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lowQualScore : . . .. .. ..... .. .... .... . . .... . .. ... ...... . .. . . ..... . ..... ... ...... .
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Reference ( gi|16459 ) : CTGCT-CTAGGTT-GCCATA-ACATGC-----A--TATT----TTCTAG---AG-CTGTT-GCT----ACA-TAAAGGTAT---TC------AATATCGATATGA--AAT-T-TG--AT-AATTG-CA-----TAGAG---GA------A-ATATTACTTTT
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Alignments
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lowQualScore : .. .... . . ..... .. .... . .... .. . . ... ...... . . .. . . . ..... ... ...... .
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Reference ( family-470 ) : CTGCTCCGGGTAGCCATT-A----C-A-TGC-----A--TATT----TTCTAGCGCTGTT-GCT----ACG-TAACCGTAT-T---C------AATATCGATACGA--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TAGAG---GA------AATA-TTACTTTT
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gi|16452 : CTGCTTTAGGTAGCCACT-A----C-A-TGC-----A--TATG----TTATAACATTGTT-GCT----ACA-TAATGGTAT-T---C------AATATCAATATGA--AAT-TTGGC-AACTG-CA-----TAGAG---GA------AATA-Tatatg
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gi|16490 : gtaaatgGTAGCCACT-A----C-A-TTC-----A--TATT----TTTTAGAGC--TGTT-A--CT----AG-GGTGAGGGTATAT---C------AATATCAATATGA--AAT-TTAGT-AATTG-CA-----TAGAG---AA------AATA-TTATTTTTaatg
gi|16491 : TAACCAT--A----C-AATGC-----A--TATT----TTCTAGCGC--TGTT-G--CT----AC-A-TAACCGTAT-T---C------AATATAATTATGA--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TACAA---TA------TATA-TAACTTTTt
gi|16492 : ----C-A-TGT-----A--CATT----TTTTAGCAT--TGTT-G--CT----AC-A-TAACGGTTT-T---C------AATATCAATATGA--AAT-TTGGC-AA------------AGAG---GA------AATA-TCACTTTTtatg
gi|16493 : c----C-A-TGC-----AAAGATT----TTTT---GC--TGTT-A--CT----AC-A-TAACCGAAT-T---C------AATATTGTTACTA--AAC-TTGGA-AATTG-CA-----TAGAG---GA------AATA-TTtatg
gi|16494 : C-----A--TATT------CTAGCGT--TGTT-G--TG----AT-G-TAACTGTAT-T---C------AATATCAACATGC--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TAGAG---GA------ATTA-TT
gi|16495 : AGCACCATATT-GTCCC----ACTA-TAACAGTAT-T---C------AATATCAATATGATGAAA-TTGTC-AATTGTCATCATGTAGAA---AA------AATA-GTATTTT
gi|16496 : T-G--CT----AC-A-TAACTGTAA-T---C------ACTATCAATATGA--AAT-TTGGC----TG-C-------AGAG---GT------AATA-TTACATTTcatg
gi|16497 : ATATCAATATGA--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TAGCA---GT------AATA-CAACTTTTcatg
gi|16498 : A--AAT-TTGGC-AGTTG-CA-----TAAAG---GC------AATA-TTACTTTTtatg
gi|16499 : aatgtcT-TTGGC-AATTA-CA-----TAAAG---GA------AATA-TTACTTTTtatg
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blockSeqs : A . . . . . . . . . G . . A T . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . G . . T T . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . G . . A T . . . .
blockSeqs : T . . . . . . . . . C . . G C . . . .
blockSeqs : A . . . . . . . . . A . . A T . . . .
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blockSeqs : A T . .
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Alignments
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lowQualScore : .. .... . . ..... .. .... .. . .. .... . . . . ... ...... . . .. . . . ..... ... ...... .
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Reference ( family-470 ) : CTGCTCCGGGTAGCCATT-A----C-A-TGC-----A--TATT----TTCTAGCGC--TGTT-G--CT----AC-A-TAACCGTAT-T---C------AATATCGATACGA--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TAGAG---GA------AATA-TTACTTTT
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gi|16491 : TAACCAT--A----C-AATGC-----A--TATT----TTCTAGCGC--TGTT-G--CT----AC-A-TAACCGTAT-T---C------AATATAATTATGA--AAT-TTGGC-AATTG-CA-----TACAA---TA------TATA-TAACTTTTt
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