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Reference ( gi|94276 )        :                        ATATTTAT-GT---GTTAA-----A----GTTAT--TGAAATTT---T-GAT--A-----AC-AT----AGTGAC-----TGATAAGCCT-T--A----------C---TAGGCTG--GGT-AT--TT-----CT-TT---G--C-----ATGTACT--AA-C-G-C-T--T-T--T-G-----C--AAAT-G-TTG-T-A-A--T--CT----T--AAA------A-TG------T---AT----TGCACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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gi|94283                      :                      tttatagcat-GT---CTTGA-----A----GAAAT--TGCACTTT---TTGAA--A-----AC-AT----AGTGAC-----TGATAAGTCT-TAAA----------T---AAGGCTG--GAT-ATAATC-----CT-TG---G--C-----ACTTATC--AA---G-T-T--T-G--G-G-----C--TAAT-G-TTG-T-A-A--A--CT----T--AA
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gi|94284                      :                     tttttatatacgtgttgagacA-----A----GTTGC--TG---TTT---T-AAT--ACCTTAGC-AT----ATTGAC-----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTG--GTA-AC--AT-----CT-GA---A--C-----ATTTGCT-------G-C-T--A-T--T-G-----T----TT-G-CTT-T-A-G--T--TT----T--GAA------T-TGAA----T---ATTTGATGTACCAGT--CATT----TTAAAAG-AT
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gi|94266                      :                                                               AATTT---A-GAT--A-----AC-AT----AGTAAC-----TGATAAACCT-T--A----------G---TAGGCTC--AGT-AT--AT-----CT-TA---A--C-----ATGTATT--AA-T-G-T-T--T-T--T-G-----C--TAAT-T-TAA-T-A-A--A--AT----T--AAA------A-GA------T---AT----TGTACCTGT--TACT----TTAAAAA-ATAat
gi|94265                      :                                          tctttaatcatgtacggaagtAATTT---A-GAT--A-----AC-AT----AGTAAC-----TGATAAACCT-T--A----------G---TAGGCTC--AGT-AT--AT-----CT-TA---A--C-----ATGTATT--AA-T-G-T-T--T-T--T-G-----C--TAAT-T-TAA-T-A-A--A--AT----T--AAA------A-GA------T---AT----TGTACCTGT--TACT----TTAAAAA-ATA
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Reference ( family-488 )      :                           ATATT-TAT-GTGTTGAAGTNAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--TNACATTT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTG-----C--NAA-TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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Reference ( family-488 )      :                           ATATT-TAT-GTGTTGAAGTNAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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Reference ( family-488 )      :                           ATATT-TAT-GTGTTGAAGTNAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94250                      :                            TATT-TAT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------C---TAGGCTAG--------G--T---AT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-G-A-A--A----TC----T--AAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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gi|94257                      :                                 tcT-ATGTTGAAGTAAT--TGCAATT--AG-GAT--A-----A------A-AT----ATTCAC----AGTTAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGA--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CA-G-T--T--TAG-C--TAA-----TG-TT--GTT-A-A--T----CTAACAT--GACAT-----TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94258                      :                       tctttatacatgtatTGTTGACATAAT--TGCAATT--GT-GAT--A-----A------A-AT----AGTGAG----TGATAAGCCA-T--A----------T---TAGGTTGT--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAC-----TG-TT--G-T-A-A--A----CC----A--AACA------TGC---ATTT--TATCTGT--CACT----TTAATAA-AT
gi|94259                      :       tttttatatacgtgttgagacTATA-TAT-GTGTTAAAGTAAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------A-AA----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTCA--------G--T---CT--TTCT--A-AACATTT-------ATTAA-TA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TA-TT--G-TGA-A--T----CT----T---ACG------TAT---ATTG--TACCTTTAATACA----TTAATAATATA
gi|94260                      :                        tcttTATT-TAT-GTGTTAAAGTTAT--T--AA------------A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------C---AAGGCTGG--------G--T---TT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTC-C--AAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----TT----T--AAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94261                      :                        tcatTATT-TAT-GTGTTAACGTTAA--TGGAATT--TT-GAA--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGACT-T--A----------C---TGGGCTGT--------G--T---AT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-T-T-A--T----TT----T--AAAA------TAT---ATTG--TACCTGT--CATT----TTAATAA-ATA
gi|94262                      :                       tcatATATT-TGT-GTG--GAAGTCAT--TCCAATT--TT-GGT--A-----A------A-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--A---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CA-T-T--T--TT
gi|94263                      :                       tctttTATT-TAT-GTATTGCAGTAAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------CAATATTAAGTGAC----TGATAAGCCTAT--A----------TAAGTAGGCTTG--------G--T---AT--AATT--T-AATAATC-------TTAAA-CG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-CA--GTT-A-A--TTAAACG----C--AATG------TGT---ATTG--TACCTGT--CATT----TTAATAA-AT
gi|94264                      :                               tcttT-GTGTTTGAGTTAT--AGCAATT--TT-CAT--A-----A------A-AT----AGTGAC----TGATAAGACT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--G-AACATTT---------------------C--TTG----TAA------------------A--T----CT----T--A-CA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACA----TTAA
gi|94265                      :                  tctttataatTAAT-CAT-GTACGGAAGT--------AATT--TA-GAT--A-----A------C-AT----AGTAAC----TGATAAACCT-T--A----------G---TAGGCTCA--------G--T---AT--ATCT--T-AACATGT-------ATTAA-TG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TT-TA--A-T-A-A--A----AT----T--AAAA------GAT---ATTG--TACCTGT--TACT----TTAAAAA-ATA
gi|94266                      :                        tcttTAAT-CAT-GTACGGAAGT--------AATT--TA-GAT--A-----A------C-AT----AGTAAC----TGATAAACCT-T--A----------G---TAGGCTCA--------G--T---AT--ATCT--T-AACATGT-------ATTAA-TG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TT-TA--A-T-A-A--A----AT----T--AAAA------GAT---ATTG--TACCTGT--TACT----TTAAAAA-ATA
gi|94267                      :                        tcttTATTCTAT-TT-TTGAGTTAAT--TACAAGTAGCT-GAT--A-----GTTACACC-AT----AGTGAC----TAATGAGTCT-T--A----------T---AAGGCTGGTTATCATTGGCT---AT--TTCG--G-AATATCT-------ATTAT-TG-T-G--T--TTG-C--TAAT----TG-TT--GAT-A-A--T-----T----T--AACA------TGC---GTTG--TACTTGT--CACT----TAGATAA-
gi|94268                      :                        tcttTATT-TAT-GTGTT------AT------AT------AAA--A-----A------C-AT----AGTTAC----TGATAAGCAT-A--A----------T---TAAGCTGG--------T--T---AT--TATT--T-AACATTT-------ATTAA-CA-TAT--T--TT----------------TT-----------T----TC----T--ATCA------TAG---ATTG--TACTTGT--CATT----TTAACAA-ATA
gi|94269                      :   tttttgtcttctatgttaaatattATATT-T---GTGTTGAAGTAAT--TGCAACT--TT-GAT--G-----A------T-AC----AGAGAC----TTATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AATATTT-------ATTAA-CG-T-G--T--TTG-C--TAA------A-TTAAA-T-A-A--T----GT----TAAAAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--TATT----TAAATAA-ATA
gi|94270                      :                    cttttacATATT-T---GTGTTGAAGTCAT--TGCATTT--TT-GAT--A-----A------A-AT----AGCGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------A--T---AT--TCTT--C-AACATTT-------ATAAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----TG----T--AATA------TGT---ATTG--TACATGT--TCCTCTAATTGATAA-ATA
gi|94271                      :                         tctTATC-T-T-GCGTTAAAGTAAT--TGCAATT--TT-GGTCAA-----A------C-AT-------GAC----TGATAAGTAT-T--A----------T---TAAGCTGA--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTGA-TA-T-G--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--T-TAA-A--T----AT----T---ACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CATT----TGAATAA-ATA
gi|94272                      :                                 ttT-GTGTTGAAGTAAT--AGCCATT--TT-AAC--A-----G------C-AT----AGTAAC----TGATAAGCAT-T--A----------T---TATGCTTG--------G------AA--TCCT--T-CACATTT-------ATT---------------------TA-----------------A-A--T-----T----T--AGCA------TGT---GTTG--TGCCTGT--CACT----T
gi|94273                      :                   tttatagcatATT-T-T-GTGTTAGAGTTAT--TGCAATT--TT-GAA--A-----A------T-AT----AATGAC----TAATGAGCCT-T--ATT--------T---TATGCTTG--------G--T---GT--TTTT--T-AA
gi|94274                      :                          ttcATT-TCT-GTGTTAATGTAAT--TCCAATT--TT-GAT--A-----A------------------------------GCTT-T--A----------T---TAGGCTGG--------A--T---AT--TTCT--T-TATATTT-------ATTAA-CA-T-T--A--TTG-C--AAG-----TG-TT--G-TAA-A--T----CC----T--AACA------TGT---ATTG--CACTTGT--CACT----GTAATAA-ATA
gi|94275                      : ttatgttttgttaaataatgtcatgtaaATT-GGT-GTGATGAAGTTATATTACAATG--TT-GGT--A-----A------T-AT----AGTGAC----TGATAAACCT-G--A----------T---TAGGCTGT--------C--G---AC--TTTG--T-AAAATGT-------ATTAA-CATT-T--T--TTG-C--TAA-----TA-CT--G-T-A-A--A----TA----T--AACT------TGT---ACTG--CGCATGT--CACT----TTGATAA-
gi|94276                      :                        ttaATATT-TAT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------C---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AAAA------TGT---ATTG--CACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94277                      :                            TATT-TAC-TTGTTGAAGCAAT--TGCAATT--TT-GAA--A-----A------A-AT----AGTGAC----AAAGAAGTCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--C---AT--TTCT--T-AGCATGT-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----TG----T--AACA------TGTATAATTG--TACCTGT--ATCT----TTAATAA-ATA
gi|94278                      :                            TATT-TG----GTTAAAGTAAC--TACATTT--CT-AAT--A-----C------G-AT----AGTTAG----TGA----CCT-T--G----------T---TAGGTTGA--------A--T---TT--ATCT--A-AACATTA-------ATGAA-CG-T-G--T--TTG-C--TTA-----TG-TT--A-T-A-AATTGA--TT----T--AACA------TGT---ATTG--TTCCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94279                      :                                   T-ATGTTGAAATATT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------G-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--G----------T---TAGACTGA--------G--T---A
gi|94280                      :                                  tT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAGGCCT-T--A----------C---TAGGCTGG--------G--T---TT--TTCT--T-AACATGT-------ACTAA-AG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----TT----T--AAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATAatgtcacagtatgttctgattttagcaatgattttcaaaacaaagtttatattgattgctttaat
gi|94281                      :                                   T-ATGTTGAAGTTTT--TCCATTT--TA-AAT--ATAG--A------A-AT----AGTAAC----TGATATGCCT-T--T----------A---TATGCTGA--------G--T---AT--ATTT--T-AAGACGT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTA-T--TGA-----TG-TT--A-T-A-A--A----AT----T--AGCA------TGT---ATTT--TACCTGT--AACT----GTAATAA-ATA
gi|94282                      :                                   T-ATGTTGAAGTTTT--TCCATTT--TA-AAT--ATAG--A------A-AT----AGTAAC----TGATATGCCT-T--T----------A---TATGCTGA--------G--T---AT--ATTT--T-AAGACGT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTA-T--TGA-----TG-TT--A-T-A-A--A----AT----T--AGCA------TGT---ATTT--TACCTGT--AACT----GTAATAA-ATA
gi|94283                      :                                    -GTCTTGAAGAAAT--TGCACTT--TTTGAA--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGTCT-TAAA----------T---AAGGCTGG--------A--T---ATAATCCT--T-GGCACTT-------ATCAA--G-T-T--T--GGG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----CT----T--AA
gi|94284                      :                                          GAAGTTGC--TG---TT--TT-AAT--ACCTTAG------C-AT----ATTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------T--A---AC--ATCT--G-AACATTT-------GCTGC-TA-T-TG-T--TTG-CTTTAG-----TT-TT--G---A-A--T-----T----G--AATA------TTT---GATG--TACCAGT--CATT----TTAAAAG-AT
gi|94285                      :                                                           --TT-GAT--A-----A------C-AT----GGTAAC----TGATTAGCTT-T--A----------T---CAGACTGA--------G--C---AT--ATTT--T-AACATTT-------AACAA-CA-T-
gi|94286                      :                                                   aagtgATT--TT-GAT--A-----A------A-CT----TGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TACGCTGG--------G--T---AT--TTTC--G-AACTTTT-------ATTAA--A-T-T--A--TTG-C--TAT-----TG-TT--G-TAA-A--T----CA----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--TATT----TTAATCA-ATA
gi|94287                      :                                                          T--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGTCT-T--AAAAAAAATAAT---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTTT--A-AACATTC-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-G--TAA-----AG-TT--G-T-A-A--A----CC----T--AACATGACGTTGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94288                      :                                                                   --A-----A------A-AC----AGTGAC----TGATAAGCCT-G--T----------T---TAGGCAGG--------G--TACAAT--TTTTTAT-AACAATT-------ATT-A-TG-T-TTGT--TTG-T--CTA-----TGTTT--G-T-G----------T----T--A-----------T---ATTGTTTTCATGT--CACG----TGAATAA-ATA
gi|94289                      :                                                                                   -AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-A--A----------T---TAGGCTGA--------G--T---AT--TT
gi|94290                      :                                                                                   aaT----AATGAC----CGATAGGCTC-T--A----------T---TAAGCTTT--------A--T---AT--TGCG--G-AACATTT-------ATTAAGTA-T-T--TTCTTGCC--TAA------A-CT--G-T-A-A--T----TT----A--AAC-------------ATTG--TATTTG---CAAT----TTAATAA-ATA
gi|94291                      :                                                                                     T----AGCGACATATTAAAAAGCCT-T--A----------T---CAGGTTGG--------G--T---AT--TTCT--A-AACAGCT--------------G-T-T--T-----------A-----TG-TT-----------------T----T--AA-A------TGT---GTAG--TACCCGT--CACT----TAAAT
gi|94292                      :                                                                                            TGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGA--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------CTGAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-TAA-A--T----CT----T---TTA------TGT---ATTG--TATCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94293                      :                                                                                                           CCT-T--T----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--GTCT--T-AACAATC-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----CT-TT--G-TAA-A--T----CG----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--TGCA----TTAATGA-ATA
gi|94294                      :                                                                                                              -T--A----------G---TAGTCTAT--------G--T---AT--ATAT--T-AACATTTTTGCTTTATTAA-CG-T-T--T--TAG-A--TAAATAAATG-CT--G-T-ACA--T----CT-------AAAA------TGT---ATTG--CACATGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94295                      :                                                                                                                                                                                                                                              --AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA


blockSeqs                     :                                C A T          T  AT       AG  T   CA CCTTA TTACACC   ATTA      ATAT            AA AAAAAAATAA AAG        TTATCATT GC ACA  AA    TA         TTGCTTT            TG TC   C TT   ATAAA  T  AA T A C TTAAAC   AACA AA  A TGACGT   ATA    TT       AA    CTAA       T
blockSeqs                     :                                . A .          T  .        .   .   .  TAG   CA        .         .               .  TT         .          .        .  .    .     .          .                  G  .    . .    T      .  .  T A . ATTGAT   .    .   A T        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  TAG   C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  A G . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . T .          T  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . A . TT       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . A . TC       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . A . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . A . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . A . AT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . G .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          T  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AC       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          T  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          C  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TT       .    .   T .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          T  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . C .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AA       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . G .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AA       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          C  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . A .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TG       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . G .          A  .        .   .   .  .     T         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AT       .    .   T .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . . .          T  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TA       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . . .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . . .          T  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . . .          T  .        .   .   .  .     T         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                . . .          A  .        .   .   .  .     T         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AT       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          A  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AA       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          T  .        .   .   .  .     G         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AA       .    .   A .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          T  .        .   .   .  .     G         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          T  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          A  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . AC       .    .   T .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          T  .        .   .   .  .     A         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TT       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                    .          .  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
blockSeqs                     :                                               .  .        .   .   .  .     C         .         .               .  .          .          .        .  .    .     .          .                  .  .    . .    .      .  .  . . . TC       .    .   C .        .      .        .     .          .
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blockSeqCons                  :                           
originalCons                  :                           ATATT-TAT-GTGTTGAAGTNAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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lowQualScore                  :                                6 6 2          6  66       44  1   44 22222 77777777  0000      0000          9 22 1111111111 666        22222222 22 666  22    33 9     3 1111111     0  0 0 33 33   0 44   55555  0  44 0 0 0 22222222 1111 33  6 999999   888    44       44    1111       1   
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Reference ( family-488 )      :                           ATATT-TAT-GTGTTGAAGTNAT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94250                      :                            TATT-TAT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------C---TAGGCTAG--------G--T---AT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-G-A-A--A----TC----T--AAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
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gi|94266                      :                        tcttTAAT-CAT-GTACGGAAGT--------AATT--TA-GAT--A-----A------C-AT----AGTAAC----TGATAAACCT-T--A----------G---TAGGCTCA--------G--T---AT--ATCT--T-AACATGT-------ATTAA-TG-T-T--T--TTG-C--TAA-----TT-TA--A-T-A-A--A----AT----T--AAAA------GAT---ATTG--TACCTGT--TACT----TTAAAAA-ATA
gi|94267                      :                        tcttTATTCTAT-TT-TTGAGTTAAT--TACAAGTAGCT-GAT--A-----GTTACACC-AT----AGTGAC----TAATGAGTCT-T--A----------T---AAGGCTGGTTATCATTGGCT---AT--TTCG--G-AATATCT-------ATTAT-TG-T-G--T--TTG-C--TAAT----TG-TT--GAT-A-A--T-----T----T--AACA------TGC---GTTG--TACTTGT--CACT----TAGATAA-
gi|94268                      :                        tcttTATT-TAT-GTGTT------AT------AT------AAA--A-----A------C-AT----AGTTAC----TGATAAGCAT-A--A----------T---TAAGCTGG--------T--T---AT--TATT--T-AACATTT-------ATTAA-CA-TAT--T--TT----------------TT-----------T----TC----T--ATCA------TAG---ATTG--TACTTGT--CATT----TTAACAA-ATA
gi|94269                      :   tttttgtcttctatgttaaatattATATT-T---GTGTTGAAGTAAT--TGCAACT--TT-GAT--G-----A------T-AC----AGAGAC----TTATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-AATATTT-------ATTAA-CG-T-G--T--TTG-C--TAA------A-TTAAA-T-A-A--T----GT----TAAAAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--TATT----TAAATAA-ATA
gi|94270                      :                    cttttacATATT-T---GTGTTGAAGTCAT--TGCATTT--TT-GAT--A-----A------A-AT----AGCGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------A--T---AT--TCTT--C-AACATTT-------ATAAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----TG----T--AATA------TGT---ATTG--TACATGT--TCCTCTAATTGATAA-ATA
gi|94271                      :                         tctTATC-T-T-GCGTTAAAGTAAT--TGCAATT--TT-GGTCAA-----A------C-AT-------GAC----TGATAAGTAT-T--A----------T---TAAGCTGA--------G--T---AT--TTCT--T-AACATTT-------ATTGA-TA-T-G--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--T-TAA-A--T----AT----T---ACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CATT----TGAATAA-ATA
gi|94272                      :                                 ttT-GTGTTGAAGTAAT--AGCCATT--TT-AAC--A-----G------C-AT----AGTAAC----TGATAAGCAT-T--A----------T---TATGCTTG--------G------AA--TCCT--T-CACATTT-------ATT---------------------TA-----------------A-A--T-----T----T--AGCA------TGT---GTTG--TGCCTGT--CACT----T
gi|94273                      :                   tttatagcatATT-T-T-GTGTTAGAGTTAT--TGCAATT--TT-GAA--A-----A------T-AT----AATGAC----TAATGAGCCT-T--ATT--------T---TATGCTTG--------G--T---GT--TTTT--T-AA
gi|94274                      :                          ttcATT-TCT-GTGTTAATGTAAT--TCCAATT--TT-GAT--A-----A------------------------------GCTT-T--A----------T---TAGGCTGG--------A--T---AT--TTCT--T-TATATTT-------ATTAA-CA-T-T--A--TTG-C--AAG-----TG-TT--G-TAA-A--T----CC----T--AACA------TGT---ATTG--CACTTGT--CACT----GTAATAA-ATA
gi|94275                      : ttatgttttgttaaataatgtcatgtaaATT-GGT-GTGATGAAGTTATATTACAATG--TT-GGT--A-----A------T-AT----AGTGAC----TGATAAACCT-G--A----------T---TAGGCTGT--------C--G---AC--TTTG--T-AAAATGT-------ATTAA-CATT-T--T--TTG-C--TAA-----TA-CT--G-T-A-A--A----TA----T--AACT------TGT---ACTG--CGCATGT--CACT----TTGATAA-
gi|94276                      :                        ttaATATT-TAT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------C---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTCT--T-TGCATGT-------ACTAA-CG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----CT----T--AAAA------TGT---ATTG--CACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94277                      :                            TATT-TAC-TTGTTGAAGCAAT--TGCAATT--TT-GAA--A-----A------A-AT----AGTGAC----AAAGAAGTCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------G--C---AT--TTCT--T-AGCATGT-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----TG----T--AACA------TGTATAATTG--TACCTGT--ATCT----TTAATAA-ATA
gi|94278                      :                            TATT-TG----GTTAAAGTAAC--TACATTT--CT-AAT--A-----C------G-AT----AGTTAG----TGA----CCT-T--G----------T---TAGGTTGA--------A--T---TT--ATCT--A-AACATTA-------ATGAA-CG-T-G--T--TTG-C--TTA-----TG-TT--A-T-A-AATTGA--TT----T--AACA------TGT---ATTG--TTCCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94279                      :                                   T-ATGTTGAAATATT--TGCAATT--TT-GAT--A-----A------G-AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-T--G----------T---TAGACTGA--------G--T---A
gi|94280                      :                                  tT-GTGTTAAAGTTAT--TGAAATT--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAGGCCT-T--A----------C---TAGGCTGG--------G--T---TT--TTCT--T-AACATGT-------ACTAA-AG-C-T--T--TTG-C--AAA-----TG-TT--G-T-A-A--T----TT----T--AAAA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATAatgtcacagtatgttctgattttagcaatgattttcaaaacaaagtttatattgattgctttaat
gi|94281                      :                                   T-ATGTTGAAGTTTT--TCCATTT--TA-AAT--ATAG--A------A-AT----AGTAAC----TGATATGCCT-T--T----------A---TATGCTGA--------G--T---AT--ATTT--T-AAGACGT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTA-T--TGA-----TG-TT--A-T-A-A--A----AT----T--AGCA------TGT---ATTT--TACCTGT--AACT----GTAATAA-ATA
gi|94282                      :                                   T-ATGTTGAAGTTTT--TCCATTT--TA-AAT--ATAG--A------A-AT----AGTAAC----TGATATGCCT-T--T----------A---TATGCTGA--------G--T---AT--ATTT--T-AAGACGT-------ATTAA-CG-T-T--T--TTA-T--TGA-----TG-TT--A-T-A-A--A----AT----T--AGCA------TGT---ATTT--TACCTGT--AACT----GTAATAA-ATA
gi|94283                      :                                    -GTCTTGAAGAAAT--TGCACTT--TTTGAA--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGTCT-TAAA----------T---AAGGCTGG--------A--T---ATAATCCT--T-GGCACTT-------ATCAA--G-T-T--T--GGG-C--TAA-----TG-TT--G-T-A-A--A----CT----T--AA
gi|94284                      :                                          GAAGTTGC--TG---TT--TT-AAT--ACCTTAG------C-AT----ATTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TAGGCTGG--------T--A---AC--ATCT--G-AACATTT-------GCTGC-TA-T-TG-T--TTG-CTTTAG-----TT-TT--G---A-A--T-----T----G--AATA------TTT---GATG--TACCAGT--CATT----TTAAAAG-AT
gi|94285                      :                                                           --TT-GAT--A-----A------C-AT----GGTAAC----TGATTAGCTT-T--A----------T---CAGACTGA--------G--C---AT--ATTT--T-AACATTT-------AACAA-CA-T-
gi|94286                      :                                                   aagtgATT--TT-GAT--A-----A------A-CT----TGTGAC----TGATAAGCCT-T--A----------T---TACGCTGG--------G--T---AT--TTTC--G-AACTTTT-------ATTAA--A-T-T--A--TTG-C--TAT-----TG-TT--G-TAA-A--T----CA----T--AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--TATT----TTAATCA-ATA
gi|94287                      :                                                          T--TT-GAT--A-----A------C-AT----AGTGAC----TGATAAGTCT-T--AAAAAAAATAAT---TAGGCTGG--------G--T---AT--TTTT--A-AACATTC-------ATTAA-CA-T-T--T--TTG-G--TAA-----AG-TT--G-T-A-A--A----CC----T--AACATGACGTTGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94288                      :                                                                   --A-----A------A-AC----AGTGAC----TGATAAGCCT-G--T----------T---TAGGCAGG--------G--TACAAT--TTTTTAT-AACAATT-------ATT-A-TG-T-TTGT--TTG-T--CTA-----TGTTT--G-T-G----------T----T--A-----------T---ATTGTTTTCATGT--CACG----TGAATAA-ATA
gi|94289                      :                                                                                   -AT----AGTGAC----TGATAAGCCT-A--A----------T---TAGGCTGA--------G--T---AT--TT
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gi|94291                      :                                                                                     T----AGCGACATATTAAAAAGCCT-T--A----------T---CAGGTTGG--------G--T---AT--TTCT--A-AACAGCT--------------G-T-T--T-----------A-----TG-TT-----------------T----T--AA-A------TGT---GTAG--TACCCGT--CACT----TAAAT
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gi|94294                      :                                                                                                              -T--A----------G---TAGTCTAT--------G--T---AT--ATAT--T-AACATTTTTGCTTTATTAA-CG-T-T--T--TAG-A--TAAATAAATG-CT--G-T-ACA--T----CT-------AAAA------TGT---ATTG--CACATGT--CACT----TTAATAA-ATA
gi|94295                      :                                                                                                                                                                                                                                              --AACA------TGT---ATTG--TACCTGT--CACT----TTAATAA-ATA