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Reference ( gi|38931 )        :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGACG--TTA---TC---GACAGCAGAT-------C-----A-------GATATC------AAAAT-----A---AT-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
gi|38935                      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGACG--TTA---TG---GACAGCAGAT-------C-----A-------GAAATC------AAAAT-----A---ATA----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAACCAGGCTAA
gi|38921                      :                                TTTTAT-TT---T-G-GTCTCT--CGAGCTG--TTA---TA---GACAGCAGAT-------C-----A-------GATATC------AAAAT-----A---AT-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
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gi|38930                      : attgcatgtctttagggagcattttaaagatTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGAC-----------------AGCAGAT-------C-----A-------GATATC------AAAAT-----A---AT-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38937                      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG-----TTA---TG---GACAGCAGAA-------A-----G-------GATATC------CAAAT-----A---AT-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAAGCTA
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gi|38942                      :                                TTTTAT-TT---T-GCATCTTC--CGAG-----TTA---TG---GACAGCAGAA-------A-----G-------GATATC------CAAAT-----A---AT-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCATATT--TAATCAAGCTA
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Reference ( family-453 )      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGACG---TTA---TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
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Reference ( family-453 )      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG---AC----T--TA------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
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Reference ( family-453 )      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG---AC----T--TA------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
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gi|38960                      :                                                                                     AGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------C-----------A-A-----------AA-AAA-CTGTCCATCC---AC-----ACCTTATC--ATATCAGGCTAA
gi|38961                      :                                                                                     AGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------C-----------A-A-----------AA-AA--CTGTCCATCC---AC-----ACCTTATC--ATATCAGGCTAA
gi|38962                      :                                                                                     AGCATAT----C-----A---GATATCAA----ACT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCTTTATT--CAACCAGGCTAA
gi|38963                      :                                                                                      GCAGAT----C-----A---GATATCCG----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----ACCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38964                      :                                                                                                                                                  -----------A-A-----------AA-AAG-CTGCCCATCC---ACACATTGTTTTATTTATAAT-AGGCTAAgatgctg
gi|38965                      :                                                                                              gatatagaagtaaannnnnnnnnnaAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---GT-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAtggtctgtaaacagagagaga
gi|38966                      :                                                                                                                       AT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAAGCTA


blockSeqs                     :                                      G  AAT T        AC    CTGGCTTAA                       GATC TAATTG           CATA   ATTA TCATGTA .           AATTATGTAAT   TTATAAATTAA  C              TGA  ACATT        TA
blockSeqs                     :                                      .  .   .        AC    ACAACACAC                       .    GTGG             .      .    ATA     .           G             TTGTTTAATAA  A              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ATGGTGTCA                       .    A                .      .    .       .           .             .            A              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ATGCATTA                        .    A                .      .    .       .           .             .            A              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     CTGTTA                          .    A                .      .    .       .           .             .            A              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ACGTTA                          .    A                .      .    .       .           .             .            A              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ACGTTA                          .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ACCTA                           .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AGTTA                           .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ATA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TAA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TAG                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ACA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     CCA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     TTA                             .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     ACT                             .    A                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AC                              .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AC                              .    T                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AC                              .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AC                              .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     AC                              .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     A                               .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     A                               .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
blockSeqs                     :                                      .  .   .        .     A                               .    G                .      .    .       .           .             .            .              .    .            . 
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blockSeqCons                  :                                                            TTA*****************                                                      ***********
originalCons                  :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG---AC----T--TA------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
finalCons                     :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGTTA-----------------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA





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lowQualScore                  :                                      2  111 2        22    88888888888888 888888            7777 111111111        7777   7777 9999999 77777777777 44444444444 8 33333333333  6   8          333  99999        11            
consensus                     :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
Reference ( family-453 )      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
gi|38915                      :                                TTTTAT-TG---T-ACATCCAC--CGAG--------------A------TGAAAAGCACGT----C-----A---G-TATCCA----AAT----A-------AAAATTATGTAAT-----------A-A-----------AA-ATG-CTGCCCATCC---AC-----GCATTGTT--TTATTAGGATAA
gi|38916                      :          aattgcaagtacctttggcgtaTTTTAT-TG---T-ATATCCAC--TGAG--------------A------TGAAAAGCACAA----C-----A---GATGTCCA----AAT----A-------A-----------TAATTATGTAATA-A-----------AA-AAG-CTGTTCATCA---AC-----GCATTGTT--TTATTAAGCTAAaagccagtaaatagagagaga
gi|38917                      :          aattacaagtgcctttggcgtaTTTTAT-TC---T-ATATCCAC--CGAG--------------A------TGAAAAGCACGT----C-----A---GATGTCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-ATTATAAATTAAAA-AAG-CTGTCCATCC---AT-----GCATTGTT--TTATTAGGCTAAaagccggtaaacagtgagaga
gi|38918                      :             aattgcaagtgccttcggcgtaTAT-TTAATT-GCATATCCACCGAG--------------A------TGAAAAGCACGT----C-----A---GATGTCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-ATTGTTTAATAAAACAAG-CTGTCCATAT---AC-----GCATTGTT--TTAGTAGGCTAAaatctggttaacagagagaga
gi|38919                      :            aattgcaagtgcctttggcgTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------AT------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCAATC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAaagccggggaacagagagaga
gi|38920                      : attgcatgtctttagggagcattttaaagatTTTTAT-T------GCATATCCACCGAG--------------A------TGAAAAGAACGT----C-----A---GATGTCCACATAAAT----ATCATGTAA-----------T-----------A-A-----------AG-AGG-CTGTCCATCC---AC-----GCATTGTT--TTATTAGGCTAA
gi|38921                      :            ttccatgtgcctttgacgtaTTTTAT-TT---T-G-GTCTCT--CGAGCTG---TT------A------TAGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAAaagccggtaaacagagaggga
gi|38922                      :                gtgccttttacagattTTTTAT-TT---TTGAGTCTCC--CGAG------------------------ACAGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------G-A-----------AA-AAG-CTGTCCATCC---AC-----GCCTTATC--ATATGAGGCTA
gi|38923                      :                      gccttttgacattTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------------------------ACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----T-------A-----------T-----------A-A-----------AAAAAG-CTGTCCATTC---AC-----GTCTTATT--TAATCAGGCTAggag
gi|38924                      :                      gccttttaaaTTTTAT-TT---T-GTGTCTCC--CGAG------CTGGCTTAA------TGGACAACAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAGACTGTCCATTC---AT-----CCCTTATT--TAATCAGGCTAccagta
gi|38925                      :                   gccttttagtaatTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAA----A-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T--------------------------A-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAAGCTA
gi|38926                      :                  gccttttatttattTTTTGT-TT-----GTGTCTCA--CAAGATGCA-TT------A------TCAACAGCAGAT----T-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTTCATCC---AC-----AACTTATT--TAATCAGGATA
gi|38927                      :                   gccttttggacaaTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------AC------AACACACTGGGCAGCACAT----C-----G---GATATTCA----AAT----A-------A-----------TG----------A-A-----------AA-GAG-ATGTCCATCC---A--------CTTATT--TATTCAGGCTAA
gi|38928                      :                    ccttttgcttttTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------TA------A------TGGACAGCACAT----T-----G---GATAGCCA----AAT----A-------A-----------T-----------G-A-----------AA-AAG-CTGTCCATCG---AT-----GTCTTATT--TAATCAGGCCA
gi|38929                      :                      tttgacatttTTTTATGTT---T-GCGTATC----GAG------TA------G------TAGACAGCAGATGATCC-----GTGGGATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------TG-AAG-TTGTCCATCC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38930                      :                              tgTTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------------------------ACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38931                      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGACG---TT------A------TCGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAA
gi|38932                      :                                TTTTTT-TG---T-GTGTCTCC--C-----------------A------CG-ACAGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-TTGTCCATCC---AC-----GCCTTATC--ATATCAGGCTA
gi|38933                      :                                 TTT-T-TT---T-GCGTCTCC--CGAG--------------A------C---CAGCAGAT----C-----A---GATATCTA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATCC---GC-----GCCTTATC--ATATCAGGCCAgcaaag
gi|38934                      :                                TTTTAT-TT---C-GCATCTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAA----A-------A-----------T-----------T-T-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--AAATTA
gi|38935                      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAGACG---TT------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GAAATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AAAAAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAACCAGGCTAAttttatttaggttgcaggc
gi|38936                      :                                TTTTAT-TT---T-GTGTTTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAT----T-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCTATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCGGGCTA
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gi|38940                      :                                TTTTAT-TT---T-GCATCTCC--TGAG------TT------A------TGGACAACAGAT----C-----G---GATATCCA----AATATTAA-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-TCATCCATTCTGAAT-----GCCTTATT--TAACCAGGCTA
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gi|38942                      :                                TTTTAT-TT---T-GCATCTTC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAA----A-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCATATT--TAATCAAGCTA
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gi|38944                      :                                TTTTAT-TT---T-GCGTCTCC--CGAG------TT------A------TGGACAGCAGAA----A-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AG-AAG-CTGCCCATTC---AC-----ACCTTATT--TAATCAAGCTAt
gi|38945                      :                                TTTTAT-TT---T-GTGTCTCC--TGAG------CC------A------TGGACAGCAGAT----CTAATTG---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----ACCCAATT--TAATCAGGCT
gi|38946                      :                                 TTTAT-AT---T-GCGTCTCC--TGAG-------------------------CAGCAGAT----C-----G---GATATCAA----CAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----CCCTTATT--TAATCAGGC
gi|38947                      :                                 TTTAC-TG---T-GTGTCTCC--TGAG------TT------A------TG-ACGGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCGTTC---AC-----GCCTAATT--TAATCAGGCTA
gi|38948                      :                                                                           ------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----T-------A-----------C-----------A-A-----------AAAAAG-CTGTCCATTA---AC-----GCCTTACT--TAATCAGGCTAA
gi|38949                      :       ttattgcatgtctctaagaagcctttaaaagatT---T-GCGTCTCC--CGAGAG----TT------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---TC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTActaccagtgcacgtgaaaga
gi|38950                      :                                                                                   GACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAga
gi|38951                      :                                                              gagact------A------TGGACAGCAGGT----C-----A---GATATCAA----AAT----T-------A-----------T-----------A-A-----------AAAAAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38952                      :                                                                    ------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----AATA----A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----TCTTCATT--TAATTAGGCTAAgaa
gi|38953                      :                                                                    ------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----T-------A-----------T-----------A-A-----------AA--AG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38954                      :                                                                    ------A------TGGACAGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---TC-----GCCTTA-T--TAATCAGGCTA
gi|38955                      :                                                                    ------A------CGGACAGCAGAT----T-----A---GATATCAA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATG--TAATCAGGCTActcggaacatagaga
gi|38956                      :                                                                    ------A------TGGACAGCAGAT----C-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAT-CTGTCCGTTC---AT-----GCTTTATT--TAATCAGGC
gi|38957                      :                                                                                      AGCAGAT----T-----G---GATATCCA----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-ATGTTCATTC---AC-----GCCCTATT--TAATCAGGCTA
gi|38958                      :                                                                                    aaAGCAGAT----C-----A---GATATCCA----A-T----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATCC---AC-----ACCTTATC--ATATCAGGCTA
gi|38959                      :                                                                                      AGCAGAT----C-----A---GATATCAA----AAT----T-------A-----------T-----------ACA-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAGGCT
gi|38960                      :                                                                                      AGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------C-----------A-A-----------AA-AAA-CTGTCCATCC---AC-----ACCTTATC--ATATCAGGCTAA
gi|38961                      :                                                                                      AGCAGAT----C-----A---GATATCCA----AAT----A-------A-----------C-----------A-A-----------AA-AA--CTGTCCATCC---AC-----ACCTTATC--ATATCAGGCTAA
gi|38962                      :                                                                                      AGCATAT----C-----A---GATATCAA----ACT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCTTTATT--CAACCAGGCTAA
gi|38963                      :                                                                                       GCAGAT----C-----A---GATATCCG----AAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---AC-----ACCTTATT--TAATCAGGCTA
gi|38964                      :                                                                                                                                                   -----------A-A-----------AA-AAG-CTGCCCATCC---ACACATTGTTTTATTTATAAT-AGGCTAAgatgctg
gi|38965                      :                                                                                               gatatagaagtaaannnnnnnnnnaAT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AA-AAG-CTGTCCATTC---GT-----GCCTTATT--TAATCAGGCTAtggtctgtaaacagagagaga
gi|38966                      :                                                                                                                        AT----A-------A-----------T-----------A-A-----------AG-AAG-CTGTCCATTC---AC-----GCCTTATT--TAATCAAGCTA