lowQualScore                  :                              22                                      111            222222222222222222222222222222222222           2222222222222222222                       11111111         11111                      11                                        1111111111           111111                             1111111                                 111111           1111111        11111                          11      1111111111                               11111                    111111          2222222       111  1111                                                                                              111        11111          111111111111                                     
lowQualScore                  :           3  2  1     7 333  33  0  5  0  1      1  8     1    2  2  555     3 5 22 666666666666666666666666666666666666  33    22 9999999999999999999  5555 44     3  1 777 00000000 1  1 22 22222   3 44 222 5555  22  88       4  444           99999  3  55    1111111111   1 1 33  555555  22  44 6666666  3  3 222 1 2222222     5  22  888  1     4  222 2  333333  222 5 22 4444444   4 22 44444 333    11 2       2  1   00 33 0 0000000000   88  3     1  444 777   11   44444      9 11 22    22 666666   1  3   1111111  11   000  7777 4 1  0     1  9   11 9   888 1 888  66666  11  5  1 9  9  2 11 9999  1  222   222 11 888     444  2 222 22222  0       999999999999  2        2     55555555      1     
lowQualScore                  :           .  .  .     . ...  ..  .  .  .  .      .  .     .    .  .  ...     . . .. ....................................  ..    .. ...................  .... ..     .  . ... ........ .  . .. .....   . .. ... ....  ..  ..       .  ...           .....  .  ..    ..........   . . ..  ......  ..  .. .......  .  . ... . .......     .  ..  ...  .     .  ... .  ......  ... . .. .......   . .. ..... ...    .. .       .  .   .. .. . ..........   ..  .     .  ... ...   ..   .....      . .. ..    .. ......   .  .   .......  ..   ...  .... . .  .     .  .   .. .   ... . ...  .....  ..  .  . .  .  . .. ....  .  ...   ... .. ...     ...  . ... .....  .       ............  .        .     ........      .     
lowQualScore                  :           7  9  9     6 333  88  6  6  3  6      4  5     4    9  5  888     1 4 22 444444444444444444444444444444444444  33    11 0000000000000000000  4444 00     2  5 777 77777777 5  5 00 22222   0 11 666 9999  00  77       9  888           44444  4  99    4444444444   5 5 99  444444  00  11 1111111  0  0 666 5 9999999     8  55  333  5     4  555 9  999999  222 7 00 3333333   3 00 11111 777    77 4       4  2   00 33 9 2222222222   77  5     5  888 777   77   99999      4 88 99    00 333333   3  6   9999999  77   333  2222 0 2  1     2  3   77 5   222 2 111  22222  66  1  2 1  1  8 66 1111  7  000   000 66 555     444  3 000 11111  9       888888888888  1        6     33333333      7     
consensus                     :   AATGACATNGTATC-TGATA-T---CGNTTCTAACATTCGTCTTTTT-GCCGACGA-TACA-AGCCT-TATTTTA-TNA--TCGATCA-------TA-ATA-A-C----G-ATATNANCAATGCTG--C--A-CAA-------AT---TT----T-AAATTCCGA-C--AT-CAA---NA-AA-A--T-NACTGAA-T--G---G---TCA--AANNAATGGCTNGT--NACTTTCAATCCNTCN-AAAAC-NGAAT---CGCTN--CTT-A-T-ATCTC--GCAA--AC--GC--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCACCCNCCA-CTTTNTA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CG--ATCA--C-ACAAACA-CC-TAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACGACTG-C-ACC-TGG--CACNN--NCATATTGA--AT-ACAT-TAAGGAN-AAG-GCNTGG--NC--AAG--AATN--AA-N-ATTA-TGAGAAAA-CTNAAA--TNTCA-G-C-T-N-GA----TAG--AAAAT-CACTNGAAA--CN---ATATA---TAC--AT--CN--TTTAT-AAGA-C---C-NCTNCTAGAATATGCCGACG-TN---ATTTGGGATAATTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
Reference ( gi|103893 )       :   AATGACATAGTATC-TGATA-T---CGCATCTAATATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACA-AGCCTGTATTTTA-TAA--TCGATCA-------TA-ATA-A-C----A-ATATAAACAATGCTG--C--A-CAA-------AT---TT----T-GAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-A--T-CACTGAA-T--G---G---TCA--AAACAATGGCTTGT--AACTTTTAATCCATCG-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GT--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCATCCACCA-CTTTATA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C-ACAAACA-CT-TAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACAACTG-T-ACC-TGG--CACTC--TCATATTCA--AT-ACAT-TATGGAT-AAG-GCATGG--TC--AAG--AATT--AA-A-GTCA-TGAGAAAA-CTGAAA--TATCA-G-C-T-T-GA----CAG--AAGAT-CCCTGGAGA--CA---ATATA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCGA-C---C-ACTGTTAGAATATGGTAACA-CA---ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103895                     :   AATGACATATTATC-TGATA-T---CGCATCTAACATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACA-AGCCTGTACTTTA-TAA--TCGATCA----------------C----A-ATATAAACAATGCTG--C--A-CAC-------AT---TT----T-GAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-A--T-CACTGAA-T--G---G---TCA--AAACAATGGCTTGT--AACTTTCAATCCACCG-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GT--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCATCTCCCA-CTATATA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--GA--ATCA--C-ACAAACA-CT-AAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TTAAACAACTG-T-ACC-TGG--CACTC--TCATATTCA--AT-ACAT-TATGGAT-AAG-GCATGG--TC--AAG--AATT--AA-A-GTCG-TGAGAAAA-CTGAAA--TATCA-G-C-T-A-GA----CAG--AAGAT-CCCTGAAGA--CA---ATATA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCAA-C---C-ACTGTTAGAATATGGTAACA-CA---ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103896                     :   AATGACATAGTATC-TGATA-T---CGCATCTAACATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACA-AGCCTATACTTTA-TGA--TCGATCA-------CA-ATA-C-C----A-ATATGAACAATGCTG--C--A-CAA-------AT---TC----T-GAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-A--T-TACTGAA-T--G---G---TCA--AATCAATGGCTTGT--AACTTTCAATCCGTCG-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GT--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCATCCACCA-CTATATA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--AAA-G--T--A--CA--ATCA--C-ACAAACT-CT-TAT--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACAACTG-T-ACC-TTG--CACTC--TCATATTGA--AC-ACAT-AAAGGAT-AAG-GCATGG--TC--AAA--AATT--AA-A-ATCA-TGAGAAAA-TTGAAA--TATCA-G-C-T-A-GA----CAG--AAAAT-CCTTGGAGA--CT---ATATA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCGA-C---C-ACTGTTAGAATATGGTAACA-CA---ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103894                     :   AATGTCATAGTATC-TGACC-T---CGCATCTAACATTCGCCTTTTT-GCAGACGA-TACA-AGCCTGTACTTTA-TAA--TCGATTA-------CA-ATA-A-C----A-ATATAAACGATGTTG--C--A-CAA-------AT---TT----T-GAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-A--T-AACTGAA-T--G---G---TCA--AAGCA-TGGCTTGT--TACTTCCAATCCGTCT-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GC--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCACCCACCA-CTATATA-TTCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATTA--C-ACAAACA-CT-TAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACAACTG-T-ACC-TGG--CACTC--TCATATTGA--AT-ACAT-TAGGGAG-AAG-ACATGG--TC--AAG--AACT--AA-A-ATCA-TGAGAAAA-CTGAAA--TATCA-G-C-T-A-GA----CAG--AAGAT-TCCTAGAAA--CT---ATCTA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCGA-C---C-ACTGTTAGAATATGATAACA-CA---ATCTGGGATTACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103882                     :   AATGACATAGTATC-TGATATT---CAC-TCCAACATACGACTTTTT-GCCGATGA-CACA-AGCCTTTACTTTA-TAA--TTAATCA-------TA-ATA-A-T----G-ATATTGTTAATGCTG--C--A-CAG-------AC---TT----T-AAATTTTGA-C--AT-AAA---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---TCA--AATAAATGACTGGT--TACTTTTAATCCATCG-AAAAC-AGAAT---CAATG--CAT-G-T-AACTC--GCAA--AC--GC--AC--TC-AA-C---C-CG-T---TCACCCCCCA-CTTTTTA-TGCAG-AA---C-CA---A--CA-A-ATT--AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C-ACAAACA-TC-TAGGAG--TAT-A---C-----TTA-TCAAATAACTG-C-AGC-TGG--CACAC--TCATATTGA--CT-ATAT-TAAGAAT-AAA-GCTTGG--GC--TAG--AATA--AA-T-ATTA-TAAGAAAA-CTAAAA--TTTCA-G-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CACTAGAAA--CA---ATCTA---AAT--GT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-TTTATTGGAATATGCCAATG-TT---ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAAAA
gi|103881                     : taAATGACATAGTATC-TGATATT---CAC-TCCAACATACGACTTTTT-GCCGATGA-AACA-AGCCTTTACTTTA-TAA--TTAATCA-------TA-ATA-A-T----G-ATATTGTTAATGCTG--C--A-CAG-------AC---AT----T-AAATTCTGA-C--AT-AAA---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---TCA--AATAAATGGCTGGC--TACTTTTAATCCATCC-AAAAC-AGAAT---CAACG--CAT-G-T-AACTC--GCAA--AC--GC--AC--TC-AA-C---C-CG-T---TCACCCTCCA-CTTTTTA-TGCAG-AA---C-CA---A--CA-A-ATT--AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C-ACAAACA-TC-TAGGAG--TAT-A---C-----TTA-TCAAATAACTG-C-AGC-TGG--CACAC--TCATATTGA--CT-ATAT-TAAGAAT-AAA-GCTTGG--TC--TAG--AATA--AA-T-ATTA-TGAGAAAA-CTAAAA--TTTCA-G-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CACTAGAAA--CA---ATCTA---CAT--TT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CTTATTGGAATATGCCAATG-TT---ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAAAA
gi|103883                     : taAATGACATAGTATC-TGACA-T---TGACTTCAACATATGACTTTTT-GCTGATGA-TACA-AGTCTATACCTTA-TAA--TTAACCA-------TA-ATA-A-T----G-AGATTGCTAATGCCG--CTGT-GAA-------A-----T----T-AAATTTTGA-C--AT-AAA---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---TCA--AATAAATGGCTGGT--TACGTTTAATCCATCC-AAAAC-AGAAT---CATTG--AAT-A-T-AACTT--GCAA--AC--GC--AC--TC-AA-C---C-CG-C---TCACCCCCCA-CTTTTTA-TGCAG-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--TTT--A--GAA-G--T--G--CC--ATCA--C-ACAGACA-TC-TAGGAG--TAT-A--------TTTA-TCAAATAACTG-C-AGC-TGG--CACAC--TCATATTGA--CT-TTAT-TAAGAAT-AAA-GCTTGG--AC--TAA--AATA--AA-T-ATTA-TGAGAAAA-CTAAAA--TTTCA-G-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CACTGGAAA--C-----TATT---TAC--AT--TTCATTTAT-AAGA-C---C-TTTATTGGAATATGCCGATG-TT---ATTTGGGATAATTGTAC-------AACTTAT-GAAAA
gi|103892                     : taAATGATATAGTGTC-CGATA-T---TGATTCTAACAAACGTCTTTTT-GCCGACGA-TACG-AGTCTTTATTTCA-CAA--TTAACCA-------CA-ATA-A-T----G-ATATAATTAATGCTG--C--T-GAA-------AC---TT----T-GAATTCAGA-T--AT-TAG---TA-AA-A--T-ATCTTAA-T--G---G---TCA--TATAAATTGCTGGT--TACTTTTAATCCCTCT-AAAAC-TGAATACATGC--------A-T-ATATAACGCAA--AC--GC--AA--TC-AG-C---T-CC-C---TCATCCTCCA-CTTGTTA-TGCAC-AA---C-CA---A--TA-----T--ATT--GTTGAA-G--T--T--CC--ATCA--C-ACAAACA-TT-TAC--A--TGT-AGGACTATATTCA-TCA-----CTG-C-GAC-TGG--CACTC--TCATATTGA--AT-ACAT-TAAGGAA-AAG-GCATGG------------AT-----------A-TGAGAAAA-CCTAAA--CACCA-G-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-ATCTCGAAA--CT---ATATA---CAA--AT--CA--TTTAT-ACGA-C---C-CTTATTAGAATATGCAGACG-TC---ATTTGGGATAATTGTAC-------TAAGTAC-GAAAA
gi|103884                     :   AATGACATAGTATC-TGAGATT---CGC-TCCAACATAC------------GATGA-TAGA-AGCCTTTACTTTA-TAA--TTAATCA-------TA-ATA-A-C----G-ACATTGTTAATGCTG--C--A-CAG-------AC---AT----T-AAATTCTGA-C--TT-AAA---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---TCA--AATAAATGGCTGGT--TACTTTTAATCGATCC-AAAAC-AGAAT---CAATG--CAT-G-T-AACTC--GCAA--AC--GC--AC--TC-AA-C---C-CG-T---TCACTCCCCA-TTTTTTA-TGCAG-AA---C-CA---A--CA-A-ATT--AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCA--C-ACAAACA-TC-TAGGAG--TAT-A--------TTTA-TCAAATAACTG-C-AGC-TGG--
gi|103897                     : taAATGATATAGTGTC-CGATA-T---TGATTCTAACATACGTCTTTTT-GCCGACGA-TACG-AGTCTTTATTTCA-CAA--TTAACCC-------CA-ATA-A-T----G-ATATAATCAATGCTG--C--T-CCA-------AC---TT----T-GAATTCAGA-T--AT-AAG---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---TCA--AATAAACGGCTGTT--TACTTTTAATCCCTCT-AAAAC-TGAAT---ACATG--CAT-A-C-ATCAC--GCAA--AC--GC--AA--TC-AG-C---T-CC-C---TCATCCTCCA-CTTGTTA-TGCAC-AA---C-CA---A--C----A-T--ATT--GTTGAA-G--T--A--CC--ATCA--C-ACAAAGA-TT-TAG--GACTAT-A---TT---Taaaatcacac
gi|103898                     :   AATGATATTGTTAC-GGATA-T---CAATTCAAACATTCGTCTATTT-GCCGATGA-TTCA-AG--TAT-TTTTATTAATGTAGATCA-------T--GTA--------A-ATGT------TGCTG--CAGA-CAG-------A-----T----T-GGA----G--------CAA---TA-AG---------TGGT-T--A---G---TCA----------GTTT-T--AAC-------CCA-CG-AAAAC-AGAAT---CGCTA--TTG-A-T-ATCTC--GTAA--TC--AT--AA--GA-AA-C---C-TG-C---ACACCAACCC-CTAAATA-TGCTC-AA---T-CA---A--AC-C-A-T--TTT--A--GAA-A--T--A--AA--AACT--C-ACAAACA-CC-TAG--G--CGTCA---CG---TTTT-TTGGAT-TCTG-T-AAC-TGG--CACTC--ACATATAGA--AT-AAAT-TAAAGTT-AAA-ACGTGG--GA--AAG--AATC--AA-T-ATAA-TGCGGCAA-CTCAAA--TTTCA-A-T-T-T-GA----TCG--AAAAT-CCTTAGAAA--TA---ATAAA---TAC--TA--CT--TTTAT-TAGA-C---C-TATTTTAGAATACGCAGATG-TT---ATTTTGGATAACTGCAC-------ACACTAT-GAAAagaatgttaaataa
gi|103886                     :   AATGACATCATAGA-TGATT-T---CAATTCAAACATTTGTCTTATC-GCAGATGA-CACG-GGTCT---TTTTA-TTA--TAG-----------TAGATA-A-C----C-CTATT--CAA-GCTG--C--AACTA-------CT---CT----T--AATTCCGA-CTTGT-TAA---AA-AT-A--T-C--TAAT-T--G---G---GCA--GATAAATGGCTTGT--CAAATTTAACCCCTTA-AAAAC-AGAAT---CTCTC--TTG-G-T-TTC----------AC--GC--AAGGTC-AA-T---TTCA-TAAACCATCCACCA-GTTTTTA-TGAAT-TA---T-CA------TATG-A-T--AAC--C--GAA-A--T--AGACG--ATCA--C-A--AACA-TC-TTG--G--TGT-G---TT---CCTG-TCAAATGACT--T-ATCATGG--CATAA--ACATATTGA--GT-ATAT-AA-AAAC-AAAAGCATGG--AA--CAG--AATA--AA-T-ATTA-TGAAAAAAACT-AAA--TA-CA-GTC-T-T-GA----TAG--GATAG-CATTAGAAA--CT---ATATA---TAC--AT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CCTTCTAGAATATGGAGATA-TA---CTATTCGATAATTGCAC-------TCAATAT-GAGAA
gi|103885                     : taAATGACATCGTAGA-TGATA-T---CAATTCAAACATTCGATTTTTC-GCCGATGA-CACA-GGTCT---TTTTA-TCA--TAG--TA-------T--ATA-A-C----C-CTAT--TCAA-GCTG--------AAACT----AC---TC----T-AAATTCCGA-CTTGT-TA-----A-AA-A--T-ATCTAAT-T--G---G---GCA--GATAAATGGCTTGT--CAAATTTAACTCCTTA-AAAAC-AGAA-------TT--CTTGA-T-TTC----------AC--GC--AAGGTC-AATT---T-TA-TAAACCATCCACCAGTTTTTTA-TGAAT-AA---T-CAT--A--T--G-A-T--AAC--C--GAA-G--TAGA--CG--AT----C-ACAAACATCT-TA---G--TGT-G---TT---CCTG-TCAAATGAC-A-T-ATCATGG--CATAA--ACATATTAA--CT-ATA--TAAAAACAAAA-GCATGG--AA--CAG--AATA--AA-T-ATTA-TGAAAATA-TTTAAA--TA-CA-GTC-T-T-GA----TAG--GATAG-CATTAGAAA--CT---ATATA---TAC--AT--CA--ATTAT-AAGA-C---C-CCTTCTAGAATATGGAGATA-TA---CTATTCGATAATTGCAC-------TCAATAT-GAGAA
gi|103900                     : taAATGATATTGTTTC-TAAAA-T---AGGCTCTGCGATTCGCCTCTTT-GCTGACGA-CACA-ACCCTTTATGTTA-TTG--TCGATAA-------TC-CT----C----A-ACATG--CCGTTCTC--C--G----------------TT----T-AAATTCTGA-C--CTACAA----A-AA-A--T-CAATGAC-T--G---GGT-TCA--AC-C--TGGCTAGT--AACTTTTAATCCTTCT-AAAAC-TGAAT---CTCTA--CTT-A-T-TTCTC--GCAA--AC--AT---G--TCAAA-C---C-CC-A---GCACCCGCC-----CATA-TTCATGAA---CTCT---ATTCA-A-A-T--A-C--A--GGACG--CTGA--CA--AT----C-ACAAACA-CC-TTG--A--AAT-A---AC---TCTA-TCTAACGATGG-C-ACA-TGG--CACAA--ACACATTGA--AG-ACAT-CACCAAA-AAA-GCTTGGAATC--GAGCCAAT------A-ATC--TGCGCTCT-CTCAAA--T-TCACT-C-T-T-AA----TCG--TCGGT-CGCTTGAAA--CT---ATCTA---CAC--AT--CT--TTCAT-TAGA-CATAC-AC---TCGAATACTCTGACG-TC---GTTTGGGATAA
gi|103890                     :   AATGACATCGTAGA-TGATA-T---CAATTCAAACATTCGTCTTTTTCGCAGATGACTA-A-GGTCT---TTTTA-TTA--TAG-----------TAGATA-A-C----C-CTAT--TCAA-GCTG--C--A-ACT-------AC---TC----T-AAATTCCAA-C---T-TGT---TA-AA-A--T--ATTTAATT--G---G---ACA--GACAAAAGGCTTGT--CAAATTTAACCCCTTATAAAAT-AGAAT---CTCTT--TTG-A-T--TTTA--CGCA--AG--G-------TC-AATT---T-CA-TAAACCATCCATCA-TTTTTTA-TGAAT-AA---T-CAT--A--T--G-A-T--AAC--C--GAA-G--TAGA--CG--AT----C-ACAAACA-TC-TTG--G--TGC-T---TT---TCTG-TCTAATGACT--T-A-T-TGA---------TTATATCGA--A--ACA----------AAA-ACATGG--AA--CAG--AATA--AA-T-ATTA-TGAAAAAA-ATTAAA--TA-CA-GTC-T-T-GA----TAG--GGTAG-CATTAGAAA--CT---ATATA---TAC--AT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CCTTCTAGAATATGGAGATA-TACT-ATTT--GATATTTGCAC-------TCAATAT-GAGAAt
gi|103903                     : taAATGATATTGTTTC-TGAAA-T---AGGCTCTGCGATTCGCCTCTTT-GCTAACGG-CACA-ACACTTTATGTTA-TTG--TCGAT----------A-AT------------CCTCAACA-TGCTG--C--T-C----------TCCGTT----T-AAATTCTGA-----T-CTA---CA-AA-AGAT-CAATGAC-T--G---GGCTTCA--AC-C--TGGCTAGT--AACTTTTAATCTTGCT-AAAAC-TGAAT---CTCTA--CTT-A-T-TTCTC--GCAA--AC--AT---G--TCAAA-C---C-CC-A---GCACCCGCC-----CATA-TTCATGAA---CTCT---ATTCA-A-A-T--A-C--A--GGACG--CTGA--CA--AT----C-ACAAACA-CC-TTT--G--AAT-A---AC---TCTA-TCTAACGATGA-C-ACA-TGG--CACAA--ACACATTGA--AG-ACAT-CACCAAA-AAA-GCTTGGAATC--GAG--
gi|103899                     :   AACGACATAGT-TCGTAATG-T---TGATTCAAATATTAGACTTTTT-GCGGATGA-CACT-AGTTTATATCTAA-TTG--CTGA-CAGTGAAACTG-ATATA-T----ATATATAAAGAA--CTG--T--A-ACT-------AT---TT----C-AAAT----A-A--AT-TTATTTTA-AATA--T-CATCCAA-T--G---G---CCA--GAACAATGGCTCTT--AAtcaaca
gi|103902                     :   AATGATATTGTTTC-TGAAA-TAGGCGC-TGCAAT--TCGCCTATTT-GCTGATGA-CACA-ACTCTTTATGTTA-TTG--CCGATAA-------TC-TT----C----A-A----AATGATGCTC--T--C-CG-------------TT----T-AAATTCTGA-C--CT-ACA---GA-AG-A--T-TAAGGAC-T--G---G---GCGTCAACC--TGGCTTTT--AACTTTCAATCCTGCT-AAAAC-TGAAT---C-CTAA-CTT-A-T-TTCTC--GCAA--ACACGT--CA-----AA-C---C-CC-A---GCACCCGCCC-ATATATA-TG-AT-AT---C-TA---TT-CA-A-A-T--ACA--G--GAA-G--CCGA--CA--TTCA--C-A--AACA-CA-TTG--G--AATCA---CT---CTC--TCTAGCGATGG-T-ACA-TGG--TACAA--ACACATTGA--AG-ACAT-CACCAAA-AAA-GCTTGGAATC----G--AGTC--AA-C-ATTA-TGTGCCCA-TTAAAA--C-TCA---C-TGT-GGAT--CAT--CAG-T-CACTTGAAA--CT---ATCTA---AAC--AT--CT--TTCATAAGGA-C---T-AC-ACTCGAATACTCTTACG-TC---GTTTGGGATAAataatgttttaccagcaaattaatgaagtatcttcccataagcaccttggcatatttttcttaaacgaatgctcttggtacacccacccatattaaccatgttaaagcgaaagcttgaactcgaatcaacatcatgagaagactcaaacacctactcacaagaaaaatctttagaagttatttacatttcatatataagacccttgtttgagtacggtcatgttatctgggataactgcacgagctatcaaaa
gi|103901                     :   AACGATATTGTTTC-TGAAA-T---TGGCTCTGTGATTTGTCTCTTT-GCTGACGA-CACA-ACCCTCTATATCA-TTG--TCG--------------ATA-A-C----C-CTTTA--CA-TGCT----------A-------GT---CT----CCGTCTTCCGA-C--AT---A---CA------------------------G---CC---------TGGCTAGT--AACTTTCAATCCTGCC-AAAAC-GGACT---TTTTA--CTT-A-T-TTCTC--GCAAACAC--GT--CA-----AA-C---C-CC-A---GCACCCGCC-----CATA-TTCAT-GA---A-CACT-ATTCA-A-A-T--ACA--G--GAA-G--TTGA--CA--CTCA--T-AC--ACA-CC-TAG--G--AATCA---CT---CTC--TCTAATGATTG-C-ACA-TGG--CACAA--ACACATTGA--AG-ACAT-TACCAAA-AAA-GCTTGGACTC-------AGTT--AACA-CTC--TACGCTCT-CTCAAA--T-TCATT-C-T-A-GG----TCG--TCGAT-CACTCGAAA--CT---ATTTA---CAC--AT--CA--TTCAT-AAGG-C---CTACACTT-GAATACGCTGACG-TC---GTTTGGGATAAt
gi|103904                     :     TGACATTGTATC-TGATATT---CAC-TCCAACATAAGACTTTTT-GCCGATGA-TACA-AGCCTTTACTTTA-TAA--TTAATCA-------TA-ATA-A-T----G-ATATTGTAAATGCTG--C--A-CAG-------AC---AT----T-AAATTCTGA-C--AT-AAA---TA-AA-A--T-ATCTGAA-T--G---G---CCA--ACTAAATGGCTGGT--TACTTTCAATCCATCC-AAAAC-AGAAC---CAATG--CAT-G-T-AACAT--GCAA--AC--GC--CA--TC-AA-C---C-CG-T---TCACCCCCCA-CTTT-TA-TGCAG-AA---C-CA---A--CA-A-ATT--AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C-ACAAACA-TC-TAGGAG--TAT-A---C-----TTA-TCAAATAACTG-C-AGC-TAG--CACAC--TCATATTGA--CT-ATAT-TAAGAAT-AAA-GCTTGG--TC--TAG--AATA--AA-T-ATTA-TGAGAAAA-CTAAAA--TTTCA-G-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CACTAGAAA--AA---ATCTA---CAT--GT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CTTATTGGAATATGCCAATG-TT---ATTTGGGATAAATGTAC-------AAATTATCGAAAt
gi|103905                     :         ATCGTTTC-TGAAA-T---TGGCTCTGCGATTCGCTTCTTT-GATGACGA-TACA-ACCCT-T-TTTTG-TCA--TTG-TCG----------ATA-A-CCCTCA-ATAT-------GCTG--C---------------T---TTCATAT-AAATTCTGA-C--CTACAA----G-AG-A--T-CA----A-T--G---A---CC---------TGGTTAGT--AGCTTTCAATCCTGCT-AAAAC-TGAAT-----CTTCACTT-A-T-TTCTC--GCAA--AC--AC---G--TC-AA-A---C--------CCAAGCACAA-GTCCATA-TTCATGAA---C-TCTTTT--CA-A-A-T--ATA--G--GAA-G--TCGA--CA--CTCG--C-AAACACA-TT-TGA--A--T-C-A---CC---CCC--TCTAGCGATGG-C-ACA-TGG--CACAA--ACACATACA--AG-ACAT-
gi|103906                     :          TGGTGTC-TGATA-T---TGATTCTAGCGTAGGTCATTTT-GCCGATAA-TACA-AGTCT---TTTCA-Tctccaacaaagcttggactcgaatcgacattctgcgctctttcaaatgttatctggatcgttggtcacccaaaactatctacacatctttcaaaaggcctacactcgatactctgacgtcgtttgggataat
gi|103887                     :                                TCTAATATCCGTTTATTT-GCTGACGA-TACC-AG-------TTTACTGA--TAG-TTG-------TA-GAA-A-C----A-CC-TGACCAA-GCTT--C--C-CTT-------GT---TC----T-TAATTCAGA-T--CT-TGA---AA-AA-A--TTCAC--AA-TTGG---G---CTG--AAA-AGTGGTTAGT--AACGTTCAATCCAAAT-AAAAC-AAAAG---CACTT--CTT-G-T-TTCGC--GTAA--AC--GA--AA--TA-AA-C---C-CT-T---CCACTCTCAA-CTTGTCA-TGAAT-AA---T------A--CA-A-T-A--ATCCAA--GAA-G--T--T--CA--GTCA--C-ATAAGCA-TC-TTG--G--TGT-C---AT---TCTC-TCAAATAACGG-T-ACC-TGG--AAATT--TCACTTAGA--GC-ATAT-AAAGGAA-CAG-GCTTGG--AA--AAG--A-TT--AA-ACATTA-TGAGAAAA-TTAAAG--TTTAA-A-C-T-T-GA----TCG--CCAAT-CACTTCAAA--CA---ATTTACTTTA-------CT--TTCAT-ACGC-C---C-TTTACTTGAATATGCAGATG-TA---ATATGGGATAATTGTAC-------ta
gi|103889                     :      taaatgatattgttgaagacataaacTCTAACATTCGTTTATTT-GCTGACGA-CACC-AG-------TTTA-C------------------TG-ATA-G-T----T-GTAGAAACAC--CTGATC--A-CGATTCCCTTGT---TC----T-TAATTCAGATC--TT-GAA---AA-AA-A--T-CAC--AA-TTGG---G---CTG--AAA-AATGGTTAGT--AACTTTCAATCCAAAT-AAAAC-AAAAG---CATTT--CTT-G-T-TTCGC--ATAA--AC--GA--AA--TA-AA-C---C-CT-T---CCACTCTCAA-C---GTG-T-CAT-GA----------------------------A--GAA-G--T--T--CA--GTCA--C-ATAAGCA-TC-TTG--G--TGT-C---AT---TCTC-TCAAATAACGG-T-ACC-TGG--AAATT--CCAC-TT----AG-ACATATAAAGACAAAG-GCTTGG--AA--AAG---ATT--AA-ATATTA-TGAGAAAT-TTAAAG--TTTAA-A-C-T-T-GATTACCA------AT-CACTTCAAA--C----ATTTA----AC--TTTACT--TTCAT-ACGC-C---C-TTTACTTGAATATGCAGATG-TA---ATATGGGATATTTGTAC-------a
gi|103907                     :            taaatgatattgttgaagacttaaacACTCGTATTTTT-GCAGACGA-TACATCGCTTGCATCTa
gi|103908                     :                                tctctcaagcataTTTTT-GCAGACGA-TACATCGCTTGCATCTacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcacgatcttactgtcatatcgcagtggtccaagcagtggttagtaaattttaacccgaacaaaacagaagcaattatgttcacactaaataaaaatgtttcttatccatttttaatttttgataatgtcccagtaaaatttgttgatcaccacaaacatttaggcataacttttagtcataatgcaaagtggcaccatcatatagataacattgtaaattcggcttgtaagattttgggaatgatgcgtaaaattaaattcctgttaaatagaaaatcactcaaccaaatatacatttcatttctcagacccactctagagtatgcatcagttgtttgggatggttgcactcattacgaaaa
gi|103891                     :                                               TTT-GCCGATGA-TACA-AGTCT---TTTTA-TTA--TAGTTCA-------C------------------CAGACCTTGCTG--CT-A-C----------T---TTGT--T-AAATTCTGG-T--CT-CAG---AA-AA-A--TTCAT---A-T--GTCGG---CTG--ATA-AATGGCTTGTCCAA--TTCATTCTAAAC-AAAAC-AGAAT---TCATG--GTT-A-TTACCGA--TAAA--AT---C--AA--TA-AA-C---C-GA-T---ACACCC-CAA-CCTCATAATGAAT-AA---T--A---A--TA-TTA-T--ACA--A--GAA-G--T--AA-CT--AT-G--C-ATAAACA-TT-TAG--G--TTTTA---CT---TTT--TCTATCAATGG-A-ACA-TGG--CATGA--ACACATACA--AT-TCAT-AAAAGAT-AAG-GCATGG--AA--GAG--AATA--AA-T-ATTA-TGCGGCTA-TT-AAG--TTCCA-T-T-T-A-GA----CAG--ATAAT-TACTTGAGA--TT---ACATA---TAT--AG--CA--TTCAT-ACGT-C---C-AATTCTAGAATATGCAAACA-TT---GTATGGGACAATTGCACTACATAATAATTAT-GAAacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcatgatcttactgtcatatcgcagtggtccaagcagtggttagtaaattttaacccgaacaaaacagaagcaattatgttcacactaaataaaaatgtttcttatccatttttaatttttgataatgtcccagtaaaatttgttgatcaccacaaacatttaggcataacttttagtcataatgcaaagtggcaccatcataaagataacattgtaaattcggcttgtaagattttgggaatgatgcgtaaaattaaattcctgttaaatagaaaatcactcaaccaaatatacatttcatttctcagacccactctagagtatgcatcagttgtttgggatggctgcactcattacgaaaa
gi|103909                     :         aaatgacattgtagaaaacataagctcatctataaaattaT-GCAGACGA-TACA-AGCCTGTACTTTA-TAA--TCGATCA-------CA-ATA-A-C----A-ATATAAACAATGCTG--C--A-CAA-------AT---TT----T-GAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-A--T-CACTGAA-T--G---G---TCA--AAACAATGGCTTGT--AACTTTTAATCCATCG-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GT--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCATCCACCA-CTATATA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C-ACAAACA-CT-TAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACAACTG-T-ACC-TGG--CACTC--TCATATTCA--AT-ACAT-TATGGAT-AAG-GCATGG--TC--AAG--AATT--AA-A-GTCA-TGAGAAAA-CTGAAA--TATCA-G-C-T-A-GA----CAG--AAGAT-CCCTGGAGA--CA---ATATA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCGA-C---C-ACTGTTAGAATATGGTAACA-CA---ATCTGGGATAATTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103888                     :                                                 T-GCTGATGA-TACT-AGTCT---TTTTA-TTA--T--ATTA-------GA-ATC-ATC----AGATCT------TGCCG--C--T-TCT-------AT---GT----T-AAATTCTGA-T--CT-CAG---AATAA-A--T-TAC--AACT--G---G---GCT--GATAAATGGCTTGT--TAATTTTAATTCAAAT-AAAAC-ACAAT---TGATG--GTT-ATT-ATC-----------C--GTAAAA--TC-AA-CAAAC-CGAT---ACATCCAAAT-ATTTCTA-TGAAT------C-AA---A--CT-G-T-T--AT---A--CAA-G-----A--CGTTATTACTC-ATAAACA-TC-TGG--GCCT-T-A---CT---TTT--TCAAATAA-TG-G-ATCATGG--CATGA--ACACATTCA--AT-GCAT-AAAAGAA-AAG-GCATGG--AA--AAG--AATA--AA-C-ATTA-TGCGACTT-TTAAAA--TTTCA-A-T-T-A-GA----TAG--AAACT-CACTTGAGA--TT---ATATA---TAC--TA--CT--TTTAT-ACGT-C---C-AATTCTAGAATATGCTAACA-TT---GTCTGGGATAATTGCAC-------
gi|103910                     :                                                                               taaatgatattgtagaaaatataagctcatccataaaattataAATGCTA--T--T-CAA-------AC---TT----T-GGATTCTGA-C--AT-TCG---TA-AA-A--T-ATCCGAG-T--G---G----------ACACTAAC-------ACT---AACAC-TCG-AATACATGCAT--------------A-T-ATCTC--GCAA--AC--GC--AA--TC-AT-C---T-CC-C---CCATCCTCCA-CTAGTCA-TGCAC-AA---T-CT---T--TA-T-A-T--AGT--T--GAA-G--A--G--CT--ATCA--C-ACAAAC--CTGTAGGAG--TAT-A--------TTAA-TCAAACTGTTG-C-AGC-TGG--CATTC--TCATATTGA--CT-A-A----------AAC-GCAAGG--T---AAA--TACT--AA-ATATTA-TGAGA-----T--AA--TATTA-A-CGT-T-------------AGAT-AGCTGGAAAATCACTTATGTA---TAC--AA--AC--TTTA-----------------TTGGAATAT-GCAGCG-TT---ATCTTATATAATTGTAA-------TACATAC-GAAAA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                     tA-AA-A--T-CACTGAA-T--G---G---TCA--AAACAATGGCTTGT--AACTTTTAATCCATCG-AAGAC-TGAAT---CGCTT--CTT-A-T-ATCTA--GGAA--AC--GT--AA--TC-AA-C---C-CG-T---CCATCCACCA-CTATATA-TGCAT-AA---C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C-ACAAACA-CT-TAG--G--TAT-A---CT---TTTA-TCAAACAACTG-T-ACC-TGG--CACTC--TCATATTCA--AT-ACAG-TATGGAT-AAG-GCATGG--TC--AAG--AATT--AA-A-GTCA-TGAGAAAA-CTGAAA--TATCA-G-C-T-T-GA----CAG--AAGAT-CCCTGGAGA--CA---ATATA---TAC--AT--CT--TTTAT-CCGA-C---C-ACTGTTAGAATAT-GTAACA-CA---ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103912                     :                                                                                                                                                                                                                             tTGGCTAGT--AACTGTCAATCCTTCT-AAAAC-TGAAT---CTTTA--CTT-A-T-TTCTC--GCAA--ACACGT--CA-----AA-C---C-CC-A---GCATCCGCC-----CATA-TTCAT-GAATTC-TA---TT-CA-A-A-T--A-C--A--GGACGCTT--A--CA--ATCA--C-A--AACA-CC-TTG--G--AAT-A---AC---TCTA-TCTAACGATGG-C-ACA-TGG--CACAA--ACACATTGA--AG-ACAT-CACCAAA-AAA-GCTTGGAATC----G--AGTC--AACA-ATC--TGCGCTCT-CTCAAA--T-TCA-ATC-T-T-GA----TCG--TCGGT-CGCTTGAAA--CT---ATCTA---CAC--AT--CT--TTCAT-TAGG-C---CTAC-ACTCGAATACTCTGACG-TC---GTTTGGGATAA
gi|103899                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ggttaatagaccA---C-CA---G--CA-A-A-TTAAT------GAA-G--T--A--TC--TTCC--C-ATAAGCA-CC-TTG--G--CAT-A---TT---TTTC-TTAAACGAATG-C-TCT-TGGTACACCCACCCATATTAA--CC-ATGT-TAAAGCG-AAA-GCTTGA--AC--TCG--AATC--AA-C-ATCA-TGAGAAGA-CTCAAA--CACCT-A-C-T-C--A----CAAGAAAAAT-CTTTAGAAG--T-----TATT---TAC--AT--TTCATATAT-AAGA-C---C-CTTGTTTGAGTACGGTCATG-TT---ATCTGGGATAACTGCAC-------GAGCTAT-CAAAAt
gi|103907                     :                                                                                                                                                                                                                           aacgacatagttcgtaatgttgattcaaatattagactttttgcggatgacactagtttatatctaattgctgacagtgaaactgatatatatatataaagaactgtaactatttcaaataaatttattttaaatatcatccaatggccagaacaatggctcttaaataatgtttt--ATCA--CCACAAACA-TT-TAG--G--CATAA---CT---TTTAGTC--ATAA-TG-CAAAG-TGG--CACCA--TCATA-TAG--ATAACAT-TGTAAAT-TCG-GCTTG----T--AAG--ATTTTGGG-A-ATGA-TGCGTAAA-ATTAAA--TTCCT-G-T-T-A-AA----TAG--AAAAT-CACT-CAAC--CA---A-ATA---TAC--AT--TTCATTTCT-CAGACC---C-ACT-CTAGAGTATG----CATCAGTTGTTTGGGATGGTTGCAC-------TCATTAC-GAAAA
gi|103908                     :                                                                                                                                                                  tctctcaagcataactcgtatttttgcagacgatacatcgcttgcatctacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcacgatcttactgtcatatcgcagtggtccaagcagtggttagtaaattttaacccgaacaaaacagaagcaattatgttcacactaaataaaaatgtttcttatccatttttaatttttgataatgtcccagtaaaatttgttg--ATCA--CCACAAACA-TT-TAG--G--CATAA---CT---TTTAGTC--ATAA-TG-CAAAG-TGG--CACCA--TCATA---AAGATAACAT-TGTAAAT-TCG-GCTTG----T--AAG--ATTTTGGG-A-ATGA-TGCGTAAA-ATTAAA--TTCCT-G-T-T-A-AA----TAG--AAAAT-CACT-CAAC--CA---A-ATA---TAC--AT--TTCATTTCT-CAGACC---C-ACT-CTAGAGTATG----CATCAGTTGTTTGGGATGGCTGCAC-------TCATTAC-GAAAA
gi|103913                     :                                                                                                                                                                                            tttttgcagacgatacatcgcttgcatctacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcatgatcttactgtcatatcgcagtggtccaagcagtggttagtaaattttaacccgaacaaaacagaagcaattatgttcacactaaataaaaatgtttcttatccatttttaatttttgataatgtcccagtaaaatttgttg--C-ATAAACA-TC-TGG--G--CCTTA---CT---TTT--TCTAATAA-TG-G-ATCATGG--CATGA--ACACATTCA--AT-ACAT-AAAAGAA-AAG-GCATGG--AA--AAG--AATA--AA-C-ATTA-TGCGGATT-TTTAAA--TTTCA-A-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CACTTGAGA--TT---ATATA---TAC--TA--CT--TTTAT-ACGT-C---C-AATTCTAGAATATGCTAACA-T----TTCTGGGATAATTGCA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        gttattact--C-ATAAACA-TC-TAG--G--TCTTA---CT---TTT--TCTAATG-TTG-G-GTCATGG--CATGA--GCACATTCA--AT-ACAT-AAAAGAA-AAG-GCACGA--AA--AAG--AATA--AATA-GT-A-TGCGACTT-TTGAAA--TTTCA-A-T-T-A-GA----TAG--AA----------------A---ATATG---TAC---T--AG--TTTAT-ACGT-C---C-AATTCTAGAATAAGCTTACA-TT---GTCTGGGATAATTG
gi|103915                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ct--C-ACAAACATCT-TGG--A--T-T-A---AC---CTTA-AGTAACA-CTGGT-AAA-TGG--GAAAC--TCATATAGA--AA-ATAT-TA---AA-AAA-TCATCA--TCTAAAG--TGTT--AG-G-ATTAATGAGAAAA-TTGAAATTTACC----C-T-T-AG----TAG--AA-ATGCCCTAAAT---CA---A-ATT---TACTTAT--CA--TATGT-TAGA-C---C-CCTTTTTGAATAT
gi|103916                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTGG--TC--TAG--AAT---AA-T-ATTA-TGAGAAAA-CTTAAA--ACTCA---C-T-TAGA----TAG--AAAAC-CACACGAAA--CT---ATTTG---CAT--GT--CA--TTCAT-AAGA-C---C-TTTATTGATATATACCGACG-TT---ATTTGGGATAATTGTTT-------AAATTAT-GAAAAtcatcaattgtttgggat
gi|103917                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atacttgtacatatatgacacctggcatttaagtcacagtcgtgttggagcccttaattagcagttgaag--AAG--AAAT--A-----TTA-TGAGAAAA-CTAAAA--TTTCA-G-T-A-A-GA----TAG--AAAAT-CACTAGAAT--CA---ATGAA---CAT--GT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CTTAGTGGAATATGCCAATG-TT---ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAGAA
gi|103918                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            --AA-ATGTAA-TGCGTAAA-CTCAAA--CATAA-G-C-T-T-GA----TAG--AACAT-CTCTTGAAA--TT---ATCTT---TAT--AT--CC--TTTAT-CAGA-C---C-CCTATTAGAGTACGATGACA-TT---ATTTGGGACAATTGTAC-------TGACTAT-CAAAA
gi|103920                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAA--TTTCA-A-T-T-A-GA----TAG--AAAAT-CGCTTGAGA--TT---ATATA---TAC--TA--CT--TTTAT-ACGT-C---C-AATTCTAGAATATGCTAACA-TT---GTCTGGGATAATTGCAC-------
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G--AAAAT-CACACAAAA--CA---ATCTA---CAT--GT--CA--TTTAT-AAGA-C---C-CTTATTGGAATATGTCAATG-CT---ATTTGGGATAATTGTAC-------AATTTAT-GAAAA
gi|103919                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               agctgA---ATTTA---TAT--TT--CT--TGCAT-GCGT-C---C-AATTTTAGAGTATGCTGCTG-TT---GTTTGGGATGGTTGTGC-------TAATTAT-GAAAA

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                            222222                                 1111111111111     11111111111111                                                                                                                                                                                  11111111111111           1111111        111111111                        11                                                                                  11111                                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         1  3333  1   44444  333 1 33        0  2      1  3     1     1 2 1 555555    3 1 222 4 3 1 1 3     999    3333333333333     77777777777777 222 5555       2  1 777 66  3333 1  1  999     1 2 22 7777    77       1  1     0     22 22     1     66 22   1  44     1        0  5555  2   666666     2   1 444  88888     4  11111111111111  1 1 1 55 2222222   3 11 666666666    33 44 0        1 11 11   9 4444 222   88888   2  44 0  11 888     2222 444              1 44  1     1   33333 66    555  1    1  0       1    3   555 11 1     1      0  3  11   2  3     55555 33 1     333    55 1  0        888     55555                 44444444      1     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         .  ....  .   .....  ... . ..        .  .      .  .     .     . . . ......    . . ... . . . . .     ...    .............     .............. ... ....       .  . ... ..  .... .  .  ...     . . .. ....    ..       .  .     .     .. ..     .     .. ..   .  ..     .        .  ....  .   ......     .   . ...  .....     .  ..............  . . . .. .......   . .. .........    .. .. .        . .. ..   . .... ...   .....   .  .. .  .. ...     .... ...              . ..  .     .   ..... ..    ...  .    .  .       .    .   ... .. .     .      .  .  ..   .  .     ..... .. .     ...    .. .  .        ...     .....                 ........      .     
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                         0  8888  7   33333  000 3 77        8  2      5  1     5     5 5 5 555555    1 0 777 8 8 2 4 2     666    1111111111111     99999999999999 777 6666       7  6 444 11  8888 5  5  888     4 9 00 4444    00       5  0     4     55 33     0     44 33   3  55     3        6  5555  7   555555     3   1 444  00000     0  33333333333333  3 3 3 66 9999999   9 88 555555555    22 00 6        1 66 33   4 9999 111   88888   4  44 7  33 888     7777 333              9 11  0     0   99999 77    777  4    2  2       0    2   888 55 0     1      2  5  55   8  8     88888 00 0     888    66 4  4        333     55555                 88888888      6     
consensus                     :                                                                                                                                                                                 AATGACATNGT---ATC-TGA-----TA---TCGACTCTAACATTCGTCTTTTT-GCCGACGA-TACAA-GCC-T-T-A-CTTTA-TNA---TCGATCATA-ATAAC--GATATNANCA-AT-----GCTGC--A-C--AAAT---T---T----TAAATTCCGA-C--AT-NAA---NA-AA-ATN-NCTGAA-T-G--G---TCAAANAAATGGCTNGTNACTTTTAATCCNTC-NAAAACNGAATCGCT-NCTT-AT-NTCTCG-CAAACGCAATC----AA-CCCGT---CCACCCNCCACTTTNTA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CG--ATCA--C--ACAAACATCTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACGACTG-CACC-TGGCA----CNNNCATATTGAATACATTAAGGANAAGGCNTGGNC--AA--GAATN--AANATTA-TGAGAAAACTNAAATNTCA-G-C--TAGATAG-AAAATCACTNGA--AACTATNTATAC--G--T--CNTTTATAA-GACCNNTNCTAGAATATGC--CGACGT--T--ATTTGGGATAATTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
Reference ( family-536 )      :                                                                                                                                                                                 AATGACATNGT---ATC-TGA-----TA---TCGNTTCTAACATTCGTCTTTTT-GCCGACGA-TACAA-GCC-T-T-A-TTTTA-TNA---TCGATCATA-ATAAC--GATATNANCA-AT-----GCTGC--A-C--AAAT---T---T----TAAATTCCGA-C--AT-CAA---NA-AA-ATN-ACTGAA-T-G--G---TCAAANNAATGGCTNGTNACTTTCAATCCNTC-NAAAACNGAATCGCT-NCTT-AT-ATCTCG-CAAACGCAATC----AA-CCCGT---CCACCCNCCACTTTNTA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CG--ATCA--C--ACAAACACCTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACGACTG-CACC-TGGCA----CNNNCATATTGAATACATTAAGGANAAGGCNTGGNC--AA--GAATN--AANATTA-TGAGAAAACTNAAATNTCA-G-C--TNGATAG-AAAATCACTNGA--AACNATATATAC--A--T--CNTTTATAA-GACCNCTNCTAGAATATGC--CGACGT--N--ATTTGGGATAATTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103881                     :                                                                                                                                                                                 AATGACATAGT---ATC-TGA-----TA---TTCACTCCAACATACGACTTTTT-GCCGATGA-AACAA-GCC-T-TTA-CTTTA-TAA---TTAATCATA-ATAAT--GATATTGTTA-AT-----GCTGC--A-C--AGAC---A---T----TAAATTCTGA-C--AT-AAA---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---TCAAATAAATGGCTGGCTACTTTTAATCCATC-CAAAACAGAATCAAC-GCAT-GT-AACTCG-CAAACGCACTC----AA-CCCGT---TCACCCTCCACTTTTTA-----TGCAG-AA----C-CA---A--CA-A-A-TT-AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C--ACAAACATCTAG--GAGTAT-A---CT---T-----A-TCA-AATAACTG-CAGC-TGGCA----CACTCATATTGACTATATTAAGAATAAAGCTTGGTC--TA--GAATA--AATATTA-TGAGAAAACTAAAATTTCA-G-T--TAGATAG-AAAATCACTAGA--AACAATCTACAT--T--T--CATTTATAA-GACCCTTATTGGAATATGC--CAATGT--T--ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAAAA
gi|103882                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATAGT---ATC-TGA-----TA---TTCACTCCAACATACGACTTTTT-GCCGATGA-CACAA-GCC-T-TTA-CTTTA-TAA---TTAATCATA-ATAAT--GATATTGTTA-AT-----GCTGC--A-C--AGAC---T---T----TAAATTTTGA-C--AT-AAA---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---TCAAATAAATGACTGGTTACTTTTAATCCATC-GAAAACAGAATCAAT-GCAT-GT-AACTCG-CAAACGCACTC----AA-CCCGT---TCACCCCCCACTTTTTA-----TGCAG-AA----C-CA---A--CA-A-A-TT-AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C--ACAAACATCTAG--GAGTAT-A---CT---T-----A-TCA-AATAACTG-CAGC-TGGCA----CACTCATATTGACTATATTAAGAATAAAGCTTGGGC--TA--GAATA--AATATTA-TAAGAAAACTAAAATTTCA-G-T--TAGATAG-AAAATCACTAGA--AACAATCTAAAT--G--T--CATTTATAA-GACCTTTATTGGAATATGC--CAATGT--T--ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAAAA
gi|103883                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATAGT---ATC-TGA-----CA---TTGACTTCAACATATGACTTTTT-GCTGATGA-TACAA-GTC-TAT-A-CCTTA-TAA---TTAACCATA-ATAAT--GAGATTGCTA-AT-----GCCGC--T-GTGAAAT---T---------AAATTTTGA-C--AT-AAA---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---TCAAATAAATGGCTGGTTACGTTTAATCCATC-CAAAACAGAATCATT-GAAT-AT-AACTTG-CAAACGCACTC----AA-CCCGC---TCACCCCCCACTTTTTA-----TGCAG-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--TTT--A--GAA-G--T--G--CC--ATCA--C--ACAGACATCTAG--GAGTAT-A--------TTT---A-TCA-AATAACTG-CAGC-TGGCA----CACTCATATTGACTTTATTAAGAATAAAGCTTGGAC--TA--AAATA--AATATTA-TGAGAAAACTAAAATTTCA-G-T--TAGATAG-AAAATCACTGGA--AACTATTTACAT--T--T--CATTTATAA-GACCTTTATTGGAATATGC--CGATGT--T--ATTTGGGATAATTGTAC-------AACTTAT-GAAAA
gi|103884                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATAGT---ATC-TGA-----GA---TTCGCTCCAACAT------------ACGATGA-TAGAA-GCCTT-T-A-CTTTA-TAA---TTAATCATA-ATAAC--GACATTGTTA-AT-----GCTGC--A-C--AGAC---A---T----TAAATTCTGA-C--TT-AAA---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---TCAAATAAATGGCTGGTTACTTTTAATCGATC-CAAAACAGAATCAAT-GCAT-GT-AACTCG-CAAACGCACTC----AA-CCCGT---TCACTCCCCATTTTTTA-----TGCAG-AA----C-CA---A--CA-A-ATT--AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCA--C--ACAAACATCTAGGAG--TAT-A--------TTT---A-TCA-AATAACTG-CAGC-TGG
gi|103885                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATCGT---AGA-TGA-----TA---TCAATTCAAACATTCGATTTTTC-GCCGATGA-CACAG-GTC-T-T----TTTA-TCA---TAG--TATA--TAAC--CCTATT--CA-A------GCTG--------AAAC---TACTC----TAAATTCCGA-CTTGT-TAA---AA-AT-AT---CTAAT-T-G--G---GCAGATAAATGGCTTGTCAAATTTAACTCCTT-AAAAACAGAAT-----TCTTGAT-TTCACG-CAAGGTCAATTTTATAA-ACCAT---CCACCAGT---TTTTTA-----TGAAT-AA----T-CAT--A--TG-A---T--AAC--C--GAA-G--T--AGACG--ATCA--C--A--AACATCTTA--G--TGT-G---TT---CCT---G-TCA-AATGAC-A-TATCATGGCA----TAAACATATTAACTATATAAAAACAAAAGCATGGAA--CA--GAATA--AATATTA-TGAAAATATTTAAATA-CA-GTC--TTGATAG-GATAGCATTAGA--AACTATATATAC--A--T--CAATTATAA-GACCCCTTCTAGAATATGG--AGATAT--ACTATTCG--ATAATTGCAC-------TCAATAT-GAGAAaaaatcacac
gi|103886                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATCAT---AGA-TGA-----TT---TCAATTCAAACATTTGTCTTATC-GCAGATGA-CACGG-GTC-T-T----TTTA-TTA---TAG----TAGATAAC--CCTATT--CA-A------GCTGC--AAC--TACT---C---T----TAA-TTCCGA-CTTGT-TAA---AA-AT-AT---CTAAT-T-G--G---GCAGATAAATGGCTTGTCAAATTTAACCCCTT-AAAAACAGAATCTCT-CTTG-GT-TTCACG-CAAGGTCAATT--------TCATAAACCATCCACCAGTTTTTA-----TGAAT-TA----T-CAT--A--TG-A---T--AAC--C--GAA-A--T--AGACG--ATCA--C--A--AACATCTTG--G--TGT-G---TT---CCT---G-TCA-AATGACT--TATCATGGCA----TAAACATATTGAGTATATAAAAACAAAAGCATGGAA--CA--GAATA--AATATTA-TGAAAAAAACTAAATA-CA-GTC--TTGATAG-GATAGCATTAGA--AACTATATATAC--A--T--CATTTATAA-GACCCCTTCTAGAATATGG--AGATAT--ACTATTCG--ATAATTGCAC-------TCAATAT-GAGAA
gi|103887                     :                                                                                                                                                                               taAATGATATTGTTGAA----GA-----CA---TAAACTCTAATATCCGTTTATTT-GCTGACGA-TACCA-G----------TTTACTGA---TAG-TTGTA-GAAAC---ACCTGACCA-A------GCTTC--C-C--TTGT---T---C----TTAATTCAGA-T--CT-TGA---AA-AA-ATTCAC--AA-TTG--G---GCTGAAAAGTGGTTAGTAACGTTCAATCCAAA-TAAAACAAAAGCACT-TCTT-GT-TTCGCG-TAAACGAAATA----AA-CCCTT---CCACTCTCAACTTGTCA-----TGAAT-AA----T------A--CA-A-T-A--ATCCAA--GAA-G--T--T--CA--GTCA--C--ATAAGCATCTTG--G--TGT-C---AT---TCT---C-TCA-AATAACGG-TACC-TGGAA----ATTTCACTTAGAGCATATAAAGGAACAGGCTTGGAA--AA--GATTA--AACATTA-TGAGAAAATTAAAGTTTAA-A-C--TTGATCG-CCAATCACTTCA--AACAAT-T-TAC--T--TTACTTTCATAC-GCCCTTTACTTGAATATGC--AGATGT--A--ATATGGGATAATTGTAC-------
gi|103888                     :                                                                                                                                                                                                                                    taT-GCTGATGA-TACTA-GTC-T-T----TTTA-TTA---T--ATTAGA-ATCATCAGATCTTGCCG-CT-----TCT-----------AT---G---T----TAAATTCTGA-T--CT-CAG---AATAA-ATT-AC--AACT-G--G---GCTGATAAATGGCTTGTTAATTTTAATTCAAA-TAAAACACAATTGAT-GGTT-ATTATC-CG-TAAAATCAACA----AA-CCGAT---ACATCCAAATATTTCTA-----TGAAT-------C-AA---A--CT-G-T-T--AT---A--CAA-G-----A--CGTTATTA--CTCATAAACATCTGG--G--CCTTA---CT---TTT-----TCA-AATAA-TG-GATCATGGCA----TGAACACATTCAATGCATAAAAGAAAAGGCATGGAA--AA--GAATA--AACATTA-TGCGACTTTTAAAATTTCA-A-T--TAGATAG-AAACTCACTTGA--GATTATATATAC--T--A--CTTTTATAC-GTCCAATTCTAGAATATGC--TAACAT--T--GTCTGGGATAATTGCAC-------a
gi|103889                     :                                                                                                                                                                          taaatgatattgtagaaaatataagctcatccataaaattataTCTAACATTCGTTTATTT-GCTGACGA-CACCA-G----------TTTACTGA---TAG-TTGTA-GAAAC---ACCTGATCA--C-----GATTC--C-C--TTGT---T---C----TTAATTCAGATC--TT-GAA---AA-AA-ATC-AC--AA-TTG--G---GCTGAAAAATGGTTAGTAACTTTCAATCCAAA-TAAAACAAAAGCATT-TCTT-GT-TTCGCA-TAAACGAAATA----AA-CCCTT---CCACTCTCAAC---GTG-----T-CAT-GA-----------------------------A--GAA-G--T--T--CA--GTCA--C--ATAAGCATCTTG--G--TGT-C---AT---TCT---C-TCA-AATAACGG-TACC-TGGAA----ATTCCAC-TTAGACATATAAAGACAAAGGCTTGGAA--AA--GATTA--AATATTA-TGAGAAATTTAAAGTTTAA-A-C--TTGATTA-CCAATCACTTCA--AAC-ATTTA-AC--T--TTACTTTCATAC-GCCCTTTACTTGAATATGC--AGATGT--A--ATATGGGATATTTGTAC-------
gi|103890                     :                                                                                                                                                       taaatgatattgttgaagacttaaacAATGACATCGT---AGA-TGA-----TA---TCAATTCAAACATTCGTCTTTTTCGCAGATGACTA-AG-GTC-T-----TTTTA-TTA---TAG----TAGATAAC--CCTAT--TCA-A------GCTGC--A-A--CTAC---T---C----TAAATTCCAA-C---T-TGT---TA-AA-ATA-TTTAAT-T-G--G---ACAGACAAAAGGCTTGTCAAATTTAACCCCTTATAAAATAGAATCTCT-TTTG-AT-TTTACG-CAAGGTCAAT--------TTCATAAACCATCCATCATTTTTTA-----TGAAT-AA----T-C----A--TATG-A-T--AAC--C--GAA-G--TAGA--CG--AT----C--ACAAACATCTTG--G--TGC-T---TT---TCT---G-TCT-AATGACT----------------------TATTGATTATATCGAAACAAAAACATGGAA--CA--GAATA--AATATTA-TGAAAAAAATTAAATA-CA-GTC--TTGATAG-GGTAGCATTAGA--AACTATATATAC--A--T--CATTTATAA-GACCCCTTCTAGAATATGG--AGATATACT--ATTT--GATATTTGCAC-------TCAATAT-GAGAAa
gi|103891                     :                                                                                                                                                                               taAATGACATTGT---A----GAAAACATAAGCTCATCTATAAAATTA-----TTT-GCCGATGA-TACAA-GTC-T-T----TTTA-TTA---TAGTTCACC-A------GACCT-------T-----GCTGCT-A-C-----T---T---TGT--TAAATTCTGG-T--CT-CAG---AA-AA-ATT-CAT--A-T-GTCG---GCTGATAAATGGCTTGTCCAATTCATTCTAAA-CAAAACAGAATTCAT-GGTT-AT--TACCGATAAAATCAATA----AA-CCGAT---ACACCC-CAACCTCATAA----TGAAT-AA----T--A---A--TA-TTA-T--ACA--A--GAA-G--T--AA-CT--AT-G--C--ATAAACATTTAG--G--TTTTA---CT---TTTTCTA-TCA-ATGGA-----ACA-TGGCA----TGAACACATACAATTCATAAAAGATAAGGCATGGAA--GA--GAATA--AATATTA-TGCGGCTA-TTAAGTTCCA-T-T--TAGACAG-ATAATTACTTGA--GATTACATATAT--A--G--CATTCATAC-GTCCAATTCTAGAATATGC--AAACAT--T--GTATGGGACAATTGCACTACATAATAATTAT-GAA
gi|103892                     :                                                                                                                                                                                aAATGATATAGT---GTC-CGA-----TA---TTGATTCTAACAAACGTCTTTTT-GCCGACGA-TACGA-GTC-T-TTA-TTTCA-CAA---TTAACCACA-ATAAT--GATATAATTA-AT-----GCTGC--T-G--AAAC---T---T----TGAATTCAGA-T--AT-TAG---TA-AA-ATA-TCTTAA-T-G--G---TCATATAAATTGCTGGTTACTTTTAATCCCTC-TAAAACTGAATACAT-GCAT-AT-ATAACG-CAAACGCAATC----AG-CTCCC---TCATCCTCCACTTGTTA-----TGCAC-AA----C-CA---A--TA-----T--ATT--GTTGAA-G--T--T--CC--ATCA--C--ACAAACATTTAC--A--TGT-AGGACTATATTC---A-TCA------CTG-CGAC-TGGCA----CTCTCATATTGAATACATTAAGGAAAAGGCATGGA-------------------TA-TGAGAAAACCTAAACACCA-G-T--TAGATAG-AAAATATCTCGA--AACTATATACAA--A--T--CATTTATAC-GACCCTTATTAGAATATGC--AGACGT--C--ATTTGGGATAATTGTAC-------TAAGTAC-GAAAA
gi|103893                     :                                                                                                                                                                                 AATGACATAGT---ATC-TGA-----TA---TCGCATCTAATATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACAA-GCC-TGT-A-TTTTA-TAA---TCGATCATA-ATAAC--AATATAAACA-AT-----GCTGC--A-C--AAAT---T---T----TGAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-ATC-ACTGAA-T-G--G---TCAAAACAATGGCTTGTAACTTTTAATCCATC-GAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGTAATC----AA-CCCGT---CCATCCACCACTTTATA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C--ACAAACACTTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACAACTG-TACC-TGGCA----CTCTCATATTCAATACATTATGGATAAGGCATGGTC--AA--GAATT--AAAGTCA-TGAGAAAACTGAAATATCA-G-C--TTGACAG-AAGATCCCTGGA--GACAATATATAC--A--T--CTTTTATCC-GACCACTGTTAGAATATGG--TAACAC--A--ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103894                     :                                                                                                                                                                                 AATGTCATAGT---ATC-TGA-----CC---TCGCATCTAACATTCGCCTTTTT-GCAGACGA-TACAA-GCC-TGT-A-CTTTA-TAA---TCGATTACA-ATAAC--AATATAAACG-AT-----GTTGC--A-C--AAAT---T---T----TGAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-ATA-ACTGAA-T-G--G---TCAAAGCA-TGGCTTGTTACTTCCAATCCGTC-TAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGCAATC----AA-CCCGT---CCACCCACCACTATATA-----TTCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATTA--C--ACAAACACTTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACAACTG-TACC-TGGCA----CTCTCATATTGAATACATTAGGGAGAAGACATGGTC--AA--GAACT--AAAATCA-TGAGAAAACTGAAATATCA-G-C--TAGACAG-AAGATTCCTAGA--AACTATCTATAC--A--T--CTTTTATCC-GACCACTGTTAGAATATGA--TAACAC--A--ATCTGGGATTACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103895                     :                                                                                                                                                                                 AATGACATATT---ATC-TGA-----TA---TCGCATCTAACATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACAA-GCC-TGT-A-CTTTA-TAA---TCGATCA-------C--AATATAAACA-AT-----GCTGC--A-C--ACAT---T---T----TGAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-ATC-ACTGAA-T-G--G---TCAAAACAATGGCTTGTAACTTTCAATCCACC-GAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGTAATC----AA-CCCGT---CCATCTCCCACTATATA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--GA--ATCA--C--ACAAACACTAAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TTA-AACAACTG-TACC-TGGCA----CTCTCATATTCAATACATTATGGATAAGGCATGGTC--AA--GAATT--AAAGTCG-TGAGAAAACTGAAATATCA-G-C--TAGACAG-AAGATCCCTGAA--GACAATATATAC--A--T--CTTTTATCC-AACCACTGTTAGAATATGG--TAACAC--A--ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103896                     :                                                                                                                                                                                 AATGACATAGT---ATC-TGA-----TA---TCGCATCTAACATTCGTCTTTTT-GCAGACGA-TACAA-GCC-TAT-A-CTTTA-TGA---TCGATCACA-ATACC--AATATGAACA-AT-----GCTGC--A-C--AAAT---T---C----TGAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-ATT-ACTGAA-T-G--G---TCAAATCAATGGCTTGTAACTTTCAATCCGTC-GAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGTAATC----AA-CCCGT---CCATCCACCACTATATA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--AAA-G--T--A--CA--ATCA--C--ACAAACTCTTAT--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACAACTG-TACC-TTGCA----CTCTCATATTGAACACATAAAGGATAAGGCATGGTC--AA--AAATT--AAAATCA-TGAGAAAATTGAAATATCA-G-C--TAGACAG-AAAATCCTTGGA--GACTATATATAC--A--T--CTTTTATCC-GACCACTGTTAGAATATGG--TAACAC--A--ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103897                     :                                                                                                                                                                                 AATGATATAGT---GTC-CGA-----TA---TTGATTCTAACATACGTCTTTTT-GCCGACGA-TACGA-GTC-T-TTA-TTTCA-CAA---TTAACCCCA-ATAAT--GATATAATCA-AT-----GCTGC--T-C--CAAC---T---T----TGAATTCAGA-T--AT-AAG---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---TCAAATAAACGGCTGTTTACTTTTAATCCCTC-TAAAACTGAATACAT-GCAT-AC-ATCACG-CAAACGCAATC----AG-CTCCC---TCATCCTCCACTTGTTA-----TGCAC-AA----C-CA---A--C----A-T--ATT--GTTGAA-G--T--A--CC--ATCA--C--ACAAAGATTTAG--GACTAT-A---TT---T
gi|103898                     :                                                                                                                                                                                 AATGATATTGT---TAC-GGA-----TA---TCAATTCAAACATTCGTCTATTT-GCCGATGA-TTCAA-G-----T-ATTTTTA-TTAATGTAGATCAT--GTAA----ATGT-------T-----GCTGCAGA-C--AGAT---T---agaatgttaaataa
gi|103898                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                AATAAGTGGTTAGTCAGTTTTAACCCA-C-GAAAACAGAATCGCT-ATTG-AT-ATCTCG-TAATCATAAGA----AA-CCTGC---ACACCAACCCCTAAATA-----TGCTC-AA----T-CA---A--AC-C-A-T--TTT--A--GAA-A--T--A--AA--AACT--C--ACAAACACCTAG--G--CGTCA---CG---TTT---T-TTG-GATT-CTG-TAAC-TGGCA----CTCACATATAGAATAAATTAAAGTTAAAACGTGGGA--AA--GAATC--AATATAA-TGCGGCAACTCAAATTTCA-A-T--TTGATCG-AAAATCCTTAGA--AATAATAAATAC--T--A--CTTTTATTA-GACCTATTTTAGAATACGC--AGATGT--T--ATTTTGGATAACTGCAC-------ACACTAT-GAAAggagcaataagtggttagtcagttttaacccacgaaaacagaatcgctattgatatctcgtaatcataagaaacctgcacaccaacccctaaatatgctcaatcaaaccattttagaaataaaaactcacaaacacctaggcgtcacgttttttggattctgtaactggcactcacatatagaataaattaaagttaaaacgtgggaaagaatcaatataatgcggcaactcaaatttcaatttgatcgaaaatccttagaaataataaatactacttttattagacctattttagaatacgcagatgttattttggataactgcacacactatgaaa
gi|103899                     :                                                                       aatgatattgttacggatatcaattcaaacattcgtctatttgccgatgattcaagtatttttattaatgtagatcatgtaaatgttgctgcagacagattggagcAACGACATAGT----TCGTAA-----TG---TTGATTCAAATATTAGACTTTTT-GCGGATGA-CACTA-GTT-TAT-A-TCTAA-TTG---CTGACAGTG-A-AACT-GATATATATATATAAAGAACTGT--A-A--CTAT---T---T----CAAAT----A-A--AT-TTATTTTA-AATATC-ATCCAA-T-G--G---CCAGAACAATGGCTCTTAA
gi|103899                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    A----C-CA---G--CA-A-A-TTAAT------GAA-G--T--A--TC--TTCC--C--ATAAGCACCTTG--G--CAT-A---TT---TTT---C-TTA-AACGAATG-CTCT-TGGTACACCCACCCATATTAACCATGTTAAAGCGAAAGCTTGAAC--TC--GAATC--AACATCA-TGAGAAGACTCAAACACCT-A-C--TCACAAGAAAAATCTTTAGA--AGTTATTTACAT--T--T--CATATATAA-GACCCTTGTTTGAGTACGG--TCATGT--T--ATCTGGGATAACTGCAC-------GAGCTAT-CAAAAataatgttttaccagcaaattaatgaagtatcttcccataagcaccttggcatatttttcttaaacgaatgctcttggtacacccacccatattaaccatgttaaagcgaaagcttgaactcgaatcaacatcatgagaagactcaaacacctactcacaagaaaaatctttagaagttatttacatttcatatataagacccttgtttgagtacggtcatgttatctgggataactgcacgagctatcaaaa
gi|103900                     : aacgacatagttcgtaatgttgattcaaatattagactttttgcggatgacactagtttatatctaattgctgacagtgaaactgatatatatatataaagaactgtaactatttcaaataaatttattttaaatatcatccaatggccagaacaatggctcttaaataatgttttAATGATATTGT---TTC-TAA-----AA---TAGGCTCTGCGATTCGCCTCTTT-GCTGACGA-CACAA-CCC-T-TTA-TGTTA-TTG---TCGAT---A-AT-------CCTCAACA--T-----GCCGT--T-C-----TCCGT---T----TAAATTCTGA-C--CT-ACA---AA-AA-ATC-AATGAC-T-G--GGT-TCAACC---TGGCTAGTAACTTTTAATCCTTC-TAAAACTGAATCTCT-ACTT-AT-TTCTCG-CAAACATG-TC----AAACCCCA---GCACCCGCC----CATA-----TTCATGAA----CTCT---ATTCA-A-A-T--A-C--A--GGACG--CTGA--CA--ATCA--C--A--AACACCTTG--A--AAT-A---AC---TCT---A-TCT-AACGATGG-CACA-TGGCA----CAAACACATTGAAGACATCACCAAAAAAGCTTGG----AATCGAGCC--AATAATC-TGCGCTCTCTCAAAT-TCACT-C--TTAATCG-TCGGTCGCTTGA--AACTATCTACAC--A--T--CTTTCATTA-GACATACACTCGAATACTC--TGACGT--C--GTTTGGGATAAT
gi|103901                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGGCTAGTAACTTTCAATCCTGC-CAAAACGGACTTTTT-ACTT-AT-TTCTCG-CAAACAC-GTCA---AA-CCCCA---GCACCCGCC----CATA-----TTCAT-GA----A-CACT-ATTCA-A-A-T--ACA--G--GAA-G--TTGA--CA--CTCA--T--AC--ACACCTAG--G--AATCA---CT---CTC-----TCT-AATGATTG-CACA-TGGCA----CAAACACATTGAAGACATTACCAAAAAAGCTTGGACT-CA--G--TT--AACACTC-TACGCTCTCTCAAAT-TCATT-C--TAGGTCG-TCGATCACTCGA--AACTATTTACAC--A--T--CATTCATAA-GGCCTACACTTGAATACGC--TGACGT--C--GTTTGGGATAAT
gi|103902                     :                                                              aacgatattgtttctgaaattggctctgtgatttgtctctttgctgacgacacaaccctctatatcattgtcgataaccctttacatgctagtctccgtcttccgacatacagccAATGATATTGT---TTC-TGA-----AA---TAGGCGCTGCAATTCGCCTATTT-GCTGATGA-CACAA-CTC-T-TTA-TGTTA-TTG---CCGATAATC-TT--C--AAAATGA-----T-----GCTCT--C-C--G------T---T----TAAATTCTGA-C--CT-ACA---GA-AG-ATT-AAGGAC-T-G--GGCGTCAACC---TGGCTTTTAACTTTCAATCCTGC-TAAAACTGAATC-CTAACTT-AT-TTCTCG-CAAACAC-GTCA---AA-CCCCA---GCACCCGCCCATATATA-----TG-AT-AT----C-TAT--T--CA-A-A-T--ACA--G--GAA-G--C-----CG--A-CATTC--ACAAACACATTG--G--AATCA---CT---CTC-----TCT-AGCGATGG-TACA-TGGTA----CAAACACATTGAAGACATCACCAAAAAAGCTTGG----AATCGAGTC--AACATTA-TGTGCCCATTAAAA-CTCA---CTGTGGATCA-TCAGTCACTTGA--AACTATCTAAAC--A--T--CTTTCATAAGGACTAC-ACTCGAATACTC--TTACGT--C--GTTTGGGATAAT
gi|103903                     :                                                                                                                                                                                 AATGATATTGT---TTC-TGA-----AA---TAGGCTCTGCGATTCGCCTCTTT-GCTAACGG-CACAACACT-T-T-A-TGTTA-TTG---TCGAT---A-AT-------CCTCAACA--T-----GCTGC--T-C-----TCCGT---T----TAAATTCTGA-T--CT-ACA---AA-AG-ATC-AATGAC-T-G--GGCTTCAACC---TGGCTAGTAACTTTTAATCTTGC-TAAAACTGAATCTCT-ACTT-AT-TTCTCG-CAAACATG-TC----AAACCCCA---GCACCCGCC----CATA-----TTCATGAA----CTCT---ATTCA-A-A-T--A-C--A--GGACG--CTGA--CA--ATCA--C--A--AACACCTTT--G--AAT-A---AC---TCT---A-TCT-AACGATGA-CACA-TGGCA----CAAACACATTGAAGACATCACCAAAAAAGCTTGG----AATCGAGTC--AACA
gi|103904                     :                                                                                                                                                                                   TGACATTGT---ATC-TGA-----TA---TTCACTCCAACATAAGACTTTTT-GCCGATGA-TACAA-GCC-T-TTA-CTTTA-TAA---TTAATCATA-ATAAT--GATATTGTAA-AT-----GCTGC--A-C--AGAC---A---T----TAAATTCTGA-C--AT-AAA---TA-AA-ATA-TCTGAA-T-G--G---CCAACTAAATGGCTGGTTACTTTCAATCCATC-CAAAACAGAACCAAT-GCAT-GT-AACATG-CAAACGCCATC----AA-CCCGT---TCACCCCCCACTTT-TA-----TGCAG-AA----C-CA---A--CA-A-A-TT-AT---A--GAT-G--T--G--TC--ATCT--C--ACAAACATCTAG--GAGTAT-A---CT---T-----A-TCA-AATAACTG-CAGC-TAGCA----CACTCATATTGACTATATTAAGAATAAAGCTTGGTC--TA--GAATA--AATATTA-TGAGAAAACTAAAATTTCA-G-T--TAGATAG-AAAATCACTAGA--AAAAATCTACAT--G--T--CATTTATAA-GACCCTTATTGGAATATGC--CAATGT--T--ATTTGGGATAAATGTAC-------AAATTATCGAAA
gi|103905                     :                                                                                                                                                                                       ATCGT---TTC-TGA-----AA---TTGGCTCTGCGATTCGCTTCTTT-GATGACGA-TACAA-CCC-T-T---TTTTG-TCA---TTG-TCG---ATAAC----CCTCAATA--T-----GCTGC----------T---T---TCATATAAATTCTGA-C--CTACAA---GA-GA-------TCAA-T-G--A---CC-------TGGTTAGTAGCTTTCAATCCTGC-TAAAACTGAATCTTC-ACTT-AT-TTCTCG-CAAACAC-GTC----AA-AC------CCAAGCACAAGTCCATA-----TTCATGAA----C-TCTTTT--CA-A-A-T--ATA--G--GAA-G--T-----CG--A-CACTC--GCAAACACATTT--G--AATCA---CC---CCC-----TCT-AGCGATGG-CACA-TGGCA----CAAACACATACAAGACATCTCCAACAAAGCTTGGAC--TC--GAATC--GACATTC-TGCGCTCTTTCAAATGTTA-T-C--TGGATCG-TTGGTCACCCAA--AACTATCTACAC--A--T--CTTTCAAAA-GGCCTACACTCG-ATACTC--TGACGT--C--GTTTGGGATAAT
gi|103906                     :                                                                                                                                                                                        TGGT---GTC-TGA-----TA---TTGATTCTAGCGTAGGTCATTTT-GCCGATAA-TACAA-GTC-T-----TTTCA-TTA---
gi|103907                     :                                                                                                                                                                                                                       TAAC--TCGTATTTTT-GCAGACGA-TACA
gi|103907                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      tctctcaagcaAG-T-G--G---TCCAAGCAGTGGTTAGTAAATTTTAACCCGAA-CAAAACAGAA--GC--AATT-AT-GT-TCA-CA--CTAAATA----AA-AATGT---TTCTTATCCA-TTTTTAATTTTTG-AT-AATGTCC-CA---G--TA-A-A----ATT--T--G------T-----TG--ATCA--CC-ACAAACATTTAG--G--CAT-AA--CT---TTT---AGTCATAA----TG-CAAAGTGGCA----CCATCATATAGATAACATTGTAAATTCGGCTTG--T--AA--GATTTTGGGAATGA-TGCGTAAAATTAAATTCCT-G-T--TAAATAG-AAAATCACTC----AACCAAATATAC--ATTT--CATTTCTCA-GACCCACTCTAGAGTATGCATCA--GT--T--GTTTGGGATGGTTGCAC-------TCATTAC-GAAAAtcgcttgcatctacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcacgatcttactgtcatatcgcagtggtccaagcagtggttagtaaattttaacccgaacaaaacagaagcaattatgttcacactaaataaaaatgtttcttatccatttttaatttttgataatgtcccagtaaaatttgttgatcaccacaaacatttaggcataacttttagtcataatgcaaagtggcaccatcatatagataacattgtaaattcggcttgtaagattttgggaatgatgcgtaaaattaaattcctgttaaatagaaaatcactcaaccaaatatacatttcatttctcagacccactctagagtatgcatcagttgtttgggatggttgcactcattacgaaaa
gi|103908                     :                                                                                                                                                                                                                                                                   tctctcaagcataactcgtatttttgcagacgatacatcgcttgcatctacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcacgatcttactgtcatatcgcAG-T-G--G---TCCAAGCAGTGGTTAGTAAATTTTAACCCGAA-CAAAACAGAA--GC--AATT-AT-GT-TCA-CA--CTAAATA----AA-AATGT---TTCTTATCCA-TTTTTAATTTTTG-AT-AATGTCC-CA---G--TA-A-A----ATT--T--G------T-----TG--ATCA--CC-ACAAACATTTAG--G--CAT-AA--CT---TTT---AGTCATAA----TG-CAAAGTGGCA----CCATCATAAAGATAACATTGTAAATTCGGCTTG--T--AA--GATTTTGGGAATGA-TGCGTAAAATTAAATTCCT-G-T--TAAATAG-AAAATCACTC----AACCAAATATAC--ATTT--CATTTCTCA-GACCCACTCTAGAGTATGCATCA--GT--T--GTTTGGGATGGCTGCAC-------TCATTAC-GAAAA
gi|103909                     :                                                                                                                                            tttttgcagacgatacatcgcttgcatctacagcttctaacttaccagatttagaaggtattcttaatcatgatcttactgtcatatcgcT-GCAGACGA-TACAA-GCC-TGT-A-CTTTA-TAA---TCGATCACA-ATAAC--AATATAAACA-AT-----GCTGC--A-C--AAAT---T---T----TGAATTCCGA-C--AT-CAA---CA-AA-ATC-ACTGAA-T-G--G---TCAAAACAATGGCTTGTAACTTTTAATCCATC-GAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGTAATC----AA-CCCGT---CCATCCACCACTATATA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C--ACAAACACTTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACAACTG-TACC-TGGCA----CTCTCATATTCAATACATTATGGATAAGGCATGGTC--AA--GAATT--AAAGTCA-TGAGAAAACTGAAATATCA-G-C--TAGACAG-AAGATCCCTGGA--GACAATATATAC--A--T--CTTTTATCC-GACCACTGTTAGAATATGG--TAACAC--A--ATCTGGGATAATTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103910                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                       A-AT-----GCTAT--T-C--AAAC---T---T----TGGATTCTGA-C--AT-TCG---TA-AA-ATA-TCCGAG-T-G--G-----ACACTAA--------CACT---AA-CACTC-GAATACA-------T-GCAT-AT-ATCTCG-CAAACGCAATC----AT-CTCCC---CCATCCTCCACTAGTCA-----TGCAC-AA----T-CT---T--TA-T-A-T--AGT--T--GAA-G--A--G--CT--ATCA--C--ACAAACCTGTAG--GAGTAT-A--------TTA---A-TCA-AACTGTTG-CAGC-TGGCA----TTCTCATATTGACTA---------AAACGCAAGGTA--AA--TACTA--AATATTA-TGAGATAATATTAACGTTA-G-A--TAGCTGG-AAAATCACT--------TATGTATAC--A--A--ACTTTAT------------TGGAATATGC--AG-CGT--T--ATCTTATATAATTGTAA-------TACATAC-GAAAA
gi|103911                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tA-AA-ATC-ACTGAA-T-G--G---TCAAAACAATGGCTTGTAACTTTTAATCCATC-GAAGACTGAATCGCT-TCTT-AT-ATCTAG-GAAACGTAATC----AA-CCCGT---CCATCCACCACTATATA-----TGCAT-AA----C-CA---A--CA-A-A-T--ATC--A--GAA-G--T--A--CA--ATCA--C--ACAAACACTTAG--G--TAT-A---CT---TTT---A-TCA-AACAACTG-TACC-TGGCA----CTCTCATATTCAATACAGTATGGATAAGGCATGGTC--AA--GAATT--AAAGTCA-TGAGAAAACTGAAATATCA-G-C--TTGACAG-AAGATCCCTGGA--GACAATATATAC--A--T--CTTTTATCC-GACCACTGTTAGAATATG---TAACAC--A--ATCTGGGATAACTGCAC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103912                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tTGGCTAGTAACTGTCAATCCTTC-TAAAACTGAATCTTT-ACTT-AT-TTCTCG-CAAACACG-TC----AA-ACC-----CCAGCATCCGCCC-ATA-----TTCAT-GAATT-C-TA---TT-CA-A-A-T--A-C--A--GGACGCTT--A--CA--ATCA--C--A--AACACCTTG--G--AAT-A---AC---TCT---A-TCT-AACGATGG-CACA-TGGCA----CAAACACATTGAAGACATCACCAAAAAAGCTTGG----AATCGAGTC--AACAATC-TGCGCTCTCTCAAATTCAA-T-C--TTGATCG-TCGGTCGCTTGA--AACTATCTACAC--A--T--CTTTCATTA-GGCCTACACTCGAATACTC--TGACGT--C--GTTTGGGATAAT
gi|103913                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggttaatagacc--C--ATAAACATCTGG--G--CCTTA---CT---TTT-----TCT-AATAA-TG-GATCATGGCA----TGAACACATTCAATACATAAAAGAAAAGGCATGGAA--AA--GAATA--AACATTA-TGCGGATTTTTAAATTTCA-A-T--TAGATAG-AAAATCACTTGA--GATTATATATAC--T--A--CTTTTATAC-GTCCAATTCTAGAATATGC--TAACAT--T---TCTGGGATAATTGCA
gi|103914                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 gttattact--C--ATAAACATCTAG--G--TCTTA---CT---TTT-----TCT-AATG-TTG-GGTCATGGCA----TGAGCACATTCAATACATAAAAGAAAAGGCACGAAA--AA--GAATA--AATAGTA-TGCGACTTTTGAAATTTCA-A-T--TAGATAG-AAAAT---------------ATGTAC-----T--AGTTTATAC-GTCCAATTCTAGAATAAGC--TTACAT--T--GTCTGGGATAATTG
gi|103915                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ct--C--ACAAACATCTTG--GATTA--A---CC---TTA---A-GTA-A-C-ACTGGTAAA-TGGGA----AACTCATATAGAAAATATTAA---AAAATCATCATCTAAA--GTGTT--AGGATTAATGAGAAAATTGAAATTTAC-C-C--TTAGTAG-AAATGCCCT--A--AATCAAATTTACTTA--T--CATATGTTA-GACCCCTTTTTGAATATTCATCAA--T--T--GTTTGGGAT
gi|103916                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tTGGTC--TA--GAAT---AATATTA-TGAGAAAACTTAAAACTCA-C-T--TAGATAG-AAAACCACACGA--AACTATTTGCAT--G--T--CATTCATAA-GACCTTTATTGATATATAC--CGACGT--T--ATTTGGGATAATTGTTT-------AAATTAT-GAAAA
gi|103917                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     atacttgtacatatatgacacctggcatttaagtcacagtcgtgttggagcccttaattagcagttgaagAAGA--AATATTA-TGAGAAAACTAAAATTTCA-G-T--AAGATAG-AAAATCACTAGA--ATCAATGAACAT--G--T--CATTTATAA-GACCCTTAGTGGAATATGC--CAATGT--T--ATTTGGGATAATTGTAC-------AAATTAT-GAGAA
gi|103918                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               --AATGTAA-TGCGTAAACTCAAACATAA-G-C--TTGATAG-AACATCTCTTGA--AATTATCTTTAT--A--T--CCTTTATCA-GACCCCTATTAGAGTACGA--TGACAT--T--ATTTGGGACAATTGTAC-------TGACTAT-CAAAA
gi|103919                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 aTAAAATTTAA-A-T--TAAATAG-AAAAACACTTAATCAA--ATTTATAT--T--T--CTTGCATGC-GTCCAATTTTAGAGTATGC--TGCTGT--T--GTTTGGGATGGTTGTGC-------TAATTAT-GAAAA
gi|103920                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    AAATTTCA-A-T--TAGATAG-AAAATCGCTTGA--GATTATATATAC--T--A--CTTTTATAC-GTCCAATTCTAGAATATGC--TAACAT--T--GTCTGGGATAATTGCAC-------
gi|103921                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TGG-AAAATCACACAA--AACAATCTACAT--G--T--CATTTATAA-GACCCTTATTGGAATATGT--CAATGC--T--ATTTGGGATAATTGTAC-------AATTTAT-GAAAA