lowQualScore : 1111111111111111111111111111111111
lowQualScore : 22 1 33 2222222222222222222222222222222222 33333333333333333 11 1 11111111111 222222 11111111111111111
lowQualScore : 88 5 99 4 6 55 44 55 8888 2222222222222222222222222222222222 44444444444444444 77 22 4 8888 6 5 2 2 66 33 55555 4444 44444 11 55555555555 0 0 7 0 777777 0 4444444 1 11 22222222222222222 1 1 99999 5
lowQualScore : .. . .. . . .. .. .. .... .................................. ................. .. .. . .... . . . . .. .. ..... .... ..... .. ........... . . . . ...... . ....... . .. ................. . . ..... .
lowQualScore : 88 0 00 5 0 55 88 55 5555 0000000000000000000000000000000000 55555555555555555 44 00 2 5555 9 5 7 7 99 11 33333 0000 66666 55 11111111111 9 9 1 9 111111 6 5555555 6 22 88888888888888888 0 3 77777 7
consensus : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAA-GC--G----AG-------AGTGTGTGT------------------ATGTG--------T--------ATGCGTGCGCGTAAATGAGAGTTGTAATCAGGAGCATGNTGTGAGAATTTTGTTAATCTATAATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATA---GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-TA-----CTTA-CTTA
Reference ( gi|102390 ) : TTTTTCCTTCTATTATATTCAAATTTACATGTAAAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTT--TTTATACAAACAT--AAAAA-GC--G----AG-------A--------------------------ATGTG--------T--------ATGCGTGCGCGTAAATGAGAGTTGTAACCAGGAGCATATTGTGGAAATTGTGTTAATCTATAATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATAAAAATTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102389 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAA-GC--G----AG-------AGTGTGTGT------------------ATGTG--------T--------ATGCGTGCGCGTAAATGAGAGTTGTAACC----GTATAGTGTGAGAATTTTGTTCATCTATAATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAACGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATTTATTTATT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCTTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102391 : TTTTTCCT-CTGTTATATTCAAATTTGCATGTACAATTACATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTA-TTTATAAAAATAT--AAAAA-GC--G----AGTGTGTGTAT-------------------------ATGTG--------T--------ATGCGTGCGCGTAAATGTAAGTTGTAATCAGGAGCATGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTATAATGTGTGATATA----TACTGCAGATGAATGAAAGATAA-TTT-CTACA--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TAT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CAAATTAAA------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TAACT-TA-----CT
gi|102393 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAACAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAAA-AC--G----AG-------AGTATGTGT------------------ATGTG--------T--------ATACGTGCTCGAAAATGAGAGTTGTAACCAGGAGCATTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTATAATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTAT-TTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102394 : TTTTTCCT-CTATTATATCCATGTTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAAAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAAA-GT--G----AG-------AGTATGTGT------------------ATGTG--------T--------ATACGTGCGCGAAAATGAGAGTTGTAACCAGGAGTATTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTATAATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTAT-TTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102395 : TTTTTAC--CTATTTTATTCAAATATCCATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATA-T--ATTATACGAATAC--AAAAA-GCTAGTCTCAG-------A--------------------------GTGTGTGTATGTAT--------ATGCGTGCACGTAGATACAAATTGGTATCAGGTGCATGTTGTGAGAATTATGTTAATATATAATGTGTGATATA----TGTAGCAGATAAATGAAAGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGTCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCATTAGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---ATACT-TA-----CTTA-
gi|102396 : tTTTTTC--TCCATTATATTCAAATTTCCATGTACAACTGCATGTGTATTTAAATTGAAATTTGTTC-TTTATACGAATATAAAAAAA-AC--G----AG-------A--------------------------GTGTGTGTATGTAT--------ATGAGTGCGCGAAGATGAGAGTCGATATCAGGTGCATGATGTAAGAATTTTGTTAATCTATAATGTTTG
gi|102392 : TTTTCCCCCTATTATATTCAAATTTACATATACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAA-GC--G----AG-------AGAGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTATGTG--------T--------ATGCGTGCGCGTAAATGAGAGTTGTAACCAGGAGCATAGTGTTAGAATTTTGTAAATCTATATTGTGTGATATA----TGCACCAGATGAATGATCGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTTAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAG------TTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTACT-TA-----CTTA-CTTAtttatacgaggacctcaaggaagattggtttacctattgagttaccctctttaaataaagaaattaattactaagtta
gi|102398 : TTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AG-------AGTGTGTGT------------------ATGTG--------T--------ACGCGTGCACGTAAATGAGAGTTGTAATCAGGAGCATGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGTAATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----------------TGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TTTCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102397 : TTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AG-------AGTGTGTGT------------------ATGTG--------T--------ACGCGTGCACGTAAATGAGAGTTGTAATCAGGAGCATGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGTAATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTAT-TTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA----------------TGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TTTCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102399 : TGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAAAGC--G----AG-------A--------------------------ATGTG--------TGTATGTGTATGTGTACGCGTAAATGAGAGTTGTAATCAGGAGCATGTTGTGAGCATTTTGTTAATCTATAATGTGTAATATA----TACAGCAGA---------------TTT-CTATC--T--TTATG-----AAAA----TGTATATGTACTTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAATA----------A--A---TTACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102401 : GCATGTTTTTAGAATTTTGTTAATCTATAATGTGTGATATAATTATGTAGCAGATGAATGAAAGTTAT-TTC-CTATC--T--TTTTA-----AGAA----TGTATATGTACGTGTT--TGT---TTATAC--GAGGGCCTCAAGACAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAA------TTATCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TAACT-TA-----CTCA-TTCA
gi|102400 : AATTTTATTT-GTATC--TCATTTT--------------TGTATAT-------TT--TGTAAATAATA---GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATATG------TCACCCTC----AA--TAAATA----------A--A---TTGGC-TAAAT--CTTATCTTA
gi|102406 : gaatgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgaatatcatgtgggaagagaaatgttttagcattttttttcactgaatatttcatgtatTTAT-TTT--TATT--T--T----------ACA----TGTAAATGTA--------------TCATTA--GAGGGTCCCAAGGAAGA-TT-AA-T-TTCAAA--CTAACTGGG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102407 : TTGT-TTTGCTATTGTC--TTTTGTTAATAACA----TGTATATGTA--------------TCATTA--GAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATCTGG------CTACTCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102408 : T-TTC-CTATTGTT--TTTTT-----AAAA----TGTAT-----CTT--------------TA---GAGGGCCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--ATAATTGGG------CTACCCTCAACAAA--TAATGA----------
gi|102409 : -TTT-CTATA--T--TT----------AA----T--ATATGTA-----T--TGT---AAATACTAGAAGGCATCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTTTGTAAG--TAAAGA----------CT-A---TTA-T-TA------TTA-TT
gi|102410 : --T--TTTTA-----AAAAAATATGTATATCGACATATC--T-----TTA-----GAGGGCCCCAACGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTATAGCTAAAGA----------
gi|102396 : --TTTTG-----TTAA----TCTATA---A--TGTT--TGT---TTATAC--GAGGACCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCTATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TTAAT-TA-----CTAA-GTTA
gi|102412 : tttttctccattatattcaaatttccatgtacaactgcatgtgtatttaaattgaaatttgttctttatacgaatataaaaaaaacgagagtgtgtgtatgtatatgagtgcgcgaagatgagagtcgatatcaggtgcatgatgtaagaa--TTTTG-----TAA-----TATA-ATGTTCTTGTA--T--------TAA--GAGGGCCTCAAGAAAGA-AT-AA-CCTT---G--CCAATCGAG------TCACCCTTTAAAAA--TAAAGAATAAACTTGTA--A---TT-CT-TA-----CTTA-CTT
gi|102402 : -----AAAA----TGTTTTTAT-TTTGTAAATGTA--TCATAA--GAGGGCCCAAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAG--CTAACTGGG------CTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102404 : gcaatgcttAA----T-TAAATATATTTG-----GA---TCATAT--GAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT-------CA---GAA------CG----TCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102411 : agatatcttctgtatcc----TGTATAT---CTTGTA--AAT---A-ATA---GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TTACCTTCTATAAA--TAAAG------------------TCGCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102420 : ttttATGTACTTGTT--T--------TAA--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAGATT--------A--A-----ACT-TGTAAATCTTA-CTTA
gi|102422 : ATGTACTTGTT--T-----TCA-----GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAGA----------
gi|102427 : TATT--TGT---TTA-AA--GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-GGCT-TT---G--TCAATTGAA------CCACCCTCTATAAA--TAAATA----------A--C---GTATT-TA-----CTTA-CTCA
gi|102419 : TGTA--TCT---TTA-----GAGGATCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTACA--TAA
gi|102429 : aaTGAT--TGT---T-------GAGGGCCTCAGAGAAGATTT-GG-C-TT---AATCCAACTGAG------CT-TTCTCTTTAGA--TAAAGT----------A--A---TTATTATA-----GTTA-TT
gi|102423 : TGTA--TCT---TTA-----GAGGGCCCCAAGGTAGA-TT-AG-T-TT------CAAACTAA--------TACCCTTTTTAAA--TAAAGATTTTC-----A--T---TCATT-CA-----TTTA-CTCA
gi|102425 : aTGAT--TGT---T-------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TTA-T-TA------TTA-TT
gi|102424 : aTGAT--TGT---T-------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TTA-T-TA------TTA-TT
gi|102428 : aTGCT--TGT---TT-TAA--GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TGAATCAAG------TCACCATTTATAAA--TAAA
gi|102426 : TGAT--TGT---T-------GAGGGCCACAGGGAAGA-TA-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAG
gi|102403 : aTT--TGTAAATAATA---GAGAGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TCATCCTCTATAAA--TAAAG------------------TCACT-TAT----CTTATCTTA
gi|102418 : atgtatatgtgtatttcatattttaaatT--TGT---TTA-AA--GAGGACTGCAAGGAAGA-TA-AGCT-TT---G--TCAATTGAG------TCAGGCTCTATAAA--TAAAGA----------A--T---GTACT-TA-----TTTA-CTTA
gi|102430 : aatgtaaT--TGT---TT-TAA--GATGACCTCAAGGAAGC-TT-GGCT-TT---G--TCAAACGAG------TCACCCTTTCTATA--TAAAGA----------A--T---TTACT-TA-----CTTA-
gi|102431 : T--TGT---TT-TA---GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTAA-A--CTTAATGTG------TCACTCTTTATAAA--TAAAG------------------TCGCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102414 : --TGTA--TCATAA--GAGGGCCCGAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACTCTATTTAAA--TAAAGA----------
gi|102405 : tgtaaaGT---TT-TAA--GAGGACCTCAATGAAGC-TT-AACT-TT---G--TCAGTTGAG------TAATCCTCTATAAA--TC--GAT---------A--A---TTACC-TA-----CTTA-
gi|102416 : gttattttatatatgtgttttaagaggacgGT---TAATA---GAGGGTCCCATGGAAGA-TT-AG-T-TT------TTAATTAAATATGTTTTACCCTCTTTAA
gi|102432 : aaaatgtgTAAAT--GAGGGCCTCAAGAAAGA-TTGAC-T-TT---G--ACAATGGAG------TCACCCTCTATAAA--TAAACA----------A--AATCTTATT-TA-----CTTG-CTTA
gi|102421 : ATA---GAGGGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTCTGTAAA--TAAAGA----------CT-A---TTA-T-TA------TTA-TT
gi|102433 : atgtattgtaaataTAA--GAGGGCCTAATGAAAAA-TT-GGCT-TT---A--TCAACTGAG------TCATCCTCTACAAA--TAAAGA----------A--T---TAATT-CA-----CTT
gi|102417 : --GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTAAAA--TAAAGA----------
gi|102434 : aaatgtataatta--GAGGGCTCCAATGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGA------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102413 : --GAGGGCCTCAAGGAA---TT-G----TT---A--CCAATTGAG------TCATCTTTTATAAA--TGGAAA----------A--T---TTACT-TA-----CTTA-
gi|102415 : tgaagattggtgttgtcaatttcaca--GAGGGCACCGAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTTAATGAG------TTACCCTCTATAAA--CAAAGA----------
Alignments
lowQualScore : 111111111111 111111111111 222222 11111111111111111
lowQualScore : 4 88 55 3 55 7777 999999 777777777777 3 3 1 3 7777 2 66 22 55555 1 4 11 333333333333 0 0 7 0 666666 0 222222 1 11 11111111111111111 11 0 1 99999 5
lowQualScore : . .. .. . .. .... ...... ............ . . . . .... . .. .. ..... . . .. ............ . . . . ...... . ...... . .. ................. .. . . ..... .
lowQualScore : 0 66 00 6 00 7777 666666 111111111111 3 1 0 1 1111 5 55 99 00000 4 1 66 555555555555 9 9 0 9 333333 3 555555 4 22 44444444444444444 88 6 3 44444 5
consensus : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
Reference ( family-485 ) : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGNTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102389 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACC----GTA-TAGTGTGAGAATTTTGTTCATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAACGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATTTATTTATT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCTTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102390 : TTTTTCCTTCTATTATATTCAAATTTACATGTAAAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTT--TTTATACAAACAT--AAAA-AGC--G----AGA--------------ATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TATTGTGGAAATTGTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATAAAAATTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102391 : TTTTTCCT-CTGTTATATTCAAATTTGCATGTACAATTACATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTA-TTTATAAAAATAT--AAAA-AGC--G----AGTG------TGTGTATATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGTAAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TACTGCAGATGAATGAAAGATAATTT-CTACA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TAT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CAAATTAAA------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CT
gi|102392 : TTTTCCCC-CTATTATATTCAAATTTACATATACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAGAGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TAGTGTTAGAATTTTGTAAATCTAT-ATTGTGTGATATA----TGCACCAGATGAATGATCGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTTAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAG------TTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102393 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAACAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AAC--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCTCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102394 : TTTTTCCT-CTATTATATCCATGTTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAAAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AGT--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCGCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGTA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102395 : TTTTTTAC-CTATTTTATTCAAATATCCATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATATA---TTATACGAATAC--AAAA-AGCTAGTCTCAGAG------TGTGTGTATG------------TATATGCGTGCACGTA-GATACAAATTGGTATCAGGTGCA-TGTTGTGAGAATTATGTTAATATAT-AATGTGTGATATA----TGTAGCAGATAAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGTCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCATTAGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---AT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102396 : TTTTTCT-CCATTATATTCAAATTTCCATGTACAACTGCATGTGTATTTAAATTGAAATTTGTTC-TTTATACGAATATAAAAAA-AAC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TATATGAGTGCGCGAA-GATGAGAGTCGATATCAGGTGCA-TGATGTAAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTTTG
gi|102396 : --TTTTG-----TTAATCTATA---A--TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGACCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCTATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--AAT-TA-----CTAA-GTTAtttatacgaggacctcaaggaagattggtttacctattgagttaccctctttaaataaagaaattaattactaagtta
gi|102397 : tttttctccattatattcaaatttccatgtacaactgcatgtgtatttaaattgaaatttgttctttatacgaatataaaaaaaacgagagtgtgtgtatgtatatgagtgcgcgaagatgagagtcgatatcaggtgcatgatgtaagaaTTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102398 : TTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102399 : TGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAAAGC--G----AGAA------TGTGTGTATG------------TGTATGTGTACGCGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGCATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTAATATA----TACAGCAGA--------------TTT-CTATC--T--TTATG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAATA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102400 : GAA------TGTGTGTATG------------TGTGTGTGTGTGAATATCATGTGGG--------AAGAGAAATGTTTT-AGCATTTTTTT--TCACTGAATATTTCATGTA----T----------AATT----TTATTTG--TATC--TCATTTT----------TGTATAT-------TT--TGTAAAT--AA-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATATG------TCACCCTC----AA--TAAATA----------A--A---TT--GGC-TAAAT--CTTATCTTA
gi|102401 : GCA-TGTTTTTAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATAATTATGTAGCAGATGAATGAAAGTTATTTC-CTATC--T--TTTTA-----AGAATGTATATGTACGTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGACAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAA------TTATCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CTCA-TTCA
gi|102402 : -----AAAATGTTTTTAT-TTTGTAAATGTA--T--CA-TAAGAGGGCCCAAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAG--CTAACTGGG------CTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102403 : gcaatgcttTT--TGTAAAT--AA-TA-GAGAGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TCATCCTCTATAAA--TAAAG------------------TC--ACT-TAT----CTTATCTTA
gi|102404 : atgtatatgtgtatttcatattttaaatAAT-TAAATATATTTG-----GA---T--CA-TATGAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT-------CA---GAA----------CGTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102405 : agatatcttctgtatccT---T--TA--A-GAGGACCTCAATGAAGC-TT-AACT-TT---G--TCAGTTGAG------TAATCCTCTATAAA--TC--GAT---------A--A---TT--ACC-TA-----CTTA-
gi|102406 : gttattttatatatgtgttttaagaggacggtTTATTTT--TATT--T--T----------ACATGTAAATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGTCCCAAGGAAGA-TT-AA-T-TTCAAA--CTAACTGGG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102407 : TTGTTTTGCTATTGTC--TTTTGTTAATAACATGTATATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATCTGG------CTACTCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102408 : TTTC-CTATTGTT--TTTTT-----AAAATGTAT-----CTT-----------------TA-GAGGGCCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--ATAATTGGG------CTACCCTCAACAAA--TAATGA----------
gi|102409 : TTT-CTATA--T--TT----------AAT--ATATGTA-----T--TGT---AAATACTA-GAAGGCATCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTTTGTAAG--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102410 : --T--TTTTA-----AAAAAATATGTATATCGACA--TAT---C--TT-TA-GAGGGCCCCAACGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTATAGCTAAAGA----------
gi|102411 : TGTATAT---CTTGTA--AAT---A---A-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TTACCTTCTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102412 : tttt--TTTTG-----TAA-TATA-ATGTTCTTGTA--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGAAAGA-AT-AA-CCTT---G--CCAATCGAG------TCACCCTTTAAAAA--TAAAGAATAAACTTGTA--A---TT---CT-TA-----CTTA-CTT
gi|102413 : T---T--CA-CA-GAGGGCCTCAAGGAA---TT-G----TT---A--CCAATTGAG------TCATCTTTTATAAA--TGGAAA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102414 : tgaagattggtgttgtcaatA-GAGGGCCCGAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACTCTATTTAAA--TAAAGA----------
gi|102415 : tgtaaatgtatcata-TA-GAGGGCACCGAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTTAATGAG------TTACCCTCTATAAA--CAAAGA----------
gi|102416 : tgtaaatgtatcatGT---T--AA-TA-GAGGGTCCCATGGAAGA-TT-AG-T-TT------TTAATTAAATATGTTTTACCCTCTTTAA
gi|102417 : aaaatgtg-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTAAAA--TAAAGA----------
gi|102418 : aaatgtataatT--TGT---T--TA-AA-GAGGACTGCAAGGAAGA-TA-AGCT-TT---G--TCAATTGAG------TCAGGCTCTATAAA--TAAAGA----------A--T---GT--ACT-TA-----TTTA-CTTA
gi|102419 : aatgtaa-TA-GAGGATCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTACA--TAA
gi|102420 : aatgtatcttATGTACTTGTT--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAG--------------A---TTAAACT-TGTAAATCTTA-CTTA
gi|102421 : A-TA-GAGGGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTCTGTAAA--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102422 : atgtattgtaaataATGTACTTGTT--T--------T--CA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAGA----------
gi|102423 : -TA-GAGGGCCCCAAGGTAGA-TT-AG-T-TT------CAAACTAA--------TACCCTTTTTAAA--TAAAGATTTTC-----A--T---TC--ATT-CA-----TTTA-CTCA
gi|102424 : atgtatcttTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102425 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102426 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TA-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAG
gi|102427 : aTATT--TGT---T--TA-AA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-GGCT-TT---G--TCAATTGAA------CCACCCTCTATAAA--TAAATA----------A--C---GT--ATT-TA-----CTTA-CTCA
gi|102428 : TGCT--TGT---T--TT-AA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TGAATCAAG------TCACCATTTATAAA--TAAA
gi|102429 : TGAT--TGT---T--------GAGGGCCTCAGAGAAGATTT-GG-C-TT---AATCCAACTGAG------CT-TTCTCTTTAGA--TAAAGT----------A--A---TT--ATTATA-----GTTA-TT
gi|102430 : T--TGT---T--TT-AA-GATGACCTCAAGGAAGC-TT-GGCT-TT---G--TCAAACGAG------TCACCCTTTCTATA--TAAAGA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102431 : T--TGT---T--T--TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTAA-A--CTTAATGTG------TCACTCTTTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102432 : -GAGGGCCTCAAGAAAGA-TTGAC-T-TT---G--ACAATGGAG------TCACCCTCTATAAA--TAAACA----------A--AATCTT--ATT-TA-----CTTG-CTTA
gi|102433 : taaatA-GAGGGCCTAATGAAAAA-TT-GGCT-TT---A--TCAACTGAG------TCATCCTCTACAAA--TAAAGA----------A--T---TA--ATT-CA-----CTT
gi|102434 : ta-GAGGGCTCCAATGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGA------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
Alignments
lowQualScore : 111111111111 111111111111 222222 11111111111111111
lowQualScore : 4 88 55 3 55 7777 999999 777777777777 3 0 3 0 3 7777 2 66 22 55555 1 4 11 333333333333 0 0 7 0 666666 0 222222 1 11 11111111111111111 11 0 1 99999 5
lowQualScore : . .. .. . .. .... ...... ............ . . . . . .... . .. .. ..... . . .. ............ . . . . ...... . ...... . .. ................. .. . . ..... .
lowQualScore : 0 66 00 6 00 7777 666666 111111111111 3 1 1 4 1 1111 5 55 99 00000 4 1 66 555555555555 9 9 0 9 333333 3 555555 4 22 44444444444444444 88 6 3 44444 5
consensus : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
Reference ( family-485 ) : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102389 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACC----GTA-TAGTGTGAGAATTTTGTTCATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAACGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATTTATTTATT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCTTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102390 : TTTTTCCTTCTATTATATTCAAATTTACATGTAAAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTT--TTTATACAAACAT--AAAA-AGC--G----AGA--------------ATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TATTGTGGAAATTGTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATAAAAATTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102391 : TTTTTCCT-CTGTTATATTCAAATTTGCATGTACAATTACATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTA-TTTATAAAAATAT--AAAA-AGC--G----AGTG------TGTGTATATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGTAAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TACTGCAGATGAATGAAAGATAATTT-CTACA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TAT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CAAATTAAA------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CT
gi|102392 : TTTTCCCC-CTATTATATTCAAATTTACATATACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAGAGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TAGTGTTAGAATTTTGTAAATCTAT-ATTGTGTGATATA----TGCACCAGATGAATGATCGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTTAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAG------TTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102393 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAACAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AAC--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCTCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102394 : TTTTTCCT-CTATTATATCCATGTTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAAAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AGT--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCGCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGTA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102395 : TTTTTTAC-CTATTTTATTCAAATATCCATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATATA---TTATACGAATAC--AAAA-AGCTAGTCTCAGAG------TGTGTGTATG------------TATATGCGTGCACGTA-GATACAAATTGGTATCAGGTGCA-TGTTGTGAGAATTATGTTAATATAT-AATGTGTGATATA----TGTAGCAGATAAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGTCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCATTAGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---AT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102396 : TTTTTCT-CCATTATATTCAAATTTCCATGTACAACTGCATGTGTATTTAAATTGAAATTTGTTC-TTTATACGAATATAAAAAA-AAC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TATATGAGTGCGCGAA-GATGAGAGTCGATATCAGGTGCA-TGATGTAAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTTTG
gi|102396 : --TTTTG-----TTAATCTATA---A--TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGACCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCTATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--AAT-TA-----CTAA-GTTAtttatacgaggacctcaaggaagattggtttacctattgagttaccctctttaaataaagaaattaattactaagtta
gi|102397 : tttttctccattatattcaaatttccatgtacaactgcatgtgtatttaaattgaaatttgttctttatacgaatataaaaaaaacgagagtgtgtgtatgtatatgagtgcgcgaagatgagagtcgatatcaggtgcatgatgtaagaaTTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102398 : TTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102399 : TGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAAAGC--G----AGAA------TGTGTGTATG------------TGTATGTGTACGCGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGCATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTAATATA----TACAGCAGA--------------TTT-CTATC--T--TTATG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAATA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102400 : GAA------TGTGTGTATG------------TGTGTGTGTGTGAATATCATGTGGG--------AAGAGAAATGTTTT-AGCATTTTTTT--TCACTGAATATTTCATGTA----T----------AATT----TTATTTG--TATC--TCATTTT----------TGTATAT-------TT--TGTAAAT--AA-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATATG------TCACCCTC----AA--TAAATA----------A--A---TT--GGC-TAAAT--CTTATCTTA
gi|102401 : GCA-TGTTTTTAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATAATTATGTAGCAGATGAATGAAAGTTATTTC-CTATC--T--TTTTA-----AGAATGTATATGTACGTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGACAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAA------TTATCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CTCA-TTCA
gi|102402 : -----AAAATGTTTTTAT-TTTGTAAATGTA--T--CA-TAAGAGGGCCCAAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAG--CTAACTGGG------CTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102403 : gcaatgcttTT--TGTAAAT--AA-TA-GAGAGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TCATCCTCTATAAA--TAAAG------------------TC--ACT-TAT----CTTATCTTA
gi|102404 : atgtatatgtgtatttcatattttaaatAAT-TAAATATATTTG-----GA---T--CA-TATGAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT-------CA---GAA----------CGTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102405 : agatatcttctgtatccT---T--TA--A-GAGGACCTCAATGAAGC-TT-AACT-TT---G--TCAGTTGAG------TAATCCTCTATAAA--TC--GAT---------A--A---TT--ACC-TA-----CTTA-
gi|102406 : gttattttatatatgtgttttaagaggacggtTTATTTT--TATT--T--T----------ACATGTAAATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGTCCCAAGGAAGA-TT-AA-T-TTCAAA--CTAACTGGG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102407 : TTGTTTTGCTATTGTC--TTTTGTTAATAACATGTATATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATCTGG------CTACTCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102408 : TTTC-CTATTGTT--TTTTT-----AAAATGTAT-----CTT-----------------TA-GAGGGCCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--ATAATTGGG------CTACCCTCAACAAA--TAATGA----------
gi|102409 : TTT-CTATA--T--TT----------AAT--ATATGTA-----T--TGT---AAATACTA-GAAGGCATCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTTTGTAAG--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102410 : --T--TTTTA-----AAAAAATATGTATATCGACA--TAT---C--TT-TA-GAGGGCCCCAACGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTATAGCTAAAGA----------
gi|102411 : TGTATAT---CTTGTA--AAT---A---A-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TTACCTTCTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102412 : tttt--TTTTG-----TAA-TATA-ATGTTCTTGTA--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGAAAGA-AT-AA-CCTT---G--CCAATCGAG------TCACCCTTTAAAAA--TAAAGAATAAACTTGTA--A---TT---CT-TA-----CTTA-CTT
gi|102413 : T---T--CA-CA-GAGGGCCTCAAGGAA---TT-G----TT---A--CCAATTGAG------TCATCTTTTATAAA--TGGAAA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102414 : tgaagattggtgttgtcaatA-GAGGGCCCGAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACTCTATTTAAA--TAAAGA----------
gi|102415 : tgtaaatgtatcata-TA-GAGGGCACCGAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTTAATGAG------TTACCCTCTATAAA--CAAAGA----------
gi|102416 : tgtaaatgtatcatGT---T--AA-TA-GAGGGTCCCATGGAAGA-TT-AG-T-TT------TTAATTAAATATGTTTTACCCTCTTTAA
gi|102417 : aaaatgtg-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTAAAA--TAAAGA----------
gi|102418 : aaatgtataatT--TGT---T--TA-AA-GAGGACTGCAAGGAAGA-TA-AGCT-TT---G--TCAATTGAG------TCAGGCTCTATAAA--TAAAGA----------A--T---GT--ACT-TA-----TTTA-CTTA
gi|102419 : aatgtaa-TA-GAGGATCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTACA--TAA
gi|102420 : aatgtatcttATGTACTTGTT--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAG--------------A---TTAAACT-TGTAAATCTTA-CTTA
gi|102421 : A-TA-GAGGGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTCTGTAAA--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102422 : atgtattgtaaataATGTACTTGTT--T--------T--CA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAGA----------
gi|102423 : -TA-GAGGGCCCCAAGGTAGA-TT-AG-T-TT------CAAACTAA--------TACCCTTTTTAAA--TAAAGATTTTC-----A--T---TC--ATT-CA-----TTTA-CTCA
gi|102424 : atgtatcttTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102425 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102426 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TA-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAG
gi|102427 : aTATT--TGT---T--TA-AA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-GGCT-TT---G--TCAATTGAA------CCACCCTCTATAAA--TAAATA----------A--C---GT--ATT-TA-----CTTA-CTCA
gi|102428 : TGCT--TGT---T--TT-AA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TGAATCAAG------TCACCATTTATAAA--TAAA
gi|102429 : TGAT--TGT---T--------GAGGGCCTCAGAGAAGATTT-GG-C-TT---AATCCAACTGAG------CT-TTCTCTTTAGA--TAAAGT----------A--A---TT--ATTATA-----GTTA-TT
gi|102430 : T--TGT---T--TT-AA-GATGACCTCAAGGAAGC-TT-GGCT-TT---G--TCAAACGAG------TCACCCTTTCTATA--TAAAGA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102431 : T--TGT---T--T--TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTAA-A--CTTAATGTG------TCACTCTTTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102432 : -GAGGGCCTCAAGAAAGA-TTGAC-T-TT---G--ACAATGGAG------TCACCCTCTATAAA--TAAACA----------A--AATCTT--ATT-TA-----CTTG-CTTA
gi|102433 : taaatA-GAGGGCCTAATGAAAAA-TT-GGCT-TT---A--TCAACTGAG------TCATCCTCTACAAA--TAAAGA----------A--T---TA--ATT-CA-----CTT
gi|102434 : ta-GAGGGCTCCAATGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGA------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
blockSeqs : T CC AA A TA TCTC AGTGTG TGTATGTGTATG T A G ATTA G GT CA TTAAT G C AA AAATAATA C TAAA TATGTT T GC ATAAACTTGTAA AA A TAAAT T
blockSeqs : . CC . . . . . . . . . . . GT . . G C . AAATAATA C CAAG . T . TTTTCAT . . AAT T
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . G C . AAATACTA C TAAA . T . AAATC . . T T
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . G C . ATCATAA C CAAA . T . ATTA . . T T
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . G C . TTATAC C CAAA . T . ATTA . . T .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . G C . TTATAC C CAAA . T . TAA . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . G C . TTATAC C GTAA . T . CTA . . . .
blockSeqs : . C . . . . . . . . . . . . . . G C . TTATAC C CAAA . T . CTA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A T . TTATAC . TAAA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A T . TTATAC . CAAA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . G C . TTATAC . CAAA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . . . . G T . TTATAC . CAAA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . . G C . TTATAC . CAAA . A . AA . . . .
blockSeqs : . . . . A C . TTATAC . GTAA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . . G C . TTATAC . CAAA . A . AA . . . .
blockSeqs : . . . G C . TCATAT . AAT . T . AC . . . .
blockSeqs : . . G . . CTTTA . AAA . T . AC . . . .
blockSeqs : . . . . . TCACA . AA . A . AA . . . .
blockSeqs : . . . . TAATA . AA . G . AA . . . .
blockSeqs : . . . TTAAA . AA . T . AA . . . .
blockSeqs : . . . TTAAA . A . A . AT . . . .
blockSeqs : . . . TTTAA . A . A . AT . . . .
blockSeqs : . . . TTTAA . A . A . AC . . . .
blockSeqs : . TTAA . A . T . AA . . . .
blockSeqs : . AATA . A . A . AT . . . .
blockSeqs : . TTTA . A . T . AT . . . .
blockSeqs : . TAA . A . T . A . . . .
blockSeqs : . TAA . A . A . . . . . .
blockSeqs : . TCA . A . T . . . . .
blockSeqs : . TA . G . A . . . . .
blockSeqs : . TA . G . G .
blockSeqs : . TA . A . A .
blockSeqs : . T . G . T .
blockSeqs : T . G . T .
blockSeqs : T . G . T .
blockSeqs : T . G . T .
blockSeqs : . G . A .
blockSeqs : . G . A .
blockSeqs : . G . T .
blockSeqs : . A . C .
blockSeqs : . . . A .
blockSeqs : . . . A .
blockSeqs : . . . A .
blockSeqs : . . . T .
blockSeqs : . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
finalCons : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 111111111111 222222 11111111111111111
lowQualScore : 4 88 55 3 55 7777 999999 777777777777 3 0 3 0 3 7777 2 66 22 55555 1 4 11 333333333333 0 0 7 0 666666 0 222222 1 11 11111111111111111 11 0 1 99999 5
lowQualScore : . .. .. . .. .... ...... ............ . . . . . .... . .. .. ..... . . .. ............ . . . . ...... . ...... . .. ................. .. . . ..... .
lowQualScore : 0 66 00 6 00 7777 666666 111111111111 3 1 1 4 1 1111 5 55 99 00000 4 1 66 555555555555 9 9 0 9 333333 3 555555 4 22 44444444444444444 88 6 3 44444 5
consensus : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
Reference ( family-485 ) : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102389 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACC----GTA-TAGTGTGAGAATTTTGTTCATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAACGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATTTATTTATT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCTTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102390 : TTTTTCCTTCTATTATATTCAAATTTACATGTAAAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTT--TTTATACAAACAT--AAAA-AGC--G----AGA--------------ATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TATTGTGGAAATTGTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATAAAAATTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102391 : TTTTTCCT-CTGTTATATTCAAATTTGCATGTACAATTACATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTA-TTTATAAAAATAT--AAAA-AGC--G----AGTG------TGTGTATATG------------TGTATGCGTGCGCGTA-AATGTAAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TACTGCAGATGAATGAAAGATAATTT-CTACA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TAT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CAAATTAAA------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CT
gi|102392 : TTTTCCCC-CTATTATATTCAAATTTACATATACAATTGCATGTATATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAA-AGC--G----AGAGAGTGTGTGTGTGTATGTGTATGTGTATGTGTATGCGTGCGCGTA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TAGTGTTAGAATTTTGTAAATCTAT-ATTGTGTGATATA----TGCACCAGATGAATGATCGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTTAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAG------TTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102393 : TTTTTCCT-CTATTATATTCAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAACAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AAC--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCTCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGCA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102394 : TTTTTCCT-CTATTATATCCATGTTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAAAATGTTCCTTTATACGAATAT--AAAA-AGT--G----AGAG------TATGTGTATG------------TGTATACGTGCGCGAA-AATGAGAGTTGTAACCAGGAGTA-TTGTGTGAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAGATGAATGAAAGTTATTTT-CTATA--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAATGA---------------------------AG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--ACT-CA-----CTCA-CTCA
gi|102395 : TTTTTTAC-CTATTTTATTCAAATATCCATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATATA---TTATACGAATAC--AAAA-AGCTAGTCTCAGAG------TGTGTGTATG------------TATATGCGTGCACGTA-GATACAAATTGGTATCAGGTGCA-TGTTGTGAGAATTATGTTAATATAT-AATGTGTGATATA----TGTAGCAGATAAATGAAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGTCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCATTAGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---AT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102396 : TTTTTCT-CCATTATATTCAAATTTCCATGTACAACTGCATGTGTATTTAAATTGAAATTTGTTC-TTTATACGAATATAAAAAA-AAC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TATATGAGTGCGCGAA-GATGAGAGTCGATATCAGGTGCA-TGATGTAAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTTTG
gi|102396 : --TTTTG-----TTAATCTATA---A--TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGACCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCTATTGAG------TTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TT--AAT-TA-----CTAA-GTTAtttatacgaggacctcaaggaagattggtttacctattgagttaccctctttaaataaagaaattaattactaagtta
gi|102397 : tttttctccattatattcaaatttccatgtacaactgcatgtgtatttaaattgaaatttgttctttatacgaatataaaaaaaacgagagtgtgtgtatgtatatgagtgcgcgaagatgagagtcgatatcaggtgcatgatgtaagaaTTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102398 : TTTCCT-CTATCGTTTTTAAATTTACATGTACAATTGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAGTAT--AAAA--GC--G----AGAG------TGTGTGTATG------------TGTACGCGTGCACGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGAATTTTGTTAATCTGT-AATGTGTGATATA----TGCAGCAAATGTATGGAAGTTATTTT-CTATC--T--TTTTG-----AAAA------------TGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--C---TT--TCT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102399 : TGCATGTGTATCTAAATTGAAATATGTTC-TTTATACGAATAT--AAAAAAGC--G----AGAA------TGTGTGTATG------------TGTATGTGTACGCGTA-AATGAGAGTTGTAATCAGGAGCA-TGTTGTGAGCATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTAATATA----TACAGCAGA--------------TTT-CTATC--T--TTATG-----AAAATGTATATGTACTTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT---A--CCAATTGAG------TAACCCTCTTTAAA--TAAATA----------A--A---TT--ACT-TA-----CTTA-CTTA
gi|102400 : GAA------TGTGTGTATG------------TGTGTGTGTGTGAATATCATGTGGG--------AAGAGAAATGTTTT-AGCATTTTTTT--TCACTGAATATTTCATGTA----T----------AATT----TTATTTG--TATC--TCATTTT----------TGTATAT-------TT--TGTAAAT--AA-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATATG------TCACCCTC----AA--TAAATA----------A--A---TT--GGC-TAAAT--CTTATCTTA
gi|102401 : GCA-TGTTTTTAGAATTTTGTTAATCTAT-AATGTGTGATATAATTATGTAGCAGATGAATGAAAGTTATTTC-CTATC--T--TTTTA-----AGAATGTATATGTACGTGTT--TGT---T--TA-TACGAGGGCCTCAAGACAGA-TT-GG-T-TT---A--CCAACTGAA------TTATCCTCTTTAAA--TAAAGA----------A--A---TA--ACT-TA-----CTCA-TTCA
gi|102402 : -----AAAATGTTTTTAT-TTTGTAAATGTA--T--CA-TAAGAGGGCCCAAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAG--CTAACTGGG------CTACCCTTTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102403 : gcaatgcttTT--TGTAAAT--AA-TA-GAGAGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TCATCCTCTATAAA--TAAAG------------------TC--ACT-TAT----CTTATCTTA
gi|102404 : atgtatatgtgtatttcatattttaaatAAT-TAAATATATTTG-----GA---T--CA-TATGAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TT-------CA---GAA----------CGTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102405 : agatatcttctgtatccT---T--TA--A-GAGGACCTCAATGAAGC-TT-AACT-TT---G--TCAGTTGAG------TAATCCTCTATAAA--TC--GAT---------A--A---TT--ACC-TA-----CTTA-
gi|102406 : gttattttatatatgtgttttaagaggacggtTTATTTT--TATT--T--T----------ACATGTAAATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGTCCCAAGGAAGA-TT-AA-T-TTCAAA--CTAACTGGG------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102407 : TTGTTTTGCTATTGTC--TTTTGTTAATAACATGTATATGTA-----T--CAT---T------A-GAGGGCCCCAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATCTGG------CTACTCTCTTTAAA--TAAAGA----------
gi|102408 : TTTC-CTATTGTT--TTTTT-----AAAATGTAT-----CTT-----------------TA-GAGGGCCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--ATAATTGGG------CTACCCTCAACAAA--TAATGA----------
gi|102409 : TTT-CTATA--T--TT----------AAT--ATATGTA-----T--TGT---AAATACTA-GAAGGCATCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTTTGTAAG--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102410 : --T--TTTTA-----AAAAAATATGTATATCGACA--TAT---C--TT-TA-GAGGGCCCCAACGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTATAGCTAAAGA----------
gi|102411 : TGTATAT---CTTGTA--AAT---A---A-TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTTAAA--CTAAATGTG------TTACCTTCTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102412 : tttt--TTTTG-----TAA-TATA-ATGTTCTTGTA--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGAAAGA-AT-AA-CCTT---G--CCAATCGAG------TCACCCTTTAAAAA--TAAAGAATAAACTTGTA--A---TT---CT-TA-----CTTA-CTT
gi|102413 : T---T--CA-CA-GAGGGCCTCAAGGAA---TT-G----TT---A--CCAATTGAG------TCATCTTTTATAAA--TGGAAA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102414 : tgaagattggtgttgtcaatA-GAGGGCCCGAAGGAAAA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACTCTATTTAAA--TAAAGA----------
gi|102415 : tgtaaatgtatcata-TA-GAGGGCACCGAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTTAATGAG------TTACCCTCTATAAA--CAAAGA----------
gi|102416 : tgtaaatgtatcatGT---T--AA-TA-GAGGGTCCCATGGAAGA-TT-AG-T-TT------TTAATTAAATATGTTTTACCCTCTTTAA
gi|102417 : aaaatgtg-TA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTAAAA--TAAAGA----------
gi|102418 : aaatgtataatT--TGT---T--TA-AA-GAGGACTGCAAGGAAGA-TA-AGCT-TT---G--TCAATTGAG------TCAGGCTCTATAAA--TAAAGA----------A--T---GT--ACT-TA-----TTTA-CTTA
gi|102419 : aatgtaa-TA-GAGGATCCCAAGGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGG------CTACCCTCTTTACA--TAA
gi|102420 : aatgtatcttATGTACTTGTT--T--------TA--A-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAG--------------A---TTAAACT-TGTAAATCTTA-CTTA
gi|102421 : A-TA-GAGGGCCTCATGGAAGA-TT-AG-T-TTGTAA--CTAAATGTG------TAACCCTCTGTAAA--TAAAGA----------CT-A---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102422 : atgtattgtaaataATGTACTTGTT--T--------T--CA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TCAATCAAG------TCACCCTTTATAAA--TAAAGA----------
gi|102423 : -TA-GAGGGCCCCAAGGTAGA-TT-AG-T-TT------CAAACTAA--------TACCCTTTTTAAA--TAAAGATTTTC-----A--T---TC--ATT-CA-----TTTA-CTCA
gi|102424 : atgtatcttTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102425 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TT-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAGT----------ATTA---TT--A-T-TA------TTA-TT
gi|102426 : aTGAT--TGT---T--------GAGGGCCACAGGGAAGA-TA-AG-T-GT---AA-CTAACTGTG------TTACCCTCATTAAA--TAAAG
gi|102427 : aTATT--TGT---T--TA-AA-GAGGGCCTCAATGAAGA-TT-GGCT-TT---G--TCAATTGAA------CCACCCTCTATAAA--TAAATA----------A--C---GT--ATT-TA-----CTTA-CTCA
gi|102428 : TGCT--TGT---T--TT-AA-GAGGGCCTCAAGGAAGA-TT-TGCT-TT---G--TGAATCAAG------TCACCATTTATAAA--TAAA
gi|102429 : TGAT--TGT---T--------GAGGGCCTCAGAGAAGATTT-GG-C-TT---AATCCAACTGAG------CT-TTCTCTTTAGA--TAAAGT----------A--A---TT--ATTATA-----GTTA-TT
gi|102430 : T--TGT---T--TT-AA-GATGACCTCAAGGAAGC-TT-GGCT-TT---G--TCAAACGAG------TCACCCTTTCTATA--TAAAGA----------A--T---TT--ACT-TA-----CTTA-
gi|102431 : T--TGT---T--T--TA-GAGGGCCGCATGGAAGA-TT-AG-T-TTAA-A--CTTAATGTG------TCACTCTTTATAAA--TAAAG------------------TC--GCT-TAT----CTTATCTTA
gi|102432 : -GAGGGCCTCAAGAAAGA-TTGAC-T-TT---G--ACAATGGAG------TCACCCTCTATAAA--TAAACA----------A--AATCTT--ATT-TA-----CTTG-CTTA
gi|102433 : taaatA-GAGGGCCTAATGAAAAA-TT-GGCT-TT---A--TCAACTGAG------TCATCCTCTACAAA--TAAAGA----------A--T---TA--ATT-CA-----CTT
gi|102434 : ta-GAGGGCTCCAATGAAGA-TT-AG-T-TTCAAA--CTAATTGGA------CTACCCTCTTTAAA--TAAAGA----------