lowQualScore : 1 1111 11 0 11 1111 111 0 22 8 5 1 0 22
lowQualScore : . .... .. . .. .... ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 8 7777 00 8 00 5555 333 7 77 4 2 5 7 11
consensus : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
Reference ( gi|83579 ) : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTCTGTCTGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83580 : ATCTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83578 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AACAACC---A-CAA--TTTTTGTCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83582 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CAAT----AGCAACC---C-CAA--TTTTTGTCTGATTG-A-AAA--AATAAa
gi|83584 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCAT----AACAACC---A-CAA--TATTTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83585 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTTG--CCA-----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCTGAATG-A-AAA--AATAAa
gi|83581 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTAG--CCAT----GGCAACC---A-CAA--TTTTTGCCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83591 : ATTTTA-CC----AATT--AT-GTTG--CCAT----AGCAACT---G-CAA--TGATTGTCTGACTG-A-AAA--AATAa
gi|83592 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCAT----GACAACC---A-CAC--TTTTTGTCTGGCTA-A-AAA--AGTAA
gi|83589 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CCAT----AACCACC---A-CAA--TTTTTGTCCAACTG-A-AAA--
gi|83596 : ATTTTA-TA----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TATTTGTTTAATTGAA-AAA--AATAA
gi|83586 : ATTTTA-CT----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC-----TAA--TTTTTTTCCGACTG-ATAAA--AAa
gi|83583 : ATTTTA-CC----TGTT--TT-GTTG--CCAT----ACCAACC-----CCT--TTTTTGTTTGACTG-A-AAA--AATAAaa
gi|83588 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---C-CAA--TTTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83587 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---C-CAA--TTTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83597 : ATCCTA-CCCATTAATT--TC-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTTGAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83594 : ATTTTA-TG----TACT--TT-ATTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTT-TGTCAGACTT-A-AAA--AATAAa
gi|83593 : ATTTTA-CC----TATT--T--GTTG--CCAT----AGCAATC---A-CTA--TTTGTGTCCGGCCG-A-AAA--AATGAa
gi|83600 : ATTTTA-CC----TATT--TTTGTTG--C-AC----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCAGACTG-A-AAa
gi|83599 : ATTTTA-CT----TATT--TT-GTTA--CCTT----AGCAACC---C-CAA--ATTGTGTCCAACTG-A-AAA--AATAAtataaa
gi|83604 : ATTTAA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAA----AGCAAC------TAG--TTTTTGTTTGACTG-A-AAA--GATa
gi|83595 : ATTTTA-CC----AATT--T--GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TAT---TTTAGCTG-A-AAA--ACTAAcaa
gi|83602 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CAATAGCAAGCAACC---A-CAA--CTTGTGTCCAACTT-A-AAA--AATa
gi|83601 : ATTTTA-C-------TTAGTT-ATTT--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTATGTCCGACTG---AAA--AATAA
gi|83598 : ATTTTA-CC----AGTT--TT-GTTG--TCAT----CACAACC---A-CAC--GTTTTATCC-ACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83603 : ATTTGA-CT----AATT--TT-TTTT--CAGT----AGTAACC---A-CAA--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--
gi|83590 : ATTTTA-TA----TATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---ATTAA--TTTTT-TCAGACTA-A-AAA--ATTAAcctaaa
gi|83606 : TTTTA-CC----AATT--TT-GTTT--CCAT----CGCAACC---A-TAC--TTTTTGTCAGACTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83605 : TTTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCAC----AGCACCT---T-CAATTTTTTTGCCTGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83608 : TTGTA-CT----TATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---G-CAA--TTT-TGTCTGGCTG---AAA--AATAAa
gi|83607 : TTTTG-CT----AATT--TT-GTTG--TCAT----AACAACCAATA-TAT--TTTTTTTCCGAATG-A-AAA--AGTAAa
gi|83609 : TTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCAT----AGTAACC---A-CAT--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83610 : TTTA-CC----AATT--TT-GCTG--CTAT----GGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCCAGCTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83612 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CTAC----AGTAACC---A-CAA--TTGATGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83611 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCTT----AGCAACC---A-CAA--TTTTCGTCCAACTA-A-GAA--
gi|83617 : TTTA-CC----AATT--TT-ATTG--CCAT----AGCAGCC---A-CAA--TTTTTGTAAAACAG-C-AAA--AATAA
gi|83613 : TTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCAG----AGCACTC---A-AAA--TTTTTGTCCGACTG-A-AAAGTAATAAa
gi|83616 : TTTA-TC----AGTT--TT-GTTA--CCAA----AGCAACC---A-TAA--TTTTTGTCCCACTG-A-AAAGTAATAAa
gi|83614 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TAATTTTCTAAATG-A-AAC--AAa
gi|83618 : TTTA-CC----TTTT--CT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAC--TTTTTGTAAGACAG-A-AAA--AATA
gi|83615 : TTTA-CC----AATT--T--ATTG--CCAT----AGCAACC---G-CAA--TATTTTTCAGACTG-A-AAA--
gi|83620 : TTA-CC----AATT--TT-GATG--CCAT----GGCAACC---A-CAA--TTTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAAgtaaa
gi|83621 : TTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAT----AGCAAAC---A-CAT--TTTTTGTCTGAATA-A-AAA--AATAa
gi|83619 : TTA-AC----AAAT--TT-GTTG--CCAT----AGCTACC---A-C-T--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83622 : TA-CC----AGTT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACT---G-CAA--TTTTTATCAGACTA-T-AAT--AGTAA
gi|83623 : ----AGTT--TT-GTTG--TTAT----AGCAACC---A-CAC--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83624 : ----AATT--TT-GTTG--TCAT----GGCAACC---A-CAA--TCTTTGTCCAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83625 : ----AGTT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-T-T--TTTTTGTCCGACTG-A-AAA--AAa
gi|83628 : ----AATT--TT-GTTA--CCAT----AGCAAGC---A-CAA--TGTTAGTTGGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83627 : ----AATT--TT-AT-GACCCAT----AGCAACC---A-TAA--TTTTTGTCCGACTGAA-AAA--AATAAa
gi|83626 : ----AGTT--TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTTTa
gi|83629 : ATT--TT-ATTG--CTAT----AGCAACT---A-TAA--TTTTTATCCTACTG-A-AAA--AAtt
gi|83630 : --TT-GTTG--CCAT----AGCAACC---A-CAATTTTTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83631 : --TT-GTTG--CCAT----AGCAAAC---A-CAAT-TTTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83632 : TG--CCAT----AGCAACC---A-CAA--TTTTTGTTCAACTG-A-AGA--
gi|83633 : CAT----AGCAACC---A-CAA--TTTCTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11 0 11 1111 111 0 22 0 0 1 0 22
lowQualScore : . .... .. . .. .... ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 8 7777 00 7 00 5555 222 7 77 7 6 5 7 00
consensus : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
Reference ( family-428 ) : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83578 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83579 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83580 : ATCTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83581 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTAG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGCCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83582 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CAATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTTGTCTGATTG-A-AAA--AATAAa
gi|83583 : ATTTTA-CC----TGTT--TT-GTTG--CCATACCA----ACC-----CCT--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83584 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83585 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTTG--CCA-AGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCTGAATG-A-AAA--AATAAa
gi|83586 : ATTTTA-CT----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC-----TAA--T-TTTTTTCCGACTG-ATAAA--AAa
gi|83587 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAaa
gi|83588 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83589 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CCATAACC----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--a
gi|83590 : ATTTTA-TA----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---ATTAA--T-TTTT-TCAGACTA-A-AAA--ATTAA
gi|83591 : ATTTTA-CC----AATT--AT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-GATTGTCTGACTG-A-AAA--AATAa
gi|83592 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATGACA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCTGGCTA-A-AAA--AGTAA
gi|83593 : ATTTTA-CC----TATT--T--GTTG--CCATAGCA----ATC---A-CTA--T-TTGTGTCCGGCCG-A-AAA--AATGA
gi|83594 : ATTTTA-TG----TACT--TT-ATTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA----TTTTGTCAGACTT-A-AAA--AATAAa
gi|83595 : ATTTTA-CC----AATT--T--GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--TATTTT----AGCTG-A-AAA--ACTAAa
gi|83596 : ATTTTA-TA----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTTTAATTGAA-AAA--AATAAa
gi|83597 : ATCCTA-CCCATTAATT--TC-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTGAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83598 : ATTTTA-CC----AGTT--TT-GTTG--TCATCACA----ACC---A-CAC--G-TTTTATCC-ACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83599 : ATTTTA-CT----TATT--TT-GTTA--CCTTAGCA----ACC---C-CAA--A-TTGTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83600 : ATTTTA-CC----TATT--TTTGTTG--C-ACAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAa
gi|83601 : ATTTTA-C-------TTAGTT-ATTT--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTATGTCCGACTG---AAA--AATAAtataaa
gi|83602 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CAATAGCAAGCAACC---A-CAA--C-TTGTGTCCAACTT-A-AAA--AATa
gi|83603 : ATTTGA-CT----AATT--TT-TTTT--CAGTAGTA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--
gi|83604 : ATTTAA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAAAGCA----AC------TAG--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--GATcctaaa
gi|83605 : TTTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCACAGCA----CCT---T-CAATTT-TTTTGCCTGACTG-A-AAA--AATAAcaa
gi|83606 : TTTTA-CC----AATT--TT-GTTT--CCATCGCA----ACC---A-TAC--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83607 : TTTTG-CT----AATT--TT-GTTG--TCATAACA----ACCAATA-TAT--T-TTTTTTCCGAATG-A-AAA--AGTAA
gi|83608 : TTGTA-CT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA----TTTTGTCTGGCTG---AAA--AATAA
gi|83609 : TTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAGTA----ACC---A-CAT--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83610 : TTTA-CC----AATT--TT-GCTG--CTATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAGCTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83611 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCTTAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTCGTCCAACTA-A-GAA--
gi|83612 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CTACAGTA----ACC---A-CAA--T-TGATGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83613 : TTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCAGAGCA----CTC---A-AAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAAGTAATAA
gi|83614 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-AATTTTCTAAATG-A-AAC--AAa
gi|83615 : TTTA-CC----AATT--T--ATTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA--T-ATTTTTCAGACTG-A-AAA--
gi|83616 : TTTA-TC----AGTT--TT-GTTA--CCAAAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCCACTG-A-AAAGTAATAAgtaaa
gi|83617 : TTTA-CC----AATT--TT-ATTG--CCATAGCA----GCC---A-CAA--T-TTTTGTAAAACAG-C-AAA--AATAAa
gi|83618 : TTTA-CC----TTTT--CT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTAAGACAG-A-AAA--AATAa
gi|83619 : TTA-AC----AAAT--TT-GTTG--CCATAGCT----ACC---A-CT---T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83620 : TTA-CC----AATT--TT-GATG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83621 : TTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAT--T-TTTTGTCTGAATA-A-AAA--AATAa
gi|83622 : TA-CC----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-TTTTATCAGACTA-T-AAT--AGTAA
gi|83623 : ----AGTT--TT-GTTG--TTATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83624 : ----AATT--TT-GTTG--TCATGGCA----ACC---A-CAA--T-CTTTGTCCAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83625 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-T-T--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AAa
gi|83626 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTT
gi|83627 : ----AATT--TT-AT-GACCCATAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCGACTGAA-AAA--AATAAtt
gi|83628 : ----AATT--TT-GTTA--CCATAGCA----AGC---A-CAA--T-GTTAGTTGGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83629 : ATT--TT-ATTG--CTATAGCA----ACT---A-TAA--T-TTTTATCCTACTG-A-AAA--AAa
gi|83630 : --TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAATTT-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83631 : --TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAAT-T-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83632 : TG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTCAACTG-A-AGA--
gi|83633 : CATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11 0 11 1111 111 0 22 0 0 1 0 22
lowQualScore : . .... .. . .. .... ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 8 7777 00 7 00 5555 222 7 77 7 6 5 7 00
consensus : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
Reference ( family-428 ) : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83578 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83579 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83580 : ATCTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83581 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTAG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGCCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83582 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CAATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTTGTCTGATTG-A-AAA--AATAAa
gi|83583 : ATTTTA-CC----TGTT--TT-GTTG--CCATACCA----ACC-----CCT--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83584 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83585 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTTG--CCA-AGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCTGAATG-A-AAA--AATAAa
gi|83586 : ATTTTA-CT----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC-----TAA--T-TTTTTTCCGACTG-ATAAA--AAa
gi|83587 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAaa
gi|83588 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83589 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CCATAACC----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--a
gi|83590 : ATTTTA-TA----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---ATTAA--T-TTTT-TCAGACTA-A-AAA--ATTAA
gi|83591 : ATTTTA-CC----AATT--AT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-GATTGTCTGACTG-A-AAA--AATAa
gi|83592 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATGACA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCTGGCTA-A-AAA--AGTAA
gi|83593 : ATTTTA-CC----TATT--T--GTTG--CCATAGCA----ATC---A-CTA--T-TTGTGTCCGGCCG-A-AAA--AATGA
gi|83594 : ATTTTA-TG----TACT--TT-ATTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA----TTTTGTCAGACTT-A-AAA--AATAAa
gi|83595 : ATTTTA-CC----AATT--T--GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--TATTTT----AGCTG-A-AAA--ACTAAa
gi|83596 : ATTTTA-TA----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTTTAATTGAA-AAA--AATAAa
gi|83597 : ATCCTA-CCCATTAATT--TC-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTGAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83598 : ATTTTA-CC----AGTT--TT-GTTG--TCATCACA----ACC---A-CAC--G-TTTTATCC-ACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83599 : ATTTTA-CT----TATT--TT-GTTA--CCTTAGCA----ACC---C-CAA--A-TTGTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83600 : ATTTTA-CC----TATT--TTTGTTG--C-ACAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAa
gi|83601 : ATTTTA-C-------TTAGTT-ATTT--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTATGTCCGACTG---AAA--AATAAtataaa
gi|83602 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CAATAGCAAGCAACC---A-CAA--C-TTGTGTCCAACTT-A-AAA--AATa
gi|83603 : ATTTGA-CT----AATT--TT-TTTT--CAGTAGTA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--
gi|83604 : ATTTAA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAAAGCA----AC------TAG--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--GATcctaaa
gi|83605 : TTTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCACAGCA----CCT---T-CAATTT-TTTTGCCTGACTG-A-AAA--AATAAcaa
gi|83606 : TTTTA-CC----AATT--TT-GTTT--CCATCGCA----ACC---A-TAC--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83607 : TTTTG-CT----AATT--TT-GTTG--TCATAACA----ACCAATA-TAT--T-TTTTTTCCGAATG-A-AAA--AGTAA
gi|83608 : TTGTA-CT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA----TTTTGTCTGGCTG---AAA--AATAA
gi|83609 : TTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAGTA----ACC---A-CAT--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83610 : TTTA-CC----AATT--TT-GCTG--CTATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAGCTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83611 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCTTAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTCGTCCAACTA-A-GAA--
gi|83612 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CTACAGTA----ACC---A-CAA--T-TGATGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83613 : TTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCAGAGCA----CTC---A-AAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAAGTAATAA
gi|83614 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-AATTTTCTAAATG-A-AAC--AAa
gi|83615 : TTTA-CC----AATT--T--ATTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA--T-ATTTTTCAGACTG-A-AAA--
gi|83616 : TTTA-TC----AGTT--TT-GTTA--CCAAAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCCACTG-A-AAAGTAATAAgtaaa
gi|83617 : TTTA-CC----AATT--TT-ATTG--CCATAGCA----GCC---A-CAA--T-TTTTGTAAAACAG-C-AAA--AATAAa
gi|83618 : TTTA-CC----TTTT--CT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTAAGACAG-A-AAA--AATAa
gi|83619 : TTA-AC----AAAT--TT-GTTG--CCATAGCT----ACC---A-CT---T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83620 : TTA-CC----AATT--TT-GATG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83621 : TTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAT--T-TTTTGTCTGAATA-A-AAA--AATAa
gi|83622 : TA-CC----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-TTTTATCAGACTA-T-AAT--AGTAA
gi|83623 : ----AGTT--TT-GTTG--TTATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83624 : ----AATT--TT-GTTG--TCATGGCA----ACC---A-CAA--T-CTTTGTCCAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83625 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-T-T--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AAa
gi|83626 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTT
gi|83627 : ----AATT--TT-AT-GACCCATAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCGACTGAA-AAA--AATAAtt
gi|83628 : ----AATT--TT-GTTA--CCATAGCA----AGC---A-CAA--T-GTTAGTTGGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83629 : ATT--TT-ATTG--CTATAGCA----ACT---A-TAA--T-TTTTATCCTACTG-A-AAA--AAa
gi|83630 : --TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAATTT-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83631 : --TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAAT-T-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83632 : TG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTCAACTG-A-AGA--
gi|83633 : CATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
blockSeqs : A CATT AG AC AGCA AAT TT A GT
blockSeqs : A . . . . . TT A GT
blockSeqs : . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
finalCons : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
Alignments
lowQualScore : 1 1111 11 0 11 1111 111 0 22 0 0 1 0 22
lowQualScore : . .... .. . .. .... ... . .. . . . . ..
lowQualScore : 8 7777 00 7 00 5555 222 7 77 7 6 5 7 00
consensus : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
Reference ( family-428 ) : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83578 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83579 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83580 : ATCTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83581 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTAG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGCCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83582 : ATTTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CAATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTTGTCTGATTG-A-AAA--AATAAa
gi|83583 : ATTTTA-CC----TGTT--TT-GTTG--CCATACCA----ACC-----CCT--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83584 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAACA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTCTGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83585 : ATTTTA-AC----AATT--TT-GTTG--CCA-AGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCTGAATG-A-AAA--AATAAa
gi|83586 : ATTTTA-CT----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC-----TAA--T-TTTTTTCCGACTG-ATAAA--AAa
gi|83587 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAaa
gi|83588 : ATTTTAACT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---C-CAA--T-TTTT-TCCAACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83589 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CCATAACC----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAACTG-A-AAA--a
gi|83590 : ATTTTA-TA----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---ATTAA--T-TTTT-TCAGACTA-A-AAA--ATTAA
gi|83591 : ATTTTA-CC----AATT--AT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-GATTGTCTGACTG-A-AAA--AATAa
gi|83592 : ATTTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATGACA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCTGGCTA-A-AAA--AGTAA
gi|83593 : ATTTTA-CC----TATT--T--GTTG--CCATAGCA----ATC---A-CTA--T-TTGTGTCCGGCCG-A-AAA--AATGA
gi|83594 : ATTTTA-TG----TACT--TT-ATTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA----TTTTGTCAGACTT-A-AAA--AATAAa
gi|83595 : ATTTTA-CC----AATT--T--GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--TATTTT----AGCTG-A-AAA--ACTAAa
gi|83596 : ATTTTA-TA----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-ATTTGTTTAATTGAA-AAA--AATAAa
gi|83597 : ATCCTA-CCCATTAATT--TC-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTGAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83598 : ATTTTA-CC----AGTT--TT-GTTG--TCATCACA----ACC---A-CAC--G-TTTTATCC-ACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83599 : ATTTTA-CT----TATT--TT-GTTA--CCTTAGCA----ACC---C-CAA--A-TTGTGTCCAACTG-A-AAA--AATAA
gi|83600 : ATTTTA-CC----TATT--TTTGTTG--C-ACAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAa
gi|83601 : ATTTTA-C-------TTAGTT-ATTT--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTATGTCCGACTG---AAA--AATAAtataaa
gi|83602 : ATTTTA-CC----TATT--TT-GTTG--CAATAGCAAGCAACC---A-CAA--C-TTGTGTCCAACTT-A-AAA--AATa
gi|83603 : ATTTGA-CT----AATT--TT-TTTT--CAGTAGTA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--
gi|83604 : ATTTAA-CC----AATT--TT-GTTG--CCAAAGCA----AC------TAG--T-TTTTGTTTGACTG-A-AAA--GATcctaaa
gi|83605 : TTTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCACAGCA----CCT---T-CAATTT-TTTTGCCTGACTG-A-AAA--AATAAcaa
gi|83606 : TTTTA-CC----AATT--TT-GTTT--CCATCGCA----ACC---A-TAC--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83607 : TTTTG-CT----AATT--TT-GTTG--TCATAACA----ACCAATA-TAT--T-TTTTTTCCGAATG-A-AAA--AGTAA
gi|83608 : TTGTA-CT----TATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA----TTTTGTCTGGCTG---AAA--AATAA
gi|83609 : TTTA-CC----AATT--GT-GTTG--CCATAGTA----ACC---A-CAT--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83610 : TTTA-CC----AATT--TT-GCTG--CTATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCCAGCTG-A-AAA--AGTAAa
gi|83611 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCTTAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTCGTCCAACTA-A-GAA--
gi|83612 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CTACAGTA----ACC---A-CAA--T-TGATGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83613 : TTTA-TC----AATT--TT-GTTG--CCAGAGCA----CTC---A-AAA--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAAGTAATAA
gi|83614 : TTTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-AATTTTCTAAATG-A-AAC--AAa
gi|83615 : TTTA-CC----AATT--T--ATTG--CCATAGCA----ACC---G-CAA--T-ATTTTTCAGACTG-A-AAA--
gi|83616 : TTTA-TC----AGTT--TT-GTTA--CCAAAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCCACTG-A-AAAGTAATAAgtaaa
gi|83617 : TTTA-CC----AATT--TT-ATTG--CCATAGCA----GCC---A-CAA--T-TTTTGTAAAACAG-C-AAA--AATAAa
gi|83618 : TTTA-CC----TTTT--CT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTAAGACAG-A-AAA--AATAa
gi|83619 : TTA-AC----AAAT--TT-GTTG--CCATAGCT----ACC---A-CT---T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA
gi|83620 : TTA-CC----AATT--TT-GATG--CCATGGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTCAGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83621 : TTA-CC----AATT--TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAT--T-TTTTGTCTGAATA-A-AAA--AATAa
gi|83622 : TA-CC----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACT---G-CAA--T-TTTTATCAGACTA-T-AAT--AGTAA
gi|83623 : ----AGTT--TT-GTTG--TTATAGCA----ACC---A-CAC--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AATAA
gi|83624 : ----AATT--TT-GTTG--TCATGGCA----ACC---A-CAA--T-CTTTGTCCAACTG-A-AAA--AAAAAa
gi|83625 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-T-T--T-TTTTGTCCGACTG-A-AAA--AAa
gi|83626 : ----AGTT--TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTT
gi|83627 : ----AATT--TT-AT-GACCCATAGCA----ACC---A-TAA--T-TTTTGTCCGACTGAA-AAA--AATAAtt
gi|83628 : ----AATT--TT-GTTA--CCATAGCA----AGC---A-CAA--T-GTTAGTTGGACTG-A-AAA--AATAAa
gi|83629 : ATT--TT-ATTG--CTATAGCA----ACT---A-TAA--T-TTTTATCCTACTG-A-AAA--AAa
gi|83630 : --TT-GTTG--CCATAGCA----ACC---A-CAATTT-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83631 : --TT-GTTG--CCATAGCA----AAC---A-CAAT-T-TTTTGTCAG-CTG-A-AAA--AATAA
gi|83632 : TG--CCATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTTTGTTCAACTG-A-AGA--
gi|83633 : CATAGCA----ACC---A-CAA--T-TTCTGTCCGACTG-A-AAA--AGTAA