lowQualScore : 1 111111111 11111111111 888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11111 11111 11111111111 111111 11 1111 1
lowQualScore : 2 1 1 1 22 222 7 1 444444 11 000000000 2 55555555555 333 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 11 55 8 11 2222 3 9 0 1 55555 7777 55555 0 11 1 22222 666 444444 33333333333 33333 44 000000 22 3333 555555555 222 777777777777 0 1 22 55 22 22 33 33 3333 2222 0000 1 3 5 22 1 0 6 2 2 3 6
lowQualScore : . . . . .. ... . . ...... .. ......... . ........... ... ........................................................................... .. .. . .. .... . . . . ..... .... ..... . .. . ..... ... ...... ........... ..... .. ...... .. .... ......... ... ............ . . .. .. .. .. .. .. .... .... .... . . . .. . . . . . . .
lowQualScore : 6 7 7 7 33 888 9 5 111111 99 333333333 3 77777777777 777 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 88 55 1 88 8888 4 1 2 3 22222 0000 55555 8 88 3 33333 111 111111 66666666666 44444 99 222222 00 0000 777777777 555 333333333333 1 4 77 77 00 00 44 99 3333 9999 5555 5 1 4 11 3 8 9 1 4 6 1
consensus : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACAG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----ACTTATCAATTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----GACAAGT--TGTCCATT--TANAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAATAT-AGGATAG--A--A--A--CA----TATA-C--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
Reference ( gi|83301 ) : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACTG-------ACACC---TT------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--A----ACTTCTCAATTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----TACAAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAT-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAT-TGGGTAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---AAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGCTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83302 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TTT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACTG-------ACACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--A----ACATTTTAATTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----GACAAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAT-TTGGAAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---AAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTCCAACAAATAA
gi|83303 : ATGTTT-ACGATTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACTG-------ACACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--AACTTACTTCTCAATTGTA-TTAACTT-----T--A-AAATAT----GACAAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATATTAATTCTAATAT-GGGATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-GGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83304 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACTG-------ACACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--A----ACTTCTCAATTGTA-TTAACTT-----T--T-AAATAT----GACAA-----GTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATATT-ATTTTAATAT-AAGATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCACGGTTTTTCAG---CTTATTTCAACAAATAA
gi|83305 : ATGTTT-AAAACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TTCACTG-------ACACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------AA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--T----ACTTCTCAGTTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----GACAACT--TGTCCATT--TAATAA--CACT------CC-----------TT-----AAA-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAA-AGGATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGTATAGTTGGATA-CCATTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83306 : ATGTTT-AAAACTTTAA-C-TAT--TAATG---TTTTCTTTAAT-AAAATTTACATTTA------TTTTGAAA--TACACAG-------ACACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------AA--------------CA---------------GAATCAAAGATT--AAA--AATGCA--A----ACTTCTCAATTGTA-TTAACTTTGAAAT--G-AAATAT----GACAAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAT-AGG--AG--A--A--A--CA----TACA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATACCCCCCAATTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83309 : ATGTTTTAAGACTT-CA-C-TAT--TAATG---TCTACTTTTAT-GAGATTTATATTTA------TTTCAAAA--TACACAG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------TATTCTTCAT--TA--------------CA---------------AAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----AATTATCAATTGTA-TAAACTT-----T--G-AAATAT----GACAAGT--TGTCCA-T--TATAAA--AACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTTATAT-AGAATAG--A--AAGA--CA----T-TACC--TT---GAAA-TGC-ACTTTT-TATGCACTGTCGGATA-CCCCTGG
gi|83310 : ATGTTTTAAGACTA-AA-C-TAT--TGATG---TCTACTTCTAT-GAATTTTATATTTA------TTTCGAAA--TACAGAG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------TATTCTTCAT--TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--ACTACATCA----ACTTATCAATTGTA-TTAACTT-----C--A-AAATAT----GACAAGT--TGTTCATT--TA-AAA--AACT------CC-----------TT-----TAC-C------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAATAT-AGAATAG--A--A--A--AA----CATA-C--TT---GAAA-TGC-ACTTTT-TATGCATCGTTGGATA-C
gi|83311 : ATGTTTGAAGATTT-GA-C-TAT--TAATG---TCTACTGTTAT-GAAATTTATATTTA------TTTCAAAA--TACACAG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------TATTCTTTAT--TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----ACTTATCAATTGTA-TTAACTT-----TTTA-AAATAT--------------GTCCATT--AAAAAAAACACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----C---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTTTAATAT-AGAACAA--A--A--A--TA----TATA-C--TT---GAAA-TGG-ACGATT-AATG
gi|83312 : ATGTTTCAAGACTT-AA-T-TAT--TA--G---TCTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTTCGAAA--TACATTGTACACAGATACC---TG------TTG---AAA--------------A---------------TATTCTTCAT--TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAATCAAC-----A----ACTTATCAATTGTA-TTAACTT-----A--A-AAATAT----GAAAAAG--TGTCCATT--AA-AAA--AACT------CC-----------TT-----TTT-TTATACCAT--A----T---------T---TTTA------------TGGCCACAAT-ATTTTAATGA-AGAATAG--A--A--A--AA----CATA-C--AT---GAAA-TGC-ACTATT-TATGCATCGTTGGATA-
gi|83314 : ATGTTTTAAGAATT-AA-C-TAT--TAATG---TCTTCTTTTAT-GAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACAG-------ATACC---TA------GTG---AAAATATTCTTC-----A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----ACTTATTATTTGTA-TTA
gi|83316 : ATGTTTTAAGACTT-AA-TATAT--CAATG---TCTACTTTAAT-AAAATTTATATTTA------TTTCGAAA---A---------------------T------AT-------------------------------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACAT------------CA--A----ACTTATAAATTATA-TTAACTTGA---T--G-TAATAT----TAC
gi|83307 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--TTGTG---TTTACTTTTAT-AAAACTGGTATTCA------TTTGGAAA--CACACAA-------ATACT---AT------ATG---AAA--------------A---------------A-----------TA--------------TAATTTGCTTCTATACTGAATCAAACATT--AAA--A---CA----------TATAAATTG----TAACTT-----T--C-AAATAT----GAC---T--TGTCcatctaattaccacataattatataagtcatcacatgggtccacaatatcgtcaatactgtccattaaaaaatcactccattactttatttttatggcaacaataatttaatatagaatagaaacatatatttgaaatgcactataaatgcatcatcggatactcccggttgtcaattttat
gi|83308 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTTGGAAA--AACACAA-------ATACT---AT------ATG---AAA--------------AATACAATTCTT----T-----------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCAAACATT--AAA--AA---A--A-------TATAAATTG----TAACTT-----T--C-AAATAT----GACTAGT--CATC
gi|83317 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTTGGAAA--TACACAA-------ATACT---AT------ATG---AAA--------------AATTTAATTTGCTT--C-----------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCAAACATT--AAA--A---CA------------TAAATTG----TAACTT-----T--C-AAATAT----GACTAGT--CATC
gi|83318 : GTCT-AAGACTT-AA-C-TTT--TCATG---TTTCTTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTTGGAAA--TACACTG-------ACAAC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA-------------------------------GAGTCAAAGATT--AAA--AATGCA--A----ACTTCTCAATTCTT-TTAACTC-----T--G-AAATGT----GACTAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----C---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAT-AGGATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83320 : TTT-AAGACTT-AA-T-TAT--TAATG---TCTACTTTCAT-GAATTTTATATTTA------TATCGAAA--TACA--G-------ATACC---TA------AGG---AAAATATTCTTC-----A---------------T-----------TA--------------CT---------------GGATCAAACATT--AAATCAAC-----A----ACTTACCAATTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----GAAAAGT--TGTCCA-T--TAAAAA--AACT------CC-----------TT-----TTT-TATGCC-AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAAT-ATTCAAACA
gi|83321 : TTT-AAGACT--AA-C-TATATTAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTGTATTTACATGTATTTCGTAA--TAAACAG-------ATATC---TA------ATG---AGA--------------A--------------------------------------------A---------------G---------TT--AAC--A---CA--A----ACTTATCAATTGTACTTGA--------T--G-AAATAT----TACAACT--TGTTCATA--AAAAAAT-CACT------CC------------T-----TAC-T------TT--A----T---------T---TTCA------------TGACAACAAT-ATTTAAATAT-AGAATAG--A--A--A--CA----TACA-T--TT-----GA-TGT-GT-ATC-ATCGGATA-------A-CCCCAG--TTGTCA--ATTTTAT
gi|83319 : TTT-AAGGATT-AA-C-TTT--CAATGGTTTTTTCTTTTAT-AAAGTTTAAATTCA------TTTGGAAA--TACATAA-------ATACTAA-TTTAAAAAATA---AAATTTTCTTC------A---------------C-----------TA--------------CA---------------GAATAAAACATTTAAAA--AATG
gi|83322 : TC-AAGAATT-AA-A-TAT--CAGTC---TTTACTTCTAT-GAAATTGATTTTCA------TTTAGAAAAATACACAA-------ATACA---AA------ATG---AAA--------------AATATAAGTTTCTTCAC-----------TA--------------CA---------------GAATTGAACATC--GAA--AATACA--A----AC--ATCAATTG----TAACCT-----T----AAATAT----GACAAAT--TGTCCATTA-CAAAAA--CACT------CC-----------TT-----TA
gi|83324 : ACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AGAATTTATATTTA------TTTGAAAA--TACACTG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATC--AAA--AATCCA--A----ACTTCTCAATTGTA-TTAACTT-----T--T-AAATAT----AACAAGT--TGTCCATT--TATTAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---ATTA------------TGGCAATATT-ATTCTTATAT-AGGATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAT-TGT-AC-ATT-AACGGATAGTTGGATA-----CATTTTCTTGGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83313 : aTT-AAGC-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTTATAAT--TACACAA-------ACAC-----T------A-A---AAA--------------A---------------C-----------TA--------------CA---------------AAATCAAACATT--ACA--AATACA--A----AC---------ATA-TCAATTT-----T--T-AAATAT----GACAAAT--TGTCAATT----TAAA--CACT------CCTTTTGCATATTTT-----TAT-T------AC-------T---------T---TTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAATAT-AGAGTAG--C--A--A--C
gi|83323 : attttaaaaaccacgaTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAACTGATATTCG------TTTGAGAA--TACACAA-------ATACT---AA------ATGC--AAAAAACAAGTTTCTTCA---------------C-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACAAA--AAA--TATACA--A----AC--ATCAATTCCA-T---CTT-----T--T-ATATATGTTATACATGTACTGTCCATTA-CACAAA--AACT------CT-----------TG-----TAA-T------AT--ATTTTT---------T---TTTAATTCATTTTTATTAGCAACACT-TTTCTAATAT-AGAATAG--A--A--A--TC----CAT--T--CTGGAAAAG-TCC-CC-GTT-CATGGATccattctggaagttgtattattcatgaa
gi|83315 : aaaactaa-AG-C-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTTATAAT--TACACAA-------ACAC-----T------A-A---AAA--------------A---------------C-----------TA--------------CA---------------AAATCAAACATT--ACA--AATACA--A----AC---------ATA-TCAATTT-----T--T-AAATAT----GACAAAT--TGTCAATT----TAAA--CACT------CCTTTTGCATATTTT-----TAT-T------AC-------T---------T---TTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAATAT-AGTGTAG--C--A--A--C
gi|83325 : acgttttaaaaaccacgagta-TGT--TAGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTTGGAGA--AACACTA-------ATACTATATT------ATATGTATA--------------A---------------TTTTCTTCTA--TA--------------TA---------------GAATCCATCATT--TAT--GGTACA--A----ACATATGAATTG----TAACTT-----T--T-AAATAT----GACTAGT--CATCccattctggaagttgtattattcatgaa
gi|83326 : AATG---TTTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTTTGAAA--TACACAG-------ATACC---TA------ATG---AAAATATTCTTC-----A---------------T-----------TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAATCAAC-----A----ACTTATCAATTGTA-TTAATTT-----C--G-AAATAT----GAAAAGT--TGTCCA-T--TAAAAA--AACT------CC-----------TT-----AAC-C------AT--A----T---------T---GTTA------------TGACAACAGT-ATTTTAATAT-AGAATA---ATTA--A--CA----TATA-C--TT---GAAA-TGC-ACTATT-TATGCATCATTGGATA-CCTCCGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83327 : CTTTCATTAAAGTGT-TATTCA------TTTGGAAA--TACACAA-------ATACT---TA------ATG---AAA--------------A---------------C-----------TATAAGTTTCTTGCTACA---------------GAATCAAACATA--AAA--AATACA--A----ACATTTCAATTGCA-T---CTT-----T--T-ATATAT----GACAA-C--TGCCCATTACAAAAAA--AACT------CT-----------TT-----TGA-T------AT--A----TTTTAATTCAT---TTTT------------TGGCAACAAA-ATTCTAATACATGTATAG--A--AT-A--CAAACCCATA-C--TT---GCAATTTC-ACTATTCAATG
gi|83328 : TTATCTCTA------TTTGGATG--TTGGCTC-------AGAGC---TG------ATG---GGA--------------A---------------T----------------------------------------------------CATT--AAA--CAT-----------CTTATCAATTGTA-TTAACTT-----T--G-ATATAT----GACAAGT--TGTCCA-T--TAAAAA--AAAT------CC-----------TA-----AAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACACT-ATTTTAATAT-AGAACAG--A--A--A--AA----TATA-TACTT---GAAA-TGC-ACTATT-AATGCATCATTGGATA-CCCCTGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83329 : ATTTA------TTTGGAAA--TACACAG-------ATTCC---TA------ATG---AAA--------------A---------------T-----------GA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATGCA--A----ACTTTTCAATTGTA-TTAACAT-----T--G-AAATAT----GACAAGT--TGTCCATT--TATAAA--CACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTGA------------TGGCAATAAT-ATTCTATTAT-TGGGAAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA--CACCGGTTTCTCATCATCTTATTTCATCAAATAA
gi|83330 : A--TACA--G-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------TATTCTTCAT--TA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----ACTTATCAATTGTA-TAATCTT-----T--G-AAATAT----GACAAAC--TGTCCA-T--TAAAAA--AACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TCTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAATAT-AGAATAGATA--A--A--CA----TATA-C--TT---GAAA-TGC-AC-
gi|83331 : ACACAG-------ATACC---TA------ATG---AAA--------------A---------------TATATTCTTCATTA--------------CA---------------GAATCAAACATT--AAA--AATACA--A----ACTTATCACTTGTA-TTAACTT-----T--G-AAATAT----GACAAA----------------------ACT------CC-----------TT-----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAAT-ATTTCAATAT-AGTATAG--A--A--A--CA----TATG-C--TT----GAA-TGC-AC-TTT-
gi|83332 : CA--A----ACATATAAATTGTA---AATCT-----T----AAATAT----TATTAGT--CATCCATT--AA-AAA--CACTTGAATACA-----------TT-----TCTGT------GT--A----T---------TCATTTTA------------TGGCAGCAAT-ATTCTAA-----AG--AG--A--A--A--CG----CATA-C--TTA--AAAA-TTCAAC-ATT-CATGAAT
gi|83333 : T-----T--GTAAATAT----GAGGAAT--TGTTTATTA-CAAAAA--CACT------CC-----------TTGTATATAT-TTTT---ATTCA----T---------T---TTTA------------TGGTAACAAT-ATTCTAACAT-AGAATAG--A--A--ACCCA----TACA----TG---AAAA-TGCAAC-ATT-CATGAATA
gi|83316 : --TGTCCATT--AAAAAAT-CACT------CC-----------AT-----TAC-T------TT--A----T---------T---TTTA------------TGGCAACAAT-AATTTAATAT-AGAATAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-ACTATA-AATGCATCATCGGATA-CTCCCGG-TTGTCA--ATTTTAT
gi|83334 : atgttttaagacttaatatatcaatgtctactttaataaaatttatatttatttcgaaaatatttacagaatcaaacatcaaacttataaattatattaacttgatgtaatattaccatctaattaccacataattatataagtcatcacatgggtccacaatatcgtcaatacATAAA---A-T------CA-----------TT-----TAC-T------AT--T----T---------T---TTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTAATAT-TGAATAG--A--A--A--CA----TATA-C--TT---GATA-GTC-ACTATT-TATAAACTGACAGATA-CCCTGGGT
gi|83335 : T------CC-----------CT-----T-T-T-------T--A----T---------T---TTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAATAT-TGGGAAG--A--A--A--CA----TATA-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CACCCGGTTTCTCAGGATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83336 : -----TAC-T------AT--A----T---------T---TTTA------------TGTCAGTAAT-ATTCTAATAT-TGGGAAG--A--A--A--CA----TATG-T--TT---GAAA-TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83337 : TTCTA-TGT-AGAATAG--A--A--AAACA----TATA-C--TT---GAAA-TGC-ACTATT-TATGCATCATCGGATA-CCCC
Alignments
lowQualScore : 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111 1
lowQualScore : 2 1 1 1 22 222 0 1 444444 1 11 11 11 4444444 2 1 6666 11 222 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222 222 1 11 55 0 11 222 1 2222 2222 1 1 333333 33333 8888 33333 1 2222 11 11 1 777 2 22 33 444444 66666 333333 222 11 66666666666666666666 777777777777 1 333333 1 1 33 11 11 11 1 1 1 33 3 4 11 1 1 2 3 1 5
lowQualScore : . . . . .. ... . . ...... . .. .. .. ....... . . .... .. ... . .............................................................................. .... ... . .. .. . .. ... . .... .... . . ...... ..... .... ..... . .... .. .. . ... . .. .. ...... ..... ...... ... .. .................... ............ . ...... . . .. .. .. .. . . . .. . . .. . . . . . .
lowQualScore : 0 7 7 6 22 777 5 5 000000 4 99 88 88 2222222 3 3 6666 88 333 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 333 3 88 33 7 88 333 5 7777 7777 4 3 777777 22222 0000 22222 3 7777 99 88 0 555 6 00 11 000000 77777 888888 444 99 00000000000000000000 111111111111 4 888888 3 7 88 99 99 99 4 4 4 33 0 8 77 9 5 0 2 0 0
consensus : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
Reference ( family-563 ) : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TANAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83301 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TT----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-T----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ATT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGTAG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGCTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83302 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TTT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACATT----TTA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TATTTGGA-AG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTCCAACAAATAA
gi|83303 : ATGTTT-ACGATTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTACTTCTCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATTAATTCTAA------TA-TGGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--GGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83304 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACAA------GTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATT-ATTTTAA------TA-TAAGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCACGGTTTTTCAG---CTTATTTCAACAAATAA
gi|83305 : ATGTTT-AAAACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--TC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--T---ACTTC----TCA----GTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-CT--TGTCCATT--TAATA--A-CACT------CCTT-----A------AAT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-AAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGTATAGTTGGATA-CCATTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83306 : ATGTTT-AAAACTTTAA-C-TAT--TAATG---TTTTCTTTAAT-AAAATTTACATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTTTGAAAT--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGG--AG--A--A--A--CATACA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATACCCCCCAATTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83307 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--TTGTG---TTTACTTTTAT-AAAACTGGTATTCA------TTT-GGAAA--C--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------A---------------A--------------TA--------------TAATTTGCTTCTATACTGAATCA----AAC---AT-T--AAA-----ACA---------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----AC----T--TGTC
gi|83308 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--A--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATACAATTCTT----T--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AA---A--A------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83309 : ATGTTTTAAGACTT-CA-C-TAT--TAATG---TCTACTTTTAT-GAGATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---AATTA----TCA----ATTGTA-T------AAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCA-T--TATAA--A-AACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTTA------TA-TAGAATAG--A--AAGA--CAT-TACCTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCACTGTCGGATA-CCCCTGG
gi|83310 : ATGTTTTAAGACTA-AA-C-TAT--TGATG---TCTACTTCTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--A-------GAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--ACTACATCA---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----C--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTTCATT--TAAAA--A--ACT------CCTT-----T------ACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--AACATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCATCGTTGGATA-C
gi|83311 : ATGTTTGAAGATTT-GA-C-TAT--TAATG---TCTACTGTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTTAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----TTTA-A-----AATAT-G---------------TCCATT--AAAAAAAA-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTTTAA------TA-TAGAACAA--A--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGG-ACGATT-AATG
gi|83312 : ATGTTTCAAGACTT-AA-T-TAT--TA--G---TCTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--ATTGTACACAGATACC-TG----T--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----A--A-A-----AATAT-G----AAAA-AG--TGTCCATT---AAAA--A-AACT------CCTT-----TTTTTATACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCCACAAT-ATTTTAA------TG-AAGAATAG--A--A--A--AACATA-CAT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCGTTGGATA-
gi|83313 : TT-AAGC-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGAGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83314 : attttaaaaaccacgaATGTTTTAAGAATT-AA-C-TAT--TAATG---TCTTCTTTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----G--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TTA----TTTGTA-T------TAtgtattattcatgaa
gi|83315 : -AG-C-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGTGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83316 : acgttttaaaaaccacgagtaATGTTTTAAGACTT-AA-TATAT--CAATG---TCTACTTTAAT-AAAATTTATATTTA------TTTCGAAAA--T--ATTTA-------CAGA-ATC-AA----ACAT---C-AAA--------------C---------------T--------------TA--------------TA----------------AATTATATTAACTTGATGT--AAT--ATTACC--ATCTAATTA----CCACATAATTATA-TAAGTCATCACAT-----G--G-GTCCACAATATCG----TCAATAC--TGTCCATT--AAAAA--ATCACT------CCAT-----T------ACT---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-AATTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-ACTATA-AATGCATCATCGGATA-CTCCCGG-TTGTCA--ATTTTATtgtattattcatgaa
gi|83317 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATTTAATTTGCTT--C--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--A--------------CA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83318 : GTCT-AAGACTT-AA-C-TTT--TCATG---TTTCTTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACAAC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA-------------------------------GAGTCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTCTT-T------TAACTC-----T--G-A-----AATGT-G----ACTA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83319 : TTT-AAGGATT-AA-C-TTT--CAATGGTTTTTTCTTTTAT-AAAGTTTAAATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------TAAATA-C-TA----A--TTTAA-AAA--------------A---------------TAAAATTTTCTTCACTA--------------CA---------------GAATAA----AAC---AT-TTAAAA--AAT
gi|83320 : TTT-AAGACTT-AA-T-TAT--TAATG---TCTACTTTCAT-GAATTTTATATTTA------TAT-CGAAA--T--AC--A---------GATACC-TA----A--G---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CT---------------GGATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----CCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTTTTTTAT------GCC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCAAA------CA-g
gi|83321 : TTT-AAGACT--AA-C-TATATTAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTGTATTTACATGTATTT-CGTAA--T--AA--A-------CAGATATC-TA----A--T---G-AGA--------------A-----------------------------------------------A---------------G----------------T-T--AA-----CACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTACT------TGA--------T--G-A-----AATAT-T----ACAA-CT--TGTTCATA--AAAAA--ATCACT------CCTT------------ACT---TT--A----------T---------TTTCA------------TGACAACAAT-ATTTAAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATACA-TTT-G---A--TGT-GT-ATC-A--------TCGGATA-ACCCCAG-TTGTCA--ATTTTAT
gi|83322 : TC-AAGAATT-AA-A-TAT--CAGTC---TTTACTTCTAT-GAAATTGATTTTCA------TTT-AGAAAAAT--AC--A-------CAAATACA-AA----A--T---G-AAA--------------AATATAAGTTTCTTCAC--------------TA--------------CA---------------GAATTG----AAC---AT-C--GAA--AATACA--A---AC--A----TCA----ATTG----------TAACCT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCCATTA-CAAAA--A-CACT------CCTT-----T------A
gi|83323 : TT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAACTGATATTCG------TTT-GAGAA--T--AC--A-------CAAATACT-AA----A--T---GCAAAAAACAAGTTTCTTCA---------------C--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AA-A--AAA--TATACA--A---AC--A----TCA----ATTCCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-GTTATACAT-GTACTGTCCATTA-CACAA--A-AACT------CTTG-----T------AAT---AT--ATTTT------T---------TTTTAATTCATTTTTATTAGCAACACT-TTTCTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--TCCATT-CTG-G-AAAAGTCC-CC-GTT-CATGGAT
gi|83324 : aaaactaaACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AGAATTTATATTTA------TTT-GAAAA--T--AC--A-------CTGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-C--AAA--AATCCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-A----ACAA-GT--TGTCCATT--TATTA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TATTA------------TGGCAATATT-ATTCTTA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAT--TGT-AC-ATT-AACGGATAGTTGGATA-----CATTTTCTTGGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83325 : a-TGT--TAGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAGA--A--AC--A-------CTAATACTATATTATA--T---GTATA--------------A---------------TTTTCTTCTA-----TA--------------TA---------------GAATCC----ATC---AT-T--TAT--GGTACA--A---ACATA----TGA----ATTG----------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83326 : AATG---TTTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAAC-----A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAATTT-----C--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----A------ACC---AT--A----------T---------TGTTA------------TGACAACAGT-ATTTTAA------TA-TAGAATA---ATTA--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATTGGATA-CCTCCGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83327 : CTTTCATTAAAGTGT-TATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATACT-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------C--------------TATAAGTTTCTTGCTACA---------------GAATCA----AAC---AT-A--AAA--AATACA--A---ACATT----TCA----ATTGCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-G----ACAA--C--TGCCCATTACAAAAA--A-AACT------CTTT-----T------GAT---AT--A----------TTTTAATTCATTTTT------------TGGCAACAAA-ATTCTAATACATGTA-TAGAATAC--A--A--A--CCCATA-CTT-G-CAAT-TTC-ACTATTCAATG
gi|83328 : TTATCTCTA------TTT-GGATG--TTGGC--T-------CAGAG--C-TG----A--T---G-GGA--------------A---------------T-----------------------------------------------------------C---AT-T--AAA--CAT----------CTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----TATAT-G----ACAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AAAT------CCTA-----A------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACACT-ATTTTAA------TA-TAGAACAGAAA--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-AATGCATCATTGGATA-CCCCTGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83329 : ATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATTCC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------GA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTT----TCA----ATTGTA-T------TAACAT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTGA------------TGGCAATAAT-ATTCTAT------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA--CACCGGTTTCTCATCATCTTATTTCATCAAATAA
gi|83330 : --AT--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------AATCTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-AC--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTCTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAGATA--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-
gi|83331 : --AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATATTCTTCAT---TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----CTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-A-----------------------ACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTCAA------TA-TAGTATAG--A--A--A--CATATG-CTT-G--AA--TGC-AC-TTT-
gi|83332 : CA--A---ACATA----TAA----ATTGTA---------AATCT-----T----A-----AATAT-T----ATTA-GT--CATCCATT---AAAA--A-CACTTGAATACATT-----T-------CT---GT--G----------TATTCA----TTTTA------------TGGCAGCAAT-ATTCTAA----------AG---AG--A--A--A--CGCATA-CTTAA-AAA--TTCAAC-ATT-CATGAAT
gi|83333 : T-----T--GTA-----AATAT-G----AGGA-AT--TGTTTATTA-CAAAA--A-CACT------CCTTGTATAT------ATTTTTATTCA----------T---------TTTTA------------TGGTAACAAT-ATTCTAA------CA-TAGAATAG--A--A--A--CCCATA-CAT-GAAAA--TGCAAC-ATT-CATGAATA
gi|83334 : T------CATT-----T------ACT---AT--T----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTAA------TA-TTGAATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-ATA--GTC-ACTATT-TATAAACTGACAGATA-CCCTGGGT
gi|83335 : ataaaaT------CCCT-----T--------T---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CACCCGGTTTCTCAGGATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83336 : -----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGTCAGTAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATG-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83337 : TTCTA-------TG-TAGAATAG--A--A--AAACATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATCGGATA-CCCC
Alignments
lowQualScore : 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111 1
lowQualScore : 2 1 1 1 22 222 0 1 444444 1 11 11 11 4444444 2 1 6666 11 222 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222 222 1 11 55 0 11 222 1 2222 2222 1 1 333333 33333 8888 33333 1 2222 11 11 888 1 22 33 444444 66666 333333 222 11 66666666666666666666 777777777777 1 333333 1 1 33 11 11 11 1 1 1 33 3 4 11 1 1 2 3 1 5
lowQualScore : . . . . .. ... . . ...... . .. .. .. ....... . . .... .. ... . .............................................................................. .... ... . .. .. . .. ... . .... .... . . ...... ..... .... ..... . .... .. .. ... . .. .. ...... ..... ...... ... .. .................... ............ . ...... . . .. .. .. .. . . . .. . . .. . . . . . .
lowQualScore : 0 7 7 6 22 777 5 5 000000 4 99 88 88 2222222 3 3 6666 88 333 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 333 3 88 33 7 88 333 5 7777 7777 4 3 777777 22222 0000 22222 3 7777 99 88 444 9 00 66 000000 77777 888888 444 99 00000000000000000000 111111111111 4 888888 3 7 88 99 99 99 4 4 4 33 0 8 77 9 5 0 2 0 0
consensus : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
Reference ( family-563 ) : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83301 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TT----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-T----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ATT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGTAG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGCTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83302 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TTT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACATT----TTA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TATTTGGA-AG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTCCAACAAATAA
gi|83303 : ATGTTT-ACGATTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTACTTCTCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATTAATTCTAA------TA-TGGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--GGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83304 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACAA------GTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATT-ATTTTAA------TA-TAAGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCACGGTTTTTCAG---CTTATTTCAACAAATAA
gi|83305 : ATGTTT-AAAACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--TC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--T---ACTTC----TCA----GTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-CT--TGTCCATT--TAATA--A-CACT------CCTT-----A------AAT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-AAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGTATAGTTGGATA-CCATTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83306 : ATGTTT-AAAACTTTAA-C-TAT--TAATG---TTTTCTTTAAT-AAAATTTACATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTTTGAAAT--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGG--AG--A--A--A--CATACA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATACCCCCCAATTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83307 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--TTGTG---TTTACTTTTAT-AAAACTGGTATTCA------TTT-GGAAA--C--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------A---------------A--------------TA--------------TAATTTGCTTCTATACTGAATCA----AAC---AT-T--AAA-----ACA---------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----AC----T--TGTC
gi|83308 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--A--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATACAATTCTT----T--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AA---A--A------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83309 : ATGTTTTAAGACTT-CA-C-TAT--TAATG---TCTACTTTTAT-GAGATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---AATTA----TCA----ATTGTA-T------AAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATTA-TAAAA-----ACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTTA------TA-TAGAATAG--A--AAGA--CAT-TACCTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCACTGTCGGATA-CCCCTGG
gi|83310 : ATGTTTTAAGACTA-AA-C-TAT--TGATG---TCTACTTCTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--A-------GAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--ACTACATCA---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----C--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTTCATT--TAAAA--A--ACT------CCTT-----T------ACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--AACATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCATCGTTGGATA-C
gi|83311 : ATGTTTGAAGATTT-GA-C-TAT--TAATG---TCTACTGTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTTAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----TTTA-A-----AATAT-G---------------TCCATT--AAAAAAAA-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTTTAA------TA-TAGAACAA--A--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGG-ACGATT-AATG
gi|83312 : ATGTTTCAAGACTT-AA-T-TAT--TA--G---TCTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--ATTGTACACAGATACC-TG----T--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----A--A-A-----AATAT-G----AAAA-AG--TGTCCATT---AAAA--A-AACT------CCTT-----TTTTTATACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCCACAAT-ATTTTAA------TG-AAGAATAG--A--A--A--AACATA-CAT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCGTTGGATA-
gi|83313 : TT-AAGC-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGAGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83314 : attttaaaaaccacgaATGTTTTAAGAATT-AA-C-TAT--TAATG---TCTTCTTTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----G--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TTA----TTTGTA-T------TAtgtattattcatgaa
gi|83315 : -AG-C-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGTGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83316 : acgttttaaaaaccacgagtaATGTTTTAAGACTT-AA-TATAT--CAATG---TCTACTTTAAT-AAAATTTATATTTA------TTTCGAAAA--T--ATTTA-------CAGA-ATC-AA----ACAT---C-AAA--------------C---------------T--------------TA--------------TA----------------AATTATATTAACTTGATGT--AAT--ATTACC--ATCTAATTA----CCACATAATTATA-TAAGTCATCACAT-----G--G-GTCCACAATATCG----TCAATAC--TGTCCATT--AAAAA--ATCACT------CCAT-----T------ACT---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-AATTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-ACTATA-AATGCATCATCGGATA-CTCCCGG-TTGTCA--ATTTTATtgtattattcatgaa
gi|83317 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATTTAATTTGCTT--C--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--A--------------CA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83318 : GTCT-AAGACTT-AA-C-TTT--TCATG---TTTCTTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACAAC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA-------------------------------GAGTCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTCTT-T------TAACTC-----T--G-A-----AATGT-G----ACTA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83319 : TTT-AAGGATT-AA-C-TTT--CAATGGTTTTTTCTTTTAT-AAAGTTTAAATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------TAAATA-C-TA----A--TTTAA-AAA--------------A---------------TAAAATTTTCTTCACTA--------------CA---------------GAATAA----AAC---AT-TTAAAA--AAT
gi|83320 : TTT-AAGACTT-AA-T-TAT--TAATG---TCTACTTTCAT-GAATTTTATATTTA------TAT-CGAAA--T--AC--A---------GATACC-TA----A--G---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CT---------------GGATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----CCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTTTTTTAT------GCC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCAAA------CA-g
gi|83321 : TTT-AAGACT--AA-C-TATATTAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTGTATTTACATGTATTT-CGTAA--T--AA--A-------CAGATATC-TA----A--T---G-AGA--------------A-----------------------------------------------A---------------G----------------T-T--AA-----CACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTACT------TGA--------T--G-A-----AATAT-T----ACAA-CT--TGTTCATA--AAAAA--ATCACT------CCTT------------ACT---TT--A----------T---------TTTCA------------TGACAACAAT-ATTTAAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATACA-TTT-G---A--TGT-GT-ATC-A--------TCGGATA-ACCCCAG-TTGTCA--ATTTTAT
gi|83322 : TC-AAGAATT-AA-A-TAT--CAGTC---TTTACTTCTAT-GAAATTGATTTTCA------TTT-AGAAAAAT--AC--A-------CAAATACA-AA----A--T---G-AAA--------------AATATAAGTTTCTTCAC--------------TA--------------CA---------------GAATTG----AAC---AT-C--GAA--AATACA--A---AC--A----TCA----ATTG----------TAACCT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCCATTA-CAAAA--A-CACT------CCTT-----T------A
gi|83323 : TT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAACTGATATTCG------TTT-GAGAA--T--AC--A-------CAAATACT-AA----A--T---GCAAAAAACAAGTTTCTTCA---------------C--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AA-A--AAA--TATACA--A---AC--A----TCA----ATTCCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-GTTATACAT-GTACTGTCCATTA-CACAA--A-AACT------CTTG-----T------AAT---AT--ATTTT------T---------TTTTAATTCATTTTTATTAGCAACACT-TTTCTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--TCCATT-CTG-G-AAAAGTCC-CC-GTT-CATGGAT
gi|83324 : aaaactaaACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AGAATTTATATTTA------TTT-GAAAA--T--AC--A-------CTGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-C--AAA--AATCCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-A----ACAA-GT--TGTCCATT--TATTA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TATTA------------TGGCAATATT-ATTCTTA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAT--TGT-AC-ATT-AACGGATAGTTGGATA-----CATTTTCTTGGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83325 : a-TGT--TAGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAGA--A--AC--A-------CTAATACTATATTATA--T---GTATA--------------A---------------TTTTCTTCTA-----TA--------------TA---------------GAATCC----ATC---AT-T--TAT--GGTACA--A---ACATA----TGA----ATTG----------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83326 : AATG---TTTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAAC-----A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAATTT-----C--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----A------ACC---AT--A----------T---------TGTTA------------TGACAACAGT-ATTTTAA------TA-TAGAATA---ATTA--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATTGGATA-CCTCCGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83327 : CTTTCATTAAAGTGT-TATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATACT-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------C--------------TATAAGTTTCTTGCTACA---------------GAATCA----AAC---AT-A--AAA--AATACA--A---ACATT----TCA----ATTGCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-G----ACAA--C--TGCCCATTACAAAAA--A-AACT------CTTT-----T------GAT---AT--A----------TTTTAATTCATTTTT------------TGGCAACAAA-ATTCTAATACATGTA-TAGAATAC--A--A--A--CCCATA-CTT-G-CAAT-TTC-ACTATTCAATG
gi|83328 : TTATCTCTA------TTT-GGATG--TTGGC--T-------CAGAG--C-TG----A--T---G-GGA--------------A---------------T-----------------------------------------------------------C---AT-T--AAA--CAT----------CTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----TATAT-G----ACAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AAAT------CCTA-----A------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACACT-ATTTTAA------TA-TAGAACAGAAA--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-AATGCATCATTGGATA-CCCCTGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83329 : ATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATTCC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------GA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTT----TCA----ATTGTA-T------TAACAT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTGA------------TGGCAATAAT-ATTCTAT------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA--CACCGGTTTCTCATCATCTTATTTCATCAAATAA
gi|83330 : --AT--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------AATCTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-AC--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTCTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAGATA--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-
gi|83331 : --AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATATTCTTCAT---TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----CTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-A-----------------------ACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTCAA------TA-TAGTATAG--A--A--A--CATATG-CTT-G--AA--TGC-AC-TTT-
gi|83332 : CA--A---ACATA----TAA----ATTGTA---------AATCT-----T----A-----AATAT-T----ATTA-GT--CATCCATT---AAAA--A-CACTTGAATACATT-----T-------CT---GT--G----------TATTCA----TTTTA------------TGGCAGCAAT-ATTCTAA----------AG---AG--A--A--A--CGCATA-CTTAA-AAA--TTCAAC-ATT-CATGAAT
gi|83333 : T-----T--GTA-----AATAT-G----AGGA-AT--TGTTTATTA-CAAAA--A-CACT------CCTTGTATAT------ATTTTTATTCA----------T---------TTTTA------------TGGTAACAAT-ATTCTAA------CA-TAGAATAG--A--A--A--CCCATA-CAT-GAAAA--TGCAAC-ATT-CATGAATA
gi|83334 : --TAAAA-------T------CATT-----T------ACT---AT--T----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTAA------TA-TTGAATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-ATA--GTC-ACTATT-TATAAACTGACAGATA-CCCTGGGT
gi|83335 : aT------CCCT-----T--------T---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CACCCGGTTTCTCAGGATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83336 : -----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGTCAGTAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATG-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83337 : TTCTA-------TG-TAGAATAG--A--A--AAACATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATCGGATA-CCCC
blockSeqs : T T G A AT GTT T CATGTA C AA TG TT TTGTACA C A TTAT CA TTA C AATTTAATTTGCTTCTACAGTGTATATT TATT TTG G TA TC TC TCT A CTTC CATA T C AAGTCA TGAAA TTA TCCAC C TTAT TA AC ACA T AA TC TGAATA TTTTA TTTTAT TTT TC TTTTTATTACT ATTCATTTTTAT A TACATG T G AA TT AG AA C A A AG A T CA G A C T C C
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . C . T . . T AATACAATTCTTTTACAGTGTATATT . . . . TC . . T . . T . . . GT . . . G . AT T . TC . GTATA . . . TTTTTATTACT . . . . G AT . . . . . . T A T A G A . T C C
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . C . T . . . AATATAATTTGCTTCTATACT . . . . TC . . T . . T . . . G . . . G . AC T . C . . . . . TTTTAATTCA . . . . G . . . . . . . . . G A G A . T T C
blockSeqs : C . . . . . . . . . . . . C . T . . . AATATAAGTTTCTTCACTACA . . . . . . . T . . T . . . A . . . C . AC A . C . . . . . TATTCA . . . . G . . . . . . . . . T A T A . T A C
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATAAAATTTTCTTCACTACA . . . . . . . T . . T . . . T . . . G . AC T . C . . . . . TTTTT . . . . G . . . . . . . . . T A G A . T A C
blockSeqs : T . . . . . . . . . . . . C . . . . . AAACAAGTTTCTTCACTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . T A C T . T G C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ACTATAAGTTTCTTGCTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . T T C C . T A C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATATTCTTCATTACA . . . . . . . T . . T . . . C . . . G . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . T T C C . T G G
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . T . . T . . . C . . . A . T A . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . T A C C . T C C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . A . . T . . . G . . . A . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . T T G A . T G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ATATTCTTTATTACA . . . . . . . T . . T . . . A . . . A . T T . C . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . A G A . T G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . A . . T . . . A . . . G . A A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . A G C . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . T A . A . . . . . C . . . . G . . . . . . . . . . A C C . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . ATATTCTTCATTACT . . . . . . . T . . T . . . C . . . G . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATTTTCTTCTATATA . . . . . . . T . . C . . . G . . . C . A C . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . A G A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . A . T T . C . . . . . C . . . . G . . . . . . . . . . T A T .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATATTCTTCATTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . T A . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . A A A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATTACA . . . . . . . A . . C . . . T . . . G . A A . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . A A A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATTACA . . . . . . . T . . T . . . T . . . G . T A . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . C G C .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATTACA . . . . . . . A . . T . . . T . . . G . T T . C . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . . C G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATAACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . G . T A . A . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . T C
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . ATAACA . . . . . . . T . . T . . . T . . . G . T A . C . . . . . T . . . . T . . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . C . . . . . ACTACA . . . . . . . T . . T . . . G . . . A . T A . C . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . ACTACA . . . . . . . T . . . . . . G . . . A . T A . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . T
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . CTTATA . . . . . . . A . . . . . . G . . . G . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . ATTACA . . . . . . . . . . . . . . G . . . A . . . . . . . . . . T . . . . G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . ATGACA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . ATTA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
finalCons : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
Alignments
lowQualScore : 1 777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11111111111111111111 1
lowQualScore : 2 1 1 1 22 222 0 1 444444 1 11 11 11 4444444 2 1 6666 11 222 2 999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999999 2222 222 1 11 55 0 11 222 1 2222 2222 1 1 333333 33333 8888 33333 1 2222 11 11 888 1 22 33 444444 66666 333333 222 11 66666666666666666666 777777777777 1 333333 1 1 33 11 11 11 1 1 1 33 3 4 11 1 1 2 3 1 5
lowQualScore : . . . . .. ... . . ...... . .. .. .. ....... . . .... .. ... . .............................................................................. .... ... . .. .. . .. ... . .... .... . . ...... ..... .... ..... . .... .. .. ... . .. .. ...... ..... ...... ... .. .................... ............ . ...... . . .. .. .. .. . . . .. . . .. . . . . . .
lowQualScore : 0 7 7 6 22 777 5 5 000000 4 99 88 88 2222222 3 3 6666 88 333 6 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 7777 333 3 88 33 7 88 333 5 7777 7777 4 3 777777 22222 0000 22222 3 7777 99 88 444 9 00 66 000000 77777 888888 444 99 00000000000000000000 111111111111 4 888888 3 7 88 99 99 99 4 4 4 33 0 8 77 9 5 0 2 0 0
consensus : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
Reference ( family-563 ) : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TAAAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTNTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83301 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TT----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-T----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ATT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGTAG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGCTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83302 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TTT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACATT----TTA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TATTTGGA-AG--A--A--A--CATATA-TTT-A-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTCCAACAAATAA
gi|83303 : ATGTTT-ACGATTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTACTTCTCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATTAATTCTAA------TA-TGGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--GGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83304 : ATGTTT-AAGACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACAA------GTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATATT-ATTTTAA------TA-TAAGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CTCACGGTTTTTCAG---CTTATTTCAACAAATAA
gi|83305 : ATGTTT-AAAACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--TC--A-------CTGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--T---ACTTC----TCA----GTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-CT--TGTCCATT--TAATA--A-CACT------CCTT-----A------AAT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-AAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGTATAGTTGGATA-CCATTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83306 : ATGTTT-AAAACTTTAA-C-TAT--TAATG---TTTTCTTTAAT-AAAATTTACATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGACACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------AA--------------CA---------------GAATCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTTTGAAAT--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGG--AG--A--A--A--CATACA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATACCCCCCAATTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83307 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--TTGTG---TTTACTTTTAT-AAAACTGGTATTCA------TTT-GGAAA--C--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------A---------------A--------------TA--------------TAATTTGCTTCTATACTGAATCA----AAC---AT-T--AAA-----ACA---------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----AC----T--TGTC
gi|83308 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--A--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATACAATTCTT----T--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AA---A--A------TA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83309 : ATGTTTTAAGACTT-CA-C-TAT--TAATG---TCTACTTTTAT-GAGATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---AATTA----TCA----ATTGTA-T------AAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATTA-TAAAA-----ACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTTA------TA-TAGAATAG--A--AAGA--CAT-TACCTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCACTGTCGGATA-CCCCTGG
gi|83310 : ATGTTTTAAGACTA-AA-C-TAT--TGATG---TCTACTTCTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--A-------GAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--ACTACATCA---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----C--A-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTTCATT--TAAAA--A--ACT------CCTT-----T------ACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--AACATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTTTT-TATGCATCGTTGGATA-C
gi|83311 : ATGTTTGAAGATTT-GA-C-TAT--TAATG---TCTACTGTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-CAAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTTAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----TTTA-A-----AATAT-G---------------TCCATT--AAAAAAAA-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTTTAA------TA-TAGAACAA--A--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGG-ACGATT-AATG
gi|83312 : ATGTTTCAAGACTT-AA-T-TAT--TA--G---TCTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-CGAAA--T--AC--ATTGTACACAGATACC-TG----T--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----A--A-A-----AATAT-G----AAAA-AG--TGTCCATT---AAAA--A-AACT------CCTT-----TTTTTATACC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCCACAAT-ATTTTAA------TG-AAGAATAG--A--A--A--AACATA-CAT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCGTTGGATA-
gi|83313 : TT-AAGC-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGAGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83314 : attttaaaaaccacgaATGTTTTAAGAATT-AA-C-TAT--TAATG---TCTTCTTTTAT-GAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----G--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TTA----TTTGTA-T------TAtgtattattcatgaa
gi|83315 : -AG-C-TAT--TAATG---TATACTTTTAT-AGAATTTATATTTA------TTT-ATAAT--T--AC--A-------CAAACA-C-TA----A--------AAA--------------A---------------C--------------TA--------------CA---------------AAATCA----AAC---AT-T--ACA--AATACA--A---ACATA----TCA----ATT---------------TT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCAATT--T--AA--A-CACT------CCTT-----T------TGC---AT--ATTTTTATTACT---------TTTTA------------TGGCAACTAT-ATTCTAA------TA-TAGTGTAG--C--A--A--CCCATT-CTG-G-AAG--T
gi|83316 : acgttttaaaaaccacgagtaATGTTTTAAGACTT-AA-TATAT--CAATG---TCTACTTTAAT-AAAATTTATATTTA------TTTCGAAAA--T--ATTTA-------CAGA-ATC-AA----ACAT---C-AAA--------------C---------------T--------------TA--------------TA----------------AATTATATTAACTTGATGT--AAT--ATTACC--ATCTAATTA----CCACATAATTATA-TAAGTCATCACAT-----G--G-GTCCACAATATCG----TCAATAC--TGTCCATT--AAAAA--ATCACT------CCAT-----T------ACT---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-AATTTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-ACTATA-AATGCATCATCGGATA-CTCCCGG-TTGTCA--ATTTTATtgtattattcatgaa
gi|83317 : ATTTTT-AAGAATA-AT-C-TAT--CTGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATA-C-TAT---A--T---G-AAA--------------AATTTAATTTGCTT--C--------------TA--------------CAGTGTATATT------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--A--------------CA----TAA----ATTG----------TAACTT-----T--C-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83318 : GTCT-AAGACTT-AA-C-TTT--TCATG---TTTCTTTTTAT-AAAATTTATATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CTGACAAC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA-------------------------------GAGTCA----AAG---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTC----TCA----ATTCTT-T------TAACTC-----T--G-A-----AATGT-G----ACTA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------C---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCTGGTTTATCAGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83319 : TTT-AAGGATT-AA-C-TTT--CAATGGTTTTTTCTTTTAT-AAAGTTTAAATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------TAAATA-C-TA----A--TTTAA-AAA--------------A---------------TAAAATTTTCTTCACTA--------------CA---------------GAATAA----AAC---AT-TTAAAA--AAT
gi|83320 : TTT-AAGACTT-AA-T-TAT--TAATG---TCTACTTTCAT-GAATTTTATATTTA------TAT-CGAAA--T--AC--A---------GATACC-TA----A--G---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CT---------------GGATCA----AAC---AT-T--AAATCAACA--------ACTTA----CCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTTTTTTAT------GCC---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTCAAA------CA-g
gi|83321 : TTT-AAGACT--AA-C-TATATTAATG---TTTACTTTTAT-AAAATTTGTATTTACATGTATTT-CGTAA--T--AA--A-------CAGATATC-TA----A--T---G-AGA--------------A-----------------------------------------------A---------------G----------------T-T--AA-----CACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTACT------TGA--------T--G-A-----AATAT-T----ACAA-CT--TGTTCATA--AAAAA--ATCACT------CCTT------------ACT---TT--A----------T---------TTTCA------------TGACAACAAT-ATTTAAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--CATACA-TTT-G---A--TGT-GT-ATC-A--------TCGGATA-ACCCCAG-TTGTCA--ATTTTAT
gi|83322 : TC-AAGAATT-AA-A-TAT--CAGTC---TTTACTTCTAT-GAAATTGATTTTCA------TTT-AGAAAAAT--AC--A-------CAAATACA-AA----A--T---G-AAA--------------AATATAAGTTTCTTCAC--------------TA--------------CA---------------GAATTG----AAC---AT-C--GAA--AATACA--A---AC--A----TCA----ATTG----------TAACCT-----T----A-----AATAT-G----ACAA-AT--TGTCCATTA-CAAAA--A-CACT------CCTT-----T------A
gi|83323 : TT-AA-C-TAT--TAATG---TTTACTTTTAT-AAAACTGATATTCG------TTT-GAGAA--T--AC--A-------CAAATACT-AA----A--T---GCAAAAAACAAGTTTCTTCA---------------C--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AA-A--AAA--TATACA--A---AC--A----TCA----ATTCCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-GTTATACAT-GTACTGTCCATTA-CACAA--A-AACT------CTTG-----T------AAT---AT--ATTTT------T---------TTTTAATTCATTTTTATTAGCAACACT-TTTCTAA------TA-TAGAATAG--A--A--A--TCCATT-CTG-G-AAAAGTCC-CC-GTT-CATGGAT
gi|83324 : aaaactaaACTT-AA-C-TAT--TAATG---TTTCCTTTTAA-AGAATTTATATTTA------TTT-GAAAA--T--AC--A-------CTGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-C--AAA--AATCCA--A---ACTTC----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-A----ACAA-GT--TGTCCATT--TATTA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TATTA------------TGGCAATATT-ATTCTTA------TA-TAGGATAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAT--TGT-AC-ATT-AACGGATAGTTGGATA-----CATTTTCTTGGCATCTTATTTCAACAAATA
gi|83325 : a-TGT--TAGTG---TTTACTTTTAT-AAAATTGGTATTCA------TTT-GGAGA--A--AC--A-------CTAATACTATATTATA--T---GTATA--------------A---------------TTTTCTTCTA-----TA--------------TA---------------GAATCC----ATC---AT-T--TAT--GGTACA--A---ACATA----TGA----ATTG----------TAACTT-----T--T-A-----AATAT-G----ACTA-GT--CATC
gi|83326 : AATG---TTTACTTTTAT-GAATTTTATATTTA------TTT-TGAAA--T--AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAAATATTCTTC-----A---------------T--------------TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAATCAAC-----A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------TAATTT-----C--G-A-----AATAT-G----AAAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----A------ACC---AT--A----------T---------TGTTA------------TGACAACAGT-ATTTTAA------TA-TAGAATA---ATTA--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATTGGATA-CCTCCGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83327 : CTTTCATTAAAGTGT-TATTCA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAAATACT-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------C--------------TATAAGTTTCTTGCTACA---------------GAATCA----AAC---AT-A--AAA--AATACA--A---ACATT----TCA----ATTGCA-T---------CTT-----T--T-A-----TATAT-G----ACAA--C--TGCCCATTACAAAAA--A-AACT------CTTT-----T------GAT---AT--A----------TTTTAATTCATTTTT------------TGGCAACAAA-ATTCTAATACATGTA-TAGAATAC--A--A--A--CCCATA-CTT-G-CAAT-TTC-ACTATTCAATG
gi|83328 : TTATCTCTA------TTT-GGATG--TTGGC--T-------CAGAG--C-TG----A--T---G-GGA--------------A---------------T-----------------------------------------------------------C---AT-T--AAA--CAT----------CTTA----TCA----ATTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----TATAT-G----ACAA-GT--TGTCCA-T--TAAAA--A-AAAT------CCTA-----A------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACACT-ATTTTAA------TA-TAGAACAGAAA--A--A--TATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-AATGCATCATTGGATA-CCCCTGG-GTGTCAG--TTTTAT
gi|83329 : ATTTA------TTT-GGAAA--T--AC--A-------CAGATTCC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------T--------------GA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATGCA--A---ACTTT----TCA----ATTGTA-T------TAACAT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-GT--TGTCCATT--TATAA--A-CACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTGA------------TGGCAATAAT-ATTCTAT------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA--CACCGGTTTCTCATCATCTTATTTCATCAAATAA
gi|83330 : --AT--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATTCTTCAT-----TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----ATTGTA-T------AATCTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-AC--TGTCCA-T--TAAAA--A-AACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTCTA------------TGGCAACAAT-ATTTTAA------TA-TAGAATAGATA--A--A--CATATA-CTT-G-AAA--TGC-AC-
gi|83331 : --AC--A-------CAGATACC-TA----A--T---G-AAA--------------A---------------TATATTCTTCAT---TA--------------CA---------------GAATCA----AAC---AT-T--AAA--AATACA--A---ACTTA----TCA----CTTGTA-T------TAACTT-----T--G-A-----AATAT-G----ACAA-A-----------------------ACT------CCTT-----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAACAAT-ATTTCAA------TA-TAGTATAG--A--A--A--CATATG-CTT-G--AA--TGC-AC-TTT-
gi|83332 : CA--A---ACATA----TAA----ATTGTA---------AATCT-----T----A-----AATAT-T----ATTA-GT--CATCCATT---AAAA--A-CACTTGAATACATT-----T-------CT---GT--G----------TATTCA----TTTTA------------TGGCAGCAAT-ATTCTAA----------AG---AG--A--A--A--CGCATA-CTTAA-AAA--TTCAAC-ATT-CATGAAT
gi|83333 : T-----T--GTA-----AATAT-G----AGGA-AT--TGTTTATTA-CAAAA--A-CACT------CCTTGTATAT------ATTTTTATTCA----------T---------TTTTA------------TGGTAACAAT-ATTCTAA------CA-TAGAATAG--A--A--A--CCCATA-CAT-GAAAA--TGCAAC-ATT-CATGAATA
gi|83334 : --TAAAA-------T------CATT-----T------ACT---AT--T----------T---------TTTTA------------TGGCAACAGT-ATTTTAA------TA-TTGAATAG--A--A--A--CATATA-CTT-G-ATA--GTC-ACTATT-TATAAACTGACAGATA-CCCTGGGT
gi|83335 : aT------CCCT-----T--------T---TT--A----------T---------TTTTA------------TGGCAATAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATA-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CACCCGGTTTCTCAGGATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83336 : -----T------ACT---AT--A----------T---------TTTTA------------TGTCAGTAAT-ATTCTAA------TA-TTGGGAAG--A--A--A--CATATG-TTT-G-AAA--TGC-AC-ATT-AATGGATAGTTGGATA-CCCCCGGTTTCTCAGCATCTTATTTCAACAAATAA
gi|83337 : TTCTA-------TG-TAGAATAG--A--A--AAACATATA-CTT-G-AAA--TGC-ACTATT-TATGCATCATCGGATA-CCCC