lowQualScore : 1 111
lowQualScore : 4 5 0 11 0 1 11 11 5555 1 11111 0 11 2 0 1 2 1 7777 11 44 22 2 000 0 11 55 11 555 0 0 4 222222 4 11 0
lowQualScore : . . . .. . . .. .. .... . ..... . .. . . . . . .... .. .. .. . ... . .. .. .. ... . . . ...... . .. .
lowQualScore : 3 6 8 99 8 4 11 99 9999 5 99999 8 11 3 8 5 3 5 7777 88 77 11 5 222 8 11 55 99 333 8 8 2 444444 7 22 9
consensus : ATGGANTTTNAT-G--A-AATAA--A--CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-N--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
Reference ( gi|18206 ) : ATGGAATTTGAT-G--A-ACTAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTT--A-AAA--CG--T--T--GCTC-CTATCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18225 : ATGGAATTTGAT-G--A-ACTAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGCT--TA-A-TAA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATGTTT--A-AAA--CG--T--T--GCTC-CTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18228 : ATGGAATTTGAT-T--A-ACTAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-A-TAA-AAGAA-TGGA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--GCTC-CTATCG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTCAACAA
gi|18231 : ATGGAATTTGAT-G--A-ACTAA--A--CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TAA-AAGAA-TGAA-A--AAG--T-AA--ACATATCTTA--A-AAG--CG--T--T--GCTC-CTGTCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18215 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-AGAA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTGT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18208 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATC-TT--A-AAA--TA--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTGAACAA
gi|18232 : ATGGAATTTGAT-T--A-ACTAA--A--CT---TCGAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TAA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAACAACTTA--A-ACA--TG--T--T--GCTC-CTATAG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18211 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CCATCG-AGCTAT--------ATACCCG-TTTTGACAA
gi|18224 : ATGGAATTTGAT-G--A-ACTAA--A--CT----CAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TGA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--GCTC-CTATCG-ATCTA
gi|18227 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT-----A---A-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATCTTA--A-AAA--CA--T--T--ACTC-CTATGG-AACTAT------CCATA--CG-TTTTAACAA
gi|18222 : ATGGAATTTGAT-G--C-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TTTT--AA-A-CAA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAAGATCTTC--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAATAA
gi|18221 : ATGGAATTATAT-G--A-AATGA--A--CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AACGATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18226 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATGA--A--CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCT-AAGAA-TGAC-A--ATG--T-AA--AAAGATCTTA--A-AAA--CG--C--T--ACAC-CTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18213 : ATGGAATTTCAT-GGGA-AAAAA--A--CTG--TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-T--ATG--T-AA--AAAGATCTTA--A-AAA--CA--T--T--TCTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18205 : ATGGATTTTCAT-G--A-AATAA--A--CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGTT--TA-A-TCA-AAAAA-TGAA-T--ACG--T-TA--AAAGATCTTA--A-AAA--CA--T--T--ACTC-CTATCG-ATCTAT------TGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18204 : ATGGATTTTCAT-GT-A-A--AA--A--CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AACAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAAGATCTTA--A-AAA--TG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAccc
gi|18229 : ATGGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--AT-----------------------------G--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTCAACAAacc
gi|18207 : ATGGATTTTCAT-G--A-AAAAA--A--CG---TAAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TAA-AAAAA-TGAA-C--ATG--T-TA--AAAGATCTTT--A-ACA--TG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18219 : ATGGAATTTCAT-G--T-AATAA--A--CA---TCAAAA-TGATAA-----AT-GCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAATATCTCA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-TTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTATAACAAatc
gi|18210 : ATGGAATTTCAT-G--A-AATAA--A--CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-ATAAC-TGAA-T--ATGTTT-AA--AGAT---TTTAAA-AAA--AG--T--T--ACTC-CTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-ATTTAACAAac
gi|18216 : ATGGATTTTCAT-G--A-ATTAA--A--AG---CCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TAA-AAAAA---AA-T--ATG--T-TA--AAAGATCATA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-ATATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18214 : ATGGATTTTCAT-G--A-AATAA--A--CA---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTA--TA-A-TAA-AAAAAATGAA-T--TTG--T-TA--AAAGATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-TTACCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18230 : ATGGATTTTCAT-G--A-AA-AA--A--CA---TAAAAA-TTATTT-----AT-TTAT--AA-A-TCA-AAGAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAAGATTTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAac
gi|18217 : ATGGATTTTCAT-G--A-AAAAA--AAACT----CAAAA-TGATTA-----GT-TCTT--TA-A-TCA-AAAAAATGAA-T--AGG--T-TA--AAAGATCTTA--A-AAA--TG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAga
gi|18233 : ATGGATTTTCAT-A--A-AAAAATAA--CG---TTAAAA-TGATTTGAAGAAT-T----------TCA-AGAAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAAGATTTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18223 : ATGGATTTTCAT-G--A-AATTA--A--CA---TATAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAAGA-AGAA-T--ATC--T-TA--AAAAATCTTA--ATAAA--CA--T--T--ACTC-CTATCG---------------ATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18200 : ACGGATTTTTAT-G--A-AATAA--A--CG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCAT--TA-G-CCC-CAAAA-CGAA-T--ATG--C-AA--AAATATCTTA--A-AAA--TT--T--TTAAC-C-CTATCT-ATTTAG------CAATA--AG--TTTAACAAacc
gi|18197 : ACGGATTTTTAT-G--A-AATAA--A--CG---TAAACA-TGACTT-----AT-TCTT--GA-A-CCTTAAGAA-TGAA-T--ATA--T-AC--AAATATCTTT--A-AAA--TGTTT--T--ATCC-CTATCT-ATCAAG------CGATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18199 : ACGGATTTTTAT-G--A-AATAA--A--TG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TATT--AA-A-CCT-AAAAA-TGAA-T--ATG--T-AA--AACTATCTTT--A-AAA--TG--TG-T--TATCACTATAT-ATCTAG------CTATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18201 : ACGGATTTTCAT-G--A-AATAA--A--CG---TTAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-CCC-CAAAA-TGAA-T--GTG--T-AA--ACATATCTTTA-A-AAA--TA--T--T--TTTT-TTATC---TCTAT------C--TA--CC-TTacct
gi|18220 : ATGGATTTTCAT-G--A-ATTAA--A--CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TTACAAAAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAAGATCTTgcgataagtttaaca
gi|18234 : ATGGATTTTCAT-G--A-AATAA--A--AA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-A-----------------------------------TCTTA--A-AAA--CG--T--T--TCTT-CTACCG-ATCTAT------CGATA--TG--TTTAACAA
gi|18209 : ACGGATTTTTAT-G--A-AATAA--A--CA---TCAAAG-TGACTT-----AT-TCTT--TACA-GCA-AA-AA-CGAA-T--ATA--A-TA--AAATATTTTT--A-AAA--C---------GCTT-TTATCGCATCTAacc
gi|18203 : ACGGATTTTTAT-G--ACATTAA--A--AT----CAAAA-TGACTA-----AT-TCTT--TA-A-CCA-AAAA----AA-ATTATG--C--A--AAATATCTTA--G-AAA--CG--TCCT--ATCC-CTATCT-ACCTAG------CGATA--AG--TTTAACAA
gi|18202 : ACGGATTTTTAT-G--A-AACAA--A--CG---TCAAAA-TGACT----------CTT--TA-A-ACC-AAAAT-TGAA-T--ATA--T-GA--AAATACCTTT--A-AAATGTG--T--T--ATCC-CTTTCT-ATCTGA------CGATA--AG-TTccct
gi|18218 : ACGGATTTTTAT-A--A-AATAA--A--TT---TCAAA--TGATGT-----AT-TATTCATA-C-TTG-AA--A-T--A-A--ATT--T-AATAAAATATCTTT--A-AGA--CGCTT--T--ATCC-TTATCT-ACCTAG------CGATA--CG-Taaac
gi|18212 : ACGGATTTTTAT-G--A-AATAA--A--CG---TCAACA-TGACTT-----ATATCTT--AT-A-CCA-AA-AA-TGAA-----TA--T-AATGAAATATCTTT--G-AAG--CG--gtaac
gi|18237 : GGAATTTGAT-G--A-ACTAA--A--CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TGA-AAGAA-TGAA-A--ATG--TAAA--AAAAATCTTA--A-AAA--CG--T--T--GCTC-TTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAgtttatacacacctggcgaaacgtgtaaca
gi|18235 : GGAATTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T--A--AAATATCTTA--A-AAA--TG-----T--GCTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TGTTAACAA
gi|18236 : cGGAATTTGATAG--A-A--AA--A--CCCTGTCAAAG-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-T--ATG--T-AA--ACAGATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAC------CGAAA--CG-TTTGAACA
gi|18240 : GAATTTGAT-G--A-CATCA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAATATATTA--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18241 : GAGTTTGAT-C--A-ACTGA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGCA-A--ATG--T-AA--AAAGATC-TT--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTGT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18238 : GATTTTCAT-G--A-AATAA--A--CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AA--A-TGAA-T--TTG--T-TA--AAAGATCTTA--A-AAA--AG--T--T--TCTC-CCATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18239 : GATTTTCAT-G--A-AAAAA--AA-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-TAAAA-TGAA-T--ATGA-T-AA--AAG-ATCTTA--A-AAA--TG--T--T--ACTC-CTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18242 : ATTT-AT-G--A-AATAA--A--CG---CCAAAA-TGACTT-----AT-CATT--TATA-CCA-AAT-A-TGAACA--ATA--T-----TAATATGTTT--A-----------------CTC-CTATAT-ATTCAG------CGATA--AG-TTTAAACAAa
gi|18246 : atTTTGAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TGA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-CA--AAATATCTTA--A-AAA--CG--T--T--GCTC-CTTACG-ATCTAT------CAATA--CGTTTTTAACAAaact
gi|18245 : TTTCAT-G--A-AATAA--G--CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCCT--TT-A-TCA-AAGAA-TGAA-T--ATG--T-TA--AAATATTTTA--A-AAA--CA--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTGT------CGATA--CG-TTGTAACAA
gi|18243 : TTTTAT-T--A-AATAA-----CA---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-ATA-AAAGA-TGAA-T--ATA--T--A--TAATATCTTT--A-AAA--TATTT--T--ATCC-CTATAT-ATATATATATAGCGATA--AG--TTTAACAAacc
gi|18198 : tTTGA--A--A-AC-AA--A--CG---CCAAAA-TGATT------AT-TCTT--TA-A-CCC-AAAAA-TGAA-T--ATG--T-AA--AAATATCTTT--A-CAA--TGTTT--T--ATCC-CTATCT-GTCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18247 : acggatttttaAT-G--A-AATAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AATAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AACGATCTTA--A-AAA--CG--T--T--ATTC-CTATCG-AGTTAT------CGATA--CG-TTTTAATAAacct
gi|18248 : TAA--A--CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TCA-AAGAA-TGAA-A--ATG--T-AA--AAAAATCTTC--A-AAA--CG--T--T--ACTC-CTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18249 : aa---TCAAAA-TGACCT-----AT-TCTC--TG-ACTCA-AA-AA-TGAA-T--ATG--T-AA--AAATATTTTT--A-AAA--
gi|18250 : gA-TGACTT-----AT-TATT--TATA-CCA-AAAAA-TGAA-T--ATA--A-TA--AAATATC-TA--A-AAA--CGCTT--T--ACCT-TTATCT-ACCAAG------CAATA--TG-TGTTAt
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|18244 ): TTTTTACGAAATTAACGTCATAATAACTTATAATATACAAAAAAATGAATATAATAACTATATTTAAAACGCGTTATCTTTATTTACCTGGCGATAAGTTAAC
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 11 11 0 4444 1 11111 0 11 2 0 1 0 1 1 22 0 0 4444 11 2 0 11 0 0 22 888888 11 11 0 1 222222 11 11
lowQualScore : . . .. .. .. . .... . ..... . .. . . . . . . .. . . .... .. . . .. . . .. ...... .. .. . . ...... .. ..
lowQualScore : 0 0 11 11 11 8 6666 5 99999 7 00 2 7 5 7 6 5 00 7 7 8888 00 5 7 33 8 8 11 666666 11 11 8 3 333333 11 11
consensus : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
Reference ( family-439 ) : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18197 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TAAACA-TGACTT-----AT-TCTT--GA-A-CCTT-AAGAA-TGAA-TAT-A-T-A--C--AAATATC-TT-TA-AA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-ATCAAG------CGATA--AG--TTTAACAA
gi|18198 : ACGGATTTTTATTGA--AAACAA--A-CG---CCAAAA-TGATT------AT-TCTT--TA-A-CC-C-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-CA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-GTCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18199 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-TG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TATT--AA-A-CC-T-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AACTATC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCACTATAT-ATCTAG------CTATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18200 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCAT--TA-G-CC-C-CAAAA-CGAA-TAT-G-C-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TT------T--TTAAC-CCTATCT-ATTTAG------CAATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18201 : ACGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TTAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-CC-C-CAAAA-TGAA-TGT-G-T-A--A--ACATATCTTT-AA-AA-A--TATTTTTTT--T--ATCTCTATCT-ACCTTG------CGATA--AG--TTTAACAacct
gi|18202 : ACGGATTTTTAT--G--AAACAA--A-CG---TCAAAA-TG---------AC-TCTT--TA-A-AC-C-AAAAT-TGAA-TAT-A-T-G--A--AAATACC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCCCTTTCT-ATCTGA------CGATA--AG-T
gi|18203 : ACGGATTTTTAT--G--ACATTA--A-AA---TCAAAA-TGACTA-----AT-TCTT--TA-A-CC-A-AAAAA---AATTAT-G-C----A--AAATATC-TT-AG-AA-A--CG------TCCT--ATCCCTATCT-ACCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAaaac
gi|18204 : ATGGATTTTCAT--G--TAA-AA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AACAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAccct
gi|18205 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGTT--TA-A-TC-A-AAAAA-TGAA-TAC-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------TGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18206 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAccc
gi|18207 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-CG---TAAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA-TGAA-CAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-TA-AC-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18208 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT--A-AA-A--TA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTGAACAAatc
gi|18209 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAG-TGACTT-----AT-TCTT--TACA-GC-A-AA-AA-CGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--CG-------------CTTTTATCGCATCTA
gi|18210 : ATGGAATTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-ATAAC-TGAA-TAT-G-T-T--T--AAAGATT-TTAAA-AA-A--AG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-ATTTAACAA
gi|18211 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCCATCG-AGCTAT--------ATACCCG-TTTTGACAAacc
gi|18212 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAACA-TGACTT-----ATATCTT--AT-A-CC-A-AA-AA-TGAA-TA----T-A--ATGAAATATC-TT-TG-AA-G--CGGT----T--T--A----TACAC-ACCTGG------CGAAA--CG--TGTAACA
gi|18213 : ATGGAATTTCAT--GGGAAAAAA--A-CTG--TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--TCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18214 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTA--TA-A-TA-A-AAAAAATGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTACCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18215 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-AGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CAATA--CG-TTTTAACAAac
gi|18216 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-AG---CCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA---AA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-AT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCATATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18217 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-AAC--TCAAAA-TGATTA-----GT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAAAATGAA-TAG-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18218 : ACGGATTTTTAT--A--AAATAA--A-TT---TC-AAA-TGATGT-----AT-TATTCATA-C-TT-G-A--AA-T--A-AAT-T-T-AATA--AAATATC-TT-TA-AG-A--CGCT----T--T--ATCCTTATCT-ACCTAG------CGATA--CG-Tacc
gi|18219 : ATGGAATTTCAT--G--TAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATAA-----AT-GCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATC-TC-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTATAACAAgtaac
gi|18220 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TT-ACAAAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-ac
gi|18221 : ATGGAATTATAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18222 : ATGGAATTTGAT--G--CAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TTTT--AA-A-CA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAATAA
gi|18223 : ATGGATTTTCAT--G--AAATTA--A-CA---TATAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAGA-AGAA-TAT-C-T-T--A--AAAAATC-TT-AATAA-A--CA------T--T--ACTC---------CTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18224 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-C----TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAacc
gi|18225 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGCT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATG-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18226 : ATGGAATTTGAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-T-AAGAA-TGAC-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------C--T--ACACCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18227 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT-----A----A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATGG-AACTAT------CCATA--CG-TTTTAACAA
gi|18228 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGGA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTCAACAA
gi|18229 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT--------------------------------G------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTCAACAA
gi|18230 : ATGGATTTTCAT--G--AAA-AA--A-CA---TAAAAA-TTATTT-----AT-TTAT--AA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18231 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAA-G-T-A--A--ACATATC-TT-AA-AA-G--CG------T--T--GCTCCTGTCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAga
gi|18232 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCGAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAACAAC-TT-AA-AC-A--TG------T--T--GCTCCTATAG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18233 : ATGGATTTTCAT--A--AAAAAATAA-CG---TTAAAA-TGATTTGAAGAAT-T----------TC-A-AGAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18234 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-AA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-------------------------------------ATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--TCTTCTACCG-ATCTAT------CGATA--TG--TTTAACAAacc
gi|18235 : GGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T----A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TG---------T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TGTTAACAAacc
gi|18236 : cGGAATTTGAT--A--GAA-AA--A-CCCTGTCAAAG-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--ACAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAC------CGAAA--CG-TTTGAACA
gi|18237 : GGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-TAA--A--AAAAATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCTTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18238 : GATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AA--A-TGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--AG------T--T--TCTCCCATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18239 : GATTTTCAT--G--AAAAAA--AACG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-TAAAA-TGAA-TAT-GAT-A--A--AAG-ATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18240 : GAATTTGAT--G--ACATCA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATA-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAa
gi|18241 : GAGTTTGAT--C--AACTGA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGCA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT--A-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18242 : TTTAT--G--AAATAA--A-CG---CCAAAA-TGACTT-----AT-CATT--TATA-CC-A-AAT-A-TGAA-CA--A-T-A--T--TAATATG-T-------------------T--T--ACTCCTATAT-ATTCAG------CGATA--AG-TTTAAACAA
gi|18243 : ataTTTTAT--T--AAATAA----CA---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-AT-A-AAAGA-TGAA-TAT-A-T----A--TAATATC-TT-TA-AA-A--TATT----T--T--ATCCCTATAT-ATATATATATAGCGATA--AG--TTTAACAAaact
gi|18244 : tTTTTAC--G--AAATTA--A-CG---TCATAA-TAACTT-----AT-AATA--TA----CAA-AAAAA-TGAA-TATAA-T-A--A--CTATAT--TT-AA-AACG--CG------T--T--ATCTTTATTT-ACCTGG------CGATA--AG-Tacct
gi|18245 : tTTTCAT--G--AAATAA--G-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCCT--TT-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATT-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGATA--CG-TTGTAACAAaac
gi|18246 : TTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-C--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTTACG-ATCTAT------CAATA--CGTTTTTAACAAacc
gi|18247 : AT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AATAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ATTCCTATCG-AGTTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18248 : AATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAAATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18249 : ---TCAAAA-TGACCT-----AT-TCTC--TG-ACTC-A-AA-AA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--
gi|18250 : gA-TGACTT-----AT-TATT--TATA-CC-A-AAAAA-TGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATC--T-AA-AA-A--CGCT----T--T--ACCTTTATCT-ACCAAG------CAATA--TG-TGTTAt
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 11 11 0 4444 1 11111 0 11 2 0 1 0 1 1 22 0 0 4444 11 2 0 11 0 0 22 888888 11 11 0 1 222222 11 11
lowQualScore : . . .. .. .. . .... . ..... . .. . . . . . . .. . . .... .. . . .. . . .. ...... .. .. . . ...... .. ..
lowQualScore : 0 0 11 11 11 8 6666 5 99999 7 00 2 7 5 7 6 5 00 7 7 8888 00 5 7 33 8 8 11 666666 11 11 8 3 333333 11 11
consensus : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
Reference ( family-439 ) : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18197 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TAAACA-TGACTT-----AT-TCTT--GA-A-CCTT-AAGAA-TGAA-TAT-A-T-A--C--AAATATC-TT-TA-AA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-ATCAAG------CGATA--AG--TTTAACAA
gi|18198 : ACGGATTTTTATTGA--AAACAA--A-CG---CCAAAA-TGATT------AT-TCTT--TA-A-CC-C-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-CA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-GTCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18199 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-TG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TATT--AA-A-CC-T-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AACTATC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCACTATAT-ATCTAG------CTATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18200 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCAT--TA-G-CC-C-CAAAA-CGAA-TAT-G-C-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TT------T--TTAAC-CCTATCT-ATTTAG------CAATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18201 : ACGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TTAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-CC-C-CAAAA-TGAA-TGT-G-T-A--A--ACATATCTTT-AA-AA-A--TATTTTTTT--T--ATCTCTATCT-ACCTTG------CGATA--AG--TTTAACAacct
gi|18202 : ACGGATTTTTAT--G--AAACAA--A-CG---TCAAAA-TG---------AC-TCTT--TA-A-AC-C-AAAAT-TGAA-TAT-A-T-G--A--AAATACC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCCCTTTCT-ATCTGA------CGATA--AG-T
gi|18203 : ACGGATTTTTAT--G--ACATTA--A-AA---TCAAAA-TGACTA-----AT-TCTT--TA-A-CC-A-AAAAA---AATTAT-G-C----A--AAATATC-TT-AG-AA-A--CG------TCCT--ATCCCTATCT-ACCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAaaac
gi|18204 : ATGGATTTTCAT--G--TAA-AA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AACAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAccct
gi|18205 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGTT--TA-A-TC-A-AAAAA-TGAA-TAC-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------TGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18206 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAccc
gi|18207 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-CG---TAAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA-TGAA-CAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-TA-AC-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18208 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT--A-AA-A--TA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTGAACAAatc
gi|18209 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAG-TGACTT-----AT-TCTT--TACA-GC-A-AA-AA-CGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--CG-------------CTTTTATCGCATCTA
gi|18210 : ATGGAATTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-ATAAC-TGAA-TAT-G-T-T--T--AAAGATT-TTAAA-AA-A--AG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-ATTTAACAA
gi|18211 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCCATCG-AGCTAT--------ATACCCG-TTTTGACAAacc
gi|18212 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAACA-TGACTT-----ATATCTT--AT-A-CC-A-AA-AA-TGAA-TA----T-A--ATGAAATATC-TT-TG-AA-G--CGGT----T--T--A----TACAC-ACCTGG------CGAAA--CG--TGTAACA
gi|18213 : ATGGAATTTCAT--GGGAAAAAA--A-CTG--TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--TCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18214 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTA--TA-A-TA-A-AAAAAATGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTACCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18215 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-AGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CAATA--CG-TTTTAACAAac
gi|18216 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-AG---CCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA---AA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-AT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCATATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18217 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-AAC--TCAAAA-TGATTA-----GT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAAAATGAA-TAG-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18218 : ACGGATTTTTAT--A--AAATAA--A-TT---TC-AAA-TGATGT-----AT-TATTCATA-C-TT-G-A--AA-T--A-AAT-T-T-AATA--AAATATC-TT-TA-AG-A--CGCT----T--T--ATCCTTATCT-ACCTAG------CGATA--CG-Tacc
gi|18219 : ATGGAATTTCAT--G--TAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATAA-----AT-GCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATC-TC-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTATAACAAgtaac
gi|18220 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TT-ACAAAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-ac
gi|18221 : ATGGAATTATAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18222 : ATGGAATTTGAT--G--CAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TTTT--AA-A-CA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAATAA
gi|18223 : ATGGATTTTCAT--G--AAATTA--A-CA---TATAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAGA-AGAA-TAT-C-T-T--A--AAAAATC-TT-AATAA-A--CA------T--T--ACTC---------CTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18224 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-C----TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAacc
gi|18225 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGCT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATG-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18226 : ATGGAATTTGAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-T-AAGAA-TGAC-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------C--T--ACACCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18227 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT-----A----A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATGG-AACTAT------CCATA--CG-TTTTAACAA
gi|18228 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGGA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTCAACAA
gi|18229 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT--------------------------------G------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTCAACAA
gi|18230 : ATGGATTTTCAT--G--AAA-AA--A-CA---TAAAAA-TTATTT-----AT-TTAT--AA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18231 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAA-G-T-A--A--ACATATC-TT-AA-AA-G--CG------T--T--GCTCCTGTCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAga
gi|18232 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCGAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAACAAC-TT-AA-AC-A--TG------T--T--GCTCCTATAG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18233 : ATGGATTTTCAT--A--AAAAAATAA-CG---TTAAAA-TGATTTGAAGAAT-T----------TC-A-AGAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18234 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-AA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-------------------------------------ATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--TCTTCTACCG-ATCTAT------CGATA--TG--TTTAACAAacc
gi|18235 : GGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T----A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TG---------T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TGTTAACAAacc
gi|18236 : cGGAATTTGAT--A--GAA-AA--A-CCCTGTCAAAG-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--ACAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAC------CGAAA--CG-TTTGAACA
gi|18237 : GGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-TAA--A--AAAAATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCTTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18238 : GATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AA--A-TGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--AG------T--T--TCTCCCATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18239 : GATTTTCAT--G--AAAAAA--AACG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-TAAAA-TGAA-TAT-GAT-A--A--AAG-ATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18240 : GAATTTGAT--G--ACATCA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATA-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAa
gi|18241 : GAGTTTGAT--C--AACTGA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGCA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT--A-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18242 : TTTAT--G--AAATAA--A-CG---CCAAAA-TGACTT-----AT-CATT--TATA-CC-A-AAT-A-TGAA-CA--A-T-A--T--TAATATG-T-------------------T--T--ACTCCTATAT-ATTCAG------CGATA--AG-TTTAAACAA
gi|18243 : ataTTTTAT--T--AAATAA----CA---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-AT-A-AAAGA-TGAA-TAT-A-T----A--TAATATC-TT-TA-AA-A--TATT----T--T--ATCCCTATAT-ATATATATATAGCGATA--AG--TTTAACAAaact
gi|18244 : tTTTTAC--G--AAATTA--A-CG---TCATAA-TAACTT-----AT-AATA--TA----CAA-AAAAA-TGAA-TATAA-T-A--A--CTATAT--TT-AA-AACG--CG------T--T--ATCTTTATTT-ACCTGG------CGATA--AG-Tacct
gi|18245 : tTTTCAT--G--AAATAA--G-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCCT--TT-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATT-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGATA--CG-TTGTAACAAaac
gi|18246 : TTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-C--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTTACG-ATCTAT------CAATA--CGTTTTTAACAAacc
gi|18247 : AT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AATAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ATTCCTATCG-AGTTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18248 : AATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAAATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18249 : ---TCAAAA-TGACCT-----AT-TCTC--TG-ACTC-A-AA-AA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--
gi|18250 : gA-TGACTT-----AT-TATT--TATA-CC-A-AAAAA-TGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATC--T-AA-AA-A--CGCT----T--T--ACCTTTATCT-ACCAAG------CAATA--TG-TGTTAt
blockSeqs : T T TG GG TA CCTG A GAAGA CA C A A A TT AAT TG T AA TG TTTTTT CC TA T ATATAG CC TT
blockSeqs : T T . . . TG A . . T . A A T AA . T T TG TT . . T . . T
blockSeqs : T T . . . AC . . . T . A . T A . T T . GT . . T . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . A . T A . T A . CT . . C . . T
blockSeqs : T T . . . G . . . . . A . T A . T A . TT . . T . . T
blockSeqs : T T . . . G . . . . . A . T A . T T . CT . . C . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . C . T G . G A . . . . G . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . A . T T . G A . . . . T . . A
blockSeqs : A G . . . A . . . . . G . A T . T A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . A . C A . G T . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . A . . . . . G . A T . T T . . . . G . . T
blockSeqs : T T . . . T . . . . . A . T A . T T . . . . T . . T
blockSeqs : A C . . . G . . . . . G . T T . G A . . . . T . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A T . T T . . . . G . . T
blockSeqs : T T . . . A . . . . . A . T A . T A . . . . C . . T
blockSeqs : A C . . . G . . . . . G . T A . G A . . . . G . . T
blockSeqs : T C . . . T . . . . . A . T A . G A . . . . T . . T
blockSeqs : A G . . . G . . . . . A . A T . T A . . . . G . . T
blockSeqs : T C . . . A . . . . . G . T A . G A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . T . . . . . A . T T . G T . . . . G . . T
blockSeqs : T T . . . G . . . . . G . A T . T A . . . . C . . T
blockSeqs : A C . . . T . . . . . G . T T . T A . . . . G . . T
blockSeqs : T C . . . A . . . . . A . T T . G C . . . . G . . T
blockSeqs : A T . . . G . . . . . G . A A . G A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . G A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . T . . . . . G . T T . A T . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . A . . . . . G . A A . T A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . T A . . . . A . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . G A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . T A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . T A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A T . G A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . A . . . . . A . T A . T A . . . . T . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . C A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A T . G A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . G . T A . T A . . . . G . . T
blockSeqs : T C . . . A . . . . . A . A T . G A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . T A . A A . . . . G . . T
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A A . G A . . . . T . . T
blockSeqs : A G . . . A . . . . . T . T A . T A . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . G . . . . . A . T A . G T . . . . T . . T
blockSeqs : T C . . . T . . . . . A . A A . T A . . . . G . . .
blockSeqs : A G . . . T . . . . . G . A T . T A . . . . T . . .
blockSeqs : G G . . . G . . . . . G . C C . T A . . . . T . . .
blockSeqs : T . . . A . . . . . T . T A . T A . . . . C . . .
blockSeqs : T . . . G . . . . . G . T A . T C . . . . G . . .
blockSeqs : T . . . A . . . . . A . T A . G T . . . . T . . .
blockSeqs : C . . . T . . . . . . . A T . A A . . . . G . . .
blockSeqs : G . . . T . . . . . . . A . . T . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . T . . . . . . . A . . T . . . . . C
blockSeqs : . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons : ****** T*
originalCons : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
finalCons : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CGT-TTTAACAA
Alignments
lowQualScore : 1 1 11 11 11 0 4444 1 11111 0 11 2 0 1 0 1 1 22 0 0 4444 11 2 0 11 0 0 22 888888 11 11 0 1 222222 11 11
lowQualScore : . . .. .. .. . .... . ..... . .. . . . . . . .. . . .... .. . . .. . . .. ...... .. .. . . ...... .. ..
lowQualScore : 0 0 11 11 11 8 6666 5 99999 7 00 2 7 5 7 6 5 00 7 7 8888 00 5 7 33 8 8 11 666666 11 11 8 3 333333 11 11
consensus : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
Reference ( family-439 ) : ATGGANTTTNAT--G--AAATAA--A-CN---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-NAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ANCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18197 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TAAACA-TGACTT-----AT-TCTT--GA-A-CCTT-AAGAA-TGAA-TAT-A-T-A--C--AAATATC-TT-TA-AA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-ATCAAG------CGATA--AG--TTTAACAA
gi|18198 : ACGGATTTTTATTGA--AAACAA--A-CG---CCAAAA-TGATT------AT-TCTT--TA-A-CC-C-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-CA-A--TGTT----T--T--ATCCCTATCT-GTCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18199 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-TG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TATT--AA-A-CC-T-AAAAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AACTATC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCACTATAT-ATCTAG------CTATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18200 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCAT--TA-G-CC-C-CAAAA-CGAA-TAT-G-C-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TT------T--TTAAC-CCTATCT-ATTTAG------CAATA--AG--TTTAACAAacct
gi|18201 : ACGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TTAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-CC-C-CAAAA-TGAA-TGT-G-T-A--A--ACATATCTTT-AA-AA-A--TATTTTTTT--T--ATCTCTATCT-ACCTTG------CGATA--AG--TTTAACAacct
gi|18202 : ACGGATTTTTAT--G--AAACAA--A-CG---TCAAAA-TG---------AC-TCTT--TA-A-AC-C-AAAAT-TGAA-TAT-A-T-G--A--AAATACC-TT-TA-AA-ATGTG------T--T--ATCCCTTTCT-ATCTGA------CGATA--AG-T
gi|18203 : ACGGATTTTTAT--G--ACATTA--A-AA---TCAAAA-TGACTA-----AT-TCTT--TA-A-CC-A-AAAAA---AATTAT-G-C----A--AAATATC-TT-AG-AA-A--CG------TCCT--ATCCCTATCT-ACCTAG------CGATA--AG--TTTAACAAaaac
gi|18204 : ATGGATTTTCAT--G--TAA-AA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AACAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAccct
gi|18205 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGTT--TA-A-TC-A-AAAAA-TGAA-TAC-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------TGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18206 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAccc
gi|18207 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-CG---TAAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA-TGAA-CAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-TA-AC-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18208 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT--A-AA-A--TA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTGAACAAatc
gi|18209 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAG-TGACTT-----AT-TCTT--TACA-GC-A-AA-AA-CGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--CG-------------CTTTTATCGCATCTA
gi|18210 : ATGGAATTTCAT--G--AAATAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-ATAAC-TGAA-TAT-G-T-T--T--AAAGATT-TTAAA-AA-A--AG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-ATTTAACAA
gi|18211 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCCATCG-AGCTAT--------ATACCCG-TTTTGACAAacc
gi|18212 : ACGGATTTTTAT--G--AAATAA--A-CG---TCAACA-TGACTT-----ATATCTT--AT-A-CC-A-AA-AA-TGAA-TA----T-A--ATGAAATATC-TT-TG-AA-G--CGGT----T--T--A----TACAC-ACCTGG------CGAAA--CG--TGTAACA
gi|18213 : ATGGAATTTCAT--GGGAAAAAA--A-CTG--TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--TCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18214 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTA--TA-A-TA-A-AAAAAATGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTACCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18215 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTA-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-AGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CAATA--CG-TTTTAACAAac
gi|18216 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-AG---CCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAAAA---AA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-AT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCATATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18217 : ATGGATTTTCAT--G--AAAAAA--A-AAC--TCAAAA-TGATTA-----GT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAAAATGAA-TAG-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18218 : ACGGATTTTTAT--A--AAATAA--A-TT---TC-AAA-TGATGT-----AT-TATTCATA-C-TT-G-A--AA-T--A-AAT-T-T-AATA--AAATATC-TT-TA-AG-A--CGCT----T--T--ATCCTTATCT-ACCTAG------CGATA--CG-Tacc
gi|18219 : ATGGAATTTCAT--G--TAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATAA-----AT-GCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATC-TC-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCTTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTATAACAAgtaac
gi|18220 : ATGGATTTTCAT--G--AATTAA--A-CG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TT-ACAAAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-ac
gi|18221 : ATGGAATTATAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18222 : ATGGAATTTGAT--G--CAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TTTT--AA-A-CA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAATAA
gi|18223 : ATGGATTTTCAT--G--AAATTA--A-CA---TATAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAAGA-AGAA-TAT-C-T-T--A--AAAAATC-TT-AATAA-A--CA------T--T--ACTC---------CTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18224 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-C----TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-ATCTAacc
gi|18225 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TGCT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATG-TT-TA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18226 : ATGGAATTTGAT--G--AAATGA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-T-AAGAA-TGAC-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--CG------C--T--ACACCTATCG-AGCTAT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18227 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT-----A----A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATGG-AACTAT------CCATA--CG-TTTTAACAA
gi|18228 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGGA-AAT-G-T-A--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTCAACAA
gi|18229 : ATGGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT--------------------------------G------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTCAACAA
gi|18230 : ATGGATTTTCAT--G--AAA-AA--A-CA---TAAAAA-TTATTT-----AT-TTAT--AA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACA
gi|18231 : ATGGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAAATGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAA-G-T-A--A--ACATATC-TT-AA-AA-G--CG------T--T--GCTCCTGTCG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAAga
gi|18232 : ATGGAATTTGAT--T--AACTAA--A-CT---TCGAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TA-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAACAAC-TT-AA-AC-A--TG------T--T--GCTCCTATAG-ATCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18233 : ATGGATTTTCAT--A--AAAAAATAA-CG---TTAAAA-TGATTTGAAGAAT-T----------TC-A-AGAAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAAGATT-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18234 : ATGGATTTTCAT--G--AAATAA--A-AA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TATT--TA-------------------------------------ATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--TCTTCTACCG-ATCTAT------CGATA--TG--TTTAACAAacc
gi|18235 : GGAATTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T----A--AAATATC-TT-AA-AA-A--TG---------T--GCTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TGTTAACAAacc
gi|18236 : cGGAATTTGAT--A--GAA-AA--A-CCCTGTCAAAG-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-A--A--ACAGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAC------CGAAA--CG-TTTGAACA
gi|18237 : GGAATTTGAT--G--AACTAA--A-CT---TCAAAA-TAATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-TAA--A--AAAAATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCTTATTG-AGCTAT------CAATA--CG-TTTTAACAA
gi|18238 : GATTTTCAT--G--AAATAA--A-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AA--A-TGAA-TTT-G-T-T--A--AAAGATC-TT-AA-AA-A--AG------T--T--TCTCCCATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAA
gi|18239 : GATTTTCAT--G--AAAAAA--AACG---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-TAAAA-TGAA-TAT-GAT-A--A--AAG-ATC-TT-AA-AA-A--TG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAacc
gi|18240 : GAATTTGAT--G--ACATCA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAATATA-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-ATCTAT------CGATA--CG-TTTTAACAAa
gi|18241 : GAGTTTGAT--C--AACTGA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGCA-AAT-G-T-A--A--AAAGATC-TT--A-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGGTA--CG-TTTTAACAA
gi|18242 : TTTAT--G--AAATAA--A-CG---CCAAAA-TGACTT-----AT-CATT--TATA-CC-A-AAT-A-TGAA-CA--A-T-A--T--TAATATG-T-------------------T--T--ACTCCTATAT-ATTCAG------CGATA--AG-TTTAAACAA
gi|18243 : ataTTTTAT--T--AAATAA----CA---TCAAAA-TGACTT-----AT-TCTT--TA-A-AT-A-AAAGA-TGAA-TAT-A-T----A--TAATATC-TT-TA-AA-A--TATT----T--T--ATCCCTATAT-ATATATATATAGCGATA--AG--TTTAACAAaact
gi|18244 : tTTTTAC--G--AAATTA--A-CG---TCATAA-TAACTT-----AT-AATA--TA----CAA-AAAAA-TGAA-TATAA-T-A--A--CTATAT--TT-AA-AACG--CG------T--T--ATCTTTATTT-ACCTGG------CGATA--AG-Tacct
gi|18245 : tTTTCAT--G--AAATAA--G-CA---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCCT--TT-A-TC-A-AAGAA-TGAA-TAT-G-T-T--A--AAATATT-TT-AA-AA-A--CA------T--T--ACTCCTATCG-AGCTGT------CGATA--CG-TTGTAACAAaac
gi|18246 : TTTGAT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TG-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-C--A--AAATATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--GCTCCTTACG-ATCTAT------CAATA--CGTTTTTAACAAacc
gi|18247 : AT--G--AAATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AATAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AACGATC-TT-AA-AA-A--CG------T--T--ATTCCTATCG-AGTTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18248 : AATAA--A-CT---TCAAAA-TGATTT-----AT-TCTT--TA-A-TC-A-AAGAA-TGAA-AAT-G-T-A--A--AAAAATC-TT-CA-AA-A--CG------T--T--ACTCCTATCG-AGCTAT------CGATA--CG-TTTTAATAA
gi|18249 : ---TCAAAA-TGACCT-----AT-TCTC--TG-ACTC-A-AA-AA-TGAA-TAT-G-T-A--A--AAATATT-TT-TA-AA-A--
gi|18250 : gA-TGACTT-----AT-TATT--TATA-CC-A-AAAAA-TGAA-TAT-A-A-T--A--AAATATC--T-AA-AA-A--CGCT----T--T--ACCTTTATCT-ACCAAG------CAATA--TG-TGTTAt