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gi|101655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACTTGGCTATTTATTTTCCGAGATCTGGAGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-AGA----------AAAAAAATGAAAAAAGTATCTAATTTTGATCATTTTTTT-CAGAGACATATA-AATAGAGATAGGCAACTGGA-----------------------------GGCA-----C-------TTG-------------TC--T-----A-----------A--AT---T---T-AAG-CTTATTT----A-TTTTACTTTGATAG-GATACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTTCTGGGTATAACCAGTA--------CTAAGCATA------TATGTG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGTCGTGGCGGAGGATCGA---ACCCATAACCCTCCGATCAT-GGGTTTGGTGCTC-ACCACT----AGACCACATGGC---GTTT-TCTAAATCATGG-AACTCACATCCTCCAGAAACAAACAACATA-TTTGTGTGATTATGGTATCAAAAGAAAGGGAT-TGATTGTAAA-TTTGGGAGATT-C-AT--TTTT-CTTTTTTGATTTTAAAGAAATGAGGAATTTTTACGCTTaatgttattt
gi|101657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGAGATCTTGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCTTTATTTTAGAGATCTAGGGATATTTTCCTTG---------AA-GAA----------AAAAAA---------GTAC----------TTAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAAGCAACTCGAGGCA----CTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CA---T--TTGAC----AT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-AAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAGCTTA-GACTAATCACGCTCGAAGTGTCTTGCTCA--AGAAC----A--------CCACACATAGTAGT-T--GCG-G-Aaacgttattt
gi|101657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---AA-GTGTCTTGCTC---AAGA--ACACCACACATAGTAGTTGCGGAGGATCGA---ACTCACGACCTTCCGATCAT-GGGTTTGATGCACTACCACT----AGACCACGTGGC---GTTT-TCTAAATCATGGATACATAACTCCCCCAAAATCAAACAACATATTTTTTGTGATTATGGTATCATAGGAAACGGCT-TG-------G-TT------------GT--TTTT-CTTGTTTAAATTTAAAGAAATGTAGAGTTTTT-ggatcgaactcacgaccttccgatcatgggtttgatgcactaccactagaccacgtggcgttttctaaatcatggatacataactcccccaaaatcaaacaacatattttttgtgattatggtatcataggaaacggcttggttgtttttcttgtttaaatttaaagaaatgtagagtttttacgct
gi|101659                     : tttgagatcttgagaacatggccatttattttcagagatctggggaacattggccattactttcagagatccagggatcaaaggctttattttagagatctagggatattttccttgaagaaaaaaaagtacttaattttatcagagacatataaacagagataagcaactcgaggcacttgtctaaatttcaggtggcacatttgacattttctagtttagtttaaacttatttattttacttcgattgtgaaacaagttcttacagcttagactaatcacgctcgTTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATATAAGGCTACTGTCCTT----------AA-AGT----------AAAAAA---------GGACCTAATTT-GATCAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCA----CGTGTCTAAATT---TCAGTTGGCA-----CA---T--CTGAC----TT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---C-GAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAGCTTA-GACAAA-CATGCTCGAA--GTCTTCCTGGGTATAACCAGTA--------CTAAGCATA------T--GTG-G-AAA---AA-GTGTCTTTCTC---AAGG--ACACCACACATAGTCGTGGC-GAATAT-----------CGACCCTCCGATCAacgct
gi|101662                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGCTCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGACTATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCTTA-TTTAAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-TAA----------AAAGAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAAGCAACTGAAGGCA----CTTGTCTAAATT---TCAGGTGACA-----CAT--T--TTGGC----TT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-GAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACGACTTC-GACAAATCACGCTCGAA--GTCT
gi|101666                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTTGCCATTACTTTCAGAGATTCAGGGATCAAAGGCTTAATTTAAGAGATCTAGGGATATTGTCCTCAAAGAAAAAAAA-AGA----------AAAAAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTCAT-CAGACACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCAAAATTTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CAT--T--TT-GC----GT--TT-TC--T-----A--
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gi|101709                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCA----CTTGACTAAATT---TCAAATGGCA-----CAT--T--T-GGC----GT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-TAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTCCTGGGTATAACCAGTACTAAAGTACTAAGCATA------T--GTG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGCTGTGGCAGAGGATCGA---ACCCACGTCCCTCCGATCAT-GGGTTCGGTGCTCTACCACA----AGACCACGTGGT---GTTT-TCTAATTCATGGAAACACAACTCCTCCAAAATTAAACAACATA-TTTTTGTGATTATGGTATCAAACGAAATGGCTATG---------TTTGGaatgttattt
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gi|101655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACTTGGCTATTTATTTTCCGAGATCTGGAGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-AGA----------AAAAAAATGAAAAAAGTATCTAATTTTGATCATTTTTTT-CAGAGACATATA-AATAGAGATAGGCAACTGGA-----------------------------GGCA-----C-------TTG-------------TC--T-----A-----------A--AT---T---T-AAG-CTTATTT----A-TTTTACTTTGATAG-GATACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTTCTGGGTATAACCAGTA--------CTAAGCATA------TATGTG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGTCGTGGCGGAGGATCGA---ACCCATAACCCTCCGATCAT-GGGTTTGGTGCTC-ACCACT----AGACCACATGGC---GTTT-TCTAAATCATGG-AACTCACATCCTCCAGAAACAAACAACATA-TTTGTGTGATTATGGTATCAAAAGAAAGGGAT-TGATTGTAAA-TTTGGGAGATT-C-AT--TTTT-CTTTTTTGATTTTAAAGAAATGAGGAATT-TTTACGCTTaatgttattt
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gi|101657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---AA-GTGTCTTGCTC---AAGA--ACACCACACATAGTAGTTGCGGAGGATCGA---ACTCACGACCTTCCGATCAT-GGGTTTGATGCACTACCACT----AGACCACGTGGC---GTTT-TCTAAATCATGGATACATAACTCCCCCAAAATCAAACAACATATTTTTTGTGATTATGGTATCATAGGAAACGGCT-TG-------G-TT------------GT--TTTT-CTTGTTTAAATTTAAAGAAATGTAGAGTT-TTTACGCTggatcgaactcacgaccttccgatcatgggtttgatgcactaccactagaccacgtggcgttttctaaatcatggatacataactcccccaaaatcaaacaacatattttttgtgattatggtatcataggaaacggcttggttgtttttcttgtttaaatttaaagaaatgtagagtttttacgct
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gi|101655                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACTTGGCTATTTATTTTCCGAGATCTGGAGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-AGA----------AAAAAAATGAAAAAAGTATCTAATTTTGATCATTTTTTT-CAGAGACATATA-AATAGAGATAGGCAACTGGA-----------------------------GGCA-----C-------TTG-------------TC--T-----A-----------A--AT---T---T-AAG-CTTATTT----A-TTTTACTTTGATAG-GATACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTTCTGGGTATAACCAGTA--------CTAAGCATA------TATGTG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGTCGTGGCGGAGGATCGA---ACCCATAACCCTCCGATCAT-GGGTTTGGTGCTC-ACCACT----AGACCACATGGC---GTTT-TCTAAATCATGG-AACTCACATCCTCCAGAAACAAACAACATA-TTTGTGTGATTATGGTATCAAAAGAAAGGGAT-TGATTGTAAA-TTTGGGAGATT-C-AT--TTTT-CTTTTTTGATTTTAAAGAAATGAGGAATT-TTTACGCTTaatgttattt
gi|101657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTTGAGATCTTGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCTTTATTTTAGAGATCTAGGGATATTTTCCTTG---------AA-GAA----------AAAAAA---------GTAC----------TTAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAAGCAACTCGAGGCA----CTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CA---T--TTGAC----AT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-AAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAGCTTA-GACTAATCACGCTCGAAGTGTCTTGCTCA--AGAAC----A--------CCACACATAGTAGT-T--GCG-G-Aaacgttattt
gi|101657                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ---AA-GTGTCTTGCTC---AAGA--ACACCACACATAGTAGTTGCGGAGGATCGA---ACTCACGACCTTCCGATCAT-GGGTTTGATGCACTACCACT----AGACCACGTGGC---GTTT-TCTAAATCATGGATACATAACTCCCCCAAAATCAAACAACATATTTTTTGTGATTATGGTATCATAGGAAACGGCT-TG-------G-TT------------GT--TTTT-CTTGTTTAAATTTAAAGAAATGTAGAGTT-TTTACGCTggatcgaactcacgaccttccgatcatgggtttgatgcactaccactagaccacgtggcgttttctaaatcatggatacataactcccccaaaatcaaacaacatattttttgtgattatggtatcataggaaacggcttggttgtttttcttgtttaaatttaaagaaatgtagagtttttacgct
gi|101659                     : tttgagatcttgagaacatggccatttattttcagagatctggggaacattggccattactttcagagatccagggatcaaaggctttattttagagatctagggatattttccttgaagaaaaaaaagtacttaattttatcagagacatataaacagagataagcaactcgaggcacttgtctaaatttcaggtggcacatttgacattttctagtttagtttaaacttatttattttacttcgattgtgaaacaagttcttacagcttagactaatcacgctcgTTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATATAAGGCTACTGTCCTT----------AA-AGT----------AAAAAA---------GGACCTAATTT-GATCAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCA----CGTGTCTAAATT---TCAGTTGGCA-----CA---T--CTGAC----TT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---C-GAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAGCTTA-GACAAA-CATGCTCGAA--GTCTTCCTGGGTATAACCAGTA--------CTAAGCATA------T--GTG-G-AAA---AA-GTGTCTTTCTC---AAGG--ACACCACACATAGTCGTGGC-GAATAT-----------CGACCCTCCGATCA
gi|101662                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGCTCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGACTATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCTTA-TTTAAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-TAA----------AAAGAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAAGCAACTGAAGGCA----CTTGTCTAAATT---TCAGGTGACA-----CAT--T--TTGGC----TT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-GAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACGACTTC-GACAAATCACGCTCGAA--GTCT
gi|101666                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTTGCCATTACTTTCAGAGATTCAGGGATCAAAGGCTTAATTTAAGAGATCTAGGGATATTGTCCTCAAAGAAAAAAAA-AGA----------AAAAAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTCAT-CAGACACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCAAAATTTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CAT--T--TT-GC----GT--TT-TC--T-----A--
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blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . TA   .           T                                                                                                .                .             A                                                           AAT                                                         .      .                                           .                                .  AT                  . G  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . C    .           G                                                                                                .                .             G                                                           AAT                                                         .      .                                           .                                .  A                   . A  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           A   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           AAT                                                         .      .                                           .                                .  A                   . A  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           A   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  A                   . A  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           G   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  A                   . G  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           A   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  G                   . C  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  A                   . T  .     .                           . .
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           A   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  .                   . A  .     .                              
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .  .                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           A   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                           .                                .                                                                
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                                                                                                                             
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    .           T   .               .                   .            .            .                        .               .            .       .  .      .     .   .  .  .     .    . .    .           .                                                                                                .                .             A                                                           .                                                           .      .                                                                                                                                             
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Reference ( family-42 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTGGCCATTACTTTCAGAGATCCAGGGATCAAAGGCCTAATTTTAGAGATCTAGGGATATTGTCCTT----------AA-TGA----------AAAAAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTTAT-CAGAGACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCA----CTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CAT--T--TTGGC----TT--TT-TC--T-----A--GTT-T----A--GT---T---T-AAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTCCTGGGTAGAACCAGTA--------CTAAGCATA------T--GCG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGCCGTGGCGGAGGATCGA---ACCCACGACCCTCCGATCAT-GGGTTCGGTGCTCTACCACT----GGACCACGCGGC---GTTT-TCTAAATCATGGAAACACACATCCTCCAGAATCAAACAACATA-TTTTTGTGATTATGGTATCAAAAGAAAGGGCT-TG-------A-TTTGGGAGATT-A-NT--TTTT-CTTTTTTAAATTTAAAGAAATGAAGAA-T-TTTACGCTTT
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gi|101666                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTGGAGATCTGGAGAACATGGCCATTTATTTTCAGAGATCTGGGGAACATTTGCCATTACTTTCAGAGATTCAGGGATCAAAGGCTTAATTTAAGAGATCTAGGGATATTGTCCTCAAAGAAAAAAAA-AGA----------AAAAAA---------GTACCTAATTT-GATCAATTTCAT-CAGACACATATA-AACAGAGATAGGCAACTGGAGGCAAAATTTTGTCTAAATT---TCAGGTGGCA-----CAT--T--TT-GC----GT--TT-TC--T-----A--
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gi|101716                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TAAATA---ACAAATAGCA-----CGTGCT--TTACCCATATT--TT-AC--TCAATCA--GTT---------GT---T---T-AAA-CTTATTT----A-TTTTACTTCGATTGTGAAACAA-GTTCTTACAACTTA-GACAAATCACGCTCGAA--GTCTTCCTGGGTAGAACCAATA--------CAAAGTCTA------T--GCG-G-AAA---AA-GTGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGCCGTGGCGGAGGATCGA---ACACACTACCCTCCGATCAT-GGATTCGGTGCTCTACCACA----AGACCACGCG
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gi|101727                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   TGGCA-----AAT--TCCTTGACA---TT--TTGTC--C-----ATGGTT-A----A--GT---T---T-AAA-CTTATTA----A-TTTTACTTTGAGTGTGAAACAA-GTTCTTACAACTGA-GGCAAATCACGCCCGAA--GTCTTCCAAGTTAGAACCAGTA--------CTAAGCATA------T--GCG-G-AAA---A---TGTCTTGCTC---AAGG--ACACCACACATAGCCGTGGCGGATGATCGA---ACACACGACCCTCCGATCAT-GATTTCAGTGCTTTACCAAT----GGACCACGCG
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