lowQualScore                  :                                    111111                                                           11            111111          
lowQualScore                  :             1111  11 11     1111   222222 222222 0 0 222  222 0 11  11  11   0  111           22222 22 777 3333   444444 222  1   
lowQualScore                  :             ....  .. ..     ....   ...... ...... . . ...  ... . ..  ..  ..   .  ...           ..... .. ... ....   ...... ...  .   
lowQualScore                  :             7777  11 11     7777   000000 333333 8 8 222  222 8 99  88  11   8  444           11111 99 333 0000   000000 222  4   
consensus                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT---C-C--TAC-AG--TGC-TC---CATAAACGGCT-----T-CTN--A----TAT------A---AA-AAA
Reference ( gi|142994 )       : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACT--G---T------T-T-T---TT---C-C--TAT-AG--TGC-TC---CATAAACGGCT-----T-ATA--A----TAT------A---AA-AAA
gi|142993                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT---C-C--TAT-AG--TGC-TC---CATAAACGGCT-----T-ATA--A----TAT------A---AA-AAA
gi|143007                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--TCGAC----ACT--G---T------A-T-T---TT---C-C--TAT-AG--TGC-TC---CATAAAGGGAC-----T-CTA--A----TATCATAACA---AA-AAA
gi|143001                     : TTGTTCATTTCC----AA--A--GCTAC----ACT--A---T------T-T-T----T---C-C--TAT-AG--TAC-TC---CATAAACAGCT-----T-CTA--A----TAT------A---TA-AAA
gi|143005                     : TTGT-CATTATC----CT--T--GCAAC----ACT--A---T------A-T-T---TT---C-T--TAT-AG--TGC-TC---CATAAACGACT-----T-CTA--AT---TAT------A---AA-AA
gi|143012                     : TTGTTTATTTCC----CT--G--GCAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT---C-C--TTT-AG--TGC-TC---CATAATTGTTT-----T-TTA--A----TAT------
gi|143008                     : TCGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACT--T---A------T-A-T---TT---C-C--TGT-AG--TGC-TC---CATAAAGGGCG-----T-CTG--A----TAT------A---
gi|142996                     : TTGTTTATTTTC----CT--A--GCAAC----ACAA-G---T------T-T-T---TT---C-A--TAC-AT--AGC-TC---CACAAACGGCT-----T-CTC--A----TAT------A---AA-AAA
gi|142995                     : TTGTTAATTTCC----CT--T--GCAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT---C-C--TAC-AG--TGC-TC---CATAAACATTT-----T-CTC--A----TAT------
gi|142997                     : TTGTTTATTTCC----CT--A--CCAAC----ACT--T---G------C-T-T---TT---C-A--TAC-AA--TGC-TC---CATAAACGGCT-----T-CTC--A----TAT------ACACAA-AAA
gi|143017                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACT--A---T------T-T-TATATT---C-T--CAC-AG--TAC-TT---CATAAAAGACT-----T-ACA--A----GAA------A---AA-AAA
gi|143015                     : TTGATCATTTCC----CA--A--GCAAC----ACT--G---T------T-T-T---TT-----C--TAT-AG--TGT-TTCCGCGTAAACGGCA-----T-CTT--A----TAT------A---AA-
gi|143003                     : TTGTTCATTTCC----CT--C--CCAAC----ACT--AT--T------T-T-T---TT---C-C--TAT-AG--TGC-TC---T-TAAATGGTT-----T-CTC--A----TAT------C---AATAAA
gi|143000                     : TTGTTCATTTAC----CC--A--GCAAC----ACC--AT--T------T-T-T---TT---C-T--TAC-AT--TAC-TC---CATAAACGGCT-----T-CTT--A----TAT------
gi|143006                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACT------T------G-T-T---TC---C-C--GAC-AG--CAC-TC---CATGAACAGCT-----T-CTG--C----TAT------A---AA-AAA
gi|143020                     : TTGTTAATTCCC----CT--G--GTAAC----ACT--T---T------T-T-T---TC---C-C--TAT-GA--TGT-TC---CAAAAAAAGCT-----T-CCA--A----TAT------A---AA-AA
gi|143019                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAT----AC-------T------T-T-T---TT---C-C--TAC-A-----C-TC---CATAAACGACT-----T-ATA--A----
gi|142999                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAGA----AAT--A---T------T-T-T---T----C-C--TAC-AA--TGC-TC---CATAAACGGTT-----T-CTC--A----TAT------aa
gi|143016                     : TTGTTCATTTTT----CA--A--GCAAC----ATT--A---T------T-T-T--------C-C--CAT-AG--TGA-TC---CATAAACAGCT-----T-CTA--A----TGC------A---A
gi|143002                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACT--ATC-T------T-T-T---TT---C-C--TTC-AC--TGC-TC---CATGAACAGTT-----T-
gi|143004                     : TTTTTTATTTCC----CT--A--GAAAC----ACT-------------T-T-T---TT---C-C--TAC-AG--TGC-TT---CATGAACGTCC-----T-CTT--A----TATCC----A---AA-AAAcccatat
gi|143011                     : TTGTTCATTTTT----CT--A--ACAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT-----C--TAC-AG--TGC-TG---CATAAAAGGTT-----
gi|143009                     : TTTTTAATTTCT----CT--A--GCAAT----ACAA-G---T------T-T-T---TT---C-C--TAC-AA--TGC-TC---CATAAACTGCT-----T-ctcgtgt
gi|142998                     : TTGTTTATTTCC----TT--A--GCAAC----A-TAAG---T------T-T-T---TT---C-C--TTC-AG--TGG-TG---CATAAACAGCT-----T-CTC--A----TAT------ctcatgcccaaaaa
gi|143010                     : TTGTTAATTGCC-----T--A--GCAAC----ATT--T---T------T-T-T---TTT--C-C--TCC-AG--TGC-TC---CATAAATGGCT-----T-CTC--A----TAT------
gi|143025                     : TTGTTAGTTTCC----CT--A--TCAAC----ACT--G---T------T-T-TA--TT---C-C--TAA-AG--TGC-T----CATAAAC
gi|143021                     : TTGTTTATTTTC----CT--G--GCAAC----CGT--GGCTT------T-T-T---TT---C-C--TAC-AG--TGA-TC---CAT-AGCGGCT-----T-CTG--A----TAT------
gi|143022                     : TTGTTCATTTAC----CT--A--GCAAC----AAA--A---T------T-T-G---T----C-C--TAT-AG--TGT-TC---CATAAAAGGTT-----T-
gi|143013                     : TTGGTAATTTCC----CT--A--GCAAC----ACT--C---C------C-C-C---CCACCC-C--TAC-AG--TGC-TC---CGTAAACGGCT-----T-CTC--A----TTT------A---AG-AAAct
gi|143023                     : TTGACCATTTAC----CT--A--ACAAA----ATT--A---C------T-T-T---T----C-C--TAT-AG--TGC-TC---CACAAACGACT-----T-
gi|143014                     : TTGTTTATAACC----TC--A--CTAAT----ACT--A---C------T-T-T---TT---T-C--TAC-AG--TGC-TC---CATAAACGG-T-----T-CTC--A----TAT------A---Act
gi|143024                     : TTGTTCATTTCT----CT--A--GCAATTAAAAAT--A---C------T-A-T---TT---C-C--TAT-AG--TAC-TT---AATAAAAGACT-----T-CTG--C----TAT------C---AA-AAA
gi|143018                     : TTGTTCATTTCA----CA--A--GAAAC----ATT--A---T------G-T-T---AT---C-CACTAC-TG--TAC-TC---CATAAACGTCT-----T-CTT--C----TAT------A---AA-AAA
gi|143026                     : TTGTTGATTTCC----CT--G--ACAAC----ATT--A---TAATGTAT-A-T---TG---C-C--TGC-AGACTGC-TC---CAAAAATGGTT-----T-CTC--A----TGT------A---
gi|143027                     :  TGTTGATTTCC----AT--A--TCTGC----ATT--G---T------T-T-T---TC---CTC--TAT-AG--TGC-TC---CATAAACGGCT-----T-CTA--A----TAT------A---AA-AAA
gi|143029                     :  TGTTCATTTCC----TA--A--TCTAA----ATT--A---A------T-T-T---TT---C-C---ATCAG--TGT-TC---CATAAACGGCT-----T-GTC--A----TATCC----A---AA-AA
gi|143028                     :  TGTTTATTTCT----CT--A--CCAGC----ACT--A---T------TAT-T---TT---T-T--TAC-AG--TGT-GC---AATAAACGGCT-----T-TTC--A----TATCCG---A---AA-
gi|143031                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACT--A---T------T-T-T---TT---C-T--TTC-AT--CGA-TC---CATTAA
gi|143030                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--TCAAC----AAT--A---A------T-T-T--------C-C--TAC-AG--TGA-TC---CATAAAAAGTT-----T-
gi|143033                     :   GTTCATTCCA----TT--A--GCAAC----ACT--G---T------T-T-T---TC---C-C--TAC-AG--TAC-TC---CACAAACGGCT-----T-CTG--C----TAC------A---AA-ct
gi|143032                     :   GTTAATTTCC----AT--A--GCAAC----ACT--A---T------C-G-T---TT---C-C--TAC-AT--TGC-TC---CATAAACGGTT-----T-CTC--A----TATCGCC--A---AA-AA
gi|143035                     :    TTCATTTGC----CT--A--GCAAT----AGT--T---T------T-T-C---TT---C-CC-TAT-AG--TGC-TC---CTTAAACTGCT-----T-CTA--A----TAT------A---AA-AAA
gi|143036                     :    TTCATTTCC----GT--ATAGGAAC----ACT--A---T------T-T-T----T---C-C--TAT-AA--TGC-TC---CATAAACTGTT-----T-CTA--A----TAT------C---AA-AA
gi|143034                     :    TTAATTTCC----TT--A--GCAAC----ACT--A---T------T-TGT---TT---C-C--TAC-AG--TCC-AC---CATAAACGGCT-----TCATATCC----CAT------A---AA-
gi|143038                     :     TCATTTCT----CC--A--GCAAC----ATT--G---T------T-T-T--------C-C--TAA-AG--TGA-TC---CATAAACGGTT-----T-CTA--AAAACAAT------A---AA-AA
gi|143037                     :     TCATTTCCGTTACTGTA--GCAAT----ACT--A---A------A-T-T---TT---C-T--TAC-AG--TGCATC---CATAAACGGCT-----T-TTC--A----TATCTG---A---AA-AA
gi|143039                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAT----ACC--A---T------T-T-T---TT---C-C--TAT-AG--TGC-TG---TATAAACGACT-----T-CTC--A----TATCC----A---AA-
gi|143040                     :       ATTTCT----CT--A--GCAAC----ATT--G---T------T-T-T---T----C-C--TAC-AA--TGC-TC---AATAAATGGCTCTTCAT-ATC--A-----AT------A---AA-AA
gi|143041                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAC----AAT--A----------T-G-T---TG---C-C--TTC-AG--TGT-TC---AATAAAGGGCT-----T-CTC--A----TAT------
gi|143042                     :       ATTTCT----CT--G----AAC----ACT--A---T------T-T-T---T----C-C--TAC-AA--TGC-TT---CAAAAACGATT-----T-CTT--G----TATCC----A---AA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                             111111          
lowQualScore                  :             1111  11 11     3333    44 222222 0 0 222  222 0 11 0    11   0  111              1 2222 111 11 222222 222  2   
lowQualScore                  :             ....  .. ..     ....    .. ...... . . ...  ... . .. .    ..   .  ...              . .... ... .. ...... ...  .   
lowQualScore                  :             7777  11 11     4444    66 333333 8 8 222  222 8 99 8    11   8  444              3 8888 666 22 444444 000  6   
consensus                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
Reference ( family-461 )      : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142993                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142994                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142995                     : TTGTTAATTTCC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACATTTTCTCA----T---A--T------
gi|142996                     : TTGTTTATTTTC----CT--A--GCAAC----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-A--T-ACAT--AGC-TC---CACAAACGGCTTCTCA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142997                     : TTGTTTATTTCC----CT--A--CCAAC----ACTT--G------C-T-T---TT---C-A--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTCA----T---A--T------ACACAA-AAA
gi|142998                     : TTGTTTATTTCC----TT--A--GCAAC----A-TAAGT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAG--TGG-TG---CATAAACAGCTTCTCA----T---A--T------
gi|142999                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAGA----AATA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--T------
gi|143000                     : TTGTTCATTTAC----CC--A--GCAAC----ACCA--T------T-T-T---TT---T-C--TTACAT--TAC-TC---CATAAACGGCTTCTTA----T---A--T------
gi|143001                     : TTGTTCATTTCC----AA--A--GCTAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TAC-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---A--T------A---TA-AAA
gi|143002                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTATCT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAC--TGC-TC---CATGAACAGTTTCCCA----T---A--T------
gi|143003                     : TTGTTCATTTCC----CT--C--CCAAC----ACTAT-T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---T-TAAATGGTTTCTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143004                     : TTTTTTATTTCC----CT--A--GAAAC----ACT----------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TT---CATGAACGTCCTCTTA----T---A--TCC----A---AA-AAA
gi|143005                     : TTGT-CATTATC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------A-T-T---TT---C-T--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGACTTCTAAT---T---A--T------A---AA-AA
gi|143006                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACT---T------G-T-T---TC---C-C--G-ACAG--CAC-TC---CATGAACAGCTTCTGC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143007                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--TCGAC----ACTG--T------A-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAAGGGACTCTAA----T---A--TCATAACA---AA-AAA
gi|143008                     : TCGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTT--A------T-A-T---TT---C-C--T-GTAG--TGC-TC---CATAAAGGGCGTCTGA----T---A--T------A---
gi|143009                     : TTTTTAATTTCT----CT--A--GCAAT----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACTGCTTCTCA----T---GCCC------A---AA-AA
gi|143010                     : TTGTTAATTGCC-----T--A--GCAAC----ATTT--T------T-T-T---TTT--C-C--T-CCAG--TGC-TC---CATAAATGGCTTCTCA----T---A--T------
gi|143011                     : TTGTTCATTTTT----CT--A--ACAAC----ACTA--T------T-T-T---TT-----C--T-ACAG--TGC-TG---CATAAAAGG-TTCTCG----T---G--T------
gi|143012                     : TTGTTTATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-TTAG--TGC-TC---CATAATTGTTTTTTAA----T---A--T------
gi|143013                     : TTGGTAATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTC--C------C-C-C---CCACCC-C--T-ACAG--TGC-TC---CGTAAACGGCTTCTCA----T---T--T------A---AG-AAA
gi|143014                     : TTGTTTATAACC----TC--A--CTAAT----ACTA--C------T-T-T---TT---T-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGG-TTCTCA----T---A--T------A---A
gi|143015                     : TTGATCATTTCC----CA--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT-----C--T-ATAG--TGT-TTCCGCGTAAACGGCATCTTA----T---A--T------A---AA-
gi|143016                     : TTGTTCATTTTT----CA--A--GCAAC----ATTA--T------T-T-T--------C-C--C-ATAG--TGA-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---G--C------A---A
gi|143017                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-TATATT---C-T--C-ACAG--TAC-TT---CATAAAAGACTTACAA----G---A--A------A---AA-AAA
gi|143018                     : TTGTTCATTTCA----CA--A--GAAAC----ATTA--T------G-T-T---AT---C-CACT-ACTG--TAC-TC---CATAAACGTCTTCTTC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143019                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAT----AC----T------T-T-T---TT---C-C--T-ACA-----C-TC---CATAAACGACT---------T---A--T------A---AA-
gi|143020                     : TTGTTAATTCCC----CT--G--GTAAC----ACTT--T------T-T-T---TC---C-C--T-ATGA--TGT-TC---CAAAAAAAGCTTCCAA----T---A--T------A---AA-AA
gi|143021                     : TTGTTTATTTTC----CT--G--GCAACCGTGGCT---T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGA-TC---CAT-AGCGGCTTCTGA----T---A--T------
gi|143022                     : TTGTTCATTTAC----CT--A--GCAAC----AAAA--T------T-T-G---T----C-C--T-ATAG--TGT-TC---CATAAAAGGTTTCT
gi|143023                     : TTGACCATTTAC----CT--A--ACAAA----ATTA--C------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TGC-TC---CACAAACGACTTCT
gi|143024                     : TTGTTCATTTCT----CT--A--GCAATTAAAAATA--C------T-A-T---TT---C-C--T-ATAG--TAC-TT---AATAAAAGACTTCTGC----T---A--T------C---AA-AAA
gi|143025                     : TTGTTAGTTTCC----CT--A--TCAAC----ACTG--T------T-T-TA--TT---C-C--T-AAAG--TGC-T----CATAAAC
gi|143026                     : TTGTTGATTTCC----CT--G--ACAAC----ATTA--TAATGTAT-A-T---TG---C-C--T-GCAGACTGC-TC---CAAAAATGGTTTCTCA----T---G--T------A---
gi|143027                     :  TGTTGATTTCC----AT--A--TCTGC----ATTG--T------T-T-T---TC---CTC--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143028                     :  TGTTTATTTCT----CT--A--CCAGC----ACTA--T------TAT-T---TT---T-T--T-ACAG--TGT-GC---AATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCCG---A---AA-
gi|143029                     :  TGTTCATTTCC----TA--A--TCTAA----ATTA--A------T-T-T---TT---C-C--A-TCAG--TGT-TC---CATAAACGGCTTGTCA----T---A--TCC----A---AA-AA
gi|143030                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--TCAAC----AATA--A------T-T-T--------C-C--T-ACAG--TGA-TC---CATAAAAAGTTTCT
gi|143031                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-T--T-TCAT--CGA-TC---CATTAA
gi|143032                     :   GTTAATTTCC----AT--A--GCAAC----ACTA--T------C-G-T---TT---C-C--T-ACAT--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--TCGCC--A---AA-AA
gi|143033                     :   GTTCATTCCA----TT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TC---C-C--T-ACAG--TAC-TC---CACAAACGGCTTCTGC----T---A--C------A---AA-
gi|143034                     :    TTAATTTCC----TT--A--GCAAC----ACTA--T------T-TGT---TT---C-C--T-ACAG--TCC-AC---CATAAACGGCTTCATA----TCCCA--T------A---AA-
gi|143035                     :    TTCATTTGC----CT--A--GCAAT----AGTT--T------T-T-C---TT---C-CC-T-ATAG--TGC-TC---CTTAAACTGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143036                     :    TTCATTTCC----GT--ATAGGAAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAA--TGC-TC---CATAAACTGTTTCTAA----T---A--T------C---AA-AA
gi|143037                     :     TCATTTCCGTTACTGTA--GCAAT----ACTA--A------A-T-T---TT---C-T--T-ACAG--TGCATC---CATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCTG---A---AA-AA
gi|143038                     :     TCATTTCT----CC--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T--------C-C--T-AAAG--TGA-TC---CATAAACGGTTTCTAAAAACA---A--T------A---AA-AA
gi|143039                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAT----ACCA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TG---TATAAACGACTTCTCA----T---A--TCC----A---AA-
gi|143040                     :       ATTTCT----CT--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---AATAAATGGCTCTTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143041                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAC----AATA--T------G-T-T---G----C-C--T-TCAG--TGT-TC---AATAAAGGGCTTCTCA----T---A--T------aa
gi|143042                     :       ATTTCT----CT--G----AAC----ACTA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TT---CAAAAACGATTTCTTG----T---A--TCC----A---AA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                             111111          
lowQualScore                  :             1111  11 11     3333    44 222222 0 0 222  222 0 11 0    11   0  111              1 2222 111 11 222222 222  2   
lowQualScore                  :             ....  .. ..     ....    .. ...... . . ...  ... . .. .    ..   .  ...              . .... ... .. ...... ...  .   
lowQualScore                  :             7777  11 11     4444    66 333333 8 8 222  222 8 99 8    11   8  444              3 8888 666 22 444444 000  6   
consensus                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
Reference ( family-461 )      : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142993                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142994                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142995                     : TTGTTAATTTCC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACATTTTCTCA----T---A--T------
gi|142996                     : TTGTTTATTTTC----CT--A--GCAAC----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-A--T-ACAT--AGC-TC---CACAAACGGCTTCTCA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142997                     : TTGTTTATTTCC----CT--A--CCAAC----ACTT--G------C-T-T---TT---C-A--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTCA----T---A--T------ACACAA-AAA
gi|142998                     : TTGTTTATTTCC----TT--A--GCAAC----A-TAAGT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAG--TGG-TG---CATAAACAGCTTCTCA----T---A--T------
gi|142999                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAGA----AATA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--T------
gi|143000                     : TTGTTCATTTAC----CC--A--GCAAC----ACCA--T------T-T-T---TT---T-C--TTACAT--TAC-TC---CATAAACGGCTTCTTA----T---A--T------
gi|143001                     : TTGTTCATTTCC----AA--A--GCTAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TAC-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---A--T------A---TA-AAA
gi|143002                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTATCT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAC--TGC-TC---CATGAACAGTTTCCCA----T---A--T------
gi|143003                     : TTGTTCATTTCC----CT--C--CCAAC----ACTAT-T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---T-TAAATGGTTTCTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143004                     : TTTTTTATTTCC----CT--A--GAAAC----ACT----------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TT---CATGAACGTCCTCTTA----T---A--TCC----A---AA-AAA
gi|143005                     : TTGT-CATTATC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------A-T-T---TT---C-T--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGACTTCTAAT---T---A--T------A---AA-AA
gi|143006                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACT---T------G-T-T---TC---C-C--G-ACAG--CAC-TC---CATGAACAGCTTCTGC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143007                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--TCGAC----ACTG--T------A-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAAGGGACTCTAA----T---A--TCATAACA---AA-AAA
gi|143008                     : TCGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTT--A------T-A-T---TT---C-C--T-GTAG--TGC-TC---CATAAAGGGCGTCTGA----T---A--T------A---
gi|143009                     : TTTTTAATTTCT----CT--A--GCAAT----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACTGCTTCTCA----T---GCCC------A---AA-AA
gi|143010                     : TTGTTAATTGCC-----T--A--GCAAC----ATTT--T------T-T-T---TTT--C-C--T-CCAG--TGC-TC---CATAAATGGCTTCTCA----T---A--T------
gi|143011                     : TTGTTCATTTTT----CT--A--ACAAC----ACTA--T------T-T-T---TT-----C--T-ACAG--TGC-TG---CATAAAAGG-TTCTCG----T---G--T------
gi|143012                     : TTGTTTATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-TTAG--TGC-TC---CATAATTGTTTTTTAA----T---A--T------
gi|143013                     : TTGGTAATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTC--C------C-C-C---CCACCC-C--T-ACAG--TGC-TC---CGTAAACGGCTTCTCA----T---T--T------A---AG-AAA
gi|143014                     : TTGTTTATAACC----TC--A--CTAAT----ACTA--C------T-T-T---TT---T-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGG-TTCTCA----T---A--T------A---A
gi|143015                     : TTGATCATTTCC----CA--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT-----C--T-ATAG--TGT-TTCCGCGTAAACGGCATCTTA----T---A--T------A---AA-
gi|143016                     : TTGTTCATTTTT----CA--A--GCAAC----ATTA--T------T-T-T--------C-C--C-ATAG--TGA-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---G--C------A---A
gi|143017                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-TATATT---C-T--C-ACAG--TAC-TT---CATAAAAGACTTACAA----G---A--A------A---AA-AAA
gi|143018                     : TTGTTCATTTCA----CA--A--GAAAC----ATTA--T------G-T-T---AT---C-CACT-ACTG--TAC-TC---CATAAACGTCTTCTTC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143019                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAT----AC----T------T-T-T---TT---C-C--T-ACA-----C-TC---CATAAACGACT---------T---A--T------A---AA-
gi|143020                     : TTGTTAATTCCC----CT--G--GTAAC----ACTT--T------T-T-T---TC---C-C--T-ATGA--TGT-TC---CAAAAAAAGCTTCCAA----T---A--T------A---AA-AA
gi|143021                     : TTGTTTATTTTC----CT--G--GCAACCGTGGCT---T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGA-TC---CAT-AGCGGCTTCTGA----T---A--T------
gi|143022                     : TTGTTCATTTAC----CT--A--GCAAC----AAAA--T------T-T-G---T----C-C--T-ATAG--TGT-TC---CATAAAAGGTTTCT
gi|143023                     : TTGACCATTTAC----CT--A--ACAAA----ATTA--C------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TGC-TC---CACAAACGACTTCT
gi|143024                     : TTGTTCATTTCT----CT--A--GCAATTAAAAATA--C------T-A-T---TT---C-C--T-ATAG--TAC-TT---AATAAAAGACTTCTGC----T---A--T------C---AA-AAA
gi|143025                     : TTGTTAGTTTCC----CT--A--TCAAC----ACTG--T------T-T-TA--TT---C-C--T-AAAG--TGC-T----CATAAAC
gi|143026                     : TTGTTGATTTCC----CT--G--ACAAC----ATTA--TAATGTAT-A-T---TG---C-C--T-GCAGACTGC-TC---CAAAAATGGTTTCTCA----T---G--T------A---
gi|143027                     :  TGTTGATTTCC----AT--A--TCTGC----ATTG--T------T-T-T---TC---CTC--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143028                     :  TGTTTATTTCT----CT--A--CCAGC----ACTA--T------TAT-T---TT---T-T--T-ACAG--TGT-GC---AATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCCG---A---AA-
gi|143029                     :  TGTTCATTTCC----TA--A--TCTAA----ATTA--A------T-T-T---TT---C-C--A-TCAG--TGT-TC---CATAAACGGCTTGTCA----T---A--TCC----A---AA-AA
gi|143030                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--TCAAC----AATA--A------T-T-T--------C-C--T-ACAG--TGA-TC---CATAAAAAGTTTCT
gi|143031                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-T--T-TCAT--CGA-TC---CATTAA
gi|143032                     :   GTTAATTTCC----AT--A--GCAAC----ACTA--T------C-G-T---TT---C-C--T-ACAT--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--TCGCC--A---AA-AA
gi|143033                     :   GTTCATTCCA----TT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TC---C-C--T-ACAG--TAC-TC---CACAAACGGCTTCTGC----T---A--C------A---AA-
gi|143034                     :    TTAATTTCC----TT--A--GCAAC----ACTA--T------T-TGT---TT---C-C--T-ACAG--TCC-AC---CATAAACGGCTTCATA----TCCCA--T------A---AA-
gi|143035                     :    TTCATTTGC----CT--A--GCAAT----AGTT--T------T-T-C---TT---C-CC-T-ATAG--TGC-TC---CTTAAACTGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143036                     :    TTCATTTCC----GT--ATAGGAAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAA--TGC-TC---CATAAACTGTTTCTAA----T---A--T------C---AA-AA
gi|143037                     :     TCATTTCCGTTACTGTA--GCAAT----ACTA--A------A-T-T---TT---C-T--T-ACAG--TGCATC---CATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCTG---A---AA-AA
gi|143038                     :     TCATTTCT----CC--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T--------C-C--T-AAAG--TGA-TC---CATAAACGGTTTCTAAAAACA---A--T------A---AA-AA
gi|143039                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAT----ACCA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TG---TATAAACGACTTCTCA----T---A--TCC----A---AA-
gi|143040                     :       ATTTCT----CT--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---AATAAATGGCTCTTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143041                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAC----AATA--T------G-T-T---G----C-C--T-TCAG--TGT-TC---AATAAAGGGCTTCTCA----T---A--T------aa
gi|143042                     :       ATTTCT----CT--G----AAC----ACTA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TT---CAAAAACGATTTCTTG----T---A--TCC----A---AA-AAA


blockSeqs                     :             GTTA  GT TA     CGTG    AG AATGTA     ATA  ACC   AC      AC      CCG              A AAAC CCC CC CATAAC CAC  T
blockSeqs                     :             .     .  .      TAAA    TC .          A    T     C       .       .                C T    .   .  CGCC   .    T
blockSeqs                     :             .     .  .      .       G  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  CCG    .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       T  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  CTG    .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       G  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  CC     .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  CC     .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  CC     .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  CC     .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                G .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                G .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                G .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                G .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .      .    .
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .     
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .     
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .      .     
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                G .    .   .  .      .     
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                A .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                C .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                T .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                . .    .   .  .            
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                                           
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                                           
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                                           
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                                           
blockSeqs                     :             .     .  .      .       .  .          .    .     .       .       .                                           


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
finalCons                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                             111111          
lowQualScore                  :             1111  11 11     3333    44 222222 0 0 222  222 0 11 0    11   0  111              1 2222 111 11 222222 222  2   
lowQualScore                  :             ....  .. ..     ....    .. ...... . . ...  ... . .. .    ..   .  ...              . .... ... .. ...... ...  .   
lowQualScore                  :             7777  11 11     4444    66 333333 8 8 222  222 8 99 8    11   8  444              3 8888 666 22 444444 000  6   
consensus                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
Reference ( family-461 )      : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTNA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142993                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142994                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTATAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142995                     : TTGTTAATTTCC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACATTTTCTCA----T---A--T------
gi|142996                     : TTGTTTATTTTC----CT--A--GCAAC----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-A--T-ACAT--AGC-TC---CACAAACGGCTTCTCA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|142997                     : TTGTTTATTTCC----CT--A--CCAAC----ACTT--G------C-T-T---TT---C-A--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTCA----T---A--T------ACACAA-AAA
gi|142998                     : TTGTTTATTTCC----TT--A--GCAAC----A-TAAGT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAG--TGG-TG---CATAAACAGCTTCTCA----T---A--T------
gi|142999                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAGA----AATA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--T------
gi|143000                     : TTGTTCATTTAC----CC--A--GCAAC----ACCA--T------T-T-T---TT---T-C--TTACAT--TAC-TC---CATAAACGGCTTCTTA----T---A--T------
gi|143001                     : TTGTTCATTTCC----AA--A--GCTAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TAC-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---A--T------A---TA-AAA
gi|143002                     : TTGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTATCT------T-T-T---TT---C-C--T-TCAC--TGC-TC---CATGAACAGTTTCCCA----T---A--T------
gi|143003                     : TTGTTCATTTCC----CT--C--CCAAC----ACTAT-T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---T-TAAATGGTTTCTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143004                     : TTTTTTATTTCC----CT--A--GAAAC----ACT----------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGC-TT---CATGAACGTCCTCTTA----T---A--TCC----A---AA-AAA
gi|143005                     : TTGT-CATTATC----CT--T--GCAAC----ACTA--T------A-T-T---TT---C-T--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGACTTCTAAT---T---A--T------A---AA-AA
gi|143006                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACT---T------G-T-T---TC---C-C--G-ACAG--CAC-TC---CATGAACAGCTTCTGC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143007                     : TTGTTCATTTCC----CT--A--TCGAC----ACTG--T------A-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TC---CATAAAGGGACTCTAA----T---A--TCATAACA---AA-AAA
gi|143008                     : TCGTTCATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTT--A------T-A-T---TT---C-C--T-GTAG--TGC-TC---CATAAAGGGCGTCTGA----T---A--T------A---
gi|143009                     : TTTTTAATTTCT----CT--A--GCAAT----ACAAG-T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAA--TGC-TC---CATAAACTGCTTCTCA----T---GCCC------A---AA-AA
gi|143010                     : TTGTTAATTGCC-----T--A--GCAAC----ATTT--T------T-T-T---TTT--C-C--T-CCAG--TGC-TC---CATAAATGGCTTCTCA----T---A--T------
gi|143011                     : TTGTTCATTTTT----CT--A--ACAAC----ACTA--T------T-T-T---TT-----C--T-ACAG--TGC-TG---CATAAAAGG-TTCTCG----T---G--T------
gi|143012                     : TTGTTTATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-C--T-TTAG--TGC-TC---CATAATTGTTTTTTAA----T---A--T------
gi|143013                     : TTGGTAATTTCC----CT--A--GCAAC----ACTC--C------C-C-C---CCACCC-C--T-ACAG--TGC-TC---CGTAAACGGCTTCTCA----T---T--T------A---AG-AAA
gi|143014                     : TTGTTTATAACC----TC--A--CTAAT----ACTA--C------T-T-T---TT---T-C--T-ACAG--TGC-TC---CATAAACGG-TTCTCA----T---A--T------A---A
gi|143015                     : TTGATCATTTCC----CA--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TT-----C--T-ATAG--TGT-TTCCGCGTAAACGGCATCTTA----T---A--T------A---AA-
gi|143016                     : TTGTTCATTTTT----CA--A--GCAAC----ATTA--T------T-T-T--------C-C--C-ATAG--TGA-TC---CATAAACAGCTTCTAA----T---G--C------A---A
gi|143017                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAC----ACTA--T------T-T-TATATT---C-T--C-ACAG--TAC-TT---CATAAAAGACTTACAA----G---A--A------A---AA-AAA
gi|143018                     : TTGTTCATTTCA----CA--A--GAAAC----ATTA--T------G-T-T---AT---C-CACT-ACTG--TAC-TC---CATAAACGTCTTCTTC----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143019                     : TTGTTCATTTCA----CT--A--GCAAT----AC----T------T-T-T---TT---C-C--T-ACA-----C-TC---CATAAACGACT---------T---A--T------A---AA-
gi|143020                     : TTGTTAATTCCC----CT--G--GTAAC----ACTT--T------T-T-T---TC---C-C--T-ATGA--TGT-TC---CAAAAAAAGCTTCCAA----T---A--T------A---AA-AA
gi|143021                     : TTGTTTATTTTC----CT--G--GCAACCGTGGCT---T------T-T-T---TT---C-C--T-ACAG--TGA-TC---CAT-AGCGGCTTCTGA----T---A--T------
gi|143022                     : TTGTTCATTTAC----CT--A--GCAAC----AAAA--T------T-T-G---T----C-C--T-ATAG--TGT-TC---CATAAAAGGTTTCT
gi|143023                     : TTGACCATTTAC----CT--A--ACAAA----ATTA--C------T-T-T---T----C-C--T-ATAG--TGC-TC---CACAAACGACTTCT
gi|143024                     : TTGTTCATTTCT----CT--A--GCAATTAAAAATA--C------T-A-T---TT---C-C--T-ATAG--TAC-TT---AATAAAAGACTTCTGC----T---A--T------C---AA-AAA
gi|143025                     : TTGTTAGTTTCC----CT--A--TCAAC----ACTG--T------T-T-TA--TT---C-C--T-AAAG--TGC-T----CATAAAC
gi|143026                     : TTGTTGATTTCC----CT--G--ACAAC----ATTA--TAATGTAT-A-T---TG---C-C--T-GCAGACTGC-TC---CAAAAATGGTTTCTCA----T---G--T------A---
gi|143027                     :  TGTTGATTTCC----AT--A--TCTGC----ATTG--T------T-T-T---TC---CTC--T-ATAG--TGC-TC---CATAAACGGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143028                     :  TGTTTATTTCT----CT--A--CCAGC----ACTA--T------TAT-T---TT---T-T--T-ACAG--TGT-GC---AATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCCG---A---AA-
gi|143029                     :  TGTTCATTTCC----TA--A--TCTAA----ATTA--A------T-T-T---TT---C-C--A-TCAG--TGT-TC---CATAAACGGCTTGTCA----T---A--TCC----A---AA-AA
gi|143030                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--TCAAC----AATA--A------T-T-T--------C-C--T-ACAG--TGA-TC---CATAAAAAGTTTCT
gi|143031                     :  TGTTCATTTCC----CT--G--GCAAC----ACTA--T------T-T-T---TT---C-T--T-TCAT--CGA-TC---CATTAA
gi|143032                     :   GTTAATTTCC----AT--A--GCAAC----ACTA--T------C-G-T---TT---C-C--T-ACAT--TGC-TC---CATAAACGGTTTCTCA----T---A--TCGCC--A---AA-AA
gi|143033                     :   GTTCATTCCA----TT--A--GCAAC----ACTG--T------T-T-T---TC---C-C--T-ACAG--TAC-TC---CACAAACGGCTTCTGC----T---A--C------A---AA-
gi|143034                     :    TTAATTTCC----TT--A--GCAAC----ACTA--T------T-TGT---TT---C-C--T-ACAG--TCC-AC---CATAAACGGCTTCATA----TCCCA--T------A---AA-
gi|143035                     :    TTCATTTGC----CT--A--GCAAT----AGTT--T------T-T-C---TT---C-CC-T-ATAG--TGC-TC---CTTAAACTGCTTCTAA----T---A--T------A---AA-AAA
gi|143036                     :    TTCATTTCC----GT--ATAGGAAC----ACTA--T------T-T-T---T----C-C--T-ATAA--TGC-TC---CATAAACTGTTTCTAA----T---A--T------C---AA-AA
gi|143037                     :     TCATTTCCGTTACTGTA--GCAAT----ACTA--A------A-T-T---TT---C-T--T-ACAG--TGCATC---CATAAACGGCTTTTCA----T---A--TCTG---A---AA-AA
gi|143038                     :     TCATTTCT----CC--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T--------C-C--T-AAAG--TGA-TC---CATAAACGGTTTCTAAAAACA---A--T------A---AA-AA
gi|143039                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAT----ACCA--T------T-T-T---TT---C-C--T-ATAG--TGC-TG---TATAAACGACTTCTCA----T---A--TCC----A---AA-
gi|143040                     :       ATTTCT----CT--A--GCAAC----ATTG--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TC---AATAAATGGCTCTTCA----T---A--T------C---AATAAA
gi|143041                     :       ATTTCC----CT--A--GCAAC----AATA--T------G-T-T---G----C-C--T-TCAG--TGT-TC---AATAAAGGGCTTCTCA----T---A--T------aa
gi|143042                     :       ATTTCT----CT--G----AAC----ACTA--T------T-T-T----T---C-C--T-ACAA--TGC-TT---CAAAAACGATTTCTTG----T---A--TCC----A---AA-AAA