lowQualScore : 1 4444 111111111111111111 111
lowQualScore : 2 22222 1 7 4444 11 3333333 8888 1 33333 4444444 555 22 222222222222222222 1 111 22 0 555555 22 555555 4 777 55555
lowQualScore : . ..... . . .... .. ....... .... . ..... ....... ... .. .................. . ... .. . ...... .. ...... . ... .....
lowQualScore : 9 11111 8 0 5555 33 1111111 8888 1 66666 6666666 999 44 888888888888888888 8 000 44 9 666666 66 000000 5 444 66666
consensus : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGNAGAACAGCG---TT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---TCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTNATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
Reference ( gi|89582 ) : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGATCAGCA---TT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGTTGATCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-G-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89579 : AAAAA-ATATAG-A---TGTCGAAGAACAACG---TT--T-------ACTCAATTATTCTAGCCTTGTCGATCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89580 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGCG---TT--ACATTGTAACTCGACTATTCTATCCTTGTCGATCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAA---CAAAAAAGTAGA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89581 : AAAAATATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGCG---TT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGATCACAGAA-CACT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATGTAT--CTGTAT-----GAA--C-----GAAAGCATCTTTCATATTAG---AAAAATAGTAGA-----TACATGtgtgcaa
gi|89585 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTTGAAGAACAGTG---TT--A-------TCTTGACTATTACAGCCTTGT----CACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAAGCATCTTCCATATTAA---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAaatgtgcaa
gi|89583 : AAAAA-ATACAG-A---TGTCGAATCACAGCG---TT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGATCACAGAA-CAGT-----G-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGAA-AAAAAAGATATAT--CTGTAT-----GAA--C-----AAAAGCATCTTTTATATTAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89586 : AAAAA-ATAGAG-A---TGCTGAAGAACAGTG---TC--A-------TCTCGACTATTATAGCCTTGT----CTCAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------GGTACCAT-CAG-A-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATATtgtgcaa
gi|89584 : AAAAA-ATTGAG-A---TGTCGAAGAATAGCG---TTTAA-------ACTTAACTATTCTAGCCTTGGCGATCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-A-AAACCAAATATAT--CTATAT-----GAA--T-----GAAAGCAACTTTCATATTAG---CAACATAGTAGA-----TACATGTgtgtgcaa
gi|89588 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGCA---TT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGTCGATCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGAACCAT-TAG-A-AAAAAATATATAT--CTGTAT-----ATAGCT-----GAAA-TGTATTTAAT-TTAATTTCAAAATgtgtgcaa
gi|89587 : AAAAA-GTAGAG-A---TGTCAAAGAACAGCA---T------------------------AACCTT-----------AA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-ACAAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTActgggtgtggatgtgggggtgtatgtgc
gi|89589 : AAAAA-ATAAAG-A---CATCGAAGAACAGAA---TT--A-------TCTAGACTATTTTAGTCTTG----TCACAGAA-CAGT-----A-------T---AT-----------------------------AT-C-------------TGTAT-------------GAA--T-----GAAACCATATTTCATATTTG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAtgtg
gi|89590 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGTACAGCG---TT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCCTGTCGATCACAGAA-CTGT-----G-------T---AC--CAT------C----A------T---TCATACAG-A-TAGATAGGAATATTACTATAT-----tgtgcaa
gi|89591 : AAAAA-AAAGAG-A---TGTCGAAAAACTGCG---TT--A-------ACTTCACTATTCTAGCCTTGTCGATCAAAGAATTGGT-----G-------T---AT--
gi|89592 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGCG---TT--A-------ACTCGACTATT
gi|89593 : A-ATAAAA-AGGTTGTCGGAGAACAACAACGTT--A-------ATTTGATT-TTTGAG---TAT-GGTCACAGAA-AAGT-----ACTTAAACT---AT--TAA------AT---A------TGTACCAT-CAG-A-AAAACAGTCACGT--GTTTAT-----TAA--T-----CAAACCATGTTTAATA
gi|89594 : AGAG-C---TGTCGAAGAACAGTG---TT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGT--A--ACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A-----------TGTACAAT-AAA-A-AAAA-AGATATAT--ATGTAT-----CAA--T-----GAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----
gi|89595 : AGAG-C---TGCCGAAGAACAGTG---TT--A-------ACTCGAATA--------------AT------A-TATT-----A-------T---AT--TAT------A-----------TGTACCAT-CAG-C-AAAACAGTTATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACAATCTTTAATATTAG---CAAAACAGTACA-----TACATATA
gi|89596 : AGAG-C---TGCCAGAGAACAGTA---CT--T-------ACTCGGCTATTCTTGGCTTG----TCACAGAA-CAGT-----A-------T----T--TAT------A----------------CAT-CA--G-AAAACAGGCATAT--CTTCATCATTCAAA--TTATTAAAAATGATTTTTAATATCTG---CAAAATAGAAAA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89597 : AGAA-T---TGTCAGAGAACAGCG---TT--A-------ACTTGACTCTTC----------GACTA---AA-CAGT-----A-------TC--AA--TAA------C----A------TGTACGAT-TAA---AAAGCAGGCATAT----ATAT-----CAA--C-----CAAACCGTTTTTAATATTAA---CAAAATAGTACATCTTGTACATGTAtg
gi|89598 : AGAG-C---TGTCAGAGAACAGCA---TT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----TCACAGAcgtaca
gi|89600 : AGAG-C---TGTCGGAGAACAGCA---TT--G-------ACTCGACTATTTTAGCCTTGT
gi|89599 : AGAGTA---T-TCGGAGAACAGCG---TT--A-------ACTCGAATATTCTGACCTTG----TCACAGAA-TAGT-----A-------CCTGAT--TAT------A----
gi|89601 : AGAG-T---TGTCGGAGAACAACG---CC--A-------ACTCGGCTAGTCTAGCCTTGTcctacagagaa
gi|89602 : AGAT-A---TATCGGGGAACAGGG---TA--A-------ACTCCACTATTCTAGCCTTGT
gi|89603 : ---TGTCAAAGAACAGCG---TT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----TCACAGAA-CAGC-----G-------T---Acacattatttatcatcttgtatataactactgtgaaatcaaacaaatat
gi|89604 : ---TGTCACAGAACAGCA---TT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----TCACAGAA-CAGT-----G-------T---
gi|89605 : ---TGTCAAAGAACAGCG---TT--A-------ACTTGTCTATTCTAGCCTTG----TCACAGAA-C
gi|89606 : ---TGTCACAGAACAGCG---TT--A-------ACCTGACTATCCTGGCCTTG----TCACAGAA-CAGT-----G-------T---A
gi|89611 : ---TGTCACAGAACAGCA---TT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----TCACAGA
gi|89607 : ---TGTCACAGAACAGAG---TT--A-------ACCTGACTATTCTAGCCTTG----TCACAGAA-CAG
gi|89608 : ---TGTCATAGAACCGGG---TT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----TCACAGAA-CAGC-----A-------T---
gi|89609 : ---TGTCACAGAACAGTG---TT--A-------ACTTGACTATTATAGCCTTG----TCACAGAA-C
gi|89610 : ---TGTCACAGAACAGCT---TT--A-------ACTTGACTATTCTTGCCTTG----TCAAAGAA-CAG
gi|89613 : ---TGTCACAGAACAGCG---TA--A-------ACTTGACTATTATCGCCTTG----TCACAGAA-CAG
gi|89614 : ---TGTCACAGAACCGCG---TT--A-------ACTTGACTATTCTTGCTTTG----TCACAGAA-CA
gi|89616 : ---TGTCATAGAACAGCT---TT--A-------ACTTGACTATTCTGGCC----TGGTCACAAAA-C
gi|89612 : ---TGTCACAGAACCATG---TT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----TCAAAGAA-CAG
gi|89615 : ---TGTCACAGAACATTG---AT--A-------ACTTGACTTTTCTAGCCTTG----TCACAGAA-CAG
gi|89617 : GTTAAAGAACAGCG---TT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT----CACAGAA-CAGT-----A-------T---AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAG-G-AAAACAGATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATAAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGT
gi|89618 : AGAACAACA---C---A-------ACTTGGCTATTGTCGCCTC--TA--CACAAAA-TTGT-----A-------TTT-AT--TATCTAGAAG----A------TGCACCAT-CAG-A-AAAACAGGCAAAT--CCACAT-----CA---T-----CACACTGGCTTTAATAGCAG---TAAAATAGTAGA-----TACACGTAttatgcaa
gi|89619 : AGAACGGCG---TT--A-------ACTCGACTATTGTAGCCTTG----TCACAGAA-CAGC-----A-------T---tgtgaaa
gi|89620 : CAGCG---TT--A-------ACTTGATTATTCTAGCTATG----TCACAGAA-CCATACATAA-------T---AT--TGT------ATAATA------TGTATCAT-CAT-A-TAAACAGGCATAT--TTTTAT-----CAA--T-----CAA---ATCTTT-ATAGCAA---CGATTTAGTAAA-----TACATGTA
gi|89621 : a---TT--A-------A-TCGACTATTCCAGCCTTGT----CACAGAA-CAGT-----A-------T---AG--TAT------A-----------TATACTAT-CCG-A-AAAACAGATATAT--tgtg
gi|89622 : gCACAGAA-CAGT-----A-------T---TTGATAT------A----AATAATGTGTTCCAT-CAG-T-AAAACAAGCATAT--ATTTAT-----CCA--C-----GAAACCATCTTT
gi|89623 : CTAT-CAG-A-AAAACAGAT--------------------------------CCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89624 : ACATGTATCT--CTCTAT-----TAA--T-----CAAACCATCTTTAATATTAGTTTCAATA-AATAGA-----TACATGTtatgta
Alignments
lowQualScore : 33333333 111111111111111111
lowQualScore : 2 1 111 1 111 11 3333333 33333333 1 33333 4444444 33 22 444444444444444444 1 1 1 22 0 444444 22 44444 2 777 55555
lowQualScore : . . ... . ... .. ....... ........ . ..... ....... .. .. .................. . . . .. . ...... .. ..... . ... .....
lowQualScore : 7 7 888 0 666 33 0000000 00000000 1 44444 5555555 33 33 000000000000000000 7 7 7 33 4 999999 55 55555 9 000 33333
consensus : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
Reference ( family-491 ) : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGNAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTNATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89579 : AAAAA-ATATAG-A---TGTCGAAGAACAAC---GTT--T-------ACTCAATTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89580 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--ACATTGTAACTCGACTATTCTATCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAA---CAAAAAAGTAGA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89581 : AAAAATATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CACT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATGTAT--CTGTAT-----GAA--C-----GAAAGCATCTTTCATATTAG---AAAAATAGTAGA-----TACATGtgtgcaa
gi|89582 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGATCAGC---ATT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---TGATCACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAaatgtgcaa
gi|89583 : AAAAA-ATACAG-A---TGTCGAATCACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----G-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAAAAAGATATAT--CTGTAT-----GAA--C-----AAAAGCATCTTTTATATTAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGTA
gi|89584 : AAAAA-ATTGAG-A---TGTCGAAGAATAGC---GTTTAA-------ACTTAACTATTCTAGCCTTGGCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAACCA-AATATAT--CTATAT-----GAA--T-----GAAAGCAACTTTCATATTAG---CAACATAGTAGA-----TACATGTtgtgcaa
gi|89585 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTTGAAGAACAGT---GTT--A-------TCTTGACTATTACAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAAGCATCTTCCATATTAA---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89586 : AAAAA-ATAGAG-A---TGCTGAAGAACAGT---GTC--A-------TCTCGACTATTATAGCCTTGT-------CTCAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------GGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATATtgtgcaa
gi|89587 : AAAAA-GTAGAG-A---TGTCAAAGAACAGC---AT------------------------AACCTT--------------AA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGACAAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89588 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGAACCAT-TAGA-AAAAAA-TATATAT--CTGTAT-----ATAGCT-----GAAA-TGTATTTAAT-TTAATTTCAAAATtgtg
gi|89589 : AAAAA-ATAAAG-A---CATCGAAGAACAGA---ATT--A-------TCTAGACTATTTTAGTCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT-----------------------------AT-C-------------TGTAT-------------GAA--T-----GAAACCATATTTCATATTTG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTActgggtgtggatgtgggggtgtatgtgc
gi|89590 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGTACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCCTGTCGAT---CACAGAA-CTGT-----G-------T--AC--CAT------C----A------T---TCATACAGA-TAGATA-GGAATATTACTATAT-----tgtgcaa
gi|89591 : AAAAA-AAAGAG-A---TGTCGAAAAACTGC---GTT--A-------ACTTCACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CAAAGAATTGGT-----G-------T--AT--
gi|89592 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATT
gi|89593 : A-ATAAAA-AGGTTGTCGGAGAACAACAACGTT--A-------ATTTGATT-TTTGAGTATGGT-------CACAGAA-AAGT-----ACTTAAACT--AT--TAA------AT---A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GTCACGT--GTTTAT-----TAA--T-----CAAACCATGTTTAATA
gi|89594 : AGAG-C---TGTCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGT-------AACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A-----------TGTACAAT-AAAA-AAAA-A-GATATAT--ATGTAT-----CAA--T-----GAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----
gi|89595 : AGAG-C---TGCCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTCGAATAAT-----------------------A-TATT-----A-------T--AT--TAT------A-----------TGTACCAT-CAGC-AAAACA-GTTATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACAATCTTTAATATTAG---CAAAACAGTACA-----TACATATA
gi|89596 : AGAG-C---TGCCAGAGAACAGT---ACT--T-------ACTCGGCTATTCTTGGCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----A-------T---T--TAT------A----------------CAT-CAG--AAAACA-GGCATAT--CTTCATCATTCAAA--TTATTAAAAATGATTTTTAATATCTG---CAAAATAGAAAA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89597 : AGAA-T---TGTCAGAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTCTTC--GACT--------------AAA-CAGT-----A-------TC-AA--TAA------C----A------TGTACGAT-TA-A-AAAGCA-GGCATAT----ATAT-----CAA--C-----CAAACCGTTTTTAATATTAA---CAAAATAGTACATCTTGTACATGTAtg
gi|89598 : AGAG-C---TGTCAGAGAACAGC---ATT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAcgtaca
gi|89599 : AGAGTA---T-TCGGAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGAATATTCTGACCTTG----T---CACAGAA-TAGT-----A-------C--CT--GAT------------------TATACCTA-CAGA-GAA
gi|89600 : AGAG-C---TGTCGGAGAACAGC---ATT--G-------ACTCGACTATTTTAGCCTTGT---
gi|89601 : AGAG-T---TGTCGGAGAACAAC---GCC--A-------ACTCGGCTAGTCTAGCCTTGT---
gi|89602 : AGAT-A---TATCGGGGAACAGG---GTA--A-------ACTCCACTATTCTAGCCTTG----T---CACA
gi|89603 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----G-------T--Attatttatcatcttgtatataactactgtgaaatcaaacaaatat
gi|89604 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----G-------T--
gi|89605 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGTCTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-C
gi|89606 : ---TGTCACAGAACAGC---GTT--A-------ACCTGACTATCCTGGCCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----G-------T--A
gi|89607 : ---TGTCACAGAACAGA---GTT--A-------ACCTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89608 : ---TGTCATAGAACCGG---GTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----A-------T--
gi|89609 : ---TGTCACAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTATAGCCTTG----T---CACAGAA-C
gi|89610 : ---TGTCACAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCCTTG----T---CAAAGAA-CAG
gi|89611 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T---CACAGA
gi|89612 : ---TGTCACAGAACCAT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CAAAGAA-CAG
gi|89613 : ---TGTCACAGAACAGC---GTA--A-------ACTTGACTATTATCGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89614 : ---TGTCACAGAACCGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCTTTG----T---CACAGAA-CA
gi|89615 : ---TGTCACAGAACATT---GAT--A-------ACTTGACTTTTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89616 : ---TGTCATAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCC-TGG---T---CACAAAA-C
gi|89617 : GTTAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATAAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGT
gi|89618 : AGAACAAC---AC---A-------ACTTGGCTATTGTCGCCTC-T---A---CACAAAA-TTGT-----A-------TTTAT--TATCTAGAAG----A------TGCACCAT-CAGA-AAAACA-GGCAAAT--CCACAT-----CA---T-----CACACTGGCTTTAATAGCAG---TAAAATAGTAGA-----TACACGTAttatgcaa
gi|89619 : AGAACGGC---GTT--A-------ACTCGACTATTGTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----A-------T--tgtgaaa
gi|89620 : ACAGC---GTT--A-------ACTTGATTATTCTAGCTATG----T---CACAGAA-CCATACATAA-------T--AT--TGT------ATAATA------TGTATCAT-CATA-TAAACA-GGCATAT--TTTTAT-----CAA--T-----CAA---ATCTTT-ATAGCAA---CGATTTAGTAAA-----TACATGTA
gi|89621 : ---GTT--A-------A-TCGACTATTCCAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AG--TAT------A-----------TATACTAT-CCGA-AAAACA-GATATAT--tgtg
gi|89622 : ---CACAGAA-CAGT-----A-------T--TTGATAT------A----AATAATGTGTTCCAT-CAGT-AAAACA-AGCATAT--ATTTAT-----CCA--C-----GAAACCATCTTT
gi|89623 : CTAT-CAGA-AAAACA-GAT--------------------------------CCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89624 : ACA-TGTATCT--CTCTAT-----TAA--T-----CAAACCATCTTTAATATTAGTTTCAATA-AATAGA-----TACATGTtatgta
Alignments
lowQualScore : 33333333 111111111111111111
lowQualScore : 2 1 111 1 111 11 3333333 33333333 1 33333 4444444 33 22 444444444444444444 1 1 1 22 0 444444 22 44444 3 777 55555
lowQualScore : . . ... . ... .. ....... ........ . ..... ....... .. .. .................. . . . .. . ...... .. ..... . ... .....
lowQualScore : 7 7 888 6 666 33 0000000 00000000 1 44444 5555555 33 33 000000000000000000 7 7 7 33 4 999999 55 55555 9 000 33333
consensus : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
Reference ( family-491 ) : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89579 : AAAAA-ATATAG-A---TGTCGAAGAACAAC---GTT--T-------ACTCAATTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89580 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--ACATTGTAACTCGACTATTCTATCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAA---CAAAAAAGTAGA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89581 : AAAAATATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CACT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATGTAT--CTGTAT-----GAA--C-----GAAAGCATCTTTCATATTAG---AAAAATAGTAGA-----TACATGtgtgcaa
gi|89582 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGATCAGC---ATT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---TGATCACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAaatgtgcaa
gi|89583 : AAAAA-ATACAG-A---TGTCGAATCACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----G-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAAAAAGATATAT--CTGTAT-----GAA--C-----AAAAGCATCTTTTATATTAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGTA
gi|89584 : AAAAA-ATTGAG-A---TGTCGAAGAATAGC---GTTTAA-------ACTTAACTATTCTAGCCTTGGCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAACCA-AATATAT--CTATAT-----GAA--T-----GAAAGCAACTTTCATATTAG---CAACATAGTAGA-----TACATGTtgtgcaa
gi|89585 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTTGAAGAACAGT---GTT--A-------TCTTGACTATTACAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAAGCATCTTCCATATTAA---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89586 : AAAAA-ATAGAG-A---TGCTGAAGAACAGT---GTC--A-------TCTCGACTATTATAGCCTTGT-------CTCAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------GGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATATtgtgcaa
gi|89587 : AAAAA-GTAGAG-A---TGTCAAAGAACAGC---AT------------------------AACCTT--------------AA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGACAAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89588 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGAACCAT-TAGA-AAAAAA-TATATAT--CTGTAT-----ATAGCT-----GAAA-TGTATTTAAT-TTAATTTCAAAATtgtg
gi|89589 : AAAAA-ATAAAG-A---CATCGAAGAACAGA---ATT--A-------TCTAGACTATTTTAGTCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT-----------------------------AT-C-------------TGTAT-------------GAA--T-----GAAACCATATTTCATATTTG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTActgggtgtggatgtgggggtgtatgtgc
gi|89590 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGTACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCCTGTCGAT---CACAGAA-CTGT-----G-------T--AC--CAT------C----A------T---TCATACAGA-TAGATA-GGAATATTACTATAT-----tgtgcaa
gi|89591 : AAAAA-AAAGAG-A---TGTCGAAAAACTGC---GTT--A-------ACTTCACTATTCTAGCCTTGTCGAT---CAAAGAATTGGT-----G-------T--AT--
gi|89592 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATT
gi|89593 : A-ATAAAA-AGGTTGTCGGAGAACAACAACGTT--A-------ATTTGATT-TTTGAGTATGGT-------CACAGAA-AAGT-----ACTTAAACT--AT--TAA------AT---A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GTCACGT--GTTTAT-----TAA--T-----CAAACCATGTTTAATA
gi|89594 : AGAG-C---TGTCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGT-------AACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A-----------TGTACAAT-AAAA-AAAA-A-GATATAT--ATGTAT-----CAA--T-----GAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----
gi|89595 : AGAG-C---TGCCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTCGAATAAT-----------------------A-TATT-----A-------T--AT--TAT------A-----------TGTACCAT-CAGC-AAAACA-GTTATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACAATCTTTAATATTAG---CAAAACAGTACA-----TACATATA
gi|89596 : AGAG-C---TGCCAGAGAACAGT---ACT--T-------ACTCGGCTATTCTTGGCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----A-------T---T--TAT------A----------------CAT-CAG--AAAACA-GGCATAT--CTTCATCATTCAAA--TTATTAAAAATGATTTTTAATATCTG---CAAAATAGAAAA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89597 : AGAA-T---TGTCAGAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTCTTC--GACT--------------AAA-CAGT-----A-------TC-AA--TAA------C----A------TGTACGAT-TA-A-AAAGCA-GGCATAT----ATAT-----CAA--C-----CAAACCGTTTTTAATATTAA---CAAAATAGTACATCTTGTACATGTAtg
gi|89598 : AGAG-C---TGTCAGAGAACAGC---ATT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAcgtaca
gi|89599 : AGAGTA---T-TCGGAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGAATATTCTGACCTTG----T---CACAGAA-TAGT-----A-------C--CT--GAT------------------TATACCTA-CAGA-GAA
gi|89600 : AGAG-C---TGTCGGAGAACAGC---ATT--G-------ACTCGACTATTTTAGCCTTGT---
gi|89601 : AGAG-T---TGTCGGAGAACAAC---GCC--A-------ACTCGGCTAGTCTAGCCTTGT---
gi|89602 : AGAT-A---TATCGGGGAACAGG---GTA--A-------ACTCCACTATTCTAGCCTTG----T---CACA
gi|89603 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----G-------T--Attatttatcatcttgtatataactactgtgaaatcaaacaaatat
gi|89604 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----G-------T--
gi|89605 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGTCTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-C
gi|89606 : ---TGTCACAGAACAGC---GTT--A-------ACCTGACTATCCTGGCCTTG----T---CACAGAA-CAGT-----G-------T--A
gi|89607 : ---TGTCACAGAACAGA---GTT--A-------ACCTGACTATTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89608 : ---TGTCATAGAACCGG---GTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----A-------T--
gi|89609 : ---TGTCACAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTATAGCCTTG----T---CACAGAA-C
gi|89610 : ---TGTCACAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCCTTG----T---CAAAGAA-CAG
gi|89611 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T---CACAGA
gi|89612 : ---TGTCACAGAACCAT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T---CAAAGAA-CAG
gi|89613 : ---TGTCACAGAACAGC---GTA--A-------ACTTGACTATTATCGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89614 : ---TGTCACAGAACCGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCTTTG----T---CACAGAA-CA
gi|89615 : ---TGTCACAGAACATT---GAT--A-------ACTTGACTTTTCTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAG
gi|89616 : ---TGTCATAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCC-TGG---T---CACAAAA-C
gi|89617 : GTTAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATAAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGT
gi|89618 : AGAACAAC---AC---A-------ACTTGGCTATTGTCGCCTC-T---A---CACAAAA-TTGT-----A-------TTTAT--TATCTAGAAG----A------TGCACCAT-CAGA-AAAACA-GGCAAAT--CCACAT-----CA---T-----CACACTGGCTTTAATAGCAG---TAAAATAGTAGA-----TACACGTAttatgcaa
gi|89619 : AGAACGGC---GTT--A-------ACTCGACTATTGTAGCCTTG----T---CACAGAA-CAGC-----A-------T--tgtgaaa
gi|89620 : ACAGC---GTT--A-------ACTTGATTATTCTAGCTATG----T---CACAGAA-CCATACATAA-------T--AT--TGT------ATAATA------TGTATCAT-CATA-TAAACA-GGCATAT--TTTTAT-----CAA--T-----CAA---ATCTTT-ATAGCAA---CGATTTAGTAAA-----TACATGTA
gi|89621 : ---GTT--A-------A-TCGACTATTCCAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AG--TAT------A-----------TATACTAT-CCGA-AAAACA-GATATAT--tgtg
gi|89622 : ---CACAGAA-CAGT-----A-------T--TTGATAT------A----AATAATGTGTTCCAT-CAGT-AAAACA-AGCATAT--ATTTAT-----CCA--C-----GAAACCATCTTT
gi|89623 : CTAT-CAGA-AAAACA-GAT--------------------------------CCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89624 : ACA-TGTATCT--CTCTAT-----TAA--T-----CAAACCATCTTTAATATTAGTTTCAATA-AATAGA-----TACATGTtatgta
blockSeqs : T T GGT A AAC TA CATTGTA TCGAT T ACATA CTTAAAC TT GA CTAGAAGA A C A TA CATTCA GC TATTA C TTT TCTTG
blockSeqs : . . . A . . . TCGAT . . . C . AAATAATG . . . . G . . C TTT .
blockSeqs : . . . A . . . TTGAT . . . . . ATAATA . . . . G . . C . .
blockSeqs : . . . A . . . TCGAT . . . . . ATA . . . . G . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . GCGAT . . . . . AA . . . . G . . C . .
blockSeqs : . . . A . . . TCGAT . . . . . AA . . . . G . . C . .
blockSeqs : . . . A . . . TCGAT . . . . . AA . . . . G . . C . .
blockSeqs : . . . A . . . TCGAT . . . . . AA . . . . G . . G . .
blockSeqs : . . . A . . . GT . . . . . AA . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . . A . . . TA . . . . . AA . . . . A . . C . .
blockSeqs : . . . A . . . T . . . . . AA . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . . A . . . T . . . . . AA . . . . T . . G . .
blockSeqs : . . . A . . . T . . . . . AA . . . . C . . A . .
blockSeqs : . . . G . . . T . . . . . CA . . . . G . . A . .
blockSeqs : . . A . . . T . . . . . CA . . . . C . . A . .
blockSeqs : . . A . . . T . . . . . AA . . . . G . . C . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . A . . . . C . . A . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . A . . . . C . . C . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . A . . . . C . . A .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . A . . . . T . . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . G . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . T . . . .
blockSeqs : . C . . . T . . . .
blockSeqs : . A . . . T . . . .
blockSeqs : . C . . . T . . . .
blockSeqs : . C . . . T . . . .
blockSeqs : . T . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . C . . . T .
blockSeqs : . T . . . . .
blockSeqs : A . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons : T*******
originalCons : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT---T---CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
finalCons : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTGT-------CACAGAA-CAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111111111
lowQualScore : 2 1 111 1 111 11 3333333 6666 2222 8888 33333 4444444 33 22 444444444444444444 1 1 1 22 0 444444 22 44444 3 777 55555
lowQualScore : . . ... . ... .. ....... .... .... .... ..... ....... .. .. .................. . . . .. . ...... .. ..... . ... .....
lowQualScore : 7 7 888 6 666 33 0000000 1111 0000 3333 66666 6666666 44 44 000000000000000000 7 7 7 33 4 999999 55 55555 9 000 33333
consensus : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
Reference ( family-491 ) : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89579 : AAAAA-ATATAG-A---TGTCGAAGAACAAC---GTT--T-------ACTCAATTATTCTAGCCTTG----T----CGATCACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89580 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--ACATTGTAACTCGACTATTCTATCCTTG----T----CGATCACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAA---CAAAAAAGTAGA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89581 : AAAAATATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----T----CGATCACAGAACACT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATGTAT--CTGTAT-----GAA--C-----GAAAGCATCTTTCATATTAG---AAAAATAGTAGA-----TACATGtgtgcaa
gi|89582 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGATCAGC---ATT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTG----TTGATC----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAaatgtgcaa
gi|89583 : AAAAA-ATACAG-A---TGTCGAATCACAGC---GTT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----T----CGATCACAGAACAGT-----G-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAAAAAGATATAT--CTGTAT-----GAA--C-----AAAAGCATCTTTTATATTAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGTA
gi|89584 : AAAAA-ATTGAG-A---TGTCGAAGAATAGC---GTTTAA-------ACTTAACTATTCTAGCCTTGGCGAT----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAACCA-AATATAT--CTATAT-----GAA--T-----GAAAGCAACTTTCATATTAG---CAACATAGTAGA-----TACATGTtgtgcaa
gi|89585 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTTGAAGAACAGT---GTT--A-------TCTTGACTATTACAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAAGCATCTTCCATATTAA---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89586 : AAAAA-ATAGAG-A---TGCTGAAGAACAGT---GTC--A-------TCTCGACTATTATAGCCTTG----T----C----TCAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------GGTACCAT-CAGA-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATATtgtgcaa
gi|89587 : AAAAA-GTAGAG-A---TGTCAAAGAACAGC---AT------------------------AACCTT-------------------AACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGACAAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTAgtgtgcaa
gi|89588 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTGTCGAT----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGAACCAT-TAGA-AAAAAA-TATATAT--CTGTAT-----ATAGCT-----GAAA-TGTATTTAAT-TTAATTTCAAAATtgtg
gi|89589 : AAAAA-ATAAAG-A---CATCGAAGAACAGA---ATT--A-------TCTAGACTATTTTAGTCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT-----------------------------AT-C-------------TGTAT-------------GAA--T-----GAAACCATATTTCATATTTG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTActgggtgtggatgtgggggtgtatgtgc
gi|89590 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGTACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCCTGTCGAT----C----ACAGAACTGT-----G-------T--AC--CAT------C----A------T---TCATACAGA-TAGATA-GGAATATTACTATAT-----tgtgcaa
gi|89591 : AAAAA-AAAGAG-A---TGTCGAAAAACTGC---GTT--A-------ACTTCACTATTCTAGCCTTG----T----C----
gi|89592 : AAAAA-ATAGAG-A---TGTCGAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTgatcaaagaattggtgtat
gi|89593 : A-ATAAAA-AGGTTGTCGGAGAACAACAACGTT--A-------ATTTGATT-TTTGAGTATGG----T----C----ACAGAAAAGT-----ACTTAAACT--AT--TAA------AT---A------TGTACCAT-CAGA-AAAACA-GTCACGT--GTTTAT-----TAA--T-----CAAACCATGTTTAATA
gi|89594 : AGAG-C---TGTCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T----A----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT-----------A------TGTACAAT--AAA-AAAAAA-GATATAT--ATGTAT-----CAA--T-----GAAACCATCTTTGATATTAG---CAAAATAGTAGA-----
gi|89595 : AGAG-C---TGCCGAAGAACAGT---GTT--A-------ACTCGAATAAT----------------------------ATATT-----A-------T--AT--TAT------A-----------TGTACCAT-CAGC-AAAACA-GTTATAT--CTGTAT-----GAA--T-----AAAACAATCTTTAATATTAG---CAAAACAGTACA-----TACATATA
gi|89596 : AGAG-C---TGCCAGAGAACAGT---ACT--T-------ACTCGGCTATTCTTGGCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T---T--TAT------A----------------CAT-CAG--AAAACA-GGCATAT--CTTCATCATTCAAA--TTATTAAAAATGATTTTTAATATCTG---CAAAATAGAAAA-----TACATGTAtgtgcaa
gi|89597 : AGAA-T---TGTCAGAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTCTTC--GACT-------------------AAACAGT-----A-------TC-AA--TAA------C----A------TGTACGAT-TA-A-AAAGCA-GGCATAT----ATAT-----CAA--C-----CAAACCGTTTTTAATATTAA---CAAAATAGTACATCTTGTACATGTAtg
gi|89598 : AGAG-C---TGTCAGAGAACAGC---ATT--A-------ACTCAACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAcgtaca
gi|89599 : AGAGTA---T-TCGGAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGAATATTCTGACCTTG----T----C----ACAGAATAGT-----A-------C--CT--GAT------------------TATACCTA-CAGA-GAA
gi|89600 : AGAG-C---TGTCGGAGAACAGC---ATT--G-------ACTCGACTATTTTAGCCTTG----T----
gi|89601 : AGAG-T---TGTCGGAGAACAAC---GCC--A-------ACTCGGCTAGTCTAGCCTTG----T----
gi|89602 : AGAT-A---TATCGGGGAACAGG---GTA--A-------ACTCCACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACA
gi|89603 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGC-----G-------T--Attatttatcatcttgtatataactactgtgaaatcaaacaaatat
gi|89604 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----G-------T--
gi|89605 : ---TGTCAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTTGTCTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAAC
gi|89606 : ---TGTCACAGAACAGC---GTT--A-------ACCTGACTATCCTGGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----G-------T--A
gi|89607 : ---TGTCACAGAACAGA---GTT--A-------ACCTGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAG
gi|89608 : ---TGTCATAGAACCGG---GTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T----C----ACAGAACAGC-----A-------T--
gi|89609 : ---TGTCACAGAACAGT---GTT--A-------ACTTGACTATTATAGCCTTG----T----C----ACAGAAC
gi|89610 : ---TGTCACAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCCTTG----T----C----AAAGAACAG
gi|89611 : ---TGTCACAGAACAGC---ATT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTTG----T----C----ACAGA
gi|89612 : ---TGTCACAGAACCAT---GTT--A-------ACTTGACTATTCTAGCCTTG----T----C----AAAGAACAG
gi|89613 : ---TGTCACAGAACAGC---GTA--A-------ACTTGACTATTATCGCCTTG----T----C----ACAGAACAG
gi|89614 : ---TGTCACAGAACCGC---GTT--A-------ACTTGACTATTCTTGCTTTG----T----C----ACAGAACA
gi|89615 : ---TGTCACAGAACATT---GAT--A-------ACTTGACTTTTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAG
gi|89616 : ---TGTCATAGAACAGC---TTT--A-------ACTTGACTATTCTGGCCTGG----T----C----ACAAAAC
gi|89617 : GTTAAAGAACAGC---GTT--A-------ACTCGACTATTCTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AT--TAT------A----A------TGTACCAT-CAGG-AAAACA-GATATAT--CTGTAT-----GAA--T-----GAAACCATCTTTCATATAAG---CAAAATAGTGGA-----TACATGT
gi|89618 : AGAACAAC---AC---A-------ACTTGGCTATTGTCGCCTCT----A----C----ACAAAATTGT-----A-------TTTAT--TATCTAGAAG----A------TGCACCAT-CAGA-AAAACA-GGCAAAT--CCACAT-----CA---T-----CACACTGGCTTTAATAGCAG---TAAAATAGTAGA-----TACACGTAttatgcaa
gi|89619 : AGAACGGC---GTT--A-------ACTCGACTATTGTAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGC-----A-------T--tgtgaaa
gi|89620 : ACAGC---GTT--A-------ACTTGATTATTCTAGCTATG----T----C----ACAGAACCATACATAA-------T--AT--TGT------ATAATA------TGTATCAT-CATA-TAAACA-GGCATAT--TTTTAT-----CAA--T-----CAA---ATCTTT-ATAGCAA---CGATTTAGTAAA-----TACATGTA
gi|89621 : ---GTT--A-------A-TCGACTATTCCAGCCTTG----T----C----ACAGAACAGT-----A-------T--AG--TAT-----------A------TATACTAT-CCGA-AAAACA-GATATAT--tgtg
gi|89622 : ----C----ACAGAACAGT-----A-------T--TTGATAT------A----AATAATGTGTTCCAT-CAGT-AAAACA-AGCATAT--ATTTAT-----CCA--C-----GAAACCATCTTT
gi|89623 : CTAT-CAGA-AAAACA-GAT--------------------------------CCATCTTTCATATTAG---CAAAATAGTAGA-----TACATGTA
gi|89624 : ACA-TGTATCT--CTCTAT-----TAA--T-----CAAACCATCTTTAATATTAGTTTCAATA-AATAGA-----TACATGTtatgta