lowQualScore : 1 444444444444444444444444444444444444444 2222222222222 222222222 11 2 11 1 33333333 4444444444 1 1 11
lowQualScore : 4 4 2 2 0 0 333333 55555555555 11 2222 1 2 1 1 1 88888 22 11 22 44444 222222222222222222222222222222222222222 2 33 55555 5555 0000000000000 5 1 2 5 111111111 5 8 444 11 444 33 1 1 11 2 2 1 888 6666 7 5 2 0 1 33 444 444 999 22222222 5555 3333333333 3 55 33 4 2 555 6 4 0 4 3 3 9 99 3
lowQualScore : . . . . . . ...... ........... .. .... . . . . . ..... .. .. .. ..... ....................................... . .. ..... .... ............. . . . . ......... . . ... .. ... .. . . .. . . . ... .... . . . . . .. ... ... ... ........ .... .......... . .. .. . . ... . . . . . . . .. .
lowQualScore : 1 9 1 3 5 1 111111 11111111111 55 3333 1 9 1 1 9 22222 88 66 88 11111 555555555555555555555555555555555555555 4 22 99999 0000 6666666666666 0 0 3 6 555555555 2 0 777 44 777 77 5 7 00 9 7 2 777 3333 7 0 7 7 7 77 777 777 333 55555555 7777 3333333333 3 88 44 0 9 000 0 1 2 4 6 2 6 22 6
consensus : ATTAANTTTCGTNGTTTCC-GCTTCAAGGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA-----AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTC-----G-CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGNACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCA---CATC-N-GTGAC-TG--TGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Reference ( gi|82979 ) : ATTCATTTTCGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA-----AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGCGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTC-----T-CACGTCAGGGTTTATCGCACCCTGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAAAACTAAT---T--GTTATGCTAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGAATGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCACGC-CCGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----C---T----GCCA---CA---A-GTTAC-TG--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGATTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82959 : ATTAAATTTTGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----TA-----AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTTACCGTTGCTGTAATTCACACGTC-----T-CGTGTCAGGGTTTATCGCACCTTGCTGTGCAAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTTATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-ACGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCA---CA---C-GTGAC-----TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGATATTTGTTTGATTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82957 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------T--TT----GTGGG-CACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT----------AA--AA--A-----AA-----AT----TA------TT----T-TTT----T---CAA-A--AT-----T----TCGA-------------TATCGCATAGTGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTC-----G-CGCGTCAGGATTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTAATCAAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CCGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCA---C------GTCACTTGATTGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTT-ATTCGTTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTTTAG-AA
gi|82958 : tATTAAATTTCGTGGTTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-ATCTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA-----TT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATTGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGCAATTCACACATC-----G-CGCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGTTGTGCCAATAAAGAGTTGACAC---ATGCCAATTTGTACACTAATATACAAGTACAATATAGAACTAATGAATTAGTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGGAAAGAACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGATTTCAGAAGGCAGGT-CCGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCACGTCA---T-GTGAC-TG--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTTATGTGCTGCGTTTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATTTATTTAATCATTAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82960 : tATTCAATTTCGTGGTTTCC-ACTTCGAAAACA------TA-----------T--TC----ATGGG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCTATTT--C--C--AAAA--AC--A-----AT-----AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTATTAACCTCTGCTACA--TTACACGTT-----G-TGCATCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGGCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGTAAGAG---ATCTAACCTAGAAAGAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCA---CATC-ACGTGAC-TG--TAAAAATAGACA-TA-A---ACCAATGTGCTGCATCTTTTAGGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATGTTTAATCATAAAGAGAAACAATTATAG-AATAGAACAA
gi|82963 : tATTAAATTTCATGGTTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GTCTAAAATTCGTTGAAA-C-CCAATT---------------AA--A-----AA-----A------------------------------------A--CT-----T----TCGA-------------C-TCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTT-----T-CTCGTCAGGGTTTATCGCACCTAGCTGTGCCAAT-AAGCATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATGC-AA-ACCAGAGGAGAGGAAAGGGAGAAGTATGAG---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGAC-CTGCAA--TA---AATAACAATAA---TA----CG--T----GCCACATCA---A-GTGAC-TG--TGATAATGAACAGTACATATATGAATGTGCTACAACTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATG----------------ATCATATAGAGAAAC---TATAGAAATAAAATA
gi|82961 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GTCTTGAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AAAAAAAAT----CAAAAAAATA----A-AGT----T---TAC-A--GT-----T----TCAG-------------CATCGCATAGTGAGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAGTGCACACATC-----G-CTCGTCAGGGTTTATTGCATCCCACTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAGTTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATG--GAAACCAGAGGAGAGGAAA-ATAAAAGTACAAA---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGTCAGGC-CTGCAG--TA---AATAAC---AACAGTA----TG--T----GCCA---CATC-ACGTGAC-TG--TGATAATAAACAGTA-A---ATAAATGTGCTACGACTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-----ATTAAAAATG----------------ATCATAAAGAGAAACAA-TATAA-
gi|82964 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GTCTTAAATTCGTTAAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AGAAAGAA-----AG----T-------TT------------------AC-A--CT-----T----TCGA-------------CACCGCATAGTGCGTTCCAGTAATGAACCTCTGCTGTAATATACACGTC-----G-CTCGTCAGTGTTTATCGCATCCCGCTGTGCAAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTCATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATGC-AA-ACCAGAGGAGAGGAAA-GGAAAAGTACGAG---ATCTAATTCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCAG--TC---AATAAC---AATAGTA----CG--T----GCCA---CATC-ATGTGAC-TG--TGA
gi|82965 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTTAAAGAC------------------------------TGGG-GACCTAAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--CCGA--AAAA--AAT-A-----AA-----AT--------------------------------A--A--C-------------GA-------------CATCGCATATTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTT-----G-CGCGTCGGGGTTTATTGCACCCTGCT---------------TGACAC---ATGCGAATTAGTACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTCTGCAAACA--------------A-GGA--------------TCTACTCCAGAAAGGGTTTCAGGAGGCAGGC-CTGCTG--TA---AATAAC---AT---TAG---CATGT----GCCA---CATC-ATGTGAC-TG--TGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTAGGTCTTTTAAGAGATT-GTTTGTTTTTATTCATTAAAAATGTATCGCCAAATATTTGATCATAAAGAGAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82966 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTCA--GACA------TA-----------T--TC----ATAGG-GTCTTAAATTAGTTGAAA-C-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AATAA--ATAAAATAAAA---TA----A-AGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGATGTGATGCACACGTCGTTGTTGCTCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGTCAAT-AACAGTTGACAC---ATACCAATTAATACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTATGC-AA-ACC----------AAA-GGATACGAA-------ATCTAATCCAGAAAAGGTTTCAGAAGGCAGGCTTCAGTATTTA---AATAAC---AA---TAGTATG---T----GCCA---CA------TCAC--G--TGA
gi|82967 : tATTAAATTTCATGGTTTCC-ACTTCAAAGACAATGTCATA-----------T--TC----ATGGG-GACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA-----AA----A-------AT----A-AAT----T---TAC-A--GC-----TAAAATCAG-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTACTGTAATACACACGTC-----G-CGCATCAGAGTTTATCACACGCTGCTGTGCCAGTTAAGAGTTAACAC---ATGCCAATTCGTATCCTAATATACAAGTACGATAT-AAACTTAT---T--GTTATGCAAACATC--ACGTGAct
gi|82969 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-TCTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----ATGGT--ACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTC--C--A---------A--A-----AA-----A---------------------------------AC-C--C------------------------------------AGTGCATTCCAGTTATTAACCT--GCCTTAATATACACGTC-----G-CACGTCAGGGTTTATCGCACCGAGCTGTGCCAATTAAGAATTGACACGGCATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTATAAGATTGAATTAAT---T--GTTATGCAAACTAG--AGGAGAGGAAA-GGAGAAGttgtgataatgaacagta
gi|82968 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------T--TC----ATGGG-GAATTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA-----AT----t
gi|82971 : tATTAAATTTCGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACG------TA-----------T--TC----ATAGG-GATTTAAATTCGTTGAAA-G-GCAA
gi|82980 : tATTAATTTTTGTTGTTTTT-GATTCAAAGACA------TA-----------T--TC----ATTGG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--AAAA--AA--A-----AT-----GT----T-------TT----
gi|82970 : ATTAAATTTCATGGTTTCT-GCTTCAAAGACA------TACATTTAAGGTAT--TC----GTGGG-GATTTAAATTCGTTGAAACC-CCAATTT--C--A--AAAA--AAATA-----AA-----AT----A-------AG----T-TACAAAATAAATAC-A--CT-----T----TCGA-------------CA
gi|82972 : tATTGAATTTTGTGATTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTTGG-GTCTTAAATTCGTTGAAA-
gi|82974 : tATTAATTTTTGTTGTTTTC-AGTTCAAGAACA------TA-----------T--TC----ATAGG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--GAGA--AA--A-----AATC---AT----T-------TT----
gi|82984 : tATTAATTTTCATTGTTTTT-GCTTCAAGGA---------------------T--TT----GTTGG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA-----
gi|82981 : ATTAATTTTCATTATTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------T--TT----GTGGG-AACTTAATTTCATCGAGA-A-CTAATTTAAG--A--AAGA--AA--A-----AA-----AT----T-------AT----T-TTtcgattcagtgcaaactttccaca
gi|82976 : ATTAATTATTGTTGTTTTTTGGTTCAAGGACA------CA-----------T--TC----GTGGG-AACTTAATTTCGTTGAAA-A-CGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA-----
gi|82985 : tATTAATTTTCATTGTTTTTTGCTTCAAGGACA------TA-----------T--TT----GTTGG-GACTAAATTTCATTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--GA--A-----AA-----A
gi|82973 : ATTAAATTTCGTGATTTCC-ACTTCAATGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GATTTAAATTCATTa
gi|82982 : tATTAATTTTTGTTGTTTTT-GGTTCAAGCACA------TA-----------T--TT----GTGGG-GTTTTAATTTCGTTGAAA-A-TTAATTT--T--AGTAAAA--AA--A-----AA-----AT----C-------AT----T-TT
gi|82983 : ATTAATTTTCGTTATTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------T--TC----GCGGG-GACTTAATTTCGCTGAAA-A-CGCATTT--
gi|82986 : ATTAATGTTCATTGTTTTC-GATTCAAGGACA------TA-----------T--T-----GTGGG-GA-----ATT-GTTGAAA-A-CTAACTT--G--C--AAAA--AA--A-----AA-----AT----T-------GT----T-TTaagaga
gi|82987 : ATTAATTTTGGTTGTTTTT-GGTTCAAGGACT------AA-----------T--TC----GTAGG-AATTTAATTACGTTG-AA-A-CAAATTT--T--A--GAAA-------------------------T-------TG----T-TTT----TAG-TGC-AATCTTTGAAT----TTGAGCATTTC------TATTACATAATGTGTTTTAATTACTAACCT
gi|82988 : TTAATTTTCGTTGTTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-CGAATTT--T--AT-AAAA--AA--A-----AA-----AT----T-------GT----T-TTA----G---TGCAA--CC-----T----TTGAATTAGAGTATTTCTATTACAAAACGCGTTTTAATTACTGACCTTTAC
gi|82991 : TTAATTTTCTTTGTTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTCTC----AT-GC-GACATGAATTTGTTGAAA-G-CTTATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82975 : ATTTTCATTGTTTTT-GGTTCATGGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-CAAAGTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA-----t
gi|82977 : tatcaTTTTCGTTGTTTTT-GGTTCAA---CA------TA-----------T--TT----GTGGG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-AGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----GA-----
gi|82962 : tattaatTTTCGTGGTTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------T--TC----GTGGG-TACATAAATTCGTTGAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AT----AA-----AT----A-------ATAAAATATGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGTTGTAATACATAC----------------AGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGCCAAC-AAGAATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTTATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTATGCAAACAAG--AGGAGAGGAAA-GGAGAAGTACGAG---ATCTAATCCAT--AGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAATAAC---AG---TA----TG--T----GCCA---CA------TCAC--A--TAATAATGAATGGTA-A---ATCAATGTGCTACG-CCCTTAAGAGATTTATTTGTTTT-ATTCATCAAAAATGTATCACCATATATTTGATAATAAAGAGAAACA---ATAG-AATAAAAAAAttgttct
gi|82992 : tgttaaaTTTTGTTGTTTTT-ATTTCAAGGACA------TA-----------T--TCGTGGGTGGG-GATTTAATTTCATTGAAA-G-------T--A--A--AAAA--AA--A-----AA-----AT----
gi|82978 : aaaTTTCATTGTTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------T--TT----GTTTTTGACTTAATTTCGTTGAGA-A-TCAAATT--G--A--GAAAGTAA--A-----AA-----ca
gi|82990 : tattacaGTTTTT-GCTT-AAGGACA------TA-----------T--TC----ATGGG-GACTTAAATTTGTGGAAA-A-caatcatt
gi|82993 : ttaaattGTTTCC-GGTTCAAGGACA------TA-----------T--TC----CTGCA-GAAT----TTCGTTTAAA-AGGTAATTT--A--A--AAAC--AA--A-----AATG---AT----T-------TT----T-
gi|82989 : TTCAATGGTA------TA-----------T--TC----ATGAG-GATTTAATTTCGTTGAAA-A-GAAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----A
gi|82994 : ttaaatttctttgcttttttggTCAAGGACA------TA-----------T--TT----GTGGG-TATTTAATTTCGTTGAAA-A-ATAATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82995 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-------T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTC-----G-CGTGTCAGGGTTTATCGCTTCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TA---AATAAC---AA---TA----A---T----GCCACGTCA---C-GTGAC-TG--TGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTG
gi|82996 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-------T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCTTAGTGCGTTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTC-----G-CGTGTCAGGGTTTATCGCTCCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TA---AATAAC---AA---TA----A---A----GCCACGTCA---C-GTGAC-TG--TGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGc
gi|82997 : ACCTAGTTGTGCCAAT-AAAAGTCAACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACTAGTTAGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACC--AGGTGAGGAAA-GGAGAAGAACAAC---ACCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAATGCAGAC-CCAGTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---T----GCCA---CA---C-GTGAC-----TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCATCTTTTAAAAGATTTAATTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATAACAATATATTTTATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAAc
gi|82999 : AGGAAA-GTGTAAGTACGAC---ATCTAATCTAGAAACAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TA---AATAAC---AA---TA----G---TATGTGCCA---CATCAA-GTGAC-TG--TGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTATGTCTATTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAG-AAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82998 : GAAGGACGACGAGATCTAATCCAAAAAGGATTTCAGAAGGCAGGC-CTACTG--TA---AATCAC---CA---TA----G---T----GCTA---CATCTC-GTGAC-TG--CGGTAATGAACTGTA-A---A
gi|83000 : cgacactgaaaccaattcatgcaaagtgggtcatcaacacgcacacttagatg---CA---C-GTGAT-TG--TGATAATGAACAGTA-A---ATCATTGTGCTACGTCTTTTAAGAGATGTGTTTGATTT-ATTCAATTAAAATGTATCTCCATATATTTGATCATAAAAAGAAACA---ATAA-AATAAAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 1111111111111 2222 333 11
lowQualScore : 1 1 1 11 2 0 1 333333 55555555555 2222 1 1 1 1 1 1 55555 22 11 22 66666 555 44444444444444444444444444444444 2 33 55555 4444 9999999999999 0 1 777777 0 7 444 1 444 33 444 2 2 2 1 5555 2 0 33 6666 5555 5555 333 2 1 2 444 1 1 3 1 66 3
lowQualScore : . . . .. . . . ...... ........... .... . . . . . . ..... .. .. .. ..... ... ................................ . .. ..... .... ............. . . ...... . . ... . ... .. ... . . . . .... . . .. .... .... .... ... . . . ... . . . . .. .
lowQualScore : 0 1 0 55 2 6 7 000000 00000000000 2222 1 1 4 0 1 6 55555 66 55 77 99999 666 55555555555555555555555555555555 2 11 66666 7777 4444444444444 1 0 777777 5 5 444 0 444 44 666 1 5 1 9 3333 5 9 44 6666 3333 3333 999 5 0 7 777 0 6 3 8 00 3
consensus : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCAC-GTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Reference ( family-499 ) : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAGGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGNACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATC-N-GTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82957 : ATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTT----GTG-GG-CACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT----------AA--AA--A-----AA---AT----TA------TT----T-TTT----T---CAA-A--AT-----T----TCGA-------------TATCGCATAGTGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGCGTCAGGATTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTAATCAAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCAC-TTGAT--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTT-ATTCGTTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTTTAG-AA
gi|82958 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-ATCTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---TT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATTGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGCAATTCACACATCG------CGCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGTTGTGCCAATAAAGAGTTGACAC---ATGCCAATTTGTACACTAATATACAAGTACAATATAGAACTAATGAATTAGTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGGAAAGAACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGATTTCAGAAGGCAGGT-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCAT-GTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTTATGTGCTGCGTTTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATTTATTTAATCATTAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82959 : tATTAAATTT-TGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----TA---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTTACCGTTGCTGTAATTCACACGTCT------CGTGTCAGGGTTTATCGCACCTTGCTGTGCAAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTTATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-ACGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACA---C-GTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGATATTTGTTTGATTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82960 : tATTCAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCGAAAACA------TA-----------TTC----ATG-GG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCTATTT--C--C--AAAA--AC--A-----AT---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTATTAACCTCTGCTACA--TTACACGTTG------TGCATCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGGCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTAAGAG---ATCTAACCTAGAAAGAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCAC-GTGACTGTAAAAATAGACA-TA-A---ACCAATGTGCTGCATCTTTTAGGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATGTTTAATCATAAAGAGAAACAATTATAG-AATAGAACAA
gi|82961 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GTCTTGAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--C--A--AAAA--AA--AAAAAAAA---AT----CAAAAAAATA----A-AGT----T---TAC-A--GT-----T----TCAG-------------CATCGCATAGTGAGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAGTGCACACATCG------CTCGTCAGGGTTTATTGCATCCCACTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAGTTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATGGAAACCAGAGGAGAGGAAA-ATAAAAGTACAAA---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGTCAGGC-CTGCAG--TAAATAACAACAGTATG----T----GCCACATCAC-GTGACTGTGATAATAAACAGTA-A---ATAAATGTGCTACGACTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-----ATTAAAAA----------------TGATCATAAAGAGAAACAA-TATAA-
gi|82962 : tTTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-TACATAAATTCGTTGAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AT----AA---AT----A-------ATAAAATATGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGTTGTAATACATAC----------------AGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGCCAAC-AAGAATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTTATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTATGCAAACAAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGTACGAG---ATCTAATCCAT--AGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAATAACAGTATG----T----GCCACATC------AC-ATAATAATGAATGGTA-A---ATCAATGTGCTACG-CCCTTAAGAGATTTATTTGTTTT-ATTCATCAAAAATGTATCACCATATATTTGATAATAAAGAGAAACA---ATAG-AATAAAAAAA
gi|82963 : tgATTAAATTT-CATGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GTCTAAAATTCGTTGAAA-C-CCAATT---------------AA--A-----AA---A------------------------------------A--CT-----T----TCGA-------------C-TCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTT------CTCGTCAGGGTTTATCGCACCTAGCTGTGCCAAT-AAGCATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAAGGGAGAAGTATGAG---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGAC-CTGCAA--TAAATAACAATAATACG----T----GCCACATCAA-GTGACTGTGATAATGAACAGTACATATATGAATGTGCTACAACTTTTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAA----------------TGATCATATAGAGAAAC---TATAGAAATAAAATA
gi|82964 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GTCTTAAATTCGTTAAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AGAAAGAA---AG----T-------TT------------------AC-A--CT-----T----TCGA-------------CACCGCATAGTGCGTTCCAGTAATGAACCTCTGCTGTAATATACACGTCG------CTCGTCAGTGTTTATCGCATCCCGCTGTGCAAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTCATATACAAGTACGATATTGAACTAAT---T--GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAA-GGAAAAGTACGAG---ATCTAATTCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCAG--TCAATAACAATAGTACG----T----GCCACATCAT-GTGACTGTGA
gi|82965 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGAC----------------------------TG-GG-GACCTAAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--CCGA--AAAA--AAT-A-----AA---AT--------------------------------A--A--C-------------GA-------------CATCGCATATTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTG------CGCGTCGGGGTTTATTGCACCCTGCT---------------TGACAC---ATGCGAATTAGTACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTCTGCAAACA------------A-GGA--------------TCTACTCCAGAAAGGGTTTCAGGAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACATTA----GCATGT----GCCACATC-ATGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTAGGTCTTTTAAGAGATT-GTTTGTTTTTATTCATTAAAAATGTATCGCCAAATATTTGATCATAAAGAGAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82966 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCA--GACA------TA-----------TTC----ATA-GG-GTCTTAAATTAGTTGAAA-C-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AATAAATAAAATAAAA---TA----A-AGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGATGTGATGCACACGTCGTTGTTGCTCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGTCAAT-AACAGTTGACAC---ATACCAATTAATACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT---T--GTTATGCAAAC-C---------AAA-GGA----TACGAA---ATCTAATCCAGAAAAGGTTTCAGAAGGCAGGCTTCAGTATTTAAATAACAATAGTATG----T----GCCACATCAC-GTGACT
gi|82967 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCC-ACTTCAAAGACAATGTCATA-----------TTC----ATG-GG-GACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AA----A-------AT----A-AAT----T---TAC-A--GC-----TAAAATCAG-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTACTGTAATACACACGTCG------CGCATCAGAGTTTATCACACGCTGCTGTGCCAGTTAAGAGTTAACAC---ATGCCAATTCGTATCCTAATATACAAGTACGATATA-AACTTAT---T--GTTATGCAAACATCACGTGA
gi|82968 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTC----ATG-GG-GAATTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----ttgtgataatgaacagta
gi|82969 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-TCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----ATG-GT--ACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTC--C--A---------A--A-----AA---A---------------------------------AC-C--C------------------------------------AGTGCATTCCAGTTATTAACCT--GCCTTAATATACACGTCG------CACGTCAGGGTTTATCGCACCGAGCTGTGCCAATTAAGAATTGACACGGCATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTATAAGATTGAATTAAT---T--GTTATGCAAACTAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAG
gi|82970 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCT-GCTTCAAAGACA------TACATTTAAGGTATTC----GTG-GG-GATTTAAATTCGTTGAAACC-CCAATTT--C--A--AAAA--AAATA-----AA---AT----A-------AG----T-TACAAAATAAATAC-A--CT-----T----TCGA-------------CAt
gi|82971 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACG------TA-----------TTC----ATA-GG-GATTTAAATTCGTTGAAA-G-GCAA
gi|82972 : tATTGAATTT-TGTGA--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTT-GG-GTCTTAAATTCGTTGAAA-
gi|82973 : tATTAAATTT-CGTGA--TTTCC-ACTTCAATGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GATTTAAATTCATT
gi|82974 : tATTAATTTT-TGTTG--TTTTC-AGTTCAAGAACA------TA-----------TTC----ATA-GG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--GAGA--AA--A-----AATC-AT----T-------TT----
gi|82975 : tATCAATTTT-CATTG--TTTTT-GGTTCATGGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-CAAAGTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82976 : tATTAATTAT-TGTTG--TTTTTTGGTTCAAGGACA------CA-----------TTC----GTG-GG-AACTTAATTTCGTTGAAA-A-CGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82977 : tATTAATTTTTCGTTG--TTTTT-GGTTCAA---CA------TA-----------TTT----GTG-GG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-AGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----GA---
gi|82978 : tATTACATTT-CATTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----GTT-TTTGACTTAATTTCGTTGAGA-A-TCAAATT--G--A--GAAAGTAA--A-----AA---ttgttct
gi|82979 : tATTCATTTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGCGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCT------CACGTCAGGGTTTATCGCACCCTGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAAAACTAAT---T--GTTATGCTAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAATGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCACGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----C----T----GCCACA---A-GTTACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGATTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAAcaatcatt
gi|82980 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GATTCAAAGACA------TA-----------TTC----ATT-GG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--AAAA--AA--A-----AT---GT----T-------TT----
gi|82981 : ATTAATTTT-CATTA--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----GTG-GG-AACTTAATTTCATCGAGA-A-CTAATTTAAG--A--AAGA--AA--A-----AA---AT----T-------AT----T-TT
gi|82982 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GGTTCAAGCACA------TA-----------TTT----GTG-GG-GTTTTAATTTCGTTGAAA-A-TTAATTT--T--AGTAAAA--AA--A-----AA---AT----C-------AT----T-TT
gi|82983 : ATTAATTTT-CGTTA--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----GCG-GG-GACTTAATTTCGCTGAAA-A-CGCATTT--A--A--GAGA--
gi|82984 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTT-GCTTCAAGGA---------------------TTT----GTT-GG-GACTTAATTTCGTTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82985 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTTTGCTTCAAGGACA------TA-----------TTT----GTT-GG-GACTAAATTTCATTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--GA--A-----AA---Atcgattcagtgcaaactttccaca
gi|82986 : ATTAATGTT-CATTG--TTTTC-GATTCAAGGACA------TA-----------TT-----GTG-GG-GAATT------GTTGAAA-A-CTAACTT--G--C--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTa
gi|82987 : ATTAATTTT-GGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACT------AA-----------TTC----GTA-GG-AATTTAATTACGTTG-AA-A-CAAATTT--T--A--GAAA-----------------------T-------TG----T-TTT----TAG-TGC-AATCTTTGAAT----TTGAGCATTTC------TATTACATAATGTGTTTTAATTACTAACCT
gi|82988 : TTAATTTT-CGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----GTG-GG-GACTTAATTTTGTTGAAA-A-CGAATTT--T--AT-AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTA----G---TGCAA--CC-----T----TTGAATTAGAGTATTTCTATTACAAAACGCGTTTTAATTACTGACCTTTAC
gi|82989 : TTAAATTT-CTTTGCTTTTTT-GGTTCAATGGTA------TA-----------TTC----ATG-AG-GATTTAATTTCGTTGAAA-A-GAAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----A
gi|82990 : TTG--TTTTT-GCTT-AAGGACA------TA-----------TTC----ATG-GG-GACTTAAATTTGTGGAAA-A-
gi|82991 : ttaaaTTAATTTT-CTTTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTC----TCATGC-GACATGAATTTGTTGAAA-G-CTTATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82992 : AAATTT-TGTTG--TTTTT-ATTTCAAGGACA------TA-----------TTCGTGGGTG-GG-GATTTAATTTCATTGAAA-G-------T--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----t
gi|82993 : G--TTTCC-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----CTG-CA-G----AATTTCGTTTAAA-AGGTAATTT--A--A--AAAC--AA--A-----AATG-AT----T-------TT----T-ca
gi|82994 : TCAAGGACA------TA-----------TTT----GTG-GG-TATTTAATTTCGTTGAAA-A-ATAATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82995 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTTCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----T----GCCACGTCAC-GTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82996 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCTTAGTGCGTTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTCCCCGCTGTGCCAAT-AAGAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----A----GCCACGTCAC-GTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82997 : ACCTAGTTGTGCCAAT-AAAAGTCAACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACTAGTTAGATATAGAACTAAT---T--GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAACAAC---ACCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAATGCAGAC-CCAGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACA---C-GTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCATCTTTTAAAAGATTTAATTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATAACAATATATTTTATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82998 : GAAGGACGACGAGATCTAATCCAAAAAGGATTTCAGAAGGCAGGC-CTACTG--TAAATCACCATA----G----T----GCTACATCTC-GTGACTGCGGTAATGAACTGTA-A---A
gi|82999 : cgacactgaaaccaattcatgcaaagtgggtcatcaacacgcacacttagatgAGGAAA-GTGTAAGTACGAC---ATCTAATCTAGAAACAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACAATA----G----TATGTGCCACATC-AAGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTATGTCTATTAAGAGATTTGTTTGTTTT-ATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGA-AAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|83000 : ACATC-ACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-A---ATCATTGTGCTACGTCTTTTAAGAGATGTGTTTGATTT-ATTCAATTAAAATGTATCTCCATATATTTGATCATAAAAAGAAACA---ATAA-AATAAAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 1111111111111 2222 11
lowQualScore : 1 1 1 11 2 0 333333 55555555555 2222 1 1 1 1 1 1 55555 22 11 22 66666 555 44444444444444444444444444444444 2 33 55555 4444 9999999999999 0 1 777777 0 5 2 444 1 5555 2 444 2 2 2 1 5555 2 0 33 6666 5555 5555 0 1 2 444 1 44 1 66 3
lowQualScore : . . . .. . . ...... ........... .... . . . . . . ..... .. .. .. ..... ... ................................ . .. ..... .... ............. . . ...... . . . ... . .... . ... . . . . .... . . .. .... .... .... . . . ... . .. . .. .
lowQualScore : 0 1 0 55 2 6 000000 00000000000 2222 1 1 4 0 1 6 55555 66 55 77 99999 666 55555555555555555555555555555555 2 11 66666 7777 4444444444444 1 0 777777 5 0 5 444 0 3333 5 666 1 5 1 5 3333 5 9 44 6666 3333 3333 5 0 5 777 0 99 8 00 3
consensus : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Reference ( family-499 ) : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82957 : ATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGCACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT----------AA--AA--A-----AA---AT----TA------TT----T-TTT----T---CAA-A--AT-----T----TCGA-------------TATCGCATAGTGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGCGTCAGGATTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTAATCAAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCACTTGAT--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG--TTTATTCGTTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTTTAG-AA
gi|82958 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGATCTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---TT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATTGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGCAATTCACACATCG------CGCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGTTGTGCCAAT-AAAGAGTTGACAC---ATGCCAATTTGTACACTAATATACAAGTACAATATAGAACTAATGAATTAGTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGGAAAGAACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGATTTCAGAAGGCAGGT-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCATGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTTATGTGCTGCGTTTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATTTATTTAATCATTAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82959 : tATTAAATTT-TGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----TA---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTTACCGTTGCTGTAATTCACACGTCT------CGTGTCAGGGTTTATCGCACCTTGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTTATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-ACGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGATATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82960 : tATTCAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCGAAAACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCTATTT--C--C--AAAA--AC--A-----AT---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTATTAACCTCTGCTACA--TTACACGTTG------TGCATCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGGCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTAAGAG---ATCTAACCTAGAAAGAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTAAAAATAGACA-TA-A---ACCAATGTGCTGCATCTTTTAGGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATGTTTAATCATAAAGAGAAACAATTATAG-AATAGAACAA
gi|82961 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTGAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--C--A--AAAA--AA--AAAAAAAA---AT----CAAAAAAATA----A-AGT----T---TAC-A--GT-----T----TCAG-------------CATCGCATAGTGAGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAGTGCACACATCG------CTCGTCAGGGTTTATTGCATCCCACTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAGTTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGGAAACCAGAGGAGAGGAAA-ATAAAAGTACAAA---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGTCAGGC-CTGCAG--TAAATAACAACAGTATG----T----GCCACATCACGTGACTGTGATAATAAACAGTA-A---ATAAATGTGCTACGACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTT----ATTAAAAA----------------TGATCATAAAGAGAAACAA-TATAA-
gi|82962 : tTTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGTACATAAATTCGTTGAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AT----AA---AT----A-------ATAAAATATGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGTTGTAATACATAC----------------AGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGCCAAC-AA-GAATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTTATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACAAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGTACGAG---ATCTAATCCAT--AGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAATAACAGTATG----T----GCCACATCAC------ATAATAATGAATGGTA-A---ATCAATGTGCTACG-CCCTTAAGAGATTTATTTG-TTTTATTCATCAAAAATGTATCACCATATATTTGATAATAAAGAGAAACA---ATAG-AATAAAAAAA
gi|82963 : tgATTAAATTT-CATGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTAAAATTCGTTGAAA-C-CCAATT---------------AA--A-----AA---A------------------------------------A--CT-----T----TCGA-------------C-TCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTT------CTCGTCAGGGTTTATCGCACCTAGCTGTGCCAAT-AA-GCATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAAGGGAGAAGTATGAG---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGAC-CTGCAA--TAAATAACAATAATACG----T----GCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTACATATATGAATGTGCTACAACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAA----------------TGATCATATAGAGAAAC---TATAGAAATAAAATA
gi|82964 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTAAATTCGTTAAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AGAAAGAA---AG----T-------TT------------------AC-A--CT-----T----TCGA-------------CACCGCATAGTGCGTTCCAGTAATGAACCTCTGCTGTAATATACACGTCG------CTCGTCAGTGTTTATCGCATCCCGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTCATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAA-GGAAAAGTACGAG---ATCTAATTCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCAG--TCAATAACAATAGTACG----T----GCCACATCATGTGACTGTGA
gi|82965 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGAC-----------------------------TG-GGGACCTAAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--CCGA--AAAA--AAT-A-----AA---AT--------------------------------A--A--C-------------GA-------------CATCGCATATTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTG------CGCGTCGGGGTTTATTGCACCCTGCT----------------TGACAC---ATGCGAATTAGTACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTCTGCAAACA------------A-GGA--------------TCTACTCCAGAAAGGGTTTCAGGAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACATTA----GCATGT----GCCACATCATGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTAGGTCTTTTAAGAGA-TTGTTTGTTTTTATTCATTAAAAATGTATCGCCAAATATTTGATCATAAAGAGAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82966 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCA--GACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGTCTTAAATTAGTTGAAA-C-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AATAAATAAAATAAAA---TA----A-AGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGATGTGATGCACACGTCGTTGTTGCTCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGTCAAT-AA-CAGTTGACAC---ATACCAATTAATACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAAC-C---------AAA-GGA----TACGAA---ATCTAATCCAGAAAAGGTTTCAGAAGGCAGGCTTCAGTATTTAAATAACAATAGTATG----T----GCCACATCACGTGACT
gi|82967 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCC-ACTTCAAAGACAATGTCATA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AA----A-------AT----A-AAT----T---TAC-A--GC-----TAAAATCAG-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTACTGTAATACACACGTCG------CGCATCAGAGTTTATCACACGCTGCTGTGCCAGTTAA-GAGTTAACAC---ATGCCAATTCGTATCCTAATATACAAGTACGATATA-AACTTAT----T-GTTATGCAAACATCACGTGA
gi|82967 : tACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-ttgtgataatgaacagta
gi|82968 : tattaaatttcatggtttccacttcaaagacaatgtcatattcatggggacttaaattcattgaaaaccaatttaaaaaaaaaaaaaaataaatttacagctaaaatcagcatcgcatagtgcgttccagttattaacctctactgtaatacacacgtcgcgcatcagagtttatcacacgctgctgtgccagttaagagttaacacatgccaattcgtatcctaatatacaagtacgatataaacttattgttatgcaaATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGAATTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----
gi|82969 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-TCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GT-ACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTC--C--A---------A--A-----AA---A---------------------------------AC-C--C------------------------------------AGTGCATTCCAGTTATTAACCT--GCCTTAATATACACGTCG------CACGTCAGGGTTTATCGCACCGAGCTGTGCCAATTAA-GAATTGACACGGCATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTATAAGATTGAATTAAT----T-GTTATGCAAACTAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGT
gi|82970 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCT-GCTTCAAAGACA------TACATTTAAGGTATTC----G-TG-GGGATTTAAATTCGTTGAAACC-CCAATTT--C--A--AAAA--AAATA-----AA---AT----A-------AG----T-TACAAAATAAATAC-A--CT-----T----TCGA-------------CA
gi|82971 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACG------TA-----------TTC----A-TA-GGGATTTAAATTCGTTGAAA-G-GCAA
gi|82972 : tATTGAATTT-TGTGA--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TT-GGGTCTTAAATTCGTTGAAA-
gi|82973 : tATTAAATTT-CGTGA--TTTCC-ACTTCAATGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGATTTAAATTCATT
gi|82974 : tATTAATTTT-TGTTG--TTTTC-AGTTCAAGAACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--GAGA--AA--A-----AATC-AT----T-------TT----
gi|82975 : tATCAATTTT-CATTG--TTTTT-GGTTCATGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CAAAGTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82976 : tATTAATTAT-TGTTG--TTTTTTGGTTCAAGGACA------CA-----------TTC----G-TG-GGAACTTAATTTCGTTGAAA-A-CGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82977 : tATTAATTTTTCGTTG--TTTTT-GGTTCAA---CA------TA-----------TTT----G-TG-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-AGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----GA---
gi|82978 : tATTACATTT-CATTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----GTTT-TTGACTTAATTTCGTTGAGA-A-TCAAATT--G--A--GAAAGTAA--A-----AA---ttgttct
gi|82979 : tATTCATTTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGCGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCT------CACGTCAGGGTTTATCGCACCCTGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAAAACTAAT----T-GTTATGCTAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAATGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCACGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----C----T----GCCACA--A-GTTACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAAcaatcatt
gi|82980 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GATTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--AAAA--AA--A-----AT---GT----T-------TT----
gi|82981 : ATTAATTTT-CATTA--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGAACTTAATTTCATCGAGA-A-CTAATTTAAG--A--AAGA--AA--A-----AA---AT----T-------AT----T-TT
gi|82982 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GGTTCAAGCACA------TA-----------TTT----G-TG-GGGTTTTAATTTCGTTGAAA-A-TTAATTT--T--AGTAAAA--AA--A-----AA---AT----C-------AT----T-TT
gi|82983 : ATTAATTTT-CGTTA--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-CG-GGGACTTAATTTCGCTGAAA-A-CGCATTT--A--A--GAGA--
gi|82984 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTT-GCTTCAAGGA---------------------TTT----G-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82985 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTTTGCTTCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TT-GGGACTAAATTTCATTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--GA--A-----AA---Atcgattcagtgcaaactttccaca
gi|82986 : ATTAATGTT-CATTG--TTTTC-GATTCAAGGACA------TA-----------TT-----G-TG-GGGAATT------GTTGAAA-A-CTAACTT--G--C--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTa
gi|82987 : ATTAATTTT-GGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACT------AA-----------TTC----G-TA-GGAATTTAATTACGTTG-AA-A-CAAATTT--T--A--GAAA-----------------------T-------TG----T-TTT----TAG-TGC-AATCTTTGAAT----TTGAGCATTTC------TATTACATAATGTGTTTTAATTACTAACCT
gi|82988 : TTAATTTT-CGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CGAATTT--T--AT-AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTA----G---TGCAA--CC-----T----TTGAATTAGAGTATTTCTATTACAAAACGCGTTTTAATTACTGACCTTTAC
gi|82989 : TTAAATTT-CTTTGCTTTTTT-GGTTCAATGGTA------TA-----------TTC----A-TG-AGGATTTAATTTCGTTGAAA-A-GAAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----A
gi|82990 : TTG--TTTTT-GCTT-AAGGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTTGTGGAAA-A-
gi|82991 : ttaaaTTAATTTT-CTTTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTC----T-CATGCGACATGAATTTGTTGAAA-G-CTTATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82992 : AAATTT-TGTTG--TTTTT-ATTTCAAGGACA------TA-----------TTCGTGGG-TG-GGGATTTAATTTCATTGAAA-G-------T--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----t
gi|82993 : G--TTTCC-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----C-TG-CAG----AATTTCGTTTAAA-AGGTAATTT--A--A--AAAC--AA--A-----AATG-AT----T-------TT----T-ca
gi|82994 : TCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGTATTTAATTTCGTTGAAA-A-ATAATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82995 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTTCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----T----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82996 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCTTAGTGCGTTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTCCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----A----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82997 : ACCTAGTTGTGCCAAT-AA-AAGTCAACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACTAGTTAGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAACAAC---ACCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAATGCAGAC-CCAGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCATCTTTTAAAAGATTTAATTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATAACAATATATTTTATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82998 : GAAGGACGACGAGATCTAATCCAAAAAGGATTTCAGAAGGCAGGC-CTACTG--TAAATCACCATA----G----T----GCTACATCTCGTGACTGCGGTAATGAACTGTA-A---A
gi|82999 : cgacactgaaaccaattcatgcaaagtgggtcatcaacacgcacacttagatgAGGAAA-GTGTAAGTACGAC---ATCTAATCTAGAAACAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACAATA----G----TATGTGCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTATGTCTATTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGA-AAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|83000 : ACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-A---ATCATTGTGCTACGTCTTTTAAGAGATGTGTTTG-ATTTATTCAATTAAAATGTATCTCCATATATTTGATCATAAAAAGAAACA---ATAA-AATAAAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 1111111111111 2222 11
lowQualScore : 1 1 1 11 2 0 333333 55555555555 2222 1 1 1 1 1 1 55555 22 11 22 66666 555 44444444444444444444444444444444 2 33 55555 4444 9999999999999 0 1 777777 0 5 2 444 1 5555 2 444 2 2 2 1 5555 2 0 33 6666 5555 5555 0 1 2 444 1 44 1 66 3
lowQualScore : . . . .. . . ...... ........... .... . . . . . . ..... .. .. .. ..... ... ................................ . .. ..... .... ............. . . ...... . . . ... . .... . ... . . . . .... . . .. .... .... .... . . . ... . .. . .. .
lowQualScore : 0 1 0 55 2 6 000000 00000000000 2222 1 1 4 0 1 6 55555 66 55 77 99999 666 55555555555555555555555555555555 2 11 66666 7777 4444444444444 1 0 777777 5 0 5 444 0 3333 5 666 1 5 1 5 3333 5 9 44 6666 3333 3333 5 0 5 777 0 99 8 00 3
consensus : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Reference ( family-499 ) : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82957 : ATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGCACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT----------AA--AA--A-----AA---AT----TA------TT----T-TTT----T---CAA-A--AT-----T----TCGA-------------TATCGCATAGTGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGCGTCAGGATTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTAATCAAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCACTTGAT--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG--TTTATTCGTTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTTTAG-AA
gi|82958 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGATCTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---TT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATTGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGCAATTCACACATCG------CGCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGTTGTGCCAAT-AAAGAGTTGACAC---ATGCCAATTTGTACACTAATATACAAGTACAATATAGAACTAATGAATTAGTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGGAAAGAACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGATTTCAGAAGGCAGGT-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCATGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTTATGTGCTGCGTTTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATTTATTTAATCATTAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82959 : tATTAAATTT-TGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----TA---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTTACCGTTGCTGTAATTCACACGTCT------CGTGTCAGGGTTTATCGCACCTTGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTTATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-ACGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGATATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82960 : tATTCAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCGAAAACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCTATTT--C--C--AAAA--AC--A-----AT---AT----T-------TT----T-TTT----T----AC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTATTAACCTCTGCTACA--TTACACGTTG------TGCATCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGGCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTAAGAG---ATCTAACCTAGAAAGAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTAAAAATAGACA-TA-A---ACCAATGTGCTGCATCTTTTAGGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATGTTTAATCATAAAGAGAAACAATTATAG-AATAGAACAA
gi|82961 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTGAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--C--A--AAAA--AA--AAAAAAAA---AT----CAAAAAAATA----A-AGT----T---TAC-A--GT-----T----TCAG-------------CATCGCATAGTGAGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAGTGCACACATCG------CTCGTCAGGGTTTATTGCATCCCACTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAGTTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGGAAACCAGAGGAGAGGAAA-ATAAAAGTACAAA---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGTCAGGC-CTGCAG--TAAATAACAACAGTATG----T----GCCACATCACGTGACTGTGATAATAAACAGTA-A---ATAAATGTGCTACGACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTT----ATTAAAAA----------------TGATCATAAAGAGAAACAA-TATAA-
gi|82962 : tTTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGTACATAAATTCGTTGAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AT----AA---AT----A-------ATAAAATATGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGTTGTAATACATAC----------------AGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGCCAAC-AA-GAATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTTATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACAAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGTACGAG---ATCTAATCCAT--AGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAATAACAGTATG----T----GCCACATCAC------ATAATAATGAATGGTA-A---ATCAATGTGCTACG-CCCTTAAGAGATTTATTTG-TTTTATTCATCAAAAATGTATCACCATATATTTGATAATAAAGAGAAACA---ATAG-AATAAAAAAA
gi|82963 : tgATTAAATTT-CATGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTAAAATTCGTTGAAA-C-CCAATT---------------AA--A-----AA---A------------------------------------A--CT-----T----TCGA-------------C-TCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTT------CTCGTCAGGGTTTATCGCACCTAGCTGTGCCAAT-AA-GCATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAAGGGAGAAGTATGAG---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGAC-CTGCAA--TAAATAACAATAATACG----T----GCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTACATATATGAATGTGCTACAACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAA----------------TGATCATATAGAGAAAC---TATAGAAATAAAATA
gi|82964 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTAAATTCGTTAAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--AA--AGAAAGAA---AG----T-------TT------------------AC-A--CT-----T----TCGA-------------CACCGCATAGTGCGTTCCAGTAATGAACCTCTGCTGTAATATACACGTCG------CTCGTCAGTGTTTATCGCATCCCGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTCATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAA-GGAAAAGTACGAG---ATCTAATTCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCAG--TCAATAACAATAGTACG----T----GCCACATCATGTGACTGTGA
gi|82965 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGAC-----------------------------TG-GGGACCTAAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--CCGA--AAAA--AAT-A-----AA---AT--------------------------------A--A--C-------------GA-------------CATCGCATATTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTG------CGCGTCGGGGTTTATTGCACCCTGCT----------------TGACAC---ATGCGAATTAGTACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTCTGCAAACA------------A-GGA--------------TCTACTCCAGAAAGGGTTTCAGGAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACATTA----GCATGT----GCCACATCATGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTAGGTCTTTTAAGAGA-TTGTTTGTTTTTATTCATTAAAAATGTATCGCCAAATATTTGATCATAAAGAGAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82966 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCA--GACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGTCTTAAATTAGTTGAAA-C-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AATAAATAAAATAAAA---TA----A-AGT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGATGTGATGCACACGTCGTTGTTGCTCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGTCAAT-AA-CAGTTGACAC---ATACCAATTAATACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAAC-C---------AAA-GGA----TACGAA---ATCTAATCCAGAAAAGGTTTCAGAAGGCAGGCTTCAGTATTTAAATAACAATAGTATG----T----GCCACATCACGTGACT
gi|82967 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCC-ACTTCAAAGACAATGTCATA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AA----A-------AT----A-AAT----T---TAC-A--GC-----TAAAATCAG-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTACTGTAATACACACGTCG------CGCATCAGAGTTTATCACACGCTGCTGTGCCAGTTAA-GAGTTAACAC---ATGCCAATTCGTATCCTAATATACAAGTACGATATA-AACTTAT----T-GTTATGCAAACATCACGTGA
gi|82967 : tACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-ttgtgataatgaacagta
gi|82968 : tattaaatttcatggtttccacttcaaagacaatgtcatattcatggggacttaaattcattgaaaaccaatttaaaaaaaaaaaaaaataaatttacagctaaaatcagcatcgcatagtgcgttccagttattaacctctactgtaatacacacgtcgcgcatcagagtttatcacacgctgctgtgccagttaagagttaacacatgccaattcgtatcctaatatacaagtacgatataaacttattgttatgcaaATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGAATTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----
gi|82969 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-TCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GT-ACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTC--C--A---------A--A-----AA---A---------------------------------AC-C--C------------------------------------AGTGCATTCCAGTTATTAACCT--GCCTTAATATACACGTCG------CACGTCAGGGTTTATCGCACCGAGCTGTGCCAATTAA-GAATTGACACGGCATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTATAAGATTGAATTAAT----T-GTTATGCAAACTAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGT
gi|82970 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCT-GCTTCAAAGACA------TACATTTAAGGTATTC----G-TG-GGGATTTAAATTCGTTGAAACC-CCAATTT--C--A--AAAA--AAATA-----AA---AT----A-------AG----T-TACAAAATAAATAC-A--CT-----T----TCGA-------------CA
gi|82971 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACG------TA-----------TTC----A-TA-GGGATTTAAATTCGTTGAAA-G-GCAA
gi|82972 : tATTGAATTT-TGTGA--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TT-GGGTCTTAAATTCGTTGAAA-
gi|82973 : tATTAAATTT-CGTGA--TTTCC-ACTTCAATGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGATTTAAATTCATT
gi|82974 : tATTAATTTT-TGTTG--TTTTC-AGTTCAAGAACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--GAGA--AA--A-----AATC-AT----T-------TT----
gi|82975 : tATCAATTTT-CATTG--TTTTT-GGTTCATGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CAAAGTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82976 : tATTAATTAT-TGTTG--TTTTTTGGTTCAAGGACA------CA-----------TTC----G-TG-GGAACTTAATTTCGTTGAAA-A-CGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82977 : tATTAATTTTTCGTTG--TTTTT-GGTTCAA---CA------TA-----------TTT----G-TG-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-AGAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----GA---
gi|82978 : tATTACATTT-CATTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----GTTT-TTGACTTAATTTCGTTGAGA-A-TCAAATT--G--A--GAAAGTAA--A-----AA---ttgttct
gi|82979 : tATTCATTTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGCGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCT------CACGTCAGGGTTTATCGCACCCTGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAAAACTAAT----T-GTTATGCTAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAATGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCACGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----C----T----GCCACA--A-GTTACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAAcaatcatt
gi|82980 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GATTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--AAAA--AA--A-----AT---GT----T-------TT----
gi|82981 : ATTAATTTT-CATTA--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGAACTTAATTTCATCGAGA-A-CTAATTTAAG--A--AAGA--AA--A-----AA---AT----T-------AT----T-TT
gi|82982 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GGTTCAAGCACA------TA-----------TTT----G-TG-GGGTTTTAATTTCGTTGAAA-A-TTAATTT--T--AGTAAAA--AA--A-----AA---AT----C-------AT----T-TT
gi|82983 : ATTAATTTT-CGTTA--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-CG-GGGACTTAATTTCGCTGAAA-A-CGCATTT--A--A--GAGA--
gi|82984 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTT-GCTTCAAGGA---------------------TTT----G-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--AA--A-----AA---
gi|82985 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTTTGCTTCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TT-GGGACTAAATTTCATTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--GA--A-----AA---Atcgattcagtgcaaactttccaca
gi|82986 : ATTAATGTT-CATTG--TTTTC-GATTCAAGGACA------TA-----------TT-----G-TG-GGGAATT------GTTGAAA-A-CTAACTT--G--C--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTa
gi|82987 : ATTAATTTT-GGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACT------AA-----------TTC----G-TA-GGAATTTAATTACGTTG-AA-A-CAAATTT--T--A--GAAA-----------------------T-------TG----T-TTT----TAG-TGC-AATCTTTGAAT----TTGAGCATTTC------TATTACATAATGTGTTTTAATTACTAACCT
gi|82988 : TTAATTTT-CGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CGAATTT--T--AT-AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-TTA----G---TGCAA--CC-----T----TTGAATTAGAGTATTTCTATTACAAAACGCGTTTTAATTACTGACCTTTAC
gi|82989 : TTAAATTT-CTTTGCTTTTTT-GGTTCAATGGTA------TA-----------TTC----A-TG-AGGATTTAATTTCGTTGAAA-A-GAAATTT--A--A--AAAA--AA--A-----A
gi|82990 : TTG--TTTTT-GCTT-AAGGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTTGTGGAAA-A-
gi|82991 : ttaaaTTAATTTT-CTTTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTC----T-CATGCGACATGAATTTGTTGAAA-G-CTTATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82992 : AAATTT-TGTTG--TTTTT-ATTTCAAGGACA------TA-----------TTCGTGGG-TG-GGGATTTAATTTCATTGAAA-G-------T--A--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----t
gi|82993 : G--TTTCC-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----C-TG-CAG----AATTTCGTTTAAA-AGGTAATTT--A--A--AAAC--AA--A-----AATG-AT----T-------TT----T-ca
gi|82994 : TCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGTATTTAATTTCGTTGAAA-A-ATAATTT--G--A--GAAA--AA--A-----A
gi|82995 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTTCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----T----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82996 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--TA--A-----A-----T----TA------TT----T-TCT----T---TAC-A--CT-----T----TTGA-------------CATCGCTTAGTGCGTTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTCCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----A----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82997 : ACCTAGTTGTGCCAAT-AA-AAGTCAACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACTAGTTAGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAACAAC---ACCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAATGCAGAC-CCAGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCATCTTTTAAAAGATTTAATTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATAACAATATATTTTATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82998 : GAAGGACGACGAGATCTAATCCAAAAAGGATTTCAGAAGGCAGGC-CTACTG--TAAATCACCATA----G----T----GCTACATCTCGTGACTGCGGTAATGAACTGTA-A---A
gi|82999 : cgacactgaaaccaattcatgcaaagtgggtcatcaacacgcacacttagatgAGGAAA-GTGTAAGTACGAC---ATCTAATCTAGAAACAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACAATA----G----TATGTGCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTATGTCTATTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGA-AAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|83000 : ACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-A---ATCATTGTGCTACGTCTTTTAAGAGATGTGTTTG-ATTTATTCAATTAAAATGTATCTCCATATATTTGATCATAAAAAGAAACA---ATAA-AATAAAA
blockSeqs : A T G CT T ATGTCA CATTTAAGGTA GTGG T T A C G C CCG GT GT AT AAAAA TAA AAAATAAAATAAAGTTT A AT TTGAA AAAA ATTAGAGTATTTC T TTGTTG T A GGC A GAAT A ACC T G A A CGAG T TT GTAT CATG ATGT A C TAT T TT T AG A
blockSeqs : A . G . T . . . . . A . . C AAG T . T GAAAG TC CAAAAAAATAAAGTTT . . . . GCATTTC T . T . . A . . ACC T . A A C . . GTAT . . A . . T T T AG .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C A . . . T TG AAGTTACAAAATAAAT . . . . . T . . . . A . . ACC T . G T C . . ATAC . . A . . C A A AT .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . A A . . . . . AATAAAATATGTTT . . . . . G . . . . T . . CAG A . A T G . . GTAC . . T . . A T A AG .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TTGTTTTTAGT . . . . . A . . . . T . . AAG A . G T A . . GTAT . . T . . C T A AG .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TATTTTCTTT . . . . . A . . . . T . . CAG A . G T G . . . . . T . . G T A A .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TATTTTCTTT . . . . . A . . . . T . . CAG A . A T G . . . . . T . . G T A . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . A C . . . . . TTTTTTTTT . . . . . A . . . . T . . ATC T . G T G . . . . . T . . T A T . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . AATAAATTT . . . . . G . . . . T . . TAG A . G T A . . . . . A . . A T T . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C A . . . . . TTTTTTTTT . . . . . A . . . . A . . ACC T . G A C . . . . . A . . A T A . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TGTTTTAGT . . . . . A . . . . T . . ACC T . G T C . . . . . A . . T A A . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TTTTTTTT . . . . . T . . . . A . . ACC T . G T C . . . . . A . . G
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C C . . . . . TTTTTTTT . . . . . T . . . . A . . ACC T . G A C . . . . . T . . C
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . C T . . . . . TTT . . . . . T . . . . A . . A . . T G C . . . . . T . .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . G T . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . T . . . . . . T .
blockSeqs : A . G . . . . . . . A . . A T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . G T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . G G . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . C C . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . C T . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . . T . . G T . . . . .
blockSeqs : T . G . . . . . . . A . . T A . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . T T . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . G T . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . T G . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . T T . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . T T . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . A A . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . G G . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . A A . . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . T . . T A . . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . . A . . T G . . . .
blockSeqs : T . T . . . . . . . A . . T C . . . .
blockSeqs : A . T . . . . . . . T . . C C . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . T . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : N**** TTTTTNTTT*********************** T*
originalCons : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-TTT----T---TAC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
finalCons : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTTN----A--AAAA--AA--A-----AA---ATTTTTTNTTT-----------------------AC-A--CT-----T----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTGT-TTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Alignments
lowQualScore : 33333333333333333333333333333333 1111111111111 2222 11
lowQualScore : 1 1 1 11 2 0 333333 55555555555 2222 1 1 1 1 1 1 55555 22 55555555 33 66666 555 77777777777777777777777777777777 2 2 4444 2222222222222 0 1 777777 0 5 2 444 1 5555 2 444 2 2 2 1 5555 2 0 33 6666 5555 5555 0 1 2 444 1 44 1 66 3
lowQualScore : . . . .. . . ...... ........... .... . . . . . . ..... .. ........ .. ..... ... ................................ . . .... ............. . . ...... . . . ... . .... . ... . . . . .... . . .. .... .... .... . . . ... . .. . .. .
lowQualScore : 0 1 0 55 2 6 000000 00000000000 2222 1 1 4 0 1 6 55555 66 66666666 99 99999 666 00000000000000000000000000000000 2 2 7777 2222222222222 1 0 777777 5 0 5 444 0 3333 5 666 1 5 1 5 3333 5 9 44 6666 3333 3333 5 0 5 777 0 99 8 00 3
consensus : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--------AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-T-NT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
Reference ( family-499 ) : ATTAANTTT-CGTNG--TTTCC-GCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAANTTCGTTGAAA-A-CCAATTT--N--A--AAAA--------AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-T-NT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAATNCACACGTCG------CGCGTCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATNGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTGANAATGGACAGTA-A---ACNAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGAGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82957 : ATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGCACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT----------AA--------AA--A-----AA---AT----TA------TT----T-T-TT----T---CAA-AA-TT----TCGA-------------TATCGCATAGTGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGCGTCAGGATTTATCGCACCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTAATCAAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCACTTGAT--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG--TTTATTCGTTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTTTAG-AA
gi|82958 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGATCTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--------AA--A-----AA---TT----T-------TT----T-T-TT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATTGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGCAATTCACACATCG------CGCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGTTGTGCCAAT-AAAGAGTTGACAC---ATGCCAATTTGTACACTAATATACAAGTACAATATAGAACTAATGAATTAGTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGGAAAGAACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGATTTCAGAAGGCAGGT-CCGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACGTCATGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTTATGTGCTGCGTTTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATTTATTTAATCATTAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82959 : tATTAAATTT-TGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--------AA--A-----TA---AT----T-------TT----T-T--T----T---TAC-AC-TT----TTGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTTGTTTACCGTTGCTGTAATTCACACGTCT------CGTGTCAGGGTTTATCGCACCTTGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATAAAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAAAAGAACGAC---ATCTTATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-ACGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGATATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82960 : tATTCAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCGAAAACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCTATTT--C--C--AAAA--------AC--A-----AT---AT----T-------TT----T-T--T----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTATTAACCTCTGCTACA--TTACACGTTG------TGCATCAGGGTTTATCGCACCCCGCTGTGGCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTAAGAG---ATCTAACCTAGAAAGAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCACATCACGTGACTGTAAAAATAGACA-TA-A---ACCAATGTGCTGCATCTTTTAGGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATGTTTAATCATAAAGAGAAACAATTATAG-AATAGAACAA
gi|82961 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTGAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--C--A--AAAA--------AA--AAAAAAAA---AT----CAAAAAAATA----A-A-GT----T---TAC-AG-TT----TCAG-------------CATCGCATAGTGAGTTCCAGTTATTAACCTCTGCTGTAGTGCACACATCG------CTCGTCAGGGTTTATTGCATCCCACTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAGTTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGGAAACCAGAGGAGAGGAAA-ATAAAAGTACAAA---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGTCAGGC-CTGCAG--TAAATAACAACAGTATG----T----GCCACATCACGTGACTGTGATAATAAACAGTA-A---ATAAATGTGCTACGACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTT----ATTAAAAA----------------TGATCATAAAGAGAAACAA-TATAA-
gi|82962 : tTTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGTACATAAATTCGTTGAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--------AA--AT----AA---AT----A-------ATAAAATAT-GT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGTTGTAATACATAC----------------AGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGCCAAC-AA-GAATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTTATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACAAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGTACGAG---ATCTAATCCAT--AGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAATAACAGTATG----T----GCCACATCAC------ATAATAATGAATGGTA-A---ATCAATGTGCTACG-CCCTTAAGAGATTTATTTG-TTTTATTCATCAAAAATGTATCACCATATATTTGATAATAAAGAGAAACA---ATAG-AATAAAAAAA
gi|82963 : tgATTAAATTT-CATGG--TTTCT-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTAAAATTCGTTGAAA-C-CCAATT---------------------AA--A-----AA---A-------------------------------------AC-TT----TCGA-------------C-TCGCATAGTGTGTTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTT------CTCGTCAGGGTTTATCGCACCTAGCTGTGCCAAT-AA-GCATTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAAGGGAGAAGTATGAG---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGAC-CTGCAA--TAAATAACAATAATACG----T----GCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTACATATATGAATGTGCTACAACTTTTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAA----------------TGATCATATAGAGAAAC---TATAGAAATAAAATA
gi|82964 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGTCTTAAATTCGTTAAAA-C-CCAATTT--C--C--AAAA--------AA--AGAAAGAA---A-----------------------GT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CACCGCATAGTGCGTTCCAGTAATGAACCTCTGCTGTAATATACACGTCG------CTCGTCAGTGTTTATCGCATCCCGCTGTGCAAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTCATATACAAGTACGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAACCAGAGGAGAGGAAA-GGAAAAGTACGAG---ATCTAATTCAGAAAGGGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCAG--TCAATAACAATAGTACG----T----GCCACATCATGTGACTGTGA
gi|82965 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGAC-----------------------------TG-GGGACCTAAATTCGTTGAAA-C-CAAATTT--CCGA--AAAA--------AAT-A-----AA---AT---------------------------------A--AC---------GA-------------CATCGCATATTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGCTGTAATACACACGTTG------CGCGTCGGGGTTTATTGCACCCTGCT----------------TGACAC---ATGCGAATTAGTACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTCTGCAAACA------------A-GGA--------------TCTACTCCAGAAAGGGTTTCAGGAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACATTA----GCATGT----GCCACATCATGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTAGGTCTTTTAAGAGA-TTGTTTGTTTTTATTCATTAAAAATGTATCGCCAAATATTTGATCATAAAGAGAAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|82966 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCA--GACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGTCTTAAATTAGTTGAAA-C-CCAATTT--C--A--AAAA--------AA--A-----AATAAATAAAATAAAA---TA----A-A-GT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTAATTAACCTCTGATGTGATGCACACGTCGTTGTTGCTCGTCAGGGTTTATTGCACCCCGCTGTGTCAAT-AA-CAGTTGACAC---ATACCAATTAATACCCTAATATACAAGTATGATATTGAACTAAT----T-GTTATGCAAAC-C---------AAA-GGA----TACGAA---ATCTAATCCAGAAAAGGTTTCAGAAGGCAGGCTTCAGTATTTAAATAACAATAGTATG----T----GCCACATCACGTGACT
gi|82967 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCC-ACTTCAAAGACAATGTCATA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTT--A--A--AAAA--------AA--A-----AA---AA----A-------AT----A-A-AT----T---TAC-AG-CTAAAATCAG-------------CATCGCATAGTGCGTTCCAGTTATTAACCTCTACTGTAATACACACGTCG------CGCATCAGAGTTTATCACACGCTGCTGTGCCAGTTAA-GAGTTAACAC---ATGCCAATTCGTATCCTAATATACAAGTACGATATA-AACTTAT----T-GTTATGCAAACATCACGTGA
gi|82967 : tACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-ttgtgataatgaacagta
gi|82968 : tattaaatttcatggtttccacttcaaagacaatgtcatattcatggggacttaaattcattgaaaaccaatttaaaaaaaaaaaaaaataaatttacagctaaaatcagcatcgcatagtgcgttccagttattaacctctactgtaatacacacgtcgcgcatcagagtttatcacacgctgctgtgccagttaagagttaacacatgccaattcgtatcctaatatacaagtacgatataaacttattgttatgcaaATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTTAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGAATTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--------AA--A-----AA---AT----
gi|82969 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-TCTTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TG-GT-ACTTAAATTCATTGAAA-A-CCAATTC--C--A---------------A--A-----AA---A----------------------------------AC-CC--------------------------------AGTGCATTCCAGTTATTAACCT--GCCTTAATATACACGTCG------CACGTCAGGGTTTATCGCACCGAGCTGTGCCAATTAA-GAATTGACACGGCATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTATAAGATTGAATTAAT----T-GTTATGCAAACTAGAGGAGAGGAAA-GGAGAAGT
gi|82970 : tATTAAATTT-CATGG--TTTCT-GCTTCAAAGACA------TACATTTAAGGTATTC----G-TG-GGGATTTAAATTCGTTGAAACC-CCAATTT--C--A--AAAA--------AAATA-----AA---AT----A-------AG----T-T-ACAAAATAAATAC-AC-TT----TCGA-------------CA
gi|82971 : tATTAAATTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACG------TA-----------TTC----A-TA-GGGATTTAAATTCGTTGAAA-G-GCAA
gi|82972 : tATTGAATTT-TGTGA--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TT-GGGTCTTAAATTCGTTGAAA-
gi|82973 : tATTAAATTT-CGTGA--TTTCC-ACTTCAATGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGATTTAAATTCATT
gi|82974 : tATTAATTTT-TGTTG--TTTTC-AGTTCAAGAACA------TA-----------TTC----A-TA-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--GAGA--------AA--A-----AATC-AT----T-------TT----
gi|82975 : tATCAATTTT-CATTG--TTTTT-GGTTCATGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CAAAGTT--T--A--GAAA--------AA--A-----AA---
gi|82976 : tATTAATTAT-TGTTG--TTTTTTGGTTCAAGGACA------CA-----------TTC----G-TG-GGAACTTAATTTCGTTGAAA-A-CGAATTT--T--A--GAAA--------AA--A-----AA---
gi|82977 : tATTAATTTTTCGTTG--TTTTT-GGTTCAA---CA------TA-----------TTT----G-TG-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-AGAATTT--T--A--GAAA--------AA--A-----GA---
gi|82978 : tATTACATTT-CATTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----GTTT-TTGACTTAATTTCGTTGAGA-A-TCAAATT--G--A--GAAAGT------AA--A-----AA---ttgttct
gi|82979 : tATTCATTTT-CGTGG--TTTCC-ACTTCAAAGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAAATTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--------AA--A-----AA---AT----T-------TT----T-T-TT----T---TAC-AC-TT----TCGA-------------CATCGCATAGCGCGTTCCAGTTGTTAACCTTTGCTGTAATTCACACGTCT------CACGTCAGGGTTTATCGCACCCTGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAAAACTAAT----T-GTTATGCTAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAATGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCACGC-CCGGTG--TAAATAACAATA----C----T----GCCACA--A-GTTACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGTGTCTTTTAAGAGATTTGTTTG-ATTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTAATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAAcaatcatt
gi|82980 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GATTCAAAGACA------TA-----------TTC----A-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-TGAATTT--T--A--AAAA--------AA--A-----AT---GT----T-------TT----
gi|82981 : ATTAATTTT-CATTA--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGAACTTAATTTCATCGAGA-A-CTAATTTAAG--A--AAGA--------AA--A-----AA---AT----TA------TT----T-T-
gi|82982 : ATTAATTTT-TGTTG--TTTTT-GGTTCAAGCACA------TA-----------TTT----G-TG-GGGTTTTAATTTCGTTGAAA-A-TTAATTT--T--AGTAAAA--------AA--A-----AA---ATCA--T-------TT----T-
gi|82983 : ATTAATTTT-CGTTA--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-CG-GGGACTTAATTTCGCTGAAA-A-CGCATTT--A--A--GAGA--------
gi|82984 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTT-GCTTCAAGGA---------------------TTT----G-TT-GGGACTTAATTTCGTTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--------AA--A-----AA---
gi|82985 : ATTAATTTT-CATTG--TTTTTTGCTTCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TT-GGGACTAAATTTCATTGAAA-A-CTAATTT--T--A--GAAA--------GA--A-----AA---Atcgattcagtgcaaactttccaca
gi|82986 : ATTAATGTT-CATTG--TTTTC-GATTCAAGGACA------TA-----------TT-----G-TG-GGGAATT------GTTGAAA-A-CTAACTT--G--C--AAAA--------AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-T-a
gi|82987 : ATTAATTTT-GGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACT------AA-----------TTC----G-TA-GGAATTTAATTACGTTG-AA-A-CAAATTT--T--A--GAAATTGTTTTTAGT-G-----CA---AT----C-------TT----T-GAAT----T---TGA-GCATT----TC---------------TATTACATAATGTGTTTTAATTACTAACCTt
gi|82988 : TTAATTTT-CGTTG--TTTTT-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----G-TG-GGGACTTAATTTTGTTGAAA-A-CGAATTT--T--AT-AAAA--------AA--A-----AA---AT----T-------GT----T-T-TA----G---TGCAAC-CT----TTGAATTAGAGTATTTCTATTACAAAACGCGTTTTAATTACTGACCTTTAC
gi|82989 : TTAAATTT-CTTTGCTTTTTT-GGTTCAATGGTA------TA-----------TTC----A-TG-AGGATTTAATTTCGTTGAAA-A-GAAATTT--A--A--AAAA--------AA--A-----A
gi|82990 : TTG--TTTTT-GCTT-AAGGACA------TA-----------TTC----A-TG-GGGACTTAAATTTGTGGAAA-A-
gi|82991 : ttaaaTTAATTTT-CTTTG--TTTTT-GGTTCAAAGACA------TA-----------TTC----T-CATGCGACATGAATTTGTTGAAA-G-CTTATTT--G--A--GAAA--------AA--A-----A
gi|82992 : AAATTT-TGTTG--TTTTT-ATTTCAAGGACA------TA-----------TTCGTGGG-TG-GGGATTTAATTTCATTGAAA-G-------T--A--A--AAAA--------AA--A-----AA---AT----t
gi|82993 : G--TTTCC-GGTTCAAGGACA------TA-----------TTC----C-TG-CAG----AATTTCGTTTAAA-AGGTAATTT--A--A--AAAC--------AA--A-----AATG-AT----T-------TT----T-ca
gi|82994 : TCAAGGACA------TA-----------TTT----G-TG-GGTATTTAATTTCGTTGAAA-A-ATAATTT--G--A--GAAA--------AA--A-----A
gi|82995 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--------TA--A-----A-----T----TA------TT----T-T-CT----T---TAC-AC-TT----TTGA-------------CATCGCATAGTGCATTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTTCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----T----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82996 : TTCGTTGAAA-A-CCAATTT--C--A--AAAA--------TA--A-----A-----T----TA------TT----T-T-CT----T---TAC-AC-TT----TTGA-------------CATCGCTTAGTGCGTTCCAGTTGTTAATCTTTGCTGTAATTCACACGTCG------CGTGTCAGGGTTTATCGCTCCCCGCTGTGCCAAT-AA-GAGTTGACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACAAGTACGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGTACGAC---ATCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAACGCAGGC-CTGGAG--TAAATAACAATA----A----A----GCCACGTCACGTGACTGTGAAAATGGACAGTA-A---ACAAATGTGCTGC
gi|82997 : ACCTAGTTGTGCCAAT-AA-AAGTCAACAC---ATGCCAATTAGTACCCTAATATACTAGTTAGATATAGAACTAAT----T-GTTATGCAAACACCAGGTGAGGAAA-GGAGAAGAACAAC---ACCTAATCCAGAAAGGGTTTCAGAATGCAGAC-CCAGTG--TAAATAACAATA----G----T----GCCA---CACGTGAC--TGAAAATGGACAGTA-A---ACTAATGTGCTGCATCTTTTAAAAGATTTAATTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATAACAATATATTTTATCATAAAATGAAACAAGTATAG-AATAGAATAA
gi|82998 : GAAGGACGACGAGATCTAATCCAAAAAGGATTTCAGAAGGCAGGC-CTACTG--TAAATCACCATA----G----T----GCTACATCTCGTGACTGCGGTAATGAACTGTA-A---A
gi|82999 : cgacactgaaaccaattcatgcaaagtgggtcatcaacacgcacacttagatgAGGAAA-GTGTAAGTACGAC---ATCTAATCTAGAAACAGTTTCAGAAGGCAGGC-CTGCTG--TAAATAACAATA----G----TATGTGCCACATCAAGTGACTGTGATAATGAACAGTA-A---ATGAATGTGCTATGTCTATTAAGAGATTTGTTTG-TTTTATTCATTAAAAATGTATCACCATATATTTGATCATAAAGA-AAACA---ATAG-AATTAAATAA
gi|83000 : ACATCACGTGATTGTGATAATGAACAGTA-A---ATCATTGTGCTACGTCTTTTAAGAGATGTGTTTG-ATTTATTCAATTAAAATGTATCTCCATATATTTGATCATAAAAAGAAACA---ATAA-AATAAAA