lowQualScore                  :                                                                                                  1        1111111111111111111111    11111111                       777777777777777777777777777777777777777777777777777             2222222222222222                                                                     3333333333333333                              33333                                         1                                   1111                                                    
lowQualScore                  :         1     88 2    1          2222   1      2222       444  0     111  11       22222         7 1  88  0000000000000000000000    99999999   11    4             000000000000000000000000000000000000000000000000000          1  9999999999999999  1  11    4444444       3    222  6     4                           4444444444444444    1     9       3    1 999  44444 88888 33 1     99999999  1  222         0 2       4      4    1  1  33333   2222    3333    444  3333  22    1   5    555  1  3     
lowQualScore                  :         .     .. .    .          ....   .      ....       ...  .     ...  ..       .....         . .  ..  ......................    ........   ..    .             ...................................................          .  ................  .  ..    .......       .    ...  .     .                           ................    .     .       .    . ...  ..... ..... .. .     ........  .  ...         . .       .      .    .  .  .....   ....    ....    ...  ....  ..    .   .    ...  .  .     
lowQualScore                  :         4     55 6    2          4444   1      4444       444  2     999  55       99999         0 2  11  4444444444444444444444    22222222   77    5             888888888888888888888888888888888888888888888888888          2  5555555555555555  2  77    2222222       3    333  4     2                           5555555555555555    6     1       8    5 000  00000 00000 22 3     22222222  2  222         3 6       9      2    3  3  66666   8888    1111    111  1111  00    8   1    000  7  0     
consensus                     : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGTAAGAGCACTTCA---A-----T----------T---G----G--G--GA------A-----G-GAGGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTC-C--GAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---GT----TG--TTATCTACGCCAA---TG-TTNTTTTT
Reference ( gi|74789 )        : ATAAAATT-TCCTTC-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTCA-AC-AAT----------------------ACTTA-------AAT--GGGCATAAGAGCACTTCA---A-----T----------G---G----G--G--GA------A-----G-GAGGCAACCT-GGAC--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGT---CCTTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTC-C--AAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTAAATTCTGCTCA-TT-TC-----TTA--A-AAAA----TATG---GT----TG--TTATTTACACCAA---TG-TTGTTTTT
gi|74798                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-TGTTTG----AGTAA---------TAAT--------AAGTAT-----CCTGAAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGTAAGAGCACTTCA---A-----TTATT------G---GCTGCA--G--GG------A-----C-GAAGCAACCT-GGGG--------------GC-AG--TATG-------TGAGTATAGTGT---CCCTCTCCTGCTGCTGGC---AATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTC-C--GAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTTTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TACG---GT----TG--TTATTTACTCCAA---TG-TTGTTTT
gi|74795                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTT----GCC-TTTTTG----AATAACT--TTGCGTAAT---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------AGGTT-------AAT--GGGCGAAATGACACTTCA---A-----TAATTGT----G---G----G--GTTGG------G-----A-GAGGCAACTTTGG----------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGCGTGT---CCCTCTCCCGCTGGTGGCGGAAAATCTACTTTACTCCC-----G-------------GGATAAGGCAAATCGCTC-CG-AAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TTATT-----TTA--G-AAAATAATTATG---GT----CG--TTATTTACACCAA---TG-TTGTTTTT
gi|74788                      : ATAACAAT-TCCTTT-C-AAAA-GGAACGGCTT----GCT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCATAAT---TA--AAAATAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GG--------GCACTTT----------T----------T---G----A--G--GA--------------GAGGCAGCCT-AGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGTGAAGGGTGT---CCCTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGAAACCGCTC-C--GAAACTTGA-----A--T-GTT-----------T-AT---CTTAAACACTT-AACGACTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATA---GT----TA--TTATCTACGCCAA---TG-TTTTTTTT
gi|74797                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-GAAA-GGAGCGACTT----GCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCATAGT---TA--TTAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-AAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGAGTAACAGCACTTCA---ATTAT-T----------G---G------------------------G-GAGGCAACTT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGTATACC-TCTCCTGCT--T-------------CTCTACTCCCTGGTAACTA-CCGCTATTCAGATAAGGCGAATCGCTC-TG-AAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATA---GC----TG--TTATTTAAGCCAA---T
gi|74790                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GGT-TTTTTT----AGTAACT--TAACGTAA-----------GTTT-----TTTGTAGGT--------------------------------------------AT--GAGCGTAAGAGTACTTCAGTTA-----T----------T---A----A--G--GA------A--------AAGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTCCGGCTGGCGGCGGTAACTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCCC-G--GAAACTTCA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGTTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---GT----TG--TTATCTACGTCAA---TG-TTTTTTTTtatttactttt
gi|74793                      : ATAAAATA-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCT-TTTTTT----AGTAGCT--TAGCGTAAT---TA--TAAGTGT-----TTGATAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GAGCGTAAGAGTACTTAATTTA-----T----------T---G----A--G--GA--------------GAGGCA--TT-GGG---------------GT-AG--TGTG-------TGGGAGGGGTGT---CCTTCTCCCGCTGGTGGCAGTATTTCTACTCTACTT------------CCGCTATTGGAGTACGGGGAACCGCTC-G--GAAACTTGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTTAAAACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAG----TTTG---GT----TG--TTTTCTACGTCAA---TG-ATGTTTTT
gi|74792                      : ATAAATTT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCT-ATTTTG----AGTAACT--TAGCGTAGT---TA--TACGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ATTTT-------AAT--TGGTGTAAGAGCACTTCA---G-----T----------T---C----T--T--GC------A-----GAGAGGCAACCT-GGGG--------------AT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTGA---CCCTCTCCCGCTGGTATCGGTAATACTACTCTACTT------------CCGCTATTGGGATACGGGTAACCGCTC-C--GAAACTTGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-TACGGCTACATTCCACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATA---GT----TG--TTATt
gi|74791                      : ATAATATT-TCCTTT-T-AAAA-GAAACGGCTT----GCT-TTTTTTTTTTAGTAACT--TAACGTAAT---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--AAGCCTAAGAGTACTTCA---A-----T----------AAT-G----A--G--GA--------------GAGGCAGTCT-GGGG--------------GT-AG--GGTC-------TTGGAAGGGTGT---CCCACTCCCACAGGTGGCGATAACACCACTCTACTCAC-----GCTA-----TATT-GGATACGGGGAATCGCAC-A--GAAACTTGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TGTG---GT----TG--TTATCTACGTCAA---TA-TTTTTTTc
gi|74801                      : ATACAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-T------------------------AAT---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GGT----------------------ACTTT-------AAT--GGTCATAAGAGCACTTCATTTA-----T----------T---G----G--G----------A-----G-GAGGCAACCG-GGGGAGGGGGGGGGGGTGGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAATGT---CCCTCTCCTGCTGGTGGCTACAATTCT---CTTCTTCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGCAAACCGCTC-C--GAA-----A-----A--T-G-TTG--------AT-AT---C-TACACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TT-TCGTTGATTAG-A-AAAA----CATG---GT----TA--TTATATACGCCAA---TG-TCTTTTTT
gi|74794                      : ATAAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TACGTAG-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------TATTTAG---TAAGAGCACTTCA---G-----T----------T---G----T--T--GC------A-----GAGCGGCAACTT-GGGG--------------AT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---ACCTCTCCCGCTGGTAGCGGTAATACTACTCTATTTCC-----GCT--------TTTGGATACGGGGAACCGCTC-C--GAAACTGGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-TGAACGGCTACATTATACTAA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---GT----TG--
gi|74799                      : ATAAACTT-TCCTTT-TTAAAA-GGAACGGCTT----GCCCTTTTTG----AGTAACTA-TAA-GTAAT---TA--TAGGTAT-----TTTGTAGGTAA-AT-GAT----------------------ACTTA-------A-T--GGGCA-------A-TTCA---A-----T----------TATTG----G--G--GA--------------GAGGCAACGT-GGGG--------------GG-GG--GGGGGTATCTTTTGGAAGGGTGT---CACTTTCCCGCTGGTGGAGGTAATTCTACCCTACTCCC-----GCTA-------TTGGGATAAGGGGAACCGCTC-C--AAA-----A-----AAAT-ATTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTATTCA-TT-TC-----TTA-------------------GT----TG--TTATTTACGCCAA---TG--TGTTTT
gi|74796                      : ATAAAATT-TCCATT-T-AGAA-GAAACCGCTT----GCT-GTTTTG----AGTAACT---AGCATAAT---TA--TAAATAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AGT--GGGCA--------CTT-----------T----------T---T----G--A--GA------A-----G--AGGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATGT---CCCTCTCCCGCTGATTGTGGTAATTCTACTCTACTCC-------CT-----CTATTGGGATACGGGGAACCGCTC-CG-AAA-----A-----A--T-GTT-----------T-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTTA-TT-TC-----TTAG-A-AAAA----AAAA---GT----TT--TTATCTACGCCAT---TG-TTTTTTTT
gi|74800                      : ATAAAATG-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCT-TTTTTA----AGTAACT--AAGCGTCAT---TA--TAAATAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GATGTTGTGGAATATGTTGTACATAACTTATGCATAAAAT--AGGTTTAA-ACCAATT-----A-----T----------T---G----G--G--GA--------------GAGGCAATCT-GGGT--------------GT-TA--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTTCCGCTTGTTGTGGTAATTCTACTCTACTCCC-----ACT------T-TTGGGATACGGGGAACCGCTC-C--GAA-----AT----A--T-GTTTGAT------AT-AT---ATTAATCAC-T-AACTGCTGAGTACTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---TT----TT--TTATCTACGCCAA---TG-CTGTTTTT
gi|74803                      : ATAAAATT-TCCTTT-TCACAA-GGAGTAA-----------TTTTTG----A------------GTAAT---TA--TAAGTCT-----TTTATAGGTAA-AC-CAA----------------------ACTTT-------AGT--GGGCAT-AGAGCACTTAA---A-----TTATTGGGGTGG---G----G--G--GG------G-----G-GGGGCAGCCT-GCGG--------------GT-AG--GGTG-------TGGGAAGAGTGT---CCCTCTCACCCTGGCGGTGGAAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCACTATTGGGATAAGGGGAACCGCTC-T--GAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AATTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----Tttt
gi|74802                      : ATAAAATT-TACTTT-T-AAAA-GGAGCGGTTT----GCC-TTTTTG----AGTAACT--TA--------------TAAATGT-----TTTGTAGGTAA-AT-GCT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCATAAGAGCACTTCA---A-----T----------TATTG----G--G--GA--------------GAGGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGT---CCCTCTGCCGCTGGTGGCGATAATTCTACTCGACTCCC-----GCTA-
gi|74807                      : ATAAATTT-TCTTTTAT-AAAA-GGAACAGCTTAATTGCC-TTTTTG----GGCAACT--T----TAATGGGCA--TAAGtt
gi|74806                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAG-GGAACGGCTT----ACT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCATAGT---TA--TAAATAT-----TTTGTAGGAAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GAGCGTAAGA--ATT------A-----T----------T---G----A--G--GA--------------GAGGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATGT---CCCTCTCCCGCTGagcatttcaattattggagagaggcaacctgggggtagtgtgtgggaagtgtgtctcccactggtggtgataattctactctactcccgctattggaaaatggggaaccgctccgaaaaatgtttgatatcttaaacaccaactgctgaattctactattt
gi|74808                      : ATAAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTT----GCC-TTGTTA----AGTAGC----AG---AAC---TA--TAAGTAT-----TCTGTAGGTAA-AT-GGT----------------------ACCTC-------AAT--AGGCGT-AGAGCACTTCA---A-----T----------T---ATT--G--G--GA------A-------GAGGCAACAA-GGA---------------GG-AGAATGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTGTCCCACTGG
gi|74804                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TGATTTT-----TTTGTGAGTAA-AC-GAT----------------------GCTTT-------AAT--GGGTGTAAGAGCTATTCA---A-----T----------
gi|74805                      : ATAAAAGT-TTCTTT-T-AAAA-GAATCGGCTT----GCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TAACTAA-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------ATT--TGGTGTATGAGCACTTCA---tatt
gi|74809                      : ATAAAATT-TTCTT--------------GGCT---------TTTTTG----AGTAACT--TCGCGTGAC---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GGT----------------------ACTTT-------AAT--GAGCCTAAGAGCAGTTAA---ATTAT-T----------G---A----G--G--GA--------------GAGGCAACCT-Gcttgtt
gi|74810                      : ATAAAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGATT----GCC-TTTTTG----AGTAACT----G----------A--TACATAT-----TTTGTAGGTAATAC-GTC----------------------GCTTT-------GAT--GGGTGTAAGAGCACTTCAGTTA-----T----------T---G----G--G--GA------
gi|74811                      : ATAAAGTT-TTCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTT----GTC-CTGTTC----AGTGACTAATGGGGTAAC---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGT
gi|74812                      : ATTAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACTGCTT----AC--TTTTTG----AACAACT--AAGTTTAAT---TA--TAAATAA-----TTTATAGGTAA-AT-GAT----------------------Aa
gi|74813                      : ATACAGTT-TCCTTT-T-GAAA-GGAACACCTT----GCC-TTTTTG----AGTAATT--TGGCGTATT---TAATCCAATAG-----TTTGT
gi|74814                      :   AAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACTGCTT----GCC-TTTTTG----AGTAACT--AAGCGTAAT---TA--TAAGTAT-----TT-GTATGTAA-TC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGTGAGAGCACTTCA---A-----TT---------GTT-G----G--G--GA--------------GAGGCAACCT-GGGG--------------GT-AA--TGTG-------TGTGAAAGGTGC---CCCTCTCCCGTTGGTGGTAATAATTCTACTCTACTCCC-----GCTATTCGCTATTGGGATACGTGGAACCGCTC-C--AAA-----A-----A--A-GTTTC--------AT-AT---CTTAAACAC-G-TACTGCTGAATTCTACTTA-TA-TC-----TTATCATAAAA----TATG---GT----TG--TTATTTACGCCAA---TG-TTTTTTT
gi|74815                      :   AAAAGT-TCCTTT-A-AAAA-GGAACGGCTT----GCC-CTTTTG----AGTAACT--AAGCGTTAG---TA--TAAGTAT-----TTGGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGTAAGAGCACTTCA---G-----TTATT------G---G----G--G--GAGTGGGGA-----G-GAGGCAAGTT-TGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGAGAAAAGTGC---CCCTCTCCCGCTGGTGGAGGTATTTCTACTCTACTCC------------------TGGGATAAGGCGAATCGCTT-C--GAA-----A-----C--C-TTTTG--------GT-AT---CTTAAACAC-T-
gi|74816                      :    AAATTGTCCTTT-T-AAAA-GGAATGGCTT-----------TTA----AGTAACC--TAGCGTAAT---GA--TAAATAT-----TTTGTAGGGTA-AC-ACT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCATAAGATCACTTTA---A-----T----------TATTG----G--G--GA--------------GAAGCAACTT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---ACCTGTCCCGCTGGTGGCAGTGATACTACTCTATTCCC-----GCT-------ATTTGGATAcaaataatgcattcta
gi|74817                      :      ATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGATT----GTC-TTGTTG----AGTAACT--GAGC---AT---TA--TAAGCA----------------A-AT-GGT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGCAAGAGAGCTGCA---A-----T----------AAGTG----G--G--GA--------------GAGGCAGCCT-GGAT--------------GTTAG--TGTG-------TGGGGGGGGTGG---CCCTCTCCCGCTGGAGGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----ACTA----TTAT---GATACGGGGTACTGCTC-C--GAAACTTGA-----A--C-GTTT---------AT-AT---c
gi|74818                      :                -T-AAAATGGAACGGCCT----ACC-TTTTCG----AGTAATT--TAGCGTAAC---TA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGTGTATGAGCACTTCA---A-----T----------T---A----TTTG--GA------ATGTGGG-GACGCAACCT-GGGT--------------GT-AG--TGTG-------TGGGA-GAGTGT---CCCTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTTTACTTTTCTCCC-----GCTT-CCACTATTGAGATACGGAGAACTGCTC-C--GAA-----T-----A--T-GTTTGAT------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTACTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----CATG---GT----TG--TTATTTACGCCAA---CG-TTGTTTTT
gi|74819                      :                  -AAAA-GGAACGGTTT----GCC-TTTTTG----AGTAAC-----------T---TA--TACGTA------TTTGTAGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--TTGTGAAAGAGCACTTTA---T-----T----------T---G----T--T--GC------A-----GAGAGGCATCCT-GGGA--------------GT-AG--TG
gi|74820                      :                     AA-TGAACGGCTT----GCC-TTTTTG----AGTAATT--CAGCGTTAT---TA--TAAATAT-----TTTGTAAATAA-AC-GAT----------------------TCTTT-------TAT--GGGCGTACAAATACTTCATTTA-----T----------T---T----G--G--GA--------------GAAGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGG-----GTGT---CTCCCTCCCGCTGGAGGCTGTAAGTCTGCT--------------CTA-CCACTATTGAGATACGAGAAAC
gi|74821                      :                            CGGCTT----GTC-TTTTTG----AGTAACT--TA--------------TACGTAT-----TT-GTTGGTAA-AC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--T----TGAGAGCACTTCA---G-----T----------T---G----T--T--GC------AT----A-GAGGCAACCT-TGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTCTCGCTGTTAGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----G--A-----TATTTGAATATGGGGGACCGCTC-C--GAAACTTGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTACATTCTACTCATTT-TT-----TTA--C-AAAA----TATG---GT----TG--TTATCTACGCCAA---TG-TTTTTCTTcacacacacacaacacttggatcttggatgtattttaaa
gi|74822                      :                                 T----GCC-ATTTTG----GGTAACT--AAGCGTAAT---TA--TAAGTAC-----TTTGTAGAT-A-ACTGAC----------------------ACTTT-------GAT--AGGCGTAAGAGCAATTCA---AT----T----------A---T----T--G--GA------G-----A-GAGGCAACCT-GTGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTCACGCTGATGGCGGTA---CTA--CTACTT------------CCGCTATTTGGATACTTGGAACCGCTC-C--GGAACATGA-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-ATAA----CATGAAAGTGACATGGATTA--TACACGAAAC-TGTTTATTTTT
gi|74823                      :                                 T----GCT-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---AA--TAAGTAT-----TTTGTAGGT-A-ACTGGT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGCAAGAGCACTT-------------------------------------GA------A-----------CAAT----------------------T-AT--TG-G-------TGAGAGGTGTTT---TCT-CTCACGCTGGTAGCGATACTACTACTCTACTTCC-----GCTA-------TTTGGATACTTAGAACCGCTT-C--GAA-----ATATGAA--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTAG-A-AAAA----TATA---AT----TG--TTATCTACGCCAA---TG-TTTTTTT
gi|74824                      :                                           TTTTG----AGTAACT--TAGCGTAAT---TA--TAAGTATATAATTTTGTAGGTAA-TC-GAT----------------------ACTTT-------AAT--GGGCGTAAGAGCACTTCA---ATTATTT----------G---G----G-------------------G-GAGGTAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAG
gi|74807                      :                                                                                                           ----------------------ACTTT-------AAT--GGGCATAAGAGCATTTCA---A-----T----------T---A----TT-G--GA------G-----A-GAGGCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGTGTGT---C----TCCCACTGGTGGTGATAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGAAAATGGGGAACCGCTC-CG-AAA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-Tg
gi|74825                      :                                                                                                        ataaattttcttttataaaaggaacagcttaattgcctttttgggcaTGAAAGCACTTCA---AATACTT----------G---G----G--A--GA----------------GTCAAACT-GGGA--------------GA-AG--TGT---------GGGAAGAGTGT---TTCTCTACCGCTGATGGGGGTA
gi|74827                      :                                                                                                                                                                    ---A-----T----------T---G----G--G--GA--------------GAGGCAACCT-GTGG--------------GT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTGT---CCCTCTCCCGCTGTTGGCGGTAATTCTGCTCTTCTCCT-----GCTA-C------TGGAATACGGTGAACTGCTC-C--GAA-----A-----AT-T-GTTTG--------AT-ATATATTT--ACAC-T-AACTGGTGAATACAACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---GT----TA--TTATCTACGCCAATGCTG-TTGTTTTT
gi|74826                      :                                                                                                                                                                                             caatt--G--GA------G-----A-GAGCCAACCT-GGGG--------------GT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTGT---CCCTCTCCCGCTGATGGCGGTAATTTTGCTCTACTC------------CCGCTATT-GGATACGGGGTACCGCTC-CGAAAA-----A-----A--T-GTTTGATATATATAT-AT---ATCAAACAC-T-TACTACTGAATACTACTCC-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATGT--TT----TT--TTACCTGCGCCAT---TG-CGATTTTT
gi|74828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                 caattattCTCCAGCTTGTGGCGGTAACTCTACTCTACTCCC-----GC-A------AATGGGATACGGTGAACCGCTCAT--AAACTTG-A-----A--A-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---GT----TG--TTATCTACGTCAA---TG-TTGTTTTTtt
gi|74829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GCAACTCTACTCTACTCCC-----GCTA-------TTTGGATACGTGGAACCGCTC-G--GAA-----ACTTGAA--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-TTAACGACAGAATTCTACTCA-TT-TC-----TTA--G-AAAG----TATG---AT----TG--TTATCTAAGTCGA---TT-TTAATTTT
gi|74830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               GATACGAGGAACCGCCC-T--AAA-----A-----A--T-AATTG--------AT-GT---CTTAAACAC-C-AACTGCATAATTCTACTAA-TT-TC-----TTA--G-AAAC----TATA---A----------TATATACTCCAA---
gi|74833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA-----A-----A--T-GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-Tcagttt
gi|74832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AA-----A-----A--TAGTTT---------AT-AT---CTTGAATAC-C-AGCTGTTGAATTCCACTCA-TT-TT-----TTT--G-AAAA----TATA---TT----AT--TTATTTATGCAAA---TG-
gi|74831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            t-----A--T-ATTTGT-------AT-AT---CTCAAACAC-C-AACTGCTGTATCCTACTCA-TT-TC-----TTA--A-AAGA----TATA---GT----TG--TTATTTACGCCAA---TG-T
gi|74834                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctgaaatttaaagttggTTG--------AT-AT---TTTAAAGAC-T-ATCTGCTGAATTCTTCTCA-AT-TC-----TTA--G-AAAA----TATG---AT----TG--TTATCTACGCCAA---TG-TTTTTTTT
gi|74835                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTG--------ATCAT---TATAAACTC-T-AACTGTTGAATTCTACTAA-TT-TC-----TTC--G-AAAA----TATG---TT----TG--TTATTTTCACCGT---TA-TTGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                          111            4444444444444444444444444444444444444444                                                                                                 3333333333333333                             33333                                                                                                                                   
lowQualScore                  :         1      1 2    1             1      2222       444     3333333   2222  11      22222 22222       44444444   111 1   1         1                   111 2222 66666 3333333333333333333333333333333333333333             77777777777777   1  11    4444444           11   1                                  0000000000000000    1                    55  00000 77777 44 44444     77777777  1  222  11       8 5                   1  1  33333  222  4    3333    1                 222    1     
lowQualScore                  :         .      . .    .             .      ....       ...     .......   ....  ..      ..... .....       ........   ... .   .         .                   ... .... ..... ........................................             ..............   .  ..    .......           ..   .                                  ................    .                    ..  ..... ..... .. .....     ........  .  ...  ..       . .                   .  .  .....  ...  .    ....    .                 ...    .     
lowQualScore                  :         3      3 5    2             1      3333       000     5555555   3333  55      77777 77777       00000000   999 1   1         2                   444 3333 11111 1111111111111111111111111111111111111111             11111111111111   2  77    1111111           88   3                                  0000000000000000    2                    88  00000 77777 44 55555     33333333  2  111  77       8 0                   3  3  44444  555  3    0000    4                 888    0     
consensus                     : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
Reference ( family-475 )      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
gi|74788                      : ATAACAAT-TCCTTT-C-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCAT-------AAT----TA--AAAATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGG--------GCACTTT---------T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAGCCTAGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGGTG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGAAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTT-----------T-AT---CT--TAAACACTT-AACGACTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTATTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74789                      : ATAAAATT-TCCTTC-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTC---A-ACA-ATACTTAAA-TGGGCATAAGAGCACTTCA---A----T-----G----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGA--------------CGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-TTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCA--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTAAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AA-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74790                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGGT-TTTTTT----AGTAACT--TAACGT-------AA------------GTT-----T-----TTTGTAG--------GTA-------------------TGAGCGTAAGAGTACTTCAGTTA----T-----T----------A---A-----GG---A------A--------AAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCGGCTGGCGGCGGTAACTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCCCGG--AAACTTCA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGTTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTTTTTTT
gi|74791                      : ATAATATT-TCCTTT-T-AAAA-GAAACGGCTTGCT-TTTTTTTTTTAGTAACT--TAACGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TAAGCCTAAGAGTACTTCA---A----TAA---T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAGTCTGGG--------------GGT-AG--GGTC-------TTGGAAGGGTG--TCC-CACTCCCACAGGTGGCGATAACACCACTCTACTCAC-----GCTA-----TATT-GGATACGGGGAATCGCACAG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TGTG-GTTGTTATCTACGTCAA---TATTTTTTT
gi|74792                      : ATAAATTT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-ATTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AGT----TA--TACGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATATTTTAA-TTGGTGTAAGAGCACTTCA---G----T-----T----------C---T-----TG---C------A-----GAGAGGCAACCTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--ACC-CTCTCCCGCTGGTATCGGTAATACTACTCTACTT------------CCGCTATTGGGATACGGGTAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-TACGGCTACATTCCACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTGTTATC
gi|74793                      : ATAAAATA-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTT----AGTAGCT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTG-----T-----TTGATAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGAGCGTAAGAGTACTTAATTTA----T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCA---TTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAGGGGTG--TCC-TTCTCCCGCTGGTGGCAGTATTTCTACTCTACTT------------CCGCTATTGGAGTACGGGGAACCGCTCGG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TTAAAACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TTTG-GTTGTTTTCTACGTCAA---TGATGTTTTT
gi|74794                      : ATAAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TACGTA-----G-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTTA-TTTA-GTAAGAGCACTTCA---G----T-----T----------G---T-----TG---C------A-----GAGCGGCAACTTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TAC-CTCTCCCGCTGGTAGCGGTAATACTACTCTATTTCC-----GCT--------TTTGGATACGGGGAACCGCTCCG--AAACTGGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TGAACGGCTACATTATACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGt
gi|74795                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTTTTG----AATAACT--TTGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATAGGTTAA-TGGGCGAAATGACACTTCA---A----TAATTGT----------G---G-----GGTTGG------G-----A-GAGGCAACTTTGG--------------G-T-AG--TGTG-------TGGGAAGCGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGAAAATCTACTTTACTCCC-----G-------------GGATAAGGCAAATCGCTCCG--AA-----A-----AA-T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TTATT-----TT---AG-AAAATAATTATG-GTCGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74796                      : ATAAAATT-TCCATT-T-AGAA-GAAACCGCTTGCT-GTTTTG----AGTAACT---AGCAT-------AAT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAG-TGGGC--------ACTT----------T-----T----------T---G-----AG---A------A-----G--AGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCC-CTCTCCCGCTGATTGTGGTAATTCTACTCTACTCC-------CT-----CTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTT-----------T-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTTA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----AAAA-GTTTTTATCTACGCCAT---TGTTTTTTTT
gi|74797                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-GAAA-GGAGCGACTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCAT-------AGT----TA--TTAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACA-ATACTTTAA-TGGGAGTAACAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-G-----G-----------------G-GAGGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGTATAC-CTCTCCTGCT--T-------------CTCTACTCCCTGGTAACTA-CCGCTATTCAGATAAGGCGAATCGCTCTGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GCTGTTATTTAAGCCAA-----TTATTT
gi|74798                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TGTTTG----AGTAA---------T-------AAT---------AAGTA-----T-----CCTGAAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----TATT-------G---GCTGCAGG---G------A-----C-GAAGCAACCTGGG--------------GGC-AG--TATG-------TGAGTATAGTG--TCC-CTCTCCTGCTGCTGGC---AATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTTTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TACG-GTTGTTATTTACTCCAA---TGTTGTTTTactttt
gi|74799                      : ATAAACTT-TCCTTT-TTAAAA-GGAACGGCTTGCCCTTTTTG----AGTAACTA-TAA-GT-------AAT----TA--TAGGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ATG-ATACTT-AA-TGGGC--AA------TTCA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACGTGGG--------------GGG-GG--GGGGGTATCTTTTGGAAGGGTG--TCA-CTTTCCCGCTGGTGGAGGTAATTCTACCCTACTCCC-----GCTA-------TTGGGATAAGGGGAACCGCTCCA--AA-----A-----AAAT-----ATTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTATTCA-TT-TC-----TT---A---------------GTTGTTATTTACGCCAA---TGTGTTTT
gi|74800                      : ATAAAATG-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTA----AGTAACT--AAGCGTCATTATAAATATTTTG--TAGGTAAACGAT-----GTTGTGGAATATGTTGTACATA-ACTTATGCATAAAATAGGTTTAA-ACCAATT-----A----T-----T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAATCTGGG--------------TGT-TA--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTTCCGCTTGTTGTGGTAATTCTACTCTACTCCC-----ACT------T-TTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----AT----A--T-----GTTTG--------AT-AT---ATATTAATCAC-T-AACTGCTGAGTACTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-TTTTTTATCTACGCCAA---TGCTGTTTTT
gi|74801                      : ATACAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-T-------------------------------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-GTACTTTAA-TGGTCATAAGAGCACTTCATTTA----T-----T----------G---G-----G-----------A-----G-GAGGCAACCGGGGGAGGGGGGGGGGGTGGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAATG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCTACAATT---CTCTTCTTCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGCAAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----G-TTG--------AT-AT---C---TACACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TT-TCGTTGATT---AGAAAAA----CATG-GTTATTATATACGCCAA---TGTCTTTTTTttt
gi|74802                      : ATAAAATT-TACTTT-T-AAAA-GGAGCGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TAAATG-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ATG-CTACTTTAA-TGGGCATAAGAGCACTTCA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-CTCTGCCGCTGGTGGCGATAATTCTACTCGACTCCC-----GCTA-
gi|74803                      : ATAAAATT-TCCTTT-TCACAA-GGAGTAA-------TTTTTG----A------------GT-------AAT----TA--TAAGTC-----T-----TTTATAG--------GTA---A-ACC-AAACTTTAG-TGGGCAT-AGAGCACTTAA---A----T-----TATTGGGGTGGG---G-----GG---G------G-----G-GGGGCAGCCTGCG--------------GGT-AG--GGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-CTCTCACCCTGGCGGTGGAAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCACTATTGGGATAAGGGGAACCGCTCTG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AATTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----Ttt
gi|74804                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TGATTT-----T-----TTTGTGA--------GTA---A-ACG-ATGCTTTAA-TGGGTGTAAGAGCTATTCA---A----T-----T----------
gi|74805                      : ATAAAAGT-TTCTTT-T-AAAA-GAATCGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAACTA-----A-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAT-TTGGTGTATGAGCACTTCA---C----T-----T----------G---att
gi|74806                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAG-GGAACGGCTTACT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCAT-------AGT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GAA---A-ACG-ATACTTTAA-TGAGCGTAAGA--ATT------A----T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCC-CTCTCCCGCTGtt
gi|74807                      : ATAAATTT-TCTTTTAT-AAAA-GGAACAGCT-----------------------------T-------AAT----T------GCC-----T-----TTT-TGG--------GCA---A--------CTTTAA-TGGGCATAAGAGCATTTCA---A----T-----T----------A---TT----GG---A------G-----A-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGTGTG-------TCTCCCACTGGTGGTGATAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGAAAATGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74808                      : ATAAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTGTTA----AGTAGC----AG----------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TCTGTAG--------GTA---A-ATG-GTACCTCAA-TAGGCGT-AGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-G-----GG---A------A-------GAGGCAACAAGGA--------------GG--AGAATGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTGTCCCACTGG
gi|74809                      : ATAAAATT-TTCTT--------------GGCT-----TTTTTG----AGTAACT--TCGCGT-------GAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-GTACTTTAA-TGAGCCTAAGAGCAGTTAAATTA----T-----T----------G---A-----GG---G------A-------GAGGCAACCTG
gi|74810                      : ATAAAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGCC-TTTTTG----AGTAACT----G------------------A--TACATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---ATACG-TCGCTTTGA-TGGGTGTAAGAGCACTTCAGTTA----T-----T----------G---G-----GG---A------
gi|74811                      : ATAAAGTT-TTCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGTC-CTGTTC----AGTGACTAATGGGGT-------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---
gi|74812                      : ATTAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTAC--TTTTTG----AACAACT--AAGTTT-------AAT----TA--TAAATA-----A-----TTTATAG--------GTA---A-ATG-ATA
gi|74813                      : ATACAGTT-TCCTTT-T-GAAA-GGAACACCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--TGGCGT-------ATT----TAATCCAATA-----G-----TTTGT
gi|74814                      :   AAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--AAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TT-GTAT--------GTA---A-TCG-ATACTTTAA-TGGGCGTGAGAGCACTTCA---A----T-----T----------GTT-G-----GG---G------A-----G--AGGCAACCTGGG--------------GGT-AA--TGTG-------TGTGAAAGGTG--CCC-CTCTCCCGTTGGTGGTAATAATTCTACTCTACTCCC-----GCTATTCGCTATTGGGATACGTGGAACCGCTCCA--AA-----A-----A--A-----GTTTC--------AT-AT---CT--TAAACAC-G-TACTGCTGAATTCTACTTA-TA-TC-----TTATCAT-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTTTTTTT
gi|74815                      :   AAAAGT-TCCTTT-A-AAAA-GGAACGGCTTGCC-CTTTTG----AGTAACT--AAGCGT-------TAG----TA--TAAGTA-----T-----TTGGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---G----T-----TATTG------G---G-----GG---AGTGGGGA-----G-GAGGCAAGTTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGAGAAAAGTG--CCC-CTCTCCCGCTGGTGGAGGTATTTCTACTCTACTCC------------------TGGGATAAGGCGAATCGCTTCG--AA-----A-----C--C-----TTTTG--------GT-AT---CT--TAAACAC-TCAAATAATGCATTCTA
gi|74816                      :    AAATTGTCCTTT-T-AAAA-GGAATGGCTT-------TTA----AGTAACC--TAGCGT-------AAT----GA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GGT---A-ACA-CTACTTTAA-TGGGCATAAGATCACTTTA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAAGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TAC-CTGTCCCGCTGGTGGCAGTGATACTACTCTATTC------------CCGCTATTTGGATAC
gi|74817                      :      ATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGTC-TTGTTG----AGTAACT--GAGC----------AT----TA--TAAGCA--------------------------------A-ATG-GTACTTTAA-TGGGCGCAAGAGAGCTGCA---A----TAAG--T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAGCCTGGA--------------TGTTAG--TGTG-------TGGGGGGGGTG--GCC-CTCTCCCGCTGGAGGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----ACTA----TTAT---GATACGGGGTACTGCTCCG--AAACTTGA-----A--C-----GTTT---------AT-AT---
gi|74818                      :                -T-AAAATGGAACGGCCTACC-TTTTCG----AGTAATT--TAGCGT-------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGTGTATGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-T-----GG---A------ATGTGGG-GACGCAACCTGGG--------------TGT-AG--TGTG-------TGGG-AGAGTG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTTTACTTTTCTCCC-----GCTT-CCACTATTGAGATACGGAGAACTGCTCCG--AA-----T-----A--T-----GTTTGAT------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTACTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----CATG-GTTGTTATTTACGCCAA---CGTTGTTTTT
gi|74819                      :                  -AAAA-GGAACGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TACGTA-----T-----TT-GTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TTTGTGAAAGAGCACTTTA---T----T-----T----------G---T-----TG---C------A-----GAGAGGCATCCTGGG--------------AGT-AG--TG
gi|74820                      :                     AA-TGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--CAGCGT-------TAT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAA--------ATA---A-ACG-ATTCTTTTA-TGGGCGTACAAATACTTCATTTA----T-----T----------T---G-----GG---A--------------GAAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------T-----GGGTG--TCT-CCCTCCCGCTGGAGGCTGTAAGTCTGCT--------------CTA-CCACTATTGAGATACGAGAAACCAC
gi|74821                      :                            CGGCTTGTC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TACGTA-----T-----TT-GTTG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TT----TGAGAGCACTTCA---G----T-----T----------G---T-----TG---C------AT----A-GAGGCAACCTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCTCGCTGTTAGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----G--A-----TATTTGAATATGGGGGACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTACATTCTACTCATTT-TT-----TT---AC-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTCTTacacacacaacacttggatcttggatgtattttaaa
gi|74822                      :                                 TGCC-ATTTTG----GGTAACT--AAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----C-----TTTGTAG--------ATA---A-CTG-ACACTTTGA-TAGGCGTAAGAGCAATTCA---A----T-----T----------AT--T-----GG---A------G-----A-GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCACGCTGATGGCGGTA---CTA--CTACTT------------CCGCTATTTGGATACTTGGAACCGCTCCG--GAACATGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-ATAA----CATG-
gi|74823                      :                                 TGCT-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----AA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-CTG-GTACTTTAA-TGGGCGCAAGAGCACTT--------------------------------------G---A------A-----------CAAT---------------------T-AT--TG-G-------TGAGA--GGTG--TTTTCTCTCACGCTGGTAGCGATACTACTACTCTACTTCC-----GCTA-------TTTGGATACTTAGAACCGCTTCG--AA-----ATATGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----TATA-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTaaagtgacatggattatacacgaaactgtttattttt
gi|74824                      :                                       TTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----TATAATTTTGTAG--------GTA---A-TCG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATTTG-----GG----------------G-GAGGTAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGG
gi|74825                      :                                                                                                                                             TGAAAGCACTTCA---AATACT-----T----------G---G-----GA------------------GAGTCAAACTGGG--------------AGA-AG--TGTG---------GGAAGAGTG--TTT-CTCTACCGCTGATGGGGGTA
gi|74826                      :                                                                                                                                                          ---A----T-----T----------G---G-----AG---A--------------GAGCCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGATGGCGGTAATTTTGCTCTACTC------------CCGCTATT-GGATACGGGGTACCGCTCCGAAAA-----A-----A--T-----GTTTGATATATATAT-AT---AT--CAAACAC-T-TACTACTGAATACTACTCC-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATGTTTTTTTACCTGCGCCAT---TGCGATTTTT
gi|74827                      :                                                                                                                                                     caatt---A----T-----T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGTTGGCGGTAATTCTGCTCTTCTCCT-----GCTA-C------TGGAATACGGTGAACTGCTCCG--AA-----A-----AT-T-----GTTTG--------AT-ATATATT--T--ACAC-T-AACTGGTGAATACAACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTATTATCTACGCCAATGCTGTTGTTTTTtt
gi|74828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             caattCTCCAGCTTGTGGCGGTAACTCTACTCTACTCCC-----GCAA------AT-GGGATACGGTGAACCGCTCAT--AA-----A-----C--TTGAAAGTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TTAACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTGTTTTT
gi|74829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCAACTCTACTCTACTCCC-----GCTA-------TTTGGATACGTGGAACCGCTCGG--AA-----ACTTGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TTAACGACAGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TATG-ATTGTTATCTAAGTCGA---TTTTAATTTT
gi|74830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GATACGAGGAACCGCCCTA--AA-----A-----A--T-----AATTG--------AT-GT---CT--TAAACAC-C-AACTGCATAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAC----TATA-A----TATATACTCCAA---
gi|74831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----A--T-----ATTTGT-------AT-AT---CT--CAAACAC-C-AACTGCTGTATCCTACTCA-TT-TC-----TT---AA-AAGA----TATA-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTcagttt
gi|74832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgaaatttaaagttgg--AA-----A-----A--TA----GTTT---------AT-AT---CT--TGAATAC-C-AGCTGTTGAATTCCACTCA-TT-TT-----TT---TG-AAAA----TATA-TTATTTATTTATGCAAA---TG
gi|74833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74834                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTG--------AT-AT---TT--TAAAGAC-T-ATCTGCTGAATTCTTCTCA-AT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74835                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTG--------ATCAT---TA--TAAACTC-T-AACTGTTGAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---CG-AAAA----TATG-TTTGTTATTTTCACCGT---TATTGTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                          111            4444444444444444444444444444444444444444                                                                                                 3333333333333333                             33333                                                                                                                                   
lowQualScore                  :         1      1 2    1             1      2222       444     3333333   2222  11      22222 22222       44444444   111 1   1         1                   111 2222 66666 3333333333333333333333333333333333333333             77777777777777   1  11    4444444           11   1                                  0000000000000000    1                    55  00000 77777 44 44444     77777777  1  222  11       8 5                   1  1  33333  222  4    3333    1                 222    1     
lowQualScore                  :         .      . .    .             .      ....       ...     .......   ....  ..      ..... .....       ........   ... .   .         .                   ... .... ..... ........................................             ..............   .  ..    .......           ..   .                                  ................    .                    ..  ..... ..... .. .....     ........  .  ...  ..       . .                   .  .  .....  ...  .    ....    .                 ...    .     
lowQualScore                  :         3      3 5    2             1      3333       000     5555555   3333  55      77777 77777       00000000   999 1   1         2                   444 3333 11111 1111111111111111111111111111111111111111             11111111111111   2  77    1111111           88   3                                  0000000000000000    2                    88  00000 77777 44 55555     33333333  2  111  77       8 0                   3  3  44444  555  3    0000    4                 888    0     
consensus                     : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
Reference ( family-475 )      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
gi|74788                      : ATAACAAT-TCCTTT-C-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCAT-------AAT----TA--AAAATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGG--------GCACTTT---------T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAGCCTAGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGGTG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGAAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTT-----------T-AT---CT--TAAACACTT-AACGACTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTATTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74789                      : ATAAAATT-TCCTTC-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTC---A-ACA-ATACTTAAA-TGGGCATAAGAGCACTTCA---A----T-----G----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGA--------------CGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-TTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCA--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTAAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AA-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74790                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGGT-TTTTTT----AGTAACT--TAACGT-------AA------------GTT-----T-----TTTGTAG--------GTA-------------------TGAGCGTAAGAGTACTTCAGTTA----T-----T----------A---A-----GG---A------A--------AAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCGGCTGGCGGCGGTAACTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCCCGG--AAACTTCA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGTTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTTTTTTT
gi|74791                      : ATAATATT-TCCTTT-T-AAAA-GAAACGGCTTGCT-TTTTTTTTTTAGTAACT--TAACGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TAAGCCTAAGAGTACTTCA---A----TAA---T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAGTCTGGG--------------GGT-AG--GGTC-------TTGGAAGGGTG--TCC-CACTCCCACAGGTGGCGATAACACCACTCTACTCAC-----GCTA-----TATT-GGATACGGGGAATCGCACAG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TGTG-GTTGTTATCTACGTCAA---TATTTTTTT
gi|74792                      : ATAAATTT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-ATTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AGT----TA--TACGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATATTTTAA-TTGGTGTAAGAGCACTTCA---G----T-----T----------C---T-----TG---C------A-----GAGAGGCAACCTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--ACC-CTCTCCCGCTGGTATCGGTAATACTACTCTACTT------------CCGCTATTGGGATACGGGTAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-TACGGCTACATTCCACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTGTTATC
gi|74793                      : ATAAAATA-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTT----AGTAGCT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTG-----T-----TTGATAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGAGCGTAAGAGTACTTAATTTA----T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCA---TTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAGGGGTG--TCC-TTCTCCCGCTGGTGGCAGTATTTCTACTCTACTT------------CCGCTATTGGAGTACGGGGAACCGCTCGG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TTAAAACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TTTG-GTTGTTTTCTACGTCAA---TGATGTTTTT
gi|74794                      : ATAAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TACGTA-----G-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTTA-TTTA-GTAAGAGCACTTCA---G----T-----T----------G---T-----TG---C------A-----GAGCGGCAACTTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TAC-CTCTCCCGCTGGTAGCGGTAATACTACTCTATTTCC-----GCT--------TTTGGATACGGGGAACCGCTCCG--AAACTGGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TGAACGGCTACATTATACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGt
gi|74795                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTTTTG----AATAACT--TTGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATAGGTTAA-TGGGCGAAATGACACTTCA---A----TAATTGT----------G---G-----GGTTGG------G-----A-GAGGCAACTTTGG--------------G-T-AG--TGTG-------TGGGAAGCGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGAAAATCTACTTTACTCCC-----G-------------GGATAAGGCAAATCGCTCCG--AA-----A-----AA-T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TTATT-----TT---AG-AAAATAATTATG-GTCGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74796                      : ATAAAATT-TCCATT-T-AGAA-GAAACCGCTTGCT-GTTTTG----AGTAACT---AGCAT-------AAT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAG-TGGGC--------ACTT----------T-----T----------T---G-----AG---A------A-----G--AGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCC-CTCTCCCGCTGATTGTGGTAATTCTACTCTACTCC-------CT-----CTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTT-----------T-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTTA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----AAAA-GTTTTTATCTACGCCAT---TGTTTTTTTT
gi|74797                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-GAAA-GGAGCGACTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCAT-------AGT----TA--TTAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACA-ATACTTTAA-TGGGAGTAACAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-G-----G-----------------G-GAGGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGTATAC-CTCTCCTGCT--T-------------CTCTACTCCCTGGTAACTA-CCGCTATTCAGATAAGGCGAATCGCTCTGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GCTGTTATTTAAGCCAA-----TTATTT
gi|74798                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TGTTTG----AGTAA---------T-------AAT---------AAGTA-----T-----CCTGAAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----TATT-------G---GCTGCAGG---G------A-----C-GAAGCAACCTGGG--------------GGC-AG--TATG-------TGAGTATAGTG--TCC-CTCTCCTGCTGCTGGC---AATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTTTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TACG-GTTGTTATTTACTCCAA---TGTTGTTTTactttt
gi|74799                      : ATAAACTT-TCCTTT-TTAAAA-GGAACGGCTTGCCCTTTTTG----AGTAACTA-TAA-GT-------AAT----TA--TAGGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ATG-ATACTT-AA-TGGGC--AA------TTCA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACGTGGG--------------GGG-GG--GGGGGTATCTTTTGGAAGGGTG--TCA-CTTTCCCGCTGGTGGAGGTAATTCTACCCTACTCCC-----GCTA-------TTGGGATAAGGGGAACCGCTCCA--AA-----A-----AAAT-----ATTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTATTCA-TT-TC-----TT---A---------------GTTGTTATTTACGCCAA---TGTGTTTT
gi|74800                      : ATAAAATG-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTA----AGTAACT--AAGCGTCATTATAAATATTTTG--TAGGTAAACGAT-----GTTGTGGAATATGTTGTACATA-ACTTATGCATAAAATAGGTTTAA-ACCAATT-----A----T-----T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAATCTGGG--------------TGT-TA--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTTCCGCTTGTTGTGGTAATTCTACTCTACTCCC-----ACT------T-TTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----AT----A--T-----GTTTG--------AT-AT---ATATTAATCAC-T-AACTGCTGAGTACTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-TTTTTTATCTACGCCAA---TGCTGTTTTT
gi|74801                      : ATACAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-T-------------------------------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-GTACTTTAA-TGGTCATAAGAGCACTTCATTTA----T-----T----------G---G-----G-----------A-----G-GAGGCAACCGGGGGAGGGGGGGGGGGTGGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAATG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCTACAATT---CTCTTCTTCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGCAAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----G-TTG--------AT-AT---C---TACACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TT-TCGTTGATT---AGAAAAA----CATG-GTTATTATATACGCCAA---TGTCTTTTTTttt
gi|74802                      : ATAAAATT-TACTTT-T-AAAA-GGAGCGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TAAATG-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ATG-CTACTTTAA-TGGGCATAAGAGCACTTCA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-CTCTGCCGCTGGTGGCGATAATTCTACTCGACTCCC-----GCTA-
gi|74803                      : ATAAAATT-TCCTTT-TCACAA-GGAGTAA-------TTTTTG----A------------GT-------AAT----TA--TAAGTC-----T-----TTTATAG--------GTA---A-ACC-AAACTTTAG-TGGGCAT-AGAGCACTTAA---A----T-----TATTGGGGTGGG---G-----GG---G------G-----G-GGGGCAGCCTGCG--------------GGT-AG--GGTG-------TGGGAAGAGTG--TCC-CTCTCACCCTGGCGGTGGAAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCACTATTGGGATAAGGGGAACCGCTCTG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AATTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----Ttt
gi|74804                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TGATTT-----T-----TTTGTGA--------GTA---A-ACG-ATGCTTTAA-TGGGTGTAAGAGCTATTCA---A----T-----T----------
gi|74805                      : ATAAAAGT-TTCTTT-T-AAAA-GAATCGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAACTA-----A-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAT-TTGGTGTATGAGCACTTCA---C----T-----T----------G---att
gi|74806                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAG-GGAACGGCTTACT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCAT-------AGT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GAA---A-ACG-ATACTTTAA-TGAGCGTAAGA--ATT------A----T-----T----------G---A-----GG---A--------------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCC-CTCTCCCGCTGtt
gi|74807                      : ATAAATTT-TCTTTTAT-AAAA-GGAACAGCT-----------------------------T-------AAT----T------GCC-----T-----TTT-TGG--------GCA---A--------CTTTAA-TGGGCATAAGAGCATTTCA---A----T-----T----------A---TT----GG---A------G-----A-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGTGTG-------TCTCCCACTGGTGGTGATAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGAAAATGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74808                      : ATAAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTGTTA----AGTAGC----AG----------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TCTGTAG--------GTA---A-ATG-GTACCTCAA-TAGGCGT-AGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-G-----GG---A------A-------GAGGCAACAAGGA--------------GG--AGAATGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTGTCCCACTGG
gi|74809                      : ATAAAATT-TTCTT--------------GGCT-----TTTTTG----AGTAACT--TCGCGT-------GAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-GTACTTTAA-TGAGCCTAAGAGCAGTTAAATTA----T-----T----------G---A-----GG---G------A-------GAGGCAACCTG
gi|74810                      : ATAAAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGCC-TTTTTG----AGTAACT----G------------------A--TACATA-----T-----TTTGTAG--------GTA---ATACG-TCGCTTTGA-TGGGTGTAAGAGCACTTCAGTTA----T-----T----------G---G-----GG---A------
gi|74811                      : ATAAAGTT-TTCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGTC-CTGTTC----AGTGACTAATGGGGT-------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---
gi|74812                      : ATTAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTAC--TTTTTG----AACAACT--AAGTTT-------AAT----TA--TAAATA-----A-----TTTATAG--------GTA---A-ATG-ATA
gi|74813                      : ATACAGTT-TCCTTT-T-GAAA-GGAACACCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--TGGCGT-------ATT----TAATCCAATA-----G-----TTTGT
gi|74814                      :   AAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--AAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TT-GTAT--------GTA---A-TCG-ATACTTTAA-TGGGCGTGAGAGCACTTCA---A----T-----T----------GTT-G-----GG---G------A-----G--AGGCAACCTGGG--------------GGT-AA--TGTG-------TGTGAAAGGTG--CCC-CTCTCCCGTTGGTGGTAATAATTCTACTCTACTCCC-----GCTATTCGCTATTGGGATACGTGGAACCGCTCCA--AA-----A-----A--A-----GTTTC--------AT-AT---CT--TAAACAC-G-TACTGCTGAATTCTACTTA-TA-TC-----TTATCAT-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTTTTTTT
gi|74815                      :   AAAAGT-TCCTTT-A-AAAA-GGAACGGCTTGCC-CTTTTG----AGTAACT--AAGCGT-------TAG----TA--TAAGTA-----T-----TTGGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---G----T-----TATTG------G---G-----GG---AGTGGGGA-----G-GAGGCAAGTTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGAGAAAAGTG--CCC-CTCTCCCGCTGGTGGAGGTATTTCTACTCTACTCC------------------TGGGATAAGGCGAATCGCTTCG--AA-----A-----C--C-----TTTTG--------GT-AT---CT--TAAACAC-TCAAATAATGCATTCTA
gi|74816                      :    AAATTGTCCTTT-T-AAAA-GGAATGGCTT-------TTA----AGTAACC--TAGCGT-------AAT----GA--TAAATA-----T-----TTTGTAG--------GGT---A-ACA-CTACTTTAA-TGGGCATAAGATCACTTTA---A----T-----TATT-------G---G-----GG---A--------------GAAGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TAC-CTGTCCCGCTGGTGGCAGTGATACTACTCTATTC------------CCGCTATTTGGATAC
gi|74817                      :      ATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGTC-TTGTTG----AGTAACT--GAGC----------AT----TA--TAAGCA--------------------------------A-ATG-GTACTTTAA-TGGGCGCAAGAGAGCTGCA---A----TAAG--T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAGCCTGGA--------------TGTTAG--TGTG-------TGGGGGGGGTG--GCC-CTCTCCCGCTGGAGGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----ACTA----TTAT---GATACGGGGTACTGCTCCG--AAACTTGA-----A--C-----GTTT---------AT-AT---
gi|74818                      :                -T-AAAATGGAACGGCCTACC-TTTTCG----AGTAATT--TAGCGT-------AAC----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGTGTATGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATT-T-----GG---A------ATGTGGG-GACGCAACCTGGG--------------TGT-AG--TGTG-------TGGG-AGAGTG--TCC-CTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTTTACTTTTCTCCC-----GCTT-CCACTATTGAGATACGGAGAACTGCTCCG--AA-----T-----A--T-----GTTTGAT------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTACTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----CATG-GTTGTTATTTACGCCAA---CGTTGTTTTT
gi|74819                      :                  -AAAA-GGAACGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TACGTA-----T-----TT-GTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TTTGTGAAAGAGCACTTTA---T----T-----T----------G---T-----TG---C------A-----GAGAGGCATCCTGGG--------------AGT-AG--TG
gi|74820                      :                     AA-TGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--CAGCGT-------TAT----TA--TAAATA-----T-----TTTGTAA--------ATA---A-ACG-ATTCTTTTA-TGGGCGTACAAATACTTCATTTA----T-----T----------T---G-----GG---A--------------GAAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------T-----GGGTG--TCT-CCCTCCCGCTGGAGGCTGTAAGTCTGCT--------------CTA-CCACTATTGAGATACGAGAAACCAC
gi|74821                      :                            CGGCTTGTC-TTTTTG----AGTAACT--TA----------------------TACGTA-----T-----TT-GTTG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TT----TGAGAGCACTTCA---G----T-----T----------G---T-----TG---C------AT----A-GAGGCAACCTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCTCGCTGTTAGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----G--A-----TATTTGAATATGGGGGACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACACTT-AACGGCTACATTCTACTCATTT-TT-----TT---AC-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTCTTacacacacaacacttggatcttggatgtattttaaa
gi|74822                      :                                 TGCC-ATTTTG----GGTAACT--AAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----C-----TTTGTAG--------ATA---A-CTG-ACACTTTGA-TAGGCGTAAGAGCAATTCA---A----T-----T----------AT--T-----GG---A------G-----A-GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCACGCTGATGGCGGTA---CTA--CTACTT------------CCGCTATTTGGATACTTGGAACCGCTCCG--GAACATGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-ATAA----CATG-
gi|74823                      :                                 TGCT-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----AA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-CTG-GTACTTTAA-TGGGCGCAAGAGCACTT--------------------------------------G---A------A-----------CAAT---------------------T-AT--TG-G-------TGAGA--GGTG--TTTTCTCTCACGCTGGTAGCGATACTACTACTCTACTTCC-----GCTA-------TTTGGATACTTAGAACCGCTTCG--AA-----ATATGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----TATA-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTaaagtgacatggattatacacgaaactgtttattttt
gi|74824                      :                                       TTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----TATAATTTTGTAG--------GTA---A-TCG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------ATTTG-----GG----------------G-GAGGTAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGG
gi|74825                      :                                                                                                                                             TGAAAGCACTTCA---AATACT-----T----------G---G-----GA------------------GAGTCAAACTGGG--------------AGA-AG--TGTG---------GGAAGAGTG--TTT-CTCTACCGCTGATGGGGGTA
gi|74826                      :                                                                                                                                                          ---A----T-----T----------G---G-----AG---A--------------GAGCCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGATGGCGGTAATTTTGCTCTACTC------------CCGCTATT-GGATACGGGGTACCGCTCCGAAAA-----A-----A--T-----GTTTGATATATATAT-AT---AT--CAAACAC-T-TACTACTGAATACTACTCC-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATGTTTTTTTACCTGCGCCAT---TGCGATTTTT
gi|74827                      :                                                                                                                                                     caatt---A----T-----T----------G---G-----GG---A--------------GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGTTGGCGGTAATTCTGCTCTTCTCCT-----GCTA-C------TGGAATACGGTGAACTGCTCCG--AA-----A-----AT-T-----GTTTG--------AT-ATATATT--T--ACAC-T-AACTGGTGAATACAACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTATTATCTACGCCAATGCTGTTGTTTTTtt
gi|74828                      :                                                                                                                                                                                                                                                                             caattCTCCAGCTTGTGGCGGTAACTCTACTCTACTCCC-----GCAA------AT-GGGATACGGTGAACCGCTCAT--AA-----A-----C--TTGAAAGTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TTAACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTGTTTTT
gi|74829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GCAACTCTACTCTACTCCC-----GCTA-------TTTGGATACGTGGAACCGCTCGG--AA-----ACTTGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-TTAACGACAGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TATG-ATTGTTATCTAAGTCGA---TTTTAATTTT
gi|74830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GATACGAGGAACCGCCCTA--AA-----A-----A--T-----AATTG--------AT-GT---CT--TAAACAC-C-AACTGCATAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAC----TATA-A----TATATACTCCAA---
gi|74831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     -----A--T-----ATTTGT-------AT-AT---CT--CAAACAC-C-AACTGCTGTATCCTACTCA-TT-TC-----TT---AA-AAGA----TATA-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTcagttt
gi|74832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ctgaaatttaaagttgg--AA-----A-----A--TA----GTTT---------AT-AT---CT--TGAATAC-C-AGCTGTTGAATTCCACTCA-TT-TT-----TT---TG-AAAA----TATA-TTATTTATTTATGCAAA---TG
gi|74833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          t--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74834                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTG--------AT-AT---TT--TAAAGAC-T-ATCTGCTGAATTCTTCTCA-AT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74835                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TTG--------ATCAT---TA--TAAACTC-T-AACTGTTGAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---CG-AAAA----TATG-TTTGTTATTTTCACCGT---TATTGTTT


blockSeqs                     :         G      A T    T             C      TTTT       AAT     CATTATA   ATTT  AT      AACGA ATAAT       AATATGTT   CAT T   T         A                   GTT ATAC AATTG ATTGGGGTGGGGGGGGG                                    GAGGGGGGGGGGGT   T  AA    GTATCTT           TA   T                                  CCTGGTAACTACCGC     G                    AA  ACTTC TATGA AA TGAAA     ATATATAT  C  ATA  AT       T G                   T  A  GTTGA  ATC  A    TAAT    T                 TGC    G
blockSeqs                     :         .      . C    .             .      .          AT      .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   TTT .    AAG   ATTGGGGGAGTGGGGAG                                    .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTATTCGC         G                    A   ACTTG CTTGA A  A         AT        .  .    .        T C                   .  .  .      .    A    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   TTT .    AA    ATTGGCTGCAGGGAC                                      .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTACCGC          G                    A   ACTTG T     T  .         T         .  .    .        T T                   .  .  .      .    A    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   ATT .    .     ATTTGGAATGTGGG                                       .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTACCGC          G                    A   ACTTG .     .  .         .         .  .    .        T T                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   GTT .    .     GGGGTTGGGA                                           .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTACCGC          T                    .   ACTGG .     .  .         .         .  .    .        T .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   TTT .    .     GTTGGGGAG                                            .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTACCAC          G                    .   ACTTG .     .  .         .         .  .    .        T .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     CTTGCAGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTTCCAC          C                    .   ACTTG .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      A
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GTTGCAGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCACTAT             G                    .   ACATG .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGGGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CTACCAC             G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGGGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CTGCTAC             G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          A       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGAGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  ACGCTA              G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGGAA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTA              G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGGGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTA              G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GTTGCAGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCAA              G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GTTGCATA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCTA              G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGAGA                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCGCT               T                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      A
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          A       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTTGGGG                                             .                .  .     .                 .    .                                  CCACT               G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGGAAG                                              .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          A       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     TGAGAAG                                              .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                T                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      A
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          A       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     AAGGAA                                               .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                T                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      T
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     ATTGGG                                               .                .  .     .                 .    .                                  CCTC                T                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .      G
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          G       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GAGGGA                                               .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .       
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GAGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                G                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .       
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GAGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                  CCGA                T                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                 .       
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          C       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                .                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                         
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGAG                                                .                .  .     .                 .    .                                  CCGC                .                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                         
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          A       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GAGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                  CCG                 .                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .      .    .    .       .                         
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                  C                   .                    .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .  .                                                  
blockSeqs                     :         .      . .    .             .      .          T       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     TGGGA                                                .                .  .     .                 .    .                                                                           .   .     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .                                                     
blockSeqs                     :                . .    .             .      .          .       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGAGA                                                .                .  .     .                 .    .                                                                                     .     .  .         .         .  .    .        . .                   .  .                                                     
blockSeqs                     :                  .    .             .      .          .       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGGA                                                .                .  .     .                                                                                                                               .         .  .    .        . .                                                                            
blockSeqs                     :                       .             .      .          .       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GGGA                                                 .                .  .                                                                                                                                     .         .  .                                                                                            
blockSeqs                     :                                     .      .          .       .         .     .       .     .           .          .   .   .         .                   .   .    .     GAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      
blockSeqs                     :                                     .      .          .       .         .     .       .     .           .          .   .   .                             .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                     .      .          .       .         .     .       .     .           .          .                                     .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              
blockSeqs                     :                                            .          .       .         .     .       .     .                                                            .   .    .                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                         ATTGGGGA********************************                                                                                                                                              *****
originalCons                  : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----T----------G---G-----GG---A------A-----G-GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
finalCons                     : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGT-------AAT----TA--TAAGTA-----T-----TTTGTAG--------GTA---A-ACG-ATACTTTAA-TGGGCGTAAGAGCACTTCA---A----T-----TATTGGGGA--------------------------------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCC-CTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CT--TAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                               3333333333333333                             33333                                                                                                                                 
lowQualScore                  :         1      1 2    1             1      2222       444          11       22222           1   5555555555    1  22222   11                 44444      1  444444444 66666666666666   777777777             77777777777777   1  11    4444444           11                                     0000000000000000    1                    55  00000 77777 44 44444     88888888  1  222         8 5                   1  1  33333  222  4    3333    1                 222    1     
lowQualScore                  :         .      . .    .             .      ....       ...          ..       .....           .   ..........    .  .....   ..                 .....      .  ......... ..............   .........             ..............   .  ..    .......           ..                                     ................    .                    ..  ..... ..... .. .....     ........  .  ...         . .                   .  .  .....  ...  .    ....    .                 ...    .     
lowQualScore                  :         3      3 5    2             1      3333       000          55       77777           1   0000000000    2  99999   66                 66666      1  333333333 66666666666666   333333333             11111111111111   2  77    1111111           88                                     0000000000000000    2                    88  00000 77777 44 55555     99999999  2  111         8 0                   3  3  44444  555  3    0000    4                 888    0     
consensus                     : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTAAGAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
Reference ( family-475 )      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTAAGAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCCCGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTNTTTTT
gi|74788                      : ATAACAAT-TCCTTT-C-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCATAATTA--AAAATAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGC--------ACTT-----T------TT---------G-------A------GGA---------GAGGCAGCCTAGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGGTG--TCCCTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGAAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTT-----------T-AT---CTTAAACACTT-AACGACTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTATTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74789                      : ATAAAATT-TCCTTC-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTCA-ACA----------ATAC-TT-----AAA--TGGGCATAAGAGCACTT-----CAATG-------------G-------G------GGAAG-------GAGGCAACCTGGA--------------CGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCCTTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCA--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTAAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AA-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74790                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGGT-TTTTTT----AGTAACT--TAACGTAA--------GTTT-----TTTGTAGGTA--------------------------------TGAGCGTAAGAGTACTT-----CAGTTA-TT---------A-------A------GGA---------AAAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCCGGCTGGCGGCGGTAACTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGGATACGGGGAACCGCCCGG--AAACTTCA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGTTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTTTTTTT
gi|74791                      : ATAATATT-TCCTTT-T-AAAA-GAAACGGCTTGCT-TTTTTTTTTTAGTAACT--TAACGTAATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TAAGCCTAAGAGTACTT-----CAA-TA-AT---------G-------A------GGA---------GAGGCAGTCTGGG--------------GGT-AG--GGTC-------TTGGAAGGGTG--TCCCACTCCCACAGGTGGCGATAACACCACTCTACTCAC-----GCTA-----TATT-GGATACGGGGAATCGCACAG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TGTG-GTTGTTATCTACGTCAA---TATTTTTTT
gi|74792                      : ATAAATTT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-ATTTTG----AGTAACT--TAGCGTAGTTA--TACGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAT-TT-----TAA--TTGGTGTAAGAGCACTT-----CAGTTC-TT---------G-------C------AGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--ACCCTCTCCCGCTGGTATCGGTAATACTACTCTACTT------------CCGCTATTGGGATACGGGTAACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-TACGGCTACATTCCACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GTTGTTATC
gi|74793                      : ATAAAATA-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTT----AGTAGCT--TAGCGTAATTA--TAAGTGT-----TTGATAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGAGCGTAAGAGTACTT-----AATTTA-TT---------G-------A------GGA---------GAGGCA---TTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAGGGGTG--TCCTTCTCCCGCTGGTGGCAGTATTTCTACTCTACTT------------CCGCTATTGGAGTACGGGGAACCGCTCGG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTTAAAACTT-AACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TTTG-GTTGTTTTCTACGTCAA---TGATGTTTTT
gi|74794                      : ATAAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TACGTAG-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TTA--TTTA-GTAAGAGCACTT-----CAGTTG-TT---------G-------C------AGA---------GCGGCAACTTGGG--------------GAT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TACCTCTCCCGCTGGTAGCGGTAATACTACTCTATTTCC-----GCT--------TTTGGATACGGGGAACCGCTCCG--AAACTGGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-TGAACGGCTACATTATACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGt
gi|74795                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTTTTG----AATAACT--TTGCGTAATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAG-GT-----TAA--TGGGCGAAATGACACTT-----CAATAA-TT---------GTGGGGTTG------GGA---------GAGGCAACTTTGG--------------G-T-AG--TGTG-------TGGGAAGCGTG--TCCCTCTCCCGCTGGTGGCGGAAAATCTACTTTACTCCC-----G-------------GGATAAGGCAAATCGCTCCG--AA-----A-----AA-T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TTATT-----TT---AG-AAAATAATTATG-GTCGTTATTTACACCAA---TGTTGTTTTT
gi|74796                      : ATAAAATT-TCCATT-T-AGAA-GAAACCGCTTGCT-GTTTTG----AGTAACT---AGCATAATTA--TAAATAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAG--TGGGC--------ACTT-----T------TT---------G-------A------GAA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCCCTCTCCCGCTGATTGTGGTAATTCTACTCTACTCC-------CT-----CTATTGGGATACGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTT-----------T-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTGAATTCTACTTA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----AAAA-GTTTTTATCTACGCCAT---TGTTTTTTTT
gi|74797                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-GAAA-GGAGCGACTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCATAGTTA--TTAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACA----------ATAC-TT-----TAA--TGGGAGTAACAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------G------G-----------GAGGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTGTATACCTCTCCTGCT--T-------------CTCTACTCCCTGGTAACTA-CCGCTATTCAGATAAGGCGAATCGCTCTGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATA-GCTGTTATTTAAGCCAA-----TTATTT
gi|74798                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TGTTTG----AGTAA---------TAAT-----AAGTAT-----CCTGAAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTAAGAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------GCTGCAGGGAC--------GAAGCAACCTGGG--------------GGC-AG--TATG-------TGAGTATAGTG--TCCCTCTCCTGCTGCTGGC---AATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGGGAACTGCTCCG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTTTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TACG-GTTGTTATTTACTCCAA---TGTTGTTTTactttt
gi|74799                      : ATAAACTT-TCCTTT-TTAAAA-GGAACGGCTTGCCCTTTTTG----AGTAACTA-TAA-GTAATTA--TAGGTAT-----TTTGTAGGTAA-ATG----------ATAC-TT------AA--TGGGC--AA------TT-----CAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACGTGGG--------------GGG-GG--GGGGGTATCTTTTGGAAGGGTG--TCACTTTCCCGCTGGTGGAGGTAATTCTACCCTACTCCC-----GCTA-------TTGGGATAAGGGGAACCGCTCCA--AA-----A-----AAAT-----ATTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTGCTGAATTCTATTCA-TT-TC-----TT---A---------------GTTGTTATTTACGCCAA---TGTGTTTT
gi|74800                      : ATAAAATG-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCT-TTTTTA----AGTAACT--AAGCGTCATTA--TAAATAT-----TTTGTAGGTAA-ACGATGTTGTGGAATATGTTGTACATAACTTATGCATAAAATAGGTTTAAACCAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAATCTGGG--------------TGT-TA--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTTCCGCTTGTTGTGGTAATTCTACTCTACTCCC-----ACT------T-TTGGGATACGGGGAACCGCTCCG--AA-----AT----A--T-----GTTTGAT------AT-AT---ATTAATCAC-T-AACTGCTGAGTACTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-TTTTTTATCTACGCCAA---TGCTGTTTTT
gi|74801                      : ATACAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-T------------------------AATTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------GTAC-TT-----TAA--TGGTCATAAGAGCACTT-----CATTTA-TT---------G-------G------GAG---------GAGGCAACCGGGGGAGGGGGGGGGGGTGGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAATG--TCCCTCTCCTGCTGGTGGCTACAATT---CTCTTCTTCC-----GCTA-CCGCTATTGGGATAAGGCAAACCGCTCCG--AA-----A-----A--T-----G-TTG--------AT-AT---C-TACACAC-T-TACTGCTGAATTCTGCTTA-TT-TCGTTGATT---AGAAAAA----CATG-GTTATTATATACGCCAA---TGTCTTTTTTttt
gi|74802                      : ATAAAATT-TACTTT-T-AAAA-GGAGCGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA-----------TAAATGT-----TTTGTAGGTAA-ATG----------CTAC-TT-----TAA--TGGGCATAAGAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGAGTG--TCCCTCTGCCGCTGGTGGCGATAATTCTACTCGACTCCC-----GCTA-
gi|74803                      : ATAAAATT-TCCTTT-TCACAA-GGAGTAA-------TTTTTG----A------------GTAATTA--TAAGTCT-----TTTATAGGTAA-ACC----------AAAC-TT-----TAG--TGGGCAT-AGAGCACTT-----AAATTA-TTGGGGTGGGGG-------G------GGG---------GGGGCAGCCTGCG--------------GGT-AG--GGTG-------TGGGAAGAGTG--TCCCTCTCACCCTGGCGGTGGAAATTCTACTCTACTCCC-----GCTA-CCACTATTGGGATAAGGGGAACCGCTCTG--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-T-AATTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----Ttt
gi|74804                      : ATAAAATT-TCCCTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGCC-TTTTTA----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TGATTTT-----TTTGTGAGTAA-ACG----------ATGC-TT-----TAA--TGGGTGTAAGAGCTATT-----CAATTA-TT---------
gi|74805                      : ATAAAAGT-TTCTTT-T-AAAA-GAATCGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TAACTAA-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAT--TTGGTGTATGAGCACTT-----CACTTG-TT---------
gi|74806                      : ATAAAATT-TCCTTT-T-AAAG-GGAACGGCTTACT-TTTTTG----AGTAACT--TAGCATAGTTA--TAAATAT-----TTTGTAGGAAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGAGCGTAAG-------------AATTA-TT---------G-------A------GGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGTGAAGGATG--TCCCTCTCCCGCTG
gi|74807                      : ATAAATTT-TCTTTTAT-AAAA-GGAACAGCT-----------------------------TAATT------GCCT-----TTT-TGGGCAA-----------------C-TT-----TAA--TGGGCATAAGAGCATTT-----CAATTA-TT---------G-------G------AGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGTGTG------TCTCCCACTGGTGGTGATAATTCTACTCTACTC------------CCGCTATTGGAAAATGGGGAACCGCTCCGA-AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74808                      : ATAAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAATGACTTGCC-TTGTTA----AGTAGC----AG---AACTA--TAAGTAT-----TCTGTAGGTAA-ATG----------GTAC-CT-----CAA--TAGGCGTA-GAGCACTT-----CAATTA-TT---------G-------G------GAA---------GAGGCAACAAGGA--------------GG--AGAATGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTGTCCCACTGG
gi|74809                      : ATAAAATT-TTCTT--------------GGCT-----TTTTTG----AGTAACT--TCGCGTGACTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------GTAC-TT-----TAA--TGAGCCTAAGAGCAGTT-----AAATTA-TT---------GA------G------GGA---------GAGGCAACCTG
gi|74810                      : ATAAAATT-TCTTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGCC-TTTTTG----AGTAACT----G-------A--TACATAT-----TTTGTAGGTAATACG----------TCGC-TT-----TGA--TGGGTGTAAGAGCACTT-----CAGTTA-TT---------G-------G------GGA---------
gi|74811                      : ATAAAGTT-TTCTTT-T-AAAA-GGAACGGCTTGTC-CTGTTC----AGTGACTAATGGGGTAACTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTA
gi|74812                      : ATTAATTT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTAC--TTTTTG----AACAACT--AAGTTTAATTA--TAAATAA-----TTTATAGGTAA-ATG----------ATA
gi|74813                      : ATACAGTT-TCCTTT-T-GAAA-GGAACACCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--TGGCGTATTTAATCCAATAG-----TTTGT
gi|74814                      :   AAAATT-TCGTTT-T-AAAA-GGAACTGCTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--AAGCGTAATTA--TAAGTAT-----TT-GTATGTAA-TCG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTGAGAGCACTT-----CAATTG-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACCTGGG--------------GGT-AA--TGTG-------TGTGAAAGGTG--CCCCTCTCCCGTTGGTGGTAATAATTCTACTCTACTCCC-----GCTATTCGCTATTGGGATACGTGGAACCGCTCCA--AA-----A-----A--A-----GTTTC--------AT-AT---CTTAAACAC-G-TACTGCTGAATTCTACTTA-TA-TC-----TTATCAT-AAAA----TATG-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTTTTTTT
gi|74815                      :   AAAAGT-TCCTTT-A-AAAA-GGAACGGCTTGCC-CTTTTG----AGTAACT--AAGCGTTAGTA--TAAGTAT-----TTGGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTAAGAGCACTT-----CAGTTA-TT---------G-------G------GGGAGTGGGGAGGAGGCAAGTTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGAGAAAAGTG--CCCCTCTCCCGCTGGTGGAGGTATTTCTACTCTACTCC------------------TGGGATAAGGCGAATCGCTTCG--AA-----A-----C--C-----TTTTG--------GT-AT---CTTAAACAC-TCAAATAATGCATTCTA
gi|74816                      :    AAATTGTCCTTT-T-AAAA-GGAATGGCTT-------TTA----AGTAACC--TAGCGTAATGA--TAAATAT-----TTTGTAGGGTA-ACA----------CTAC-TT-----TAA--TGGGCATAAGATCACTT-----TAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAAGCAACTTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TACCTGTCCCGCTGGTGGCAGTGATACTACTCTATTC------------CCGCTATTTGGATAC
gi|74817                      :      ATT-TCCTTT-T-AAAA-GGAACGGATTGTC-TTGTTG----AGTAACT--GAGC---ATTA--TAAGCA----------------A-ATG----------GTAC-TT-----TAA--TGGGCGCAAGAGAGCTG-----CAATAA-GT---------G-------G------GGA---------GAGGCAGCCTGGA--------------TGTTAG--TGTG-------TGGGGGGGGTG--GCCCTCTCCCGCTGGAGGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----ACTA----TTAT---GATACGGGGTACTGCTCCG--AAACTTGA-----A--C-----GTTT---------AT-AT---
gi|74818                      :                -T-AAAATGGAACGGCCTACC-TTTTCG----AGTAATT--TAGCGTAACTA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGTGTATGAGCACTT-----CAATTATTT---------G-------GAATGT-GGG---------GACGCAACCTGGG--------------TGT-AG--TGTG-------TGGG-AGAGTG--TCCCTCTCCTGCTGGTGGCGGTAATTTTACTTTTCTCCC-----GCTT-CCACTATTGAGATACGGAGAACTGCTCCG--AA-----T-----A--T-----GTTTGAT------AT-AT---CTTAAACAC-T-AACTACTGAATTCTGCTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----CATG-GTTGTTATTTACGCCAA---CGTTGTTTTT
gi|74819                      :                  -AAAA-GGAACGGTTTGCC-TTTTTG----AGTAACT--TA-----------TACGTAT-----TT-GTAGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TTTGTGAAAGAGCACTT-----TATTTG-TT---------G-------C------AGA---------GAGGCATCCTGGG--------------AGT-AG--TG
gi|74820                      :                     AA-TGAACGGCTTGCC-TTTTTG----AGTAATT--CAGCGTTATTA--TAAATAT-----TTTGTAAATAA-ACG----------ATTC-TT-----TTA--TGGGCGTACAAATACTT-----CATTTA-TT---------T-------G------GGA---------GAAGCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------T-----GGGTG--TCTCCCTCCCGCTGGAGGCTGTAAGTCTGCT--------------CTA-CCACTATTGAGATACGAGAAACCAC
gi|74821                      :                            CGGCTTGTC-TTTTTG----AGTAACT--TA-----------TACGTAT-----TT-GTTGGTAA-ACG----------ATAC-TT-----TAA--TT----TGAGAGCACTT-----CAGTTG-TT---------G-------C------ATA---------GAGGCAACCTTGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCTCGCTGTTAGCGGTAATACTACTCTACTTCC-----G--A-----TATTTGAATATGGGGGACCGCTCCG--AAACTTGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACACTT-AACGGCTACATTCTACTCATTT-TT-----TT---AC-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTCTTacacacacaacacttggatcttggatgtattttaaa
gi|74822                      :                                 TGCC-ATTTTG----GGTAACT--AAGCGTAATTA--TAAGTAC-----TTTGTAGATAA-CTG----------ACAC-TT-----TGA--TAGGCGTAAGAGCAATT-----CAATTA-TT---------G-------G------AGA---------GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCACGCTGATGGCGGTA---CTA--CTACTT------------CCGCTATTTGGATACTTGGAACCGCTCCG--GAACATGA-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-ATAA----CATG-
gi|74823                      :                                 TGCT-GTTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATAA--TAAGTAT-----TTTGTAGGTAA-CTG----------GTAC-TT-----TAA--TGGGCGCAAGAGCACTTGAA--CAATTA-TT---------G-------G------TGA---------GAGG---------------------------------TG-------T------------TTTCTCTCACGCTGGTAGCGATACTACTACTCTACTTCC-----GCTA-------TTTGGATACTTAGAACCGCTTCG--AA-----ATATGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAAGAC-T-AACTGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AGAAAAA----TATA-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTaaagtgacatggattatacacgaaactgtttattttt
gi|74824                      :                                       TTTTG----AGTAACT--TAGCGTAATTA--TAAGTATATAATTTTGTAGGTAA-TCG----------ATAC-TT-----TAA--TGGGCGTAAGAGCACTT-----CAATTA-TT---------T-------G------GGG---------GAGGTAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGG
gi|74825                      :                                                                                                                                  TGAAAGCACTT-----CAAATA-CT---------T-------G------GGA---------GAGTCAAACTGGG--------------AGA-A----GTG-------TGGGAAGAGTG--TTTCTCTACCGCTGATGGGGGTA
gi|74826                      :                                                                                                                                             -----CAATTA-TT---------G-------G------AGA---------GAGCCAACCTGGG--------------GGT-AG--TGTG-------TAGGAAGGGTG--TCCCTCTCCCGCTGATGGCGGTAATTTTGCTCTACTC------------CCGCTATT-GGATACGGGGTACCGCTCCGAAAA-----A-----A--T-----GTTTGATATATATAT-AT---ATCAAACAC-T-TACTACTGAATACTACTCC-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATGTTTTTTTACCTGCGCCAT---TGCGATTTTT
gi|74827                      :                                                                                                                                             -----CAATTA-TT---------G-------G------GGA---------GAGGCAACCTGTG--------------GGT-AG--TGTG-------TGGGAAGGGTG--TCCCTCTCCCGCTGTTGGCGGTAATTCTGCTCTTCTCCT-----GCTA-C------TGGAATACGGTGAACTGCTCCG--AA-----A-----AT-T-----GTTTG--------AT-ATATATTT--ACAC-T-AACTGGTGAATACAACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTATTATCTACGCCAATGCTGTTGTTTTTtt
gi|74828                      :                                                                                                                                                                                                                                                               CTCCAGCTTGTGGCGGTAACTCTACTCTACTCCC-----GCAA------AT-GGGATACGGTGAACCGCTCAT--AA-----A-----C--TTGAAAGTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-TTAACGGCTGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-GTTGTTATCTACGTCAA---TGTTGTTTTT
gi|74829                      :                                                                                                                                                                                                                                                                              GCAACTCTACTCTACTCCC-----GCTA-------TTTGGATACGTGGAACCGCTCGG--AA-----ACTTGAA--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-TTAACGACAGAATTCTACTCA-TT-TC-----TT---AG-AAAG----TATG-ATTGTTATCTAAGTCGA---TTTTAATTTT
gi|74830                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GATACGAGGAACCGCCCTA--AA-----A-----A--T-----AATTG--------AT-GT---CTTAAACAC-C-AACTGCATAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---AG-AAAC----TATA-A----TATATACTCCAA---
gi|74831                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -----A--T-----ATTTGT-------AT-AT---CTCAAACAC-C-AACTGCTGTATCCTACTCA-TT-TC-----TT---AA-AAGA----TATA-GTTGTTATTTACGCCAA---TGTcagttt
gi|74832                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctgaaatttaaagttgg--AA-----A-----A--TA----GTTT---------AT-AT---CTTGAATAC-C-AGCTGTTGAATTCCACTCA-TT-TT-----TT---TG-AAAA----TATA-TTATTTATTTATGCAAA---TG
gi|74833                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       t--AA-----A-----A--T-----GTTTG--------AT-AT---CTTAAACAC-C-AACTGCTGAATTCTACT-A-TT-T
gi|74834                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTG--------AT-AT---TTTAAAGAC-T-ATCTGCTGAATTCTTCTCA-AT-TC-----TT---AG-AAAA----TATG-ATTGTTATCTACGCCAA---TGTTTTTTTT
gi|74835                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTG--------ATCAT---TATAAACTC-T-AACTGTTGAATTCTACTAA-TT-TC-----TT---CG-AAAA----TATG-TTTGTTATTTTCACCGT---TATTGTTT