lowQualScore                  :                                                                     11         1              111111    111             4444444444                  
lowQualScore                  :             1 11 11  2  111  1   22222  11 3 1 33333333 99          22     111 3   2    1 1   444444    111 55555       7777777777      2           
lowQualScore                  :             . .. ..  .  ...  .   .....  .. . . ........ ..          ..     ... .   .    . .   ......    ... .....       ..........      .           
lowQualScore                  :             0 44 44  7  888  0   44444  33 6 0 55555555 77          33     777 0   1    1 0   111111    777 11111       4444444444      4           
consensus                     : ATTATTTCAAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGCCACCCG-AAATT---TCAGCCGTGTAT-ATT---GA-ATTGA--TA----TTAGCCT--C-TCCG-GTCTCTGTAACGATTTTGG
Reference ( gi|33178 )        : ATTATTTCAAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AGGGGTGCCACCCT-AAATT---TGAGCTGTGTGT-ATT---CA-ATTGT--TG----TTAGCCT--CATTCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33177                      : ATTATTTCAAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AGGGGTGCCACCCT-AAATT---TGAGCTGTGTGT-ATT---CA-ATTGT--TG----TTAGCCT--CATTCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33179                      : ATTATTGCAAAAAA--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AGGGATGCCACCCT-AAATT---TGAGCTGTGTGT-ATT---CA-ATTGT--TG----TTAGCCT--CCTCCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33180                      : ATTATTTCATAA-A--A--TTAAT---AA-AGA-----AA--TTC-T--------AGGGGTGCCACCCT-AAATT---TGAGCTGTGTGC-ATT---GA-ATTGT--TG----TTAGCCT--TCTCCG-GTCTCTGCAACGAATTTGG
gi|33181                      : ATTATTTAAAAA-A--G--TTATT---TA-AGA-----AA--TGC-T--------AGGGGTGCCACCGT-AAATT---TGAGCTTTGAGT-ATT---CC-ATTGT--CG----TTAGCCT--CCTCCG-AACTCTGCATTGATTTTGG
gi|33182                      : ATTGTTCCGAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AAGTGTG--ACCTT-AAATT---TCAACCGTGTGT-ATT----G-ATTGT--TG----TTAGCCT--CCTCCG-ATCTCTGAATTGATTTTGG
gi|33183                      : ATTATTTCGAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AAGTGTG--A-CCT-AAATT---TCAACCGTGTGT-ATT---GA---TGT--TA----TTAGCCT--CCTCCG-ATCTCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      : ATTGTTTCGAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-T--------AAGTGTG--ACCCT-AAATT---TCAACCGTGTGC-A-T---CG-ATTGT--TGAACATTAGCCT--CCTCCG-A--TCTGTTATGATTTTGG
gi|33185                      : ATTATT-CAAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGGT-CCCTAAAATT---TCAGTCGTCTAT-ATT---GT-ATCGA--TA----TTAACA---CATT---ATTTCT
gi|33186                      :    ATTTCAAAA-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGATGCCGCACA-AAAGT---TCAGCTGT
gi|33187                      :     TTTCAAAG-A--G--TTCTT---AA-TGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTACCACCCA-AAATT---TCAGTCTTGTAT-ATT---GA-ATTGA--TA----TTAGCCT---GTT-G-ATTTCTGTAA
gi|33188                      :     TTCCAAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TGC-G--------GAAGGTATTGCTC---GATT---TCAGTCGTGTGT-ATT---GA-ATTGC--TA----TTAGCCT----GTCT-GTCTCTGTAA
gi|33189                      :      TTCAAAG-A--A--TTATT---AA-AGA-----AA--AAC-T--------AAAGGTGCCACCTG-AAATT---CCAGCCATGTAT-ATT---GA-ATTGA--TA----TTAGCCT--GATT
gi|33190                      :      TTCAAAG-A--G--TTGTT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGCTACCCA-AAATT---TCAGCCCTGTAC-ATT---AT-ATTAA--TA----TTAACCT--
gi|33192                      :      TTCAAAG-A--GAATAATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------ATAGGTGCAATCCG-AAATT---TCAGCCGCGTAT-GTT---TA-ACTGG--TA----TTAGCCT--
gi|33191                      :      TTCGAAA-G--A--TT-TT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGTCATCCG-AAATT---TCAGCAATGTAT-GTT---GC-ACTGA--TA----TTAGCCT---A-TCA-GTCTCTGC
gi|33193                      :      TTCAAAG-A--G--ATATT---AA-AAA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGCCAACCA-AAGTT---TCAGCCATGAAT-ATT---AT-TTTGA--TA----TTAGCCTG-C---CA-GTCTCTGTAA
gi|33194                      :      TTCAAAG-A--T--TTATT---AA-AGA-----AA--TTA-T--------AAAGGTGCCACCCG-AAATT---TCAACCAAGTAT-ATT---GA-ATTAA--TA----TTAGC
gi|33195                      :      TTAAAAG-A--A--TTGTT---AA-AGA-----AA--TAC-C--------AAATGTGCCACCCG-TATTT---TCGGCCGTGTAT-GTT---TA-ATTGG--TA----TTCGC-------TTG-ATCTCTGTAA
gi|33196                      :      TTCAGAC-A--A--TTGTTCATAA-AGA-----AA--TGC-C--------GAAGGTACCACCAG-AAATT---TTAGCTGTGTGT-ATT---GA-ATTG
gi|33197                      :      TTCAAAA----G--TTTTT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGTCATCCG-AAATT---TCAGCCATGTAT-GTT---GC-ACTGA--TA----TTTACCT---A-TCA-GTCTCT
gi|33198                      :      TTCAAGG-A--G--ATATT---AA-AAA-----AA--TAC-T--------AAAGGAGCCACCTG-AAATT---T-AGCCGTATAT-ACT---GA-AATGA--TT----TAAGCCTG-C---CA-GTCTCTGTAA
gi|33199                      :      TTCAAAA-G--A--TT-TT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGTCATCCG-AAATT---TCAGCCATGTAT-GTTGCACA-A---A--TA----TAAGCCT---A-CCA-GTCTCTGC
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gi|33201                      :      TTCAAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------CTAGGTGCCACTCA-AAATT---TCAGTCGAGTAA-GTT---GA-ATGATAATG----CTAATCT--C
gi|33202                      :      TTCAAAG-A--G--TTTTT---AA-AGA-----AAGCGGC-T--------AAAGGTACCATCCA-AAATT---GAAGTCGTATAT-ATA---AT-ATTGA--TA----TTAACCTG-C---CA-GTCTCTGGAA
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gi|33204                      :      TTTAAAA-G--A--TT-TT---AA-AGA-----TA--TAC-T--------AAAAGTGTCATCCG-AAATT---TCAGCCATGTAT-GTT---GC-ACTGA--TA----TTAGCCT--
gi|33206                      :      TTCAAAG-A--A--TTATT---AA-AGA-----AA------------------AGTGCCGCCCA-AAATT---TTA-TTG-GTGTAATT---GA-ATTGA--CA----TTAACCTG-C---CA-GTCTCTGTAA
gi|33205                      :      TTCGAAG-A--G--TTA--------AGA-----AA--AAC-T--------AAAAGTGTCACCCG-AAATT---TCAGCCGTTTAT-TTT---AC-ATTGA--TA----TTAGCCT----GTCA-GTCTCGGTAA
gi|33207                      :      TTCAAAA----G--TTATT---TA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGTCATCCG-AAATT---TCAGC
gi|33208                      :      TTCGAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------A--------------AAA------GAGCTGTGTAC--TT---TATATTGC--TA----TTAGCCTG-C---CA-GTCTCTGTAAC
gi|33209                      :      TTCAACG-A--G--TTATT---AA-----------------------------GGTGCCACTCG-AAAAT---TCAGTCGTGTAT-GTT---GA-ATTGA--TA----TTAGCCTG-C---CA-ATTTCTGTAA
gi|33210                      :       TCAAAA-G--A--TT-TT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGTCATCCG-AAATT---TCAGCCATGTAT-GTT---GC-ACTAA--TA----TTAGCCT---A-TCA-GTCTCTGC
gi|33211                      :       TCAAAG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAAGTGCCACCAG-AAGTGCCATCAGATATGTAT-GTT---GA-ATTGA--TA----TTAGTTT----GTCA-GTCTCTGTAA
gi|33212                      :       TTAAAG-A--G--CTTTT---AA-AGA-----AA--TAC-G--------AGAGGTGCCACCTG-AAATT---TCAGCCATGCAT-GTT---GA-ATTG
gi|33213                      :       TCAAAA-------TTA-----AA-AGATTCAAAA--TAC-T--------AAAGGTGCCACCCG-AAATT---TCAATTGTGTAT-A-T---CT-ACTGA--TA----TTAGCAT---GCCCG--TCTCTGTAA
gi|33214                      :        CAAAG-A--C--TCATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGCCACCCG-AAATT---TCAGTCGTGTAC-ATA---AT-ATTGG--TA----TTAGCCTG-CA---A-GTCTCTG
gi|33215                      :         AAAA-G--G--TTTTT---AA-A-A-----AA--TAC-T--------AAACGTGCCACCTG-AAATT---T-AGCCGTTAGT-ATT---GA-ATTGA--TA----TCAGCCT---A--CGCATCTCTGTAA
gi|33216                      :           AG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TACCT--------AAAGGTGTCACCAG-AAATT---TCAGCCGTATGT-GTT---GA-ATTGA--TA----TTAGCCTGCCAT-----TCTCTGTAA
gi|33217                      :           AG-A--G--TTATT---AA-AGA-----AA--TAC-T--------TAAGGTGCAACCTA-AAATT---TCAACCGTGTAT-GTT---GA-A
gi|33218                      :                             A-ATA-----AA--TAC-T--------AAAGGTGCCACCAG-AAATT---TCAGCCGTGTAT-GTT---GA-ATTGA--TA----TAAGCCT----TCCA-GTCACTGTAA





Alignments
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lowQualScore                  :                    1     22 11  2  111  1      11  1 33333333                   111           1   1  222  11  1         1 99999 33                   
lowQualScore                  :                    .     .. ..  .  ...  .      ..  . ........                   ...           .   .  ...  ..  .         . ..... ..                   
lowQualScore                  :                    1     44 44  7  888  0      33  0 55555555                   777           0   0  999  44  0         1 66666 22                   
consensus                     :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T---TCCG-GTCTCTGTAACGATTTTGG
Reference ( family-522 )      :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T-C-TCCG-GTCTCTGTAACGATTTTGG
gi|33177                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--AT--TG-TTGTTAGCC-T-CATTCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33178                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--AT--TG-TTGTTAGCC-T-CATTCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33179                      :            ATTATTGC-AAAAAA-G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGATGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--AT--TG-TTGTTAGCC-TCC-TCCG-ATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33180                      :            ATTATTTC-ATAAA--A--TTAAT---AA-AGAAAT--TC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-CAT-TGA--AT--TG-TTGTTAGCCTT-C-TCCG-GTCTCTGCAACGAATTTGG
gi|33181                      :            ATTATTTA-AAAAA--G--TTATT---TA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCGTAAATT---TGAGCTTTGAG-TAT-TCC--AT--TG-TCGTTAGCC-TCC-TCCG-AACTCTGCATTGATTTTGG
gi|33182                      :            ATTGTTCC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCTTAAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TG---AT--TG-TTGTTAGCC-TCC-TCCG-ATCTCTGAATTGATTTTGG
gi|33183                      :            ATTATTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCT-AAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TGA------TG-TTATTAGCC-TCC-TCCG-ATCTCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      :            ATTGTTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCCTAAATT---TCAACCGTGTG-CAT-CGATTGT--TGAACATTAGCC-TCC-TCCG-A--TCTGTTATGATTTTGG
gi|33185                      :            ATTATT-C-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGGTCCCTAAAATT---TCAGTCGTCTA-TAT-TGT--AT--CG-ATATTAAC
gi|33186                      :               ATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGATGCCGCACAAAAGT---TCAGCTGTacattatttct
gi|33187                      :                TTTC-AAAGA--G--TTCTT---AA-TGAAAT--AC-T--------AAAGGTACCACCCAAAATT---TCAGTCTTGTA-TAT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T-G-T-TG-ATTTCTGTAA
gi|33188                      :                TTCC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-G--------GAAGGTATTGCTCGA--TT---TCAGTCGTGTG-TAT-TGA--AT--TG-CTATTAGCC-T-G-TCT--GTCTCTGTAA
gi|33189                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAAA--AC-T--------AAAGGTGCCACCTGAAATT---CCAGCCATGTA-TAT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T-
gi|33190                      :                 TTC-AAAGA--G--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCTACCCAAAATT---TCAGCCCTGTA-CAT-TAT--AT--TA-ATATTAACC-T-gatt
gi|33191                      :                 TTCGAAAGA-----TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCAATGTA-TGT-TGC--AC--TG-ATATTAGCC-T-A-T-CA-GTCTCTG
gi|33192                      :                 TTC-AAAGA--GAATAATT---AA-AGAAAT--AC-T--------ATAGGTGCAATCCGAAATT---TCAGCCGCGTA-TGT-TTA--AC--TG-GTATTAGCC-T-c
gi|33193                      :                 TTC-AAAGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCAACCAAAGTT---TCAGCCATGAA-TAT-TAT--TT--TG-ATATTAGCC-T---GCCA-GTCTCTGTAA
gi|33194                      :                 TTC-AAAGA--T--TTATT---AA-AGAAAT--TA-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCAAGTA-TAT-TGA--AT--TA-ATATTAGC
gi|33195                      :                 TTA-AAAGA--A--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-C--------AAATGTGCCACCCGTATTT---TCGGCCGTGTA-TGT-TTA--AT--TG-GTATTCGCT-T------G-ATCTCTGTAA
gi|33196                      :                 TTC-AGACA--A--TTGTTCATAA-AGAAAT--GC-C--------GAAGGTACCACCAGAAATT---TTAGCTGTGTG-TAT-TGA--AT--TG-
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gi|33199                      :                 TTC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--AC--AA-ATATAAGCC-T-A--CCA-GTCTCTG
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gi|33201                      :                 TTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------CTAGGTGCCACTCAAAATT---TCAGTCGAGTA-AGT-TGA--ATGATA-ATGCTAATC-T-C-
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gi|33203                      :                 TTC-AAGGA--G--TT-CT---AATAGAAAT--CC-TTATTTTTTAAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCGTGTA-AAT-TAT--AT--TG-CTATTAGCC-T---GCTA-GTCTCTGTAA
gi|33204                      :                TTTA-AAAGA-----TT-TT---AA-AGATAT--AC-T--------AAAAGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--AC--TG-ATATTAGCC-T-
gi|33205                      :                 TTC-GAAGA--G--TTA--------AGAAAA--AC-T--------AAAAGTGTCACCCGAAATT---TCAGCCGTTTA-TTT-TAC--AT--TG-ATATTAGCC-T-G-T-CA-GTCTCGGTAA
gi|33206                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AG------------------AAAAGTGCCGCCCAAAATT---TTATTGGTGTA--AT-TGA--AT--TG-ACATTAACC-T---GCCA-GTCTCTGTAA
gi|33207                      :                 TTC-AAA-A--G--TTATT---TA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGC
gi|33208                      :                 TTC-GAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAG-------------------AGCTGTGTA-CTT-TAT--AT--TG-CTATTAGCC-T---GCCA-GTCTCTGTAAC
gi|33209                      :                 TTC-AACGA--G--TTATT---AA------------------------GGTGCCACTCGAAAAT---TCAGTCGTGTA-TGT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T---GCCA-ATTTCTGTAA
gi|33210                      :                  TC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--AC--TA-ATATTAGCC-T-A-T-CA-GTCTCTG
gi|33211                      :                  TC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAGTGCCACCAGAAGTGCCATCAGATATGTA-TGT-TGA--AT--TG-ATATTAGTT-T-G-T-CA-GTCTCTGTAAc
gi|33212                      :                  TT-AAAGA--G--CTTTT---AA-AGAAAT--AC-G--------AGAGGTGCCACCTGAAATT---TCAGCCATGCA-TGT-TGA--AT--TG-
gi|33213                      :                                            AAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAATTGTGTA-TATCT----AC--TG-ATATTAGCA-T-G-CCC--GTCTCTGTAA
gi|33214                      : tcaaaattaaaagattcaC-AAAGA--C--TCATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGTCGTGTA-CAT-AAT--AT--TG-GTATTAGCC-T---GCAA-GTCTCTG
gi|33215                      :                    -AAAAG--G--TTTTT---AA-A-AAAT--AC-T--------AAACGTGCCACCTGAAATT---T-AGCCGT-TAGTAT-TGA--AT--TG-ATATCAGC----C-TACGCATCTCTGTAA
gi|33216                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--ACCT--------AAAGGTGTCACCAGAAATT---TCAGCCGTATG-TGT-TGA--AT--TG-ATATTAGCC-T---GCCA-TTCTCTGTAA
gi|33217                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------TAAGGTGCAACCTAAAATT---TCAACCGTGTA-TGT-TGA--A
gi|33218                      :                                        A-ATAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCAGAAATT---TCAGCCGTGTA-TGT-TGA--AT--TG-ATATAAGCC-T---TCCA-GTCACTGTAA





Alignments
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lowQualScore                  :                    .     .. ..  .  ...  .      ..  . ........                   ...           .   .  ...    .          ...  .                   
lowQualScore                  :                    1     44 44  7  888  0      33  0 55555555                   777           0   0  999    0          999  0                   
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Reference ( family-522 )      :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--TCCGGTCTCTGTAACGATTTTGG
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gi|33178                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCTCATTCGATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33179                      :            ATTATTGC-AAAAAA-G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGATGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCTCCTCCGATCTCTGCAACGATTTTGG
gi|33180                      :            ATTATTTC-ATAAA--A--TTAAT---AA-AGAAAT--TC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-CAT-TGA--ATTG-TTGTTAGCCTTCTCCGGTCTCTGCAACGAATTTGG
gi|33181                      :            ATTATTTA-AAAAA--G--TTATT---TA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCGTAAATT---TGAGCTTTGAG-TAT-TCC--ATTG-TCGTTAGCCTCCTCCGAACTCTGCATTGATTTTGG
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gi|33183                      :            ATTATTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCT-AAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TGA----TG-TTATTAGCCTCCTCCGATCTCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      :            ATTGTTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCCTAAATT---TCAACCGTGTG-CAT-CGATTGTTGAACATTAGCCTCCTCCGA--TCTGTTATGATTTTGG
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gi|33186                      :               ATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGATGCCGCACAAAAGT---TCAGCTGTacattatttct
gi|33187                      :                TTTC-AAAGA--G--TTCTT---AA-TGAAAT--AC-T--------AAAGGTACCACCCAAAATT---TCAGTCTTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GTTGATTTCTGTAA
gi|33188                      :                TTCC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-G--------GAAGGTATTGCTCGA--TT---TCAGTCGTGTG-TAT-TGA--ATTG-CTATTAGCCT--GTCTGTCTCTGTAA
gi|33189                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAAA--AC-T--------AAAGGTGCCACCTGAAATT---CCAGCCATGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--
gi|33190                      :                 TTC-AAAGA--G--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCTACCCAAAATT---TCAGCCCTGTA-CAT-TAT--ATTA-ATATTAACCT--gatt
gi|33191                      :                 TTCGAAAGA-----TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCAATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTAGCCT--ATCAGTCTCTG
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gi|33193                      :                 TTC-AAAGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCAACCAAAGTT---TCAGCCATGAA-TAT-TAT--TTTG-ATATTAGCCT--GCCAGTCTCTGTAA
gi|33194                      :                 TTC-AAAGA--T--TTATT---AA-AGAAAT--TA-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCAAGTA-TAT-TGA--ATTA-ATATTAGC
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gi|33197                      :                 TTC-AAA-A--G--TTTTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTTACCT--ATCAGTCTCT
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gi|33205                      :                 TTC-GAAGA--G--TTA--------AGAAAA--AC-T--------AAAAGTGTCACCCGAAATT---TCAGCCGTTTA-TTT-TAC--ATTG-ATATTAGCCT--GTCAGTCTCGGTAA
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gi|33207                      :                 TTC-AAA-A--G--TTATT---TA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGC
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gi|33211                      :                  TC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAGTGCCACCAGAAGTGCCATCAGATATGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGTTT--GTCAGTCTCTGTAAc
gi|33212                      :                  TT-AAAGA--G--CTTTT---AA-AGAAAT--AC-G--------AGAGGTGCCACCTGAAATT---TCAGCCATGCA-TGT-TGA--ATTG-
gi|33213                      :                                            AAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAATTGTGTA-TATCT----ACTG-ATATTAGCAT--GCCCGTCTCTGTAA
gi|33214                      : tcaaaattaaaagattcaC-AAAGA--C--TCATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGTCGTGTA-CAT-AAT--ATTG-GTATTAGCCT--GCAAGTCTCTG
gi|33215                      :                    -AAAAG--G--TTTTT---AA-A-AAAT--AC-T--------AAACGTGCCACCTGAAATT---T-AGCCGT-TAGTAT-TGA--ATTG-ATATCAGCCT--ACGCATCTCTGTAA
gi|33216                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--ACCT--------AAAGGTGTCACCAGAAATT---TCAGCCGTATG-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GCCATTCTCTGTAA
gi|33217                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------TAAGGTGCAACCTAAAATT---TCAACCGTGTA-TGT-TGA--A
gi|33218                      :                                        A-ATAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCAGAAATT---TCAGCCGTGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATAAGCCT--TCCAGTCACTGTAA





Alignments
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lowQualScore                  :                    1     44 44  7  888  0      33  0 55555555                   777           0   0  999    0          000 777 7   333                
consensus                     :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
Reference ( family-522 )      :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
gi|33177                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCT---CATTCGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33178                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCT---CATTCGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33179                      :            ATTATTGC-AAAAAA-G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGATGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33180                      :            ATTATTTC-ATAAA--A--TTAAT---AA-AGAAAT--TC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-CAT-TGA--ATTG-TTGTTAGCCTTCTC---CGGTC---TCTGCAACGAATTTGG
gi|33181                      :            ATTATTTA-AAAAA--G--TTATT---TA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCGTAAATT---TGAGCTTTGAG-TAT-TCC--ATTG-TCGTTAGCCTCCTC---CGAAC---TCTGCATTGATTTTGG
gi|33182                      :            ATTGTTCC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCTTAAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TG---ATTG-TTGTTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGAATTGATTTTGG
gi|33183                      :            ATTATTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCT-AAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TGA----TG-TTATTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      :            ATTGTTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCCTAAATT---TCAACCGTGTG-CAT-CGATTGTTGAACATTAGCCT---C---C--TCCGATCTGTTATGATTTTGG
gi|33185                      :            ATTATT-C-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGGTCCCTAAAATT---TCAGTCGTCTA-TAT-TGT--ATCG-ATATTAAC
gi|33186                      :               ATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGATGCCGCACAAAAGT---TCAGCTGTacattatttct
gi|33187                      :                TTTC-AAAGA--G--TTCTT---AA-TGAAAT--AC-T--------AAAGGTACCACCCAAAATT---TCAGTCTTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GT---TGATT---TCTGTAA
gi|33188                      :                TTCC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-G--------GAAGGTATTGCTCGA--TT---TCAGTCGTGTG-TAT-TGA--ATTG-CTATTAGCCT--GT---CTGTC---TCTGTAA
gi|33189                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAAA--AC-T--------AAAGGTGCCACCTGAAATT---CCAGCCATGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--G
gi|33190                      :                 TTC-AAAGA--G--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCTACCCAAAATT---TCAGCCCTGTA-CAT-TAT--ATTA-ATATTAACCT--att
gi|33191                      :                 TTCGAAAGA-----TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCAATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTAGCCT--AT---CAGTC---TCTG
gi|33192                      :                 TTC-AAAGA--GAATAATT---AA-AGAAAT--AC-T--------ATAGGTGCAATCCGAAATT---TCAGCCGCGTA-TGT-TTA--ACTG-GTATTAGCCT--c
gi|33193                      :                 TTC-AAAGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCAACCAAAGTT---TCAGCCATGAA-TAT-TAT--TTTG-ATATTAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33194                      :                 TTC-AAAGA--T--TTATT---AA-AGAAAT--TA-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCAAGTA-TAT-TGA--ATTA-ATATTAGC
gi|33195                      :                 TTA-AAAGA--A--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-C--------AAATGTGCCACCCGTATTT---TCGGCCGTGTA-TGT-TTA--ATTG-GTATTCGCTT--------GATC---TCTGTAA
gi|33196                      :                 TTC-AGACA--A--TTGTTCATAA-AGAAAT--GC-C--------GAAGGTACCACCAGAAATT---TTAGCTGTGTG-TAT-TGA--ATTG-
gi|33197                      :                 TTC-AAA-A--G--TTTTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTTACCT--AT---CAGTC---TCT
gi|33198                      :                 TTC-AAGGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGAGCCACCTGAAATT---T-AGCCGTATA-TAC-TGA--AATG-ATTTAAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33199                      :                 TTC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACAA-ATATAAGCCT--AC---CAGTC---TCTG
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gi|33201                      :                 TTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------CTAGGTGCCACTCAAAATT---TCAGTCGAGTA-AGT-TGA--A-TG-ATA
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gi|33205                      :                 TTC-GAAGA--G--TTA--------AGAAAA--AC-T--------AAAAGTGTCACCCGAAATT---TCAGCCGTTTA-TTT-TAC--ATTG-ATATTAGCCT--GT---CAGTC---TCGGTAA
gi|33206                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAA------------------AGTGCCGCCCAAAATT---TTATTGGTGTA--AT-TGA--ATTG-ACATTAACCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33207                      :                 TTC-AAA-A--G--TTATT---TA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGC
gi|33208                      :                 TTC-GAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAG-------------------AGCTGTGTA-CTT-TAT--ATTG-CTATTAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAAC
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gi|33210                      :                  TC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTA-ATATTAGCCT--AT---CAGTC---TCTG
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gi|33212                      :                  TT-AAAGA--G--CTTTT---AA-AGAAAT--AC-G--------AGAGGTGCCACCTGAAATT---TCAGCCATGCA-TGT-TGA--ATTG-
gi|33213                      :                                            AAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAATTGTGTA-TATCT----ACTG-ATATTAGCAT--GC---CCGTC---TCTGTAA
gi|33214                      : tcaaaattaaaagattcaC-AAAGA--C--TCATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGTCGTGTA-CAT-AAT--ATTG-GTATTAGCCT--GC---AAGTC---TCTG
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gi|33216                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--ACCT--------AAAGGTGTCACCAGAAATT---TCAGCCGTATG-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CATTC---TCTGTAA
gi|33217                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------TAAGGTGCAACCTAAAATT---TCAACCGTGTA-TGT-TGA--A
gi|33218                      :                                        A-ATAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCAGAAATT---TCAGCCGTGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATAAGCCT--TC---CAGTC---ACTGTAA





Alignments
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lowQualScore                  :                    .     .. ..  .  ...  .      ..  . ........                   ...           .   .  ...    .          ... ... .   ...                
lowQualScore                  :                    1     44 44  7  888  0      33  0 55555555                   777           0   0  999    0          000 777 7   333                
consensus                     :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
Reference ( family-522 )      :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
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gi|33179                      :            ATTATTGC-AAAAAA-G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGATGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGCAACGATTTTGG
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gi|33181                      :            ATTATTTA-AAAAA--G--TTATT---TA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCGTAAATT---TGAGCTTTGAG-TAT-TCC--ATTG-TCGTTAGCCTCCTC---CGAAC---TCTGCATTGATTTTGG
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gi|33183                      :            ATTATTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCT-AAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TGA----TG-TTATTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      :            ATTGTTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCCTAAATT---TCAACCGTGTG-CAT-CGATTGTTGAACATTAGCCT---C---C--TCCGATCTGTTATGATTTTGG
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gi|33188                      :                TTCC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-G--------GAAGGTATTGCTCGA--TT---TCAGTCGTGTG-TAT-TGA--ATTG-CTATTAGCCT--GT---CTGTC---TCTGTAA
gi|33189                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAAA--AC-T--------AAAGGTGCCACCTGAAATT---CCAGCCATGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--G
gi|33190                      :                 TTC-AAAGA--G--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCTACCCAAAATT---TCAGCCCTGTA-CAT-TAT--ATTA-ATATTAACCT--att
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gi|33193                      :                 TTC-AAAGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCAACCAAAGTT---TCAGCCATGAA-TAT-TAT--TTTG-ATATTAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33194                      :                 TTC-AAAGA--T--TTATT---AA-AGAAAT--TA-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCAAGTA-TAT-TGA--ATTA-ATATTAGC
gi|33195                      :                 TTA-AAAGA--A--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-C--------AAATGTGCCACCCGTATTT---TCGGCCGTGTA-TGT-TTA--ATTG-GTATTCGCTT--------GATC---TCTGTAA
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gi|33197                      :                 TTC-AAA-A--G--TTTTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTTACCT--AT---CAGTC---TCT
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gi|33205                      :                 TTC-GAAGA--G--TTA--------AGAAAA--AC-T--------AAAAGTGTCACCCGAAATT---TCAGCCGTTTA-TTT-TAC--ATTG-ATATTAGCCT--GT---CAGTC---TCGGTAA
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gi|33211                      :                  TC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAGTGCCACCAGAAGTGCCATCAGATATGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGTTT--GT---CAGTC---TCTGTAAc
gi|33212                      :                  TT-AAAGA--G--CTTTT---AA-AGAAAT--AC-G--------AGAGGTGCCACCTGAAATT---TCAGCCATGCA-TGT-TGA--ATTG-
gi|33213                      :                                            AAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAATTGTGTA-TATCT----ACTG-ATATTAGCAT--GC---CCGTC---TCTGTAA
gi|33214                      : tcaaaattaaaagattcaC-AAAGA--C--TCATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGTCGTGTA-CAT-AAT--ATTG-GTATTAGCCT--GC---AAGTC---TCTG
gi|33215                      :                    -AAAAG--G--TTTTT---AA-A-AAAT--AC-T--------AAACGTGCCACCTGAAATT---T-AGCCGT-TAGTAT-TGA--ATTG-ATATCAGCCT--AC---GCATC---TCTGTAA
gi|33216                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--ACCT--------AAAGGTGTCACCAGAAATT---TCAGCCGTATG-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CATTC---TCTGTAA
gi|33217                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------TAAGGTGCAACCTAAAATT---TCAACCGTGTA-TGT-TGA--A
gi|33218                      :                                        A-ATAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCAGAAATT---TCAGCCGTGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATAAGCCT--TC---CAGTC---ACTGTAA


blockSeqs                     :                    G     TG AA  A  CAT         CG    TATTTTTT                   CCA           G   C  ATT    A          CCT ATT G   CGA
blockSeqs                     :                    .     A  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          TCT .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          CCT .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          CCT .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  C      .          CCT .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  T      .          G   .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   T   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          A   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   C  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  T      .          A   .   G   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  C      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   G  .           .     .                          .             .   .  A      .          A   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  T      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   G   .  
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blockSeqs                     :                    .     .  .   G  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   G  .           .     .                          .             .   .  C      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   T  .           .     .                          .             .   .  A      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  C      .          G   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .          A   .   A   .  
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blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  T      .          .   .   A   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   T  .           .     .                          .             .   .  A      .          .   .   .   .  
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  C      .          .              
blockSeqs                     :                    .     .  .   T  .           .     .                          .             .   .  A      .                         
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  A      .                         
blockSeqs                     :                    .     .  .   A  .           .     .                          .             .   .  T      .                         
blockSeqs                     :                    .     .  .   .  .           .     .                          .             .   .  A      .                         
blockSeqs                     :                    .     .  .   .  .           .     .                          .             .   .  A      .                         
blockSeqs                     :                    .     .  .   .  .           .     .                          .             .   .  A      .                         
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blockSeqCons                  :                                                                                                                        G** ***
originalCons                  :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
finalCons                     :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCTG--C---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG





Alignments
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lowQualScore                  :                    .     .. ..  .  ...  .      ..  . ........                   ...           .   .  ...    .          ... ... .   ...                
lowQualScore                  :                    1     44 44  7  888  0      33  0 55555555                   777           0   0  999    0          000 777 7   333                
consensus                     :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
Reference ( family-522 )      :            ATTATTTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGCCGTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CGGTC---TCTGTAACGATTTTGG
gi|33177                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCT---CATTCGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33178                      :            ATTATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCT---CATTCGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33179                      :            ATTATTGC-AAAAAA-G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AGGGATGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-TAT-TCA--ATTG-TTGTTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGCAACGATTTTGG
gi|33180                      :            ATTATTTC-ATAAA--A--TTAAT---AA-AGAAAT--TC-T--------AGGGGTGCCACCCTAAATT---TGAGCTGTGTG-CAT-TGA--ATTG-TTGTTAGCCTTCTC---CGGTC---TCTGCAACGAATTTGG
gi|33181                      :            ATTATTTA-AAAAA--G--TTATT---TA-AGAAAT--GC-T--------AGGGGTGCCACCGTAAATT---TGAGCTTTGAG-TAT-TCC--ATTG-TCGTTAGCCTCCTC---CGAAC---TCTGCATTGATTTTGG
gi|33182                      :            ATTGTTCC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCTTAAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TG---ATTG-TTGTTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGAATTGATTTTGG
gi|33183                      :            ATTATTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCT-AAATT---TCAACCGTGTG-TAT-TGA----TG-TTATTAGCCTCCTC---CGATC---TCTGTAATGATTTTAG
gi|33184                      :            ATTGTTTC-GAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-T--------AA--GTGTGACCCTAAATT---TCAACCGTGTG-CAT-CGATTGTTGAACATTAGCCT---C---C--TCCGATCTGTTATGATTTTGG
gi|33185                      :            ATTATT-C-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGGTCCCTAAAATT---TCAGTCGTCTA-TAT-TGT--ATCG-ATATTAAC
gi|33186                      :               ATTTC-AAAAA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGATGCCGCACAAAAGT---TCAGCTGTacattatttct
gi|33187                      :                TTTC-AAAGA--G--TTCTT---AA-TGAAAT--AC-T--------AAAGGTACCACCCAAAATT---TCAGTCTTGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GT---TGATT---TCTGTAA
gi|33188                      :                TTCC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--GC-G--------GAAGGTATTGCTCGA--TT---TCAGTCGTGTG-TAT-TGA--ATTG-CTATTAGCCT--GT---CTGTC---TCTGTAA
gi|33189                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAAA--AC-T--------AAAGGTGCCACCTGAAATT---CCAGCCATGTA-TAT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--G
gi|33190                      :                 TTC-AAAGA--G--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCTACCCAAAATT---TCAGCCCTGTA-CAT-TAT--ATTA-ATATTAACCT--att
gi|33191                      :                 TTCGAAAGA-----TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCAATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTAGCCT--AT---CAGTC---TCTG
gi|33192                      :                 TTC-AAAGA--GAATAATT---AA-AGAAAT--AC-T--------ATAGGTGCAATCCGAAATT---TCAGCCGCGTA-TGT-TTA--ACTG-GTATTAGCCT--c
gi|33193                      :                 TTC-AAAGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCAACCAAAGTT---TCAGCCATGAA-TAT-TAT--TTTG-ATATTAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33194                      :                 TTC-AAAGA--T--TTATT---AA-AGAAAT--TA-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCAAGTA-TAT-TGA--ATTA-ATATTAGC
gi|33195                      :                 TTA-AAAGA--A--TTGTT---AA-AGAAAT--AC-C--------AAATGTGCCACCCGTATTT---TCGGCCGTGTA-TGT-TTA--ATTG-GTATTCGCTT--------GATC---TCTGTAA
gi|33196                      :                 TTC-AGACA--A--TTGTTCATAA-AGAAAT--GC-C--------GAAGGTACCACCAGAAATT---TTAGCTGTGTG-TAT-TGA--ATTG-
gi|33197                      :                 TTC-AAA-A--G--TTTTT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTTACCT--AT---CAGTC---TCT
gi|33198                      :                 TTC-AAGGA--G--ATATT---AA-AAAAAT--AC-T--------AAAGGAGCCACCTGAAATT---T-AGCCGTATA-TAC-TGA--AATG-ATTTAAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33199                      :                 TTC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACAA-ATATAAGCCT--AC---CAGTC---TCTG
gi|33200                      :                 TTC-AGAAATGG--TT--C---AA-AGAATT--AT-A--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TTAGCTTCGTA-TAT-TGA--ATTG-ATGTCAACCT--GC---TGATT---TCTGc
gi|33201                      :                 TTC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------CTAGGTGCCACTCAAAATT---TCAGTCGAGTA-AGT-TGA--A-TG-ATA
gi|33202                      :                 TTC-AAAGA--G--TTTTT---AA-AGAAAGCGGC-T--------AAAGGTACCATCCAAAATT---GAAGTCGTATA-TAT-AAT--ATTG-ATATTAACCT--GC---CAGTC---TCTGGAAatgctaatctc
gi|33203                      :                 TTC-AAGGA--G--TT-CT---AATAGAAAT--CC-TTATTTTTTAAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAACCGTGTA-AAT-TAT--ATTG-CTATTAGCCT--GC---TAGTC---TCTGTAA
gi|33204                      :                TTTA-AAAGA-----TT-TT---AA-AGATAT--AC-T--------AAAAGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTG-ATATTAGCCT--
gi|33205                      :                 TTC-GAAGA--G--TTA--------AGAAAA--AC-T--------AAAAGTGTCACCCGAAATT---TCAGCCGTTTA-TTT-TAC--ATTG-ATATTAGCCT--GT---CAGTC---TCGGTAA
gi|33206                      :                 TTC-AAAGA--A--TTATT---AA-AGAAA------------------AGTGCCGCCCAAAATT---TTATTGGTGTA--AT-TGA--ATTG-ACATTAACCT--GC---CAGTC---TCTGTAA
gi|33207                      :                 TTC-AAA-A--G--TTATT---TA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGC
gi|33208                      :                 TTC-GAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAG-------------------AGCTGTGTA-CTT-TAT--ATTG-CTATTAGCCT--GC---CAGTC---TCTGTAAC
gi|33209                      :                 TTC-AACGA--G--TTATT---AA------------------------GGTGCCACTCGAAAAT---TCAGTCGTGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CAATT---TCTGTAA
gi|33210                      :                  TC-AAAAG--A--TT-TT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGTCATCCGAAATT---TCAGCCATGTA-TGT-TGC--ACTA-ATATTAGCCT--AT---CAGTC---TCTG
gi|33211                      :                  TC-AAAGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAAGTGCCACCAGAAGTGCCATCAGATATGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGTTT--GT---CAGTC---TCTGTAAc
gi|33212                      :                  TT-AAAGA--G--CTTTT---AA-AGAAAT--AC-G--------AGAGGTGCCACCTGAAATT---TCAGCCATGCA-TGT-TGA--ATTG-
gi|33213                      :                                            AAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAATTGTGTA-TATCT----ACTG-ATATTAGCAT--GC---CCGTC---TCTGTAA
gi|33214                      : tcaaaattaaaagattcaC-AAAGA--C--TCATT---AA-AGAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCCGAAATT---TCAGTCGTGTA-CAT-AAT--ATTG-GTATTAGCCT--GC---AAGTC---TCTG
gi|33215                      :                    -AAAAG--G--TTTTT---AA-A-AAAT--AC-T--------AAACGTGCCACCTGAAATT---T-AGCCGT-TAGTAT-TGA--ATTG-ATATCAGCCT--AC---GCATC---TCTGTAA
gi|33216                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--ACCT--------AAAGGTGTCACCAGAAATT---TCAGCCGTATG-TGT-TGA--ATTG-ATATTAGCCT--GC---CATTC---TCTGTAA
gi|33217                      :                       AGA--G--TTATT---AA-AGAAAT--AC-T--------TAAGGTGCAACCTAAAATT---TCAACCGTGTA-TGT-TGA--A
gi|33218                      :                                        A-ATAAAT--AC-T--------AAAGGTGCCACCAGAAATT---TCAGCCGTGTA-TGT-TGA--ATTG-ATATAAGCCT--TC---CAGTC---ACTGTAA