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Unaligned ( gi|114834 ): CCGCAAGTGCCGGGACCACCCGACTGCAAATCACACAATAACAGAATGTATAGAATTTCAACACCGTTTGCTTGCAACAAAACATGT






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gi|114809                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGAGTGATCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATATATCAGTCAA-GTT-TTAACATACATT
gi|114810                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATATTTCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114811                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TGCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATATATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114812                     :                      TTTCAGTC-A-CCAAAAATATGGTGA----CCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGGGG-TCGGGTTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-
gi|114813                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCTCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ACATATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATTatttacatgcatgttt
gi|114814                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATGCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATATATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114815                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----ATGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTTAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATATATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114816                     :                      TTTCAGTC-A-CCAAAAATATGGTGA----CCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGGGGATCGGGGTGGGCTATCCCCCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-
gi|114817                     :                      TTTCAGTC-A-CCAAAAATATGGTGA----CCCTTTTAATCACCCCGT--AAAAGGTCTGTGGGGATTGGGGTGAGCCATCCCCCAACAAACCG-TAC--A---CAT--A-attgacatgca
gi|114818                     :                      TTTCAATC-A-CTACAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTATGTCAGGGTCAGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATGTATGAGTCAA-GTT-attgacatgcat
gi|114819                     :                      TTTCAATC-A-CTAAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCTGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCTGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCA-TAC--A---AAT--A-T---ATGTATTAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114820                     :                      TTTCAATC-A-CTAAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCTGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCTGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCA-TAC--A---AAT--A-T---ATGTATTAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114821                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCAT--AATAGGTCTGTGAGGGTCTGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T--------------AA-GTT-GTAACATACATT
gi|114822                     :                      TTTCAATC-A-CTAAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCTGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGAAGGGCCATCCTTCAACAAACCG-TAC-------AT--A-T---ATGTATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114823                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCGATCCCTCAACAAACTG-TAC--A---CAT--A-T---ATATATTAGTCAA-GTT-GTAACATACATTgatatatatat
gi|114824                     :                      TTTCAATC-A-CTGAAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCC
gi|114825                     :                       TTTAGCT-A-CCGCAAG----GTTC----TCCGCTTA-TTAACCCGT--TATGGGTCTGCAGGTGTCGGGGT----CATCACGCTGTAAATCG-CAC--AAT-AAT--AGC---ATTTATAA---AATGTTAGCAACAT
gi|114826                     :                              -A-CCGTAAG----GTTG----CCTGTTTA-TTACCAT-T--AATGGGTCTGCAGGGGTCG----GGACCATCCCGCTGCAAACCG-CAC--A---tttgtagaacatat
gi|114827                     :                                    agct----GTGA----CTCATTTA-TCATCCCGT--AATAGGTCTGTGGGGGTCGGGGTGGGCCATCCCCCAGCCAACCG-TAC--A---AAT--A-gtaaagtttagcaacattttgcaaaacatat
gi|114828                     :                                    tatg----GTGA----CCCATTTAATTACCCCGT--AAAAGGTCTGTTGGGGTCGGGATGGGCCATCCCCCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-attgacatgcat
gi|114829                     :                                 tatgAAA----GTGA----TCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATGTATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATTattgacatgcat
gi|114830                     :                                     AAA----GTGA----TCTATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTGAGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---CAT--A-T---ATGTATTAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
gi|114831                     :                                        ----GTGA----CCAATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTATTAGGGTCGGGTGGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-
gi|114832                     :                                                    gCCATTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGTCCGGGTCGGGATGGGCCATCCCTCAACAAACCG-AAC--A---AAT--A-T---ATGTATTAGTCAA-GTT-ATAATATACATTgttgacatgcatgtttatctatatattttacaaa
gi|114833                     :                                                             TTACCCCGT--AATAGGTATGTAGGAGTCGGGGTGGGCAATCCCCTAACATACCG-TAC--AGACAATCGA-C---ATGTAT


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blockSeqs                     :                                    T   .       .      G    A         .           G                                     .  TT    .  G .        C G    .   G 
blockSeqs                     :                                    T   .       .      G    A         .           C                                     .  AT    .  T .        C G    .   G 
blockSeqs                     :                                    T   .       .      G    A         .           C                                     .  AT    .  G .        C G    .   G 
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blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        C G    .   T 
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blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        C G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        G G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        T G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        T G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        C G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        T G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        A G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        C G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        T G    .   G 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        T G    .   G 
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blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        . .    .   . 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        . .    .   . 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      T    A         .           T                                     .  .     .  . .        . .    .   . 
blockSeqs                     :                                    C   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        . .    .   . 
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    A         .           T                                     .  .     .  . .        . .    .     
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    .         .           T                                     .  .     .  . .                     
blockSeqs                     :                                    A   .       .      A    .         .           T                                     .  .     .  . .                     
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1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|114834 ): CCGCAAGTGCCGGGACCACCCGACTGCAAATCACACAATAACAGAATGTATAGAATTTCAACACCGTTTGCTTGCAACAAAACATGT






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Reference ( family-458 )      :                      TTTCAATC-A-CCGAAAA----GTGA----CCCGTTTAATCACCCCGT--AATAGGTCTGCGGGGGTCGGGGTGGGCCATCCCTCAACAAACCG-TAC--A---AAT--A-T---ATGTATCAGTCAA-GTT-GTAACATACATT
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gi|114833                     :                                                             TTACCCCGT--AATAGGTATGTAGGAGTCGGGGTGGGCAATCCCCTAACATACCG-TAC--AGACAATCGA-C---ATGTAT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|114834 ): CCGCAAGTGCCGGGACCACCCGACTGCAAATCACACAATAACAGAATGTATAGAATTTCAACACCGTTTGCTTGCAACAAAACATGT