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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19483 ): TCCAGTTAGCTCCGTCTATAGAGTGTCTGACTAGCAATCAGGGGTCGAGAGTTCGAATCCC






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gi|19479                      :    TCC-GTGGCCTAGTGG-TTAAGGCGTCCGCCTCGGAAGCGGGAGGTCGAAGGTT-CGAATCC
gi|19480                      :    TCC-GTGACCTAGTGG-TTAAGGCGTCCGCCTCGGAAGAAGGAGGTCGAAGGTT-CG-AATCCC--GGT-GGA
gi|19481                      :    TCC-GTGGCCTAGTGG-TTAATGCGTCCGCCTCGGAAGCAGGAGGTCAAAGGTT-TGAATCCC
gi|19482                      :    TCT-ATGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATGCGGAAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCC--
gi|19484                      :      C-ATAGCTCAGTGA-CTAGAGCGCCTGTCTAGTCAACATAAGGTAAAGGGTTCCG-A-CCCC--TCT-CGAGACATTTT
gi|19485                      :      C-ATAGCTCAGTGA-CTAGAGCGCCTGTCT
gi|19486                      :      C-ATGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATGCGGAAAGTCGTGGGTT-CG-ATCCCC--TCC-GGagtcaaca
gi|19487                      :      C-ATGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCAAGCGGAAGGTTGTGGGTT-CA-ATCCCC--T
gi|19488                      :      C-GTGGCCTAGTGG--TAGAGCGTCTGCCTCGCATGTGGAAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19489                      :      C-GTGGTCCAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGTATGCGGAAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCC--
gi|19490                      :      C-ATGGTCTAGTGG--TAGAGCATCTGTC-CACGGTCAAAAGGTCATGGGTT-AG-ATCCCC--TCT-GCAG-
gi|19491                      :      C-GTAGTCTAGTGG--TAAAGCGTCCGCCTCGCACACGGAAGGTCATGGGTT-CG-ATCCCC--
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gi|19493                      :      C-ATGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATGCGGAAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCC--
gi|19494                      :      C-GTGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCTGCCTCGTATGCGGAAGGCCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19495                      :           atagAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATACGGAAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCCGTCCT-GG
gi|19496                      :               AGTGG--TAGAGCGTCTGCCTCGCATGCAGAAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCC--
gi|19497                      :               AGTGG--TAGAGCGTCCGTCTCGCATGCGGAAGGTCGAGGGTT-CA-ATCCC
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gi|19499                      :               AGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATGCCGGAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19500                      :                GTGGTCTAGAGCGTCCGCCTCGCATGCGGGAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCCG-TCC-GG


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blockSeqs                     :       A            C                   T           T     .  .                 
blockSeqs                     :       A            C                   A           T     .  .                 
blockSeqs                     :       A            .                   T           T     .  .                 
blockSeqs                     :       G            .                   T           T     .  .                 
blockSeqs                     :       G            .                   G           T     .  .                 
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blockSeqs                     :       G            .                   T           T     .  .                 
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blockSeqs                     :                    .                                                          
blockSeqs                     :                    .                                                          
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blockSeqCons                  : 
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19483 ): TCCAGTTAGCTCCGTCTATAGAGTGTCTGACTAGCAATCAGGGGTCGAGAGTTCGAATCCC






Alignments
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lowQualScore                  :       ..           ..                . .  .        .     .  .      ...  .    .      
lowQualScore                  :       66           11                2 0  2        0     1  3      666  1    7      
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Reference ( family-552 )      : GGCTCC-GTGGCCCAGTGG-CTAGAGCGTCCGCCTCGCANGCGGGAGGTCGNGGGTT-CG-ATCCCC--TCT-GGAG-CCTTTT
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gi|19494                      :      C-GTGGTCTAGTGG--TAGAGCGTCTGCCTCGTATGCGGAAGGCCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19495                      :           atagAGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATACGGAAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCCGTCCT-GG
gi|19496                      :               AGTGG--TAGAGCGTCTGCCTCGCATGCAGAAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCC--
gi|19497                      :               AGTGG--TAGAGCGTCCGTCTCGCATGCGGAAGGTCGAGGGTT-CA-ATCCC
gi|19498                      :               AGTGG--TAGAGCGTCCGCCTTGCATGCAGAAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19499                      :               AGTGG--TAGAGCGTCCGCCTCGCATGCCGGAGGTCGTGGGTT-CG-ATCCCC--
gi|19500                      :                GTGGTCTAGAGCGTCCGCCTCGCATGCGGGAGGTCGTGGGTT-CA-ATCCCCG-TCC-GG
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|19483 ): TCCAGTTAGCTCCGTCTATAGAGTGTCTGACTAGCAATCAGGGGTCGAGAGTTCGAATCCC