lowQualScore : 2222222222 1111111111111111111111 2222222222222222222222222222222 11111111111111111111 1111
lowQualScore : 2 2 11 3 222 11 1 666 11 22 11 1 11 0000000000 7777777777777777777777 1 33333333 222 1 2 1 777 5555555 3 0 4444444444444444444444444444444 0 11 22 555555 0 0 3333 1 11 1 4 1 0 0 2 0 2 4 3333 0 5555 11 3 33333333333333333333 6666 11 11 1 5555 11 0 22222 0 11 0
lowQualScore : . . .. . ... .. . ... .. .. .. . .. .......... ...................... . ........ ... . . . ... ....... . . ............................... . .. .. ...... . . .... . .. . . . . . . . . . .... . .... .. . .................... .... .. .. . .... .. . ..... . .. .
lowQualScore : 4 7 77 5 000 66 1 999 55 66 55 1 55 7777777777 7777777777777777777777 0 55555555 777 0 9 0 666 7777777 1 9 2222222222222222222222222222222 8 11 11 777777 8 8 2222 5 11 6 7 6 8 8 4 8 3 2 9999 8 6666 11 2 44444444444444444444 9999 99 99 6 9999 11 8 11111 9 22 9
consensus : TTAAGGTCAGCATC-GGANGCGTATAT---T--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--A-TTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCTA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------T-------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAATT
Reference ( gi|33404 ) : TTGAGGTCAACATC-GGAAGCGTATAT---T--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--A-TTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCCTA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGTCATCTTGA-T-------------T-------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAA---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAATT
gi|33387 : TTAAGGTCTGCATC-GGAAGCATATAT---T--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--C-TTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------T-------GTT-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T-GT-TG----GGAA-GAGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T------------------AA----A--AA--GTAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33386 : ctcatTTAAGGTCAGCATT-GGAAGCATATAT---T--TAAACAA-TAT-ATCC--TATTT--C--A-TTT--T-----TTT-TTTACTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-------TGCTATCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTCGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TG-----T-AAA--G-TAAGT
gi|33390 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-GGAAGCATATAT---T--TTAACAA-TGT-ATTC--TATTT--C--A-TTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--TTTTTT------TTAT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAAct
gi|33388 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-GAAAGCATATAT---T--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--A-TTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---TT-ATA-T-T---TTAC-------TGCCATCTTGA-T-------------TGTTGTTTTTT-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTACGATG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33394 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-GGAAGCATATAT---T--TAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--A-TTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-------TGCTATCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GCGCCAATT--TTAACGTTG-G--------------C-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--AA--GCAATT-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33397 : ctcatTTAAGGTTAGTACC-GGAAGCGTATAT---T--CAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--A---T--G-----TTT-ACTTCTTG---------------------CTTCATA-TATT--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATTTTGA-TTG-----------T-------TTT-TT----TGTAAA-T--A--TTTTGC------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATATTG-G-A-T-AACTTGTGGT-C-C-AATACT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-CAAAT--AT--G-Tgttagtaactgatatccaaaag
gi|33391 : ctcatTTAAGGTCAACATAAGGAAACGTATAT---T--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTC--C--A-TTT--T-----TTC-TTCCCTT----------------------TTTCCTA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT-----------TG----GGAA-GGGCCGGTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGTAGCCG---CA-TGT----A--T-A-C------------------AA----A--AA--GCAACA-AAAT---CA--G-TT-----T-AAA--G-T
gi|33392 : cccctttTTAAGATCAGCATA-GGAAACGTATAC---T--CAAACAA-TAC-ACCT--TTTTTTTC--A-TTT--T-----TTA-ACCCCTT----------------------CTTCCTG-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------TGC-----TTA-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-ACCTTGTGGC-C-C-AACTCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G--T-----T-AAA--G-TA
gi|33389 : ctcatTTAAGATCAGCATA-GGAAACGTATAT---T--CAAGCAA-TAC-CCCC--TTTTT--C--A-TGG--T-----TTA-CCC-CTT----------------------CTTCCTG-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-TGG-----------C-------TTA-TT----TGTAAA-T--A--CTATGT------T-GT-TG----GGAT-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACATGTGGC-C-C-AAACCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAAtttatgtttataattataaaattaaaaaaatattttattccaataaa
gi|33393 : ctcatTTGAGGTCAGCATC-GGATGTGTATAT---T--TAAACCA-TGT-ACCC--TATTT--C--A-TTT--T-----T----CTTTTTT---------------------CTTCCTA-AATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATTTTGG-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GTAGG----GGAA-GGGATAATT--TATATGTTA-A-T-T-TACTTGTGAC-T-C-AACCCT-TTTGTTAATA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----C--AA--ACAATG-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--A-TAAA
gi|33396 : cccatTTAAGGTCAGCATC-GGGAGTATATAT---T--TAAACAA-TGT-ACCT--TATTT--C--A--TT--T-----TTT-TCTTTTTT---------------------CTACCTA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA---------------G-------TGT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-CG----G---------GATT--TTAAAGTTT-G-A-T-AGCTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTAATACTA---CA-GGT----A--T-------A--------------AA----A--AA--G--ATATAAAA---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33398 : cccatTTAAGGTCAGCATA-GGAAACGTTTAT---T--CAAACAA-TAC-ACCC------------A-TTT--T-----TCC-CCT----A---------------------TTTCCTA-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------------CTTGA-T-------------TG------TTTATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-TT-TG----GGAA-GGGCCGATT--AAAATGTTT-A-C-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCCACAA---CA-TAT----A--T-A-C---G--------------AA----A--AA--GTAATT-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33385 : ctcgtTTGCAATCAGCATT-GGACGCGTATAT---T--TAAACAA-TGT-CCGC--TATTT--C--A-TTT--T----------CTTCTAT---------------------TTTCCTT-TATG--------A---AT-ATG-T-G---TTAT-------TGCCATCTGGA-T-------------T-------TTT-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGACACTT--TTAATGTTG-G-T-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTTTTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--AA---CAATA-ACAT---AT--G-TT-----T-ATA--A-TAATTTgtt
gi|33382 : ctcatTTGCAATCAGCATT-GGATGCGTATAT---T--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--A-TTT--T-----CTT-CCAT-TTA------------------------CCTT-TATA--------A---AT-ATGAT-TGTGTCAT-------TGCCATCTGGA-T-------------A-------TTT-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--AA---CAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--A-TAAATTttttatatgtttgatataaaagtactattatatttgctttattgttataaacaattaagtcatccacataatactaaatcatatgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaatagcttgcctcaagtttcttgaaaatgttctgggaataacatggt
gi|33395 : cccatTTAAGGTCAACATT-GGAGGCGTCTAT---T--AAAACAA-TGT---CC--CA-----C--AATTT--C-----TTT-TCTTC----------------------------CTA-TATG--------A---TA-ATG-T-T---TTGT-------TGCCATCTTGA-T-------------TG------TTC-TTA---TGTAAA-C--A--CTTTGT------T-GA-TG----GAAA-CG-TAGATT--GCAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACACT-TTTGCTATTC---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---TT--G--T-----T-AAA--ttatatgtttgatataaaagtactattatgtttgtattattcttataaacaattaagccatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaagtttgttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33383 : ctcatTTGCAATCAGCATT-GGATGCGTATAT---T--TAAACAA-TGC-CCTC--TATTT--C--A-TTT--T-----CTT-CCAT-TTA------------------------CCTT-TATA--------A---AT-ATGAT-TGTGTTCT-------TGCCATCTGGA-T-------------A-------TTT-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--AA---CAATA-AACT---AT--G-TT-----T-AAA--A-TAAGTTt
gi|33384 : cccatTTGCAATCAGCATT-GGATGCGTATAT---T--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--G-TTT--T-----CTT-CCAT-TTA------------------------CCTT-TAAA--------A---AT-ATGAT-TGTGTTAT-------TGCCATCTGGA-T-------------A-------TTT-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-C-TAAACCCG-TTTGCTATTT---TA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--AA---CAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--A-TAAATTttatatgtttgatataaaagtattattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcagaagagcttgccctcaggttttttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33401 : cccatTTAAGGTCAGCAAT-GGATGCGTATAT---T--TTCACAA-TGT-GCCC--TACTT--C--A-TTT--G-----TCT-TCTCC------------------------CTTCCAA-AATG--------A---AT-ATA-T-T---TTAT-------TGCCGTCTTGA-T-------------T-------GCTATG----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GGAA-AAGACTATT--TAAGTGTTG-T-A-T-TACTTGTGGT-C-C-GATCTT-TTTGCTGTTC---CA-T-T----A--T-A-T---A--------------TA----A--A--------A-AAAA---AT--G-TT-----TAAAA--G-TAAATttatatttttgatataaaagtactattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcaagtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaggtttcttgaaaatgatcagggaataacatggt
gi|33399 : catTTAAGGTTAGCATC-GGAAGCGTATAT---T--TTAACA--TGT-ATTC--TATTT--C--A-TTT--T-------T-TCTTCTTG---------------------CCTCATA-TATG--------A---AA-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATTTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCGATT--TTAagaaaaatagaaagtataattatat
gi|33402 : ctcatTTAAGGTGAACATC-GGGTGCGTATAT---T--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C------T--T-----TTT-TCTTCTT----------------------TTTCCTA-TATG--------A---AT-ATT-T-T---GTAT-------TGCCATCTTG--------------------------------------AA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGC
gi|33400 : catTTAAAGCCAGAATT-TGATGCGTGAAT---T--GAAACTA-TGT--CCC--TAATTA-C--A-TTT--C----------CTTCTGT---------------------TTTCCTT-CAAG--------A----------------TTAT-------T-TTATCTTGG-T-------------T-------ATT-TTA---TGCAAA-T--A--ATTTGT------T-GC-TT----GGA---GGT--ATT--TTAATGACG-A-A-T-AACTGATGGT-C-A-AATTAT-TTTTCTATTC---AA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCA--A-GAAA---GTTGG-TT-----T-AAA--ta
gi|33403 : ctcatTTAAGATCAGCATC-AGATCCGCATAT---T--TGAACAA-TGT-CGCC--TATT------A---T--C-----TTA-ACTTCTTT---------------------CTTCCTA-CATG--------A---AT-G-----T---TTAT-------TACTATCTTGA-T-------------T-------GTT-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-TT-TT----GAAA-GGGC
gi|33405 : atGTCAGCATT-GG----GT-TGTCTGT--TAAACAA-TGTCACAC--TATTT--C--A-TTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTG-TATG--------A---CT-AT----T---TTAG-------TGCCATCTTTA-T-------------TA------TTC-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCAGATT--TGAATGTTG-G-A-A-AAGGTGTTGC-C-T-AACATG-TTTGCTGTTC---CA-TAT----A--T-ACC---A--------------AA----A--AAT-GCAATT-AAAT---AG--G-AT-----T-AAA--GTTAAGTTtccctttgctatttcatgtaaacaaaaaagcaataaatatgttaagaacagtttagtagtttaa
gi|33408 : aTCAACATC-GGAAACAAATAT---T--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--A-TGT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCATA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTA------------------A-T-------------G-------TTT-TT----TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GT-TA----GGAA-GGGCCAATT--TTAATGTTG-A-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CG-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--T-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33407 : TCAACATT-GAATGCGTATAT---T--TAAACAA-TGT-CTCC--CATTT--C--A-TTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTG-TATG-------------------T-T---TTAT-------TGTCAACTTGA-T-------------TG------TTC-TTAATATGTTAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTCG-G-A-T-AACTTATGAC-C-C-TAACCT-TCTGCTATTC---CA-TGA----A--T-A-C---A--------------A--------------AATA-AAAT---GT--G-TT-----T-AAA--A-TAAA
gi|33409 : TCAACATT-AGAGGCGTTTAT---T--TAAACAA-TGT--CCCATTATTT--C--A-TTG--T--------------------------------------CTTTCTA-TATA--------A---TT-ATG-T-T---TTGT-------TGCCATCTTGA-T-------------T-------GTTGTTA---TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GA-TG----GGGA-CG-TCGATT--TTAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-GAAACT-TTTGCTATTC---CA-TGC----T--T-A-C---A--------------TA----A--AA--GCAATA-AAAC---AT--G-CT-----A-AAA--T-TAAgtttaaat
gi|33410 : TCAGCATC-GGATGCGTATAT---T--CAAATAA-CGA-ATTG--CATTT--C--A-TTT--T--------------------------------------CTTCCGA-TATG---------------ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTAA-T-------------T-------GTT-TTA---TGTAAA-T--G--TTTTGT------T-AT-T------------GTCGA-T--TTAATGTTA-A-T-T-AACGCGTAGC-C-G-AATGCT-TTTGTTA-TATTTCA-TGT----AATT-G-C------------------------A--AA--GCAATA-AAAC---AT--G-CT-----T-TAA--G-AAAA
gi|33413 : CGTATAT---T--TATTCAA-TGT-CCTC--CATTT--C--A-TTT--T--------------------------------------CTTCCTA-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCACCTTAA-T-------------G-------TTT-TCA---TGTTAA-T--A--TTTTTG------T-GT-TG----GGAA-GGACCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTATTC---CA-TGT----T--T-A-C---A--------------AT----A--AA--GCAATA-CAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAAgtgtaatcaaaccttatatattaattcagagaagtaatatt
gi|33411 : ataCGTACAT---T--TAAACAA-TGT---CC--CACA---C--A-GCT--T-----CTT-TCTCCTTGGTATATATTTATTTTAATCATCTTC--A-GATG--------A---AT-GTG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------T-------GTT-TTA---TGTCAA-T--A--ATTAAT------G-GT-TA----GGGA-GGGTCTATT--CCAATGTTG-G-A-T-AACATGTCAC-A-C-ACCCCT-TTTTCTAGAT---CA-TGC----A--T-A-C---A--------------AA----AC-AA--CCAATG-GAAT---AC--G-TC-----T-GAA--G--AAATaatcatttatatggatat
gi|33414 : agcattacataTATAT---A--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--A-TTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCATA-TATG--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------T--------------------AAA-T--A--GTTTG--------------------------CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAG--G-TAAGTaactttacttatttgaatata
gi|33406 : TATAT---T--TAAACAA-TTT-GTC-----TTC--T--A-TTT--TA----TTT-TCTTCTTT---------------------CTTCCCA-TATG--------A---GT-ATG-G-T---TTAT-------TGCCATCTTTG-T-------------G-------GTT-TCA---TG-----T--A--ATGTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCAATT--TGAATATTG-----T-A--TT-TAGCTC-C-AACCCT-TTTGTTATTT---AA-TGC----A--T-A-----A--------------AA----A--CA--GCAATA-AAAT---TT--GTTT-----T-AAAATG-TAAAaaagtatatattgaagagttttattgtttatctatttaattatt
gi|33412 : atcagcagagatgcacataTATAC---T--TAAACAT-TGT-CCAC--TAATT--C--A-TTG--T-----GTT-CATTCTT-----------------------TT--TA-TATG--------A---ATTATG-C-T---G-AT-------CGTCCTCTTGA-T-------------T-------GGC--------GTAAA-T--A--TTGTGT------T-GC-TG----GGAA-ACGACGGTT--TTAACGTTG-G-A-T-AATGTGTGGC-C-C-AACCAT-TTTGCTATTT---CA-TAT----A--at
gi|33415 : gatcccTGTAT---TACTAAACAA-TGT-AT------TTG--C--G-TT--------------CTACTCG---------------------TTT--TAGTA-G--------C---GT-ATA-TAT---TTGT-------TGCCATTTTAA-T-------------T-------ATA-ATA---TGTTAT-TTAA--ATTT--------T-GT-TA----GGGA-GGGCTGAAT--ATAATGTTG-GTA-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTC---CA-TTT----T--G-A-C-------------------A----G--AA--GCAATA-AAAC---AG--G-TT-----T-AAA--C-TA
gi|33416 : ATAT---C--TAAACAA-TGT-CCCC--TATTT--CCTA-TTTCAT-----TAT-TATTCTTT---------------------CTTCCAA-TACG--------A---AT-GT--T-T---TTAT-------TGTCATCTTGA-T-------------T-------TTT-GG----TGTAAA-T--A--ATCTGT------T-TT-TG----GGGA-G------------------G-A-A-T-AACGTGTGCC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTA---CA-TGT----A--T-G-C---A--------------AA----A--AA--GCTATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--A-TAAGTT
gi|33417 : AT---T--TAAAAAAATGT-CTCC--CATTT--C--A-TTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTA-TATGTAGGAAATAT--AT-ATG-T-T---TTAT-------GGCCACCTTGG-T-------------T-------GTT-TCA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCTC-GTTGCCATTC---TG-TGTATACA--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATT-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TA
gi|33418 : --TATTT--T--A-TTT--TACATATTTATCTTCTTG---------------------AA----A-TATG--------ATAAAT-GTA-T-T---GTAT-------T-TCATCTTGA-TCAATATTAA----T-------TTT-CTA---TATAAA-T--A----TT-T------T-GT-TG----GGAA-ATGCC--TTAATTAATGTTG-T-T-TGAAATTGTGGC-C---GACCCT-TTTGCTA--A---TT-TGTA---A--T-A-TTTGA--------------AA----C--AA--GC-------AA---AT--G-TT-----T-
gi|33419 : -----TTT-TCCCCCTT---------------------CTTCCTG-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------TGCCATCTTGA-T-------------TG------TTTATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TT----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGCTATTA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAttaaa
gi|33420 : -----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTTCTA-TATG--------A---GT-ATG-T-T---TTAT-------TGTCATCTTGA-TTGTTTGGTTGTTGT-------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T----------GAGA-GGTCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T----------------------AA----A--AT--GCAATG-GGAT---AT--G-TTATGTGT-AAA--G-TA
gi|33421 : TT-TCTTCTTT---------------------CTTCCTA-CATG--------A---TT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCGTCTTGA-T-------------TG------TTT-TT----TGTAAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----TGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---TT-TGT----A--T-ACC---A--------------AA----A--GAACGCAATATAAAT---AT--G-TT-----A-AAA--G-TAAA
gi|33422 : -TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCATTTTGA-G-------------T-------ATT-T------GTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATGTT--AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAAACTataaatt
gi|33423 : tttatt-TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCATTTTGA-G-------------T-------ATT-T------GTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATATGTTAA----A--AG--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAA
gi|33424 : tttattT-ATG-T-T-----AT-------TGCCACTTTGAATA------------T-------GTG-TT----TGT------------TTAT------T-GT-TG----GGAA-AGGCCGCTA--CTAATATTGCA-A-G-AACGTATGCC-C-T-GACCCA-TTTGCTA--A---TA-TGT----A--T-A-----A--------------TG----A--AA--ACAATA-Atgtgtatggtt
gi|33425 : atgtcAT-------TGCCATCTTGA-T-------------T-------CT------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AACTTGTAGC-C-C-AACCCG-TTTGCT--------A-TGT----G----------A--------------AT----T--AT--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAAcatactgcataataataatttt
gi|33426 : attgattgttaaaAT-------TGCCATCATGA-T-------------T-------CT------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AGCTTGTGGC-C-C-AACCCG-TTTGCTA-TG---TG-AGT-------T-A-T-------------------------------GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAAACT
gi|33427 : attgattgttaaa-------TGTCATTTTGA-T-------------A-------TTT-AA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAA-T-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T-----------------------------------GAAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAAAataaaatgattaatataaaaat
gi|33428 : -------TGTCATTTTGA-T-------------A-------TTT-TA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAAAT-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACCTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T-----------------------------------GAAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAGA
gi|33429 : -------TTT-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---TT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33431 : -------TTT-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTATGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--AA--GGAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33430 : -------TTT-TA----TATAAAAT--A--ATGTGT------T-GT-TG----GAGA-GG-CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-GACTTGTGGC-C-C-AACCCA-TTTGTTATTT---CA-T
gi|33433 : AAT-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCCGATT--TTA-CGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--AA--GCAATA-CAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAA
gi|33434 : -T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATTCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--AA--GCAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--G-TAAA
gi|33432 : -T--A--ATCTGT------A-G---G----GGAA-GGGCCGAAT--CTAATGTTG-GCA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT---------------A--------------AA----ATTAT--GAAATA-AAAT---AT--G-TT-----T-AAA--C-TAAgttaacacattagata
gi|33435 : ttatg----GGAA-TGGCCAAAT--CTAATGTTGAG-A-G-AACTTGTGGC-C-A-GACCCT-TTTGCT-TTA---AATTGT----A--T-
gi|33436 : TT--TTATTGTTG-G-A-T-AACTGGTCGC-C-C-AACCTT-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--T-A-----A--------------AA----A--CA--ACAACA-ATAAGCTAT--G-TT-----T-AAA--G-TAAAttgacttatatgcatgataaatattgtaatatgtgtttatttggcaataaaatatgtttaaactaaaataaaatttatat
gi|33403 : CCC-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--A-A-C---A--------------AA----A--AA--GCAAT--AAAT---AT--G-TT-----
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|33437 ): ACTAATAAATTTGTATCATACTGATGAACAATTACGCCATTTACTGAATATTAAATCAGATGACCAAGTTAGGTCCATGATGACCCAGGAGTGTTTTTCCTCAGGCCCCGTGGCAATG
Alignments
lowQualScore : 2222222222 1111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 2222 11 1 44 11 22 11 11 1111111111 2222222222222222222222 0 3333 1 33333333 222 0 0 0 444 1 0 333333333333333333333333333333333333 0 11 22 555555 0 0 3333 1 11 1 4 1 0 0 2 0 2 3 3333 0 5555 11 3 22222222222222222222 7777 11 0 11 1 0 0 22222 0 0 11 0
lowQualScore : .. . . .... .. . .. .. .. .. .. .......... ...................... . .... . ........ ... . . . ... . . .................................... . .. .. ...... . . .... . .. . . . . . . . . . .... . .... .. . .................... .... .. . .. . . . ..... . . .. .
lowQualScore : 99 3 0 5555 55 1 33 55 66 55 55 8888888888 9999999999999999999999 6 5555 0 55555555 666 9 9 9 222 7 9 777777777777777777777777777777777777 8 00 11 666666 8 8 1111 5 00 5 6 5 8 8 3 8 3 9 7777 8 5555 11 1 22222222222222222222 6666 99 8 99 6 8 8 00000 8 8 11 9
consensus : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
Reference ( family-426 ) : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
gi|33382 : TCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT---------TATA--------A---AT-ATGAT-TGTGTCAT-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATT
gi|33383 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCTC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTTTATAA--A-TATG--------A---TT-GTG-T-T---C--T-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AACTA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTTttatatgtttgatataaaagtactattatgtttgtattattcttataaacaattaagccatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaagtttgttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33384 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--GTTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT--TAAAAA-TATG--------A---TT-GTG-------TTAT-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-C-TAAACCCG-TTTGCTATTT---TA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATTttatatgtttgatataaaagtattattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcagaagagcttgccctcaggttttttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33385 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GACGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CCGC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTAT---------------------TTTCCT----T-TATG--------A---AT-ATG-T-G---TTAT-TGCCATCTGGA-T---------T-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGACACTT--TTAATGTTG-G-T-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTTTTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-ACATA-TG-TT-----T-AT-A--A-TAATTTttatatttttgatataaaagtactattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcaagtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaggtttcttgaaaatgatcagggaataacatggt
gi|33386 : ctcatttgcaaTTAAGGTCAGCATT-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TAT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TTTACTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-TGCTATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTCGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TG-----T-AA-A--G-TAAGTttttatatgtttgatataaaagtactattatatttgctttattgttataaacaattaagtcatccacataatactaaatcatatgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaatagcttgcctcaagtttcttgaaaatgttctgggaataacatggt
gi|33387 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--CTTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T-GT-TG----GGAA-GAGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T------------------AA----A--A-A--GTAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAct
gi|33388 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-AAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---TT-ATA-T-T---TTAC-TGCCATCTTGA-T---------TGTTGTTT------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTACGATG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33389 : ctcatTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATATT--CAAGCAA-TAC-CCCC--TTTTT--C--ATGG--T-----TTA-CC--CCTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-TGG-------C-------------TT---A-TT----TGTAAA-T--A--CTATGT------T-GT-TG----GGAT-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACATGTGGC-C-C-AAACCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33390 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TTAACAA-TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--TTTTTT------TTAT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33391 : ctcatTTAAGGTCAACATAAG-GAAACG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTC--C--ATTT--T-----TTC-TTCCCTTT----------------------TTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT-----------TG----GGAA-GGGCCGGTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGTAGCCG---CA-TGT----A--T-A-C------------------AA----A--A-A--GCAACA-AAATC-AG-TT-----T-AA-A--G-T
gi|33392 : cccctttTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATACT--CAAACAA-TAC-ACCT--TTTTTTTC--ATTT--T-----TTA-ACCCCTT----------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TGC-----------TT---A-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-ACCTTGTGGC-C-C-AACTCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG--T-----T-AA-A--G-TA
gi|33393 : ctcatTTGAGGTCAGCATC-G-GATGTG----TATATT--TAAACCA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----T----CTTTTTT---------------------CTTCCT----A-AATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATTTTGG-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GTAGG----GGAA-GGGATAATT--TATATGTTA-A-T-T-TACTTGTGAC-T-C-AACCCT-TTTGTTAATA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----C--A-A--ACAATG-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAtttatgtttataattataaaattaaaaaaatattttattccaataaa
gi|33394 : cccatTTAAGGTCAGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-TGCTATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GCGCCAATT--TTAACGTTG-G--------------C-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33395 : ctcatTTAAGGTCAACATT-G-GAGGCG----TCTATT--AAAACAA-TGT-CCCA--CA--------ATTT--C-----TTT-T----------------------------CTTCCT----A-TATG--------A---TA-ATG-T-T---TTGT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---C-TTA---TGTAAA-C--A--CTTTGT------T-GA-T-----GGAA-ACGTAGATT--GCAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACACT-TTTGCTATTC---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG--T-----T-AA-A--gttagtaactgatatccaaaag
gi|33396 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-GGAGTA----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCT--TATTT--C--A-TT--T-----TTT-TCTTTTTT---------------------CTACCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-----------G-------------TG---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-CG----G---------GATT--TTAAAGTTT-G-A-T-AGCTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTAATACTA---CA-GGT----A--T-------A--------------AA----A--A-A--GATATA-AAA-A-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAt
gi|33397 : cccatTTAAGGTTAGTACC-G-GAAGCG----TATATT--CAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATGT--T-----TA---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATT--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATTTTGA-T---------TGT-----------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--TTTTGC------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATATTG-G-A-T-AACTTGTGGT-C-C-AATACT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATACAAATA-TG-T
gi|33398 : ctcatTTAAGGTCAGCATA-G-GAAACG----TTTATT--CAAACAA-TAC-ACCC------------ATTT--T-----TCC-CCT----A---------------------TTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------CTTGA-T---------TG------------TT---TATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-TT-TG----GGAA-GGGCCGATT--AAAATGTTT-A-C-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCCACAA---CA-TAT----A--T-A-C---G--------------AA----A--A-A--GTAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33399 : ctcgtTTAAGGTTAGCATC-G-GAAGCG----TATATT--TTAACA--TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-------T-TCTTCTTG---------------------CCTCAT----A-TATG--------A---AA-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCGATT--TTAgtt
gi|33400 : ctcatTTAAAGCCAGAATT-T-GATGCG----TGAATT--GAAACTA-TGT--CCC--TAATTA-C--ATTT--C----------CTTCTGT---------------------TTTCCT----T-CAAG--------A---TT-AT----T---TTAT-------CTTGG-T---------T-------------AT---T-TTA---TGCAAA-T--A--ATTTGT------T-GC-TT----GGA---GGT--ATT--TTAATGACG-A-A-T-AACTGATGGT-C-A-AATTAT-TTTTCTATTC---AA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAGA-AAGTT-GG-TT-----T-AA-A--
gi|33401 : ctcatTTAAGGTCAGCAAT-G-GATGCG----TATATT--TTCACAA-TGT-GCCC--TACTT--C--ATTT--G-----T----CTTCTCC---------------------CTTCCA----A-AATG--------A---AT-ATA-T-T---TTAT-TGCCGTCTTGA-T---------T-------------GC---TATG----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GGAA-AAGACTATT--TAAGTGTTG-T-A-T-TACTTGTGGT-C-C-GATCTT-TTTGCTGTTC---CA-T-T----A--T-A-T---A--------------TA----A--A-A-------A-AAA-A-TG-TT-----TAAA-A--G-TAAAT
gi|33402 : catTTAAGGTGAACATC-G-GGTGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C-----T--T-----TTT-TCTTCTTT----------------------TTCCT----A-TATG--------A---AT-ATT-T-T---GTAT-TGCCATCTTG-------------------------------------------AA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCagaaaaatagaaagtataattatat
gi|33403 : catTTAAGATCAGCATC-A-GATCCG----CATATT--TGAACAA-TGT-CGCC--TATT------A--T--C-----TTA-ACTTCTTT---------------------CTTCCT----A-CATG--------A---AT-G-----T---TTAT-TACTATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-TT-TT----GAAA-GGGCta
gi|33403 : atCCC-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--A-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAT--AAATA-TG-TT-----tccctttgctatttcatgtaaacaaaaaagcaataaatatgttaagaacagtttagtagtttaa
gi|33404 : atttaagatcagcatcagatccgcatatttgaacaatgtcgcctattatcttaacttctttcttcctacatgaatgtttattactatcttgattgttttatgtaaataatttattttttgaaagggctTTGAGGTCAACATC-G-GAAGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAAAA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATTaagaacagtttagtagtttaa
gi|33405 : GTCAGCATT-G-GGT-TG----TCTGTT---AAACAA-TGTCACAC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---CT-AT----T---TTAG-TGCCATCTTTA-T---------TA------------TT---C-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCAGATT--TGAATGTTG-G-A-A-AAGGTGTTGC-C-T-AACATG-TTTGCTGTTC---CA-TAT----A--T-ACC---A--------------AA----A--A-AT-GCAATT-AAATA-GG-AT-----T-AA-A--GTTAAGTT
gi|33406 : aTCAGCA---GAGATGCACATATATATT--TAAACAA-TTT-GTC-----TTC--T--ATTT--TA----TTT-TCTTCTTT---------------------CTTCCC----A-TATG--------A---GT-ATG-G-T---TTAT-TGCCATCTTTG-T---------G-------------GT---T-TCA---TG-----T--A--ATGTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCAATT--TGAATATTG-----T-A--TT-TAGCTC-C-AACCCT-TTTGTTATTT---AA-TGC----A--T-A-----A--------------AA----A--C-A--GCAATA-AAATT-TGTTT-----T-AA-AATG-TAAA
gi|33407 : aTCAACATT-G-AATGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----G-TATG-------------------T-T---TTAT-TGTCAACTTGA-T---------TG------------TT---C-TTAATATGTTAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTCG-G-A-T-AACTTATGAC-C-C-TAACCT-TCTGCTATTC---CA-TGA----A--T-A-C---A--------------A---------------AATA-AAATG-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAat
gi|33408 : TCAACATC-G-GAAACA----AATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATGT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTA------------A-T---------G-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GT-TA----GGAA-GGGCCAATT--TTAATGTTG-A-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CG-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TT-TT-----T-AA-A--G-TAAAgtttaaat
gi|33409 : TCAACATT-A-GAGGCG----TTTATT--TAAACAA-TGT--CCCATTATTT--C--ATTG--T--------------------------------------CTTTCT----A-TATA--------A---TT-ATG-T-T---TTGT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---TGTTA---TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GA-TG----GGGA-CG-TCGATT--TTAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-GAAACT-TTTGCTATTC---CA-TGC----T--T-A-C---A--------------TA----A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----A-AA-A--T-TAA
gi|33410 : TCAGCATC-G-GATGCG----TATATT--CAAATAA-CGA-ATTG--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCG----A-TATG--------A-------TG-T-T---TTAT-TGCCATCTTAA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTAAA-T--G--TTTTGT------T-AT-T------------GTCGA-T--TTAATGTTA-A-T-T-AACGCGTAGC-C-G-AATGCT-TTTGTTA-TATTTCA-TGT----AATT-G-C------------------------A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----T-TA-A--G-AAAA
gi|33411 : AGCATT-A-CATACG----TACATT--TAAACAA-TGT-CCCA--CA-----C--AGCT--T-----CTT-TCTCCTTGGTATATATTTATTTTAATCATCTTC------A-GATG--------A---AT-GTG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTCAA-T--A--ATTAAT------G-GT-TA----GGGA-GGGTCTATT--CCAATGTTG-G-A-T-AACATGTCAC-A-C-ACCCCT-TTTTCTAGAT---CA-TGC----A--T-A-C---A--------------AA----AC-A-A--CCAATG-GAATA-CG-TC-----T-GA-A--G--AAATgtgtaatcaaaccttatatattaattcagagaagtaatatt
gi|33412 : ----TATACT--TAAACAT-TGT-CCAC--TAATT--C--ATTG--T-----GTT-CATTCTT-----------------------TT--T----A-TATG--------A---ATTATG-C-T---G-AT-CGTCCTCTTGA-T---------T-------------GG---C--------GTAAA-T--A--TTGTGT------T-GC-TG----GGAA-ACGACGGTT--TTAACGTTG-G-A-T-AATGTGTGGC-C-C-AACCAT-TTTGCTATTT---CA-TAT----A--aactttacttatttgaatata
gi|33413 : gatcccATACG----TATATT--TATTCAA-TGT-CCTC--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCACCTTAA-T---------G-------------TT---T-TCA---TGTTAA-T--A--TTTTTG------T-GT-TG----GGAA-GGACCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTATTC---CA-TGT----T--T-A-C---A--------------AT----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33414 : ----TATATA--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-----------------------------AAA-T--A--GTTTG--------------------------CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-G--G-TAAGTaatcatttatatggatat
gi|33415 : ----TGTATTACTAAACAA-TGT-A----------------TTT--G-----CGT-TCTACTCG---------------------TTT--T----AGTA-G--------C---GT-ATA-TAT---TTGT-TGCCATTTTAA-T---------T-------------AT---A-ATA---TGTTAT-TTAA--ATTT--------T-GT-TA----GGGA-GGGCTGAAT--ATAATGTTG-GTA-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTC---CA-TTT----T--G-A-C-------------------A----G--A-A--GCAATA-AAACA-GG-TT-----T-AA-A--C-TAaaagtatatattgaagagttttattgtttatctatttaattatt
gi|33416 : ATATC--TAAACAA-TGT-CCCC--TATTT--CCTATTTCAT-----TAT-TATTCTTT---------------------CTTCCA----A-TACG--------A---AT-GT--T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-GG----TGTAAA-T--A--ATCTGT------T-TT-TG----GGGA-G------------------G-A-A-T-AACGTGTGCC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTA---CA-TGT----A--T-G-C---A--------------AA----A--A-A--GCTATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTT
gi|33417 : ATT--TAAAAAAATGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----A-TATGTAGGAAATAT--AT-ATG-T-T---TTAT-GGCCACCTTGG-T---------T-------------GT---T-TCA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCTC-GTTGCCATTC---TG-TGTATACA--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TA
gi|33418 : --TATTT--T--ATTT--TACATATTTATCTTCTTG---------------------AA--------A-TATG--------ATAAAT-GTA-T-T---GTAT-T-TCATCTTGA-TCAATATTAAT-------------TT---T-CTA---TATAAA-T--A----TT-T------T-GT-TG----GGAA-ATGCC--TTAATTAATGTTG-T-T-TGAAATTGTGGC-C---GACCCT-TTTGCTA--A---TT-TGTA---A--T-A-TTTGA--------------AA----C--A-A--GC-----AAATG-TT-TT-----T-AA-A--
gi|33419 : -----TTT-TCCCCCTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---TATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TT----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGCTATTA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33420 : -----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTTCT----A-TATG--------A---GT-ATG-T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------TGTTTGGTTGTTGTTT---T-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T-G---------AGA-GGTCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T----------------------AA----A--A-T--GCAATG-GGATA-TG-TTATGTGT-AA-A--G-TA
gi|33421 : TT-TCTTCTTT---------------------CTTCCT----A-CATG--------A---TT-ATG-T-T---TTAT-TGCCGTCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----TGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---TT-TGT----A--T-ACC---A--------------AA----A--G-AACGCAATATAAATA-TG-TT-----A-AA-A--G-TAAA
gi|33422 : -TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCA-T---------T-------------TTGAGTATT----TGTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATGTT--AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACTataaatt
gi|33423 : tttatt-TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCA-T---------T-------------TTGAGTATT----TGTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATATGTTAA----A--A-G--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33424 : tttattT-ATG-T-T-----AT-TGCCACTTTGAATA--------T-------------GT---G-TT----TGT------------TTAT------T-GT-TG----GGAA-AGGCCGCTA--CTAATATTGCA-A-G-AACGTATGCC-C-T-GACCCA-TTTGCTA--A---TA-TGT----A--T-A-----A--------------TG----A--A-A--ACAATA-ACATACTG-CA-----T-AATA--A-TAATTTtgtgtatggtt
gi|33425 : atgtcAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------CT---------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AACTTGTAGC-C-C-AACCCG-TTTGCT--------A-TGT----G----------A--------------AT----T--A-T--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAt
gi|33426 : attgattgttaaaAT-TGCCATCATGA-T---------T-------------CT---------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AGCTTGTGGC-C-C-AACCCG-TTTGCTA-TG---TG-AGT-------T-A-T--------------------------------GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACT
gi|33427 : attgattgttaaa-TGTCATTTTGA-T---------A-------------TT---T-AA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAA-T-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAAataaaatgattaatataaaaat
gi|33428 : -TGTCATTTTGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAAAT-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACCTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAGA
gi|33429 : -------------TT---T-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33430 : -------------TT---T-TA----TATAAAAT--A--ATGTGT------T-GT-TG----GAGA-GG-CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-GACTTGTGGC-C-C-AACCCA-TTTGTTATTT---CA-T
gi|33431 : -------------TT---T-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTATGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GGAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33432 : -T--A--ATCTGT------A-G---G----GGAA-GGGCCGAAT--CTAATGTTG-GCA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT---------------A--------------AA----ATTA-T--GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33433 : ttatgAAT-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCCGATT--TTA-CGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33434 : -T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATTCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33435 : ----GGAA-TGGCCAAAT--CTAATGTTGAG-A-G-AACTTGTGGC-C-A-GACCCT-TTTGCT-TTA---AATTGT----A--T-gttaacacattagata
gi|33436 : TT--TTATTGTTG-G-A-T-AACTGGTCGC-C-C-AACCTT-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--T-A-A---A--------------AAC---A--ACA--ACAATA-AGCTA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAttgacttatatgcatgataaatattgtaatatgtgtttatttggcaataaaatatgtttaaactaaaataaaatttatat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33437 ): ACTAATAAATTTGTATCATACTGATGAACAATTACGCCATTTACTGAATATTAAATCAGATGACCAAGTTAGGTCCATGATGACCCAGGAGTGTTTTTCCTCAGGCCCCGTGGCAATG
Alignments
lowQualScore : 2222222222 1111111111111111111111 222222222222222222222222222222222222 11111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 2222 11 1 44 11 22 11 11 1111111111 2222222222222222222222 0 3333 1 33333333 222 0 0 0 444 1 0 333333333333333333333333333333333333 0 11 22 555555 0 0 3333 1 11 1 4 1 0 0 2 0 2 3 3333 0 5555 11 3 22222222222222222222 7777 11 0 11 1 0 0 22222 0 0 11 0
lowQualScore : .. . . .... .. . .. .. .. .. .. .......... ...................... . .... . ........ ... . . . ... . . .................................... . .. .. ...... . . .... . .. . . . . . . . . . .... . .... .. . .................... .... .. . .. . . . ..... . . .. .
lowQualScore : 99 3 0 5555 55 1 33 55 66 55 55 8888888888 9999999999999999999999 6 5555 0 55555555 666 9 9 9 222 7 9 777777777777777777777777777777777777 8 00 11 666666 8 8 1111 5 00 5 6 5 8 8 3 8 3 9 7777 8 5555 11 1 22222222222222222222 6666 99 8 99 6 8 8 00000 8 8 11 9
consensus : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
Reference ( family-426 ) : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
gi|33382 : TCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT---------TATA--------A---AT-ATGAT-TGTGTCAT-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATT
gi|33383 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCTC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTTTATAA--A-TATG--------A---TT-GTG-T-T---C--T-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AACTA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTTttatatgtttgatataaaagtactattatgtttgtattattcttataaacaattaagccatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaagtttgttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33384 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--GTTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT--TAAAAA-TATG--------A---TT-GTG-------TTAT-TGCCATCTGGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-C-TAAACCCG-TTTGCTATTT---TA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATTttatatgtttgatataaaagtattattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcagaagagcttgccctcaggttttttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33385 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GACGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CCGC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTAT---------------------TTTCCT----T-TATG--------A---AT-ATG-T-G---TTAT-TGCCATCTGGA-T---------T-------------TT---T-TA----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GAAA-GGGACACTT--TTAATGTTG-G-T-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTTTTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-ACATA-TG-TT-----T-AT-A--A-TAATTTttatatttttgatataaaagtactattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcaagtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaggtttcttgaaaatgatcagggaataacatggt
gi|33386 : ctcatttgcaaTTAAGGTCAGCATT-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TAT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TTTACTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-TGCTATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTCGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TG-----T-AA-A--G-TAAGTttttatatgtttgatataaaagtactattatatttgctttattgttataaacaattaagtcatccacataatactaaatcatatgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaatagcttgcctcaagtttcttgaaaatgttctgggaataacatggt
gi|33387 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--CTTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T-GT-TG----GGAA-GAGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T------------------AA----A--A-A--GTAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAct
gi|33388 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-AAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---TT-ATA-T-T---TTAC-TGCCATCTTGA-T---------TGTTGTTT------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTACGATG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33389 : ctcatTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATATT--CAAGCAA-TAC-CCCC--TTTTT--C--ATGG--T-----TTA-CC--CCTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-TGG-------C-------------TT---A-TT----TGTAAA-T--A--CTATGT------T-GT-TG----GGAT-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACATGTGGC-C-C-AAACCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33390 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TTAACAA-TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--TTTTTT------TTAT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTTATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33391 : ctcatTTAAGGTCAACATAAG-GAAACG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTC--C--ATTT--T-----TTC-TTCCCTTT----------------------TTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT-----------TG----GGAA-GGGCCGGTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGTAGCCG---CA-TGT----A--T-A-C------------------AA----A--A-A--GCAACA-AAATC-AG-TT-----T-AA-A--G-T
gi|33392 : cccctttTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATACT--CAAACAA-TAC-ACCT--TTTTTTTC--ATTT--T-----TTA-ACCCCTT----------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TGC-----------TT---A-TT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-ACCTTGTGGC-C-C-AACTCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG--T-----T-AA-A--G-TA
gi|33393 : ctcatTTGAGGTCAGCATC-G-GATGTG----TATATT--TAAACCA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----T----CTTTTTT---------------------CTTCCT----A-AATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATTTTGG-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GTAGG----GGAA-GGGATAATT--TATATGTTA-A-T-T-TACTTGTGAC-T-C-AACCCT-TTTGTTAATA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----C--A-A--ACAATG-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAtttatgtttataattataaaattaaaaaaatattttattccaataaa
gi|33394 : cccatTTAAGGTCAGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-TGCTATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GCGCCAATT--TTAACGTTG-G--------------C-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33395 : ctcatTTAAGGTCAACATT-G-GAGGCG----TCTATT--AAAACAA-TGT-CCCA--CA--------ATTT--C-----TTT-T----------------------------CTTCCT----A-TATG--------A---TA-ATG-T-T---TTGT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---C-TTA---TGTAAA-C--A--CTTTGT------T-GA-T-----GGAA-ACGTAGATT--GCAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACACT-TTTGCTATTC---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG--T-----T-AA-A--gttagtaactgatatccaaaag
gi|33396 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-GGAGTA----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCT--TATTT--C--A-TT--T-----TTT-TCTTTTTT---------------------CTACCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-----------G-------------TG---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-CG----G---------GATT--TTAAAGTTT-G-A-T-AGCTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTAATACTA---CA-GGT----A--T-------A--------------AA----A--A-A--GATATA-AAA-A-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAt
gi|33397 : cccatTTAAGGTTAGTACC-G-GAAGCG----TATATT--CAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATGT--T-----TA---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATT--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATTTTGA-T---------TGT-----------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--TTTTGC------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATATTG-G-A-T-AACTTGTGGT-C-C-AATACT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATACAAATA-TG-T
gi|33398 : ctcatTTAAGGTCAGCATA-G-GAAACG----TTTATT--CAAACAA-TAC-ACCC------------ATTT--T-----TCC-CCT----A---------------------TTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------CTTGA-T---------TG------------TT---TATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-TT-TG----GGAA-GGGCCGATT--AAAATGTTT-A-C-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCCACAA---CA-TAT----A--T-A-C---G--------------AA----A--A-A--GTAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33399 : ctcgtTTAAGGTTAGCATC-G-GAAGCG----TATATT--TTAACA--TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-------T-TCTTCTTG---------------------CCTCAT----A-TATG--------A---AA-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCGATT--TTAgtt
gi|33400 : ctcatTTAAAGCCAGAATT-T-GATGCG----TGAATT--GAAACTA-TGT--CCC--TAATTA-C--ATTT--C----------CTTCTGT---------------------TTTCCT----T-CAAG--------A---TT-AT----T---TTAT-------CTTGG-T---------T-------------AT---T-TTA---TGCAAA-T--A--ATTTGT------T-GC-TT----GGA---GGT--ATT--TTAATGACG-A-A-T-AACTGATGGT-C-A-AATTAT-TTTTCTATTC---AA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAGA-AAGTT-GG-TT-----T-AA-A--
gi|33401 : ctcatTTAAGGTCAGCAAT-G-GATGCG----TATATT--TTCACAA-TGT-GCCC--TACTT--C--ATTT--G-----T----CTTCTCC---------------------CTTCCA----A-AATG--------A---AT-ATA-T-T---TTAT-TGCCGTCTTGA-T---------T-------------GC---TATG----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TT----GGAA-AAGACTATT--TAAGTGTTG-T-A-T-TACTTGTGGT-C-C-GATCTT-TTTGCTGTTC---CA-T-T----A--T-A-T---A--------------TA----A--A-A-------A-AAA-A-TG-TT-----TAAA-A--G-TAAAT
gi|33402 : catTTAAGGTGAACATC-G-GGTGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C-----T--T-----TTT-TCTTCTTT----------------------TTCCT----A-TATG--------A---AT-ATT-T-T---GTAT-TGCCATCTTG-------------------------------------------AA-T--A--ATATGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCagaaaaatagaaagtataattatat
gi|33403 : catTTAAGATCAGCATC-A-GATCCG----CATATT--TGAACAA-TGT-CGCC--TATT------A--T--C-----TTA-ACTTCTTT---------------------CTTCCT----A-CATG--------A---AT-G-----T---TTAT-TACTATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-TT-TT----GAAA-GGGCta
gi|33403 : atCCC-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--A-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAT--AAATA-TG-TT-----tccctttgctatttcatgtaaacaaaaaagcaataaatatgttaagaacagtttagtagtttaa
gi|33404 : atttaagatcagcatcagatccgcatatttgaacaatgtcgcctattatcttaacttctttcttcctacatgaatgtttattactatcttgattgttttatgtaaataatttattttttgaaagggctTTGAGGTCAACATC-G-GAAGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAAAA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATTaagaacagtttagtagtttaa
gi|33405 : GTCAGCATT-G-GGT-TG----TCTGTT---AAACAA-TGTCACAC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---CT-AT----T---TTAG-TGCCATCTTTA-T---------TA------------TT---C-TTA---TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCAGATT--TGAATGTTG-G-A-A-AAGGTGTTGC-C-T-AACATG-TTTGCTGTTC---CA-TAT----A--T-ACC---A--------------AA----A--A-AT-GCAATT-AAATA-GG-AT-----T-AA-A--GTTAAGTT
gi|33406 : aTCAGCA---GAGATGCACATATATATT--TAAACAA-TTT-GTC-----TTC--T--ATTT--TA----TTT-TCTTCTTT---------------------CTTCCC----A-TATG--------A---GT-ATG-G-T---TTAT-TGCCATCTTTG-T---------G-------------GT---T-TCA---TG-----T--A--ATGTCT------T-AT-TG----GGAA-AGGCCAATT--TGAATATTG-----T-A--TT-TAGCTC-C-AACCCT-TTTGTTATTT---AA-TGC----A--T-A-----A--------------AA----A--C-A--GCAATA-AAATT-TGTTT-----T-AA-AATG-TAAA
gi|33407 : aTCAACATT-G-AATGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----G-TATG-------------------T-T---TTAT-TGTCAACTTGA-T---------TG------------TT---C-TTAATATGTTAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTCG-G-A-T-AACTTATGAC-C-C-TAACCT-TCTGCTATTC---CA-TGA----A--T-A-C---A--------------A---------------AATA-AAATG-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAat
gi|33408 : TCAACATC-G-GAAACA----AATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATGT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTA------------A-T---------G-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GT-TA----GGAA-GGGCCAATT--TTAATGTTG-A-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CG-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TT-TT-----T-AA-A--G-TAAAgtttaaat
gi|33409 : TCAACATT-A-GAGGCG----TTTATT--TAAACAA-TGT--CCCATTATTT--C--ATTG--T--------------------------------------CTTTCT----A-TATA--------A---TT-ATG-T-T---TTGT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---TGTTA---TGTAAA-T--A--CTTTGT------T-GA-TG----GGGA-CG-TCGATT--TTAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-GAAACT-TTTGCTATTC---CA-TGC----T--T-A-C---A--------------TA----A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----A-AA-A--T-TAA
gi|33410 : TCAGCATC-G-GATGCG----TATATT--CAAATAA-CGA-ATTG--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCG----A-TATG--------A-------TG-T-T---TTAT-TGCCATCTTAA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTAAA-T--G--TTTTGT------T-AT-T------------GTCGA-T--TTAATGTTA-A-T-T-AACGCGTAGC-C-G-AATGCT-TTTGTTA-TATTTCA-TGT----AATT-G-C------------------------A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----T-TA-A--G-AAAA
gi|33411 : AGCATT-A-CATACG----TACATT--TAAACAA-TGT-CCCA--CA-----C--AGCT--T-----CTT-TCTCCTTGGTATATATTTATTTTAATCATCTTC------A-GATG--------A---AT-GTG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------GT---T-TTA---TGTCAA-T--A--ATTAAT------G-GT-TA----GGGA-GGGTCTATT--CCAATGTTG-G-A-T-AACATGTCAC-A-C-ACCCCT-TTTTCTAGAT---CA-TGC----A--T-A-C---A--------------AA----AC-A-A--CCAATG-GAATA-CG-TC-----T-GA-A--G--AAATgtgtaatcaaaccttatatattaattcagagaagtaatatt
gi|33412 : ----TATACT--TAAACAT-TGT-CCAC--TAATT--C--ATTG--T-----GTT-CATTCTT-----------------------TT--T----A-TATG--------A---ATTATG-C-T---G-AT-CGTCCTCTTGA-T---------T-------------GG---C--------GTAAA-T--A--TTGTGT------T-GC-TG----GGAA-ACGACGGTT--TTAACGTTG-G-A-T-AATGTGTGGC-C-C-AACCAT-TTTGCTATTT---CA-TAT----A--aactttacttatttgaatata
gi|33413 : gatcccATACG----TATATT--TATTCAA-TGT-CCTC--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCACCTTAA-T---------G-------------TT---T-TCA---TGTTAA-T--A--TTTTTG------T-GT-TG----GGAA-GGACCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTATTC---CA-TGT----T--T-A-C---A--------------AT----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33414 : ----TATATA--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCAT----A-TATG--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-----------------------------AAA-T--A--GTTTG--------------------------CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-G--G-TAAGTaatcatttatatggatat
gi|33415 : ----TGTATTACTAAACAA-TGT-A----------------TTT--G-----CGT-TCTACTCG---------------------TTT--T----AGTA-G--------C---GT-ATA-TAT---TTGT-TGCCATTTTAA-T---------T-------------AT---A-ATA---TGTTAT-TTAA--ATTT--------T-GT-TA----GGGA-GGGCTGAAT--ATAATGTTG-GTA-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTC---CA-TTT----T--G-A-C-------------------A----G--A-A--GCAATA-AAACA-GG-TT-----T-AA-A--C-TAaaagtatatattgaagagttttattgtttatctatttaattatt
gi|33416 : ATATC--TAAACAA-TGT-CCCC--TATTT--CCTATTTCAT-----TAT-TATTCTTT---------------------CTTCCA----A-TACG--------A---AT-GT--T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-GG----TGTAAA-T--A--ATCTGT------T-TT-TG----GGGA-G------------------G-A-A-T-AACGTGTGCC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTA---CA-TGT----A--T-G-C---A--------------AA----A--A-A--GCTATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTT
gi|33417 : ATT--TAAAAAAATGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCT----A-TATGTAGGAAATAT--AT-ATG-T-T---TTAT-GGCCACCTTGG-T---------T-------------GT---T-TCA---TGTAAA-T--A--ATTTAT------T-GT-TG----GGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCTC-GTTGCCATTC---TG-TGTATACA--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TA
gi|33418 : --TATTT--T--ATTT--TACATATTTATCTTCTTG---------------------AA--------A-TATG--------ATAAAT-GTA-T-T---GTAT-T-TCATCTTGA-TCAATATTAAT-------------TT---T-CTA---TATAAA-T--A----TT-T------T-GT-TG----GGAA-ATGCC--TTAATTAATGTTG-T-T-TGAAATTGTGGC-C---GACCCT-TTTGCTA--A---TT-TGTA---A--T-A-TTTGA--------------AA----C--A-A--GC-----AAATG-TT-TT-----T-AA-A--
gi|33419 : -----TTT-TCCCCCTT---------------------CTTCCT----G-TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------TG------------TT---TATT----TGTAAA-T--A--ATATGT------T-GT-TT----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGCTATTA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33420 : -----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTTCT----A-TATG--------A---GT-ATG-T-T---TTAT-TGTCATCTTGA-T---------TGTTTGGTTGTTGTTT---T-TT----TGTAAA-T--A--ACTTGT------T-G---------AGA-GGTCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T----------------------AA----A--A-T--GCAATG-GGATA-TG-TTATGTGT-AA-A--G-TA
gi|33421 : TT-TCTTCTTT---------------------CTTCCT----A-CATG--------A---TT-ATG-T-T---TTAT-TGCCGTCTTGA-T---------TG------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATGTGT------T-GT-TG----TGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---TT-TGT----A--T-ACC---A--------------AA----A--G-AACGCAATATAAATA-TG-TT-----A-AA-A--G-TAAA
gi|33422 : -TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCA-T---------T-------------TTGAGTATT----TGTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATGTT--AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACTataaatt
gi|33423 : tttatt-TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCA-T---------T-------------TTGAGTATT----TGTAAT-T--C--ATTTTG------T-GT-AG----GGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATATGTTAA----A--A-G--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33424 : tttattT-ATG-T-T-----AT-TGCCACTTTGAATA--------T-------------GT---G-TT----TGT------------TTAT------T-GT-TG----GGAA-AGGCCGCTA--CTAATATTGCA-A-G-AACGTATGCC-C-T-GACCCA-TTTGCTA--A---TA-TGT----A--T-A-----A--------------TG----A--A-A--ACAATA-ACATACTG-CA-----T-AATA--A-TAATTTtgtgtatggtt
gi|33425 : atgtcAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------CT---------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AACTTGTAGC-C-C-AACCCG-TTTGCT--------A-TGT----G----------A--------------AT----T--A-T--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAt
gi|33426 : attgattgttaaaAT-TGCCATCATGA-T---------T-------------CT---------------AA-T--GTTATTTGTA-----T-AT-TGAAAGGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AGCTTGTGGC-C-C-AACCCG-TTTGCTA-TG---TG-AGT-------T-A-T--------------------------------GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACT
gi|33427 : attgattgttaaa-TGTCATTTTGA-T---------A-------------TT---T-AA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAA-T-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAAataaaatgattaatataaaaat
gi|33428 : -TGTCATTTTGA-T---------A-------------TT---T-TA----TGTAAA-C--A----TTGTAAAAAAT-GT-AG----GGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACCTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAGA
gi|33429 : -------------TT---T-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33430 : -------------TT---T-TA----TATAAAAT--A--ATGTGT------T-GT-TG----GAGA-GG-CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-GACTTGTGGC-C-C-AACCCA-TTTGTTATTT---CA-T
gi|33431 : -------------TT---T-TT----TGTTAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTATGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GGAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33432 : -T--A--ATCTGT------A-G---G----GGAA-GGGCCGAAT--CTAATGTTG-GCA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT---------------A--------------AA----ATTA-T--GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33433 : ttatgAAT-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----AGAA-GGGCCGATT--TTA-CGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33434 : -T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATTCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33435 : ----GGAA-TGGCCAAAT--CTAATGTTGAG-A-G-AACTTGTGGC-C-A-GACCCT-TTTGCT-TTA---AATTGT----A--T-gttaacacattagata
gi|33436 : TT--TTATTGTTG-G-A-T-AACTGGTCGC-C-C-AACCTT-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--T-A-A---A--------------AAC---A--ACA--ACAATA-AGCTA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAttgacttatatgcatgataaatattgtaatatgtgtttatttggcaataaaatatgtttaaactaaaataaaatttatat
blockSeqs : AA A T CATA AC A CA AT TT CT CA ACATATTTAT GGTATATATTTATTTTAATCAT AAAA TAGGAAAT TAA GT C TGTTTGGTTGTTGTTTTTT TA TT AAAAAA AAAG C AA C T A A A T ATTT ATAC AT G TATATATATATATGTT TTCT TT AC C ATGTG AT
blockSeqs : T . T . . . C . A . . ATTTT C AA . T GT C CAATATTAATTTTCTA . TT AAAAA AAAG C . A T A A A T T A . G TATATATATATGTT TTCT C T T . .
blockSeqs : T . C . . . C . . . . CTTC C . . . . . TGTTGTTTTTTTT . . A . . . . T . . A T T A . G TTTGA TTCT . . . . .
blockSeqs : T . A . . . C . . . . CTTC T . . . . . TGTTCTTAATA . . A . . . . T . . . C T A . . TAA C . . . . .
blockSeqs : T . A . . . A . . . . TTTT G . . . . . TTTGAGTATT . . . . . . . T . . . C A A . . CCA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TTTT G . . . . . TTTGAGTATT . . . . . . . C . . . C A . . . CCA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TTAC G . . . . . GGCTTATT . . . . . . . . . . . C A . . . TAA . . . . . .
blockSeqs : A . A . . . C . . . . TTCT T . . . . . TGCTTATT . . . . . . . . . . . C A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TTAA G . . . . . TGTTCTTA . . . . . . . . . . . C A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : A . A . . . A . . . . TTTT T . . . . . TGTTTTTT . . . . . . . . . . . C G . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . T . . . A . . . . TTTT T . . . . . TGTTTATT . . . . . . . . . . . A A . . . TA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TCCC G . . . . . TATTCTTA . . . . . . . . . . . C A . . . TG . . . . . .
blockSeqs : T . G . . . A . . . . TTTT T . . . . . TGTTGTTA . . . . . . . . . . . T A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . C . . . . TTAA G . . . . . TGTTTATT . . . . . . . . . . . C C . . . TG . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TTTT A . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . C A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : A . A . . . A . . . . CTTT G . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . C A . . . TA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . GTTC T . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . T A . . . TA . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . A . . . . CGTT C . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . T C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . G . . . . TATT T . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . T C . . . CG . . . . . .
blockSeqs : C . T . . . A . . . . TTTT T . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . C T . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . T . . . C . . . . TTTT G . . . . . TATTTTA . . . . . . . . . . . T A . . . TA . . . . . .
blockSeqs : C . A . . . A . . . . TT T . . . . . TGCTATG . . . . . . . . . . . T C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . G . . . . TT T . . . . . TGTTTTA . . . . . . . . . . . T T . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . C . . . . TT T . . . . . GGTTTCA . . . . . . . . . . . C C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . T . . . A . . . . TA G . . . . . TGTTTTA . . . . . . . . . . . T A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . A . . . A . . . . TT G . . . . . TGTTTTA . . . . . . . . . . . G C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : C . G . . . C . . . . TT G . . . . . GTTTTCA . . . . . . . . . . . T T . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . T . . . C . . . . TT T . . . . . TATAATA . . . . . . . . . . . T T . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . T . . . C . . . . T T . . . . . TGTTTCA . . . . . . . . . . . C C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : T . . . A . . . . T G . . . . . TGTTTTT . . . . . . . . . . . T A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . A . . . . . T . . . . . ATGTGTT . . . . . . . . . . . T C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . G . . . . . ATTTTA . . . . . . . . . . . T A . . . TG . . . . . .
blockSeqs : . . . C . . . . . T . . . . . ATTTTA . . . . . . . . . . . T C . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TTTTTA . . . . . . . . . . . C A . . . CA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . TGTTTT . . . . . . . . . . . C A . . . TA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GTGTTT . . . . . . . . . . . A A . . . AA . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . TTTTTT . . . . . . . . . . . A A . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . GTTTTT . . . . . . . . . . . C A . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . TTTTGG . . . . . . . . . . . T A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . ATTTAA . . . . . . . . . . . C A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . ATTTTA . . . . . . . . . . . C G . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . TGGC . . . . . . . . . . . C A . . . C . . . . . .
blockSeqs : . TCT . . . . . . . . . . . T T . . . A . . . . . .
blockSeqs : . TCT . . . . . . . . . . . T A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . A . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons : *** TGTTTTT***************************** **** ****
originalCons : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-T---------T-------------TT---T-TT----TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
finalCons : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCT----A-TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-TGCCATCTTGA-TTGTTTTT-----------------------------TGTAAA-T--A--ATTTGT------T-GT-TG----GGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33437 ): ACTAATAAATTTGTATCATACTGATGAACAATTACGCCATTTACTGAATATTAAATCAGATGACCAAGTTAGGTCCATGATGACCCAGGAGTGTTTTTCCTCAGGCCCCGTGGCAATG
Alignments
lowQualScore : 2222222222 1111111111111111111111 1111111111111111111 11111111111111111111
lowQualScore : 11 1 1 2222 11 1 44 11 22 11 11 3333333333 2222222222222222222222 0 4444 33333333 222 0 0 0 444 5555555 55555555555 333333 1111111111111111111 0 333 0 444444 0 0 1 11 444 1 0 0 2 0 2 3 3333 0 5555 11 3 22222222222222222222 7777 11 0 11 1 0 0 22222 0 0 11 0
lowQualScore : .. . . .... .. . .. .. .. .. .. .......... ...................... . .... ........ ... . . . ... ....... ........... ...... ................... . ... . ...... . . . .. ... . . . . . . . .... . .... .. . .................... .... .. . .. . . . ..... . . .. .
lowQualScore : 99 3 0 5555 55 1 33 55 66 55 55 6666666666 9999999999999999999999 6 3333 55555555 666 9 9 9 222 5555555 00000000000 444444 7777777777777777777 8 777 8 111111 8 8 5 00 222 5 8 8 3 8 3 9 7777 8 5555 11 1 22222222222222222222 6666 99 8 99 6 8 8 00000 8 8 11 9
consensus : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
Reference ( family-426 ) : TTAAGGTCAGCATC-G-GANGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTN---------------------CTTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATT
gi|33382 : TCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT--------TATA--------A---AT-ATGAT-TGTGTCAT-------TGCCATCTGGAT-----------ATT------T------------T-A----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TTGAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATT
gi|33383 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCTC--TATTT--C--ATTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTTTATAAA--TATG--------A---TT-GTG-T-T---CT---------TGCCATCTGGAT-----------ATT------T------------T-A----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TTGAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-CAA-AACCCT-TTTGCTATTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AACTA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTTttatatgtttgatataaaagtactattatgtttgtattattcttataaacaattaagccatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaagtttgttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33384 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GATGCG----TATATT--TAAACAA-TGC-CCGC--TATTT--C--GTTT--T-----CTT-CCATTTAC---------------------CTT--TAAAAATATG--------A---TT-GTG-T-T-----AT-------TGCCATCTGGAT-----------ATT------T------------T-A----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TTGAAA-GGGCCACTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGCGGC-C-TAAACCCG-TTTGCTATTT---TA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAATTttatatgtttgatataaaagtattattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcatgtgatcaaaatcctcctaagatggctcagaagagcttgccctcaggttttttgaaaatgttcagggaataacatggt
gi|33385 : cccatttgcaaTCAGCATT-G-GACGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CCGC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTAT---------------------TTTCCTT----TATG--------A---AT-ATG-T-G---TTAT-------TGCCATCTGGAT-----T------TT------T------------T-A----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TTGAAA-GGGACACTT--TTAATGTTG-G-T-T-AACTTGCAGC-CAA-AACCCT-TTTGCTTTTT---CA-TGTA---A--TGA-C---A--------------TATTCTA--A-A---CAATA-ACATA-TG-TT-----T-AT-A--A-TAATTTttatatttttgatataaaagtactattatatttgtattattcttataaacaattaagtcatccacataatactaaagcaagtgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaagagcttgccctcaggtttcttgaaaatgatcagggaataacatggt
gi|33386 : ctcatttgcaaTTAAGGTCAGCATT-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TAT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TTTACTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-------TGCTATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTCGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TG-----T-AA-A--G-TAAGTttttatatgtttgatataaaagtactattatatttgctttattgttataaacaattaagtcatccacataatactaaatcatatgatcaaaatcctcctaagatggctcaaaatagcttgcctcaagtttcttgaaaatgttctgggaataacatggt
gi|33387 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--CTTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----G-T------T------------T-T----TGTAAA-T---AACT-TGT------T-GT-TGGGAA-GAGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T------------------AA----A--A-A--GTAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAct
gi|33388 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-AAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---TT-ATA-T-T---TTAC-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTTGTTTTTT------------T-T----TGTAAA-T---AATA-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTTACGATG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33389 : ctcatTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATATT--CAAGCAA-TAC-CCCC--TTTTT--C--ATGG--T-----TTA-CC--CCTT---------------------CTTCCTG----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----G-----GCT------TA-----------T-T----TGTAAA-T---ACTA-TGT------T-GT-TGGGAT-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACATGTGGC-C-C-AAACCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33390 : ctcatTTAAGGTCTGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TTAACAA-TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTTTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---ATTT-TTT------TTAT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTTATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33391 : ctcatTTAAGGTCAACATAAG-GAAACG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTC--C--ATTT--T-----TTC-TTCCCTTT----------------------TTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT-----------TGGGAA-GGGCCGGTT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGTAGCCG---CA-TGT----A--T-A-C------------------AA----A--A-A--GCAACA-AAATC-AG-TT-----T-AA-A--G-T
gi|33392 : cccctttTTAAGATCAGCATA-G-GAAACG----TATACT--CAAACAA-TAC-ACCT--TTTTTTTC--ATTT--T-----TTA-ACCCCTT----------------------CTTCCTG----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GCT------TA-----------T-T----TGTAAA-T---AATA-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-ACCTTGTGGC-C-C-AACTCT-TTTGCTACCA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG--T-----T-AA-A--G-TA
gi|33393 : ctcatTTGAGGTCAGCATC-G-GATGTG----TATATT--TAAACCA-TGT-ACCC--TATTT--C--ATTT--T-----T----CTTTTTT---------------------CTTCCTA----AATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATTTTGGT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GTAGGGGAA-GGGATAATT--TATATGTTA-A-T-T-TACTTGTGAC-T-C-AACCCT-TTTGTTAATA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----C--A-A--ACAATG-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAtttatgtttataattataaaattaaaaaaatattttattccaataaa
gi|33394 : cccatTTAAGGTCAGCATC-G-GAAGCA----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATTT--T-------T-TCTTCTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAC-------TGCTATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GCGCCAATT--TTAACGT---------------TGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33395 : ctcatTTAAGGTCAACATT-G-GAGGCG----TCTATT--AAAACAA-TGT-CCCA--CA--------ATTT--C-----TTT-TCTTC----------------------------CTA----TATG--------A---TA-ATG-T-T---TTGT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------C------------T-TA---TGTAAA-C---ACTT-TGT------T-GA-T-GGAA-ACGTAGATT--GCAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACACT-TTTGCTATTC---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG--T-----T-AA-A--gttagtaactgatatccaaaag
gi|33396 : ctcatTTAAGGTCAGCATC-G-GGAGTA----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCT--TATTT--C--A-TT--T-----TTT-TCTTTTTT---------------------CTACCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGA------------GTG------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-CGG---------GATT--TTAAAGTTT-G-A-T-AGCTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTAATACTA---CA-GGT----A--T-------A--------------AA----A--A-A--GATATA-AAA-A-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAt
gi|33397 : cccatTTAAGGTTAGTACC-G-GAAGCG----TATATT--CAAACAA-TGT-ATCA--TATTT--C--ATGT--T-----TA---CTTCTTG---------------------CTTCATA----TATT--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATTTTGAT-----T-----GTT------T------------TTT----TGTAAA-T---ATTT-TGC------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAATATTG-G-A-T-AACTTGTGGT-C-C-AATACT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATACAAATA-TG-T
gi|33398 : ctcatTTAAGGTCAGCATA-G-GAAACG----TTTATT--CAAACAA-TAC-ACCC------------ATTT--T-----TCC-CCT----A---------------------TTTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------------CTTGAT-----T-----GTT------TA-----------T-T----TGTAAA-T---AATA-TGT------T-TT-TGGGAA-GGGCCGATT--AAAATGTTT-A-C-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCCACAA---CA-TAT----A--T-A-C---G--------------AA----A--A-A--GTAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33399 : ctcgtTTAAGGTTAGCATC-G-GAAGCG----TATATT--TTAACA--TGT-ATTC--TATTT--C--ATTT--T-------T-TCTTCTTG---------------------CCTCATA----TATG--------A---AA-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TCT------T-AT-TGGGAA-AGGCCGATT--TTAgtt
gi|33400 : ctcatTTAAAGCCAGAATT-T-GATGCG----TGAATT--GAAACTA-TGT--CCC--TAATTA-C--ATTT--C----------CTTCTGT---------------------TTTCCTT----CAAG--------A---TT-AT----T---TTAT-------------CTTGGT-----T-----ATT------T------------T-A----TGCAAA-T---AATT-TGT------T-GC-TTGGA---GGT--ATT--TTAATGACG-A-A-T-AACTGATGGT-C-A-AATTAT-TTTTCTATTC---AA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAGA-AAGTT-GG-TT-----T-AA-A--
gi|33401 : ctcatTTAAGGTCAGCAAT-G-GATGCG----TATATT--TTCACAA-TGT-GCCC--TACTT--C--ATTT--G-----T----CTTCTCC---------------------CTTCCAA----AATG--------A---AT-ATA-T-T---TTAT-------TGCCGTCTTGAT-----T-----GCT------A------------T-G----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TTGGAA-AAGACTATT--TAAGTGTTG-T-A-T-TACTTGTGGT-C-C-GATCTT-TTTGCTGTTC---CA-T-T----A--T-A-T---A--------------TA----A--A-A-------A-AAA-A-TG-TT-----TAAA-A--G-TAAAT
gi|33402 : catTTAAGGTGAACATC-G-GGTGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ACCC--TATTT--C-----T--T-----TTT-TCTTCTTT----------------------TTCCTA----TATG--------A---AT-ATT-T-T---GTAT-------TGCCATCTTG----------------------------------------------AA-T---AATA-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCagaaaaatagaaagtataattatat
gi|33403 : catTTAAGATCAGCATC-A-GATCCG----CATATT--TGAACAA-TGT-CGCC--TATT------ATCT--T-----AA---CTTCTTT---------------------CTTCCTA----CATG--------A---AT-GT--------TTAT-------TACTATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-A----TGTAAA-T---AATT-TAT------T-TT-TTGAAA-GGGCta
gi|33403 : atCCC-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--A-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAAT--AAATA-TG-TT-----tccctttgctatttcatgtaaacaaaaaagcaataaatatgttaagaacagtttagtagtttaa
gi|33404 : atttaagatcagcatcagatccgcatatttgaacaatgtcgcctattatcttaacttctttcttcctacatgaatgtttattactatcttgattgttttatgtaaataatttattttttgaaagggctTTGAGGTCAACATC-G-GAAGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGTCATCTTGAT-----T------TT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAAAA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAATTaagaacagtttagtagtttaa
gi|33405 : GTCAGCATT-G-GGT-TG----TCTGTT---AAACAA-TGTCACAC--TATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTG----TATG--------A---CT-AT----T---TTAG-------TGCCATCTTTAT-----T-----ATT------C------------T-TA---TGTAAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGAGAA-GGGCAGATT--TGAATGTTG-G-A-A-AAGGTGTTGC-C-T-AACATG-TTTGCTGTTC---CA-TAT----A--T-ACC---A--------------AA----A--A-AT-GCAATT-AAATA-GG-AT-----T-AA-A--GTTAAGTT
gi|33406 : aTCAGCA---GAGATGCACATATATATT--TAAACAA-TTT-GTC-----TTC--T--ATTT--TA----TTT-TCTTCTTT---------------------CTTCCCA----TATG--------A---GT-ATG-G-T---TTAT-------TGCCATCTTTGT-----G-----GTT------T------------C-A----TG-----T---AATG-TCT------T-AT-TGGGAA-AGGCCAATT--TGAATATTG-----T-A--TT-TAGCTC-C-AACCCT-TTTGTTATTT---AA-TGC----A--T-A-----A--------------AA----A--C-A--GCAATA-AAATT-TGTTT-----T-AA-AATG-TAAA
gi|33407 : aTCAACATT-G-AATGCG----TATATT--TAAACAA-TGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTG----TATG-------------------T-T---TTAT-------TGTCAACTTGAT-----T-----GTT------C------------T-TAATATGTTAA-T---AATG-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAATGTCG-G-A-T-AACTTATGAC-C-C-TAACCT-TCTGCTATTC---CA-TGA----A--T-A-C---A--------------A---------------AATA-AAATG-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAAat
gi|33408 : TCAACATC-G-GAAACA----AATATT--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATGT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCATA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTA------------------AT-----------GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---ACTT-TGT------T-GT-TAGGAA-GGGCCAATT--TTAATGTTG-A-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CG-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TT-TT-----T-AA-A--G-TAAAgtttaaat
gi|33409 : TCAACATT-A-GAGGCG----TTTATT--TAAACAA-TGT--CCCATTATTT--C--ATTG--T--------------------------------------CTTTCTA----TATA--------A---TT-ATG-T-T---TTGT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------G------------T-TA---TGTAAA-T---ACTT-TGT------T-GA-TGGGGA--CGTCGATT--TTAATGTTG-T-A-T-AACTTGTGGC-C-C-GAAACT-TTTGCTATTC---CA-TGC----T--T-A-C---A--------------TA----A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----A-AA-A--T-TAA
gi|33410 : TCAGCATC-G-GATGCG----TATATT--CAAATAA-CGA-ATTG--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCGA----TATG--------A-------TG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTAAT-----T-----GTT------T------------T-A----TGTAAA-T---GTTT-TGT------T-AT-T--------GTCGA-T--TTAATGTTA-A-T-T-AACGCGTAGC-C-G-AATGCT-TTTGTTA-TATTTCA-TGT----AATT-G-C------------------------A--A-A--GCAATA-AAACA-TG-CT-----T-TA-A--G-AAAA
gi|33411 : AGCATT-A-CATACG----TACATT--TAAACAA-TGT-CCCA--CA-----C--AGCT--T-----CTT-TCTCCTTGGTATATATTTATTTTAATCATCTTC--A----GATG--------A---AT-GTG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-A----TGTCAA-T---AATT-AAT------G-GT-TAGGGA-GGGTCTATT--CCAATGTTG-G-A-T-AACATGTCAC-A-C-ACCCCT-TTTTCTAGAT---CA-TGC----A--T-A-C---A--------------AA----AC-A-A--CCAATG-GAATA-CG-TC-----T-GA-A--G--AAATgtgtaatcaaaccttatatattaattcagagaagtaatatt
gi|33412 : ----TATACT--TAAACAT-TGT-CCAC--TAATT--C--ATTG--T-----GTT-CATTCTT-----------------------TT--TA----TATG--------A---ATTATG-C-T---G-AT-------CGTCCTCTTGAT-----T-----GGC---------------------------GTAAA-T---ATTG-TGT------T-GC-TGGGAA-ACGACGGTT--TTAACGTTG-G-A-T-AATGTGTGGC-C-C-AACCAT-TTTGCTATTT---CA-TAT----A--aactttacttatttgaatata
gi|33413 : gatcccATACG----TATATT--TATTCAA-TGT-CCTC--CATTT--C--ATTT--T--------------------------------------CTTCCTA----TATG--------A---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCACCTTAA------T-----GTT------T------------T-CA---TGTTAA-T---ATTT-TTG------T-GT-TGGGAA-GGACCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATCCT-TTTGCTATTC---CA-TGT----T--T-A-C---A--------------AT----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33414 : ----TATATA--TAAACAA-TGT-ATCC--TATTT--C--ATTT--T-----TT---CTTCTTG---------------------CTTCATA----TATG--------C---AT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-------------------------------------AAA-T---AGTT-TG----------------------CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-G--G-TAAGTaatcatttatatggatat
gi|33415 : ----TGTATTACTAAACAA-TGT-A----------------TTT--G-----CGT-TCTACTCG---------------------TTT--TAG---TA-G--------C---GT-ATA-TAT---TTGT-------TGCCATTTTAAT-----T-----ATA------A------------T-A----TGTTAT-TTA-AATT-T--------T-GT-TAGGGA-GGGCTGAAT--ATAATGTTG-GTA-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTC---CA-TTT----T--G-A-C-------------------A----G--A-A--GCAATA-AAACA-GG-TT-----T-AA-A--C-TAaaagtatatattgaagagttttattgtttatctatttaattatt
gi|33416 : ATATC--TAAACAA-TGT-CCCC--TATTT--CCTATTTCAT-----TAT-TATTCTTT---------------------CTTCCAA----TACG--------A---AT-GT--T-T---TTAT-------TGTCATCTTGAT-----T------TT------T------------G-G----TGTAAA-T---AATC-TGT------T-TT-TGGGGA-G------------------G-A-A-T-AACGTGTGCC-C-C-AACCCT-GTTGCTGTTA---CA-TGT----A--T-G-C---A--------------AA----A--A-A--GCTATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--A-TAAGTT
gi|33417 : ATT--TAAAAAAATGT-CTCC--CATTT--C--ATTT--T----------CTTCTTT---------------------CTTCCTA----TATGTAGGAAATAT--AT-ATG-T-T---TTAT-------GGCCACCTTGGT-----T-----GTT------T------------C-A----TGTAAA-T---AATT-TAT------T-GT-TGGGAA-GGGCTGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCTC-GTTGCCATTC---TG-TGTATACA--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATT-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TA
gi|33418 : --TATTT--T--ATTT--TACATATTTATCTTCTTG---------------------AA----A----TATG--------ATAAAT-GTA-T-T---GTAT-------T-TCATCTTGATCAA--T-----ATTAA----T------------T-T----TCTATA-T---AAATATTT------T-GT-TGGGAA-ATGCC--TTAATTAATGTTG-T-T-TGAAATTGTGGC-C---GACCCT-TTTGCTA--A---TT-TGTA---A--T-A-TTTGA--------------AA----C--A-A--GC-----AAATG-TT-TT-----T-AA-A--
gi|33419 : -----TTT-TCCCCCTT---------------------CTTCCTG----TATG--------A---AT-ATG-C-T---TTAT-------TGCCATCTTGAT-----T-----GTT------TA-----------T-T----TGTAAA-T---AATA-TGT------T-GT-TTGGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-A-AACCCT-TTTGCTATTA---CA-TGT----A--T-A-T---G--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33420 : -----TTT-TCTTCTTG---------------------CTTTCTA----TATG--------A---GT-ATG-T-T---TTAT-------TGTCATCTTGAT-----T-----GTT------TGGTTGTTGTTTTT-T----TGTAAA-T---AACT-TGT------T-G-----AGA-GGTCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGAC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T----------------------AA----A--A-T--GCAATG-GGATA-TG-TTATGTGT-AA-A--G-TA
gi|33421 : TT-TCTTCTTT---------------------CTTCCTA----CATG--------A---TT-ATG-T-T---TTAT-------TGCCGTCTTGAT-----T-----GTT------T------------T-T----TGTAAA-T---AATG-TGT------T-GT-TGTGAA-GGGCCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---TT-TGT----A--T-ACC---A--------------AA----A--G-AACGCAATATAAATA-TG-TT-----A-AA-A--G-TAAA
gi|33422 : ----TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCATTTTGAG-----T-----ATT------T--------------------GTAAT-T---CATT-TTG------T-GT-AGGGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGT-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATGTT--AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACTataaatt
gi|33423 : tttatt----TAT---------A---AT-ATG-T-TGT-TTATCTGCAATTGTCATTTTGAG-----T-----ATT------T--------------------GTAAT-T---CATT-TTG------T-GT-AGGGAA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-GTA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTATA---TA-TGT----A--T-A-T---ATATATATATATGTTAA----A--A-G--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33424 : tttattT-ATG-T-T-----AT-------TGCCACTTTGAA-----T-----ATG------TG-----------T-T----TGT-----------T-TAT------T-GT-TGGGAA-AGGCCGCTA--CTAATATTGCA-A-G-AACGTATGCC-C-T-GACCCA-TTTGCTA--A---TA-TGT----A--T-A-----A--------------TG----A--A-A--ACAATA-ACATACTG-CA-----T-AATA--A-TAATTTtgtgtatggtt
gi|33425 : atgtcAT-------TGCCATCTTGATTCTAAT-----GTT------A------------T-T----TGTATA-TTGAAA------------------GGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTGCT-A-G-AACTTGTAGC-C-C-AACCCG-TTTGCT--------A-TGT----G----------A--------------AT----T--A-T--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAt
gi|33426 : attgattgttaaaAT-------TGCCATCATGAT-----TCTAATGTT------A------------T-T----TGTATA-TTGAAA------------------GGGGA-GGGCCGTAA--CTAATGTTG-CTA-G-AGCTTGTGGC-C-C-AACCCG-TTTGCTA-TG---TG-AGT-------T-A-T--------------------------------GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAACT
gi|33427 : attgattgttaaa-------TGTCATTTTGAT-----------ATT------T------------A-A----TGTAAA-C---A--T-TGTAAAAA-T-GT-AGGGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAAAataaaatgattaatataaaaat
gi|33428 : -------TGTCATTTTGAT-----------ATT------T------------T-A----TGTAAA-C---A--T-TGTAAAAAAT-GT-AGGGGACGGGCCGAAC--CTAATGTTG-A-AAG-AACCTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT-------T------------------------------------GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAGA
gi|33429 : TT------T------------T-T----TGTTAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATT-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33430 : TT------T------------T-A----TATAAAAT---AATG-TGT------T-GT-TGGAGA-GG-CCGATT--TTAATGTTG-G-A-T-GACTTGTGGC-C-C-AACCCA-TTTGTTATTT---CA-T
gi|33431 : TT------T------------T-T----TGTTAA-T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-AG-CTGATT--TTA-----------T-AACTTATGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-C---A--------------AA----A--A-A--GGAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33432 : -T---AATC-TGT------A-G---GGGAA-GGGCCGAAT--CTAATGTTG-GCA-G-AACTTGTGGC-C-C-AACCCCATTT----------CA-TGT---------------A--------------AA----ATTA-T--GAAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--C-TAA
gi|33433 : ttatgAAT-T---AATT-TGT------T-GT-TGAGAA-GGGCCGATT--TTA-CGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AACCCT-TTTGCTTCTA---CA-TGT----A--T-A-TA--A--------------AA----A--A-A--GCAATA-CAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAA
gi|33434 : -T---AATT-TGT------T-GT-TGGGAA-GGGCCGATT--TTAACGTTG-G-A-T-AACTTGTGGC-C-C-AATTCT-TTTGCTACTA---CA-TGT----A--T-A-T---A--------------AA----A--A-A--GCAATA-AAATA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAA
gi|33435 : GGAA-TGGCCAAAT--CTAATGTTGAG-A-G-AACTTGTGGC-C-A-GACCCT-TTTGCT-TTA---AATTGT----A--T-gttaacacattagata
gi|33436 : TT--TTATTGTTG-G-A-T-AACTGGTCGC-C-C-AACCTT-TTTGCTATTT---CA-TGT----A--T-A-A---A--------------AAC---A--ACA--ACAATA-AGCTA-TG-TT-----T-AA-A--G-TAAAttgacttatatgcatgataaatattgtaatatgtgtttatttggcaataaaatatgtttaaactaaaataaaatttatat
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|33437 ): ACTAATAAATTTGTATCATACTGATGAACAATTACGCCATTTACTGAATATTAAATCAGATGACCAAGTTAGGTCCATGATGACCCAGGAGTGTTTTTCCTCAGGCCCCGTGGCAATG