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gi|14221 : GCTAC-TG---TCCTGCTGTGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACTACAGTCACACCATGTGGTAAT--------GAGA---AA-A--------A--CA---T--G-CATATTGTACCCCAAT---TT---GCATAATT----CACCACAGCATTTATGA-CCCCAAGGTTTAAGATAGGATGTA----T-GT----TA-TATTGCATAGTATTA-TAAACAATAACTT-AATTTAAATATTTTCAGTT-ATTTAG-GAGG--TCAATACCAA-TG-----------GT--AAGA-AATT-ATG--T
gi|14222 : GTTAC-TGACTTCCTGATAAGCTTTACTAATC--TCCCACC-ACCACAT---------GTGG------------GAG------------GC-CAATTA-TGTTGG-CATGCTGTACTTGAAA---TA---GCATAAAT----CAC-------------A-CC--AGGGTTTATGACAGG----A----T-GT--------AT---ATAACCTT--TCGCTT-TGGC-T-AAT-----CATG---AGTT-AATTAG-GGGTCATTGACATTGG-TG---ACATACAAGT--GATA-AAT
gi|14223 : CTACCTGACATCCTACTGTGCTCTCCAAATTTCCCCCAAGGACTACATTCACACCATGTGGTAATATACATTGGAGACATAATGCCCC-C-CT--CTGTCT--G-CATACTGCACAC-AGTGCCTC----CATAGAT----CACCCCATGTTTAATAA-CCCCTGGGTTAATGACAGG----A----T-GTATG-TAATATTACATCATTTTA-TGGCCTATTGC-T-AATTTCAACATTTTCAGTTAAATTAGAGGGT--TT-GTATCAATTGTACA-TTGCTACT---AAA-AATC-ATG--T
gi|14224 : TGTACCCAAAC---TTTACACATAAAA----TATCTAAGTTCCCAT-A-TCCCAGGGATTATGACAGG----A----T-G-----------CACCTATCATTA-CATCATACGGC-T-AATT--ATCATT---A----AATTAG-GGG---TCAGTGATAA-TG
gi|14225 : A-AATTGAAA--TTTT-CTGATG--TTAGGTATTTTTTTCACAAAT--------------------------------ACACTATTTTAACAGT-AAAA--ATAAA---AC-T---CTC-C----------TT-TTGAATCA----CATACA----ATAGCA-AAG----CA-TA----GGAAGGAAAATAAACATTCATTTAGTACATA--TTCATAT-ATTTATGAATAAATAAGAGAA
gi|14226 : AC---------GTACATT--TTCATAT-ATTTATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTAATTTCTCAT---TTTTC-ATTACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCTAGCTGACTGTGA------TATATATCAATCAACTAAATTGCCTATTTATTATAAAATTAATGAAATGAGTTTATGAGCAATTAATAGT
gi|14227 : aattgAAAC---------GTACATT--T-CATAT-ATTTATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTAAATTTATATT---TTTTC-TATACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAATAATCAGGTAATGACCTAGCTGACTGTG-AAAAGCCATATATCAAT
gi|14228 : tAAATAAAGGAACAAAGGTTTTAATTTATCTT---TTTTC-ATTATGAAGTAGATGCAGTTCAAATGTCTATTCAATGA--------TAATGACCTAGCTGACTGAG-AAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGTTTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
blockSeqs : C TC G T ATACATTG CAT T ACATGCAT AT G TG T T GCCTC TCTGA C A C A ATGT TGCT A ATGT A C T C A A GTCA T CAAACTTGCA AA G G CC T AA AGG ATACATGTATACATG A A AC TA TTA A ATG TATA TGATTTTA TTTTTC TTGT A G T GTTT C TTTT A A T ATTCATTTAGTACA TG A T TTC G TAATCAGG A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T TTTAC T C T . T ATGT . . ATG . . T C . . GT . TAAACTTACA AA . . CC T . AGG TTCAA T . AC . TTA . AAG TCA TATTAA TTTTTC TTGT T G . . C TTTT A G T GTACA . . T . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T TA T C T . T ATAT . . . . . T T . . GT . CAAACTTACA A . . CC T . AGG TTCAA T . AC . TT . . TCA ATTTTA TTTTTC TTGT T G . . C TTTT A G T GTACA . . T . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTACA . A . . T AA T C T . T ATGT . . . . . T . . . GT . CAAACTTACA A . . . . . AGG TTCAA T . C . TT . . TCA TATTAA TTTTTC TTGT A G . . C TTTT A G T GTACA . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T TA T C A . T ATGT . . . . . T . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . TTCAA A . . . TT . . TGC ATTTTA TTTTTC TTGT G A . . C TTTT C T T GTACA . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CACTGCC . T . . T TG T C A . T ATGT . . . . . T . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . A A . . . . . . TCA TATTAA TTTTTC TTGA T C . . C TTTT C T A ATACG . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . T . . T AA T C A . T ATGT . . . . . T . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . A A . . . . . . ATA ATTTTA TTTTTC TTGT G A . . T CTTT A T A GTACA . . T . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T AA T C A . T ATGT . . . . . T . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . A A . . . . . . TCA TATTAA TTTTTC TTGT T C . . C TTTT C G T GTACA . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCT . G . . T AA T A A . T ATGT . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . A A . . . . . . ATA ATTTTA TTTTTC CTGT T G . . C TTTT C T A GTACA . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CACTGCC . T . . T TA T C A . T ATGT . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA A . . . . . . A T . . . . . . CCA TATTTA TTTTTC CTGT G A . . C TTTT C T A ACC . . T . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CACTGCC . G . . T AA T A A . T ATGT . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA . . . . . . . A A . . . . . . TTA TATTAA AC . T C . . C TTTT C T A AC . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGTC . G . . T AA T C A . T . . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA . . . . . . . A A . . . . . . TCG ATTTTA AC . G A . . C TTTT C T A . . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . T . . T AA T C A . T . . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA . . . . . . . A T . . . . . . TCA TATTAA AC . T C . . . . C T A . . . T . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T AA T C A . T . . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA . . . . . . . A A . . . . . . ATA ATTTTA AC . G A . . . . C T A . . . A . . . A
blockSeqs : . . . T . . T CCCTGCC . G . . T AA T C A . T . . . . . . . . . . TT . CAAACTTACA . . . . . . . A A . . . . . . TCA TATTTA AT . T C . . . . C T C . . . A . . . .
blockSeqs : . . . G . . T CCCTGCC . G . . T AA T C T . T . . . . . . . . . . GT . CAAACTTACA . . . . . . . A T . . . . . . TCA TATTAA AT . G A . . . . A T T . . . T . . . .
blockSeqs : . . . G . . T CCCTGCC . G . . T AA T A T . T . . . . . . . . . . GG . CAAACTTTCA . . . . . . . A A . . . . . . TCA ATTTTA AC . T C . . . . A G . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . G . . A CCCTGCC . A . . C AA T A T . A . . . . . . . . . . GG . CAAACTTAA . . . . . . . A T . . . . . . ATA TATTAA AC . G A . . . . . G . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . G . . A CCCTGCC . G . . C TA T A T . A . . . . . . . . . . GG . TACATTGCT . . . . . . . A A . . . . . . TCA ATTTTA C . T C . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . G . . A CCCTGCA . G . . C TT T A T . A . . . . . . . . . . GG . ACATACA . . . . . . . A A . . . . . . ATA TTTTT A . G A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A CCCTACA . A . . C TT T A T . A . . . . . . . . . . GG . CCTAC . . . . . . . A T . . . . . . GC CTTT A . T C . .
blockSeqs : . . . G . . A CCCCCC . A . . C TT T A T . A . . . . . . . . . . GG . T . . . . . . . A T . . . . . . GC TATA A . T C . .
blockSeqs : . . . G . . T GCC . G . . C TT T A T . A . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . . . . . . . . . GC TTTT A . T C . .
blockSeqs : . . . G . . A A . . . . C TT T A T . A . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . TA TTT A . T G . .
blockSeqs : . . . G . . A A . . . . C TT A A T . A . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . TA T A . T G . .
blockSeqs : . . . G . . A A . . . . C TT . A T . A . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . CC T A . . . . .
blockSeqs : . . . T . . A . . . . . C TT . C T . A . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . T A .
blockSeqs : . . . G . . T . . . . . T TT . C T . T . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . T A .
blockSeqs : . . . G . . T . . . . . C TT . C T . T . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . T . . . . . C TA . A T . T . . . . . . . . . . GT . . . . . .
blockSeqs : . . . G . . A . . . . . C CT . A T . A . . . . . . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . T . . . . . C TT . C A . A . . . . . . . . . . G . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . G TT . T C . T . . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . TA . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons : TCA* NNTTNA***** TC**** TTTT GTACA*********
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finalCons : TCCAGCTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCACACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CAGTGT--G-CATATTGTACCCCAAT---TN---GCGTAATT----CACCCCAGGTTTNATGA-CCCCAGGGTTTATGACAGG----A----T-GT----TA-TATCGCATAGTATTA-TGGCTTATTAC-T-AATTTAAACATTTTCAGTT-AATTAG-GGGT--TCAATATCAA-TGCAAACTTACAAGT--AAAA-AATT-ATG--TTAT-ATGATT--TTATGAATATTTTTCATAAATT---GT----A--------------TACCAGAACACTATTTTAACAGT-AAAA--A--AA---AC-T---TTTCA-TGNNTTNA-----TGAATATC----ATAAA----ATANCA-AAG----CACTATTTTAGCAGTAAAANAAACGTACA---------TT--TTCATGT-ATTNATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTACTTTATCTT---TTTTC-ATTACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCTAGCTGACTGTGAAAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
Alignments
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Reference ( family-535 ) : TCCAGCTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCACACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CAGTGT--G-CATATTGTACCCCAAT---TN---GCGTAATT----CACCCCAGGTTTNATGA-CCCCAGGGTTTATGACAGG----A----T-GT----TA-TATCGCATAGTATTA-TGGCTTATTAC-T-AATTTAAACATTTTCAGTT-AATTAG-GGGT--TCAATATCAA-TGCAAACTTACAAGT--AAAA-AATT-ATG--TTAT-ATGATT--TTATGAATATTTTTCATAAATT---GT----A--------------TACCAGAACACTATTTTAACAGT-AAAA--A--AA---AC-T---TTT-CAT--GNNTTNATGAATAT----CA-TAAA----ATANCA-AAG----CACTATTTTAGCAGTAAAANAAAC---------GTACATT--TTCATGT-ATTNATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTACTTTATCTT---TTTTC-ATTACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCTAGCTGACTGTGAAAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
gi|14188 : TCCAGGTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCTCACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CAGTGT--G-CATATTGTACTCTGAT---TA---GTGTAAAT----CACCCCAGGTTTAATGA-CCCCAGGGATTAAGACAGG----A----T-GT----TA-TATCACATAGTATTA-TGCCTTATTAC-T-AATTTAAACATTTTCTGTT-AATTAT-GGTT--TCAATATCAA-TGCAAACTTGCAAGT--AAAA-AATT-ATG--TTAT-ATGATT--TTATGTATATTTTTCACAAATT---GT----A--------------TACCAGAACACTATTTTAACAGT--AAA--A--AA---AC-T---CTG-C-T--GT-----TGAATAA----CA-TACA----AAAGCA-AAG----CA-TA----AGAAGAAAAATAGAT---------GTACATT--TTCATAT-ATTTATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTACTTTGTCTT---TTTTC-ATTACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCTAGCTAACTGTGAAAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
gi|14189 : TCCAGGTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCTCACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CAGGGT--G-CATATTGTACTCTAAT---TA---GCGTAAAT----CACCCCAGGTTTAATGA-CCCCAGGGATTAAGACAGG----A----T-GT----TA-TATCACATAGTATTA-TGCCTTATTAC-T-AATTTAAACATTTTCTGTT-AATTAT-GT-T--TCAATATCAA-TGCAAACTTGCAAGT--AAAA-AATT-ATG--TTAT-ATGATT--TTATGTATATTTTTCACAAATT---GT----A--------------TACCAGAACACTATTTTAACAGT-AAAA--A--AA----C-T---CTG-C-T--GT-----TGAATAA----CA-TACA----AAAGCA-AAG----CA-TA----AGAAGAAAAATAGAT---------GTACATT--TTCATAT-ATTTATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTACTTTGTCTT---TTTTC-ATTACGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATAACCTAGCTAACTGTGAAAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
gi|14190 : TCCAGCTAA-TGGCACCCTGCTGAACTTTCATAATT--CACCAAC-ACTACATTCACACAATGTGGTAAT--------ATGA---AATACCCTGC-CA--CAGTGT--G-CATATTGTTCCCTAAT---AA---GTATAAAT----CATCCCAGGTTTTATGA-CCCCAGGGTTTATGACAGG----A----T-GT----AA-AATCACATAGTATTA-TGGCTTGTTAC-T-ATTTTAAACATTTTCAGTT-AATTAG-GGGT--TCAATATCAA-TGTAAACTTACAAGT--AAAA-AAAT-ATG--TAAT-ATGATT--GTATGCATATTTTTCACAAATT---GT----A--------------TACCAGTACACTATTTTAACAAA-AAAAACA--AA---AC-T---CTG-C-T--GT-----TGAATAA----CA-TACA----ATAGCA-AAG----CA-TA----AGAAGGAAAATAAAC---------GTACATT--TT----------ATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTAATTTATCTTTTCTTTTC-ATTACGAAGTAGATGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCGAGCTGACTG---AAAAGCCATATATCAATGAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAATTGAGTTTATGAACAATTAATGGT
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gi|14192 : TCCAGCTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCACACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CAATGT--G-TAAATTGTACCATAAT---TG---GCATAAAT----CACCCAAGGTTTTATGA-CCCCATGGTTGATGGCCGG----A----T-GT----AA-TATCACATAGTATTA-TGGCGTATTAC-T-TATTTAATCATTTTCAGTT-TATTAG-GGGT--TCAATATCAA-TGCAAACTTA-AAGT--AAAA-AAAT-ATG--CAAA-ATGATT--TTATGTATAGTTTTCAAAAAGT---GT----ATACATGTATACATGTACCAGTACACTATTTTAACAGT-AAAAC-A--AA---AC-T---C-----T--GCTTT--TGAATAA----CA-TACA----AAAGCA-AAG----CA-TA----AGAAGGAAAATACAT---------GTACATT--TTCATAT-ATTTATGAATAAAT-----AAC---GGTTTTAATTTATCTT---TTTTC-ATTATGAAGTAGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCCAGCTGACTGTG-AAAAGCCATATATCAACAAGCTAAATTGCCAATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGT
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gi|14194 : TCCAGCTAC-TGGCACCCTGCTGAGCTTTCATAATT--CACCAAC-ACCACATTCACACCATGTGGTAAT--------GAGA---AATACCCTGC-CA--CATTGT--G-CATATTGTACCCTAAT---AA---GCGTGAT-----CACCCCAGGTTTAATGA-CCCCAGGGTTTATGACAGG----A----T-GT----TA-TATCACACAGTATTA-TGCCTTATTAC-T-AATTTAAACATTTTCAGTT-AATTAG-GGTT--TCAATATTAA-TGCAAACTTACAAGTA-AAAA-AATT-AAG--TTAT-ATGATT--TTATGAATATTTTTCATAAATT---GT----A--------------TACCAGAACACTATTTTAACAGT-AAAA--A--AA---AC-T---TTT-CAT--GTATTAATGAATA-----AA-TAAA----GGAACA-AAG----
gi|14194 : AGT-AAAA--A--AATTAAG-T---TAT--AT--GATTTTATGAATATTTTTCA-TAAATTGTATACCA-GAA----CACTATTTTAACAGTAAAAAAAAC--------------TT--TTCATGT-ATTAATGAATAAATAAAGGAACAAAGGTTTTACTTTATCTT---TTTTC-ATTGCGAAGTTGAGGTAGTTCAAATGTCTATTCAAGAA--------TAATGACCTAGTTGACTGTGAAAAAGCCATATATCAATAAACTAAATTGCCTATTGATTATAAAATTAATAAAATGAGTTTATGAACAATTAATGGTgttttactttatcttttttcattgcgaagttgaggtagttcaaatgtctattcaagaataatgacctagttgactgtgaaaaagccatatatcaataaactaaattgcctattgattataaaattaataaaatgagtttatgaacaattaatggt
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gi|14225 : A-AATTGAAA--TTTT-CTGATG--TTAGGTATTTTTTTCACAAAT--------------------------------ACACTATTTTAACAGT-AAAA--ATAAA---AC-T---CTC-C-------TTT-TGAATCA----CA-TACA----ATAGCA-AAG----CA-TA----GGAAGGAAAATAAACATTCATTTAGTACATA--TTCATAT-ATTTATGAATAAATAAGAGAA
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