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Reference ( gi|43619 )        :                                                         TTTA-TTGATATT--ATGCA--GAGGAAA-GG-TCGTCTAG----ACTAAC--TTCAG------G------GGACTATTTTATTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGGCTAGT-TATACAGATTTTAGG-G--A--TA-TTTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGCTATACAGATATTAGGAG
gi|43622                      :                                                         TTTA-TTGATATT--ATGCA--GAGGAAA-GG-TCGTCTAG----ACTAAC--TTCAG------G------GGACTATTTTATTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGGCTAGT-TATACAGATTTTAGG-G--A--TA-TTTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGCTATACAGATATTAGGAG
gi|43611                      :                                                         TTTA-TTGATATT--ATGCA--GAGGAAA-GG-TCATCTAG----ACAGAT--TTCAG------G------GGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGGCTAGC-GATACAGAATTTAGG-G--AC-TA-ATTTATTTA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAGAATTTAGGA
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gi|43589                      :    ttttattgatattgactacatggcaggctagcgatacagatttaagggactatTTTA-TTGATATT--GACTA--CATGGCA-GG-----CTAGCGATAC-AGA--TTTAA------G------GGACTATTTTATTGATA-------TT---ATGCAGAGGAAAGGTCATC-TAGACAGATTTCAGG-G--GACTA-TTTCATTGA-------TATTGTGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAGAATTTAGG
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gi|43620                      : tttattgatattgagtacattgcaggatatttagcaatacagattttagggactatTTTA-TTGATATT--GAGTA--CATTGCA-GG-ATATTTAGCAATACAGAT--TTTAG------G------G-ACTATTTTATTTATA-------TTACAGAG---AGGAAAGGTCATC-TAGACAGATTTCAGGAG--A--CAATTTTATTGA-------TATTGAATTCATGGCAGG----CTAGCAATACAGATTTTAGG
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gi|43617                      : tttattgatattgagtacattgcaggatatttagcaatacagattttagggactatTTTA-TTGATATT--GAGTA--CATTGCA-GG-ATATTTAGCAATACAGAT--TTTAG------G------G-ACTATTTTATTTATA-------TTACAGAG---AGGAAAGGTCATC-TAGACAGATTTCAGGAG--A--CAATTTTATTGA-------TATTGAATTCATGGCAGG----CTAGCAATACAGATTTTAGG
gi|43602                      :                                                         TTTAATTGATATT--ATGGA--GATGAAA-GG-TCATCTAA----ACAGAT--TTTAG------G------AGACTATTTTATTGATA-------TT---GACTACATGGCAGGCTAGC-GATACAGATTTAAGG-G--A--ga
gi|43602                      :     ttttattgatattgagtacatggcagtgtagcgatacagattttagtgactaTTTA-TTGATATT---------GAGTACATGG-CAGTGTAGCGATACAGAT--TTTAG------T------G-ACTATTTAATTGATA-------TT---ATGGAGATGAAAGGTCATC-TAAACAGATTTTAGGAG--AC-TA-TTTTATTGA-------TATTGACTACATGGCAGG----CTAGCGATACAGAT-TTAAGGG
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gi|43587                      :     ttttattgatattgagtacatggcagtgtagcgatacagattttagtgactaTTTA-TTGATATT---------GAGTACATGG-CAGTGTAGCGATACAGAT--TTTAG------T------G-ACTATTTAATTGATA-------TT---ATGGAGATGAAAGGTCATC-TAAACAGATTTTAGGAG--AC-TA-TTTTATTGA-------TATTGACTACATGGCAGG----CTAGCGATACAGAT-TTAAGGG
gi|43610                      :                                                        tTTTA-TTGATATT--GAGTA--CATGGCA-GG-----CTAGCGATACAGAT--ATTAG------G------AG-CTATTTTGTTGATA-------TT---GAGTACATGGTAGGCTAAC-AATATAGATTATAAG-A--AT-TA-TTTTATTGATACAATGTATTGAGTACATGGCAGG----CTAACGATACAGATa
gi|43595                      :                                                        tTTTA-TTGATATT--GAGTA--CATGGCA-GG-----CTAGCGATACAGAT--ATTAG------G------AG-CTATTTTGTTGATA-------TT---GAGTACATGGTAGGCTAAC-AATATAGATTATAAG-A--AT-TA-TTTTATTGATACAATGTATTGAGTACATGGCAGG----CTAACGATACAGATtt
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gi|43592                      :                                                        tTTTG-TTGATATT---------GAGTACATGG-T-----AG----GCTAACAATATAG------ATTATAAGAATTATTTTATTGATACAATGTATT---GAGTACATGGCAGGCTAAC-GATACAGATTTTACA-G--AC-TA-TTTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGTGATACAGAT-TTAAGGGa
gi|43612                      :                                                        tTTTA-TTGATACA--ATGTATTGAGTACA-TG-GC----AG----GCTAACGATACAG------ATTTTACAGACTATTTTATTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGGCTAGT-GATACAGATTTAAGG-G--AC-TA-TTTTATTa
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gi|43613                      :                                                        tTTTA-TTGATATTGAATTCA--TGGCA---GG-----CTAGCAATACAGAT--TTTAG------G------G-ACTATTTTATTGATA-------TT---
gi|43598                      :                                                        tTTTA-TTGATATTGAATTCA--TGGCA---GG-----CTAGCAATACAGAT--TTTAG------G------G-ACTATTTTATTGATA-------TT---a
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gi|43599                      :                                                        tTTTA-TTGATATT--GAGTA--CATGGCA-GG-----CTAGTGATAC-AGA--TTTAA------G------GGACTATTTTATT
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gi|43628                      :                                                                                                                 AG------G------GGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGGCTAGC-GATACAAATTTTAAG-G--A--
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gi|43624                      :                                                                                                                   ------G------GGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGGCTAGC-GATACAAATTTTAAG-G--ACTTA--TTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----TTAGAAATACAGATATTAGG
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gi|43594                      :                                                                                                                                      TTTTGTTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGGCTAGC-TATACAGATATTAGGAG--C--TA-TTTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAGATATTAGGAGctattttgttgatattgagtacatggtaggctaacaatatagattataag
gi|43616                      :                                                                                                                                      TTTTATTTATA-------TTACAGAG---AGGAAAGGTCATC-TAGACAGATTTCAGGAG--A--CAATTTTATTGA-------TATTGAATTCATGGCAGG----CTAGCAATACAGATTTTAGGctattttgttgatattgagtacatggtaggctaacaatatagattataag
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gi|43598                      :                                                                                                                                      TTTTATTGATA-------TT---GAATTCATGGCAGGCTAGC-AATACAGATTTTAGG-G--AC-TA-TTTTATTGA-------TATTa
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gi|43599                      :                                                                                                                                      TTTTATTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGGCTAGT-GATACAGATTTAAGG-G--AC-TA-TTTTATT
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gi|43626                      :                                                                                                                                                                                             AGG-G--A--AC-TTTTATTGA-------TATTGAGTTCATGGCAGT----CTAGTGATACAGATTTTAGGct
gi|43625                      :                                                                                                                                                                    ttgatattacagagaggaaaggtcaAGG-G--A--AC-TTTTATTGA-------TATTGAGTTCATGGCAGT----CTAGTGATACAGATTTTAGGga
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gi|43622                      :  TTTATTGATATT-----ATGCAGAGGAAAGGTCG---TCTAG-----ACTAACTTCAGGGGACTATTTTATTGATA-------TT---GAGTACATGGCAGG----CTAGTTATACAGATTTTAGG-G-A-TATTTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----CTAGCTATACAGATATTAGGAGtga
gi|43623                      :                                                            GGGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAAATTTTAAG-G-ACTTATTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----TTAGAAATACAGATATTAGGG
gi|43624                      :                                                            GGGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAAATTTTAAG-G-ACTTATTTATTGA-------TATTGAGTACATGGCAGG----TTAGAAATACAGATATTAGGGa
gi|43625                      :                                                          AGGGAACT--TTTATTGATA-------TT---GAGTTCATGGCAGT----CTAGTGATACAGATTTTAGG-G-Aa
gi|43626                      :                                 ttgatattacagagaggaaaggtcaAGGGAACT--TTTATTGATA-------TT---GAGTTCATGGCAGT----CTAGTGATACAGATTTTAGG-G-A
gi|43627                      :                                 ttgatattacagagaggaaaggtcaAGGGGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAAATTTTAAG-G-A
gi|43628                      :                                                          AGGGGACTATTTCATTGATA-------TT---GTGTACATGGCAGG----CTAGCGATACAAATTTTAAG-G-A


blockSeqs                     :              ACAGA             GTCAT       TGA               GA              CAATGTA  ACA              TCGT     T              A G             TACAATG                  ATAT
blockSeqs                     :              ACAGA             GTCAT       CGA               GA              CAATGTA  ACA              TCGT     T              A G             TACAATG                  ATAT
blockSeqs                     :              .                 GATAT       CTA               GA              CAATGTA  .                .        T              A G             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 GTCGT       TTA               GA              CAATGTA  .                .        G              . G             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 GATAT       CAA               GA              .        .                .        G              . G             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 GTCGT       CGA               GA              .        .                .        G              . G             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 GT          CTA               GA              .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 GT          CGA               GA              .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 T           CGA               GA              .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           TGA               GA              .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CGA               AA              .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CTA               AA              .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           TTA               GA              .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CAA               GA              .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CGA               A               .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CTA               G               .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 T           CGA               A               .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 T           CAA               A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 T           AAA               A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           CAA               G               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           AAA               G               .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           .                 A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           .                 A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           .                 G               .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           .                 A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 G           .                 A               .        .                .        G              . .             .                        .   
blockSeqs                     :              .                 T           .                 A               .        .                .        A              . .             .                        .   
blockSeqs                     :                                                              G               .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :                                                              G               .        .                .        T              . .             .                        .   
blockSeqs                     :                                                              A               .        .                .        T              . .             .                            
blockSeqs                     :                                                              A               .        .                .        T              . .             .                            
blockSeqs                     :                                                              A               .        .                .        T              . .             .                            
blockSeqs                     :                                                              A               .        .                .        T              . .             .                            
blockSeqs                     :                                                                              .        .                .        G              . .                                          
blockSeqs                     :                                                                              .        .                .        G              . .                                          
blockSeqs                     :                                                                              .        .                .        G              . .                                          
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