lowQualScore : 1 11 444444444444 1
lowQualScore : 4 5 333 222 3 1 1 444444 11 33333 1 111111111111 1 6666666666666 222 22222 2222 6666666666 99999999999999 333333 1 8888888888 3 3 1 1 22222 1 111 1 6 1 1 2 2222 2 1 1 3 1 11
lowQualScore : . . ... ... . . . ...... .. ..... . ............ . ............. ... ..... .... .......... .............. ...... . .......... . . . . ..... . ... . . . . . .... . . . . . ..
lowQualScore : 1 7 000 999 6 6 5 333333 11 66666 4 999999999999 4 4444444444444 000 88888 4444 2222222222 11111111111111 000000 1 7777777777 2 1 0 0 77777 1 999 1 0 1 1 4 4444 2 1 1 3 1 66
consensus : ATATCGTA---TATAA---TTATGT-TAT-A------TGA-TGTTTATTAG-----A-TN-----T-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
Reference ( gi|133386 ) : ATATTGCA---TATAA---TTAGGT-TAT-A------TGA-CGTTTATTAG-----A-TG-----T-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCAG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133387 : ATATCGTA---TATAA---TTATGT-TGT-A------TGA-TGTATGTTAG-----A-TT-----T-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C---CAG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133391 : ATGCTGTA---TATAA---GTATGT-TAT-A------TGA-TGTATATTAG-----A-TG-----G-----TGT-CACCATATGTGTC-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------TC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCAG-GAAA-TGAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTG
gi|133389 : ATATTGTA---TATAA---TTAG-T-TAT-A------TGA-TGTTTATTAG-----A-TT-----G-----TGT-CGCCATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----AA-C---C-TTC-----------T----G-GA-A----A-AA--CTTGTCA
gi|133390 : ATATTGTA---TATAA---TTTTGT-TAT-A------TGA-TGTTTAT------------------------GT-TGCCATATGTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTG-AAAA-AAAT----G-GA-A-AA-G-AA--CTTGTCAaactagtcaaaacttgtca
gi|133393 : ATATCGTA---TACAA---TTATGT-TAT-A------TGT-TGTTTATTAT-----A-CT-----T-----TGT-CGTCATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------GC-AAT-TTC-TC-ACTGGTCTCT-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTTTCA
gi|133392 : ATATCGTA---CATAA---TTATGT-TAT-A------TGA-GGTTTAATAA-----A-TT-----G-----TGT-CGCTTTATTTGTA-A-----------TCGTAAT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TTT-TCC-TC-ATTGATCTCA-----GA-C---C-TTCTG-GAGA-GAAT----G-AA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133394 : ATACCGTA---TATAC---TTATGT-TAT-A-------GA-GGTTTATTTG-----A-TT-----G-----TGT-CGCCGTATTTGTA-A-----------TT---CT-----A----T----------AC--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTG-AAAA-TAAT----G-G---------AA--CTTGTCA
gi|133397 : ATTTCGTA---TATAA---TTATGT-TAT-A------TGA-AGTTAATTAG-----A-TACGAT-T-----TGGACGCCATATTTGTG-A-----------TG---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAC-TCA-TCTAT-GGTCTCA-----GG-C---C-TTTTG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--TCTGTCA
gi|133396 : ATATCGTT---TACAA---ATGTGC-CAT-A------TGA-TATTTATTAG-----A-TA-----CGATTGTGT-CGCCATATTTGCA-A-----------CC---AT-----A----T----------GT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCA-TC-ACTGGTCTCA-----TA-C---C-TTCTA-GAAA-TAAT----G-AA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133395 : ATAGCGTA---TATAA---TTATGT-TAC-A------TGG-TATTTATTAG-----A-TT-----G-----TGT-CGCCATATTTGTA-AGCATTATATTATC---AT-----A----TAT--------AT--------------AT------G-TG----------AC-TTT-TAT-TT-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTT-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTT
gi|133398 : ATATCGTAGATTATAAAATTTA--T-TAT-A------TGT-TGTT-ATTAG-----A-TA-----TGATTTTGT-CGCCATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----TATATATATATAT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-TAAT----G-GA-T-AT-A-AA--
gi|133399 : ATGTTGTA---TATAA---TTATGT-TAT-A------TGA-AGTTTATTAGGTACGA-TA-----T-----TGG-CGC-ATATTTGTT-A-----------TC---GT-----A----T----------AA--------------AT------G-TG----------AT-TTT-TCC-TC-ATTTGTCTCA-----GA-C---C-ATCTG-GATG-TAAT----G-GA-ATAT-A-A
gi|133388 : ATATCTCA---TAAAA---TTATGT-CAT-A------TGA-TGTTTATTAG-----A-TT-----T-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AC-----ATCAGT----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-A
gi|133400 : ATACCGTA---TATAT---TTATGT-TAT-A------TGA-TATTAATCAG-----G-TT-----T-----TGC-CGCCACATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------A------------------TCT----------T---C-TT----GAAA-TAAT----G-GA-A-AC-C-AA--TTTGTCA
gi|133402 : ATGTCGTA---TATAT---TTAA---TAT-G------TGAATTTTTATTAG-----A-TA-----TCCTTGTAT-CTTCATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------TT------G-T---------------AT--------ATGGGTCTCA-----GA-T---C-TTCTG-GAAA-TGG-----G-GG-A-GT-C-AA--CCTGTCA
gi|133404 : ATATCGTA---TATAA---TT--GT-TAT-ACATGTGTGA-TATTTATTAG-----A-TACGATTT-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AA-----A----T----------TT--------------AT------GATT----------A--TAT-TCA-TT-ATGGGTTT
gi|133403 : ATATCGTA---TATAA---TAATGG-TAT-A------TGA-GGTTTATTAC-----A-TA---------------CG--AT-TTTGCA-T-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ACTCGTACG-TG----------AC-TAT-TTG-CT-ATTGGGGTCA-----AATC---C-TTTA--GAAA-TAAT----G-AA-A-AT-A-AA--CT
gi|133401 : ATATCGTA---TAAAA---TAATGT-T-T-A------TGA-AAGGTATTAG-----A-TAGGAGTT-----TGT-CTCATTTTTTGCA-T-----------TC---ATTATACA----T----------GT--------------AT------G-TG----------AA-TAT-TCG-TT-ATGCGTGTAAGACCTGA-C---C-TTCTG-GAAA-TAATAAAAA-AA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133408 : ATAT---A---TATAC---TTATGT-TAC-A------TGA-CGTTAAT--------A-CG-----T-----CG---AGCATACTAATATA-----------T----AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TGTGTGTGTGTGGC-TAT-TCC-TA-ATAAATCTCA-----GA-G---C-TTATG-GAAG-TA---------A-A-GT-A-AA--CTT
gi|133405 : tatATATCGTA---TATAT---CTATTTATAT-A------TAA---TTTATTAA-----A-TA-----TGATTGTGT-CGCCATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----C----------ATATACATACATATAAAT------G-TG----------AA-TAT-TCC-TC-AT
gi|133406 : ATATCGTA---TATAA---TTATGT-TATTA------TGA-TTTTTATTAG-----A-TT-----T-----TGT-CAACATAATTATA-G-----------T
gi|133407 : TATTATC---TATGA---TTATGT-TAT-A------TGA-TTTTTATAAA-----ACTG-----T------GT-CGCTATATTTGTA-A-----------TA---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCT-TC-ATGAGTCTCA-----GG-T---CATTTA--GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133412 : A---TATAA---TTATGT-TAT-A------TGA-TGTTTATTAG-----A-TT-----G-----TGT-CGCCATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TT-GTGGGTCTCA-----AA-C---T-TTCTGAAAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133414 : tTAC---TTAG-T-TAT-T------AGA-ATTTTATTAG-----A-TACAATTT-----TGT-CGCCATCTTTGCA-T-----------TC---AT-----A----T----------TT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-ACA-TC-AGGAGTCTAA-----GA-C---C-TTTTG-AAAA-T------------A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133416 : GT-TAT-A------TGA-AGTTCATTGG-----A-TA-----CAATAGTGT-TACCGTTTTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AC--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TAC-TC-ATGGGTTTCA-----GA-C---C-TTCTG-GATA-TAAT----G-GT-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133417 : AC-A------TGA-TGTTTATTTG-----A-TT-----T-----TGT-CGCCATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----A----------AT--------------AT------T-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTTA
gi|133410 : ------TGA-AGTTTCTTCG-----A-TACGATTT-----TAT-CGCCATATTTTTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AA--------------AT------G-AG----------AC-TAT-TTA-TC-ATGGATTTAA-----GA-C---T-TTCTG-GAAA-AAAT----G-GATA-GT---AA--CTTGTCA
gi|133418 : ttgcaatatttgtattgtcttTTATTAG-----A-TT-----T-----TGT-CGTCATATTT-TA-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCG-----GA-C---A-TTGTG-GAAA-TAAT----G-GA-A-AT-A-AAATCTTGTCA
gi|133419 : -----T-----TGT-CGCCATAATTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------AT------A-TACATC------AC-TAT-TCC-TC-ACGTGTGTAA-----GA-A---C-TTC---TAAATTAAT----G-GA-A-AA-A-TA--TTTGCCA
gi|133420 : ttATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------ATTATTA---------AT------G-TG----------AC-TAT-TAC-TC-GTGGGCCTCA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-TAAT----T-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133415 : ATGCTTGCC-G-----------TA---AT-----G----T----------AT--------------AT------G-TA----------ACATATGTCC-TC-ATAGGCCTAA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-T-AT----GAAA-A-AT-ACAA--CTTG
gi|133409 : aattatattacaccgaacatgttctgagttATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AG------G-TA----------AA-TGT-TC--TC-ATGGGTCTAA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-T-AT----C-AA-A-ATAA-AA--CTT
gi|133411 : atcgtaaataacttaacatgtatgctgtccgttattttgtagtgtgccgatttATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AT------T-TA----------AAATATGTCC-TC-ATGTGTCTAA-----GA-C---C-TTCTG-GAAA-T-AT----G-AA-A-AC-A-AA--
gi|133413 : tgtaagtacatttatgtatgtatgctatccattaatttataatgtactgatttTATTTGTA-T-----------TC---GT-----G----T----------AT-------------------------G----------AA-TGT-TCT-TC-ATGAGTCTCA-----GA-T---A-TTC-----------T----G-GA-A-AT-A-AA--CTTGTCA
gi|133421 : ataattgttctaggaatttatataaccagtactatattacacTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AT------G-TA----------ATATAT-TCCCTC-ATGGGTCTAA-----GA-C---A--TCTG-GAAA-T-AT----G-AA-A-ATAA-AA--CTTGT
gi|133422 : TA-G-----------TC---GT-----A----T----------AT--------------GT------A-TG----------GC-GAA-TTA-TC-ATGGGTCTCA-----GA-CCTAC-TTTTG-GAAA-TAAT----G-TA-A-AA-A-AA--
gi|133423 : T-----A----C----------AT--------------AT------G-TGTAA-------AC-TATGTCC-TC-ATGGGTCTAA-----GA-C---C-TTCTT-GAAA-T-AT----GAGA-A-ATAA-AA--CTTGT
gi|133424 : ----------AT--------------AT------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCCCT-----GG-C---A-TTCTG-GAAA-TAA
gi|133425 : T------G-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCA-----GA-C---C-TTCTG-AAAT-TAAT----G-GA-A-AT-T-AA--CTTGTCA
gi|133426 : -TCC-CA-ATGGGTCTAA-----GA-C---C-TTCTT-GAAA-T-AT----G-AA-A-AT-A-AA--
gi|133427 : -TT-ATGGGTCTCG-----GA-C---C-TTCTG-GAAT-GAAT----G-GA-A-TT-G-AA--CGTGTCA
Alignments
lowQualScore : 333333333333
lowQualScore : 222 22 3333 1 2 444444 222 1 33333333333 000000000000 5555 11 1 22222 5555555555555 111 22222 2222 6666666666 88888888888888 1 8888888888 3 3 1 1 111 22222 1 1 1 2222 2 11 1 1 666666 1 11
lowQualScore : ... .. .... . . ...... ... . ........... ............ .... .. . ..... ............. ... ..... .... .......... .............. . .......... . . . . ... ..... . . . .... . .. . . ...... . ..
lowQualScore : 777 00 1111 4 8 000000 444 4 44444444444 222222222222 6666 77 2 99999 9999999999999 999 77777 3333 1111111111 88888888888888 0 5555555555 1 0 0 0 888 66666 1 1 4 3333 2 55 1 1 444444 1 55
consensus : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----ATT-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
Reference ( family-520 ) : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----ATN-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133386 : ATATTGCA---TATAA--TT----AGGT-TAT-A------TG---ACG-TTTATTA-----G-----ATG-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133387 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TGT-A------TG---ATG-TATGTTA-----G-----ATT-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-------CAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133388 : ATATCTCA---TAAAA--TT----ATGT-CAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----ATT-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AC-----ATCAGT----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-A
gi|133389 : ATATTGTA---TATAA--TT----A-GT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----ATT-----G-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAAAC---C-----TTCTG-GAAA-AACT----T-GTCA-A-ACTAGTCAA-AA--CTTGTCA
gi|133390 : ATATTGTA---TATAA--TT----TTGT-TAT-A------TG---ATG-TTTAT----------------------------GT----TG--C-C-----ATATGTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-AAAT----G-G--A-A-AA------G-AA--CTTGTCA
gi|133391 : GTA---TATAA--GT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TATATTA-----G-----ATG-----G-----TGT----CA--C-C-----ATATGTGTC-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------TC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TGAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTG
gi|133392 : atgctATATCGTA---CATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AGG-TTTAATA-----A-----ATT-----G-----TGT----CG--C-T-----TTATTTGTA-A-----------TCGTAAT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TCC-TC-ATTGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAGA-GAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133393 : ATATCGTA---TACAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---TTG-TTTATTA-----T-----ACT-----T-----TGT----CG--T-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------GC-AAT-TTC-TC-ACTGGTCTCTGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTTTCA
gi|133394 : ATACCGTA---TATAC--TT----ATGT-TAT-A-------G---AGG-TTTATTT-----G-----ATT-----G-----TGT----CG--C-C-----GTATTTGTA-A-----------TT---CT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-TAAT----G-G----------------AA--CTTGTCA
gi|133395 : ATAGCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAC-A------TG---GTA-TTTATTA-----G-----ATT-----G-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-AGCATTATATTATC---AT-----A----TAT--------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TAT-TT-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTT
gi|133396 : ATATCGTT---TACAA--AT----GTGC-CAT-A------TG---ATA-TTTATTA-----G-----ATA-----CGATTGTGT----CG--C-C-----ATATTTGCA-A-----------CC---AT-----A----T----------GT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCA-TC-ACTGGTCTCATAC---C-----TTCTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133397 : ATTTCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTAATTA-----G-----ATACGAT-T-----TGGA---CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TG---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAC-TCA-TCTAT-GGTCTCAGGC---C-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--TCTGTCA
gi|133398 : ATATCGTAGATTATAAAATT-----TAT-TAT-A------TG---TTG-TT-ATTA-----G-----ATA-----TGATTTTGT----CG--C-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----TATATATATATAT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-T-AT------A-AA--
gi|133399 : ATGTTGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTTATTA-----GGTACGATA-----T-----TGG----CG--C-------ATATTTGTT-A-----------TC---GT-----A----T----------AA--------------ATG-TG----------AT-TTT-TCC-TC-ATTTGTCTCAGAC---C-----ATCTG-GATG-TAAT----G-G--A-ATAT------A-A
gi|133400 : ATACCGTA---TATAT--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATA-TTAATCA-----G-----GTT-----T-----TGC----CG--C-C-----ACATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-T-----------------------------------GAT---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AC------C-AA--TTTGTCA
gi|133401 : ATATCGTA---TAAAA--TA----ATGT-T-T-A------TG---AAA-GGTATTA-----G-----ATAGGAGTT-----TGT----CT--C-A-----TTTTTTGCA-T-----------TC---ATTATACA----T----------GT--------------ATG-TG----------AA-TAT-TCG-TT-ATGCGTGTAAGAC---CTGACCTTCTG-GAAA-TAATAAAAA-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133402 : ATGTCGTA---TATAT--TT----A-----AT-A------TGTGAATT-TTTATTA-----G-----ATA-----TCCTTGTAT----CT--T-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------TTG-T---------------AT--------ATGGGTCTCAGAT---C-----TTCTG-GAAA-TGG-----G-G--G-A-GT------C-AA--CCTGTCA
gi|133403 : ATATCGTA---TATAA--TA----ATGG-TAT-A------TG---AGG-TTTATTACATACG-----ATT-----T-----TGC----AT--C-C-----ATAT--ATA-C-----------TC---GT-----A----C----------------------------G-TG----------AC-TAT-TTG-CT-ATTGGGGTCAAAT---C-----CTTTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CT
gi|133404 : ATATCGTA---TATAA--TT------GT-TAT-ACATGTGTG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AA-----A----T----------TT--------------ATGATT----------A--TAT-TCA-TT-ATGGGTTT
gi|133405 : ATATCGTA---TATAT--CT----AT-T-TAT-A------T----ATAATTTATTA-----A-----ATA-----TGATTGTGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----C----------ATATACATACATATAAATG-TG----------AA-TAT-TCC-TC-AT
gi|133406 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TATTA------TG---ATT-TTTATTA-----G-----ATT-----T-----TGT----CA--A-C-----ATAATTATA-G-----------T
gi|133407 : TATTATC---TATGA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATT-TTTATAA-----A-----ACT-----G-----TGT----CG--C-T-----ATATTTGTA-A-----------TA---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGGT---C-----ATTTA-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133408 : ATAT-ATA---TATAC--TT----ATGT-TAC-A------TG---ACG-TT----------A-----ATA-----C------GT----CG--AGC-----ATACTAATATA-----------T----AT-----A----T----------AT--------------ATG-TGTGTGTGTGTGGC-TAT-TCC-TA-ATAAATCTCAGAG---C-----TTATG-GAAG-TA-----------A-A-GT------A-AA--CTT
gi|133409 : tATCGTA---AATAA--CTTAACATGT-----A------TG---CTG-TCCGTTA------------TT-----T-----TGTAGTGTG--C-CGATTTATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AGG-TA----------AA-TGT-TC--TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----C-A--A-A-ATA-----A-AA--CTT
gi|133410 : -----G-----ATT-----T-----TAT----CG--C-C-----ATATTTTTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AA--------------ATG-AG----------AC-TAT-TTA-TC-ATGGATTTAAGAC---T-----TTCTG-GAAA-AAAT----G-G--ATA-GT--------AA--CTTGTCA
gi|133411 : ttgcaatatttgtattgtctttgaagtttcttcgatacGTA---CAT----TT----ATGTATGT-A------TG---CTA-TCCATTA-----------ATT-----TATAA-TGTAC--TGATT-T-----ATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATT-TA----------AAATATGTCC-TC-ATGTGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AC------A-AA--
gi|133412 : tgtaaTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----ATT-----G-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TT-GTGGGTCTCAAAC---T-----TTCTGAAAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133413 : TATTTGTA-T-----------TC---GT-----G----T----------AT-------------------G----------AA-TGT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGAT---A-----TTCTG-GA------------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133414 : ataattgttctaggaatttatataaccagtactatattacacTAC--TT----A-GT-TATTA------GA---AT--TTTATTA-----G-----ATACAATTT-----TGT----CG--C-C-----ATCTTTGCA-T-----------TC---AT-----A----T----------TT--------------ATG-TG----------AC-TAT-ACA-TC-AGGAGTCTAAGAC---C-----TTTTG-AAAA-T--------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133415 : -----ATGCTTGCC-G-----------TA---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ACATATGTCC-TC-ATAGGCCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----GAA--A-A-AT------ACAA--CTTG
gi|133416 : aattatattacaccgaacatgttctgagttGT-TAT-A------TG---AAG-TTCATTG-----G-----ATA-----CAATAGTGT----TA--C-C-----GTTTTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-ATGGGTTTCAGAC---C-----TTCTG-GATA-TAAT----G-G--T-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133417 : AC-A------TG---ATG-TTTATTT-----G-----ATT-----T-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----A----------AT--------------ATT-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTTA
gi|133418 : TTATTA-----G-----ATT-----T-----TGT----CG--T-C-----ATATTT-TA-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCGGAC---A-----TTGTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AAATCTTGTCA
gi|133419 : TT-----T-----TGT----CG--C-C-----ATAATTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATA-TACATC------AC-TAT-TCC-TC-ACGTGTGTAAGAA---C-----TTCT---AAATTAAT----G-G--A-A-AA------A-TA--TTTGCCA
gi|133420 : -----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------ATTATTA---------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-GTGGGCCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----T-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133421 : TTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ATATAT-TCCCTC-ATGGGTCTAAGAC---A------TCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133422 : TA-G-----------TC---GT-----A----T----------AT--------------GTA-TG----------GC-GAA-TTA-TC-ATGGGTCTCAGACCTAC-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-T--A-A-AA------A-AA--
gi|133423 : T-----A----C----------AT--------------ATG-TGTAA-------AC-TATGTCC-TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----GAG--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133424 : ----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCCCTGGC---A-----TTCTG-GAAA-TAA
gi|133425 : TG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAT-TAAT----G-G--A-A-AT------T-AA--CTTGTCA
gi|133426 : -TCC-CA-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AT------A-AA--
gi|133427 : -TT-ATGGGTCTCGGAC---C-----TTCTG-GAAT-GAAT----G-G--A-A-TT------G-AA--CGTGTCA
Alignments
lowQualScore : 222222222222
lowQualScore : 222 22 3333 1 2 444444 222 1 66666 33333 222222222222 7777 11 1 22222 5555555555555 111 22222 2222 6666666666 88888888888888 1 8888888888 3 3 1 1 111 22222 1 1 1 2222 2 11 1 1 666666 1 11
lowQualScore : ... .. .... . . ...... ... . ..... ..... ............ .... .. . ..... ............. ... ..... .... .......... .............. . .......... . . . . ... ..... . . . .... . .. . . ...... . ..
lowQualScore : 777 00 1111 4 8 000000 444 4 55555 22222 999999999999 3333 77 2 99999 9999999999999 999 77777 3333 1111111111 88888888888888 0 5555555555 1 0 0 0 888 66666 1 1 4 3333 2 55 1 1 444444 1 55
consensus : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
Reference ( family-520 ) : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133386 : ATATTGCA---TATAA--TT----AGGT-TAT-A------TG---ACG-TTTATTA-----G-----AT-----GT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133387 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TGT-A------TG---ATG-TATGTTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-------CAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133388 : ATATCTCA---TAAAA--TT----ATGT-CAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AC-----ATCAGT----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-A
gi|133389 : ATATTGTA---TATAA--TT----A-GT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAAAC---C-----TTCTG-GAAA-AACT----T-GTCA-A-ACTAGTCAA-AA--CTTGTCA
gi|133390 : ATATTGTA---TATAA--TT----TTGT-TAT-A------TG---ATG-TTTAT----------------------------GT----TG--C-C-----ATATGTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-AAAT----G-G--A-A-AA------G-AA--CTTGTCA
gi|133391 : GTA---TATAA--GT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TATATTA-----G-----AT-----GG-----TGT----CA--C-C-----ATATGTGTC-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------TC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TGAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTG
gi|133392 : atgctATATCGTA---CATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AGG-TTTAATA-----A-----AT-----TG-----TGT----CG--C-T-----TTATTTGTA-A-----------TCGTAAT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TCC-TC-ATTGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAGA-GAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133393 : ATATCGTA---TACAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---TTG-TTTATTA-----T-----AC-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------GC-AAT-TTC-TC-ACTGGTCTCTGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTTTCA
gi|133394 : ATACCGTA---TATAC--TT----ATGT-TAT-A-------G---AGG-TTTATTT-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----GTATTTGTA-A-----------TT---CT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-TAAT----G-G----------------AA--CTTGTCA
gi|133395 : ATAGCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAC-A------TG---GTA-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-AGCATTATATTATC---AT-----A----TAT--------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TAT-TT-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTT
gi|133396 : ATATCGTT---TACAA--AT----GTGC-CAT-A------TG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGA-TTG----TGT----CG--C-C-----ATATTTGCA-A-----------CC---AT-----A----T----------GT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCA-TC-ACTGGTCTCATAC---C-----TTCTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133397 : ATTTCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTAATTA-----G-----ATACGA-TT-----TGGA---CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TG---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAC-TCA-TCTAT-GGTCTCAGGC---C-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--TCTGTCA
gi|133398 : ATATCGTAGATTATAAAATT-----TAT-TAT-A------TG---TTG-TT-ATTA-----G-----ATATGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----TATATATATATAT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-T-AT------A-AA--
gi|133399 : ATGTTGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTTATTA-----GGTACGAT-----AT-----TGG----CG--C-------ATATTTGTT-A-----------TC---GT-----A----T----------AA--------------ATG-TG----------AT-TTT-TCC-TC-ATTTGTCTCAGAC---C-----ATCTG-GATG-TAAT----G-G--A-ATAT------A-A
gi|133400 : ATACCGTA---TATAT--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATA-TTAATCA-----G-----GT-----TT-----TGC----CG--C-C-----ACATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-T-----------------------------------GAT---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AC------C-AA--TTTGTCA
gi|133401 : ATATCGTA---TAAAA--TA----ATGT-T-T-A------TG---AAA-GGTATTA-----G-----ATAGGAGTT-----TGT----CT--C-A-----TTTTTTGCA-T-----------TC---ATTATACA----T----------GT--------------ATG-TG----------AA-TAT-TCG-TT-ATGCGTGTAAGAC---CTGACCTTCTG-GAAA-TAATAAAAA-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133402 : ATGTCGTA---TATAT--TT----A-----AT-A------TGTGAATT-TTTATTA-----G-----ATATC--CT-----TGTAT--CT--T-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------TTG-T---------------AT--------ATGGGTCTCAGAT---C-----TTCTG-GAAA-TGG-----G-G--G-A-GT------C-AA--CCTGTCA
gi|133403 : ATATCGTA---TATAA--TA----ATGG-TAT-A------TG---AGG-TTTATTACATACG-----AT-----TT-----TGC----AT--C-C-----ATAT--ATA-C-----------TC---GT-----A----C----------------------------G-TG----------AC-TAT-TTG-CT-ATTGGGGTCAAAT---C-----CTTTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CT
gi|133404 : ATATCGTA---TATAA--TT------GT-TAT-ACATGTGTG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AA-----A----T----------TT--------------ATGATT----------A--TAT-TCA-TT-ATGGGTTT
gi|133405 : ATATCGTA---TATAT--CT----AT-T-TAT-A------T----ATAATTTATTAAATATG-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----C----------ATATACATACATATAAATG-TG----------AA-TAT-TCC-TC-AT
gi|133406 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TATTA------TG---ATT-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CA--A-C-----ATAATTATA-G-----------T
gi|133407 : TATTATC---TATGA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATT-TTTATAA-----A-----AC-----TG-----TGT----CG--C-T-----ATATTTGTA-A-----------TA---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGGT---C-----ATTTA-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133408 : ATAT-ATA---TATAC--TT----ATGT-TAC-A------TG---ACG-TTAAT-------------AC-------------GT----CG--AGC-----ATACTAATATA-----------T----AT-----A----T----------AT--------------ATG-TGTGTGTGTGTGGC-TAT-TCC-TA-ATAAATCTCAGAG---C-----TTATG-GAAG-TA-----------A-A-GT------A-AA--CTT
gi|133409 : tATCGTA---AATAA--CTTAACATGT-----A------TG---CTG-TCCGTTA------------T-----TT-----TGTAGTGTG--C-CGATTTATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AGG-TA----------AA-TGT-TC--TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----C-A--A-A-ATA-----A-AA--CTT
gi|133410 : -----G-----AT-----TT-----TAT----CG--C-C-----ATATTTTTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AA--------------ATG-AG----------AC-TAT-TTA-TC-ATGGATTTAAGAC---T-----TTCTG-GAAA-AAAT----G-G--ATA-GT--------AA--CTTGTCA
gi|133411 : ttgcaatatttgtattgtctttgaagtttcttcgatacGTA---CAT----TT----ATGTATGT-A------TG---CTA-TCCATTA-----------AT-----TTATAA-TGTAC--TGATT-T-----ATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATT-TA----------AAATATGTCC-TC-ATGTGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AC------A-AA--
gi|133412 : tgtaaTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TT-GTGGGTCTCAAAC---T-----TTCTGAAAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133413 : TATTTGTA-T-----------TC---GT-----G----T----------AT-------------------G----------AA-TGT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGAT---A-----TTCTG-GA------------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133414 : ataattgttctaggaatttatataaccagtactatattacacTAC--TT----A-GT-TATTA------GA---AT--TTTATTA-----G-----ATACAATTT-----TGT----CG--C-C-----ATCTTTGCA-T-----------TC---AT-----A----T----------TT--------------ATG-TG----------AC-TAT-ACA-TC-AGGAGTCTAAGAC---C-----TTTTG-AAAA-T--------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133415 : -----ATGCTTGCC-G-----------TA---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ACATATGTCC-TC-ATAGGCCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----GAA--A-A-AT------ACAA--CTTG
gi|133416 : aattatattacaccgaacatgttctgagttGT-TAT-A------TG---AAG-TTCATTG-----G-----AT-----ACAATAGTGT----TA--C-C-----GTTTTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-ATGGGTTTCAGAC---C-----TTCTG-GATA-TAAT----G-G--T-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133417 : AC-A------TG---ATG-TTTATTT-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----A----------AT--------------ATT-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTTA
gi|133418 : TTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTT-TA-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCGGAC---A-----TTGTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AAATCTTGTCA
gi|133419 : T-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATAATTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATA-TACATC------AC-TAT-TCC-TC-ACGTGTGTAAGAA---C-----TTCT---AAATTAAT----G-G--A-A-AA------A-TA--TTTGCCA
gi|133420 : -----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------ATTATTA---------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-GTGGGCCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----T-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133421 : TTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ATATAT-TCCCTC-ATGGGTCTAAGAC---A------TCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133422 : TA-G-----------TC---GT-----A----T----------AT--------------GTA-TG----------GC-GAA-TTA-TC-ATGGGTCTCAGACCTAC-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-T--A-A-AA------A-AA--
gi|133423 : T-----A----C----------AT--------------ATG-TGTAA-------AC-TATGTCC-TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----GAG--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133424 : ----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCCCTGGC---A-----TTCTG-GAAA-TAA
gi|133425 : TG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAT-TAAT----G-G--A-A-AT------T-AA--CTTGTCA
gi|133426 : -TCC-CA-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AT------A-AA--
gi|133427 : -TT-ATGGGTCTCGGAC---C-----TTCTG-GAAT-GAAT----G-G--A-A-TT------G-AA--CGTGTCA
Alignments
lowQualScore : 222222222222
lowQualScore : 222 22 3333 1 2 444444 222 1 66666 33333 222222222222 7777 11 1 22222 5555555555555 111 22222 2222 6666666666 88888888888888 1 8888888888 3 3 1 1 111 22222 1 1 1 2222 2 11 1 1 666666 1 11
lowQualScore : ... .. .... . . ...... ... . ..... ..... ............ .... .. . ..... ............. ... ..... .... .......... .............. . .......... . . . . ... ..... . . . .... . .. . . ...... . ..
lowQualScore : 777 00 1111 4 8 000000 444 4 55555 22222 999999999999 3333 77 2 99999 9999999999999 999 77777 3333 1111111111 88888888888888 0 5555555555 1 0 0 0 888 66666 1 1 4 3333 2 55 1 1 444444 1 55
consensus : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
Reference ( family-520 ) : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133386 : ATATTGCA---TATAA--TT----AGGT-TAT-A------TG---ACG-TTTATTA-----G-----AT-----GT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133387 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TGT-A------TG---ATG-TATGTTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-------CAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133388 : ATATCTCA---TAAAA--TT----ATGT-CAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AC-----ATCAGT----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-A
gi|133389 : ATATTGTA---TATAA--TT----A-GT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAAAC---C-----TTCTG-GAAA-AACT----T-GTCA-A-ACTAGTCAA-AA--CTTGTCA
gi|133390 : ATATTGTA---TATAA--TT----TTGT-TAT-A------TG---ATG-TTTAT----------------------------GT----TG--C-C-----ATATGTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-AAAT----G-G--A-A-AA------G-AA--CTTGTCA
gi|133391 : GTA---TATAA--GT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TATATTA-----G-----AT-----GG-----TGT----CA--C-C-----ATATGTGTC-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------TC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TGAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTG
gi|133392 : atgctATATCGTA---CATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AGG-TTTAATA-----A-----AT-----TG-----TGT----CG--C-T-----TTATTTGTA-A-----------TCGTAAT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TCC-TC-ATTGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAGA-GAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133393 : ATATCGTA---TACAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---TTG-TTTATTA-----T-----AC-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------GC-AAT-TTC-TC-ACTGGTCTCTGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTTTCA
gi|133394 : ATACCGTA---TATAC--TT----ATGT-TAT-A-------G---AGG-TTTATTT-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----GTATTTGTA-A-----------TT---CT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-TAAT----G-G----------------AA--CTTGTCA
gi|133395 : ATAGCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAC-A------TG---GTA-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-AGCATTATATTATC---AT-----A----TAT--------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TAT-TT-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTT
gi|133396 : ATATCGTT---TACAA--AT----GTGC-CAT-A------TG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGA-TTG----TGT----CG--C-C-----ATATTTGCA-A-----------CC---AT-----A----T----------GT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCA-TC-ACTGGTCTCATAC---C-----TTCTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133397 : ATTTCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTAATTA-----G-----ATACGA-TT-----TGGA---CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TG---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAC-TCA-TCTAT-GGTCTCAGGC---C-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--TCTGTCA
gi|133398 : ATATCGTAGATTATAAAATT-----TAT-TAT-A------TG---TTG-TT-ATTA-----G-----ATATGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----TATATATATATAT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-T-AT------A-AA--
gi|133399 : ATGTTGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTTATTA-----GGTACGAT-----AT-----TGG----CG--C-------ATATTTGTT-A-----------TC---GT-----A----T----------AA--------------ATG-TG----------AT-TTT-TCC-TC-ATTTGTCTCAGAC---C-----ATCTG-GATG-TAAT----G-G--A-ATAT------A-A
gi|133400 : ATACCGTA---TATAT--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATA-TTAATCA-----G-----GT-----TT-----TGC----CG--C-C-----ACATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-T-----------------------------------GAT---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AC------C-AA--TTTGTCA
gi|133401 : ATATCGTA---TAAAA--TA----ATGT-T-T-A------TG---AAA-GGTATTA-----G-----ATAGGAGTT-----TGT----CT--C-A-----TTTTTTGCA-T-----------TC---ATTATACA----T----------GT--------------ATG-TG----------AA-TAT-TCG-TT-ATGCGTGTAAGAC---CTGACCTTCTG-GAAA-TAATAAAAA-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133402 : ATGTCGTA---TATAT--TT----A-----AT-A------TGTGAATT-TTTATTA-----G-----ATATC--CT-----TGTAT--CT--T-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------TTG-T---------------AT--------ATGGGTCTCAGAT---C-----TTCTG-GAAA-TGG-----G-G--G-A-GT------C-AA--CCTGTCA
gi|133403 : ATATCGTA---TATAA--TA----ATGG-TAT-A------TG---AGG-TTTATTACATACG-----AT-----TT-----TGC----AT--C-C-----ATAT--ATA-C-----------TC---GT-----A----C----------------------------G-TG----------AC-TAT-TTG-CT-ATTGGGGTCAAAT---C-----CTTTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CT
gi|133404 : ATATCGTA---TATAA--TT------GT-TAT-ACATGTGTG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AA-----A----T----------TT--------------ATGATT----------A--TAT-TCA-TT-ATGGGTTT
gi|133405 : ATATCGTA---TATAT--CT----AT-T-TAT-A------T----ATAATTTATTAAATATG-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----C----------ATATACATACATATAAATG-TG----------AA-TAT-TCC-TC-AT
gi|133406 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TATTA------TG---ATT-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CA--A-C-----ATAATTATA-G-----------T
gi|133407 : TATTATC---TATGA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATT-TTTATAA-----A-----AC-----TG-----TGT----CG--C-T-----ATATTTGTA-A-----------TA---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGGT---C-----ATTTA-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133408 : ATAT-ATA---TATAC--TT----ATGT-TAC-A------TG---ACG-TTAAT-------------AC-------------GT----CG--AGC-----ATACTAATATA-----------T----AT-----A----T----------AT--------------ATG-TGTGTGTGTGTGGC-TAT-TCC-TA-ATAAATCTCAGAG---C-----TTATG-GAAG-TA-----------A-A-GT------A-AA--CTT
gi|133409 : tATCGTA---AATAA--CTTAACATGT-----A------TG---CTG-TCCGTTA------------T-----TT-----TGTAGTGTG--C-CGATTTATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AGG-TA----------AA-TGT-TC--TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----C-A--A-A-ATA-----A-AA--CTT
gi|133410 : -----G-----AT-----TT-----TAT----CG--C-C-----ATATTTTTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AA--------------ATG-AG----------AC-TAT-TTA-TC-ATGGATTTAAGAC---T-----TTCTG-GAAA-AAAT----G-G--ATA-GT--------AA--CTTGTCA
gi|133411 : ttgcaatatttgtattgtctttgaagtttcttcgatacGTA---CAT----TT----ATGTATGT-A------TG---CTA-TCCATTA-----------AT-----TTATAA-TGTAC--TGATT-T-----ATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATT-TA----------AAATATGTCC-TC-ATGTGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AC------A-AA--
gi|133412 : tgtaaTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TT-GTGGGTCTCAAAC---T-----TTCTGAAAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133413 : TATTTGTA-T-----------TC---GT-----G----T----------AT-------------------G----------AA-TGT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGAT---A-----TTCTG-GA------------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133414 : ataattgttctaggaatttatataaccagtactatattacacTAC--TT----A-GT-TATTA------GA---AT--TTTATTA-----G-----ATACAATTT-----TGT----CG--C-C-----ATCTTTGCA-T-----------TC---AT-----A----T----------TT--------------ATG-TG----------AC-TAT-ACA-TC-AGGAGTCTAAGAC---C-----TTTTG-AAAA-T--------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133415 : -----ATGCTTGCC-G-----------TA---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ACATATGTCC-TC-ATAGGCCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----GAA--A-A-AT------ACAA--CTTG
gi|133416 : aattatattacaccgaacatgttctgagttGT-TAT-A------TG---AAG-TTCATTG-----G-----AT-----ACAATAGTGT----TA--C-C-----GTTTTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-ATGGGTTTCAGAC---C-----TTCTG-GATA-TAAT----G-G--T-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133417 : AC-A------TG---ATG-TTTATTT-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----A----------AT--------------ATT-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTTA
gi|133418 : TTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTT-TA-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCGGAC---A-----TTGTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AAATCTTGTCA
gi|133419 : T-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATAATTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATA-TACATC------AC-TAT-TCC-TC-ACGTGTGTAAGAA---C-----TTCT---AAATTAAT----G-G--A-A-AA------A-TA--TTTGCCA
gi|133420 : -----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------ATTATTA---------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-GTGGGCCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----T-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133421 : TTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ATATAT-TCCCTC-ATGGGTCTAAGAC---A------TCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133422 : TA-G-----------TC---GT-----A----T----------AT--------------GTA-TG----------GC-GAA-TTA-TC-ATGGGTCTCAGACCTAC-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-T--A-A-AA------A-AA--
gi|133423 : T-----A----C----------AT--------------ATG-TGTAA-------AC-TATGTCC-TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----GAG--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133424 : ----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCCCTGGC---A-----TTCTG-GAAA-TAA
gi|133425 : TG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAT-TAAT----G-G--A-A-AT------T-AA--CTTGTCA
gi|133426 : -TCC-CA-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AT------A-AA--
gi|133427 : -TT-ATGGGTCTCGGAC---C-----TTCTG-GAAT-GAAT----G-G--A-A-TT------G-AA--CGTGTCA
blockSeqs : GAT AA TAAC A T CATGTG TGA A CATAC GTACG ACGATTG AGTG AT G GATTT AGCATTATATTA GTA TATAC TCAG ATATATATAT ATACATACATATAA A TGTGTGTGTG A G CTA TGACC A T A AAAA A TC T T TAGTCA C AT
blockSeqs : . . . . T . . . AATAT . ATGATTT AT . . . TA . . . AT TATTA . CATC A G . . . . A . A . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AGGAGTT AC . . . A . . . . . . TAA A G . . . . A . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . ACGATTT A . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . ACAATTT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . ACAATAG . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . ACGATT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TTATAA . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . ATCCT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . GG . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AT . . . . C . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TG . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . TG . . . . A . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . TT . . . . G . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
finalCons : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
Alignments
lowQualScore : 222222222222
lowQualScore : 222 22 3333 1 2 444444 222 1 66666 33333 222222222222 7777 11 1 22222 5555555555555 111 22222 2222 6666666666 88888888888888 1 8888888888 3 3 1 1 111 22222 1 1 1 2222 2 11 1 1 666666 1 11
lowQualScore : ... .. .... . . ...... ... . ..... ..... ............ .... .. . ..... ............. ... ..... .... .......... .............. . .......... . . . . ... ..... . . . .... . .. . . ...... . ..
lowQualScore : 777 00 1111 4 8 000000 444 4 55555 22222 999999999999 3333 77 2 99999 9999999999999 999 77777 3333 1111111111 88888888888888 0 5555555555 1 0 0 0 888 66666 1 1 4 3333 2 55 1 1 444444 1 55
consensus : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
Reference ( family-520 ) : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133386 : ATATTGCA---TATAA--TT----AGGT-TAT-A------TG---ACG-TTTATTA-----G-----AT-----GT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133387 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TGT-A------TG---ATG-TATGTTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-------CAG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133388 : ATATCTCA---TAAAA--TT----ATGT-CAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AC-----ATCAGT----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-A
gi|133389 : ATATTGTA---TATAA--TT----A-GT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAAAC---C-----TTCTG-GAAA-AACT----T-GTCA-A-ACTAGTCAA-AA--CTTGTCA
gi|133390 : ATATTGTA---TATAA--TT----TTGT-TAT-A------TG---ATG-TTTAT----------------------------GT----TG--C-C-----ATATGTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-AAAT----G-G--A-A-AA------G-AA--CTTGTCA
gi|133391 : GTA---TATAA--GT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TATATTA-----G-----AT-----GG-----TGT----CA--C-C-----ATATGTGTC-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------TC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCAG-GAAA-TGAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTG
gi|133392 : atgctATATCGTA---CATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AGG-TTTAATA-----A-----AT-----TG-----TGT----CG--C-T-----TTATTTGTA-A-----------TCGTAAT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TCC-TC-ATTGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAGA-GAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133393 : ATATCGTA---TACAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---TTG-TTTATTA-----T-----AC-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------GC-AAT-TTC-TC-ACTGGTCTCTGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTTTCA
gi|133394 : ATACCGTA---TATAC--TT----ATGT-TAT-A-------G---AGG-TTTATTT-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----GTATTTGTA-A-----------TT---CT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAA-TAAT----G-G----------------AA--CTTGTCA
gi|133395 : ATAGCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAC-A------TG---GTA-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-AGCATTATATTATC---AT-----A----TAT--------AT--------------ATG-TG----------AC-TTT-TAT-TT-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTT
gi|133396 : ATATCGTT---TACAA--AT----GTGC-CAT-A------TG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGA-TTG----TGT----CG--C-C-----ATATTTGCA-A-----------CC---AT-----A----T----------GT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCA-TC-ACTGGTCTCATAC---C-----TTCTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133397 : ATTTCGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTAATTA-----G-----ATACGA-TT-----TGGA---CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TG---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAC-TCA-TCTAT-GGTCTCAGGC---C-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--TCTGTCA
gi|133398 : ATATCGTAGATTATAAAATT-----TAT-TAT-A------TG---TTG-TT-ATTA-----G-----ATATGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTATA-A-----------TC---AT-----A----TATATATATATAT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-T-AT------A-AA--
gi|133399 : ATGTTGTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---AAG-TTTATTA-----GGTACGAT-----AT-----TGG----CG--C-------ATATTTGTT-A-----------TC---GT-----A----T----------AA--------------ATG-TG----------AT-TTT-TCC-TC-ATTTGTCTCAGAC---C-----ATCTG-GATG-TAAT----G-G--A-ATAT------A-A
gi|133400 : ATACCGTA---TATAT--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATA-TTAATCA-----G-----GT-----TT-----TGC----CG--C-C-----ACATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-T-----------------------------------GAT---C-----TTCTT-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AC------C-AA--TTTGTCA
gi|133401 : ATATCGTA---TAAAA--TA----ATGT-T-T-A------TG---AAA-GGTATTA-----G-----ATAGGAGTT-----TGT----CT--C-A-----TTTTTTGCA-T-----------TC---ATTATACA----T----------GT--------------ATG-TG----------AA-TAT-TCG-TT-ATGCGTGTAAGAC---CTGACCTTCTG-GAAA-TAATAAAAA-A--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133402 : ATGTCGTA---TATAT--TT----A-----AT-A------TGTGAATT-TTTATTA-----G-----ATATC--CT-----TGTAT--CT--T-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------TTG-T---------------AT--------ATGGGTCTCAGAT---C-----TTCTG-GAAA-TGG-----G-G--G-A-GT------C-AA--CCTGTCA
gi|133403 : ATATCGTA---TATAA--TA----ATGG-TAT-A------TG---AGG-TTTATTACATACG-----AT-----TT-----TGC----AT--C-C-----ATAT--ATA-C-----------TC---GT-----A----C----------------------------G-TG----------AC-TAT-TTG-CT-ATTGGGGTCAAAT---C-----CTTTA-GAAA-TAAT----G-A--A-A-AT------A-AA--CT
gi|133404 : ATATCGTA---TATAA--TT------GT-TAT-ACATGTGTG---ATA-TTTATTA-----G-----ATACGATTT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AA-----A----T----------TT--------------ATGATT----------A--TAT-TCA-TT-ATGGGTTT
gi|133405 : ATATCGTA---TATAT--CT----AT-T-TAT-A------T----ATAATTTATTAAATATG-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-T-----------TC---AT-----A----C----------ATATACATACATATAAATG-TG----------AA-TAT-TCC-TC-AT
gi|133406 : ATATCGTA---TATAA--TT----ATGT-TATTA------TG---ATT-TTTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CA--A-C-----ATAATTATA-G-----------T
gi|133407 : TATTATC---TATGA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATT-TTTATAA-----A-----AC-----TG-----TGT----CG--C-T-----ATATTTGTA-A-----------TA---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGGT---C-----ATTTA-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133408 : ATAT-ATA---TATAC--TT----ATGT-TAC-A------TG---ACG-TTAAT-------------AC-------------GT----CG--AGC-----ATACTAATATA-----------T----AT-----A----T----------AT--------------ATG-TGTGTGTGTGTGGC-TAT-TCC-TA-ATAAATCTCAGAG---C-----TTATG-GAAG-TA-----------A-A-GT------A-AA--CTT
gi|133409 : tATCGTA---AATAA--CTTAACATGT-----A------TG---CTG-TCCGTTA------------T-----TT-----TGTAGTGTG--C-CGATTTATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------AGG-TA----------AA-TGT-TC--TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----C-A--A-A-ATA-----A-AA--CTT
gi|133410 : -----G-----AT-----TT-----TAT----CG--C-C-----ATATTTTTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AA--------------ATG-AG----------AC-TAT-TTA-TC-ATGGATTTAAGAC---T-----TTCTG-GAAA-AAAT----G-G--ATA-GT--------AA--CTTGTCA
gi|133411 : ttgcaatatttgtattgtctttgaagtttcttcgatacGTA---CAT----TT----ATGTATGT-A------TG---CTA-TCCATTA-----------AT-----TTATAA-TGTAC--TGATT-T-----ATGCTTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATT-TA----------AAATATGTCC-TC-ATGTGTCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AC------A-AA--
gi|133412 : tgtaaTA---TATAA--TT----ATGT-TAT-A------TG---ATG-TTTATTA-----G-----AT-----TG-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TT-GTGGGTCTCAAAC---T-----TTCTGAAAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133413 : TATTTGTA-T-----------TC---GT-----G----T----------AT-------------------G----------AA-TGT-TCT-TC-ATGAGTCTCAGAT---A-----TTCTG-GA------------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133414 : ataattgttctaggaatttatataaccagtactatattacacTAC--TT----A-GT-TATTA------GA---AT--TTTATTA-----G-----ATACAATTT-----TGT----CG--C-C-----ATCTTTGCA-T-----------TC---AT-----A----T----------TT--------------ATG-TG----------AC-TAT-ACA-TC-AGGAGTCTAAGAC---C-----TTTTG-AAAA-T--------------A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133415 : -----ATGCTTGCC-G-----------TA---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ACATATGTCC-TC-ATAGGCCTAAGAC---C-----TTCTG-GAAA-T-AT----GAA--A-A-AT------ACAA--CTTG
gi|133416 : aattatattacaccgaacatgttctgagttGT-TAT-A------TG---AAG-TTCATTG-----G-----AT-----ACAATAGTGT----TA--C-C-----GTTTTTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AC--------------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-ATGGGTTTCAGAC---C-----TTCTG-GATA-TAAT----G-G--T-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133417 : AC-A------TG---ATG-TTTATTT-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATATTTGTG-A-----------TC---AT-----A----A----------AT--------------ATT-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTTA
gi|133418 : TTATTA-----G-----AT-----TT-----TGT----CG--T-C-----ATATTT-TA-A-----------CC---AT-----A----T----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGATCTCGGAC---A-----TTGTG-GAAA-TAAT----G-G--A-A-AT------A-AAATCTTGTCA
gi|133419 : T-----TT-----TGT----CG--C-C-----ATAATTGTA-T-----------TC---AT-----A----T----------AT--------------ATA-TACATC------AC-TAT-TCC-TC-ACGTGTGTAAGAA---C-----TTCT---AAATTAAT----G-G--A-A-AA------A-TA--TTTGCCA
gi|133420 : -----ATATTTGTA-A-----------TC---AT-----A----T----------ATTATTA---------ATG-TG----------AC-TAT-TAC-TC-GTGGGCCTCAGAC---C-----TTCTG-GAAA-TAAT----T-G--A-A-AT------A-AA--CTTGTCA
gi|133421 : TTGCC-G-----------TC---AT-----G----T----------AT--------------ATG-TA----------ATATAT-TCCCTC-ATGGGTCTAAGAC---A------TCTG-GAAA-T-AT----G-A--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133422 : TA-G-----------TC---GT-----A----T----------AT--------------GTA-TG----------GC-GAA-TTA-TC-ATGGGTCTCAGACCTAC-----TTTTG-GAAA-TAAT----G-T--A-A-AA------A-AA--
gi|133423 : T-----A----C----------AT--------------ATG-TGTAA-------AC-TATGTCC-TC-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----GAG--A-A-ATA-----A-AA--CTTGT
gi|133424 : ----------AT--------------ATG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCCCTGGC---A-----TTCTG-GAAA-TAA
gi|133425 : TG-TG----------AC-TAT-TCC-TC-ATGGGTCTCAGAC---C-----TTCTG-AAAT-TAAT----G-G--A-A-AT------T-AA--CTTGTCA
gi|133426 : -TCC-CA-ATGGGTCTAAGAC---C-----TTCTT-GAAA-T-AT----G-A--A-A-AT------A-AA--
gi|133427 : -TT-ATGGGTCTCGGAC---C-----TTCTG-GAAT-GAAT----G-G--A-A-TT------G-AA--CGTGTCA