lowQualScore : 1111111
lowQualScore : 66666666666 1111 7777777 3 11 333 0 55555555555555555555555 333333333 111 1 0 5 6 5
lowQualScore : ........... .... ....... . .. ... . ....................... ......... ... . . . . .
lowQualScore : 33333333333 6666 6666666 3 11 000 8 99999999999999999999999 888888888 222 3 7 2 4 5
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------NCCGGACG----AGCCTGCT----GCGANTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCGGACGAGCCTACTACGAGTGAC
Reference ( gi|43635 ) : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCTGCT----GGCACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAACACCAGACAACCCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACCG--AC--CAATAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGA
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----AAGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGA
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----ATGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGA
gi|43671 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----
gi|43644 : agccagctggaactgaccatAACACATCTCAGTGAAAAAC----------AACAGACG----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTacgagtgac
gi|43636 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTgctggcactgaccataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ACGATTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTattacgaatggcattatgacatc
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACTAGACA----AGCCTACT----ACAAGTG--ACAACA-TA------------------------ACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCgctggaactgaccat
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTGCT----ACGAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACAT---------C---CCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGAagctggaactgaccataa
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ACAAGTG--AC--AA-AAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCcata
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAAC----------AACAGACG----AGCCTACG----AAGAATG--AT--AA-TAT----------------------TACAT---------C---TCGGTGTGAAACCCTGAACAAACCTagctgtaactgaccataa
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ACGAGTGACAC--TA-TAA----------------------T--AG---------C---TCAATGTGAAACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGAgctggaactgaccacaa
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACTACA-GG---TG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGAcataa
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TTCAT---------C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGAcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACTAGACA----AGCCTACTACAAGTCAC----AA--CA-TA------------------------ACAT---------C---TCATTGTGAAACCCTGAACAAGCCcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGATG----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-TAC----------------------AACAT---------C---TCAATGTGAAACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGAagctggaactgaccataa
gi|43645 : AACACATCTCAGTGAAAAAC--------------AACAGAGGAGCCTACT----ACGAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACAA---------T---TGAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGAcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAAAC----------CGTATATA----ATCCTACT----TCTAATG--AT--AA-TAA----------------------TGCAT---------C---TCGGTCTGAAAcataa
gi|43638 : AATACATCTCAGTTTGAAAC----------AGTAGACA----ATCCTACT----GCTAATG--AG--AA-TAA----------------------CGCAT---------T---TCAGTCTGGAAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAAC----------TACGGACA----AACATGTT----GCGAGTG--AC--AA-TGT----------------------TGCAT---------C---TCAATGTGAAAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAAC----------ATTAGGTG----AGCCTACA----GTAAGTG--AA--AA-TAA----------------------TACAT---------A---TTAATGCCAAACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGA
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAAC----------ACTAGACT----AGCCTACT----ACAAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTAAAAAAGCCTaat
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GTAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGAgctggaactgaccataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCTGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACATGTA------CATGTCAGTGTGGAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGA
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAATT----------CCTGAACA----AGCCTGCT----AGGACTG--AC--CA-TAA----------------------CACAT---------C---TCAGTGAAAAACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGA
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGTCTGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------TATAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTA
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---ACAATGTGGAACACCAGACAACCCT
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTAAAAA----AGCCTGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTgaacaagccagctggaaccgaccaataa
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AACCTGCT----GGAACTG--AC--CA-CAA----------------------TACAT---------C---TCAATGTGAAACgctggcactgaccataa
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAAA----------CCCAGGCA----AGCATACT----GCCAGTG--ACATCA-T------------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGA
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACANNNNNNNNNNC---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGA
gi|43657 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGGACTG--AC--CA-TAANNNNNNNNNNGAGTGACAACATTACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCT
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAAA----------CACGGTCG----AGCTTACT----ACAAGTG--AC--AT-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGAgctggaactgaccataa
gi|43644 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGTCTGCT----GGCACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43654 : aacacatctcagtgaaaaacaacagacgagcctactacgagtgacaacatTACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43654 : tacatgtcagtgtggaacaccagacaagcctactacgagtgacaacatTACATGTCAGTGTGGAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCC
gi|43653 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------agctggaactgaccataa
gi|43653 : tacatgtcagtgtggaacaccagacaagcctactacgagtgacaacatTACATGTCAGTGTGGAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCC
gi|43669 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------agctggaactgaccataa
gi|43651 : ctcagtgtgaaacaccagacgagcctactacgagtgacaacatTACATCTCAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43651 : tacatctcagtgtgaaacaccagacgagcctactatgagtgacaacatTACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ATGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCC
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACA----AGCCTACT----ACAAGTG--AC--AA-AAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCagctgggactgaccataa
gi|43648 : TACATCTCGGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AACCTGCT----GGAACTG--AC--CA-CAA----------------------agctgtaactgaccataa
gi|43641 : aatacatctcaatgtgaaacaacagacgagcctacgaagaatgataatatTACATCTCAGTGTGAATT----------CCTGAACA----AGCCTGCT----AGGACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43645 : aatatatctcagtgtgaaacaccagacgagcctactacaggtgacaacatTACAATTGAGTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGTCTGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43666 : aacacatctcagtgaaaaacaacagaggagcctactacgagtgaccacatTACTTCTCAATGTGAATT----------CTTCGGCA----TGTCTACT----ACCAGCG--GT--AA-AAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAAC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAc
gi|43632 : ACATCTCATTGTGAAAC----------CCTGAACA----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43647 : aatacatctcagtgtgaaacactagacaagcctactacaagtcacaacataACATCTCAATGTGAAAC----------CCTCAACA----AACCTGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------
gi|43668 : aatacatctcagtgtgaaacaccagatgagcctactacgagtgacaatacaCATCTCAGTGTGAATT----------CCTGAACA----AGCCTGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------CACAT---------C---TCAGTGAAAAACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGA
gi|43642 : CATCTCAGTGTGAATT----------CCTGAACA----AGCCTGCT----GGGACTG--AC--CA-TAA----------------------caca
gi|43669 : aatacatctcagtgtgaaacaccagacaagcctactacgagtgacaacatttCTCAGTGTGAAAC----------ACCAGACG----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCC
gi|43670 : TATGAAAT----------ACCAGACA----AGCCTACT----ACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACAT---------C---TCagctggaactgaccataa
gi|43671 : ----AGCCAGCT----GGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGA
gi|43644 : AA----------------------CACAT---------C---TCAGTGAAAAACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGA
gi|43636 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagtctgctggcactgaccataa
gi|43631 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAattatgacatc
gi|43630 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACTAGACAAGCCTACTACAAGTGAaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagcctgctggaactgaccat
gi|43629 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACAAGTGAaacataacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctggaactgaccataa
gi|43648 : AA----------------------TACAT---------C---TCAATGTGAAACAACAGACGAGCCTACGAAGAATGaaaattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctgtaactgaccataa
gi|43646 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGAataatattacatctcggtgtgaaaccctgaacaaacctgctggaactgaccacaa
gi|43632 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACTAGACAAGCCTACTACAAGTactataatagctcaatgtgaaaccctgaacaaacctgctaggactgaccataa
gi|43647 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGATGAGCCTACTACGAGTGAcacaacataacatctcattgtgaaaccctgaacaagccagctggaactgaccataa
gi|43645 : AA----------------------CACAT---------C---TCAGTGAAAAACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAaatacaacatctcaatgtgaaaccctcaacaaacctgctgggactgaccataa
gi|43649 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACCGTATATAATCCTACTTCTAATGcacattacaattgagtgtgaaaccctgaacaagtctgctgggactgaccataa
gi|43638 : AA----------------------TACAT---------C---TCAGTTTGAAACAGTAGACAATCCTACTGCTAATGataataatgcatctcggtctgaaa
gi|43650 : A----------------------CACAT---------C---TCAGTGCGAAACACTAGACTAGCCTACTACAAGTGAagaataacgcatttcagtctggaac
gi|43665 : ----------------------TACAT---------C---TCGGTGTGAAACCCTGAACAAACCTcacattacatctcagtgtgaaaccctaaaaaagcctgctggaactgaccataa
gi|43654 : ----------------------TACAT---------G---TCAGTGTGGAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAgctggaactgaccacaatacatctcaatgtgaaac
gi|43653 : ----------------------TACAT---------G---TCAGTGTGGAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctggaactgaccataa
gi|43651 : ----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGAaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctggaactgaccataa
gi|43652 : ----------------------TACAT---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctgggactgaccataa
gi|43669 : ---------C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGAaaaattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctgtaactgaccataa
gi|43670 : TATGAAATACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAaacattacatctcagtgtgaaaccctgaacaagccagctggaactgaccataa
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111111111
lowQualScore : 0 1 0 0 4444444444 0 1 11 666 0 33333333333333333333333 333333333 111 111 4 1 4 4
lowQualScore : . . . . .......... . . .. ... . ....................... ......... ... ... . . . .
lowQualScore : 9 0 4 6 0000000000 5 0 22 666 9 11111111111111111111111 777777777 666 666 6 5 4 9
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCGGACGAGCCTA----------CTGCGAGTG--AC--NA-TAN----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCCGGACGAGCCTGCTGCGACTGAC
Reference ( family-510 ) : AATACATCTCAGTGTGAAA-CNCCGGACGAGCCTG----------CTGCGANTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCGGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACAAGTG--AC--AA-AAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGAC
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTAGACAAGCCTA----------CTACAAGTG--ACAACA-TA------------------------ACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACGATTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTAGACAAGCCTA----------CTACAAGTC--ACAACA-TA------------------------ACA---------T---C---TCATTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcat
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTAAGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACAAGCCTA----------CTATGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAC
gi|43635 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCTG----------CTGGCACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43636 : AA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAA-CACCAGACAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACCG--AC--CAATAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGACattatgacatc
gi|43638 : AATACATCTCAGTTTGAAA-CAGTAGACAATCCTA----------CTGCTAATG--AG--AA-TAA----------------------CGCA---------T---T---TCAGTCTGGAAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAA-CTACGGACAAACATG----------TTGCGAGTG--AC--AA-TGT----------------------TGCA---------T---C---TCAATGTGAAAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAA-CATTAGGTGAGCCTA----------CAGTAAGTG--AA--AA-TAA----------------------TACA---------T---A---TTAATGCCAAACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGAC
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACAGGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGACaat
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACAAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TTCA---------T---C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAA-CACCAGACGAGCCTG----------CTACGAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACA---------T---C---CCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43644 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACAGACGAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTGCTcata
gi|43644 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGTCTG----------CTGGCACTG--AC--CA-TAA----------------------ggcactgaccataa
gi|43645 : aacacatctcagtgaaaaacaacagacgagcctactacgagtgacaacatAACACATCTCAGTGAAAAA-CAACAGAGGAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACA---------A---T---TGAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGAC
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACGAGTGACAC--TA-TAA----------------------T--A---------G---C---TCAATGTGAAACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGACcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGATGAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-TAC----------------------AACA---------T---C---TCAATGTGAAACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAA-CAACAGACGAGCCTA----------CGAAGAATG--AT--AA-TAT----------------------TACA---------T---C---TCGGTGTGAAACCCTGAACAAACCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCGTATATAATCCTA----------CTTCTAATG--AT--AA-TAA----------------------TGCA---------T---C---TCGGTCTGAAAcacaa
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAA-CACTAGACTAGCCTA----------CTACAAGTG--AC--CA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTAAAAAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43651 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTATGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGGACTGACcataa
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACAAGCCTA----------CTACAAGTG--AC--AA-AAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGACcataa
gi|43653 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCAGACAAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43654 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCAGACAAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACANNNNNNNNNN---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTAAAAAAGCCTG----------CTGGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCT
gi|43656 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCTG----------CTGGCACTG--AC--CA-TAA----------------------ggcactgaccataa
gi|43657 : tacatctcagtgtgaaaccctaaaaaagcctgctggaactgaccatTACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCAG----------CTGGGACTG--AC--CA-TAANNNNNNNNNNGAGTGACAACATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAA-ACCCAGGCAAGCATA----------CTGCCAGTG--ACATCA-T------------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGACcataa
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCAG----------CTGGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---ACAATGTGGAACACCAGACAACCCT
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCAG----------CTGTAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGACgaacaagccagctggaaccgaccaataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCTG----------CTGGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------TGTACATGTCAGTGTGGAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAAT-TCCTGAACAAGCCTG----------CTAGGACTG--AC--CA-TAA----------------------CACA---------T---C---TCAGTGAAAAACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAA-CCCTGAACAAGTCTG----------CTGGGACTG--AC--CA-TAA----------------------TATA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTA
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAA-ACACGGTCGAGCTTA----------CTACAAGTG--AC--AT-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAA-CCCTGAACAAACCTG----------CTGGAACTG--AC--CA-CAA----------------------TACA---------T---C---TCAATGTGAAAC
gi|43666 : TACTTCTCAATGTGAATTCTTCGG-CATGTCTA----------CTACCAGCG--GT--AA-AAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAAC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAA-CCCTGAACAAGCCAG----------CTGGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGATTGACc
gi|43668 : CATCTCAGTGTGAAT-TCCTGAACAAGCCTG----------CTGGGACTG--AC--CA-TAA----------------------CACA---------T---C---TCAGTGAAAAACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43669 : CTCAGTGTGAAA-CACCAGACGAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcaca
gi|43670 : TATGAAATACCAGACAAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43670 : TATGAAA-TACCAGACAAGCCTA----------CTACGAGTG--AC--AA-CAT----------------------TACA---------T---C---TCaacattacatctc
gi|43671 : AGCCAG----------CTGGAACTG--AC--CA-TAA----------------------TACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
Alignments
lowQualScore : 1 222 0 111 111 4444444444 66666666666666666 1 0 1 333333333 111 111 0 1 5
lowQualScore : . ... . ... ... .......... ................. . . . ......... ... ... . . .
lowQualScore : 9 111 3 666 666 0000000000 44444444444444444 0 9 0 777777777 666 666 3 7 9
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
Reference ( family-510 ) : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---A----------CTG----------------CGAGTGACNA-TANTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCCGGACGAGCCTGCTGCGACTGAC
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CAAGTGACAA-AATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGAC
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CAAGTGACAA-CATAACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGATTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CAAGTCACAA-CATAACA---------T---C---TCATTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcat
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------AGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------TGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAC
gi|43635 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---G----------CTG----------------GCACTGACCA-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43636 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------TTA----------------CGAATGGCAT-TATGACA---------T---C---
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAA-CACCA--GACAACCC---T---GAACAAGCCAGCTG----------------GAACCGACCAATAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGAC
gi|43638 : AATACATCTCAGTTTGAAA-CAGTA--GACAATCC---T---A----------CTG----------------CTAATGAGAA-TAACGCA---------T---T---TCAGTCTGGAAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAA-CTACG--GACAAACA---T---G----------TTG----------------CGAGTGACAA-TGTTGCA---------T---C---TCAATGTGAAAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAA-CATTA--GGTGAGCC---T---A----------CAG----------------TAAGTGAAAA-TAATACA---------T---A---TTAATGCCAAACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGAC
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CAGGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGACaat
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTTCA---------T---C---TCAGTGTGAATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---G----------CTA----------------CGAGTGACCA-CATTACA---------T---C---CCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43644 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTGCTGGCACTGACcata
gi|43645 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GAGGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACCA-CATTACA---------A---T---TGAGTGTGAAACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAC-TATAATA---------G---C---TCAATGTGAAACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGACcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GATGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-TACAACA---------T---C---TCAATGTGAAACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAA-CAACA--GACGAGCC---T---A----------CGA----------------AGAATGATAA-TATTACA---------T---C---TCGGTGTGAAACCCTGAACAAACCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAA---ACCGTATATAATCC---T---A----------CTT----------------CTAATGATAA-TAATGCA---------T---C---TCGGTCTGAAAcacaa
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAA-CACTA--GACTAGCC---T---A----------CTA----------------CAAGTGACCA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTAAAAAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43651 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------TGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGGACTGACcataa
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CAAGTGACAA-AATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGACcataa
gi|43653 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43654 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACANNNNNNNNNN---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTA--AAAAAGCC---T---G----------CTG----------------GAACTGACCA-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGCACTGAC
gi|43657 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCCAGCTGGGA----------CTGACCATAANNNNNNNNNNGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAA-ACCCA--GGCAAGCA---T---A----------CTG----------------CCAGTGACAT-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGACcataa
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---G----------CTG----------------GAACTGACCA-TAATACA---------T---C---ACAATGTGGAACACCAGACAACCCTG
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---G----------CTG----------------TAACTGACCA-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGACaacaagccagctggaaccgaccaataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---G----------CTG----------------GAACTGACCA-TAATACA---------TGTACATGTCAGTGTGGAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---G----------CTA----------------GGACTGACCA-TAACACA---------T---C---TCAGTGAAAAACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGTC---T---G----------CTG----------------GGACTGACCA-TAATATA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACT
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAAACAC-G--GTCGAGCT---T---A----------CTA----------------CAAGTGACAT-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACa
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAA-CCCTG--AACAAACC---T---G----------CTG----------------GAACTGACCA-CAATACA---------T---C---TCAATGTGAAAC
gi|43666 : TACTTCTCAATGTGAATTCTTCG--G-CATGTC---T---A----------CTA----------------CCAGCGGTAA-AAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---G----------CTG----------------GAACTGACCA-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAC
gi|43668 : CATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---G----------CTG----------------GGACTGACCA-TAACACA---------T---C---TCAGTGAAAAACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43669 : CTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCAGTGTGAAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcaca
gi|43670 : TATGAAA-TACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGACAA-CATTACA---------T---C---TCcataa
gi|43671 : AGCC---A---G----------CTG----------------GAACTGACCA-TAATACA---------T---C---TCAGTGTGAAACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43671 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---A----------CTA----------------CGAGTGAC
Alignments
lowQualScore : 1 222 0 111 222 0 0 555555555555555 2222222 0 0 2222 22 333333333 4444444444 1
lowQualScore : . ... . ... ... . . ............... ....... . . .... .. ......... .......... .
lowQualScore : 8 222 4 666 888 9 9 666666666666666 9999999 9 9 0000 00 777777777 3333333333 2
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
Reference ( family-510 ) : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGAC
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GATT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------CA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCATTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcat
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-A---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAC
gi|43635 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------CACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43636 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ATT-A-C---------------GAAT-------GG-C-A----TTAT-GACA---------TC
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAA-CACCA--GACAACCC---TGA-ACA-AGC---------------CAGCTGGAACCGA-CCA----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGAC
gi|43637 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-
gi|43638 : aatacatcacaatgtggaacaccagacaaccctgaacaagccagctggaaccgaccaatAATACATCTCAGTTTGAAA-CAGTA--GACAATCC---T---ACT-G-C---------------TAAT-------GA-G-A----ATAA-CGCA---------TTTCAGTCTGG----------AAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAA-CTACG--GACAAACA---T---GTT-G-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATGT-TGCA---------TCTCAATGTGA----------AAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAA-CATTA--GGTGAGCC---T---ACA-G-T---------------AAGT-------GA-A-A----ATAA-TACA---------TATTAATGCCA----------AACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGAC
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AGGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGACaat
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TTCA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---GCT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCCCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43644 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGCACTGACcata
gi|43645 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GAGGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------ATTGAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----CTAT-AATA---------GCTCAATGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGACcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GATGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATAC-AACA---------TCTCAATGTGA----------AACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACG-A-A---------------GAAT-------GA-T-A----ATAT-TACA---------TCTCGGTGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAA---ACCGTATATAATCC---T---ACT-T-C---------------TAAT-------GA-T-A----ATAA-TGCA---------TCTCGGTCTGA----------AAcacaa
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAA-CACTA--GACTAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTAAAAAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43651 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGGACTGACcataa
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGACcataa
gi|43653 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43654 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACANNNNNNNNNNCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTA--AAAAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGCACTGAC
gi|43657 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCCAGCTGGGACTGA-CCATAANNNNNNNNNNGAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAA-ACCCA--GGCAAGCA---T---ACT-G-C---------------CAGT-------GA-C-A----TCAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGACcataa
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCACAATGTGGAACACCAGACAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACCGAC
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-T---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGACcaataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GACC-ATAATACATGTACA---------TGTCAGTGTGG----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-A-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGTC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-TATA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACT
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAAACAC-G--GTCGAGCT---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----TTAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACa
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAA-CCCTG--AACAAACC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ACAA-TACA---------TCTCAATGTGA----------AAC
gi|43666 : TACTTCTCAATGTGAATTCTTCG--G-CATGTC---T---ACT-A-C---------------CAGC-------GG-T-A----AAAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAC
gi|43668 : CATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43669 : CTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcaca
gi|43670 : TATGAAA-TACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCcataa
gi|43671 : AGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43671 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-
Alignments
lowQualScore : 1 222 0 111 222 0 0 555555555555555 2222222 0 0 2222 22 333333333 4444444444 1
lowQualScore : . ... . ... ... . . ............... ....... . . .... .. ......... .......... .
lowQualScore : 8 222 4 666 888 9 9 666666666666666 9999999 9 9 0000 00 777777777 3333333333 2
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
Reference ( family-510 ) : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGAC
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GATT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------CA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCATTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcat
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-A---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAC
gi|43635 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------CACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43636 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ATT-A-C---------------GAAT-------GG-C-A----TTAT-GACA---------TC
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAA-CACCA--GACAACCC---TGA-ACA-AGC---------------CAGCTGGAACCGA-CCA----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGAC
gi|43637 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-
gi|43638 : aatacatcacaatgtggaacaccagacaaccctgaacaagccagctggaaccgaccaatAATACATCTCAGTTTGAAA-CAGTA--GACAATCC---T---ACT-G-C---------------TAAT-------GA-G-A----ATAA-CGCA---------TTTCAGTCTGG----------AAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAA-CTACG--GACAAACA---T---GTT-G-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATGT-TGCA---------TCTCAATGTGA----------AAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAA-CATTA--GGTGAGCC---T---ACA-G-T---------------AAGT-------GA-A-A----ATAA-TACA---------TATTAATGCCA----------AACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGAC
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AGGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGACaat
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TTCA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---GCT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCCCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43644 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGCACTGACcata
gi|43645 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GAGGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------ATTGAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----CTAT-AATA---------GCTCAATGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGACcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GATGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATAC-AACA---------TCTCAATGTGA----------AACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACG-A-A---------------GAAT-------GA-T-A----ATAT-TACA---------TCTCGGTGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAA---ACCGTATATAATCC---T---ACT-T-C---------------TAAT-------GA-T-A----ATAA-TGCA---------TCTCGGTCTGA----------AAcacaa
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAA-CACTA--GACTAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTAAAAAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43651 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGGACTGACcataa
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGACcataa
gi|43653 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43654 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACANNNNNNNNNNCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTA--AAAAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGCACTGAC
gi|43657 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCCAGCTGGGACTGA-CCATAANNNNNNNNNNGAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAA-ACCCA--GGCAAGCA---T---ACT-G-C---------------CAGT-------GA-C-A----TCAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGACcataa
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCACAATGTGGAACACCAGACAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACCGAC
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-T---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGACcaataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GACC-ATAATACATGTACA---------TGTCAGTGTGG----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-A-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGTC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-TATA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACT
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAAACAC-G--GTCGAGCT---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----TTAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACa
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAA-CCCTG--AACAAACC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ACAA-TACA---------TCTCAATGTGA----------AAC
gi|43666 : TACTTCTCAATGTGAATTCTTCG--G-CATGTC---T---ACT-A-C---------------CAGC-------GG-T-A----AAAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAC
gi|43668 : CATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43669 : CTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcaca
gi|43670 : TATGAAA-TACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCcataa
gi|43671 : AGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43671 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-
blockSeqs : A GTA AGC GGG CATAANNNNNNNNNN TGGAACC TAAT TG NNNNNNNNN AACACCAGAC G
blockSeqs : T A . GA . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . G . . . . . A . . T
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . A . . . . . A . . G
blockSeqs : . A . . . . . A . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . G . . . . . A . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . C . . T
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . A . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . T
blockSeqs : . A . . . . . T . . G
blockSeqs : . A . . . . . T . . A
blockSeqs : . A . . . . . A . . C
blockSeqs : . G . . . . . T . . C
blockSeqs : . A . . . . . T . . C
blockSeqs : . G . . . . . A . . C
blockSeqs : . G . . . . . A . . C
blockSeqs : . G . . . . . A . . G
blockSeqs : . G . . . . . A . . C
blockSeqs : . G . . . . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . A . .
blockSeqs : . G . . . . . T . .
blockSeqs : . A . . . . . T .
blockSeqs : . A . . . . . A .
blockSeqs : . A . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
finalCons : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
Alignments
lowQualScore : 1 222 0 111 222 0 0 555555555555555 2222222 0 0 2222 22 333333333 4444444444 1
lowQualScore : . ... . ... ... . . ............... ....... . . .... .. ......... .......... .
lowQualScore : 8 222 4 666 888 9 9 666666666666666 9999999 9 9 0000 00 777777777 3333333333 2
consensus : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
Reference ( family-510 ) : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCG--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCCGGACAAGCCTGCTGGGACTGAC
gi|43629 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGAC
gi|43630 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43631 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GATT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43632 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACTA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------CA-C-A----ACAT-AACA---------TCTCATTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcat
gi|43633 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-A---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43634 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACAAGTGAC
gi|43635 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------CACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTATTACGAATGGC
gi|43636 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ATT-A-C---------------GAAT-------GG-C-A----TTAT-GACA---------TC
gi|43637 : AATACATCACAATGTGGAA-CACCA--GACAACCC---TGA-ACA-AGC---------------CAGCTGGAACCGA-CCA----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTATGAGTGAC
gi|43637 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-
gi|43638 : aatacatcacaatgtggaacaccagacaaccctgaacaagccagctggaaccgaccaatAATACATCTCAGTTTGAAA-CAGTA--GACAATCC---T---ACT-G-C---------------TAAT-------GA-G-A----ATAA-CGCA---------TTTCAGTCTGG----------AAC
gi|43639 : AATACATATTAATGCCAAA-CTACG--GACAAACA---T---GTT-G-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATGT-TGCA---------TCTCAATGTGA----------AAACCCAGGCAAGC
gi|43640 : AACGCATTTCAGTCTGGAA-CATTA--GGTGAGCC---T---ACA-G-T---------------AAGT-------GA-A-A----ATAA-TACA---------TATTAATGCCA----------AACTACGGACAAACATGTTGCGAGTGAC
gi|43641 : AATATATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------AGGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTAGGACTGACaat
gi|43642 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TTCA---------TCTCAGTGTGA----------ATTCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43643 : AATACACCTCAGTGCGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---GCT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCCCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43644 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGCACTGACcata
gi|43645 : AACACATCTCAGTGAAAAA-CAACA--GAGGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------ATTGAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGTCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43646 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----CTAT-AATA---------GCTCAATGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTAGGACTGACcataa
gi|43647 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GATGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ATAC-AACA---------TCTCAATGTGA----------AACCCTCAACAAACCTGCTGGGACTGACcataa
gi|43648 : AATACATCTCAATGTGAAA-CAACA--GACGAGCC---T---ACG-A-A---------------GAAT-------GA-T-A----ATAT-TACA---------TCTCGGTGTGA----------AACCCTGAACAAACCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43649 : AATACATCTCAGTGTGAA---ACCGTATATAATCC---T---ACT-T-C---------------TAAT-------GA-T-A----ATAA-TGCA---------TCTCGGTCTGA----------AAcacaa
gi|43650 : ACACATCTCAGTGCGAAA-CACTA--GACTAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-C----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTAAAAAAGCCTGCTGGAACTGAC
gi|43651 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-T---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGGACTGACcataa
gi|43652 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----AAAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGTAACTGACcataa
gi|43653 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43654 : TACATGTCAGTGTGGAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcataa
gi|43655 : TACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACANNNNNNNNNNCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACcataa
gi|43656 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTA--AAAAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGCACTGAC
gi|43657 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCCAGCTGGGACTGA-CCATAANNNNNNNNNNGAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCTGCTGGAACTGACcataa
gi|43658 : TGCATCTCAATGTGAAA-ACCCA--GGCAAGCA---T---ACT-G-C---------------CAGT-------GA-C-A----TCAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTATGAGTGACcataa
gi|43659 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCACAATGTGGAACACCAGACAACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACCGAC
gi|43660 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-T---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTAAGAGTGACcaataa
gi|43661 : TACATCTCAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GACC-ATAATACATGTACA---------TGTCAGTGTGG----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43662 : TACATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-A-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGACGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43663 : TACAATTGAGTGTGAAA-CCCTG--AACAAGTC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-TATA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACT
gi|43664 : TGCATCTAAATGTGAAAACAC-G--GTCGAGCT---T---ACT-A-C---------------AAGT-------GA-C-A----TTAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGAGTGACa
gi|43665 : TACATCTCGGTGTGAAA-CCCTG--AACAAACC---T---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ACAA-TACA---------TCTCAATGTGA----------AAC
gi|43666 : TACTTCTCAATGTGAATTCTTCG--G-CATGTC---T---ACT-A-C---------------CAGC-------GG-T-A----AAAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACC
gi|43667 : ACATCTCATTGTGAAA-CCCTG--AACAAGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACGAGCCTACTACGATTGAC
gi|43668 : CATCTCAGTGTGAAT-TCCTG--AACAAGCC---T---GCT-G-G---------------GACT-------GA-C-C----ATAA-CACA---------TCTCAGTGAAA----------AACAACAGAGGAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43669 : CTCAGTGTGAAA-CACCA--GACGAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACCCTGAACAAGCCAGCTGGAACTGACcaca
gi|43670 : TATGAAA-TACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-A----ACAT-TACA---------TCTCcataa
gi|43671 : AGCC---A---GCT-G-G---------------AACT-------GA-C-C----ATAA-TACA---------TCTCAGTGTGA----------AACACCAGACAAGCCTACTACGAGTGAC
gi|43671 : AATACATCTCAGTGTGAAA-CACCA--GACAAGCC---T---ACT-A-C---------------GAGT-------GA-C-