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Reference ( gi|144690 )       : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAA-A--ATGT-CA-CC--C----GAGGA-GTCAAAATTACATGCA
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gi|144735                     :                                              AT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GATT-GGT-CAAAATTACATG





Alignments
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lowQualScore                  :             ...        . ........  ......      ...         .....    .. .     . .  .....  .   .              
lowQualScore                  :             444        9 22222222  888888      555         11111    22 9     9 9  55555  9   0              
consensus                     : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAAATTACATGCA
Reference ( family-480 )      : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAAATTACATGCA
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blockSeqCons                  : 
originalCons                  : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAAATTACATGCA
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Alignments
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lowQualScore                  :             ...        . ........  ......      ...         .....    .. .     . .  .....  .   .              
lowQualScore                  :             444        9 22222222  888888      555         11111    22 9     9 9  55555  9   0              
consensus                     : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAAATTACATGCA
Reference ( family-480 )      : GATTATAAGAAT---CCATCATG-A--------GT------ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAAATTACATGCA
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gi|144715                     :    TATAAGAAT---TCATCATA-A--------AT------ATCCAT---GTGGGGTAG-----AAAT--A-TTTCA-C-CC---GAGGAGGT-CAAACTTACATGCA
gi|144716                     :    TATAAGAAT---CCGTCAAG-A--------GT------ATTAAT---GTGGGATGG-----AAAA--A-TTTCA-C-AT---GAGG-GGT-TGAAATTACGTGCA
gi|144717                     :    TATAAGAAT---CCCTCACA-A--------GT-------TCTGT---GTAGGATAT-----AGAA--A-TCTTA-C-CT---AAGG-GGT-CAAAATTACATGC
gi|144718                     :    TATAGGAAT---CCATATTG-A--------GT------ATTCAT---GTGGGAAAA-----AAAA--A-T-TCG-C-CC---GAGG-CGT-CAATATAACATGTA
gi|144719                     :     ATAAGAAT---CTATCATG-C--------AT------ATCCGT---GTGGGATAG-----AAAT--A-TTCCA-C-CA---GAGG-GGT-CGAAATTACATGCA
gi|144720                     :      TGAGAAT---ATAATATA-A----------------ATCCATCACACAGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-CAAATTTGCATGCA
gi|144721                     :       AAAAAT---CCATCATG----------------------------TAGGATAG-----AAAT--A-TCTCA-C-CC---TTTG-GGT-TAAAATTACATGCA
gi|144722                     :       AAAAAT---CCATCATG-A--------GTTC----ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAT--A-TCTCA-C-CC---
gi|144723                     :       AAAAAA---CCATCAGG-A--------GTTC----ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-T-CC---TCCG-AGT-CAAAATTACATGCA
gi|144724                     :       AAAAAT---CCATCATT-A--------ATTT----ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---TTGT-GGT-CAGAATTACATGCA
gi|144725                     :       AAAAAT---CCGTCATG-A--------ATTC----ATTCAT---GTGGGATAG-----AAAT--A-ACTCA-C-CG---AAAG-CGT-CGAAATTACATGCA
gi|144726                     :       AAAAAT---ACATCATG-A--------GTTC----ATCCAT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CT---TCTG-GAT-CAAAATTACAAGCA
gi|144727                     :       AAAAAT---CCATCAGG-ATCTCATTCAT------ATTCAT---GTGGGATAG-----AAAA--G-TCTCA-C-CC---GAGG-GGT-C-AAATTATATGTA
gi|144728                     :       AACAAT---CCATCAGG-A--------GTTC----ATCCTT---GTGGGATAG-----GAAA--A-TCTCA-C-CT------G-GAT-CAAAATTACATGCA
gi|144729                     :       AAAACT---CCATCATG-T--------TTTC----GTTCAT---GTGGGATAG-----AAAA--AATCTCA-A-CC---TCTT-GGT-CAAAATCACATGCA
gi|144730                     :       AAAAAT---CCATCATC-A--------GTTC----AACCAT---GTGGAATAG-----GAAA--A-TCTCA-C-TC---TGTG-GTT-CAAAA-TGTATGCA
gi|144731                     :       AAAAAT---CCATCATC-A--------GTTA----ATCCAT---GTGGAACAG-----ACAA--A-TCTTA-C-CC---TCTT-GGT-CAAAATTGCA
gi|144732                     :       AAAAATT--CCA-CATG-A--------CCTC----ATCCTT---GTTAGATAG-----AAAA--A-TCTTA-C------GAGG-GGT-CAAAATTACATG
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gi|144735                     :                                              AT---GTGGGATAG-----AAAA--A-TCTCA-C-CC---GATT-GGT-CAAAATTACATG