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gi|85711                      :                                                                                                                                                                                                                                                    ttctgatataaaataccacattaagcaattattttgtaatcattttgttttttttgttataatgacatttgatgtttctttttagaagtaatattgatttctgatatttctattgaaATCCCTTCCTTG-ATTTGTTT-ATAAAG-TATTAATTTAACATA-----AACAAAAATACAAAATAA-AAC----ACAACT--GTATCAGATAA-----GTT-T-AAAATATG-TAATTTATT--ATAACTAGTAAT-TT-CTTCTAAAC-------AATA-TTTACGTTA-------C--------ATTC--------AT--CTGAT--AAAAA-------CAGTTATAT--------AA-T-C----GTTC---AA-AAAATCATCT-----TA---AAATATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTT---TGATGCATATTAACA-CCTAT-ATGGTTTCT-TCT--CGTC-----CTAATG-CTT-----TT-A---------TA-AAATGT--T-CTGTGG-ACACATGTTAGTACAATATAA--A--CACATTTTTATAAC----TTTACATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATG--TGAAATG-GACGTTTAC---AAGTAGTA-----T-------------T-----T--ATACAC---TTC-TTTA--------AAA----TTTAATTAT--C----AAC-----TTTA----A-ATTGGATCAG--------ATCAAATTCCTGCAGGCTTT---AATT-CATATTAACACCCAA-ATTGTATCCTCT--CGTTCTGATG-TTTTTTG-TA-AA-TGTTCT----GTG--GACACATGTAAGTTCAAT-ACAAAC--ATA-------TTTTTAT--AAC-TTTATATAACATAAAATACGTTACACAAATG-TGAAACGTAACATTTAT-------AAGTAGTATTTATTCA----T-TCT-TTTAAAA-TATAATTATCAAAT-----------TGA-------------------------AA--T----TG---A--TAT--G---------------------AACCGTAATTTAAATCATA---------------------C---------------------AAG--CCTGCTAATGACTTCAATACAACA-TGATA--AGAATGACGATACATATAGGTACA-CTTG---CAA-------AATATGGAATATT----TTTTTA----GGAATATTTTA-CACAAAA-AAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTG-AACTCCAAAG-TAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACT-ATGCGTATTTAATCCATTCTGTACATTTC-CGTTGCTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTC
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gi|85718                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    atcagatcaaattcctacaggctttcataattacatctttgtttttttcttatgtttttTCCT-A-ATGCTTTT-ATAAAA-TATTCTGTGGACACA-TGTAAGTACAA-AACAAACACA-TTT--TTATAACATTATATAACATAAAATACATTAC-AAAA-ATG-TGA---AAT--GTAAC-----GT-TTAC----AAGT-------AGTA-TTTA--TT--------C--------ACTT--------CT--TT------AAAA-------TT--TA-AT--------TA-T-CAA--GTTT---AA-A--------T-----TG---GAT---CAGATCTAATTCCTGCAGGCTT---TGATTCATATTAACA-TCCAA-ATGGTATCG-TCT--CGGT-----CTGATG-TTT-----CT-A---------TA-AA-TGT--T-CTGTGG-ACACATGTTAGTACAGTACAT--A--CAAATTTTTATAAC----TTTATATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATG--TGGAACGTAACATTAAC---AAGTAGTA-----T-------------T-----T--ATTCATAT-TAT-TT----------GAA----TATAATCA--------AG------TTTA----A-ATT-GATCAT--------ATGAA----CTGTAA--TTT---AAAT-CATAaaagttgctcattaaaattgaattttgattatataagcctgataataacttcttcataacataacagaatgatacatagaggtacactggtaaaataaagagtgtgtcgtatgaaatttacatgaacttaactataacatacactactgtactctgaagtaacgtaatgttatgctgtaataaaatactatgtgcttccaatctactctgtacatttttcgttgttggaagaagtagatggataggattctatacttcatcattactgtcatcctcatcctcagaactttctccatattccatatcaaattcttcttcatacatgttactgcaaaactgatttttgcaagcgggtgagcatttcagtgaatttaacaggcactggcatgatggtaatttacattctctagcacatttgcaagacaggaattccataacaacctgtggagcgggaagtcctttcatccattcaactaccaactgtccatcttccatgaaccatccgtgatcttctggacttggaatttcaggaaagtttactagacttctacgccggagtgtagatatagtgtgtcttcacagggtggcagttttcccgattcaacatca
gi|85713                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TTCT-A-ATGTATTT-ATATAA-TGTTATGAT--CA-A-TGTTACTGTCA-TACAAAAACA-TTT--CTGTAACTGTATATAAAATAAAATACGTTAC-CAGA-ATG-TGA---AAT--TTCAC-----AT-TTAC----GAAT-------AGAA-TTTA--AT--------C--------A-AA--------TT--TG--T--TAAAA-------TC--CA-AT--------CA-T-CAA--GT
gi|85712                      :                               ttctgatataaaacaccactttaagcatatttttttttataaatttgctaatttatacgttatttattatactttacgttatatttttgaagtcatattgatttcggctatttctattcaaaatcattcttagatttgttaataaaatattaatttagcataaatacaatccataaaagaacatcataaaacataactgaagtttaaaattactttaatattatctttttttaaacaatatttatgttatattcatctgatacaaacagttataatcgttcaaaaattatactaaatcatcacatcagatcaaattcctacaggctttcataattacatctttgtttttttcttatgtttttTTTGTTTATAAAGTATTAATGTAA-CATAAACAAA-AAT--ACATAA-----TAAAACACAAC-TGTATCAG-ATAA-ATT-TAA---AATATGTAAT-----TTATTAT----AAGT-------AGTAATTTC--TTGTAAACAAT--------ATTTACGTTACATTCATC--TGATAAAAACAGTAATA--TA-ATCGTTCTTAAA-T-CAT--CTTT---AA-A--------T-----------AT---CAGATCAAATTCCTGCAGGCTT---TGATTCATATTAACG-C-CAATATGGTTTCA-TCT--CGTT-----CTAATG-ATT-----TT-A---------TATAA-TGT--T-CTGTGG-ACACATATTAGTACAATACAA--A--CACATGTTTATAAC----TTTATATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATA--TGAAATGTAACGTTGAC---AAGTGGTA-----T-------------T-----T--ATTCA--C-TTC-TTTA--------AAA----TTTAATTAT--C----AAG-----TTTA----A-ATTGGATCAG--------ATCGAATTCCTGCAGGCTTT---GATaaagttgctcattaaaattgaattttgattatat
gi|85728                      :                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctgatataaaataccgcattaagcaattattttgtaatcattttgtttttttatgttacaatgacatttgacgttagtttttagaagtaatattgatttccgatatttctattgaaatcacttcctagaTTTGTTTATAAAGTATTAATGTAA-CATAAACAAA-AAT--ACATAA-----TAAAACACAAC-TGTATCAG-ATAA-ATT-TAA---AATATGTAAT-----TTATTAT----AAGT-------AGTAATTTC--TTGTAAACAAT--------ATTTACGTTACATTCATC--TGATAAAAACAGTAATA--TA-ATCGTTCTTAAA-T-CAT--CTTT---AA-A--------T-----------AT---CAGATCAAATTCCTGCAGGCTT---TGATTCATATTAACG-C-CAATATGGTTTCA-TCT--CGTT-----CTAATG-ATT-----TT-A---------TATAA-TGT--T-CTGTGG-ACACATATTAGTACAATACAA--A--CACATGTTTATAAC----TTTATATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATA--TGAAATGTAACGTTGAC---AAGTGGTA-----T-------------T-----T--ATTCA--C-TTC-TTTA--------AAA----TTTAATTAT--C----AAG-----TTTA----A-ATTGGATCAG--------ATCGAATT
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gi|85713                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     T--T--CAAAAAT-----TA--TA-CT--------AAAT-CA-----TC---AC-A--------T----------------CAGATCAAATTCCTACAGGCTT---T----CATAATTACATCTTTG-TTTTTTTCT-TAT---GTTTTTTTCTAATG-TAT-----TT-A---------TATAA-TGT--T-ATGAT---CA-ATGTTACTGTCATACAA--A--AACATTTCTGTAAC----TGTATATAA--AATAAAATA-CGTTAC-CAGA-ATG--TGAAATTTCACATTTAC---GAATAGAA-----T-------------T-----T--AATCA-AA-TTT-GTTA--------AAA----TCCAATCAT--C----AA-------GTA----AAGTT-GCTCAT---------TAAAAT---TGAA--TTTT---GATT--ATAT
gi|85722                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ttctgatataaaacaccactttaagcatatttttttttataaatttgctaatttatacgttatttattatactttacgttatatttttgaagtcatattgatttcggctatttctattcaaaatcattcttagatttgttaataaaatattaatttagcataaatacaatccataaaagaacatcataaaacataactgaagtttaaaattactttaatattatctttttttaaacaatatttatgttatattcatctgatacaaacagttataatcgA-AT--------TA-T-CAA--GTTT---AA-A--------T-----TG---GAT---CATATCAAATTCCTGCAGGCTT---TGATTAATATTATCA-C-CAATATGGTTTCA-TCT--CGTC-----CTAAAG-TTT-----TTTA---------TATAA-TGT--T-CTGTTG-ACACATGTTAGTACAATACAA--A--CACAATTTTATAAC----TTTATATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATG--TGAAATGTTACATTTAC---AAGTAGTA-----T-------------T-----T--ATTCAT-T-TTT-TTTA--------AAA----TATAATTAT--C----AAG-----TTTA----A-ATTGGATCAG--------ATCAAATTCCTGCAGGCTTT---GATT-CATATTAACACCCAA-ATGGTATCGTCT--CGCCCTGGTA-CTTTT-A-TA-AA-TGTTAT----TTG--GACACATGTAAGTACAAT-ACAAAC-AAT--------TTTTTAT--AAC-TTTATATAACATAAAATATGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTCA----T-TTT-TTTAAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTA-------------------------AA--T----C----A--TAT--G---------------------A-------------TCATATGAACTGTAATTTAAATCATAC---------------------ACG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACA-TAATA--AGAATGACGATACATATAGGTACA-CTCG---CAA-------AATATGGAATGTG----TTTTTA----GGAAACTTTTA-CACAACATAAAATT--CTGTTTCAAGCAATTTTG-AACTCTAAAG-TAACATAAACTTATACTGTTATAAAACACT-ATGTGTTTTTAATCCATTCTGTACATTTC-CGTTGTTACAAGAAGTAGTTTGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTGTATGTTCCGTATCAAAACTCTT--------------------ACTCGACTTTTGCAGACGGATAAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACAATGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGTGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCATAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACAAAACATCTTCAATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGACAATTTGCTCGCAATGAATGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAAATATTAA
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gi|85707                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ttctgatataaaataccacattaagcaattattctgtaaccattttgtattttttcgttacaattacatttgatcttaatttttagaagtaatattgatttccgatatttctattgaaatcccttcctagatttgtttataaagtattaattaaacataaacaaaaatacattataaaacacaagtgtatcagataggtttaaaatatgtaatttattattagtagttatttcttctaaacaatatttacgttacattcatctgataaaaaacagttatataatcgttccA-AA--------AA-T-CAT--CTTA---AA-A--------T-----------AT---CAGATCAAATTCCTGCAGGCTT---TGATGCATATTAACG-CCTAT-ATGGTTTCT-TTT--CGTC-----CTGATG-CTT-----TT-A---------TA-AAATGT--T-CTGTGG-ACACATGTTAGTACAATACAA--A--CACATTTTTATAAC----TTTGTATAA--CATAAAATA-CGTTAC-AAAA-ATG--TGAATTGTAACGTTTAC---AAGAGGTA-----T-------------T-----T--ATTCAAGT-CTTCTTTA--------AAA----TTTAATTAT--C----AAG-----TTTA----A-ATTGGATCAG--------ATCAAATTCCTGCAGGCTTT---GATT-CATATTAACACCTAA-ATGGTATCGTCT--CGTTCTGATG-TTTTT-A-TA-AA-TGTTCT----GTG--GACAC-TGTTAGTACAAT-ACAAAC-AAT--------TTGTTAT--TAC-TTTATATGACATAAAATATGTTACAAAAATG-TGAAACATAACATTTGC-------AAGTAGTATTTATTCA----TATTT-TTTTAAAATATAATTATCAAGT-----------TTAAATTGATCATATGAACTGTAATTTAA-------------------------------------------A-------------TCATA---------------------C---------------------AAG--CCTGCTAATGACTTCCATATTACA-TAATA--AGAATAA-GA---ATATTGGTACA-CTCG---CAA-------AATGTGGAATGTT----TTTTAA----AGAATATTTTA-CACAAAATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTG-AACTCCAAAG-TAAC--AATCTTATACTGTAATAAAACACT-ATGTGTATTTAATCCATTTTGTACATTTC-CGTTGCTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTTTCTATGTTCCGTATCAAAACTCTT--------------------ACTCGAATTTTGCAGACGGATGATCATTTTAATGCATTTATCAGACAATGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGATATGAA---TTCTATAACAAC-ATGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAATCATCTTCCATGAACCATCCTTGCTCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAATTT-TTTCCAGATTTAACACTAAGATATTAA
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|85709                      :          ttctgatataaaataccacattaagcaattatttttaatcattttgtatttttacgttacaattacattttacgttactttttagaagtaatattgatttccgatatttgtattgaaatgccttcctagatttgtttataaagtattaatttaacataaacaaaaatacataataaaacacaagtgtatcagataagtaatgtaatatgtaatttattattattaattatttcttttaaacaatatttacgttacaatcatctgataaaaaaaatttTTTCGTCCTA-ATGCTTTTATA------TACTGTTCTGTGGACACATGTTAGTACA--ATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAA-CATAAAATACGT--T---ACAAAAATGTG----AAAT--GTAACGT-TTACAAGTAG--TAT--TTA--TT-CAT--TTCTTT---AA--TA-------TTTAATT--------AC--CAAG-----TTTAAATTGGATCATATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTAATATTAACACCAAAATGGTTTCATCT--CGT-------CCTAATGTTTTT-ATATAATGTTCTGTTGACACATGTTAGTACAATACAAACTCAATTTTATAACTTTATATAACATAAAATGC--GT-TA-C-AAA-----AATGTGAAATGTAACATTTAC-------AAGTAGTA-------TTTATTCAT-T-TTTTTTTAA--AATATAATAAT--CAAG-----TTTAA-ATTGGAACAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACTCAAATGGTATC--------GTATCGCCCTGATG-ATTTT-ATA--AATGTTCTGGTGACACATGTTAGTACAATACAAACA-ATTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAATGTAACATaatgcgttacaaaaatgtgaaatgtaacatttacaagtagtatttattcatttttttttaaaatataataatcaagtttaaattggaacagatcaaattcctgcaggctttgattcatattaacactcaaatggtatcgtatcgccctgatgattttataaatgttctggtgacacatgttagtacaatacaaacaattttttataactttatataacataaaatacgttacaaaaatgtgaaatgtaacat
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gi|85731                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tacgttacaatcatctgataaaaaaagttatataatcgttccaaaTT-CAA--AA----------AATC--------AT--C---------TTAAAAT--ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATGCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATAAAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATATAAACACATTTTTATAACTTTACATAACATAAAATAC--GT-TA-C-AAA-----AATGTGAAATG-GACGTTTAC-------AAGTAGTA-------TTTATACA----CTTCTTTAA--AATTTAATTAT--CAAC-----TTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTAATTCATA
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Reference ( family-565 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATCTCGTCCT-A-ATGTTTTTATA------TAATGTTC------CGTNGACACATGTTAG--TAC--A--A--TACAAACACAATTTTATAA-----CTTTATATAA-CATAA---AATACGTTACAAAAATGTGT--TA--AA-TAGTAAC-GT-TTACAAGTAGTATTTA--T--T-CAT-TTNTTTT--TA-A-------A-------A--------TATAATC---------AT--CA--------T--TAAA-----AT--ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CG-------TCCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA--T-TTTCTTTAA-AATNTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATCGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A--T--TTTTTT-AAAA-TATAATTA---------------TCA----------AGT-----------TTAA-A-TCG----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACATAATAAGAATGACGATACATATAGGTACACTCGCAAAATATGGAATG----TNTTTTTA----GGAAAATTTTACACAACATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCTAAAGTAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTNTTTAATCCATTCTGTACA-TTTCCGTTGTTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGACTTTTGCAGACGGATGAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACANTGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAACCATCTTCCATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAGATATTAA
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gi|85713                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttctgatataaaacaccactttaagcatatttttttttataaatttgctaatttatacgttatttattatactttacgttatatttttgaagtcatattgatttcggctatttctattcaaaatcattcttagatttgttaataaaATCAGATCAAATTCCTACAGGCTTT----CATAATTACATCT---TTGTTTTTTTCTTAT-GTTTTTTTCTAATG-TATTT-A-TATAATGTT--ATGATCA-ATGTTACTGTCATACAAAAACATTTCT-GTAACTGTATATAAAATAAAATACGTTACCAGAATGTGAAATTTCACATTTAC-------GAATAGAATTTAATCA-A--A--TTTGTT-AAAA-TCCAATCA---------------TCA----------AG-------------TAA-A---G----T-T---G-------------C-------------T---------------------CAT
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Reference ( family-565 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ATCCCTTCCTAGATTTGTTTATAAAGTATTAATGTNACGTAAACAAAT---AATACAT-A-TACAAACACAACTGTATA--CTCATATAA-TNTAA---AATACGTTACAA--AATNTGTTAT-A-G-TAGTAATTTCTTNTAAACAATATTTACGTTACATTCNTCTGATA-AAA--------TATAATC---------AT--------C-----A--------T--TA----AAAT------ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA--T-TTTCTTTAA-AATNTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATCGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A--T--TTTTTT-AAAA-TATAATTA---------------TCA----------AGT-----------TTAA-A-TCG----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACATAATAAGAATGACGATACATATAGGTACACTCGCAAAATATGGAATGTG----TTTTTA----GGAAAATTTTACACAACATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCTAAAGTAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTNTTTAATCCATTCTGTACA-TTTCCGTTGTTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGACTTTTGCAGACGGATGAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACANTGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAACCATCTTCCATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAGATATTAA
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gi|85707                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttctgatataaaataccacattaagcaattattttgtaatcattttgttttttttgttataatgacatttgatgtttctttttagaagtaatattgatttctgatatttctattgaaATACCTTCCTAGATTTGTTTATAAAGTATTAATTTAACATAAACA---------AAAATACATAATA-AAACACA--------ACTGTAT-----CTGATAA--G--TTTAA---A---ATATGATA-----TTATTATTAGTAGTAATTTCTTCTAAACAATATTTATGTTACATTCATCTGATAAAAAC-AG-TTATATAATC--GTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT--ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATGCATATTAACGCCTATATGGTTTCTTTT--CGT-------CCTGATGCTTTT-ATAAAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTGTATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAATTGTAACGTTTACAAGAGGTA-------TTTATTCAAGT-CTTCTTTAA-AATTTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTAAATGGT---------ATCGTCTCGTTCTGATG-TTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACAC-TGTTAGTACAATACAAACA-ATTTGTTATTACTTTATATGACATAAAATATGTTACAAAAATGTGAAACATAACATTTGC-------AAGTAGTATTTATTCATA--T-TTTTTT-AAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTAAATTGA-TCA----TAT---GAACTGTAATTTAAA-------------T---------------------CATA---------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATTACATAATAAGAATAA-GA---ATATTGGTACACTCGCAAAATGTGGAATGTT----TTTTAA----AGAATATTTTACACAAAATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCCAAAGTAAC--AATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTATTTAATCCATTTTGTACA-TTTCCGTTGCTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTTTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGAATTTTGCAGACGGATGATCATTTTAATGCATTTATCAGACAATGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGATATGAA---TTCTATAACAAC-ATGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAATCATCTTCCATGAACCATCCTTGCTCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAATTT-TTTCCAGATTTAACACTAAGATATTAA
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gi|85727                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATCAGATCAAATTCCTGCATGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATAGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAA--TTTTTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATATGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--ATTT-TTTTTT-AAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTAA----A-TCA----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------GAA----CTG-TAATttaaatcata
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gi|85729                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           AACACTTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAAAAATGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTTA--T-TT-CTTTAA-AATATGATTATCAAGTTTAA-ATTGGACCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCAATATGGT---------TTCATCTCGTCCTAATG-CTTTT-ATTT-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACA-TTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAATGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A----TTTTGT-AAAA-TATAATCATCAAGT-----------TTAA----A-TTGATAATAT---GAACTGTAATTTAAA-------------T---------------------CATA---------------------CAAG--CCTGCTGGTGACTTCCATATAACAGAATAAGAATGATGATATATATAGGTATATT
gi|85730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACGTTACAATCATCTGATAAAAAA-AG-TTATATAATC--GTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT--ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGAT-CATATTAACACCTATATGGTTTCTTTT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTTCAAAAATG-TGAAATGTAACGATTACAAGTAGTA-------TTTGTTCA----CTTCTTTAA-AATTTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCATATCAA
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gi|85733                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ATATAATC--GTTCCAAAAAT-ATC----TTAAA-----AT--ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTTTTTCGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTTTGGATACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATATGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACTCTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA----TTTCTTTAA-AATTTAATTATCAAGTTTAA-ATTGCATCATATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTAATATAAAC
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Reference ( family-565 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCCCTTCCTAGATTTGTTTATAAAGTATTAATTTAACATAAACA---------AAAATACATAATA-AAACACA--------ACTGTAT-----CAGATAA-G--T--AA---A---ATATGTTA---ATTTATTATTAGTAGTAATTTCTTCTAAACAATATTTACGTTACATTCATCTGATAAAAA-CAG-TTATATAATCGTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT---ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA--T-TTTCTTTAA-AATNTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATCGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A--T-TTTTTT-AAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTAA----A-TCG----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACATAATAAGAATGACGATACATATAGGTACACTCGCAAAATATGGAATGTG----TTTTTA----GGAAAATTTTACACAACATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCTAAAGTAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTNTTTAATCCATTCTGTACA-TTTCCGTTGTTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGACTTTTGCAGACGGATGAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACANTGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAACCATCTTCCATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAGATATTAA
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gi|85729                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACACTTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAAAAATGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTTA--T-TT-CTTTAA-AATATGATTATCAAGTTTAA-ATTGGACCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCAATATGGT---------TTCATCTCGTCCTAATG-CTTTT-ATTT-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACA-TTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAATGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A----TTTTGT-AAAA-TATAATCATCAAGT-----------TTAA----A-TTGATAATAT---GAACTGTAATTTAAA-------------T---------------------CATA---------------------CAAG--CCTGCTGGTGACTTCCATATAACAGAATAAGAATGATGATATATATAGGTATATT
gi|85730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACGTTACAATCATCTGATAAAAA-AAG-TTATATAATCGTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT---ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGAT-CATATTAACACCTATATGGTTTCTTTT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTTCAAAAATG-TGAAATGTAACGATTACAAGTAGTA-------TTTGTTCA----CTTCTTTAA-AATTTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCATATCAA
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Reference ( family-565 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCCCTTCCTAGATTTGTTTATAAAGTATTAATTTAACATAAACA---------AAAATACATAATA-AAACACA--------ACTGTAT-----CAGATAA-G--T--AA---A---ATATGTTA---ATTTATTATTAGTAGTAATTTCTTCTAAACAATATTTACGTTACATTCATCTGATAAAAA-CAG-TTATATAATCGTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT---ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA--T-TTTCTTTAA-AATNTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATCGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-A-TA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A--T-TTTTTT-AAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTAA----A-TCG----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACATAATAAGAATGACGATACATATAGGTACACTCGCAAAATATGGAATGTG----TTTTTA----GGAAAATTTTACACAACATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCTAAAGTAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTNTTTAATCCATTCTGTACA-TTTCCGTTGTTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGACTTTTGCAGACGGATGAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACANTGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAACCATCTTCCATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAGATATTAA
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gi|85729                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AACACTTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAAAAATGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTTA--T-TT-CTTTAA-AATATGATTATCAAGTTTAA-ATTGGACCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCAATATGGT---------TTCATCTCGTCCTAATG-CTTTT-ATTT-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACA-TTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAATGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A----TTTTGT-AAAA-TATAATCATCAAGT-----------TTAA----A-TTGATAATAT---GAACTGTAATTTAAA-------------T---------------------CATA---------------------CAAG--CCTGCTGGTGACTTCCATATAACAGAATAAGAATGATGATATATATAGGTATATT
gi|85730                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TACGTTACAATCATCTGATAAAAA-AAG-TTATATAATCGTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT---ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGAT-CATATTAACACCTATATGGTTTCTTTT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTTCAAAAATG-TGAAATGTAACGATTACAAGTAGTA-------TTTGTTCA----CTTCTTTAA-AATTTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCATATCAA
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Unaligned ( gi|85714 ): TTCTGATATAAAATACCACATTAAGCAATTATTTTGTATCATTTGTATTTTTACGTTACAATTACATTTGACGTTACTTTTTAG






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Reference ( family-565 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ATCCCTTCCTAGATTTGTTTATAAAGTATTAATTTAACATAAACA---------AAAATACATAATA-AAACACA--------ACTGTAT-----CAGATAA-G--T--AA---A---ATATGTTA---ATTTATTATTAGTAGTAATTTCTTCTAAACAATATTTACGTTACATTCATCTGATAAAAA-CAG-TTATATAATCGTTCCAAAAATCATC----TTAAA-----AT---ATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCTATATGGTTTCTTCT--CGT-------CCTAATGCTTTT-ATATAATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAACACATTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATG-TGAAATGTAACGTTTACAAGTAGTA-------TTTATTCA--T-TTTCTTT-AA-AATNTAATTATCAAGTTTAA-ATTGGATCAGATCAAATTCCTGCAGGCTTTGATTCATATTAACACCCAAATGGT---------ATCGTCTCGCCCTGATG-CTTTT-ATA-AATGTTCTGTGGACACATGTTAGTACAATACAAA--CAANTTTTTATAACTTTATATAACATAAAATACGTTACAAAAATGTGAAACGTAACATTTAC-------AAGTAGTATTTATTC--A--T-TTTTTT-AAAA-TATAATTATCAAGT-----------TTAA----A-TCG----TAT---G-------------A-------------T---------------------CATAT--------------------CAAG--CCTGCTAATGACTTCCATATAACATAATAAGAATGACGATACATATAGGTACACTCGCAAAATATGGAATGTG----TTTTTA----GGAAAATTTTACACAACATAAACTT--CTGTTTCAAGCAATTTTGAACTCTAAAGTAACATAATCTTATACTGTAATAAAACACTATGTGTNTTTAATCCATTCTGTACA-TTTCCGTTGTTACAAGAAGTAGTTGGATAG---TGTACATGTCATCATTACTGCCATTCTC-TCCATCAGAGCTTTCTCTATGTTCCGTATCAAA-----------AC-TCTTACT-------CGACTTTTGCAGACGGATGAGCATTTTAGTGCATTTAACAGACANTGACATGTTGGTAATTTACATTATCTAGCGTACTTGCAGGAGACATGAA---TTCTATAACAAC-CTGTGTAGCAGAATATCACTTCATCCATTTAGCTTCCAACTAACCATCTTCCATGAACCATCCGTGATCTTTTGGACTT-GAATTTCAGTAAAGTTTATTAGGCTTCTACGCCAGATGTCTGATAATTTGCTCGCAATGAGTGGAGATATAATGTGCCTTCACAGGGTGGAA-GT-TTTCCTGATTCAACACCAAGATATTAA
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