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Reference ( gi|122023 ) : AGGAATC-AT-TTT-CACTG--AT-----ATA---TA--GA--------T--CAGTACGATCA-ACACAA--TTCCAGATTACCTC-AAAA-CAG------TT-GTA-CTCCA--T-TC---TA--A--A-T-G-T------TATCA-G----------T---AT---C-GGACAT-------GACAC--TC--AACTA-TTTTGGGGTAATCTGGAA--TTTT-GTAGGTCACACTG-------A-------------------AT-------T---GTATGT--CAGT-GAAA-TA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGATCGGTGGGAACTATGAAATCTACACATGT---TCCAAAAAT
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-437 ) : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCG-ACCTA-CAA--AA--TTCCAGAT-TACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A--TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCACTG--AN--------C--TA---T--------------------AT-----AT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCGGTGGGAACTATAAAATC--TGC----ACATGTACCCAAAAT
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Reference ( family-437 ) : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACCTA-CAN--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A--TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCACTGA--N-------------------T-TA---TATAT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCGGTGGGAACTATAAAATC--TGC----ACATGTACCCAAAAT
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gi|122023 : AGGAATCATTTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCAA-CAC--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGTACTCCA--T-TC---TA--A----A----TG----TT-ATCA-GT---AT---C----GGAC----------------ATGACAC--TCAAC------TA-TTTTGGGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCACACTGA--A-------------------T-TG---TATGT--CAGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGATCGGTGGGAACTATGAAATC--TAC----ACATGTTCCAAAAAT
gi|122024 : AGGAATCATTTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCAA-CAC--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGTACTCCA--T-TC---TA--A----A----TG----TT-ATCA-GT---AT---C----GGAC----------------ATGACAC--TCAAC------TA-TTTTGGGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCACACTGA--A-------------------T-TG---TATGT--CAGT-GAAATA---GATTCCT
gi|122025 : AGGAATCTTGTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCCATATT-CAC--AA--TTCCAGATTACCTAAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAAGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAT-AGCGCACTGA--A-------------------T-TT---TATAT--CAGT-TAAATA---GATTCCTT---T-TATACCCAGA----CGGTCGATGGGAACTATAAAATT--TAC----ACATGTACCAAAAATttgatactcaaatggtcagt
gi|122026 : AGGAATCTTGTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCCATATT-CAC--AA--TTCCAGATTACCTAAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAAGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAT-AGCGCACTGA--A-------------------T-TT---TATAT--CAGT-TAAATA---GATTCCT
gi|122026 : AGGAATCTATTTA-ACTG--AT-----ATA---A-A--AT--------TCAG--TGCGCTATA-CAA--AA--TTCCAGATTACTTCAAAA-CAG------TTGAGCGTCA--T-GT---T-------------TG----GT-AACGTTT---ACATTT----AGA-----------------ATGAAGC--GCAAC------TG-TTTTTAGGTAATCTGGAA--TTG---T-G--AAT-ATGGCACTGA--T-------------------C-TA---TATAT--CAGT-GAACAA---GATTCCTC---T-AATACACAGA----CGGTCGGCAGGAACTATAAAATA--TGC----ACAAGTACCAACAATctaatacacagacggtcggcaggaactataaaatatgcacaagtaccaacaat
gi|122027 : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----AT------A--GA--------TCAG--TGCAATATA-CAC--AA--TTCCAGATTAGCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCT--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TA---AC---C----GGGC----------------ATGGCAC--TCAAC------AG-TTTTGAGGTTATCGGGAA--TTT---T-G--TAT-GTCGCACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GACATA---GTTTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTTGGTGGTAACTATAAAATC--TAC----AAATATACCAAACAT
gi|122028 : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----AT------A--GA--------TCAG--TGCAATATA-CAC--AA--TTCCAGATTAGCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCT--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TA---AC---C----GGGC----------------ATGGCAC--TCAAC------AG-TTTTGAGGTTATCGGGAA--TTT---T-G--TAT-GTCGCACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GACATA---GTTTCCT
gi|122028 : AGGAAACTATGTC-ACTG--AT-----ATA---C-A--AT--------TCAG--TGCGACATA-CAA--AA--TTCCCGATAACCTCAAAA-CTG------TTGAGTGCCA--T-GC---CC--G----G----T-----TA---CG-TTT--ACATTT----AGAA----------------A-GAAGC--GCAAC------TG-TTTTGAGCTAATCTGGAA--TTG---T-G--TAT-ATTGCACTGA------------------------TC---TATAT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGG----CGGTCAGTTGGAGCTATAAAATA--TGC----ACATGTActaatacccaggcggtcagttggagctataaaatatgcacatgta
gi|122029 : TC-AACA--AT-----ATA---T-A--GA--------TTAG--TGTAACCTA-CAA--AA--TCCCAAATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACA-TT---AC---C----GGAC----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TGCTGAAGTTATCTGGAA--TCT---T-G--TAG-GTCGTACCAA--A-------------------T-TC---TATAT--CGGT-GAAAAA---GATTCCT
gi|122030 : CAT--TGTTACCTA-TAA--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-TT---AC---C----GAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-A--TAG-GTCGCACTGAT-A-------------------TATA---TATAT--CGAT-GAAATA---GTTCCCT
gi|122031 : --TTCCCCATAACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TA----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGC--ACAAC------TG-TTTTGGGGTAGTCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGTACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCT
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gi|122034 : AAGAATCTATTTC-TCCA--AA-----ATA---A-A--AA--------CCAG--TGCCATCTA-CAA--AA--TTG-AGATTACCTTGTCA-CAG------TTGAGCTTCA--CGTCCGGTA--AC---A----TT----TATAA---TT---AT---TT---AGA-----------------ATGAAGT--GCAAC------TG-TTTTGAGGTAAT-TGGAA--TTT---T-G------GTTGCACCAA--T-------------------C-TA---TTTAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTC---T-CTTATCCAGA----CAATTGGTGGTAACTATAAAATC--TGC----ACTTGTACCCAAAATctcttatccagacaattggtggtaactataaaatctgcacttgtacccaaaat
gi|122035 : AGGAATTTATTTC-ACTG--AT-----GTA---T-A--TA--------TCAG--TGCGACCAA-CAA--TA--TTCCAGATTACCTAAAAA-AAA------TTACTCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---T----GGAT----------------ATGAAG---TTAAC------TG-TGTTTTGGTCAACTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCATCGA--T-------------------T-TG---TATAT--TGGTAAAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----C-------AGGAAGTATAAAATC--TGC----ACATGGACCCAAAAT
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gi|122036 : AGGAATCTATTTTTACCA--AT-----ATA---C-A--AA--------TCGA--TGCGACCTA-CAA--AA--TTCCAGTTGACCAAAACA-CAG------TTA-ACTTCA--TATC---CA-------------G----TA-A-CG-TTT--ACATTT----AGA-----------------ATGAAGA--GTAAT------TT-TTTTTAGGTAATCTGGAA--TAT---T-G--TTG-GTCGCACTGA--T-------------------A-TA---TACAT--CAGT-GAAATA---AATTCCTC---T-AATACTCAGA----CAGCCAAAAAGAACTATAAAATC--TGC----TTATGTACCCAAAATctaatactcagacagccaaaaagaactataaaatctgcttatgtacccaaaat
gi|122037 : AGGAATCTTTTTC-TCCA--AA-----ATA---T-A--GA--------TCGG--TGATATCTA-CAC--AA--TTCCAAATTACCTAAAAA-CAG------TTGAGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TG-AACA-TT---AC---T----GGAC----------------ATGACAC--TCAAC------TGTTTTTGAGGTAATCTGAAA--TTT---T-G--TAA-ATTGCACTGA--A-------------------A-TG---TATAA--TAGT-GAAATT---GATTCCTG---T-AATACCCATA----CAGTTGATCGAAACTTTAAAAAC--TAG----AAATAAACCCAAAAT
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gi|122038 : AGGAATCAATTTC-ACTA--TT-----ATA---C-A--TT--------TCAG--TGCAATTTA-CAA--AA--TTTCAGATTACCTCAAAAACAG------TTGAGTGTCA--TGTC---CAGTA----A----TG----TT-CACA-TT--------T----AGA-----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TTTTTAGGTAATTTGGAA--TTG---T-G--TAG-ATATCACCGA--T-------------------C-TA---TATTT--TGGA-GAAAAA---GATTCCTC---T-AATTCCCAGA----TGGTCAGTGGGAACTATAAAATA--TGC----ACATCTACCAAAAActaattcccagatggtcagtgggaactataaaatatgcacatctaccaaaaa
gi|122039 : --TGCGATATA-CAC--AG--TTTTAGATTACTTCGAAA-CAG------TTGCACTTCG--T-TC---TA--A----A----TG----GA-ATCG-TT---AC---T----GGAC----------------ACGACGC--TTAAT------TG-TTGTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCAATAT--A-------------------T-TG---TTAAT--CAGT-GTAATA---TATTCCT
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gi|122041 : AGGAATCTATTTC-CTTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGTGACCTA-TAA--AAATTTCC-GATTTGCTCGAAA-CAG------TTGAGGGTCA--TGTC---CA--ATAATA----TT----TA-CATG-T---------------AAA----------------ATAAACC--GCAAC------TG-TTTAGAGGTAATCTGATA--ATA---T-G--TAG-GTCGCACTTA--C-------------------C-TA---TATAT--CAGT-GAAATA---GATAAATC---T-AATACCCAGA----CGGTTGGTGGTAACTGTAAAATC--TGC----ATATGTACCCAATAT
gi|122042 : AG--CGTGATTTT-TAC--AA--TTCCAGGTAACCTCAAGA-CAGAAACTGTTGTGCTTTA--A-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAACATGACTGTTACCAAATATGACAC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTAGAA--TTT---T-G--TAG-GTTGCACTGA--A-------------------T-TA---TATAT--CGAT-GAAACA---GATTGCT
gi|122043 : AGGATTCTATTTC-ACCG--AT-----GTAATTT-AAAGA--------TCAG--TGCGACCTA-TAC--AA--TTTCAGATTACTTCAAAA-CAG------TTGCGATTCATGT-TCGCTT--------A----TG----TT-TACA-TT--------T----AGA-----------------ATAAAGC--GCGAC------TG-TTTTGAGGGAATCTGAAA--TAG---T-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TAATT--CGGA-GAAATA---TATTTCTC---T-AACACCCAGA----CGGTCGACAGGAACTATAATATC--
gi|122044 : AGAAATATATTTC-TCCG--AA-----TTA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACATA-CAC--TA--TTTCAGATTCCCTCAAAA-CAG------TCGCGCTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACA-TA---AG---C----GAAC----------------ATGAATC--GCAAC------TG-TTTTGAAGTAATCTGAAA--TTG---T-A--TAG-GTCGCACTGATCT-------------------T-TAAATTACAT--CGGT-GAAATA---GAATCCTA---T-Aca
gi|122045 : AGGAATATATTTC-ATCG--AC-----ATA---TTA--TA---------CAG--TGCGACCTA-TAA--AAA-TTCCAGTTTACCTCAAAA-CAG------TTGAGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGA
gi|122046 : AGGAATCTATTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TTCGATTTA-CAA--AA--TTCCAGA
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gi|122050 : ATTTATAAC-ACCG--AT-----AAA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACATA-CGC--AA--TTCAAGATTACCTCAGA
gi|122051 : TCAATTTC-ACTG--AC-----GTA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCTA-CAC--AG--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCTGTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TG-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGCTATGAA--------G-TTTTGCAGTAATCTGGAA--CT
gi|122052 : TATGTC-ACCG--GT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCTACCTA-TAA--AA--TGCCAAATAACCTCAAAA-TAG------TTGAGATTCA--TGTC---CGGTA----A----TGTT--TA-AAT--TT---A-----------AA----------------ATGAAGC--GCAAC------TG-TTTTGGGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TATGT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AACACCCAGA----CGGACGGCAGAAACTATAAAATC--TAC----ACATATACCCAAA
gi|122053 : TTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGCTCTA-CAA--AA--T-CCAGATGATCTCAAAA-CAG------TTGCGTTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-GT---AC---C----GGAC----------------ATGACTC--TCAAT------TA-CTTAAAGGTAATCTAGAA--ATG---T-G--TAG-GTCGCAGTGA--A-------------------T-AG---TACAT--TAGT-GAAATA---
gi|122053 : TATTTC-ACTA--AT-----GTA---C-T--AT--------TCAC--TGCGACCTA-CAC--AT--TTCTAGATTACCTTTAAG-TAA------TTGAGAGTCA--TGTCCGGTA--CC---A----TT----TA-CAT--TT---A----------GA-----------------ATGAAAC--GCAAC------TG-TTTTGAGATCATCTGGA---TTT---T-G--TAG-AGCGCACTGA--T-------------------C-TA---TATAT--CGGT-GAAAAA---AAAATCTC---T-AATACCGAGA----CGGTCGATGGGAGCTAT-AAATA--TGA----ACATGTACCAAAAAaaaaaatctctaataccgagacggtcgatgggagctataaatatgaacatgtaccaaaaa
gi|122054 : AGGAATCTTTATC-ACCGTTAT-----ATA---C-A--AA--------TCAG--TGCAATCTA-CAC--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-TAG------TTGCTCTTCA--T-TT---TA--A----A----TG----TA-AATG-TT---AC---C----AGAC----------------ATGACAC--TCGAC------TG-TTTTGAAGTAATTTGGAA--TTT---T-G--AAG-GTCATACTTA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAAT
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gi|122055 : TTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGCTCTA-CAA--AA--T-CCAGATGATCTCAAAA-CAG------TTGCGTTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-GT---AC---C----GGAC----------------ATGACTC--TCAAT------TA-CTTAAAGGTAATCTAGAA--ATG---T-G--TAG-GTCGCAGTGA--A-------------------T-AG---TACAT--TAGT-GAAATATTTATTTTCTT---T-AATACCCAGA----
gi|122056 : TC-AACA--AT-----ATA---T-A--GA--------TTAG--TGTAACCTA-CAA--AA--TCCCAAATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACA-TT---AC---C----GGAC----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TGCTGAAGTTATCTGGAA--TCT---T-G--TAG-GTCGTACCAA--A-------------------T-TC---TATAT--CGGT-GAAAAA---GATTCCTC---T-AATACACAGA----TGGTTGGTGGGAACTATACAATT--TGC----ACATGTACCCAAAAT
gi|122057 : --GA--------ACAT--TGTTACCTA-TAA--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-TT---AC---C----GAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-A--TAG-GTCGCACTGAT-A-------------------TATA---TATAT--CGAT-GAAATA---G-TTCC-C---T-AATACCCAGA----AGGTCTGTACAAATTATAAAATC--TGC----ACAAGTATCCAAAAT
gi|122058 : --GA--------TCAGATTGCGGCCGAGCGGGTAT--TTCCCCATAACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TA----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGC--ACAAC------TG-TTTTGGGGTAGTCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGTACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTCTTAT-AATACCCAAA----CGGTCGGTAGGAACTTTAAAATC--TAC----AAATGTACCCAAAAT
gi|122059 : A--------TCAG--CGCGACCTA-TAA--AA--TTCC--------TGAAA-----------------------T-TC---TA--A----A----GG----CA-AACG-TT---AC---A----GGA----------------------------AA----------TTTTA---CAATTCGGAA--TTT---T-A--TAG-GTCGCACTTA--TATATATATATATATATATATATA---TATAT--AGGT-TAAATA---GATTCCTC---T-AATACTCAAA----AGGTCGGTATAACCTATAAAATT--TGC----ACATGTAC
gi|122060 : AG--CGTGATTTT-TAC--AA--TTCCAGGTAACCTCAAGA-CAGAAACTGTTGTGCTTTA--A-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAACATGACTGTTACCAAATATGACAC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTAGAA--TTT---T-G--TAG-GTTGCACTGA--A-------------------T-TA---TATAT--CGAT-GAAACA---GATTGCTC---TAAATATCCAG-----CTGTCAGTGGGAACTATAATATC--TAC----ACATGTACCCAAAAT
gi|122061 : --TGCGATATA-CAC--AG--TTTTAGATTACTTCGAAA-CAG------TTGCACTTCG--T-TC---TA--A----A----TG----GA-ATCG-TT---AC---T----GGAC----------------ACGACGC--TTAAT------TG-TTGTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCAATAT--A-------------------T-TG---TTAAT--CAGT-GTAATA---TATTCCTC---T-AATACCCAGG----CGGTCGGTGGGAACTATAAAACC--TAC----ATATCTACCCAAAAT
gi|122062 : --T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-T----AC---CT---GAAA----------------ATGAAGC--TTAAC------TG-TTTTTAGGTAATCTGGAA--TTG---T-A--TAT-GTAGCACTGA--TATATATTT-----------C-TA---TATAT--CCGT-GAAATA---GATTCTCC---T-AATACACAGA----AGGTCAGTGGGAACTACAAAATC--TGC----ACGTGTACCCACAAT
gi|122063 : gcgcacctgctaaataatgtaccgaaacattgtTCAATTTC-ACTG--AC-----GTA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCTA-CAC--AG--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCTGTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TG-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGCTATGAA--------G-TTTTGCAGTAATCTGGAA--CT
gi|122064 : G------TTGCGCTTCA--T-TC---CA--A----AAT--TG----TA-AAAG-T--------------------------------------------CAAC------TG-TGTTGAGGTAAT-----------------------GTCGCACTGA--A-------------------T-TT---TTT--------------------TTCTTC---T-TACATACAGA----CGGTCGTTGGGAGCTATAAAATCGACGCATAAACATGTACCCAAAA
gi|122065 : GCGCTCCA-----C---TA--A----C----T---------ACG-TTT--AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCGAC------TG-TTTTGCGATAATCTGGTA--T
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gi|122071 : A--TTT---T-G--TAG-GCCGCATTGC--A-------------------T-TG---TATAT--TAAT-AAATTA---GATTCCTC---T-CATACCCTGACGGTCGGTCGGTGGAAACTATTAAATC--TGC----ACATATACCCAAAATa
gi|122072 : TTGCACTGA--T-------------------C-TA---CATAT--TGGT-GAAACA---GATTTTGC---T-AATACACAAA----TAGTTGGTGGGAACTATAAAATC--TAC----ACATGTTCCCAAAAT
gi|122073 : -------------------T-TT---TATA-----GT-GAAATA---GATCCCTC---T-GATACCCAGG----CAGTCGGTGGGAACTATAAAATA--TGC----ACATGTATCAAAAAT
gi|122074 : a---TATAT--TGTT-GAGATA---AATTCCTC---T-AATACACAGG----TGGTCGTTGGGAATTATAAAATC--TGC----ATATGTACCCAAAAT
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gi|122065 : GCGCTCCA-----C---TA--A----C----T---------ACG-TTT--AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCGAC------TG-TTTTGCGATAATCTGGTA--T
gi|122066 : TTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---TC---C----GGAT----------------A-----------A-----------TCTGAGGTAATCTTGAA--TTG---C-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TTTAT--CGGT-GTTATA---AAT
gi|122067 : ACG-TC---AC--------GAAC----------------AT--CGC--TAAATACGGTTTG-TTTCAA---AAGCTGG----TTTAAGT-GATTAATGTCGCACCGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCTGTGACAACTATAAAATC--TAC----ACATG
gi|122068 : ----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAAACTGGAA--TTT---TTA--TAG-GTCGCACTGT--A-------------------T-AA---TATGT--CGAT-GAAATA---TATTCCTT---T-AATACCAAGA----AGATCAGTGCGAACTACAAAATC--TGC----ATATGTACCCACAAT
gi|122069 : TCTGGAA--TTT---T-G--TAA-ATCGAACTGA--T-------------------C-TA---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTG---T-AATACTGAGA----TGATAGATGGGAACTATAAAATT--TGC----ACATGC-TTCAAAA
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gi|122070 : TAGAT--TCC---T-A--TAG-GTCACACTGA--T-------------------C-TA---TGCAT--CGGT-GAAATA---GATTTGTC---T-ATTTCTCAGA----tgtctatttctcagaa
gi|122071 : A--TTT---T-G--TAG-GCCGCATTGC--A-------------------T-TG---TATAT--TAAT-AAATTA---GATTCCTC---T-CATACCCTGACGGTCGGTCGGTGGAAACTATTAAATC--TGC----ACATATACCCAAAATa
gi|122072 : TTGCACTGA--T-------------------C-TA---CATAT--TGGT-GAAACA---GATTTTGC---T-AATACACAAA----TAGTTGGTGGGAACTATAAAATC--TAC----ACATGTTCCCAAAAT
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blockSeqs : . . . . . . C . . . G . . . . . T ATTT C C . . . . . . TA . G . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . C . . . G . . . . . . C C C . . . . . . A . G . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . . . . . A . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C C . . . . . . T . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C C . . . . . . A . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . C C C . . . . . . A . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . . . . . A . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . . . . . A . T . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . . . . . T . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . . . . C C A . . . . . . T . G . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . C . . . . . . . . . . C C A . . . . . . T . A . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACCTA-CAN--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCACTGA--N-------------------T-TG---TATAT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCGGTGGGAACTATAAAATC--TGC----ACATGTACCCAAAAT
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Reference ( family-437 ) : AGGAATCTATTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACCTA-CAN--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCACTGA--N-------------------T-TG---TATAT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCGGTGGGAACTATAAAATC--TGC----ACATGTACCCAAAAT
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gi|122022 : AGGAATCTATTTC-ACCT--AT-----ATT---T-A--GG--------TCAG--AGCAATATA-CAC--AG--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTACGTTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATAATGC--TCAAC------TC-TTTTGAGGTTATTGGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---AATTCCT
gi|122022 : AGGAATTTATTTC-ACTG--AT-----ATA---C-A--AT--------TCAG--TGCGACCTA-CAA--AA--TTCCCAATAACCTCAAAA-GAG------TTGAGCATTA--TGTC---CG-------------G----TA-A-CG-TTT--ACATTT----AGA-----------------ATAAAAC--GTAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--CTG---T-G--TAT-ATTGCTCTGA--C-------------------C-TA---AATAT--AGGT-GAAATA---GATTCCTT---T-TATTCCCTGA----CGGCCGGTGGGAACTATAAAATA--TGC----ACATGTACCTAAAAtttattccctgacggccggtgggaactataaaatatgcacatgtacctaaaa
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gi|122026 : AGGAATCTTGTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCCATATT-CAC--AA--TTCCAGATTACCTAAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAAGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAT-AGCGCACTGA--A-------------------T-TT---TATAT--CAGT-TAAATA---GATTCCT
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gi|122039 : AGGAATATATTAC-ACTG--ATTAACAATA---T-A------------T-----TGCGACCTA-CAA--AA--TTCCAGATTACCTCACAA-CAA------TTAAGCGTCG--TGTC---CA-------------G----T--AACG-AT---TC---CATTTAGA-----------------ACGAAGT--GCAAC------TG-TTTCGAAGTAATCTAAAA--CTG---T-G--TAT-ATCGCA----------------------------------------TGGT-G-AAT------TTCCTC---T-TATACCCATA----CGGTCGCTGGGAATTATAAAATC--TAC----ATATCTACGAAAAAtggtgaatttcctcttatacccatacggtcgctgggaattataaaatctacatatctacgaaaaa
gi|122040 : AGGAATCTATTTC-ACCG--AC-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACATA-CAA--AA--TTCCAGATTACCCCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TT---TA--A----A----TT----TA-AACA-TT---AC---C----GGAC----------------ATGAATC--TCAAC------TA-TTTTGAGGTTATTTGGCA--TTT---T-A--TAG-GTAGCACTGA--T-------------------C-TA---TATAC--CGGT-GACATA---
gi|122041 : AGGAATCTATTTC-CTTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGTGACCTA-TAA--AAATTTCC-GATTTGCTCGAAA-CAG------TTGAGGGTCA--TGTC---CA--ATAATA----TT----TA-CATG-T---------------AAA----------------ATAAACC--GCAAC------TG-TTTAGAGGTAATCTGATA--ATA---T-G--TAG-GTCGCACTTA--C-------------------C-TA---TATAT--CAGT-GAAATA---GATAAATC---T-AATACCCAGA----CGGTTGGTGGTAACTGTAAAATC--TGC----ATATGTACCCAATAT
gi|122042 : AG--CGTGATTTT-TAC--AA--TTCCAGGTAACCTCAAGA-CAGAAACTGTTGTGCTTTA--A-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAACATGACTGTTACCAAATATGACAC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTAGAA--TTT---T-G--TAG-GTTGCACTGA--A-------------------T-TA---TATAT--CGAT-GAAACA---GATTGCT
gi|122043 : AGGATTCTATTTC-ACCG--AT-----GTAATTT-AAAGA--------TCAG--TGCGACCTA-TAC--AA--TTTCAGATTACTTCAAAA-CAG------TTGCGATTCATGT-TCGCTT--------A----TG----TT-TACA-TT--------T----AGA-----------------ATAAAGC--GCGAC------TG-TTTTGAGGGAATCTGAAA--TAG---T-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TAATT--CGGA-GAAATA---TATTTCTC---T-AACACCCAGA----CGGTCGACAGGAACTATAATATC--
gi|122044 : AGAAATATATTTC-TCCG--AA-----TTA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACATA-CAC--TA--TTTCAGATTCCCTCAAAA-CAG------TCGCGCTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACA-TA---AG---C----GAAC----------------ATGAATC--GCAAC------TG-TTTTGAAGTAATCTGAAA--TTG---T-A--TAG-GTCGCACTGATCT-------------------T-TAAATTACAT--CGGT-GAAATA---GAATCCTA---T-Aca
gi|122045 : AGGAATATATTTC-ATCG--AC-----ATA---TTA--TA---------CAG--TGCGACCTA-TAA--AAA-TTCCAGTTTACCTCAAAA-CAG------TTGAGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----GGA
gi|122046 : AGGAATCTATTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TTCGATTTA-CAA--AA--TTCCAGA
gi|122047 : GAATCTATTTC-ACGG--AT-----ATA---T-A--GAAATATATATCAG--TGCTACATA-TAC--AA--TTCCAGATTACCTAAAAA-CAG------TTAAGCTTCA--T-TT---T
gi|122048 : AATCTATTTC-ACCG--AT-----GCA---T-A--GA--------TCAG--TGTGACCTA-TAG--GA--ATCTA
gi|122049 : ATCTATTTC-ACTG--AT-----ATA---T-A--GG--------TAAG--TGCGACCTA-CAT--AT--TATCAGATTACCTCTAAA-CAG------TTGCGGTTTA--T-TT---TA--C----A----TG----TA-AATA-TT---AT---T----GGAC----------------ATGACCC--TCAAC------TG-TTTCGAGCAAATC-GGAAATTTT---T-A--TAG-GTCACACTGA--T-------------------C-TA---TATAT--CAAG-GAAATA---GATTCCTC---T-TATACCCAGA----TAGTTAG-AGGAGTTATAAATTA--TGC----ATTTGGACCCAAAAT
gi|122050 : ATTTATAAC-ACCG--AT-----AAA---T-A--GA--------TCAG--TGCGACATA-CGC--AA--TTCAAGATTACCTCAGA
gi|122051 : TCAATTTC-ACTG--AC-----GTA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCTA-CAC--AG--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCTGTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TG-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGCTATGAA--------G-TTTTGCAGTAATCTGGAA--CT
gi|122052 : TATGTC-ACCG--GT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCTACCTA-TAA--AA--TGCCAAATAACCTCAAAA-TAG------TTGAGATTCA--TGTC---CGGTA----A----TGTT--TA-AAT--TT---A-----------AA----------------ATGAAGC--GCAAC------TG-TTTTGGGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TATGT--CGGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AACACCCAGA----CGGACGGCAGAAACTATAAAATC--TAC----ACATATACCCAAA
gi|122053 : TTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGCTCTA-CAA--AA--T-CCAGATGATCTCAAAA-CAG------TTGCGTTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-GT---AC---C----GGAC----------------ATGACTC--TCAAT------TA-CTTAAAGGTAATCTAGAA--ATG---T-G--TAG-GTCGCAGTGA--A-------------------T-AG---TACAT--TAGT-GAAATA---
gi|122053 : TATTTC-ACTA--AT-----GTA---C-T--AT--------TCAC--TGCGACCTA-CAC--AT--TTCTAGATTACCTTTAAG-TAA------TTGAGAGTCA--TGTCCGGTA--CC---A----TT----TA-CAT--TT---A----------GA-----------------ATGAAAC--GCAAC------TG-TTTTGAGATCATCTGGA---TTT---T-G--TAG-AGCGCACTGA--T-------------------C-TA---TATAT--CGGT-GAAAAA---AAAATCTC---T-AATACCGAGA----CGGTCGATGGGAGCTAT-AAATA--TGA----ACATGTACCAAAAAaaaaaatctctaataccgagacggtcgatgggagctataaatatgaacatgtaccaaaaa
gi|122054 : AGGAATCTTTATC-ACCGTTAT-----ATA---C-A--AA--------TCAG--TGCAATCTA-CAC--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-TAG------TTGCTCTTCA--T-TT---TA--A----A----TG----TA-AATG-TT---AC---C----AGAC----------------ATGACAC--TCGAC------TG-TTTTGAAGTAATTTGGAA--TTT---T-G--AAG-GTCATACTTA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAAT
gi|122054 : ATTTC-ACTG--AT-----ATA---C-A--AT--------TAAG--TATGACCTT-CAA--AA--TTCCAAATTACTTCAAAA-CAG------TCGAGTGTCA--TGTC---TG-------------G----TA-A-CA-TTTACAT---T----TAAA----------------ATGAAGA--GCAAC------TA-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTG---T-G--TAG-ATTGCACTGA--T-------------------T-TG---TATATAACGGT-GATAAA---GATTCCTC---T-AATACCAAGA----CAGTTGATAGGAAATATAAAATA--TGC----CCATGTACCAAAAATctaataccaagacagttgataggaaatataaaatatgcccatgtaccaaaaat
gi|122055 : TTTC-ACCG--AT-----ATA---T-A--GA--------TCAG--TGCGCTCTA-CAA--AA--T-CCAGATGATCTCAAAA-CAG------TTGCGTTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-GT---AC---C----GGAC----------------ATGACTC--TCAAT------TA-CTTAAAGGTAATCTAGAA--ATG---T-G--TAG-GTCGCAGTGA--A-------------------T-AG---TACAT--TAGT-GAAATATTTATTTTCTT---T-AATACCCAGA----
gi|122056 : TC-AACA--AT-----ATA---T-A--GA--------TTAG--TGTAACCTA-CAA--AA--TCCCAAATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACA-TT---AC---C----GGAC----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TGCTGAAGTTATCTGGAA--TCT---T-G--TAG-GTCGTACCAA--A-------------------T-TC---TATAT--CGGT-GAAAAA---GATTCCTC---T-AATACACAGA----TGGTTGGTGGGAACTATACAATT--TGC----ACATGTACCCAAAAT
gi|122057 : --GA--------ACAT--TGTTACCTA-TAA--AA--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-TT---AC---C----GAAC----------------ATGACGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-A--TAG-GTCGCACTGAT-A-------------------TATA---TATAT--CGAT-GAAATA---G-TTCC-C---T-AATACCCAGA----AGGTCTGTACAAATTATAAAATC--TGC----ACAAGTATCCAAAAT
gi|122058 : --GA--------TCAGATTGCGGCCGAGCGGGTAT--TTCCCCATAACCTCAAAA-CAG------TTGCGCTTCA--T-TC---TA--A----A----TA----TA-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGC--ACAAC------TG-TTTTGGGGTAGTCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGTACTGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTCTTAT-AATACCCAAA----CGGTCGGTAGGAACTTTAAAATC--TAC----AAATGTACCCAAAAT
gi|122059 : A--------TCAG--CGCGACCTA-TAA--AA--TTCC--------TGAAA-----------------------T-TC---TA--A----A----GG----CA-AACG-TT---AC---A----GGA----------------------------AA----------TTTTA---CAATTCGGAA--TTT---T-A--TAG-GTCGCACTTA--TATATATATATATATATATATATA---TATAT--AGGT-TAAATA---GATTCCTC---T-AATACTCAAA----AGGTCGGTATAACCTATAAAATT--TGC----ACATGTAC
gi|122060 : AG--CGTGATTTT-TAC--AA--TTCCAGGTAACCTCAAGA-CAGAAACTGTTGTGCTTTA--A-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---AC---C----AAACATGACTGTTACCAAATATGACAC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAATCTAGAA--TTT---T-G--TAG-GTTGCACTGA--A-------------------T-TA---TATAT--CGAT-GAAACA---GATTGCTC---TAAATATCCAG-----CTGTCAGTGGGAACTATAATATC--TAC----ACATGTACCCAAAAT
gi|122061 : --TGCGATATA-CAC--AG--TTTTAGATTACTTCGAAA-CAG------TTGCACTTCG--T-TC---TA--A----A----TG----GA-ATCG-TT---AC---T----GGAC----------------ACGACGC--TTAAT------TG-TTGTGAGGTAATCTGGAA--TTT---T-G--TAG-GTCGCAATAT--A-------------------T-TG---TTAAT--CAGT-GTAATA---TATTCCTC---T-AATACCCAGG----CGGTCGGTGGGAACTATAAAACC--TAC----ATATCTACCCAAAAT
gi|122062 : --T-TC---TA--A----A----TG----TA-AATG-T----AC---CT---GAAA----------------ATGAAGC--TTAAC------TG-TTTTTAGGTAATCTGGAA--TTG---T-A--TAT-GTAGCACTGA--TATATATTT-----------C-TA---TATAT--CCGT-GAAATA---GATTCTCC---T-AATACACAGA----AGGTCAGTGGGAACTACAAAATC--TGC----ACGTGTACCCACAAT
gi|122063 : gcgcacctgctaaataatgtaccgaaacattgtTCAATTTC-ACTG--AC-----GTA---T-A--GA--------TCAG--TACGATCTA-CAC--AG--TTCCAGATTACCTCAAAA-CAG------TTGCTGTTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TG-AACG-TT---AC---C----GGAC----------------ATGGCGCTATGAA--------G-TTTTGCAGTAATCTGGAA--CT
gi|122064 : G------TTGCGCTTCA--T-TC---CA--A----AAT--TG----TA-AAAG-T--------------------------------------------CAAC------TG-TGTTGAGGTAAT-----------------------GTCGCACTGA--A-------------------T-TT---TTT--------------------TTCTTC---T-TACATACAGA----CGGTCGTTGGGAGCTATAAAATCGACGCATAAACATGTACCCAAAA
gi|122065 : GCGCTCCA-----C---TA--A----C----T---------ACG-TTT--AC---C----GGAC----------------ATGACGC--TCGAC------TG-TTTTGCGATAATCTGGTA--T
gi|122066 : TTTA--T-TC---TA--A----A----TG----TA-AACG-TT---TC---C----GGAT----------------A-----------A-----------TCTGAGGTAATCTTGAA--TTG---C-G--TAT-GTCGCACTGA--T-------------------C-TA---TTTAT--CGGT-GTTATA---AAT
gi|122067 : ACG-TC---AC--------GAAC----------------AT--CGC--TAAATACGGTTTG-TTTCAA---AAGCTGG----TTTAAGT-GATTAATGTCGCACCGA--A-------------------T-TG---TATAT--CAGT-GAAATA---GATTCCTC---T-AATACCCAGA----CGGTCTGTGACAACTATAAAATC--TAC----ACATG
gi|122068 : ----------------ATGAAGC--TCAAC------TG-TTTTGAGGTAAACTGGAA--TTT---TTA--TAG-GTCGCACTGT--A-------------------T-AA---TATGT--CGAT-GAAATA---TATTCCTT---T-AATACCAAGA----AGATCAGTGCGAACTACAAAATC--TGC----ATATGTACCCACAAT
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gi|122070 : AATCTATTTC-ACCG--AT-----GCA---T-A--GA--------TCAG--TGTGACCTA-TAG--GA--ATCTA
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gi|122071 : A--TTT---T-G--TAG-GCCGCATTGC--A-------------------T-TG---TATAT--TAAT-AAATTA---GATTCCTC---T-CATACCCTGACGGTCGGTCGGTGGAAACTATTAAATC--TGC----ACATATACCCAAAATa
gi|122072 : TTGCACTGA--T-------------------C-TA---CATAT--TGGT-GAAACA---GATTTTGC---T-AATACACAAA----TAGTTGGTGGGAACTATAAAATC--TAC----ACATGTTCCCAAAAT
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