lowQualScore : 1 111111 222222222 11111111 111
lowQualScore : 5 44 0 8 00 0 00 0 0 0000 111111 0 000 111111111 000 99999999 00 2 66 222 000 0 333 2 777 00
lowQualScore : . .. . . .. . .. . . .... ...... . ... ......... ... ........ .. . .. ... ... . ... . ... ..
lowQualScore : 5 66 6 9 66 4 66 4 4 9999 888888 4 777 888888888 777 11111111 66 7 88 000 777 4 666 9 111 88
consensus : TCTGTGNGTTCC-NTNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---NN-GG-T---TG-C----ATGAGATA---T-C-N----TACC--TGAT-NA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( gi|71294 ) : TCTGTGTGTTCC-ATGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71299 : TCTGTGTGTTCC-ATGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCC-ATTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71302 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCC-ATCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AAT----AA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTC-ACTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71287 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACT--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACG--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---G---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTC-ATCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTC-ATCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TGCC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AAT----GA---GT-GG-T---TG-T----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TATC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71251 : TCTGTGTGTTCC-ACTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AAT----GA---GT-TG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71243 : TCTGTGAGTTCC-ATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AAT----GA---GT-GG-T---TG-T----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71346 : TCTGTGTGTTCC-ATCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AA-AGATA---T-T-T----TACC--TGAT------A---AAAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTC-ATTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TG----A---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTT-AATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACT--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTC-ATCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGAAA---T-C-T----TACC--TGATAAA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---CT-GG-T---TG-C----AC-AGATA---T-C-T----TACT--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71219 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AAC----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-G-T----TACC--TGATAAA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTC-AATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GA-GG-T---TG-C----CC-AGATA---T-C-T----TACT--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71261 : TCTGTATGTTCC-ATCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AAT----AA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGAGA---T-C-T----TACC--TGAT--A---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71265 : tcTCTGTGCGTTCC-ATTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AAT----GA---TT-GG-T---TG-C----AT-AGATT---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTAC-ATTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TA-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGTT-AA---A---AAAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTC-ATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-----A---AT-GG-T---TG-C----AC-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTC-GTTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-ATATA---T-C-T----TACC--AGAT-TA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71209 : TTTATGCGTTCT-GTTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----AA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGATAAA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCC-ATTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-ATATA---T-C-T----TACC--TGAT-TA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCC-CTTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---AT-GG-T---TG-CATATAT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71202 : TCTGTGCATTCC-GTTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---G------------------T-AGATA---T-C-T----TACC--GGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCC-ATTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AAT----GA----T-AG-T---TG-C----CA-AAATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---ATAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71236 : TCTGTGCATTCA-GTTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T---G----TACC--TGAT-GA---A---AAAC-TTAAAC---CT-
gi|71205 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---CA-GG-T---TG------ATGAGATA---T---G----TGCC--TGCT-TA---A---AAAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71210 : TCTGTGTGTTCT-GTTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT--GAAA---T-G-TG---TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActc
gi|71247 : TCTGTGTGTTCT-GTTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GATAGGT-GG-A---TG-A----AA-CAATA---T-TATG---TACC--AGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-a
gi|71250 : TCTGTGTGTTCC-ATTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AAT----GA----T-AG-T---TT-G----AT-GAAAA---A-T-G----TACC--TGCT-TA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71203 : TCTATGAATTTT-CTAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTATAGA---AT-GA-T------------C-AAATA---T---G----TACC--TGCT-GA---A---AAAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71220 : TCTGTGCATTCC-ATTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AAT----GA---TA-GG-C---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71200 : TCTATGAGTTAC-CTGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAC----GA---TA-GA-C---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--AACT-CA---A---AAAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71214 : TCTGTGCATTCC-GTTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---C
gi|71272 : TCTGTGCATTAC-GTTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GA-T---TG------ATGAAATA---T---T----TACCTGTGCT-AA---A---AAAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTC-CTAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA---A-G-T----CACA---AAT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTC-CTAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---G---AACC-TTTAAC---
gi|71244 : TCTATGAGTTTC-CTAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----G-G----TACC--AAAT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71271 : TCTGTGCATTTC-GTTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AAT----GA---TT-GA-----TG---------AAATA---T---G----TACC--TGCTCAA---A---AAAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTC-CTAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AAT----GA----T-GGAT---TG------ATGAAATA---T-A------TACA--AACT-CA---A---AATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAA
gi|71235 : TTTATGAGTTTC-CTAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TAT----GA---TA-GG-TAAATGAA----AT-AAGTA---C-C-------AAC--TG----A---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71260 : TCTATGGGTTTT-CTAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT-GAAAA---A-T-G----TACC--TGCT-AA---A---AAAC-TCT
gi|71255 : TCTATGAGTTTC-CTGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG---------AAATA-----A-G----TACC--AACT-CA---A---AAAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTC-CTAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----A-G----TACC--AAAT-CA---A---AATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71228 : TCTGTGCAATTC-ATTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AAT----GT---TA-GG-A---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTC-CTAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----G-T----TACC--AAAT-CA---A---AAAC-TCTAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTC-GCTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AAT----GT---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACA--AGCT-CA---A---AAAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTC-CTCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-AG-T---TG------ATGAAATA---TGC-------ACC-------AACTCA---AAAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71266 : TCTATGAGTTTC-CTAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----A-G----TACC--AAAT-CA---A---AAACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71215 : TCTATGCATTTC-CTAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AAT----GA---TA-GA-T---TA------ATGAAATA---T---G----TACC--AACT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71225 : TCTACGAGTTTC-TTAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT-----------------G-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71222 : TCTACGAGTTTC-TTAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT-----------------G-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTC-CTAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AAT----G----GT-AA-T---TT-G----ATGAAATA-----C-G----TACC--TG
gi|71230 : TCTATGAGTTTC--TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AAT----GA---CA-GG-T---TG------ATGAGTTA---T-A-TAATGTACC--AGCT-CA---A---AAAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAAtttcaaaa
gi|71269 : TCTATAAGTTTC-CTAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACA--AACT-AA---A---TAAT-ATTAAC---GT-GTT-A--AAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTC-ATACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AAT----GA---AA-TG-T---TA------ATGAAATA---T---G----TACC-------AACTCA---AAAC-TTT
gi|71262 : TCTATGAGTTGC--TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AAT----GA---CA-GG-T---TG------AT-GAATG------------TAGC--TGCT-CA---A---AAAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAAtaaacagct
gi|71297 : TCTACGAGTTTC-CTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT--GA-A---T-C-----------------AA---A---AAA--TTTAAC---C
gi|71295 : TCTACGAGTTTC-CTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT--GA-A---T-C-----------------AA---A---AAA--TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71282 : TCTATG-ATTCC--TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------AT-GAAAA---A-A-G----TATC--AAAT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71281 : TCTATGAGTTTC-CTAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----G-G----TACC--AAAT-CA---A---AAAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTA-CTAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAAT----GA---TA-GG-A---TG------ATAAAATA-----A-G----TACT--AAAT-CA---A---AAA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTC-CTAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----A-G----TATC--AAAT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71608 : TATGCGTTTC-CTAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA---T---G----TACA--AACT-CA---A---AGAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71207 : TGAGTTTC-CTAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT-GAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-T
gi|71208 : tcaaTGAGTTTC-CTAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA----T-AG-G---TG------AT-GAATA---T---G----TACC--TGCT-TA---A---AAAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71627 : tcaaTGCATTTC-CTAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CAT----AA---CT-GA-----TG---------AAATA---T---G----TACA--TGAT--C---A---AAAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTC-CTAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AAT-----A---TTAAG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--AACT-CA---A---TATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71670 : TTCC-ATTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GA-T---TG-C----AT-TGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71651 : TTCC-AATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AAT----GA---GT-GA-T---TG-C----AT-AGAAA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : TTCC-AATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AAT----GA---TT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71657 : TTCC-AGTTATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AA-ATATA---T-C-T----TACC--TGATAAA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71639 : TTCT-CTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------AT--GAAA---T-T-T----C-----------A---A---AAAC-TTTAAC---C
gi|71638 : tTTTC-ATTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG-A----CG-AAATA---T---G----TACC--TGGT-CA---A---AATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71233 : TTCCTATAG--GAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACA--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71279 : tctattagtTTCC--TAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AAT----GA---TA-GG-A---TG------ATGAAATA-----A-G----TACC--AAAT-CA---A---GAGC-TCTAActaaacaa
gi|71611 : tctacgagaTTCC--TAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC-------AACT-A---AATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71606 : tataactTCC-A--GAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGT----GA---TA-GG-T---TG-A----CG-AAATA---T---G----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : tatgagGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-T-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT----AT---GT-GG-T---TG-C----AT-AGATA---T-C-T----TACC--TGAT-AA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T-A------TACC--TGCT--T---A---AAGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---TA-GA-T---TG------ATGAAATAAATT-A-TG---TACC--TTCT-TA---A---AAAC-TTTAA
gi|71626 : ATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TATC--TGCT-CA---ATTTAAAC-TTAAAC---C
gi|71784 : atgattttaTGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---GG-GG-T---TG-C----AT-AGAAA---T-T-G----TACC--TGAT-AA---A---AATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71609 : TGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GAT----GA---TA-AG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---C
gi|71226 : tatgattttcatctcTGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AAT----GA---
gi|71223 : tctactagtttccttTGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AAT----GA---taagtagatgaagtatgtacaaactcaaaaacattaactt
gi|71789 : tctactagtttccttTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AAT----GA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAAtaagtagatgaagtatgtacaaactcaaaaacattaactt
gi|71290 : atatTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AAT----TA---TA-TG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TATC--CACT-CG---A---AAAC-TCCAAC---a
gi|71805 : tctatgaattttctacaagattt-GTTTCA--TTCATAT-CC-AAT----GA---CA-GG-T---TG------ATGAAATA---T---G----TACC--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71808 : AT-GC-AAT----AA---TA-GG-T---TG------ATGAAATA---T-G-T-----ACA--TGCT-CA---A---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa
Alignments
lowQualScore : 1 1111 1111 111
lowQualScore : 1 0 2 1 0 00 0 00 0 0 33 8 0000 222222 00 00 7777 00 1 44 000 0 0 333 2 666 00
lowQualScore : . . . . . .. . .. . . .. . .... ...... .. .. .... .. . .. ... . . ... . ... ..
lowQualScore : 0 4 5 9 2 66 4 66 4 4 11 3 0000 888888 55 55 5555 55 5 11 777 4 4 444 8 888 88
consensus : TCTGTGNGTTTCNTNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATNGGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CGTACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( family-44 ) : TCTGTGNGTTCCNTNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGANNGGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CNTACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71200 : TCTATGAGTTACCTGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AACGATAGACTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTCCTAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAG---A-ACC-TTTAAC---
gi|71202 : TCTGTGCATTCCGTTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGA---GT---------A---G--AT--A--T--CTTACC--GGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71203 : TCTATGAATTTTCTAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTATAGAATG-ATC---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTCCTCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AATGATAAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GCACC---AAC-TCA---A-AAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71205 : TCTGTGTGTTCCATTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACAGGTTG-ATG---A---G--AT--A--T---GTGCC--TGCT-TAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71207 : TGAGTTTCCTAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A------AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-Tctc
gi|71208 : tcaaTGAGTTTCCTAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGG-TG-ATG---A------AT--A--T---GTACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71209 : tcaaTTTATGCGTTCTGTTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATAAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71210 : TCTGTGTGTTCTGTTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--G--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTCCTAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATGGATTG-ATG---A---A--AT--A--T---ATACA--AACT-CAA---A-ATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71214 : TCTGTGCATTCCGTTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---Ca
gi|71215 : TCTATGCATTTCCTAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATAGATTA-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTCATACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAAATGTTA-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--AACT-CAA---A-ACT-TTTAAa
gi|71219 : TCTGTGTGTTCCATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AACGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--GTTACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAacagct
gi|71220 : TCTGTGCATTCCATTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AATGATAGGCTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCCCTTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAATGGTTGCATATATA---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71222 : TCTACGAGTTTCTTAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT---------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71223 : TTCCTT---TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATAAGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---GTACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71225 : tctactagtTCTACGAGTTTCTTAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT---------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71226 : TTCCTT---TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATAAGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---GTACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71228 : tctactagtTCTGTGCAATTCATTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AATGTTAGGATG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTCCTAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACTGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AGTACC--AAAT-CAA---A-ATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71230 : TCTATGAGTTTC-TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACAGGTTG-ATG---A---GTTAT--A--TAATGTACC--AGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTCATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-AATGGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71233 : TCTATTAGTTTCCTATAGGAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71235 : TTTATGAGTTTCCTAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TATGATAGG-TAAATG---A---A--AT--A-----AGTACC--AACT-GAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActaaacaa
gi|71236 : TCTGTGCATTCAGTTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T---GTACC--TGAT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTCGCTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AATGTTAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACA--AGCT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71243 : TCTGTGAGTTCCATTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGTGGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71244 : TCTATGAGTTTCCTAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----GGTACC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71247 : TCTGTGTGTTCTGTTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGG-TGGATG---AAACA--AT--A--TTATGTACC--AGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-
gi|71250 : TCTGTGTGTTCCATTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AATGATAGTTTG-ATG---A---A--AA--A--T---GTACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71251 : TCTGTGTGTTCCACTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71255 : TCTATGAGTTTCCTGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AATGATAGGT----TG---A---A--AT--A-----AGTACC--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71260 : TCTATGGGTTTTCTAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AA--A--T---GTACC--TGCT-AAA---A-AAC-TCT
gi|71261 : TCTGTATGTTCCATCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AATAAGTGGTTGCAT----A---G--AG--A--T--CTTACC--TGAT--AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71262 : tcTCTATGAGTTGC-TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACAGGTTG-ATG---A------AT---------GTAGC--TGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTCCTAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--AAGT--CACA-----AAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71265 : TCTGTGCGTTCCATTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AATGATTGGTTGCAT----A---G--AT--T--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71266 : TCTATGAGTTTCCTAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AGTACC--AAAT-CAA---A-AACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71269 : TCTATAAGTTTCCTAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACA---AAC-TAA---ATAAT-ATTAAC---GT-GTT-A--AAA
gi|71271 : TCTGTGCATTTCGTTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AATGATTG-----ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCTCAAA---A-AAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAA
gi|71272 : TCTGTGCATTACGTTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGATTG-ATG---A---A--AT--A--T---TTACCTGTGCT-AAA---A-AAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTCCTAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGGTAATTTG-ATG---A---A--AT--A-----CGTACC--TGTT-TCA---A-AA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTCGTTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AATGAGTGGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CTTACC--AGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71279 : TCTACGAGATTCCTAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AGTACC--AAAT-CAA---G-AGC-TCTAA
gi|71281 : TCTATGAGTTTCCTAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----GGTACC--AAAT-CAA---A-AAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71282 : TCTATGA-TTCC-TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--A---A--A--AGTATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTCCTAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----GTTACC--AAAT-CAA---A-AAC-TCTAAC---CT-
gi|71287 : TCTGTGTGTTCCATTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71290 : TCTATGAATTTTCTACAAGATTTTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AATTATATGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTATC--CACT-CGA---A-AAC-TCCAAC---
gi|71294 : TCTGTGTGTTCCATGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71295 : TCTACGAGTTTCCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A--------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---C
gi|71297 : TCTACGAGTTTCCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A--------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71299 : TCTGTGTGTTCCATGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71302 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGAGGTTGC-CC---A---G--AT--A--T--CTTACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTCATCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AA--A--T--CTTACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTCACTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTACATTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTACAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGTT-AAA---A-AAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCCATTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCCATTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGTGGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CTTACC--TGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTTAATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACTGGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CTTACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCCATCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AATAAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTACTAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAATGATAGGATG-ATA---A---A--AT--A-----AGTACT--AAAT-CAA---A-AA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCCATTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AATGAGTTGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71346 : TCTGTGTGTTCCATCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCA-A---A---G--AT--A--T--TTTACC--TGAT---A---A-AAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTCATTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TG----AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACG--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTATC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTCATCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTGCC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTCATCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTCAATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAG---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCCATTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGTGGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCCATTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AATGATA-GTTGC-CA---A---A--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-TAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTCCTAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AGTATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71606 : TATGAGTCC---AGAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGTGATAGGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71608 : TATGCGTTTCCTAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AATGATAGGATG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACA--AACT-CAA---A-GAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71609 : TATGATTTTCATCTCTGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GATGATAAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71611 : TTTCCTAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC---AAC-T-A---A-ATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71626 : tataacTTAATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTATC--TGCT-CAATTTA-AAC-TTAAAC---C
gi|71627 : atgattTGCATTTCCTAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CATAACTG-----ATG---A---A--AT--A--T---GTACA--TGAT-C-A---A-AAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTCCTAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AATATTAAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--AACT-CAA---T-ATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71638 : TTTCATTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AATGATAGGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGGT-CAA---A-ATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71639 : TTCTCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--T--T--C-------------AA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71651 : tTTCCAATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGTGATTGCAT----A---G--AA--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71657 : TTCCAGTTATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGTGGTTGCA-A---A---T--AT--A--T--CTTACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : TTCCAATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AATGATTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71670 : TTCCATTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGATTGCATT-------G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATATGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--TTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : GATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CTTACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATAGATTG-ATG---A---A--ATAAA--TTATGTACC--TTCT-TAA---A-AAC-TTTAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---ATACC--TGCT-T-A---A-AGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71784 : TGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AATGAGGGGTTGCAT----A---G--AA--A--T--TGTACC--TGAT-AAA---A-ATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71789 : ATATTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AATGATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71805 : -GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---a
gi|71808 : AT-GC-AATAATAGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---GTACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11111 111
lowQualScore : 1 22 1 0 00 0 00 0 0 333 8 0000 222222 00 00 77777 00 1 44 000 0 0 333 2 666 00
lowQualScore : . .. . . .. . .. . . ... . .... ...... .. .. ..... .. . .. ... . . ... . ... ..
lowQualScore : 0 33 0 2 66 4 66 4 4 888 3 0000 888888 55 55 99999 55 5 11 777 4 4 444 8 888 88
consensus : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( family-44 ) : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-NGGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71200 : TCTATGAGTTACC-TGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AACGAT-AGACTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAG---A-ACC-TTTAAC---
gi|71202 : TCTGTGCATTCCG-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGA----GT---------A---G--AT--A--T--CT-TACC--GGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71203 : TCTATGAATTTTC-TAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTAT-AGAATG-ATC---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTCC-TCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-CACC---AAC-TCA---A-AAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71205 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAC-AGGTTG-ATG---A---G--AT--A--T---G-TGCC--TGCT-TAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71207 : TGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-Tctc
gi|71208 : tcaaTGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGG-TG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71209 : tcaaTTTATGCGTTCTG-TTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATAAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71210 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--G--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTCC-TAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAT-GGATTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACA--AACT-CAA---A-ATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71214 : TCTGTGCATTCCG-TTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---Ca
gi|71215 : TCTATGCATTTCC-TAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGAT-AGATTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTCA-TACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAA-ATGTTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-ACT-TTTAAa
gi|71219 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AACGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--GT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAacagct
gi|71220 : TCTGTGCATTCCA-TTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AATGAT-AGGCTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCCC-TTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAA-TGGTTGCATATATA---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71222 : TCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71223 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGAT-AAGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71225 : tctactaTCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71226 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGAT-AAGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71228 : tctactaTCTGTGCAATTCA-TTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AATGTT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACTGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-ATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71230 : TCTATGAGTTTC--TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGAC-AGGTTG-ATG---A---GTTAT--A--TAATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATAAT--GGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71233 : TCTATTAGTTTCC-TATAGGAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71235 : TTTATGAGTTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TATGAT-AGG-TAAATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-GAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActaaacaa
gi|71236 : TCTGTGCATTCAG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T---G-TACC--TGAT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTCG-CTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AATGTT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AGCT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71243 : TCTGTGAGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAG-TGGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71244 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71247 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGG-TGGATG---AAACA--AT--A--TTATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-
gi|71250 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AATGAT-AGTTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71251 : TCTGTGTGTTCCA-CTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71255 : TCTATGAGTTTCC-TGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AATGAT-AGGT----TG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71260 : TCTATGGGTTTTC-TAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-AAA---A-AAC-TCT
gi|71261 : TCTGTATGTTCCA-TCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AATAAG-TGGTTGCAT----A---G--AG--A--T--CT-TACC--TGAT--AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71262 : tcTCTATGAGTTGC--TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGAC-AGGTTG-ATG---A------AT---------G-TAGC--TGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--AAGT--CA-CA-----AAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71265 : TCTGTGCGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AATGAT-TGGTTGCAT----A---G--AT--T--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71266 : TCTATGAGTTTCC-TAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-AACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71269 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA---AAC-TAA---ATAAT-ATTAAC---GT-GTT-A--AAA
gi|71271 : TCTGTGCATTTCG-TTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AATGAT-TG-----ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCTCAAA---A-AAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAA
gi|71272 : TCTGTGCATTACG-TTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGATTG-ATG---A---A--AT--A--T--T--TACCTGTGCT-AAA---A-AAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGGT-AATTTG-ATG---A---A--AT--A-----CG-TACC--TGTT-TCA---A-AA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTCG-TTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AATGAG-TGGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--AGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71279 : TCTACGAGATTCC-TAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---G-AGC-TCTAA
gi|71281 : TCTATGAGTTTCC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71282 : TCTATGA--TTCC-TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--A---A--A--AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A------GTTACC--AAAT-CAA---A-AAC-TCTAAC---CT-
gi|71287 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71290 : TCTATGAATTTTC-TACAAGATTTTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AATTAT-ATGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--CACT-CGA---A-AAC-TCCAAC---
gi|71294 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71295 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---C
gi|71297 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71299 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71302 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-AGGTTGC-CC---A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTCA-TCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTCA-CTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTACA-TTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTACAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGTT-AAA---A-AAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCCA-TTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AATGAG-TGGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTTA-ATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAC-TGGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AATAAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTAC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAATGAT-AGGATG-ATA---A---A--AT--A-----AG-TACT--AAAT-CAA---A-AA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AATGAG-TTGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71346 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCA-A---A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT---A---A-AAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTCA-TTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TG----AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACG--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TATC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTCA-TCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TGCC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTCA-TCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAG---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AATGAG-TGGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCCA-TTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AATGAT-A-GTTGC-CA---A---A--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-TAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71606 : GAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGTGAT-AGGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71608 : tatgagtccaTATGCGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AATGAT-AGGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-GAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71609 : TATGATTTTCA-TCTCTGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GATGAT-AAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71611 : TTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC---AAC-T-A---A-ATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71626 : tataac-TTAATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--TGCT-CAATTTA-AAC-TTAAAC---C
gi|71627 : atgattTGCATTTCC-TAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CATAAC-TG-----ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGAT-C-A---A-AAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTCC-TAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AATATT-AAGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---T-ATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71638 : TTTCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGGT-CAA---A-ATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71639 : TTTCTCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--T--T--C--------------AA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71651 : TTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAG-TGATTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71657 : ATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAG-TGGTTGCA-A---A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : ttccagttTTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AATGAT-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71670 : TTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGATTGCATT-------G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-ATGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : GATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAG-TGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAT-AGATTG-ATG---A---A--ATAAA--TTATG-TACC--TTCT-TAA---A-AAC-TTTAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACC--TGCT-T-A---A-AGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71784 : TGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AATGAG-GGGTTGCAT----A---G--AA--A--T--TG-TACC--TGAT-AAA---A-ATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71789 : ATATTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AATGAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71805 : -GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAC-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---a
gi|71808 : AT-GC-AATAAT-AGGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11111 111
lowQualScore : 1 22 1 0 00 0 00 0 0 555 8 0000 222222 00 00 77777 00 1 44 000 0 0 333 2 666 00
lowQualScore : . .. . . .. . .. . . ... . .... ...... .. .. ..... .. . .. ... . . ... . ... ..
lowQualScore : 0 33 0 2 66 4 66 4 4 333 8 0000 888888 55 55 99999 55 5 11 777 4 4 444 8 888 88
consensus : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( family-44 ) : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71200 : TCTATGAGTTACC-TGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AACGATA-GACTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAG---A-ACC-TTTAAC---
gi|71202 : TCTGTGCATTCCG-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGA----GT---------A---G--AT--A--T--CT-TACC--GGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71203 : TCTATGAATTTTC-TAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTATA-GAATG-ATC---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTCC-TCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-CACC---AAC-TCA---A-AAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71205 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG-ATG---A---G--AT--A--T---G-TGCC--TGCT-TAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71207 : TGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-Tctc
gi|71208 : tcaaTGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71209 : tcaaTTTATGCGTTCTG-TTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71210 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--G--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTCC-TAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATG-GATTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACA--AACT-CAA---A-ATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71214 : TCTGTGCATTCCG-TTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---Ca
gi|71215 : TCTATGCATTTCC-TAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GATTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTCA-TACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAAA-TGTTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-ACT-TTTAAa
gi|71219 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AACGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--GT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAacagct
gi|71220 : TCTGTGCATTCCA-TTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AATGATA-GGCTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCCC-TTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAAT-GGTTGCATATATA---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71222 : TCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71223 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71225 : tctactaTCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71226 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71228 : tctactaTCTGTGCAATTCA-TTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AATGTTA-GGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACTGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-ATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71230 : TCTATGAGTTTC--TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG-ATG---A---GTTAT--A--TAATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATAAT--GGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71233 : TCTATTAGTTTCC-TATAGGAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71235 : TTTATGAGTTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TATGATA-GG-TAAATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-GAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActaaacaa
gi|71236 : TCTGTGCATTCAG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T---G-TACC--TGAT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTCG-CTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AATGTTA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AGCT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71243 : TCTGTGAGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71244 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71247 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TGGATG---AAACA--AT--A--TTATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-
gi|71250 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AATGATA-GTTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71251 : TCTGTGTGTTCCA-CTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71255 : TCTATGAGTTTCC-TGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGT----TG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71260 : TCTATGGGTTTTC-TAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-AAA---A-AAC-TCT
gi|71261 : TCTGTATGTTCCA-TCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AG--A--T--CT-TACC--TGAT--AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71262 : tcTCTATGAGTTGC--TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG-ATG---A------AT---------G-TAGC--TGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--AAGT--CA-CA-----AAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71265 : TCTGTGCGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AATGATT-GGTTGCAT----A---G--AT--T--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71266 : TCTATGAGTTTCC-TAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-AACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71269 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA---AAC-TAA---ATAAT-ATTAAC---GT-GTT-A--AAA
gi|71271 : TCTGTGCATTTCG-TTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AATGA-----TTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCTCAAA---A-AAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAA
gi|71272 : TCTGTGCATTACG-TTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG-ATG---A---A--AT--A--T--T--TACCTGTGCT-AAA---A-AAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGGTA-ATTTG-ATG---A---A--AT--A-----CG-TACC--TGTT-TCA---A-AA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTCG-TTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AATGAGT-GGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--AGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71279 : TCTACGAGATTCC-TAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---G-AGC-TCTAA
gi|71281 : TCTATGAGTTTCC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71282 : TCTATGA--TTCC-TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--A---A--A--AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A------GTTACC--AAAT-CAA---A-AAC-TCTAAC---CT-
gi|71287 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71290 : TCTATGAATTTTC-TACAAGATTTTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AATTATA-TGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--CACT-CGA---A-AAC-TCCAAC---
gi|71294 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71295 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---C
gi|71297 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71299 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71302 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGA-GGTTGC-CC---A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTCA-TCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTCA-CTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTACA-TTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTACAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGTT-AAA---A-AAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCCA-TTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTTA-ATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACT-GGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTAC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAATGATA-GGATG-ATA---A---A--AT--A-----AG-TACT--AAAT-CAA---A-AA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AATGAGT-TGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71346 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCA-A---A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT---A---A-AAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTCA-TTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TG----AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACG--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TATC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTCA-TCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TGCC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTCA-TCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAG---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCCA-TTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AATGATA--GTTGC-CA---A---A--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-TAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71606 : GAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGTGATA-GGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71608 : tatgagtccaTATGCGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-GAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71609 : TATGATTTTCA-TCTCTGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GATGATA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71611 : TTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC---AAC-T-A---A-ATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71626 : tataac-TTAATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--TGCT-CAATTTA-AAC-TTAAAC---C
gi|71627 : atgattTGCATTTCC-TAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CATAA-----CTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGAT-C-A---A-AAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTCC-TAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AATATTA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---T-ATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71638 : TTTCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGGT-CAA---A-ATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71639 : TTTCTCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--T--T--C--------------AA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71651 : TTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GATTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71657 : ATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCA-A---A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : ttccagttTTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AATGATT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71670 : TTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GATTGCATT-------G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-ATGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : GATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG-ATG---A---A--ATAAA--TTATG-TACC--TTCT-TAA---A-AAC-TTTAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACC--TGCT-T-A---A-AGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71784 : TGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AATGAGG-GGTTGCAT----A---G--AA--A--T--TG-TACC--TGAT-AAA---A-ATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71789 : ATATTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71805 : -GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---a
gi|71808 : AT-GC-AATAATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11111 111
lowQualScore : 1 22 1 0 00 0 00 0 0 555 8 0000 222222 00 00 77777 00 1 44 000 0 0 333 2 666 00
lowQualScore : . .. . . .. . .. . . ... . .... ...... .. .. ..... .. . .. ... . . ... . ... ..
lowQualScore : 0 33 0 2 66 4 66 4 4 333 8 0000 888888 55 55 99999 55 5 11 777 4 4 444 8 888 88
consensus : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( family-44 ) : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71200 : TCTATGAGTTACC-TGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AACGATA-GACTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAG---A-ACC-TTTAAC---
gi|71202 : TCTGTGCATTCCG-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGA----GT---------A---G--AT--A--T--CT-TACC--GGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71203 : TCTATGAATTTTC-TAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTATA-GAATG-ATC---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTCC-TCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-CACC---AAC-TCA---A-AAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71205 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG-ATG---A---G--AT--A--T---G-TGCC--TGCT-TAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71207 : TGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-Tctc
gi|71208 : tcaaTGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TG-ATG---A------AT--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71209 : tcaaTTTATGCGTTCTG-TTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71210 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--G--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTCC-TAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATG-GATTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACA--AACT-CAA---A-ATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71214 : TCTGTGCATTCCG-TTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---Ca
gi|71215 : TCTATGCATTTCC-TAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GATTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTCA-TACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAAA-TGTTA-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---A-ACT-TTTAAa
gi|71219 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AACGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--GT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAacagct
gi|71220 : TCTGTGCATTCCA-TTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AATGATA-GGCTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCCC-TTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAAT-GGTTGCATATATA---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71222 : TCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71223 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71225 : tctactaTCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71226 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG-ATG---A---A--GT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---TT-
gi|71228 : tctactaTCTGTGCAATTCA-TTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AATGTTA-GGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACTGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-ATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71230 : TCTATGAGTTTC--TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG-ATG---A---GTTAT--A--TAATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATAAT--GGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71233 : TCTATTAGTTTCC-TATAGGAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71235 : TTTATGAGTTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TATGATA-GG-TAAATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-GAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActaaacaa
gi|71236 : TCTGTGCATTCAG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T---G-TACC--TGAT-GAA---A-AAC-TTAAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTCG-CTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AATGTTA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AGCT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71243 : TCTGTGAGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71244 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71247 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TGGATG---AAACA--AT--A--TTATG-TACC--AGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-
gi|71250 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AATGATA-GTTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71251 : TCTGTGTGTTCCA-CTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71255 : TCTATGAGTTTCC-TGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGT----TG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AACT-CAA---A-AAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71260 : TCTATGGGTTTTC-TAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AA--A--T---G-TACC--TGCT-AAA---A-AAC-TCT
gi|71261 : TCTGTATGTTCCA-TCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AG--A--T--CT-TACC--TGAT--AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71262 : tcTCTATGAGTTGC--TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG-ATG---A------AT---------G-TAGC--TGCT-CAA---A-AAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--AAGT--CA-CA-----AAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71265 : TCTGTGCGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AATGATT-GGTTGCAT----A---G--AT--T--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71266 : TCTATGAGTTTCC-TAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---A-AACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71269 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA---AAC-TAA---ATAAT-ATTAAC---GT-GTT-A--AAA
gi|71271 : TCTGTGCATTTCG-TTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AATGA-----TTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCTCAAA---A-AAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAA
gi|71272 : TCTGTGCATTACG-TTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG-ATG---A---A--AT--A--T--T--TACCTGTGCT-AAA---A-AAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGGTA-ATTTG-ATG---A---A--AT--A-----CG-TACC--TGTT-TCA---A-AA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTCG-TTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AATGAGT-GGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--AGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71279 : TCTACGAGATTCC-TAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TACC--AAAT-CAA---G-AGC-TCTAA
gi|71281 : TCTATGAGTTTCC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----GG-TACC--AAAT-CAA---A-AAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71282 : TCTATGA--TTCC-TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--A---A--A--AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A------GTTACC--AAAT-CAA---A-AAC-TCTAAC---CT-
gi|71287 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71290 : TCTATGAATTTTC-TACAAGATTTTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AATTATA-TGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--CACT-CGA---A-AAC-TCCAAC---
gi|71294 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71295 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---C
gi|71297 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---------------------------AT-CAA---A-AAA-TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71299 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71302 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGA-GGTTGC-CC---A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTCA-TCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTCA-CTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTACA-TTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTACAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGTT-AAA---A-AAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCCA-TTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTGCAT----A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-TAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTTA-ATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACT-GGTTGCAC----A---G--AT--A--T--CT-TACT--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTAC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAATGATA-GGATG-ATA---A---A--AT--A-----AG-TACT--AAAT-CAA---A-AA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AATGAGT-TGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71346 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCA-A---A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT---A---A-AAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTCA-TTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TG----AA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACG--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TATC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTCA-TCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TGCC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTCA-TCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAG---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTGTAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCCA-TTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AATGATA--GTTGC-CA---A---A--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-TAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A-----AG-TATC--AAAT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71606 : GAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGTGATA-GGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71608 : tatgagtccaTATGCGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AATGATA-GGATG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--AACT-CAA---A-GAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71609 : TATGATTTTCA-TCTCTGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GATGATA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71611 : TTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC---AAC-T-A---A-ATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71626 : tataac-TTAATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TATC--TGCT-CAATTTA-AAC-TTAAAC---C
gi|71627 : atgattTGCATTTCC-TAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CATAA-----CTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGAT-C-A---A-AAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTCC-TAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AATATTA-AGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--AACT-CAA---T-ATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71638 : TTTCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ACG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGGT-CAA---A-ATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71639 : TTTCTCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--T--T--C--------------AA---A-AAC-TTTAAC---C
gi|71651 : TTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GATTGCAT----A---G--AA--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71657 : ATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTGCA-A---A---T--AT--A--T--CT-TACC--TGATAAAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : ttccagttTTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AATGATT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71670 : TTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GATTGCATT-------G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-ATGTGGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--TT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : GATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTGCAT----A---G--AT--A--T--CT-TACC--TGAT-AAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG-ATG---A---A--ATAAA--TTATG-TACC--TTCT-TAA---A-AAC-TTTAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---A-TACC--TGCT-T-A---A-AGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71784 : TGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AATGAGG-GGTTGCAT----A---G--AA--A--T--TG-TACC--TGAT-AAA---A-ATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71789 : ATATTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AATGATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71805 : -GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACC--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---a
gi|71808 : AT-GC-AATAATA-GGTTG-ATG---A---A--AT--A--T---G-TACA--TGCT-CAA---A-AAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa
blockSeqs : A TC A TGT C ATAT AACA AATG C AA ATG C CTC
blockSeqs : C C T TA C G GTT TATG A AA TCG C CTC
blockSeqs : A G A TA C C A TATG C CA TCA C CCC
blockSeqs : A C C TA C G G CT A AA CT C CTC
blockSeqs : T C T CA A G A CT C AA TT C CTC
blockSeqs : A A A TA C G A GT C C . C CTC
blockSeqs : A C A TA T G G CT C A . . CTC
blockSeqs : C C T GT G G G AG A G . . CTC
blockSeqs : T G T TA C G A CT C T . . CT
blockSeqs : A G A TG C G A AG C T . . CT
blockSeqs : C C T TA C G A CT C C . . CT
blockSeqs : C G A TA C G A GG C T . . CT
blockSeqs : A C A AA C G A CT C C . . CT
blockSeqs : T A T GT C G G AG A C . . CT
blockSeqs : C A T TA C G A CT C C . . CT
blockSeqs : A A T AT C G G CA A C . . CT
blockSeqs : A C A TA C G A CT C C . . CT
blockSeqs : A T T TA C G A AG C C . . TT
blockSeqs : C C A TA C G A CG C A . . CT
blockSeqs : A T T TA C G A CT C C . . CT
blockSeqs : A C T CA C G A AG C C . . CT
blockSeqs : A A A TA C G A GG A C . . .
blockSeqs : A C A TA C G G AG C C . . .
blockSeqs : A A T GT C G A GT A C . . .
blockSeqs : C C A TA C G A CT C C . . .
blockSeqs : A C A GT C G G CT C C . . .
blockSeqs : A G T TA C G A CT A A . . .
blockSeqs : A G T TA C G G CT C C . . .
blockSeqs : T A T TA C G A CT A G . . .
blockSeqs : T C A GT C G A CT A G . . .
blockSeqs : T G T TA C G G CT C C . . .
blockSeqs : A A T TA C G A CT C A . . .
blockSeqs : G A T GT C G A CT A C . . .
blockSeqs : T C G CA T G G CT C C . . .
blockSeqs : A C A TA C G A CT C T . . .
blockSeqs : A A C TT C G G CT A A . . .
blockSeqs : C C A TA C G A CT C C . . .
blockSeqs : A A A TA C G A AG A A . . .
blockSeqs : A C T TA C G A CT A C . . .
blockSeqs : C C A TA C G A TT A C . . .
blockSeqs : C G A GT C G A CT A A . . .
blockSeqs : A G T TA C G T CT C C . . .
blockSeqs : T C T TA C C A CT C T . . .
blockSeqs : A G A TA . A A CT T A . . .
blockSeqs : A C T TA . A A CT A T . . .
blockSeqs : A C A GT . A A CT A T . . .
blockSeqs : A C A TA . G G CT A C . . .
blockSeqs : T C A GT . G A CT A C . . .
blockSeqs : A A A TA . G G AG A C . . .
blockSeqs : T C T TA . G G CT A C . . .
blockSeqs : A A A GT . G G CT C A . . .
blockSeqs : A C G GT . G G CT A C . . .
blockSeqs : T C A GA . G G CT A A . . .
blockSeqs : T A A GT . G G CT A C . . .
blockSeqs : T A G GT . G G TT A C . . .
blockSeqs : T A T GT . G G CT A A . . .
blockSeqs : T A T GT . A T TG A A . . .
blockSeqs : A A C GT . T G G A A . . .
blockSeqs : T A T GT . G G G A A . . .
blockSeqs : C A T CT . G G G T A . . .
blockSeqs : T A T GT . G A G A A . . .
blockSeqs : T A T TA . G G G A T . . .
blockSeqs : T A T GT . G G G A A . . .
blockSeqs : A A T GT . . G G A A . . .
blockSeqs : T C C GT . . G A A A . . .
blockSeqs : T A A GT . . G G A C . . .
blockSeqs : T A T GT . . G G A A . . .
blockSeqs : T A C GT . . G G A A . . .
blockSeqs : T A T GT . . G G A A . . .
blockSeqs : T A T GT . . G G A A . . .
blockSeqs : T A T GT . . A G A A . . .
blockSeqs : T A C TA . . A G A A . . .
blockSeqs : T A C TA . . A G A A . . .
blockSeqs : T A T TA . . A G A A . . .
blockSeqs : C A T TA . . A G A C . . .
blockSeqs : C C T TA . . A G A A . . .
blockSeqs : A C A TA . . A G A C . . .
blockSeqs : C A A TA . . A G C C . . .
blockSeqs : A C C TA . . A G C T . .
blockSeqs : C A TA . . A G A C . .
blockSeqs : C T TA . . A G C C . .
blockSeqs : A A GT . . G G A C . .
blockSeqs : A A GT . . T T C C . .
blockSeqs : A T TT . . G G G A . .
blockSeqs : A A GT . . G G A A .
blockSeqs : . T GT . . G G A A .
blockSeqs : . T GT . . G G A A .
blockSeqs : T TA . . G G A A .
blockSeqs : TA . . A G A A .
blockSeqs : GG . . A G A T .
blockSeqs : TA . . G G A T .
blockSeqs : CA . . A G C A .
blockSeqs : TA . . A C C C
blockSeqs : T . . A A A C
blockSeqs : . . . . G C C
blockSeqs : . . . . G C .
blockSeqs : . . . . G C .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : CT*** ***
originalCons : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--T--CG-TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
finalCons : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTGCATG---A---G--AT--A--TCT---TACC--TGAT-NAA---A-AAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Alignments
lowQualScore : 11 1111 22222222 111
lowQualScore : 1 22 1 0 00 0 00 0 0 555 99 0000 2222 000 00000000 00 1 44 000 0 333 2 666 00
lowQualScore : . .. . . .. . .. . . ... .. .... .... ... ........ .. . .. ... . ... . ... ..
lowQualScore : 0 33 0 2 66 4 66 4 4 333 22 2222 1111 777 22222222 66 6 11 777 4 555 9 333 88
consensus : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-CATG---A---GATA---T-C-N----TACC--TGAT-NAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
Reference ( family-44 ) : TCTGTGNGTTTCN-TNGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG-CATG---A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-NAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71200 : TCTATGAGTTACC-TGGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AACGATA-GACTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--AACT-CAA---AAAC-TTTAAC---TT-GCT-A--AAA
gi|71201 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGTTAAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--CTCATAT-TC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAG---AACC-TTTAAC---
gi|71202 : TCTGTGCATTCCG-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGA----GT----------A---GATA---T-C-T----TACC--GGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---AT-G---A--AAAA
gi|71203 : TCTATGAATTTTC-TAGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATTATA-GAATG--ATC---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-GAA---AAAC-TTAAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71204 : TCTATGAGTTTCC-TCGACGATGCTAAAGAC--ACATGTGAA-AATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-AGTTG--ATG---A---AATA---TGC-------ACC---AAC-TCA---AAAC-TTTAAG---CT-GCT-A--AAAa
gi|71205 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG--ATG---A---GATA---T---G----TGCC--TGCT-TAA---AAAT-TTTAAC---CT-G---
gi|71207 : TGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAT--ACATGTGAA-GTTCCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A----ATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-Tctc
gi|71208 : tcaaTGAGTTTCC-TAGATGATGTTGAACAA--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TG--ATG---A----ATA---T---G----TACC--TGCT-TAA---AAAC-TTcaaagtccaaaa
gi|71209 : tcaaTTTATGCGTTCTG-TTGATCATACTGAACAA--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGATAAAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71210 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATAATACTGAACAC--ACATAAGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATG---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71213 : TCTATGAGTTTCC-TAGTTGATGCTGAACAC--ACATGTCAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATG-GATTG--ATG---A---AATA---T-A------TACA--AACT-CAA---AATC-TTTAAT---CT-GCT-A--AAAAa
gi|71214 : TCTGTGCATTCCG-TTAATGATACTTAACAG--ACATGTGAA-GATTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---Ca
gi|71215 : TCTATGCATTTCC-TAAATGACACTTAACAC--ATATGTTAA-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GATTA--ATG---A---AATA---T---G----TACC--AACT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71216 : TTTATGAGTTTCA-TACATGATGTTGAACAC--AAATGTGAT-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGAAA-TGTTA--ATG---A---AATA---T---G----TACC--AACT-CAA---AACT-TTTAAa
gi|71219 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AACGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-G-T----TACC--TGATAAAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAacagct
gi|71220 : TCTGTGCATTCCA-TTGATGATACTGAATAC--ACATGTGAA-GT------TTCATAT-CT-AATGATA-GGCTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71221 : TCTGCAAGTTCCC-TTGATGATGCTAAACAC--AC--GTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAAT-GGTTG-CATATATA---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAT-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71222 : TCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71223 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG--ATG---A---AGTA---T---G----TACA--AACT-CAA---AAAC-ATTAAC---TT-
gi|71225 : tctactaTCTACGAGTTTCT-TAGATGATTTTGAACAA--AAATGTGAA-GATTTA--TTCATAT-CT----------GTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71226 : GTTTCC-TT--TGATGCTGAACAT--G-ATGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-AGTAG--ATG---A---AGTA---T---G----TACA--AACT-CAA---AAAC-ATTAAC---TT-
gi|71228 : tctactaTCTGTGCAATTCA-TTGATGATACTAAACAC----ATGTGAA-GTGTCA--TTCATAT-CC-AATGTTA-GGATG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAGC-TTTAACATGCT-C---A--AAAA
gi|71229 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTAT-CC-ACTGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----A-G----TACC--AAAT-CAA---AATC-TTTAACCT-CT-G---A--AA
gi|71230 : TCTATGAGTTTC--TAGTTGATGTTGAACAC--AC-TGTGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG--ATG---A---GTTA---T-A-TAATGTACC--AGCT-CAA---AAAC-TCGAACTCGCT-C---A--AAAA
gi|71231 : TCTGTGAGTTTCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATAAT--GGTTG-CAC----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TCTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71233 : TCTATTAGTTTCC-TATAGGAGGATGAATAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCCTAT-TC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACA--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71235 : TTTATGAGTTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATGT-CA-TATGATA-GG-TA-AATG---A---AATA-----A-G----TACC--AACT-GAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAActaaacaa
gi|71236 : TCTGTGCATTCAG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T---G----TACC--TGAT-GAA---AAAC-TTAAAC---CT-
gi|71237 : TCTGTCAATTTCG-CTGATGATACTAAACAC--ACATGTGAT-GTTTCA--TCCATAT-CC-AATGTTA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACA--AGCT-CAA---AAAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71243 : TCTGTGAGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GGTTG-TAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAAa
gi|71244 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAA-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----G-G----TACC--AAAT-CAA---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71247 : TCTGTGTGTTCTG-TTGATGATACTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GG-TG-GATG---AAACAATA---T-TATG---TACC--AGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-
gi|71250 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATAATACAGAACAC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATA--CC-AATGATA-GTTTG--ATG---A---AAAA---T---G----TACC--TGCT-TAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCCCA--AAAAactaaaa
gi|71251 : TCTGTGTGTTCCA-CTGATGATGCTAAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71255 : TCTATGAGTTTCC-TGGAGAATGCTGGACAT--GCATGTGAA-ATTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGTTGAAATA---A---G---------------TACC--AACT-CAA---AAAC-ATTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71260 : TCTATGGGTTTTC-TAGATGATGCTGAACACACACATGTGAC-GTTTCC--TTCATGT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AAAA---T---G----TACC--TGCT-AAA---AAAC-TCT
gi|71261 : TCTGTATGTTCCA-TCGATGATGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTCTCA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTG-CAT----A---GAGA---T-C-T----TACC--TGAT--AA---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71262 : tcTCTATGAGTTGC--TAGATGATGTTGAACAC--AC---TGAA-GTTTCA--TCCAAAT-CA-AATGACA-GGTTG--ATG---A----ATG------------TAGC--TGCT-CAA---AAAC-TCGAACTCACT-C---A--AAAA
gi|71264 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA---A-G-T----CACA---AAT-CAA---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71265 : TCTGTGCGTTCCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTTA--TTCATAT-CA-AATGATT-GGTTG-CAT----A---GATT---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71266 : TCTATGAGTTTCC-TAGGGGATGTTGAAGAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----A-G----TACC--AAAT-CAA---AAACTTTTAACTT-CT-A---A--AAA
gi|71269 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAT-GTTTCA--ATCATGT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T-
gi|71271 : TCTGTGCATTTCG-TTGATAATGCTGAACAC--ACATATAAA-GTTTCA--TTCA-AT--C-AATGA-----TTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCTCAAA---AAAC-TTTCAT---CT-GCTCA--AAAAgtacaaactaaataatattaacgtgttaaaa
gi|71272 : TCTGTGCATTACG-TTGATGATACTGAACAC--ACATTTTAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG--ATG---A---AATA---T---T----TACCTGTGCT-AAA---AAAC-TGTAAC---CA-G---ATTAAAA
gi|71274 : TCTATAAGTTTCC-TAGATGATGATGAACTG--AAATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGGTA-ATTTG--ATG---A---AATA-----C-G----TACC--TGTT-TCA---AAA
gi|71275 : TCTGTGTGTTTCG-TTCATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CG-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---TATA---T-C-T----TACC--AGAT-TAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71279 : TCTACGAGATTCC-TAAAGGATGTTGAACAA--ACATGTGAA-GTTGCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----A-G----TACC--AAAT-CAA---GAGC-TCTAA
gi|71281 : TCTATGAGTTTCC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACAAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-AC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----G-G----TACC--AAAT-CAA---AAAT-TTGAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71282 : TCTATGA--TTCC-TAGAGGATGTTGAAC-----CATGTGAA-GTTTCA--TTCA-ATCCC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AA-A---A-A-G----TATC--AAAT-CAA---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71285 : TCTATGAGTTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--GCCAGTGAG-GTTTCA--TTCCTGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----G-T----TACC--AAAT-CAA---AAAC-TCTAAC---CT-
gi|71287 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGCTGAACAC--ACGTGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACT--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71290 : TCTATGAATTTTC-TACAAGATTTTGAACA---AGATGTGAA-GTTTAA--TTCATGT-CC-AATTATA-TGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TATC--CACT-CGA---AAAC-TCCAAC---
gi|71294 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71295 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---------------------------AT-CAA---AAAA-TTTAAC---C
gi|71297 : TCTACGAGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAC--ACATGTAAA-----CA--TTCATAG-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---------------------------AT-CAA---AAAA-TTTAAC---Caaattctcaaa
gi|71299 : TCTGTGTGTTCCA-TGGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CC-G---A--AAAAaaattctcaaa
gi|71302 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71305 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGA-GGTTG-C-CC---A---GATA---T-C-T----TACT--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71309 : TCTATGTGTTTCA-TCAATGATGGTGATCAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GAAA---T-C-T----TACC--TGATAAAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71312 : TCTGTGTGTTTCA-CTGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71320 : TCCGTGAGTTACA-TTGATGATGCTGAACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTA-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGTT-AAA---AAAA-TTTAAT---CT-G---A--AAAA
gi|71321 : TCTGTGTGTCCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-ATTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71325 : TCTGTGCATTCCA-TTAATGATGCTGCCCAA--ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---TATA---T-C-T----TACC--TGAT-TAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71326 : TCTGTGTGTTTTA-ATGATGATGGTGAACAA--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACT--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAA
gi|71327 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACT-GGTTG-CAC----A---GATA---T-C-T----TACT--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71338 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGATGAACAC--ACATGTGAA-GTTTGA--TTCATAT-CC-AATAAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71339 : TCTATGAGTTTAC-TAAAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-AT------TTCATGT-CCAAATGATA-GGATG--ATA---A---AATA-----A-G----TACT--AAAT-CAA---AAA--TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71344 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-AC-AATGAGT-TGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---
gi|71346 : TCTGTGTGTTCCA-TCGATGATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CA-A---A---GATA---T-T-T----TACC--TGAT---A---AAAC-TTTTAC---CT-G---A--AAAA
gi|71348 : TCTGTGTGTTTCA-TTGATGATAGTAAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TG----AA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71351 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACG--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71352 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TATC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71353 : TCTGTGTGTTTCA-TCGTTGGTGGTAAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TGCC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71355 : TCTGTGTGTTTCA-TCGATGATGGTAAAAAC--GCATGTGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71359 : TCTGTGTGTTTCA-ATGATGATGGTGAACAC--ACATGCAAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAG---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71361 : TCTGTGTGTTCCA-TTGATGATGGTGAACAT--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CT-AATGAGT-GGTTG-TAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTAAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71364 : TCTGTGTGTTCCA-TTGGCGATGCTGAACAC--ACACGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-GG-AATGATA--GTTG-C-CA---A---AATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---ATAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71605 : TATGCATTTCC-TAGAGGATGTTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA-----A-G----TATC--AAAT-CAA---AAAC-TTTAAC---CTCT---A--AAAA
gi|71606 : GAGGATGCTCAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AGTGATA-GGTTG--ACG---A---AATA---T---G----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71608 : tatgagtccaTATGCGTTTCC-TAGATGATGCTGAACAT--GCATGGGAA-GTTTTA--TTAATGT-CC-AATGATA-GGATG--ATG---A---AATA---T---G----TACA--AACT-CAA---AGAC-AGTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71609 : TATGATTTTCA-TCTCTGATACTGAACA---ACATGTGAA-ATTTCA--TTCATAT-TC-GATGATA-AGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---C
gi|71611 : TTTCC-TAGATAATGCTGAACAC--ACATTTCAA-GTTTGG--TTAGTGA-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC---AAC-T-A---AATC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAA
gi|71626 : tataac-TTAATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GATTCA--CTCATAC-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TATC--TGCT-CAATTTAAAC-TTAAAC---C
gi|71627 : atgattTGCATTTCC-TAGATGATGTTGAACGA--ACATGTGAAGGTTTCA--TTCATAT-CC-CATAA-----CTG--ATG---A---AATA---T---G----TACA--TGAT-C-A---AAAC-TT--AC---CT-
gi|71629 : aTGAGTTTCC-TAAATGACGCTGAATGC--ACATGTGAA-GTTTTA--TTCATAC-CC-AATATTA-AGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--AACT-CAA---TATC-TTTAAC---CT-ACT-A--AAAA
gi|71638 : TTTCA-TTGATGATACTGAACAC--ACATGAGAA-GTTTCATTTTTATAT-CC-AATGATA-GGTTG--ACG---A---AATA---T---G----TACC--TGGT-CAA---AATC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAa
gi|71639 : TTTCTCTAGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATT---T-C------------------AA---AAAC-TTTAAC---C
gi|71651 : TTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-TG-AATGAGT-GATTG-CAT----A---GAAA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAA-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71657 : ATGATGCTGGACAT--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AATGAGT-GGTTG-CA-A---A---TATA---T-C-T----TACC--TGATAAAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71662 : ttccagttTTCCA-ATGATGATGCTGAACAC--ACCCGTGAA-GTTTCT--TTCATAT-CC-AATGATT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-CTTAAC---CT-G---
gi|71670 : TTCCA-TTGATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GATTG-CATT-------GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71721 : GATGATGCTGAACAC--ATATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CA-AAT-ATGTGGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71731 : GATTATGGTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-T-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71734 : GATGATGGTGAACAC--ACATGCGAA-GTTTCA--TTTATAT-CC-AATGAGT-GGTTG-CAT----A---GATA---T-C-T----TACC--TGAT-AAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71767 : ATGATGTAGAACAC--ACATG--AA-GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGATA-GATTG--ATG---A---AATAAATT-A-TG---TACC--TTCT-TAA---AAAC-TTTAA
gi|71770 : ATAATGCTAAGCAC--A--TGTGAA-GTTTCA--TTCAAAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T-A------TACC--TGCT-T-A---AAGT-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAA
gi|71784 : TGACGCTGAACAC--ACATGTGAA-GTATCA--TTCATAT-CC-AATGAGG-GGTTG-CAT----A---GAAA---T-T-G----TACC--TGAT-AAA---AATC-TTTAAC---CT-G---A--AAAA
gi|71789 : ATATTGAACAC--ACATGTGAA-GTTTCA--TTCTTAT-CC-AATGATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCT-A--AAAA
gi|71805 : -GTTTCA--TTCATAT-CC-AATGACA-GGTTG--ATG---A---AATA---T---G----TACC--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-G---a
gi|71808 : AT-GC-AATAATA-GGTTG--ATG---A---AATA---T-G-T-----ACA--TGCT-CAA---AAAC-TTTAAC---CT-GCTCA--AAAAtttaa