lowQualScore : 11111111 1 11
lowQualScore : 1 1 5 3333 111 0 22222222 1111 0 0 0 2 8 111 222 33 5555555555 1 1111 66 3 5 66 4
lowQualScore : . . . .... ... . ........ .... . . . . . ... ... .. .......... . .... .. . . .. .
lowQualScore : 1 1 7 4444 111 6 22222222 3333 6 6 6 5 9 777 888 44 7777777777 3 6666 33 4 7 44 3
consensus : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGAT-ACG------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACGTGACAGCTTTCTCACA-TGACCTGACGAAAAT
Reference ( gi|115282 ) : TTTC-T-CCCATTTCTGCCC----ATAGA---AGAT-ACG------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-ATCACGTGATAGCTGTCTCACA-GGGCTTGACGAAAAT
gi|115285 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGCT-GTG------G----GT-TT-T-C-C-CA---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACGTGATAGCTTTCTCACA-TTACCTGATGAAAAT
gi|115284 : TTTC-T-CCCATTTCTTCTC----GTAGA---AGAT-ACG------G----GT-TT---C-C-CC---ATGA-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCT----AT-GTCACATGATAGCTTTCTCACA-TGGCCAGACAAAAAT
gi|115283 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGAT-AGG------G----GT-TT-T-C-C-CC---ACGG-A-CGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACATAACAGCTTCCTCACA-TGACCTGATGAAAAT
gi|115286 : TTTC-TGCTCATTTCTACTC----ATAGA---AGAT-ACG------G----GA-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GCTACGTGATAGCTTTCTCACG-TGACCTGACAAAA
gi|115261 : TTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATGGA---AGAT-ACA------G----CT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATATTCC----AT-GTCATGTGATAGTCTTCACACA-TGACCTGACAAAAAT
gi|115288 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---ATAT-ACA------G----GC-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGTAAA-C------TC--T-ATATTCC----AT-GTAACATGATTGCTTTCTAACA-TGGTCTGACGAAAAT
gi|115262 : TTTC-T-CCAAGTTCTGCTC----AAAGA---AAAT-ATG------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-ACGAAAAA-C------TA--C-ATCTTCC----AT-GTCACGTGACAGCTTTCTCACA-TGACCTGATGAAAAT
gi|115264 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGAT-ACA------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GAAA----------------ATCTTCC----AT-GTCATGTGACAGCTTTGTCAAA-TAGCCTGACGAAAA
gi|115287 : tTTTC-T-CCCATTTCTACTTTG--ATAGA---AGAT-ACA------G----GT-TT-T-C-C-CCC--ATGG-A-GCAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GACATGTGACACCTTTCTCACA-TGACCTGACAAAAA
gi|115289 : TTTC-T-CACATTTCTGTTC----ATATATTAGGAT-ACG------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAT-A------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACGTGACAGTTCTCTCATA-TGACATGATGAAAAT
gi|115290 : TTTC-T-TTCATTTCAGTCC----ATAGA---AGAT-ACG------G----GT-TT-T-C-T-CC---ATGG-A-GGAATA-CATGCATTC--C-ATATTCC----AT-GTCATGTGACAGCTTTCTCACA-TGACCGGACGAAAA
gi|115265 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTCTGACATAGA---AGAT-ATG------G----GT-TT-C-G-T-TA---ATGG-A-TGAAAA-C------TC--T-ATCCTAC----AT-GGCACGTGAGAGCTTTCTCACA-TGACCTGACAAAAAT
gi|115267 : tTTTT-C-CCCATTTCTAATC----ATAGA---AGAT-AAC------G----GT-TT-----C-CT---ACGG-A-AGAAAA-C------TC--T-ATATTCC----AT-GTCACGTGACAGTT-TCTCACA-TGACCTGACGAAAAT
gi|115268 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATATA---AGAT-ACG------G----GT-TTCT-C-A-CA---ATGT-A-GGAAAT-C------GC--T-AGCTTTC----AT-GTCACGTGAGAGCTTTTTCATA-TGACCTGACAAAAAT
gi|115291 : tTTTC-T-TCAATTTCTGCTC----ATAGA---AGAC-ATG------T----GT-TT-T-C-C-TC---ATGG-A-GGAAAG-T------TC--T-CTCTTCC----AT-GTCATGACACAGCTTTCTCACA-TGACCTCACAAAAAT
gi|115269 : TTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGAT-ACG------G----AT-TT-T-C-T-CC---ATAA-C-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AG-GACTTGAGACATCTTTCTCACATGGGCTT-ACGAAAAT
gi|115270 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGAT-ACG------G----AT-TT-T-C-T-CC---ATAA-C-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AG-GACTTGAGACATCTTTCTCACATAGGCTT-ACGAAAAT
gi|115271 : tTTTC-T-CACATTTCATCTC----ATAAA---AGAT-AAG------G----GC-TT-T-T-C-CA---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--TGATCTTCC-------ACCCTGTGACATCTTTCACACA-TGACCCGACAAAAAT
gi|115272 : tTTCC-T-C----TTCAGCTC----ATAAA---AG-----------------GT-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-AGAAAA-C------TC--T-ATCTTTC----AT-GTGACATTATACCTTCCTCACG-TGGCCTGACAAAAAT
gi|115275 : tTTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAGA---TGTT----------------T-TT-T-T-T-CC---ATGG-A-GGAAAA-C------TC--T-ATCTTCC----AT-GGCACGAGACAGTT
gi|115263 : tTTTC-T-CATATTTCTGCTC----ATAGA---AGAT-ACG------G----GT-TT-C-C-C-CC---ACGG-A-GGAAt
gi|115293 : tTTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAAA---CGAT-ACG------A----GT-TT-T-C-C-CC---GTGG-A-GGAA
gi|115277 : TTTC-T-TCCATTTCTGCTT----TAAGA---AGAT-A-A------G----GC-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-GGAAAT-C------TC--T-ATCT
gi|115273 : tTTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATAGA---A-AT-ACG------G----GT-TT-T-C-C-AC---A--------------------------------C----AT-GACATGTGACAGCTTTCTCACA-TGACATGACGAAcaca
gi|115281 : tTTTT-C-CCCATTTCTGCTC----ACAAA---AGAT-ACA------G----GT-TT-T-C-A-AC---ATGG-C-GGAAAA--------------A-CTTCA----AT-GTCATGTGTCGGCTTTCTAAC
gi|115274 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGAT-ACATAGACTG----GT-TT-T-T-A-CG---GTGA-A-GAAAAT-C------TT--A-ATCTTCC----A--------TGACAGCTTTGTCACC-CTGCTTGACGAAA
gi|115279 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGAT-ACATAGACTG----GT-TT-T-T-A-CG---ATGA-A-CAAAAT-C------TT--A-ATCTTCC----A--------TGACAGCTTTGTCACC-CTGCTTGACGAAA
gi|115278 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGAT-ACATAGACTG----GT-TT-T-T-A-CG---ATGA-A-CAAAAT-C------TT--A-ATCTTCC----A--------TGACAGCTTTGTCACC-CTGCTTGACGAAA
gi|115292 : tTTTC-T-CCCCTTTCTGTTC----TTGGA---AGAT-AAT------G----GT-TT-T-CTC-CC---AT------------T------TC--T-G-CTCATGGAAAT-GTCACATGACAGATTTCTCACG-TGACCTGATGAAAAT
gi|115276 : TTTCAT-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGAT-ACT------G----GT-TT-T-C-T-CC---
gi|115280 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCAA--AAAAA---AGAT-ACA------G----GC-TT-T-C-C-CCTTGATGG-A-cctt
gi|115294 : tTTC-C-TTCATTTCTGTTC----ATAGA---AGAT-ACA------G----AT-TT-T-C-C-CC---ACGG-A-GGAAAA-T------AC--T-ATCTTCT----AT-GTCACGTGATAGCTTACGCACA-TGGCCTGACGAAAAT
gi|115295 : TTC-T-CCCATTTCTGTGC----ATTTA---AGAT-ACA------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATAA-A-GGAAAA-C------TCTTT-ATCTTCC----AT-GTCACATGAGCTCTTTCTTGCT-TGGCCTGACAAAAA
gi|115296 : TTC-T-TTCATTTCTGCTA----GTAGA---AGAT-ACA------G----AT-TT-T-C-A-CC---ATGG-A-G
gi|115266 : TC-T-CCAATTTCGGCTC----ATGGA---AGAT-ACG------G-----T-TT-T-C-C-CA---TTGG-A-AGAA---T------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACGTGACAGCTTTCTCACA-CGACCTGACAAAAttatataagaatcttacat
gi|115297 : ttgTC-T-CTCATTTTTGATC----ATAGA---AAAT-ATA------G----GC-TT-T-C-C-TC---ATGG-A-GGAAAA-C------------A-CTTCC----AT-GTCTGGTGACACCTTTCTCACA-TTACCTGACGGAAAT
gi|115298 : TTTCTGCTC----ATAGA---AGAT-ACA------G----GT-TT-T-C-C-CC---ATGT-A-GGAAAT-T------GA--T-ATCTTCC----AT-GACACATGACATCTTTCT------GGCCTGA
gi|115299 : TTATGCTC----ATAGA---ATAT-ACG------G----ATCTT-T-C-C-CT---ATGG-A-GGAAAC-A------TC--T-ATTTTAC----AT-GACACGTGACAGCTTTCTCACA-CGACATGACGAAAATtctgacaaatat
gi|115265 : CC----ATGTA---GGAT-A-G------A----GT-TT-T-CAT-CC---ATTA-A-CGAAAC-C------CA--T-ATCTTCT----AT-GTCA
gi|115275 : ttttctcccatttctgctcCC----ATGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CTCC---ATGGAA-AAAAAA-CA-----TC--T-ATcacgtgagagctttctcacatgacctgacaaaaat
gi|115285 : ttttctcctatttctgctcC----ATGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CTCC---ATTG---GGAAAA-C------CCA-C-AGCTTCT----AT-cacgagacagttt
gi|115284 : tttctcccatttctgctcC----ATAGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CTTC---ATGG---GGAAAC-C------CG--T-ATCTTCT----Atcacgtgatagctttctcacattacctgatgaaaat
gi|115283 : tttctcccatttcttctcgC----ATGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-CGT-CC---GTGG-G-GAAAAC-C------CC--T-ATCTTCC----AT-tcacatgatagctttctcacatggccagacaaaaat
gi|115286 : tttctcccatttctgctcC----ATGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CTCC---ATGG---GGAAAT-C------CCG-T-ATCTTCT----AT-tcacataacagcttcctcacatgacctgatgaaaat
gi|115261 : tttctgctcatttctactcC----ATGGA---ATAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CTCC---ATGG-G-GAAAAG-C------TG--T-ATCTTCC----AT-ctacgtgatagctttctcacgtgacctgacaaaa
gi|115294 : ttttctcccatttctactcC----ATAGA---AGAT-A-G------T----AT-TT-T-C-CTCC---GTGG-G-GAAAAT-C------TG--T-ATCTTCT----AT-tcatgtgatagtcttcacacatgacctgacaaaaat
gi|115262 : ttccttcatttctgttcC----ATGGA---AGAT-GTA------G----TT-TT-T-CGT-CC---ATGG---GGAAAA-C------CCA-T-ATTTTCtcacgtgatagcttacgcacatggcctgacgaaaat
gi|115264 : ttttctccaagttctgctcaaaC----ATGGA---AGAT------------------TT-T-C-T-CC---ATGG-G-GAAAAC-C------TG--T-ATCTTCT----AT-tcacgtgacagctttctcacatgacctgatgaaaat
gi|115287 : ttttctcccatttctgctcC----ATGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-TGC-T-CC---ATGG-G-GGAAAACC------TG--T-ATCTTC------T-ATCAtcatgtgacagctttgtcaaatagcctgacgaaaa
gi|115289 : tttctcccatttctacttC----ATGGA---AGAT-AGA------T----AT-TT-C-C-T-CC---ATGG---GGAAAA-C------CCG-T-ATCCTacatgtgacacctttctcacatgacctgacaaaaa
gi|115267 : tttctcacatttctgttcatatattC----ATGGA---ATAT-A-G------A----GT-TT-T-C-T-TC----CGT-A-GGAAAC-C------GT--T-ATCTTCT----AT-tcacgtgacagttctctcatatgacatgatgaaaat
gi|115291 : tttttccccatttctaatcC----ATGGA---AGAG-A-G------A----AC-TT-T-C-CTCC---ATG--A-GGAAAA-C------ACA-T-GTCTTCT----AT-tcacgtgacagtttctcacatgacctgacgaaaat
gi|115266 : tttcttcaatttctgctcC----ATGGA---AGAT-A-G------A----AT-TC-T-T-C-CA---ATGG----GAAAA-C------CG--T-ATCTTCC----AT-tcatgacacagctttctcacatgacctcacaaaaat
gi|115295 : ttgtctccaatttcggctcC----ATGGA---AGATAAAG------A----GT-TT-T-C-CTTT---ATGG-G-GAAAAC-C------TG--T-ATCTTtcacgtgacagctttctcacacgacctgacaaaa
gi|115272 : ttctcccatttctgtgcatttC----ATGAA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-TTCC---ATGG---GGAAAA-C------tcacatgagctctttcttgcttggcctgacaaaaa
gi|115298 : tttcctcttcagctcataaaagC----ATGGA---AGAT-ATC------A----AT-TT-C-C-T-AC---ATGG-G-GAAAAC-C------TG--T-ATCTTCT----AT-tgacattataccttcctcacgtggcctgacaaaaat
gi|115290 : tttctgctc----ATGGA---A--T-GCA------T----GT-AT-T-C-CTCC---ATGG-A--GAAAA-C------CCG-T-ATCTTCT----AT-acacatgacatctttctggcctgatctgacaaatat
gi|115300 : tttctttcatttcagtcc----ATGGG---AGAA-ACG------G----GG-TT-T-C-C-CC---ATGG-A-AGTAAA-C------TC--TTATCATCC----AT-GTCATGTGACAGCTTTTTCACA-TGATTTGACGAAAAattccatgtcatgtgacagctttctcacatgaccggacgaaaa
gi|115269 : TGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CGTT---ATGG-A-GAAAAT-C------CG--T-ATCTTCT----AT-
gi|115270 : ttttcttccagttctgctcTGGA---AGAT-A-G------A----GT-TT-T-C-CGTT---ATGG-A-GAAAAT-C------CG--T-ATCTTCT----AT-ggacttgagacatctttctcacatgggcttacgaaaat
gi|115271 : ttttcttccagttctgctcTGGA---AGAT-CAG------A----GT-TT-T-C-CTCC---ATTG---GAAAAG-C------CCT-T-ATCTTTT----AT-ggacttgagacatctttctcacataggcttacgaaaat
gi|115297 : ttttctcacatttcatctc---AGAC-ATG------GAAGTGT-TT-T-C-CTCC---ATG--A-GGAAAGCC------TA--T-ATTTTCT----ATGATCAccctgtgacatctttcacacatgacccgacaaaaat
gi|115277 : tctctcatttt---AGAT-AGA------G----AT-TT-C-C-T-CC---ATGG---GGAAAG-C------CT--T-ATCTTCggtgacacctttctcacattacctgacggaaat
gi|115301 : ttttcttccatttctgctttaaTGG-A-G-AAAA-C------TC--T-ATTTCCC----AT-GTCACGAAACAGCTTTCTCACG-TGAACTGACGAAAATcaca
gi|115302 : ct------TC--T-ATCTTCC----AT-GTCACGTGACAGCTTTCTTACA-CGACCTGACCAAAGT
gi|115303 : -ATCTTCC----AT-GTCACGTGGTAGCTTTCTCTCA-TGGTCTGACGAAAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1 4444 3 111 888888 1 1 1 222 1 333333 11 2 2222
lowQualScore : . . .... . ... ...... . . . ... . ...... .. . ....
lowQualScore : 1 1 9999 8 888 666666 0 0 0 888 0 111111 55 1 3333
consensus : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
Reference ( family-515 ) : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115261 : TTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATGGA---AGATACA------GCT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCATGTGATAGTCTTCACACATGACCTGACAAAAAT
gi|115262 : tTTTC-T-CCAAGTTCTGCTC----AAAGA---AAATATG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGACGAAAAAC------TA--C-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115263 : tTTTC-T-CATATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-CC-CCC---ACGGA-GGAA
gi|115264 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GAAA---------------ATCTTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTGTCAAATAGCCTGACGAAAA
gi|115265 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCTGACATAGA---AGATATG------GGT-TT-CG-TTA---ATGGA-TGAAAAC------TC--T-ATCCTAC----ATGGCACGTGAGAGCTTTCTCACATGACCTGACAAAAAT
gi|115266 : tTC-T-CCAATTTCGGCTC----ATGGA---AGATACG------G-T-TT-TC-CCA---TTGGA-AGAA--T------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACACGACCTGACAAAA
gi|115267 : ttgTTTT-C-CCCATTTCTAATC----ATAGA---AGATAAC------GGT-TT----CCT---ACGGA-AGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCACGTGACAG-TTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115268 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATATA---AGATACG------GGT-TTCTC-ACA---ATGTA-GGAAATC------GC--T-AGCTTTC----ATGTCACGTGAGAGCTTTTTCATATGACCTGACAAAAAT
gi|115269 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATGGGCTTACGAAAAT
gi|115270 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATAGGCTTACGAAAAT
gi|115271 : tTTTC-T-CACATTTCATCTC----ATAAA---AGATAAG------GGC-TT-TT-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--TGATCTTCC----A--CCCTGTGACATCTTTCACACATGACCCGACAAAAAT
gi|115272 : tTTCC-T-C----TTCAGCTC----ATAAA---AG------------GT-TT-TC-CCC---ATGGA-AGAAAAC------TC--T-ATCTTTC----ATGTGACATTATACCTTCCTCACGTGGCCTGACAAAAAT
gi|115273 : tTTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATAGA---A-ATACG------GGT-TT-TC-CAC---A------------------------------C----ATGACATGTGACAGCTTTCTCACATGACATGACGAA
gi|115274 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---GTGAA-GAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115275 : tTTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAGA---TGTT-----------T-TT-TT-TCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGGCACGAGACAGTTT
gi|115276 : tTTTCAT-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATACT------GGT-TT-TC-TCC---
gi|115277 : tTTTC-T-TCCATTTCTGCTT----TAAGA---AGATA-A------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATC------TC--T-ATCTcctt
gi|115278 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAAcaca
gi|115279 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115280 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCAA--AAAAA---AGATACA------GGC-TT-TC-CCCTTGATGGA-
gi|115281 : tTTTT-C-CCCATTTCTGCTC----ACAAA---AGATACA------GGT-TT-TC-AAC---ATGGC-GGAAAA-------------A-CTTCA----ATGTCATGTGTCGGCTTTCTAAC
gi|115282 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATATCACGTGATAGCTGTCTCACAGGGCTTGACGAAAAT
gi|115283 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATAGG------GGT-TT-TC-CCC---ACGGA-CGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACATAACAGCTTCCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115284 : TTTC-T-CCCATTTCTTCTC----GTAGA---AGATACG------GGT-TT--C-CCC---ATGAA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCT----ATGTCACATGATAGCTTTCTCACATGGCCAGACAAAAAT
gi|115285 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGCTGTG------GGT-TT-TC-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGATAGCTTTCTCACATTACCTGATGAAAAT
gi|115286 : TTTC-TGCTCATTTCTACTC----ATAGA---AGATACG------GGA-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGCTACGTGATAGCTTTCTCACGTGACCTGACAAAA
gi|115287 : TTTC-T-CCCATTTCTACTTTG--ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCCC--ATGGA-GCAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGACATGTGACACCTTTCTCACATGACCTGACAAAAA
gi|115288 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---ATATACA------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGTAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTAACATGATTGCTTTCTAACATGGTCTGACGAAAAT
gi|115289 : TTTC-T-CACATTTCTGTTC----ATATATTAGGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATA------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGTTCTCTCATATGACATGATGAAAAT
gi|115290 : TTTC-T-TTCATTTCAGTCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-TCC---ATGGA-GGAATACATGCATTC--C-ATATTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTCTCACATGACCGGACGAAAA
gi|115291 : TTTC-T-TCAATTTCTGCTC----ATAGA---AGACATG------TGT-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAGT------TC--T-CTCTTCC----ATGTCATGACACAGCTTTCTCACATGACCTCACAAAAAT
gi|115292 : TTTC-T-CCCCTTTCTGTTC----TTGGA---AGATAAT------GGT-TT-TCTCCC---AT----------T------TC--T-G-CTCATGGAAATGTCACATGACAGATTTCTCACGTGACCTGATGAAAAT
gi|115293 : TTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAAA---CGATACG------AGT-TT-TC-CCC---GTGGA-GGAA
gi|115294 : TTC-C-TTCATTTCTGTTC----ATAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-CCC---ACGGA-GGAAAAT------AC--T-ATCTTCT----ATGTCACGTGATAGCTTACGCACATGGCCTGACGAAAAT
gi|115295 : TTC-T-CCCATTTCTGTGC----ATTTA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATAAA-GGAAAAC------TCTTT-ATCTTCC----ATGTCACATGAGCTCTTTCTTGCTTGGCCTGACAAAAA
gi|115296 : TTC-T-TTCATTTCTGCTA----GTAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-ACC---ATGGA-G
gi|115297 : TC-T-CTCATTTTTGATC----ATAGA---AAATATA------GGC-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAAC------------A-CTTCC----ATGTCTGGTGACACCTTTCTCACATTACCTGACGGAAATttatataagaatcttacat
gi|115298 : TTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGTA-GGAAATT------GA--T-ATCTTCC----ATGACACATGACATCTTTCTGGCCTGATCTGACAAATAT
gi|115299 : TTATGCTC----ATAGA---ATATACG------GATCTT-TC-CCT---ATGGA-GGAAACA------TC--T-ATTTTAC----ATGACACGTGACAGCTTTCTCACACGACATGACGAAAAT
gi|115300 : ----ATGGG---AGAAACG------GGG-TT-TC-CCC---ATGGA-AGTAAAC------TC--TTATCATCC----ATGTCATGTGACAGCTTTTTCACATGATTTGACGAAAA
gi|115301 : TGGA-G-AAAAC------TC--T-ATTTCCC----ATGTCACGAAACAGCTTTCTCACGTGAACTGACGAAAAT
gi|115302 : ct------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTTACACGACCTGACCAAAGT
gi|115303 : -ATCTTCC----ATGTCACGTGGTAGCTTTCTCTCATGGTCTGACGAAAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1 4444 111 888888 1 1 1 222 1 333333 11 2 2222
lowQualScore : . . .... ... ...... . . . ... . ...... .. . ....
lowQualScore : 1 1 9999 888 666666 0 0 0 888 0 111111 55 1 3333
consensus : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
Reference ( family-515 ) : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115261 : TTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATGGA---AGATACA------GCT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCATGTGATAGTCTTCACACATGACCTGACAAAAAT
gi|115262 : tTTTC-T-CCAAGTTCTGCTC----AAAGA---AAATATG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGACGAAAAAC------TA--C-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115263 : tTTTC-T-CATATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-CC-CCC---ACGGA-GGAA
gi|115264 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GAAA---------------ATCTTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTGTCAAATAGCCTGACGAAAA
gi|115265 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCTGACATAGA---AGATATG------GGT-TT-CG-TTA---ATGGA-TGAAAAC------TC--T-ATCCTAC----ATGGCACGTGAGAGCTTTCTCACATGACCTGACAAAAAT
gi|115266 : tTC-T-CCAATTTCGGCTC----ATGGA---AGATACG------G-T-TT-TC-CCA---TTGGA-AGAA--T------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACACGACCTGACAAAA
gi|115267 : ttgTTTT-C-CCCATTTCTAATC----ATAGA---AGATAAC------GGT-TT----CCT---ACGGA-AGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCACGTGACAG-TTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115268 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATATA---AGATACG------GGT-TTCTC-ACA---ATGTA-GGAAATC------GC--T-AGCTTTC----ATGTCACGTGAGAGCTTTTTCATATGACCTGACAAAAAT
gi|115269 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATGGGCTTACGAAAAT
gi|115270 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATAGGCTTACGAAAAT
gi|115271 : tTTTC-T-CACATTTCATCTC----ATAAA---AGATAAG------GGC-TT-TT-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--TGATCTTCC----A--CCCTGTGACATCTTTCACACATGACCCGACAAAAAT
gi|115272 : tTTCC-T-C----TTCAGCTC----ATAAA---AG------------GT-TT-TC-CCC---ATGGA-AGAAAAC------TC--T-ATCTTTC----ATGTGACATTATACCTTCCTCACGTGGCCTGACAAAAAT
gi|115273 : tTTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATAGA---A-ATACG------GGT-TT-TC-CAC---A------------------------------C----ATGACATGTGACAGCTTTCTCACATGACATGACGAA
gi|115274 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---GTGAA-GAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115275 : tTTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAGA---TGTT-----------T-TT-TT-TCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGGCACGAGACAGTTT
gi|115276 : tTTTCAT-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATACT------GGT-TT-TC-TCC---
gi|115277 : tTTTC-T-TCCATTTCTGCTT----TAAGA---AGATA-A------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATC------TC--T-ATCTcctt
gi|115278 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAAcaca
gi|115279 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115280 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCAA--AAAAA---AGATACA------GGC-TT-TC-CCCTTGATGGA-
gi|115281 : tTTTT-C-CCCATTTCTGCTC----ACAAA---AGATACA------GGT-TT-TC-AAC---ATGGC-GGAAAA-------------A-CTTCA----ATGTCATGTGTCGGCTTTCTAAC
gi|115282 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATATCACGTGATAGCTGTCTCACAGGGCTTGACGAAAAT
gi|115283 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATAGG------GGT-TT-TC-CCC---ACGGA-CGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACATAACAGCTTCCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115284 : TTTC-T-CCCATTTCTTCTC----GTAGA---AGATACG------GGT-TT--C-CCC---ATGAA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCT----ATGTCACATGATAGCTTTCTCACATGGCCAGACAAAAAT
gi|115285 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGCTGTG------GGT-TT-TC-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGATAGCTTTCTCACATTACCTGATGAAAAT
gi|115286 : TTTC-TGCTCATTTCTACTC----ATAGA---AGATACG------GGA-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGCTACGTGATAGCTTTCTCACGTGACCTGACAAAA
gi|115287 : TTTC-T-CCCATTTCTACTTTG--ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCCC--ATGGA-GCAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGACATGTGACACCTTTCTCACATGACCTGACAAAAA
gi|115288 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---ATATACA------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGTAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTAACATGATTGCTTTCTAACATGGTCTGACGAAAAT
gi|115289 : TTTC-T-CACATTTCTGTTC----ATATATTAGGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATA------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGTTCTCTCATATGACATGATGAAAAT
gi|115290 : TTTC-T-TTCATTTCAGTCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-TCC---ATGGA-GGAATACATGCATTC--C-ATATTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTCTCACATGACCGGACGAAAA
gi|115291 : TTTC-T-TCAATTTCTGCTC----ATAGA---AGACATG------TGT-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAGT------TC--T-CTCTTCC----ATGTCATGACACAGCTTTCTCACATGACCTCACAAAAAT
gi|115292 : TTTC-T-CCCCTTTCTGTTC----TTGGA---AGATAAT------GGT-TT-TCTCCC---AT----------T------TC--T-G-CTCATGGAAATGTCACATGACAGATTTCTCACGTGACCTGATGAAAAT
gi|115293 : TTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAAA---CGATACG------AGT-TT-TC-CCC---GTGGA-GGAA
gi|115294 : TTC-C-TTCATTTCTGTTC----ATAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-CCC---ACGGA-GGAAAAT------AC--T-ATCTTCT----ATGTCACGTGATAGCTTACGCACATGGCCTGACGAAAAT
gi|115295 : TTC-T-CCCATTTCTGTGC----ATTTA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATAAA-GGAAAAC------TCTTT-ATCTTCC----ATGTCACATGAGCTCTTTCTTGCTTGGCCTGACAAAAA
gi|115296 : TTC-T-TTCATTTCTGCTA----GTAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-ACC---ATGGA-G
gi|115297 : TC-T-CTCATTTTTGATC----ATAGA---AAATATA------GGC-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAAC------------A-CTTCC----ATGTCTGGTGACACCTTTCTCACATTACCTGACGGAAATttatataagaatcttacat
gi|115298 : TTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGTA-GGAAATT------GA--T-ATCTTCC----ATGACACATGACATCTTTCTGGCCTGATCTGACAAATAT
gi|115299 : TTATGCTC----ATAGA---ATATACG------GATCTT-TC-CCT---ATGGA-GGAAACA------TC--T-ATTTTAC----ATGACACGTGACAGCTTTCTCACACGACATGACGAAAAT
gi|115300 : ----ATGGG---AGAAACG------GGG-TT-TC-CCC---ATGGA-AGTAAAC------TC--TTATCATCC----ATGTCATGTGACAGCTTTTTCACATGATTTGACGAAAA
gi|115301 : TGGA-G-AAAAC------TC--T-ATTTCCC----ATGTCACGAAACAGCTTTCTCACGTGAACTGACGAAAAT
gi|115302 : ct------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTTACACGACCTGACCAAAGT
gi|115303 : -ATCTTCC----ATGTCACGTGGTAGCTTTCTCTCATGGTCTGACGAAAAT
blockSeqs : A G TGAC TTA TAGACT C C T TTG C ATGCAT TT G GGAA
blockSeqs : . . AA . TAGACT . . . C . . . T .
blockSeqs : . . TG . TAGACT . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
finalCons : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
Alignments
lowQualScore : 1 1 4444 111 888888 1 1 1 222 1 333333 11 2 2222
lowQualScore : . . .... ... ...... . . . ... . ...... .. . ....
lowQualScore : 1 1 9999 888 666666 0 0 0 888 0 111111 55 1 3333
consensus : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
Reference ( family-515 ) : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115261 : TTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATGGA---AGATACA------GCT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCATGTGATAGTCTTCACACATGACCTGACAAAAAT
gi|115262 : tTTTC-T-CCAAGTTCTGCTC----AAAGA---AAATATG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGACGAAAAAC------TA--C-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115263 : tTTTC-T-CATATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-CC-CCC---ACGGA-GGAA
gi|115264 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GAAA---------------ATCTTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTGTCAAATAGCCTGACGAAAA
gi|115265 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCTGACATAGA---AGATATG------GGT-TT-CG-TTA---ATGGA-TGAAAAC------TC--T-ATCCTAC----ATGGCACGTGAGAGCTTTCTCACATGACCTGACAAAAAT
gi|115266 : tTC-T-CCAATTTCGGCTC----ATGGA---AGATACG------G-T-TT-TC-CCA---TTGGA-AGAA--T------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTCACACGACCTGACAAAA
gi|115267 : ttgTTTT-C-CCCATTTCTAATC----ATAGA---AGATAAC------GGT-TT----CCT---ACGGA-AGAAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTCACGTGACAG-TTTCTCACATGACCTGACGAAAAT
gi|115268 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATATA---AGATACG------GGT-TTCTC-ACA---ATGTA-GGAAATC------GC--T-AGCTTTC----ATGTCACGTGAGAGCTTTTTCATATGACCTGACAAAAAT
gi|115269 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATGGGCTTACGAAAAT
gi|115270 : tTTTC-T-TCCAGTTCTGCTC----ATAGA---AGATACG------GAT-TT-TC-TCC---ATAAC-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----AGGACTTGAGACATCTTTCTCACATAGGCTTACGAAAAT
gi|115271 : tTTTC-T-CACATTTCATCTC----ATAAA---AGATAAG------GGC-TT-TT-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--TGATCTTCC----A--CCCTGTGACATCTTTCACACATGACCCGACAAAAAT
gi|115272 : tTTCC-T-C----TTCAGCTC----ATAAA---AG------------GT-TT-TC-CCC---ATGGA-AGAAAAC------TC--T-ATCTTTC----ATGTGACATTATACCTTCCTCACGTGGCCTGACAAAAAT
gi|115273 : tTTTC-T-CCCATTTCTACTC----ATAGA---A-ATACG------GGT-TT-TC-CAC---A------------------------------C----ATGACATGTGACAGCTTTCTCACATGACATGACGAA
gi|115274 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---GTGAA-GAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115275 : tTTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAGA---TGTT-----------T-TT-TT-TCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGGCACGAGACAGTTT
gi|115276 : tTTTCAT-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATACT------GGT-TT-TC-TCC---
gi|115277 : tTTTC-T-TCCATTTCTGCTT----TAAGA---AGATA-A------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATC------TC--T-ATCTcctt
gi|115278 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAAcaca
gi|115279 : tTTTC-T-CCCATTTCTGTGC----GAAGA---AGATACATAGACTGGT-TT-TT-ACG---ATGAA-CAAAATC------TT--A-ATCTTCC----A-------TGACAGCTTTGTCACCCTGCTTGACGAAA
gi|115280 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCTCAA--AAAAA---AGATACA------GGC-TT-TC-CCCTTGATGGA-
gi|115281 : tTTTT-C-CCCATTTCTGCTC----ACAAA---AGATACA------GGT-TT-TC-AAC---ATGGC-GGAAAA-------------A-CTTCA----ATGTCATGTGTCGGCTTTCTAAC
gi|115282 : tTTTC-T-CCCATTTCTGCCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATATCACGTGATAGCTGTCTCACAGGGCTTGACGAAAAT
gi|115283 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATGGA---AGATAGG------GGT-TT-TC-CCC---ACGGA-CGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACATAACAGCTTCCTCACATGACCTGATGAAAAT
gi|115284 : TTTC-T-CCCATTTCTTCTC----GTAGA---AGATACG------GGT-TT--C-CCC---ATGAA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCT----ATGTCACATGATAGCTTTCTCACATGGCCAGACAAAAAT
gi|115285 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---AGCTGTG------GGT-TT-TC-CCA---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGATAGCTTTCTCACATTACCTGATGAAAAT
gi|115286 : TTTC-TGCTCATTTCTACTC----ATAGA---AGATACG------GGA-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGCTACGTGATAGCTTTCTCACGTGACCTGACAAAA
gi|115287 : TTTC-T-CCCATTTCTACTTTG--ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCCC--ATGGA-GCAAAAC------TC--T-ATCTTCC----ATGACATGTGACACCTTTCTCACATGACCTGACAAAAA
gi|115288 : TTTC-T-CCCATTTCTGCTC----ATAGA---ATATACA------GGC-TT-TC-CCC---ATGGA-GGTAAAC------TC--T-ATATTCC----ATGTAACATGATTGCTTTCTAACATGGTCTGACGAAAAT
gi|115289 : TTTC-T-CACATTTCTGTTC----ATATATTAGGATACG------GGT-TT-TC-CCC---ATGGA-GGAAATA------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGTTCTCTCATATGACATGATGAAAAT
gi|115290 : TTTC-T-TTCATTTCAGTCC----ATAGA---AGATACG------GGT-TT-TC-TCC---ATGGA-GGAATACATGCATTC--C-ATATTCC----ATGTCATGTGACAGCTTTCTCACATGACCGGACGAAAA
gi|115291 : TTTC-T-TCAATTTCTGCTC----ATAGA---AGACATG------TGT-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAGT------TC--T-CTCTTCC----ATGTCATGACACAGCTTTCTCACATGACCTCACAAAAAT
gi|115292 : TTTC-T-CCCCTTTCTGTTC----TTGGA---AGATAAT------GGT-TT-TCTCCC---AT----------T------TC--T-G-CTCATGGAAATGTCACATGACAGATTTCTCACGTGACCTGATGAAAAT
gi|115293 : TTTC-T-CCTATTTCTGCTC----ATAAA---CGATACG------AGT-TT-TC-CCC---GTGGA-GGAA
gi|115294 : TTC-C-TTCATTTCTGTTC----ATAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-CCC---ACGGA-GGAAAAT------AC--T-ATCTTCT----ATGTCACGTGATAGCTTACGCACATGGCCTGACGAAAAT
gi|115295 : TTC-T-CCCATTTCTGTGC----ATTTA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATAAA-GGAAAAC------TCTTT-ATCTTCC----ATGTCACATGAGCTCTTTCTTGCTTGGCCTGACAAAAA
gi|115296 : TTC-T-TTCATTTCTGCTA----GTAGA---AGATACA------GAT-TT-TC-ACC---ATGGA-G
gi|115297 : TC-T-CTCATTTTTGATC----ATAGA---AAATATA------GGC-TT-TC-CTC---ATGGA-GGAAAAC------------A-CTTCC----ATGTCTGGTGACACCTTTCTCACATTACCTGACGGAAATttatataagaatcttacat
gi|115298 : TTTCTGCTC----ATAGA---AGATACA------GGT-TT-TC-CCC---ATGTA-GGAAATT------GA--T-ATCTTCC----ATGACACATGACATCTTTCTGGCCTGATCTGACAAATAT
gi|115299 : TTATGCTC----ATAGA---ATATACG------GATCTT-TC-CCT---ATGGA-GGAAACA------TC--T-ATTTTAC----ATGACACGTGACAGCTTTCTCACACGACATGACGAAAAT
gi|115300 : ----ATGGG---AGAAACG------GGG-TT-TC-CCC---ATGGA-AGTAAAC------TC--TTATCATCC----ATGTCATGTGACAGCTTTTTCACATGATTTGACGAAAA
gi|115301 : TGGA-G-AAAAC------TC--T-ATTTCCC----ATGTCACGAAACAGCTTTCTCACGTGAACTGACGAAAAT
gi|115302 : ct------TC--T-ATCTTCC----ATGTCACGTGACAGCTTTCTTACACGACCTGACCAAAGT
gi|115303 : -ATCTTCC----ATGTCACGTGGTAGCTTTCTCTCATGGTCTGACGAAAAT