lowQualScore : 1
lowQualScore : 0 3 4444 77
lowQualScore : . . .... ..
lowQualScore : 6 2 4444 44
consensus : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-NTTTAAGCTCCC
Reference ( gi|38328 ) : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38342 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38344 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----AC-GTTTAAGCTCCC
gi|38330 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----AC-GTTTAAGCTCCC
gi|38346 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38332 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38347 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----AC-TTTTAAGCGCCC
gi|38333 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----AC-TTTTAAGCGCCC
gi|38348 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38334 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38343 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38329 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38350 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AG-TTTTAAGCTTCC
gi|38336 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AG-TTTTAAGCTTCC
gi|38345 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38331 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38349 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38335 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38351 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AG-TTTCAAGCTCCC
gi|38337 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AG-TTTCAAGCTCCC
gi|38352 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCTC
gi|38338 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCTC
gi|38353 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AG--GTTAAACTCC
gi|38339 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AG--GTTAAACTCC
gi|38354 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----AA-TTTC-AGCTCCC
gi|38340 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----AA-TTTC-AGCTCCC
gi|38355 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38341 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38359 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AC-TTTTAAGCT
gi|38357 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AC-TTTTAAGCT
gi|38358 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAG-GCTTAAGCTCC
gi|38356 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAG-GCTTAAGCTCC
gi|38362 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AG-TTTCAAACTCCC
gi|38360 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AG-TTTCAAACTCCC
gi|38363 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG-C
gi|38361 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG-C
gi|38365 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38364 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38368 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38366 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38369 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTTAGCTCCC
gi|38367 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTTAGCTCCC
Alignments
lowQualScore : 0 4444 33
lowQualScore : . .... ..
lowQualScore : 4 2222 00
consensus : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
Reference ( family-524 ) : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-NTTTAAGCTCCC
gi|38328 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38329 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38330 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----AC-GTTTAAGCTCCC
gi|38331 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38332 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38333 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----AC-TTTTAAGCGCCC
gi|38334 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38335 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38336 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AG-TTTTAAGCTTCC
gi|38337 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AG-TTTCAAGCTCCC
gi|38338 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCTC
gi|38339 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AG-G-TTAAACTCC
gi|38340 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A--ATTTCAGCTCCC
gi|38341 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38342 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38343 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AG-TTTTAAGCTCCC
gi|38344 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----AC-GTTTAAGCTCCC
gi|38345 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38346 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38347 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----AC-TTTTAAGCGCCC
gi|38348 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38349 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38350 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AG-TTTTAAGCTTCC
gi|38351 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AG-TTTCAAGCTCCC
gi|38352 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCTC
gi|38353 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AG-G-TTAAACTCC
gi|38354 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A--ATTTCAGCTCCC
gi|38355 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38356 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAG-GCTTAAGCTCC
gi|38357 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AC-TTTTAAGCT
gi|38358 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAG-GCTTAAGCTCC
gi|38359 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AC-TTTTAAGCT
gi|38360 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AG-TTTCAAACTCCC
gi|38361 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG-C
gi|38362 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AG-TTTCAAACTCCC
gi|38363 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG-C
gi|38364 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38365 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38366 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38367 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTTAGCTCCC
gi|38368 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTAAGCTCCC
gi|38369 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AG-GTTTTAGCTCCC
Alignments
lowQualScore : 0 4444 33
lowQualScore : . .... ..
lowQualScore : 4 2222 00
consensus : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
Reference ( family-524 ) : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38328 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38329 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38330 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38331 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38332 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38333 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38334 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38335 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38336 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38337 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38338 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38339 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38340 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38341 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38342 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38343 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38344 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38345 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38346 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38347 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38348 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38349 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38350 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38351 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38352 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38353 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38354 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38355 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38356 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38357 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38358 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38359 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38360 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCC
gi|38361 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38362 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCCct
gi|38363 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38364 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCCct
gi|38365 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38366 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38367 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC
gi|38368 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38369 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC
Alignments
lowQualScore : 0 4444 33
lowQualScore : . .... ..
lowQualScore : 4 2222 00
consensus : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
Reference ( family-524 ) : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38328 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38329 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38330 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38331 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38332 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38333 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38334 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38335 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38336 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38337 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38338 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38339 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38340 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38341 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38342 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38343 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38344 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38345 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38346 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38347 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38348 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38349 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38350 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38351 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38352 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38353 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38354 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38355 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38356 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38357 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38358 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38359 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38360 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCC
gi|38361 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38362 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCCct
gi|38363 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38364 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCCct
gi|38365 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38366 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38367 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC
gi|38368 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38369 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC
blockSeqs : ACTG AT
blockSeqs : ACTG AT
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . A
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . A
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . T
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : . G
blockSeqs : .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
finalCons : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
Alignments
lowQualScore : 0 4444 33
lowQualScore : . .... ..
lowQualScore : 4 2222 00
consensus : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
Reference ( family-524 ) : GTGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38328 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38329 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38330 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38331 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38332 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38333 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38334 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38335 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38336 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38337 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38338 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38339 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38340 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38341 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38342 : GTGGTGTCTAATGCTACTTACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38343 : GTGGTGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGATGGACTCCCGTGAAAC----AGT-TTTAAGCTCCC
gi|38344 : GTGGTGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGGTGTACTTCCGTGAAAC----ACG-TTTAAGCTCCC
gi|38345 : GTGGCGTCTTATACTTCTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38346 : GTGGCGTCTAATGCTGCTGACGGGATATTGGGTGTACTCCCGCGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38347 : GTGGTGTTTAAAGCTACTGACGGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAGC----ACT-TTTAAGCGCCC
gi|38348 : GTGGTGTCTGATGCTACTGCCGGGAAATTGGGTGTATTCTCGTGAAAC----AGATTTTAAGCTCC
gi|38349 : GTGGCGTCTTATGTTACTGACGGGAAATTTGGTGGACTCCCATGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38350 : GTAGTGTCTTATGCTACTGACGGGACATTGGGTGTACGCCCATGAAAC----AGT-TTTAAGCTTCC
gi|38351 : GTGGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGATTCTAGTGAAAC----AGT-TTCAAGCTCCC
gi|38352 : GTGGCGTCTAATGGTACTGACGGGAAACTGCGTGTACTGCTGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCTC
gi|38353 : GTGGTGTCTAATGCTACTGACGTGAAATTAGGTATTCTCCCGTGAAAC----AGG--TTAAACTCC
gi|38354 : GTGGCGTCTTGTGTTAATGGCGGGAAATTGGGTGTACTCACGTGAAAC----A-A-TTTCAGCTCCC
gi|38355 : GTGGCGTCTAATGATACTGACGGGAAATTAGGTGTACTCCCGTGAA
gi|38356 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38357 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38358 : TGGCGTCTAATGCTACTGACGGGAAATTGGATGTACTCCCGTGAAACACTGAGG-CTTAAGCTCC
gi|38359 : TGGTGTCTAATTCTACTGACTGGAAATTGGGTGTACTCCCGTGAAAC----ACT-TTTAAGCT
gi|38360 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCC
gi|38361 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38362 : GGCGTCTAATGCTTCTGACGGGAAATTGGATGGACTTCAGTGAAAC----AGT-TTCAAACTCCCct
gi|38363 : GGCGTCTAATGCTACTGACGGGAGATTGACTGTGCTCCCGTGAAAC----AG
gi|38364 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCCct
gi|38365 : GTGTCTAAAGCTACTTACGGGGAATTGGATGTACTGCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38366 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38367 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC
gi|38368 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGGAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTAAGCTCCC
gi|38369 : GTCTTATGTAACTGACGAGAAATTGGAAATACTCCCGTGAAAC----AGG-TTTTAGCTCCC