lowQualScore                  :                1            1           1      2                                                          333    222                            11111111       1111111                                                                                  55555555555                                               1     11111                                                                      1                                              999999999999999999999999999999999999999999                    1                                                   1                                               1       222                             2222    5555555555555555                               1      22222222222      3333333333333333         11                            
lowQualScore                  :          777   2          6 7       4   5      1                           4   777                  999   555    777            999999          11111111       0000000     3 33    5                       7               44444      222 7777777777 6  77777777777     3333      77      88 1                    2     55555  1          0          88     2  6        1        2       5    2222 0      8888   1       44444444  1 666666666    888888888888888888888888888888888888888888 1     44444444     4           888888888      1       11  6            4    1     1   2                                3     0 111                 66666   11  2222    5555555555555555 222     6        8    1     7 5 0  1 33333333333      4444444444444444 2    55 88    0  77 22 1 99  1        
lowQualScore                  :          ...   .          . .       .   .      .                           .   ...                  ...   ...    ...            ......          ........       .......     . ..    .                       .               .....      ... .......... .  ...........     ....      ..      .. .                    .     .....  .          .          ..     .  .        .        .       .    .... .      ....   .       ........  . .........    .......................................... .     ........     .           .........      .       ..  .            .    .     .   .                                .     . ...                 .....   ..  ....    ................ ...     .        .    .     . . .  . ...........      ................ .    .. ..    .  .. .. . ..  .        
lowQualScore                  :          000   5          0 0       0   5      6                           0   000                  666   222    000            666666          22222222       0000000     6 99    7                       4               00000      888 0000000000 4  11111111111     1111      00      44 2                    5     00000  2          1          11     5  7        2        4       9    5555 8      9999   1       11111111  1 111111111    555555555555555555555555555555555555555555 1     11111111     3           444444444      1       66  0            7    7     1   3                                5     8 444                 99999   77  4444    0000000000000000 333     9        3    1     2 3 8  4 66666666666      9999999999999999 6    22 77    2  22 22 6 00  6        
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTT-TTTTCAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATCC--AAAA--AAAAN--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCGCTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATTTT---T----------T-AC-----------CATTG---ATATTGAACCCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAAT-NAGCCA-TAATACTATGCGATATAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGTG----AATTACGCNA--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGACAATTATATTCCATATGACAC---TNCCC--AT-C-AAAGG-T---AGA-AACAT--T---CATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----AT-GTCATAT---GGNCN---AGTTATGGGTAGNAT-ACACAATN-T--G-ANNAACCAAAAGAA
Reference ( gi|104666 )       : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTT-TTTTCAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATCC--AAAG-GAAAAA--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCACTTT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATTTT---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACCCCCTAA-AT-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACAACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-T-AAA-AA-----T---CATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTTGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGGCT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-T--G-ATAAACCAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTT-TTTTCAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATCC--AAA----AAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCGCTCT--AATA-TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACACCCTAA-AT-AACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAAGATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--AATGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TAAAA-AA-----T---CATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTGGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGGCT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAACA-T--A-ATAAAACAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTT-TTTT-AATGT-------ATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATCC--AAAA-AAAAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCGCTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATTTT---T----------T-AC-----------CATTC---GTATTGACCCCATAA-AT-AATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTAT-TGTCCA-TAATATCATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCAT-----------T----------T-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TAAAA-AA-----T---CCTATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTTGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGGCT---ACTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-T--G-ATAAAACAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATT-TTT-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATCC--AAA---AAAAAT-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCGCTAT--AATA-TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACCCCACAA-AT-AACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAA--ATTGACATACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TAAAA-AA-----T---CCT-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTGCGTA-A-TG----AT-GTCATAT---GGGCT---AGTTATAGGTAAAAT-GCACAATA-T--G-ATAAAACAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGT-------ATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC---AAA---AAAAACTGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCGCTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AT-----------CATTG---GTATTGACCCCATAA-AT-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGTG----AATTATGCAA--GTTGGGGTACA--------AT-A---------GGCA------------T----------GTT-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-TAA-AAA-AA-----T---CCTATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTGGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---TGGCT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-T--G-ATAAAACAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTT-TTTTCAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATCC--AAAA-AAAAAAT-GAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATT-------TCGCTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CGTTG---GTATTGACCCTATAA-AT-AACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAAT-TGTCTA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAAC-TGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------A-T-ATCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TAAAA-AA-----T---CCTATTTGTCCAGAATACTAAAATACTGGTTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGACT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-T--G-ATAAAACAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCTAAA---AAAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCACTCT--AATA-TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACCCCCTAA-AC-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCAT-TGTCCA-TAATACCATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------C----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGCGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCC--AT-C-A-----T-TAAAA-AA-----T---CATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTGGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGGCT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-TAAA-ATATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC---AAAT-AAAAAAATGAACAAAAATT-------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACTCT--AATA-AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACCCACTAA-AT-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAAT-TGTCCA-AAATACTATGCAATATAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGATACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-T-AAA-AA-----C---CCTATTT
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT--TTTCAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGA
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATCA--AAAA-GAAAAT--GAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATG-------TAACTCT--AATA-TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATTTC---T----------T-AC-----------CGTAG---GCACTGATCTCCTAA-AT-AACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------GTT-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-T-AAACCA-----T---CATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTT-TTT--AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATCC--CAA---AAAAAT-GAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCACTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---ATATTGACCCCCTAA-GT-AACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAAT-TGTCGA-TAATACTTTGCAATATAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TCC--AAAAAGAAAAT--GAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATG-------TCACTCT--AATA-TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATTTC---T----------T-AC-----------CATTG---GTATTGACCTCCTAA-AT-AACTGAAAATATTTAAATTAAGTTAT-TGTTTA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G---------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCA---------------GGACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCC--AT-C-AAAGGTT-T-AAA-AA-----T---CATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTGAGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGACT---AGTTATAGGTAAAAT-ACACAATA-T--G-ATAAA--AAAAA
gi|104678                     :                                                                                                                      AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACTTTAAAAAA-TAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATTTT---TAGTAGCAATGT-AC-----------AATTG---ATACAAACCCTCTAATTT-AACTGAAAATGTTGAAATT-AGCAAT-AGGCCA-TAAAATGATGTAATATTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGTG----ATCTATGGAGGCACT-GTGTGCA--------GT-A---------TGCAGACAGAGGGGGGC----------A-T-------T------A-T-GTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAA--------TGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---T-TCT--TA-A-AAAGG-T-G-AGA-AAT----T---CATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATGGGTA-A-TG----AT-GTTAAATG--GGGGTAA-AATGGCAGGTAGAAT-ACACAGTATT--A-ATAA--CAAAcaa
gi|104679                     :                                                                                                                      AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATG-------TCACTTC--AAAAATAGTTGACGGACGTTACAAAATG-GGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTG---ACAT--ACGCCA-AA-AT-AACTGAAAATGTTTGAAT--AATAAT-CAGCCA-TAATATTATGTAATATAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGATG----AATTATACAG--ATTGGGGTACA--------ATCAGCACATAGTTGCA------------G----------G-G-------T------A-T-TTCTC--------AATACCATATGGTGTGAC--------TGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                               TG--------ATTATTT-------TCACTTC--AAAAATATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATG---TCAATGACCCC-TAA-TT-AACTCA----------------TGAT-TAGCCA--AA----GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT-GG------------TGTGAT-------TTATGCTA--TTTCAAGTACA--------GC-A---------TGC--------------------------------------------------------------CAACATAAT-TGGCCTCCCACATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                          CTCT--TATA-TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATTTC---T----------T-AA-----------CATTG---GTATTGACCCCCTAA-AT-AACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGTG----AATTATGCAA--AATGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGCAG------------CTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCC--AT-CAAAAGG-T-T-A
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                      TTGCAT-----ATTTTT---T----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTG---ATATTGAACCCCTAA-TA-AACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACG-CCA-TAATACTATGTGATAT----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGTG----ATTTATGCCA--ATTATGGTACA--------AT-T---------TACACAT---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATACATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACAATT-T--G-AATAACCGAAAGA
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                      TTACAT-----AATTTT---T----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTG---ATATTGAACCT-TAA-ATTAACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAAT-AAGCCA-TAATACTATGTGATTT----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGTG----ATTTATGCTA--ATTAGGGTTTA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTTTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTT--AT---AAAG------AGA-AACAT--T---CATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---CCATAT---A---TCAAAGTTGT--GTAAAAC-A-ACAA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                      TTACAT-----ATTTTT---T----------T-ACTTGTAAGTTTACATTG---ATATTGAACCCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAAAT-AGTAAC-AAGCCA-TAATACTATGTGATTT----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGATG----ATTTATACTT--ATTAGGGAACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCAT--------ATTACCACATTGTGTGAA--------TGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-AACAT--T---CATATATG
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                      TTACAT-----AATTTT---T----------T-AC-------------TTGTAAGT-TTG-----C--------ATTGA-----TTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATA----GTACATCCT----------------GTCATAAACCCTG--GTG----AATTATTCTA--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------TACTGCAGCAGG-G-------T------A-T-TTCTC--------ATCACCACATGGTGTGAA--------TGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC----AT------------------------------T---CATATATGTCCAGGGAACTGGTAGA----ATATA-TG----ATCATCATAT----ATCA---AATT---GG-AAAGTAACACAATT-T--G-AATAACCAAAgcagaatagataatcatcatatatcaaattgtgtagtgaataaccaaaatgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                       TACAT-----AATTTT---T----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTG---ATATTGAACCCCTAG-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAAT-AAGCCA-TAATACTGTGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGTG----ATTTATGCTA--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTG-----TAGCA----CTTTGTGCAATATGCCTGTAGACAT-TATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----AT---CATAT---A---T---AAAATTGGGTAGTA--ACACAATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------TTACTTGTAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGACA-TAATACTATGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TCACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAA---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACCATAA-TT-AACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----ATTTACACTA--ATCAGAGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGAGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AAC-AACAT--T---CATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACA-TAA-TT-AACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----ATTTACGCTA--ATTAGAGTACA--------AT-A---------TGCACCC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGAGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AAC-AACAT--T---CATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------TTACTTGTAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACAATGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGACAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AAC-AACAT--T---CCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATAGATA-A-TC----A---CCATAT----ATCA---AAT--TGAGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------TTACTTGTAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACCCTTA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATT-AGTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATA----ACATCCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG-----ATTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGT------------------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT---cagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                        ACAT-----AATTTT---T----------TTACTTGTAAGTTTGCATTG---ATATTGAAACCCTTA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATT-AGTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATA----ACATCCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG-----ATTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGT------------------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT---
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGTGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC-----TCC--GT-A-TAAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTA---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTGTGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGTG----A-TCACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAA---------T----------G-TGGCAGTGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTATGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGTGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC-----TCC--GT-A-TAAG-------AA-GACACATT---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACAATGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TTACGCTT--ATTACGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC-----TCC--CT-T-TAAGG-----AAC-AA-----CATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATAGATA-ATCATCATAT-ATCAAAT---TGGCT---AGT
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTA---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTGTGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TCACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAA---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTA---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAATACTGTGTGATATAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGTG----A-TCACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAA---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CACAT--T---CATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--G-AATAACCAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTG---ATATTGAAACCCTAA-TT-AACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGGCA-TAACACTATGTGATATAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGTG----A-TTACGCTT--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-TGGCAGGGT------A-T-TTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT--AT----AAGG-----AGA-CATAT--T---CATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATAGATA-A-TC----A---TCATAT----ATCA---AAT--TGGGTAGTA--ACACCATT-T--GAATAAACAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                         -----------CATTG---ATATTGAACCCCTAA-TT-GACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAAT-AAGCCGGT--TAC----CGATA----GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGTG----ATTTATGCTA--ATTAGGGTACA--------AT-A---------TGCACAC---------T----------G-T-------TGTAGGGTAT-TTCTC--------ATTAACACATGGTGTGAA--------TGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC-----TCCTAATAC-GA--------AAA-AACAT--T---CATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATAGATA-A-TC----A---TCATATATCAAACT---GGGTA---GTA-----ACACAATT-T--G-AATAACCAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAT-TGTCCA-TAATACTATGCAATATAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGTG----AATTATGCAA--ATTGGGGTACA--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-TTTTCTC--------ATTACCACATGGTGTGAC--------TGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TAAAA-AA-----T---CCTGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTGGGTA-A-CG----AT-GTCATAT---GGGCT---A--------CACAAT-ACACAATA-T--G-ATAAAACATAAAAA
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGATG----AATTATACAA--ATTGGGGTACAGTCAGCACAT-AGT-------TGTA------------G----------G-G-------T------A-T-TTCTC--------AATACCATATGGTGTGAC--------TGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGC
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TACC--------AT-A---------TGCA------------T----------G-T-------T------T-T-TTCTC--------ATAACCACATGATGTGAC--------TGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA---------------ATATATTCCATATGACAC---TATCC--AT-C-AAAGG-T-TCAAA-AA-----T---CACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTGGGTA-A-CG----AT-GTTATAT---GGGTT---AGTTATAGATAAAAA-ACACAATA-T--G-GTAAAACAAAAAAA
gi|104704                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        AACTAGTAGACTGTGTA-A-CG----AT-GTCAAAT---GGTTT---AGTTATAGGTAAAAA-ACACAATA-T--G-ATAAAACAAAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                   11111111                                                                                                55555555555                                               1                                   1111                                          1                              111     111111                                                                                                                             2                             22    22222                                                22      222222222222            1                         
lowQualScore                  :          666                  1        88                                  1   666                  3  55   7 55   999            888888          00000000        9999999 0  5      33                                       33333    222   6666666666 6  55555555555            11  1    222 1 1                   7     1  0  1               11      3333      1        1        1       1   2222  3   0  11    11             11 222  11 444444  0  111    44444444                 2      1       11                          1                                            1 1                 222 1  1  11    33333   0 2    0   1                      222        66      666666666666  222     2 8    0  1   22  22        
lowQualScore                  :          ...                  .        ..                                  .   ...                  .  ..   . ..   ...            ......          ........        ....... .  .      ..                                       .....    ...   .......... .  ...........            ..  .    ... . .                   .     .  .  .               ..      ....      .        .        .       .   ....  .   .  ..    ..             .. ...  .. ......  .  ...    ........                 .      .       ..                          .                                            . .                 ... .  .  ..    .....   . .    .   .                      ...        ..      ............  ...     . .    .  .   ..  ..        
lowQualScore                  :          444                  6        00                                  0   444                  6  00   3 00   666            888888          44444444        3333333 3  3      77                                       88888    777   7777777777 2  44444444444            33  2    555 2 2                   6     0  5  1               66      3333      7        1        8       4   4444  1   1  33    66             55 222  55 333333  9  999    00000000                 3      1       55                          1                                            4 2                 111 4  3  99    66666   5 2    2   1                      333        44      222222222222  444     4 8    4  5   00  33        
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--AAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATATGGTCAAAT--TATG---GGTAGNA-ACACAATNTGAATAAC-CAAAAGAA
Reference ( family-547 )      : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--AAAN--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGACAATTATATTCCATATGACAC---TNCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATATGGNCNAGT--TATG---GGTAGNATACACAATNTGANNAAC-CAAAAGAA
gi|104666                     : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTTTTTT-CAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAGGA--AAAA--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-TTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACAACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATATGGGCTAGT--TATA---GGTAAAATACACAATATGATAAAC-CAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--A--T--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACACC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAAGA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAA-TCATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATATGGGCTAGT--TATA---GGTAAAATACACAACATAATAAAA-CAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATTTT-T-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--AAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-ATAATA--TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-ACAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAAATTG--ACATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-T-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTG---CGTAATGATGTCATATGGGCTAGT--TATA---GGTAAAATGCACAATATGATAAAA-CAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTTTTTT--AATGTATT-------TTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--AAAAT-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTCGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTATTGTCCA-TAATATCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATTTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATATGGGCTACT--TATA---GGTAAAATACACAATATGATAAAA-CAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTAT-------TTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC-AA--AAA-A--AACT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AT-----------CATTGGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAGTTG--GGGTACAATAGGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--AAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATATTGGCTAGT--TATA---GGTAAAATACACAATATGATAAAA-CAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTTTTTT-CAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATC-CA--AAA-A--AAAAATGAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATTT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTTGGTATTGACCCT-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAATTGTCTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAA-CTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TATA---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGAATAC---TAAAATACTGGTTAACGATGTCATATGGACTAGT--TATA---GGTAAAATACACAATATGATAAAA-CAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCT--AAA-A--AAAT--GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AC-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCATTGTCCA-TAATACCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--AC---G--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGCGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCCATCA---T--T--AAAAA-A-TCATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATATGGGCTAGT--TATA---GGTAAAATACACAATATAAAATATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-AAATAAA-A--AAAT--GAACAAAAA-TT------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACT-CTAATA--AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCA-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-AAATACTATGCAATA--TAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAAC
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGAcctattt
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-AA--AAAGA--AAAT--GAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATGT-------AACT-CTAATA--TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTAGGCACTGATCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAACCA-TCATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTT---AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CC--AAA-A--AAAT--GAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGATATTGACCCC-CTAA--GT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCGA-TAATACTTTGCAATA--TAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TC-CA--AAA-AGAAAAT--GAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATATTTAAATTAAGTTATTGTTTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------T-TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCAGG---------------ACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCCATCAAAGGTTT--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTG---AGTAACGATGTCATATGGACTAGT--TATA---GGTAAAATACACAATATGATAAA---AAAA
gi|104678                     :                                                                                                                        AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACT-TTAAAAAATAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATT---TTTAGTAGCAATGT-AC-----------AATTGATAC-AAACCCTCTAA--TTTA-ACTGAAAATGTTGAAATTA-GCAATAGGCCA-TAAAATGATGTAATA--TTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGT----GATCTATG-GAGGCACTGTGTGCAGTATGC--AGACAG--AGG-GGGGCATTATGTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAATGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---TTCTTA-AAAAGG--T---GAGAAATTCATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATG---GGTAATGATGTTAAATGG--GGGTAAAATGGCAGGTAGAATACACAGTATTAATAAC-AAAacaa
gi|104679                     :                                                                                                                        AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATGT-------CACTTCAAAAA--TAGTTGACGGACGTTACAAAA-TGGGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTGACAT---ACGC-CAAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTGAAT--AATAATCAGCCA-TAATATTATGTAATA--TAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAGATTG--GGGTACAATCAGC--ACATAG--TTGCAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                                 TG--------ATTATTTT-------CACTTCAAAAA--TATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATGTCAATG-ACCC-CTAA--TT-A-ACTCA----------------TGATTAGCCA--AA------GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT---GGT-------------GT----GATTTATGCTATTTC--AAGTACAGCATGCCAACA-TAATTGGC------------CTC------------CCAC---------ATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                            CT-CTTATA--TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATT---TCT----------T-AA-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGC------------AGCTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCCATCAAAAG--
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                        TTACAT-----AATT---TTT----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAACCT-TAAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAATAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTTTAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TTTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTTAT-AAAG------AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--CCATATATCAAAGT--TGT-----GTAAAACA-ACAAgtta
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                        TTGCAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTGATATTGAACCC-CTAA--TA-A-ACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACGCCA-TAATACTATGTGATA--T----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGT----GATTTATGCCAATTA--TGGTACAATTTAC--ACATTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---CATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACAATTTGAATAAC-CGAAAGA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                        TTACAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTGTAAGTTTACATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAAATA-GTAACAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGAT----GATTTATACTTATTA--GGGAACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCAT--------ATTACCACATTGTGTGAATGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGAAACATTCATATA------------TGGCAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT--TGT-----GTAG-----------TGAATAAC-CAAAA
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                        TTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-------------------TTG-------TAAGTTT-GCATTGA-----TTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GG-----------------T----GAATTATTCTAATTA--GGGTACAATATGC--ATACTG--CAGCAGGGTATT---TCTC--------ATCACCACATGGTGTGAATGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGAC---------------------------ACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---TATGATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GAAAGTA-ACACAATTTGAATAAC-CAAAtgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                         TACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTGATATTGAACCC-CTAG--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAATAAGCCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCT-----GTAG----CACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATAAAAT----TG---GGTAGTA-ACACAATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGACA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-ATAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACACTAATCA--GAGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACA--TAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACGCTAATTA--GAGTACAATATGC--ACCCTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGACAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATA---GATAATCA--CCATAT-ATCAAAT----TG---AGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATATcagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                          ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGA-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--CGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCC--TTTAAGG-----AACAACATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GCTAG
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGAt
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAC-CAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAACACTATGTGATA--TAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACATATTCATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAT----TG---GGTAGTA-ACACCATTTGAATAAA-CAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                           -----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-G-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGCCGGT--TAC----CGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------ATTAACACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC---TCCTAAT---ACG--A--AAAAACATTCATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT-ATCAAAC----TG---GGTAGTA-ACACAATTTGAATAAC-CAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATATGGGCTA-------------CACAATACACAATATGATAAAA-CATAAAAA
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAAATTG--GGGTACAGTCAGC--ACATAG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGC
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TACCATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATAACCACATGATGTGACTGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA-A--------------TATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--TTCAAAAA---TCACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTTATATGGGTTAGT--TATA---GATAAAAAACACAATATGGTAAAA-CAAAAAAA
gi|104704                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AACTAGTAGACTG---TGTAACGATGTCAAATGGTTTAGT--TATA---GGTAAAAAACACAATATGATAAAA-CAAAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               11111                                11111111                                                                                                55555555555                                               1                                   1111                                          1                              111     111111                                                                                                                             1                             22    22222                                                22      2222        22          1                            
lowQualScore                  :          666                           88                                  1   666                  3  55  55 22222                888888          00000000        9999999 0  5      33                                       33333    222   6666666666 6  55555555555            11  1    222 1 1                   7     1  0  1               11      3333      1        1        1       1   2222  3   0  11    11             11 000  11 444444  0  111    44444444                 2      1       11                          1                                            4 0                 222 1  1  11    33333   0 2    0   1                      222        66      2222   1    44     1  2 2 1 1  0  1 1    1  0        
lowQualScore                  :          ...                           ..                                  .   ...                  .  ..  .. .....                ......          ........        ....... .  .      ..                                       .....    ...   .......... .  ...........            ..  .    ... . .                   .     .  .  .               ..      ....      .        .        .       .   ....  .   .  ..    ..             .. ...  .. ......  .  ...    ........                 .      .       ..                          .                                            . .                 ... .  .  ..    .....   . .    .   .                      ...        ..      ....   .    ..     .  . . . .  .  . .    .  .        
lowQualScore                  :          444                           00                                  0   444                  6  00  00 77777                888888          44444444        3333333 3  3      77                                       88888    777   7777777777 2  44444444444            33  2    555 2 2                   6     0  5  1               66      3333      7        1        8       4   4444  1   1  33    66             55 888  55 333333  9  999    00000000                 3      1       55                          1                                            5 5                 111 1  3  99    66666   5 2    2   1                      333        44      4444   4    22     4  9 9 4 4  4  5 5    5  6        
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATC-AAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
Reference ( family-547 )      : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GGTC-AAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
gi|104666                     : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTTTTTT-CAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAGGA--A--AAA-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-TTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACAACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AACCAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A------AATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACACC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAAGA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAA-TCATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAACAT--AATAAAACAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATTTT-T-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-ATAATA--TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-ACAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAAATTG--ACATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-T-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTG---CGTAATGATGTCATAT---GGGC-TAGTTATAGGT-AAAATG-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTTTTTT--AATGTATT-------TTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--AA-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTCGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTATTGTCCA-TAATATCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATTTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGC-TACTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTAT-------TTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC-AA--AA--A--A--AACTGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AT-----------CATTGGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAGTTG--GGGTACAATAGGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--AAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---TGGC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTTTTTT-CAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATC-CA--AA--AAAA--AAATGAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATTT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTTGGTATTGACCCT-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAATTGTCTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAA-CTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TATA---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGAATAC---TAAAATACTGGTTAACGATGTCATAT---GGAC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCT--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AC-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCATTGTCCA-TAATACCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--AC---G--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGCGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCCATCA---T--T--AAAAA-A-TCATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATATAAAAT-ATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-AAATAA--A--A--AAATGAACAAAAA-TT------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACT-CTAATA--AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCA-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-AAATACTATGCAATA--TAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAAC
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGAcctattt
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-AA--AA--AG-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATGT-------AACT-CTAATA--TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTAGGCACTGATCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAACCA-TCATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTT---AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CC--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGATATTGACCCC-CTAA--GT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCGA-TAATACTTTGCAATA--TAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TC-CA--AA--A--AGAAAATGAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATATTTAAATTAAGTTATTGTTTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------T-TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCAGG---------------ACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCCATCAAAGGTTT--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTG---AGTAACGATGTCATAT---GGAC-TAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-G-AT-AA--AAAAAA
gi|104678                     :                                                                                                                         AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACT-TTAAAAAATAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATT---TTTAGTAGCAATGT-AC-----------AATTGATAC-AAACCCTCTAA--TTTA-ACTGAAAATGTTGAAATTA-GCAATAGGCCA-TAAAATGATGTAATA--TTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGT----GATCTATG-GAGGCACTGTGTGCAGTATGC--AGACAG--AGG-GGGGCATTATGTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAATGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---TTCTTA-AAAAGG--T---GAGAAATTCATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATG---GGTAATGATGTTAAATGGGGGTA-AAATGGCAGGT-AGAATA-C-ACAGTAT-TAAT-AACAAAcaa
gi|104679                     :                                                                                                                         AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATGT-------CACTTCAAAAA--TAGTTGACGGACGTTACAAAA-TGGGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTGACAT---ACGC-CAAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTGAAT--AATAATCAGCCA-TAATATTATGTAATA--TAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAGATTG--GGGTACAATCAGC--ACATAG--TTGCAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                                  TG--------ATTATTTT-------CACTTCAAAAA--TATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATGTCAATG-ACCC-CTAA--TT-A-ACTCA----------------TGATTAGCCA--AA------GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT---GGT-------------GT----GATTTATGCTATTTC--AAGTACAGCATGCCAACA-TAATTGGC------------CTC------------CCAC---------ATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                             CT-CTTATA--TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATT---TCT----------T-AA-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGC------------AGCTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCCATCAAAAG--
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAACCT-TAAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAATAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTTTAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TTTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTTAT-AAAG------AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATC-AAAGT-TGTGT-A-AA-A-CAACAAgtta
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                         TTGCAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTGATATTGAACCC-CTAA--TA-A-ACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACGCCA-TAATACTATGTGATA--T----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGT----GATTTATGCCAATTA--TGGTACAATTTAC--ACATTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---CATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCGAAAGA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTGTAAGTTTACATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAAATA-GTAACAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGAT----GATTTATACTTATTA--GGGAACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCAT--------ATTACCACATTGTGTGAATGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGAAACATTCATATA------------TGGCAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAATTGT--GT-AG-------------T-GAAT-AACCAAAA
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-------------------TTG-------TAAGTTT-GCATTGA-----TTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GG-----------------T----GAATTATTCTAATTA--GGGTACAATATGC--ATACTG--CAGCAGGGTATT---TCTC--------ATCACCACATGGTGTGAATGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGAC---------------------------ACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---TATGATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGAA-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAtgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                          TACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTGATATTGAACCC-CTAG--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAATAAGCCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCT-----GTAG----CACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATA-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGACA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-ATAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACACTAATCA--GAGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACA--TAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACGCTAATTA--GAGTACAATATGC--ACCCTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGACAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATC-AAAT--TGAGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---cagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGA-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--CGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCC--TTTAAGG-----AACAACATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGCT-AG
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGAt
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAACACTATGTGATA--TAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACATATTCATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AAACAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-G-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGCCGGT--TAC----CGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------ATTAACACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC---TCCTAAT---ACG--A--AAAAACATTCATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATC-AAAC--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATGTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTACACAAT----------A-C-ACAATAT-G-AT-AA
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAAATTG--GGGTACAGTCAGC--ACATAG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGCaacataaaaa
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACCATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATAACCACATGATGTGACTGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA--------------AT-ATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--TTCAAAAA---TCACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTTATAT---GGGT-TAGTTATAGATAAAAA-A-C-ACAATAT-GGTA-AAACAAAAAAA
gi|104704                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTAGTAGACTG---TGTAACGATGTCAAAT---GGTT-TAGTTATAGGT-AAAA-AAC-ACAATAT-GATA-AAACAAAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               11111                                11111111                                                                                                55555555555                                               1                                   1111                                          1                              111     111111                                                                                                                             1                             22    22222                                                22      2222       22          1                            
lowQualScore                  :          666                           88                                  1   666                  3  55  55 22222                888888          00000000        9999999 0  5      33                                       33333    222   6666666666 6  55555555555            11  1    222 1 1                   7     1  0  1               11      3333      1        1        1       1   2222  3   0  11    11             11 000  11 444444  0  111    44444444                 2      1       11                          1                                            4 0                 222 1  1  11    33333   0 2    0   1                      222        66      2222   0   44     1  2 3 1 1  0  1 1    1  0        
lowQualScore                  :          ...                           ..                                  .   ...                  .  ..  .. .....                ......          ........        ....... .  .      ..                                       .....    ...   .......... .  ...........            ..  .    ... . .                   .     .  .  .               ..      ....      .        .        .       .   ....  .   .  ..    ..             .. ...  .. ......  .  ...    ........                 .      .       ..                          .                                            . .                 ... .  .  ..    .....   . .    .   .                      ...        ..      ....   .   ..     .  . . . .  .  . .    .  .        
lowQualScore                  :          444                           00                                  0   444                  6  00  00 77777                888888          44444444        3333333 3  3      77                                       88888    777   7777777777 2  44444444444            33  2    555 2 2                   6     0  5  1               66      3333      7        1        8       4   4444  1   1  33    66             55 888  55 333333  9  999    00000000                 3      1       55                          1                                            5 5                 111 1  3  99    66666   5 2    2   1                      333        44      4444   3   88     4  4 3 5 5  8  5 5    5  6        
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATCAAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
Reference ( family-547 )      : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATCAAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
gi|104666                     : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTTTTTT-CAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAGGA--A--AAA-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-TTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACAACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AACCAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A------AATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACACC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAAGA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAA-TCATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAACAT--AATAAAACAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATTTT-T-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-ATAATA--TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-ACAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAAATTG--ACATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-T-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTG---CGTAATGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATG-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTTTTTT--AATGTATT-------TTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--AA-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTCGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTATTGTCCA-TAATATCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATTTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTACTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTAT-------TTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC-AA--AA--A--A--AACTGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AT-----------CATTGGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAGTTG--GGGTACAATAGGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--AAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---TGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTTTTTT-CAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATC-CA--AA--AAAA--AAATGAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATTT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTTGGTATTGACCCT-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAATTGTCTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAA-CTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TATA---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGAATAC---TAAAATACTGGTTAACGATGTCATAT---GGACTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCT--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AC-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCATTGTCCA-TAATACCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--AC---G--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGCGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCCATCA---T--T--AAAAA-A-TCATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATATAAAAT-ATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-AAATAA--A--A--AAATGAACAAAAA-TT------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACT-CTAATA--AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCA-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-AAATACTATGCAATA--TAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAAC
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGAcctattt
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-AA--AA--AG-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATGT-------AACT-CTAATA--TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTAGGCACTGATCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAACCA-TCATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTT---AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CC--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGATATTGACCCC-CTAA--GT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCGA-TAATACTTTGCAATA--TAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TC-CA--AA--A--AGAAAATGAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATATTTAAATTAAGTTATTGTTTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------T-TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCAGG---------------ACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCCATCAAAGGTTT--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTG---AGTAACGATGTCATAT---GGACTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-G-AT-AA--AAAAAA
gi|104678                     :                                                                                                                         AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACT-TTAAAAAATAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATT---TTTAGTAGCAATGT-AC-----------AATTGATAC-AAACCCTCTAA--TTTA-ACTGAAAATGTTGAAATTA-GCAATAGGCCA-TAAAATGATGTAATA--TTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGT----GATCTATG-GAGGCACTGTGTGCAGTATGC--AGACAG--AGG-GGGGCATTATGTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAATGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---TTCTTA-AAAAGG--T---GAGAAATTCATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATG---GGTAATGATGTTAAATGGGGGTAAAATGGCAGGT-AGAATA-C-ACAGTAT-TAAT-AACAAAcaa
gi|104679                     :                                                                                                                         AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATGT-------CACTTCAAAAA--TAGTTGACGGACGTTACAAAA-TGGGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTGACAT---ACGC-CAAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTGAAT--AATAATCAGCCA-TAATATTATGTAATA--TAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAGATTG--GGGTACAATCAGC--ACATAG--TTGCAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                                  TG--------ATTATTTT-------CACTTCAAAAA--TATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATGTCAATG-ACCC-CTAA--TT-A-ACTCA----------------TGATTAGCCA--AA------GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT---GGT-------------GT----GATTTATGCTATTTC--AAGTACAGCATGCCAACA-TAATTGGC------------CTC------------CCAC---------ATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                             CT-CTTATA--TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATT---TCT----------T-AA-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGC------------AGCTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCCATCAAAAG--
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAACCT-TAAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAATAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTTTAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TTTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTTAT-AAAG------AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATCAAAGT-TGTGT-A-AA-A-CAACAAgtta
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                         TTGCAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTGATATTGAACCC-CTAA--TA-A-ACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACGCCA-TAATACTATGTGATA--T----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGT----GATTTATGCCAATTA--TGGTACAATTTAC--ACATTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---CATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCGAAAGA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTGTAAGTTTACATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAAATA-GTAACAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGAT----GATTTATACTTATTA--GGGAACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCAT--------ATTACCACATTGTGTGAATGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGAAACATTCATATA------------TGGCAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAATTGT--GT-AG-------------T-GAAT-AACCAAAA
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-------------------TTG-------TAAGTTT-GCATTGA-----TTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GG-----------------T----GAATTATTCTAATTA--GGGTACAATATGC--ATACTG--CAGCAGGGTATT---TCTC--------ATCACCACATGGTGTGAATGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGAC---------------------------ACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---TATGATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGAA-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAtgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                          TACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTGATATTGAACCC-CTAG--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAATAAGCCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCT-----GTAG----CACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATAAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGACA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-ATAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACACTAATCA--GAGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACA--TAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACGCTAATTA--GAGTACAATATGC--ACCCTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGACAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATCAAAT--TGAGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---cagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGA-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--CGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCC--TTTAAGG-----AACAACATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGCT-AG
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGAt
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAACACTATGTGATA--TAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACATATTCATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AAACAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-G-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGCCGGT--TAC----CGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------ATTAACACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC---TCCTAAT---ACG--A--AAAAACATTCATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAC--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATGTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---G
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAAATTG--GGGTACAGTCAGC--ACATAG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGCggctacacaatacacaatatgataaaacataaaaa
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACCATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATAACCACATGATGTGACTGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA--------------AT-ATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--TTCAAAAA---TCACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTTATAT---GGGTTAGTTATAGATAAAAA-A-C-ACAATAT-GGTA-AAACAAAAAAA
gi|104704                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTAGTAGACTG---TGTAACGATGTCAAAT---GGTTTAGTTATAGGT-AAAA-AAC-ACAATAT-GATA-AAACAAAACAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               11111                                11111111                                                                                                55555555555                                               1                                   1111                                          1                              111     111111                                                                                                                             1                             22    22222                                                22      2222       22          1                            
lowQualScore                  :          666                           88                                  1   666                  3  55  55 22222                888888          00000000        9999999 0  5      33                                       33333    222   6666666666 6  55555555555            11  1    222 1 1                   7     1  0  1               11      3333      1        1        1       1   2222  3   0  11    11             11 000  11 444444  0  111    44444444                 2      1       11                          1                                            4 0                 222 1  1  11    33333   0 2    0   1                      222        66      2222   0   44     1  2 3 1 1  0  1 1    1  0        
lowQualScore                  :          ...                           ..                                  .   ...                  .  ..  .. .....                ......          ........        ....... .  .      ..                                       .....    ...   .......... .  ...........            ..  .    ... . .                   .     .  .  .               ..      ....      .        .        .       .   ....  .   .  ..    ..             .. ...  .. ......  .  ...    ........                 .      .       ..                          .                                            . .                 ... .  .  ..    .....   . .    .   .                      ...        ..      ....   .   ..     .  . . . .  .  . .    .  .        
lowQualScore                  :          444                           00                                  0   444                  6  00  00 77777                888888          44444444        3333333 3  3      77                                       88888    777   7777777777 2  44444444444            33  2    555 2 2                   6     0  5  1               66      3333      7        1        8       4   4444  1   1  33    66             55 888  55 333333  9  999    00000000                 3      1       55                          1                                            5 5                 111 1  3  99    66666   5 2    2   1                      333        44      4444   3   88     4  4 3 5 5  8  5 5    5  6        
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATCAAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
Reference ( family-547 )      : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATCAAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
gi|104666                     : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTTTTTT-CAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAGGA--A--AAA-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-TTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACAACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AACCAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A------AATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACACC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAAGA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAA-TCATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAACAT--AATAAAACAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATTTT-T-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-ATAATA--TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-ACAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAAATTG--ACATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-T-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTG---CGTAATGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATG-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTTTTTT--AATGTATT-------TTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--AA-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTCGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTATTGTCCA-TAATATCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATTTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTACTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTAT-------TTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC-AA--AA--A--A--AACTGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AT-----------CATTGGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAGTTG--GGGTACAATAGGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--AAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---TGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTTTTTT-CAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATC-CA--AA--AAAA--AAATGAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATTT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTTGGTATTGACCCT-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAATTGTCTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAA-CTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TATA---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TATTTGTCCAGAATAC---TAAAATACTGGTTAACGATGTCATAT---GGACTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCT--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AC-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCATTGTCCA-TAATACCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--AC---G--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGCGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCCATCA---T--T--AAAAA-A-TCATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---GGGCTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATATAAAAT-ATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-AAATAA--A--A--AAATGAACAAAAA-TT------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACT-CTAATA--AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCA-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-AAATACTATGCAATA--TAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGGT-T--AAAAAC
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGAcctattt
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-AA--AA--AG-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATGT-------AACT-CTAATA--TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTAGGCACTGATCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAACCA-TCATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTT---AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CC--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGATATTGACCCC-CTAA--GT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCGA-TAATACTTTGCAATA--TAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TC-CA--AA--A--AGAAAATGAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATATTTAAATTAAGTTATTGTTTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------T-TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCAGG---------------ACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCCATCAAAGGTTT--AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTG---AGTAACGATGTCATAT---GGACTAGTTATAGGT-AAAATA-C-ACAATAT-G-AT-AA--AAAAAA
gi|104678                     :                                                                                                                         AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACT-TTAAAAAATAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATT---TTTAGTAGCAATGT-AC-----------AATTGATAC-AAACCCTCTAA--TTTA-ACTGAAAATGTTGAAATTA-GCAATAGGCCA-TAAAATGATGTAATA--TTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGT----GATCTATG-GAGGCACTGTGTGCAGTATGC--AGACAG--AGG-GGGGCATTATGTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAATGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---TTCTTA-AAAAGG--T---GAGAAATTCATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATG---GGTAATGATGTTAAATGGGGGTAAAATGGCAGGT-AGAATA-C-ACAGTAT-TAAT-AACAAAcaa
gi|104679                     :                                                                                                                         AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATGT-------CACTTCAAAAA--TAGTTGACGGACGTTACAAAA-TGGGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTGACAT---ACGC-CAAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTGAAT--AATAATCAGCCA-TAATATTATGTAATA--TAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAGATTG--GGGTACAATCAGC--ACATAG--TTGCAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                                  TG--------ATTATTTT-------CACTTCAAAAA--TATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATGTCAATG-ACCC-CTAA--TT-A-ACTCA----------------TGATTAGCCA--AA------GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT---GGT-------------GT----GATTTATGCTATTTC--AAGTACAGCATGCCAACA-TAATTGGC------------CTC------------CCAC---------ATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                             CT-CTTATA--TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATT---TCT----------T-AA-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGC------------AGCTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCCATCAAAAG--
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAACCT-TAAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAATAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTTTAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TTTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTTAT-AAAG------AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATCAAAGT-TGTGT-A-AA-A-CAACAAgtta
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                         TTGCAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTGATATTGAACCC-CTAA--TA-A-ACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACGCCA-TAATACTATGTGATA--T----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGT----GATTTATGCCAATTA--TGGTACAATTTAC--ACATTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---CATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCGAAAGA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTGTAAGTTTACATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAAATA-GTAACAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGAT----GATTTATACTTATTA--GGGAACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCAT--------ATTACCACATTGTGTGAATGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGAAACATTCATATA------------TGGCAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAATTGT--GT-AG-------------T-GAAT-AACCAAAA
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-------------------TTG-------TAAGTTT-GCATTGA-----TTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GG-----------------T----GAATTATTCTAATTA--GGGTACAATATGC--ATACTG--CAGCAGGGTATT---TCTC--------ATCACCACATGGTGTGAATGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGAC---------------------------ACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---TATGATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGAA-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAtgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                          TACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTGATATTGAACCC-CTAG--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAATAAGCCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCT-----GTAG----CACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATAAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGACA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-ATAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACACTAATCA--GAGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACA--TAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACGCTAATTA--GAGTACAATATGC--ACCCTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGACAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AACAACATTCCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATA---GATAATCA--CCATAT----ATCAAAT--TGAGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---cagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT---
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGTAT--AAGA-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--CGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCC--TTTAAGG-----AACAACATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGCT-AG
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGAt
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAACACTATGTGATA--TAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCTAT--AAGG-----AGACATATTCATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGTA-A-C-ACCATTT-GAAT-AAACAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-G-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGCCGGT--TAC----CGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------ATTAACACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC---TCCTAAT---ACG--A--AAAAACATTCATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAC--TGGGT-AGTA-A-C-ACAATTT-GAAT-AACCAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATGTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--T--TAAAAAATCC-TGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATAT---G
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAAATTG--GGGTACAGTCAGC--ACATAG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGCggctacacaatacacaatatgataaaacataaaaa
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACCATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATAACCACATGATGTGACTGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA--------------AT-ATATTCCATATGACAC---TATCCATCAAAGG--TTCAAAAA---TCACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTTATAT---GGGTTAGTTATAGATAAAAA-A-C-ACAATAT-GGTA-AAACAAAAAAA
gi|104704                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AACTAGTAGACTG---TGTAACGATGTCAAAT---GGTTTAGTTATAGGT-AAAA-AAC-ACAATAT-GATA-AAACAAAACAA


blockSeqs                     :          TTT                           TT                                  A   CTG                  T  AT  .  AAA                  GTTCGT          CATTAAAA        TTAAATT    T      AA                                       TTATC    GTA   AGTAGCAATG T  TTGTAAGTTTG            CA  T    GTT T C                   A     T     G               GG      ACAT      T        G        A       T   GTCA  A      AA    CT             CA TTT  AT TGCAGG     ATG    CAATGTAT                 C      C       GA                          G                                            A                   ATA A  C  CA    TTT       A        T                      CTG        TG      GGGG       TA     A  A T A A     A A    A
blockSeqs                     :          .                             T                                   T   .                    .  .   .  AGA                  .               .               .          T      .                                        .        .     .          T  TTGTAAGTTTA            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  GAC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    TTC       A        T                      .          TG      G          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             T                                   T   .                    .  .   .  AA                   .               .               .          .      .                                        .        .     .          T  TTGAAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAT  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    TT        A        T                      .          TG      G          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             T                                   T   .                    .  .   .  GA                   .               .               .          .      .                                        .        .     .          T  TTGTAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         A        T                      .          TG      G          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             T                                   T   .                    .  .   .  A                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTGCAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAT  .  AGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         A        T                      .          TG      T          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             T                                   A   .                    .  .   .  A                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTGCAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         C        T                      .          TG      G          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             T                                   T   .                    .  .   .  A                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTGTAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ATAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  TAC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         C        T                      .          TG      G          TA     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             .                                   A   .                    .  .   .  A                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTGTAAGTTTG            TC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         A        T                      .          TG      G          GG     .  A T . .     A .    .
blockSeqs                     :          .                             .                                   A   .                    .  .   .  A                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTGTAAGTTTG            CC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       T   .     A      AA    .              .  CAA  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         C        T                      .          TG      G          TG     .  A . . .     T .    .
blockSeqs                     :          .                             .                                   A   .                    .  .   .  .                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  TTTAAGTTTG             CC  .    G   . .                   A     T     .               .       ACAT      A        .        T       G   .     T      GA    .              .  CAC  .  GACAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            A                   .   T  T  AA    T         C        A                      .          TG      G          TA     .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  .                      AC  .    A   . .                   A     A     .               .       GCAT      A        .        A       G   .     A      AG    .              .  CCC  .  GGCAGG     .      .                        C      .       .                           .                                            A                   .   A  C  CA    T         C        A                      .          TG      G          TA     .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                    .               .               .          .      .                                        .        .     .          .  .                      AC  .    T   . .                   A     C     .               .       ACAT      A        .        A       T   .     T      TA    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  TT    A         C        A                      .          .       .          T      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                    .               .          .      .                                        .        .     .          .  .                      AC  .    A   . .                   A     T     .               .       ACAT      T        .        A       G   .     A      AA    .              .  CAC  .  GGCAGT     .      .                        C      .       .                           .                                            .                   .   C  T  CA    T         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                               .      .                                        .        .     .          .  .                      CC  .    T   . .                   A     T     .               .       TCAT      A        .        A       G   .     T      TA    .              .  CAC  .  GGCAGT     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  CA    .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AC  .    A   . .                   .     A     .               .       ACAT      A        .        A       G   .     T      CA    .              .  CAC  .  GGCAGT     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  A     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AC  .    T   . .                   .     A     .               .       ACAT      A        .        A       G   .     T      TT    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AC  .    T   . .                   .     A     .               .       ACAT      A        .        T       G   .     A      TA    .              .  CAA  .  GGCAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AC  .    T   . .                   .     A     .               .       ACAT      A        .        T       G   .     T      TA    .              .  CAC  .  GGCAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       ACAT      A        .        T       G   .     T      TT    .              .  CAA  .  GGCAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       A         T        .        T       G   .     T      TA    .              .  CAA  .  TGTAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         T        .        T       G   .     T      TA    .              .  CAC  .  TGTAGG     .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     A      TT    .              .  CAC  .  GGGGG      .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     T .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     A      TT    .              .  TGT  .  GGC        .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  T . . .     A .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     .      TT    .              .  CAT  .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  A . . .     A .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                               .        .     .          .  .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       T   .     .      TT    .              .  CA   .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .  A . . .     . .    .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     .      TT    .              .  C    .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         T        A                      .          .       .          .      .  . . . .             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     .      TT    .              .  .    .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  T  .     .         C        A                      .          .       .          .      .                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       G   .     .      TT    .              .  .    .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  A  .     .         A        A                      .          .       .                                        
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        T       T   .     .      TT    .              .  .    .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   C  C  .     .         .        T                      .          .                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        A       G   .     .      TT    .              .  .    .  .          .      .                        A      .       .                           .                                            .                   .   A  C  .     .         .        T                      .          .                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AA  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        A       T   .     .      TT    .              .  .    .  .          .      .                        C      .       .                           .                                            .                   .   A  .  .     .         .                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      AC  .    T   . .                   .     A     .               .       .         A        .        A       G   .     .      TA    .              .  .    .  .          .      .                        C      .       .                           .                                            .                   .   .  .  .                                                                                                           
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                            .                      .   .    T   . .                   .     A     .               .       .         T        .        .       .   .     .      AA    .              .  .    .  .          .      .                        C      .       .                           .                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            T     .               .                          .        .       .   .     .      AA    .              .  .    .  .          .      .                        .      .       .                           .                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .  .    .  .          .      .                        .      .       .                           .                                                                                                                                                                                      


blockSeqCons                  :                                                                                                            **                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CAC     GGCAGG                                                                                                                                                           **    *****                                                **      ****       **
originalCons                  : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCATCAAAGG--T--AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCATGTCATAT---GATCAAATTATGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
finalCons                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCCAT--AAGG-----AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATAT----ATCAAAT--TGGGT-AGNA-A-C-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                               11111                                11111111                                                                                                55555555555                                               1                                   1111                                          1                              111     111111                                                                                                                             1                              222                                                       11                            11                    11                           
lowQualScore                  :          666                           88                                  1   666                  3  55  55 22222                888888          00000000        9999999 0  5      33                                       33333    222   6666666666 6  55555555555            11  1    222 1 1                   7     1  0  1               11      3333      1        1        1       1   2222  3   0  11    11             11 000  11 444444  0  111    44444444                 2      1       11                          1                                            4 0                 222 1  11  000    888 1 0 3        1                      222        44     1 99 444444 33333    1 22  222 22   1 666666 55  1  0  1 1    1           
lowQualScore                  :          ...                           ..                                  .   ...                  .  ..  .. .....                ......          ........        ....... .  .      ..                                       .....    ...   .......... .  ...........            ..  .    ... . .                   .     .  .  .               ..      ....      .        .        .       .   ....  .   .  ..    ..             .. ...  .. ......  .  ...    ........                 .      .       ..                          .                                            . .                 ... .  ..  ...    ... . . .        .                      ...        ..     . .. ...... .....    . ..  ... ..   . ...... ..  .  .  . .    .           
lowQualScore                  :          444                           00                                  0   444                  6  00  00 77777                888888          44444444        3333333 3  3      77                                       88888    777   7777777777 2  44444444444            33  2    555 2 2                   6     0  5  1               66      3333      7        1        8       4   4444  1   1  33    66             55 888  55 333333  9  999    00000000                 3      1       55                          1                                            5 5                 111 1  55  555    888 0 5 0        1                      333        77     3 00 111111 66666    4 77  555 00   4 000000 44  5  8  5 5    5           
consensus                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCC-ATC--AAGG---AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----NA--AC-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
Reference ( family-547 )      : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCANCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATNAGCCA-TAATACTATGCGATA--TAACATACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATNAAACCTGGGGT----GAATTACGCNAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCC-AT---AAGG---AGAAACATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----NA--AC-ACAATNT-GAAT-AACCAAAAGAA
gi|104666                     : TTTTTTTGA---ATTGATAGAATCAACTACACTTTTTTTT-CAATGTTTTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AAGGA--A--AAA-GAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-TTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACAACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AACTATGAAAGCTCACCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACACTTTGTGCAATATGCATGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGGTT-AAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATA-TG-G------G-----CTAG-TTATA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATAT-GATA-AACCAAAAAAA
gi|104667                     : TTTTTTTGA---ATCGATAGAATCAATTTCACTTTTTTTT-CAGTGCATTAAGTATTTAATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A------AATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGCTGAATGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----TATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACACC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATGAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAAGA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGTGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTTGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAAAAATCATATTTGTCCAGATAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATA-TG-G------G-----CTAG-TTATA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAACAT--AATAAAACAAAAAAA
gi|104668                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTATTTT-T-CAATGTATTAGGTTTTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-ATAATA--TAGGGGATGAATGTAACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-ACAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTTAATTGAGAAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGTGTCAGAATTATGCAAATTG--ACATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTCGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGCAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAAAAATCCT-TTTGTCCAGGTAACCAGTAGACTG---CGTAATGATGTCATA-TG-G------G-----CTAG-TTATA---G--GTA-A-----AAT-GC-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104669                     : TTTTTTTTA---ATTCATAGAATCAATTTCACATTTTTTT--AATGTATT-------TTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-CA--AA--AA-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGGCGCTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-----------CATTCGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ATTGAAAATGTTTAAATTAAGTTATTGTCCA-TAATATCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATTTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACTTTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAAAAATCCTATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTT---GGTAACGATGTCATA-T--GGGCTACT-----TA------TA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104670                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTAT-------TTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATACTTTATC-AA--AA--A--A--AACTGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAACAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AT-----------CATTGGTATTGACCCC-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTAACTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAGTTG--GGGTACAATAGGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GAAACTGGACAGTAGCGTACATTGTTTTCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGGT--AAAAAAATCC-TATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATATT--G------G-----CTAG-TTATA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAA
gi|104671                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCA-TTTTTTTT-CAGTGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAAGGTGCATCTA---AGACATGAATAATTTATC-CA--AA--AAAA--AAATGAACACACATTT------AGAGATTTTG--------TTCAATTT-------CGCT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAACAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTTGGTATTGACCCT-ATAA--AT-A-ACTGAAAATGTTCAAATTGAGTAATTGTCTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTTATAAAA-CTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TATA---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTATAGT-GTTGGTG--AATTATGGAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCTATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAAAAATCCTATTTGTCCAGAATAC---TAAAATACTGGTTAACGATGTCATA-TGGA------C-----TAGT-TA-TA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATAT-GATA-AAACAAAAAAA
gi|104672                     : TTTTTTTGA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTTTTT--CAATGTATTAAGTATTTTAAGTTTGCAGAGTACAACTACTGAGATATAAAAAAATTATCTCT--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TACGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTAACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AC-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTCATTGTCCA-TAATACCATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--AC---G--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGCGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATAATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTGGGCAAATATATTCCATG-GATATATATATCC-AT---CATT---AAAAA-A-TCATATTTATCAAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGATGTCATA-TG-G------G-----CTAG-TTATA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATATAAAAT-ATATAAAAAAA
gi|104673                     : TTTTTTTCA---ATTTATAGAATCAATTTCACTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCATCTA---AGATATGAATAATTTATC-AAATAA--A--A--AAATGAACAAAAA-TT------AGAGATTTTG--------TTTAACG--------CACT-CTAATA--AAGGGGATGAACGTTACAAAAAGAGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCCA-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCCA-AAATACTATGCAATA--TAACATATATCCTATCTTAAACCCT-GGGGACATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGATACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGAATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATATAATTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGGTT-AAAAAC
gi|104674                     : TTTTTTTGTTTTATTTATGGAATCAATTTCGCTTTT-TTT-CAATGTATTAAGTATTTTATATTTGCAGAGTGCAACTA---AGAcctattt
gi|104675                     :   TTTTTTA---ATTTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTTTTCAATGTAATAAGTATTTTTTGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-AA--AA--AG-A--AAATGAACAAAAATTT------AGAGGTTGTG--------TTTAATGT-------AACT-CTAATA--TGGGGGATGAACGGTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAA-----AATT---TCT----------T-AC-----------CGTAGGCACTGATCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTAAATCAAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCCTGGGGGTCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T------TTTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAAT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAACTGGACAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAACCATCATATTTGTCCA
gi|104676                     :    TTTTGA---ACGTATAGAATCAATTTCGCTTTTTTT---AATGTATGAAGTATTTTATGTTTGCAGAGTGCAACTA---AGATATGAATAATTTATC-CC--AA--A--A--AAATGAACAAAAATTT------TGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGATGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGATATTGACCCC-CTAA--GT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAAGTAATTGTCGA-TAATACTTTGCAATA--TAACATAC
gi|104677                     :                                                                                                   TC-CA--AA--A--AGAAAATGAACACAAATTT------AGAGATTTTG--------TTTAATGT-------CACT-CTAATA--TAGGGGATGAACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----AATT---TCT----------T-AC-----------CATTGGTATTGACCTC-CTAA--AT-A-ACTGAAAATATTTAAATTAAGTTATTGTTTA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACCTT-GGGGTCATAAATGCTGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------T-TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCACAGCAGG---------------ACAGTAGCAAACACCTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAA---TATCC-ATCA-AAGGTTTAAAAA---TCATATTTGTCCAGGTAACTAATATACTG---AGTAACGATGTCATA-TGGA------C-----TAGT-TA-TA---G--GTA-A-----AAT-AC-ACAATAT-G-AT-AA--AAAAAA
gi|104678                     :                                                                                                                         AACAAAAATTA------AGAGAATTTGCATTAAAATTGAATGTTTAAATTCACT-TTAAAAAATAGGGGACAGACGTTACAAAAAGGGGACGGACGTTACAT-----GATT---TTTAGTAGCAATGT-AC-----------AATTGATAC-AAACCCTCTAA--TTTA-ACTGAAAATGTTGAAATTA-GCAATAGGCCA-TAAAATGATGTAATA--TTACATACATCCTGTCATTAACCCA-GGGGTTATTAAACATGGGGT----GATCTATG-GAGGCACTGTGTGCAGTATGC--AGACAG--AGG-GGGGCATTATGTCTCCAATGTATATTACCACATGGTGTGAATGTAGTCCTTGGGGGAAATTTGGAGAGCACAGTAGGATGTCAGGTAGATTGACAGTAGCATATACCTTATACAATATAGATGTAGAC-ATTATATTCCATTTGGCAC---TTCTTAAA---AAGG---TGAGAAATTCATACTTGTCCTGGGAAC---TAGAATG---GGTAATGA--TGTTA-A--A------TGGGGGTAAA-A--TGGCAG--GTA-G-----AAT-AC-ACAGTAT-TAAT-AACAAAcaa
gi|104679                     :                                                                                                                         AACAAAACTTTGTTCGTAGAA----TA--------TTTAATGT-------CACTTCAAAAA--TAGTTGACGGACGTTACAAAA-TGGGACGTACGTTACAT-----AATT------------------AC-----------CACTGACAT---ACGC-CAAA--AT-A-ACTGAAAATGTTTGAAT--AATAATCAGCCA-TAATATTATGTAATA--TAACAAGCATCCTGCCATAAACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAGATTG--GGGTACAATCAGC--ACATAG--TTGCAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-TTTGGCA--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTCAAAAGTAGCATACACTTTGT
gi|104680                     :                                                                                                                                                  TG--------ATTATTTT-------CACTTCAAAAA--TATGTGACGGATGTTACAAAAAGGGGACAGACATTACATTTATCACTTGTATGT----------C-AC-----------CAATGTCAATG-ACCC-CTAA--TT-A-ACTCA----------------TGATTAGCCA--AA------GCGAAAGGTTATATACATCCTGTCATAAACCCT---GGT-------------GT----GATTTATGCTATTTC--AAGTACAGCATGCCAACA-TAATTGGC------------CTC------------CCAC---------ATGTGGT-GGTGGGA--GATTAGTAAAGCTTATCAGGAAGTCA-GTAAC
gi|104681                     :                                                                                                                                                                             CT-CTTATA--TAGGGGATGGACGTTATAAAAAGGGGACAGACTTAACAT-----AATT---TCT----------T-AA-----------CATTGGTATTGACCCC-CTAA--AT-A-ACCGAAAATGTTTAAAT-AAGTAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTGTCTTAAACCCT-GGGATCATAAAACCTGTGGT----GAATTATGCAAAATG--GGGTACAATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AATCATGAAAGCTCAGC------------AGCTGGGCAGTAGCATACATTTTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATACTATATGACAC---TATCC-ATCAAAAGG---
gi|104682                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AGTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAACCT-TAAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTAA-TAATAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TTCATCATGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAAGCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTTTAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TTTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTACGAAAGCTCAGCAGAGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCGATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAT---TCCTT-AT---AAAG---AGAAACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--CCATA-T--A------T-----CAAAGT--TG---T--GTA-------AA--ACAACAAtta
gi|104683                     :                                                                                                                                                                                                                         TTGCAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTTAAGTTTG-CATTGATATTGAACCC-CTAA--TA-A-ACTGAAAATGATTAAAT-AAGTAATACGCCA-TAATACTATGTGATA--T----TACATCCGGCCATCAACCAT-GGGGTCATAAAACCTTGGGT----GATTTATGCCAATTA--TGGTACAATTTAC--ACATTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTGGCATACACTTTGTGCAATATACATGAAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---CATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACAATTT-GAAT-AACCGAAAGA
gi|104684                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----ATTT---TTT----------T-ACTTGTAAGTTTACATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAAATA-GTAACAAGCCA-TAATACTATGTGATT--T----TACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGAT----GATTTATACTTATTA--GGGAACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCAT--------ATTACCACATTGTGTGAATGTAGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGTTCAGCAGGGTGCCA-TTAGCTGGACAGTAACATTCACTTTGTGCAATATGCCTGTAAAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGAAACATTCATATA------------TGGCAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---T--GTA-G------------------T-GAAT-AACCAAAA
gi|104685                     :                                                                                                                                                                                                                         TTACAT-----AATT---TTT----------T-AC-------------------TTG-------TAAGTTT-GCATTGA-----TTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GG-----------------T----GAATTATTCTAATTA--GGGTACAATATGC--ATACTG--CAGCAGGGTATT---TCTC--------ATCACCACATGGTGTGAATGTTGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGTCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---------------------------ATTCATATATGTCCAGGGAACTGGTAGAATA---TATGATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--AAA-G-----TA--AC-ACAATTT-GAAT-AACCAAAtgcagtgccagttatgtaaaacaacaaaa
gi|104686                     :                                                                                                                                                                                                                          TACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGAAAGTTTGCATTGATATTGAACCC-CTAG--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTG-GTAATAAGCCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATAAAACCTGGGGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCT-----GTAG----CACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----AAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACAATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104687                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGACA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTTCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104688                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-ATAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACACTAATCA--GAGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104689                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------T-ACTTGCAAGTTTGCATTGATATTGAAACA--TAA--TT-A-ACAGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCTTAATCCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GATTTACGCTAATTA--GAGTACAATATGC--ACCCTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGAGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTACCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AACAACATTCATACATGTTCAGGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104690                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGACAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTTAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTATGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTTTATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AACAACATTCCTACATGTTCAGGGAACTGGTGGAATA---GATAATCA--CCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---A--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104691                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--cagtgccagttatgtgaaacaacaaaaaaa
gi|104692                     :                                                                                                                                                                                                                           ACAT-----AATT---TTT----------TTACTTGTAAGTTTGCATTGATATTGAAACC-CTTA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAAGCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGT----------------GTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCGTATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--
gi|104693                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104694                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCGT-AT---AAGA---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104695                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGTGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104696                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACAATGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TTACGCTTATTA--CGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-TT---AAGG---AACAACATGCATACATGTTCATGGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--CTA-G-----
gi|104697                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGAt
gi|104698                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTAATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAATACTGTGTGATA--TAACAT----CCTGTCATAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGGGGT----GA-TCACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACAATG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTAAGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACACATTCATATATGTTCAGAGAACTGGTAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AACCAAAAGA
gi|104699                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAAACC-CTAA--TT-A-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGGCA-TAACACTATGTGATA--TAAC-TA-----TGTCAGAAACCCT-GGGGTCATTAAACCTGTGGT----GA-TTACGCTTATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TGGCAGGGTATT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTAACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATATTCCATATGACAC---TCCCT-AT---AAGG---AGACATATTCATATATGTTAAGAGAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-T--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACCATTT-GAAT-AAACAAAAGA
gi|104700                     :                                                                                                                                                                                                                                                            -----------CATTGATATTGAACCC-CTAA--TT-G-ACTGAAAATGTTTAAATTA-GTAATAAGCCGGT--TAC----CGATA------GTACATCCTGTCATAAACCCT-GGGGTTATAAAACCTGGAGT----GATTTATGCTAATTA--GGGTACAATATGC--ACACTG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------ATTAACACATGGTGTGAATGTGGT-GTTGGTG--ACTTATGAAAGCTCAGCAGGGTGCCA-GTAGCTGGACAGTTACATACACTTTGTGCAATATGCCTGTAGAC-ATTATTTTCCATATGACAC---TCCTA-AT---ACGA---AAAAACATTCATATATGTTCAGGAAACTGGAAGAATA---GATAATCA--TCATA-T--A------T-----CAAA-C--TG---G--GTA-G-----TA--AC-ACAATTT-GAAT-AACCAAA
gi|104701                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TAATTGTCCA-TAATACTATGCAATA--TAACATACATCCTATCTTAAACACT-GGGGTCATAAAACATGTGGT----GAATTATGCAAATTG--GGGTACAATATGC--ATGTTT--T---------TT---TCTC--------ATTACCACATGGTGTGACTGTAGT-GTTGGTG--AGTTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTAAGTGGACAGTAGCATACATTGTGTGCAATATGCCTGTAGGCAAATATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGG---TTAAAAAATCCTGTTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAA-CG------A-T--G------T-----CATA-T--GG---G--CTACA-----CAATAC-ACAATAT-G-AT-AA
gi|104702                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACCCC-GAGGTCATAAAACCTGGGAT----GAATTATACAAATTG--GGGTACAGTCAGC--ACATAG--TTGTAGGGTATT---TCTC--------AATACCATATGGTGTGACTGTATT-GTTGGCG--AATTATGAAAGCTCAGCAGATTACCA-GTAGCTCAACAGTAGCATACACTTTGTACAATATGCaacataaaaa
gi|104703                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TACCATATGC--A---TG--T-------TTTT---TCTC--------ATAACCACATGATGTGACTGTAGT-ATTGGTG--AATTATGAAAGCTCAGCAGGATGCCA-GTTACTGGACAGTAGTATACATTTTGTGCAA--------------AT-ATATTCCATATGACAC---TATCC-ATCA-AAGGTTCAAAAA---TCACATTTGTCCAGGTAACTAGTAGACTG---GGTAACGA--TGTTA-T--A------T------GGG-T--TA---GTTATA-GATAAAAA--AC-ACAATAT-GGTA-AAACAAAAAAA
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|104704 ): AACTAGTAGACTGTGTAACGATGTCAAATGGTTTAGTTATAGGTAAAAAACACAATATGATAAAACAAAACAA