lowQualScore : 2222 111111111111 22222 222222 111111111 3333333333333
lowQualScore : 11 444444444 1 0 22222 22222 66 1 0000 1 1 444444444444 4444444 222 88888 1 11 11111 11 1 2222 222 4444444 55555555 555555 55 5 0 9 4444 33333 1 0 11 1 33 222 5 33333 55 999999999 1 2222222222222
lowQualScore : .. ......... . . ..... ..... .. . .... . . ............ ....... ... ..... . .. ..... .. . .... ... ....... ........ ...... .. . . . .... ..... . . .. . .. ... . ..... .. ......... . .............
lowQualScore : 55 222222222 1 1 66666 66666 88 0 3333 0 3 111111111111 2222222 333 00000 3 88 88888 88 3 7777 333 2222222 66666666 777777 66 5 8 9 2222 44444 4 1 99 4 88 444 8 44444 22 444444444 5 6666666666666
consensus : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-NAANCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TACTN-CAATT--------GCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Reference ( gi|33243 ) : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CATTT-ATTCCAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTAT--A--TG-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-AAAAACC-AATAGGTGTGTCAATACCTTA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CTTAAA-----TACTT-CAATA--------GCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33245 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGTTGTAT--A--AA-TT--CATTAAGC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-TAACCCC-AATAGTTGTGTCAATACCTAA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTAC--AC--AG-TA--AC---CCTAAA-----TACTT-CAATT--------GCATGACTA-AAAA-------------CATATAAGTTTATCAA
gi|33246 : AAACAACA--AAGTGAATTGATG---------G-CTCGTAGT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCATTT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTAAAACTTTAAAA-TTGCTGTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-AAAAA-C-AATAGGCATGCCAATACCTAA-C--ATAAGGTACAT-----C-ATGTAAATAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TACTT-CAATT--------GAATGGCAA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAACCA
gi|33247 : AAACAACA--AAGTGAATGTATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTT-AATTCAACA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGT-TTTCAAACTTAAATT-TTGCTTTAC--A--AA-TT--AGTTAAAT-T----TT---GG-------TGA------CAAA-TAAACCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACGTAT--AA-TA--ACCGTCCTAAA-----TACTT-CCATT--------GCATGACTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAAGCA
gi|33252 : AAACAATA--AAGTGAACGGATA---------G-CCCATATT-----G-----CCTTTATAT-TTTTT-ATTTAAGCA-TT-AA------------GA-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTATAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA---------A-AAAAACT-GATAGGTGTGCCAATACTTAA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CATAAA-----TACTA-AAATT--------GCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAGGCAt
gi|33244 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTT-AATATAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTAT--A--AA-AT--CATTGACC-A----TT---GG-------TGA------C-AA-ATAACCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAA-C--TGAAGGCA--------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCAAA-----TACTT-CAATT--------GCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCAt
gi|33242 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTT-AATATAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTAT--A--AA-AT--CATTGACC-A----TT---GG-------TGA------C-AA-ATAACCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAA-C--TGAAGGCA--------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCAAA-----TACTT-CAATT--------GCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCAt
gi|33249 : AAACAACA--AAGTGA-TGTATG---------G-CTCGTATT-----T-----AAGTAACAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GC-------AACAT---T-----TGTCTATCAAACATTAAAA-ATACTTTAT--A--AA-TT--CATTAATC-AACGATT---AC-------TGA------CAAATAACCCCC-AATAGGTGTGCCAATACCAAA-C--TTAAGGCACAT-----C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TACTT-CAACT--------GCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTTGAGCAt
gi|33248 : AAACAACA--AAGTGAAAGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTGGACA-AT-TGTCATT----T--GT-------TACATAATTA----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTAC--A--AT-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGC------CAAA-TAACCCC-AATAGGTGTGCCAGTA-CTTATC--TTAAGGCAAAT-----C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTTTA-----TACTT-TAATT--------GTATGATTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAGGTA
gi|33250 : AAACAACA--AAGTGAATGG-TA---------G-TTTATATT-----G-----CCTTAATAT-TATCT-AATACAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TC-CTTTAT--A--AA-TT--CATTGACC-A----TT---GCTGCATGGTGA------C-AA-ACAACCC-GATACGTGTACC-ATAACCTATC--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTAAA-----TACAA-CAATT--------GCATGACTA-AA---------------AATATAAGTTGGTCGAGCA
gi|33251 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---TAATTTTGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTCTT--A--AA-TT--TATGAACC-A----TT---GC-------TAA------CAAA-TAATCCC-AATAGGTGTGCCAATACTTAA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACATTT--AA-TA--AC---ACTAAA-----AACTT-CAAt
gi|33253 : AAACGACA--AAGTGAACGGATG---------G-CTCGTTTT-----A-----CTTTAAAAT-TATTT-AATTCAGCA-TTCTGGCATG----T--GT-------TACAT---T-----T------CAAACTTTAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--AATAAACC-A----TT---GC-------TGG------CAAA-TAACCCT-AATAAGTGTG------CCTAA-C--GAAAGGCACAC-----C-ATGTAGATAT--GA-TA--AC---TCTAAA-----TACTT-C-ATA--------TCATGCCTA-GAAT-------------AATATTAATTGGTCAAGCA
gi|33258 : AAACAACA--CAGTGAATGGTTA---------G-CTCATATTATATTG-----CCTTAATAT-TAT--------------------GTT----T---T-------TA-------------GTATTTCAGACTTTAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA-------AAA-AA----T-GATAGGTATGCCAGAACCTTA-C--TTAAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AATTAATAC---CCTAAAAAATGTACTA-CAATT--------GCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33257 : AAACCACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCACATA-----G-----TCTTAATAT-TGTTT-A-------A-TT-TACCATTACGGTAAGT-------TACAT---T-----TGTTTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATCAA--TG-----CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------C--A-AATAACCTGATAGGTGTGCCAATACTTAA-C--TTAAGGCACAC-----T-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TAt
gi|33255 : AAACAACA--AAGTGAATAGATG---------G-CTTATGTT-----A-----CTGTACTTT-TATTT-AATTAAGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---T-----TGTCGTTCAAACTTTAAAAATTGACTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TTATTGC-------TGA------CAAA-TAATCCG-AAT-GGTATGCCAAATCCTAA-T--TTAAGGCACAC-----C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CTTATT-----TTTTTACAACT--------GCATGAATA-GAAT-------------AGTATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33254 : AATCAATA--AAGTGAATGAATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTT-AACTTAGCA-TT-TA------------AT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAA-TTTAAA---TAATTTAT--------------TTACCCCA----TT---TC-------TGA------TAAA-TAAC-CC-GTTAGGTGTGCCAATACCTAA-C--TTAAGGCACAT-----C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCGAAA-----TATTG-CATTT--------GCATCAATA-GAAT-------------AATTTAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33256 : AAACAACA--AAGTGAATGGATGTCTTGTATTGTCTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GTCATTTGTTAC-T---T-----TGTCTTTCAAACTTAAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-GT--CATGAACC-A----TT---AC-------TGA------CAAA-TAACCCT-TATAGGTGTGCCAATATC-AA-C--TTAAGt
gi|33259 : AAACAATG--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATACT-----G-----TCTTAAT----------TT--AGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACT---------GCTT-----A--CA-TC--CATTA--------------GT-------TGA------CAAA-TAA--CC-A---GAT-------TACCTAA-C--TTAAGGCACAT-----A-ATGTAGATAT--AA-TA--TC---CCTAAA-----TATTG-CAACT--------GCATGAATA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAG
gi|33261 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTT-A-------A-TT-TAGCATT----T--A-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-GT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA--------AA-AGTAACC---------TGTTA----------------GGCACAC-----C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TATTA-CAATT--------GCATGAACA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGTAaat
gi|33262 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTT-A-------A-TT-TAGCATT----T--A-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-GT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA--------AA-AGTAACC---------TGTTA----------------GGCACAC-----C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TATTA-CAATT--------GCATGAATA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAt
gi|33260 : AACCAACA--AAGTGAATGGATG---------T-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTC-AATC--------------------------------TATAT---T-----TGTCTGTCAAACTTTAAAA-CTG-GTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------CGA------C--A-AATAACCTGACAGATGTGCCAATACtgtat
gi|33263 : AAACAACA--AAGTGTATAGATG---------G-CTTGTAAT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGCCATT----T--GT-------
gi|33264 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCACCA-T
gi|33270 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CAATT-AATTCAGCA-T
gi|33265 : AAACAACA--GAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCG-T
gi|33269 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TAATT-AATTCAGCA-T
gi|33267 : AAACAACA--AATTGAATGGATG---------A-CTCTTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTCAGCA-T
gi|33266 : AAACAACA--AAGTGAATGGACG---------G-CTAGTATT-----G-----CCTTAACAT-TATTT-AATTCAGCA-T
gi|33268 : AAACAACA--AAGCGAATGGATG---------G-TTTGTATT-----G-----CCTCAATAT-TATTT-AATTCAACA-T
gi|33271 : AACAGCACTAGATAAACGGACC---------G-CTCG-GTT-----GTAACACCTTAATAT-TATTTTATTT-AGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TC--AATTAACC-A----TT---AT-------TGA-------AAA-ATAACCC-GATGTGTGTGCCAGCACCTAA-C--TTATGGCACAC-----C-GTATAC--------------C-------GA-----TACT--------------------ACAA-GAAT-------------AATATAAGTTGGACAAGCA
gi|33272 : AACAATA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCTTATT-----G-----CCTTAATATGTATTA-ATT-CAGCA-Tt
gi|33273 : ACAACA--AAGTGAATAAATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCGTAATAT-TATTT-AATCCAACA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---TAATTTTGTCATTCAAACTTTAACA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-TAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAA-C--TTAAGGAACAT-----C-ATGTACGTAT--AA-T------------AA-----TACTT-CAATT--------GCATGATTA-GAAT-------------AATATAATTTGGTCAAGCA
gi|33274 : AACA--AAGTGAATGGATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-ACTTCAGCA-TT------------T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-ATGCTTTCT--A--AA-TT--CATTAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-TAATCCC-AATAAGTGTGCCAATACCTAA-C--TTAAAGCACAT-----A-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCTAAA-----TACTT-CAATAATTGAATTGCATGGCTA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGCA
gi|33275 : AATA--AGGTCAATGGATG---------A-CTTGTATT-----G-----TCTAAATAT-TATTT-AATTCAACA-TT-TGTTATT----T--GT-------TACAT---G-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGAGATAT--A--AA-TTCACATCAACC-A----TT---GC-------TGA------CAAA-TAACCCC-AGTAGCTGTGCCAATACCTAA-C--TAAAGGCACAT-----C-ATGTACAT-----A-TA--AC---CCTAAA-----TACTT-CAATT--------GCATGACTA-GACT-------------ATTATAAATTGGTCAAGCA
gi|33276 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CACACATT-----G-----CCTTAATAT-TATTT-AATTGAGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCCAACCTTAAAA-TTGCTTTAT--T--AA-TT--TATTAACC-A----TT---GC-------AG-------TAAA-A-----T-GATATATGTGCGGATAC-TTG------AAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTAAA-----TACTA-CAATT--------GCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33277 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTT-AATTGAGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAT--T--AA-TT--TATTAACC-A----TT---GC-------AG-------TAAA-A-----T-GATATATGTGCGAATAC-TTG------AAGGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTAAA-----TACTA-CAATT--------GCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33278 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTT-AATTGAGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTA---A--TAATT--TATTAACC-A----TT---GC-------AG-------TAAA-A-----T-GATATATGTGCGAATAC-TTG------AAAGCACAC-----C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CTTAAA-----TACTA-CAATT--------GCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33279 : AATGGATG---------T-CTCGTATT-----G-----CCCTAATAT-TATTT-AATTAAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TATAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTAT--A--AA-T---CATTAACC-A----TT---GC-------TAATGCTAACAAA-TAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACATAA-C--TTAAGGCACAT-----C-ATGTATGTAT--AA-TT--AC---CATAAA-----TACTT-CAATT--------GCATGAGTT-GACT-------------AATATAAGTTGGTCAATCAt
gi|33280 : ---------G-TTCGGATT-----G-----CCATAATAA-TATTT-AATTGAGCA-TT-TA------------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAT--A--AA-TT--TATTAACC-A----TT---GC-------AG-------TAAA-A-----T-GATAGGTGTGCGAATAC-TTG------AAGGCACAC-----C-ATATACATAT--AA-TT--AC---CCTAAA-----TACTA-CAATT--------GCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTTGTCAAGCA
gi|33281 : TCATATT-----G-----CCTTAAACT-TATTT-AATTCAGCA-TT-TGTCATT----T--GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTTAAA-TTGCTTTAT--A--TA-TG--CATTAACA-A----TT---GC-------TGA------CAAA-TAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTTA-CGGTCAAGCAATAC-----TAATATACAAATTAAA-CATTAT---CTGAAA-----TAATT-C--CA--------GCAAGAATATGA---------------AATACAAt
gi|33282 : TTAAAACTTTAAAA-TTGCTTTAT--AAATG-TA--TAT--ACT-A----TT---GC-------TGA------CACA-TAA--CCTGATATGTATGTCAATACC--------TAAGGTACATACATAC-ATGTACGTAT--AA-TA--AA---CCTAAA-----TACTA-CAATT--------ACATGACTA-G----------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111 1 3333333333333
lowQualScore : 11 444444444 1 0 22222 22222 1 0 33 1 33333 4444444 222 77777 1 11 11 2222 222 4444444 333333 1 4 22 11 222 1 0 11 1 33 222 1 33333 1 55555555 1 1 1111111111111
lowQualScore : .. ......... . . ..... ..... . . .. . ..... ....... ... ..... . .. .. .... ... ....... ...... . . .. .. ... . . .. . .. ... . ..... . ........ . . .............
lowQualScore : 55 111111111 0 1 55555 55555 0 1 00 2 22222 1111111 333 77777 2 77 77 7777 222 1111111 666666 0 9 88 88 333 3 7 88 3 77 333 3 33333 0 00000000 4 4 4444444444444
consensus : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Reference ( family-531 ) : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAANAANCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33242 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GG-------TGA------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33243 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CATTTATTCCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATATGTT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAAAAAAACC-AATAGGTGTGTCAATACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CTTA-AA-----TACTTC--------A-ATAGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33244 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GG-------TGA------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33245 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGTTGTATAAATT--CATTAAGC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAACCCC-AATAGTTGTGTCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTAC--AC--AG-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-AAAA-------------CATATAAGTTTATCAAt
gi|33246 : AAACAACA--AAGTGAATTGATG---------G-CTCGTAGT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--TTGTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTAAAACTTTAAAA-TTGCTGTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAAAAAAAC--AATAGGCATGCCAATACCTAAC--ATAAGGTACAT---C-ATGTAAATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGAATGGCAA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAACCA
gi|33247 : AAACAACA--AAGTGAATGTATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGT-TTTCAAACTTAAATT-TTGCTTTACAAATT--AGTTAAAT--T----TT---GG-------TGA------CAAATAAACCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--ACCGTCCTA-AA-----TACTTC--------C-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAAGCA
gi|33248 : AAACAACA--AAGTGAAAGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGGACAAT--T-GTCATTTGT-------TACATAATTA----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTACAATTT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGC------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAGTACTTATC--TTAAGGCAAAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTT-TA-----TACTTT--------A-ATTGTATGATTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAGGTAt
gi|33249 : AAACAACA--AAGTGA-TGTATG---------G-CTCGTATT-----T-----AAGTAACAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGC-------AACAT---T-----TGTCTATCAAACATTAAAA-ATACTTTATAAATT--CATTAATC--AACGATT---AC-------TGA------CAAATAACCCCCAATAGGTGTGCCAATACCAAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ACTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTTGAGCA
gi|33250 : AAACAACA--AAGTGAATGG-TA---------G-TTTATATT-----G-----CCTTAATAT-TATCTAATACAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TC-CTTTATAAATT--CATTGACC--A----TT---GCTGCATGGTGA------CAAACAA-CCC-GATACGTGTACCATAACCTATC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACAAC--------A-ATTGCATGACTA-AA---------------AATATAAGTTGGTCGAGCA
gi|33251 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTCTTAAATT--TATGAACC--A----TT---GC-------TAA------CAAATAATCCC-AATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATTT--AA-TA--AC---ACTA-AA-----AACTTC--------A-At
gi|33252 : AAACAATA--AAGTGAACGGATA---------G-CCCATATT-----G-----CCTTTATAT-TTTTTATTTAAGCATT--A-A------GA-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTATAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA-------AAAAAA--CT-GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTAA--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAGGCA
gi|33253 : AAACGACA--AAGTGAACGGATG---------G-CTCGTTTT-----A-----CTTTAAAAT-TATTTAATTCAGCATTC-T-GGCATGTGT-------TACAT---T-----T------CAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--AATAAACC--A----TT---GC-------TGG------CAAATAACCCT-AATAAGTGTG------CCTAAC--GAAAGGCACAC---C-ATGTAGATAT--GA-TA--AC---TCTA-AA-----TACTTC--------ATAT--CATGCCTA-GAAT-------------AATATTAATTGGTCAAGCAt
gi|33254 : AATCAATA--AAGTGAATGAATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAACTTAGCATT--T-A------AT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAATTT--AAA-T---------AATT--TATTTACCCCA----TT---TC-------TGA------TAAATAA-CCC-GTTAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCGA-AA-----TATTGC--------A-TTTGCATCAATA-GAAT-------------AATTTAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33255 : AAACAACA--AAGTGAATAGATG---------G-CTTATGTT-----A-----CTGTACTTT-TATTTAATTAAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCGTTCAAACTTTAAAAATTGACTTATAAATT--CATTAACC--A----TTATTGC-------TGA------CAAATAATCCG-AAT-GGTATGCCAAATCCTAAT--TTAAGGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CTTATTT-----TTTTAC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AGTATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33256 : AAACAACA--AAGTGAATGGATGTCTTGTATTGTCTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGTCATTTGTTAC-T---T-----TGTCTTTCAAACTTAAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATGAACC--A----TT---AC-------TGA------CAAATAACCCT-TATAGGTGTGCCAATATC-AAC--TTAAGt
gi|33257 : AAACCACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCACATA-----G-----TCTTAATAT-TGTTTAATTTACCATTACG-GTAA---GT-------TACAT---T-----TGTTTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATCAATG--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAA-CCT-GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---T-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TA
gi|33258 : AAACAACA--CAGTGAATGGTTA---------G-CTCATATTATATTG-----CCTTAATAT-TAT--------------------GTTT-T-------TA-------------GTATTTCAGACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TG--------AAAAAAT----GATAGGTATGCCAGAACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AATTAATAC---CCTA-AAAAATGTACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33259 : AAACAATG--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATACT-----G-----TCTTAAT-----------TTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACT---------GCTT---ACATC--CATTA---------------GT-------TGA------CAAATAA-CCA-GAT-----------TACCTAAC--TTAAGGCACAT---A-ATGTAGATAT--AA-TA--TC---CCTA-AA-----TATTGC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGt
gi|33260 : AACCAACA--AAGTGAATGGATG---------T-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTCAATC---------------------------TATAT---T-----TGTCTGTCAAACTTTAAAA-CTGGTT-ATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------CGA------CAAATAA-CCT-GACAGATGTGCCAATACaat
gi|33261 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAACA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGTA
gi|33262 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAt
gi|33263 : AAACAACA--AAGTGTATAGATG---------G-CTTGTAAT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GCCATTTGT-------tgtat
gi|33264 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCACCAT
gi|33265 : AAACAACA--GAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCGT
gi|33266 : AAACAACA--AAGTGAATGGACG---------G-CTAGTATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33267 : AAACAACA--AATTGAATGGATG---------A-CTCTTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33268 : AAACAACA--AAGCGAATGGATG---------G-TTTGTATT-----G-----CCTCAATAT-TATTTAATTCAACAT
gi|33269 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TAATTAATTCAGCAT
gi|33270 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CAATTAATTCAGCAT
gi|33271 : AACAGCACTAGATAAACGGACC---------G-CTCG-GTT-----GTAACACCTTAATAT-TATTTTATTTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATC--AATTAACC--A----TT---AT-------TGA------AAAATAA-CCC-GATGTGTGTGCCAGCACCTAAC--TTATGGCACAC----------CGTAT---------AC---C----GA-----TACTAC--------A------------A-GAAT-------------AATATAAGTTGGACAAGCA
gi|33272 : AACAATA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCTTATT-----G-----CCTTAATATGTA-TTAATTCAGCATt
gi|33273 : ACAACA--AAGTGAATAAATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCGTAATAT-TATTTAATCCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCATTCAAACTTTAACA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGAACAT---C-ATGTACGTAT--AA-T-------------AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGATTA-GAAT-------------AATATAATTTGGTCAAGCA
gi|33274 : AACA--AAGTGAATGGATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTACTTCAGCATT----------TGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-ATGCTTTCTAAATT--CATTAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAATCCC-AATAAGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAAGCACAT---A-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTCAATAATTGA-ATTGCATGGCTA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGCA
gi|33275 : AATA--AGGTCAATGGATG---------A-CTTGTATT-----G-----TCTAAATAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTTATTTGT-------TACAT---G-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGAGATATAAATTCACATCAACC--A----TT---GC-------TGA------CAAATAACCCC-AGTAGCTGTGCCAATACCTAAC--TAAAGGCACAT---C-ATGTACAT-----A-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-GACT-------------ATTATAAATTGGTCAAGCA
gi|33276 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CACACATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCCAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GC-------AGT------AAAAT-------GATATATGTGCGGATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33277 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GC-------AGT------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33278 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAATAATT--TATTAACC--A----TT---GC-------AGT------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AAGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CTTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33279 : AATGGATG---------T-CTCGTATT-----G-----CCCTAATAT-TATTTAATTAAGCATT--T-GTCATTTGT-------TATAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTATAAAT---CATTAACC--A----TT---GC-------TAATGCTAACAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACATAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGAGTT-GACT-------------AATATAAGTTGGTCAATCAt
gi|33280 : ---------G-TTCGGATT-----G-----CCATAATAA-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--TATTAACC--A----TT---GC-------AGT------AAAAT-------GATAGGTGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATATACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTTGTCAAGCA
gi|33281 : TCATATT-----G-----CCTTAAACT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTTAAA-TTGCTTTATATATG--CATTAACA--A----TT---GC-------TGA------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTTACGGTCAAGCAATAC---TAATATACAAATTAAA-CATTAT---CTGA-AA-----TAATTC--------C-A--GCAAGAATATGA---------------AATACAAt
gi|33282 : TTAAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATG--TATATACT--A----TT---GC-------TGA------CACATAA-CCT-GATATGTATGTCAATACCTAAG--GTA---CATACATAC-ATGTACGTAT--AA-TA--AA---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTACATGACTA-G----------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111 3333333333333
lowQualScore : 11 444444444 1 0 22222 22222 1 0 33 1 33333 4444444 222 77777 1 11 11 2222 222 4444444 333333 999999 11 222 1 0 11 1 33 222 1 33333 1 55555555 1 1 1111111111111
lowQualScore : .. ......... . . ..... ..... . . .. . ..... ....... ... ..... . .. .. .... ... ....... ...... ...... .. ... . . .. . .. ... . ..... . ........ . . .............
lowQualScore : 55 111111111 0 1 55555 55555 0 1 00 2 22222 1111111 333 77777 2 77 77 7777 222 1111111 666666 333333 88 333 3 7 88 3 77 333 3 33333 0 00000000 4 4 4444444444444
consensus : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Reference ( family-531 ) : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33242 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33243 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CATTTATTCCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATATGTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAAAAAAACC-AATAGGTGTGTCAATACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CTTA-AA-----TACTTC--------A-ATAGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33244 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33245 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGTTGTATAAATT--CATTAAGC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGTTGTGTCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTAC--AC--AG-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-AAAA-------------CATATAAGTTTATCAAt
gi|33246 : AAACAACA--AAGTGAATTGATG---------G-CTCGTAGT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--TTGTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTAAAACTTTAAAA-TTGCTGTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAA-AAAAAC-AATAGGCATGCCAATACCTAAC--ATAAGGTACAT---C-ATGTAAATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGAATGGCAA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAACCA
gi|33247 : AAACAACA--AAGTGAATGTATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGT-TTTCAAACTTAAATT-TTGCTTTACAAATT--AGTTAAAT--T----TT---GGTG-------A------CAAATAAACCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--ACCGTCCTA-AA-----TACTTC--------C-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAAGCA
gi|33248 : AAACAACA--AAGTGAAAGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGGACAAT--T-GTCATTTGT-------TACATAATTA----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTACAATTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------C------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAGTACTTATC--TTAAGGCAAAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTT-TA-----TACTTT--------A-ATTGTATGATTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAGGTAt
gi|33249 : AAACAACA--AAGTGA-TGTATG---------G-CTCGTATT-----T-----AAGTAACAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGC-------AACAT---T-----TGTCTATCAAACATTAAAA-ATACTTTATAAATT--CATTAATC--AACGATT---ACTG-------A------CAAATAACCCCCAATAGGTGTGCCAATACCAAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ACTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTTGAGCA
gi|33250 : AAACAACA--AAGTGAATGG-TA---------G-TTTATATT-----G-----CCTTAATAT-TATCTAATACAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TC-CTTTATAAATT--CATTGACC--A----TT---GCTGCATGGTGA------CAAACAACCC--GATACGTGTACCATAACCTATC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACAAC--------A-ATTGCATGACTA-AA---------------AATATAAGTTGGTCGAGCA
gi|33251 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTCTTAAATT--TATGAACC--A----TT---GCTA-------A------CAAATAATCCC-AATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATTT--AA-TA--AC---ACTA-AA-----AACTTC--------A-At
gi|33252 : AAACAATA--AAGTGAACGGATA---------G-CCCATATT-----G-----CCTTTATAT-TTTTTATTTAAGCATT--A-A------GA-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTATAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAA-AACT---GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTAA--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAGGCA
gi|33253 : AAACGACA--AAGTGAACGGATG---------G-CTCGTTTT-----A-----CTTTAAAAT-TATTTAATTCAGCATTC-T-GGCATGTGT-------TACAT---T-----T------CAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--AATAAACC--A----TT---GCTG-------G------CAAATAACCCT-AATAAGTGTG------CCTAAC--GAAAGGCACAC---C-ATGTAGATAT--GA-TA--AC---TCTA-AA-----TACTTC--------ATAT--CATGCCTA-GAAT-------------AATATTAATTGGTCAAGCAt
gi|33254 : AATCAATA--AAGTGAATGAATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAACTTAGCATT--T-A------AT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAATTT--AAA-T---------AATT--TATTTACCCCA----TT---TCTG-------A------TAAATAACCC--GTTAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCGA-AA-----TATTGC--------A-TTTGCATCAATA-GAAT-------------AATTTAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33255 : AAACAACA--AAGTGAATAGATG---------G-CTTATGTT-----A-----CTGTACTTT-TATTTAATTAAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCGTTCAAACTTTAAAAATTGACTTATAAATT--CATTAACC--A----TTATTGCTG-------A------CAAATAATCCG-AAT-GGTATGCCAAATCCTAAT--TTAAGGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CTTATTT-----TTTTAC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AGTATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33256 : AAACAACA--AAGTGAATGGATGTCTTGTATTGTCTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGTCATTTGTTAC-T---T-----TGTCTTTCAAACTTAAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATGAACC--A----TT---ACTG-------A------CAAATAACCCT-TATAGGTGTGCCAATATC-AAC--TTAAGt
gi|33257 : AAACCACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCACATA-----G-----TCTTAATAT-TGTTTAATTTACCATTACG-GTAA---GT-------TACAT---T-----TGTTTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATCAATG--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAA-CCT-GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---T-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TA
gi|33258 : AAACAACA--CAGTGAATGGTTA---------G-CTCATATTATATTG-----CCTTAATAT-TAT--------------------GTTT-T-------TA-------------GTATTTCAGACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A-------AAA-AA---T-GATAGGTATGCCAGAACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AATTAATAC---CCTA-AAAAATGTACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33259 : AAACAATG--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATACT-----G-----TCTTAAT-----------TTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACT---------GCTT---ACATC--CATTA---------------GTTG-------A------CAAATAACC------AGAT-------TACCTAAC--TTAAGGCACAT---A-ATGTAGATAT--AA-TA--TC---CCTA-AA-----TATTGC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGt
gi|33260 : AACCAACA--AAGTGAATGGATG---------T-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTCAATC---------------------------TATAT---T-----TGTCTGTCAAACTTTAAAA-CTGGTT-ATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCCG-------A------CAAATAA-CCT-GACAGATGTGCCAATACaat
gi|33261 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAACA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGTA
gi|33262 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAt
gi|33263 : AAACAACA--AAGTGTATAGATG---------G-CTTGTAAT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GCCATTTGT-------tgtat
gi|33264 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCACCAT
gi|33265 : AAACAACA--GAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCGT
gi|33266 : AAACAACA--AAGTGAATGGACG---------G-CTAGTATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33267 : AAACAACA--AATTGAATGGATG---------A-CTCTTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33268 : AAACAACA--AAGCGAATGGATG---------G-TTTGTATT-----G-----CCTCAATAT-TATTTAATTCAACAT
gi|33269 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TAATTAATTCAGCAT
gi|33270 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CAATTAATTCAGCAT
gi|33271 : AACAGCACTAGATAAACGGACC---------G-CTCG-GTT-----GTAACACCTTAATAT-TATTTTATTTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATC--AATTAACC--A----TT---ATTG-------A------AAAATAACCC--GATGTGTGTGCCAGCACCTAAC--TTATGGCACAC---C-------GTAT--A-----------CC---GA-----TACTAC--------A------------A-GAAT-------------AATATAAGTTGGACAAGCA
gi|33272 : AACAATA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCTTATT-----G-----CCTTAATATGTA-TTAATTCAGCATt
gi|33273 : ACAACA--AAGTGAATAAATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCGTAATAT-TATTTAATCCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCATTCAAACTTTAACA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGAACAT---C-ATGTACGTAT--AA-T-------------AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGATTA-GAAT-------------AATATAATTTGGTCAAGCA
gi|33274 : AACA--AAGTGAATGGATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTACTTCAGCATT----------TGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-ATGCTTTCTAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAATCCC-AATAAGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAAGCACAT---A-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTCAATAATTGA-ATTGCATGGCTA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGCA
gi|33275 : AATA--AGGTCAATGGATG---------A-CTTGTATT-----G-----TCTAAATAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTTATTTGT-------TACAT---G-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGAGATATAAATTCACATCAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AGTAGCTGTGCCAATACCTAAC--TAAAGGCACAT---C-ATGTACAT-----A-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-GACT-------------ATTATAAATTGGTCAAGCA
gi|33276 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CACACATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCCAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGGATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33277 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33278 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAATAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AAGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CTTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33279 : AATGGATG---------T-CTCGTATT-----G-----CCCTAATAT-TATTTAATTAAGCATT--T-GTCATTTGT-------TATAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTATAAAT---CATTAACC--A----TT---GCTA-------ATGCTAACAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACATAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGAGTT-GACT-------------AATATAAGTTGGTCAATCAt
gi|33280 : ---------G-TTCGGATT-----G-----CCATAATAA-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATAGGTGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATATACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTTGTCAAGCA
gi|33281 : TCATATT-----G-----CCTTAAACT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTTAAA-TTGCTTTATATATG--CATTAACA--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTTACGGTCAAGCAATAC---TAATATACAAATTAAA-CATTAT---CTGA-AA-----TAATTC--------C-A--GCAAGAATATGA---------------AATACAAt
gi|33282 : TTAAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATG--TATATACT--A----TT---GCTG-------A------CACATAACCT--GATATGTATGTCAATACCTAAG--GTA---CATACATAC-ATGTACGTAT--AA-TA--AA---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTACATGACTA-G----------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111 3333333333333
lowQualScore : 11 444444444 1 0 22222 22222 1 0 33 1 33333 4444444 222 77777 1 11 11 2222 222 4444444 333333 999999 11 222 1 0 11 1 33 222 1 33333 1 55555555 1 1 1111111111111
lowQualScore : .. ......... . . ..... ..... . . .. . ..... ....... ... ..... . .. .. .... ... ....... ...... ...... .. ... . . .. . .. ... . ..... . ........ . . .............
lowQualScore : 55 111111111 0 1 55555 55555 0 1 00 2 22222 1111111 333 77777 2 77 77 7777 222 1111111 666666 333333 88 333 3 7 88 3 77 333 3 33333 0 00000000 4 4 4444444444444
consensus : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Reference ( family-531 ) : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33242 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33243 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CATTTATTCCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATATGTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAAAAAAACC-AATAGGTGTGTCAATACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CTTA-AA-----TACTTC--------A-ATAGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33244 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33245 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGTTGTATAAATT--CATTAAGC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGTTGTGTCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTAC--AC--AG-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-AAAA-------------CATATAAGTTTATCAAt
gi|33246 : AAACAACA--AAGTGAATTGATG---------G-CTCGTAGT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--TTGTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTAAAACTTTAAAA-TTGCTGTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAA-AAAAAC-AATAGGCATGCCAATACCTAAC--ATAAGGTACAT---C-ATGTAAATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGAATGGCAA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAACCA
gi|33247 : AAACAACA--AAGTGAATGTATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGT-TTTCAAACTTAAATT-TTGCTTTACAAATT--AGTTAAAT--T----TT---GGTG-------A------CAAATAAACCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--ACCGTCCTA-AA-----TACTTC--------C-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAAGCA
gi|33248 : AAACAACA--AAGTGAAAGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGGACAAT--T-GTCATTTGT-------TACATAATTA----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTACAATTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------C------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAGTACTTATC--TTAAGGCAAAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTT-TA-----TACTTT--------A-ATTGTATGATTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAGGTAt
gi|33249 : AAACAACA--AAGTGA-TGTATG---------G-CTCGTATT-----T-----AAGTAACAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGC-------AACAT---T-----TGTCTATCAAACATTAAAA-ATACTTTATAAATT--CATTAATC--AACGATT---ACTG-------A------CAAATAACCCCCAATAGGTGTGCCAATACCAAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ACTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTTGAGCA
gi|33250 : AAACAACA--AAGTGAATGG-TA---------G-TTTATATT-----G-----CCTTAATAT-TATCTAATACAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TC-CTTTATAAATT--CATTGACC--A----TT---GCTGCATGGTGA------CAAACAACCC--GATACGTGTACCATAACCTATC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACAAC--------A-ATTGCATGACTA-AA---------------AATATAAGTTGGTCGAGCA
gi|33251 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTCTTAAATT--TATGAACC--A----TT---GCTA-------A------CAAATAATCCC-AATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATTT--AA-TA--AC---ACTA-AA-----AACTTC--------A-At
gi|33252 : AAACAATA--AAGTGAACGGATA---------G-CCCATATT-----G-----CCTTTATAT-TTTTTATTTAAGCATT--A-A------GA-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTATAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAA-AACT---GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTAA--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAGGCA
gi|33253 : AAACGACA--AAGTGAACGGATG---------G-CTCGTTTT-----A-----CTTTAAAAT-TATTTAATTCAGCATTC-T-GGCATGTGT-------TACAT---T-----T------CAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--AATAAACC--A----TT---GCTG-------G------CAAATAACCCT-AATAAGTGTG------CCTAAC--GAAAGGCACAC---C-ATGTAGATAT--GA-TA--AC---TCTA-AA-----TACTTC--------ATAT--CATGCCTA-GAAT-------------AATATTAATTGGTCAAGCAt
gi|33254 : AATCAATA--AAGTGAATGAATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAACTTAGCATT--T-A------AT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAATTT--AAA-T---------AATT--TATTTACCCCA----TT---TCTG-------A------TAAATAACCC--GTTAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCGA-AA-----TATTGC--------A-TTTGCATCAATA-GAAT-------------AATTTAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33255 : AAACAACA--AAGTGAATAGATG---------G-CTTATGTT-----A-----CTGTACTTT-TATTTAATTAAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCGTTCAAACTTTAAAAATTGACTTATAAATT--CATTAACC--A----TTATTGCTG-------A------CAAATAATCCG-AAT-GGTATGCCAAATCCTAAT--TTAAGGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CTTATTT-----TTTTAC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AGTATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33256 : AAACAACA--AAGTGAATGGATGTCTTGTATTGTCTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGTCATTTGTTAC-T---T-----TGTCTTTCAAACTTAAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATGAACC--A----TT---ACTG-------A------CAAATAACCCT-TATAGGTGTGCCAATATC-AAC--TTAAGt
gi|33257 : AAACCACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCACATA-----G-----TCTTAATAT-TGTTTAATTTACCATTACG-GTAA---GT-------TACAT---T-----TGTTTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATCAATG--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAA-CCT-GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---T-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TA
gi|33258 : AAACAACA--CAGTGAATGGTTA---------G-CTCATATTATATTG-----CCTTAATAT-TAT--------------------GTTT-T-------TA-------------GTATTTCAGACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A-------AAA-AA---T-GATAGGTATGCCAGAACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AATTAATAC---CCTA-AAAAATGTACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33259 : AAACAATG--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATACT-----G-----TCTTAAT-----------TTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACT---------GCTT---ACATC--CATTA---------------GTTG-------A------CAAATAACC------AGAT-------TACCTAAC--TTAAGGCACAT---A-ATGTAGATAT--AA-TA--TC---CCTA-AA-----TATTGC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGt
gi|33260 : AACCAACA--AAGTGAATGGATG---------T-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTCAATC---------------------------TATAT---T-----TGTCTGTCAAACTTTAAAA-CTGGTT-ATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCCG-------A------CAAATAA-CCT-GACAGATGTGCCAATACaat
gi|33261 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAACA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGTA
gi|33262 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAt
gi|33263 : AAACAACA--AAGTGTATAGATG---------G-CTTGTAAT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GCCATTTGT-------tgtat
gi|33264 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCACCAT
gi|33265 : AAACAACA--GAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCGT
gi|33266 : AAACAACA--AAGTGAATGGACG---------G-CTAGTATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33267 : AAACAACA--AATTGAATGGATG---------A-CTCTTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33268 : AAACAACA--AAGCGAATGGATG---------G-TTTGTATT-----G-----CCTCAATAT-TATTTAATTCAACAT
gi|33269 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TAATTAATTCAGCAT
gi|33270 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CAATTAATTCAGCAT
gi|33271 : AACAGCACTAGATAAACGGACC---------G-CTCG-GTT-----GTAACACCTTAATAT-TATTTTATTTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATC--AATTAACC--A----TT---ATTG-------A------AAAATAACCC--GATGTGTGTGCCAGCACCTAAC--TTATGGCACAC---C-------GTAT--A-----------CC---GA-----TACTAC--------A------------A-GAAT-------------AATATAAGTTGGACAAGCA
gi|33272 : AACAATA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCTTATT-----G-----CCTTAATATGTA-TTAATTCAGCATt
gi|33273 : ACAACA--AAGTGAATAAATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCGTAATAT-TATTTAATCCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCATTCAAACTTTAACA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGAACAT---C-ATGTACGTAT--AA-T-------------AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGATTA-GAAT-------------AATATAATTTGGTCAAGCA
gi|33274 : AACA--AAGTGAATGGATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTACTTCAGCATT----------TGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-ATGCTTTCTAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAATCCC-AATAAGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAAGCACAT---A-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTCAATAATTGA-ATTGCATGGCTA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGCA
gi|33275 : AATA--AGGTCAATGGATG---------A-CTTGTATT-----G-----TCTAAATAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTTATTTGT-------TACAT---G-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGAGATATAAATTCACATCAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AGTAGCTGTGCCAATACCTAAC--TAAAGGCACAT---C-ATGTACAT-----A-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-GACT-------------ATTATAAATTGGTCAAGCA
gi|33276 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CACACATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCCAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGGATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33277 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33278 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAATAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AAGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CTTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33279 : AATGGATG---------T-CTCGTATT-----G-----CCCTAATAT-TATTTAATTAAGCATT--T-GTCATTTGT-------TATAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTATAAAT---CATTAACC--A----TT---GCTA-------ATGCTAACAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACATAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGAGTT-GACT-------------AATATAAGTTGGTCAATCAt
gi|33280 : ---------G-TTCGGATT-----G-----CCATAATAA-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATAGGTGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATATACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTTGTCAAGCA
gi|33281 : TCATATT-----G-----CCTTAAACT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTTAAA-TTGCTTTATATATG--CATTAACA--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTTACGGTCAAGCAATAC---TAATATACAAATTAAA-CATTAT---CTGA-AA-----TAATTC--------C-A--GCAAGAATATGA---------------AATACAAt
gi|33282 : TTAAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATG--TATATACT--A----TT---GCTG-------A------CACATAACCT--GATATGTATGTCAATACCTAAG--GTA---CATACATAC-ATGTACGTAT--AA-TA--AA---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTACATGACTA-G----------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
blockSeqs : CT TCTTGTATT T ATATT TAACA G AC T TCATT CATTTGT AAT AATTT A CA CC ACGA ATT CATGGTG TGCTAA CCCCCA GG ATA A TA T AT CGT T AAATG T AATAATTG T T AATATATAAGAAC
blockSeqs : . . . . . . C . TCATT . . AATTT . . . . . . . AACCA . . . . . TT . . . T . . . AATATATAAGAAC
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . A . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . T . . . AATATATAAGAAC
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . AAACA . . . . . . . . . T . . . AATATATAAGAAC
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . ACCCA . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . TCCCA . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCTA . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . TCCGA . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GCATG . . . . . . . . . . CCCTT . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . CCATT . . . . . . . . . . TCCCA . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TTATT . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCCA . . . . . . . . . G . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TCATT . . . . . . . . . . CCCG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . CCCG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . GTT . . . . . . . . . . CCCG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . CCTG . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . ATT . . . . . . . . . . CCTG . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCCG . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CCTG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CTG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TG . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CC . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : CCCCG*
originalCons : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
finalCons : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCCG-ATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Alignments
lowQualScore : 11111 3333333333333
lowQualScore : 11 444444444 1 0 22222 22222 1 0 33 1 33333 4444444 222 77777 1 11 11 2222 222 4444444 333333 999999 11 222 1 0 11 1 33 222 1 33333 1 55555555 1 1 1111111111111
lowQualScore : .. ......... . . ..... ..... . . .. . ..... ....... ... ..... . .. .. .... ... ....... ...... ...... .. ... . . .. . .. ... . ..... . ........ . . .............
lowQualScore : 55 111111111 0 1 55555 55555 0 1 00 2 22222 1111111 333 77777 2 77 77 7777 222 1111111 666666 333333 88 333 3 7 88 3 77 333 3 33333 0 00000000 4 4 4444444444444
consensus : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
Reference ( family-531 ) : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-GATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTNC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33242 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33243 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CATTTATTCCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATATGTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAAAAAAACC-AATAGGTGTGTCAATACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CTTA-AA-----TACTTC--------A-ATAGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33244 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-TTCATATT-----G-----CCTTGATAT-TATTTAATATAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TTCCTTTATAAAAT--CATTGACC--A----TT---GGTG-------A------CAAATAA-CCC-GATAGGTGTACCTTTACCTAAC--TGAAGGCA------C-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCCA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTT-GGTT-------------AATATAAGCTGGTCTAGCA
gi|33245 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGTTGTATAAATT--CATTAAGC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGTTGTGTCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTAC--AC--AG-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-AAAA-------------CATATAAGTTTATCAAt
gi|33246 : AAACAACA--AAGTGAATTGATG---------G-CTCGTAGT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--TTGTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTAAAACTTTAAAA-TTGCTGTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAA-AAAAAC-AATAGGCATGCCAATACCTAAC--ATAAGGTACAT---C-ATGTAAATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGAATGGCAA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAACCA
gi|33247 : AAACAACA--AAGTGAATGTATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGT-TTTCAAACTTAAATT-TTGCTTTACAAATT--AGTTAAAT--T----TT---GGTG-------A------CAAATAAACCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACGTAT--AA-TA--ACCGTCCTA-AA-----TACTTC--------C-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAAGCA
gi|33248 : AAACAACA--AAGTGAAAGGATG---------G-CTCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGGACAAT--T-GTCATTTGT-------TACATAATTA----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTACAATTT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------C------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAGTACTTATC--TTAAGGCAAAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTT-TA-----TACTTT--------A-ATTGTATGATTA-GAAT-------------AATAGAAGTTGGTCAGGTAt
gi|33249 : AAACAACA--AAGTGA-TGTATG---------G-CTCGTATT-----T-----AAGTAACAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGC-------AACAT---T-----TGTCTATCAAACATTAAAA-ATACTTTATAAATT--CATTAATC--AACGATT---ACTG-------A------CAAATAACCCCCAATAGGTGTGCCAATACCAAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ACTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTTGAGCA
gi|33250 : AAACAACA--AAGTGAATGG-TA---------G-TTTATATT-----G-----CCTTAATAT-TATCTAATACAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACTTTAAAA-TC-CTTTATAAATT--CATTGACC--A----TT---GCTGCATGGTGA------CAAACAACCC--GATACGTGTACCATAACCTATC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACAAC--------A-ATTGCATGACTA-AA---------------AATATAAGTTGGTCGAGCA
gi|33251 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTCTTAAATT--TATGAACC--A----TT---GCTA-------A------CAAATAATCCC-AATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATTT--AA-TA--AC---ACTA-AA-----AACTTC--------A-At
gi|33252 : AAACAATA--AAGTGAACGGATA---------G-CCCATATT-----G-----CCTTTATAT-TTTTTATTTAAGCATT--A-A------GA-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTATAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAA-AACT---GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTAA--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAGGCA
gi|33253 : AAACGACA--AAGTGAACGGATG---------G-CTCGTTTT-----A-----CTTTAAAAT-TATTTAATTCAGCATTC-T-GGCATGTGT-------TACAT---T-----T------CAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--AATAAACC--A----TT---GCTG-------G------CAAATAACCCT-AATAAGTGTG------CCTAAC--GAAAGGCACAC---C-ATGTAGATAT--GA-TA--AC---TCTA-AA-----TACTTC--------ATAT--CATGCCTA-GAAT-------------AATATTAATTGGTCAAGCAt
gi|33254 : AATCAATA--AAGTGAATGAATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAACTTAGCATT--T-A------AT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAATTT--AAA-T---------AATT--TATTTACCCCA----TT---TCTG-------A------TAAATAACCC--GTTAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCGA-AA-----TATTGC--------A-TTTGCATCAATA-GAAT-------------AATTTAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33255 : AAACAACA--AAGTGAATAGATG---------G-CTTATGTT-----A-----CTGTACTTT-TATTTAATTAAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCGTTCAAACTTTAAAAATTGACTTATAAATT--CATTAACC--A----TTATTGCTG-------A------CAAATAATCCG-AAT-GGTATGCCAAATCCTAAT--TTAAGGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CTTATTT-----TTTTAC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AGTATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33256 : AAACAACA--AAGTGAATGGATGTCTTGTATTGTCTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGTCATTTGTTAC-T---T-----TGTCTTTCAAACTTAAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATGAACC--A----TT---ACTG-------A------CAAATAACCCT-TATAGGTGTGCCAATATC-AAC--TTAAGt
gi|33257 : AAACCACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCACATA-----G-----TCTTAATAT-TGTTTAATTTACCATTACG-GTAA---GT-------TACAT---T-----TGTTTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATCAATG--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAA-CCT-GATAGGTGTGCCAATACTTAAC--TTAAGGCACAC---T-ATGTACGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TA
gi|33258 : AAACAACA--CAGTGAATGGTTA---------G-CTCATATTATATTG-----CCTTAATAT-TAT--------------------GTTT-T-------TA-------------GTATTTCAGACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A-------AAA-AA---T-GATAGGTATGCCAGAACCTTAC--TTAAGGCACAC---C-ATGTACATAT--AATTAATAC---CCTA-AAAAATGTACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGCA
gi|33259 : AAACAATG--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATACT-----G-----TCTTAAT-----------TTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCATTCAAACT---------GCTT---ACATC--CATTA---------------GTTG-------A------CAAATAACC------AGAT-------TACCTAAC--TTAAGGCACAT---A-ATGTAGATAT--AA-TA--TC---CCTA-AA-----TATTGC--------A-ACTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAGTTGGTCAAGt
gi|33260 : AACCAACA--AAGTGAATGGATG---------T-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTCAATC---------------------------TATAT---T-----TGTCTGTCAAACTTTAAAA-CTGGTT-ATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCCG-------A------CAAATAA-CCT-GACAGATGTGCCAATACaat
gi|33261 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAACA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGTA
gi|33262 : AAAAAACA--AAGTGAATGGATG------------------------------CTTTAATAT-TATTTAATTTAGC----------ATTTA-----------------------GT-----------TAAAA-TTGCTTTATAAAGT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------AAAGTAACC-----------TG--------------TTA-GGCACAC---C-ATGTATGTAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TATTAC--------A-ATTGCATGAATA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAt
gi|33263 : AAACAACA--AAGTGTATAGATG---------G-CTTGTAAT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCATT--T-GCCATTTGT-------tgtat
gi|33264 : AAACAACA--AAGTGAATGGATG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCACCAT
gi|33265 : AAACAACA--GAGTGAATGGATG---------G-CTTGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCGT
gi|33266 : AAACAACA--AAGTGAATGGACG---------G-CTAGTATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33267 : AAACAACA--AATTGAATGGATG---------A-CTCTTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTCAGCAT
gi|33268 : AAACAACA--AAGCGAATGGATG---------G-TTTGTATT-----G-----CCTCAATAT-TATTTAATTCAACAT
gi|33269 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-TAATTAATTCAGCAT
gi|33270 : AAACAACA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCATATT-----G-----CCTTAATAT-CAATTAATTCAGCAT
gi|33271 : AACAGCACTAGATAAACGGACC---------G-CTCG-GTT-----GTAACACCTTAATAT-TATTTTATTTAGCATT--T-A------GT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATC--AATTAACC--A----TT---ATTG-------A------AAAATAACCC--GATGTGTGTGCCAGCACCTAAC--TTATGGCACAC---C-------GTAT--A-----------CC---GA-----TACTAC--------A------------A-GAAT-------------AATATAAGTTGGACAAGCA
gi|33272 : AACAATA--AAGTGAATGACTG---------G-CTCTTATT-----G-----CCTTAATATGTA-TTAATTCAGCATt
gi|33273 : ACAACA--AAGTGAATAAATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCGTAATAT-TATTTAATCCAACATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---TAATTTTGTCATTCAAACTTTAACA-TTGCTTTATAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAGGAACAT---C-ATGTACGTAT--AA-T-------------AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGATTA-GAAT-------------AATATAATTTGGTCAAGCA
gi|33274 : AACA--AAGTGAATGGATG---------G-CCCGTATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTACTTCAGCATT----------TGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-ATGCTTTCTAAATT--CATTAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAATCCC-AATAAGTGTGCCAATACCTAAC--TTAAAGCACAT---A-ATGTACATAT--AA-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTCAATAATTGA-ATTGCATGGCTA-GAAT-------------AATATAAATTGGTCAAGCA
gi|33275 : AATA--AGGTCAATGGATG---------A-CTTGTATT-----G-----TCTAAATAT-TATTTAATTCAACATT--T-GTTATTTGT-------TACAT---G-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGAGATATAAATTCACATCAACC--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AGTAGCTGTGCCAATACCTAAC--TAAAGGCACAT---C-ATGTACAT-----A-TA--AC---CCTA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGACTA-GACT-------------ATTATAAATTGGTCAAGCA
gi|33276 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CACACATT-----G-----CCTTAATAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCCAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGGATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33277 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATTAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33278 : A--AAGTGAACGGATA---------G-CTCACATT-----G-----CCTTAACAT-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTAATAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATATATGTGCGAATACTTGA------AAGCACAC---C-ATGTACATAT--AA-TT--AC---CTTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCAATACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTGGTCAAGCAt
gi|33279 : AATGGATG---------T-CTCGTATT-----G-----CCCTAATAT-TATTTAATTAAGCATT--T-GTCATTTGT-------TATAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTAAAA-TTGATTTATAAAT---CATTAACC--A----TT---GCTA-------ATGCTAACAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACATAAC--TTAAGGCACAT---C-ATGTATGTAT--AA-TT--AC---CATA-AA-----TACTTC--------A-ATTGCATGAGTT-GACT-------------AATATAAGTTGGTCAATCAt
gi|33280 : ---------G-TTCGGATT-----G-----CCATAATAA-TATTTAATTGAGCATT--T-A------GT-------TACAT---A-----TGTCTTTCAAACCTTAAAA-TTGCTTTATAAATT--TATTAACC--A----TT---GCAG-------T------AAAAT-------GATAGGTGTGCGAATACTTGA------AGGCACAC---C-ATATACATAT--AA-TT--AC---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTGCATGACTA-GAATAATATATAAGAACAATATAAGTTTGTCAAGCA
gi|33281 : TCATATT-----G-----CCTTAAACT-TATTTAATTCAGCATT--T-GTCATTTGT-------TACAT---T-----TGTCTTTCAAACTTTTAAA-TTGCTTTATATATG--CATTAACA--A----TT---GCTG-------A------CAAATAACCCC-AATAGGTGTGCCAATACCTTACGGTCAAGCAATAC---TAATATACAAATTAAA-CATTAT---CTGA-AA-----TAATTC--------C-A--GCAAGAATATGA---------------AATACAAt
gi|33282 : TTAAAACTTTAAAA-TTGCTTTATAAATG--TATATACT--A----TT---GCTG-------A------CACATAACCT--GATATGTATGTCAATACCTAAG--GTA---CATACATAC-ATGTACGTAT--AA-TA--AA---CCTA-AA-----TACTAC--------A-ATTACATGACTA-G----------------AATATAAGTTGGTCAAGCA