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lowQualScore                  :          88           11      3                       
lowQualScore                  :          ..           ..      .                       
lowQualScore                  :          33           99      8                       
consensus                     :   ATCACAGCCACCACATCAGCACAGCGCAACCATCACAGCCACCACATCAGCA
Reference ( gi|21856 )        :   ATCACAGTTACCACATCAGCTTAGCGCAGCCATCACAGCCACCACATCAGCA
gi|21825                      :   ATCACAGCCACCACATCAGCTTAGCGCAACCATCACAGCCACCACATAAGC
gi|21827                      : ccATCACAGCCACCACATCAGCTAAGCGCAACCATCACAGCCACCACATCAGC
gi|21829                      : ccATCACAGCCACCACATCAGCTCAGTGCAACCAGCACAGCCACCACATCAGCA
gi|21848                      : ccATCACAGTCACCACATCAGCTAAGCGCAATCATCACAGCTACCACGTCAGCA
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gi|21847                      : ccACCACAAACACCACATCGCCATAGCACAACCACCACAGCCACCAACTCAGCA
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gi|21837                      :   ccCACAGCCACCACATCATCTTAGCTCAACCATCACAGCCACCACATCAGC
gi|21831                      : ccaaCACAGCCACCACATCAGCATAACGCAGCCATCACAGCCACCAAACCAGCA
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gi|21854                      :     CACAGTCACCACATCAGCACAACACAGCAACTACAGCCACTATATCAGCA
gi|21855                      :   caaACAACCACTACATCAGCATAGCGCAACCATCACAACCACCACATCAGCA
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gi|21864                      :      ACAGCCGTCATATCAGCACAACGCAACCATAACAGCCACCACATCAGCA





Alignments
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consensus                     :     ATCACAGCCACCACATCAGCACAGCGCAACCATCACAGCCACCACATCAGCA
Reference ( family-478 )      :     ATCACAGCCACCACATCAGCACAGCGCAACCATCACAGCCACCACATCAGCA
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gi|21855                      :     caaACAACCACTACATCAGCATAGCGCAACCATCACAACCACCACATCAGCA
gi|21856                      :  acgATCACAGTTACCACATCAGCTTAGCGCAGCCATCACAGCCACCACATCAGCA
gi|21857                      :     ATCACAGTCACCACAACAGCACAGTGCAACCACCGCAGCCTCCACATCAGCA
gi|21858                      :     ATCACAGCCACTACATCAGCACAGCGTAACCATCATAGCCTCAACATCAGCA
gi|21859                      :     ATCACAGCCACCACACTAGCTCAGCGAAACCAGCACAGCCACCACATCAGCA
gi|21860                      :     ACCACAACCACTACATCAACACAACACAACCACCACAGCCACTACATCAGCA
gi|21861                      :        ACAGCCACTACCTCAGCACAGCACAACCACCACAGCCACCATATCAGCA
gi|21862                      :    acaCACAGCCTCAACATCAGCATAGCGCAACCATCACAGCCTCCTCATCAGCA
gi|21863                      :       CACAGCTATTACATCAGCACAACACAACCATCACAGTCACCACATCAGCA
gi|21864                      :        ACAGCCGTCATATCAGCACAACGCAACCATAACAGCCACCACATCAGCA
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blockSeqs                     :                          C


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Alignments
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