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Reference ( family-48 ) : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CGGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAAATAG----T-G-T--------T-TT--------T-------G-----ATAATNTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACCGC---AAT-ATTACTTTTG--TTTT---CTTTATCAAGCGCTA-A-GGGTA-ATTTT---AC-TATTTT-A-NAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-AC----T-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-AGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAAT-C-CCC-G--C-C-G-G-C-A---ACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCANAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
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gi|101042 : TTTTTTTCGCTTAATAAGTTTTTT---TTTATA----ATTCTCTATGAGCCCG------TTAAATATATATAA-----TGGACCA----TT-TTTTGCTTAAATTCCATTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--GG-A-GGGTTATTTT---CATATTTT-ACAAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---T
gi|101043 : TTTTTCTCGCTAAATAAGATTTTA---TTTATT----ATTCTCTATGAGACCGTTATATATATATATATATAA-----TGGACCG----TT-TTTG-CTTTAATTCCATTCCTGATTTGAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--
gi|101044 : TTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTATT----ATTCTCTTTGAGCCCG------TTAAATATATATAA-----TGGGCCA----TT-TTTTGCTTTAATTCCATACCTGAATTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGTAAACAG--T--GCATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAG-CTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGT--GG-A-GGGTTATTTT---CATATTTT-A-CAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCAGGCCCGATAAGCTCAGTCA-T---T-AGCGGGTCTGAATATTAATCCATGGGTCACGAGTTTGAA-A-C-CCC-A-CC-GATCACAATCTCCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTGAT--AAATGTTCA-TTTTTATGCCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAGCCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATCGTGGTTATATTTATTTTATTGGATTAGAT---------GCGT-AAAAATTCCAAAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATTTATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAAAACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTGgca
gi|101045 : ATAAAATTGTAAAATTTGTT----ATTCTCTCTTAGACAG------ATAAATATATGTAA-----CAGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGATCT-AGATAG----T-GTT--------T-TT--------T-------G-----ACAATTTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACTGCAAAAAA-ATAACTTTTGTTTTTTCTTTATCAAGA--GA-ATGGGTAATTTT---ACTATTTT-A--AAATTC--A---------ATC--ATt
gi|101046 : ATAAAGTT--A---TTTATT----ATTCTCTCTTAGACAG------ATAAATATATGTAA-----CAGACCA----TT-TTCC-CTTTAATTCAATTCCTGGTCTAAAA-AG----T-G-T--------TATT--------T-------G-----ATAATTTATTGACTGAGTAGCAAACAGTAT--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGACTCGCCTGAATCT--------ACATCAACACTGACTGCA--AAA-ATTACTTTTG---TTTATTTATCAAGC--GA-A-TGGTAATTTT---ACTATTTT-A--AATTTC--A---------ATC--AT
gi|101047 : ATAATATTATT---TTTCTTT---ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCGATTCCTGGTCTAAA-TAGGTTTT-G-T--------T-TT--------T-------TT----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGTATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC----A--TTTT-TTTATCAAGC--TA-T-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101048 : TTA---TTTCTT----TTTCTTTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTTGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TT--------TTT-----G-----ATATTTTATTGACTGAATAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACCGCA--AAA-ATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TT-A-GGGTAATTTT---ACTATTTC---GAAATTC--A---------ATC--AT
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gi|101050 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAGACCA----TT----C-CTTAAATTCCATTCCTGGTCT-TAATAG----T-GTT--------T-TT--------T-------G-----ATAATTTATTGACTGAGTAGCAAATAG--T--ATATATCCAGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCTTGGATCT--------ACATCAACACTGACCGCA--AAA-ATTACTTCTG--TTTTCTTTATTAAGC--TA-A-GGGAAATGTT---ACTATTTT---CAAATTC--A---------ATC--AT
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gi|101053 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CATATCA----TT-TTGC-CTTTAATTCCATTCTTGGTCTAAA-TAG----T-T-T--------T-TT--------TTT-----A-----ATAATTTACTGACTGAGTAGCAAACAG--T--TTATACCCTGATAGTACAGCATGAATTTGCAGGCTCGCCTGGATTT--------ACATCAACACTGACCGCA--AAA-AATGCTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-C-GGTTAATTTT---ACTATTTT----AAATTC--A---------ATC--AT
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gi|101055 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TT--------T-------TTTTT-ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101056 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TT--------T-------TTTTTTATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
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gi|101061 : ---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TT--------TTTTTGTGG-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACTGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GAGTATTTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--G---------ATC--AT
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gi|101065 : TTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATTCCTTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGATACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAATC--GG-A-TGGTTATTTT---CATATTTT-A-CAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTC--T---TAAGCGCGTCTGAATATTAATCCATTGGTCACGAGTTTGAA-T-
gi|101069 : taa---TTGTA----A---T--C-A---GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGAATATCAATACAGGGGTCGTGAGTTTTAA-T-C-CCC-G-CCCAGCCACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101078 : tcatgtttgttttggtctaaacaaagagttatggatatatgttatatattctcggacaatcaggaacattttcgttatccataGTGATTTTTATGCCACTTA-A-CAAGTTA--A---------AAA--AT-CTTC-ATT---TTATGTTATA---T--G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCAT------
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gi|101092 : atttgtcatattttacaataataactgaaagtttaaaaaaagtgAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---A-AGGGCATCTGAATATTAATACATGGGTCACGAGTTTGAA-G-C-CCC-A-CC-GATCACAATCTGCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAAAGACCAAT--AAATGTTCC-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTTTTAAGAAAA-G-ATAAAATTATGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GAGTAAAAGATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGAGAT-------------------CTTAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAATAAGCATATTCCGTCTG
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gi|101113 : ttcattttttaacgagttcaaaatttcatgttacaTC--A---------TTC--AT-CTTG-------TTATA-----------------GCCAGGCCTGATTAGCTCAGTC-AT---T-AGCACATCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-TCC-CCC-A-CCCAGCCACAATCTCCGTGATGGTTGATATATGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCATCT-------CT
gi|101114 : tttactcatgTCT-A-CAAAT----A---------ATT---TTCTTT-CAC---TTAGA----A---T----AC--GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101152 : GTTTG---T---CTGTA----AC--T--G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTAACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCTAGCAACAGTCTCTGTGATGATTGATATACGAAATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101160 : TTGTCTT---TTATA-----------------GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTTG-T---T-AGCGCGTCTGACAATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CTCGGCCATAATCTCCGTGATGGTTGATATACGACATTGTGTCACATTATCACATATATC-----TCACCG-------CTGAT------TCAAGTGAGAAA
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gi|101165 : TG-TTTG--TTGTA----T---T--C-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGTAATT-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-C-CCCCA-CCCAGCAACAGTCTCCGTGATAATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101171 : -CTT---TTCTA----T---TTAG-CCT-GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCATTTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101176 : TC---TTGTA-----------G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTTAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGACTCTCAATCCAGGGGTCGTAAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCTGGCCACATTCTCCCTGATGGTTGATATACAACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCTCACCG--CTGAT------TTAAGTGGGAAA
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gi|101188 : T---TTTTA----AAGTT--A-ACTTGCCGTGCCCGATTAGTTCAGTCAGT-----AGCACGTCTGACTACCAATCCAGGGATCATGATTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATTATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCATCGCTGGATTCAAGAGAGA
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gi|101206 : TGTC----A---T--A-CCA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CACGGCAACAGTCTCCATGATGATTGATATACGACATTGTGTTTCATTATCA-------T-----TCGTTT-------CT
gi|101215 : TA----G---T--G---T-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGTGCATCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGATTGAA-T-C-ACT-G-CTTGGCCACAATCTCTATGATGTTTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101221 : A----A---T--G-----GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCAGT---T-AA-GCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCC-CCC-A-CCTGCCAACAGTCTCTGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101226 : ----A---T--A-ATC-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATACAGGGGTCGTGAGTTTGAA-TCC-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATATGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101228 : ----A---T--G-A---GTCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGACATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101231 : ---T--G-ACC-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCTTGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATTATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCAT------
gi|101233 : ---T--A-ACA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCTGT---T-A-CGCGACTGACTATCAATCCAGGGGTCGTAAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CCAGG-AA-AGTCTCCGTGATGATTGATATACGATATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101238 : --G-AC--GCCGGACCCGATTAGCTCAGTCAGT---T-A-CGCGTCTGACTATCGATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CCAGGCAACTGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101244 : -ACA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCATCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-CTCCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101246 : -ACT-GCCAGGCCTGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAA--GTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TTGTCT-------CT
gi|101248 : -ACA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTTTCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCC-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101258 : CT-ACCGGGCCCGATTAGTTCAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGACTGTCAATCCAGGG-TCGTGAGTCCGAA-T-C-CCC-G-CTCGGCAACAATCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATAG-------T-----TCGTCT-------TT
gi|101260 : CT-GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCTGG---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATTATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101056 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TT--------T-------TTTTTTATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101057 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAACATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-TGGTTTTT-T-TT--------T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCTACATCAAAACATCAATACTGACGGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101058 : TTA---TTTTTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAACATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-TGGTTTTTTT-TT--------T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCTACATCAAAACATCAATACTGACGGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101059 : TTA---TTTCTT----ATTCCCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAT-A----TT-TTCC-CTTAAATTCCGTTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TTTGTTTTTTT-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTAATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------TCATCATCACTGACGCC---AAT-AATAAT------TTTTTTTTATCAAAC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101060 : TTA---TTTCTT----ATTCCCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAAATATATGTAACAAATATT-TTCC-CTTAAATTCCGTTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TTTGTTTTTTT-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTAATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------TCATCATCACTGACGCC---AAT-AATAAT------TTTTTTTTATCAAAC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101061 : ---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TT--------TTTTTGTGG-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACTGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GAGTATTTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--G---------ATC--AT
gi|101062 : CA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TTTTTTT---T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTACTTT---------TTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGA-AAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101064 : TTGAAATCCATTCCTGGTC--AAGTAG----T-G-T--------T-TT--------TTTTTG--G-----ATAATTTATTGACTGAGTAGCAATCAC--T--ATATACCTTAATAGTACAGCATGAATGTGCTGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGGCCGC---AATAATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTT---GAAATTC--A---------ATC--AT
gi|101065 : TTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATTCCTTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGATACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAATC--GG-A-TGGTTATTTT---CATATTTT-A-CAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTC--T---TAAGCGCGTCTGAATATTAATCCATTGGTCACGAGTTTGAA-T-
gi|101069 : taa---TTGTA----A---T--C-A---GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGAATATCAATACAGGGGTCGTGAGTTTTAA-T-C-CCC-G-CCCAGCCACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101070 : attttttcatattcctttatcaaacagatgttttccatggcataaacatttggtttctcagctctttagagtttaaT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TTGTCT-------CT
gi|101078 : tcatgtttgttttggtctaaacaaagagttatggatatatgttatatattctcggacaatcaggaacattttcgttatccataGTGATTTTTATGCCACTTA-A-CAAGTTA--A---------AAA--AT-CTTC-ATT---TTATGTTATA---T--G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCAT------
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gi|101090 : t-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGTGCGTCTGACTACCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-T-CCC-G-CCCACCCACAATCTCTGTGATGATTGATATAAGACATTGCGTCTCATTACCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101092 : atttgtcatattttacaataataactgaaagtttaaaaaaagtgAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---A-AGGGCATCTGAATATTAATACATGGGTCACGAGTTTGAA-G-C-CCC-A-CC-GATCACAATCTGCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAAAGACCAAT--AAATGTTCC-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTTTTAAGAAAA-G-ATAAAATTATGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GAGTAAAAGATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGAGAT-------------------CTTAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAATAAGCATATTCCGTCTG
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gi|101113 : ttcattttttaacgagttcaaaatttcatgttacaTC--A---------TTC--AT-CTTG-------TTATA-----------------GCCAGGCCTGATTAGCTCAGTC-AT---T-AGCACATCTGACTATCAATCCAGGGGTCCTGAGTTTGAA-TCC-CCC-A-CCCAGCCACAATCTCCGTGATGGTTGATATATGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCATCT-------CT
gi|101114 : tttactcatgTCT-A-CAAAT----A---------ATT---TTCTTT-CAC---TTAGA----A---T----AC--GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTGTCAACCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101118 : TTG-CTT---TT-----------T--A-GGT-GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTAATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101126 : tacaatgattcacaattgctacaaATTCTAA---------ATC--AT---TG---T---CTGTC----A---T--T-ATA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101152 : GTTTG---T---CTGTA----AC--T--G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTAACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCTAGCAACAGTCTCTGTGATGATTGATATACGAAATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101160 : TTGTCTT---TTATA-----------------GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTTG-T---T-AGCGCGTCTGACAATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CTCGGCCATAATCTCCGTGATGGTTGATATACGACATTGTGTCACATTATCACATATATC-----TCACCG-------CTGAT------TCAAGTGAGAAA
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gi|101165 : TG-TTTG--TTGTA----T---T--C-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGTAATT-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTTAAA-T-C-CCCCA-CCCAGCAACAGTCTCCGTGATAATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101170 : -CTA---TTGTAT---A---T--G-G---GCCGGGCCCAATTAGCTCAGTCG-T---T-AGGGCGTCTGAGTATCAATCCAGTGGTCGTAAGTTCGAA-T-C-CCC-G-GCCGGCCACAATCTCCATGATGGTTGATATACGATATTGCGTCTCACTATCA-------T-----TCGTTT-------
gi|101171 : -CTT---TTCTA----T---TTAG-CCT-GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCATTTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101176 : TC---TTGTA-----------G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTTAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGACTCTCAATCCAGGGGTCGTAAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCTGGCCACATTCTCCCTGATGGTTGATATACAACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCTCACCG--CTGAT------TTAAGTGGGAAA
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gi|101179 : TT---TTATA----A------------GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGGTGATAGATATACGACATTGTATCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101188 : T---TTTTA----AAGTT--A-ACTTGCCGTGCCCGATTAGTTCAGTCAGT-----AGCACGTCTGACTACCAATCCAGGGATCATGATTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATTATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCATCGCTGGATTCAAGAGAGA
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gi|101215 : TA----G---T--G---T-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGTGCATCTGACTGTCAATCCAGGGGTCATGAGATTGAA-T-C-ACT-G-CTTGGCCACAATCTCTATGATGTTTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101221 : A----A---T--G-----GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCAGT---T-AA-GCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCC-CCC-A-CCTGCCAACAGTCTCTGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101228 : ----A---T--G-A---GTCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGACATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101231 : ---T--G-ACC-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCTTGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATTATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCAT------
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gi|101238 : --G-AC--GCCGGACCCGATTAGCTCAGTCAGT---T-A-CGCGTCTGACTATCGATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCC-G-CCAGGCAACTGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101246 : -ACT-GCCAGGCCTGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTTGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAA--GTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TTGTCT-------CT
gi|101248 : -ACA-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTTTCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-TCC-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101354 : -GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT-----AACGCGTCTGACTATCAATCGAGGGGTCGTAAGTTCGAA-T-C-CCCCG-TCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101359 : -GCCGGGCCCAATTAGCTCAGTCAGT---T-AG-GCATCTGACTATCAATCGAGGGGTTGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCTCTCACCGCTGAT------TCAAAAGGGAAA
gi|101361 : -GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGAC---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCTTGAGTTCGAA-TCC-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCCCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101363 : -GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGGCTATCAATCCAGGGGTCATGAGTTCGAA-T-TGCCC-G-CCTGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101364 : -GCCGGGCCCGATCAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACAATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCTGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101365 : -GTCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCTTCT-------CT
gi|101463 : CCGGGCCCGATTAGCTCAGTCT-T---T-AGCGCGTCTGAATATCAATCCAGGGATCGTGAGTTCGAA-A-C-TCC-A-CCCGGCCACAATCTCCGTGATGGTTGATATATGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101466 : CCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT-----AACGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAGCAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACACTGTGTCTCATTACCA-------T-----TCGTCT-------CT
gi|101634 : TAATTAAAATGTTAA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAGTGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAACACTATTTT-TAAGAAAA-T-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTATACTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAAT-CCATAAAGGTACAGTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
gi|101635 : TTTGAATGTTAGTTTTATATAGGTTAA----GCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTACATTTT--TG-AAATGATGCTTAAATATTAATTC---AAATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATG-AAAACAAGCATATTCCGTCTGt
gi|101636 : TTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAAAG-ATAAAATTATGGTTAGATTTGTTTTATTGGATAAGATCTACAAAATGCGTAAACAAT-CCATAAAGGTACATTTTTTTGAAAATGATGCCTATATATCAATTC---AGATAT-------------------ATCAG---------ATAAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTT-----TTAAAAACAAGCATATTCCGTCTGt
gi|101637 : AGGTTAAA------AACCCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTCTTTTACTGGATAAGAT---------GCGTAAAAAAATAAAAAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTCCAGAGACATAGACTATGTTTCTGATTAATTCAGATATCTCAGATGAAAACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTGt
blockSeqs : AAA T TTATAT ATATA AATA . G A GTTT G TGGTTTTTTT TGTTTTTTTG T TA GC ACATCAAA G C AAA A GTT C GC G T TAT ACA TA TACCCTAGT TT TC ATA AAGTTAACTT T AAT G T C C T CATATAT ATCTC CTCACCG CGCTGGA TA T T AT CTACAAAAT A T TT CAG AGACTATGTTTCTGATTAA ATATCTCAG
blockSeqs : . . . . . . G A . . TGGTTTTTT TGTTTTTTTG T . . ACATCAAA G C A A G C . . . . GAA . . . C G TTATATGA A AAT G T C C A . . CACCG A . . . AG . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . G A . . TTT TTTTTGTGG T . . . G C A A G C . . . . GAA . . . C G TTTAGCCT G . G . C C . . . . G . . . T . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . G A . . TTA TTTTTTT T . . . G C A A G C . . . . GAA . . . C . ATGACT G . G . C C . . . . A . . . G . A A . . . .
blockSeqs : . . . . . . G A . . TTT TTTTTTG T . . . G C A A G C . . . . GAA . . . C . ATGACT G . G . C A . . . . A . . . G . A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TGT TTTTTGG T . . . A T A A G C . . . . GAA . . . C . ATGACT A . G . C C . . . . A . . . G . A T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . TGT TTTTTG T . . . A T A A G A . . . . GAA . . . C . ATGACT G . G . C C . . . . T . T . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA TTTTTT T . . . A G A A A C . . . . GAA . . . A . ATGACT G . G . . C . . . . T . G . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA TTTG G . . . A C . A G C . . . . GAA . . . T . ATGACT G . G . . C . . . . T . G . . A .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA TTTA T . . . C T . . G C . . . . GAA . . . C . ATTATA G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . G . . AA TTT G . . . A C . . G T . . . . GAA . . . C . ACTTGA G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . AA TG T . . . A C . . G T . . . . AC . . . C . ATACCA G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AA TG G . . . A C . . G C . . . . AC . . . C . ATAATC G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A C . . G T . . . . AC . . . T . TAGGT G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG T . . . A G . . . T . . . . AC . . . T . ACTGA G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . T . . . . AA . . . T . TATGG G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . T . . . . AC . . . C . ATGTA G . G . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . T . . . . AC . . . C . ATCA G . A . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . C . . . . AT . . . . . ATAC G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . C . . . . AC . . . . . ATAG G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . . . . . . A . . . . . ATCA G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A T . . . . . . . . A . . . . . TTCA G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT TG G . . . A G . . . . . . . . G . . . . TTCA G . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TT TG G . . . A C . . . . . . . . C . . . . GTGT G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . TT TG T . . . G C . . . . . . . . G . . . . ATGA G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . AA TG T . . . G . . . . TGA G . G . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . ATG G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GA G . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . A G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . A G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . G . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . G . . . . . . .
blockSeqs : . G . A . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : C . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : G . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
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originalCons : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CGGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAAATAG----T-G-T--------T-TT--------T-------G-----ATAATNTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCGACACTGACCGC---AAT-ATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTT-A-NAAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-AGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
finalCons : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CGGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAAATAG----T-G-T--------T-TT--------T-------G-----ATAATNTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCGACACTGACCGC---AAT-ATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTT---ACTATTTTGAA-AAATTC--A---------ATC--ATGCTTG-CTT---TTGTA----A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-AGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
Alignments
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lowQualScore : ... .... ...... ..... . .... . . . .... . ............ ...................... . . .. .. ........ . . ... . ... . .. . . ... .. .. ... .............. . ... . . . . . . . ....... ..... ....... ....... .. . . ... ......... . . . .. ... ................... .........
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consensus : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CGGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAAATAG----T-G-T--------T-TT--------T-------G-----ATAATNTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCGACACTGACCGC---AAT-ATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-AGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
Reference ( family-48 ) : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CGGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAAATAG----T-G-T--------T-TT--------T-------G-----ATAATNTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCGACACTGACCGC---AAT-ATTACTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-AGCGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
gi|101037 : TTTTTTTCGCTTAATAAGGTTTTA---TTGATTTATAATTCTCTATGAGCCCG------TTTAATATATATAA-----TGAACAA----TTGTTTG-CTTAAATTCCATTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTCACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATACCTTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--GG-A-GGCTTATTTTCATATTTT-ACAAATTC--AGTCATGCTTG-TTT---TTGTA-A---T--T-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGCGTGTCTGAATATTAATCCATTGGTCACGAGTTTGAA-T-C-CCC-A-CC-GGTCACAATCTCCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGCCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGT---AAATTCTATAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATATATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTG
gi|101038 : TTTTTTTTGCTAAATAACGTTTTA---TTTATT----ATTCTCTACGAGTCCG------TTAAATATATATAG-----TGGACCA----TT-TTTTGCTTAAATTCCATTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGTGTAGCAAACAG--T--GCATACCTTGATAACACGGTTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATGAAGCGCCAGA-GGGTTATTTTTATATTTT-ACAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGCTCGTCTGAATATTAATCCATGGGTCACGAGTTTGAA-T-C-CCC-A-CC-GGTCACAATCTCCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------GTGAT------ATAAAAGAGAGATTAAT--AAATCTTCA-TTTTTATGCCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACGAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-T-ATAAAACTATGGTTAAATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGTAAAAAATTCCATAAAGGTGCATTTT--TTAAAATGATGCTTATATATTATTTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAATACATTTATTCTTTTTTAAGACTTTAACATGAAAAACAAGCATATTCAGGCTGt
gi|101039 : TTTTTTTTGCTAAATAAGGTTTTA---TTTATT----ATTTTCTATGAGCCTG------TTAAATATATATAA-----TGGACCA----TT-TTTTGCTTAAATTCCATTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTGGCAAACAG--TGCACATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--CG-A-GGTTTTTTTTCATATTTT-ACAAATTC--AGTCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCATT---T--GCAGGTCTGAATATTAATTCATGGGTCACGAGTTTGAA-T-A-CCC-A-CC-GGTCACAATCTCCATGATGGTGGATATAC-ATATGGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------GTAAAAGAGAGGCTAAT--AAATGTTCA-TTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAATCAAGCAAAGCCTA-TTT-TAAGAAAA-G-ATCAAATTGTGGTTAGATTTATTTTATTGGATTAGAT---------GCGT-AAAAATTCCAAAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATACATTAATTC---AGATAA-------------------TTCAG---------ATGAAAACATTTATTCTTTTTTACGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCC
gi|101040 : TTTTTTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTATA----ATTCTCTATGAGCCCG------TTAAATATATATAA-----TGGACCA----TT-TTTTGCTTAAATTCCGTTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--GG-A-GGGTTATTTTCATATTTT-ACAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TCGTA-A---T--G-ACT-GCCAGGCCCGATTAGCTCTGTC-AT---T-AGCGCGTCTGAATATTAATCCATGGGTCACGAGCTTGAA-T-C-CCC-A--CCGGTCACAATCTCCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------ATGAT------ATAAAAGAGAGACTAAT--AAAAGTTCATTTTTTATGTCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATGAAGGTCAAATAAGCAAAACCTATTTT-TAAGAAAA-ATATAAAATTGTGGTTAGATTTGTTTTATTGGATTAGAT---------GCGT-AAAAATTCCAAAAAGGTACATTTT--T
gi|101042 : TTTTTTTCGCTTAATAAGTTTTTT---TTTATA----ATTCTCTATGAGCCCG------TTAAATATATATAA-----TGGACCA----TT-TTTTGCTTAAATTCCATTCCTGATTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGC--GG-A-GGGTTATTTTCATATTTTACAAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---T
gi|101043 : TTTTTCTCGCTAAATAAGATTTTA---TTTATT----ATTCTCTATGAGACCGTTATATATATATATATATAA-----TGGACCG----TT-TTTG-CTTTAATTCCATTCCTGATTTGAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--
gi|101044 : TTTCGCTAAATAAGGTTTTA---TTTATT----ATTCTCTTTGAGCCCG------TTAAATATATATAA-----TGGGCCA----TT-TTTTGCTTTAATTCCATACCTGAATTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGTAAACAG--T--GCATACATTGATAACACGGCTTGGATGTGCAG-CTGATCTGGGTCT--------ACATCGACACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAAGT--GG-A-GGGTTATTTTCATATTTT-ACAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCAGGCCCGATAAGCTCAGTCA-T---T-AGCGGGTCTGAATATTAATCCATGGGTCACGAGTTTGAA-A-C-CCC-A-CC-GATCACAATCTCCGTGATGGTTGATATAC-ATATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTGAT------ATAAAAGAGAGACTGAT--AAATGTTCA-TTTTTATGCCAGTTCTTTATTTCAATGTTAGTTTTATATAGGTTAAACAAGCAAAGCCTATTTT-TAAGAAAA-G-ATAAAATCGTGGTTATATTTATTTTATTGGATTAGAT---------GCGT-AAAAATTCCAAAAAGGTACATTTT--TGAAAATGATGCTTATTTATTAATTC---AGATAT-------------------CTCAG---------ATGAAAACATTTATTCTTTTTTAAGACTTAAACATGAAAAACAAGCATATTCCGTCTGgca
gi|101045 : ATAAAATTGTAAAATTTGTT----ATTCTCTCTTAGACAG------ATAAATATATGTAA-----CAGACCA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGATCT-AGATAG----T-GTT--------T-TT--------T-------G-----ACAATTTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACTGCAAAAAA-ATAACTTTTGTTTTTTCTTTATCAAGA--GA-ATGGGTAATTTTACTATTTT--AAAATTC--AATCATt
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gi|101054 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TTTTTT----T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101055 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TT--------T-------TTTTT-ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101056 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAA-TTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-T--------T-TT--------T-------TTTTTTATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATAAACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------ACATCAACACTGACGGC---AATAATTAC-------TTTTTTTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101057 : TTA---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAACATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-TGGTTTTT-T-TT--------T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCTACATCAAAACATCAATACTGACGGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101058 : TTA---TTTTTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAACATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCTTGGTCTAAT-TAG----T-G-TGGTTTTTTT-TT--------T-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCTACATCAAAACATCAATACTGACGGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101059 : TTA---TTTCTT----ATTCCCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAT-A----TT-TTCC-CTTAAATTCCGTTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TTTGTTTTTTT-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTAATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------TCATCATCACTGACGCC---AAT-AATAAT------TTTTTTTTATCAAAC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101060 : TTA---TTTCTT----ATTCCCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAAATATATGTAACAAATATT-TTCC-CTTAAATTCCGTTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TTTGTTTTTTT-------G-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTAATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGTCTGGATCT--------TCATCATCACTGACGCC---AAT-AATAAT------TTTTTTTTATCAAAC--TA-A-GGGTAATTTTACTATTTTGAAAAATTC--AATCAT
gi|101061 : ---TTTCTT----ATTCTCTCTTAGACAG------GTAAATATATGTAA-----CAAAACA----TT-TTCC-CTTAAATTCCATTCCTGGTCTAAA-TAG----T-G-T--------T-TT--------TTTTTGTGG-----ATAATGTATTGACTGAGTAGCAAACAG--T--ATATACCCTGATAGTACAGCATGAATGTGCAGGCTCGCCTGGATCT--------ACATCAACACTGACTGC---AATAATTACTTTT--------TTTATCAAGC--TA-A-GAGTATTTTTACTATTTTGAAAAATTC--GATCAT
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gi|101065 : TTTAAAATGG----T-G-A--------A-TT--------T-------G-----ATAATTTACTGACTGCGTAGCAAACAG--T--GCATTCCTTGATAACACGGCTTGGATGTGCAGGCTGATCTGGGTCT--------ACATCGATACTAACCGC---AAT-ATTATTTTTG--TTTTCTTTATCAATC--GG-A-TGGTTATTTTCATATTTT-ACAAATTC--AATCATGCTTG-CTT---TTGTA-A---T--G-ACT-GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTC--T---TAAGCGCGTCTGAATATTAATCCATTGGTCACGAGTTTGAA-T-
gi|101069 : taa---TTGTA-A---T--C-A---GCCGGGCCTGATTAGCTCAGTCG-T---T-AGCGCGTCTGAATATCAATACAGGGGTCGTGAGTTTTAA-T-C-CCC-G-CCCAGCCACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101078 : tcatgtttgttttggtctaaacaaagagttatggatatatgttatatattctcggacaatcaggaacattttcgttatccataTTAAAAAATCT----TCAT--TTT-ATG---TTATA-----T--G-A---GCCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCCCG-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CTCAT------
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gi|101171 : -CTT---TTCTA-T---TTAG-CCT-GCCAGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCATTTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101365 : -GTCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT---T-A-CGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAACAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACATTGTGTCTCATTATCA-------T-----TCTTCT-------CT
gi|101463 : CCGGGCCCGATTAGCTCAGTCT-T---T-AGCGCGTCTGAATATCAATCCAGGGATCGTGAGTTCGAA-A-C-TCC-A-CCCGGCCACAATCTCCGTGATGGTTGATATATGACATTGCGTCTCATTATCA-------T-----TCGTCT-------CT
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gi|101466 : CCGGGCCCGATTAGCTCAGTCGGT-----AACGCGTCTGACTATCAATCCAGGGGTCGTGAGTTCGAA-T-C-CCC-G-CCCGGCAGCAGTCTCCGTGATGATTGATATACGACACTGTGTCTCATTACCA-------T-----TCGTCT-------CT
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