TATACAGTAGT-------AATTAC--TGTTAGTG--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC-GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCA---GA---CACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTAT---CAAAAGT-G---TC--CG--A-TCCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATG--ATTTCTAT-T--GAT-TGC-A-TATC------TG-TG---CACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGT----TT-----TTAT--T-TGTAAG-ACAAT--ATT--GT-TA-CTAACCGTGTATACCA-CATACCA-ACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAA-C---TCTCAAC--A--ATATC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT--AGGTG--T--GACTT-AAA--ATGATTG--T--AACTGTACATG------T---A-------T------CTATATAT------AAGT-GA-A-CT-ATGT---TTGG--TAT--ATTAG-TC--TA----T-T-TAGT--------TAA-T-------A-GT---CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCCCG--TGATACAAATAA-CATCGTT-----TGACATTCCC-TATAACCA--TTATACAGTAGT-------GTTTAC--TGTTAATC--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--ATGACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATAT---CATAAGT-G---TC--CG--A-CTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG--ATTTCTGT-T--GAT-TTT-G-TATC------TG-TG---CACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATAT----TT-----TTAT--T-TGTATG-ACAGT--ATC--GT-TA-GCAACCGTATATACCA-CATACAG-ACAGTAATT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCA---AA---CGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTAT---TAAAAGA-A---TC--TG--G-CTAAACC----T-----TA--------ACCACCAACA---A----ATC--ATTTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATA------TA-C-----ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAAT----TT-----T-AT--T-AATAAG-ATATT--ATC--GT-TA-GCAATCTTATATACAA-CATACCA-TCGGTACTTGTCAATA-TAAGAATATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAA-CTCTCGGCAAT-----ATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGTAAA--TG--T--GACTT-A-------TATT--T--AGCTGCACAGG------TATCA-------T------T------T------ATTT-AA-A-TC-A--T---CTTA-------------TC----TT--T-T-TA-T--------TAA-T-------A-GA---CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCCAG--TAATACTAATAG-C-----T-----TGATA---CTATAA---CA--TTAGACAGAAAT-------GTTTAC--TCTTAATG--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138774 : TTTTCTATATGTAAAACCAATATATTAAGCTA---AA---
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCA---GA---CAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATAT---CAAAAGT-A---TC--CG--A-CTCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACA--GA----ATG--A------T-T--GA--TGT-A-TACCACA---TA-CA---AACAGTAATTGTaataagagaagtaagaccaacgtatatcttcagtagaattgaattccattgaaagtgtatctgtacacactatttgtgttaggttacaatggtatacttttatcaataaaacaatatcgtatataaccttaattaccttatatcatcagtaattgtcaatataagaatatcaacaatctagcgtatgccatcaactcttgacaatatttagttattgttgttggtatggtaaatttgacgtaaattgatatttggctgcactggtatcatttaattcaaatgaactatttttaattaattaatattattttattaatagtattgcgtaactttatattgaattccaatgacattaataacgccatatgacattacctatcaccattttacagaagtatttactgttaatggttagccacatagccctgtacattgctatttatatacactttatgtatat
gi|138775 : TTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAA---CAC-----CGTATAGCGCAAA-AGA--TTACTT------------TTAGC-G---TCAGCGAAA-CTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT--AATTCTAC-T--GAG-AGTGG-TATC------TG-TA---CACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAAC----TC-----T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCA---GA---CACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTAT---CAAAAGT-A---TC--CG--A-TACAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----TTG--ATTTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC------TG-TG---AACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAAT----TT-----T-AT--T-TGTAAG-ACAAT--ATT--GT-TA-GCAACCGTGTATACCA-CGTACAA-ACAGTAATTGTCACTA-TAAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAA-C---CCGCAAC--A--ATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT--A--GG--T--GACTT-AAA--ATGAATG--T--GGCTGCACAGG------T---A-------TCTATATT------T------AAGT-GA-A-CA-GGGT---TTAA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T--AGT--------TAA-T-------A-GT---CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCCCA--TGATACTTATAA-CATCGTT-----TGACATTCCC-TATAACCA--TTATACAGTAGT-------GTTTAC--TGTTAATA--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA-GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTA---AA---CAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATAT---TGTCAGC-GATATT--CG--A-CCTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AA----ATTT-AATTCTATCT--AAGGTGT---TATC------TG-AA---CACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAAT--------------------ATAAGTAC-TT--ATC---T-TATGTAACCATGTAT-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-C---C-CCAAT--C--ATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C---T--GAGCT-AAA--T-G-GTT--T--GGCTGCAATGG------A---A-------T------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCA---AATTACACT---GCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATAT---TGTCAGC-AAGATT--CG--A-CCTAGATA---T-----GA--------ACTTTCGATAA-AA----TTT--AATTCTATCT--AAA-GAG-G-TGTC------TG-TA---CACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAAT----AC-----A-AT--T------G-ATAGTT-ATC---T-TATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCA-TCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAA-C---C-CCA----A--ACATA--A-T-G---T---TTGGTGGC----ATAGGTAAA--C---T--GACCT-ATA--A-TGGTC--T--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCA---AA---CAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTGGCTTG---TAT---TGTCAGC-GATATT--CG--A-CTTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT--ATATCTA-----AAA-TGT---TATC------TG-TA---CATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATATAATTGGTAGTTATC-T-TAT-------GT--A-C--AT----GTAACCATATAT-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGCCAATAGTATAACCATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAATC---C--CAAT--C--ATA----A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA---A--C---T--GGCTT-ATG--A-TGGTT--T--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCA---AA---TAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTTGCTT---ATAT---TGTCAGC-AAGATT--CG--A-CCTAAATA---T-----GA--------TTTTTCGATA---A----A----ATTT-----T--AAT-TCT-A-TCTAAAGAGGTGTCGTTACACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT--------------------------ACAATTGATA--AT-TATGTCACCGTATAT-CCAGCGTACCA-TCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAA-T---CCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAAA--C---T--GACCT-ATA--A-TGGTT--T--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCA---AA---AGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTAT---CAAAAGT-A---TC--TG--G-CTCAACC----A-----AA--------ACTTTCAACAGAAA----ATA--ATTTCTAT-T--AAT-CGT-A-AATC------TG-TA---CACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---------TACT---GCTTATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATAT---TACCAGT-GAGATT--CG--G-CCTAAATATTGT-----GA--------ACCTCCAATAG-AA----TTT--AATTCTGT-C--GAA-ACT-AGTATC------TG-T-------ACTAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-T----TA-----TTCT--T-T-CAAG-AGA-T--ATT--GT-GT-GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCA-CCAGTAACTGTCAATAGTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAA-C---CCCCAACATA--ATTTC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCA---GA---CGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATAT---TAAAAGC-A---AC--TG--G-CTCAAAC----T-----AA--------ACCTTCAACAG-AA----ATC--ATTTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATT------TA-TG---TACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138767 : GTTGAGTCG---GA---CACTTATG---ATATCTCAAGCAAA-TTTATTTGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACctatattatgccgtaaaac
gi|138768 : tttactatatgtaaaacctatatGTTGGGTCG---GA---CGCTTATG---ATATCTCAAGCAAA-TTTATTTGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-Cttgaagactcaacaggaatgatttctgttgattgtatatcagtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacggtatcattagcaaccgtgtattccacacacaaacagtaattgtcaataaaagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccccaacaatattatttttgttgctggtatggtacgtgacttaaaaagaatatggctacacaggtatctatatttaagtgaatgaagttttatatattagtctatttttagttaatcgtcttgcatagctctatattgaatgcccttgatactaataacattgattgacattccctaaaacttagtatttactgttaatggtgaaccatataaccctgtacatacatacattgttatttatatacattaaattgtatattt
gi|138769 : tttaatatgtgtaaaacctatatattacGTTGGGTCG---GA---CGCTTATG---ATATCTCTGGCAAA-TTTATTTGCGCTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACttgaaccctcaacaggaatgattcccgctgattgtttatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatattttatttgtatgacagtaccgttagcaaccgtatataccacatacagaaagtaattgtcaatatataaatatcaacaaactaaagtatgccgtaaaaccagcaacaatattattttgttgctggtatggtacttgacttaaaagaatatggctacacaggtattaatgtttaagtaaatgaggtttcatatattagtctattttcagtcgatcgtcttgcatagctctatattgaatgcctatgatactaataacatcaattgacattctctaaaaccattatacagtagtatttactgttaatggtgaaccatataaccctgtacacacgtacattgttatttatatactttaaattgtatattt
gi|138770 : tttgctatatgtaaaaactatatGTTGGATCG---GA---CACTTTTG---ATACCATTAGCAAA-TTTATTTGCGCTATAAGCGAAAGT-G---TC--TG--G-CCCAACttgaaccctcaacaggaatgattcccgctgactgtatatctgtgcacaccaaccgtgcccagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtaccgttagcaaccgtatataccacacacagacagtaattgtcaatataagaacatcaacaaactagagtatgccgcaaaaccggcaacaatattattttgttgtcggcgcggcacgtgactttaaagaatatggctacacaggtatttatattcaagtgaatgatatttcatgtattagtctattttcagttgatcgtcttgcatagctctatattgaatgcctatgatactaataacatcgattgacattccctaaaaccatatacagtagtaattactgttagtggttaaccatataaccctgtacacacgtacattgttatttatatactttaaattgtatattt
gi|138773 : tttactatatgtgatacctatatGTTGAGTCG---GA---CACTTATG---ATATCTCAAGCAAA-TTTATTTGCACTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAACctgaaccttcaacagaaatgatttctattgattgcatatctgtgcacactaattgtgctcggttgctctggtaagtttttatttgtaagacaatattgttactaaccgtgtataccacataccaacagtaattgtcaatataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaactctcaacaatatcatttttcttgctggtattgtaggtgtgacttaaaatgattgtaactgtacatgtatctatatataagtgaactatgtttggtatattagtctatttagttaatagtcttacgtaactctatattgaatgcccgtgatacaaataacatcgtttgacattccctataaccattatacagtagtgtttactgttaatcgtgaaccgtataaccctgttcatgacggttcattgttatttatatacattaatttgtatattt
gi|138781 : tttactatatgtaaaacctgtatGTTGAGCCA---GA---TACTTTTG---ATACTATAAGGAAA-TTTATTTGCGCTAT---ttgaaccctcaacaggaatgatttctgttgattttgtatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtatcgttagcaaccgtatataccacatacagacagtaatt
gi|138784 : ctatatgttaaccaaaagcctccgcttTAAGTCA---AA---CAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTG---TAT---TGTCAGT-GATATT--CG--A-CCTAACTA---T-----AA--------ACTTGAGATAA-AA----TTT--AATTCTAT-CTAAAG-TGT---TATC------TG-TA---CATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAAT----GTAA---TTAG--T-AGT--------T--ATC---T-TATGTAACCATATAT-CCAGCATGCCA-CCAATAATTGTCAATAGTATAACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-C---C-CCAAT--C--ATAAT--G-T-T---TG-GTcaaaactttcaacagaaaataatttctattaatcgtaaatctgtacacactaattgtgctaggttaccatg
gi|138785 : AGGCCA---AA---C-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCTGCT---AATAG---TATCGAT-G--------G--AGTTTAACT----T-----AA--------AT----------------ATGTAAATTCTAT-T--GAT-TGTGG-TATT------TG-TG--------TAA--------GGTTACAACGGTATAA-----CT-----TTAC--T-ACTATG-ACAAT--AT--------------CGTATGTA--A-CCTACAGTACAGTAAggtgaaaatgaactga
gi|138776 : CG---GA---TACTTTTG---ATACCATAAGTAAA-TTTATTTGCGTTATAAGCAAAAGT-G---TC--TG--G-CCTAAC
gi|138786 : atgtaatacctacTGCTT---ATAT---CATCGGA-G---G----G--A-TTCAACT----T-----GAGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT--AATCATAA-T--GGT-TGT-A-T--C------TG-TA---CACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGT----TT-----TTATGATATATGCG-ATTAT--ATCGTAT-T---TAATCTTATA-AACG-CATGCCG-TCAGAAATTGCCAATA-TAATAATATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAA-C---CTT---C--A--ATACT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGT--A--AAGTT--AACCT-GAA--T-TGATATTT--GACTACACTGG------T---A-------T------C------C--------GT-TA-T-TGTAAAT-----------T--ATTA--TT--TATT--TAT-TAGT----------A-T-------TAGT---CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCCAA--TGGGACTAATAA-CGCC-ATA----TGACATTCCC-TATCACCA--TTATACGGCAGT-------GTTCAC--TGTTAATA--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA-GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTatacaacttgaaccttcaacagaattgatttctgttgattgtatatctgtgaacactaattgtgcttggttgctatggtaaaattttatttgtaagacaatattgttagcaaccgtgtataccacgtacaaacagtaattgtcactataagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccgcaacaatattatttttgttgctggtattgtaggtgacttaaaatgaatgtggctgcacaggtatctatatttaagtgaacagggtttaatatattagtctattttagttaatagtcttgtatagctctatattgaatgcccatgatacttataacatcgtttgacattccctataaccattatacagtagtgtttactgttaatagtgaaccatataaccctgtacataagtacattgctatttatatacattactttgtata
gi|138787 : AAGTTG---AC--CA--A-CTCGACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----TTG--ATCTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC------TG-TG---CACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-----TT-----TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138774 : G--A-C-CAACG----T-----AT--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG--AATTCCAT-T--GAA-AGT-G-TATC------TG-TA---CACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-C----TT-----TTAT--C-AATAAA-ACAAT--ATC--GTATA--TAACCTTAATTACCT-TATATCA-TCAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAAC-T---CT-TGAC--A--ATATTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT--A--AA--TTTGACGT-AAA--T-TGATA--TTTGGCTGCACTGG------T---A-------TCAT---T------T------AATTCAA-A-TG-AACTA--TTTT--TA---ATTAA-TTAATATTATT-T-TA-T--------TAA-T-------A-GT---ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCCAA--TGACATTAATAA-CGCC-ATA----TGACATTACC-TATCACCA--TTTTACAGAAGT-------ATTTAC--TGTTAATG--GTTAGCCACATAGCCCT-------------GTACATTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138767 : ttttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaaTCAACAG-AA----ATC--ATTCCTGT-T--GA
gi|138773 : tttactatatgtaaaacctatatgttaggccagacacttttgcttatagcgcaaataaatttgcttgagatatcataagtgtccgactcaacttgaagacTCAACAG-AA----ATC--ATTCCTGT-T--GAttgtatatcagtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaaaattttatttgtaagacggtatcattagcaaccgtgtattccacacacaaacagtaattgtcaataaaagaatatcaacaaactagagtatgccgtaaaacccccaacaatattatttttgttgctggtatggtacgtgacttaaaaagaatatggctacacaggtatctatatttaagtgaatgaagttttatatattagtctatttttagttaatcgtcttgcatagctctatattgaatgcccttgatactaataacattgattgacattccctaaaacttagtatttactgttaatggtgaaccatataaccctgtacatacatacattgttatttatatacattaaattgtatattt
gi|138783 : tttactatatgtaaaacctgtatgttaggccagacacttttgcttatagtgcaaataaatttgcttgagatatcataagtgtccgactcaacttgaacccTCAATAG-AA----ATG--ATTTCTGT-T--GAttttgtatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatatttttatttgtatgacagtatcgttagcaaccgtatataccacatacagacagtaatt
gi|138788 : tatatcaagccagacgcctccgcttttagcgcaaaaaaaatgtgcgtataatattaaaagcaactggctcaaactaaacct-TGT---TATC------TG-AA---CACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAAT--------------------ATAAGTAC-TT--ATC---T-TATGTAACCATGTAT-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-C---C-CCAAT--C--ATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C---T--GACCT-AAA--T-G-GTT--T--GGCTGCAttgtatatttatgtacacaaattgtgaaaggttacaatggtgactatattatgccgtaaaac
gi|138789 : -TGT---TATC------TG-AA---CACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT--------------------ATAAGTAC-TT--ATC---T-TATGTAACCATGTAT-CCAGCGTACCA-CCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAAGC---C--CAAT--C--ATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA---A--C---T--GACCT-AAA--T-G-GTT--T--GGCTGCAATGG------A---A-------T------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAA-ACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAA-C---CCGCAAC--A--ATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT--A--GG--T--GAATT-AAA--ATGAAAG--T--GGCTGCTCAGG------T---A-------TCTAAATT------T------AAGT-GA-A-CG-GGGT---TTAA--TAT--ATTAG-TC--TATT--T-T--AGT--------TAA-TAGTCTTGC-GTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCCCA--TGATACTAATTA-CATCATT-----TGACATTCCC-TATAACCA--TTATACAGTAGT-------GTTTAC--TGTTAATA--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA-GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138771 : TGTATACCA-CATACAA-ACAGTAATTGT
gi|138791 : tttactatatgtaatactatatgtaaggccagacaatttttcttatagcgcaaaaaatttgctaatgatatcaaaagtatccgactcaacctgaaccttcaacagaatgattgaACTATATTATGCCGTAAAA-C---CCTCAAC--ATTTTTTT--A-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGTAAA--TG--T--GTCTT-AAATTT-GATTT--T--ACCTGCACAGA------T---ATCTTTTTT------T------T------AATT-GA-ACTG----------TG--CTT--ATTAG-TA--TATT--T-T-T--T--------AAA-T-------A-GT---CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCCTG--TGATACTAATTA-CATCATT-----TGACATTCCC-TATAACCA--TCATACAGTAGT-------GTTTAC--TGTTAATG--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA-GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138768 : A-C---CAGCAAC--A--AAATA--A-T-A---TT-GTTGCTGGT----
gi|138792 : tttaatatgtgtaaaacctatatattacgccagacacttttgcttatagcgcaaataaatttgcttgagatatcataagcgtccgacccaacttgaaccctcaacaggaatgattcccgctgattgtttatctgtgcacactaattgtgctcagttgctatggtaatattttatttgtatgacagtaccgttagcaaccgtatataccacatacagaaagtaattgtcaatatataaatatcaacaaactaaagtatgccgtaaaTATACATG------T---A-------T--------------------------A-A-CG-AACTATATTTAGTTA---ATTAG-T---TGTT--T-T---AT--------CAA-T-------A-GT---CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTCAA--TGCCATTAATAA-CAGC-ATA----TGATCTACCC-TAACAACATTTTATAGAGCAGT-------GTTTAatggtacttgacttaaaagaatatggctacacaggtattaatgtttaagtaaatgaggtttcatatattagtctattttcagtcgatcgtcttgcatagctctatattgaatgcctatgatactaataacatcaattgacattctctaaaaccattatacagtagtatttactgttaatggtgaaccatataaccctgtacacacgtacattgttatttatatactttaaattgtatattt
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattattGG------T---A-------T------C------T------AAGC-TATA-TT-T-GT---GTTA--T-T--ATTAC-CA--TATTA-T-TATATT--------TAA-T-------A-GT---CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC--------ATTAATAA-CATC-ATAACTATGACCTTCCC-TAAAACCA--T---ATAGCCGT-------GTTTAttgt
gi|138795 : taaattgatatttaactgcagt-A-TA-AATT---TTTA--TAT--GTTTG-GA--TATTA-A-T-TAGTGTAATTTATGACT-------A-AT---CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTTAA--TGACTCTATTAA-CGTCATT-----TGACATTCCC-TAATACCA--TTATTCAGCAGT-------TTTTAC--TGATATTG--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG-GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138794 : T---TTTA---ATGAATTAAATA--TATT--T-T-T-----------------------T-GT---CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCTGA--TGACACTTATAA-CATC-ATA----TGGCATTCCC-TATTACCA--TTATTCAGTAGT-------ATTTAC--TGATATTG--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA-GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138799 : tctttA-T-------A-GT---CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATC------AGGGTGGTAAGTATCCAT------AATATTCTC-TACAACCG--CT-CTCAGTAGT-------ATGTATTGAGT--GCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA-GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : aA-T-------A-GT---CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATCA---GGGTGGTAGTAA-C--CA-------TAATATTCCC-TACAACCGCCTT---CATTAGT-------G--TAT--ATTGAGTGCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG-GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138796 : aA-T-------A-GT---CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATCA---GGGTGGTAGTAA-C--CA-------TAATATTCCC-TACAACCG--CC-CTCATTAGT-------GTATATTGAGT--GCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG-GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : aA-T-------A-GT---CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATCAG---GGTGGTAGTAA-C--CA-------TAATATTCCC-TACAACCG--CC-CTCATTAGT-------GTATATTGAGT--GCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG-GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : aA-T-------T-GT---CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATCAGGATGATA-----AA-TATCC-T-----TAATATTCTT-TACAACCA--TT-CTCAATAGTCACTAGAATATATCAAG--AACA--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA-GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138801 : aAGACCA--T----CAATAAA-------ATTAAT---GTTAATG--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA-GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 2222 11111 1111 111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 444444444444444444444 11111111111111111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 333 3 2 2222 55 22222 22 22 3333 44444 66666666 1 44444 33 555 0 5 22 44 111 1 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 77 77 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 1 1 4 0 22 3 88 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 0 888888 666666666666666666666 3 0 5 777 2 22222222222222222 33 555 66 5 7777 2 77777777 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 33 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . ... . . .... .. ..... .. .. .... ..... ........ . ..... .. ... . . .. .. ... . . .. .. . ....... .. ... . . .. .. . . ....... . . . . . . . . . . . .. . .. . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. . ...... ..................... . . . ... . ................. .. ... .. . .... . ........ .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 777 6 1 3333 77 88888 66 66 0000 55555 66666666 8 33333 55 111 6 5 55 88 000 7 8 33 55 0 3333333 88 333 5 0 11 11 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 0 0 0 8 99 4 77 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 3 222222 666666666666666666666 3 8 1 333 7 99999999999999999 11 888 33 3 3333 7 22222222 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 22 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATATCAN-AAGCG---TC--CG--ACCCAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAGT--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAACATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT-------T------T------AAGT-GAACGANGT---T-T----TA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT-TAAT--------AGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACTTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGCGATATCAN-AAGCG---TC--CG--ACCCAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAGT--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGANCATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT-------T------T------AAGT-GAACGAAGT---T-T----TA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT-TAAT--------AGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CG--ACTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAGT--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT-------T------T------AAGT-GAATGAAGT---T-T----TA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT-TGAT--------CGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CG--ACTCAACT----T-----GA--------AGACTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGGT--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTATAT-------T------T------AAGT-GAATGAAGT---T-T----TA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-TAGT-TAAT--------CGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGCG---TC--CG--ACCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAT-TGT-T-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAGT--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAATATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT-------TAATGTTT------AAGT-AAATGAGGT---T-T----CA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-CAGT-CGAT--------CGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATATCAT-AAGCG---TC--CG--ACCCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAC-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAGT--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAACATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT-------T------TATATTCAAGT-GAATGATAT---T-T----CA---TG---T--ATTAG-TC--TATT--T-T-CAGT-TGAT--------CGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGA---CACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTATCAA-AAGTG---TC--CG--ATCCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTAT-T--GAT-TGC-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAAT--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATATC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------TAT-------CTATATAT------AAGT-GAACTATGT---T-T----GG---TA---T--ATTAG-TC--TA----T-T-TAGT-TAAT--------AGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGA---CAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATATCAA-AAGTA---TC--CG--ACTCAACC----T-----GA--------ACCTTCAACAG--A----ATG-A--------T-T--GA--TGT-A-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAA---CGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTATTAA-AAGAA---TC--TG--GCTAAACC----T-----TA--------ACCACCAACA---A----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TAT---ATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAATTT--T-AT--T-AATAAG-ATATT--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATAC-AACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAATATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTTA-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGT-------AAATGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCAT----T------T------A----------------T-T----TAAATCA---T--CTTA--TC--T--T--T-T-TA-T-TAAT--------AGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGA---CACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CG--ACTCAACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TTT-G-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAGT--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : CCAACG----T-----AT--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG-AA--TTCCAT-T--GAA-AGT-G-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAAT--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAATATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATATTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------TATCAT----T------T------AATTCAAATGAACTA--T-T----TT---TA------ATTAA-TTAATATTATT-T-TA-T-TAAT--------AGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAG---CAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA--TTACTT------TT----AGCG---TCAGCGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT-AA--TTCTAC-T--GAG-AGTGG-TATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGA---CACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTATCAA-AAGTA---TC--CG--ATACAACT----T-----GA--------ACCTTCAACAG-AA----TTG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAAT--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAATATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------TATCTATAT-T------T------AAGT-GAACAGGGT---T-T----AA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T--AGT-TAAT--------AGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAA---CAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATATTGT-CAGCGATATT--CG--ACCTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-TT--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT-------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACT---GCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-A---TT--CG--ACCTAGATA---T-----GA--------ACTTTCGATAA-AA----TTT-AA--TTCTATCT--AAA-GAG-G-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAATAC--A-AT--T------G-ATAGTT-ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATAAT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAA---CAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTGGCTTG---TATTGT-CAGCGATATT--CG--ACTTAACTA---T-----AA--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT-AT--ATCTA-----AAA-TGT---TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------GTT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACCATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA----A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAA---TAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-A---TT--CG--ACCTAAATA---T-----GA--------TTTTTCGATA--AA----ATT-TTAATTCTATCT--AAA-GAG-G-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAATTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A----T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAA---AGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTATCAA-AAGTA---TC--TG--GCTCAACC----A-----AA--------ACTTTCAACAGAAA----ATA-AT--TTCTAT-T--AAT-CGT-A-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---------TACTGCTTATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATATTAC-CAGTGAGATT--CG--GCCTAAATATTGT-----GA--------ACCTCCAATAG-AA----TTT-AA--TTCTGT-C--GAA-ACT-AGTATC-TGT------ACTAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA-T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA-ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATTTC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGA---CGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATATTAA-AAGCA---AC--TG--GCTCAAAC----T-----AA--------ACCTTCAACAG-AA----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGT-A-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAA---CAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTGTCAG-TGATA---TT--CG--ACCTAACTA---T-----AA--------ACTTGAGATAA-AA----TTT-AA--TTCTAT-CTAAAG-TGT---TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT--------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA----A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAA---C-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTATCGA-TGGAG---T---------TTAACT----T-----AA--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GAT-TGTGG-TAT----------------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAAT--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : TGCTT---ATATCAT-CGGAG---G----G--ATTCAACT----T-----GAGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT-AA--TCATAA-T--GGT-TGT-A-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTAT--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAATATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATACT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------TAT-------C------C------------------GT---TAT----TG---TAAATT--ATTA--TT--TATT--TAT-TAG--TATT--------AGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : C--CA--ACTCGACT----T-----GA--------ACCCTCAACAG-GA----TTG-AT--CTCTGT-T--GAT-TGT-A-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttga-TGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-TT--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : -TGT---TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-TT--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACCATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT-------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAATACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------TATCTAAAT-T------T------AAGT-GAACGGGGT---T-T----AA---TA---T--ATTAG-TC--TATT--T-T--AGT-TAAT--------AGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTTTTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------TATCTTTTTTT------T------AATT-GAACTGTGC---T-T-----------------ATTAG-TA--TATT--T-T-T--T-AAAT--------AGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : AACGAACTATAT-T----TAGT-TA------ATTAG-T---TGTT--T-T---AT-CAAT--------AGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatacatgtatTTT--AACTGCAGTGG------TAT-------C------T------AAG-----CTATAT---T-TGTGTTA---T----T--ATTAC-CA--TATTA-T-TATATT-TAAT--------AGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataT---T-T----TA----A---TGAATTAAATA--TATT--T-T-T-------T---------GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tctttAATT---T-T----TA---TA---T--GTTTG-GA--TATT--AAT-TAGTGTAATTTATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataAAT--------AGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AAT--------AGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AAT--------TGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AAT--------AGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AAT--------AGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 11111 1111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 5555555555555555555555 2222222222222222 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 9999 55 33333 22 22 3333 44444 66666666 1 44444 33 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 999 55 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 777777 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 777777 444 0000000000000000000000 2 2 0000000000000000 33 44 2 2 5555 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . .... .. ..... .. .. .... ..... ........ . ..... .. ... . .. .. .. . .. .. . ....... .. ... . . ... .. . . ....... . . . . . . . . . . . . .. ...... . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. ...... ... ...................... . . ................ .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 1 2222 77 44444 66 66 0000 55555 66666666 8 33333 55 000 5 55 88 44 7 33 55 0 2222222 88 333 5 0 222 00 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 222222 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 777777 777 8888888888888888888888 8 0 7777777777777777 11 88 7 7 9999 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGNTATCAN-AAGCG---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTAT-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------T---AT--------T------T------AAGTGAACGATGTTT----N-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGATATCAN-AAGCG---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATN-AT--TTCTAT-T--GAT-TGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------T---AT--------T------T------AAGTGAACGANGTTT----T-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------T---AT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTT----T-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTAT---AT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTT----T-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGCG---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAT-TGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------T---AT--------TAATGTTT------AAGTAAATGAGGTTT----C-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATATCAT-AAGCG---TC--CGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TCCCGC-T--GAC-TGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------T---AT--------T------TATATTCAAGTGAATGATATTT----C-A---TG-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTATCAA-AAGTG---TC--CGA--TCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATG-AT--TTCTAT-T--GAT-TGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATA--TC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------T---AT--------CTATATAT------AAGTGAACTATGTTT----G-G---TA-T--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATATCAA-AAGTA---TC--CGA--CTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----ATG---------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTATTAA-AAGAA---TC--TGG--CTAAACC----TT-----A--------ACCACCAAC---AA----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGTAA-----A--TGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCAT--------T------T------A------------TT----T-AAATCA-T--CTTA--T-C--TT-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTG---TC--CGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----ATG-AT--TTCTGT-T--GAT-TTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : CCAACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----TTG-AA--TTCCAT-T--GAA-AGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATA--TTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------T---ATCATTTAATT------C------AAATGAACTAT-TTT----T-AAT-TA----ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT-ACTTTT----------AGCG---TCAGCGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----TTT-AA--TTCTAC-T--GAG-AGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTATCAA-AAGTA---TC--CGA--TACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----TTG-AT--TTCTGT-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------T---ATCTATAT--T------T------AAGTGAACAGGGTTT----A-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTT---ATATTGT-CAGCGATATT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------A---AT--------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-A---TT--CGA--CCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----TTT-AA--TTCTATCT--AAA-GAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTGGCTTGTATTGTCAG-CGATA---TT--CGA--CTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAATT-AT--ATCTA-----AAA-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA------A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-A---TT--CGA--CCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----ATT-TTAATTCTATCT--AAA-GAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTATCAA-AAGTA---TC--TGG--CTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----ATA-AT--TTCTAT-T--AAT-CGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTTGCTT---ATATTAC-CAGTGAGATT--CGG--CCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----TTT-AA--TTCTGT-C--GAA-ACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATT--TC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATATTAA-AAGCA---AC--TGG--CTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----ATC-AT--TTCTAT-T--GAT-TGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTGTCAG-TGATA---TT--CGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----TTT-AA--TTCTAT-CTAAAG-TGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA------A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTATCGA-TGGAG---T---------TTAACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GAT-TGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : TGCTTATATCATCGG-AGG----------GA--TTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----TTT-AA--TCATAA-T--GGT-TGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATA--CT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------T---AT--------C--------------------CGTTATTG----T-A---AATT--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : C--CAA--CTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----TTG-AT--CTCTGT-T--GAT-TGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttga-TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : -TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------A---AT--------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------T---ATCTAAAT--T------T------AAGTGAACGGGGTTT----A-A---TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTT--TTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------T---ATCTTTTTT-T------T------AATTGAACTGTGCTT----------------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : ACATG------T---AT-----------------------AACGAACTATATTT----A-G---TT-A--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatTTT--AACTGCAGTGG------T---AT--------C------T------AAG----CTATATTTGTGTT-A---T--T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTT----T-A----A-TGAATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tctttATGTTT----GGA---TA-TTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 11 1111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 5555555555555555555555 11111 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 1 1 88 00 3333 44444 66666666 1 666666 1 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 999 55 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 3 88 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 777777 4444444444444444444444 2 11111 33 55555 33 44 2 2 5555 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . . . .. .. .... ..... ........ . ...... . ... . .. .. .. . .. .. . ....... .. ... . . ... .. . . ....... . . . . . . . . . . . . .. . .. . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. ...... ...................... . ..... .. ..... .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 1 3 0 99 66 0000 55555 66666666 8 111111 6 000 5 55 99 44 7 33 55 0 3333333 88 333 5 0 222 00 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 4 77 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 777777 5555555555555555555555 8 99999 77 55555 11 88 7 7 9999 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTATANTATCAG-AAGTGTCCGACCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGTGNTATCAN-AAGCGTCCGACCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTGTCCGACTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTGTCCGACTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATATT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTATAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGCGTCCGACCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------TAATGTTT------AAGTAAATGAGGTTTC----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCCAGAGATATCAT-AAGCGTCCGACCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATATT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------TATATTCAAGTGAATGATATTTC----A--TG-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTGCTAATGGTATCAA-AAGTGTCCGATCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTAT-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATATC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------TAT--------CTATATAT------AAGTGAACTATGTTTG----G--TA-T--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTTGCTAATGATATCAA-AAGTATCCGACTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----A-TG--------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTTGCTTCTAGTATTAA-AAGAATCTGGCTAAACC----TT-----A--------ACCACCAACA---A----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TAT---ATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAATTT--T-AT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATAC-AACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTTA-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGT-------AAATGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCA------T------T----------------TATTTA----AATCA-T--CTTA--T-CT--T-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTTGCTTGAGATATCAT-AAGTGTCCGACTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : CCAACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCAT-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATATTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------TATCATTTAATT------C------AAATGAACTATTTTTA----A--TT-A--ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccaatatattaagctaaaaataagagaagtaagaTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT-ACTTTTAGCGTCA----GCG--AAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTAC-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTTACTTATGGTATCAA-AAGTATCCGATACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------TATCTATAT--T------T------AAGTGAACAGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTGTCAG-CGATATTCGACCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-ATTCGACCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATAAT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTGGCTTGTATTGTCAG-CGATATTCGACTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA-----AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA----A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTTGCTTATATTGTCAGCAAG-ATTCGACCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A----T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTTCCTTATAGTATCAA-AAGTATCTGGCTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTAT-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTTGCTTATATTACCAGTGAG-ATTCGGCCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTGT-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATTTC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGTGCGTATAATATTAA-AAGCAACTGGCTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTTGCTTGTATTGTCAG-TGATATTCGACCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTAT-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA----A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCTGCTAATAGTATCGA-TGGAGT-----TTAACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : TGCTTATATCATCGG-AGG-----GATTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATAA-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATACT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------TAT--------C--------------------CGTTATTGT----A--AATT--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : CCAACTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttgaTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATAGT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATATT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------TATCTAAAT--T------T------AAGTGAACGGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTTTTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------TATCTTTTTT-T------T------AATTGAACTGTGCTT--------------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : ACATG------TAT-----------------------AACGAACTATATTTA----G--TT-A--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatTTT--AACTGCAGTGG------TAT--------C------T------AAG----CTATATTTGTGTTA--T--T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTTA----A--TG-A--ATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tcttttATGTTTGG---A--TA-TTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 5555555555555555555555 11111 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 1 1 8888 888 22 0 3333 44444 66666666 1 666666 1 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 999 55 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 777777 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 777777 4444444444444444444444 2 11111 33 55555 33 44 2 2 5555 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . . . .... ... .. . .... ..... ........ . ...... . ... . .. .. .. . .. .. . ....... .. ... . . ... .. . . ....... . . . . . . . . . . . . .. ...... . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. ...... ...................... . ..... .. ..... .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 0 9 0 6666 222 55 3 0000 55555 66666666 8 111111 6 000 5 55 99 44 7 33 55 0 2222222 88 333 5 0 222 00 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 222222 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 777777 5555555555555555555555 8 99999 77 55555 11 88 7 7 9999 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGT-ATCCGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGT-GTCCGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGT-GTCCGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGT-GTCCGA--CTCAACT----TG-----A--------AGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTATAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGC-GTCCGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------TAATGTTT------AAGTAAATGAGGTTTC----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCCAGAGATATCA--T-AAGC-GTCCGA--CCCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------TATATTCAAGTGAATGATATTTC----A--TG-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTAATGGTATCA--A-AAGT-GTCCGA--TCCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTAT-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATA--TC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------TAT--------CTATATAT------AAGTGAACTATGTTTG----G--TA-T--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTT-GCTAATGATATCA--A-AAGT-ATCCGA--CTCAACC----TG-----A--------ACCTTCAACAG--A----A-TG--------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTT-GCTTCTAGTATTA--A-AAGA-ATCTGG--CTAAACC----TT-----A--------ACCACCAAC---AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGTAA-----A--TGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCA------T------T----------------TATTTA----AATCA-T--CTTA--T-C--TT-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGT-GTCCGA--CTCAACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : AATATA-TTAAGCTAAAAATAAGA--G-AAGT-A--AGA--CC-AACG----TA-----T--------ATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCAT-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATA--TTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------TATCATTTAATT------C------AAATGAACTATTTTTA----A--TT-A--ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT--ACTTTTAGCGTCA--G---------CGAAACTCAGCT----TAGATGAA--------ACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTAC-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTT-ACTTATGGTATCA--A-AAGT-ATCCGA--TACAACT----TG-----A--------ACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------TATCTATAT--T------T------AAGTGAACAGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--G-CGAT-ATTCGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG--ATTCGA--CCTAGATA---TG-----A--------ACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTG-GCTTGTATTGTCA--G-CGAT-ATTCGA--CTTAACTA---TA-----A--------ACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA-----AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA------A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG--ATTCGA--CCTAAATA---TG-----A--------TTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-CCTTATAGTATCA--A-AAGT-ATCTGG--CTCAACC----AA-----A--------ACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTAT-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTT-GCTTATATTACCA--GTGAG--ATTCGG--CCTAAATATTGTG-----A--------ACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTGT-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATT--TC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGT-GCGTATAATATTA--A-AAGC-AACTGG--CTCAAAC----TA-----A--------ACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTT-GCTTGTATTGTCA--G-TGAT-ATTCGA--CCTAACTA---TA-----A--------ACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTAT-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA------A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCT-GCTAATAGTATCGATG-GAGT-TT---------AACT----TA-----A--------AT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : T-GCTTATATCATCG--G-AGG------GA--TTCAACT----TG-----AGTGTATAAACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATAA-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATA--CT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------TAT--------C--------------------CGTTATTGT----A--AATT--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : -AAGTTGACCAA--CTCGACT----TG-----A--------ACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------TATCTAAAT--T------T------AAGTGAACGGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTT--TTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------TATCTTTTTT-T------T------AATTGAACTGTGCTT--------------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : ACATG------TAT-----------------------AACGAACTATATTTA----G--TT-A--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatTTT--AACTGCAGTGG------TAT--------C------T------AAG----CTATATTTGTGTTA--T--T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTTA----A--TG-A--ATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tcttttATGTTTGG---A--TA-TTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 5555555555555555555555 11111 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 1 1 8888 3 22 0 6666 44444 1 666666 1 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 999 55 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 777777 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 777777 4444444444444444444444 2 11111 33 55555 33 44 2 2 5555 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . . . .... . .. . .... ..... . ...... . ... . .. .. .. . .. .. . ....... .. ... . . ... .. . . ....... . . . . . . . . . . . . .. ...... . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. ...... ...................... . ..... .. ..... .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 0 9 0 9999 7 55 3 1111 55555 8 111111 6 000 5 55 99 44 7 33 55 0 2222222 88 333 5 0 222 00 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 222222 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 777777 5555555555555555555555 8 99999 77 55555 11 88 7 7 9999 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AAGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTATAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------TAATGTTT------AAGTAAATGAGGTTTC----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCCAGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------TATATTCAAGTGAATGATATTTC----A--TG-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTAATGGTATCA--A-AAGTGTCCGA--TCCAACC----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTAT-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATA--TC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------TAT--------CTATATAT------AAGTGAACTATGTTTG----G--TA-T--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTT-GCTAATGATATCA--A-AAGTATCCGA--CTCAACC----TG-----AACCTTCAACAG--A----A-TG--------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTT-GCTTCTAGTATTA--A-AAGAATCTGG--CTAAACC----TT-----AACCACCAAC---AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGTAA-----A--TGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCA------T------T----------------TATTTA----AATCA-T--CTTA--T-C--TT-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : AATATA-TTAAGCTAAAAATAAGA--G-AAGTA--AGA--CC-AACG----TA-----TATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCAT-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATA--TTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------TATCATTTAATT------C------AAATGAACTATTTTTA----A--TT-A--ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT--ACTTTTAGCGTCA--G--------CGAAACTCAGCT----TAGATGAAACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTAC-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTT-ACTTATGGTATCA--A-AAGTATCCGA--TACAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------TATCTATAT--T------T------AAGTGAACAGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--G-CGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAGATA---TG-----AACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTG-GCTTGTATTGTCA--G-CGATATTCGA--CTTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA-----AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA------A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAAATA---TG-----ATTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-CCTTATAGTATCA--A-AAGTATCTGG--CTCAACC----AA-----AACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTAT-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTT-GCTTATATTACCA--GTGAG-ATTCGG--CCTAAATATTGTG-----AACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTGT-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATT--TC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGT-GCGTATAATATTA--A-AAGCAACTGG--CTCAAAC----TA-----AACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTT-GCTTGTATTGTCA--G-TGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTAT-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA------A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCT-GCTAATAGTATCGATG-GAGTTT---------AACT----TA-----AAT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : T-GCTTATATCATCG--G-AGGGATTCAA--CTTGAGTGTA-TA-----AACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATAA-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATA--CT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------TAT--------C--------------------CGTTATTGT----A--AATT--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : CCAA--CTCGACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttgaTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------TATCTAAAT--T------T------AAGTGAACGGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTT--TTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------TATCTTTTTT-T------T------AATTGAACTGTGCTT--------------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : ACATG------TAT-----------------------AACGAACTATATTTA----G--TT-A--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatTTT--AACTGCAGTGG------TAT--------C------T------AAG----CTATATTTGTGTTA--T--T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTTA----A--TG-A--ATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tcttttATGTTTGG---A--TA-TTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1111111 1 1 1 1 11111111 1111 2222222222222 11111 5555555555555555555555 11111 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 1 1 8888 3 22 0 6666 44444 1 666666 1 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3333333 22 555 3 6 999 55 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 777777 4 99999999 1 6666 4 7777777777777 33 2 22 77777 1 33 777777 4444444444444444444444 2 11111 33 55555 33 44 2 2 5555 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . . . .... . .. . .... ..... . ...... . ... . .. .. .. . .. .. . ....... .. ... . . ... .. . . ....... . . . . . . . . . . . . .. ...... . ........ . .... . ............. .. . .. ..... . .. ...... ...................... . ..... .. ..... .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 0 9 0 9999 7 55 3 1111 55555 8 111111 6 000 5 55 99 44 7 33 55 0 2222222 88 333 5 0 222 00 3 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 222222 2 11111111 0 4444 7 0000000000000 22 4 99 99999 0 11 777777 5555555555555555555555 8 99999 77 55555 11 88 7 7 9999 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AAGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACGG-T--ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATCTATAT--------T------T------AAGTGAATGAAGTTTT----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--T-AT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GGT-------A--CTT--GA-CTT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------TAATGTTT------AAGTAAATGAGGTTTC----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCCAGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GGC-------A--CGT--GA-CTT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGG------TAT--------T------TATATTCAAGTGAATGATATTTC----A--TG-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTAATGGTATCA--A-AAGTGTCCGA--TCCAACC----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTAT-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGT-AAGTTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATA--TC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TGT-------AGGTGT--GA-CTT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATG------TAT--------CTATATAT------AAGTGAACTATGTTTG----G--TA-T--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTT-GCTAATGATATCA--A-AAGTATCCGA--CTCAACC----TG-----AACCTTCAACAG--A----A-TG--------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTT-GCTTCTAGTATTA--A-AAGAATCTGG--CTAAACC----TT-----AACCACCAAC---AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGAAA-TT--TTAT--T-AATAAG-ATAT-T--ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AGTAA-----A--TGT--GA-CTT-ATA------TTT--AGCTGCACAGG------TATCA------T------T----------------TATTTA----AATCA-T--CTTA--T-C--TT-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATATTT--TTAT--T-TGTATG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : AATATA-TTAAGCTAAAAATAAGA--G-AAGTA--AGA--CC-AACG----TA-----TATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCAT-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTATA-CTT--TTAT--C-AATAAA-ACAA-T--ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATA--TTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GGT-------A--AATTTGA-CGT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGG------TATCATTTAATT------C------AAATGAACTATTTTTA----A--TT-A--ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT--ACTTTTAGCGTCA--G--------CGAAACTCAGCT----TAGATGAAACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTAC-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTATAACTC--T
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTT-ACTTATGGTATCA--A-AAGTATCCGA--TACAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAAAATTT--T-AT--T-TGTAAG-ACAA-T--ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-TGT-------A--GGT--GA-CTT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGG------TATCTATAT--T------T------AAGTGAACAGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATAgt
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--G-CGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GAGCT---AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------A
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAGATA---TG-----AACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAGAA-TA--CAAT--T------G-ATAGTT--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAt
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTG-GCTTGTATTGTCA--G-CGATATTCGA--CTTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA-----AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAAAATAT--A-AT--T-GGTA------G-TT-ATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA------A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA--------A--C-T--GG-CTT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAAATA---TG-----ATTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGAAAT-------------------ACAA-TTGATAAT-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGGTAA-----A--C-T--GA-CCT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-CCTTATAGTATCA--A-AAGTATCTGG--CTCAACC----AA-----AACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTAT-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATGatggaattcctatattt
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTT-GCTTATATTACCA--GTGAG-ATTCGG--CCTAAATATTGTG-----AACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTGT-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAAA-TTA--TTCT--T-T-CAAG-AGA--T--ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATT--TC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGT-GCGTATAATATTA--A-AAGCAACTGG--CTCAAAC----TA-----AACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGAgcaattaattgacctatattgaaattttgctgcaatggtatc
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTT-GCTTGTATTGTCA--G-TGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTAT-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAAAATGTAATTAG--T-AGT---------T--ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA------A-TGT---TT-GGTGGTGctatattatgccgtaaaac
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCT-GCTAATAGTATCGATG-GAGTTT---------AACT----TA-----AAT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTATAA-CT--TTAC--T-ACTATG-ACAA-T--ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : T-GCTTATATCATCG--G-AGGGATTCAA--CTTGAGTGTA-TA-----AACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATAA-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTATAGTTT--TTATGATATATGCG-ATTA-T--ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATA--CT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GGTAAAGTTAA--CCT--GA-ATT-GATA-----TTT--GACTACACTGG------TAT--------C--------------------CGTTATTGT----A--AATT--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : CCAA--CTCGACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAAAA-TT--TTAT--T-TGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttgaTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAAAA-------------TATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAAAAT-------------ATAAGTAC-T-T--ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA--------A--C-T--GA-CCT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAATGG------AAT--------T------T------Aatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GGT-------A--GGT--GA-ATT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGG------TATCTAAAT--T------T------AAGTGAACGGGGTTTA----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTt
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTT--TTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AGT-------AAATGT--GT-CTT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGA------TATCTTTTTT-T------T------AATTGAACTGTGCTT--------------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : ACATG------TAT-----------------------AACGAACTATATTTA----G--TT-A--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattatttatTTT--AACTGCAGTGG------TAT--------C------T------AAG----CTATATTTGTGTTA--T--T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTTA----A--TG-A--ATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tcttttATGTTTGG---A--TA-TTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT
blockSeqs : G T A A A ATG T AA ATTG GATGA A TTTAA G TAA C TA GG GG A AA TC T TGTAATT GA ATA A T AGT TG A A TGTACAT T A A A G T G C AT TTTT T TTAATT C AGAA A TAAAGTTAACC TT G AA TTGAT A TT TATCTA CATTTAATTC G GTGTT AT ATTA AA AT A A ATAT CTTGCGTAGT GAAG AGG C A ATAACTA A TT CTCA AGT T GC CA C CA TA ACG A CCGT TATGAAT G
blockSeqs : A T . . A GC C . GTA . . AT G T C . T AG . . TC T TTTTT . TG T T GG T G . T A T A G A . A C . TTTA T TATT C AGAA A TAGGTG . . A TGAT A . . CTTTTTTTT G GG . ATT G C . . TAG . . AGG C A GAT A . . A T GC . . CA T C A . ATTAAA .
blockSeqs : G T . . A GC C . A . . A G T C . T A . . CC T TTTTT . TG T T AG . G . T A G A G G . G C . TTTT . TATT T AGAA . TAAATG . . T TGAA A . . TAATGTTT G T . AT G C . . CAG . . C C A AAT A . . A T GC . . CA C C A . TTTAAA .
blockSeqs : G T . . G GT T . A . . A G T . . C T . . TC T TTTTT . TG A . AG . G . T A G A G G . G C . TT . TTTT C G . TAAATG . . A TGAA G . . TTATATTC T C . AT G C . . CAG . . T C A GAT T . . A T . . . . C C A . TTTAAA .
blockSeqs : G T . . A T T . A . . A G T . . T A . . TA C CTTTT . TG A . AA . G . T A G T G G . A C . TT . GTTC T . . TAAAC . . A GAA T . . CTATATAT T C . GT G C . . TAG . . T C G GTT T . . A T . . . . T A A . ATTAAT .
blockSeqs : A C . . G T A . A . . A C T . . T A . . TC T TTATT . AA T . AT . G . T A G A G G . G C . TT . GTTT T . . TAAAC . . A GAA A . . CTATATTT A G . AT A C . . TAG . . C T A ATA T . . A T . . . . T A A . ACTTTA .
blockSeqs : G T . . A T T . A . . A G T . . T A . . TA A TTTTT . TG A . AG . G . T A G T G G . G C . TC . TTTT C . . TACG . . A GAA G . . CTAAATTT G A . AT G C . . TA . . A C G GTT T . . A T . . . . T A A . ATTACT .
blockSeqs : A A . . A A T . . . . A G A . . A A . . AT C TTTT . AA A . AA . G . . A G A G A . T C . TT . TATT A . . TACT . . A TGA T . . CATT G A . TA G T . . AG . . A C A ATA T . . A T . . . . T A A . AATTTA .
blockSeqs : G T . . G A T . . . . A T A . . G G . . TT T TTTT . TG A . AA . A . . A G C G A . C T . GT . TTT G . . CACG . . A TGG C . . TT T A . AT G C . . AG . . C C A ATT T . . A T . . . . C A A . ATTTAA .
blockSeqs : T G . . G A T . . . . T G T . . T G . . GT A TTTT . TA A . AA . G . . A G T . T . T C . AT . TTT G . . TAAA . . A TGG T . . TT T T . AT G A . . A . . A C A ATT T . . A T . . . . T G A . TATGTA .
blockSeqs : T A . . T T T . . . . T T A . . A A . . GT A TTTT . GG T . AA . G . . . G C . G . C C . TC . TTT G . . TAGG . . G TGG T . . TT T A . TA C A . . T . . C T A ATA A . . A T . . . . T G G . TATGTA .
blockSeqs : T G . . T G T . . . . T T A . . A G . . AT A TACA . AG C . TA . G . . . . T . . . A C . CT . TTT G . . TAGG . . A TGG T . . CT . A . GA G A . . A . . T T A ATA A . . A A . . . . C G G . TATGTA .
blockSeqs : T A . . T G C . . . . T T T . . A G . . GT A TATA . AC A . T . . . . . . C . . . T C . GT . ATG G . . AC . . A TGG T . . C A . T . G . . T . . A C G ATT T . . T A . . . . C A G . AATCTA .
blockSeqs : G T . . T A T . . . . A T T . . T A . . TA C CTTT . TG A . G . . . . . . C . . . A . . GT . GT T . . AC . . . TGG T . . . . . . . . . . A . . G C A CT A . . T A . . . . A A G . AGTAT .
blockSeqs : T T . . G G T . . . . A A A . . A A . . AT A TTTT . TA A . A . . . . . . T . . . T . . TT . . A . . AC . . . . G . . . A G A CA C . . T T . . . . C G G . GCAA .
blockSeqs : A G . . T G G . . . . T T T . . T G . . AA A T . T . . T . . . . . . C . . . T . . T . . A . . AC . . . . T . . . . G . T C . . . . . . . . T A A . TA .
blockSeqs : A . . A A . . . . . A C A . . G A . . AT A T . A . . T . . . . . . C . . . G . . . . . C . T . . . . G . A C . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T A . . . . . T T A . . T A . . AA A . . . . . . . . . . . . A T . . . . . G . . . . . A C . . . . . .
blockSeqs : . . G G . . . . . A T T . . T . . . TA A . . . . . . . . . . A C . . . .
blockSeqs : . T G . . . . . T G . . . T . . . TC T
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . GT A
blockSeqs : . . . GT A
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : TTTT*** TTT***** CATATTT***************
originalCons : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTT--TTAT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TAT--------T------T------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
finalCons : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAAAATTTT---AT--T-TGTAAG-ACAG-T--ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-TTTT-----GTTGNTGGT----AT-GGT-------A--CGT--GA-CTT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGG------TATCATATTT---------------AAGTGAACGATGTTTN----A--TA-T--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Alignments
lowQualScore : 1111 1111111 1 1 1 1 11111 1111 33333333333333333 22222 2222222222222 111 1111 11111 33333333 111111111
lowQualScore : 1 2 2 1 1 8888 3 22 0 6666 44444 1 666666 1 444 5 22 44 99 1 22 44 1 3 1 2 5555 1 22 2 5 999 4 8 2 9999999 0 3 3 0 1 5 0 0 2 1 4 0 22 88888888 88888 22 1 6666 4 00000000000000000 33 2 55555 33 00000 1 22 0 2 9999999999999 555 33 111 88 4444 33 44 2 2 2222 8888888888 4444 44444 1 3 00000000 1 22 4444 666 4 88 22 2 99 44 444 2 4444 888888888 2
lowQualScore : . . . . . .... . .. . .... ..... . ...... . ... . .. .. .. . .. .. . . . . .... . .. . . ... . . . ....... . . . . . . . . . . . . .. ........ ..... .. . .... . ................. .. . ..... .. ..... . .. . . ............. ... .. ... .. .... .. .. . . .... .......... .... ..... . . ........ . .. .... ... . .. .. . .. .. ... . .... ......... .
lowQualScore : 1 3 0 9 0 9999 7 55 3 1111 55555 8 111111 6 000 5 55 99 44 7 33 55 0 6 8 4 7777 8 55 9 7 555 2 8 1 5555555 9 0 2 1 0 9 7 3 2 0 0 8 99 44444444 22222 88 0 4444 4 99999999999999999 11 2 66666 11 88888 0 99 3 7 2222222222222 000 99 000 11 4444 11 88 7 7 6666 8888888888 2222 33333 2 0 44444444 0 88 2222 222 7 77 99 2 22 44 111 1 7777 666666666 4
consensus : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAA-A-ATTTT----AT-TTGTAAG-ACAG-T-ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GG----T-------A--CGT--GA-C-----TT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGGTA-T---C------A--T---ATTT--AAGTGAACGANGTTTN-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
Reference ( family-571 ) : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACCTCTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTATANTATCA--G-AAGTATCCGA--CCCAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TNAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTAC--ACACTAATTGTGTNCGGTTACNATGGTAA-A-ATTTT----AT-TTGTAAG-ACAG-T-ATCGT-TA-------GTAACCGTATATACCAGCGTACCANCAGTAATTGTCAATAGTAAGAAC-ATCAACAAACTANAGTGTGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGNTGGT----AT-GG----T-------A--CGT--GA-C-----TT-AAAA--GGGTNT--GGCTGCACAGGTA-T---C------A--T---ATTT--AAGTGAACGATGTTTN-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--N--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTANAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AA--GTACGTTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138766 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGCGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAA-A-ATTTTT---AT-TTGTAAG-ACAG-T-ATCAT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAGCGAACTAGAGTATGCCGTAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GG----T-------A--CGT--GA-C-----TT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTA-T-------------------TT--AAGTGAATGAAGTTTT-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCTTAAAACCA--TT----ACA--CAGTAGTATTTACAGTTAGT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138767 : TTTACTATATGTAAAACCTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AAGACTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-AGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAA-A-ATTTT----AT-TTGTAAG-ACGG-T-ATCAT-TA-------GCAACCGTGTATTCCA-CACACAAACAGTAATTGTCAATAA-AAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCCCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GG----T-------A--CGT--GA-C-----TTAAAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTA-T---CT-----A--T---ATTT--AAGTGAATGAAGTTTT-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T-TAGTTAATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--TTGATACTAATAACATTGAT-----TGACATTCCCTAAAACT-----------------TAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AC--ATACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138768 : TTTAATATGTGTAAAACCTATATATTACGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-TTGTT-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAA-T-ATTTT----AT-TTGTATG-ACAG-T-ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGAAAGTAATTGTCAATA-TATAAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCAGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGCTGGT----AT-GG----T-------A--CTT--GA-C-----TT-AAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTA-T---T------AA-T---GTTT--AAGTAAATGAGGTTTC-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTCGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCAAT-----TGACATTCTCTAAAACCA--TT----ATA--CAGTAGTATTTACTGTTAAT--G--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138769 : TTTGCTATATGTAAAAACTATATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCCAGAGATATCA--T-AAGCGTCCGA--CCCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TCCCGC-T--GA-CTGTA-TATC-TGTGC--ACACCAACCGTGCCCAGTTGCTATGGTAATA-TTTTT----AT-TTGTATG-ACAG-T-ACCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CACACAGACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAC-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGCAAAACCGGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TT-GTTGTCGGC----GC-GG----C-------A--CGT--GA-C-----TT-TAAA--GAATAT--GGCTACACAGGTATT---T------A--T---ATTC--AAGTGAATGATATTTC-ATGT--ATTAG-T-CTATT-T-T-CAGTTGATCGT----------CTTGCATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--T--ATGATACTAATAACATCGAT-----TGACATTCCCTAAAACCA---T----ATA--CAGTAGTAATTACTGTTAGT--G--GTTAACCATATAACCCTGTA-C--AC-AC--GTACATTGTTATTTA----TATAC-T--TTAAAT-TGTATATTT
gi|138770 : TTTACTATATGTGATACCTATATGTTGGGCCAGACACTTTCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-GCTAATGGTATCA--A-AAGTGTCCGA--TCCAACC----TG-----AACCTTCAACAG-AA----A-TGAT--TTCTAT-T--GA-TTGCA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCGGTTGCTCTGGTAA-G-TTTTT----AT-TTGTAAG-ACAA-T-ATTGT-TA-------CTAACCGTGTATACCA-CATACCAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACTCTCAAC--AATA--TC--ATT-T---TT-CTTGCTGGT----AT-TG----T-------AGGTGT--GA-C-----TT-AAAAT-GATTGT--AACTGTACATGTA-T---CT-----A--T---ATAT--AAGTGAACTATGTTTG-GTAT--ATTAG-T-CTA---T-T-TAGTTAATAGT----------CTTACGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--C--GTGATACAAATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--C--GTGAACCGTATAACCCTGTT-C--AT-GACGGTTCATTGTTATTTA----TATAC-A--TTAATT-TGTATATTT
gi|138771 : TTTACTATATGTAATAC-TATATGTAAGGCCAGACAATTTTTCTTATAGCGCAAA-AAA-TTT-GCTAATGATATCA--A-AAGTATCCGA--CTCAACC----TG-----AACCTTCAACAG--A----A-TG--------AT-T--GA--TGTA-TACCACATACAAACAGTAATTGT
gi|138772 : TTTACAATATGTAAAACATATATATTAAGCCAAACGCCCCCGCTTATAGAGCAAATAAA-TTT-GCTTCTAGTATTA--A-AAGAATCTGG--CTAAACC----TT-----AACCACCAAC---AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TA---TATAC--ACACTAATTGTGTTAGGTTACCATGGCGA-A-ATTTT----AT-TAATAAG-ATAT-T-ATCGT-TA-------GCAATCTTATATA-CAACATACCATCGGTACTTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACTCTCGGC--AATATTTT--A-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AA-AG----TAA-----A--TGT--GA-C-----TT-ATA------TTT--AGCTGCACAGGTA-T---C------ATTT---ATTT--AAAT--------------CAT--CTTA--T-C--TT-T-T-TA-TTAATAGA----------CTTGCATAATTCTAT----ATTAAATGCC--A--GTAATACTAATAGC-----T-----TGATA----CTATAA-CA--TT----AGA--CAGAAATGTTTACTCTTAAT--G--GTGAACCATATAGCCTTG
gi|138773 : TTTACTATATGTAAAACCTGTATGTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAGTGCAAATAAA-TTT-GCTTGAGATATCA--T-AAGTGTCCGA--CTCAACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----A-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTTTG-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGCTATGGTAATA-TTTTT----AT-TTGTATG-ACAG-T-ATCGT-TA-------GCAACCGTATATACCA-CATACAGACAGTAATT
gi|138774 : AATATA-TTAAGCTAAAAATAAGA--G-AAGTA--AGA--CC-AACG----TA-----TATCTTCAGTAG-AA----T-TGAA--TTCCAT-T--GA-AAGTG-TATC-TGTAC--ACACTATTTGTGTTAGGTTACAATGGTAT-A-CTTTT----AT-CAATAAA-ACAA-T-ATCGTATA--------TAACCTTAATTACC-TTATATCATCAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ATCAACAATCTAGCGTATGCCATCAA-CTCTTGAC--AATA--TTTAG-T-TA--TT-GTTGTTGGT----AT-GG----T-------A--AATTTGA-C-----GT-AAAT--TGATATTTGGCTGCACTGGTA-T---C------A--TTTAATTC--AAATGAACTATTTTTA-ATTA--ATTAA-TATTATT-T-T---ATTAATAGT----------ATTGCGTAACTTTAT----ATTGAATTCC--A--ATGACATTAATAACGCC-ATA----TGACATTACCTATCACCA--TT----TTA--CAGAAGTATTTACTGTTAAT--G--GTTAGCCACATAGCCCTGTA-C--A-----------TTGCTATTTA----TATAC-ACTTTA----TGTATAT
gi|138775 : ttttctatatgtaaaaccTTAATATTTGCAAAACTAATATATTAGGCCAAGCAACACCG--TATAGCGCAAA-AGA-TT--ACTTTTAGCGTCA--G--------CGAAACTCAGCT----TAGATGAAACCTTCATTAG-AA----T-TTAA--TTCTAC-T--GA-GAGTGGTATC-TGTAC--ACTCTAATTGTGTATGGATACCATTGTAT-A-ACTCT----GT-
gi|138776 : ATGTAATACCTAC--GTTAGGCCAGACACTTTTGCTTATAACGCAAATAAA-TTT-ACTTATGGTATCA--A-AAGTATCCGA--TACAACT----TG-----AACCTTCAACAG-AA----T-TGAT--TTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGA--ACACTAATTGTGCTTGGTTGCTATGGTAA-A-ATTTT----AT-TTGTAAG-ACAA-T-ATTGT-TA-------GCAACCGTGTATACCA-CGTACAAACAGTAATTGTCACTA-TAAGAAT-ATCAACAAACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--ATT-T---TT-GTTGCTGGT----AT-TG----T-------A--GGT--GA-C-----TT-AAAAT-GAATGT--GGCTGCACAGGTA-T---CT-----A--T---ATTT--AAGTGAACAGGGTTTA-ATAT--ATTAG-T-CTA-T-T-T-TAGTTAATAGT----------CTTGTATAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTTATAACATCGTT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC-A--TTACTT-TGTATA
gi|138777 : ACCAATATTTTAAGTTAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--G-CGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AA----ATTTAA--TTCTATCT--AAGGTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAA-A-A------------TATAAGTAC-T-T-ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA------------A--C-T--GAGC-----T---AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138778 : ACCAATATTTTAAGCCAAATTACACTGCTCATAGCGCAAATTGC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAGATA---TG-----AACTTTCGATAA-AA----T-TTAA--TTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-TGTAC--ACACTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAG-A-ATACA----AT-T-----G-ATAGTT-ATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCTGTAAAACCCCAAAC---ATA--AT--G-T---------TTGGTGGC----ATAGG----TAA-----A--C-T--GA-C-----CT-ATAA--TGGTCT--GGCTGCAatggaatttat
gi|138779 : ACCAATATTATAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCACAAATCGC-TTG-GCTTGTATTGTCA--G-CGATATTCGA--CTTAACTA---TA-----AACTTTAGATAA-AATTTAA-TTAT--ATCTA-----AA-ATGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTCTGTATAGTTACAATGGTAA-A-ATATA----AT-TGGTA------G-TTATC-T-TATGTACATGTAACCATATAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGCCAATAGTATAACC-ATCGACAGATTATATTGTGCCGTAAAA-TCCCAAT--CATA------A-TGT---TC-GGTGGTAGTG---AT-GA------------A--C-T--GG-C-----TT-ATGA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138780 : ACCAATATTTTAAGCCAAATAACACTGCTCATAGTGCAAATTAC-TTT-GCTTATATTGTCA--GCAAG-ATTCGA--CCTAAATA---TG-----ATTTTTCGATA--AA----A-TTTTAATTCTATCT--AA-AGAGG-TGTC-GTTAC--ACATTAATTGTATGTGGTTAGAATGGTGA-A-ATACA----AT-TGATAA-------------T-TAT------GTCACCGTATAT-CCAGCGTACCATCAGTAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTACAATGTGCCATAAAATCCCAAAC--A------T--A-T-G---T---TTGGTGGT----ATAGG----TAA-----A--C-T--GA-C-----CT-ATAA--TGGTTT--GGCTGCAATGGAA-TTCCT------A--T---ATTT--atggaatatata
gi|138781 : CTATATGTTAA-CCAAAAGCCTCCGCTTATAGCGCAAATAAA-TTT-CCTTATAGTATCA--A-AAGTATCTGG--CTCAACC----AA-----AACTTTCAACAGAAA----A-TAAT--TTCTAT-T--AA-TCGTA-AATC-TGTAC--ACACTAATTGTGCTAGGTTACCATG
gi|138782 : ATATTTTAAGCC---TAC---TGCTTATAGC--ATATTTA-TTT-GCTTATATTACCA--GTGAG-ATTCGG--CCTAAATATTGTG-----AACCTCCAATAG-AA----T-TTAA--TTCTGT-C--GA-AACTAGTATC-TGTAC------TAATTGTGTATGGTTACAATGGTAA-A-TTATT----CT-TT-CAAG-AGA--T-ATTGT-GT-------GTAACCTTATGT-CCAGCATTCCACCAGTAACTGTCAATAGTAA--ACTATCAACAAGTTCAGGTGTGCCGTAAAACCCCCAACATAATT--TC--A-T-A---TG-GTTGGTGGT----A---GCAATT-------A--ATT--GA-CCTATATT-GAAA-----TTT--TGCTGCAATGGTA-T---C------
gi|138783 : TATATCAAGCCAGACGCCTCCGCTTTTAGCGCAAAAAAAATGT-GCGTATAATATTA--A-AAGCAACTGG--CTCAAAC----TA-----AACCTTCAACAG-AA----A-TCAT--TTCTAT-T--GA-TTGTA-TATT-TATGT--ACACAAATTGTGAAAGGTTACAATGGTGA-CTATATT----ATGCCGTAAA-AC
gi|138784 : TAAGTCAAACAACGCTGCTCATAGCGCAAATCGC-TTT-GCTTGTATTGTCA--G-TGATATTCGA--CCTAACTA---TA-----AACTTGAGATAA-AA----T-TTAA--TTCTAT-CTAAA-GTGT--TATC-TGTAC--ATACTAATTGTGTATAGTTACAATGGTAA-A-ATGTA----AT-TAGTA------G-TTATC-T-TAT------GTAACCATATAT-CCAGCATGCCACCAATAATTGTCAATAGTATAACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA------A-TGT---TT-GGTGGTG
gi|138785 : AGGCCAAAC-CCACTGTTTATAGCGCAAATAAA-TCT-GCTAATAGTATCGATG-GAGTTT---------AACT----TA-----AAT-----ATGT-AA----A-------TTCTAT-T--GA-TTGTG-------GTAT---------TTGTGTAAGGTTACAACGGTAT-A-ACTTT----AC-TACTATG-ACAA-T-ATCGT-AT-------GTAACCaaaatgaactga
gi|138786 : T-GCTTATATCATCG--G-AGGGATTCAA--CTTGAGTGTA-TA-----AACACTCAATAA-AA----T-TTAA--TCATAA-T--GG-TTGTA-T--C-TGTAC--ACGCTAGTTGTGTTAAGT-ACAATGGTAT-A-GTTTTTATGAT-ATATGCG-ATTA-T-ATCGT-AT-------TTAATCTTATAAAC--GCATGCCGTCAGAAATTGCCAATA-TAATAAT-ATTAACAAACTAAAGTATGCCGTAAAACCTT---C--AATA--CT--A-T-TTAATT-GTTGTCGGT----TT-GG----TAAAGTTAA--CCT--GA-A-----TT-GATA-----TTT--GACTACACTGGTA-T---C------CGTT---ATT-----GTAAAT------------T--ATTA--T-TTATT-TAT-TAG-TATTAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGCC--A--ATGGGACTAATAACGCC-ATA----TGACATTCCCTATCACCA--TT----ATA--CGGCAGTGTTCACTGTTAAT--A--GTAATCCATATAGCTTAGTA-C--AT-AA--GTACAATGCTATTTG----TATAC-AATTTA----TGTATATTTtacagtacagtaa
gi|138787 : CCAA--CTCGACT----TG-----AACCCTCAACAG-GA----T-TGAT--CTCTGT-T--GA-TTGTA-TATC-TGTGC--ACACTAATTGTGCTCAGTTGATATGGTAA-A-ATTTT----AT-TTGTAAG-ACA
gi|138788 : aagttgaTGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTTACAATGGTAA-A-A------------TATAAGTAC-T-T-ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAATTTATGGTGTGCCGTAAAA-CCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA------------A--C-T--GA-C-----CT--AAA--TGGTTT--GGCTGCA
gi|138789 : TGT--TATC-TGAAC--ACATTAATTGTGTGTGGTAACAATGGTAA-A-AT------------ATAAGTAC-T-T-ATC-T-TAT------GTAACCATGTAT-CCAGCGTACCACCAATAATTGTCAATAGTAA-ACC-ATCAACAAATTATGGTGTGCCGTAAAA-GCCCAAT--CATA--GT--G-T---------TTGATGGTAGAAAT-GA------------A--C-T--GA-C-----CT--AAA--TGGTTT--GGCTGCAatggaatatat
gi|138790 : TGTATACCA-CATACAAACAGTAATTGTCAATA-TAAGAAT-ACCAACAGACTAGAGTATGCCGTAAAACCCGCAAC--AATA--TT--A-T-T---TTTGTTGCTGGT----AT-GG----T-------A--GGT--GA-A-----TT-AAAAT-GAAAGT--GGCTGCTCAGGTA-T---CT-----A--A---ATTT--AAGTGAACGGGGTTTA-ATAT--ATTAG-T-CTATT-T-T--AGTTAATAGTCTTGCGTAGTCTTGCGTAGCTCTAT----ATTGAATGCC--C--ATGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TT----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--A--GTGAACCATATAACCCTGTA-C--AT-AA--GAACATTGTTATTTA----TATAC-A--TTatggaatttat
gi|138791 : ACTATATTATGCCGTAAAACCCTCAAC--ATTT--TTTTA-T-TA--TT-GTTGGTGGT----AT-AG----T-------AAATGT--GT-C-----TT-AAATTTGATTTT--ACCTGCACAGATA-T---C------T--T---TTTTTTAATTGAACTGTGCTT--------ATTAG-T-ATATT-T-T-T--TAAATAGT----------CTTGCGTTACTCTAT----ATTGAAAGCC--T--GTGATACTAATTACATCATT-----TGACATTCCCTATAACCA--TC----ATA--CAGTAGTGTTTACTGTTAAT--G--GTGAGCCATATAGCCCTGTA-C--AC-GA--GTACATTGCTATTTA----TATAT-A--TTTAAT-TTTATATTT
gi|138792 : TA-TA--C------A--T---GTAT--AA-CGAACTATATTTA-GTTA--ATTAG-T--TGTT-T-T---ATCAATAGT----------CTTGCGTAACTCTAT----ATTGAATGTC--A--ATGCCATTAATAACAGC-ATA----TGATCTACCCTAACAACATTTT----ATA--GAGCAGTGTTTATTGT
gi|138793 : accaaaattgatatttggtgcattattTTT--AACTGCAGTGGTA-T---CTAAGCTA--T---ATTT----GTG---------TT-AT-T--ATTAC-C-ATATTAT-TATATTTAATAGT----------CTTGTGTAATTCTATGAAGATT-AATGCC----------ATTAATAACATC-ATAACTATGACCTTCCCTAAAACC---------ATA--TAGCCGTGTTTA
gi|138794 : taaattgataTTTA-ATGA--ATTAAAT-ATATT-T-T-T------T-GT----------CTTGCATAACTCTTT----ATTGAATGCT--G--ATGACACTTATAACATC-ATA----TGGCATTCCCTATTACCA--TT----ATT--CAGTAGTATTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C--TT-AA--GTACATTGCTATTTA----TATAC----T---ATGTGTATAT
gi|138795 : tcttttATGTTTGGATATTAATTAG-T-GTAAT-T-T---ATGACTAAT----------CTTGCGTAACTCTAC----ATTGAATGTT--A--ATGACTCTATTAACGTCATT-----TGACATTCCCTAATACCA--TT----ATT--CAGCAGTTTTTACTGATATT--G--GTAAACCATATAGCCCTATA-C---T-AG--GTATATTGCTATTTA----TATAC-A--GT-ATT-TGTATA
gi|138796 : ataaatttttatAATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCGTA-TCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138797 : AATAGT----------CTTGTGTAACTTTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC----CT---CATTAGTGTATATTG--AGTGCG--ATGAGCCATATAATCCCATA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138798 : AATTGT----------CTTGTGTAGCT--AT----ATTAAATATC--AGGATGATA-----AATATCC-T-----TAATATTCTTTACAACCA--TTCTCAATAGTCACTAGAATATATCAAGAAC--A--GT-ATCCATATAATCCTGTA-C--ATAAA--GTATGTTGTTA--TA----TATAC-G--C--AAT-T---TATTT
gi|138799 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ATTGAATATCAGG--GTGGTA-----AGTATCCA------TAATATTCTCTACAACCG--CT----CT---CAGTAGTATGTATTG--AGTGCG--ATAAGCCATATAATCCCGTACC--AA-AA--GTACGTTATTATTTT----TATGCTA--TGAATT-TGCATA
gi|138800 : AATAGT----------CTTGTGTAACTCTAT----ACTGAATATC-----AGGGTGGTAGTAAC--CA-------TAATATTCCCTACAACCG--CC-----TT--CATTAGTGTATATTG--AGT--GCAATGAGCCATATAATCCCGTA-CCAAC-AG--GTACGTTATTATTTT----TATGC-T--ATGTAT-TGCATA
gi|138801 : TTAATGTTAAT--G--GTGAACCACATAGCTCTGTA-C--AT-AA--GTACATTGATATTTACCGTTATAC-AATCTA----TGTATAT