lowQualScore : 1 333333333 1111111 222222222222222222 1111 1111 111 1111111 111
lowQualScore : 2 888888888888888888 111 444444444 3 1 7 4444444 1 666666 6666 333333333333333333 3333 6666 333 444444 3 3 11 1 4444444 77777777777777 11 33 33 0 9999 0 0 4444 1 000 9 5555 5 0 5555555555 99999 0000000 3 000 111 11 2222 0 1
lowQualScore : . .................. ... ......... . . . ....... . ...... .... .................. .... .... ... ...... . . .. . ....... .............. .. .. .. . .... . . .... . ... . .... . . .......... ..... ....... . ... ... .. .... . .
lowQualScore : 1 000000000000000000 999 222222222 2 1 4 4444444 0 000000 2222 999999999999999999 9999 7777 999 999999 0 0 33 0 9999999 11111111111111 33 22 11 9 7777 9 9 7777 8 444 1 1111 9 9 8888888888 55555 5555555 0 999 666 33 0000 9 0
consensus : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---T---C-TG----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Reference ( gi|144333 ) : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144332 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---TT----AAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144334 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CCAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATATT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAA--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144336 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144335 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144339 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-TAT---T---T-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGTT--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144338 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-TAT---T---T-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGTT--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144340 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TCAT-T---T---C-TA----A-ATA----C----C--------A----CT----TC--C-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGG-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTA--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAGT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144337 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGCTTT-T-T---T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-T-A------------T--T--AT-GA----A-A-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAA-AG----CTCT---TGAAT---TAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144342 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGGT--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144341 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-TT--T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGGT--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144343 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-TA----A-ACC----C----A--------A----AT----TC--T-TAA--A------AT-C-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATATT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TT
gi|144345 : TGGGAACTAGATTCATATTTGGAACGAGAATATTACACG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---T---C-TCGC--A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TTC--A------AT-T-G--T-T-------TGT-G-A---------T--T--TT-ATTGA----T-T-TT-T--AA-ATGGT--ATG-T----AATA-T----------T---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144344 : TGGGAATTAGATTAATA------------------CCAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-TGTTT---C-TA----A-ATC----T----T--------A----AT----TA--T-AAG--A------AC-T-G--T-T-------AGT-C-A---------T--T--TT-AT-GA----A-T-TG-C--AA--TGCT--ATG-T----AATA-T----------A---T-----TAC-AG----TATT---TGAAT---AAAAC--GTT----GTTTAAA-CAA-AAT
gi|144346 : TGGGAACTAGATTCAAA------------------CAAG---CT----AAT-GAGC-TT-T-A---T---T-CA----A-AAC----C----C--------A----AT----TC--A-TAG--AC-----AT-T----T-T-------TGT-C-A---------T--T--TTAAT-AT----T-T-TG-C--AA-ATATT--ATG-T----TATA-T----------T---C-TTTGTGC-AGTATTTTTT---TTTAT---AAAAG--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144347 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TGTTTCC-ATT----C----CGCAT----A----AT----TCG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-A------TATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144351 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAGTTTCT----AA---AGC-TT-T-T---TTT-C-TG----T-ATC----C----TTTCCACATA----AT----TCG-T-TAA--A---------C-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC---------CTATGTGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144350 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT-----GT-AAGC-TT-TCT---T---C-TG----A-ATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGTG--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144348 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----C----T--------------T----TC--CATAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT---ATG-T----TAAA-T----------A-----TGTGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144349 : TGGAAGC-AGATTAACA------------------CACG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----C----TTTCCACATA----AT----TTG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144353 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT-----GT-AAGC-TT-TCT---T---C-TG----A-ATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGTG--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-A
gi|144352 : TGGGAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAAA---GGT-TT-T-T---T---C-TG----T-ATC-----------------------AT----TT--C-CAC--A-------T-T-A--T-T-------TGT-T-AAATTATGACT--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTT-AAT
gi|144354 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT-----GT-AAGC-TT-TCT---T---C-TG----A-ATC----C-------------------T----TT--T-CAT--A------AT-T-G--TATACACATGTGT-TAA---------T--TAAT--AT-GA----CTT-TG-TG-AA-ATTTTCAATG-T----AAT-------------------TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTG-AA
gi|144355 : TGAAAGC-AGATTTACA------------------CTAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144356 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------TGAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-TTA-AAT
gi|144357 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AA--T--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144359 : TGGGAGACAGATTCAAA------------------AAAG---CT----G-T-AAGC-TT-TCT---T---C-TG----A-ATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------T-T-C-A---------C--------AT-GA----C-TGTG-TT-AA-GTAAT--ATG-T----GATA-TTTTCAATGGAA---T-TGTTTAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAA--AT-----GTTTAAA-CTA-AGT
gi|144358 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AAT---GT-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATCATTTC----C--------ACATAAT----TCG-T-TAA--ACATATGAC-T-G--T-A-------TGC-------------T--T--T--AT-----------TG-TT-AA-ATGT---ATACT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144360 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATCGTTTC----C--------ACATAAT----TCA-T-TAA--AC-----ATAC-GACT-T-------TAT-G-C---------T--T--T--AT-TG----T-T-T------A-ATGT---ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAC--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144361 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGC-TT-T-T---T---T-CA----GTATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------ATGT-G--T-TAAA----TGT---A---------T--T--G--CT-TC----A-T-TG-TT-AA-ATGT---ATG-CTA--AATA-T----------A---CGTATGT-----------------GAAT---AAAAT--ATT----GTTTGAA-CTA-AA
gi|144362 : GGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGCTTT-T-T---T---C-TG----T-ATCTTT-C----C--------AC---ATAATGTG--C-TAG--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-TGCTTCA-T-TGTT--AA-ATGTA--TTC-T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ACT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144363 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGCTTT-T-T---T---C-TG----T-ATC----C------------------AT----TC--CACAT--A------ATGT-A--T-T-------AG----A---------T--G--T--AT-GACTGTA-T-TA-CTTCA-TTGTTAAATG-T----ATTC-T----------AAATT-TATGTAC-------TTATA--TGAAT---AAAAT--A-T----ATTTAAA-CTA-AAT
gi|144364 : GGAGACAGAT-CATA------------------TAAG---C-----------GC-TT-C-C---T---CCTG----G-ATC----CTTT-C--------A----ACATG-TC--T--AG------------T-G--T-T-------TGA-A-A---------TGTT--T--AT-------A-T-TG----AA-ATGTT---TG-T----A-CA-A----------A---C--ATGTAT-TA----TTGT----GAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144365 : GAACTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TG-T-T---T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGC-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144366 : AGC-AGATTTACA------------------CGAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-TG----T-ATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT---ACGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---ACAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144367 : GCTAGATTCATA------------------CAAG---TT----AAT-TAGC-TT-T-TTT-T---C-TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TTTGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144368 : CTAGATTCATA------------------AATG---CT----AAT-AAGC-TT-T-T---TGTTC-TA----A-ATC----C----A--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--TA-T--AT-GA----C-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----ACTA-T----------A---C-TATATAC-AG----ATCT---TGAAT---ACAAT--ATT----GTCTAAA-CCA-A
gi|144369 : TA------------------TAAG---CT----ATTATAGC-TT-TCT---T---C-AA----G-ATC----C----T-----------------------T-TA-------------T-A--C-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-----------TG-T--GT-ATATTGAATG-T----ATGACT----------A---C-TATGTTC-A------TTT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAAGACA-AAT
gi|144370 : -T-T---T---C-TA----C-AAC----G----C--------A-----T----TG--A-TAT--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-AGGTT--ATG-T----CATA-G----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAACT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144371 : -TA----A-ATC----C----C--------A----AT----TTGAT-TAG--A------AT-C----------------T-C-AA--------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-T--AA-AA--T--ATG-C----AATA-T----------G---C-TATGTAC-AG----TTCT---TAAAT---AGAATCAATTTGAAGTTTAAA-TCA-A
gi|144372 : T----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGTT--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAT-AG----TTCT---TAAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144373 : --T-T-------TGT-C-AC--------T--T--T--AT-GA----A-T-TT-T--AA-ATGTT--TCG-T----AAT----------------------GTAC-AG----TTCT---TGAATAAAAAAAT--ATT----GTTTAGG-CCATAAT
gi|144374 : -C-A---------T--TG-T--GT-GA----A-T-AG-C--CA-GTGTT--ATG-T----AATA-T----------A---T-TACATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATA----AATTGAA-TTA-AAT
gi|144375 : --AT-GA----A-T-TG-C--AG-ATATT--GTG-T----AGTA-T----------A---C-TAAGTAC-AG----TTCC---TGTAC---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144376 : -ATGTT--ATG-G----AATA-T----------G---C-TGTACAT-AG----TTTA---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CCA-AAT
Alignments
lowQualScore : 1 333333333 222 222222222222222222 1111 1111 111
lowQualScore : 1 777777777777777777 111 222222222 3 1 7 111 222 1 1 44444 6666 333333333333333333 3333 66 4 333 444444 2 2 11 1 4444444 66666666666666 11 33 33 0 9999 0 0 4444 1 9999 8 5555 5 0 5555555555 99999 9999999 2 000 111 11 1111 0 1
lowQualScore : . .................. ... ......... . . . ... ... . . ..... .... .................. .... .. . ... ...... . . .. . ....... .............. .. .. .. . .... . . .... . .... . .... . . .......... ..... ....... . ... ... .. .... . .
lowQualScore : 6 888888888888888888 888 444444444 2 1 4 888 666 0 0 33333 2222 999999999999999999 9999 44 9 666 888888 9 9 33 0 8888888 33333333333333 33 11 11 9 2222 9 9 1111 8 8888 0 0000 6 9 7777777777 00000 8888888 7 777 666 22 9999 9 0
consensus : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-G----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Reference ( family-494 ) : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---T---C-T-G----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144332 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---TT----AAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144333 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---T---C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144334 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CCAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAA--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144335 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144336 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144337 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGCTTT-T-T---T---C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-T-A------------T--T--AT-GA----A-A-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAA-AG----CTCT---TGAAT---TAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144338 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-TAT---T---T-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144339 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TT-TAT---T---T-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144340 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TCAT-T---T---C-T-A----AATA----C----C--------A----CT----TC--C-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGG-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-A--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAGT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144341 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144342 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144343 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---TT--C-T-A----AACC----C----A--------A----AT----TC--T-TAA--A------AT-C-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TT
gi|144344 : TGGGAATTAGATTAATA------------------CCAG---CT----AAT-TAGC-TT-T-TGTTT---C-T-A----AATC----T----T--------A----AT----TA--T-AAG--A------AC-T-G--T-T-------AGT-C-A---------T--T--TT-AT-GA----A-T-TG-C--AA--TGC-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-----TAC-AG----TATT---TGAAT---AAAAC--GTT----GTTTAAA-CAA-AAT
gi|144345 : TGGGAACTAGATTCATATTTGGAACGAGAATATTACACG---CT----TAT-TAGC-TT-T-T---T---C-TCGC---AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TTC--A------AT-T-G--T-T-------TGT-G-A---------T--T--TT-ATTGA----T-T-TT-T--AA-ATGG-T--ATG-T----AATA-T----------T---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144346 : TGGGAACTAGATTCAAA------------------CAAG---CT----AAT-GAGC-TT-T-A---T---T-C-A----AAAC----C----C--------A----AT----TC--A-TAG--AC-----AT-T----T-T-------TGT-C-A---------T--T--TTAAT-AT----T-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----TATA-T----------T---C-TTTGTGC-AGTATTTTTT---TTTAT---AAAAG--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144347 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-GTTTCCATT----C----CGCAT----A----AT----TCG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-A------TATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144348 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----C----T--------------T----TC--CATAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-T----TAAA-T----------A-----TGTGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144349 : TGGAAGC-AGATTAACA------------------CACG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TTG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144350 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----G-T-AAGC-TT-TCT---T---C-T-G----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144351 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAGTTTCT----AA---AGC-TT-T-T---TTT-C-T-G----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TCG-T-TAA--A---------C-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC---------CTATGTGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144352 : TGGGAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAAA---GGT-TT-T-T---T---C-T-G----TATC-----------------------AT----TT--C-CAC--A-------T-T-A--T-T-------TGT-T-AAATTATGACT--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTT-AAT
gi|144353 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----G-T-AAGC-TT-TCT---T---C-T-G----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-A
gi|144354 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----G-T-AAGC-TT-TCT---T---C-T-G----AATC----C-------------------T----TT--T-CAT--A------AT-T-G--TATACACATGTGT-TAA---------T--TAAT--AT-GA----CTT-TG-TG-AA-ATTT-TCAATG-T----AAT-------------------TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTG-AA
gi|144355 : TGAAAGC-AGATTTACA------------------CTAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144356 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------TGAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-TTA-AAT
gi|144357 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AA--T--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144358 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AAT---GT-TT-T-T---TT--C-T-G----TATCATTTC----C--------ACATAAT----TCG-T-TAA--ACATATGAC-T-G--T-A-------TGC-------------T--T--T--AT-----------TG-TT-AA-ATGTAT--AC--T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144359 : TGGGAGACAGATTCAAA------------------AAAG---CT----G-T-AAGC-TT-TCT---T---C-T-G----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------T-T-C-A---------C--------AT-GA----C-TGTG-TT-AA-GTAA-T--ATG-T----GATA-TTTTCAATGGAA---T-TGTTTAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAA--AT-----GTTTAAA-CTA-AGT
gi|144360 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATCGTTTC----C--------ACATAAT----TCA-T-TAA--AC-----ATAC-GACT-T-------TAT-G-C---------T--T--T--AT-TG----T-T-T------A-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAC--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144361 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-A-G----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------ATGT-G--T-TAAA----TGT---A---------T--T--G--CT-TC----A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-CTA--AATA-T----------A---CGTATGT-----------------GAAT---AAAAT--ATT----GTTTGAA-CTA-AA
gi|144362 : GGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGCTTT-T-T---T---C-T-G----TATCTTT-C----C--------AC---ATAATGTG--C-TAG--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-TGCTTCA-T-TGTT--AA-ATGT-A--TTC-T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ACT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144363 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCA-AA---AGCTTT-T-T---T---C-T-G----TATC----C------------------AT----TC--CACAT--A------ATGT-A--T-T-------AG----A---------T--G--T--AT-GACTGTA-T-TA-CTTCA-TTGT-TAAATG-T----ATTC-T----------AAATT-TATGTAC-------TTATA--TGAAT---AAAAT--A-T----ATTTAAA-CTA-AAT
gi|144364 : GGAGACAGAT-CATA------------------TAAG---C-----------GC-TT-C-C---T---CCT-G----GATC----CTTT-C--------A----ACATG-TC--T--AG------------T-G--T-T-------TGA-A-A---------TGTT--T--AT-------A-T-TG----AA-ATGT-T---TG-T----A-CA-A----------A---C--ATGTAT-TA----TTGT----GAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144365 : GAACTAGATTCATA------------------CAAG---CT----AAT-TAGC-TG-T-T---T---C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGC-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144366 : AGC-AGATTTACA------------------CGAG---CTTCT-AA---AGC-TT-T-T---TT--C-T-G----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ACGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---ACAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144367 : GCTAGATTCATA------------------CAAG---TT----AAT-TAGC-TT-T-T---TTT-C-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TTTGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144368 : CTAGATTCATA------------------AATG---CT----AAT-AAGC-TT-T-T---TGTTC-T-A----AATC----C----A--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--TA-T--AT-GA----C-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----ACTA-T----------A---C-TATATAC-AG----ATCT---TGAAT---ACAAT--ATT----GTCTAAA-CCA-A
gi|144369 : A------------------TAAG---CT----ATTATAGC-TT-TCT---T---C-A-A----GATC----C----T-----------------------T-TA-------------T-A--C-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-----------TG-T--GT-ATAT-TGAATG-T----ATGACT----------A---C-TATGTTC-A------TTT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAAGACA-AAT
gi|144370 : t-TAT--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-AGGT-T--ATG-T----CATA-G----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAACT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144371 : tttctacaacgcattga-T-A----AATC----C----C--------A----AT----TTGAT-TAG--A------AT-C----------------T-C-AA--------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-T--AA-AA---T--ATG-C----AATA-T----------G---C-TATGTAC-AG----TTCT---TAAAT---AGAATCAATTTGAAGTTTAAA-TCA-A
gi|144372 : T----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAT-AG----TTCT---TAAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144373 : --T-T-------TGT-C-AC--------T--T--T--AT-GA----A-T-TT-T--AA-ATGT-T--TCG-T----AAT----------------------GTAC-AG----TTCT---TGAATAAAAAAAT--ATT----GTTTAGG-CCATAAT
gi|144374 : -C-A---------T--TG-T--GT-GA----A-T-AG-C--CA-GTGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-TACATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATA----AATTGAA-TTA-AAT
gi|144375 : --AT-GA----A-T-TG-C--AG-ATAT-T--GTG-T----AGTA-T----------A---C-TAAGTAC-AG----TTCC---TGTAC---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144376 : -ATGT-T--ATG-G----AATA-T----------G---C-TGTACAT-AG----TTTA---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CCA-AAT
Alignments
lowQualScore : 1 33333333 222222222222222222 1111 1111 111
lowQualScore : 1 777777777777777777 111 22222222 11 11 2 44444 6666 333333333333333333 3333 66 4 333 444444 2 2 11 1 4444444 66666666666666 11 33 33 0 9999 0 0 4444 1 9999 8 5555 5 0 5555555555 99999 9999999 2 000 111 11 1111 0 1
lowQualScore : . .................. ... ........ .. .. . ..... .... .................. .... .. . ... ...... . . .. . ....... .............. .. .. .. . .... . . .... . .... . .... . . .......... ..... ....... . ... ... .. .... . .
lowQualScore : 6 888888888888888888 888 00000000 44 44 1 33333 2222 999999999999999999 9999 44 9 666 888888 9 9 33 0 8888888 33333333333333 33 11 11 9 2222 9 9 1111 8 8888 0 0000 6 9 7777777777 00000 8888888 7 777 666 22 9999 9 0
consensus : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Reference ( family-494 ) : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144332 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144333 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144334 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAA--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144335 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144336 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144337 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-T-A------------T--T--AT-GA----A-A-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAA-AG----CTCT---TGAAT---TAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144338 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144339 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144340 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTCAT--T--T-CTA----AATA----C----C--------A----CT----TC--C-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGG-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-A--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAGT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144341 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144342 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144343 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AACC----C----A--------A----AT----TC--T-TAA--A------AT-C-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TT
gi|144344 : TGGGAATTAGATTAATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTTGTT--T-CTA----AATC----T----T--------A----AT----TA--T-AAG--A------AC-T-G--T-T-------AGT-C-A---------T--T--TT-AT-GA----A-T-TG-C--AA--TGC-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-----TAC-AG----TATT---TGAAT---AAAAC--GTT----GTTTAAA-CAA-AAT
gi|144345 : TGGGAACTAGATTCATATTTGGAACGAGAATATTACACG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--C-TCGC---AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TTC--A------AT-T-G--T-T-------TGT-G-A---------T--T--TT-ATTGA----T-T-TT-T--AA-ATGG-T--ATG-T----AATA-T----------T---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144346 : TGGGAACTAGATTCAAA------------------CAAG---CT---AAT-GAGCTTTA--T--T-C-A----AAAC----C----C--------A----AT----TC--A-TAG--AC-----AT-T----T-T-------TGT-C-A---------T--T--TTAAT-AT----T-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----TATA-T----------T---C-TTTGTGC-AGTATTTTTT---TTTAT---AAAAG--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144347 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTGTTTCCATT----C----CGCAT----A----AT----TCG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-A------TATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144348 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CATAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-T----TAAA-T----------A-----TGTGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144349 : TGGAAGC-AGATTAACA------------------CACG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TTG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144350 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144351 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAGTTTCT---AA---AGCTTTT--T--TTCTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TCG-T-TAA--A---------C-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC---------CTATGTGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144352 : TGGGAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGGTTTT--T--T-CTG----TATC-----------------------AT----TT--C-CAC--A-------T-T-A--T-T-------TGT-T-AAATTATGACT--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTT-AAT
gi|144353 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-A
gi|144354 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----GT-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C-------------------T----TT--T-CAT--A------AT-T-G--TATACACATGTGT-TAA---------T--TAAT--AT-GA----CTT-TG-TG-AA-ATTT-TCAATG-T----AAT-------------------TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTG-AA
gi|144355 : TGAAAGC-AGATTTACA------------------CTAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144356 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------TGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-TTA-AAT
gi|144357 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AA--T--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144358 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAAT---GTTTTT--T--T-CTG----TATCATTTC----C--------ACATAAT----TCG-T-TAA--ACATATGAC-T-G--T-A-------TGC-------------T--T--T--AT-----------TG-TT-AA-ATGTAT--AC--T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144359 : TGGGAGACAGATTCAAA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------T-T-C-A---------C--------AT-GA----C-TGTG-TT-AA-GTAA-T--ATG-T----GATA-TTTTCAATGGAA---T-TGTTTAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAA--AT-----GTTTAAA-CTA-AGT
gi|144360 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCGTTTC----C--------ACATAAT----TCA-T-TAA--AC-----ATAC-GACT-T-------TAT-G-C---------T--T--T--AT-TG----T-T-T------A-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAC--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144361 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CAG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------ATGT-G--T-TAAA----TGT---A---------T--T--G--CT-TC----A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-CTA--AATA-T----------A---CGTATGT-----------------GAAT---AAAAT--ATT----GTTTGAA-CTA-AA
gi|144362 : GGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCTTT-C----C--------AC---ATAATGTG--C-TAG--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-TGCTTCA-T-TGTT--AA-ATGT-A--TTC-T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ACT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144363 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C------------------AT----TC--CACAT--A------ATGT-A--T-T-------AG----A---------T--G--T--AT-GACTGTA-T-TA-CTTCA-TTGT-TAAATG-T----ATTC-T----------AAATT-TATGTAC-------TTATA--TGAAT---AAAAT--A-T----ATTTAAA-CTA-AAT
gi|144364 : GGAGACAGAT-CATA------------------TAAG---C----------GCTTCC--T--C-CTG----GATC----CTTT-C--------A----ACATG-TC--T--AG------------T-G--T-T-------TGA-A-A---------TGTT--T--AT-------A-T-TG----AA-ATGT-T---TG-T----A-CA-A----------A---C--ATGTAT-TA----TTGT----GAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144365 : GAACTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTGTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGC-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144366 : AGC-AGATTTACA------------------CGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ACGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---ACAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144367 : GCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--TTCTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TTTGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144368 : CTAGATTCATA------------------AATG---CT---AAT-AAGCTTTT--TGTT-CTA----AATC----C----A--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--TA-T--AT-GA----C-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----ACTA-T----------A---C-TATATAC-AG----ATCT---TGAAT---ACAAT--ATT----GTCTAAA-CCA-A
gi|144369 : A------------------TAAG---CT---ATTATAGCTTTC--T--T-CAA----GATC----C----T-----------------------T-TA-------------T-A--C-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-----------TG-T--GT-ATAT-TGAATG-T----ATGACT----------A---C-TATGTTC-A------TTT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAAGACA-AAT
gi|144370 : t-TAT--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-AGGT-T--ATG-T----CATA-G----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAACT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144371 : tttctacaacgcattgaTA----AATC----C----C--------A----AT----TTGAT-TAG--A------AT-C----------------T-C-AA--------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-T--AA-AA---T--ATG-C----AATA-T----------G---C-TATGTAC-AG----TTCT---TAAAT---AGAATCAATTTGAAGTTTAAA-TCA-A
gi|144372 : T----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAT-AG----TTCT---TAAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144373 : --T-T-------TGT-C-AC--------T--T--T--AT-GA----A-T-TT-T--AA-ATGT-T--TCG-T----AAT----------------------GTAC-AG----TTCT---TGAATAAAAAAAT--ATT----GTTTAGG-CCATAAT
gi|144374 : -C-A---------T--TG-T--GT-GA----A-T-AG-C--CA-GTGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-TACATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATA----AATTGAA-TTA-AAT
gi|144375 : --AT-GA----A-T-TG-C--AG-ATAT-T--GTG-T----AGTA-T----------A---C-TAAGTAC-AG----TTCC---TGTAC---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144376 : -ATGT-T--ATG-G----AATA-T----------G---C-TGTACAT-AG----TTTA---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CCA-AAT
Alignments
lowQualScore : 1 33333333 222222222222222222 1111 1111 111
lowQualScore : 1 777777777777777777 111 22222222 11 11 2 44444 6666 333333333333333333 3333 66 4 333 444444 2 2 11 1 4444444 66666666666666 11 33 33 0 9999 0 0 4444 1 9999 8 5555 5 0 5555555555 99999 9999999 2 000 111 11 1111 0 1
lowQualScore : . .................. ... ........ .. .. . ..... .... .................. .... .. . ... ...... . . .. . ....... .............. .. .. .. . .... . . .... . .... . .... . . .......... ..... ....... . ... ... .. .... . .
lowQualScore : 6 888888888888888888 888 00000000 44 44 1 33333 2222 999999999999999999 9999 44 9 666 888888 9 9 33 0 8888888 33333333333333 33 11 11 9 2222 9 9 1111 8 8888 0 0000 6 9 7777777777 00000 8888888 7 777 666 22 9999 9 0
consensus : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Reference ( family-494 ) : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144332 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144333 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144334 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAA--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144335 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144336 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144337 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-T-A------------T--T--AT-GA----A-A-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAA-AG----CTCT---TGAAT---TAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144338 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144339 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144340 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTCAT--T--T-CTA----AATA----C----C--------A----CT----TC--C-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGG-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-A--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAGT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144341 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144342 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144343 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AACC----C----A--------A----AT----TC--T-TAA--A------AT-C-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TT
gi|144344 : TGGGAATTAGATTAATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTTGTT--T-CTA----AATC----T----T--------A----AT----TA--T-AAG--A------AC-T-G--T-T-------AGT-C-A---------T--T--TT-AT-GA----A-T-TG-C--AA--TGC-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-----TAC-AG----TATT---TGAAT---AAAAC--GTT----GTTTAAA-CAA-AAT
gi|144345 : TGGGAACTAGATTCATATTTGGAACGAGAATATTACACG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--C-TCGC---AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TTC--A------AT-T-G--T-T-------TGT-G-A---------T--T--TT-ATTGA----T-T-TT-T--AA-ATGG-T--ATG-T----AATA-T----------T---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144346 : TGGGAACTAGATTCAAA------------------CAAG---CT---AAT-GAGCTTTA--T--T-C-A----AAAC----C----C--------A----AT----TC--A-TAG--AC-----AT-T----T-T-------TGT-C-A---------T--T--TTAAT-AT----T-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----TATA-T----------T---C-TTTGTGC-AGTATTTTTT---TTTAT---AAAAG--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144347 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTGTTTCCATT----C----CGCAT----A----AT----TCG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-A------TATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144348 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CATAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-T----TAAA-T----------A-----TGTGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144349 : TGGAAGC-AGATTAACA------------------CACG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TTG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144350 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144351 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAGTTTCT---AA---AGCTTTT--T--TTCTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TCG-T-TAA--A---------C-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC---------CTATGTGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144352 : TGGGAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGGTTTT--T--T-CTG----TATC-----------------------AT----TT--C-CAC--A-------T-T-A--T-T-------TGT-T-AAATTATGACT--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTT-AAT
gi|144353 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-A
gi|144354 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----GT-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C-------------------T----TT--T-CAT--A------AT-T-G--TATACACATGTGT-TAA---------T--TAAT--AT-GA----CTT-TG-TG-AA-ATTT-TCAATG-T----AAT-------------------TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTG-AA
gi|144355 : TGAAAGC-AGATTTACA------------------CTAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144356 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------TGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-TTA-AAT
gi|144357 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AA--T--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144358 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAAT---GTTTTT--T--T-CTG----TATCATTTC----C--------ACATAAT----TCG-T-TAA--ACATATGAC-T-G--T-A-------TGC-------------T--T--T--AT-----------TG-TT-AA-ATGTAT--AC--T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144359 : TGGGAGACAGATTCAAA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------T-T-C-A---------C--------AT-GA----C-TGTG-TT-AA-GTAA-T--ATG-T----GATA-TTTTCAATGGAA---T-TGTTTAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAA--AT-----GTTTAAA-CTA-AGT
gi|144360 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCGTTTC----C--------ACATAAT----TCA-T-TAA--AC-----ATAC-GACT-T-------TAT-G-C---------T--T--T--AT-TG----T-T-T------A-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAC--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144361 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CAG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------ATGT-G--T-TAAA----TGT---A---------T--T--G--CT-TC----A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-CTA--AATA-T----------A---CGTATGT-----------------GAAT---AAAAT--ATT----GTTTGAA-CTA-AA
gi|144362 : GGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCTTT-C----C--------AC---ATAATGTG--C-TAG--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-TGCTTCA-T-TGTT--AA-ATGT-A--TTC-T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ACT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144363 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C------------------AT----TC--CACAT--A------ATGT-A--T-T-------AG----A---------T--G--T--AT-GACTGTA-T-TA-CTTCA-TTGT-TAAATG-T----ATTC-T----------AAATT-TATGTAC-------TTATA--TGAAT---AAAAT--A-T----ATTTAAA-CTA-AAT
gi|144364 : GGAGACAGAT-CATA------------------TAAG---C----------GCTTCC--T--C-CTG----GATC----CTTT-C--------A----ACATG-TC--T--AG------------T-G--T-T-------TGA-A-A---------TGTT--T--AT-------A-T-TG----AA-ATGT-T---TG-T----A-CA-A----------A---C--ATGTAT-TA----TTGT----GAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144365 : GAACTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTGTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGC-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144366 : AGC-AGATTTACA------------------CGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ACGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---ACAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144367 : GCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--TTCTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TTTGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144368 : CTAGATTCATA------------------AATG---CT---AAT-AAGCTTTT--TGTT-CTA----AATC----C----A--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--TA-T--AT-GA----C-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----ACTA-T----------A---C-TATATAC-AG----ATCT---TGAAT---ACAAT--ATT----GTCTAAA-CCA-A
gi|144369 : A------------------TAAG---CT---ATTATAGCTTTC--T--T-CAA----GATC----C----T-----------------------T-TA-------------T-A--C-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-----------TG-T--GT-ATAT-TGAATG-T----ATGACT----------A---C-TATGTTC-A------TTT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAAGACA-AAT
gi|144370 : t-TAT--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-AGGT-T--ATG-T----CATA-G----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAACT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144371 : tttctacaacgcattgaTA----AATC----C----C--------A----AT----TTGAT-TAG--A------AT-C----------------T-C-AA--------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-T--AA-AA---T--ATG-C----AATA-T----------G---C-TATGTAC-AG----TTCT---TAAAT---AGAATCAATTTGAAGTTTAAA-TCA-A
gi|144372 : T----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAT-AG----TTCT---TAAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144373 : --T-T-------TGT-C-AC--------T--T--T--AT-GA----A-T-TT-T--AA-ATGT-T--TCG-T----AAT----------------------GTAC-AG----TTCT---TGAATAAAAAAAT--ATT----GTTTAGG-CCATAAT
gi|144374 : -C-A---------T--TG-T--GT-GA----A-T-AG-C--CA-GTGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-TACATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATA----AATTGAA-TTA-AAT
gi|144375 : --AT-GA----A-T-TG-C--AG-ATAT-T--GTG-T----AGTA-T----------A---C-TAAGTAC-AG----TTCC---TGTAC---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144376 : -ATGT-T--ATG-G----AATA-T----------G---C-TGTACAT-AG----TTTA---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CCA-AAT
blockSeqs : T TTTGGAACGAGAATATTA TTT TCTAAT GT GT T TTTCC ATTT TTTCCACATA AATG GA A GTT CATATG A C AC ACACATG TTAAATTATGAC GT AA TA CTTT CTT T TCA C TTTC T TTTCAATGGA AATT AGTATT C ATG AAA CA TGAA
blockSeqs : T . . TCTAA . . T CA GTTT TTTCCACATA ATG G A GTT C G C . AAA CACA . A T CTTT TT T TAA C TTTC T A CG TAA C G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A TTT TTTCCAC . G A G C G C . . CACA . G T CTTT TT . TGA C TA T A C TAA C G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . TTTCCAC . G A G . . . . . TTAA . . . CTTC TT . AT C . T . C AG C G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . CGCATA . G A G . . . . . TCAA . . . CTGT TT . T C . T . C AG C G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . CACATA . A . G . . . . . TCAC . . . TTT TT . T C . T . C AG T G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . CACATA . . . G . . . . . TCA . . . TTT TG . T C . T . C AG T G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . TTTCA . . . G . . . . . TCA . . . TTT TT . T C . T . C AG C G . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . CAC . . . G . . . . . TCA . . . TTT TT . T C . A . C AG C G . . .
blockSeqs : T . . TCAAA . . . A . CA . . . G . . . . . TCA . . . TTT TT . T . . A . C AG C A . . .
blockSeqs : T . . TCAAA . . . A . CA . . . G . . . . . TTA . . . TTT TT . T . . T . C AG T G . . .
blockSeqs : T . . TCAAA . . . A . CA . . . G . . . . . TCA . . . . TT . A . . T . C AG C . . . .
blockSeqs : T . . TCTAA . . . A . CA . . . A . . . . . TCA . . . . TT . T . . T . C AG T . . . .
blockSeqs : T . . ATTAT . . . A . CA . . . G . . . . . GCA . . . . TT . T . . T . T AG A . . . .
blockSeqs : C . . AATT . . . A . CA . . . C . . . . . TCA . . . . TT . T . . A . C AG A . . . .
blockSeqs : C . . AATT . . . T . CA . . . G . . . . . TCA . . . . C . T . . T . C AG A . . . .
blockSeqs : C . . AATT . . . T . CA . . . A . . . . . TCA . . . . C . T . . T . T TA T . . . .
blockSeqs : C . . AATT . . . A . CA . . . T . . . . . TCA . . . . C . T . . T . T TA C . . . .
blockSeqs : C . . AATT . . . T . CA . . . A . . . . . TGA . . . . C . G . . T . T TA A . . . .
blockSeqs : T . . AATT . . . T . AA . . . T . . . . . TCA . . . . C . G . . T . C TA T . . . .
blockSeqs : T . . AATT . . . A . TA . . . A . . . . . TCA . . . . T . T . . T . C TA T . . . .
blockSeqs : T . . AATT . . . A . CA . . . C . . . . . TGC . . . . T . A . . C . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . TATT . . . T . CA . . . T . . . . . AAA . . . . C . T . . T . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . TATT . . . T . CA . . . T . . . . . CCA . . . . C . T . . T . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . TATT . . . T . CA . . . T . . . . . TCA . . . . C . T . . T . C AG T . . . .
blockSeqs : . . . AATT . . . T . AA . . . T . . . . . TCA . . . . C . T . . G . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . TATT . . . A . CA . . . A . . . . . TCA . . . . C . T . . T . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . AATG . . . T . T . . . T . . . . . TCA . . . . T . T . . T . T AG G . . . .
blockSeqs : . . . AATT . . . T . C . . . A . . . . . TCA . . . . C . T . . T . C AG C . . . .
blockSeqs : . . . AATT . . . T . C . . . T . . . . . AC . . . . C . T . . T . C AG A . . . .
blockSeqs : . . . AATA . . . T . T . . . G . . . . . AC . . . . C . T . . T . . AG C . . . .
blockSeqs : . . . GTA . . . G . T . . . T . . . . . AC . . . . C . T . . T . . A C . . . .
blockSeqs : . . . GTA . . . A . C . . . G . . . . . CC . . . . T . T . . T . . A T . . . .
blockSeqs : . . . GTA . . . T . T . . . G . . . . . TA . . . . C . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . GTA . . . A . T . . . G . . . . . AC . . . . T . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . AA . . . A . . . . . G . . . . . CC . . . . C . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . G . . . . . T . . . . . A . . . . T . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : A . . . . . G . . . . . A . . . . C . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . G . . . . . A . . . . C . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . T . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
finalCons : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Alignments
lowQualScore : 1 33333333 222222222222222222 1111 1111 111
lowQualScore : 1 777777777777777777 111 22222222 11 11 2 44444 6666 333333333333333333 3333 66 4 333 444444 2 2 11 1 4444444 66666666666666 11 33 33 0 9999 0 0 4444 1 9999 8 5555 5 0 5555555555 99999 9999999 2 000 111 11 1111 0 1
lowQualScore : . .................. ... ........ .. .. . ..... .... .................. .... .. . ... ...... . . .. . ....... .............. .. .. .. . .... . . .... . .... . .... . . .......... ..... ....... . ... ... .. .... . .
lowQualScore : 6 888888888888888888 888 00000000 44 44 1 33333 2222 999999999999999999 9999 44 9 666 888888 9 9 33 0 8888888 33333333333333 33 11 11 9 2222 9 9 1111 8 8888 0 0000 6 9 7777777777 00000 8888888 7 777 666 22 9999 9 0
consensus : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
Reference ( family-494 ) : TGGGAGCTAGATTCACA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTG----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144332 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144333 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144334 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAA--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144335 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144336 : TGGAAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-A----------A---C-TATATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144337 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-T-A------------T--T--AT-GA----A-A-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAA-AG----CTCT---TGAAT---TAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144338 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144339 : TGGGAGCTAGATTTATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTTTA--T--T-TTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-C-TG-T--AA-ATGT-T--ATG-T----AATT-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTTT---TGAAT---AAAAT--GTT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144340 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTCAT--T--T-CTA----AATA----C----C--------A----CT----TC--C-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGG-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-A--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAGT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144341 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144342 : TGGGTGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--A-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGG-T--ATG-T----AAAA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAGAT--ATT----GTTTAAA-
gi|144343 : TGGGAGCTAGATTCATA------------------CAAG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--T-CTA----AACC----C----A--------A----AT----TC--T-TAA--A------AT-C-G--T-C-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TT
gi|144344 : TGGGAATTAGATTAATA------------------CCAG---CT---AAT-TAGCTTTTGTT--T-CTA----AATC----T----T--------A----AT----TA--T-AAG--A------AC-T-G--T-T-------AGT-C-A---------T--T--TT-AT-GA----A-T-TG-C--AA--TGC-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-----TAC-AG----TATT---TGAAT---AAAAC--GTT----GTTTAAA-CAA-AAT
gi|144345 : TGGGAACTAGATTCATATTTGGAACGAGAATATTACACG---CT---TAT-TAGCTTTT--T--C-TCGC---AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TTC--A------AT-T-G--T-T-------TGT-G-A---------T--T--TT-ATTGA----T-T-TT-T--AA-ATGG-T--ATG-T----AATA-T----------T---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144346 : TGGGAACTAGATTCAAA------------------CAAG---CT---AAT-GAGCTTTA--T--T-C-A----AAAC----C----C--------A----AT----TC--A-TAG--AC-----AT-T----T-T-------TGT-C-A---------T--T--TTAAT-AT----T-T-TG-C--AA-ATAT-T--ATG-T----TATA-T----------T---C-TTTGTGC-AGTATTTTTT---TTTAT---AAAAG--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144347 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTGTTTCCATT----C----CGCAT----A----AT----TCG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-A------TATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144348 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CATAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-T----TAAA-T----------A-----TGTGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144349 : TGGAAGC-AGATTAACA------------------CACG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TTG-T-TAA--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144350 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144351 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAGTTTCT---AA---AGCTTTT--T--TTCTG----TATC----C----TTTCCACATA----AT----TCG-T-TAA--A---------C-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC---------CTATGTGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144352 : TGGGAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGGTTTT--T--T-CTG----TATC-----------------------AT----TT--C-CAC--A-------T-T-A--T-T-------TGT-T-AAATTATGACT--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTT-AAT
gi|144353 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------TACAC-A---------T--G--T--GT-TA----A-C-T-----AATATGT-G--ATA-TTTTCAATG-TA---------A---T-TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTA-A
gi|144354 : TGGGAGACAGATTCACA------------------AAAG---CT----GT-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C-------------------T----TT--T-CAT--A------AT-T-G--TATACACATGTGT-TAA---------T--TAAT--AT-GA----CTT-TG-TG-AA-ATTT-TCAATG-T----AAT-------------------TGTATAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CTG-AA
gi|144355 : TGAAAGC-AGATTTACA------------------CTAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144356 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------TGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-TTA-AAT
gi|144357 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------AT-TCG--T-T-------AA----A---------C--G--T--AT-GACTTTA-T-TG-TT-AA-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AA--T--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144358 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAAT---GTTTTT--T--T-CTG----TATCATTTC----C--------ACATAAT----TCG-T-TAA--ACATATGAC-T-G--T-A-------TGC-------------T--T--T--AT-----------TG-TT-AA-ATGTAT--AC--T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AA
gi|144359 : TGGGAGACAGATTCAAA------------------AAAG---CT---G-T-AAGCTTTC--T--T-CTG----AATC----C----C-------------------TT--T-CAT--A------AT-T-G--T-A-------T-T-C-A---------C--------AT-GA----C-TGTG-TT-AA-GTAA-T--ATG-T----GATA-TTTTCAATGGAA---T-TGTTTAC-TA----TTTG---TGAAT---AAAAA--AT-----GTTTAAA-CTA-AGT
gi|144360 : TGGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCGTTTC----C--------ACATAAT----TCA-T-TAA--AC-----ATAC-GACT-T-------TAT-G-C---------T--T--T--AT-TG----T-T-T------A-ATGT----ATGCT----AA-A-T----------A-----TATGTACTAA----TG-----TGAAT---AAAAC--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144361 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CAG----TATC----C----T--------------T----TC--CACAT--A------ATGT-G--T-TAAA----TGT---A---------T--T--G--CT-TC----A-T-TG-TT-AA-ATGT----ATG-CTA--AATA-T----------A---CGTATGT-----------------GAAT---AAAAT--ATT----GTTTGAA-CTA-AA
gi|144362 : GGAAGC-AGATTTACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATCTTT-C----C--------AC---ATAATGTG--C-TAG--A---------T-G--T-A-------TGA-C-----------T--T--T--AT-TGCTTCA-T-TGTT--AA-ATGT-A--TTC-T----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---AAAAT--ACT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144363 : GGAAGC-AGATTCACA------------------CAAG---CTTCAAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----C------------------AT----TC--CACAT--A------ATGT-A--T-T-------AG----A---------T--G--T--AT-GACTGTA-T-TA-CTTCA-TTGT-TAAATG-T----ATTC-T----------AAATT-TATGTAC-------TTATA--TGAAT---AAAAT--A-T----ATTTAAA-CTA-AAT
gi|144364 : GGAGACAGAT-CATA------------------TAAG---C----------GCTTCC--T--C-CTG----GATC----CTTT-C--------A----ACATG-TC--T--AG------------T-G--T-T-------TGA-A-A---------TGTT--T--AT-------A-T-TG----AA-ATGT-T---TG-T----A-CA-A----------A---C--ATGTAT-TA----TTGT----GAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-A
gi|144365 : GAACTAGATTCATA------------------CAAG---CT---AAT-TAGCTGTT--T----CTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGC-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AAT
gi|144366 : AGC-AGATTTACA------------------CGAG---CTTCTAA---AGCTTTT--T--T-CTG----TATC----CTTTCC--------AC---AT----TA--T-TTGTTA------AA-C-G--T-A-------TGC-C-----------T--T--T--AT-GCTTT-A-T-TG-TT-AA-ATGT----ACGCT----AA-A-T----------A-----TATGTAC-------TTATG--TGAAT---ACAAT--ATT----GTTTAAA-CTA-AAT
gi|144367 : GCTAGATTCATA------------------CAAG---TT---AAT-TAGCTTTT--T--TTCTA----AATC----C----C--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TTTGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144368 : CTAGATTCATA------------------AATG---CT---AAT-AAGCTTTT--TGTT-CTA----AATC----C----A--------A----AT----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--TA-T--AT-GA----C-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----ACTA-T----------A---C-TATATAC-AG----ATCT---TGAAT---ACAAT--ATT----GTCTAAA-CCA-A
gi|144369 : A------------------TAAG---CT---ATTATAGCTTTC--T--T-CAA----GATC----C----T-----------------------T-TA-------------T-A--C-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-----------TG-T--GT-ATAT-TGAATG-T----ATGACT----------A---C-TATGTTC-A------TTT---TGAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAAGACA-AAT
gi|144370 : t-TAT--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-AGGT-T--ATG-T----CATA-G----------A---C-TATGTAC-AG----TTCT---TGAAT---AAACT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144371 : tttctacaacgcattgaTA----AATC----C----C--------A----AT----TTGAT-TAG--A------AT-C----------------T-C-AA--------T--T--T--AT-AA----A-T-TG-T--AA-AA---T--ATG-C----AATA-T----------G---C-TATGTAC-AG----TTCT---TAAAT---AGAATCAATTTGAAGTTTAAA-TCA-A
gi|144372 : T----TC--T-TAG--A------AT-T-G--T-T-------TGT-C-A---------T--T--T--AT-GA----A-T-TG-C--AA-ATGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---C-TATGTAT-AG----TTCT---TAAAT---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-A
gi|144373 : --T-T-------TGT-C-AC--------T--T--T--AT-GA----A-T-TT-T--AA-ATGT-T--TCG-T----AAT----------------------GTAC-AG----TTCT---TGAATAAAAAAAT--ATT----GTTTAGG-CCATAAT
gi|144374 : -C-A---------T--TG-T--GT-GA----A-T-AG-C--CA-GTGT-T--ATG-T----AATA-T----------A---T-TACATAT-AG----TTCT---TGAAT---AAAAT--ATA----AATTGAA-TTA-AAT
gi|144375 : --AT-GA----A-T-TG-C--AG-ATAT-T--GTG-T----AGTA-T----------A---C-TAAGTAC-AG----TTCC---TGTAC---AAAAT--ATT----GTTTAAA-CCA-AA
gi|144376 : -ATGT-T--ATG-G----AATA-T----------G---C-TGTACAT-AG----TTTA---TGAAT---AAAAT--A-T----GTTTAAA-CCA-AAT