lowQualScore : 77777777777777777777777777777777777777777777777777777777 11 1 11111 1111111111 11111111111111111 1111 111111111 11111111 1 1111 222222222222 1111111111 4444444444444444444444444444444444444444444 11111111111111111111 11 11111111111 3333333333333 111111111 333333333333333333333333333333333 1111111111 2222 1111 111
lowQualScore : 5 77 55555555555555555555555555555555555555555555555555555555 1 1 9999 11 2 0 1 1 888 2 7777 0 1 44 8888 2 66666 8888888 99999 9999999999 6 22 1 1 33 5555 1 1 11111111111111111 0000 44 88 666666666 1 444444 5 1 55 2222 1 555 77 66 1 0 2 1 1 1 1 888 1 11 44444444 11 2 4 3 2 6 4 2 1 4 2222 1 5555 2 1 1 222222222222 1 0000000000 1 11 0 6666 222 1 7777 1 1 666666 1 2222222222222222222222222222222222222222222 2 444444 333 88888888888888888888 1 222 3 11 444 111 88 1 2 1 222 8888 5 1 11 4 11 11 33333333333 11 333333 1111111111111 2 44 33333 999999999 33 444 33 2 111111111 666666 444 33 666666666666666666666666666666666 4 1 2 4444444444 77 2 7777 1 22 66666666666 1111 22 888 111 1 2
lowQualScore : . .. ........................................................ . . .... .. . . . . ... . .... . . .. .... . ..... ....... ..... .......... . .. . . .. .... . . ................. .... .. .. ......... . ...... . . .. .... . ... .. .. . . . . . . . ... . .. ........ .. . . . . . . . . . .... . .... . . . ............ . .......... . .. . .... ... . .... . . ...... . ........................................... . ...... ... .................... . ... . .. ... ... .. . . . ... .... . . .. . .. .. ........... .. ...... ............. . .. ..... ......... .. ... .. . ......... ...... ... .. ................................. . . . .......... .. . .... . .. ........... .... .. ... ... . .
lowQualScore : 0 00 22222222222222222222222222222222222222222222222222222222 9 2 2222 88 9 0 9 1 888 1 4444 1 9 88 1111 0 99999 1111111 77777 0000000000 3 33 4 4 44 5555 4 4 22222222222222222 8888 55 44 444444444 3 222222 8 2 00 7777 3 000 55 88 2 6 5 2 2 2 6 444 2 77 66666666 77 1 5 8 5 4 0 4 3 0 4444 3 9999 7 0 3 777777777777 3 8888888888 2 77 2 1111 111 2 7777 2 2 111111 2 5555555555555555555555555555555555555555555 2 999999 333 44444444444444444444 1 000 2 55 222 999 44 1 3 2 111 9999 1 2 44 4 33 77 00000000000 77 555555 2222222222222 5 77 11111 111111111 00 444 00 5 555555555 444444 999 33 999999999999999999999999999999999 1 0 9 7777777777 22 9 2222 4 00 55555555555 6666 00 333 666 5 3
consensus : ATTACCGTTAATGAAATT-----N-TANN---T--GCAGTTAA-TCAT-GGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTN---GGTANT-GATTGTTT-ATTAAATGAATATTTTAT--CGA-A----AGTATCG--ATAT--TNTAG-C-NC--C-----ACAT-T---TGTGC--------GATA--TTT-TT-AA--TGN--TAT-TT-T--N--A---ACTC--G-GG-N--T-GTTT-TCCTGA-NAA---N-T-GG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TAT-NCC-GTTAC-ACA-A-A-A-AAGGT--G-A--TAA--G---AA--CGATGTNAAT-AATTATAGAGGCA-TAAC--A-T-TAN---TA-AGT-TGTCTTTCNA-----A-A----NTN---TT-T--ACCA-C-CAT---T-TTA---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--A-A--C-N--T---TTTG-TG-A--CAA--AN-AC----GATA-GC---A---T---T-T-----C-----T--G-ACG---CACAGT--TTGGATTTAGG---AA---AGGN-A-G-A-T---C---NACNG-TT-GATGCNAT-GTT--T----G--T-T-T--T------A----ATNTC----TATTG-T--ACAA-----A----A--N-T--A---T--T-TAAAC---G----ATA------A--NAA--A-C------GT---CT---TTA---C--GT----GCT-TTTGTNGA---T----C-T-NAAGA-AGCGT-TT-CG--A--T--AG----TAT---NT--A-TAGAAACGCATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( gi|12526 ) : ATCACCGTTGCTGAAATT-----T-TACT---T--GC--------CAC-GAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT---GGTATT-GATTGTTT-ATTAAATGAATATTTTAT--CGA-A----AGTATCG--ATAT--TATAG-C-AC--C-----ATAT-T---TGTGC--------GACA--TTT-TT-AA--TGC--TAT-TT-T--A--A---ACTC--G-GG-G--T-GTTT-CCCTGA-GCA---G-T-GG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TAT-CCC-GTTAC-ACA-A-A-A-AGGGT--G-A--TAA--G---AA--TAATGTTAGT-AATTATCGTGGCA-TAAC--A-T-TAT---TA-AGT-TGTCTTTCTC-----A-A----CTG---TT-T--ACCA-C-CAT---T-TTG---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--A-A--T-T--T---TTTG-TG-G--CAA--AC-AC----GACA-GC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAAT--TTGGATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAG-TG-GATGCCAT-GTT--T----G--C-T-T--T------A----ATTTC----TATTG-T--ACAA-----A----A--T-T--A---T--T-TAAAC---A----ATA------A--TAA--A-C------GT---CT---TTA---C--GT-A--GCT-TTTATTGA---C----C-T-GAAGA-AGTGT-TT-TG--A--C--AG----TAT---AT--A-CAGAAACGCTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATT-----T-TACT---T--GC--------CAC-GAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTATT---GGTATT-GATTGTTT-ATTAAATGAATATTTTAT--TGA-A----AGTATCG--ATAT--TATAA-C-AC--C-----ATAT-T---TGTGC--------GACA--TTT-TT-AA--TGC--TTT-TT-T--A--A---ACTC--G-GG-G--T-AATT-CCCTGA-GCA---G-T-GG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TAT-CCC-GTTAC-ACA-A-A-A-AGGGT--G-A--TAA--G---AA--TAATGTTAGT-AATTATCGTGGCA-TAAC--A-T-TAT---TA-AGT-TGTCTTTCTA-----A-A----CTG---TT-T--ACTA-C-CAT---T-TTG---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--A-T--T-T--T---TTTG-TG-A--CAA--AC-AC----GACA-GC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAAT--TTGGATTTAGG---GA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAG-TG-GATGCCAT-GTT--T----G--C-T-T--T------A----ATTTC----TATT--T-----A-----A----A--T-T--A---T--T-TAAAC---A----ATA------A--TAA--A-C------GT---CT---TTA---C--GT-A--GCT-TTTATTGA---C----C-T-GAAGA-AGTGT-TT-TA--A--C--AG----TAT---AA--A-CAGAAACGCTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATT-----T-TACT---T--GC--------CAA-GAAAAAGTT------AAAATCTAGCATATCTTTT---GGTATT-GACTGTTC-ATTAAATGAATATTTTAT--CGA-A----AGTATCG--ATAT--TATAG-C-AC--C-----ATAT-T---TGTGC--------GACA--TTT-TT-AA--TGC--TAT-AT-T--A--A---ATTC--A-GG-G--T-ACTT-CGCTGA-GCA---G-T-GG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TAT-CCC-GTTAC-ACA-A-A-G-AGGTT--G-A--CAA--G---AA--TTATGTTAGT-AATTATCGTGGCA-TTAC--A-T-TAT---TA-AGT-TGTCTTTCTC-----A-A----CTG---TT-T--ACCA-C-CAT---T-TTA---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--T-T--T-T--T---TTGG-TG-A--CAA--AC-AC----GACA-GC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAAT--TTGGATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---AACAG-CG-GATGCCAT-GTT--T----G--C-T-T--T------A----ATTTC----TATTG-T--ACAA-----A----C--T-T--A---T--T-TAAAC---A----ATA------A--CAA--A-C------GT---CT---TTA---C--GA-A--GCT-TTAATTAA---C----C-T-GAAGA-AGTGT-TT-TG--A--T--AGTATATAT---AT--A-CAGAAACGCTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAAT---------ACTGAGC--GC--------TA--GTAAATGTTT-----GAAAGCTGGAAAATCGATT---GGGAGC-GATTTCTT-ATTAAATGAGTATTTTGT--TGA-A----AGTATTG--ATAT--TTTAGGC-TC--C------CAT-T---TATGT--------GATA--TTT-TT-AA--TGC--TAT-TT-T--G--A---CCTC--A-GG-C--T-TTTT-TCCCGA-TAA---G-T-GG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TAT-CCCTATT-C-ACA-A-A-A-AAGGT--A-G--TGT--G---AG--CGATGTTAAT-AATTACCGAGGCA-TAAC--C-T-TGG---TA-AGT-TGTTTATCTA-----A-A----CTG---TT-T--ACCA-C-CAT---A-CTC---A-A-TAAAAG---G--AT-TGA--A-A--C-A--T---TTTG-TA-A--TAA--TA-AT----GATA-TC---A---T---T-T-----C-----A--G-ATG---CGCAAT--TTGGATTTCGA---AA---GGGA-C-G-G-T---C---AACAG-TT-GATGCTAT-ATT--T----G--T-G-T--T------A----ATGTC----AATTA-T--CCAG-----A----A--T-T--A---T--T-TATAT---G----ATA------A--TAA--A-C------GT---TT---ATA---T--GT-T--GTT-TTCGTTGA---C----A-T-GATGA-AGTGT-TT-CG--A--T--AG----TAT---AT--A-TAGAAATGCACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATT-----A-TAAA---T--GCAGTTAAGTCAT-TGAAAAG---------AAAT-----AAGTCTGCA---GGTTCT-GATTGTTTGATTAA-TGAATATTTCAT--AGA-A----AGCATTG--ACAT--TTTAG-C-CT--C-----TCAT-C---TGTGT--------GAAA--TTT-TT-AA--TGC--AAT-TC-T--A--G---A-TA--G-TG-G--C-TTTT-CCCTGA-TAA---A-T-AG---A--CGGAGG-AGT----TG-T--AAT-ACC-ATTAC-ATA-A-A-A-AGGG---G-A--TAA--A---TG--TGATGTAAAT-AATTATAGAGGTA-TCAC--ACT-TGT---TA--GT-TGT--TTATC-----A-A----ATA---TT-TTCACCA-C-TAT---T-TTA---A-A-CAAACG---G--AT-TGT--A-T--C-A--T---ACTG-TG-A---AA--AG-A------ACA-GC---A---TAGTT-T-----C-----G--G-ATT---CTCAGT--TTGGATTTAGG---AA---AGGA-A-A-A-T---C---AACTA-CT-GATGCTTT-GTT--T----G--T-A-T--T------A----AACAC----TATTG-T--ACAA-----A----C--A-T--A---T--T-TGAAT---G----ATA------A--CAA--A-A------GG---CT---TTAT--T--GT----GTT-TTTGTAGA---T----T-T-TAAAA-AG-GCATT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAAATGGATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATT-----A-TAAA---T--GCAGTTAAGTCATTGAAAA---T------AAA------TAAGTCTGCA---GGTTCT-GATTGTTTGATTAA-TGAATATTTCAT--AGA-A----AGCATTG--ACAT--TTTAG-C-CT--C-----TCAT-C---TGTGT--------GATA--TTT-TT-AA--TGC--AAT-TC-T--A--G---A-TA--G-TG-GC-T-TTTT-CCCTGA-TAA---A-T-GG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AAT-ACC-GTTAC-ATA-A-A-A-AAGGG--G-A--TAA--A---TG--TGATGTAAAT-AATTATAGAGGTA-TCAC--ACT-TGT---TA--GT-TGTTTATCAA-----A-A----ATT---TT-C--ACCA-C-TAT---T-TTA---A-A-CAAACG---G--AT-TGT--A-T--C-A--T---ACTG-TG-A---AA--AT-A------ATA-GC---A---TAGTT-T-----C-----G--G-ATT---CTCAGT--TTGGATTTAGG---AA---AGGA-A-A-A-T---C---AACTA-CT-GATGCTTT-GTT--T----G--T-G-T--T------A----TACAC----TATTG-T--ACAA-----A----A--A-T--A---T--T-TGAAT---G----ATA------A--CAA--A-A------GG---C----TTA---T--TTGG--GTT-TTTGTAGA---T----T-T-TAAAA-AG-GCATT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAAATGGATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGCAGT---TAAGT--------CAT-TGAAAAG---------AAAT-----AATTCTGCA---GGTTCT-GATCGTTTGATTAA-TGAATATTTCAT--AGA-A----AGCATCG--GCAT--GTTAA-C-CT--C-----TCAG-C---CGTGT--------GATA--TTT-TTTAA--TGC--AAT-TC-T--AGAA---AGT-----GG-C--T-TTTT-CCCTGA-TAA---A-T-GG---A--CGGAATGATT----TG-T--AAT-ATT-ATTAC-ATA-A-A-A-AAGGG--G-A--TAA--A---TG--TGATGTAAAT-AATTATAGAAGTA-TCAC--ACT-TGT---TA--GT-TGT--TTATC-----A-AAAAATTG---C-----ACCA-C-TAT---T-TTA---T-A-CAAACG---G--AT-TGT--A-T--C-A--T---ACTG-TG-A---AA--AG-A------ATA-GC---A---TAGTT-T-----C-----G--G-ATT---CTCAGT--TTGGATTTAGG---AA---AGGA-A-A-A-T---C---AACTA-CT-GATGCTTT-GTT--T----G--T-A-T--T------ATAC-AT-------TATTG-T--ACAA-----A----A--C-T--A---T--T-TGAAT---G----ATA------A--CAA--A-T------G----CT---TTAT--T--GT----GTT-TTTGCAGA---T----T-T-TAAAA-AG-GCATT-TG--A--T--AA----TAT---TT--A-TCGAAATGGATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATT-----A-TAAA---T--GCAGTTAAATCAT-TGAAAAG---------AAATT-----AGTCTGCA---GGTTCT-GATTGTTTGATTAA-TGAATATTTCAT--ATA-A----AGCATTG--ACAT--TTTAG-C-CT--C-----TCAT-C---TGTGT--------GATA--TTT-TT-AA--TGC--AAT-TC-T--A--G---A-TA--GTGG-C--T-TTTT-CCCTGA-TAA---A-T-GG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AAT-ACC-ATTGC-ATA-A-A-A-ATGGG--G-A--TA-------AA--T-------GT-GATT-TTGT-----T-------T-TAA---AA-AAT-TGTC------------------------------ACCA-C-TAT---G-TTA---A-A-CAAACT---A-----TGT--A-G--C-A--T---ACTG-TG-----AA--A--AG----AATA-GC---ATAGT---T-T-----C-----G--G-ATT---CTCAGT--TTGGAATTAGG---AA---AGGA-A-A-A-T---C---AACTA-CT-GATGCTTT-GTT--T----G--T-A-T--T------G----CACAC----TATTG-T--ACAA-----A----A--A-T--A---T--T-TGAAT---G----ATT------A--CAA--A-A------GG---CT---TTA---T--TA-A--GTT-TTTGTAGAT--T----C-T-AAAAA-GGCA--TT-AG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAAACTGATTATG-GTT
gi|12534 : AAAAAGTTTAAAGAAAAAT-----AAAGCCTTT---GCTAGT-GACCTACT-ACTAAATGAATATTTTAT--TGA-A----TCTTGTG--ATAT--ATTGG-C-TT--C----------T---TGT-T--------GA----TTT-GT-AA--CGG--TAT-TT-T--T--A---ATTC--T-GG-T--C-ATTT-TCCTGA-TAA---T-T-GG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCT-ATT-T-ATA-A-G-A-AAAAT--G-A--CCC--G---GA--CGATGTCAAT-AATTACAGAGGTA-TAAG--C-T-TAG---TC-AGT-TGTTTATCTA-----A-G----ATA---TT-T--ACGG-G-TAT---T-TTA---A-A-TAAGCG---A--AT-T----A-A--TAC--T---TGTA-TT-G--AAA--AT-A------ATA-AT---A---T---T-G-----TGAG--T--G-ACG---CTCAAT--TTGGATTTAGA---CG---TGGA-A-G-G-T---C---GACAG-TT-GATGCAAT-ATT--T----G--TAC-T--T------A----A-TTC----CATTA-T--ACAA-----AAAGTA--T-T--A---T--T-AAAA-----------A------A--TGA--C-C------G----CT---TAG---CTTGT----GCA-TTTGTAGA---C----C-T-AAAGA-AAGCT-TT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAAATGGTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatAAAAGAC------AAAA---GGCAA-----TA---GGTAGC-GAGTATAT-AATGAATGAATATCTAAT--TGA-A----AGTATTG--ATAT--TTTAG-CTGCT-C-----ATAT-T---TGTG----------ATA--TTT-T--AA--CGC--TAT-AT-T--G--G---ACAC--T-GG-T--T-ATTT-TCCGGA-AAA---A-T-GG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TAT-CCC-TTTAC-ATA-A-A-A-AAGAT--G-A--TGC--A---AA--TGATGTAAAT-AATTATAGAGGCA-TAAC--A-T-TAG---TA-AGT-TGTTTATCGA-----A-A----CTA---TT-T--ACTT-C-TGT---T-TTA---A-A-TAAAGG---A--AT-CGT--G-A--T-A--T---TTTG-TG-----AA--A--AT----GATA-ATGTAA---T---A-T-----C-----T--G-ATG---TACAAT--TTGGGTTCAGA---AA---AGGG-A-G-A-T---C---TACTG-TT-GATGTTTT-ATT--TATACG--G-T-T--A------A----A--------TATTA-T--GCAA-----A----C--T-T--A---T--T-TGAAT---G----ATT------A--CAAG-A-CTGTATTGT---GT---TTA---T--GT-A--GAT-TTT------------------AAAA-AATGT-TT-CG--A--T--AC----TAT---TT--A-TAGAAACGCACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12539 : tgctgtcaagtctcttGTT------GAAATCTGGCAAATCTATT---GGTAGTAGATTGCTT-ATTAAATCAATATTTTCT--CGA-A----AGTATTG--ATAT--CATAG-C-AC--C-----ATAT-T---TGTGT--------GATA--TTT-T--AA--TGT--TTT-TT-T--T--A---ATTC--A-GG-T--T-ATTT-TCCTGA-GCA---G-T-GG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TAT-TCC-GTTGC-CTA-A-C-A-AAAGC--G-A--TAG--G---A---CAATATAAAT-ACATATCGCGGAA-TTAC--A-T-TAT---TA-AGT-TGTCTTTCTA-----A-A----TTG---TT-T--ACTA-C-AAG---T-TTG---A-A-CAAACC---A--AT-GGA--ACA--A-T--T---TTTG-TG-A--CAA--AC-AC----GACA-TC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAAT--TTAGATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAA-TT-GATACAAT-GGTCAT----G--T-T-T--C------A----A
gi|12537 : cAAAGCTGTTTTGGGT----GATCGTTT-ACTAAATGAGTACTA-AT--AGCTA----ACTG-CG--ATAT---AT---C-AT--CTTCTCATAT-C---ACTG----------ACA--TAT-TC-AA--TAT--TAT-TT-T--A--G---ATAC--A-AG-C--T-GTTT-TCCTGA-AAA---C-T-GG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CAT-TCC-TTTAT-ACA-A-A-A-ATGGT--G-A--AAT--A---AA--CAATGTTAAT-AATTACAGAGAAA-T--T--A-T-T-T---TA-A--------TACTA-----G-C----CTG---AG-T--A------TAT---A-CTG---A-A-CACACG---A--AT---A--A-A--T-A--A---ATGG-TGTA--CAG--ATAAT----GATA-TC---A---T---A-T-----C-----A--G-ATG---CTCAGT--TTGGGTTTTGG---AA---AAAT-A-G-a
gi|12530 : tgcaatcaaatctcaaaacagaaatTAGT-GATAGTTT-ATCAAACTAGTTTTTCATTTCGA-CCTGCAATAT------AT--TATCT-G-GT--C-----ATAT------AACC--------GATA--TTT-TT-AA--TCT--CAT-TT-T--C--A---ATAC--A-GG-G--T-GTTT-TCCTGA-CGA---A-T-GG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TAT-TCC-GTTAC-ACA-A-A-A-AAGGG--G-A--CAA--A---GACGTA--GTTAGC-AATTATAGGGGCA-TAAC--T-T-TAG---TT-AGT-TGTTTGGGAA-----A-A----ATT---TT-C--ACCA-G-CGT---C-TTG---A-A-CGCACG---T--AT-AAACAA-A--T-G--G---TATG-AG-G--CAA--AT-A----------GT---A---T---TATAA---C-----T--G-ACG---CACAGT--TTGGCTTCAGA---AA---GGGT-A-G-A-T---C---TACAA-CG-GATGCTAT-TTT--T----ATAC-T-TCAT------A----ATAT-----TATCG----ACAA-----A----G--T-T---------T-TAAAT---G----AGA------A--AAA--AAC------GA---CT---TTA---CT-GT----GCT-TTTATCGA---T----T-TAAAAAA-AGCG--TT-TG--ATTC--GG----TTT---AT-----AGAAATGCTCTGTG-GCTCAAACTtattatagataagatattgaatgaaaagaataaactttattgtgcatttatagatttaaaaaaaacatttgattctataaataaaaatgcattgtgacttaaa
gi|12542 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtc-GATTATAT-AATGAATGAATATATAAT--TGG-A----AGCATTA--ATAT--TTTAG-CTGCT-C-----ATAT-T---TGTG----------ATA--TTT-TT-AA--CGC--T----T-T--A--ATGGACTC--T-TG-T--T-ATTT-TCCGGA-GAA---A-T-GG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TAT-CAC-TTTAC-ATA-A-A-A-AAGGC--G-A--TGC--A---AA--TTATGTAAAT-AATTATAGAGGCA-AAAC--A-T-TAG---TA-AGT-TGTTTATCGA-----A-A----TTA---TT-T--ACTT-C-TAT---T-TTA---A-A-TAAATG---A--AT-TGT--A-A--T-A--T---TTTG-TG-A---AA--GT-AA----TATA-GT---AA--T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAA---TTTGCTTT----------------------------------G-TT-GATAC---------T----G------T--T------A----A---A----TATTG-T--GCAA-----A----C--T-T--A---T--T-TGAAT---G----ATA------A--TAA--A-T------GA---CT---GTAT--T--GT----GTT-TATGTCAA---T----C-T-TAAAA-AATGT-TT-CG--A--T--AC----TAT---TT--A-TAGACACGCACTGTA-GATGAAACT
gi|12532 : -GATAATCT-GTTGAACGAATATTTTAT--CGA-A--------TC-----AT--TTGA--------C-----ATAT-TGGGTGGACACATGACGGATA--TGT-TT-AACATGA--TAT-TT-------A---GTGC--T-GG-A--T-ACTT-TCC----GCACTTA-T-GGTC-A--TTGGGGTA------TA-T--TGT-ACA---TAT-ACATA-A-A-AGGGA--G-A--TAA--G---AA--CGACCCGAAG-AATTATCGCAGGA-TTAC--C-T-TGC---TA-AGT-AATTTTGGAA-----A-A----CTT---TT-C--ACTA-G-TAT---T-CTA---A-C-CAATAG---A--GT-AGA--A-AAAT-G--G---TTCG-AA-G--AGA--AT-A--------A-GT---T---T---T-T-----A-----TCAG-ACG---CACATT--TTGGTTTTCGT---AA---AGGT-T-GTA-G---C----ACGG-TA-GATGCCAT-TTT--T----G--T-T-T--T------AC---ATAAC----T-TTG-T--TCAA-----C----A--T-TTTA---T--T---------A----ATA------A--TAA--A--------AT----TAGATTAT--C--GT-GT-GCT-TTTATCGAT--C----T-T-AAAAA-AGCG--TT-CG--A--C--TC----CGT---TT--A-TCGCAATGCATTGTG-GTTTAAACT
gi|12538 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcTCT-ACTAAATGAATATTTCCT--TGA-A----A-CAGCGG-ATAT--TATTG-C-TCTGC-----ACAT------------------GACAGGTTTATT-AAA-TGG--TAT-TT-T--G--A---ACTC----------T-GTTT-TTTT----C----------------CCCAGAAAGT----TA---------------AA-ACA-A-A-------T--G-A--CAG--G---GG--AGATGTAAAT-AATTATAGGGGGA-TAAC--G-C-TTG---TC-AGC-TGTTTATCTA-----A-G----ATT---TT-T--ACAG-G-TGT---T-CTT---A-A-CAAAAG---A--ATATGT--A-A--------------G-TG-GTGCGA--GG-AG----AACA-GT---A---TAC-TAT-----C-----G--G-ACG---CACAAT--TTGGCTTTAGG---GC---GAGT-C-G-C-T---C---AACAG-TT-GATGCTAT-GTT--T----G--T-T-T--TGCAAGCA----GT-------TAT---T--AAAA-----A----A--T-C------C--T-TAAAT---G----GAA------A--TAA--A-C------GCTTATT---TTG---C--------GCG-TTTGTAGA---T----T-T-AAAAA-AG-GC-TTATG--A--T--AG----TGT---GT--A-TAGAAATGCATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12535 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacacT-ACTAAATGAATATTTTAT--TGA-A----TCTTGTG--ATAT--ATTGG-C-TT--C-----ACATCT---TGT-T--------GATA--TTT-TT-AA--CGG--TAT-TT-T--T--A---ATTC--T-GG-T--C-ATTT-TCCTGA-TAA---T-T-GG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCT-ATT-T-ATA-A-G-A-AAAAT--G-A--CCC--G---GA--CGATGTCAAT-AATTACAGAGGTA-TAAG--C-T-TAG---TC-AGT-TG--TTTACC-----A-AAG--ATA---TT-T--ACGG-G-TAT---T-TTA---A-A-TAAGCG---A--AT-T----A-A--TAC--T---TGTA-TT-G--AAA--AT-A------ATA-AT---A---T---T-G-----TGAG--T--G-ACG---CTCAAT--TTGGATTTAGA---CG---TGGA-A-G-G-T---C---GACAG-TT-GATGCAAT-ATT--T----G--TAC-T--T------A----A-TTC----CATTA-T--ACAA-----AAAGTA--T-T--A---T--T-AAAA-----------A------A--TGA--C-C------G----CT---TAG---CTTGT----GCA-TTTGTAGA---C----C-T-AAAGA-AAGCT-TT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAAATGGTTTATG-GTTTAAACT
gi|12531 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacAAATGAAT-TCTTAT--TGA-------GTCTTGGGATAC--ATTAG-C-AT--C-----ACATCT---TGT-T--------GATA--TTT-T--AA--CGG--TAT-TT-T--T--A---ATTC--T-GG-T--T-ACTT-TTCTGA-TAA---T-T-GG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGT-TTA-TTTAT-AAG-A-A-A-AA-------A--TACCCG---GA--CGATGTTAAT-AAGTATAGGGGTA-TAAG--C-C-TAA---TA-AGT-TGTTCATCTG-----A-G----GTA---TT-T--ACTG-G-TAT---T-TTA---A-A-TAAGCA---A--AT-T----A-A--T-A--C---TTGGATT-G--AAA--AT-A------ATA------A---T---T-T-----TGTGAGT--G-ACG---CTCAAT--TTAGATTTAGA---CATTTAGGA-A-G-A-T---T---GACTG-TT-GATGCAGT-ATT--T----GTAC-T-T--------------AGTTC----AATTA-T--ACAAAAAAGA----A--G-T--A---TTGT-TAAAA---A----ATG------A--C------C------G----CT---TAG---CT-TT-T--GCC-TTTGTAGA---C----C-T-AAAGA-AAGCT-TT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGGAATGGTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12540 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaaAATGAATATTTTA----GA-ACA--ACTAGCG--ATATATTATCG-T-CT--C-----ATAT-T------ACA-------GATA--TAT-TT-AA--TAT--TAT-TT-TTGA--T---ACT-----GG-G--T-GTTT-TCCAGA-TGA---A-T-GG---A--CTAAGGG-------T--T--CAT-TCC-ACTAC-ACA-A-A-A-AGGGT--A-A--CAA--A---GA--TGATGTTAAT-AATTACCGGGGAA-TAACCTA-TATATATGTATAGG-CATATTTTTC-----A-A----TAG---T-------------GT---T-TTA---A-A-CGAGCA---AGTAT-ACA--A-A-------T---GGTG-TG-A--TGA--AA-AT----AAGG-TT---A---T---A-T-----C-----T--G-ATG---CTCAAT--TTGGTTTTAGA---AA---GGG
gi|12533 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttAATGTTTTA---AGA-T----AGTTCTG--ATGT--CATAT-C-TC--C-----A-AT-C---GGTGC--------AAAC--TTT-TT-AA--TCA--TAT-AT-----------ATTCATG-TG-G--T-ACATATCCTGA-A-A---GCT-GG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGT-TCCAGTTCC-CCCCA-A-A-AAGGT--A-A--TAT--T---AA--TAATGTGAAC-AATAACAGAGGTA-TCAC--T-C-TCA---CA-AGTATG-CTTTCAA-----A-A----ATA---TT-T---TCA-T-CTT---T-ATA---AGA-TAAACG------TT-TAA--G-A--T-C--A---TAGG-CG-G----------AT----GAAA-ACA--A---T---T-TATTACC-----T--G-ACT---TCCAGT--TCGGTTTTCAA---AA---AATT-G-A-A-G---C----ACTGTTG-GCTG-TAT-ATT--T----G--T-A-T--T------G----AATTC----TATCA-TAGACAC-----A----G--T-TC-A---T--A-AAAATGAAA----ACA------A--GAA--A-CT-----GT---A------A---T--GT----TCT-TTTGTTGATTTC----C-T-TAAG---GCA--TT-TG--A--G--GT----TGT---AT--A-TAGAAATGGAATTTG-GTTAAA
gi|12541 : tgttgatgaggtcatcaaggcaatttcatcaatgaaaaagggtaaaagtagtggtgatgataaattgatccacga--ATTT--TATTA-C-AC--C-----TTATAT---TGT-T--------AAAA--TAT-TC-AA--TAA--AAT-CTAT--A--ATG-AC-------G-G--T-GTTTATCCAGAAGC----G-T-GG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGT-CCC-TATAC-ATA-A-A-A-AAGGT--G-A--CAA--ATTAAA--TA----CAGCGAATTATAGAGGGA-TTAC--A-T-TAA---TA-AAT-TCCCTTGCTA-----A-A----ATT---TT-T---TCA-C-TGTGTAT-TAG---A-AATAGAC--------T-TAA--T-A--C-T--T---GGTG-TG-----AA--AC-AG----AACATAT---A---C---T-T-----AA----T--G-ATT---CACAGT--TTGGTTTCAGAGATAA---AAAA-A-G-----------TACAA-TT-GATTGCAT-TTT--C----A--T-A-T--T------A----CATTG----TATTA-T--ACAA-----A----A--GAT--A---T--TGTCAAA---A----A-A------C--TAA--A-------------CT---TTAT--T--GT----GCT-TTTATTGA---C----TAC-GAAAG-GGCA--TT-TGATA--C--GG----T-T---AT--A--AGAGACGCGCTATGTGTTAAA
gi|12543 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaa---TGTGT--------TAAA--TTT-TT-AA--TGC--TAT-TT-T--A--A---ACTC--G-GG-G--T-GTTT-CCCTGA-GCA---G-T-GG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TAT-CCC-GTTAC-ACA-A-A-A-AGGGT--G-A--TAA--G---AA--TAATGTTAGT-AATTATCGTGGCA-TAAC--A-T-TAT---TA-AGT-TGTCTTTCTA-----A-A----CTG---TT-T--ACTA-C-CAT---T-TTG---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--T----T-T--T---TTTG-TT-A--CAA--AC-AC----GACA-GC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAAT--TTGGATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAG-TG-GATGCCAT-GTT--T----G--C-T-T--T------A----ATTTC----TGTTG-T--ACAA-----A----A--T-T--A---T--T-TAAAC---A----ATA------A--TAA--A-C------GT---CT---TTA---C--GT-A--GCT-TTTATTGA---C----C-T-GAAGA-AGTGT-TT-TG--A--C--AG----TAT---AT--A-CAGAAACGCTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12545 : c--TTT-TT-AA--TGA--AAT-AT-T--C--A---ATTC--A-GG-T--TCGTTT--CCTGA-AAA---T-T-GG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AAC-ACC-ATTAC-ATA-A-A-A-AAGGT-------CCA--G---TA--TAA------T-AACTATTGAGGCA-TTTC--ACT-TAT---TG-A-T-TCCCTATGTA-----A-A----ATAT--TT-T--GTCA---CAT---A-TTAAGTA-A-TAGATT---A--AC-TAA--A--------------TGG-TG-----AG--AT-ACTTTTGATG-TC---A---T---T-G-----A-----T--G-AGT---CACAGG--CAGGATTTAGG---AA---A----A-A-A-TATAC---CACTA-TA-GATAACAT-ATT--T----A--C-T-T--T------A----ATGGC----TTTAG-G--ACAA-----A----AGTC-T--C---T--T-TAGAA---G----AGA------A---AAGGA-C------GT---TT---TTAT--T--GT-A----TATTTGTTGA---TTTTGC-T-AAAGC-A-----TT-TG--A--T--AG----TATTCAAC--ACCAAAAAC----TATG-G
gi|12544 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AAT-AT-T--T--G---ATTC--A-GG-T--TCGTTT--CCTGA-AAA---T-T-GG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AAC-ACC-ATTAC-ATA-A-A-A-AAGGTCCA-G--TA-------AA--TGACCCAAAT-AACTATCGAGGCA-TTTC--ACT-TAT---CG-A-T-TCCCTATGTA-----A-A----ATA---TTCT--GTCA---CAT---A-TTAAGTA-A-TAGATT---A--AC-TAA--A--------------TGG-T--G--C-G--AT-ACTTTTGATG-TC---A---T---T-G-----A-----T--G-AGT---CACAGG--CAGGATTTAGGA--AA---AAGT-A-T-A-----C---CACTA-TA-GATAACAT-ATT--T----A--C-T-T--T------A----ATGGC----TTTAG-G--ACAA-----A----A--G-T--ATCTT--T-CTAAG---A----GAA------A--AGG--A-C------GT---TT---TTAT--T--GT-A----TATTTGTTGA---TTTTGC-T-AAAGC-A-----TT-TG--A--T--AG----TATTCAAC--ACCAAAAAC----TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AAT-AT-T--T--G---ATTC--A-GG-T--TCGTTT--CCTGA-AAA---T-T-GG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AAC-ACC-ATTAC-ATA-A-A-A-AAGGTCCA-G--TA-------AA--TGACCCAAAT-AACTATCGAGGCA-T
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGC--AAT-AT-T--C--G---ACTC--G-GG-C--T-GTTT-CCCTAA-AGA---A-T-GG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGT-ACC-ATTAT-TTA-A-A-A-AAGGG--G-A--CAG--A---CA--TGATGTTAAT-AATTACAGAGGGA-TAAC--A-C-TAA---TC-AGC-AGCATGGGGA-----A-A----CTT---TT-T--ACCA-G-CAT---A-TTA---A-A-TAAGCG---T--AT-TGT--A-T--C-T--T---GGTG-CG-A--CAG--TA-AT----GATA-TC---A---T---A-T-----C-----T--G-ACT---CACAAT--TCGGGTTGATA---AA---AGGA-A-A-A-T---C---TACTG-TT-GATGCGGT-GTT--T----A--T-T-T--T------A--------CAAAACATTA-TA-AAAA-----A----A--A-T--A------C-TAAAC---A----ATA------A--AAT--T-C------GT---CT---TAA---CT-GT----GCA-TTCATTGA---T----C-T-CCACA-AGGCG-TT-CG--A--T--TC----TAT---AA--A-TAGGAATATGCTATG-GCTTAAATTACAttcacttatcgattccctatgtaaaatattctgttacatattaagtaatagattaactaaatggtgcgatacttttgatgtaattgatgagtcacaggcaggatttaggaaaaagtataacacaatagataacatatttactttaatggctttaggacaaaagtatctttctaagagaaaaggacgtttttattgtatatttgttgattttgctaaagcatttgatagtattcaacaccaaaaactatgg
gi|12548 : T-TT-AA--TGC--AAT-AT-T--C--G---ACTT--G-GG-C--T-GGTT-TCCTGA-GGA---G-T-GA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGT-ACC-ATTATTGGA-A-A-ATAGGG---G-A--CAG--A---CG--TGATGTTAAT-AATTACAGAGGGA-TAAC--ACT-TAT---CA--GC-AGCATGGGAA-----A-A----CTT---TT-T--ACCA-G-CAT---A-TTA---A-A-TAGGCG---T--AT-TGT--A-T--C-T--T---GGTG-CG-A--TAG--TA-AT----GATA-TC---A---T---A-T-----C-----T--G-ACG---CACAAT--TCGGGTTTAGA---AA---AGGA-A-A-A-T---C---TACTG-TT-GATGCGGT-GTT--T----A--T-T-T--T------A--------CAAAACATTA-T--AGAA-----A----A--A-A--A---TA-C-TAAAC---A----ATA------A--AAA--T-C------GT---CT---GTA---CT-GT----GCA-TTCATTGA---
gi|12549 : T-TT-AA--TAT--TATATT-T--A--A---TGTC--G-GATA--T-GTTC-CAC--A-AAA---A-T-GG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGC-ACC-ATTAC-ACA-A-A-A-AGGG---G-A--TAA--G-------TACTGTAACC-AATTATtatccgcaaggcgttcgattctataaataggaatatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATAT-TT-G--A--A---AAT---G-GA-AACT-GT----CCTGT-GCA---A-T-GG--------GGAGAAAG----TA-T--CTC-TCC-AATAC-ACA-ATA-A-AGGGT--ACG--TAA-------A--TGAT-TCAATCAATTACAG-AGCAATATC--A-T-TAA---TC-AAT-TGTCTTT-GC-----A-A------GAATTT-T--ACTT-C-AAT---A-TTC---A-A-TAATTGTTTA--AC-CAA--A-A------------TGG-TG-T--AAT--AC-AC-----ATA-AC---A---T---T-T-----T-----T--G-ATG------AATCACTGGTTTCCGA---AA---A--C-A-GTACT---C---TACTA-TT-GATAACTT-ATC--A----A--C-G-T--T------A----CAATC----TATGA-T--CCAA-----A----A--G-T--A---T--T-TAaaaggtattac
gi|12551 : TTT-TCCAGA-GGA---A-T-GGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TAT-ACC-ACTAT-TCT-A-A-A-AGG-T--G-A--TAA--T---AA--AAATGTTAAT-AAGCATAGGAGTA-TGAC--G-C-TTG---TA-AAT-TGTA-TGAAC-----ACA----CTT---TT-C--ACAA-G-TAT---C-CTA---A-A-CAAAGG---T--AT-TGAT-A-A--T-T--tcatgttaaaaaatggtgactttattgtatgtttatagatgtctataaagcatttgattgtattcaacataataagttat
gi|12552 : taaaaataaggctaaTTTACCCTGA--TA---G-TTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-TAGTA--CCT-GTTCC-AAA-A-A-A-AAGG-----A--TAT--T---AA--CAATGTTGAT-AATTATAGGGGCA-TTAT--GCT-TAC---TA-G---TATC-TTCTCTAA--A-A----TTG---TC-T----CA-C-AGT---TGTTA---G-A-TACCCG---------TGC--A-C--G-TAAT---TTTG-T-----CGA--AG-AC----AACA-AG---A---T---T-TTAA--C-----A--GAATG---C-CACT--TTGGTTCCAGA---CA---AAAA-A-G-A-A---G---CACTG-TT-GATTGTAT-TTT--T----G--T-T-C--T------A----CAGTC-----GTTGATAAATAG-----A----A--T-T--A---T--T-C-AAC---ATGAGAGA------A--AAA--A-------------------TA---C--AT-AGCGCT-TCTGTTGA---T----T-T-TAAAA-TGGAA-TT-TG--A--C--AT----GGT---TT--A-CCGCAATGGAATAAG-GTTTAAACTGTggtgtgaa
gi|12553 : A-GAA---A-T-GG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGT-ACC-ATTAT-TGA-A-ACA-AGGGG--G-AATTAT-------A--TGATATTAAT-AACTA-CA-GGTA-CAAC--ACT-TGT---TAGAAT--------CACGTGAAA-A----CTT---TT-T--ACTAGCGCAT---T-T-----A-A-CAAACG------GT-TG--------T-A--T---CTTG-AC-G--TGA--CC-GT----AATA-GT---A---TGA-TAT-----C-----T--G-ACG---TATTAT--TTGGG-TTAAG---AA---ATGCAA-A-A-T---C---TAGTA-TT-TATACGGT-GTT--T-----------------------------------TATTT-T--ACAG-----A----A----T--A---T--TATAAAA---A----A
gi|12554 : -GTTTC-ATA-C-A-A-ACGGA--A-A--TAA--A---AA--CACGGTCATC-AATTATAGAGATA-TAAC--T-T-TAT---TT-A-T-CGTTTTGGGC-----A-AG---TTA---TT-T--ACTA-G-CGT---T-CTA---A-A-CACAAG---A------GA--A------C--G---TTTG-TG-----AATTAA-AT----GATA-TA---A---T---T-T-----T-----A--G-ACG---CGCAAT--TTTAATTCAGA---AA---AG-------A-T---CGAATACAA-TTCGATGCTATCGTT--CATG-G--C-T-A--C------A----GT--------ATTG-G--ACAA---------------------------TAAAC---T-----TA------AGGTAA--A------------------TTATAGC--GT-A---CG-TTTATTGA---T----T-T-AAAAAGAGCG--TT-CG--A--C--------TAT---GTTAA-TAGGAATGCATTGCG-GCTa
gi|12557 : -----A-A----TTG---TT-T--AGTA-C-AAT---T-TTG---A-A-CAAACA---C--AT-TGA--A---------TAAGTATG-TG-A--CAA--CC-AC----GACA-GC---A---TG--TGT-----T-----T--G-ATA---CACGAT--TTGAATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAA-TT-GATG
gi|12555 : a---TT-T--ACCA-C-CAT---A-CTC---A-A-TAAAAG---G--AT-TGA--A-A--C-A--T---TTTG-TA-A--TAA--TA-AT----GATA-TC---A---G---T-T-----C-----A--G-ATG---CGCAAT--TTGGATTT-CG---AA---AGGA-ACG-G-T---C---AACAG-TT-GATGCTAT-ATT--T----A--T-G-T--T------A----ATGTT----AATTA-T--CCAG-----A----A--T-T--A---T--T-TATAT---G----ATA------A--TAA--A-C------GT---TT---ATA---T--GT-T--ATT-TTCATTGA---C----A-T-GATGA-AGTGT-TT-CG--A--TTGAA----TAT---AT--A-TAGAAATGCACTTTG-GCTAAAATTAttt
gi|12558 : taaatatttagaagcattacgtatatatacctgttaaaaatcaga-C-TAT---T-TTA---A-A-CAAACA---G--AT-TGT--A-T--C-A--T---ACTG-TG-A---AA--AG-A------ATA-GC---A---TAGTT-T-----C-----G--G-ATT---CTCAGT--TTGGATTTAGG---AA---AGGA-A-A-A-T---C---AACTA-CT-GATGCTTT-GTT--T----G--T-G-T--T------A----TACAC----TATTG-T--ACAA-----A----A--A-T--A---T--T-TGAAT---G----ATA------A--CAA--A-A------GG---CT---TTAT--T--GT----GTT-TTTGTAGA---T----T-T-TAAAA-AG-GCATT-TG--A--T--AG----TAT---TT--A-TCGAA
gi|12556 : ---T-TTG---A-A-CAAACG---A--AT-TGA--A-C--A-A--T---TTTG-GG-A--TAA--TC-GC----AACA-CC---A---T---T-T-----C-----T--G-ATG---CACAGT--TGGAATTTAGG---AA---AGGC-A-G-A-T---C---TACAA-TT-GATGCCGT-GTT--T----G--C-T-T--T------A----CTGTC----TATAG-A--ACAA-----A----C--T-T--A---T--T-TAAA
gi|12546 : ctatttaacattcatgtctatcattacagtattaagtagta-----T--G-ATGAGTCACAGG--CAGGATTTAGGA--AA---AAGT-A-T-A-A---C----ACAA-TA-GATAACAT-ATT--T----A--C-T-T--T------A----ATGGC----TTTAG-G--ACAA-----A----A--G-T--ATCTT--T-CTAAG---A----GAA------A--AGG--A-C------GT---TT---TTAT--T--GT-A----TATTTGTTGA---TTTTGC-T-AAAGC-A-----TT-TG--A--T--AG----TATTCAAC--ACCAAAAAC----TATG-G
gi|12559 : aactttttaatgaaatatttgattcaggttcgtttcctgaaaattggagcgaaagcattataacaccattacataaaaaaggtccagtaaatgacccaaataactatcgaggcatttcacttatcgattccctatgtaaaatattctgttacatattaagtaatagattaactaaatggtgcgatacttttgatgtaat--G-ATG---CTCAGT--TTGGATTCAGA---AA---GGGG-C-G-G-T---C---CACTT-TT-GATGCAAT-ATT--A----G--TAT-T--T------G----ATGCA----T-TTA-A--ACAA-----A----A--G-G--T---T--T-TGAGCG--A----ATATGGGAGA--TTA--G-------------CT---T--------GT----GCT-TTTATCGA---T----C-T-TAAAA-AAGCC-TT-TG--A--T---G----TTT---TT--A-TCGTAACGGTCAATG-GTACAAACT
gi|12560 : T--TTGGATTCAGA---AA---AGGT-C-G-C-T---C---TACTG-TC-GATACTAT-ATT--T-------C-TAT--T------AGAACATTTA-----ATCGAT--AC---------------T-A--A---T--T-TGAAC---A----ATAAAG---A--TAA--A--------GT---ATA--TT-------GT----GCT-TTTATAGA---T----T-T-AAAGAGAGCG--TT-CG--A--T--TC----CAT---AA--A-TAGAAATGCATTGTG-GCTAAAATTATA
Alignments
lowQualScore : 444444444444444444444444444444444444444 111111 111 1111111 111111 222222222222 111111111111111111 1111111111111 11111 22222222 11
lowQualScore : 0 0 1 22 000000000000000000000000000000000000000 444 22 2 2 8 2 2 666 55 2 0 2 44 33 2 000000 5 66 1 000 22 1 1 33 333 0 333 66 88 1 5 222 1 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 0 2 1 888 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 4 77 2 33 2 2 1 1 333333 222 1 66666 2 0 8888888 1 555 1 2222 1 2 333333333333 111 1 1 333333333333333333 99999 444 9999999999999999999 4444444444 2 0 333 111 1 11 3333 1 11 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 222 8888888888888 3333 2 33333 333 1 6666 77 1 1 4 1 1 111 44 2 22222 2 1 44444444 3 55 1 33 55555 444 888 2 6 33 66 33333 1 11 8888 2222 66666 1 1
lowQualScore : . . . .. ....................................... ... .. . . . . . ... .. . . . .. .. . ...... . .. . ... .. . . .. ... . ... .. .. . . ... . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . ...... ... . ..... . . ....... . ... . .... . . ............ ... . . .................. ..... ... ................... .......... . . ... ... . .. .... . .. . . . . . . . .. ..... .. ... ............. .... . ..... ... . .... .. . . . . . ... .. . ..... . . ........ . .. . .. ..... ... ... . . .. .. ..... . .. .... .... ..... . .
lowQualScore : 1 6 0 00 222222222222222222222222222222222222222 999 22 5 4 9 0 0 666 55 5 5 0 88 88 0 666666 0 44 9 888 33 4 4 44 000 3 555 00 44 0 6 333 3 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 3 4 2 666 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 2 3 2 2 999999 111 4 99999 4 5 5555555 1 888 1 8888 1 1 000000000000 999 1 1 000000000000000000 77777 000 5555555555555555555 2222222222 2 5 000 999 1 55 3333 1 22 3 5 4 1 3 3 2 22 33333 66 111 3333333333333 7777 4 00000 999 2 6666 77 2 2 2 3 3 555 44 6 11111 6 3 55555555 9 66 0 11 44444 111 999 6 5 66 11 22222 0 88 2222 8888 22222 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAANTGC-AGTT-AA-TCA-CGGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTAT-CG--ATATNTTA-GCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTN--GAC-TCG-GGNTNT---TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TGTC-TN-T-CNAA---ANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTA---A-ACAAACG---AAT-TGAA-AC---AT--NTTG---T-G-A--CAA-A-NAC----G--ATANC---A---T---T-T--C-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T---A--ATGT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA--T---C-T--NAA-A-A-A-GCGTTT-CGAT--A--GTATTT--A----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTAATGAAATTNTANNTGC-AGTT-AA-TCA-TGGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTN--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTAT-CG--ATATTNTA-GCN--C--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGN--TATTTTN--AAC-TCG-GGNTGT---TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-NTAAGT-TGTC-TT-T-CNAA---ANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTA---A-ACAAACG---AAT-TGAA-AC---NT--TTTG---T-G-A--CAA-A-NAC----G--ATAGC---A---T---T-T--C-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T---A--ATNT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA--T---C-T--NAA-G-A-A-GCGTTT-CGAT--A--GTATNT--A----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTT-AAGTCA-TTGAAAA--T------AAA------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCAT-TG--ACATTTTA-GCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTA--GA--TAGTGGCTTT---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TGTT-TA-T-CAAA---AAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTA---A-ACAAACG---GAT-TGTA-TC---AT--ACTG---T-G-A---AA-A-TA--------ATAGC---A---TAGTT-T--C-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T------ATACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-TAT-T---T--G-G--GTTTTTGTAGA--T---T-T--TAA-A-A-AGGCATTT--GAT--A--GTATTT--A----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTT-AAGTCA-TTGAAAAG---------AAAT-----AAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCAT-TG--ACATTTTA-GCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GAAA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTA--GA--TAGTGGCT-T---TT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATTACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TGTT-TA-T-CAAA---TAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTA---A-ACAAACG---GAT-TGTA-TC---AT--ACTG---T-G-A--AAA-G-AAC----AGCATAG--------T---T-T--C-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---A--AACA-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA--T---T-T--TAA-A-A-AGGCATTT--GAT--A--GTATTT--A----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGC-AGTT-AAGTCA-TTGAAAAG---------AAAT-----AATTCTGCA--GGTTCT-GATCG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCAT-CG--GCATGTTA-ACC--T--CTCAG-CCG-TGT-GATA--TTT-TTTAA--TGC--AATTCTAGAAAG-T---GGCTTT---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TGTT-TA-T-CAAA---AAA-T---TG-CACCA-C----TATT-TTA---T-ACAAACG---GAT-TGTA-TC---AT--ACTG---T-G-A---AA-A-GA--------ATAGC---A---TAGTT-T--C-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---AT-ACAT-------TATTG-T--AC-AA-----AA--CT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AT-G-----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGCAGA--T---T-T--TAA-A-A-AGGCATTT--GAT--A--ATATTT--A----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTT-AAATCA-TTGAAAAG---------AAATT-----AGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATAA--AGCAT-TG--ACATTTTA-GCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTA--GA--TAGTGGCTTT---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATTGCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TGTC-------------------------ACCA-C----TATG-TTA---A-ACAAACT---A---TGTA-GC---AT--ACTG---T-G-A---AA-A-GA--------ATAGC---ATAGT---T-T--C-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---GC-ACA--C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-A--AA-GG----CT-T-T-A---T----TAAGTTTTTGTAGAT-T---C-T--AAA-A-A-G-GCA-TT-AGAT--A--GTATTT--A----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-CGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTAT-CG--ATATTATA-GCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTA--AAC-TCG-GGGTGT---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TGTC-TT-T-CTCA---ACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTG---A-ACAAACG---AAT-TGAA-AT---TT--TTTG---T-G-G--CAA-A-CAC----G--ACAGC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A--ATTT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA--C---C-T--GAA-G-A-A-GTGTTT-TGAC--A--GTATAT--A----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-CGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTATT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--AGTAT-CG--ATATTATA-ACA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TTTTTTA--AAC-TCG-GGGTAA---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TGTC-TT-T-CTAA---ACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTG---A-ACAAACG---AAT-TGAA-TT---TT--TTTG---T-G-A--CAA-A-CAC----G--ACAGC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A--ATTT-C-----TATT--T------A-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA--C---C-T--GAA-G-A-A-GTGTTT-TAAC--A--GTATAA--A----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-AGAAAAAGTT------AAAATCTAGCATATCTTTT--GGTATT-GACTG-TTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTAT-CG--ATATTATA-GCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATATTA--AAT-TCA-GGGTAC---TT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TGTC-TT-T-CTCA---ACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTA---A-ACAAACG---AAT-TGAT-TT---TT--TTGG---T-G-A--CAA-A-CAC----G--ACAGC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A--ATTT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AACA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--GAA--GCTTTAATTAA--C---C-T--GAA-G-A-A-GTGTTT-TGAT--A--GTATAT--A----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGCTAGTA-AA-T-G-T-------TT------GAAAGCTGGAAAATCGATT--GGGAGC-GATTT-CTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGAA--AGTAT-TG--ATATTTTAGGCT--C--C-CAT-TTA-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTG--ACC-TCA-GGCTTT---TT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT-CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TGTT-TA-T-CTAA---ACT-G---TT-TACCA-C----CATA-CTC---A-ATAAAAG---GAT-TGAA-AC---AT--TTTG---T-A-A--TAA-T-AAT----G--ATATC---A---T---T-T--C-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G--GA---C-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T---A--ATGT-C-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--GTTTTCGTTGA--C---A-T--GAT-G-A-A-GTGTTT-CGAT--A--GTATAT--A----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : ATAACAGTTAACGAGGTCGAATCTGC-AATTCGA-TCA-C-------TT------AGCA-CGAACAAAG-TGTC----TAGT-GATAG-TTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-----CCTGCA--ATATATTA-TCT--G--GTCAT-ATA-ACC-GATA--TTT-TT-AA--TCT--CATTTTC--AAT-ACA-GGGTGT---TT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTTACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TGTT-TG-G-GAAA---AAT-T---TT-CACCA-G----CGTC-TTG---A-ACGCACG---TAT---AA-ACAA-AT--GGTA---T-G-AGGCAA-------------ATAGT---A---T---TATAAC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G--GT---A-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT---A--ATAT-------TATCG----AC-AA-----AG--T-------T--TTA-A-ATG-AGAAAAA-A--AC-GA----CT-T-T-A---CT-G-T--GCTTTTATCGA--T---T-TA-AAA-A-A-A-GCGTTT--GAT--T--CGGTTT--A----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : AAATGAAT-TCT-TAT--TGA----GTCT-TGGGATACATTA-GCA--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-T--AA--CGG--TATTTTT--AAT-TCT-GGTTAC---TT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTTATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TGTT-CA-T-CTGA---GGT-A---TT-TACTG-G----TATT-TTA---A-ATAAGCA---AAT-TAAT-AC--------TTGGATT-G-A---AA-A-TA--------ATA-----A---T---T-T--TGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G--GA---A-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T---A--GT-T-C-----AATTA-T--AC-AAAAAAGAA--GT-A----TTGTTA-A-AAA-AT-GAC------C-GCTTAGCT-T-T----------T--GCCTTTGTAGA--C---C-T--AAA-GAA-A-GC-TTT-TGAT--A--GTATTT--A----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GATAA-TCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CGAATCA-T-T-TG--ACATATTG-GGT--G--GACAC-ATGACG--GATA--TGT-TT-AACATGA--TATTTAG--TGC-T---GGATAC---TT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTAT-----A-T--TGTACA---TATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AATT-TT-G-GAAA---ACT-T---TT-CACTA-G----TATT-CTA---A-CCAATAG---AGT-AGAA-AA---ATGGTTCG------------A-A-GAG----A--ATAA----G---T---T-T--T-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-G--GTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T---AC-ATAA-C-----T-TTG-T--TC-AA-----CA--TT-T----T--ATT-A-ATA-AT-AAAA-TT-AG-AT----TA-T-C-G---T--G-T--GCTTTTATCGA--T---CTT--AAA-A-A-A-GCG-TT-CGAC--T--CCGTTT--A----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGC-AATTTCA-TCAATGAAAAAG---------------GGTAAAAGTAGT--GGTGAT-GATAAATTG-ATCCACGAAATGTTT-TA---AGAT--AGTTC-TG--ATGTCATA-TCT--C--CA-AT-CGG-TGC-AAAC--TTT-TT-AA--TCA--TATAT-----AT-TCA-TGTGGTACATA-TCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCCAAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG-C-TT-T-CAAA---AAT-A---TT-T-TCA-T----CTTT-ATA---AGATAAACG----TT-TAAG-AT---CA--TAGG---CGG-A--TGA-A-AAC----A--AT-TT---A---T---TAC--C-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATTGA---A-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGT----AT--T---G--AATT-C-----TATCA-TAGAC-AC-----AG--TTCA----T--AAA-A-ATG-AA-AACA-A--GA-AA----CT-G-TAA---T--G-T--TCTTTTGTTGA--TTTCC-T--TAA-G-----GCATTT--GAG--G--TTGTAT--A----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tAAAAGTTTAAAGAAAAAT-----AAAGCCTTT--GCTAGT-GACCT-ACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--TCTTG-TG--ATATATTG-GCT--T--C-----TTG-T-T-G--A--TTT-GT-AA--CGG--TATTTTT--AAT-TCT-GGTCAT---TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TGTT-TA-T-CTAA---GAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTA---A-ATAAGCG---AAT-TAAT-AC--------TTG---T-A-T--TGA-A-AAT----A--ATAAT---A---T---T-G--TGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T---A--AT-T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA--C---C-T--AAA-GAA-A-GC-TTT-TGAT--A--GTATTT--A----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtataT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--TCTTG-TG--ATATATTG-GCT--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-TT-AA--CGG--TATTTTT--AAT-TCT-GGTCAT---TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TGTT-TA-C-CAAA---GAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTA---A-ATAAGCG---AAT-TAAT-AC--------TTG---T-A-T--TGA-A-AAT----A--ATAAT---A---T---T-G--TGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T---A--AT-T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA--C---C-T--AAA-GAA-A-GC-TTT-TGAT--A--GTATTT--A----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacAAAAGAC------AAAA---GGCAA-----TA--GGTAGC-GAGTA-TAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGAA--AGTAT-TG--ATATTTTA-GCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-T--AA--CGC--TATATTG--GAC-ACT-GGTTAT---TT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTTACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TGTT-TA-T-CGAA---ACT-A---TT-TACTT-C----TGTT-TTA---A-ATAAAGG---AAT-CGTG-AT---AT--TTTG---T-G------A-A-AAT----G--ATAATGTAA---T---A-T--C-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G--GG---A-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A---A--A----------TATTA-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-AG-ACTGT----AT-T----------G-T--GTTTATGTAGA--T---T-T--TAA-A-A-A-ATGTTT-CGAT--A--CTATTT--A----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : tgctgtcaagtctcttAAAGCTGTTTTGG--GT-GATCG-TTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTAA--C-TG--CG--ATATATCA-TCT--T--CTCAT-AT--CACTGACA--TAT-TC-AA--TAT--TATTTTA--GAT-ACA-AGCTGT---TT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTTATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-AT-ACT-AGCC-T-------G---AGT-A---TA-TAC--------------TG---A-ACACACG---AAT---AA-AT---AA--ATGG---T-GTA--CAG-ATAAT----G--ATATC---A---T---A-T--C-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A--AT---A-G-
gi|12538 : tgcaatcaaatctcaaaacagaaat-TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGAA--A-CAG-CGG-ATATTATT-GCT--CTGCACAT---------GACAGGTTTATT-AAA-TGG--TATTTTG--AAC-TCT-GTTT-T---TT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA--------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TGTT-TA-T-CTAA---GAT-T---TT-TACAG-G----TGTT-CTT---A-ACAAAAG---AATATGTA-A----GT--GGTG---C-G-A--GGA-G-AAC----A--GTA-T---A---C---TAT--C-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A--GT---C-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCAA--GCAG-T-----TATTA-------AA-----AA--AT-C----C--TTA-A-ATG-GA-AATA-A--AC-GC----TTAT-T-T---T--G-C--GCGTTTGTAGA--T---T-T--AAA-A-A-A-G-GCTTATGAT--A--GTGTGT--A----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTAtattatagataagatattgaatgaaaagaataaactttattgtgcatttatagatttaaaaaaaacatttgattctataaataaaaatgcattgtgacttaaa
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacacGTT------GAAATCTGGCAAATCTATT--GGTAGTAGATTG-CTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGAA--AGTAT-TG--ATATCATA-GCA--C--CATAT-TTG-TGT-GATA---TT-TT-AA--TGT--TTTTTTT--AAT-TCA-GGTTAT---TT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTTGCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TGTC-TT-T-CTAA---ATT-G---TT-TACTA-C----AAGT-TTG---A-ACAAACC---AAT-GGAACAA---TT--TTTG---T-G-A--CAA-A-CAC----G--ACATC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C---A--A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACAACTAG-CG--ATATATTA-TCG--T--CTCAT-AT--TACAGATA--TAT-TT-AA--TAT--TATTTTT--GAT-ACT-GGGTGT---TT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACTACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TGTA-TA-G-GCAT---ATT-T---TT-CAATA-G----TGTT-TTA---A-ACGAGCA---AGT-ATAC-AA---AT--GGTG---T-G-A--TGA-A-AAT----A--AGGTT---A---T---A-T--C-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G--Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTGT---TTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TATACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TCCC-TT-G-CTAA---AAT-T---TT-T-TCA-CTGTGTATT-AGA---A-ATAGAC------T-TAAT-AC---TT--GGTG---T-G-A--AAC-A-GAA----C--ATA-T---A---C---T-TA-A-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A--AA---A-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T---AC-AT-T-G-----TATTA-T--AC-AA-----AAG-AT-A----T--T-------G-TC-AAAA-A--AC--TAAA-CT-T-T-AT--T--G-T--GCTTTTATTGA------C-TACGAA-A-G-G-GCATTT--GAT--ACGGT-TAT--A---------AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GATTA-TAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGGA--AGCAT-TA--ATATTTTA-GCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-TT-AA--CGC--TTTAATG--GAC-TCT-TGTTAT---TT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTTACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TGTT-TA-T-CGAA---ATT-A---TT-TACTT-C----TATT-TTA---A-ATAAATG---AAT-TGTA-AT---AT--TTTG---T-G-A---AA-G-TAA----T--ATAGTA--A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT---------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T---A--A----A-----TATTG-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AATA-A--AT-GA----CT-G-T-AT--T--G-T--GTTTATGTCAA--T---C-T--TAA-A-A-A-ATGTTT-CGAT--A--CTATTT--A----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TG-TGT-TAAA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTA--AAC-TCG-GGGTGT---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TGTC-TT-T-CTAA---ACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTG---A-ACAAACG---AAT-TG-A-TT---TT--TTTG---T-T-A--CAA-A-CAC----G--ACAGC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A--ATTT-C-----TGTTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA--C---C-T--GAA-G-A-A-GTGTTT-TGAC--A--GTATAT--A----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-AA--TGA--AATATTT--GAT-TCA-GGTTCG---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTA------AATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TCCC-TA-T-GTAA---AAT-A---TTCTGTCA------CATA-TTAAGTA-ATAGATT---AAC-TAAA-------T--GGTG---C-G-A--TAC-T-TTT----G--ATGTC---A---T---T-G--A-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-----A---A-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A--ATGG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA--T---T-T--TGCTA-A-A-GCATTT--GAT--A--GTATTC--AACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTC--AAT-TCA-GGTTCG---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGT---------------CCAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TCCC-TA-T-GTAA---AATAT---TT-TGTCA------CATA-TTAAGTA-ATAGATT---AAC-TAAA-----------TGG---T-G-----AG-A-TACTTTTG--ATGTC---A---T---T-G--A-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A----AA---A-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A--ATGG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AAGTCT-C----T--TTA-G-AAG-AG-AAAAGG--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA--T---T-T--TGCTA-A-A-GCATTT--GAT--A--GTATTC--AACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTT--GAT-TCA-GGTTCG---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTA------AATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TCCC-TA-T-GTAA---AAT-A---TTCTGTTA------CATA-TTAAGTA-ATAGATT---AAC-TAAA-------T--GGTG---C-G-A--TAC-T-TTT----G--ATGTA---A---T---T-G--A-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A--GT---A-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A--ATGG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA--T---T-T--TGCTA-A-A-GCATTT--GAT--A--GTATTC--AACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGC--AATATTC--GAC-TCG-GGCTGT---TT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AGCA-TG-G-GGAA---ACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTA---A-ATAAGCG---TAT-TGTA-TC---TT--GGTG---C-G-A--CAG-T-AAT----G--ATATC---A---T---A-T--C-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T---AC-AAAA-C------ATTA-T--AA-AA-----AA--A--A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-T--TC-GT----CT-T-A-A---CT-G-T--GCATTCATTGA--T---C-T--CCA-C-A-AGGCG-TT-CGAT--T--CTATAA--A----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-AA--TGC--AATATTC--GAC-TTG-GGCTGG---TT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AGCA-TG-G-GAAA---ACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTA---A-ATAGGCG---TAT-TGTA-TC---TT--GGTG---C-G-A--TAG-T-AAT----G--ATATC---A---T---A-T--C-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T---AC-AAAA-C------ATTA-T--AG-AA-----AA--AA-A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-A--TC-GT----CT-G-T-A---CT-G-T--GCATTCATTGA--TATCC-G--CAA-G-----GCG-TT-CGAT--T--CTATAA--A----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-AA--TAT--TATATTT--AATGTCG-G-ATAT---GT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATTACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATATTTGA--AAA-T---GGAAAC---TG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AATACACA-ATAA-AGG------GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TGTC-TT-TGCAAG---AAT-----TT-TACTT-C----AATA-TTC---A-ATAATTGTTTAAC-CAAA-A---------TGG---T-G----TAATA-CAC-------ATAAC---A---T---T-T--T-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA--GT---A---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C---A--A--T-C-----TATGA-T--CC-AA-----AA--GT-A----T--TTATC-ATG-TT-AAAA-A--ATGGTGA--CT-T-T-AT--T--G-T--ATGTTTATAGATGT---C-T--ATA---A-A-GCATTT--GAT--T--GTATTC--A----
gi|12551 : T---TT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACTATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TGTA-T-----GAACACACT-T---TT-CACAA-G----TATC-CTA---A-ACAAAGG---TAT-TGAT-AA---TT--GGTG---T-G-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaggctaaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTTCCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TATC-TTCT-CTAA---AAT-----TG-TCTCA-C----AGTTGTTA---G-ATACCCG-------TG-C-ACGTAAT--TTTG---T------CGA-A-GAC----A--ACAAG---A---T---T-T--------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A--AA---A-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T---A--CAGT-C------GTTGATAAAT-AG-----AA--TT-A----T--TCA-ACATG-AG-AGAA-A--AA-AT----AC-A-T-A------G-C--GCTTCTGTTGA--T---T-T--TAA-A-A-T-GGAATT-TGAC--A--TGGTTT--A----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATTATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---ATCACG-T-GAAA---ACT-T---TT-TACTAGCG---CATT-T-----A-ACAAACG---G-T-TGTA-TC---TT--GACG---T-G-A--C-----CGT----A--ATAGT---A---TGA-TAT--C-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G--CA---A-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T---A--CAGA-A-----TATTA-T--AA-AA-----AA--
gi|12554 : -GTTTCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTT-TTGG-GCAA---GTT-A---TT-TACTA-G----CGTT-CTA---A-ACACAAG---A-----GA-AC---G---TTTG---T-G-A--ATT-A-AAT----G--ATATA---A---T---T-T--T-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G--AT---C-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC---------ATGG-CTACAGTATTG-G--AC-AA-----TA--A--A----C--TTA-A---G-GT-AAA-----------------T-T-ATAGC--G-T--ACGTTTATTGA--T---T-T--AAA-A-AGA-GCG-TT-CGAC------TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TACC-TG-T-TAAA---AAT-CAGATT-TACCA-C----CATA-CTC---A-ATAAAAG---GAT-TGAA-AC---AT--TTTG---T-A-A--TAA-T-AAT----G--ATATC---A---G---T-T--C-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G--GA---ACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T---A--ATGT-T-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--ATTTTCATTGA--C---A-T--GAT-G-A-A-GTGTTT-CGATTGA--ATATAT--A----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : T-TTG---A-ACAAACG---AAT-TGAA-CA---AT--TTTG---G-G-A--TAA-T-CGC----A--ACACC---A---T---T-T--C-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T---A--CTGT-C-----TATAG-A--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattcatgtctatcattacagtattaagtagtaAA---ATT-G---TT-TAGTA-C----AATT-TTG---A-ACAAACA---CAT-TGAA-TA---AG--TATG---T-G-A--CAA-C-CAC----G--ACAGC---A---TG--TGT--T-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTA---A-ACAAACA---GAT-TGTA-TC---AT--ACTG---T-G-A---AA-A-GA--------ATAGC---ATAGT---T-T--C-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T------ATACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA--T---T-T--TAA-A-A-AGGCATTT--GAT--A--GTATTT--A----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G--GG---C-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T---G--ATGC-A-----T-TTA-A--AC-AA-----AA--GG-T----T--TTG-A-GCGAAT-ATGG-G--AG-ATTAG-CT-T----------G-T--GCTTTTATCGA--T---CTT--AAA-A-A-A-GCCTTT--GAT-----GTTTTT--A----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G--GT---C-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T---AGAACAT-T-----TAAT------C-GA-----TA--CT-AA---T--TTG-A-ACA-AT-AAAG-ATAAA-GT----ATAT-T--------G-T--GCTTTTATAGA--T---T-T--AAA-G-AGA-GCG-TT-CGAT--T--CCATAA--A----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA
Alignments
lowQualScore : 44444444444444444444444444444444444444 111 1111111 11111111111111 111111 222222222222222 11111 222222 11
lowQualScore : 1 1 1 11111111111111111111111111111111111111 0 0 555 22 2 2 8 2 2 666 22 1 333 44 1 999 22 2 77 111 22 1 1 22 1 333 0 1 66 8888 1 22 1 1 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 1 0 1 1 777 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 2 77 2 33 0 2 1 1 2 1 33333 1 66666 2 0 8888888 1 1 4444 1 99999999999999 444 2222 333 1 999 22 111111 333 444 555 2 7777777777 4444444444 2 0 333 111 1 333 1 1 22 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 11 000000000000000 44444 2 22222 333 1 6666 77 1 1 4 1 1 2 33 444 22222 2 1 1 555555 3 55 0 1 1 44444 888888 1 6 33 77 11 0 0 8888 4444 55555 1 1
lowQualScore : . . . ...................................... . . ... .. . . . . . ... .. . ... .. . ... .. . .. ... .. . . .. . ... . . .. .... . .. . . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . . . ..... . ..... . . ....... . . .... . .............. ... .... ... . ... .. ...... ... ... ... . .......... .......... . . ... ... . ... . . .. . . . . . . . .. ..... .. .. ............... ..... . ..... ... . .... .. . . . . . . .. ... ..... . . . ...... . .. . . . ..... ...... . . .. .. .. . . .... .... ..... . .
lowQualScore : 7 0 0 88888888888888888888888888888888888888 2 7 222 22 5 5 9 0 0 666 88 2 000 88 0 222 88 4 66 111 33 4 4 00 4 888 3 5 00 2222 0 33 3 3 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 2 3 2 2 888 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 7 3 2 2 4 4 55555 4 88888 3 7 8888888 1 1 1111 1 55555555555555 888 4444 999 1 444 11 333333 999 000 111 3 3333333333 2222222222 2 5 000 999 1 444 4 1 33 2 5 4 1 2 2 1 11 88888 66 66 555555555555555 33333 4 99999 888 2 4444 44 2 2 5 2 0 5 00 666 22222 5 2 2 111111 8 55 2 0 2 88888 888888 2 2 44 33 77 1 6 0000 0000 11111 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGCAG-TTAAGTC-ACGGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTANT-GAT-TGTTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTA-T-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTGTGC-GATA--TTT-TT-A--A-TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-T-TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--T-NTT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GNA-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-ATAANA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTGATGAAATTNTAANTGCAG-TTAA-TC-ACGGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTANT-GAT-TGTTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTA-T-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTGTGC-GATA--TTT-TT-A--A-TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-T-TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--T-NTT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GNA-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-ATAANA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGCAG-TTAAGTC-ATTGAAAA--T------AAA------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GAT-TGTTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCA-T-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTGTGT-GATA--TTT-TT-A--A-TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-T-TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTT-ACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-TA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-ATAACA-A--A-A-GG----CT-TAT-T---T--G-G--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGCAG-TTAAGTC-ATTGAAAAG---------AAAT-----AAGTCTGCA--GGTTCT-GAT-TGTTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCA-T-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTGTGT-GAAA--TTT-TT-A--A-TGC--AATTCTAGA--TA--G-TGGCT-T-TT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATT-ACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AATAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A--AAAG-AAC----AGCATA-G---T---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--A--AA--CA-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--AT-A----T--TTG-A-ATG-ATAACA-A--A-A-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGCAG-TTAAGTC-ATTGAAAAG---------AAAT-----AATTCTGCA--GGTTCT-GAT-CGTTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGAA--AGCA-T-CG--GCATGTTAACC--T--CTCAG-CCGTGT-GATA--TTT-TTTA--A-TGC--AATTCTAGAA-AG--T-GGCTT-T-TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATT-ACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAA-T---TG-CACCA-C----TATT-TTAT-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--AT-AC--AT-------TATTG-T--AC-AA-----AA--CT-A----T--TTG-A-ATG-ATAACA-A--A-T-G-----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGCAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AATATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGCAG-TTAAATC-ATTGAAAAG---------AAATT-----AGTCTGCA--GGTTCT-GAT-TGTTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATAA--AGCA-T-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTGTGT-GATA--TTT-TT-A--A-TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-T-TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATT-GCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TG-TC-----------------------ACCA-C----TATG-TTAA-ACAAACT---A---TGT--A-G-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--GC-AC--A--C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-ATTACA-A--A-A-GG----CT-T-T-A---T----TAAGTTTTTGTAGATT---C-T--AAA-AA-G-GCA-TT-AGAT--AGTATTTA----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC---------C-ACGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTATT-GAT-TGTTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTA-T-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTGTGC-GACA--TTT-TT-A--A-TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-T-TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-T---T--T-TTT----G---TG-G--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-ATAATA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC---------C-ACGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTATT--GGTATT-GAT-TGTTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--AGTA-T-CG--ATATTATAACA--C--CATAT-TTGTGC-GACA--TTT-TT-A--A-TGC--TTTTTTAAAC-TC--G-GGGTA-A-TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-T-T---T--T-TTT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATT--T------A-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-ATAATA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TAAC--AGTATAAA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC---------C-AAGAAAAAGTT------AAAATCTAGCATATCTTTT--GGTATT-GAC-TGTTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGAA--AGTA-T-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTGTGC-GACA--TTT-TT-A--A-TGC--TATATTAAAT-TC--A-GGGTA-C-TT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TG-----------A--T-TTTTTTGG---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-ACA-ATAACA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--GAA--GCTTTAATTAA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAT--AGTATATA----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGC----TAG-T------AAATGTTT-----GAAAGCTGGAAAATCGATT--GGGAGC-GAT-TTCTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGAA--AGTA-T-TG--ATATTTTAGGC--T--CCCAT-TTATGT-GATA--TTT-TT-A--A-TGC--TATTTTGACC-TC--A-GGCTT-T-TT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT--CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TG-TT-TAT-CT--AAACT-G---TT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--T-TTT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---T---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G---GAC-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T--A--AT--GT-C-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-ATAATA-A--A-C-GT----TT-A-T-A---T--GTT--GTTTTCGTTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGAT--AGTATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : TAGT-GAT-AGTTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-----CC-TGCA--ATATATTATCTGGT--CATAT---AACC-GATA--TTT-TT-A--A-TCT--CATTTTCAAT-AC--A-GGGTG-T-TT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TG-TT-TGG-GA--AAAAT-T---TT-CACCA-G----CGTC-TTGA-ACGCACG---TAT---A--A-A-C---AAAT-GGT----A---TG-AGGCAAA-TA------GTATT-A---T---A-AC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G---GTA-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT--A--AT--AT-------TATCG----AC-AA-----AG--TT---------TTA-A-ATG-AGAAAA-A--AAC-GA----CT-T-T-A---CT-G-T--GCTTTTATCGA-T---T-T--AAA-AA-AAGCGTTT--GAT--TCGGTTTA----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtcAAATGAAT-TCT-TAT--TGA----GTC-T-TGGGATACATTAGCA--T--CACATCTTGT-T-GATA--TTT-T--A--A-CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTTA-C-TT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTT-ATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TG-TT-CAT-CT--GAGGT-A---TT-TACTG-G----TATT-TTAA-ATAAGCA---AAT-TAA--T-A-C---------TT----GGATTG-A---AAA-TA------ATA---A---T---T-TTGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G---GAA-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T--A--GT---T-C-----AATTA-T--AC-AAAAAAGAA--GT-A----TTGTTA-A-AAA-ATGAC-------C-GCTTAGCT-T-T----------T--GCCTTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GAT-AATCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CG-A--ATCATT-TG--ACATATTGGGT--G--GACAC-ATG-ACGGATA--TGT-TT-AACA-TGA--TATTTAGTGC-T-----GGATA-C-TT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTA-----TA-T--TGTACA---T-ATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AA-TT-TTG-GA--AAACT-T---TT-CACTA-G----TATT-CTAA-CCAATAG---AGT-AGA--A-A-A---A--TGGTT--------------CGAA-GAG----AATAA--G---T---T-TT-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-GGTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T--AC-AT--AA-C-----T-TTG-T--TC-AA-----CA--TT-T----T--ATT-A-ATA-ATAAAATT--A-G-AT----TA-T-C-G---T--G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCG-TT-CGAC--TCCGTTTA----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGCAATTTCA-TCAATGAAAAAG---------------GGTAAAAGTAGT--GGTGAT-GATAAATTG-ATCCACGAAATGTTT-TA---AGAT--AGTT-C-TG--ATGTCATATCT--C--CA-AT-CGGTGC-AAAC--TTT-TT-A--A-TCA--TATAT---AT-TCATG-TGGTA-CATA-TCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCC-AAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG--C-TTT-CA--AAAAT-A---TT-T-TCA-T----CTTT-ATAAGATAAACG----TT-TAA--G-ATC---A--T-AGG----C---GG-A--TGAA-AAC----AAT-TT-A---T---TACC-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATT-GAA-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGTA---TT--G--A--AT---T-C-----TATCA-TAGAC-AC-----AG--TTCA----T--AAA-A-ATG-AAAACA-A--G-A-AA----CT-G-TAA---T--G-T--TCTTTTGTTGA-TTTCC-T--T---AA-G-GCATTTGAGGT--TGTA--TA----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tAAAAGTTTAAAGAAAAAT-----AAAGCCTTT--GCTAGT-GAC-CTACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--TCTT-G-TG--ATATATTGGCT--T--C-----TTGT-T-GAT----TT-GT-A--A-CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-T-TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT--TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G---GAA-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-ATGAC-------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtataT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGAA--TCTT-G-TG--ATATATTGGCT--T--CACATCTTGT-T-GATA--TTT-TT-A--A-CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-T-TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT--TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAC-CA--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G---GAA-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-ATGAC-------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacAAAAGAC------AAAA---GGCAA-----TA--GGTAGC-GAG-TATAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGAA--AGTA-T-TG--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTGTG---ATA--TTT-T--A--A-CGC--TATATTGGAC-AC--T-GGTTA-T-TT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTT-ACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAACT-A---TT-TACTT-C----TGTT-TTAA-ATAAAGG---AAT-CGT--G-A-T---A--T-TTT----G---TG-A--AAAT-GAT----AATGTA-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G---GGA-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A--A--A------------TATTA-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-ATTACA-AG-A-CTGT----AT-T----------G-T--GTTTATGTAGA-T---T-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : tgctgtcaagtctcttTGCAA-TCAAATC-TCAAAACAG---------AAAT-----AAAGCTGTTTTGG--GT-GAT-CGTTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTAA--C-TG---CG--ATATATCATCT--T--CTCAT-AT-CACTGACA--TAT-TC-A--A-TAT--TATTTTAGAT-AC--A-AGCTG-T-TT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTT-ATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-ATA--------C-TAG-CC--TGAGT-A---TA-TAC--------------TGA-ACACACG---AAT---A--A-A-T---A--A-ATG----G---TGTA--CAGATAAT----GATATC-A---T---A-TC-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A---ATA-G-----TATTATA-GA-TAAGATA--T--TG------------A--AT--G--------------------AA-----AA--G----------------------AATA-A--A---------CT-T-T-AT--T--G-T--GCATTTATAGA-T---T-TA-AAA-AA-A-ACATTT--GAT--TCTATAAA----T----AAAAATG--CATTGTG-ACTTAAA
gi|12538 : TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGAA--A-CA-G-CGG-ATATTATTGCT--CTGCACAT--------GACAGGTTTATT-A--AATGG--TATTTTGAAC-TC--T-G-TTT-T-TT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA---------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-T---TT-TACAG-G----TGTT-CTTA-ACAAAAG---AATATGT--A-A-----G--T-GGT----G---CG-A--GGAG-AAC----AGTATA-C---T---A-TC-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A---GTC-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCA--AGCAGT-------TATTA-------AA-----AA--AT-C----C--TTA-A-ATG-GAAATA-A--A-C-GC----TTAT-T-T---T--G-C--GCGTTTGTAGA-T---T-T--AAA-AA-A-G-GCTTATGAT--AGTGTGTA----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacacGTT------GAAATCTGGCAAATCTATT--GGTAGTAGAT-TGCTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGAA--AGTA-T-TG--ATATCATAGCA--C--CATAT-TTGTGT-GATA---TT-TT-A--A-TGT--TTTTTTTAAT-TC--A-GGTTA-T-TT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTT-GCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAATT-G---TT-TACTA-C----AAGT-TTGA-ACAAACC---AA--TGG--A-A-C---AATT-TTT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACATC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C--A--A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACAACTA-G-CG--ATATATTATCG--T--CTCAT-AT-TACAGATA--TAT-TT-A--A-TAT--TATTTTTGAT-AC--T-GGGTG-T-TT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACT-ACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TG-TA-TAG-GC--ATATT-T---TT-CAATA-G----TGTT-TTAA-ACGAGCA---AGT-ATA--C-A-A---A--T-GGT----G---TG-A--TGAA-AAT----AAGGTT-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G---Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTG-T-TTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TAT-ACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TC-CC-TTG-CT--AAAAT-T---TT-T-TCA-CTGTGTATT-AGAA-ATAGAC------T-TAA--T-A-C---T--T-GGT----G---TG-A--AACA-GAA----CATATA-C---T---T-AA-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A---AAA-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T--AC-AT---T-G-----TATTA-T--AC-AA-----AAG-AT-A----T--T-------G-TCAAAA-A--A-C--TAAA-CT-T-T-AT--T--G-T--GCTTTTATTGA-----C-TACGAA-AG-G-GCATTT--GAT--A-CGGTTA----TA---AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GAT-TATAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGGA--AGCA-T-TA--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTGTG---ATA--TTT-TT-A--A-CGC--TTTAATGGAC-TC--T-TGTTA-T-TT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTT-ACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAATT-A---TT-TACTT-C----TATT-TTAA-ATAAATG---AAT-TGT--A-A-T---A--T-TTT----G---TG-A---AAG-TAA----TATAGTAA---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT-------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T--A--A------A-----TATTG-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-ATAATA-A--A-T-GA----CT-G-T-AT--T--G-T--GTTTATGTCAA-T---C-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TGTGT-TAAA--TTT-TT-A--A-TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-T-TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TG---A-T-T---T--T-TTT----G---TT-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TGTTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-ATAATA-A--A-C-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-A--A-TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-G-TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGTCCA--GTA------AATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTCA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-TAACTA-A-----A--T-GGT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A------AA-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A-AAAG-G--A-C-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-A--A-TGA--AATATTCAAT-TC--A-GGTTC-G-TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGT---------------CCAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATAT---TT-TGTCA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-T----A-A-CT--A--A-ATG----G---TG-----AGA-TACTTTTGATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-----AAA-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AAGTCT-C----T--TTA-G-AAG-AGAAAAGG--A-C-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-A--A-TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-G-TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGTCCA--GTA------AATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTTA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-TAACTA-A-----A--T-GGT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTA-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A---GTA-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A-AAAG-G--A-C-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-A--A-TGC--AATATTCGAC-TC--G-GGCTG-T-TT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATT-ATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AG-CA-TGG-GG--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAAGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--T-GGT----G---CG-A--CAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G---GAA-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AA-AA-----AA--A--A----TA-CTA-A-ACA-ATAAAA-T--T-C-GT----CT-T-A-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---C-TC-CAC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-A--A-TGC--AATATTCGAC-TT--G-GGCTG-G-TT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATT-ATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AG-CA-TGG-GA--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAGGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--T-GGT----G---CG-A--TAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G---GAA-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AG-AA-----AA--AA-A----TA-CTA-A-ACA-ATAAAA-A--T-C-GT----CT-G-T-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---A-TC-CGC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-A--A-TAT--TATATTTAATGTC--G-G-ATA-T-GT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATT-ACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-A--A-TGAAATATTTGAAAA-T-----GGAAA-C-TG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AAT-ACACA-ATAA-AG----G--GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TG-TC-TTTGCA--AGAAT-----TT-TACTT-C----AATA-TTCA-ATAATTGTTTAAC-CAA--A-------A--T-GGT----G---TA-A--T--A-CAC-----ATAAC-A---T---T-TT-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA---GTA---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C--A--A----T-C-----TATGA-T--CC-AA-----AA--GT-A----T--TTATC-ATG-TTAAAA-A--A-TGGTGA--CT-T-T-AT--T--G-T--ATGTTTATAGA-T---G-TC-TAT-AA-A-GCATTT--GAT--TGTATTCA----
gi|12551 : -GGCTAAT-TT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACT-ATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TG-TA-TGA-AC--ACACT-T---TT-CACAA-G----TATC-CTAA-ACAAAGG---TAT-TGAT-A-A-T------T-GGT----G---TG-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTT-CCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TA-TCTTCT-CT--AAAAT-----TG-TCTCA-C----AGTTGTTAG-ATACCCG-------TG---C-A-CGTAA--T-TTT----G---T-----CGAA-GAC----AACAAG-A---T---T-T------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A---AAA-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T--A--CA--GT-C------GTTGATAAAT-AG-----AA--TT-A----T--TCA-ACATG-AGAGAA-A--A-A-AT----AC-A-T-A------G-C--GCTTCTGTTGA-T---T-T--TAA-AA-T-GGAATT-TGAC--ATGGTTTA----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATT-ATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---A-TCACGT-GA--AAACT-T---TT-TACTAGCG---CATT-T--A-ACAAACG---G-T-TG-------T---A--T-CTT----GACGTG-A--CCGT-AAT----AGTATG-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G---CAA-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T--A--CA--GA-A-----TATTA-T--AA-AA-----AA--
gi|12554 : -GTT-TCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTTT-TGG-GC--AAGTT-A---TT-TACTA-G----CGTT-CTAA-ACACAAG---A-----G--A-A-C---G--T--TT----G---TG-A--ATTA-AAT----GATATA-A---T---T-TT-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G---ATC-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC--------AT--GG-CTACAGTATTG-G--AC-AA-----TA--A--A----C--TTA-A---G-GTAAA------------------T-T-ATAGC--G-T--ACGTTTATTGA-T---T-T--AAA-AAGA-GCG-TT-CGAC--TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TA-CC-TGT-TA--AAAAT-CAGATT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--T-TTT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---G---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G---GAACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T--A--AT--GT-T-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-ATAATA-A--A-C-GT----TT-A-T-A---T--GTT--ATTTTCATTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGATTGAATATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : -TG-TC-TAT-CATTACAGT-A---TT-AAGTA-G----TATT-T-GA-ACAAACG---AAT-TGA--A-C-A---A--T-TTT----G---GG-A--TAAT-CGC----AACACC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T--A--CT--GT-C-----TATAG-A--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattca--AAATT-G---TT-TAGTA-C----AATT-TTGA-ACAAACA---CAT-TGA--ATA-A---G--T-AT-----G---TG-A--CAAC-CAC----GACAGC-A---TG--TGTT-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTAA-ACAAACA---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-ATAACA-A--A-A-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G---GGC-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T--G--AT--GC-A-----T-TTA-A--AC-AA-----AA--GG-T----T--TTG-A-GCGAATATGG-G--A-G-ATTAG-CT-T----------G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCCTTT--GAT---GTTTTTA----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G---GTC-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T--AGAAC--AT-T-----TAAT------C-GA-----TA--CT-AA---T--TTG-A-ACA-ATAAAG-ATAA-A-GT----ATAT-T--------G-T--GCTTTTATAGA-T---T-T--AAAGAG-A-GCG-TT-CGAT--TCCATAAA----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA
Alignments
lowQualScore : 1111111111111111 333333333333333333 111 1111111 11111111111111 111111 222222222222222 11111 222222 111111 11
lowQualScore : 1 1 1 7777777777777777 777777777777777777 0 0 555 22 2 2 8 2 2 666 22 22 2 0 2 44 1 999 22 2 77 1 000 22 1 1 33 333 0 1 66 8888 1 22 2 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 0 2 1 777 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 2 77 2 33 0 2 1 1 2 1 33333 1 66666 2 0 8888888 1 1 4444 1 99999999999999 444 2222 333 1 999 22 111111 333 444 555 2 7777777777 4444444444 2 0 333 111 1 11 3333 1 22 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 11 000000000000000 44444 2 22222 333 1 6666 77 1 1 4 1 1 1 1 44 33 22222 2 1 1 555555 3 55 0 1 1 44444 000000 1 5 33 77 11 0 0 8888 4444 55555 1 1
lowQualScore : . . . ................ .................. . . ... .. . . . . . ... .. .. . . . .. . ... .. . .. . ... .. . . .. ... . . .. .... . .. . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . . . ..... . ..... . . ....... . . .... . .............. ... .... ... . ... .. ...... ... ... ... . .......... .......... . . ... ... . .. .... . .. . . . . . . . .. ..... .. .. ............... ..... . ..... ... . .... .. . . . . . . . .. .. ..... . . . ...... . .. . . . ..... ...... . . .. .. .. . . .... .... ..... . .
lowQualScore : 7 0 3 1111111111111111 555555555555555555 2 7 222 22 5 4 9 0 0 666 88 88 5 5 0 88 0 222 88 4 66 9 888 33 4 4 44 888 3 5 00 2222 0 33 7 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 3 4 2 888 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 7 3 2 2 4 4 55555 4 88888 3 7 8888888 1 1 1111 1 55555555555555 888 4444 999 1 444 11 333333 999 000 111 3 3333333333 2222222222 2 5 000 999 1 55 3333 1 33 2 5 4 1 2 2 1 11 88888 66 66 555555555555555 33333 4 99999 888 2 4444 44 2 2 5 2 2 0 2 22 44 22222 5 2 2 111111 8 55 2 0 2 88888 111111 2 0 44 33 77 1 6 0000 0000 11111 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCA-CCGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCA-CGGAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCA-TTGAAAA--T------AAA------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-TA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-TAT-T---T--G-G--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCA-TTGAAAAG---------AAAT-----AAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GAAA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--G-TGGCT-TTT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATTACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AATAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A--AAAG-AAC----AGCATA-G---T---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--A--AA--CA-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGC-AGTTAA-GTCA-TTGAAAAG---------AAAT-----AATTCTGCA--GGTTCT-GATCG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-CG--GCATGTTAACC--T--CTCAG-CCG-TGT-GATA--TTT-TTTAA--TGC--AATTCTAGAA-AG--T-GGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAA-T---TG-CACCA-C----TATT-TTAT-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--AT-AC--AT-------TATTG-T--AC-AA-----AA--CT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AT-G-----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGCAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AATATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-ATCA-TTGAAAAG---------AAATT-----AGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATTGCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TG-TC-----------------------ACCA-C----TATG-TTAA-ACAAACT---A---TGT--A-G-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--GC-AC--A--C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-A--AA-GG----CT-T-T-A---T----TAAGTTTTTGTAGATT---C-T--AAA-AA-G-GCA-TT-AGAT--AGTATTTA----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-CGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTGTT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-T---T--TT-TT----G---TG-G--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-CGAAAAAGTT------AAAATCTGGCAAATCTATT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAACA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TTTTTTAAAC-TC--G-GGGTA-ATT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-T-T---T--TT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATT--T------A-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TAAC--AGTATAAA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CA-AGAAAAAGTT------AAAATCTAGCATATCTTTT--GGTATT-GACTG-TTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATATTAAAT-TC--A-GGGTA-CTT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TG-----------A--TT-TTTTTGG---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AACA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--GAA--GCTTTAATTAA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAT--AGTATATA----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGCTAGTAAATGT-----------TT------GAAAGCTGGAAAATCGATT--GGGAGC-GATTT-CTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGGC--T--CCCAT-TTA-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTGACC-TC--A-GGCTT-TTT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT-CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TG-TT-TAT-CT--AAACT-G---TT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---T---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G--GA---C-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T--A--AT--GT-C-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--GTTTTCGTTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGAT--AGTATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : TAGT-GATAG-TTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-------CCTGCA--ATATATTATCTGGT--CATAT---A-ACC-GATA--TTT-TT-AA--TCT--CATTTTCAAT-AC--A-GGGTG-TTT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTTACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TG-TT-TGG-GA--AAAAT-T---TT-CACCA-G----CGTC-TTGA-ACGCACG---TAT---A--A-A-CAA-A--TG-GT----A---TG-AGGCAAA-TA------GTATT-A---T---A-AC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G--GT---A-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT--A--AT--AT-------TATCG----AC-AA-----AG--T-------T--TTA-A-ATG-AGAAAAA-A--AC-GA----CT-T-T-A---CT-G-T--GCTTTTATCGA-T---T-TA-AAA-AA-A-GCGTTT--GAT--TCGGTTTA----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtcAAATGAAT-TCT-TAT--TGA------GTCT-TGGGATACATTAGCA--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-T--AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTTA-CTT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTTATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TG-TT-CAT-CT--GAGGT-A---TT-TACTG-G----TATT-TTAA-ATAAGCA---AAT-TAA--T-A-C---------TT----GGATTG-A---AAA-TA------ATA---A---T---T-TTGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G--GA---A-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T--A--GT---T-C-----AATTA-T--AC-AAAAAAGAA--GT-A----TTGTTA-A-AAA-AT-GAC------C-GCTTAGCT-T-T----------T--GCCTTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GATAA-TCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CGA--ATCA-T-T-TG--ACATATTGGGT--G--GACAC-ATGACG--GATA--TGT-TT-AACATGA--TATTTAGTGC-T-----GGATA-CTT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTAT-----A-T--TGTACA---TATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AA-TT-TTG-GA--AAACT-T---TT-CACTA-G----TATT-CTAA-CCAATAG---AGT-AGA--A-A-A---A--TGGTT--------------CGAA-GAG----AATAA--G---T---T-TT-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-G--GTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T--AC-AT--AA-C-----T-TTG-T--TC-AA-----CA--TT-T----T--ATT-A-ATA-AT-AAAA-TT-AG-AT----TA-T-C-G---T--G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCG-TT-CGAC--TCCGTTTA----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGC-AATTTC-ATCAATGAAAAAG---------------GGTAAAAGTAGT--GGTGAT-GATAAATTG-ATCCACGAAATGTTT-TA---AGA--T--AGTTC-TG--ATGTCATATCT--C--CA-AT-CGG-TGC-AAAC--TTT-TT-AA--TCA--TATAT---AT-TCATG-TGGTA-CATATCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCCAAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG--C-TTT-CA--AAAAT-A---TT-T-TCA-T----CTTT-ATAAGATAAACG----TT-TAA--G-ATC---A--TA-GG----C---GG-A--TGAA-AAC----AAT-TT-A---T---TACC-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATTGA---A-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGTA---TT--G--A--AT---T-C-----TATCA-TAGAC-AC-----AG--TTCA----T--AAA-A-ATG-AA-AACA-A--GA-AA----CT-G-TAA---T--G-T--TCTTTTGTTGA-TTTCC-T--T---AA-G-GCATTTGAGGT--TGTA--TA----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tAAAAGTTTAAAGAAAAAT-----AAAGCCTTT--GCTAGT-GACCT-ACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--C-----TTG-T-T-GAT----TT-GT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtataT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-TT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAC-CA--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacTGC-TGTCAA-GTCT-CTTAAAAGAC------AAAA---GGCAA-----TA--GGTAGC-GAGTA-TAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-T--AA--CGC--TATATTGGAC-AC--T-GGTTA-TTT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTTACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAACT-A---TT-TACTT-C----TGTT-TTAA-ATAAAGG---AAT-CGT--G-A-T---A--TT-TT----G---TG-A--AAAT-GAT----AATGTA-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G--GG---A-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A--A--A------------TATTA-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-AG-ACTGT----AT-T----------G-T--GTTTATGTAGA-T---T-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : TGC-AATCAA-ATCT-CAAAACAG---------AAAT-----AAAGCTGTTTTGG--GT-GATCG-TTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTA--A--C-TG--CG--ATATATCATCT--T--CTCAT-AT--CACTGACA--TAT-TC-AA--TAT--TATTTTAGAT-AC--A-AGCTG-TTT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTTATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-ATA--------C-TAG-CC--TGAGT-A---TA-TAC--------------TGA-ACACACG---AAT---A--A-A-T---A--AA-TG----G---TGTA--CAGATAAT----GATATC-A---T---A-TC-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A--AT---A-G-----TATTATA-GA-TAAGATA--T--TG------------A--AT--G--------------------AA-----AA--G-----------------------AATA-A--A--------CT-T-T-AT--T--G-T--GCATTTATAGA-T---T-TA-AAA-AA-A-ACATTT--GAT--TCTATAAA----T----AAAAATG--CATTGTG-ACTTAAA
gi|12538 : -TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGA--A--A-CAG-CGG-ATATTATTGCT--CTGCACAT---------GACAGGTTTATT-AAA-TGG--TATTTTGAAC-TC--T-G-TTT-TTT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA--------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-T---TT-TACAG-G----TGTT-CTTA-ACAAAAG---AATATGT--A-A-----G--TG-GT----G---CG-A--GGAG-AAC----AGTATA-C---T---A-TC-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A--GT---C-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCA--AGCAGT-------TATTA-------AA-----AA--AT-C----C--TTA-A-ATG-GA-AATA-A--AC-GC----TTAT-T-T---T--G-C--GCGTTTGTAGA-T---T-T--AAA-AA-A-G-GCTTATGAT--AGTGTGTA----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacacGTT------GAAATCTGGCAAATCTATT--GGTAGTAGATTG-CTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGA--A--AGTAT-TG--ATATCATAGCA--C--CATAT-TTG-TGT-GATA---TT-TT-AA--TGT--TTTTTTTAAT-TC--A-GGTTA-TTT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTTGCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAATT-G---TT-TACTA-C----AAGT-TTGA-ACAAACC---AA--TGG--A-A-C---AATTT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACATC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C--A--A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACA--ACTAG-CG--ATATATTATCG--T--CTCAT-AT--TACAGATA--TAT-TT-AA--TAT--TATTTTTGAT-AC--T-GGGTG-TTT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACTACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TG-TA-TAG-GC--ATATT-T---TT-CAATA-G----TGTT-TTAA-ACGAGCA---AGT-ATA--C-A-A---A--TG-GT----G---TG-A--TGAA-AAT----AAGGTT-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G--Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTG-TTTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TATACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TC-CC-TTG-CT--AAAAT-T---TT-T-TCA-CTGTGTATT-AGAA-ATAGAC------T-TAA--T-A-C---T--TG-GT----G---TG-A--AACA-GAA----CATATA-C---T---T-AA-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A--AA---A-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T--AC-AT---T-G-----TATTA-T--AC-AA-----AAG-AT-A----T--T-------G-TC-AAAA-A--AC--TAAA-CT-T-T-AT--T--G-T--GCTTTTATTGA-----C-TACGAA-AG-G-GCATTT--GAT--A-CGGTTA----TA---AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GATTA-TAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGG--A--AGCAT-TA--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-TT-AA--CGC--TTTAATGGAC-TC--T-TGTTA-TTT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTTACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAATT-A---TT-TACTT-C----TATT-TTAA-ATAAATG---AAT-TGT--A-A-T---A--TT-TT----G---TG-A---AAG-TAA----TATAGTAA---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT---------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T--A--A------A-----TATTG-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AATA-A--AT-GA----CT-G-T-AT--T--G-T--GTTTATGTCAA-T---C-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TG-TGT-TAAA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TG---A-T-T---T--TT-TT----G---TT-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TGTTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTCA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-----A---A-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTCAAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGT---------------CCAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATAT---TT-TGTCA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-T----A-A-CT--A--AA-TG----G---TG-----AGA-TACTTTTGATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A----AA---A-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AAGTCT-C----T--TTA-G-AAG-AG-AAAAGG--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTTA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTA-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A--GT---A-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TC--G-GGCTG-TTT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AG-CA-TGG-GG--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAAGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--CAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AA-AA-----AA--A--A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-T--TC-GT----CT-T-A-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---C-TC-CAC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TT--G-GGCTG-GTT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AG-CA-TGG-GA--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAGGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--TAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AG-AA-----AA--AA-A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-A--TC-GT----CT-G-T-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---A-TC-CGC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-AA--TAT--TATATTTAATGTC--G-G-ATA-TGT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATTACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATATTTGAAAA-T-----GGAAA-CTG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AATACACA-ATAA-AG----G--GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TG-TC-TTTGCA--AGAAT-----TT-TACTT-C----AATA-TTCA-ATAATTGTTTAAC-CAA--A-------A--TG-GT----G---TA-A--T--A-CAC-----ATAAC-A---T---T-TT-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA--GT---A---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C--A--A----T-C-----TATGA-T--CC-AA-----AA--GT-A----T--TTATC-ATG-TT-AAAA-A--ATGGTGA--CT-T-T-AT--T--G-T--ATGTTTATAGA-T---G-TC-TAT-AA-A-GCATTT--GAT--TGTATTCA----
gi|12551 : -GGCTAATTT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACTATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TG-TA-TGA-AC--ACACT-T---TT-CACAA-G----TATC-CTAA-ACAAAGG---TAT-TGAT-A-A-T------TG-GT----G---TG-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTTCCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TA-TCTTCT-CT--AAAAT-----TG-TCTCA-C----AGTTGTTAG-ATACCCG-------TG---C-A-CGTAA--TT-TT----G---T-----CGAA-GAC----AACAAG-A---T---T-T------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A--AA---A-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T--A--CA--GT-C------GTTGATAAAT-AG-----AA--TT-A----T--TCA-ACATG-AG-AGAA-A--AA-AT----AC-A-T-A------G-C--GCTTCTGTTGA-T---T-T--TAA-AA-T-GGAATT-TGAC--ATGGTTTA----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATTATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---A-TCACGT-GA--AAACT-T---TT-TACTAGCG---CATT-T--A-ACAAACG---G-T-TG-------T---A--TC-TT----GACGTG-A--CCGT-AAT----AGTATG-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G--CA---A-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T--A--CA--GA-A-----TATTA-T--AA-AA-----AA--
gi|12554 : -GTTTCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTTT-TGG-GC--AAGTT-A---TT-TACTA-G----CGTT-CTAA-ACACAAG---A-----G--A-A-C---G--T--TT----G---TG-A--ATTA-AAT----GATATA-A---T---T-TT-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G--AT---C-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC--------AT--GG-CTACAGTATTG-G--AC-AA-----TA--A--A----C--TTA-A---G-GT-AAA-----------------T-T-ATAGC--G-T--ACGTTTATTGA-T---T-T--AAA-AAGA-GCG-TT-CGAC--TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TA-CC-TGT-TA--AAAAT-CAGATT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---G---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G--GA---ACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T--A--AT--GT-T-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--ATTTTCATTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGATTGAATATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : -TG-TC-TAT-CATTACAGT-A---TT-AAGTA-G----TATT-T-GA-ACAAACG---AAT-TGA--A-C-A---A--TT-TT----G---GG-A--TAAT-CGC----AACACC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T--A--CT--GT-C-----TATAG-A--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattca--AAATT-G---TT-TAGTA-C----AATT-TTGA-ACAAACA---CAT-TGA--ATA-A---G--TA-T-----G---TG-A--CAAC-CAC----GACAGC-A---TG--TGTT-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTAA-ACAAACA---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G--GG---C-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T--G--AT--GC-A-----T-TTA-A--AC-AA-----AA--GG-T----T--TTG-A-GCGAAT-ATGG-G--AG-ATTAG-CT-T----------G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCCTTT--GAT---GTTTTTA----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G--GT---C-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T--AGAAC--AT-T-----TAAT------C-GA-----TA--CT-AA---T--TTG-A-ACA-AT-AAAG-ATAAA-GT----ATAT-T--------G-T--GCTTTTATAGA-T---T-T--AAAGAG-A-GCG-TT-CGAT--TCCATAAA----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111 222222222 33333333 111 1111111 11111111111111 111111 222222222222222 11111 222222 111111 11
lowQualScore : 1 1 1 777777777777777 44 000000000 33333333 2 555 11 2 2 8 0 2 666 22 22 2 0 2 44 1 999 22 2 77 1 000 22 1 1 33 333 0 1 66 8888 1 22 2 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 0 2 1 777 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 2 77 2 33 0 2 1 1 2 1 33333 1 66666 2 0 8888888 1 1 4444 1 99999999999999 444 2222 333 1 999 22 111111 333 444 555 2 7777777777 4444444444 2 0 333 111 1 11 3333 1 22 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 11 000000000000000 44444 2 22222 333 1 6666 77 1 1 4 1 1 1 1 44 33 22222 2 1 1 555555 3 55 0 1 1 44444 000000 1 5 33 77 11 0 0 8888 4444 55555 1 1
lowQualScore : . . . ............... .. ......... ........ . ... .. . . . . . ... .. .. . . . .. . ... .. . .. . ... .. . . .. ... . . .. .... . .. . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . . . ..... . ..... . . ....... . . .... . .............. ... .... ... . ... .. ...... ... ... ... . .......... .......... . . ... ... . .. .... . .. . . . . . . . .. ..... .. .. ............... ..... . ..... ... . .... .. . . . . . . . .. .. ..... . . . ...... . .. . . . ..... ...... . . .. .. .. . . .... .... ..... . .
lowQualScore : 7 0 3 111111111111111 22 888888888 00000000 1 222 11 5 4 9 8 0 666 88 88 5 5 0 88 0 222 88 4 66 9 888 33 4 4 44 888 3 5 00 2222 0 33 7 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 3 4 2 888 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 7 3 2 2 4 4 55555 4 88888 3 7 8888888 1 1 1111 1 55555555555555 888 4444 999 1 444 11 333333 999 000 111 3 3333333333 2222222222 2 5 000 999 1 55 3333 1 33 2 5 4 1 2 2 1 11 88888 66 66 555555555555555 33333 4 99999 888 2 4444 44 2 2 5 2 2 0 2 22 44 22222 5 2 2 111111 8 55 2 0 2 88888 111111 2 0 44 33 77 1 6 0000 0000 11111 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACCGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA----T------AAA--------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-TA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-TAT-T---T--G-G--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GAAA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--G-TGGCT-TTT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATTACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AATAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A--AAAG-AAC----AGCATA-G---T---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--A--AA--CA-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AATTCTGCA--GGTTCT-GATCG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-CG--GCATGTTAACC--T--CTCAG-CCG-TGT-GATA--TTT-TTTAA--TGC--AATTCTAGAA-AG--T-GGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAA-T---TG-CACCA-C----TATT-TTAT-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--AT-AC--AT-------TATTG-T--AC-AA-----AA--CT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AT-G-----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGCAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AATATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-ATCATTGAAAA--G---------AAATT-------AGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATTGCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TG-TC-----------------------ACCA-C----TATG-TTAA-ACAAACT---A---TGT--A-G-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--GC-AC--A--C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-A--AA-GG----CT-T-T-A---T----TAAGTTTTTGTAGATT---C-T--AAA-AA-G-GCA-TT-AGAT--AGTATTTA----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-T---T--TT-TT----G---TG-G--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAACA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TTTTTTAAAC-TC--G-GGGTA-ATT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-T-T---T--TT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATT--T------A-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TAAC--AGTATAAA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----CAA-G-----AAAAA--GTT------AAAATC--TAGCATATCTTTT--GGTATT-GACTG-TTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATATTAAAT-TC--A-GGGTA-CTT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TG-----------A--TT-TTTTTGG---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AACA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--GAA--GCTTTAATTAA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAT--AGTATATA----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGCTAGTAAATGT------------TT------GAAAGC--TGGAAAATCGATT--GGGAGC-GATTT-CTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGGC--T--CCCAT-TTA-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTGACC-TC--A-GGCTT-TTT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT-CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TG-TT-TAT-CT--AAACT-G---TT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---T---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G--GA---C-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T--A--AT--GT-C-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--GTTTTCGTTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGAT--AGTATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : TAGT-GATAG-TTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-------CCTGCA--ATATATTATCTGGT--CATAT---A-ACC-GATA--TTT-TT-AA--TCT--CATTTTCAAT-AC--A-GGGTG-TTT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTTACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TG-TT-TGG-GA--AAAAT-T---TT-CACCA-G----CGTC-TTGA-ACGCACG---TAT---A--A-A-CAA-A--TG-GT----A---TG-AGGCAAA-TA------GTATT-A---T---A-AC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G--GT---A-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT--A--AT--AT-------TATCG----AC-AA-----AG--T-------T--TTA-A-ATG-AGAAAAA-A--AC-GA----CT-T-T-A---CT-G-T--GCTTTTATCGA-T---T-TA-AAA-AA-A-GCGTTT--GAT--TCGGTTTA----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtcAAATGAAT-TCT-TAT--TGA------GTCT-TGGGATACATTAGCA--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-T--AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTTA-CTT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTTATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TG-TT-CAT-CT--GAGGT-A---TT-TACTG-G----TATT-TTAA-ATAAGCA---AAT-TAA--T-A-C---------TT----GGATTG-A---AAA-TA------ATA---A---T---T-TTGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G--GA---A-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T--A--GT---T-C-----AATTA-T--AC-AAAAAAGAA--GT-A----TTGTTA-A-AAA-AT-GAC------C-GCTTAGCT-T-T----------T--GCCTTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GATAA-TCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CGA--ATCA-T-T-TG--ACATATTGGGT--G--GACAC-ATGACG--GATA--TGT-TT-AACATGA--TATTTAGTGC-T-----GGATA-CTT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTAT-----A-T--TGTACA---TATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AA-TT-TTG-GA--AAACT-T---TT-CACTA-G----TATT-CTAA-CCAATAG---AGT-AGA--A-A-A---A--TGGTT--------------CGAA-GAG----AATAA--G---T---T-TT-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-G--GTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T--AC-AT--AA-C-----T-TTG-T--TC-AA-----CA--TT-T----T--ATT-A-ATA-AT-AAAA-TT-AG-AT----TA-T-C-G---T--G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCG-TT-CGAC--TCCGTTTA----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGC-AATTTC-ATCAATGAAAAAGGGT------AAAAGTAGTGG------TGAT--GATAA---ATTGATCC-ACGAAATG----TTT-TA---AGA--T--AGTTC-TG--ATGTCATATCT--C--CA-AT-CGG-TGC-AAAC--TTT-TT-AA--TCA--TATAT---AT-TCATG-TGGTA-CATATCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCCAAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG--C-TTT-CA--AAAAT-A---TT-T-TCA-T----CTTT-ATAAGATAAACG----TT-TAA--G-ATC---A--TA-GG----C---GG-A--TGAA-AAC----AAT-TT-A---T---TACC-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATTGA---A-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGTA---TT--G--A--AT---T-C-----TATCA-TAGAC-AC-----AG--TTCA----T--AAA-A-ATG-AA-AACA-A--GA-AA----CT-G-TAA---T--G-T--TCTTTTGTTGA-TTTCC-T--T---AA-G-GCATTTGAGGT--TGTA--TA----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tAAAA--GTTTAAAGAAAAAT-------AAAGCCTTT--GCTAGT-GACCT-ACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--C-----TTG-T-T-GAT----TT-GT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtataT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-TT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAC-CA--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacTGC-TGTCAA-GTCTCTTAAAA--GAC------AAAA-----GGCAA-----TA--GGTAGC-GAGTA-TAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-T--AA--CGC--TATATTGGAC-AC--T-GGTTA-TTT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTTACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAACT-A---TT-TACTT-C----TGTT-TTAA-ATAAAGG---AAT-CGT--G-A-T---A--TT-TT----G---TG-A--AAAT-GAT----AATGTA-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G--GG---A-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A--A--A------------TATTA-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-AG-ACTGT----AT-T----------G-T--GTTTATGTAGA-T---T-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : TGC-AATCAA-ATCTCAAAACA--G---------AAAT-------AAAGCTGTTTTGG--GT-GATCG-TTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTA--A--C-TG--CG--ATATATCATCT--T--CTCAT-AT--CACTGACA--TAT-TC-AA--TAT--TATTTTAGAT-AC--A-AGCTG-TTT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTTATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-ATA--------C-TAG-CC--TGAGT-A---TA-TAC--------------TGA-ACACACG---AAT---A--A-A-T---A--AA-TG----G---TGTA--CAGATAAT----GATATC-A---T---A-TC-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A--AT---A-G-----TATTATA-GA-TAAGATA--T--TG------------A--AT--G--------------------AA-----AA--G-----------------------AATA-A--A--------CT-T-T-AT--T--G-T--GCATTTATAGA-T---T-TA-AAA-AA-A-ACATTT--GAT--TCTATAAA----T----AAAAATG--CATTGTG-ACTTAAA
gi|12538 : -TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGA--A--A-CAG-CGG-ATATTATTGCT--CTGCACAT---------GACAGGTTTATT-AAA-TGG--TATTTTGAAC-TC--T-G-TTT-TTT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA--------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-T---TT-TACAG-G----TGTT-CTTA-ACAAAAG---AATATGT--A-A-----G--TG-GT----G---CG-A--GGAG-AAC----AGTATA-C---T---A-TC-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A--GT---C-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCA--AGCAGT-------TATTA-------AA-----AA--AT-C----C--TTA-A-ATG-GA-AATA-A--AC-GC----TTAT-T-T---T--G-C--GCGTTTGTAGA-T---T-T--AAA-AA-A-G-GCTTATGAT--AGTGTGTA----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacac--GTT------GAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTAGTAGATTG-CTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGA--A--AGTAT-TG--ATATCATAGCA--C--CATAT-TTG-TGT-GATA---TT-TT-AA--TGT--TTTTTTTAAT-TC--A-GGTTA-TTT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTTGCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAATT-G---TT-TACTA-C----AAGT-TTGA-ACAAACC---AA--TGG--A-A-C---AATTT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACATC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C--A--A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACA--ACTAG-CG--ATATATTATCG--T--CTCAT-AT--TACAGATA--TAT-TT-AA--TAT--TATTTTTGAT-AC--T-GGGTG-TTT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACTACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TG-TA-TAG-GC--ATATT-T---TT-CAATA-G----TGTT-TTAA-ACGAGCA---AGT-ATA--C-A-A---A--TG-GT----G---TG-A--TGAA-AAT----AAGGTT-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G--Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTG-TTTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TATACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TC-CC-TTG-CT--AAAAT-T---TT-T-TCA-CTGTGTATT-AGAA-ATAGAC------T-TAA--T-A-C---T--TG-GT----G---TG-A--AACA-GAA----CATATA-C---T---T-AA-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A--AA---A-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T--AC-AT---T-G-----TATTA-T--AC-AA-----AAG-AT-A----T--T-------G-TC-AAAA-A--AC--TAAA-CT-T-T-AT--T--G-T--GCTTTTATTGA-----C-TACGAA-AG-G-GCATTT--GAT--A-CGGTTA----TA---AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GATTA-TAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGG--A--AGCAT-TA--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-TT-AA--CGC--TTTAATGGAC-TC--T-TGTTA-TTT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTTACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAATT-A---TT-TACTT-C----TATT-TTAA-ATAAATG---AAT-TGT--A-A-T---A--TT-TT----G---TG-A---AAG-TAA----TATAGTAA---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT---------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T--A--A------A-----TATTG-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AATA-A--AT-GA----CT-G-T-AT--T--G-T--GTTTATGTCAA-T---C-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TG-TGT-TAAA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TG---A-T-T---T--TT-TT----G---TT-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TGTTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTCA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-----A---A-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTCAAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGT---------------CCAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATAT---TT-TGTCA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-T----A-A-CT--A--AA-TG----G---TG-----AGA-TACTTTTGATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A----AA---A-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AAGTCT-C----T--TTA-G-AAG-AG-AAAAGG--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTTA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTA-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A--GT---A-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TC--G-GGCTG-TTT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AG-CA-TGG-GG--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAAGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--CAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AA-AA-----AA--A--A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-T--TC-GT----CT-T-A-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---C-TC-CAC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TT--G-GGCTG-GTT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AG-CA-TGG-GA--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAGGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--TAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AG-AA-----AA--AA-A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-A--TC-GT----CT-G-T-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---A-TC-CGC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-AA--TAT--TATATTTAATGTC--G-G-ATA-TGT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATTACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATATTTGAAAA-T-----GGAAA-CTG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AATACACA-ATAA-AG----G--GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TG-TC-TTTGCA--AGAAT-----TT-TACTT-C----AATA-TTCA-ATAATTGTTTAAC-CAA--A-------A--TG-GT----G---TA-A--T--A-CAC-----ATAAC-A---T---T-TT-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA--GT---A---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C--A--A----T-C-----TATGA-T--CC-AA-----AA--GT-A----T--TTATC-ATG-TT-AAAA-A--ATGGTGA--CT-T-T-AT--T--G-T--ATGTTTATAGA-T---G-TC-TAT-AA-A-GCATTT--GAT--TGTATTCA----
gi|12551 : -GGCTAATTT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACTATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TG-TA-TGA-AC--ACACT-T---TT-CACAA-G----TATC-CTAA-ACAAAGG---TAT-TGAT-A-A-T------TG-GT----G---TG-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTTCCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TA-TCTTCT-CT--AAAAT-----TG-TCTCA-C----AGTTGTTAG-ATACCCG-------TG---C-A-CGTAA--TT-TT----G---T-----CGAA-GAC----AACAAG-A---T---T-T------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A--AA---A-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T--A--CA--GT-C------GTTGATAAAT-AG-----AA--TT-A----T--TCA-ACATG-AG-AGAA-A--AA-AT----AC-A-T-A------G-C--GCTTCTGTTGA-T---T-T--TAA-AA-T-GGAATT-TGAC--ATGGTTTA----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATTATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---A-TCACGT-GA--AAACT-T---TT-TACTAGCG---CATT-T--A-ACAAACG---G-T-TG-------T---A--TC-TT----GACGTG-A--CCGT-AAT----AGTATG-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G--CA---A-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T--A--CA--GA-A-----TATTA-T--AA-AA-----AA--
gi|12554 : -GTTTCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTTT-TGG-GC--AAGTT-A---TT-TACTA-G----CGTT-CTAA-ACACAAG---A-----G--A-A-C---G--T--TT----G---TG-A--ATTA-AAT----GATATA-A---T---T-TT-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G--AT---C-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC--------AT--GG-CTACAGTATTG-G--AC-AA-----TA--A--A----C--TTA-A---G-GT-AAA-----------------T-T-ATAGC--G-T--ACGTTTATTGA-T---T-T--AAA-AAGA-GCG-TT-CGAC--TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TA-CC-TGT-TA--AAAAT-CAGATT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---G---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G--GA---ACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T--A--AT--GT-T-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--ATTTTCATTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGATTGAATATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : -TG-TC-TAT-CATTACAGT-A---TT-AAGTA-G----TATT-T-GA-ACAAACG---AAT-TGA--A-C-A---A--TT-TT----G---GG-A--TAAT-CGC----AACACC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T--A--CT--GT-C-----TATAG-A--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattca--AAATT-G---TT-TAGTA-C----AATT-TTGA-ACAAACA---CAT-TGA--ATA-A---G--TA-T-----G---TG-A--CAAC-CAC----GACAGC-A---TG--TGTT-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTAA-ACAAACA---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G--GG---C-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T--G--AT--GC-A-----T-TTA-A--AC-AA-----AA--GG-T----T--TTG-A-GCGAAT-ATGG-G--AG-ATTAG-CT-T----------G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCCTTT--GAT---GTTTTTA----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G--GT---C-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T--AGAAC--AT-T-----TAAT------C-GA-----TA--CT-AA---T--TTG-A-ACA-AT-AAAG-ATAAA-GT----ATAT-T--------G-T--GCTTTTATAGA-T---T-T--AAAGAG-A-GCG-TT-CGAT--TCCATAAA----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA
Alignments
lowQualScore : 11 222222222 33333333 111 1111111 11111111111111 111111 222222222222222 11111 222222 111111 11
lowQualScore : 1 1 1 00 1 3 4444 44 000000000 33333333 2 555 11 2 2 8 0 2 666 22 22 2 0 2 44 1 999 22 2 77 1 000 22 1 1 33 333 0 1 66 8888 1 22 2 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 0 2 1 777 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 2 77 2 33 0 2 1 1 2 1 33333 1 66666 2 0 8888888 1 1 4444 1 99999999999999 444 2222 333 1 999 22 111111 333 444 555 2 7777777777 4444444444 2 0 333 111 1 11 3333 1 22 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 11 000000000000000 44444 2 22222 333 1 6666 77 1 1 4 1 1 1 1 44 33 22222 2 1 1 555555 3 55 0 1 1 44444 000000 1 5 33 77 11 0 0 8888 4444 55555 1 1
lowQualScore : . . . .. . . .... .. ......... ........ . ... .. . . . . . ... .. .. . . . .. . ... .. . .. . ... .. . . .. ... . . .. .... . .. . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . . . ..... . ..... . . ....... . . .... . .............. ... .... ... . ... .. ...... ... ... ... . .......... .......... . . ... ... . .. .... . .. . . . . . . . .. ..... .. .. ............... ..... . ..... ... . .... .. . . . . . . . .. .. ..... . . . ...... . .. . . . ..... ...... . . .. .. .. . . .... .... ..... . .
lowQualScore : 7 0 3 44 8 6 7777 22 888888888 00000000 1 222 11 5 4 9 8 0 666 88 88 5 5 0 88 0 222 88 4 66 9 888 33 4 4 44 888 3 5 00 2222 0 33 7 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 3 4 2 888 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 7 3 2 2 4 4 55555 4 88888 3 7 8888888 1 1 1111 1 55555555555555 888 4444 999 1 444 11 333333 999 000 111 3 3333333333 2222222222 2 5 000 999 1 55 3333 1 33 2 5 4 1 2 2 1 11 88888 66 66 555555555555555 33333 4 99999 888 2 4444 44 2 2 5 2 2 0 2 22 44 22222 5 2 2 111111 8 55 2 0 2 88888 111111 2 0 44 33 77 1 6 0000 0000 11111 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA----T------AAA--------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-TA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-TAT-T---T--G-G--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GAAA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--G-TGGCT-TTT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATTACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AATAT-T---TT-CACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A--AAAG-AAC----AGCATA-G---T---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--A--AA--CA-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AATTCTGCA--GGTTCT-GATCG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-CG--GCATGTTAACC--T--CTCAG-CCG-TGT-GATA--TTT-TTTAA--TGC--AATTCTAGAA-AG--T-GGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATTACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAA-T---TG-CACCA-C----TATT-TTAT-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--AT-AC--AT-------TATTG-T--AC-AA-----AA--CT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AT-G-----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGCAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AATATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-ATCATTGAAAA--G---------AAATT-------AGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--AATTCTAGA--TA--GTGGCTT-TTT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATTGCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TG-TC-----------------------ACCA-C----TATG-TTAA-ACAAACT---A---TGT--A-G-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T--GC-AC--A--C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-A--AA-GG----CT-T-T-A---T----TAAGTTTTTGTAGATT---C-T--AAA-AA-G-GCA-TT-AGAT--AGTATTTA----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-T---T--TT-TT----G---TG-G--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAACA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TTTTTTAAAC-TC--G-GGGTA-ATT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-T-T---T--TT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATT--T------A-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TAAC--AGTATAAA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----CAA-G-----AAAAA--GTT------AAAATC--TAGCATATCTTTT--GGTATT-GACTG-TTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGC--TATATTAAAT-TC--A-GGGTA-CTT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACT-G---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TG-----------A--TT-TTTTTGG---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AACA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--GAA--GCTTTAATTAA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAT--AGTATATA----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGCTAGTAAATGT------------TT------GAAAGC--TGGAAAATCGATT--GGGAGC-GATTT-CTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGGC--T--CCCAT-TTA-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTGACC-TC--A-GGCTT-TTT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT-CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TG-TT-TAT-CT--AAACT-G---TT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---T---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G--GA---C-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T--A--AT--GT-C-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--GTTTTCGTTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGAT--AGTATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : TAGT-GATAG-TTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-------CCTGCA--ATATATTATCTGGT--CATAT---A-ACC-GATA--TTT-TT-AA--TCT--CATTTTCAAT-AC--A-GGGTG-TTT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTTACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TG-TT-TGG-GA--AAAAT-T---TT-CACCA-G----CGTC-TTGA-ACGCACG---TAT---A--A-A-CAA-A--TG-GT----A---TG-AGGCAAA-TA------GTATT-A---T---A-AC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G--GT---A-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT--A--AT--AT-------TATCG----AC-AA-----AG--T-------T--TTA-A-ATG-AGAAAAA-A--AC-GA----CT-T-T-A---CT-G-T--GCTTTTATCGA-T---T-TA-AAA-AA-A-GCGTTT--GAT--TCGGTTTA----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtcAAATGAAT-TCT-TAT--TGA------GTCT-TGGGATACATTAGCA--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-T--AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTTA-CTT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTTATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TG-TT-CAT-CT--GAGGT-A---TT-TACTG-G----TATT-TTAA-ATAAGCA---AAT-TAA--T-A-C---------TT----GGATTG-A---AAA-TA------ATA---A---T---T-TTGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G--GA---A-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T--A--GT---T-C-----AATTA-T--AC-AAAAAAGAA--GT-A----TTGTTA-A-AAA-AT-GAC------C-GCTTAGCT-T-T----------T--GCCTTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GATAA-TCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CGA--ATCA-T-T-TG--ACATATTGGGT--G--GACAC-ATGACG--GATA--TGT-TT-AACATGA--TATTTAGTGC-T-----GGATA-CTT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTAT-----A-T--TGTACA---TATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AA-TT-TTG-GA--AAACT-T---TT-CACTA-G----TATT-CTAA-CCAATAG---AGT-AGA--A-A-A---A--TGGTT--------------CGAA-GAG----AATAA--G---T---T-TT-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-G--GTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T--AC-AT--AA-C-----T-TTG-T--TC-AA-----CA--TT-T----T--ATT-A-ATA-AT-AAAA-TT-AG-AT----TA-T-C-G---T--G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCG-TT-CGAC--TCCGTTTA----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGC-AATTTC-ATCAATGAAAAAGGGT------AAAAGTAGTGG------TGAT--GATAA---ATTGATCC-ACGAAATG----TTT-TA---AGA--T--AGTTC-TG--ATGTCATATCT--C--CA-AT-CGG-TGC-AAAC--TTT-TT-AA--TCA--TATAT---AT-TCATG-TGGTA-CATATCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCCAAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG--C-TTT-CA--AAAAT-A---TT-T-TCA-T----CTTT-ATAAGATAAACG----TT-TAA--G-ATC---A--TA-GG----C---GG-A--TGAA-AAC----AAT-TT-A---T---TACC-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATTGA---A-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGTA---TT--G--A--AT---T-C-----TATCA-TAGAC-AC-----AG--TTCA----T--AAA-A-ATG-AA-AACA-A--GA-AA----CT-G-TAA---T--G-T--TCTTTTGTTGA-TTTCC-T--T---AA-G-GCATTTGAGGT--TGTA--TA----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tTAAAAA--GTTTAAAGAAAAAT-------AAAGCCTTT--GCTAGT-GACCT-ACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--C-----TTG-T-T-GAT----TT-GT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtaT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-TT-AA--CGG--TATTTTTAAT-TC--T-GGTCA-TTT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT-TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAC-CA--AAGAT-A---TT-TACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G--GA---A-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T--A--AT---T-C-----CATTA-T--ACAAA-----AA--GT-A----TTATTA-A-AAA-AT-GAC------C-G-----CT-T-A-G---CTTG-T--GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacTGC-TGTCAA-GTCTCTTAAAA--GAC------AAAA-----GGCAA-----TA--GGTAGC-GAGTA-TAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-T--AA--CGC--TATATTGGAC-AC--T-GGTTA-TTT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTTACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAACT-A---TT-TACTT-C----TGTT-TTAA-ATAAAGG---AAT-CGT--G-A-T---A--TT-TT----G---TG-A--AAAT-GAT----AATGTA-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G--GG---A-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A--A--A------------TATTA-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-TACA-AG-ACTGT----AT-T----------G-T--GTTTATGTAGA-T---T-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : TGC-AATCAA-ATCTCAAAACA--G---------AAAT-------AAAGCTGTTTTGG--GT-GATCG-TTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTA--A--C-TG--CG--ATATATCATCT--T--CTCAT-AT--CACTGACA--TAT-TC-AA--TAT--TATTTTAGAT-AC--A-AGCTG-TTT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTTATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-ATA--------C-TAG-CC--TGAGT-A---TA-TAC--------------TGA-ACACACG---AAT---A--A-A-T---A--AA-TG----G---TGTA--CAGATAAT----GATATC-A---T---A-TC-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A--AT---A-G-----TATTATA-GA-TAAGATA--T--TG------------A--AT--G--------------------AA-----AA--G-----------------------AATA-A--A--------CT-T-T-AT--T--G-T--GCATTTATAGA-T---T-TA-AAA-AA-A-ACATTT--GAT--TCTATAAA----T----AAAAATG--CATTGTG-ACTTAAA
gi|12538 : -TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGA--A--A-CAG-CGG-ATATTATTGCT--CTGCACAT---------GACAGGTTTATT-AAA-TGG--TATTTTGAAC-TC--T-G-TTT-TTT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA--------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TG-TT-TAT-CT--AAGAT-T---TT-TACAG-G----TGTT-CTTA-ACAAAAG---AATATGT--A-A-----G--TG-GT----G---CG-A--GGAG-AAC----AGTATA-C---T---A-TC-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A--GT---C-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCA--AGCAGT-------TATTA-------AA-----AA--AT-C----C--TTA-A-ATG-GA-AATA-A--AC-GC----TTAT-T-T---T--G-C--GCGTTTGTAGA-T---T-T--AAA-AA-A-G-GCTTATGAT--AGTGTGTA----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacac--GTT------GAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTAGTAGATTG-CTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGA--A--AGTAT-TG--ATATCATAGCA--C--CATAT-TTG-TGT-GATA---TT-TT-AA--TGT--TTTTTTTAAT-TC--A-GGTTA-TTT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTTGCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAATT-G---TT-TACTA-C----AAGT-TTGA-ACAAACC---AA--TGG--A-A-C---AATTT-TT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACATC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C--A--A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACA--ACTAG-CG--ATATATTATCG--T--CTCAT-AT--TACAGATA--TAT-TT-AA--TAT--TATTTTTGAT-AC--T-GGGTG-TTT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACTACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TG-TA-TAG-GC--ATATT-T---TT-CAATA-G----TGTT-TTAA-ACGAGCA---AGT-ATA--C-A-A---A--TG-GT----G---TG-A--TGAA-AAT----AAGGTT-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G--Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTG-TTTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TATACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TC-CC-TTG-CT--AAAAT-T---TT-T-TCA-CTGTGTATT-AGAA-ATAGAC------T-TAA--T-A-C---T--TG-GT----G---TG-A--AACA-GAA----CATATA-C---T---T-AA-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A--AA---A-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T--AC-AT---T-G-----TATTA-T--AC-AA-----AAG-AT-A----T--T-------G-TC-AAAA-A--AC--TAAA-CT-T-T-AT--T--G-T--GCTTTTATTGA-----C-TACGAA-AG-G-GCATTT--GAT--A-CGGTTA----TA---AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GATTA-TAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGG--A--AGCAT-TA--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-TT-AA--CGC--TTTAATGGAC-TC--T-TGTTA-TTT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTTACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAATT-A---TT-TACTT-C----TATT-TTAA-ATAAATG---AAT-TGT--A-A-T---A--TT-TT----G---TG-A---AAG-TAA----TATAGTAA---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT---------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T--A--A------A-----TATTG-T--GC-AA-----AC--TT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AATA-A--AT-GA----CT-G-T-AT--T--G-T--GTTTATGTCAA-T---C-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TG-TGT-TAAA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTAAAC-TC--G-GGGTG-TTT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTTACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACT-G---TT-TACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TG---A-T-T---T--TT-TT----G---TT-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T--A--AT--TT-C-----TGTTG-T--AC-AA-----AA--TT-A----T--TTA-A-ACA-AT-AATA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-TA-GCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTCA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-----A---A-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTCAAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGT---------------CCAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATAT---TT-TGTCA------CATA-TTAA-GT-AATA---GAT-T----A-A-CT--A--AA-TG----G---TG-----AGA-TACTTTTGATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A----AA---A-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AAGTCT-C----T--TTA-G-AAG-AG-AAAAGG--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGA--AATATTTGAT-TC--A-GGTTC-GTT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATTACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAAT-A---TTCTGTTA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--TG-GT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTA-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A--GT---A-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T--A--AT--GG-C-----TTTAG-G--AC-AA-----AA--GT-ATCTTT--CTA-A-GAG-A--AAAG-G--AC-GT----TT-T-T-AT--T--G-T--ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TC--G-GGCTG-TTT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AG-CA-TGG-GG--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAAGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--CAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AA-AA-----AA--A--A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-T--TC-GT----CT-T-A-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---C-TC-CAC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-AA--TGC--AATATTCGAC-TT--G-GGCTG-GTT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATTATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AG-CA-TGG-GA--AAACT-T---TT-TACCA-G----CATA-TTAA-ATAGGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--TG-GT----G---CG-A--TAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G--GA---A-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T--AC-AA--AA-C------ATTA-T--AG-AA-----AA--AA-A----TA-CTA-A-ACA-AT-AAAA-A--TC-GT----CT-G-T-A---CT-G-T--GCATTCATTGA-T---A-TC-CGC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-AA--TAT--TATATTTAATGTC--G-G-ATA-TGT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATTACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATATTTGAAAA-T-----GGAAA-CTG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AATACACA-ATAA-AG----G--GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TG-TC-TTTGCA--AGAAT-----TT-TACTT-C----AATA-TTCA-ATAATTGTTTAAC-CAA--A-------A--TG-GT----G---TA-A--T--A-CAC-----ATAAC-A---T---T-TT-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA--GT---A---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C--A--A----T-C-----TATGA-T--CC-AA-----AA--GT-A----T--TTATC-ATG-TT-AAAA-A--ATGGTGA--CT-T-T-AT--T--G-T--ATGTTTATAGA-T---G-TC-TAT-AA-A-GCATTT--GAT--TGTATTCA----
gi|12551 : -GGCTAATTT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACTATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TG-TA-TGA-AC--ACACT-T---TT-CACAA-G----TATC-CTAA-ACAAAGG---TAT-TGAT-A-A-T------TG-GT----G---TG-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTTCCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TA-TCTTCT-CT--AAAAT-----TG-TCTCA-C----AGTTGTTAG-ATACCCG-------TG---C-A-CGTAA--TT-TT----G---T-----CGAA-GAC----AACAAG-A---T---T-T------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A--AA---A-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T--A--CA--GT-C------GTTGATAAAT-AG-----AA--TT-A----T--TCA-ACATG-AG-AGAA-A--AA-AT----AC-A-T-A------G-C--GCTTCTGTTGA-T---T-T--TAA-AA-T-GGAATT-TGAC--ATGGTTTA----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATTATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---A-TCACGT-GA--AAACT-T---TT-TACTAGCG---CATT-T--A-ACAAACG---G-T-TG-------T---A--TC-TT----GACGTG-A--CCGT-AAT----AGTATG-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G--CA---A-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T--A--CA--GA-A-----TATTA-T--AA-AA-----AA--
gi|12554 : -GTTTCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTTT-TGG-GC--AAGTT-A---TT-TACTA-G----CGTT-CTAA-ACACAAG---A-----G--A-A-C---G--T--TT----G---TG-A--ATTA-AAT----GATATA-A---T---T-TT-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G--AT---C-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC--------AT--GG-CTACAGTATTG-G--AC-AA-----TA--A--A----C--TTA-A---G-GT-AAA-----------------T-T-ATAGC--G-T--ACGTTTATTGA-T---T-T--AAA-AAGA-GCG-TT-CGAC--TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TA-CC-TGT-TA--AAAAT-CAGATT-TACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--TT-TT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---G---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G--GA---ACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T--A--AT--GT-T-----AATTA-T--CC-AG-----AA--TT-A----T--TTA-T-ATG-AT-AATA-A--AC-GT----TT-A-T-A---T--GTT--ATTTTCATTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGATTGAATATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : -TG-TC-TAT-CATTACAGT-A---TT-AAGTA-G----TATT-T-GA-ACAAACG---AAT-TGA--A-C-A---A--TT-TT----G---GG-A--TAAT-CGC----AACACC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T--A--CT--GT-C-----TATAG-A--AC-AA-----AC--TT-A----T--TTA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattca--AAATT-G---TT-TAGTA-C----AATT-TTGA-ACAAACA---CAT-TGA--ATA-A---G--TA-T-----G---TG-A--CAAC-CAC----GACAGC-A---TG--TGTT-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G--GC---A-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTAA-ACAAACA---GAT-TGT--A-T-C---A--TA-CT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GA---A-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-----AT--ACAC-----TATTG-T--AC-AA-----AA--AT-A----T--TTG-A-ATG-AT-AACA-A--AA-GG----CT-T-T-AT--T--G-T--GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G--GG---C-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T--G--AT--GC-A-----T-TTA-A--AC-AA-----AA--GG-T----T--TTG-A-GCGAAT-ATGG-G--AG-ATTAG-CT-T----------G-T--GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCCTTT--GAT---GTTTTTA----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G--GT---C-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T--AGAAC--AT-T-----TAAT------C-GA-----TA--CT-AA---T--TTG-A-ACA-AT-AAAG-ATAAA-GT----ATAT-T--------G-T--GCTTTTATAGA-T---T-T--AAAGAG-A-GCG-TT-CGAT--TCCATAAA----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA
blockSeqs : A A A TA T T ATTG AG TTTAAAGAA GTAGTGG G TTT TC A A G A TTC AC TC G G GG T TGG TG T CT A ACT GG A T CA AAA A TG ATG G AA A GCACTTA T A TAAA G AG GTTA A GGT A TA T T TCC GA CCCGG T A ACAGCG C T C AC A TA G A T T A CATT A CAGA C CTGTGT G G TTTA A AAACAAA GGT TTTG GAT T GGC TA CTTTTG GTA TAG AGT A GTGAGT CAGAATG T GAT TTT C TT TTGT C TA A A T C C T T CA ACGGT CA GC ATGGCTACAG GATAA A AAAAG GTC C TCTT TG T C T A A C G TA CT CTTAG A . A TAGC A AA A T TTCC ACGAA G G AT GA TG ACAC ATAC GTCA T A
blockSeqs : A A A A T . ATTG . TTA TCTGGC T A TC . . G . A . . G . G G TGC . T CT . ACA . . . A C A A GT C T A . T A AAT G AT . . A A AG C . TCC . CGTAA T A C . T C AC A G G . . A A GCA A AT C GCGC . . G . GAACAAT AC . ACG . A A CA TA TAG G G TATCA TGAAT T A . . . A . A A A T . T T . AA ACT . . GAACATT ATAG A . GA . TCTT TA . . T . . C . T TG TAAA A . . CTT T A A . CT AAAA . G AT AT . ACAC A GAT . A
blockSeqs : A A A A T . ATTG . TTA TCTGGC G A TC . . G . A . . G . . T TGC . T C . GT . . . . C A C G C T . . T A A G AG . . A A TA . . G . AAT T G . . C A AC . G A . . . T CA C T . CT . . G . CACGTAA AC . . . C G CG GC . . . GAGT TT T . . . . A . A . A T . . T . . AC . . CATAAC GT . . A . A TA . . T . . C . G A TTAG . . . CTT T A A . CT AAAG . G GT A . ACAC . GAT . A
blockSeqs : C T T A C . ACGA . TTA TCTAGC A A AT . . . . A . . G . . T C . A C . GT . . . . C A C T G T . . G G A C AA . . A C TA . . G . AAT T T . . C A GC . A G . . . T CA C T . CT . . A . AGATCA AC . . . C G CG GC . . . GAGT TT A . . . . A . A . T A . . C . . AT . . AGCAGT GT . . C . . A . . C . . T . . T TGA . . . TT . A T . T AAAG . . GT T . . . GAT . A
blockSeqs : C T T A A . ACGA . TTG GCTGGA A T AT . . . . C . . G . . T C . A C . GT . . . . C A T G G G . . G G A C AA . . T C TG . . T . AGA T T . . C T AC . T G . . . T CT C G . CT . . A . ACTAAA TT . . . C C CG GC . . . G TT A . . . . C . A . T A . . C . . AC . . CAAAAC GT . . A . . A . . C . . T . . A G . . . TT . . T . T AAAG . . GT T . . . CTT . A
blockSeqs : C T T T T . AATG . GTA TCTGGC A T AT . . . . T . . G . . T C . A T . GC . . . . C A C G G A . . G G A C AA . . T C A . . T . AGA C T . . C A A . T G . . . A CT C G . CC . . A . ACTAAA TT . . . T C TG GC . . . G TG A . . . . C . A . A A . . C . . AC . . CAAAAC GT . . T . . . . . C . . C . . C G . . . CT . . T . C AAAA . . GT T . . . CTT . A
blockSeqs : C C G A C . TCTT . ACA GGC A T AG . . . . C . . G . . T A . C T . GC . . . . C G T A C A . . T G A A AG . . T C A . . T . AGA C T . . C A A . T G . . . G CT A G . CC . . A . AATAAG TT . . . C C GA GC . . . G TG G . . . . C . A . A A . . T . . AT . . ATACAC GT . . T . . . . . T . . T . . C T . . . TT . . T . C TGCT . . GT C . . . CTT . C
blockSeqs : A A A . C . TCAA . TTG TT A T AG . . . . T . . G . . A A . A T . GC . . . . C C T A G T . . C A A A TG . . T T A . . T . TGA C T . . T A A . G G . . . A CT G G . CC . . G . TATCA TT . . . T A CA TC . . . T TG A . . . . A . G . T A . . T . . A . . AACAC AT . . T . . . . . T . . A . . C T . . . TT . . C . C TGCT . . AT T . . . CAC . T
blockSeqs : . . . A . . T A T AA . . . . T . . G . . A A . A T . GT . . . . T T C A T G . . T T A T GA . . T T G . . G . AAG C T . . T T A . G G . . . T GA C T . CC . . T . TATCA GG . . . T T TA TT . . . T TG T . . . . T . A . G T . . A . . A . . TACAT AT . . T . . . . . A . . C . . C T . . . TT . . A . C TGCT . . GT C . . . CTC . T
blockSeqs : . . . . . . T A T AG . . . . C . . C . . A C . A A . CC . . . . G G T T A A . . T T A A TA . . T A G . . A . AGA T G . . T C A . A G . . . T CT A A . GC . . A . TAGCA AG . . . T T TA TT . . . T CG A . . . . A . A . C G . . C . . A . . CACAC GT . . T . . . . . T . . A . . C T . . . TT . . C . A CCAC . . AT T . . . GTT . A
blockSeqs : . . T . A AG . . . . A . . C . . C A . A C . GC . . . . A T T T G A . . A C T A TG . . T T G . . T . TTA C G . . T A C . C G . . . A GA A T . GT . . A . AAATT TT . . . A G TA AT . . . A CG C . . . . A . G . C T . . T . . T . . ATTTC AT . . G . . . . . T . . C . . C A . . . TT . . T . T CCGC . . GC T . . . CAT . T
blockSeqs : . . T . T AG . . . . T . . G . . A T . A T . GT . . . . A T T T T A . . T T A A AA . . G G G . . T . CGG C C . . C A T . A G . . . A CA A A . GT . . A . AATTT AT . . . C A TG AT . . . T CG T . . . . A . G . G A . . A . . T . . ATTTC AT . . T . . . . . A . . C . . G T . . . TT . . A . C CTAT . . AT C . . . GAA . T
blockSeqs : G . . . . T . . G . . A T . A T . GT . . . . G G C T T A . . T T T G GA . . G G T . . T . CGG T C . . A A C . G G . . . A CT C A . TC . . A . AAACA GG . . . G A CA TA . . . T CT T . . . . A . A . G A . . A . . T . . ATTTC AT . . T . . . . . A . . C . . A A . . . CT . . A . C AAAG . . GT C . . . GTT . G
blockSeqs : . . . . T . . C . . T T . T A . T . . . . G A T A T A . . A A T A AG . . T C T . . T . CAA C A . . G T C . G G . . . A CA G A . GT . . A . AAAAA TT . . . C A CG TC . . . T CG A . . . . G . C . T T . . T . . G . . ATGTC AT . . G . . . . . T . . C . . C T . . . CT . . A . C TAA . . GT T . . . GTT . T
blockSeqs : . . . . C . . G . . A T . A T . G . . . . C G C T C A . . A C A A TT . . C T T . . T . TAA A T . . A A T . G G . . . A CG A A . GT . . A . TGATA GG . . . T G TA TA . . . A CG T . . . . T . A . T T . . G . . T . . CATTG GT . . G . . . . . T . . T . . C C . . . TT . . A . T TAA . . AT C . . . CAC . G
blockSeqs : . . . T . . . . . T T . A A . T . . . . T T T A T G . . G G T T AA . . T T G . . T . GGG C A . . A T C . A G . . . T CC T A . CT . . A . AAATA GG . . . A A AC TC . . . G TG A . . . . T . A . A A . . T . . T . . ATTTC GT . . T . . . . . T . . T . . C A . . . TT . . A . T AAA . . AT C . . . CAT . A
blockSeqs : . . C . . . . . C T . T T . T . . . . G T T T T T . . T A A T CA . . T T A . . C . AGG T A . . G A C . G A . . . A CT T T . GT . . A . ACAAA TT . . . C C AT TT . . . T TG A . . . . C . A . T A . . A . . T . . ATGGC GG . . G . . . . . C . . A . . C T . . . T . . T . T GAA . . AT T . . . CAT . G
blockSeqs : . T . . . . . A A . A . . G . . . . T G C T G A . . A G A A AG . . C C T . . T . AAG T T . . C T A . T G . . . T CT A G . CA . . A . ATACT TT . . . T A CG TA . . . T CG T . . . . A . A . T A . . C . . A . . ATGGC GG . . A . . . . . A . . T . . T T . . . C . . C . C GAA . . AT C . . . CGC . A
blockSeqs : . . . . . . . T G . . . . G . . . . T A C G G G . . G A T G AA . . A C T . . T . CAA T A . . C A T . A G . . . A GC T T . GT . . A . TAATA GG . . . T G TG GC . . . T TG A . . . . C . A . T A . . C . . T . . ATGGC GG . . T . . . . . A . . T . . C T . . . C . . T . C GAA . . AA C . . . CAC . T
blockSeqs : . . . . . . C T T A T G . . G G A C CA . . T C G . . C . AGA T A . . C A G . G G . . . T CT C T . CT . . A . AACTA AT . . . C T TG TC . . . T TG A . . . . A . A . C T . . C . . T . . CAGTC AT . . T . . . . . A . . A . . C T . . . C . . T . C GAT . . GT C . . . CTT . T
blockSeqs : . . . . C C T A G A . . A T A C TA . . T A A . . T . GAC C T . . C T A . T G . . . A CG A A . CC . . G . TATCT GG . . . T C TG TC . . . T TT A . . . . A . C . C T . . C . . T . . CAGAA AT . . G . . . . . C . . A . . C T . . . T . . T . T AAA . . AT . . . . TGC . A
blockSeqs : . . . . A T T A T G . . A T A A CA . . A A A . . T . GAC T A . . C T C . T A . . . A CT A G . GC . . G . TATCT GG . . . T T TG TA . . . T TG A . . . . T . A . T A . . G . . T . . ATGTT AT . . G . . . . . C . . A . . C T . . . T . . T . T TAA . . CT . . . . GAA . C
blockSeqs : . . . . A C C G T C . . A T A C TT . . A A A . . G . AGT T A . . G T A . T A . . . A GT A A . GC . . G . ATAAT GG . . . C T CA TC . . . T TG A . . . . A . A . T T . . G . . T . . CTGTC AT . . A . . . . . T . . A . . C T . . . T . . T . T AAA . . A . . . . CAT . A
blockSeqs : . . . A C C G T C . . A A A C TT . . A A A . . G . ATA T T . . G A A . T A . . . G GT C A . CA . . T . GAACG GG . . . C T TA TC . . . T GT A . . . . A . A . T T . . C . . T . . ATGCA GG . . A . . . . . T . . A . . C T . . . T . . T . C TAA . . T . . . . CAC .
blockSeqs : . . . C T A G C C . . G G A C GT . . T A A . . T . TTA C T . . T A A . A . . . . G GT C T . GT . . T . AAACA GG . . . A A TG AC . . . T GT A . . . . T . G . C T . . T . . T . . ATAT AT . . G . . . . . T . . A . . A G . . . C . . A . A GAA . . G . . . . CAT .
blockSeqs : . . . C A . . C G . . A A A A TA . . T A A . . G . ATA T A . . A T A . A . . . . T GG A T . CA . . T . AACAA TT . . . T A TG AG . . . T GT A . . . . A . A . T T . . G . . T . . GTTC GA . . T . . . . . T . . A . . C T . . . T . . T . G TAA . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . A G . . G A T A TA . . T A A . . A . AAA A C . . T A A . A . . . . G GA C T . GC . . G . TATCA CT . . . T C CA TG . . . T CT A . . . . A . A . T T . . T . . T . . ATTC GT . . A . . . . . C . . A . . A . . . . . . . T . T AAA . . T . . . . . .
blockSeqs : A A . . G A G C TA . . T A A . . . . A C T . . C G A . G . . . . C AC A T . CC . . A . ATAC TT . . . C G CG TA . . . T CG A . . . . T . A . A A . . T . . T . . ATTC AA . . T . . . . . C . . T . . G . . . . . . . T . T GAT . . G . . . . . .
blockSeqs : C A . . T T A A AA . . T A A . . . . A T T . . T T G . C . . . . G CT C A . GT . . G . ATAC TT . . . . A C TC . . . T CG G . . . . A . G . T A . . C . . G . . ATTC T . . T . . . . . . . . C . . A . . . . . . . A . A TAA . . G . . . .
blockSeqs : . G A . C T . . A . G . . . . A C T . . T A T . T . . . . G GA T A . CA . . A . ATAC AT . . . . A . CC . . . A CG G . . . . C . C . T A . . T . . T . . ATG G . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . C . T AAA . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . A . C . . C A G . T . . . . G GC A G . CT . . C . TAAG AC . . . . A . GC . . . A TG A . . . . C . . . A A . . A . . G . . ATC A . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A . T T . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . T . . . . . . . A TA G . . C . . G . ATTT T . . . . C . GC . . . T TG A . . . . A . . . C T . . T . . A . . AA . . . C . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . . C . . . . AAA T . . . . C . A . . . T TA T . . . . G . . . T T . . . . . . . . A . . .
blockSeqs : . . . C . . . . TA T . . . . G . . . . . G TT T . . . . T . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A T . . . TG . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : TTA****** TCTGGC** C* N*** C** CG**** *** ATGNC********** TT**** C*
originalCons : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TC--G-GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--A--AT--GT-C-----TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-A---C--G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
finalCons : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTTA------AAATCTGGC--AAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGC--TATTTTNGAC-TCN---GGNTN-TTT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTTACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANT-N---TT-TACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--TN-TT----G---TG-AC--AAA-NACG----ATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G--GN---A-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T--AATGNC----------TATTG-T--AC-AA-----AA--NT-A----T--TTA-A-ACG-AT-AANA-A--AC-GT----CT-T-T-ATT----G-T--GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTTC-GAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Alignments
lowQualScore : 11 222222222 33333333 111 1111111 11111111111111 111 111111 11111111111111 1111111111 111111 11
lowQualScore : 1 1 1 00 1 3 4444 44 000000000 33333333 2 555 11 2 2 8 0 2 666 22 22 2 0 2 44 1 999 22 2 77 1 000 22 1 1 33 22 1 2 333 1 1 33 222 1 4444444 1 1 222222 1 33 2222 1 222 1 99 1 0 1 1 777 11 1111111 1 2 444444 0 1 3 2 77 2 33 0 2 1 1 2 1 33333 1 5555 2 1 0 8888888 1 1 4444 1 99999999999999 444 2222 333 1 000 22 111111 333 444 555 2 7777777777 4444444444 2 0 333 111 1 333 1 1 22 2 2 1 1 2 3 1 33 99999 11 222 99999999999999 33333 11 1 22222 33333 6666 55 11 1 1 4 222 1 1 33 0000000000 222 88888 3 0 1 1 44444 000000 1 5 33 77 11 0 0 8888 4444 55555 1 1
lowQualScore : . . . .. . . .... .. ......... ........ . ... .. . . . . . ... .. .. . . . .. . ... .. . .. . ... .. . . .. .. . . ... . . .. ... . ....... . . ...... . .. .... . ... . .. . . . . ... .. ....... . . ...... . . . . .. . .. . . . . . . ..... . .... . . . ....... . . .... . .............. ... .... ... . ... .. ...... ... ... ... . .......... .......... . . ... ... . ... . . .. . . . . . . . .. ..... .. ... .............. ..... .. . ..... ..... .... .. .. . . . ... . . .. .......... ... ..... . . . . ..... ...... . . .. .. .. . . .... .... ..... . .
lowQualScore : 7 0 3 44 8 6 7777 22 888888888 00000000 1 222 11 5 4 9 8 0 666 88 88 5 5 0 88 0 222 88 4 66 9 888 33 4 4 44 66 2 0 555 0 0 66 333 3 2222222 4 4 555555 4 33 7777 2 555 9 99 2 3 2 2 888 77 5555555 3 1 666666 3 2 3 1 11 4 44 7 3 2 2 4 4 55555 4 6666 3 1 7 8888888 1 1 1111 1 55555555555555 888 4444 999 1 111 11 333333 999 000 111 3 3333333333 2222222222 2 5 000 999 1 444 4 1 33 2 5 4 1 2 2 1 11 88888 66 000 00000000000000 66666 66 2 99999 99999 4444 88 77 2 2 5 222 2 0 00 8888888888 222 66666 8 2 0 2 88888 111111 2 0 44 33 77 1 6 0000 0000 11111 4 0
consensus : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGCTATTTTNGATT-CNGGNTN-T---TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANTN---TT-T-ACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--T-NTT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GNA-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T---A---ATG-NC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-N-T-A----T--T--TA-A-ACG---AT-AANAA--AC-GT---C--T---TTA--T--TGT-GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
Reference ( family-548 ) : ATTACCGTTGATGAAATTNTAAATGC-AGTTAA-GTCACTGAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTANT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATNTTAGCN--T--CACAT-TTG-TGC-GATA--TTT-TT-AA--TGCTATTTTNGACT-CNGGNTN-T---TT-TCC-------TGANAANTGG---A--CNGAAGGNAT----TA-T--TATNCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGT--G--ATAA--G--AACGATGTNAAT------AATTATAG-AGGCATNACA-T-TA-NTAAGT-TG-TC-TNT-CN--AAANTN---TT-T-ACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-C---A--T-NTT----G---TG-A--CAAA-NAC----GATANC-A---T---T-TC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GNA-G-AT-CNACNGTT-GA-TGCNATG-TT--TGT----TT--T---A---ATG-NC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-N-T-A----T--T--TA-A-ACG---AT-AANAA--AC-GT---C--T---TTA--T--TGT-GCTTTTGTNGA-T---C-T--NAA-AA-A-GCGTTT-CGAT--AGTATTTA----T----AGAAACG--CATTATG-GTTNAAACTATA
gi|12522 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA----T------AAA--------TAAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGCAATTCTAGATA-GTGGCTT-T---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-GTT-ACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAATT---TT-C-ACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-TA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-------ATACAC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-A-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-AACAA--AA-GG---C--T---TAT--T--TGG-GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12523 : ATTACTGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AAGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GAAA--TTT-TT-AA--TGCAATTCTAGATA-GTGGCT--T---TT-CCC-------TGATAAATAG---A--CGGA-GGAGT----TG-T--AATACC-ATT-ACATA-AAAA-GGG---G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AGGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AATATT---TT-C-ACCA-C----TATT-TTAA-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A--AAAG-AAC----AGCATA-G---T---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---A---AAC-AC-----TATTG-T--A--C-AA-----AC-A-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-AACAA--AA-GG---C--T---TTA--T--TGT-GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAACTTTA
gi|12524 : ATTACTGTTAATGAAATTAGAAATGC-AGTTAA-GTCATTGAAAA--G---------AAAT-------AATTCTGCA--GGTTCT-GATCG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--AGA--A--AGCAT-CG--GCATGTTAACC--T--CTCAG-CCG-TGT-GATA--TTT-TTTAA--TGCAATTCTAGAAA-GTGGCTT-T---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAATGATT----TG-T--AATATT-ATT-ACATA-AAAA-AGGG--G--ATAA--A--TGTGATGTAAAT------AATTATAG-AAGTATCACA-C-TT-GTTAGT-TG-TT-TAT-CA--AAAAAT---TG-C-ACCA-C----TATT-TTAT-ACAAACG---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-A---TAGTT-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---ATACAT---------TATTG-T--A--C-AA-----AA-C-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-AACAA--AT-G----C--T---TTA--T--TGT-GTTTTTGCAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AATATTTA----T----CGAAATG--GATTATG-GTTAAAATTATA
gi|12525 : ATTACCGTTAATGAAATTATAAATGC-AGTTAA-ATCATTGAAAA--G---------AAATT-------AGTCTGCA--GGTTCT-GATTG-TTTGATTAA-TGAATATTT-CAT--ATA--A--AGCAT-TG--ACATTTTAGCC--T--CTCAT-CTG-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGCAATTCTAGATA-GTGGCTT-T---TT-CCC-------TGATAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TG-T--AATACC-ATT-GCATA-AAAA-TGGG--G--ATAA---------ATGTGATT--------TTGT--------T-----T-TA-AAAAAT-TG-TC-----------------------ACCA-C----TATG-TTAA-ACAAACT---A---TGT--A-G-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGAATTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----AT--T---G---CAC-AC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-A-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-TACAA--AA-GG---C--T---TTA--T--TAA-GTTTTTGTAGATT---C-T--AAA-AA-G-GCA-TT-AGAT--AGTATTTA----T----CGAAACT--GATTATG-GTT
gi|12526 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTGTT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGCTATTTTAAACT-CGGGGTG-T---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACTG---TT-T-ACCA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-A-T---T--T-TTT----G---TG-G--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A---ATT-TC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-T-T-A----T--T--TA-A-ACA---AT-AATAA--AC-GT---C--T---TTA-----CGTAGCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12527 : ATCACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----------CACGAAAAA--GTT------AAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTATT-GATTG-TTT-ATTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAACA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGCTTTTTTAAACT-CGGGGTA-A---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGACGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACTG---TT-T-ACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TGA--A-T-T---T--T-TTT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---GA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A---ATT-TC-----TATT--T--------A-----AA-T-T-A----T--T--TA-A-ACA---AT-AATAA--AC-GT---C--T---TTA-----CGTAGCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TAAC--AGTATAAA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12528 : ATAACCGTTGCTGAAATTTTACTTGC----CAA-G-----AAAAA--GTT------AAAATC--TAGCATATCTTTT--GGTATT-GACTG-TTC-ATTAAATGAATATTT-TAT--CGA--A--AGTAT-CG--ATATTATAGCA--C--CATAT-TTG-TGC-GACA--TTT-TT-AA--TGCTATATTAAATT-CAGGGTA-C---TT-CGC-------TGAGCAGTGG---A--CCGTGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAGA-GGTT--G--ACAA--G--AATTATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--CAACTG---TT-T-ACCA-C----CATT-TTAA-ACAAACG---AAT-TG-----------A--T-TTTTTTGG---TG-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CAACAGCG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A---ATT-TC-----TATTG-T--A--C-AA-----AC-T-T-A----T--T--TA-A-ACA---AT-AACAA--AC-GT---C--T---TTA--C--GAA-GCTTTAATTAA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAT--AGTATATA----TATACAGAAACG--CTTTATG-GTTAAAA
gi|12529 : ATTACTGTTTCTGAAATACTGAGCGCTAGTAAATGT------------TT------GAAAGC--TGGAAAATCGATT--GGGAGC-GATTT-CTT-ATTAAATGAGTATTT-TGT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGGC--T--CCCAT-TTA-TGT-GATA--TTT-TT-AA--TGCTATTTTGACCT-CAGGCTT-T---TT-TCC-------CGATAAGTGG---A--CAGAGGGAGT----GA-T--TATCCCTATT--CACA-AAAA-AGGT--A--GTGT--G--AGCGATGTTAAT------AATTACCG-AGGCATAACC-T-TG-GTAAGT-TG-TT-TAT-CT--AAACTG---TT-T-ACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--T-TTT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---T---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTTCGA---AA---G-G---GAC-G-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TGT----GT--T---A---ATG-TC-----AATTA-T--C--C-AG-----AA-T-T-A----T--T--TA-T-ATG---AT-AATAA--AC-GT---T--T---ATA--T--GTT-GTTTTCGTTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGAT--AGTATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTGTA
gi|12530 : TAGT-GATAG-TTT-ATCAAACTAGTTTTT-CATTTCGA-------CCTGCA--ATATATTATCTGGT--CATAT---A-ACC-GATA--TTT-TT-AA--TCTCATTTTCAATA-CAGGGTG-T---TT-TCC-------TGACGAATGG---A--CAAAGGGTGT----CA-T--TATTCC-GTT-ACACA-AAAA-AGGG--G--ACAA--A--GACGTAGTTAGC------AATTATAG-GGGCATAACT-T-TA-GTTAGT-TG-TT-TGG-GA--AAAATT---TT-C-ACCA-G----CGTC-TTGA-ACGCACG---TAT---A--A-A-CAA-A--T-GGT----A---TG-AGGCAAA-TA------GTATT-A---T---A-AC-----T----GAC-----G---CACAGTTTGGCTTCAGA---AA---G-G---GTA-G-AT-CTACAACG-GA-TGCTATT-TT--TATAC--TTCAT---A---AT--AT-----TATCG----A--C-AA-----AG-T--------T--T--TA-A-ATG---AGAAAAAA--AC-GA---C--T---TTA--C--TGT-GCTTTTATCGA-T---T-TA-AAA-AA-A-GCGTTT--GAT--TCGGTTTA----T----AGAAATG--CTCTGTG-GCTCAAACT
gi|12531 : ataacagttaacgaggtcgaatctgcaattcgatcacttagcacgaacaaagtgtcAAATGAAT-TCT-TAT--TGA------GTCT-TGGGATACATTAGCA--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-T--AA--CGGTATTTTTAATT-CTGGTTA-C---TT-TTC-------TGATAATTGG---T--CTGAAGCGAT----TT-TGGTGTTTA-TTT-ATAAG-AAAA-A--------ATACCCG--GACGATGTTAAT------AAGTATAG-GGGTATAAGC-C-TA-ATAAGT-TG-TT-CAT-CT--GAGGTA---TT-T-ACTG-G----TATT-TTAA-ATAAGCA---AAT-TAA--T-A-C---------TT----GGATTG-A---AAA-TA------ATA---A---T---T-TTGTGAGT----GAC-----G---CTCAATTTAGATTTAGA---CATTTA-G---GAA-G-AT-TGACTGTT-GA-TGCAGTA-TT--TGTA---CT--T---A---GT--TC-----AATTA-T--A--C-AAAAAAGAA-G-T-A----T--T---------G---TT-AAAAA--AT-GA---CCGC---TTAGCT--TTT-GCCTTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGGAATG--GTTTGTG-GTGTAAACT
gi|12532 : attactgtgtcagaaatagaaaatagtataaaaatttaaagaaaaataaagcctttgctggtgaccttctaa-GATAA-TCT-GTTGAACGAATATTT-TAT--CGA--ATCA-T-T-TG--ACATATTGGGT--G--GACAC-ATGACG--GATA--TGT-TT-AACATGATATTT---AGTGCTGGATA-C---TT-TCCGCACTTATGGTCATTGG-----------GGTAT-----A-T--TGTACA---T-ATACATAAAA-GGGA--G--ATAA--G--AACGACCCGAAG------AATTATCGCAGG-ATTACC-T-TG-CTAAGT-AA-TT-TTG-GA--AAACTT---TT-C-ACTA-G----TATT-CTAA-CCAATAG---AGT-AGA--A-A-A---A--TGGTT--------------CGAA-GAG----AATAA--G---T---T-TT-----TATCAGAC-----G---CACATTTTGGTTTTCGT---AA---A-GGTTGTA-G-----CACGGTA-GA-TGCCATT-TT--TGT----TT--T---AC--ATA-AC-----T-TTG-T--T--C-AA----------C-A----T--T--TT-A-TTA---AT-AATAA--A--AT------TAGATTA--TCGTGT-GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCG-TT-CGAC--TCCGTTTA----T----CGCAATG--CATTGTG-GTTTAAACT
gi|12533 : ttattgttaagctcaaaatataaaatataacataaacaaagtctcgtgcccatgcGTTGATGAGGTCATCAAGGC-AATTTC-ATCAATGAAAAAGGGT------AAAAGTAGTGG------TGAT--GATAA---ATTGATCC-ACGAAATG----TTT-TA---AGA--T--AGTTC-TG--ATGTCATATCT--C--CA-AT-CGG-TGC-AAAC--TTT-TT-AA--TCATATAT---ATT-CATGTGG-TACATA-TCC-------TGAAAGCTGG---A--CAAAGGGTGT----TA-T--TGTTCCAGTTCCCCCC-AAAA-AGGT--A--ATAT--T--AATAATGTGAAC------AATAACAG-AGGTATCACT-C-TC-ACAAGTATG--C-TTT-CA--AAAATA---TT-T--TCA-T----CTTT-ATAAGATAAACG----TT-TAA--G-ATC---A--T-AGG----C---GG-A--TGAA-AAC----AAT-TT-A---T---TACC-----T----GAC-----T---TCCAGTTCGGTTTTCAA---AA---A-ATT-GAA-G-----CACTGTT-GGCTG-TATA-TT--TGTA---TT--G---A---AT--TC-----TATCA-TAGA--C-AC-----AG-T-TCA----T--A--AA-A-ATG---AA-AACAA--GA-AA---C--T---GTA--A--TGT-TCTTTTGTTGA-TTTCC-T--T---AA-G-GCATTTGAGGT--TGTA--TA----T----AGAAATG--GAATTTG-GTTAAA
gi|12534 : tTAAAAA--GTTTAAAGAAAAAT-------AAAGCCTTT--GCTAGT-GACCT-ACT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--C-----TTG-T-T-GAT----TT-GT-AA--CGGTATTTTTAATT-CTGGTCA-T---TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCAAT----CA-T--GGTGCCTATT--TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAT-CT--AAGATA---TT-T-ACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G---GAA-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T---A---AT--TC-----CATTA-T--A--C-AA-----AA-AGT-A----T--TATTA-A-AAA---AT-GAC-----C-GC----------TTAGCT--TGT-GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12535 : aaatgtaT-ACTAAATGAATATTT-TAT--TGA--A--TCTTG-TG--ATATATTGGCT--T--CACATCTTG-T-T-GATA--TTT-TT-AA--CGGTATTTTTAATT-CTGGTCA-T---TT-TCC-------TGATAATTGG---T--CAGAAGCGAT----TA-T--GGTGCCTATT--TATA-AGAA-AAAT--G--ACCC--G--GACGATGTCAAT------AATTACAG-AGGTATAAGC-T-TA-GTCAGT-TG-TT-TAC-CA--AAGATA---TT-T-ACGG-G----TATT-TTAA-ATAAGCG---AAT-TAA--T-A-C---------TT----G---TA-T--TGAA-AAT----AATAAT-A---T---T-GTGAG--T----GAC-----G---CTCAATTTGGATTTAGA---CG---T-G---GAA-G-GT-CGACAGTT-GA-TGCAATA-TT--TGTA---CT--T---A---AT--TC-----CATTA-T--A--CAAA-----AA-G-T-A----TTAT--TA-A-AAA---AT-GAC-----C-G-------C---TTAGCT--TGT-GCATTTGTAGA-C---C-T--AAAGAA-A-GC-TTT-TGAT--AGTATTTA----T----CGAAATG--GTTTATG-GTTTAAACT
gi|12536 : aaatgtatataaagtttaaagaaaaataaagcctatgctggtgacctacTGC-TGTCAA-GTCTCTTAAAA--GAC------AAAA-----GGCAA-----TA--GGTAGC-GAGTA-TAT-AATGAATGAATATCT-AAT--TGA--A--AGTAT-TG--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-T--AA--CGCTATATTGGACA-CTGGTTA-T---TT-TCC-------GGAAAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCCC-TTT-ACATA-AAAA-AGAT--G--ATGC--A--AATGATGTAAAT------AATTATAG-AGGCATAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAACTA---TT-T-ACTT-C----TGTT-TTAA-ATAAAGG---AAT-CGT--G-A-T---A--T-TTT----G---TG-A--AAAT-GAT----AATGTA-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---TACAATTTGGGTTCAGA---AA---A-G---GGA-G-AT-CTACTGTT-GA-TGTTTTA-TT--TATACGGTT--A---A---A----------TATTA-T--G--C-AA-----AC-T-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-TACAA-----GA---C--T---GTA--T--TGT-GTTTATGTAGA-T---T-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGAAACG--CACTGTG-TGTGATACTGTA
gi|12537 : TGC-AATCAA-ATCTCAAAACA--G---------AAAT-------AAAGCTGTTTTGG--GT-GATCG-TTT-ACTAAATGAGTACTAATAG--CTA--A--C-TG--CG--ATATATCATCT--T--CTCAT-AT--CACTGACA--TAT-TC-AA--TATTATTTTAGATA-CAAGCTG-T---TT-TCC-------TGAAAACTGG---T--CAAAAGGTTT----TA-T--CATTCC-TTT-ATACA-AAAA-TGGT--G--AAAT--A--AACAATGTTAAT------AATTACAG-AGAAATTATT-T-TA-ATA--------C-TAG-CC--TGAGTA---TA-T-AC--------------TGA-ACACACG---AAT---A--A-A-T---A--A-ATG----G---TGTA--CAGATAAT----GATATC-A---T---A-TC-----A----GAT-----G---CTCAGTTTGGGTTTTGG---AA---A-A---ATA-G-----TATTATA-GA-TAAGATA--T--TG-------------A---ATG----------------------AA-----AA-G----------------------------AATAA--A-------C--T---TTA--T--TGT-GCATTTATAGA-T---T-TA-AAA-AA-A-ACATTT--GAT--TCTATAAA----T----AAAAATG--CATTGTG-ACTTAAA
gi|12538 : -TCT-ACTAAATGAATATTT-CCT--TGA--A--A-CAG-CGG-ATATTATTGCT--CTGCACAT---------GACAGGTTTATT-AAA-TGGTATTTTGAACT-CTG-TTT-T---TT-TCC-------C---------------CAGAAAG----------T--TA---------AAACA-AA------T--G--ACAG--G--GGAGATGTAAAT------AATTATAG-GGGGATAACG-C-TT-GTCAGC-TG-TT-TAT-CT--AAGATT---TT-T-ACAG-G----TGTT-CTTA-ACAAAAG---AATATGT--A-A-----G--T-GGT----G---CG-A--GGAG-AAC----AGTATA-C---T---A-TC-----G----GAC-----G---CACAATTTGGCTTTAGG---GC---G-A---GTC-G-CT-CAACAGTT-GA-TGCTATG-TT--TGT----TT--TGCAA---GCA-GT-----TATTA---------AA-----AA-A-T-C----C--T--TA-A-ATG---GA-AATAA--AC-GC---T--T---ATT--T--TGC-GCGTTTGTAGA-T---T-T--AAA-AA-A-G-GCTTATGAT--AGTGTGTA----T----AGAAATG--CATTAAG-GATGAAATTGTA
gi|12539 : aagtttgaaaagaaataaagcgtgtagcatgttcaggagacac--GTT------GAAATC--TGGCAAATCTATT--GGTAGTAGATTG-CTT-ATTAAATCAATATTT-TCT--CGA--A--AGTAT-TG--ATATCATAGCA--C--CATAT-TTG-TGT-GATA---TT-TT-AA--TGTTTTTTTTAATT-CAGGTTA-T---TT-TCC-------TGAGCAGTGG---A--CTGAGGGAAT----TA-T--TATTCC-GTT-GCCTA-ACAA-AAGC--G--AT-A--G--GACAATATAAAT------ACATATCG-CGGAATTACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAATTG---TT-T-ACTA-C----AAGT-TTGA-ACAAACC---AA--TGG--A-A-C---AATT-TTT----G---TG-A--CAAA-CAC----GACATC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTAGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TACAATG-GTCATGT----TT--C---A---A
gi|12540 : cAATGAATATTT-TA----GAACA--ACTAG-CG--ATATATTATCG--T--CTCAT-AT--TACAGATA--TAT-TT-AA--TATTATTTTTGATA-CTGGGTG-T---TT-TCC-------AGATGAATGG---A--CTAAGGGT---------T--CATTCC-ACT-ACACA-AAAA-GGGT--A--ACAA--A--GATGATGTTAAT------AATTACCG-GGGAATAACC-TATATATA----TG-TA-TAG-GC--ATATTT---TT-C-AATA-G----TGTT-TTAA-ACGAGCA---AGT-ATA--C-A-A---A--T-GGT----G---TG-A--TGAA-AAT----AAGGTT-A---T---A-TC-----T----GAT-----G---CTCAATTTGGTTTTAGA---AA---G-G---Ga
gi|12541 : cattaaacaaaaagaaggtcgctggagatattatgcttGGTG-T---TTATCC-------AGAAGCGTGG---T--CAAAAGGCAT----TA-T--AGTCCC-TAT-ACATA-AAAA-AGGT--G--ACAA---------AT-TAAATACAGCGAATTATAG-AGGGATTACA-T-TA-ATAAAT-TC-CC-TTG-CT--AAAATT---TT-T--TCA-CTGTGTATT-AGAA-ATAGAC------T-TAA--T-A-C---T--T-GGT----G---TG-A--AACA-GAA----CATATA-C---T---T-AA-----T----GAT-----T---CACAGTTTGGTTTCAGAGATAA---A-A---AAA-G-----TACAATT-GATTGC-ATT-TT--CAT----AT--T---AC--AT--TG-----TATTA-T--A--C-AA-----AAGA-T-A----T--T---------G---TC-AAAAA--AC--TAAAC--T---TTA--T--TGT-GCTTTTATTGA-----C-TACGAA-AG-G-GCATTT--GAT--A-CGGTTA----TA---AGAGACG--CGCTATGTGTTAAA
gi|12542 : aaataaatcacccggatgtgacgaagttttagcagattttttcatagacgcgaaaaattttattacaccttatattgttaaaatattcaataaaatctataatgac-GATTA-TAT-AATGAATGAATATAT-AAT--TGG--A--AGCAT-TA--ATATTTTAGCTGCT--CATAT-TTG-TG---ATA--TTT-TT-AA--CGCTTTAATGGACT-CTTGTTA-T---TT-TCC-------GGAGAAATGG---A--CGGAAGGAGT----TA-T--TATCAC-TTT-ACATA-AAAA-AGGC--G--ATGC--A--AATTATGTAAAT------AATTATAG-AGGCAAAACA-T-TA-GTAAGT-TG-TT-TAT-CG--AAATTA---TT-T-ACTT-C----TATT-TTAA-ATAAATG---AAT-TGT--A-A-T---A--T-TTT----G---TG-A---AAG-TAA----TATAGTAA---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTT-GCTTT-------------------------------GTT-GA-TAC--TG-------------T--T---A---A----A-----TATTG-T--G--C-AA-----AC-T-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-AATAA--AT-GA---C--T---GTA--T--TGT-GTTTATGTCAA-T---C-T--TAA-AA-A-ATGTTT-CGAT--ACTATTTA----T----AGACACG--CACTGTA-GATGAAACT
gi|12543 : TG-TGT-TAAA--TTT-TT-AA--TGCTATTTTAAACT-CGGGGTG-T---TT-CCC-------TGAGCAGTGG---A--CCGAGGGAAT----TA-T--TATCCC-GTT-ACACA-AAAA-GGGT--G--ATAA--G--AATAATGTTAGT------AATTATCG-TGGCATAACA-T-TA-TTAAGT-TG-TC-TTT-CT--AAACTG---TT-T-ACTA-C----CATT-TTGA-ACAAACG---AAT-TG---A-T-T---T--T-TTT----G---TT-A--CAAA-CAC----GACAGC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAATTTGGATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAGTG-GA-TGCCATG-TT--TGC----TT--T---A---ATT-TC-----TGTTG-T--A--C-AA-----AA-T-T-A----T--T--TA-A-ACA---AT-AATAA--AC-GT---C--T---TTA-----CGTAGCTTTTATTGA-C---C-T--GAA-GA-A-GTGTTT-TGAC--AGTATATA----C----AGAAACG--CTTTATG-GTTAAAACTATA
gi|12544 : c--TTT-TT-AA--TGAAATATTTGATT-CAGGTTC-G---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATA---TTCT-GTCA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--T-GGT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A------AA-GTATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A---ATG-GC-----TTTAG-G--A--C-AA-----AA-G-T-ATCTTT--C--TA-A-GAG---A--AAAGG--AC-GT---T--T---TTA--T--TGT-ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12545 : aac--TTT-TT-AA--TGAAATATTCAATT-CAGGTTC-G---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GAGAAAGTAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGT--C-------------CAGTAT-AAT------AACTATTG-AGGCATTTCACT-TA-TTGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATA---TT-TTGTCA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-T----A-A-CT--A--A-ATG----G---TG-A----GA-TACTTTTGATGTC-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGG---AA---A-A----AA-T-ATACCACTATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A---ATG-GC-----TTTAG-G--A--C-AA-----AA-G-T-C----TCTT--TA-G-AAG---AG-AAAAGG-AC-GT---T--T---TTA--T--TGT-ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12546 : aac--TTT-TT-AA--TGAAATATTTGATT-CAGGTTC-G---TT-TCC-------TGAAAATTGG---A--GCGAAAGCAT----TA-T--AACACC-ATT-ACATA-AAAA-AGGTCCA--GTAA------ATGACCCAAAT------AACTATCG-AGGCATTTCACT-TA-TCGA-T-TC-CC-TAT-GT--AAAATA---TTCT-GTTA-C-----ATA-TTAA-GTAA-TA---GAT-TAACTA-A-----A--T-GGT----G---CG-A--TACT-TTT----GATGTA-A---T---T-GA-----T----GAG-----T---CACAGGCAGGATTTAGGA--AA---A-A---GTA-T-AA-C-ACAATA-GA-TAACATA-TT--TAC----TT--T---A---ATG-GC-----TTTAG-G--A--C-AA-----AA-G-T-ATCTTT--C--TA-A-GAG---A--AAAGG--AC-GT---T--T---TTA--T--TGT-ATATTTGTTGA-T---T-T--TGCTAA-A-GCATTT--GAT--AGTATTCAACACC----AAAAAC------TATG-G
gi|12547 : aacTT-TT-AA--TGCAATATTCGACT-CGGGCTG-T---TT-CCC-------TAAAGAATGG---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATT-ATTTA-AAAA-AGGG--G--ACAG--A--CATGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TA-ATCAGC-AG-CA-TGG-GG--AAACTT---TT-T-ACCA-G----CATA-TTAA-ATAAGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--T-GGT----G---CG-A--CAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----T---CACAATTCGGGTTGATA---AA---A-G---GAA-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T---AC--AAA-AC------ATTA-T--A--A-AA-----AA-A---A----TA-C--TA-A-ACA---AT-AAAAT--TC-GT---C--T---TAA--C--TGT-GCATTCATTGA-T---C-TC-CAC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAATA--TGCTATG-GCTTAAATTACA
gi|12548 : T-TT-AA--TGCAATATTCGACT-TGGGCTG-G---TT-TCC-------TGAGGAGTGA---A--CCAAAGGTTA----TA-T--TGTACC-ATT-ATTGG-AAAATAGGG--G--ACAG--A--CGTGATGTTAAT------AATTACAG-AGGGATAACA-C-TT-ATCAGC-AG-CA-TGG-GA--AAACTT---TT-T-ACCA-G----CATA-TTAA-ATAGGCG---TAT-TGT--A-T-C---T--T-GGT----G---CG-A--TAGT-AAT----GATATC-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---CACAATTCGGGTTTAGA---AA---A-G---GAA-A-AT-CTACTGTT-GA-TGCGGTG-TT--TAT----TT--T---AC--AAA-AC------ATTA-T--A--G-AA-----AA-A-A-A----TA-C--TA-A-ACA---AT-AAAAA--TC-GT---C--T---GTA--C--TGT-GCATTCATTGA-T---A-TC-CGC-AA-G-GCG-TT-CGAT--TCTATAAA----T----AGGAA
gi|12549 : T-TT-AA--TATTATATTTAATG-TCGGATA-T---GT-TCC-------ACAAAAATGG---T--CAGAGGGGTT----CG-T--TGCACC-ATT-ACACA-AAAA-GGG---G--ATAA--G--TAC--TGTAACC------AATTATAA-AGGTATTACtatg
gi|12550 : T-TT-AA--TGAAATATTTGAAA-ATGGAAA-C---TG-TCC-------TGTGCAATGG---G--GAGAAAGTAT----CT-C--T---CC-AAT-ACACA-ATAA-AG----G--GTAC--GTAAATGAT-TCAATC-----AATTACAG-AGCAATATCA-T-TA-ATCAAT-TG-TC-TTTGCA--AGAAT----TT-T-ACTT-C----AATA-TTCA-ATAATTGTTTAAC-CAA--A-------A--T-GGT----G---TA-A--T--A-CAC-----ATAAC-A---T---T-TT-----T----GAT-----GAATCAC----TGGTTTCCGA---AA---ACA---GTA---CT-CTACTATT-GA-TAACTTA-TCAACGT----TA--C---A---AT---C-----TATGA-T--C--C-AA-----AA-G-T-A----T--T--TATC-ATG---TT-AAAAA--ATGGTGA-C--T---TTA--T--TGT-ATGTTTATAGA-T---G-TC-TAT-AA-A-GCATTT--GAT--TGTATTCA----
gi|12551 : GGCTAAT---TT-TCC-------AGAGGAATGGTAAA--ACGATGTTAT----TAAT--TATACC-ACT-ATTCT-AAAA--GGT--G--ATAA--T--AAAAATGTTAAT------AAGCATAG-GAGTATGACG-C-TT-GTAAAT-TG-TA-TGA-AC--ACACTT---TT-C-ACAA-G----TATC-CTAA-ACAAAGG---TAT-TGAT-A-A-T------T-GGT----G---TG-A--acataataagttat
gi|12552 : taaaaataaCC-------TGATAGTTGG---A--CAAAAGGTAT----TA-T--AGTACCTGTT-CCAAA-AAAA-AGG------ATAT--T--AACAATGTTGAT------AATTATAG-GGGCATTATGCT-TA-CTAG---TA-TCTTCT-CT--AAAAT----TG-T-CTCA-C----AGTTGTTAG-ATACCCG-------TG---C-A-CGTAA--T-TTT----G---T-----CGAA-GAC----AACAAG-A---T---T-T------T----AACAGAATG---C-CACTTTGGTTCCAGA---CA---A-A---AAA-G-AA-GCACTGTT-GA-TTGTATT-TT--TGT----TC--T---A---CAG-TC------GTTGATAAA--T-AG-----AA-T-T-A----T--T--CA-ACATG---AG-AGAAA--AA-ATA--C--------A--T--AGC-GCTTCTGTTGA-T---T-T--TAA-AA-T-GGAATT-TGAC--ATGGTTTA----C----CGCAATG--GAATAAG-GTTTAAACTGTa
gi|12553 : tttacAGAAATGG---AATCCGACTAAATGTTATA-T--TGTACC-ATT-ATTGA-AACA-AGGG--GGAATTA--T--A-TGATATTAAT------AACTACAG---GTACAACACT-TG-TTAGA---A-TCACGT-GA--AAACTT---TT-T-ACTAGCG---CATT-T--A-ACAAACG---G-T-TG-------T---A--T-CTT----GACGTG-A--CCGT-AAT----AGTATG-A---T---A-TC-----T----GAC-----G---TATTATTTGGGTTAAGA---AA---T-G---CAA-A-AT-CTAGTATT-TA-TACGGTGTTT--TAT----TT--T---A---CAG-AA-----TATTA-T--A--A-AA-----AA-
gi|12554 : -GTT-TCATA-CAAA-CGGA--A--ATAA--A--AACACGGTCATC------AATTATAG-AGATATAACT-T-TA-TTTA-T-CGTTT-TGG-GC--AAGTTA---TT-T-ACTA-G----CGTT-CTAA-ACACAAG---A-----G--A-A-C---G--T--TT----G---TG-A--ATTA-AAT----GATATA-A---T---T-TT-----A----GAC-----G---CGCAATTTTAATTCAGA---AA---A-G---ATC-G-A--ATACAATTCGA-TGCTA----T--CGT----TC----------ATG-GCTACAGTATTG-G--A--C-AA-----TA-A---A----C--T--TA-A---G---GT-AAA-------------------TTA--TAGCGT-ACGTTTATTGA-T---T-T--AAA-AAGA-GCG-TT-CGAC--TATGTTAA----T----AGGAATG--CATTGCG-GCTa
gi|12555 : TAAAT------A-TT-TAG-AAGCATTACG-TATA--TA----TA-CC-TGT-TA--AAAATCAGATT-T-ACCA-C----CATA-CTCA-ATAAAAG---GAT-TGA--A-A-C---A--T-TTT----G---TA-A--TAAT-AAT----GATATC-A---G---T-TC-----A----GAT-----G---CGCAATTTGGATTT-CG---AA---A-G---GAACG-GT-CAACAGTT-GA-TGCTATA-TT--TAT----GT--T---A---ATG-TT-----AATTA-T--C--C-AG-----AA-T-T-A----T--T--TA-T-ATG---AT-AATAA--AC-GT---T--T---ATA--T--GTT-ATTTTCATTGA-C---A-T--GAT-GA-A-GTGTTT-CGATTGAATATATA----T----AGAAATG--CACTTTG-GCTAAAATTA
gi|12556 : -TG-TC-TAT-CATTACAGTA---TT-A-AGTA-G----TATT-T-GA-ACAAACG---AAT-TGA--A-C-A---A--T-TTT----G---GG-A--TAAT-CGC----AACACC-A---T---T-TC-----T----GAT-----G---CACAGTTGGAATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TGCCGTG-TT--TGC----TT--T---A---CTG-TC-----TATAG-A--A--C-AA-----AC-T-T-A----T--T--TA-A-A
gi|12557 : ctatttaacattca--AAATTG---TT-T-AGTA-C----AATT-TTGA-ACAAACA---CAT-TGA--ATA-A---G--T-AT-----G---TG-A--CAAC-CAC----GACAGC-A---TG--TGTT-----T----GAT-----A---CACGATTTGAATTTAGG---AA---A-G---GCA-G-AT-CTACAATT-GA-TG
gi|12558 : -C----TATT-TTAA-ACAAACA---GAT-TGT--A-T-C---A--T-ACT----G---TG-A---AAA-GA------ATAGC-ATAGT---T-TC-----G----GAT-----T---CTCAGTTTGGATTTAGG---AA---A-G---GAA-A-AT-CAACTACT-GA-TGCTTTG-TT--TGT----GT--T-------ATACAC-----TATTG-T--A--C-AA-----AA-A-T-A----T--T--TG-A-ATG---AT-AACAA--AA-GG---C--T---TTA--T--TGT-GTTTTTGTAGA-T---T-T--TAA-AA-AGGCATTT--GAT--AGTATTTA----T----CGAAttt
gi|12559 : ----GAT-----G---CTCAGTTTGGATTCAGA---AA---G-G---GGC-G-GT-CCACTTTT-GA-TGCAATA-TT--AGTA---TT--T---G---ATG-CA-----T-TTA-A--A--C-AA-----AA-G-G-T----T--T--TG-A-GCGAATAT-GGGAG--A--------------TTAGCT--TGT-GCTTTTATCGA-T---CTT--AAA-AA-A-GCCTTT--GAT---GTTTTTA----T----CGTAACGGTCA--ATG-GTACAAACT
gi|12560 : TTTGGATTCAGA---AA---A-G---GTC-G-CT-CTACTGTC-GA-TACTATA-TT--TCT----AT--T---A-----G-AA-----CATT--T--AATC-GA-----TA-C-T-AA---T--T--TG-A-ACA---AT-AAAGATAAA-GT---A--T-----A--T--TGT-GCTTTTATAGA-T---T-T--AAAGAG-A-GCG-TT-CGAT--TCCATAAA----T----AGAAATG--CATTGTG-GCTAAAATTATA