lowQualScore : 3 44 11 33333333333333333333333
lowQualScore : 1 1 5 7 4 0 77 22 33333 222 11 22 222 4444444 1 1 33333333333333333333333 4444444 4444444 11 1 333333 1 1 2
lowQualScore : . . . . . . .. .. ..... ... .. .. ... ....... . . ....................... ....... ....... .. . ...... . . .
lowQualScore : 4 8 3 4 0 1 11 00 66666 333 11 00 555 5555555 4 4 33333333333333333333333 5555555 8888888 88 3 888888 3 0 8
consensus : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAGT--G-----TAATTCTACTGCACGGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACGT-------A-------C-------GAC-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
Reference ( gi|114931 ) : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGATCATTAGCATTTATCATGAC--T--G-----TAATTCTACTGCACGGAC---CACAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACAT-------A-------C-------GAC-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114933 : CACATTGCCGAGAAA-TTCATAGAAGGACCC-GAT-ATTAGCATTTATCACAACAGT--G-----TAATTCTACTGCACAGAC---CATAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------AT-C-GACAT-------A-------C-------GAC-------AA-------TTATCACGTGAT--GAAAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAG-GAAATCTATGTCGAT
gi|114934 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATTAGCATTT--CACGATAGT--G-----TACTTCTACTGCACGGAC---CGTAATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------AC-T-GATGT-------A-------T-------GAC-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-TTATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTat
gi|114935 : CGCACTGCCAAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCATGACATT--G-----TAATTCTTCTGAACGGAC---TGTAATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------AT-T-GACGT-------A-------C-------GCC-------AA-------TTATCAGG---T--G-AAAATA------A-ATATTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCAATatat
gi|114928 : CACACTGCCGAACAA-TTCAAAGGAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCATGACAGT--G-----TAATTCTACTACACGGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACAA-------A-------CAACAGATGAC-------AA-------TTATTAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114930 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAGT--G-----TTATTCTACTGCACAGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------AT-T-GACAC-------A-------CAACAGACGAC-------AA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114929 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAGT--G-----TTATTCTACTGCACAGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------AT-T-GACAC-------A-------CAACAGACGAC-------AA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114932 : CACACTGCCGAGCAA-ATCAAAGAAAGACCCGGAT-ATGAGCATTAATCATGACAGT--A-----TAATTCTACTGCACGGAC---CGTAATATGAAAGTGAA--AT---GACA-------AT-TTGACAT-------A-------C-------GACTGACACCAA-------TTGTCAGGTGGT--G-AAAATC------A-TTATTGATGTTGATAC-AAAATCTATGTCAATat
gi|114942 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGATCCAGAT-ATTAGCATT---CACAACAGT--G-----TTATTCTACTGCACGGAC---CATAATATGAAAGCGAA--AA---TACA-------AC-T-GACGT-------A-------C-------GAA-------AA-------TTATCAGGT------------------------TTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATa
gi|114941 : CACACAGTCGAGAAA-TTCAAAGAAGAATCTGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAGT--G-----TAATTCTACTGCACAAAA---C-TTTTATGAAAGCAAA--AG---TACA-------AC-T-GAAGT-------A-------G-------AAT-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AATATA------A-AAATTGATCTGGAGAC-AAAATCTTTGCCGATat
gi|114939 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCAGAT-ATCACCATTTATCACAACAGT--G-----TAATTCTACTGCACAGAA---TGTTATATGAATGCAAA--AG---TACA-------AT-C-GACGT-------AGTACTA-C-------GTC-------AA-------A-ATCCGGTGAT--G-AAAATA------A-ATAATGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTTGATat
gi|114938 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACCAAGAT-ATGAGCATTTATCATAAAAAT--G-----TTATTCTATTGCAAAGAC---CATAATATAAAAGTGAA--AG---TACA-------AT-T-GACAG-------A-------T-------GAC-------AC-------TTGTCTGGTGAT-----AAATA------T-ACATTGATCTTAAGAC-AAAATCTATGTTGATat
gi|114937 : CACACTGCTGAGCAA-TTCAAAGAAGGA-----AT-ATAAGTATTTATCACGACAGT--G-----TAATTCTACTGCATAGAC---CATAATATGAAAGCGAA--AT---TGCA-------AT-T-GACATAATACTGA-------C-------GAC-------AA--------TATCAGGTAAT--G-AAAACA------A-ATGTTTATCTTAAGAC-AAAGTCTATGGCAATat
gi|114943 : CACACTGCCGAGAAAATTAAAAAAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCACGAC------------------AGTGCACGGAC---CGTAATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------AT-T-GATGT-------A-------C-------GAC------------------ATCAGGTAAT--G-AAAATA------A-TTATTGATCATGAAAC-AAAATCTATGTGGATa
gi|114936 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACTTGGAT-ATGGGCATTTATCATGAC--A--GACAGATAATGTTTCTACACAGAC---CGTAATATGAAAGTTGA--AG---TACA-------AT-T-GACAT-------A-------CAAAAGATGAC-------AC-------TTATCAGGTTATTAA-AAAAAA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114940 : CACACCGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGACAGT--G-----TAATTCTACTGCACGGAC---AGTAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACGT-------G-------C-------GAC-------AA-------TTATat
gi|114944 : CACACTG--GATCAA-TTCAAAGAAGGACCC-AATTATTAGTA-CTATCACAACAGT--G-----AAATTCTACTGCACAGAC---CTTTATATGAAAGCAAATGAGGCATATATGAAGGCATAT-GACAG-------A-------T-------GAT-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-TAAATA------A-ATATTGACCCTAAGAC-AAAATCTACATCGAT
gi|114945 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACAACAGT--G-----TAACTCTACTGCACGGAT---CGTAAT------------------TACA-------AT-T-GACAT-------A-------T-------GAC-------AA-------TTAat
gi|114947 : CACGCTGCTGAGAAA-TTCGAAGAAAGGCCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGATAGT--G-----TAATTCTACTGCACGGAC---C-TTATAT------GAA--AG---TACA-------AT-T-GACGT-------G-------C-------GGC-------A
gi|114946 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATCAGTATTTATAATGATAGT--G-----TAATTCTTATGCACAGA----CGTAATTCGAAAGTGAA--AG---TACA-------AT-T-
gi|114948 : CACACTGCCGAGAAA-TTCGATGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTGATCACGACAGT--G-----TATTTGTACTGCACGAACCGTCGCGATATGA
gi|114949 : CACT-CAAAGTAG-TTAAAAAAAAGACCCAGAT-ATGAGCATTTATCACAACAGT--G-----TAATTTTACTGCATGGAT---CGCAATATGAAAGCGAA--AG---TGCA-------GT-T-GACAT-------A-------C-------GAC-------AGACGACACTTTTCAGGTGAT--T-AAAATA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTTGAT
gi|114950 : A-TTCAAAGAAGGACCAGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAGT--G-----TAATTCTACTGCATGGAC---CGTGATATGgt
gi|114951 : AAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAGT--G-----TAATTTTACTATGCGAAT---CGTAATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACATTCGACTGA-------C-------GAC-------AG-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATgtttccaggtgatgaaaatacatgttaatattgatctttagacaaaatctatgtcaatat
gi|114952 : AAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAGT--G-----TAATTTTACTATGCGAAT---CGTAATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------AT-T-GACATTCGACTGA-------C-------GAC-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGGCGATat
gi|114953 : AAAGATCTG---TATGAG-ATTTATCACGAG--T--G-----TAATTCTACTGAATGGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AG---TATA-------AT-T-GACAG-------A-------T-------GAC-------GG-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------G-ATGTCAATATTat
gi|114954 : AGGACCCGGAT-ATCCCCATTTATCACGAC--ACAG-----TAATTTTATTGCACAGAC---CGTAATATGAAAGTGAA--AA---TACA-------AT-T-GATAG-------G-------C-------AAC-------AA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGCCGAT
gi|114955 : GCATTTATCATGACAAT--G-----TAATTCTACTG-ATTGAC---CGTAATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------CT-T-GGAAT-------ACGACAGCC-------GAC-------AA-------TTTTTAGGTGCT--G-AAAA-A------A-ATATCTATTTTCAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114956 : gatatgtTTATCACGACAGT--G-----TATTTCTACTGCACAGAC---CATAATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A--T-GACATAGAACAGA-------T-------GAC-------AA-------GTATCAGGTGAT--G-TAAATA------AGATACTGATCTTGAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114957 : ATTGTACTGCACGGAC---CGTAATAT------GAA--AG---TACA-------AT-T-GACGT-------G-------C-------GAC-------Aat
gi|114958 : ACTGTACAAAC---TGTAATATGAAAGCGAA--AG---TTCA-------AT-T-GACAG-------A-------A-------GAC-------AA-------TTATCAAATGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTAAATCGAGAC-AAAATTTATGTCGAT
gi|114959 : CA-------AT-C-GACAT-------A-------G-------AAC-------AA-------TTATCAGGAGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGTCAATat
gi|114960 : -------A-------C-------GAC-------AA-------TTACCAAGTGAT--A-AAAATG------A-ATATTGATCTTGAAAC-AAAATCTATGTCAATat
gi|114950 : CAGGTGAT--G-AAAATACATGTTA-ATATTGATCTTTAGAC-AAAATCTATGTCAAT
gi|114963 : attcaaagaaggaccaggatatcagcatttatcatgacagtgtaattctactgcatggaccgtgatatggtttcAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114962 : AGCTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114961 : AGGTGAT--G-AAAATC------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAGTCTATGTCGATat
gi|114964 : AGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGA-TTTGAGAC-AAAATCAATGTCGATat
Alignments
lowQualScore : 222222222222222
lowQualScore : 0 1 1 1 222 222 11 222 4444444 1 1 2222 999999999999999 11 8888888 4444444 4444444 11 1 333333 1 0 2
lowQualScore : . . . . ... ... .. ... ....... . . .... ............... .. ....... ....... ....... .. . ...... . . .
lowQualScore : 9 7 4 0 444 333 99 444 3333333 3 3 9999 444444444444444 88 7777777 3333333 6666666 88 3 777777 3 2 7
consensus : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
Reference ( family-564 ) : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114928 : CACACTGCCGAACAA-TTCAAAGGAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTACACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------A-------A--CAACAGATGA-------CAA-------TTATTAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114929 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114930 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114931 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGATCATTAGCATTTATCATGAC-----TGTAATTCTACTGCACGGACCAC---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114932 : CACACTGCCGAGCAA-ATCAAAGAAAGACCCGGAT-ATGAGCATTAATCATGACAG---TATAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AT---GACA-------ATT-TG----ACA------T-------A--C-------GACTGACACCAA-------TTGTCAGGTGGT--G-AAAATC------A-TTATTGATGTTGATAC-AAAATCTATGTCAAT
gi|114933 : CACATTGCCGAGAAA-TTCATAGAAGGACCCG-AT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCACGTGAT--GAAAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAG-GAAATCTATGTCGATa
gi|114934 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATTAGCATTT--CACGATAG---TGTACTTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----ATG------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-TTATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTat
gi|114935 : CGCACTGCCAAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCATGACAT---TGTAATTCTTCTGAACGGACTGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GC-------CAA-------TTATCAGG---T--G-AAAATA------A-ATATTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCAATatat
gi|114936 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACTTGGAT-ATGGGCATTTATCATGACAGACAGATAATGTTTCTACACAGACCGT---AATATGAAAGTTGA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--CAAAAGATGA-------CAC-------TTATCAGGTTATTAA-AAAAAA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114937 : CACACTGCTGAGCAA-TTCAAAGAAGGA-----AT-ATAAGTATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCATAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AT---TGCA-------A-T-TG----ACA------TAATACTGA--C-------GA-------CAA--------TATCAGGTAAT--G-AAAACA------A-ATGTTTATCTTAAGAC-AAAGTCTATGGCAATat
gi|114938 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACCAAGAT-ATGAGCATTTATCATAAAAA---TGTTATTCTATTGCAAAGACCAT---AATATAAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CAC-------TTGTCTGGTGAT-----AAATA------T-ACATTGATCTTAAGAC-AAAATCTATGTTGATa
gi|114939 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCAGAT-ATCACCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGAATGT---TATATGAATGCAAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACGTAGTACT-------A--C-------GT-------CAA--------AATCCGGTGAT--G-AAAATA------A-ATAATGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTTGATat
gi|114940 : CACACCGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACAGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAA-------TTATat
gi|114941 : CACACAGTCGAGAAA-TTCAAAGAAGAATCTGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCACAAAACTT----TTATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----AAG------T-------A--G-------AA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-AATATA------A-AAATTGATCTGGAGAC-AAAATCTTTGCCGAT
gi|114942 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGATCCAGAT-ATTAGCATT---CACAACAG---TGTTATTCTACTGCACGGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AA---TACA-------A-C-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------AAA-------TTATCAGGT------------------------TTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114943 : CACACTGCCGAGAAAATTAAAAAAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCACGACAG---TG-----------CACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ATG------T-------A--C-------GA-------C-----------ATCAGGTAAT--G-AAAATA------A-TTATTGATCATGAAAC-AAAATCTATGTGGATat
gi|114944 : CACACTG--GATCAA-TTCAAAGAAGGACCCAATT-ATTAGTACT-ATCACAACAG---TGAAATTCTACTGCACAGACCTT---TATATGAAAGCAAATGAGGCATATATGAAGGCA-TATG----ACA------G-------A--T-------GA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-TAAATA------A-ATATTGACCCTAAGAC-AAAATCTACATCGATat
gi|114945 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAACTCTACTGCACGGATCGT---AAT------------------TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTAat
gi|114946 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATCAGTATTTATAATGATAG---TGTAATTCTTATGCACAGA-CGT---AATTCGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-T
gi|114947 : CACGCTGCTGAGAAA-TTCGAAGAAAGGCCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGATAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCTT----ATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GG-------CA
gi|114948 : CACACTGCCGAGAAA-TTCGATGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTGATCACGACAG---TGTATTTGTACTGCACGAACCGTCGCGATATGA
gi|114949 : CACT-CAAAGTAG-TTAAAAAAAAGACCCAGAT-ATGAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTTTACTGCATGGATCGC---AATATGAAAGCGAA--AG---TGCA-------G-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAGACGACACTTTTCAGGTGAT--T-AAAATA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTTGAT
gi|114950 : A-TTCAAAGAAGGACCAGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCATGGACCGT---GATATGgt
gi|114950 : CAGGTGAT--G-AAAATACATGTTA-ATATTGATCTTTAGAC-AAAATCTATGTCAATgtttccaggtgatgaaaatacatgttaatattgatctttagacaaaatctatgtcaatat
gi|114951 : attcaaagaaggaccaggatatcagcatttatcatgacagtgtaattctactgcatggaccgtgatatggtttcAAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAG-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114952 : AAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGGCGATat
gi|114953 : AAAGATCTG--T-ATGAG-ATTTATCACGA--G---TGTAATTCTACTGAATGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TATA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CGG-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------G-ATGTCAATATTat
gi|114954 : AGGACCCGGAT-ATCCCCATTTATCACGACAC---AGTAATTTTATTGCACAGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AA---TACA-------A-T-TG----ATA------G-------G--C-------AA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGCCGAT
gi|114955 : GAT-ATGTGCATTTATCATGACAA---TGTAATTCTACTG-ATTGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------C-T-TGGAATACGA-----C-------AGCC-------GA-------CAA-------TTTTTAGGTGCT--G-AAAA-A------A-ATATCTATTTTCAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114956 : TTATCACGACAG---TGTATTTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A---TG----ACA------TAGAACAGA--T-------GA-------CAA-------GTATCAGGTGAT--G-TAAATA------AGATACTGATCTTGAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114957 : ATTGTACTGCACGGACCGT---AATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAat
gi|114958 : ACTGTACAAACTGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TTCA-------A-T-TG----ACA------G-------A--A-------GA-------CAA-------TTATCAAATGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTAAATCGAGAC-AAAATTTATGTCGAT
gi|114959 : CA-------A-T-CG----ACA------T-------A--G-------AA-------CAA-------TTATCAGGAGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGTCAATat
gi|114960 : -------A--C-------GA-------CAA-------TTACCAAGTGAT--A-AAAATG------A-ATATTGATCTTGAAAC-AAAATCTATGTCAATat
gi|114961 : AGGTGAT--G-AAAATC------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAGTCTATGTCGAT
gi|114962 : AGCTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114963 : AGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114964 : AGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGAT-TTGAGAC-AAAATCAATGTCGATat
Alignments
lowQualScore : 222222222222222
lowQualScore : 0 1 1 1 222 222 11 222 4444444 1 1 2222 999999999999999 11 8888888 4444444 4444444 11 1 333333 1 0 2
lowQualScore : . . . . ... ... .. ... ....... . . .... ............... .. ....... ....... ....... .. . ...... . . .
lowQualScore : 9 7 4 0 444 333 99 444 3333333 3 3 9999 444444444444444 88 7777777 3333333 6666666 88 3 777777 3 2 7
consensus : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
Reference ( family-564 ) : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114928 : CACACTGCCGAACAA-TTCAAAGGAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTACACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------A-------A--CAACAGATGA-------CAA-------TTATTAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114929 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114930 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114931 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGATCATTAGCATTTATCATGAC-----TGTAATTCTACTGCACGGACCAC---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114932 : CACACTGCCGAGCAA-ATCAAAGAAAGACCCGGAT-ATGAGCATTAATCATGACAG---TATAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AT---GACA-------ATT-TG----ACA------T-------A--C-------GACTGACACCAA-------TTGTCAGGTGGT--G-AAAATC------A-TTATTGATGTTGATAC-AAAATCTATGTCAAT
gi|114933 : CACATTGCCGAGAAA-TTCATAGAAGGACCCG-AT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCACGTGAT--GAAAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAG-GAAATCTATGTCGATa
gi|114934 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATTAGCATTT--CACGATAG---TGTACTTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----ATG------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-TTATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTat
gi|114935 : CGCACTGCCAAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCATGACAT---TGTAATTCTTCTGAACGGACTGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GC-------CAA-------TTATCAGG---T--G-AAAATA------A-ATATTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCAATatat
gi|114936 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACTTGGAT-ATGGGCATTTATCATGACAGACAGATAATGTTTCTACACAGACCGT---AATATGAAAGTTGA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--CAAAAGATGA-------CAC-------TTATCAGGTTATTAA-AAAAAA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114937 : CACACTGCTGAGCAA-TTCAAAGAAGGA-----AT-ATAAGTATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCATAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AT---TGCA-------A-T-TG----ACA------TAATACTGA--C-------GA-------CAA--------TATCAGGTAAT--G-AAAACA------A-ATGTTTATCTTAAGAC-AAAGTCTATGGCAATat
gi|114938 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACCAAGAT-ATGAGCATTTATCATAAAAA---TGTTATTCTATTGCAAAGACCAT---AATATAAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CAC-------TTGTCTGGTGAT-----AAATA------T-ACATTGATCTTAAGAC-AAAATCTATGTTGATa
gi|114939 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCAGAT-ATCACCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGAATGT---TATATGAATGCAAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACGTAGTACT-------A--C-------GT-------CAA--------AATCCGGTGAT--G-AAAATA------A-ATAATGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTTGATat
gi|114940 : CACACCGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACAGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAA-------TTATat
gi|114941 : CACACAGTCGAGAAA-TTCAAAGAAGAATCTGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCACAAAACTT----TTATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----AAG------T-------A--G-------AA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-AATATA------A-AAATTGATCTGGAGAC-AAAATCTTTGCCGAT
gi|114942 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGATCCAGAT-ATTAGCATT---CACAACAG---TGTTATTCTACTGCACGGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AA---TACA-------A-C-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------AAA-------TTATCAGGT------------------------TTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114943 : CACACTGCCGAGAAAATTAAAAAAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCACGACAG---TG-----------CACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ATG------T-------A--C-------GA-------C-----------ATCAGGTAAT--G-AAAATA------A-TTATTGATCATGAAAC-AAAATCTATGTGGATat
gi|114944 : CACACTG--GATCAA-TTCAAAGAAGGACCCAATT-ATTAGTACT-ATCACAACAG---TGAAATTCTACTGCACAGACCTT---TATATGAAAGCAAATGAGGCATATATGAAGGCA-TATG----ACA------G-------A--T-------GA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-TAAATA------A-ATATTGACCCTAAGAC-AAAATCTACATCGATat
gi|114945 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAACTCTACTGCACGGATCGT---AAT------------------TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTAat
gi|114946 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATCAGTATTTATAATGATAG---TGTAATTCTTATGCACAGA-CGT---AATTCGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-T
gi|114947 : CACGCTGCTGAGAAA-TTCGAAGAAAGGCCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGATAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCTT----ATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GG-------CA
gi|114948 : CACACTGCCGAGAAA-TTCGATGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTGATCACGACAG---TGTATTTGTACTGCACGAACCGTCGCGATATGA
gi|114949 : CACT-CAAAGTAG-TTAAAAAAAAGACCCAGAT-ATGAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTTTACTGCATGGATCGC---AATATGAAAGCGAA--AG---TGCA-------G-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAGACGACACTTTTCAGGTGAT--T-AAAATA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTTGAT
gi|114950 : A-TTCAAAGAAGGACCAGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCATGGACCGT---GATATGgt
gi|114950 : CAGGTGAT--G-AAAATACATGTTA-ATATTGATCTTTAGAC-AAAATCTATGTCAATgtttccaggtgatgaaaatacatgttaatattgatctttagacaaaatctatgtcaatat
gi|114951 : attcaaagaaggaccaggatatcagcatttatcatgacagtgtaattctactgcatggaccgtgatatggtttcAAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAG-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114952 : AAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGGCGATat
gi|114953 : AAAGATCTG--T-ATGAG-ATTTATCACGA--G---TGTAATTCTACTGAATGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TATA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CGG-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------G-ATGTCAATATTat
gi|114954 : AGGACCCGGAT-ATCCCCATTTATCACGACAC---AGTAATTTTATTGCACAGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AA---TACA-------A-T-TG----ATA------G-------G--C-------AA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGCCGAT
gi|114955 : GAT-ATGTGCATTTATCATGACAA---TGTAATTCTACTG-ATTGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------C-T-TGGAATACGA-----C-------AGCC-------GA-------CAA-------TTTTTAGGTGCT--G-AAAA-A------A-ATATCTATTTTCAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114956 : TTATCACGACAG---TGTATTTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A---TG----ACA------TAGAACAGA--T-------GA-------CAA-------GTATCAGGTGAT--G-TAAATA------AGATACTGATCTTGAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114957 : ATTGTACTGCACGGACCGT---AATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAat
gi|114958 : ACTGTACAAACTGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TTCA-------A-T-TG----ACA------G-------A--A-------GA-------CAA-------TTATCAAATGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTAAATCGAGAC-AAAATTTATGTCGAT
gi|114959 : CA-------A-T-CG----ACA------T-------A--G-------AA-------CAA-------TTATCAGGAGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGTCAATat
gi|114960 : -------A--C-------GA-------CAA-------TTACCAAGTGAT--A-AAAATG------A-ATATTGATCTTGAAAC-AAAATCTATGTCAATat
gi|114961 : AGGTGAT--G-AAAATC------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAGTCTATGTCGAT
gi|114962 : AGCTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114963 : AGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114964 : AGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGAT-TTGAGAC-AAAATCAATGTCGATat
blockSeqs : A C C ACA CGC TG GCA TGAAGGC T A GAAT ACACAACAG GC AAAAGAT CTGACAC ACGACAC TA A CATGTT G A
blockSeqs : . . C . . . . . . . . ACACAACAG . . . . . . . . A
blockSeqs : . . T . . . . . . . . ATAATACTG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . ATTCGACTG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . ATTCGACTG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . ATAGAACAG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GTAGTACT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . GAC . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . AT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . GT . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . AG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . AT . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : *******
originalCons : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
finalCons : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
Alignments
lowQualScore : 222222222222222
lowQualScore : 0 1 1 1 222 222 11 222 4444444 1 1 2222 999999999999999 11 8888888 4444444 4444444 11 1 333333 1 0 2
lowQualScore : . . . . ... ... .. ... ....... . . .... ............... .. ....... ....... ....... .. . ...... . . .
lowQualScore : 9 7 4 0 444 333 99 444 3333333 3 3 9999 444444444444444 88 7777777 3333333 6666666 88 3 777777 3 2 7
consensus : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
Reference ( family-564 ) : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATNAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114928 : CACACTGCCGAACAA-TTCAAAGGAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTACACGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------A-------A--CAACAGATGA-------CAA-------TTATTAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGAT
gi|114929 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114930 : CACACTGCCGATCAT-GTCAAAGAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTTATTCTACTGCACAGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AT---TACA-------A-T-TG----ACA------CACAACAGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAAAA-AAAATCTATGTAGATat
gi|114931 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGATCATTAGCATTTATCATGAC-----TGTAATTCTACTGCACGGACCAC---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114932 : CACACTGCCGAGCAA-ATCAAAGAAAGACCCGGAT-ATGAGCATTAATCATGACAG---TATAATTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AT---GACA-------ATT-TG----ACA------T-------A--C-------GACTGACACCAA-------TTGTCAGGTGGT--G-AAAATC------A-TTATTGATGTTGATAC-AAAATCTATGTCAAT
gi|114933 : CACATTGCCGAGAAA-TTCATAGAAGGACCCG-AT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAA-------TTATCACGTGAT--GAAAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAG-GAAATCTATGTCGATa
gi|114934 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATTAGCATTT--CACGATAG---TGTACTTCTACTGCACGGACCGT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----ATG------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-TTATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTat
gi|114935 : CGCACTGCCAAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCATGACAT---TGTAATTCTTCTGAACGGACTGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------A--C-------GC-------CAA-------TTATCAGG---T--G-AAAATA------A-ATATTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCAATatat
gi|114936 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACTTGGAT-ATGGGCATTTATCATGACAGACAGATAATGTTTCTACACAGACCGT---AATATGAAAGTTGA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--CAAAAGATGA-------CAC-------TTATCAGGTTATTAA-AAAAAA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114937 : CACACTGCTGAGCAA-TTCAAAGAAGGA-----AT-ATAAGTATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCATAGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AT---TGCA-------A-T-TG----ACA------TAATACTGA--C-------GA-------CAA--------TATCAGGTAAT--G-AAAACA------A-ATGTTTATCTTAAGAC-AAAGTCTATGGCAATat
gi|114938 : CACACTGCCAAGCAA-TTCAAAGAAGGACCAAGAT-ATGAGCATTTATCATAAAAA---TGTTATTCTATTGCAAAGACCAT---AATATAAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CAC-------TTGTCTGGTGAT-----AAATA------T-ACATTGATCTTAAGAC-AAAATCTATGTTGATa
gi|114939 : CACACTGCTGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCAGAT-ATCACCATTTATCACAACAG---TGTAATTCTACTGCACAGAATGT---TATATGAATGCAAA--AG---TACA-------A-T-CG----ACGTAGTACT-------A--C-------GT-------CAA--------AATCCGGTGAT--G-AAAATA------A-ATAATGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTTGATat
gi|114940 : CACACCGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTCTACTGCACGGACAGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAA-------TTATat
gi|114941 : CACACAGTCGAGAAA-TTCAAAGAAGAATCTGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCACAAAACTT----TTATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A-C-TG----AAG------T-------A--G-------AA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-AATATA------A-AAATTGATCTGGAGAC-AAAATCTTTGCCGAT
gi|114942 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGATCCAGAT-ATTAGCATT---CACAACAG---TGTTATTCTACTGCACGGACCAT---AATATGAAAGCGAA--AA---TACA-------A-C-TG----ACG------T-------A--C-------GA-------AAA-------TTATCAGGT------------------------TTTATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114943 : CACACTGCCGAGAAAATTAAAAAAAGGACCGGGAT-ATCAGCATTTATCACGACAG---TG-----------CACGGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ATG------T-------A--C-------GA-------C-----------ATCAGGTAAT--G-AAAATA------A-TTATTGATCATGAAAC-AAAATCTATGTGGATat
gi|114944 : CACACTG--GATCAA-TTCAAAGAAGGACCCAATT-ATTAGTACT-ATCACAACAG---TGAAATTCTACTGCACAGACCTT---TATATGAAAGCAAATGAGGCATATATGAAGGCA-TATG----ACA------G-------A--T-------GA-------TAA-------TTATCAGGTGAT--G-TAAATA------A-ATATTGACCCTAAGAC-AAAATCTACATCGATat
gi|114945 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTTATCACAACAG---TGTAACTCTACTGCACGGATCGT---AAT------------------TACA-------A-T-TG----ACA------T-------A--T-------GA-------CAA-------TTAat
gi|114946 : CACACTGCCGAGAAA-TTCAAAGAAGGACCTGGAT-ATCAGTATTTATAATGATAG---TGTAATTCTTATGCACAGA-CGT---AATTCGAAAGTGAA--AG---TACA-------A-T-T
gi|114947 : CACGCTGCTGAGAAA-TTCGAAGAAAGGCCCGGAT-ATTAGCATTTATCACGATAG---TGTAATTCTACTGCACGGACCTT----ATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GG-------CA
gi|114948 : CACACTGCCGAGAAA-TTCGATGAAGGACCCGGAT-ATTAGCATTGATCACGACAG---TGTATTTGTACTGCACGAACCGTCGCGATATGA
gi|114949 : CACT-CAAAGTAG-TTAAAAAAAAGACCCAGAT-ATGAGCATTTATCACAACAG---TGTAATTTTACTGCATGGATCGC---AATATGAAAGCGAA--AG---TGCA-------G-T-TG----ACA------T-------A--C-------GA-------CAGACGACACTTTTCAGGTGAT--T-AAAATA------A-AAATTGATCTTGAGAC-AAAATCTATGTTGAT
gi|114950 : A-TTCAAAGAAGGACCAGGAT-ATCAGCATTTATCATGACAG---TGTAATTCTACTGCATGGACCGT---GATATGgt
gi|114950 : CAGGTGAT--G-AAAATACATGTTA-ATATTGATCTTTAGAC-AAAATCTATGTCAATgtttccaggtgatgaaaatacatgttaatattgatctttagacaaaatctatgtcaatat
gi|114951 : attcaaagaaggaccaggatatcagcatttatcatgacagtgtaattctactgcatggaccgtgatatggtttcAAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAG-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114952 : AAAGAAGGACCCGGAT-ATGAGCATTTATCACGACAG---TGTAATTTTACTATGCGAATCGT---AATAAGAA-GCGAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACA------TTCGACTGA--C-------GA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTTATCTTGAGAC-AAAATCTATGGCGATat
gi|114953 : AAAGATCTG--T-ATGAG-ATTTATCACGA--G---TGTAATTCTACTGAATGGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TATA-------A-T-TG----ACA------G-------A--T-------GA-------CGG-------TTATCAGTTGAT--G-AAAATA------G-ATGTCAATATTat
gi|114954 : AGGACCCGGAT-ATCCCCATTTATCACGACAC---AGTAATTTTATTGCACAGACCGT---AATATGAAAGTGAA--AA---TACA-------A-T-TG----ATA------G-------G--C-------AA-------CAA-------TTATCAGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGCCGAT
gi|114955 : GAT-ATGTGCATTTATCATGACAA---TGTAATTCTACTG-ATTGACCGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TACA-------C-T-TGGAATACGA-----C-------AGCC-------GA-------CAA-------TTTTTAGGTGCT--G-AAAA-A------A-ATATCTATTTTCAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114956 : TTATCACGACAG---TGTATTTCTACTGCACAGACCAT---AATATGAAAGCAAA--AG---TACA-------A---TG----ACA------TAGAACAGA--T-------GA-------CAA-------GTATCAGGTGAT--G-TAAATA------AGATACTGATCTTGAGATAAAAATCTATGTCAATat
gi|114957 : ATTGTACTGCACGGACCGT---AATAT------GAA--AG---TACA-------A-T-TG----ACG------T-------G--C-------GA-------CAat
gi|114958 : ACTGTACAAACTGT---AATATGAAAGCGAA--AG---TTCA-------A-T-TG----ACA------G-------A--A-------GA-------CAA-------TTATCAAATGAT--G-AAAATA------A-ATGTTTAAATCGAGAC-AAAATTTATGTCGAT
gi|114959 : CA-------A-T-CG----ACA------T-------A--G-------AA-------CAA-------TTATCAGGAGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATCTTGAGAC--AAATCTATGTCAATat
gi|114960 : -------A--C-------GA-------CAA-------TTACCAAGTGAT--A-AAAATG------A-ATATTGATCTTGAAAC-AAAATCTATGTCAATat
gi|114961 : AGGTGAT--G-AAAATC------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAGTCTATGTCGAT
gi|114962 : AGCTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114963 : AGGTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGATTTTGAGAC-AAAATCTATGTCGATat
gi|114964 : AGTTGAT--G-AAAATA------A-ATATTGAT-TTGAGAC-AAAATCAATGTCGATat