lowQualScore : 1111111111111111 11111 111111 1 1
lowQualScore : 0 111 11 0 0 555 2222 11 2222222222222222 1 22 44 55555 0 3 2 3 2 000000 666 3 7777 777 66 5 66 1 6 3 6 2 6 4
lowQualScore : . ... .. . . ... .... .. ................ . .. .. ..... . . . . . ...... ... . .... ... .. . .. . . . . . . .
lowQualScore : 8 333 00 8 8 666 0000 44 6666666666666666 0 44 99 77777 8 1 2 6 0 555555 444 6 7777 000 99 0 99 0 0 3 3 5 0 2
consensus : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CGT----T--TG-T--A----------TACCT--ATCTTAC-CGAGGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATNAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
Reference ( gi|5274 ) : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TGT----T--TG-T--A----------TACCT--ATCTTAC-TGAAGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACATCAG-TATGACGATGAAACCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5273 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAA----T--TG-T--A----------TACCT--ATCTTAC-TGAGGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5272 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAC----A--CA-A--T----------TACCT--ATCTTAC-CGAGGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5277 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACA
gi|5279 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-TAT----T--TG-T--T----------TGTTT--A---TAC-TTGTGTTTTTATG-T-TAAA-T-A------------A---CTGTTGTATTTTTGCAATA---tctttgtattactatcttaccgaggttttcctgtataaactatacctcactttgtttttagtaacatcaacaaaattacctcggtatacctcggccatggccat
gi|5278 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAT----TACTT-T--A----------CAACT--G---TAC-GGACCTTTTCTTG------ATT-ATATCTTGCAAACA---C----ACA----TGT-GTA---ACTAAATTA-AAA-ATTGTACCGACATAT
gi|5306 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-G-TAT----T--TGCT--G----------TACC---ATCTCA
gi|5280 : cacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CCT----T--TT-C--A----------T--CT--A---TAC-AGAAGT
gi|5284 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAT----A--CA-T--A----------TACAT--A---TAC-------------A-TATAAAC--ATTGCC------CATACCT-TCATA----TACA-TACACAC--ACCTATAAACAG--CACCCACATATAC
gi|5281 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-TAC----T--TG-T--T----------TACTT--CTTTT
gi|5276 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACCCACACGC-ACAC-A-CAC----C--CG-C--A----------CA-CT--ATTTTAC-TG
gi|5293 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAC----C--TG-C-------------TATCT--AT
gi|5310 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CCT----T--TA-T--aaccga
gi|5283 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAT----T--AG-T--ctgt
gi|5309 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-TAT----T--T--T--A----------TAct
gi|5304 : cACACAACACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAC-A-CAT----T--TA-T--A----------TAtat
gi|5301 : acatACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACATACATACATACAT-ACAC-A-TGC----T--TA-T--A----------TATTT--At
gi|5300 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-N-NNN----N--NN-N--N----------NACc
gi|5314 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-AGTGT----T--T
gi|5299 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAT-ATAT-A-TAT----A--TA-T--AAGCAGTGTCTTATCT--ACGTTAT-T-AAG--TTACTGCTATAAa
gi|5316 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-A-NN-N-NNN----N--NN-N--A----------TACTTTCATTTTA
gi|5303 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACACAACAC-A-CGT----T--T
gi|5286 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CCT----T--T
gi|5290 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-ACTAT----T--Ttcatccat
gi|5282 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-ACTAT----T--Ta
gi|5296 : acACGCA-CGCACGCACGC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-TATATTCT--TG-T--T----------TGTTT--ATTCTAA-T---GTTTATATG-T-CAAATTAATGTTG------TA---CT-TTGTA----ta
gi|5319 : acgcACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-----T----T--TA-T--C----------AACCT--
gi|5318 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-GGT----T--Tctaccaag
gi|5285 : caaacacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-GGT----T--Tcacctgaggcttt
gi|5289 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CGT----cacct
gi|5307 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CGT----gggt
gi|5295 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TAT----gggtgttta
gi|5308 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-AAT----T--Tagtt
gi|5294 : cacACACA-CACACACACAC---ACACACACAAACACACACACACACAC-ACACAA-CGT----T--Tac
gi|5312 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CGcatccat
gi|5298 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACAAACACACAC-ACAC-A-TGgt
gi|5315 : acacacacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-atggtttgaactgtc
gi|5297 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-gg
gi|5291 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-atgat
gi|5287 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-ctattatcta
gi|5320 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-ctactggtt
gi|5288 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAT--ACACACACACACACAC-ACAC-A-taatt
gi|5321 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACActggt
gi|5317 : cgcCACA-TACACACACAT---ACACACAC--ATACACACACACACAC-ATAC---TGT----C--TGGT--T----------TACCT--ATCTTAC-CCAGGTTTTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCGAGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACCGTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATTAATCCTAACCTTAACCCTAAacgatattaatatttacgtacccctggctaatacctca
gi|5305 : CACA-TAAAAAAACACTGTACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TCT----T--TG-T--A----------TTACT--ATCTTAC-CGAGGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCAT
gi|5324 : CACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACA-----GT----T--C----------------TACTT--AAATTACATAATGTTTT
gi|5311 : CACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-
gi|5313 : ACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAT----T--C------------------------TCTTG--TCAAGTCTTC-------AAACC-A-A--T------CA---CT-TAGTA-------AGTA---Aactgat
gi|5325 : CA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-C-TTT----T--CA-TCCA----------TAC
gi|5302 : A-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TAT----A--TA-T--A----------TATTT--ATagaagt
gi|5322 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-CAC----C--TG-T--C----------TAatagctt
gi|5326 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-
gi|5323 : ACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-TAT----T--TA-T-------------CACGT--ATATCACGTG----TTTACTG-TATAtccttttcatccatacagaagt
gi|5292 : ACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TAT----A--TA-T--A----------TATC
gi|5277 : ---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-TCT----T--TG-T--A----------TTACT--ATCTTAC-CGAGGTTTTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCATagtcagtgacttgccgagataaggtgttccggta
gi|5275 : G-T--T----------TACCT--ATCTTAC-CGAGGTTTTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAAGTATACATCGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACACTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAAAGAATCCTAACCCTAACCTTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 1
lowQualScore : 0 111 11 0 0 0 4444 11 55 3 88888888888 22 222 333333333 1 2 666666 2 0 3 1 999999 555 3 7777 666 66 4 66 1 2 1 2
lowQualScore : . ... .. . . . .... .. .. . ........... .. ... ......... . . ...... . . . . ...... ... . .... ... .. . .. . . . .
lowQualScore : 8 333 00 7 7 8 7777 33 22 1 55555555555 11 666 444444444 7 2 888888 7 7 3 0 666666 888 3 1111 444 11 4 11 4 1 0 2
consensus : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
Reference ( family-430 ) : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATNAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5272 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CA--CA-ATTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5273 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--AT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5274 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AAGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACATCAG-TATGACGATGAAACCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5275 : G-TTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAAGTATACATCGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACACTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAAAGAATCCTAACCCTAACCTTAA
gi|5276 : acacacacacacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagtctgACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACCCACACGC-ACAC-A-C-A--CC--CG-CACA----C------T--AT-TTTAC-T-G-----
gi|5277 : ---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCAT
gi|5278 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TTACTT-TACA--A-C------T--G----TAC-G-G-----ACCT-T------TTCTTG------ATT-ATATCTTGCAAACA---C----ACA----TGT-GTA---ACTAAATTA-AAA-ATTGTACCGACATAT
gi|5279 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TG-TTTG--T-T------T--ATACTTGT-----------GT-T------TTTATG-T-TAAA-T-A------------A---CTGTTGTATTTTTGCAATA---
gi|5280 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TT-CAT-----C------T--A----TAC-A-G-----AAGT-
gi|5281 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--CT--TG-TTTA--C-T------T--CT-TTT
gi|5282 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5283 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--AG-Tactatttta
gi|5284 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TA--CA-TATA--C-A------T--A----TAC--------------------------A-TATAAAC--ATTGCC------CATACCT-TCATA----TACA-TACACAC--ACCTATAAACAG--CACCCACATATACct
gi|5285 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-G-G--TT--T
gi|5286 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--Tcacct
gi|5287 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-tcatccat
gi|5288 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ATACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CT--GG-Tactactggtt
gi|5289 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5290 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-gggt
gi|5291 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-actattta
gi|5292 : ACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-A--TA--TA-TATA--T-CAGTCAGT--GA-CTTGC-C-GAGATAAGGT-G------TTCCGG-TAactattatcta
gi|5293 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CC--TG-C-TA--T-C------T--AT-A--AC-C-G-----A
gi|5294 : ACACA-CACACACACAC---ACACACACAAACACACACACACACAC-ACACAA-C-G--TT--T
gi|5295 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A---G--TT--catccat
gi|5296 : acacACGCA-CGCACGCACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAT-ATAT-A-T-T--CT--TG-TTTG--T-T------T--AT-TCTA----------ATGT-T------TATATG-T-CAAATTAATGTTG------TA---CT-TTGTA----
gi|5297 : acgcacgcACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5298 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACAAACACACAC-ACAC-A-T-G--aatgat
gi|5299 : acacacacACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TA--TA-TATAAGCAG------T--GT-CTTAT-C-T-----ACGT-TATTAAGTTACTGCTATAAatggtttgaactgtc
gi|5300 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-N-N-N--NN--NN-NNNA--C-
gi|5301 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACATACATACATACAT-ACAC-A-T-G--CT--TA-TATA--T-T------T--A
gi|5302 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACATAT-ATAT-A-T-A--TT--TA-TATA--G-C------T--c
gi|5303 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACACAACAC-A-C-G--TT--Tt
gi|5304 : ACACAACACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAC-A-C-A--TT--TA-TATA--
gi|5305 : acatCACA-TAAAAAAACACTGTACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCATt
gi|5306 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-GTATT--TGCTGTA--C-C---------AT-CTCA
gi|5307 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5308 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-A-A--TT--Tgggtgttta
gi|5309 : cacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--TT--T--TATA--ac
gi|5310 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TA-Ttat
gi|5311 : cCACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-ctgt
gi|5312 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--actgat
gi|5313 : cACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--C---------------------T-CTTGT-C-------AAGT-C------TTC-------AAACC-A-A--T------CA---CT-TAGTA-------AGTA---Agt
gi|5314 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-AGT-G--TT--T
gi|5315 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-a
gi|5316 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-A-NN-N-N-N--NN--NN-NATA--C-T------TTCAT-TTTAagg
gi|5317 : CA-CATACACACAC---ATACACAC--ACATACACACACACAC-ACAT-A-CTG--TC--TGGTTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-C-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCGAGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACCGTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATTAATCCTAACCTTAACCCTAA
gi|5318 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-------------TATA-----------G--GT-TTCAC-CTG-----AGGC-T------TT
gi|5319 : caaACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C----TT--TA-TCAA--C-C------T------CTAC-C-A-----AG
gi|5320 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-
gi|5321 : CGCA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACA--A-C-G--taatt
gi|5322 : CACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-C-T-G--TC--Tatattaatatttacgtacccctggctaatacctca
gi|5323 : ACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TA-T-CA--C-G------T--AT-ATCAC-----------GTGT------TTACTG-TATAa
gi|5324 : CA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A---G--TT--C----TA--C-T------T--AA-ATTACAT-A-----ATGT-T------TT
gi|5325 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--T
gi|5326 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-T-C-C--TT--Ttcatccatacagaagt
Alignments
lowQualScore : 111111111 1
lowQualScore : 0 111 11 0 0 0 4444 11 55 3 88888888888 22 222 333333333 1 2 666666 2 0 3 1 999999 555 3 7777 666 66 4 66 1 4 1
lowQualScore : . ... .. . . . .... .. .. . ........... .. ... ......... . . ...... . . . . ...... ... . .... ... .. . .. . . .
lowQualScore : 8 333 00 7 7 8 7777 33 22 1 55555555555 11 666 444444444 7 2 888888 7 7 3 0 666666 888 3 1111 444 11 4 11 4 0 4
consensus : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
Reference ( family-430 ) : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5272 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CA--CA-ATTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5273 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--AT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5274 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AAGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACATCAG-TATGACGATGAAACCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5275 : G-TTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAAGTATACATCGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACACTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAAAGAATCCTAACCCTAACCTTAA
gi|5276 : acacacacacacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagtctgACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACCCACACGC-ACAC-A-C-A--CC--CG-CACA----C------T--AT-TTTAC-T-G-----
gi|5277 : ---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCAT
gi|5278 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TTACTT-TACA--A-C------T--G----TAC-G-G-----ACCT-T------TTCTTG------ATT-ATATCTTGCAAACA---C----ACA----TGT-GTA---ACTAAATTA-AAA-ATTGTACCGACATAT
gi|5279 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TG-TTTG--T-T------T--ATACTTGT-----------GT-T------TTTATG-T-TAAA-T-A------------A---CTGTTGTATTTTTGCAATA---
gi|5280 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TT-CAT-----C------T--A----TAC-A-G-----AAGT-
gi|5281 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--CT--TG-TTTA--C-T------T--CT-TTT
gi|5282 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5283 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--AG-Tactatttta
gi|5284 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TA--CA-TATA--C-A------T--A----TAC--------------------------A-TATAAAC--ATTGCC------CATACCT-TCATA----TACA-TACACAC--ACCTATAAACAG--CACCCACATATACct
gi|5285 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-G-G--TT--T
gi|5286 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--Tcacct
gi|5287 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-tcatccat
gi|5288 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ATACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CT--GG-Tactactggtt
gi|5289 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5290 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-gggt
gi|5291 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-actattta
gi|5292 : ACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-A--TA--TA-TATA--T-CAGTCAGT--GA-CTTGC-C-GAGATAAGGT-G------TTCCGG-TAactattatcta
gi|5293 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CC--TG-C-TA--T-C------T--AT-A--AC-C-G-----A
gi|5294 : ACACA-CACACACACAC---ACACACACAAACACACACACACACAC-ACACAA-C-G--TT--T
gi|5295 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A---G--TT--catccat
gi|5296 : acacACGCA-CGCACGCACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAT-ATAT-A-T-T--CT--TG-TTTG--T-T------T--AT-TCTA----------ATGT-T------TATATG-T-CAAATTAATGTTG------TA---CT-TTGTA----
gi|5297 : acgcacgcACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5298 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACAAACACACAC-ACAC-A-T-G--aatgat
gi|5299 : acacacacACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TA--TA-TATAAGCAG------T--GT-CTTAT-C-T-----ACGT-TATTAAGTTACTGCTATAAatggtttgaactgtc
gi|5300 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-N-N-N--NN--NN-NNNA--C-
gi|5301 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACATACATACATACAT-ACAC-A-T-G--CT--TA-TATA--T-T------T--A
gi|5302 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACATAT-ATAT-A-T-A--TT--TA-TATA--G-C------T--c
gi|5303 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACACAACAC-A-C-G--TT--Tt
gi|5304 : ACACAACACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAC-A-C-A--TT--TA-TATA--
gi|5305 : acatCACA-TAAAAAAACACTGTACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCATt
gi|5306 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-GTATT--TGCTGTA--C-C---------AT-CTCA
gi|5307 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5308 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-A-A--TT--Tgggtgttta
gi|5309 : cacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--TT--T--TATA--ac
gi|5310 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TA-Ttat
gi|5311 : cCACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-ctgt
gi|5312 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--actgat
gi|5313 : cACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--C---------------------T-CTTGT-C-------AAGT-C------TTC-------AAACC-A-A--T------CA---CT-TAGTA-------AGTA---Agt
gi|5314 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-AGT-G--TT--T
gi|5315 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-a
gi|5316 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-A-NN-N-N-N--NN--NN-NATA--C-T------TTCAT-TTTAagg
gi|5317 : CA-CATACACACAC---ATACACAC--ACATACACACACACAC-ACAT-A-CTG--TC--TGGTTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-C-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCGAGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACCGTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATTAATCCTAACCTTAACCCTAA
gi|5318 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-------------TATA-----------G--GT-TTCAC-CTG-----AGGC-T------TT
gi|5319 : caaACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C----TT--TA-TCAA--C-C------T------CTAC-C-A-----AG
gi|5320 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-
gi|5321 : CGCA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACA--A-C-G--taatt
gi|5322 : CACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-C-T-G--TC--Tatattaatatttacgtacccctggctaatacctca
gi|5323 : ACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TA-T-CA--C-G------T--AT-ATCAC-----------GTGT------TTACTG-TATAa
gi|5324 : CA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A---G--TT--C----TA--C-T------T--AA-ATTACAT-A-----ATGT-T------TT
gi|5325 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--T
gi|5326 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-T-C-C--TT--Ttcatccatacagaagt
blockSeqs : TGT AA GTA AC GC A TCAGTCAG TC TAC CGAGATA G G ATTAAG C A C TGCAAA TAC G TTTT CAC TA C TG C G A
blockSeqs : . . TG . GG A AGCAG . TC CTG A . . . . C . . . . . . . . C G G
blockSeqs : . . A . G T CC . TC ATA G . . . . C . . . . . . . . . A G
blockSeqs : . . G . G A CC . TC TG G . . . . C . . . . . . . . . C T
blockSeqs : . . A . G A CC . TT TG C . . . . T . . . . . . . . . C
blockSeqs : . . C . G A AC . TC CG A . . . . G . . . . . . . . . A
blockSeqs : . . A . G T AC . TT TG G . . . . T . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . T A TT . AC CG T . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . G T CT . TA GG C . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . A . T A CA . TT AG G . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . G A TC . TC CG A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . G T TT . TC CT G . . .
blockSeqs : . . G . A A TT . TC CG G . . .
blockSeqs : . . C . G N GC . TC CC G . . .
blockSeqs : . . A . A A AC . TT CA T . .
blockSeqs : . . G . G A CC . TC C . . .
blockSeqs : . . A . G A CT . TT . . .
blockSeqs : . . A . A A CC . TA . .
blockSeqs : . . G . N G CC . AA .
blockSeqs : . . G . A A CG . . .
blockSeqs : . . T . A A CT . .
blockSeqs : . . G . A T C . .
blockSeqs : . . A . G A C . .
blockSeqs : . . N . A C . .
blockSeqs : . . G . N . . .
blockSeqs : . . A . A .
blockSeqs : . . G . A .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . C . .
blockSeqs : . . G . .
blockSeqs : . . A . .
blockSeqs : . . A .
blockSeqs : . . C .
blockSeqs : . . G .
blockSeqs : . . A .
blockSeqs : . . G .
blockSeqs : . . N .
blockSeqs : . . G .
blockSeqs : . . G .
blockSeqs : . . A .
blockSeqs : . . G
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . C
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
finalCons : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
Alignments
lowQualScore : 111111111 1
lowQualScore : 0 111 11 0 0 0 4444 11 55 3 88888888888 22 222 333333333 1 2 666666 2 0 3 1 999999 555 3 7777 666 66 4 66 1 4 1
lowQualScore : . ... .. . . . .... .. .. . ........... .. ... ......... . . ...... . . . . ...... ... . .... ... .. . .. . . .
lowQualScore : 8 333 00 7 7 8 7777 33 22 1 55555555555 11 666 444444444 7 2 888888 7 7 3 0 666666 888 3 1111 444 11 4 11 4 0 4
consensus : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
Reference ( family-430 ) : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5272 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CA--CA-ATTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACAATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5273 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--AT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACTT------CT---TT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCTCGG-TATGACGATGAAGCCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATAAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5274 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-G--TT--TG-TATA--C-C------T--AT-CTTAC-T-G-----AAGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACATCAG-TATGACGATGAAACCCTCTTAAAACCCTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATGAATCCTAACCCTAACCCTAA
gi|5275 : G-TTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAAGTATACATCGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACACTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAAAGAATCCTAACCCTAACCTTAA
gi|5276 : acacacacacacacacacacacacacacacagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagagtctgACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACCCACACGC-ACAC-A-C-A--CC--CG-CACA----C------T--AT-TTTAC-T-G-----
gi|5277 : ---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCAT
gi|5278 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TTACTT-TACA--A-C------T--G----TAC-G-G-----ACCT-T------TTCTTG------ATT-ATATCTTGCAAACA---C----ACA----TGT-GTA---ACTAAATTA-AAA-ATTGTACCGACATAT
gi|5279 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TG-TTTG--T-T------T--ATACTTGT-----------GT-T------TTTATG-T-TAAA-T-A------------A---CTGTTGTATTTTTGCAATA---
gi|5280 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TT-CAT-----C------T--A----TAC-A-G-----AAGT-
gi|5281 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--CT--TG-TTTA--C-T------T--CT-TTT
gi|5282 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5283 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--AG-Tactatttta
gi|5284 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TA--CA-TATA--C-A------T--A----TAC--------------------------A-TATAAAC--ATTGCC------CATACCT-TCATA----TACA-TACACAC--ACCTATAAACAG--CACCCACATATACct
gi|5285 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-G-G--TT--T
gi|5286 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--Tcacct
gi|5287 : acACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-tcatccat
gi|5288 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ATACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CT--GG-Tactactggtt
gi|5289 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5290 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-gggt
gi|5291 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-actattta
gi|5292 : ACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-A--TA--TA-TATA--T-CAGTCAGT--GA-CTTGC-C-GAGATAAGGT-G------TTCCGG-TAactattatcta
gi|5293 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--CC--TG-C-TA--T-C------T--AT-A--AC-C-G-----A
gi|5294 : ACACA-CACACACACAC---ACACACACAAACACACACACACACAC-ACACAA-C-G--TT--T
gi|5295 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A---G--TT--catccat
gi|5296 : acacACGCA-CGCACGCACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAT-ATAT-A-T-T--CT--TG-TTTG--T-T------T--AT-TCTA----------ATGT-T------TATATG-T-CAAATTAATGTTG------TA---CT-TTGTA----
gi|5297 : acgcacgcACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-
gi|5298 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACAAACACACAC-ACAC-A-T-G--aatgat
gi|5299 : acacacacACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TA--TA-TATAAGCAG------T--GT-CTTAT-C-T-----ACGT-TATTAAGTTACTGCTATAAatggtttgaactgtc
gi|5300 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-N-N-N--NN--NN-NNNA--C-
gi|5301 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACATACATACATACAT-ACAC-A-T-G--CT--TA-TATA--T-T------T--A
gi|5302 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACATAT-ATAT-A-T-A--TT--TA-TATA--G-C------T--c
gi|5303 : acacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACACAACAC-A-C-G--TT--Tt
gi|5304 : ACACAACACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAC-A-C-A--TT--TA-TATA--
gi|5305 : acatCACA-TAAAAAAACACTGTACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-T-C--TT--TG-TATT--A-C------T--AT-CTTAC-C-G-----AGGT-T------TTCCTG-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTT----TTTAGTA---AC--ATCAACAAA-AT--TACCTCGGTATACCTCGGCCATGGCCATt
gi|5306 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-GTATT--TGCTGTA--C-C---------AT-CTCA
gi|5307 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--T
gi|5308 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-A-A--TT--Tgggtgttta
gi|5309 : cacACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAT-A-T-A--TT--T--TATA--ac
gi|5310 : cACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--TA-Ttat
gi|5311 : cCACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-ctgt
gi|5312 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-G--actgat
gi|5313 : cACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-A--TT--C---------------------T-CTTGT-C-------AAGT-C------TTC-------AAACC-A-A--T------CA---CT-TAGTA-------AGTA---Agt
gi|5314 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-AGT-G--TT--T
gi|5315 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-a
gi|5316 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-A-NN-N-N-N--NN--NN-NATA--C-T------TTCAT-TTTAagg
gi|5317 : CA-CATACACACAC---ATACACAC--ACATACACACACACAC-ACAT-A-CTG--TC--TGGTTTA--C-C------T--AT-CTTAC-C-C-----AGGT-T------TTCCTA-TATAAACT-ATACCT------CA---CT-TTGTA----TGCAGTA---AC--ACCTACAAA-AT--TACCGAGGTATACCGAGG-TATGACAATCAAGCCCTCTTAAAACCGTCTGACAACCATAATCCTAACCCAAAACGGAATTAATCCTAACCTTAACCCTAA
gi|5318 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-------------TATA-----------G--GT-TTCAC-CTG-----AGGC-T------TT
gi|5319 : caaACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C----TT--TA-TCAA--C-C------T------CTAC-C-A-----AG
gi|5320 : ACACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-
gi|5321 : CGCA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACA--A-C-G--taatt
gi|5322 : CACA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-C-T-G--TC--Tatattaatatttacgtacccctggctaatacctca
gi|5323 : ACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ATAT-A-T-A--TT--TA-T-CA--C-G------T--AT-ATCAC-----------GTGT------TTACTG-TATAa
gi|5324 : CA-CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A---G--TT--C----TA--C-T------T--AA-ATTACAT-A-----ATGT-T------TT
gi|5325 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-A-C-C--TT--T
gi|5326 : -CACACACACAC---ACACACAC--ACACACACACACACAC-ACAC-T-C-C--TT--Ttcatccatacagaagt