lowQualScore : 111 11 1111 1
lowQualScore : 8 11 333 111 111 44 1 1 0 11 11 0000 0 0 1 111 0 0 111 0 22222 111 11 0 0 222222 0 11 11
lowQualScore : . .. ... ... ... .. . . . .. .. .... . . . ... . . ... . ..... ... .. . . ...... . .. ..
lowQualScore : 0 55 111 777 999 77 0 0 2 22 22 8888 9 0 8 666 9 9 555 8 00000 444 11 8 8 333333 8 11 22
consensus : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTCT--AATTGCCA--C-C--T-CNTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
Reference ( gi|84784 ) : AAC-CAAA--C---T--AA---CACAGT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-CGTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84781 : AAC-CAAA--C---T--TA---CAAATT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-TGTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84783 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-CGTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---TAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAAATTGTT
gi|84785 : AAA-CAAA--C---G--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-CGTTT-A---TAAG-ACGTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84780 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGGCA--C-C--T-CGTTTTA---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84790 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCGCTTT--AATTGCAA--C-A--T-CGTAT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TA---GAT--G-C-CT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTGGTTt
gi|84791 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTACAA--C-A--T-CGTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAT--G-A-TT------TGT-AAAA--GC--ATCCAACTTGTTt
gi|84792 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-CATTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84786 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCA-------ATTGCCA--C-A--T-CTTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACGTGTT
gi|84782 : AACTCAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTTACACT--AATTGCCA--C-C--T-CTTTT-C---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--AC--AGCCAACTTGTTt
gi|84788 : AACTCAAA--C-------A---TACATT-CA-TTAAATCT--GTTTACCA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84789 : AACTCAAA--C---A--TA---TACATT-CA-TTAAATTT--ATTTACCA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84795 : AAC-CTAA--C---T--AA---CACATT-CA-CTCACTTC--AACTGCCA--C-C--T-CCTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--t
gi|84793 : AACTCAAA--C---A--GA---TACATT-CA-TTAAATCT--ATTTACCA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACTTAGC-T---A-T-----CG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84794 : AAC-CAAA--CGTTT--AT---C---TT-CA-TTCACTCT--AATTGCTA--G-C--T-CCTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84787 : AACTCAAA--C---A--TA---TACATT-CA-TTTAATTT--ATCTACCA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACTAAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTC-AAAA--GC--AGCCAtcgtgctt
gi|84796 : AACTCAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTTACTT---AATCGCCA--C-C--T-GTTTT-C---TAAA-ACCGAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAG--G
gi|84799 : AAC-CAAA--C---T--TA---CACATT-CT-TTTACTTT--AATCGCCA--C-A--T-CGTTT-A---TAAGCAGCCAAC-
gi|84798 : AAC-CAAAACC---T--A----CACCTT-CAGTTCCCTCTTAAATTGCCA--C-C--T-CCTTT-ATATTAAG-AACTAAC-C---A-TTATGGTA---GGT--G-C-TT------TTC-AAAA--TC--AA-TGACTTGTT
gi|84801 : C-CAAA--C---T--A----CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGCCA--C-A--T-CTTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---T-T-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AACCAACTTGTT
gi|84802 : C-CAAA--C---T--AA---CGCAAT-CA-TTCACTCA--AATTTCTA--C-C--T-CTTTT-A---TAAA-ACCGAAC-C---A-C-----TG---GGT--G-C-TT------CTT-AAAA--GT--AGCCTACTTATTt
gi|84804 : C-CAAA--C---T--TA---CACCTT-CA-ATCAGTCT--GAGTGCCG--T-C--T-CATTT-A---TAGG-ACCTAAG-C---A-C-----TA---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACt
gi|84805 : C-CTAA--T---T--TA---CAAATT-AA-TTCGTTCT--GTTTGCCA--C-C--T-CCTAA-A---TAAC-ACCTAAG-C---A-C-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCATCTTGTT
gi|84803 : C-CAAA--C---T--TA---AACCTT-CA-TTGACTCT--AATTGCCA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACCTGGC-C---A-T-----TG---G-----------------------A--GC--AGGCAACTTGTTt
gi|84806 : C-CAAA--C---T--TA---CATCTT-TA-TTCCCTTT--GATTACCA--C-C--T-CCTTT-A---TATG-ACCTTAC-T---T-T-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--AC--ATCCAATTAGTTt
gi|84808 : C-CAAA--C---T--TA---CATTTTTCA-TTTAATCT--AATCGTCAGCC-AACTACGTTG-C---TAAG-ACCTAAC-C---A-C-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GCTGAACCAACATGTT
gi|84807 : C-CCAA--C---T--TA---CACCTG-CA-TTC----T--AATTGCCA--C-C--T-CCTTT-A---TAAA-ACCTTAC-C---G-T-----TA---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84809 : -CAAA--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGCAA--C-C--T-CTTTT-A---TAAG-ACATAAC-C---A-T-----CG---GAT--G-C-GT------TTT-AAAA--GC--GGCCAACTTGTT
gi|84810 : -CAAA--C---TTTAA---CAT--T-CA-TTCGCTCT--TATTGCCA--C-C--T-CTTTT-----TAGG-ACCTAAC-A---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--CC--GGCCAACTTGTTt
gi|84811 : -CAAA--C---T--TA---CACTTT-CA-TTCACCCT--AATTGCCA--C-C--T-CCCTT-A---TAAG-ACCTTAA-C---A-T-----TG---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--TC--AGCCt
gi|84813 : -CAAA--CC--T--TA---CACCTT-CA-TCCACTTT--AATTGCCA--C-C--T-CCTTT-----T-AG-ACCTAAT-CGGTA-T-----TGTTTTAT--G-A-TTGGTATATAT-AAAG--TC--AGCCAACtttaagttacttgttt
gi|84814 : AA--C---T--AA---CACCTT-CA-TTTACTCT--AAGTGCCA--C-C--G-CCTTT-A---TAAG-ACCTTAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC-------ACTTGTT
gi|84815 : AA--C---T--AA---CATATT-AA-TTTACTCT--AAGTGTCA--C-C--T-CCTTC-A---TGAG-ACCTAAC-T---A-T-----TG---GAT--G---GT------TTC-AAAA--GT--AGCCAACTCGTTt
gi|84816 : AA--C---T--TA---CACCTT-CA-TTCACTCT--TATTGCAA--C-C--T-CCTTT-A---TAAG-ATCTAAC-C---A-T-----CG---GATAAG-------------T-GAAA--GC--TTCCAACTTGTTt
gi|84817 : A--C---T--TA---CACATT-CA-TTCACTTT--AATTGACA--C-A--T-CGTTT-A---TAAG-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GT--AGCCAACTTGt
gi|84818 : A--C---T--TA---CACTTT-CA-CTCACTCT--AATTGTCA--A-T--T-CCTTT-A---TAAG-ACCTA---------T-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTGGTTatt
gi|84800 : --C---T--AAGTTCACCTT-CA-TTCAGTCT--AATTGTTA--A-C--T-CCTTT-A---TAAG-ACCTAGC-C---A-T-----TC---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--ACCCAACTTGTt
gi|84820 : acA---CACCGT-CA-TTCACTGT--AATTGCCA--C-C--T-CTTTT-A---TATG-ACCTAAT-C---A-T-----TG---GAT--G-C--T------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTT
gi|84821 : ttCAGT-CA-CTCAT------ACTGTCA--C-C--T-CTTTTTA---TAAG-ACTTAAC-C---A-C-----TT---GAT--G-T-TT------TTT--AAA--GA--AGCCAACTTTTT
gi|84797 : caatT-TA-TTCACTGT--AATTGCCA--C-C--T-CAGTT-A---TAAC-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GA---A-CAAT------ATT-AAAA--GC--AGCCAATTTATT
gi|84822 : aacgcaagtttaaatctT-CA-TTCCTTCT--TAGTGTCA--C-C--T-CCTTT-A---TAAG-ACC---------A-T-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84812 : -CA-TTCACTTG--AGTTGTCA--CCA--C-C--TT-A---CGAA-ACCTAAC-C---A-T-----TG---GAA--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--GCCCAACTTGTT
gi|84819 : caaatttaaaatctc-CA-TTCA-TTT--A--TGTCA--C-C--T-CTTTT-A---AAAT-ATCTAAC-T---A-T-----CG---GAC--G-C-TT------TTT-AACA--GC--AACCAt
gi|84823 : acctacaCACCTT--TATTGCC--------T-CTATT-A---TAAG-ACCTTAC-A---A-A-----TG---CAC--G-C-TT------TTT-AAAAGTGC--ACCCAACTTATT
gi|84824 : ACTCT--AGTTACCA--C-C--T-CTTTT-T---TAAG-ACCTAAC-C---G-T-----TG---GAT--GTT-TT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTTGT
gi|84825 : TTGCCA--C-C--T-CCTAT-T---TAAG-ACCTAAC-T---G-A-----TG---GAT--G-C-TT------TCTAAAAA--GC--AGCCAACTTTTT
gi|84786 : AACAC---G-T-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAA
gi|84818 : aaccaaacttacacattcattcaattgccacatcttttataagaccttaccaAAC-C---AGT-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAAt
gi|84781 : acttacactttcactcactctaattgtcaattcctttataagaccta-T-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAAt
gi|84785 : aaccaaacttacaaattcattcactttaattgccacattgtttataagacctaacca-T-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAActtgtt
gi|84788 : aaacaaacgtacacattcattcactttaattgccacatcgtttataagacgtaacca-T-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAActtgttt
gi|84789 : aactcaaacatacattcattaaatctgtttaccacctcttttataagacctaacca-T-----TG---GCT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC--ATCCAActtgttt
gi|84814 : aactcaaacatatacattcattaaatttatttaccacctcttttataagaccttaccaT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--ATCCAActtgttt
Alignments
lowQualScore : 8 1 1 11 0 0 0 0 11 1111 0 1 1 111 0 111 22222 111 11 0 0 222222 0 11 11
lowQualScore : . . . .. . . . . .. .... . . . ... . ... ..... ... .. . . ...... . .. ..
lowQualScore : 2 0 0 33 9 9 9 6 22 8888 9 0 7 555 9 666 22222 666 22 9 9 666666 9 22 33
consensus : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
Reference ( family-487 ) : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84780 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----GCACCT-CGTTTTA---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84781 : AAC-CAAA-C-TTACA--AATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-TGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84782 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACACT--AATTG----CCACCT-CTTTT-C---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--AC--AGCCAACTTGTT
gi|84783 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---TAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAAATTGTT
gi|84784 : AAC-CAAA-C-TAACA--CAGT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84785 : AAA-CAAA-C-GTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACGTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84786 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCA-------ATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACGTGTTt
gi|84787 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTTAATTT--ATCTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTAAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTC-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84788 : AACTCAAA-C---ATA--CATT-CA-TTAAATCT--GTTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84789 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTAAATTT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84790 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCGCTTT--AATTG----CAACAT-CGTAT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-CT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTGGTTt
gi|84791 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTA----CAACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-A-TT------TGT-AAAA--GC--ATCCAACTTGTTt
gi|84792 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CATTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84793 : AACTCAAA-C-AGATA--CATT-CA-TTAAATCT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTTAGCT---AT-----CG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84794 : AAC-CAAA-C-GTTTA--TCTT-CA-TTCACTCT--AATTG----CTAGCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84795 : AAC-CTAA-C-TAACA--CATT-CA-CTCACTTC--AACTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--tcgtgctt
gi|84796 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACT-T--AATCG----CCACCT-GTTTT-C---TAAA-ACCGAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAG--G
gi|84797 : AACGCAAG-T-TTAAA--TCTT-TA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CAGTT-A---TAAC-ACCTAACC---AT-----TG---GA---A-CAAT------ATT-AAAA--GC--AGCCAATTTATT
gi|84798 : AAC-CAAAAC-CTACA--CCTT-CAGTTCCCTCTTAAATTG----CCACCT-CCTTT-ATATTAAG-AACTAACC---ATTATGGTA---GGT--G-C-TT------TTC-AAAA--TC--AA-TGACTTGTTt
gi|84799 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CT-TTTACTTT--AATCG----CCACAT-CGTTT-A---TAAGCAGCCAAC
gi|84800 : AC-CTAA-G-TT-CA--CCTT-CA-TTCAGTCT--AATTG----TTAACT-CCTTT-A---TAAG-ACCTAGCC---AT-----TC---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--ACCCAACTTGT
gi|84801 : C-CAAA-C-T-ACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---TT-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AACCAACTTGTT
gi|84802 : C-CAAA-C-TAACG--CAAT-CA-TTCACTCA--AATTT----CTACCT-CTTTT-A---TAAA-ACCGAACC---AC-----TG---GGT--G-C-TT------CTT-AAAA--GT--AGCCTACTTATTt
gi|84803 : C-CAAA-C-TTAAA--CCTT-CA-TTGACTCT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTGGCC---AT-----TG---G-----------------------A--GC--AGGCAACTTGTTt
gi|84804 : C-CAAA-C-TTACA--CCTT-CA-ATCAGTCT--GAGTG----CCGTCT-CATTT-A---TAGG-ACCTAAGC---AC-----TA---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACt
gi|84805 : C-CTAA-T-TTACA--AATT-AA-TTCGTTCT--GTTTG----CCACCT-CCTAA-A---TAAC-ACCTAAGC---AC-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCATCTTGTT
gi|84806 : C-CAAA-C-TTACA--TCTT-TA-TTCCCTTT--GATTA----CCACCT-CCTTT-A---TATG-ACCTTACT---TT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--AC--ATCCAATTAGTTt
gi|84807 : C-CCAA-C-TTACA--CCTG-CA-TTC----T--AATTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAA-ACCTTACC---GT-----TA---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84808 : C-CAAA-C-TTACA--TTTTTCA-TTTAATCT--AATCGTCAGCCAACTACGTTG-C---TAAG-ACCTAACC---AC-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GCTGAACCAACATGTT
gi|84809 : -CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CAACCT-CTTTT-A---TAAG-ACATAACC---AT-----CG---GAT--G-C-GT------TTT-AAAA--GC--GGCCAACTTGTTt
gi|84810 : -CAAA-C-TTTAA--CATT-CA-TTCGCTCT--TATTG----CCACCT-CTTTT-----TAGG-ACCTAACA---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--CC--GGCCAACTTGTTt
gi|84811 : -CAAA-C-TTACA--CTTT-CA-TTCACCCT--AATTG----CCACCT-CCCTT-A---TAAG-ACCTTAAC---AT-----TG---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--TC--AGCCt
gi|84812 : -CAAA-T-TTAAAATC-TC-CA-TTCACTTG--AGTTG----TCACCA-CCTT--A---CGAA-ACCTAACC---AT-----TG---GAA--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--GCCCAACTTGTTtttaagttacttgttt
gi|84813 : -CAAA-CCTTACA--CCTT-CA-TCCACTTT--AATTG----CCACCT-CCTTT-----T-AG-ACCTAATCGGTAT-----TGTTTTAT--G-A-TTGGTATATAT-AAAG--TC--AGCCAACt
gi|84814 : AA-C-TAACA--CCTT-CA-TTTACTCT--AAGTG----CCACCG-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC-------ACTTGTT
gi|84815 : AA-C-TAACA--TATT-AA-TTTACTCT--AAGTG----TCACCT-CCTTC-A---TGAG-ACCTAACT---AT-----TG---GAT--G---GT------TTC-AAAA--GT--AGCCAACTCGTTt
gi|84816 : AA-C-TTACA--CCTT-CA-TTCACTCT--TATTG----CAACCT-CCTTT-A---TAAG-ATCTAACC---AT-----CG---GATAAG-------------T-GAAA--GC--TTCCAACTTGTTt
gi|84817 : A-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----ACACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GT--AGCCAACTTGt
gi|84818 : A-C-TTACA--CTTT-CA-CTCACTCT--AATTG----TCAATT-CCTTT-A---TAAG-ACCT-------AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTGGTTatt
gi|84819 : A-C-CTACA--CATT-CA-TTTA---------TG----TCACCT-CTTTT-A---AAAT-ATCTAACT---AT-----CG---GAC--G-C-TT------TTT-AACA--GC--AACCAt
gi|84820 : -TTACA--CCGT-CA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TATG-ACCTAATC---AT-----TG---GAT--G-C--T------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTT
gi|84821 : --CAAT-CA-GTCACTCA--TACTG----TCACCT-CTTTTTA---TAAG-ACTTAACC---AC-----TT---GAT--G-T-TT------TTT--AAA--GA--AGCCAACTTTTT
gi|84822 : T-CA-TTCCTTCT--TAGTG----TCACCT-CCTTT-A---TAAG------ACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84823 : CACCTT--TATTG----CC---T-CTATT-A---TAAG-ACCTTACA---AA-----TG---CAC--G-C-TT------TTT-AAAAGTGC--ACCCAACTTATT
gi|84824 : ACTCT--AGTTA----CCACCT-CTTTT-T---TAAG-ACCTAACC---GT-----TG---GAT--GTT-TT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTTGT
gi|84825 : TTG----CCACCT-CCTAT-T---TAAG-ACCTAACT---GA-----TG---GAT--G-C-TT------TCTAAAAA--GC--AGCCAACTTTTT
Alignments
lowQualScore : 8 1 1 11 0 0 0 0 11 1111 0 1 1 111 0 111 22222 111 11 0 0 222222 0 11 11
lowQualScore : . . . .. . . . . .. .... . . . ... . ... ..... ... .. . . ...... . .. ..
lowQualScore : 2 0 0 33 9 9 9 6 22 8888 9 0 7 555 9 666 22222 666 22 9 9 666666 9 22 33
consensus : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
Reference ( family-487 ) : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84780 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----GCACCT-CGTTTTA---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84781 : AAC-CAAA-C-TTACA--AATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-TGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84782 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACACT--AATTG----CCACCT-CTTTT-C---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--AC--AGCCAACTTGTT
gi|84783 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---TAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAAATTGTT
gi|84784 : AAC-CAAA-C-TAACA--CAGT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84785 : AAA-CAAA-C-GTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACGTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84786 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCA-------ATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACGTGTTt
gi|84787 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTTAATTT--ATCTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTAAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTC-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84788 : AACTCAAA-C---ATA--CATT-CA-TTAAATCT--GTTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84789 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTAAATTT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84790 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCGCTTT--AATTG----CAACAT-CGTAT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-CT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTGGTTt
gi|84791 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTA----CAACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-A-TT------TGT-AAAA--GC--ATCCAACTTGTTt
gi|84792 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CATTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84793 : AACTCAAA-C-AGATA--CATT-CA-TTAAATCT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTTAGCT---AT-----CG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84794 : AAC-CAAA-C-GTTTA--TCTT-CA-TTCACTCT--AATTG----CTAGCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84795 : AAC-CTAA-C-TAACA--CATT-CA-CTCACTTC--AACTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--tcgtgctt
gi|84796 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACT-T--AATCG----CCACCT-GTTTT-C---TAAA-ACCGAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAG--G
gi|84797 : AACGCAAG-T-TTAAA--TCTT-TA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CAGTT-A---TAAC-ACCTAACC---AT-----TG---GA---A-CAAT------ATT-AAAA--GC--AGCCAATTTATT
gi|84798 : AAC-CAAAAC-CTACA--CCTT-CAGTTCCCTCTTAAATTG----CCACCT-CCTTT-ATATTAAG-AACTAACC---ATTATGGTA---GGT--G-C-TT------TTC-AAAA--TC--AA-TGACTTGTTt
gi|84799 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CT-TTTACTTT--AATCG----CCACAT-CGTTT-A---TAAGCAGCCAAC
gi|84800 : AC-CTAA-G-TT-CA--CCTT-CA-TTCAGTCT--AATTG----TTAACT-CCTTT-A---TAAG-ACCTAGCC---AT-----TC---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--ACCCAACTTGT
gi|84801 : C-CAAA-C-T-ACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---TT-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AACCAACTTGTT
gi|84802 : C-CAAA-C-TAACG--CAAT-CA-TTCACTCA--AATTT----CTACCT-CTTTT-A---TAAA-ACCGAACC---AC-----TG---GGT--G-C-TT------CTT-AAAA--GT--AGCCTACTTATTt
gi|84803 : C-CAAA-C-TTAAA--CCTT-CA-TTGACTCT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTGGCC---AT-----TG---G-----------------------A--GC--AGGCAACTTGTTt
gi|84804 : C-CAAA-C-TTACA--CCTT-CA-ATCAGTCT--GAGTG----CCGTCT-CATTT-A---TAGG-ACCTAAGC---AC-----TA---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACt
gi|84805 : C-CTAA-T-TTACA--AATT-AA-TTCGTTCT--GTTTG----CCACCT-CCTAA-A---TAAC-ACCTAAGC---AC-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCATCTTGTT
gi|84806 : C-CAAA-C-TTACA--TCTT-TA-TTCCCTTT--GATTA----CCACCT-CCTTT-A---TATG-ACCTTACT---TT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--AC--ATCCAATTAGTTt
gi|84807 : C-CCAA-C-TTACA--CCTG-CA-TTC----T--AATTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAA-ACCTTACC---GT-----TA---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84808 : C-CAAA-C-TTACA--TTTTTCA-TTTAATCT--AATCGTCAGCCAACTACGTTG-C---TAAG-ACCTAACC---AC-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GCTGAACCAACATGTT
gi|84809 : -CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CAACCT-CTTTT-A---TAAG-ACATAACC---AT-----CG---GAT--G-C-GT------TTT-AAAA--GC--GGCCAACTTGTTt
gi|84810 : -CAAA-C-TTTAA--CATT-CA-TTCGCTCT--TATTG----CCACCT-CTTTT-----TAGG-ACCTAACA---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--CC--GGCCAACTTGTTt
gi|84811 : -CAAA-C-TTACA--CTTT-CA-TTCACCCT--AATTG----CCACCT-CCCTT-A---TAAG-ACCTTAAC---AT-----TG---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--TC--AGCCt
gi|84812 : -CAAA-T-TTAAAATC-TC-CA-TTCACTTG--AGTTG----TCACCA-CCTT--A---CGAA-ACCTAACC---AT-----TG---GAA--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--GCCCAACTTGTTtttaagttacttgttt
gi|84813 : -CAAA-CCTTACA--CCTT-CA-TCCACTTT--AATTG----CCACCT-CCTTT-----T-AG-ACCTAATCGGTAT-----TGTTTTAT--G-A-TTGGTATATAT-AAAG--TC--AGCCAACt
gi|84814 : AA-C-TAACA--CCTT-CA-TTTACTCT--AAGTG----CCACCG-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC-------ACTTGTT
gi|84815 : AA-C-TAACA--TATT-AA-TTTACTCT--AAGTG----TCACCT-CCTTC-A---TGAG-ACCTAACT---AT-----TG---GAT--G---GT------TTC-AAAA--GT--AGCCAACTCGTTt
gi|84816 : AA-C-TTACA--CCTT-CA-TTCACTCT--TATTG----CAACCT-CCTTT-A---TAAG-ATCTAACC---AT-----CG---GATAAG-------------T-GAAA--GC--TTCCAACTTGTTt
gi|84817 : A-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----ACACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GT--AGCCAACTTGt
gi|84818 : A-C-TTACA--CTTT-CA-CTCACTCT--AATTG----TCAATT-CCTTT-A---TAAG-ACCT-------AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTGGTTatt
gi|84819 : A-C-CTACA--CATT-CA-TTTA---------TG----TCACCT-CTTTT-A---AAAT-ATCTAACT---AT-----CG---GAC--G-C-TT------TTT-AACA--GC--AACCAt
gi|84820 : -TTACA--CCGT-CA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TATG-ACCTAATC---AT-----TG---GAT--G-C--T------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTT
gi|84821 : --CAAT-CA-GTCACTCA--TACTG----TCACCT-CTTTTTA---TAAG-ACTTAACC---AC-----TT---GAT--G-T-TT------TTT--AAA--GA--AGCCAACTTTTT
gi|84822 : T-CA-TTCCTTCT--TAGTG----TCACCT-CCTTT-A---TAAG------ACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84823 : CACCTT--TATTG----CC---T-CTATT-A---TAAG-ACCTTACA---AA-----TG---CAC--G-C-TT------TTT-AAAAGTGC--ACCCAACTTATT
gi|84824 : ACTCT--AGTTA----CCACCT-CTTTT-T---TAAG-ACCTAACC---GT-----TG---GAT--GTT-TT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTTGT
gi|84825 : TTG----CCACCT-CCTAT-T---TAAG-ACCTAACT---GA-----TG---GAT--G-C-TT------TCTAAAAA--GC--AGCCAACTTTTT
blockSeqs : T A AT TA TCAG G T TAT GGT TATGG TTT AA GGTATA GT TG
blockSeqs : T . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : T . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . C . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . C . .
blockSeqCons :
originalCons : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
finalCons : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
Alignments
lowQualScore : 8 1 1 11 0 0 0 0 11 1111 0 1 1 111 0 111 22222 111 11 0 0 222222 0 11 11
lowQualScore : . . . .. . . . . .. .... . . . ... . ... ..... ... .. . . ...... . .. ..
lowQualScore : 2 0 0 33 9 9 9 6 22 8888 9 0 7 555 9 666 22222 666 22 9 9 666666 9 22 33
consensus : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
Reference ( family-487 ) : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTCT--AATTG----CCACCT-CNTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84780 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----GCACCT-CGTTTTA---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84781 : AAC-CAAA-C-TTACA--AATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-TGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84782 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACACT--AATTG----CCACCT-CTTTT-C---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--AC--AGCCAACTTGTT
gi|84783 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---TAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAAATTGTT
gi|84784 : AAC-CAAA-C-TAACA--CAGT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84785 : AAA-CAAA-C-GTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CGTTT-A---TAAG-ACGTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84786 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCA-------ATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACGTGTTt
gi|84787 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTTAATTT--ATCTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTAAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTC-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84788 : AACTCAAA-C---ATA--CATT-CA-TTAAATCT--GTTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84789 : AACTCAAA-C-ATATA--CATT-CA-TTAAATTT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTTt
gi|84790 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCGCTTT--AATTG----CAACAT-CGTAT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TA---GAT--G-C-CT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTGGTTt
gi|84791 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTA----CAACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-A-TT------TGT-AAAA--GC--ATCCAACTTGTTt
gi|84792 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CATTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--t
gi|84793 : AACTCAAA-C-AGATA--CATT-CA-TTAAATCT--ATTTA----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACTTAGCT---AT-----CG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTTGTT
gi|84794 : AAC-CAAA-C-GTTTA--TCTT-CA-TTCACTCT--AATTG----CTAGCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAt
gi|84795 : AAC-CTAA-C-TAACA--CATT-CA-CTCACTTC--AACTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--tcgtgctt
gi|84796 : AACTCAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTTACT-T--AATCG----CCACCT-GTTTT-C---TAAA-ACCGAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAG--G
gi|84797 : AACGCAAG-T-TTAAA--TCTT-TA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CAGTT-A---TAAC-ACCTAACC---AT-----TG---GA---A-CAAT------ATT-AAAA--GC--AGCCAATTTATT
gi|84798 : AAC-CAAAAC-CTACA--CCTT-CAGTTCCCTCTTAAATTG----CCACCT-CCTTT-ATATTAAG-AACTAACC---ATTATGGTA---GGT--G-C-TT------TTC-AAAA--TC--AA-TGACTTGTTt
gi|84799 : AAC-CAAA-C-TTACA--CATT-CT-TTTACTTT--AATCG----CCACAT-CGTTT-A---TAAGCAGCCAAC
gi|84800 : AC-CTAA-G-TT-CA--CCTT-CA-TTCAGTCT--AATTG----TTAACT-CCTTT-A---TAAG-ACCTAGCC---AT-----TC---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--ACCCAACTTGT
gi|84801 : C-CAAA-C-T-ACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CCACAT-CTTTT-A---TAAG-ACCTAACC---TT-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AACCAACTTGTT
gi|84802 : C-CAAA-C-TAACG--CAAT-CA-TTCACTCA--AATTT----CTACCT-CTTTT-A---TAAA-ACCGAACC---AC-----TG---GGT--G-C-TT------CTT-AAAA--GT--AGCCTACTTATTt
gi|84803 : C-CAAA-C-TTAAA--CCTT-CA-TTGACTCT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TAAG-ACCTGGCC---AT-----TG---G-----------------------A--GC--AGGCAACTTGTTt
gi|84804 : C-CAAA-C-TTACA--CCTT-CA-ATCAGTCT--GAGTG----CCGTCT-CATTT-A---TAGG-ACCTAAGC---AC-----TA---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACt
gi|84805 : C-CTAA-T-TTACA--AATT-AA-TTCGTTCT--GTTTG----CCACCT-CCTAA-A---TAAC-ACCTAAGC---AC-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCATCTTGTT
gi|84806 : C-CAAA-C-TTACA--TCTT-TA-TTCCCTTT--GATTA----CCACCT-CCTTT-A---TATG-ACCTTACT---TT-----TA---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--AC--ATCCAATTAGTTt
gi|84807 : C-CCAA-C-TTACA--CCTG-CA-TTC----T--AATTG----CCACCT-CCTTT-A---TAAA-ACCTTACC---GT-----TA---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84808 : C-CAAA-C-TTACA--TTTTTCA-TTTAATCT--AATCGTCAGCCAACTACGTTG-C---TAAG-ACCTAACC---AC-----TG---GAT--A-C-TT------TTT-AAAA--GCTGAACCAACATGTT
gi|84809 : -CAAA-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----CAACCT-CTTTT-A---TAAG-ACATAACC---AT-----CG---GAT--G-C-GT------TTT-AAAA--GC--GGCCAACTTGTTt
gi|84810 : -CAAA-C-TTTAA--CATT-CA-TTCGCTCT--TATTG----CCACCT-CTTTT-----TAGG-ACCTAACA---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--CC--GGCCAACTTGTTt
gi|84811 : -CAAA-C-TTACA--CTTT-CA-TTCACCCT--AATTG----CCACCT-CCCTT-A---TAAG-ACCTTAAC---AT-----TG---GAT--G-C-AT------TTT-AAAA--TC--AGCCt
gi|84812 : -CAAA-T-TTAAAATC-TC-CA-TTCACTTG--AGTTG----TCACCA-CCTT--A---CGAA-ACCTAACC---AT-----TG---GAA--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--GCCCAACTTGTTtttaagttacttgttt
gi|84813 : -CAAA-CCTTACA--CCTT-CA-TCCACTTT--AATTG----CCACCT-CCTTT-----T-AG-ACCTAATCGGTAT-----TGTTTTAT--G-A-TTGGTATATAT-AAAG--TC--AGCCAACt
gi|84814 : AA-C-TAACA--CCTT-CA-TTTACTCT--AAGTG----CCACCG-CCTTT-A---TAAG-ACCTTACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTA-AAAA--GC-------ACTTGTT
gi|84815 : AA-C-TAACA--TATT-AA-TTTACTCT--AAGTG----TCACCT-CCTTC-A---TGAG-ACCTAACT---AT-----TG---GAT--G---GT------TTC-AAAA--GT--AGCCAACTCGTTt
gi|84816 : AA-C-TTACA--CCTT-CA-TTCACTCT--TATTG----CAACCT-CCTTT-A---TAAG-ATCTAACC---AT-----CG---GATAAG-------------T-GAAA--GC--TTCCAACTTGTTt
gi|84817 : A-C-TTACA--CATT-CA-TTCACTTT--AATTG----ACACAT-CGTTT-A---TAAG-ACCTAACC---AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GT--AGCCAACTTGt
gi|84818 : A-C-TTACA--CTTT-CA-CTCACTCT--AATTG----TCAATT-CCTTT-A---TAAG-ACCT-------AT-----TG---GAT--G-C-TT------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTGGTTatt
gi|84819 : A-C-CTACA--CATT-CA-TTTA---------TG----TCACCT-CTTTT-A---AAAT-ATCTAACT---AT-----CG---GAC--G-C-TT------TTT-AACA--GC--AACCAt
gi|84820 : -TTACA--CCGT-CA-TTCACTGT--AATTG----CCACCT-CTTTT-A---TATG-ACCTAATC---AT-----TG---GAT--G-C--T------TTT-AAAA--GC--AGCCAACTT
gi|84821 : --CAAT-CA-GTCACTCA--TACTG----TCACCT-CTTTTTA---TAAG-ACTTAACC---AC-----TT---GAT--G-T-TT------TTT--AAA--GA--AGCCAACTTTTT
gi|84822 : T-CA-TTCCTTCT--TAGTG----TCACCT-CCTTT-A---TAAG------ACC---AT-----TG---GAC--G-C-TT------TTT-AAAA--
gi|84823 : CACCTT--TATTG----CC---T-CTATT-A---TAAG-ACCTTACA---AA-----TG---CAC--G-C-TT------TTT-AAAAGTGC--ACCCAACTTATT
gi|84824 : ACTCT--AGTTA----CCACCT-CTTTT-T---TAAG-ACCTAACC---GT-----TG---GAT--GTT-TT------TTT-AAAA--GC--AGCTAACTTGT
gi|84825 : TTG----CCACCT-CCTAT-T---TAAG-ACCTAACT---GA-----TG---GAT--G-C-TT------TCTAAAAA--GC--AGCCAACTTTTT