lowQualScore : 111 1 1 6666666666666666666666666666666666666
lowQualScore : 000 4 0 22222 5 1 0 222 111 0 22222 0 0 5 1111 11 222 0 0 4444444 3 0 1111 1111 11 3333 444 222222 3333333333333333333333333333333333333 222222
lowQualScore : ... . . ..... . . . ... ... . ..... . . . .... .. ... . . ....... . . .... .... .. .... ... ...... ..................................... ......
lowQualScore : 666 7 9 33333 9 7 9 222 444 8 00000 2 8 0 7777 11 222 8 6 9999999 8 8 8888 8888 22 0000 888 666666 8888888888888888888888888888888888888 999999
consensus : TATC-GATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---ATT-TTTATTCATGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CG----T-A--TTT-------T---------A------ACACACCTCGTA
Reference ( gi|61897 ) : TATA-GACATGAAAT-T-----TGGCCA-T-TGCATAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGAC----A--ATATA---ATT-TTTATTCATGTGCTATATTAA-------AGGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------TG----T-A------------T---------A------ACACACCTCATA
gi|61898 : TATC-AATATGGAGT-T-----TGGCAG-T-TGCATAGAG---AA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---GTT-TTTATTTATGAGCTTTATCAA-------ATAT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CA----T-AATATTTT-----T---------A------ACACACCTCATA
gi|61896 : TATC-AATATGAAAT-T-----TAGTAA-T-TGCATAGAG---AA---A-ATATTAT-----TTTTT--TGGC----A--ATATA---ATT-TTTGTTCATGTGCTGTATTAA-------ATAT-TGAAA----ATATTACGA----AA--GT----C---C------A------CA----T-ATATTTT------T---------A------ACACAGCTCGTA
gi|61917 : TATA-GATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TACATATAATTTAATTTA-ATATTAC-----TTTTTA-TGAC----A--ATATA---CTT-CTTATTTTTGTGCTATATTAA-------ATGT-TAAAA----ATATTGCAA----AA--CT----C---C------A------TG----T-AATTTGTTACATGT---------A------ACACACCTCGTAta
gi|61901 : TATA-ATTACGAAAC-T-----TGGCAA-T-CGCATAGAG---GA---A-ATATAAC-----TGTTAA-TGGC----A--ATATG---ATA-TTTATTCATGTGCTATAATAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--AT----C---C------A------CC----T-ATTTTT-------T---------A------ATACATCTCATAca
gi|61902 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGC-A-T-TGCATAGAG---GA---T-ATTTTAA-----TATTAA-TGGC----A--ATACA---ATT-TTTAATTTTGTGCTATGTTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------TG----T-ATTTT--------T---------A------ATACATCTCGTA
gi|61899 : TATC-AATAAGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATAGAG---GA---A-ATAT-AA-----TTTTTA-TGGC----A--ATACA---ATT-TT-ATTCATGTGCTAAATAAA-------ATAT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----T---G------A------CA----T-ATTTTTCT-----T---------A------ATACACCTCATA
gi|61905 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATACAG---GA---A-CTATTAC-----TTTTGA-TGGC----A--ATTTA---A-T-ACTATTCATGTACTATTTTAA-------AAGT-TGAAA----ATACTACAA----AA--GT----C---A------A------AG----T-A------------TTTTG-----A------ACACACCTt
gi|61903 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGAAA-T-TGCATAGAA---GA---A-ATATTAC-----AATTGA-TGGC----A--ATATC---ATT-TTTATTCTTGTGCTATATTAA-------ATGC-TGAAA----ATGTTAC-A----AA--GT----A---C------A------CA----T-ATTTTT-------T---------A------ACACACCTCGTAagtat
gi|61914 : TATA-ATTATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATACAA---TA---T-ATATAAC-----TTTTTA-TGAC----A--ATATA---ATT-TTCATTCTAGTACTATATTTA-------ATGT-TGAAA----CTATTGCAA----AA--GT----C---C------A------TG----TAA------------TTTTTG----A------AAACACCTCATAta
gi|61906 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGC-----TGCA--GAG---GT---A-ATATTAC-----ATTTCA-TGGC----A--ATATC---ATT-TTTAATCTCGTGTTATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAG----AA--GT----C---C------A------TA----T-AGTTTTT------T---------A------ACACACCTCGT
gi|61913 : TATC-GATATGAAAT-T-----TGATAA-T-TGCATAGAG---GA---A-ATATTACTTTTATTTTTA-TGTC----A--ATATA---ATT-TTTAT------------TTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAG----AA--AT----C---C------A------TG----T-ATTTTT-------T---------A------ACATACCTCGTA
gi|61911 : TATA-GATACAAAAT-T-----GGGCAA-T-TGCGTAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTGTTA-TGGC----A--ATATA---ATT-TTTATTCAT---------------------GT-TGAAA----ATATTAC------AA--GT----C---C------A------CG----T-ATTTTTT------T---------T------ACACACCTCATAca
gi|61916 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGCAA-C-AGCATAGAG---AA---ACAT-TTAC-----TATTAA-TGAC----G--ATATA---ATT-TTGATTCTTGTGCTATATATA-------ATAT-TGAAA----ATACTACAA----AA--GT----C---C------A------CG----T-ACGTTT-------T---------A------ACCCACCT
gi|61910 : TATC-AATATAAAAT-T-----TAGCAA-T-TGCATAGAG---GA---G-ATATTAC-----GATTAT-TGGC----A--TTATA---ATT-T--ATTCTTGTGCTATATTAA-------ATGT-TGACA----ATATTACAA----AA--TT----C---C------A------CG----T-A------------T---------
gi|61928 : TATA-GATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATAGAA---AA---C-ACATTAC-----TTTATA-TGAC----AATATATA---ATT-TTTATTCTTGTGCTAAATTAA-------ttttt
gi|61918 : TATC-AACTTGAAAT-G-----AGGCAAAC-TGCATAGGG---GA---A-ATATTAC---------GA-TAACTGGTC--ATATA---CTT-TTTATTCTTGTGCTGTAATAAT------TGTT-TGAAT----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CG----T-AACTTT-------T---------A------ACACACCTCGTAttatgtaattttcgaacacatctcatata
gi|61923 : TATC-AATACGAAAA-T-----TGAGGA-T-TAATTAGAA---AA---A-ATGATAA-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---ATG-TTTATTCATGTGTTATATTGT-------ATGT-TGTAA----GTATTACAA----AA--GT----C---A------A------TG----T-A------------T---------ta
gi|61915 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGCAA--------AGAG---GA---A-ATATCAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATG---TTTGTTTATTCATGTAT--TATCAA-------ATGT-TGAAA----ATGTAACAA----AA--AT----ttt
gi|61926 : TATC-AATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATAGCA---GT---A-ATACAAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---ATT-TGTACTTATATGCT
gi|61904 : TATG-GATATGAAAT-T-----TTGCAT-T-TGCATAGAA---GA---A-ATATTAA-----TTTTTA-TGGC----A--ATGTC---ATT-TTTGTCC
gi|61931 : TATA-GGAACGAAATAT-----TTACGA-C-TGCATTGAA---GA---A-CTGTTAC-----TTTGTC-AGGG----A--ATATAGTAATT-TTTATTCATGTGCTATATTAA-------ATGTGTAAAATTTTATATTATTA----AT--AT----TGAAT------A------TT----T-T------------T---------A------ACACACCTTGTA
gi|61929 : tcaaTATC-AATATGAAAT-T-----TGGCAA-C-TGCATAGAG---GA---A-ATATAAT-----GTTTAA-TGGT----C--ATATA---GTT-TTTAca
gi|61912 : TATC-AACATGCAAT-T-----TGGCAA-T-TGCATAGAG---GA---A-TTATT
gi|61925 : ATATGACAT---AT-T-----T--TCAGT-TGCAAAGAGT--GA---T-ATATTAC-----TTTTTA-TGTC----A--ATACA---AGT-TATATTCATGGGCTATATAAA-------ATGT-TAAGA----ATATTCTTA----AA--TT----C---C------G------CT----T-A------------TC--------A------GCACACTTCGTA
gi|61934 : tatcaATACGAAAT-T-----TGGCAT-T-TGCATAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---ACT-TTTATTCATTTGCTAT-TTTA-------ATGT-CGAAT----TTATTCCAA----AA--GT----A---T-------------TT----T-A------------TG--------A------ACACACCTCGTAta
gi|61935 : aATATGAAAT-T-----TGGCAA-T-CTCATAGAG---AA---A-ATTTTAC-----TTACAAGTGG-----A--ATCTA---ATT-TCTATTCATGTGCTATATTGA-------ATGT-T-AAA----ATATTACAA----AA--AT----C---G------A------TG----T-GTTTTT-------T---------A------ACACACCTCGTAt
gi|61936 : ATACGAAAT-T-----TGGC-A-T-TGCATAGAG---GA---G-ACATTGC-----TTTTTA-TGGG----A--ATATA---ATT-TTCATTCATAGGCTTTACTAA-------ACAT-TGAAA----ATATT---A----AA--GT----C---
gi|61907 : ATATGAGAT-T-----TGGCAA-T-CGCATGTAG---GA---A-ATAGTAC-----AACTAA-TGGC----T--ATGTA---AGT-ATTATTCTTGCGCAATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATAACAA----AA--GT----C---C------ACACATTTT----T-A------------TG--------A------ACACAGTTCATAactatt
gi|61920 : tgtcaATACGAAAA-T-----TGGAAA-T-TTCTTAGAG---GA---A-ATATTAG-----TTTTTA-TGGC----A--AT-------TC-TTT-TTCATGT--CATATTAT-------ATGT-TAAAA----ATATTACAA----AA---T----T---C------A------CC----T-A------------T---------CTTTTTTACATACCTCGTAt
gi|61930 : tagcaATGAAAT-T-----AAGCAA-T-TGTATAGAG---GA---A-ATATAAC-----TTTT-A-TGGC----A--ATATA---CTT-TTTATTCATGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GTTTACC---T------A------TGTT--T-T------------T---------A------ACACACCTCATAca
gi|61939 : atcaaaATGAAAT-A-----TGGCAA-T-TGCATAGAG---GA---A-ACGTTAC-----TTTCTA-TAGT----G--ATATA---ATT-TTTATTCATGTGCTATAATAA-------CTGC-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------ca
gi|61909 : tATGAAAT-T-----CATCAA-T-TGCGTAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGA----A--AT-------TT-TTTATTTAAGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----CTATTACAA----AA--GT----CCT-C------A------T-----T-ATTATT-------T---------A------AGACACCTTGTActttttttttttaacaatct
gi|61908 : tatcagtATGAAAT-T-----CATCAA-T-TGCGTAGAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGA----A--AT-------TT-TTTATTTAAGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----CTATTACAA----AA--GT----CCT-C------A------T-----T-ATTATT-------T---------A------AGACACCTTGTAt
gi|61921 : tatcagtATGAAAT-TGTCAATTGTCA-T-CATGTAGAA---AA---A-ATAGTA------TTTTCA-TGAC----A--CTATA---TTT-TTTATTCAAGTACTATATGAA-------ATGT-TGAAA----ATGTTACAA----AAGTGT----C---C------A------TG----C-A------------TTTTTTTAAAA------ACACACCTCt
gi|61924 : tatcaatatgATGAAAT-T-----CGGCAG-T-TGCATAGAA---GA---A-ATATTA---------------------------------TT-TTCATGTATGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----ACTTTACAA----AA--GT----T---T------A------CA----T-A------------TTATTTG---A------ATACACGTCGTA
gi|61922 : taccattATAAAAT-T-----TGGC-A-TATGCATAGAG---GA---A-GTAATAC-----TTTTTA-TTGC----A--TTATG---AAT-ATTATTCATGTTC-A---TAA-------ATCC-TGAAA----ACATTACAA----AA--GTAG--G---C------A------TATTTTT-T------------T---------A------ACACACCT
gi|61919 : tatctgtTGAACT-T-----TGGCAT-T-TGCAAAGAG---GA---T-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATT---ATT-GTTATTCATATGTTGTAATAA-------ATGA-TGAAA----CTTTTACGA----AA--GT----C---C------A------CA----T-A------------
gi|61927 : taccaattGGAAT-T-----TGACTA-T-TGCATAGAG---GG---A-ATATAAC-----AATTAA-TGGC----A--ATTTA---AGT-TT-ATTCTTGTGCTATATTAA-------ATGT-TAACA----ATATTACAA----ctttttt
gi|61932 : tattaataaAAAT-T-----TGGCAG-T-TGCATAAAG---GC---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATC---ATT-TTTATTGGTGTGCTTTATTAA-------ATGT-TTAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CA----T-A------------T---------
gi|61940 : caatgtcAAAC-T-----TGGCAA-A-TGCATTGAA---GA---C-ATATTTC-----TTTTTA-TGGC----A--ATAAA---ATT-TTTATTCTTGTGCTATACTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAC----AA--GT----C---C------A------CA----T-A------------TTTTTTA---A------AAATACCTCATAttttttaacac
gi|61900 : AAT-T-----TGGCAG-T-TGCATAGTG---GA---A-ATATCAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---GTT-TTAATTAATGGACAATATGAA-------ATGT-TAAAC----A-AATACAA----AA--AT----T---C------A------CA----T-A------------T---------A------
gi|61933 : tatcaatacagAAT-T-----TGGCAA-T------------------A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATT---ATT-GTTTTTCATGTGTCACATTAAATCATTTATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----T---C------A------CA----T-ATTTTTT------T---------A------ACACATTTCtttttaacacat
gi|61938 : caatattgAT-T-----TGCCAA-T-TGCATAGAG---GA---A-ATATTAT-----ATTTCA-TGTC----A--ATATA---ATT-TTTGTTgaatat
gi|61941 : atacaacT-T-----TGGCAA-T-TACATAAAG---GA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--TTATA---ATT-TTTATTCATGTGCTATATTAA-------ATGA-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CA----T-ATTTTTT------T---------T------ACACACCTCATAaaaacacaccttatacattgatattgaaa
gi|61937 : GCAA-T-TGCAAAGAG---GA---A-AAAATAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATAAA---ATT-GTAAAGCATATGCTATATTAA-------ATCT-CAAAA----ATATTACAGACACAA--CT----CG--T------A------TT----T-T------------T---------A------ACTTACTTCATca
gi|61942 : atacgaggtA-T-TGTATAAGG---GA---A-ATACTAC-----TTTTTA-AGGC----A--AT-TAC--ATT-TTGATTCATGTGCTA----------------T-TGAAA----ATATTACTA----AA--GT----C---CACAAATA------TT----T-T------------T---------A------ACACAC
gi|61943 : a-TACATAGAG---GA---A-ATATTGA-----GATTAA-TGGC----A--AAATA---ATA-TTTATTCTTGTGTTATATTAAATT----ATAT-TAAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------TG----T-ATTTTT-------T---------A------ACACACTTCGTAacata
gi|61944 : CAGAGAG---TA---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---ATT-TTTATTCATGTGCTATAATAG-------ATGT-GGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------TG----T-G------------TTTTTTG---A------ACACATCTCGTAta
gi|61945 : AG---GT---A-ATATTAC-----TTTTTA-TGGC----A--ATATA---AAT-TTTATTCATGTGCTATATTAG-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AT--CT----C---C------ACATCTTTT----T-T------------T---------A------ACACACCTCGTAta
gi|61946 : AG---GA---A-ATATTAC-----AGTTAA-TGGC----A--ATATA---ATT-TTTATTATTGTGCTATATCAA-------AGGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--CT----C---C------A------TG----T-A------------T---------
gi|61947 : ----A--ATATA---ATT-TTTATTCTTGTGCTATATCAA-------ATGT-TGAAA----ATATCACAA----AA--GT----T--------------------------------------T---------A------ACACACCTCATAttttttaaca
gi|61949 : attccttgcttaatggcaaaatgTT-GTTATTGATGTGATATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTAAGA----AA--GC----C---C------T------CG----T-ATATTT-------T---------A------ACACACCTCGTAca
gi|61948 : TT-GTTATTCTTGTATTGTAATAA-------ATGT-TGAAA----ATATTACAA----AA--GT----C---C------A------CT----TAA------------TTTTCG----A------ACACACCTGATta
gi|61950 : ATTCTTGTGCTATATTAA-------ATGT-TGAAA----ATATTGTAA----AA--GT----C---C------A------CA----T-ATTTTTT------T---------A------ATACACCTCATAgta
Alignments
lowQualScore : 3333 111111
lowQualScore : 3 11 1 0 1111 11 222 111 0 11 222222 0 11 222222 222 0 222222 1 5555555 0 0 1111 11 22222 55555 2 2222 22 2222 33333333 333333
lowQualScore : . .. . . .... .. ... ... . .. ...... . .. ...... ... . ...... . ....... . . .... .. ..... ..... . .... .. .... ........ ......
lowQualScore : 4 22 7 9 7777 11 222 444 8 11 222222 8 11 333333 222 8 222222 2 0000000 8 8 7777 11 11111 66666 6 8888 33 7777 22222222 444444
consensus : TATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--G--T-AT---T--T----T--------T------AACACACCTCGTA
Reference ( family-435 ) : TATCGATATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--G--T-A----T--T----T--------T------AACACACCTCGTA
gi|61896 : TATCAATATGA--AAT-TTAGTAA-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTATTT--TT-----T--TGGCA--A------TATA---ATT-TTTGTT------CATGTGCTGTATTAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACGAAA--GTCCA-----C--A--T-ATAT-T--T----T--------T------AACACAGCTCGTA
gi|61897 : TATAGACATGA--AAT-TTGGCCA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T--G--T-A---------------------T------AACACACCTCATAta
gi|61898 : TATCAATATGG--AGT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTTATT------TATGAGCTTTATCAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--A--T-AATATT--T----T--------T------AACACACCTCATA
gi|61899 : TATCAATAAGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-T-AATT--TT-----TA-TGGCA--A------TACA---ATT-TT-ATT------CATGTGCTAAATAAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTGA-----C--A--T-A----T--TTTTCT--------T------AATACACCTCATA
gi|61900 : TATCAATACAG--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGTG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTAATT------AATGGACAATATGAA-------ATG-T-TAAAC----A-AATACAAAA--ATTCA-----C--A--T-ATAT-T--T----T--------T------AACACAt
gi|61901 : TACGA--AAC-TTGGCAA-TCG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAACTG--TT-----AA-TGGCA--A------TATG---ATA-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--ATCCA-----C--C--T-ATT--T--T----T--------T------AATACATCTCATAt
gi|61902 : tataatTATCAATATGA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---TATT-TTAATA--TT-----AA-TGGCA--A------TACA---ATT-TTTAAT------TTTGTGCTATGTTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T--G--T-AT---T--T----T--------T------AATACATCTCGTA
gi|61903 : TATCAATATGA--AAT-TTGGAAA-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTACAA--TT-----GA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-C-TGAAA----ATGTTAC-AAA--GTACA-----C--A--T-ATT--T--T----T--------T------AACACACCTCGTA
gi|61904 : TATGGATATGA--AAT-TTTGCAT-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TGTC---ATT-TTTGTC------Cta
gi|61905 : TATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAG---GA---ACTA-TTACTT--TT-----GA-TGGCA--A------TTTA---A-T-ACTATT------CATGTACTATTTTAA-------AAG-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCAA-----A--G--T-A----T--T----T--------TG-----AACACACCTAGTA
gi|61906 : TATCAATATGA--AAT-TTGGC----TG----CA----GAG---GT---AATA-TTACAT--TT-----CA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTAAT------CTCGTGTTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--GTCCA-----T--A--T-AGTT-T--T----T--------T------AACACACCTCGTt
gi|61907 : TGTCAATATGA--GAT-TTGGCAA-TCG----CAT--GTAG---GA---AATA-GTACAA--CT-----AA-TGGCT--A------TGTA---AGT-ATTATT------CTTGCGCAATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATAACAAAA--GTCCA-----C--A--C-A----T--T----T--------TTATG--AACACAGTTCATA
gi|61908 : TATCAGTATGA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C--AT-T-A----TTAT----T--------T------AAGACACCTTGTAt
gi|61909 : TATCAGTATGA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C--AT-T-A----TTAT----T--------T------AAGACACCTTGTAt
gi|61910 : TATCAATATAA--AAT-TTAGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---GATA-TTACGA--TT-----AT-TGGCA--T------TATA---ATT-T--ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGACA----ATATTACAAAA--TTCCA-----C--G--T-A----T--T----T--------T------t
gi|61911 : TATAGATACAA--AAT-TGGGCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--GT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------C---------------------ATG-T-TGAAA----ATATTAC--AA--GTCCA-----C--G--T-ATTT-T--T----T--------T------TACACACCTCATAtt
gi|61912 : TATCAACATGC--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---ATTA-TT
gi|61913 : TATCGATATGA--AAT-TTGATAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TTATTTTTA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTATT------------------TAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--ATCCA-----T--G--T-ATT--T--T----T--------T------AACATACCTCGTA
gi|61914 : TATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAA---TA---TATA-TAACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTCATT------CTAGTACTATATTTA-------ATG-T-TGAAA----CTATTGCAAAA--GTCCA-----T--G--TAA----T--T----T--------TTG----AAAACACCTCATAca
gi|61915 : tataatTATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-------------AGAG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATG---TTTGTTTATT------CATGTAT--TATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTAACAAAA--AT
gi|61916 : TATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-CAG----CAT--AGA----GA---AACATTTACTA--TT-----AA-TGACG--A------TATA---ATT-TTGATT------CTTGTGCTATATATA-------ATA-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCCA-----C--G--T-ACG--T--T----T--------T------AACCCACCT
gi|61917 : TATAGATATGA--AAT-TTGGCAA-TTA----CAT--ATAATTTAATTTAATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---CTT-CTTATT------TTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAAAA----ATATTGCAAAA--CTCCA-----T--G--TAA----T--T----TGTTACATGT------AACACACCTCGTA
gi|61918 : TATCAACTTGA--AAT-GAGGCAAACTG----CAT--AGGG---GA---AATA-TTACGA--TA-----AC-TGGTC--A------TATA---CTT-TTTATT------CTTGTGCTGTAATAA-------TTGTT-TGAAT----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--G--T-AAC--T--T----T--------T------AACACACCTCGTAca
gi|61919 : TACCAATTTGA--ACT-TTGGCAT-TTG----CAA--AGAG---GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTATT------CATATGTTGTAATAA-------ATG-A-TGAAA----CTTTTACGAAA--GTCCA-----C--A--T-A----C--T----T--------T------ta
gi|61920 : TAGCAATACGA--AAA-TTGGAAA-TTT----CTT--AGAG---GA---AATA-TTAGTT--TT-----TA-TGGCA--A------T-------TC-TTT-TT------CATGT--CATATTAT-------ATG-T-TAAAA----ATATTACAAAA---TTCA-----C--C--T-ATCT-T--T----T--------T------TACATACCTCGTAttt
gi|61921 : TATCAATATGATGAAA-TTGTCAA-TTGTCATCATGTAGAA---AA---AATA-GTA-TT--TT-----CA-TGACA--C------TATA---TTT-TTTATT------CAAGTACTATATGAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTTACAAAAGTGTCCA-----T--G--C-A----T--T----T--------TTTTAAAAACACACCTCca
gi|61922 : TATCTGTATAA--AAT-TTGGCAT-ATG----CAT--AGAG---GA---AGTA-ATACTT--TT-----TA-TTGCA--T------TATG---AAT-ATTATT------CATGTTC-A---TAA-------ATC-C-TGAAA----ACATTACAAAA--GTAGG-----C--A--T-ATTT-T--T----T--------T------AACACACCT
gi|61923 : TATCAATACGA--AAA-TTGAGGA-TTA----ATT--AGAA---AA---AATG-ATAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATG-TTTATT------CATGTGTTATATTGT-------ATG-T-TGTAA----GTATTACAAAA--GTCAA-----T--G--T-A----T--T----T--------T------
gi|61924 : TATGA--AAT-TCGGCAG-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTA-TT--TT-----CA-TG-----------------------------------TATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ACTTTACAAAA--GTTTA-----C--A--T-A----T--TA---T--------TTG----AATACACGTCGTA
gi|61925 : taccatTATCAATATGA--CATATTTTCAG-TTG----CAA--AGAGT--GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGTCA--A------TACA---AGT-TATATT------CATGGGCTATATAAA-------ATG-T-TAAGA----ATATTCTTAAA--TTCCG-----C--T--T-A------------T--------C------AGCACACTTCGTA
gi|61926 : TATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGCA---GT---AATA-CAACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TGTACT------TATATGCTta
gi|61927 : TATTAATAAGG--AAT-TTGACTA-TTG----CAT--AGAG---GG---AATA-TAACAA--TT-----AA-TGGCA--A------TTTA---AGT-TT-ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAACA----ATATTACAA
gi|61928 : TATAGATATGA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAA---AA---CACA-TTACTT--TA-----TA-TGACAATA------TATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTAAATTAATT-----ATG-T-
gi|61929 : TATCAATATGA--AAT-TTGGCAA-CTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAATGT--TT-----AA-TGGTC--A------TATA---GTT-TTTAaattttcgaacacatctcatata
gi|61930 : ATCAAAATGA--AAT-TAAGCAA-TTG----TAT--AGAG---GA---AATA-TAACTT--TT------A-TGGCA--A------TATA---CTT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTTA-----C--C--T-ATGT-T--T----T--------T------AACACACCTCATA
gi|61931 : ACGA--AATATTTACGA-CTG----CAT--TGAA---GA---ACTG-TTACTT--TG-----TC-AGGGA--A------TATAGTAATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-TGTAAAATTTTATATTATTAAT--ATTGA--------A--T-AT---T--T----T--------T------AACACACCTTGTAca
gi|61932 : tcaatataggaCAATGTCA--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AAAG---GC---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------GGTGTGCTTTATTAA-------ATG-T-TTAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--A--T-ATTT-T--T----T--------T------AACACca
gi|61933 : CAATATTG--AAT-TTGGCAA-T-----------------------AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTTTT------CATGTGTCACATTAAATCATTTATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTCA-----C--A--T-ATTT-T--T----T--------T------AACACATTTCG
gi|61934 : ATACGA--AAT-TTGGCAT-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ACT-TTTATT------CATTTGCTAT-TTTA-------ATG-T-CGAAT----TTATTCCAAAA---------------G--T-A----T--T----T--------TATG---AACACACCTCGTAaatat
gi|61935 : aATATGA--AAT-TTGGCAA-TCT----CAT--AGAG---AA---AATT-TTACTT--AC-----AAGTGG-A--A------TCTA---ATT-TCTATT------CATGTGCTATATTGA-------ATG-T-T-AAA----ATATTACAAAA--ATCGA-----T--G--T-GTT--T--T----T--------T------AACACACCTCGTAt
gi|61936 : ATACGA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---GACA-TTGCTT--TT-----TA-TGGGA--A------TATA---ATT-TTCATT------CATAGGCTTTACTAA-------ACA-T-TGAAA----ATATT---AAA--GT-CA-----C-----T-A----T--T----
gi|61937 : ATACGA--GGT----GCAA-TTG----CAA--AGAG---GA---AAAA-ATACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-GTAAAG------CATATGCTATATTAA-------ATC-T-CAAAA----ATATTACAGA------CACAACTC--G--T-AT---T--T----T--------T------AACTTACTTCAT
gi|61938 : ATACAA--CAT-TTGCCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTATAT--TT-----CA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTGTTAAAACACACCTTATACATT-G-------ATA-T-TGAAA----
gi|61939 : TATGA--AAT-ATGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AACG-TTACTT--TC-----TA-TAGTG--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------CTG-C-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--T--T-T----T--T----T--------T------
gi|61940 : A--AAC-TTGGCAA-ATG----CAT--TGAA---GA---CATA-TTTCTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATACTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACACAA--GTCCA-----C--A--T-A----T--T----T--------TTTA---AAAATACCTCATAttttaacaatct
gi|61941 : T-TTGGCAA-TTA----CAT--AAAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--T------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-A-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--A--T-ATTT-T--T----T--------T------TACACACCTCATA
gi|61942 : AA-TTG----TAT--AAGG---GA---AATA-CTACTT--TT-----TA-AGGCA--A------T-TAC--ATT-TTGATT------CATGTGCTA-----------------T-TGAAA----ATATTACTAAA--GTCCA-----CAAA--T-AT---T--T----T--------T------AACACACca
gi|61943 : TA----CAT--AGAG---GA---AATA-TTGAGA--TT-----AA-TGGCA--A------AATA---ATA-TTTATT------CTTGTGTTATATTAAATT----ATA-T-TAAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T--G--T-ATT--T--T----T--------T------AACACACTTCGTAacata
gi|61944 : ----CAG--AGAG---TA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAG-------ATG-T-GGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T--G--T-G----T--T----T--------TTTG---AACACATCTCGTAta
gi|61945 : AG---GT---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---AAT-TTTATT------CATGTGCTATATTAG-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAT--CTCCA-----C--A--T-CTTT-T--T----T--------T------AACACACCTCGTAta
gi|61946 : AG---GA---AATA-TTACAG--TT-----AA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------ATTGTGCTATATCAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--CTCCA-----T--G--T-ATTT-T--T----T--------T------AACA
gi|61947 : A-TTCCTTGCTT-----AA-TGGCA--AAATGAATATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATATCACAAAA--G-------------------------T----T--------T------AACACACCTCATA
gi|61948 : TT-GTTATT------CTTGTATTGTAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C--T--TAA----T--T----T--------TCG----AACACACCTca
gi|61949 : TT-GTTATT------GATGTGATATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTAAGAAA--GCCCT-----C--GTAT-A----T--T----T--------T------AACACACCTCGTAgatgta
gi|61950 : ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTGTAAAA--GTCCA-----C--A--T-ATTT-T--T----T--------T------AATACACCTCATAta
Alignments
lowQualScore : 11 11111
lowQualScore : 222222 11 1 0 1111 11 222 111 0 11 222222 0 11 222222 222 0 222222 1 5555555 0 0 1111 11 22222 99999 1 77 1 2 111 44444444 00000
lowQualScore : ...... .. . . .... .. ... ... . .. ...... . .. ...... ... . ...... . ....... . . .... .. ..... ..... . .. . . ... ........ .....
lowQualScore : 666666 22 7 9 7777 11 222 444 8 11 222222 8 11 333333 222 8 222222 2 0000000 8 8 7777 11 11111 88888 7 11 7 6 555 00000000 11111
consensus : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
Reference ( family-435 ) : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61896 : TATCAATAT------GA--AAT-TTAGTAA-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTATTT--TT-----T--TGGCA--A------TATA---ATT-TTTGTT------CATGTGCTGTATTAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACGAAA--GTCCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAGCTCGTA
gi|61897 : TATAGACAT------GA--AAT-TTGGCCA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A-------------------T-----AACACACCTCATAta
gi|61898 : TATCAATAT------GG--AGT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTTATT------TATGAGCTTTATCAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CATAA-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61899 : TATCAATAA------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-T-AATT--TT-----TA-TGGCA--A------TACA---ATT-TT-ATT------CATGTGCTAAATAAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTGA-----C---A-T-A--T-T-TTTCT--------T-----AATACACCTCATA
gi|61900 : TATCAATAC------AG--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGTG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTAATT------AATGGACAATATGAA-------ATG-T-TAAAC----A-AATACAAAA--ATTCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAt
gi|61901 : TATAATTAC------GA--AAC-TTGGCAA-TCG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAACTG--TT-----AA-TGGCA--A------TATG---ATA-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--ATCCA-----C---C-T-AT-T-T-T---T--------T-----AATACATCTCATAt
gi|61902 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---TATT-TTAATA--TT-----AA-TGGCA--A------TACA---ATT-TTTAAT------TTTGTGCTATGTTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AATACATCTCGTA
gi|61903 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGAAA-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTACAA--TT-----GA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-C-TGAAA----ATGTTAC-AAA--GTACA-----C---A-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61904 : TATGGATAT------GA--AAT-TTTGCAT-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TGTC---ATT-TTTGTC------Cta
gi|61905 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAG---GA---ACTA-TTACTT--TT-----GA-TGGCA--A------TTTA---A-T-ACTATT------CATGTACTATTTTAA-------AAG-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCAA-----A---G-T-A--T-T-T---T--------G-----AACACACCTAGTA
gi|61906 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGC----TG----CA----GAG---GT---AATA-TTACAT--TT-----CA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTAAT------CTCGTGTTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--GTCCA-----T---A-T-AGTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTt
gi|61907 : TGTCAATAT------GA--GAT-TTGGCAA-TCG----CAT--GTAG---GA---AATA-GTACAA--CT-----AA-TGGCT--A------TGTA---AGT-ATTATT------CTTGCGCAATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATAACAAAA--GTCCA-----C---A-C-A--T-T-T---T--------TATG--AACACAGTTCATA
gi|61908 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61909 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61910 : TATCAATAT------AA--AAT-TTAGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---GATA-TTACGA--TT-----AT-TGGCA--T------TATA---ATT-T--ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGACA----ATATTACAAAA--TTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----t
gi|61911 : TATAGATAC------AA--AAT-TGGGCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--GT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------C---------------------ATG-T-TGAAA----ATATTAC--AA--GTCCA-----C---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATAt
gi|61912 : TATCAACAT------GC--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---ATTA-TT
gi|61913 : TATCGATAT------GA--AAT-TTGATAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TTATTTTTA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTATT------------------TAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--ATCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACATACCTCGTA
gi|61914 : TATAATTAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAA---TA---TATA-TAACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTCATT------CTAGTACTATATTTA-------ATG-T-TGAAA----CTATTGCAAAA--GTCCA-----T---G-TAA--T-T-T---T--------TG----AAAACACCTCATAca
gi|61915 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-------------AGAG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATG---TTTGTTTATT------CATGTAT--TATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTAACAAAA--AT
gi|61916 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CAG----CAT--AGA----GA---AACATTTACTA--TT-----AA-TGACG--A------TATA---ATT-TTGATT------CTTGTGCTATATATA-------ATA-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--CGT-T---T--------T-----AACCCACCT
gi|61917 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTA----CAT--ATAATTTAATTTAATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---CTT-CTTATT------TTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAAAA----ATATTGCAAAA--CTCCA-----T---G-T-A--A-T-T---TGTTACATGT-----AACACACCTCGTA
gi|61918 : TATCAACTT------GA--AAT-GAGGCAAACTG----CAT--AGGG---GA---AATA-TTACGA--TA-----AC-TGGTC--A------TATA---CTT-TTTATT------CTTGTGCTGTAATAA-------TTGTT-TGAAT----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-TAA--C-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAca
gi|61919 : TACCAATTT------GA--ACT-TTGGCAT-TTG----CAA--AGAG---GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTATT------CATATGTTGTAATAA-------ATG-A-TGAAA----CTTTTACGAAA--GTCCA-----C---A-T-A--C-T-T---T--------T-----ta
gi|61920 : TAGCAATAC------GA--AAA-TTGGAAA-TTT----CTT--AGAG---GA---AATA-TTAGTT--TT-----TA-TGGCA--A------T-------TC-TTT-TT------CATGT--CATATTAT-------ATG-T-TAAAA----ATATTACAAAA---TTCA-----C---C-T-ATCT-T-T---T--------T-----TACATACCTCGTAtt
gi|61921 : TATCAATAT------GATGAAA-TTGTCAA-TTGTCATCATGTAGAA---AA---AATA-GTA-TT--TT-----CA-TGACA--C------TATA---TTT-TTTATT------CAAGTACTATATGAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTTACAAAAGTGTCCA-----T---G-C-A--T-T-T---T--------TTTAAAAACACACCTCca
gi|61922 : TATCTGTAT------AA--AAT-TTGGCAT-ATG----CAT--AGAG---GA---AGTA-ATACTT--TT-----TA-TTGCA--T------TATG---AAT-ATTATT------CATGTTC-A---TAA-------ATC-C-TGAAA----ACATTACAAAA--GTAGG-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACACCT
gi|61923 : TATCAATAC------GA--AAA-TTGAGGA-TTA----ATT--AGAA---AA---AATG-ATAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATG-TTTATT------CATGTGTTATATTGT-------ATG-T-TGTAA----GTATTACAAAA--GTCAA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------
gi|61924 : TACCATTAT------GA--AAT-TCGGCAG-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTA-TT--TT-----CA-TG-----------------------------------TATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ACTTTACAAAA--GTTTA-----C---A-T-A--T-TAT---T--------TG----AATACACGTCGTA
gi|61925 : TATCAATAT------GA--CATATTTTCAG-TTG----CAA--AGAGT--GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGTCA--A------TACA---AGT-TATATT------CATGGGCTATATAAA-------ATG-T-TAAGA----ATATTCTTAAA--TTCCG-----C---T-T-A----------T--------C-----AGCACACTTCGTA
gi|61926 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGCA---GT---AATA-CAACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TGTACT------TATATGCTta
gi|61927 : TATTAATAA------GG--AAT-TTGACTA-TTG----CAT--AGAG---GG---AATA-TAACAA--TT-----AA-TGGCA--A------TTTA---A-G-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAACA----ATATTACAA
gi|61928 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAA---AA---CACA-TTACTT--TA-----TA-TGACAATA------TATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTAAATTAATT-----ATG-T-
gi|61929 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAATGT--TT-----AA-TGGTC--A------TATA---GTT-TTTAaattttcgaacacatctcatata
gi|61930 : ATCAAAAT------GA--AAT-TAAGCAA-TTG----TAT--AGAG---GA---AATA-TAACTT--TT------A-TGGCA--A------TATA---CTT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTTA-----C---C-T-ATGT-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61931 : TCAATATAGGAACGA--AATATTTACGA-CTG----CAT--TGAA---GA---ACTG-TTACTT--TG-----TC-AGGGA--A------TATAGTAATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-TGTAAAATTTTATATTATTAAT--ATTGA---------A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTTGTAca
gi|61932 : CAATGT------CA--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AAAG---GC---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------GGTGTGCTTTATTAA-------ATG-T-TTAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACca
gi|61933 : CAATAT------TG--AAT-TTGGCAA-T-----------------------AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTTTT------CATGTGTCACATTAAATCATTTATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACATTTCG
gi|61934 : AATAC------GA--AAT-TTGGCAT-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ACT-TTTATT------CATTTGCTAT-TTTA-------ATG-T-CGAAT----TTATTCCAAAA----------------G-T-A--T-T-T---TA-------TG----AACACACCTCGTAaatat
gi|61935 : ATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TCT----CAT--AGAG---AA---AATT-TTACTT--AC-----AAGTGG-A--A------TCTA---ATT-TCTATT------CATGTGCTATATTGA-------ATG-T-T-AAA----ATATTACAAAA--ATCGA-----T---G-T-GT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAt
gi|61936 : ATAC------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---GACA-TTGCTT--TT-----TA-TGGGA--A------TATA---ATT-TTCATT------CATAGGCTTTACTAA-------ACA-T-TGAAA----ATATT---AAA--GT-CA-----C-----T-A--T-T-
gi|61937 : ATAC------GA--GGT----GCAA-TTG----CAA--AGAG---GA---AAAA-ATACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-GTAAAG------CATATGCTATATTAA-------ATC-T-CAAAA----ATATTACAGA------CACAACTC---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACTTACTTCAT
gi|61938 : ATAC------AA--CAT-TTGCCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTATAT--TT-----CA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTGTTAAAACACACCTTATACATT-G-------ATA-T-TGAAA----
gi|61939 : TAT------GA--AAT-ATGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AACG-TTACTT--TC-----TA-TAGTG--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------CTG-C-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CTTTT-T-T--T-T-T---T--------T-----AACA
gi|61940 : A--AAC-TTGGCAA-ATG----CAT--TGAA---GA---CATA-TTTCTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATACTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACACAA--GTCCA-----C---A-T-A--T-T-T---T--------TTA---AAAATACCTCATAatct
gi|61941 : T-TTGGCAA-TTA----CAT--AAAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--T------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-A-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATA
gi|61942 : AA-TTG----TAT--AAGG---GA---AATA-CTACTT--TT-----TA-AGGCA--A------T-TAC--ATT-TTGATT------CATGTGCTA-----------------T-TGAAA----ATATTACTAAA--GTCCA-----CAA-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACca
gi|61943 : TA----CAT--AGAG---GA---AATA-TTGAGA--TT-----AA-TGGCA--A------AATA---ATA-TTTATT------CTTGTGTTATATTAAATT----ATA-T-TAAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACTTCGTAacata
gi|61944 : ----CAG--AGAG---TA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAG-------ATG-T-GGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-G--T-T-T---T--------TTG---AACACATCTCGTAta
gi|61945 : AG---GT---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---AAT-TTTATT------CATGTGCTATATTAG-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAT--CTCCA-----C---A-T-CTTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAta
gi|61946 : AG---GA---AATA-TTACAG--TT-----AA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------ATTGTGCTATATCAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--CTCCA-----T---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACA
gi|61947 : A-TTCCTTGCTT-----AA-TGGCA--AAATGAATATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATATCACAAAA--G------------------------T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61948 : TT-GTTATT------CTTGTATTGTAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---T-T-A--A-T-T---T--------TCG---AACACACCTca
gi|61949 : TT-GTTATT------GATGTGATATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTAAGAAA--GCCCT-----C---G-T-A--TAT-T---T--------T-----AACACACCTCGTAgatgta
gi|61950 : ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTGTAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AATACACCTCATAta
Alignments
lowQualScore : 11 11111
lowQualScore : 222222 11 1 0 1111 11 222 111 0 11 222222 0 11 222222 222 0 222222 1 5555555 0 0 1111 11 22222 99999 1 77 1 2 111 44444444 00000
lowQualScore : ...... .. . . .... .. ... ... . .. ...... . .. ...... ... . ...... . ....... . . .... .. ..... ..... . .. . . ... ........ .....
lowQualScore : 666666 22 7 9 7777 11 222 444 8 11 222222 8 11 333333 222 8 222222 2 0000000 8 8 7777 11 11111 88888 7 11 7 6 555 00000000 11111
consensus : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
Reference ( family-435 ) : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61896 : TATCAATAT------GA--AAT-TTAGTAA-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTATTT--TT-----T--TGGCA--A------TATA---ATT-TTTGTT------CATGTGCTGTATTAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACGAAA--GTCCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAGCTCGTA
gi|61897 : TATAGACAT------GA--AAT-TTGGCCA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A-------------------T-----AACACACCTCATAta
gi|61898 : TATCAATAT------GG--AGT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTTATT------TATGAGCTTTATCAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CATAA-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61899 : TATCAATAA------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-T-AATT--TT-----TA-TGGCA--A------TACA---ATT-TT-ATT------CATGTGCTAAATAAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTGA-----C---A-T-A--T-T-TTTCT--------T-----AATACACCTCATA
gi|61900 : TATCAATAC------AG--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGTG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTAATT------AATGGACAATATGAA-------ATG-T-TAAAC----A-AATACAAAA--ATTCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAt
gi|61901 : TATAATTAC------GA--AAC-TTGGCAA-TCG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAACTG--TT-----AA-TGGCA--A------TATG---ATA-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--ATCCA-----C---C-T-AT-T-T-T---T--------T-----AATACATCTCATAt
gi|61902 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---TATT-TTAATA--TT-----AA-TGGCA--A------TACA---ATT-TTTAAT------TTTGTGCTATGTTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AATACATCTCGTA
gi|61903 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGAAA-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTACAA--TT-----GA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-C-TGAAA----ATGTTAC-AAA--GTACA-----C---A-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61904 : TATGGATAT------GA--AAT-TTTGCAT-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TGTC---ATT-TTTGTC------Cta
gi|61905 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAG---GA---ACTA-TTACTT--TT-----GA-TGGCA--A------TTTA---A-T-ACTATT------CATGTACTATTTTAA-------AAG-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCAA-----A---G-T-A--T-T-T---T--------G-----AACACACCTAGTA
gi|61906 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGC----TG----CA----GAG---GT---AATA-TTACAT--TT-----CA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTAAT------CTCGTGTTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--GTCCA-----T---A-T-AGTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTt
gi|61907 : TGTCAATAT------GA--GAT-TTGGCAA-TCG----CAT--GTAG---GA---AATA-GTACAA--CT-----AA-TGGCT--A------TGTA---AGT-ATTATT------CTTGCGCAATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATAACAAAA--GTCCA-----C---A-C-A--T-T-T---T--------TATG--AACACAGTTCATA
gi|61908 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61909 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61910 : TATCAATAT------AA--AAT-TTAGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---GATA-TTACGA--TT-----AT-TGGCA--T------TATA---ATT-T--ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGACA----ATATTACAAAA--TTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----t
gi|61911 : TATAGATAC------AA--AAT-TGGGCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--GT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------C---------------------ATG-T-TGAAA----ATATTAC--AA--GTCCA-----C---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATAt
gi|61912 : TATCAACAT------GC--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---ATTA-TT
gi|61913 : TATCGATAT------GA--AAT-TTGATAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TTATTTTTA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTATT------------------TAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--ATCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACATACCTCGTA
gi|61914 : TATAATTAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAA---TA---TATA-TAACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTCATT------CTAGTACTATATTTA-------ATG-T-TGAAA----CTATTGCAAAA--GTCCA-----T---G-TAA--T-T-T---T--------TG----AAAACACCTCATAca
gi|61915 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-------------AGAG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATG---TTTGTTTATT------CATGTAT--TATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTAACAAAA--AT
gi|61916 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CAG----CAT--AGA----GA---AACATTTACTA--TT-----AA-TGACG--A------TATA---ATT-TTGATT------CTTGTGCTATATATA-------ATA-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--CGT-T---T--------T-----AACCCACCT
gi|61917 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTA----CAT--ATAATTTAATTTAATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---CTT-CTTATT------TTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAAAA----ATATTGCAAAA--CTCCA-----T---G-T-A--A-T-T---TGTTACATGT-----AACACACCTCGTA
gi|61918 : TATCAACTT------GA--AAT-GAGGCAAACTG----CAT--AGGG---GA---AATA-TTACGA--TA-----AC-TGGTC--A------TATA---CTT-TTTATT------CTTGTGCTGTAATAA-------TTGTT-TGAAT----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-TAA--C-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAca
gi|61919 : TACCAATTT------GA--ACT-TTGGCAT-TTG----CAA--AGAG---GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTATT------CATATGTTGTAATAA-------ATG-A-TGAAA----CTTTTACGAAA--GTCCA-----C---A-T-A--C-T-T---T--------T-----ta
gi|61920 : TAGCAATAC------GA--AAA-TTGGAAA-TTT----CTT--AGAG---GA---AATA-TTAGTT--TT-----TA-TGGCA--A------T-------TC-TTT-TT------CATGT--CATATTAT-------ATG-T-TAAAA----ATATTACAAAA---TTCA-----C---C-T-ATCT-T-T---T--------T-----TACATACCTCGTAtt
gi|61921 : TATCAATAT------GATGAAA-TTGTCAA-TTGTCATCATGTAGAA---AA---AATA-GTA-TT--TT-----CA-TGACA--C------TATA---TTT-TTTATT------CAAGTACTATATGAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTTACAAAAGTGTCCA-----T---G-C-A--T-T-T---T--------TTTAAAAACACACCTCca
gi|61922 : TATCTGTAT------AA--AAT-TTGGCAT-ATG----CAT--AGAG---GA---AGTA-ATACTT--TT-----TA-TTGCA--T------TATG---AAT-ATTATT------CATGTTC-A---TAA-------ATC-C-TGAAA----ACATTACAAAA--GTAGG-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACACCT
gi|61923 : TATCAATAC------GA--AAA-TTGAGGA-TTA----ATT--AGAA---AA---AATG-ATAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATG-TTTATT------CATGTGTTATATTGT-------ATG-T-TGTAA----GTATTACAAAA--GTCAA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------
gi|61924 : TACCATTAT------GA--AAT-TCGGCAG-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTA-TT--TT-----CA-TG-----------------------------------TATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ACTTTACAAAA--GTTTA-----C---A-T-A--T-TAT---T--------TG----AATACACGTCGTA
gi|61925 : TATCAATAT------GA--CATATTTTCAG-TTG----CAA--AGAGT--GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGTCA--A------TACA---AGT-TATATT------CATGGGCTATATAAA-------ATG-T-TAAGA----ATATTCTTAAA--TTCCG-----C---T-T-A----------T--------C-----AGCACACTTCGTA
gi|61926 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGCA---GT---AATA-CAACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TGTACT------TATATGCTta
gi|61927 : TATTAATAA------GG--AAT-TTGACTA-TTG----CAT--AGAG---GG---AATA-TAACAA--TT-----AA-TGGCA--A------TTTA---A-G-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAACA----ATATTACAA
gi|61928 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAA---AA---CACA-TTACTT--TA-----TA-TGACAATA------TATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTAAATTAATT-----ATG-T-
gi|61929 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAATGT--TT-----AA-TGGTC--A------TATA---GTT-TTTAaattttcgaacacatctcatata
gi|61930 : ATCAAAAT------GA--AAT-TAAGCAA-TTG----TAT--AGAG---GA---AATA-TAACTT--TT------A-TGGCA--A------TATA---CTT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTTA-----C---C-T-ATGT-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61931 : TCAATATAGGAACGA--AATATTTACGA-CTG----CAT--TGAA---GA---ACTG-TTACTT--TG-----TC-AGGGA--A------TATAGTAATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-TGTAAAATTTTATATTATTAAT--ATTGA---------A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTTGTAca
gi|61932 : CAATGT------CA--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AAAG---GC---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------GGTGTGCTTTATTAA-------ATG-T-TTAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACca
gi|61933 : CAATAT------TG--AAT-TTGGCAA-T-----------------------AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTTTT------CATGTGTCACATTAAATCATTTATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACATTTCG
gi|61934 : AATAC------GA--AAT-TTGGCAT-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ACT-TTTATT------CATTTGCTAT-TTTA-------ATG-T-CGAAT----TTATTCCAAAA----------------G-T-A--T-T-T---TA-------TG----AACACACCTCGTAaatat
gi|61935 : ATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TCT----CAT--AGAG---AA---AATT-TTACTT--AC-----AAGTGG-A--A------TCTA---ATT-TCTATT------CATGTGCTATATTGA-------ATG-T-T-AAA----ATATTACAAAA--ATCGA-----T---G-T-GT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAt
gi|61936 : ATAC------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---GACA-TTGCTT--TT-----TA-TGGGA--A------TATA---ATT-TTCATT------CATAGGCTTTACTAA-------ACA-T-TGAAA----ATATT---AAA--GT-CA-----C-----T-A--T-T-
gi|61937 : ATAC------GA--GGT----GCAA-TTG----CAA--AGAG---GA---AAAA-ATACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-GTAAAG------CATATGCTATATTAA-------ATC-T-CAAAA----ATATTACAGA------CACAACTC---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACTTACTTCAT
gi|61938 : ATAC------AA--CAT-TTGCCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTATAT--TT-----CA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTGTTAAAACACACCTTATACATT-G-------ATA-T-TGAAA----
gi|61939 : TAT------GA--AAT-ATGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AACG-TTACTT--TC-----TA-TAGTG--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------CTG-C-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CTTTT-T-T--T-T-T---T--------T-----AACA
gi|61940 : A--AAC-TTGGCAA-ATG----CAT--TGAA---GA---CATA-TTTCTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATACTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACACAA--GTCCA-----C---A-T-A--T-T-T---T--------TTA---AAAATACCTCATAatct
gi|61941 : T-TTGGCAA-TTA----CAT--AAAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--T------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-A-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATA
gi|61942 : AA-TTG----TAT--AAGG---GA---AATA-CTACTT--TT-----TA-AGGCA--A------T-TAC--ATT-TTGATT------CATGTGCTA-----------------T-TGAAA----ATATTACTAAA--GTCCA-----CAA-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACca
gi|61943 : TA----CAT--AGAG---GA---AATA-TTGAGA--TT-----AA-TGGCA--A------AATA---ATA-TTTATT------CTTGTGTTATATTAAATT----ATA-T-TAAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACTTCGTAacata
gi|61944 : ----CAG--AGAG---TA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAG-------ATG-T-GGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-G--T-T-T---T--------TTG---AACACATCTCGTAta
gi|61945 : AG---GT---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---AAT-TTTATT------CATGTGCTATATTAG-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAT--CTCCA-----C---A-T-CTTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAta
gi|61946 : AG---GA---AATA-TTACAG--TT-----AA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------ATTGTGCTATATCAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--CTCCA-----T---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACA
gi|61947 : A-TTCCTTGCTT-----AA-TGGCA--AAATGAATATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATATCACAAAA--G------------------------T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61948 : TT-GTTATT------CTTGTATTGTAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---T-T-A--A-T-T---T--------TCG---AACACACCTca
gi|61949 : TT-GTTATT------GATGTGATATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTAAGAAA--GCCCT-----C---G-T-A--TAT-T---T--------T-----AACACACCTCGTAgatgta
gi|61950 : ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTGTAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AATACACCTCATAta
blockSeqs : AGGAAC TG A TCAT GT TTT TTT GC ATTTTT AT AATGAA GTA AAAACA A ATCATTT TTTT GT CAACT ATAA A GT G A TTC GTTACATG TTAAA
blockSeqs : . . A . . T . . T . . C . A ATT . . . TTTT A TT A A . A ATG
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A TT . . . ATA . TC . A . . TA
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . AAA . TT . . . . TG
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . AT . TG . . . . CG
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . T . . . . AT . TT . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . T . . . . G . TT . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . A . . . . A . TT . . . . G
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . C . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . G . . . . T . . . . G . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . A . . . . A . TT . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . G . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . A . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . A . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . G . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . G . T . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . T . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . C . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . G . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . T . . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . A . . . . G . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . A . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . A . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T . . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . A . .
blockSeqs : . . . A . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : .
blockSeqCons : G****
originalCons : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
finalCons : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CG----T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
Alignments
lowQualScore : 11 11111
lowQualScore : 222222 11 1 0 1111 11 222 111 0 11 222222 0 11 222222 222 0 222222 1 5555555 0 0 1111 11 22222 99999 1 77 1 2 111 44444444 00000
lowQualScore : ...... .. . . .... .. ... ... . .. ...... . .. ...... ... . ...... . ....... . . .... .. ..... ..... . .. . . ... ........ .....
lowQualScore : 666666 22 7 9 7777 11 222 444 8 11 222222 8 11 333333 222 8 222222 2 0000000 8 8 7777 11 11111 88888 7 11 7 6 555 00000000 11111
consensus : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
Reference ( family-435 ) : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61896 : TATCAATAT------GA--AAT-TTAGTAA-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTATTT--TT-----T--TGGCA--A------TATA---ATT-TTTGTT------CATGTGCTGTATTAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACGAAA--GTCCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAGCTCGTA
gi|61897 : TATAGACAT------GA--AAT-TTGGCCA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A-------------------T-----AACACACCTCATAta
gi|61898 : TATCAATAT------GG--AGT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGAG---AA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTTATT------TATGAGCTTTATCAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CATAA-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61899 : TATCAATAA------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-T-AATT--TT-----TA-TGGCA--A------TACA---ATT-TT-ATT------CATGTGCTAAATAAA-------ATA-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTGA-----C---A-T-A--T-T-TTTCT--------T-----AATACACCTCATA
gi|61900 : TATCAATAC------AG--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AGTG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---GTT-TTAATT------AATGGACAATATGAA-------ATG-T-TAAAC----A-AATACAAAA--ATTCA-----CAT-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACAt
gi|61901 : TATAATTAC------GA--AAC-TTGGCAA-TCG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAACTG--TT-----AA-TGGCA--A------TATG---ATA-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--ATCCA-----C---C-T-AT-T-T-T---T--------T-----AATACATCTCATAt
gi|61902 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---TATT-TTAATA--TT-----AA-TGGCA--A------TACA---ATT-TTTAAT------TTTGTGCTATGTTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AATACATCTCGTA
gi|61903 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGAAA-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTACAA--TT-----GA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-C-TGAAA----ATGTTAC-AAA--GTACA-----C---A-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTA
gi|61904 : TATGGATAT------GA--AAT-TTTGCAT-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TGTC---ATT-TTTGTC------Cta
gi|61905 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAG---GA---ACTA-TTACTT--TT-----GA-TGGCA--A------TTTA---A-T-ACTATT------CATGTACTATTTTAA-------AAG-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCAA-----A---G-T-A--T-T-T---T--------G-----AACACACCTAGTA
gi|61906 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGC----TG----CA----GAG---GT---AATA-TTACAT--TT-----CA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTAAT------CTCGTGTTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--GTCCA-----T---A-T-AGTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTt
gi|61907 : TGTCAATAT------GA--GAT-TTGGCAA-TCG----CAT--GTAG---GA---AATA-GTACAA--CT-----AA-TGGCT--A------TGTA---AGT-ATTATT------CTTGCGCAATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATAACAAAA--GTCCA-----C---A-C-A--T-T-T---T--------TATG--AACACAGTTCATA
gi|61908 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61909 : TATCAGTAT------GA--AAT-TCATCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGAA--A------T-------TT-TTTATT------TAAGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----CTATTACAAAA--GTCCT-----C---ATT-A--T-TAT---T--------T-----AAGACACCTTGTAt
gi|61910 : TATCAATAT------AA--AAT-TTAGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---GATA-TTACGA--TT-----AT-TGGCA--T------TATA---ATT-T--ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGACA----ATATTACAAAA--TTCCA-----C---G-T-A--T-T-T---T--------T-----t
gi|61911 : TATAGATAC------AA--AAT-TGGGCAA-TTG----CGT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--GT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------C---------------------ATG-T-TGAAA----ATATTAC--AA--GTCCA-----C---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATAt
gi|61912 : TATCAACAT------GC--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---ATTA-TT
gi|61913 : TATCGATAT------GA--AAT-TTGATAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TTATTTTTA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTATT------------------TAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAGAA--ATCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACATACCTCGTA
gi|61914 : TATAATTAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--ACAA---TA---TATA-TAACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---ATT-TTCATT------CTAGTACTATATTTA-------ATG-T-TGAAA----CTATTGCAAAA--GTCCA-----T---G-TAA--T-T-T---T--------TG----AAAACACCTCATAca
gi|61915 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-------------AGAG---GA---AATA-TCACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATG---TTTGTTTATT------CATGTAT--TATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTAACAAAA--AT
gi|61916 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CAG----CAT--AGA----GA---AACATTTACTA--TT-----AA-TGACG--A------TATA---ATT-TTGATT------CTTGTGCTATATATA-------ATA-T-TGAAA----ATACTACAAAA--GTCCA-----C---G-T-A--CGT-T---T--------T-----AACCCACCT
gi|61917 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTA----CAT--ATAATTTAATTTAATA-TTACTT--TT-----TA-TGACA--A------TATA---CTT-CTTATT------TTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAAAA----ATATTGCAAAA--CTCCA-----T---G-T-A--A-T-T---TGTTACATGT-----AACACACCTCGTA
gi|61918 : TATCAACTT------GA--AAT-GAGGCAAACTG----CAT--AGGG---GA---AATA-TTACGA--TA-----AC-TGGTC--A------TATA---CTT-TTTATT------CTTGTGCTGTAATAA-------TTGTT-TGAAT----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---G-TAA--C-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAca
gi|61919 : TACCAATTT------GA--ACT-TTGGCAT-TTG----CAA--AGAG---GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTATT------CATATGTTGTAATAA-------ATG-A-TGAAA----CTTTTACGAAA--GTCCA-----C---A-T-A--C-T-T---T--------T-----ta
gi|61920 : TAGCAATAC------GA--AAA-TTGGAAA-TTT----CTT--AGAG---GA---AATA-TTAGTT--TT-----TA-TGGCA--A------T-------TC-TTT-TT------CATGT--CATATTAT-------ATG-T-TAAAA----ATATTACAAAA---TTCA-----C---C-T-ATCT-T-T---T--------T-----TACATACCTCGTAtt
gi|61921 : TATCAATAT------GATGAAA-TTGTCAA-TTGTCATCATGTAGAA---AA---AATA-GTA-TT--TT-----CA-TGACA--C------TATA---TTT-TTTATT------CAAGTACTATATGAA-------ATG-T-TGAAA----ATGTTACAAAAGTGTCCA-----T---G-C-A--T-T-T---T--------TTTAAAAACACACCTCca
gi|61922 : TATCTGTAT------AA--AAT-TTGGCAT-ATG----CAT--AGAG---GA---AGTA-ATACTT--TT-----TA-TTGCA--T------TATG---AAT-ATTATT------CATGTTC-A---TAA-------ATC-C-TGAAA----ACATTACAAAA--GTAGG-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACACCT
gi|61923 : TATCAATAC------GA--AAA-TTGAGGA-TTA----ATT--AGAA---AA---AATG-ATAATT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATG-TTTATT------CATGTGTTATATTGT-------ATG-T-TGTAA----GTATTACAAAA--GTCAA-----T---G-T-A--T-T-T---T--------
gi|61924 : TACCATTAT------GA--AAT-TCGGCAG-TTG----CAT--AGAA---GA---AATA-TTA-TT--TT-----CA-TG-----------------------------------TATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ACTTTACAAAA--GTTTA-----C---A-T-A--T-TAT---T--------TG----AATACACGTCGTA
gi|61925 : TATCAATAT------GA--CATATTTTCAG-TTG----CAA--AGAGT--GA---TATA-TTACTT--TT-----TA-TGTCA--A------TACA---AGT-TATATT------CATGGGCTATATAAA-------ATG-T-TAAGA----ATATTCTTAAA--TTCCG-----C---T-T-A----------T--------C-----AGCACACTTCGTA
gi|61926 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGCA---GT---AATA-CAACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TGTACT------TATATGCTta
gi|61927 : TATTAATAA------GG--AAT-TTGACTA-TTG----CAT--AGAG---GG---AATA-TAACAA--TT-----AA-TGGCA--A------TTTA---A-G-TTTATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TAACA----ATATTACAA
gi|61928 : TATAGATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TTG----CAT--AGAA---AA---CACA-TTACTT--TA-----TA-TGACAATA------TATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTAAATTAATT-----ATG-T-
gi|61929 : TATCAATAT------GA--AAT-TTGGCAA-CTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TAATGT--TT-----AA-TGGTC--A------TATA---GTT-TTTAaattttcgaacacatctcatata
gi|61930 : ATCAAAAT------GA--AAT-TAAGCAA-TTG----TAT--AGAG---GA---AATA-TAACTT--TT------A-TGGCA--A------TATA---CTT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTTA-----C---C-T-ATGT-T-T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61931 : TCAATATAGGAACGA--AATATTTACGA-CTG----CAT--TGAA---GA---ACTG-TTACTT--TG-----TC-AGGGA--A------TATAGTAATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-TGTAAAATTTTATATTATTAAT--ATTGA---------A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACCTTGTAca
gi|61932 : CAATGT------CA--AAT-TTGGCAG-TTG----CAT--AAAG---GC---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATC---ATT-TTTATT------GGTGTGCTTTATTAA-------ATG-T-TTAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACca
gi|61933 : CAATAT------TG--AAT-TTGGCAA-T-----------------------AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATT---ATT-GTTTTT------CATGTGTCACATTAAATCATTTATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTTCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACACATTTCG
gi|61934 : AATAC------GA--AAT-TTGGCAT-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ACT-TTTATT------CATTTGCTAT-TTTA-------ATG-T-CGAAT----TTATTCCAAAA----------------G-T-A--T-T-T---TA-------TG----AACACACCTCGTAaatat
gi|61935 : ATAT------GA--AAT-TTGGCAA-TCT----CAT--AGAG---AA---AATT-TTACTT--AC-----AAGTGG-A--A------TCTA---ATT-TCTATT------CATGTGCTATATTGA-------ATG-T-T-AAA----ATATTACAAAA--ATCGA-----T---G-T-GT-T-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAt
gi|61936 : ATAC------GA--AAT-TTGGCA--TTG----CAT--AGAG---GA---GACA-TTGCTT--TT-----TA-TGGGA--A------TATA---ATT-TTCATT------CATAGGCTTTACTAA-------ACA-T-TGAAA----ATATT---AAA--GT-CA-----C-----T-A--T-T-
gi|61937 : ATAC------GA--GGT----GCAA-TTG----CAA--AGAG---GA---AAAA-ATACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-GTAAAG------CATATGCTATATTAA-------ATC-T-CAAAA----ATATTACAGA------CACAACTC---G-T-A--T-T-T---T--------T-----AACTTACTTCAT
gi|61938 : ATAC------AA--CAT-TTGCCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AATA-TTATAT--TT-----CA-TGTCA--A------TATA---ATT-TTTGTTAAAACACACCTTATACATT-G-------ATA-T-TGAAA----
gi|61939 : TAT------GA--AAT-ATGGCAA-TTG----CAT--AGAG---GA---AACG-TTACTT--TC-----TA-TAGTG--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAA-------CTG-C-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----CTTTT-T-T--T-T-T---T--------T-----AACA
gi|61940 : A--AAC-TTGGCAA-ATG----CAT--TGAA---GA---CATA-TTTCTT--TT-----TA-TGGCA--A------TAAA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATACTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACACAA--GTCCA-----C---A-T-A--T-T-T---T--------TTA---AAAATACCTCATAatct
gi|61941 : T-TTGGCAA-TTA----CAT--AAAG---GA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--T------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATATTAA-------ATG-A-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----TACACACCTCATA
gi|61942 : AA-TTG----TAT--AAGG---GA---AATA-CTACTT--TT-----TA-AGGCA--A------T-TAC--ATT-TTGATT------CATGTGCTA-----------------T-TGAAA----ATATTACTAAA--GTCCA-----CAA-A-T-A--T-T-T---T--------T-----AACACACca
gi|61943 : TA----CAT--AGAG---GA---AATA-TTGAGA--TT-----AA-TGGCA--A------AATA---ATA-TTTATT------CTTGTGTTATATTAAATT----ATA-T-TAAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-AT-T-T-T---T--------T-----AACACACTTCGTAacata
gi|61944 : ----CAG--AGAG---TA---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------CATGTGCTATAATAG-------ATG-T-GGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----T---G-T-G--T-T-T---T--------TTG---AACACATCTCGTAta
gi|61945 : AG---GT---AATA-TTACTT--TT-----TA-TGGCA--A------TATA---AAT-TTTATT------CATGTGCTATATTAG-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAT--CTCCA-----C---A-T-CTTT-T-T---T--------T-----AACACACCTCGTAta
gi|61946 : AG---GA---AATA-TTACAG--TT-----AA-TGGCA--A------TATA---ATT-TTTATT------ATTGTGCTATATCAA-------AGG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--CTCCA-----T---G-T-ATTT-T-T---T--------T-----AACA
gi|61947 : A-TTCCTTGCTT-----AA-TGGCA--AAATGAATATA---ATT-TTTATT------CTTGTGCTATATCAA-------ATG-T-TGAAA----ATATCACAAAA--G------------------------T---T--------T-----AACACACCTCATA
gi|61948 : TT-GTTATT------CTTGTATTGTAATAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTACAAAA--GTCCA-----C---T-T-A--A-T-T---T--------TCG---AACACACCTca
gi|61949 : TT-GTTATT------GATGTGATATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTAAGAAA--GCCCT-----C---G-T-A--TAT-T---T--------T-----AACACACCTCGTAgatgta
gi|61950 : ATT------CTTGTGCTATATTAA-------ATG-T-TGAAA----ATATTGTAAAA--GTCCA-----C---A-T-ATTT-T-T---T--------T-----AATACACCTCATAta