lowQualScore : 111 222222222222222
lowQualScore : 888 2 66666 999999 3 777 6666666 2 1 111 1 1 666666666666666 11 2222 9999 11 1 0 4444444 66 222 9 333 1 1 999 4 9999
lowQualScore : ... . ..... ...... . ... ....... . . ... . . ............... .. .... .... .. . . ....... .. ... . ... . . ... . ....
lowQualScore : 444 7 00000 666666 8 777 8888888 9 9 888 0 0 555555555555555 44 5555 2222 55 1 8 7777777 11 111 4 222 2 2 777 4 4444
consensus : ACAGTTTCA-GTTT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGG-CAATACA-CAA---T-TGCCTNTGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
Reference ( gi|132843 ) : ACAGTTTCA-GCTT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132844 : ACAATATCA-GTTT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AT--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132845 : ACAGTTTCA-GTTT-CA--G--TTTAATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TATCTACGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACT---G-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132847 : ACAGTTTCA-AATG-AA--G--TTTTATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCTGTGAC---CG-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATTGGTAA
gi|132846 : ACAGTTTCA-GTTT-CA--G--TTTTAT-GGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCTATGAC---CA-TTTACAA---AA---AAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-TA-T---AA-A----CATAGTTAA
gi|132848 : ATAGTTTCA-GTTT-CA--G--TTGTATTGGCA------------ATACA-CAAGGGC-CGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGGTAA
gi|132849 : ACAATTTCA-GTTT-CA--T--TGTTATTGGCA---TAACGA-CAATACA-TAT---T-TTTCTGTGGT---CA-TTTAC-A---AT---GTTT--AT--TA---AAA-C--AA--ATGTGG-CAAA------GACAT-AAA---A-T---A-TA-T---AA-A----TATA
gi|132850 : ATAGTTTCA-GTTT-CG--G--TTC-ATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CTA---T-TGCTTATGGC---TA-TTTAT-ATATAT---GGAT--AT--TT---ATA-T--AA--ATACGG-CATACTATATAATACAACA---A-T---A-T
gi|132851 : ATAATTTCAAGTTT-CA--A--GTTTGTT----------CAG-CAAT-CAGCAAATTT-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---AA---G------T--TTTACAAA-G--AA--ATATGG-CAAA------AACA
gi|132853 : CAGTTTCA-ATTC-CC--G--TTTTATTTGCA---TAATGA-AAATATA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAA-A---CT---GGAT--AT--TT---AAA-C--AA--AGATGG-CATA------G--AC-ACA---A-T---A-TA-A---AC-A----CATGGGTAA
gi|132858 : AATTTCAAGTTT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAG-CAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATTCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132859 : AGTTTCAAGTTT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAG-CAA---A-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATTCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132861 : AGTTTCAAGTTTACAA-G--TTTTATTAGCA---TATCGG-CA--ACA-GAA-----TGCCTTTGGT---CA-TTTAC-A---A-----AAT--ATTATT---ACA-TG-AG--ATATAG-AAAA------GACAT-ACA---A-T-----TA-C---AA-A-----AT-GATA
gi|132865 : TTTCA-AATT-CA--AATTTTTATTGGCAATTTA--GG-CAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---AA---G--T---C--TT---AAA-T--AA--ATATGG-C--C------AAGAC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132862 : TTTCA-A-TT-CA--A--TTTTATTGGCA----AACAATCAGCAAA-CAT---A-TGCCTTTGGC---CA-CTTAC-----------AAT--AT--TT---ATA----AATCATATGG-CAAA------GACATGACA---A-TTACA-TA-TTTGAA-A----CATA
gi|132866 : aTTTCA-ATTT-TAAAG--TTTTACTTGTA---AATCGG-CAATA----AA---A-TGCCATTGGT---CA-TTTAC-A---AA---ATAA--AA--TT---AAA-TG-AG--ATATGG-CA-A------AGAAA-ACA---A-T---A-TA-T------A----CAAAAATA
gi|132867 : TTTA-G-TT-CA--G--TTT-ATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TC---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATACGTAA
gi|132854 : TTCA-AATT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGG-CAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---TA-TTTAC-A---AA---G--T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGCCATA------
gi|132855 : caaaTTCA-AATT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGG-CAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---AA---G--T--TT--TT---AAA-T--AA--ATAT
gi|132860 : caaaTTCA-A-TT-CA--A--TTTTATTGGCA----AACTATCAGTA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---A-----TAT--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132852 : aaaTTCA-A-TT-CA--A--TTTTATTGGCA----AACTATCAACA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---A-----TAT--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132857 : acaattcaaTTCA-A-TT-CA--A--TTTTATTGGCA----AACTATCAGCA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---A-----TAT--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132863 : caaTTCAAGTTT-CA--A--TTTTATTGACA---TAACGA-CACTACA-CAA---T-T
gi|132864 : aTTCAAGTTT-CA--A--TCTGATTGACA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-T
gi|132869 : aTCA-GTTT-CA--G--TTTTATTGAC----------------CA--AA---C-TGCTAGTAGC---CA-TTAAC-A---AT---GTAT--AT--CA---AAA-C--AA--ATACCG-CATG------TATAT-ACA---T-T---A-TA-T---AT-A----CATAGGT
gi|132870 : CA-GTTT-CA--G--TTTGATTGGCC---TAACCA-CAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-C---AA---TAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-AT-T---TA-A----CATAGGT
gi|132871 : A-GTTT-CA--A--GTTTATTGGCA---TTTCAG-CAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATTCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------TACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132873 : A-GTTTACA--A--GTTTATTGGCA---TATCAG-CAAAATA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATTCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACACTTA-T---A-TG-T-----------CATA
gi|132875 : TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAG-CAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATTCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132877 : TT-CA--G--TTTTATATGTA---TAACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCGATGGCATACACTTTAT-A---AA---
gi|132876 : TT-CA--G--TTTTATTGACA---TAACGA-CAATACA-CAG---T-TGCCTATG-----TA-CTCAT-A---------AAC--AG--TC---AAA-C--A
gi|132879 : A--G--TTTTATTGGCA---TAACGA-CAATACA-CAG---T-TGCCTATG
gi|132880 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGG-TAAAACA-T-----T-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---AA---G--T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG---TC------AAGAC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132881 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGG-CAA---A-TAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-A---AA---G--T---T--TT---AGA-T--AA--ATATGG-C--C------AAGAC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132878 : A--A--TTTTATTGACAA--TTTCGG-CTA-ACA-TAT---T-TGCCTTTGGG---CA-TTTAC-A---AA---G--T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-C--C------AAGAC-ACA---A-A---A-CA-C---AA-A----CA
gi|132882 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGG-CAA---A-CAT---G-TGCTTTTGGC---CA-TTTAC-A---AT---G--T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-C--C------AAGAC-ACA---A-T---A-CA-C---A
gi|132872 : TTTATTGACA---TATCAG-CAA---A-TAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AAATCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-T
gi|132883 : agtttataagTTTATTGGCA---TATCAG-CAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---CATCCAAATTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ACT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132874 : TTTATTAACA---TATCAT-CAAT----TAA---A-TGCTTATGGC---CA-TTTAC-A---AATC-GAA---AT-------AAA-CTCAA--ATATGG-CATA------GACAA-ACA---A-TA--A-TATT---AA-A----TACAAA
gi|132868 : agtttacacgTTTATTAGCA---ACTCGG-CAAGACA-TAAAATT-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC-----------AAT--AA--TT---ACA-G--AA--ATATGG-C--A------AACAC-A-A---T-T---A-TA-T---A
gi|132856 : tccagtatttcaaagTTATTGGCA---TAACGA-TAATAAA-TAA---T-TACCAATAGT---CA-TACAC-A---TT---GAAT--TT--TT---AAATC--AA--ACAATA-CTTA------AACAA-ACA---A-C---A-TA-----AA-T----CATAAAGAA
gi|132884 : caaattcacattcgaagTACTGGCA---TATCAG-CA---TA-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAC-A---AATTCCAATTAAT--T--------C--AA--ATATGA-CATA------GACAT-ACA---A-A---ATTA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132885 : AACGA-CAATACA-CAA---T-TGCCAATGGC---CA-TTTAC-A---AA---GAAT--AT--TT---AAT-C--AA--ATATGG-CTTA------GACAC-AGA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATGGGTAA
Alignments
lowQualScore : 111 2222222222222222 1111 1
lowQualScore : 7 11 4 66666 000 2 8 1 5555555 2 1 111 1 5555555555555555 11 111 0000 11 2 2 333333 5 222 0 333 1 1 999 4 9999
lowQualScore : . .. . ..... ... . . . ....... . . ... . ................ .. ... .... .. . . ...... . ... . ... . . ... . ....
lowQualScore : 7 66 7 88888 777 9 6 0 7777777 8 0 888 0 2222222222222222 44 888 0000 44 2 1 111111 7 000 3 111 1 2 444 3 1111
consensus : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
Reference ( family-512 ) : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTNTGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132843 : ACAGTTTCA-GC--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132844 : ACAATATCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AT--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132845 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTAATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TATCTACGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACT---G-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132846 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTAT-GGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGAC---CA-TTTACA---AA---AAAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-TA-T---AA-A----CATAGTTAA
gi|132847 : ACAGTTTCA-AA--TG-AA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTGTGAC---CG-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATTGGTAA
gi|132848 : ATAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTGTATTGGCA-----------ATACA-CAAGGGC-CGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGGTAA
gi|132849 : ACAATTTCA-GT--TT-CA--T--TGTTATTGGCA---TAACGACAATACA-TAT---T-TTTCTGTGGT---CA-TTTACA---AT---GTT-T--AT--TA---AAA-C--AA--ATGTGG-CAAA------GACAT-AAA---A-T---A-TA-T---AA-A----TATA
gi|132850 : ATAGTTTCA-GT--TT-CG--G--TTC-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CTA---T-TGCTTATGGC---TA-TTTATATATAT---GGA-T--AT--TT---ATA-T--AA--ATACGG-CATACTATATAATACAACA---A-T---A-T
gi|132851 : ATAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTGTT----------CAGCAAT-CAGCAAATTT-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G-------T--TTTACAAA-G--AA--ATATGG-CAAA------AACA
gi|132852 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAACA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132853 : acaattcaaCAGTTTCA-AT--TC-CC--G--TTTTATTTGCA---TAATGAAAATATA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAAA---CT---GGA-T--AT--TT---AAA-C--AA--AGATGG-CATA------G--AC-ACA---A-T---A-TA-A---AC-A----CATGGGTAA
gi|132854 : TTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---TA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGCCATA------
gi|132855 : caaaTTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATAT
gi|132856 : caaaTTATTGGCA---TAACGATAATAAA-TAA---T-TACCAATAGT---CA-TACACA---TT---GAA-T--TT--TT---AAATC--AA--ACAATA-CTTA------AACAA-ACA---A-C---A-TA-----AA-T----CATAAAGAA
gi|132857 : caaattcacattcgaagTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACTATCAGCAA-A----AA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132858 : caaAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAAC----A---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132859 : AGTTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAA---A-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132860 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAGTA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132861 : aaaAGTTTCAAGT--TTACAA-G--TTTTATTAGCA---TATCGGCA--ACA-GAA-----TGCCTTTGGT---CA-TTTACA---A-----AA-T--ATTATT---ACA-TG-AG--ATATAG-AAAA------GACAT-ACA---A-T-----TA-C---AA-A-----AT-GATA
gi|132862 : TTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACAATCAGCAA-ACA-TA------TGCCTTTGGC---CA-CTTAC----------AA-T--AT--TT---ATA----AATCATATGG-CAAA------GACATGACA---A-TTACA-TA-TTTGAA-A----CATA
gi|132863 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TTTTATTGACA---TAACGACACTACA-CAA---T-T
gi|132864 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TCTGATTGACA---TAACGACAATACA-CAA---T-T
gi|132865 : aTTTCA-AA--TT-CA--AATTTTTATTGGCAATTTA--GGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---C--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132866 : TTTCA-AT--TT-TAAAG--TTTTACTTGTA---AATCGGCAATA----AA---A-TGCCATTGGT---CA-TTTACA---AA---ATA-A--AA--TT---AAA-TG-AG--ATATGG-CAAA------GA-AA-ACA---A-T---A-TA-T------A----CAAAAATA
gi|132867 : TTTA-GT--T--CA--G--TTT-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TC---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATACGTAA
gi|132868 : TCCA-GTATTT-CAAAG--TTT-ATTAGCA---ACTCGGCAAGACA-TAAAATT-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC----------AA-T--AA--TT---ACA-G--AA--ATATGG-CA-A---------AC-ACA---ATT---A-TA-T---A
gi|132869 : TCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGAC---------------CA--AA---C-TGCTAGTAGC---CA-TTAACA---AT---GTA-T--AT--CA---AAA-C--AA--ATACCG-CATG------TATAT-ACA---T-T---A-TA-T---AT-A----CATAGGT
gi|132870 : CA-GT--TT-CA--G--TTTGATTGGCC---TAACCACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACC---AA---TAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-AT-T---TA-A----CATAGGT
gi|132871 : A-GT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TTTCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------TACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132872 : A-GT--TTATA--A--GTTTATTGACA---TATCAGCAA---A-TAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AAATCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-T
gi|132873 : A-GT--TTACA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAATA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACACTTA-T---A-TG-T-----------CATA
gi|132874 : A-GT--TTACA--C--GTTTATTAACA---TATCATCAAT----TAA---A-TGCTTATGGC---CA-TTTACA---AATC-GAA----AT-------AAA-CTCAA--ATATGG-CATA------GACAA-ACA---A-TA--A-TATT---AA-A----TACAAA
gi|132875 : --TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132876 : --TT-CA--G--TTTTATTGACA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG-----TA-CTCATA---------AA-C--AG--TC---AAA-C--A
gi|132877 : --TT-CA--G--TTTTATATGTA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCGATGGCATACACTTTATA---AA---
gi|132878 : A--A--TTTTATTGACAA--TTTCGGCTA-ACA-TAT---T-TGCCTTTGGG---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------GACAC-A-A---A-----A-CA-C---AA-A----CA
gi|132879 : A--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG
gi|132880 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGTAAAACA-T-----T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGTCA-A------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132881 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-TAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---T--TT---AGA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132882 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---G-TGCTTTTGGC---CA-TTTACA---AT---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---A
gi|132883 : TTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATCCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ACT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132884 : TACTGGCA---TATCAGCA---TA-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AATTCCAA-TTAAT--T--------C--AA--ATATGA-CATA------GACAT-ACA---A-A---ATTA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132885 : AACGACAATACA-CAA---T-TGCCAATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAT-C--AA--ATATGG-CTTA------GACAC-AGA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATGGGTAA
Alignments
lowQualScore : 111 2222222222222222 1111 1
lowQualScore : 7 11 4 66666 000 2 8 1 5555555 2 1 111 1 5555555555555555 11 111 0000 11 2 2 333333 5 222 0 333 1 1 999 4 9999
lowQualScore : . .. . ..... ... . . . ....... . . ... . ................ .. ... .... .. . . ...... . ... . ... . . ... . ....
lowQualScore : 7 66 7 88888 777 9 6 0 7777777 8 6 888 0 2222222222222222 44 888 0000 44 2 1 111111 7 000 3 111 1 2 444 3 1111
consensus : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
Reference ( family-512 ) : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132843 : ACAGTTTCA-GC--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132844 : ACAATATCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AT--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132845 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTAATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TATCTACGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACT---G-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132846 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTAT-GGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGAC---CA-TTTACA---AA---AAAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-TA-T---AA-A----CATAGTTAA
gi|132847 : ACAGTTTCA-AA--TG-AA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTGTGAC---CG-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATTGGTAA
gi|132848 : ATAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTGTATTGGCA-----------ATACA-CAAGGGC-CGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGGTAA
gi|132849 : ACAATTTCA-GT--TT-CA--T--TGTTATTGGCA---TAACGACAATACA-TAT---T-TTTCTGTGGT---CA-TTTACA---AT---GTT-T--AT--TA---AAA-C--AA--ATGTGG-CAAA------GACAT-AAA---A-T---A-TA-T---AA-A----TATA
gi|132850 : ATAGTTTCA-GT--TT-CG--G--TTC-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CTA---T-TGCTTATGGC---TA-TTTATATATAT---GGA-T--AT--TT---ATA-T--AA--ATACGG-CATACTATATAATACAACA---A-T---A-T
gi|132851 : ATAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTGTT----------CAGCAAT-CAGCAAATTT-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G-------T--TTTACAAA-G--AA--ATATGG-CAAA------AACA
gi|132852 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAACA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132853 : acaattcaaCAGTTTCA-AT--TC-CC--G--TTTTATTTGCA---TAATGAAAATATA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAAA---CT---GGA-T--AT--TT---AAA-C--AA--AGATGG-CATA------G--AC-ACA---A-T---A-TA-A---AC-A----CATGGGTAA
gi|132854 : TTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---TA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGCCATA------
gi|132855 : caaaTTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATAT
gi|132856 : caaaTTATTGGCA---TAACGATAATAAA-TAA---T-TACCAATAGT---CA-TACACA---TT---GAA-T--TT--TT---AAATC--AA--ACAATA-CTTA------AACAA-ACA---A-C---A-TA-----AA-T----CATAAAGAA
gi|132857 : caaattcacattcgaagTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACTATCAGCAA-A----AA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132858 : caaAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAAC----A---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132859 : AGTTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAA---A-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132860 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAGTA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132861 : aaaAGTTTCAAGT--TTACAA-G--TTTTATTAGCA---TATCGGCA--ACA-GAA-----TGCCTTTGGT---CA-TTTACA---A-----AA-T--ATTATT---ACA-TG-AG--ATATAG-AAAA------GACAT-ACA---A-T-----TA-C---AA-A-----AT-GATA
gi|132862 : TTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACAATCAGCAA-ACA-TA------TGCCTTTGGC---CA-CTTAC----------AA-T--AT--TT---ATA----AATCATATGG-CAAA------GACATGACA---A-TTACA-TA-TTTGAA-A----CATA
gi|132863 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TTTTATTGACA---TAACGACACTACA-CAA---T-T
gi|132864 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TCTGATTGACA---TAACGACAATACA-CAA---T-T
gi|132865 : aTTTCA-AA--TT-CA--AATTTTTATTGGCAATTTA--GGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---C--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132866 : TTTCA-AT--TT-TAAAG--TTTTACTTGTA---AATCGGCAATA----AA---A-TGCCATTGGT---CA-TTTACA---AA---ATA-A--AA--TT---AAA-TG-AG--ATATGG-CAAA------GA-AA-ACA---A-T---A-TA-T------A----CAAAAATA
gi|132867 : TTTA-GT--T--CA--G--TTT-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TC---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATACGTAA
gi|132868 : TCCA-GTATTT-CAAAG--TTT-ATTAGCA---ACTCGGCAAGACA-TAAAATT-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC----------AA-T--AA--TT---ACA-G--AA--ATATGG-CA-A---------AC-ACA---ATT---A-TA-T---A
gi|132869 : TCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGAC---------------CA--AA---C-TGCTAGTAGC---CA-TTAACA---AT---GTA-T--AT--CA---AAA-C--AA--ATACCG-CATG------TATAT-ACA---T-T---A-TA-T---AT-A----CATAGGT
gi|132870 : CA-GT--TT-CA--G--TTTGATTGGCC---TAACCACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACC---AA---TAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-AT-T---TA-A----CATAGGT
gi|132871 : A-GT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TTTCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------TACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132872 : A-GT--TTATA--A--GTTTATTGACA---TATCAGCAA---A-TAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AAATCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-T
gi|132873 : A-GT--TTACA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAATA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACACTTA-T---A-TG-T-----------CATA
gi|132874 : A-GT--TTACA--C--GTTTATTAACA---TATCATCAAT----TAA---A-TGCTTATGGC---CA-TTTACA---AATC-GAA----AT-------AAA-CTCAA--ATATGG-CATA------GACAA-ACA---A-TA--A-TATT---AA-A----TACAAA
gi|132875 : --TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132876 : --TT-CA--G--TTTTATTGACA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG-----TA-CTCATA---------AA-C--AG--TC---AAA-C--A
gi|132877 : --TT-CA--G--TTTTATATGTA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCGATGGCATACACTTTATA---AA---
gi|132878 : A--A--TTTTATTGACAA--TTTCGGCTA-ACA-TAT---T-TGCCTTTGGG---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------GACAC-A-A---A-----A-CA-C---AA-A----CA
gi|132879 : A--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG
gi|132880 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGTAAAACA-T-----T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGTCA-A------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132881 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-TAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---T--TT---AGA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132882 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---G-TGCTTTTGGC---CA-TTTACA---AT---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---A
gi|132883 : TTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATCCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ACT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132884 : TACTGGCA---TATCAGCA---TA-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AATTCCAA-TTAAT--T--------C--AA--ATATGA-CATA------GACAT-ACA---A-A---ATTA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132885 : AACGACAATACA-CAA---T-TGCCAATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAT-C--AA--ATATGG-CTTA------GACAC-AGA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATGGGTAA
blockSeqs : A AT A AAT AAC A T C GCAAATT A A ATA C CATTCAAATTAA TA TAC CTC TC C T CTATAT A CTT T TAC T T TTG C AAAT
blockSeqs : A . A AAG AAC A T C CAAGGG A A . . CATTCAAATTAA . . TC . T T . A . T A . . G C AAAT
blockSeqs : A . A AAG ATT A T C TAAAAT A A . . CATTCAAATTAA . . TC . . T . A . T . . . G C AAAT
blockSeqs : A . A AA A A T C CAA . G . . AAATCAAATTAA . . TC . . T . A . T . . . G . .
blockSeqs : A . . AA A A T C CAA . A . . CATTCAAATTAA . . TC . . T . G . T . . . G . .
blockSeqs : A . . AG A A T C CAA . G . . CATTCAAATTAA . . TG . . A . . . T . . . G . .
blockSeqs : . . . G A C T C CAA . A . . CATCCAAATTAA . . TG . . T . . . T . . . G . .
blockSeqs : . . . G A A T C TAT . T . . AATTCCAATTAA . . C . . A . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . G A T C T CTA . T . . TATATGGATA . . C . . A . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T A AAA . A . . AAAAAATA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . A T C CAA . T . . AATCGAAA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . T A C CAT . T . . AAGAATA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T C CAT . A . . AAGAATA . . C . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T T C TAA . T . . AAGAATA . . T . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . C T C TCA . A . . AAGAATA . . G . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T C AAA . A . . ATGTTTA . . C . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T T C GAA . T . . CTGGATA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A G C CAA . T . . TTGAATT . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A T C CAA . T . . AAATAAA . . T . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T A C CAT . T . . AAGAATA . . C . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A A T CAA . T . . ATGTATA . . G . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T T C CAA . A . . AATAATA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A A C TAA . T . . AAGAATA . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T C TAA . G . . ATATT . . C . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T C CAG . A . . AAGTT . . T . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . G . T T C CAA . A . . AAGTT . . T . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T A C TAT . A . . ATATT . . T . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . T A C CAG . A . . ATATT . . T . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . . A . A T T TAT . A . . AAATA . . C . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . C . A . C CAT . A . . AAGTT . . C . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . T . . TCA . A . . AAGTT . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . A . . CAA . A . . ATGTT . . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . T . . AA . T . . AATA . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : A . T . . TA . A . . AAGT . . . . . T . . . . . .
blockSeqs : G . T . . AA . T . . AATA . . . . . . .
blockSeqs : A . T . . AA . T . . AACA . . . . . . .
blockSeqs : A . T . . A . T . . AAGT . . . .
blockSeqs : A . A . . T . A . . AAG . . .
blockSeqs : . . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . . A
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
finalCons : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
Alignments
lowQualScore : 111 2222222222222222 1111 1
lowQualScore : 7 11 4 66666 000 2 8 1 5555555 2 1 111 1 5555555555555555 11 111 0000 11 2 2 333333 5 222 0 333 1 1 999 4 9999
lowQualScore : . .. . ..... ... . . . ....... . . ... . ................ .. ... .... .. . . ...... . ... . ... . . ... . ....
lowQualScore : 7 66 7 88888 777 9 6 0 7777777 8 6 888 0 2222222222222222 44 888 0000 44 2 1 111111 7 000 3 111 1 2 444 3 1111
consensus : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
Reference ( family-512 ) : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TANCGGCAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132843 : ACAGTTTCA-GC--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132844 : ACAATATCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AT--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132845 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTAATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TATCTACGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACT---G-T---A-TA-T---AA-A----CATAGATAA
gi|132846 : ACAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTTTAT-GGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGAC---CA-TTTACA---AA---AAAAT--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-TA-T---AA-A----CATAGTTAA
gi|132847 : ACAGTTTCA-AA--TG-AA--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTGTGAC---CG-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------AACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATTGGTAA
gi|132848 : ATAGTTTCA-GT--TT-CA--G--TTGTATTGGCA-----------ATACA-CAAGGGC-CGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATAGGTAA
gi|132849 : ACAATTTCA-GT--TT-CA--T--TGTTATTGGCA---TAACGACAATACA-TAT---T-TTTCTGTGGT---CA-TTTACA---AT---GTT-T--AT--TA---AAA-C--AA--ATGTGG-CAAA------GACAT-AAA---A-T---A-TA-T---AA-A----TATA
gi|132850 : ATAGTTTCA-GT--TT-CG--G--TTC-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CTA---T-TGCTTATGGC---TA-TTTATATATAT---GGA-T--AT--TT---ATA-T--AA--ATACGG-CATACTATATAATACAACA---A-T---A-T
gi|132851 : ATAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTGTT----------CAGCAAT-CAGCAAATTT-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G-------T--TTTACAAA-G--AA--ATATGG-CAAA------AACA
gi|132852 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAACA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132853 : acaattcaaCAGTTTCA-AT--TC-CC--G--TTTTATTTGCA---TAATGAAAATATA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTAAA---CT---GGA-T--AT--TT---AAA-C--AA--AGATGG-CATA------G--AC-ACA---A-T---A-TA-A---AC-A----CATGGGTAA
gi|132854 : TTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---TA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGCCATA------
gi|132855 : caaaTTCA-AA--TT-CA--AA-TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATAT
gi|132856 : caaaTTATTGGCA---TAACGATAATAAA-TAA---T-TACCAATAGT---CA-TACACA---TT---GAA-T--TT--TT---AAATC--AA--ACAATA-CTTA------AACAA-ACA---A-C---A-TA-----AA-T----CATAAAGAA
gi|132857 : caaattcacattcgaagTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACTATCAGCAA-A----AA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132858 : caaAATTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAAC----A---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132859 : AGTTTCAAGT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAA---A-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132860 : TTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCA---AACTATCAGTA-A-AAA---TATGCCTTTGGC---CA-TTTACA---A-----TA-T--TT--TT---AAATC------ATATGG-CAAA------GACATAACA---ATT---A-CA-T---A
gi|132861 : aaaAGTTTCAAGT--TTACAA-G--TTTTATTAGCA---TATCGGCA--ACA-GAA-----TGCCTTTGGT---CA-TTTACA---A-----AA-T--ATTATT---ACA-TG-AG--ATATAG-AAAA------GACAT-ACA---A-T-----TA-C---AA-A-----AT-GATA
gi|132862 : TTTCA-AT--T--CA--A--TTTTATTGGCAAACAATCAGCAA-ACA-TA------TGCCTTTGGC---CA-CTTAC----------AA-T--AT--TT---ATA----AATCATATGG-CAAA------GACATGACA---A-TTACA-TA-TTTGAA-A----CATA
gi|132863 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TTTTATTGACA---TAACGACACTACA-CAA---T-T
gi|132864 : aTTCAAGT--TT-CA--A--TCTGATTGACA---TAACGACAATACA-CAA---T-T
gi|132865 : aTTTCA-AA--TT-CA--AATTTTTATTGGCAATTTA--GGCAA---A-CAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---C--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132866 : TTTCA-AT--TT-TAAAG--TTTTACTTGTA---AATCGGCAATA----AA---A-TGCCATTGGT---CA-TTTACA---AA---ATA-A--AA--TT---AAA-TG-AG--ATATGG-CAAA------GA-AA-ACA---A-T---A-TA-T------A----CAAAAATA
gi|132867 : TTTA-GT--T--CA--G--TTT-ATTGGCA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TC---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATACGTAA
gi|132868 : TCCA-GTATTT-CAAAG--TTT-ATTAGCA---ACTCGGCAAGACA-TAAAATT-TGCCTTTGGC---CA-TTTAC----------AA-T--AA--TT---ACA-G--AA--ATATGG-CA-A---------AC-ACA---ATT---A-TA-T---A
gi|132869 : TCA-GT--TT-CA--G--TTTTATTGAC---------------CA--AA---C-TGCTAGTAGC---CA-TTAACA---AT---GTA-T--AT--CA---AAA-C--AA--ATACCG-CATG------TATAT-ACA---T-T---A-TA-T---AT-A----CATAGGT
gi|132870 : CA-GT--TT-CA--G--TTTGATTGGCC---TAACCACAATACA-CAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACC---AA---TAA-T--AT--TT---AAA-C--AA--ATATGG-CATA------GACAC-ACA---A-T---A-AT-T---TA-A----CATAGGT
gi|132871 : A-GT--TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TTTCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------TACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132872 : A-GT--TTATA--A--GTTTATTGACA---TATCAGCAA---A-TAA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AAATCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---C-T---A-T
gi|132873 : A-GT--TTACA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAATA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACACTTA-T---A-TG-T-----------CATA
gi|132874 : A-GT--TTACA--C--GTTTATTAACA---TATCATCAAT----TAA---A-TGCTTATGGC---CA-TTTACA---AATC-GAA----AT-------AAA-CTCAA--ATATGG-CATA------GACAA-ACA---A-TA--A-TATT---AA-A----TACAAA
gi|132875 : --TT-CA--A--GTTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATTCAAA-TTAAT--TT---AAA---------TATGG-CATA------GACAT-ACA---ATT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132876 : --TT-CA--G--TTTTATTGACA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG-----TA-CTCATA---------AA-C--AG--TC---AAA-C--A
gi|132877 : --TT-CA--G--TTTTATATGTA---TAACGACAATACA-CAA---T-TGCCGATGGCATACACTTTATA---AA---
gi|132878 : A--A--TTTTATTGACAA--TTTCGGCTA-ACA-TAT---T-TGCCTTTGGG---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------GACAC-A-A---A-----A-CA-C---AA-A----CA
gi|132879 : A--G--TTTTATTGGCA---TAACGACAATACA-CAG---T-TGCCTATG
gi|132880 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGTAAAACA-T-----T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGGTCA-A------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132881 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-TAT---T-TGCCTTTGGC---CA-TTTACA---AA---G---T---T--TT---AGA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---AACAAAATCATAAATA
gi|132882 : A--A--TTTTATTGGCAA--TTTCGGCAA---A-CAT---G-TGCTTTTGGC---CA-TTTACA---AT---G---T--TT--TT---AAA-T--AA--ATATGG-CCAA------G--AC-ACA---A-T---A-CA-C---A
gi|132883 : TTTATTGGCA---TATCAGCAAAACA-------T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---CATCCAAA-TTAAT--TT----------AA--ATATGG-CATA------GACAT-ACA---ACT---A-TA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132884 : TACTGGCA---TATCAGCA---TA-TCA---T-TGCCTATGGC---CA-TTTACA---AATTCCAA-TTAAT--T--------C--AA--ATATGA-CATA------GACAT-ACA---A-A---ATTA-TG--AA-A----TACAAACAA
gi|132885 : AACGACAATACA-CAA---T-TGCCAATGGC---CA-TTTACA---AA---GAA-T--AT--TT---AAT-C--AA--ATATGG-CTTA------GACAC-AGA---A-T---A-TA-T---AA-A----CATGGGTAA