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lowQualScore                  :      0           9  111     888  0 66   666    5 0   2  111   222 4      2   6   9  2  3  9 55  7       7   00     66  77777 88888888888888888888   999   66 3333  00 999999999  1  8     9999   1111  0000000000000000       4  66666 999 1  333333     444         66  333  8  3  6   7    4  
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Reference ( gi|133436 )       :   TTCTAGACTTTCCCACCC--AACTTC--TGTGTTTAAG---TTAT-T-AATTGA---TAC--AA-GTTTTG-TTGTTCCAGTTGCAATGCGTGCTGCTTCGTGTTG-AATTTTT-TC---T-AACTC---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAGTTATC----CCA---GAT---T---G-TGTTAC-CATATTCTAACAGT-G---G-TCG--G--ATAAA--AGATGTATAT--ATT--GTCTCCAGGGATCTTCTGTC
gi|133437                     :   TTCTAGACTTTCCCACCC--AACTTC--TGTGTTTAAG---TTAT-T-AATTGA---TAC--AA-GTTTTG-TTGTTCCAGTTGCAATGCGTGCTGCTTCGTGTTG-AATTTTT-TC---T-AACTC---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAGTTATC----CCA---GAT---T---G-TGTTA--CATATTCTAACAGT-G---G-TCG--G--ATAAA--AGATGTATAT--ATT--GTCTCCAGGGATCTTCTGTC
gi|133435                     :   TTCTAGACTTTCCCACCC--AACTTC--TGTGTTTAAG---TTAT-T-AACTGA---TAC--AA-GTTTTG-TTGTTCCAGTTGCAATGCGTGCCGCTTCGTGTTG-AATTTTT-TC---T-AACTC---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAATTATC----CCA---GAT---T---G-TGTTAC-CATATTCTAACAGT-G---G-TCG--G--ATAAA--AGATGTATAT--ATT--GTCTCCAGGGATCTTCTGTC
gi|133438                     :   TTCTAGACTTTCCCACCC--AACTTC--TGTTTTTAAG---TTAT-T-AATTGA---TAC--AA-GTTTTG-TTGTTCCAGTTGCAATGCGTGCTGTTTCGTGTTG-AATTTTT-TC---T-AACTC---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAGTTATC----CCA---GAT---T---G-TGTTAC-CATATTCTAACAGT-G---G-TTG--G--ATAAA--AGATGTATAT--ATT--GTCTTCAGGGATCTTCTGTCt
gi|133439                     :   TTCTAGACTTTCCCACCA--AACTTC--TGTGTTTAAG---TTAT-T-AATTGA---TAT--AA-GTTTTG-TCGTTCCAGTTGCAATGCGTGCTGCTTCGTGTTG-ATTTTTT-TC---T-AACTC---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAGTTATC----CCA---GAT---T---G-TGTTAC-CATATTCTAACAGT-G---G-TCG--G--ATAAA--AGATGTATAT--ATA--GTCTCCAAGGATTTTCTGTCt
gi|133441                     :   TTCTAGACATTTCTACCCTTAACTTC--TGTGTTTAAG---TTAT-T-ACTTGA---TAG--AA-GTTTTG-TTGTACCAGTTGCAATGCGTGCTG------GTT---------------------C---G---T------G-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGTGCAGTAATC----CCA---GAT---T---G-TGTTAT-CATATTCTAACAGT-G---G-TCG--G--ATAAA--AGATGTATAG--ATA--GTTTCTAGGAATCTTCTGTCt
gi|133429                     :   TTCAAGACTTTCCCATCC--TACTTC--AGAATTCAGG---TTAT-T-GATAGA---TAT--AA-GTTTTG-TAACTCCAGCTGTGATTCGTGCAGCTTCATTCTG-TATTTTTATC---A-AGTTC---A---T------A-TTT---TTC--A----TA-AT-------TTGTACAATTATC----CCA---AAT---A---A-CATTGG-CATATTCCAATAAA-G---G-TCT--T--ATAAA--TGACATTTAG--ATT--GTTTCTAGTGATTTTCTATCt
gi|133428                     :   TTCAAGACTTTCCCATCC--TACTTC--AGAATTCAGG---TTAT-T-GATAGA---TAT--AA-GTTTTG-TAACTCCAGCTGTTATTCGTGCAGCTTCATTCTG-TATTTTA-TC---A-AGTTC---A---T------A-TTT---TTC--A----TA-AT-------TTGTACAATTATC----CCA---AAT---A---A-CATTGG-CATATTCCAATAAG-G---G-TCT--T--ATAAA--TGAAATGTAG--ATT--GTTTCTAGTGATTTTCTATCt
gi|133432                     :   TTCAAGACTTTCCCATCC--TACTTC--AGAATTCAAG---TTAT-T-AATTAA---TAT--TA-ATTTTG-TAACTCCAGTTGTTATATGTGCAGCTTCGTTCTG-TATTTTA-TC---A-AGTTC---A---T------T-TTT---TTC--A----TA-AG-------TTGTACAATTATC----CCA---AAT---A---A-CATCGG-CATATTCCAATAAA-G---G-TCT--T--ATAAATGAAATGTAAAT--A----GTTTCCAGTGATTTTCTATCt
gi|133434                     :   TTCGAGACTTTCCCGTAC--TACTTC--GGAATTAAGG---TTTT-G-AATAGA---AAT--TA-ATTTTG-TAGTTCCAGTTGTAATACGAGCTGCTTCGTTTTT-AAATTTA-TC---A-AGTTC---G---T------T-TTT---TTC--G----TA-CT-------TAGTACAATTATC----CCA---AAT---G---A-CGTCTG-CATATTCTAATAAG-G---G-TCG--T--ATAAA--TGATTTGTAT--ATA--GTTTCGAGATATTTTCTATCt
gi|133430                     :   TTCAAGACTTTCCCATCC--TACTTC--AGAATTCAGG---TTAT-T-GATAGA---TAT--AA-GTTTTG-TAACTCCAGCTGTTATTCGTGCAGCTTCATACTG-TATTTTA-TC---A-AGTTC---A---T------A-TTT---CTC--A----TA-AT-------TTGTACAATTATC----CCA---AAT---A---A-CATTGG-CATATTCCACTAAG-G---G-TCT--T--ATAAA--TGACATGTTC--ATT--GATTCTAGTGATTTTCTATCt
gi|133431                     :   TTCAAGACTTTTTCATCA--TACTTT--AGAATTCAGG---TTAT-T-GATAGA---TAT--AA-GTTTTG-TAACTCCAGTTGTTATTCGTGCAGCTTCGTTCTG-TATTTTA-TC---A-AGTTC---A---T------ATTTT---TTC--A----TA-AA-------TTGTACAATTATC----CCA---AAT---A---G-CATTGA-CATATTCCAATAAG-G---G-TCT--T--ATAAA--TGACATGTAG--ATT--GTTTTGTGTGATTTTCt
gi|133433                     :   TTCAAGATTTTCCCATCC--TACTTC--AGAATTCAAG---TTAT-T-AATAGA---TAT--TA-ATTTTG-TCACTGTAATTGTTATAAGTGCAGCTTTGTTCTG-TATTTTC-TC-----AAGTT---G---TTTTTTCT-TTT---TTC--A----TA-AT-------TTAAACAATTATC----CCA---AAT---A---A-CGTCGG-TATATATCAATAAA-G---G-TCT--T--ATGAA--TGACATGCAA--ATA--GTTTCGTGTGGTTTTCTATCcagct
gi|133440                     :       AGACT--CCCAACC--TACCTC--AGTGTAGAGG---TCAC-G-AAGAGAGATTAC-------CTTG-TTGTTCCAGTTACTATACGGGCTGTATCATTTTG-GATTTTA-TT---T-AGTTC---A---A------G-TTT---TTG--A----TA-GC-------TCGTGCAGTTATC----CCA---GAT---A---A-CATGAC-CGTACTCAAACAAG-G---G-TCT--T--ATATATGAAATGTAAAT--A----ACTTCTAAAGATTTTt
gi|133443                     : ttcaagAGAGTTTCCCATCC--GCATTC--TATATACAAA---TTTT-C-AATAGA---TAC--TG-ATCTTG-TTAAGCCAGTGGCTATACGTGCAGCTTCATTTTG-TAATTTA-TCGAGTGAATTC---GA--T------G-TT--------------TG-AC-------CAGTGCAATTGTT----CCA---GAA---TAGAG-AG-GA---ATATTCAAGAATT-G---G-TCG--AACATACG--AAATGTAAATTGATT--G-----AGGGATTTTC
gi|133444                     :          aTTTCCCATCC--AGTTTC--TTTATACAAC---ATAT-T-AATGGT---TAC--TA-GTTTAG-TCGCTCCTGTGACAACTCGAGCGGCTTCGATTTG-TATTTTT-TC---T-AGGTC---T---T------T-TGC---TTC--A----GATGC-------T-GTACAATTATC----CCA---TAT---T---A-CATCTG-CATATTCAAGTAAA-G---G-GCG--T--ATGAA--AG
gi|133445                     :           TTTCCCATCC--AGTTTC--CTTATACAAC---ATAT-T-AATGGA---TAC--TA-GTTTAG-TCGCTCCTGTGACAACTCGAGCAGCATCGATTTG-TATTTTT-TT---T-AG------G---T------T-TTTTGCTTCAGA----TG-AT---------GTACAAATATC----CCA---TAT---T---A-CATCTG-CATATTCAAGTAAA-G---G-GCG--T--ATGAA--AGtaaagtaaattgtttgaagtgatt
gi|133447                     :            TTCCCATTT--AGTTTCATTATAT---AG---TTGT-TCGAGAGA---TAC--AA-GCTTGG-TTGTTCCTGTCACTATTCTTGTTGCTTCATTTTG-GATTAAG-TC---T-ACCTC---A---T------T-TTT---CTC--A----TA-TT-------GAGTGCAATTATC----GAA---TAG---T---A-TATCTC-CATATTCTAGAAGG-G---G-TCT--T--ATAAA--TGATGTATAT--ATA--GTTTCTAATGCTATCCTATCtaaagttaaatgtttgaagtgatt
gi|133446                     :            TTCTCATTT--AGTTTC--AGTATATA-G---TTGT-TCGAGAGA---TAC--AA-GCTTGG-TTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCATTTTG-AATTAAG-TC---T-AACAC---A---T------T-TTT---CTC--A----TA-TT-------GAGTGCAATTATC----GAA---TAG---T---A-TATCTC-CATATTCTAGAAGG-G---G-TCT--T--ATAAT--TGATGTATAT--ATA--GTTTCTAATGCTATCCTATC
gi|133450                     :              CCCATCC--ACATTC--TTTATA-AAGATTTTGT-A-AA--GA---AAC--TA-ATCTTG-TTAATCCGGTTACAATTCTTGCTGCTTCATTTTGTAATTTTT-
gi|133454                     :               CCATCC--GATTTC--AGTGTATAAC---TTAT-T-TATAGA---AACTGAACGC---G-TCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTG-TATTTTT-TC---T-AGTTT---G---T------C-TTT---TTC--A----TA-TT-------GGGAACAATTATCAAAAACA----AT---T---GATG-----CATATTCAAAAACT-G---G-TCG--C--AGAAA--TGATATATAT--ATTTGGTTT--AGAGATTTCCcaagtgattcatcaaattgattttggcatctataccaaacaattgatgaatattcaaaaaaggggtctaacatatgataagaaaattttatttaatg
gi|133453                     :               CCATCC--GATTTC--AGTGTATAAC---TTAT-T-TATAGA---AACTGAACGC---G-TCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTG-TATTTTT-TC---T-AGTTT---G---T------C-TTT---TTC--A----TA-TT-------GGGAACAATTATCAAAAACA----AT---T---GATG-----CATATTCAAAAACT-G---G-TCG--C--AGAAA--TGATATATAT--ATTTGGTTT--AGAGATTTCCgat
gi|133452                     :               CCATCC--GATTTC--GGTATACAAT---TTTT-G-AATAGA---CAC--AG-AACGAG-TTAACCCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTG-TACTTTC-TC---C-AATCT---G---T------C-CTT---TTC--G----TA-AT-------GAGTGCAGCCATC----CCAAACAAC---T---GATG-----CATACTCTAG-AGTGG---G-TCT--G--AGAAATGAAATGTATAT---TT--G-GTTGAGTGATTTTCTAgat
gi|133451                     :               CCATCC--GATTTC--GGTATACACT---TTTT-G-AATAGA---CAC--AG-AACGAG-TTAGCCCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTG-TACTTTC-TC---C-AATTT---G---T------C-CTT---TTC--G----TA-AT-------GAGTGCAACCATC----CCA---AACAACT---GATG-----CATACTCTAG-AGT-G---GGTCT--G--AGAAATGAAATGTATAT---TT--G-GTTGAGTGATTTTCTAtt
gi|133442                     :                     --AATTTC--AGTGTACACA---TTGTGT-AAT-GA---TAT--CA-GTTATG-TAGTTCCCAATGCGATTCAAACTGGTTCATTTTG-AATTTTA-T----T-AGGTCCAAG---T------G-TTT-----C--A----TA-GT-------GTGTGCAGTTATC----CAA---AAT---A---A-CATCTG-CGTATTCTAAAATA-G---G-TCT--A--ATAAA--AGTAGTATTT--ATT--ATTTCTAAGGATTTTCtt
gi|133455                     :                    ttcaagcgttttcaagttAAG---TTAT-T-AAGTGA---TAC--CA-GGCTTG-TTGCTCCCGTAACGATTCTGGATGCTTCAATTTG-GATTCGT-TC---G-AGGTC---T---T------C-TTC---TTC--A----GC-TT-------TGGTTATATTATC----CCA---AAC---G---A-CGTCAG-CGTATTC-AAGTGTAG---G-CCT--T--ATGAA--TGATGTGTAA--ATA--GTTTCGAGTGATgatc
gi|133456                     :                                        G---TTAT-C-AATTGA---TAC--CA-GGCTTG-TTGCTCCCGTAATGATTCTAGCTGCTTCGATTTG-GATTTTT-TC---G-AGATC---T---T------C-TTC---TTC--AGCTCTC-GT-------TA-T---ATTATC----CCA---AAC---G---A-CGTCAG-AGTATTC---GAGT-GTATG-TCT--A--ATGAA--AGATGTGTAG--ATA--GTTTCAAGCGA
gi|133457                     :                                        G---TTAT-T-TAGTGA---TAC--CA-GGCTTG-TTGCTCCCGTAATGATTCTAACTGCTTCGATTTG-GATTTTT-TC---G-AGGTC---T---T------C-TTC---TTC--A----GC-TT-------TCGTTATATTATC----CCA---AAC---G---A-CGTCAG-AGTATTCGAGT-GTAG---G-CCT--A--ATGAA--AGATGTGTAG--ATA--GTTTCAAGCGA
gi|133459                     :                                                    ATAGA---AAC--AA-GTTTTG-TTGCTCCCGTTACTATTCTTGCTGCTTCCAACTG-AATCTTT-TC---T-ATTTC---A---T------T-AAC---TTC--A----TA-CA-------AAGTGCAATTATC----CCA---GAC---A---A-TGTTAG-CATATTCTAGAATT-G---G-ACG--T--ATAAA--AGTAGTATAT--ATA--ATCTCAAGCGATTTTCTATC
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gi|133460                     :                                                    ATAGA---AAC--AA-GTTTTG-TTGCTCCCATTACTATTCTTGCTGCTTCCAACTG-AATCTTT-TC---T-ATTTC---A---T------T-AAC---TTC--A----TA-CA-------AAGTGCAATTATC----CCA---GAC---A---A-TGTTAG-CATATTCTAGAATT-G---G-ACG--T--ATAAA--AGTAGTATAT--ATA--ATCTCAAGTGAGTTTCTATCt
gi|133461                     :                                                    ATTGA---AAC--AA-GTTTTG-TTGCACCCATTACTATTCTTGCTGCTTCTACCTG-GATTTTT-TC---G-ATTTC---A---T------T-AGC---TTC--A----TA-ATTATTATGTAGTGCAATTGTC----CCA---TAC---A---A-TGTTTG-CATATTCTAGAATT-G---G-ACG--T--ATGAA--TGCTATATAT--GTA--ATCTCAAGTAATTATCTGTCt
gi|133449                     :                                                       GA---TAC--AA-GCTTGG-TTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCAT-----------------------------------------TTT---CTC--A----TA-TT-------GAGTGCAAATATC------A---AATAG-T---A-TATCTC-CATATTCTAGAAGG-G---G-TCT--T--ATAAA--TGATGTATAT--ATA--GTTTCTAt
gi|133462                     :                      ttccaatttaatttcattatatagtttttcgagaA---TAT--AA-GTTTAG-TTGTTCTCATTGTGAGTCTTGCTGCTTTATTTTT-AATTTTA-TC---A-AGTTCAAGA---T------A-TTT---TTC--A----TA-TT-------AAATACAGTTATT----ACA---GAT---atgctaccctatc
gi|133448                     :                                                                      TTTGATTGCTCCGATGACAATCCTCGCAGCTTCG------GATTTTG-TC---A-AGATA---G---T------G-TT----TTG--A----TA-GT-------CAGTACAATTGTC----CCA---AAT---A---A-TGTCAT-CGTACTCTAATAGG-G---G-TCT--G--ATAAA--GGATATAAAG--ATA--ATTTCAAGAGATGTTCTATCaacatctgtatattc
gi|133463                     :                                          tttccatcctacattttatgaaggtcatggagcgcaactaaGTTACAATGCGGGCGGCTTCATATTG-TAGTTTT-TC---T-AATTT---TATTT------T-TTT---TTC--A----TA-AT-------TAGCACAACCATC----CCA---AAC---A---A-CAGCAG-CATACTCTAAAATT-G---G-ACG--C--ATGCA--AGAAATATAA--ATT--
gi|133465                     :                                                                                             ctGCTGCTTCGTGTTG-TATTTTT-TC---T-AGTTT---G---T------C-TTT---TTC--A----TA-TT-------GGGAACAATTATCAAAAACA----AT---T---GATG-----CATATTCAAAAACT-G---G-TCG--C--AGAAA--TGATATATAT--ATTTGGTTT--AGAGATTTCCtgattaagtgtttttctattt
gi|133464                     :                                                                                                  GCTTCATATTG-TAGATTT-TC---A-AGAAT---A---T------C-CTT---TCC--A----TA-AA-------CTGTACAATTATT----CCA---AAC---T---A-T-TGATGCATATTCTAGTATA-G---G-TCGAAG--ATAAG--AAATGTATAT--gat
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Reference ( family-553 )      : TTCNAGACTTTCCCATCCN--ACTTCNGTATNCAAGTTAT-T-AATAGA---TAC--A-----A-GTTTTGTCGCTCCNGTTGCNATTCGTGCTGCTTCGTTTTGNATTTTT-TCNAG----TTC---G---T------NTTT---TTC--ATANT-------TAGT----GCAATTATCCCA-AAT--N--ACGTCG--GCATATTC-TAANAGNG---GTC--NTATAAANG--A--TGTA---TATA--TNGTT--TCNAGNGATTTTCTATC
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gi|133444                     :        aTTTCCCATCCA--GTTTCTTTATACAACATAT-T-AATGGT---TAC--T-----A-GTTTAGTCGCTCCTGTGACAACTCGAGCGGCTTCGATTTGTATTTTT-TCTAG----GTC---T---T------TTGC---TTC--AGATG-------CTGT----ACAATTATCCCA-TAT--T--ACATCT--GCATATTC-AAGTAAAG---GGC--GTATGAAA-------GTAAAGTAAA--TTGTT--TGAAGTGATT
gi|133445                     :         TTTCCCATCCA--GTTTCCTTATACAACATAT-T-AATGGA---TAC--T-----A-GTTTAGTCGCTCCTGTGACAACTCGAGCAGCATCGATTTGTATTTTT-TTTAG----------G---T------TTTTTGCTTCAGATGAT---------GT----ACAAATATCCCA-TAT--T--ACATCT--GCATATTC-AAGTAAAG---GGC--GTATGAAAGTAA--AGT----TAAA--T-GTT--TGAAGTGATT
gi|133446                     :          TTCTCATTTA--GTTTCAGTATATA-GTTGT-TCGAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCATTTTGAATTAAG-TCTAA----CAC---A---T------TTTT---CTC--ATATT-------GAGT----GCAATTAT--CG-AATAGT--ATATCT--CCATATTC-TAGAAGGG---GTC--TTATAATTG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTATCCTATC
gi|133447                     :          TTCCCATTTA--GTTTCATTATATA-GTTGT-TCGAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGTTGCTTCATTTTGGATTAAG-TCTAC----CTC---A---T------TTTT---CTC--ATATT-------GAGT----GCAATTAT--CG-AATAGT--ATATCT--CCATATTC-TAGAAGGG---GTC--TTATAAATG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTATCCTATC
gi|133448                     :          TTTCCATCCT--ACATTT-TATGAAGGTCAT-G-GAGCGC---AAC--T-----A-ATTTGATTGCTCCGATGACAATCCTCGCAGCTTCG-----GATTTTG-TCAAG----ATA---G---T------GTTT---TG---ATAGT-------CAGT----ACAATTGTCCCA-AAT--A--ATGTCA--TCGTACTC-TAATAGGG---GTC--TGATAAAGG--A--TATA---AAGA--TAATT--TCAAGAGATGTTCTATC
gi|133449                     :          TTCCAATTTA--ATTTCATTATATAGTTTTT-C-GAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCATTTT------------------------------------------CTC--ATATT-------GAGT----GCAAATATC--A-AAT--AGTATATCT--CCATATTC-TAGAAGGG---GTC--TTATAAATG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTACCCTATC
gi|133450                     :            CCCATCCA--CATTCTTTATAAAGATTTTGT-AA-AGA---AAC--T-----A-ATCTTGTTAATCCGGTTACAATTCTTGCTGCTTCATTTTGTAATTTT-TCAAG----T-----G----------ATTC---ATC--A-AAT-------TGATTTTGGCATCTATACCA-AAC--A--A--TTGATGAATATTCAAAAAAGGG---GTC--TAACATATG--A--T
gi|133451                     :             CCATCCG--ATTTCGGTATACACTTTTT-G-AATAGA---CAC--AGAACGA-GTT----AGC-CCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTGTACTTTC-TCCAA----TTT---G---T------CCTT---TTC--GTAAT-------GAGT----GCAACCATCCCA-AAC--A--AC--TGATGCATACTC-TAGAGTGG---GTC--TGAGAAATG--AAATGTA---TATT--TGGTT----GAGTGATTTTCTATaagaaaattttatttaatg
gi|133452                     :             CCATCCG--ATTTCGGTATACAATTTTT-G-AATAGA---CAC--AGAACGA-GTT-----AACCCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTGTACTTTC-TCCAA----TCT---G---T------CCTT---TTC--GTAAT-------GAGT----GCAGCCATCCCA-AAC--A--AC--TGATGCATACTC-TAGAGTGG---GTC--TGAGAAATG--AAATGTA---TATT--TGGTT----GAGTGATTTTCTATtt
gi|133453                     :             CCATCCG--ATTTCAGTGTATAACTTAT-T-TATAGA---AACTGA-----ACGC---GTCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTGTATTTTT-TCTAG----TTT---G---T------CTTT---TTC--ATATT-------GGGA----ACAATTATCAAA-AAC--A--A--TTGATGCATATTC-AAAAACTG---GTC--GCAGAAATG--A--TATA---TATATTTGGTT--T--AGAGATTTCCGATtt
gi|133454                     :             CCATCCG--ATTTCAGTGTATAACTTAT-T-TATAGA---AACTGA-----ACGC---GTCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTGTATTTTT-TCTAG----TTT---G---T------CTTT---TTC--ATATT-------GGGA----ACAATTATCAAA-AAC--A--A--TTGATGCATATTC-AAAAACTG---GTC--GCAGAAATG--A--TATA---TATATTTGGTT--T--AGAGATTTCCGAT
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gi|133456                     :                                    GTTAT-C-AATTGA---TAC--C-----A-GGCTTGTTGCTCCCGTAATGATTCTAGCTGCTTCGATTTGGATTTTT-TCGAG----ATC---T---T------CTTC---TTC--AGCTC-------TCGT----TATATTATCCCA-AAC--G--ACGTCA--GAGTATTC----GAGTGTATGTC--TAATGAAAG--A--TGTG---TAGA--TAGTT--TCAAGCGA
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gi|133460                     :                                             ATAGA---AAC--A-----A-GTTTTGTTGCTCCCATTACTATTCTTGCTGCTTCCAACTGAATCTTT-TCTAT----TTC---A---T------TAAC---TTC--ATACA-------AAGT----GCAATTATCCCA-GAC--A--ATGTTA--GCATATTC-TAGAATTG---GAC--GTATAAAAG--T--AGTA---TATA--TAATC--TCAAGTGAGTTTCTATCt
gi|133461                     :                                             ATTGA---AAC--A-----A-GTTTTGTTGCACCCATTACTATTCTTGCTGCTTCTACCTGGATTTTT-TCGAT----TTC---A---T------TAGC---TTC--ATAATTATTATGTAGT----GCAATTGTCCCA-TAC--A--ATGTTT--GCATATTC-TAGAATTG---GAC--GTATGAATG--C--TATA---TATG--TAATC--TCAAGTAATTATCTGTCt
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Reference ( family-553 )      : TTCNAGACTTTCCCATCCN--ACTTCNGTATNCAAGTTAT-T-AATAGA---TAC--A-----A-GTTTTGTCGCTCCNGTTGCNATTCGTGCTGCTTCGTTTTGNATTTTT-TCNAG----TTC---G---T------NTTT---TTC--ATANT-------TAGT----GCAATTATCCCA-AA-TA--ACGTCG--GCATATTC-TAANANNGGTC--NNATAAANG--A--TGTA---TANA--TNGTT--TCNAGNGATTTTCTATC
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Reference ( family-553 )      : TTCNAGACTTTCCCATCCN--ACTTCNGTATNCAAGTTAT-T-AATAGA---TAC--A-----A-GTTTTGTCGCTCCNGTTGCNATTCGTGCTGCTTCGTTTTGNATTTTT-TCNAG----TTC---G---T------NTTT---TTC--ATANT-------TAGT----GCAATTATCCCA-AA-TA--ACGTCG--GCATATTC-TAGNANNGGTC--NNATAAANG--A--TGTA---TANA--TNGTT--TCNAGNGATTTTCTATC
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gi|133446                     :          TTCTCATTTA--GTTTCAGTATATA-GTTGT-TCGAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCATTTTGAATTAAG-TCTAA----CAC---A---T------TTTT---CTC--ATATT-------GAGT----GCAATTAT--CG-AA-TAGTATATCT--CCATATTC-TAGAAGGGGTC--TTATAATTG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTATCCTATC
gi|133447                     :          TTCCCATTTA--GTTTCATTATATA-GTTGT-TCGAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGTTGCTTCATTTTGGATTAAG-TCTAC----CTC---A---T------TTTT---CTC--ATATT-------GAGT----GCAATTAT--CG-AA-TAGTATATCT--CCATATTC-TAGAAGGGGTC--TTATAAATG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTATCCTATC
gi|133448                     :          TTTCCATCCT--ACATTT-TATGAAGGTCAT-G-GAGCGC---AAC--T-----A-ATTTGATTGCTCCGATGACAATCCTCGCAGCTTCG-----GATTTTG-TCAAG----ATA---G---T------GTTT---TG---ATAGT-------CAGT----ACAATTGTCCCA-AA-TA--ATGTCA--TCGTACTC-TAATAGGGGTC--TGATAAAGG--A--TATA---AAGA--TAATT--TCAAGAGATGTTCTATC
gi|133449                     :          TTCCAATTTA--ATTTCATTATATAGTTTTT-C-GAGAGA---TAC--A-----A-GCTTGGTTGTTCCTGTCACTATTCTTGCAGCTTCATTTT------------------------------------------CTC--ATATT-------GAGT----GCAAATATC--A-AA-TAGTATATCT--CCATATTC-TAGAAGGGGTC--TTATAAATG--A--TGTA---TATA--TAGTT--TCTAATGCTACCCTATC
gi|133450                     :            CCCATCCA--CATTCTTTATAAAGATTTTGT-AA-AGA---AAC--T-----A-ATCTTGTTAATCCGGTTACAATTCTTGCTGCTTCATTTTGTAATTTT-TCAAG----T-----G----------ATTC---ATC--A-AAT-------TGATTTTGGCATCTATACCA-AA-CA--A--TTGATGAATATTCAAAAAAGGGGTC--TAACATATG--A--T
gi|133451                     :             CCATCCG--ATTTCGGTATACACTTTTT-G-AATAGA---CAC--AGAACGA-GTT----AGC-CCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTGTACTTTC-TCCAA----TTT---G---T------CCTT---TTC--GTAAT-------GAGT----GCAACCATCCCA-AA-CA--AC--TGATGCATACTC-TAGAGTGGGTC--TGAGAAATG--AAATGTA---TATT--TGGTT----GAGTGATTTTCTATaagaaaattttatttaatg
gi|133452                     :             CCATCCG--ATTTCGGTATACAATTTTT-G-AATAGA---CAC--AGAACGA-GTT-----AACCCTGTAACAATACGCGCTGCCTCATTTTGTACTTTC-TCCAA----TCT---G---T------CCTT---TTC--GTAAT-------GAGT----GCAGCCATCCCA-AA-CA--AC--TGATGCATACTC-TAGAGTGGGTC--TGAGAAATG--AAATGTA---TATT--TGGTT----GAGTGATTTTCTATtt
gi|133453                     :             CCATCCG--ATTTCAGTGTATAACTTAT-T-TATAGA---AACTGA-----ACGC---GTCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTGTATTTTT-TCTAG----TTT---G---T------CTTT---TTC--ATATT-------GGGA----ACAATTATCAAA-AA-CA--A--TTGATGCATATTC-AAAAACTGGTC--GCAGAAATG--A--TATA---TATATTTGGTT--T--AGAGATTTCCGATtt
gi|133454                     :             CCATCCG--ATTTCAGTGTATAACTTAT-T-TATAGA---AACTGA-----ACGC---GTCAAACCAGTAACCACTCTAGCTGCTTCGTGTTGTATTTTT-TCTAG----TTT---G---T------CTTT---TTC--ATATT-------GGGA----ACAATTATCAAA-AA-CA--A--TTGATGCATATTC-AAAAACTGGTC--GCAGAAATG--A--TATA---TATATTTGGTT--T--AGAGATTTCCGAT
gi|133455                     :                                  AAGTTAT-T-AAGTGA---TAC--C-----A-GGCTTGTTGCTCCCGTAACGATTCTGGATGCTTCAATTTGGATTCGT-TCGAG----GTC---T---T------CTTC---TTC--AGCTT-------TGGT----TATATTATCCCA-AA-CG--ACGTCA--GCGTATTC-AAGTGTAGGCC--TTATGAATG--A--TGTG---TAAA--TAGTT--TCGAGTGAT
gi|133456                     :                                    GTTAT-C-AATTGA---TAC--C-----A-GGCTTGTTGCTCCCGTAATGATTCTAGCTGCTTCGATTTGGATTTTT-TCGAG----ATC---T---T------CTTC---TTC--AGCTC-------TCGT----TATATTATCCCA-AA-CG--ACGTCA--GAGTATTC-GAGTGTATGTC--TAATGAAAG--A--TGTG---TAGA--TAGTT--TCAAGCGA
gi|133457                     :                                    GTTAT-TTAGT-GA---TAC--C-----A-GGCTTGTTGCTCCCGTAATGATTCTAACTGCTTCGATTTGGATTTTT-TCGAG----GTC---T---T------CTTC---TTC--AGCTT-------TCGT----TATATTATCCCA-AA-CG--ACGTCA--GAGTATTC-GAGTGTAGGCC--TAATGAAAG--A--TGTG---TAGA--TAGTT--TCAAGCGA
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gi|133461                     :                                             ATTGA---AAC--A-----A-GTTTTGTTGCACCCATTACTATTCTTGCTGCTTCTACCTGGATTTTT-TCGAT----TTC---A---T------TAGC---TTC--ATAATTATTATGTAGT----GCAATTGTCCCA-TA-CA--ATGTTT--GCATATTC-TAGAATTGGAC--GTATGAATG--C--TATA---TATG--TAATC--TCAAGTAATTATCTGTCt
gi|133462                     :                                                 A---TAT--A-----A-GTTTAGTTGTTCTCATTGTGAGTCTTGCTGCTTTATTTTTAATTTTA-TCAAG----TTCAAGA---T------ATTT---TTC--ATATT-------AAAT----ACAGTTATTACA-GA-TA--ACATCT--GTATATTC-t
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blockSeqs                     :    A              TTA     A    TC G     G C   A  GAT   AGAACG   C       A     A     G    G           T   T     TA  A  TGAA   AAGA    TTTTTCT   TGC   AG   A TATTATGTA  TTTG            G  C  GT CA TGAT        AA  T AA    GAAG     T TA AAT   AAG  G TT T   GA  T  T
blockSeqs                     :    A              T       A    TC G     G C   A  .     AGAACG   C       A     A     T    G           A   T     A   A  .      TATT    AT        .     G    A TT         .               .  .  GT CA TGAT        C   T AG    TT       T .  AAT   .    C TT T   .   T  T
blockSeqs                     :    A              T       A    TC G     . T   A  .     TGA      .       A     A     T    G           T   T     A   A  .      GA      A         .     .    A TT         .               .  .  GT CA TGAT        C   T AG    TT       T .  C     .    G TT T   .   G  T
blockSeqs                     :    A              T       A    TC A     . .   T  .     TGA      .       A     A     T    G           T   T     A   A  .      A       A         .     .    A TT         .               .  .  .  CA TGAT        C   T AA    TT       T .  C     .    A .  A   .   C  T
blockSeqs                     :    A              T       A    TC A     . .   A  .     A        .       C     A     T    G           T   T     C   A  .      A       T         .     .    A TT         .               .  .  .  CG TGAT        C   T AA    TT       T .  C     .    A .  A   .   G  T
blockSeqs                     :    G              T       G    TA G     . .   A  .     A        .       A     A     A    G           T   A     A   A  .      A       T         .     .    C TT         .               .  .  .  CG TGAT        C   T AG    TT       T .  A     .    T .  A   .   G  A
blockSeqs                     :    T              T       T    TT A     . .   T  .     A        .       T     A     A    G           G   A     T   T  .      A       G         .     .    A TA         .               .  .  .  TG TGAT        T   C GT    GT       A .  C     .    T .  T   .   C  G
blockSeqs                     :    T              A       T    TT A     . .   T  .     T        .       T     A     A    G           G   A     T   T  .      G       G         .     .    A TA         .               .  .  .  TG TG          T   C GT    GG       A .  T     .    T .  T   .   C  G
blockSeqs                     :    T              A       T    TT A     . .   T  .     T        .       T     A     A    G           G   A     T   T  .      G       G         .     .    A TA         .               .  .  .  TG TG          T   C GT    GG       A .  T     .    T .  T   .   C  G
blockSeqs                     :    T              A       T    TT A     . .   T  .     T        .       T     A     A    G           G   A     T   T  .      G       G         .     .    A TA         .               .  .  .  TG TG          T   C GT    GG       A .  T     .    T .  T   .   C  G
blockSeqs                     :    T              A       T    TT A     . .   T  .     A        .       C     A     A    G           G   A     T   T  .      G       G         .     .    A TA         .               .  .  .  TG CG          T   C GT    GG       A .  T     .    T .  A   .   C  G
blockSeqs                     :    A              A       A    AG G     . .   A  .     A        .       T     A     T    G           T   G     A   T  .      G       G         .     .    G TA         .               .  .  .  CA CG          T   C AG    GG       T .  T     .    A .  A   .   T  A
blockSeqs                     :    T              T       T    TT A     . .   T  .     A        .       T     A     A    G           T   A     A   A  .      G       G         .     .    A TC         .               .  .  .  TG CT          A   C GT    TT       A .  T     .    G .  A   .   T  G
blockSeqs                     :    A              A       A    AC C     . .   A  .     A        .       A     C     G    A           T   T     A   G  .      G       G         .     .    G TA         .               .  .  .  CA TA          T   A TA    GG       A .  A     .    T .  T   .   T  G
blockSeqs                     :                   G       T    AC A     . .   G  .     A        .       T     A     T    G           T   T     T   T  .      A       G         .     .    A GT         .               .  .  .  AG TA          T   A TT    TA       C .  T     .    A .  T   .   G  G
blockSeqs                     :                   A       T    AC A     . .   G  .     A        .       C     T     A    G           T   T     T   T  .      G       T         .     .    T CA         .               .  .  .  CA TA          A   T AA    GA       A .  A     .    A .  T   .   A  T
blockSeqs                     :                   A       C    AC A     . .   A  .     C        .       C     T     A    G           T   A     G   T  .      A       T         .     .    A CT         .               .  .  .  CA TA          A   T AA    GT       A .  A     .    A .  A   .   A  T
blockSeqs                     :                   A       A    AT G     . .   A  .     T        .       T     T     T    T           T   G     G   T  .      T       T         .     .    T GA         .               .  .  .  TA GA          A   A GG    GT       T .  A     .    T .  A   .   T  T
blockSeqs                     :                   A       A    AT G     . .   C  .     T        .       T     T     T    T           T   G     G   A  .      G       T         .     .    T GA         .               .  .  .  TA TA          T   A GG    TT       T .  T     .    T .  A   .   T  T
blockSeqs                     :                   T       T    GA G     . .   A  .     T        .       T     G     A    T           T   T     T   A  .      A       G         .     .    G CA         .               .  .  .  TG CT          T   T GG    TT       G .  T     .    G .  A   .   A  A
blockSeqs                     :                   A       A    AT C     . .   A  .     A        .       T     T     T    T           T   T     C   C  .      A       A         .     .    T GA         .               .  .  .  TA AG          T   A GG    TG       T .  T     .    T .  G   .   T  T
blockSeqs                     :                   A       T    AA A     . .   A  .     A        .       T     G     A    T           T   T     C   C  .      G       C         .     .    A TG         .               .  .  .  CG CT          T   A GG    TT       T .  T     .    T .  G   .   G  T
blockSeqs                     :                   G       G    AC A     . .   A  .     T        .       A     T     A    G           G   T     T   T  .      G       C         .     .    A GA         .               .  .  .  CG CT          T   A TG    TA       T .  T     .    T .  G   .   G  T
blockSeqs                     :                   G       G    AC A     . .   A  .     A        .       C     T     A    G           G   T     T   T  .      G       C         .     .    A GA         .               .  .  .  CG CT          T   A TG    TG       T .  T     .    T .  G   .   G  A
blockSeqs                     :                   G       A    AT A     . .   A  .     T        .       C     A     C    T           T   G     T   G  .      G       C         .     .    T GG         .               .  .  .  TG CT          A   A CT    TG       T .  T     .    T .  A   .   A  A
blockSeqs                     :                   G       A    AT .     . .   T  .     C        .       T     A     C    T           T   G     T   G  .      G       C         .     .    T GG         .               .  .  .  TG CA          A   A CT    GC       T .  T     .    A .  A   .   A  T
blockSeqs                     :                                   .     . .   T  .     C        .       T     C     G    T           T   G     T   G  .      G       C         .     .    T TG         .               .  .  .  TG CT          A   T TA    GC       T .  T     .    G .  A   .   A  C
blockSeqs                     :                                         . .   A  .     C        .       T     C     G    T           A   A     T   T  .      T       C         .     .    T TC         .               .  .  .  TG CA          G   T TA    TT       A .  T     .    G .  A   .   A  C
blockSeqs                     :                                         . .   A  .     A        .       T     C     G    T           A   A     T   T  .      T       T         .     .    T TC         .               .  .  .  CA CA          G   T TA    TA       A .  A     .    T .  A   .   A  T
blockSeqs                     :                                               A  .     A        .       T     A     T    T           A   A     T   T  .      T       T         .     .    C GA         .               .  .  .  CA CA          T   A TT    TA       A .  A     .    T .  A   .   A  C
blockSeqs                     :                                               T  .     A        .       T     C     T    T           C   G     T   G  .      A       T         .     .    C AA         .               .  .  .  CA TA          T   A TT    GT       A .  A     .    T .  A   .   A  T
blockSeqs                     :                                               .  .     A        .       T     C     T    T           T   A     A   A  .      A       T         .     .    C AA         .               .  .  .  C  TA          T   A TT    GT       A .  T     .    T .  G   .   T  T
blockSeqs                     :                                               .  .     A        .       T     C     T    T           A   T     T   T  .      A       A         .     .    A AA         .               .  .  .  C  TA          T   A TT    GT       T .  A     .    A .  T   .   .  T
blockSeqs                     :                                                  .     .        .       .     C     G    T           A   T     T   A  .      A       T         .     .    T TA         .               .  .  .  .  TT          T   A TT    GT       A .  T     .    T .  .   .   .  A
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gi|133460                     :                                             ATAGA---AAC--A-----A-GTTTTGTTGCTCCCATTACTATTCTTGCTGCTTCCAACTGAATCTTT-TCTAT----TTC---A---T------TAAC---TTC--ATACA-------AAGT----GCAATTATCCCA-GA-CA--ATGTTA--GCATATTC-TAGAATTGGAC--GTATAAAAG--T--AGTA---TATA--TAATC--TCAAGTGAGTTTCTATCt
gi|133461                     :                                             ATTGA---AAC--A-----A-GTTTTGTTGCACCCATTACTATTCTTGCTGCTTCTACCTGGATTTTT-TCGAT----TTC---A---T------TAGC---TTC--ATAATTATTATGTAGT----GCAATTGTCCCA-TA-CA--ATGTTT--GCATATTC-TAGAATTGGAC--GTATGAATG--C--TATA---TATG--TAATC--TCAAGTAATTATCTGTCt
gi|133462                     :                                                 A---TAT--A-----A-GTTTAGTTGTTCTCATTGTGAGTCTTGCTGCTTTATTTTTAATTTTA-TCAAG----TTCAAGA---T------ATTT---TTC--ATATT-------AAAT----ACAGTTATTACA-GA-TA--ACATCT--GTATATTC-t
gi|133463                     :                                                                              CTGTTACAATGCGGGCGGCTTCATATTGTAGTTTT-TCTAA----TTT---TATTT------TTTT---TTC--ATAAT-------TAGC----ACAACCATCCCA-AA-CA--ACAGCA--GCATACTC-TAAAATTGGAC--GCATGCAAG--A--AATA---TAAA--T--TTGATTAAGTGTTTTTCTAT
gi|133464                     :                                                                                      ATTCTTTCGGCTTCATATTGTAGATTT-TCAAG----AAT---A---T------CCTT---TCC--ATAAA-------CTGT----ACAATTATTCCA-AACTA-----TTGATGCATATTC-TAGTATAGGTCGAAGATAAGAA--A--TGTA---TAtt
gi|133465                     :                                                                                            GCTGCTTCGTGTTGTATTTTT-TCTAG----TTT---G---T------CTTT---TTC--ATATT-------GGGA----ACAATTATCAAA-AA-CA--A--TTGATGCATATTC-AAAAACTGGTC--GCAGAAATG--A--TATA---TATATTTGGTT--T--AGAGATTTCCGATtt
gi|133466                     :                                                                                                                                               T---TTCG-ATAAT-------TTGT----ACATTTATCCCA-AA-TA--ACATTG--GCATATTC-CAATAAGGGTC--TTATAAATG--A--CATG---TAGA--TTTTT--TCTAGTGATTTTCTATC