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lowQualScore                  :                                                                   . .      .  .                . ..............         .      .            .  . ..  .....        ........  ........................................................     ............ .  .  .                  ........          ........    .           . 
lowQualScore                  :                                                                   4 6      7  1                1 22222222222222         1      9            1  8 55  88888        88888888  99999999999999999999999999999999999999999999999999999999     444444444444 6  1  6                  00000000          66666666    5           7 
consensus                     :                                                                AAGCTNGAAGTT-CC-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTA---GC-GA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
Reference ( gi|42067 )        :                                                                AAGCTTGAAGTT-CC-TCTCACATTTATTAACATAT---A---CA--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------TNNNNNNNNNNA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42064                      :                                                                AAGCTTGAAGTT-CC-TCTCACATTTATTAACATAT---A---CA--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-A--CA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42061                      :                                                                AAGCTTGAAGTT-CC-TCTCACATTTATTAACATAT---A---CA--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-ttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaaagtt
gi|42061                      :        aagcttagtttcctgtcacatttattaacatgtacaactgcaattttaaacagtcaAAGCTT--AGTTTCC-TGTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CAATTTTAAACAGTCAAAGCTT-G--AA--GT-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA-A-------------------CATAT------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGT
gi|42060                      :                                                                AAGCTTGAAGTT-CC-TCTCACATTTATTAACATAT---A---CA--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-
gi|42060                      :       aagctagagtttcctgtcacatttattaacatgtacaactgcaattttaaacagtcaAAGCTAGAGTTT-CC-TGTCACATTTATTA---------A---CA--TGTACAACTG-CAATTTTAAACAGTCAAAGCTT-G--AA--GT-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA-A-------------------CATAT------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGT
gi|42046                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTGAACAGTCAAAG-TT-A--GAGGT--TCCCCTCA--------CA-------------------------T
gi|42054                      :                                                                AAGCTAGAACTT-CC-TTTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAAC------AG-TC-A--AA------------------------------------------------------GCTAGA-------------------GGTT---------------CC-TG-TCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCtgattaacatgtagaactgcatgttcaaacagtcagagct
gi|42063                      :                                                                AAGCTAGAGATT-CC-TCTCACATTTATTAACTTG---------A--T---CAACTG-CATGTTCAAACGGTCAAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42062                      :                                                                AAGCTAGAGATT-CC-TCTCACATTTATTAACTTG---------A--T---CAACTG-CATGTTCAAACGGTCAAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaaagct
gi|42050                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTCAAAG-CT-A--GAGGT--TCCTGTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaaagct
gi|42049                      :                                                                AAGCTAGAGGTT-CC-TGTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAATAGTCAAAG-ttattaacatgtacaactgcatgtttaaattgtcaaagct
gi|42049                      :        aagttaaatatcctctcacatttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaAAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTCAAAG-CT-A--GAGGT--TCCTGTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA----------------------ACATGTA-CAAC-----------------TGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42065                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CA-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42066                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CA-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCT--------CA-------------------------Tttattaacgtatacaactgcaggataaaac
gi|42056                      :                                                                AAGCTAGAGGTT-CT-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AG-AA--CT-TCCTTTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA----------------------ACATGTA-CAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCttattaacgtatacaactgcaggataaaac
gi|42055                      :                                                                AAGCTAGAGGTT-CT-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AG-AA--CT-TCCTTTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA----------------------ACATGTA-CAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42071                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTAT-AA--------A---CG--TGTACAATTG-TATGTTTAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42070                      : agctgattaccgtctcacatnnnnnnnnnnattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaAAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTAT-AA--------A---CG--TGTACAATTG-TATGTTTAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42045                      : agctgattaccgtctcacatnnnnnnnnnnattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaAAGCTAGAGGTT-CC-CCTCACATTTATTA---------A---CG--TGTACAACTG-CATGTTTAAACAGTAAAAG-CT-
gi|42044                      :        aagttaaatatcctctcacatttataaacgtgtacaattgtatgtttaaacagtcaAAGCTAGAGGTT-CC-CCTCACATTTATTA---------A---CG--TGTACAACTG-CATGTTTAAACAGTAAAAG-CT-
gi|42052                      :        aagttaaatatcctctcacatttataaacgtgtacaattgtatgtttaaacagtcaAAGCTAGAACTT-CC-TTTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AGGGG--T--TCCCCTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA----------------------ACATGTA-CAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42053                      :                                                                AAGCTAGAACTT-CC-TTTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AGGGG--T--TCCCCTCA--------CA-------------------------T
gi|42048                      :                                                                AAGCTAGTGGTT-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-ttattaacatgtacaactgcatgttcaatcagtcaaagct
gi|42058                      :          aagttaaatattctctcatttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaAAGTTAGAGGTT-CC-CCTCACATTGATTAACAT--------------GTAGAACTG-CATGT--------TCAAA-------------------------------CA-------------------------GTCAGAGCTAGA-------------------GGTT---------------CT-TC-TCACATTGATTAACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGT
gi|42047                      :                                                                AAGCTAGAGGTT-CC-CCTCACATTGATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42081                      :          aagttaaatattctctcatttattaacgtgtacaactgcatgttttaacagtcaAAGCTAGAGGTT-CC-TCTCACATTGATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42057                      :                  tcccctcacatttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaAAGGTAGAGGTT-CT-CCTCACATTTATTAA--------A----G--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AG-AA--CT-TCCTTTCA--------CA-------------------------T
gi|42059                      :                                                                AAGTTAGAGGCT-CC-CCTCACAATGATTAACAT--------------GTAGAACTG-CATGT--------TCAAA---C-A--A-----------TCA---------------------------------------GAGCTAGA-------------------GGTT---------------CA-TC-TCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaaagct
gi|42084                      :                                                                AAGCTAGGGGTT-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42082                      :                  tcccctcacatttattaacatgtacaactgcatgttcaatcagtcaAAGCTAGTGGTT-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-
gi|42068                      :                  tcccctcacatttattaacatgtacaactgcatgttcaaacagtcaAAG-TTAAATAT-CC-TCTCACATTTATTAACGTA--------------TACAACTG-CAGGATAAAACGCTTCCAG-CTGG--AG--CC-TCGTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42069                      :                                                                AAG-TTAAATAT-CC-TCTCTCATTTATTAACGTA--------------TACAACTG-CAGGATAAAACGCTTCCAG-CTGG--AG--CG-TCGTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42097                      :                                                                AAGCT-GGAGTA-CCGTCTCACATTTATTAACGTGT---A---TAACTATATAACCG-TAGGTTTAAACA
gi|42072                      :                      tctcacatttattaacgtgtataactgtaggtttaaacacttcAGCT-GAACTA-CCGTCTCACATTTGTTAACGT--------------GTATAACTG-TAGGT---------------TT-A--AA------CTTTTC---------CA--------------------------------GCTGA-------------------AGT--------A-----C-CG-TC-TCACATTTGTTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42101                      :                                                                 AGCT-GAAGCA-CCGTCTCACATTTATTA---------A---CG--TGTATAACTG-TAGGTTTAAAC
gi|42077                      :                                   aactatataaccgtaggtttaaacacatccAGCT-GAACTA-CCGTCTCACATTTGTTA---------A---CG--TGTATAACTG-TAGGTTTAAAC
gi|42073                      :              aagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactgtaggtttaaactttccAGCTTGA-GTT-CCGTCTCACATTTATAAACGTGT---A---TAACTGTATAACTGTCA-GTTTAAACA
gi|42079                      : agctgattaccgtctcacattaattaacgtgtagaactgtataaatgtagatttaaacactgccAGCT-GGAGCA-CCGTCTCACATTTATTAACGTGT---A---TAACTATATAACTA-TAGGTTTAAACA
gi|42078                      :        aagtactgtctcacatttattaacgtgaataactgtatannnnnnnnnnacacttccAGCT-GGAGCA-CCGTCTCACATTTATTAACGTGT---A---TAACTATATAACTA-TAGGTTTAAACA
gi|42100                      :        aagtactgtctcacatttattaacgtgaataactgtatannnnnnnnnnacacttccAGCT-GGAGTA-CTGTCTCACACTTATTAACGTGTATAA---CA--TA-ATAACTG-TATGTTTGAACA
gi|42074                      :             tctcacatttattaacgtgtataactatataactataggtttaaacacttccAGCT-GGAGTT-CCGTCTCACATTTATAATCGTGT---A---TAACTGTATAACTGTCA-GTTTAAACA
gi|42075                      :       agctgattaccgtctcacattaattaacgtgtagaactgtataactgtagatttaaacacttccAAGTA-CCGTCTCACATTTGTTAACGT--------------GTATAACTG-TAGGTTTAAACA-----------------------CTTCCA--------------------------------------GCTGGAGNN-------------------NNNNN-NN--NA-----C-CG-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGC
gi|42080                      :                                                                        AGTA-CCGTCTCACATTTATTAACGT--------------GTATAACTA-TAT-----AACCGT--AGG-TTTA--AA-----------CA--------CA-------------------------TCCAGCTG---------------------------A-AG--TA-----C-TG-TC-TCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42083                      :                                                                           T-CC-TCTCACATTGATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAAC------AG-TC-A--AA------------------------------------------------------GCTAGA-------------------GGTT---------------CC-TC-TCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGT
gi|42088                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTGATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAG-------------------------TCA--------AA-------------------------GCTNNNNNNNNN-------------------NGTT---------------CC-TC-TCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGT
gi|42051                      :                                                                           T-CC-TCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTCAAAG-TT-A--GA--GGCTCCCCTCA--------CA-------------------------
gi|42089                      :                                                                 aagttacataT-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAAC------AG-TC-A--AA-------------------------------------------------------GCTAG-------------------AGTT-------------T-CC-TG-TCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCatgattaacatgtagaactgcatgttcaaacaatcagagct
gi|42093                      :                                                                           T-CC-TCTCACATTGATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TCATCTCA--------CA-------------------------T
gi|42092                      :                                                                           T-CC-TCTCACATTGATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TCATCTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcgaagtt
gi|42086                      :                                                                           T-CC-TGTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTT---------------T-A--AA--T-----TGTCA----------------------------------------------A-------------------AGCTA-GA--GG-----T-TC-TCCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcgaagtt
gi|42085                      :                                                                           T-CC-TGTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTT---------------T-A--AA--T-----TGTCA----------------------------------------------A-------------------AGCTA-GA--GG-----T-TC-TCCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42095                      :                                                                           T-CT-TCTCACATTGATTAACGT--------------GTAAAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TTCTCTCA--------
gi|42096                      :                                                                           T-CA-TCTCACATTGATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCGAAG-TT-A--AA--TA-TTCTCTCA--------tttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtcaaagct
gi|42087                      :                                                                           T-CC-TGTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTT---------------T-A--AA--TA---------------------------------------------------GTCAA-------------------AGGTA-GA--GG-----T-TC-TCCTCACATTTATTAAAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCtttattaacgtgtacaactgcatgttttaacagtcaaagct
gi|42081                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-A--GAGGT--TCCTCTCA--------CA-------------------------TTGA-----------------------------TTA----------------------ACATGTA-CAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42084                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAATCAGTCAAAG-CT-AGGGG--T--TCCCCTCA--------CA-------------------------T
gi|42094                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-T--AG--TT-TCCTGTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42082                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACAT--------------GTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-AGTGG--T--TCCCCTCA--------CA-------------------------Tttattaacatgtacaactgcaattttaaacagtcaaagct
gi|42091                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTAAAAG-CT-A--GA--GATTCCTCTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA-A------------C----------TTGATCAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42090                      :                                                                           T-CC-CCTCACATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTAAAAG-CT-A--GA--GATTCCTCTCA--------CA-------------------------TTTA-----------------------------TTA-A------------C----------TTGATCAAC-----------------TGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGT
gi|42071                      :                                                                               -TCTCACATNNNNNNNNNNATTA-A---CG--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42070                      :                                                                   agctgattaccg-TCTCACATNNNNNNNNNNATTA-A---CG--TGTACAACTG-CATGTTCAAACAGTCAAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------Tttataaacgtgtacaattgtatgtttaaacagtcaaagct
gi|42048                      :                                                                   agctgattaccg-TCTCTCATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTAAACAGTCAAAG-CT-AGTGG--T--TCCCCTCA--------CA-------------------------Tttataaacgtgtacaattgtatgtttaaacagtcaaagct
gi|42047                      :                                                                    aagttaaatat-TCTCTCATTTATTAACGT--------------GTACAACTG-CATGTTTTAACAGTCAAAG-CT-A--GAGGT--TCCCCTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42097                      :                                                                    aagttaaatat-TCTCACATTTATTA---------A---CG--TGTATAACTG-TAGGTTTAAACACTTCAAG-CTGG--AG--TA-CCGTCTCA--------CA-------------------------Ttgattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42077                      :                                                                               -TCTCACATTTATTAACGT--------------GTATAACTG-TAGGTTTAAACTTTCCAGC-TG-A--AC--TA-CCGTCTCA--------CA-------------------------Tttattaacgtgtataactatataaccgtaggtttaaaca
gi|42076                      :                                                                       aagcaccg-TCTCACATTTATTA---------A---CG--TGTATAACTG-TAGGTTTAAACNNNNNNNN-NNGA--AG--CA-CCGTCTCA--------CA-------------------------Tttgttaacgtgtataactgtaggtttaaac
gi|42073                      :                                                                       aagcaccg-TCTCACATTAATTAACGT--------------GTAGAACTG-TAT----AAAT-GT-AGAT-TT-A--AA-----------CA--------C----------------------------TGCCAGCTTG-------------------AGTT---------------CCGTC-TCACATTTATAAACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACAttattaacgtgtataactgtaggtttaaac
gi|42099                      :                                                                   agctgattaccg-TCTCACACTTATTAACGTGT---ATAACA--TA-ATAACTG-TATGTTTGAACACTTCTAG-CT-G--AT--TA-CCGTCTCA--------CA-------------------------T
gi|42098                      :                                                                               -TCTCACATTTATTAACGTGT---A---TAACTATATAACTA-TAGGTTTAAACACTTCCAG-CT-G--AT--TA-CCGTCTCA--------CA-------------------------Ttaattaacgtgtagaactgtat
gi|42100                      :                                                                               -TCTCACATTTATTAACGT--------------GTATAACTA-TAT-----AACTAT--AGG-TT-T--AA------------A--------CA-------------------------CTTCCAGCTGGA-------------------G---------TA-----C-TG-TC-TCACACTTATTAACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACAtaattaacgtgtagaactgtat
gi|42074                      :                                                                               -TCTCACATTAATTAACGT--------------GTAGAACTG-TAT-----AACTGT-AGAT-TT-A--AA--CA---CTTCCA------------------------------------------GCTGG-------------------AGTT---------------CCGTC-TCACATTTATAATCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42046                      :                                                                                                                              agctgattaccgAAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CATTTATTAACGTGTACAACTGCATGTTTGAACAGTCAA-------------------AGTTA-GA--GG-----TTCC-CC-TCACATTGATTAACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGC
gi|42050                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTATTAACGTGTACAACTGCATGTTTAAACAGTCA-AAGCTAGAGGTT-CC-TG-TCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGC
gi|42051                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--CA--TA-TCCTCTCA--------CATTTATTAACGTGTACAACTGCATGTTTAAACAGTCAA-------------------AGTTA-GA--GGC----T-CC-CC-TCACAATGATTAACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGC
gi|42065                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TCATCTCA--------CATTTATTAACGTGTACAACTGCATGTTCAAACAGTCGA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCA
gi|42066                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TCATCTCA--------CATTTATTAACGTGTACAACTGCATGTTCAAACAGTCGA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCTCATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCAggataaaac
gi|42045                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTATAAACGTGTACAATTGTATGTTTAAACAGTCA-AAGCTAGAGGTT-CC-CC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCggataaaac
gi|42044                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TCCTCTCA--------CA-------------------------TTTATAAACGTGTACAATTGTATGTTTAAACAGTCA-AAGCTAGAGGTT-CC-CC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGC
gi|42048                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TTCTCTCATTTATTAACG-------------------------TGTACAACTGCATGTTTAAAC----------AGTCA-AAGCTAGTGGTT-CC-CC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42047                      :                                                                                                                                          AAG-TT-A--AA--TA-TTCTCTCATTTATTAACG-------------------------TGTACAACTGCATGTTTTAAC----------AGTCA-AAGCTAGAGGTT-CC-CC-TCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42046                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGT
gi|42063                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCagaggttcccctcacattgattaacatgtagaactgcatgttcaaacagtcagagct
gi|42062                      :                                                                                                                                                        aagctagagattcctctcacatttattaacttgatcaactgcatgttcaaacggtcaA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42050                      :                                                                                                                                                        aagctagagattcctctcacatttattaacttgatcaactgcatgttcaaacggtcaA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42049                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCagaggttcctgtcacatttattaacatgtacaactgcatgtttaaattgtcaaagct
gi|42051                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-CA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTagaggttcctgtcacatttattaacatgtacaactgcatgtttaaatagtcaaag
gi|42065                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CA-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTagaggctcccctcacaatgattaacatgtagaactgcatgttcaaacaatcagagct
gi|42066                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CA-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTaaatatcctctcacatttattaacgtatacaactgcaggataaaac
gi|42093                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CA-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTaaatatcctctctcatttattaacgtatacaactgcaggataaaac
gi|42092                      :                                                                                                                                                                   tcctctcacattgattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcgA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CA-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGT
gi|42071                      :                                                                                                                                                                   tcctctcacattgattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcgA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATAAACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42070                      :                                                                                                                                                  agctgattaccgtctcacatnnnnnnnnnnattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATAAACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42045                      :                                                                                                                                                  agctgattaccgtctcacatnnnnnnnnnnattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATAAACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42044                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATAAACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCagaggttcccctcacatttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtaaaagct
gi|42053                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGCTAGAA--CT-----T-CC-TT-TCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCagaggttcccctcacatttattaacgtgtacaactgcatgtttaaacagtaaaagct
gi|42095                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-TC-TC-TCA--TTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCaggggttcccctcacatttattaacatgtacaactgcatgttcaatcagtcaaagct
gi|42048                      :                                                                                                                                                                   tcttctcacattgattaacgtgtaaaactgcatgttcaaacagtcgA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-TC-TC-TCA--TTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGC
gi|42096                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-TC-TC-TCA--TTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTTAACAGTCAAAGCagtggttcccctcacatttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42047                      :                                                                                                                                                                   tcatctcacattgattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcgA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-TC-TC-TCA--TTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTTAACAGTCAAAGC
gi|42057                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGCTAGAA--CT-----T-CC-TT-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCagaggttcccctcacattgattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagct
gi|42068                      :                                                                                                                                                        aaggtagaggttctcctcacatttattaaagtgtacaactgcatgttcaaacagtcaA-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCA
gi|42069                      :                                                                                                                                                                                                                 A-------------------AGTTA-AA--TA-----T-CC-TC-TCTCATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCAggataaaacgcttccagctggagcctcgtctcacat
gi|42074                      :                                                                                                                                                                                                                  -------------------AGCTG-AT--TA-----C-CG-TC-TCACATTAATTAACGTGT--------AGAACTGTAT--------ggataaaacgcttccagctggagcgtcgtctcacat
gi|42101                      :                                                                                                                                                                                                                                         A-AG--CA-----C-CG-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACaactgtagatttaaacacttccagctggagttccgtctcacatttataatcgtgtataactgtataactgtcagtttaaaca
gi|42077                      :                                                                                                                                                                                                      aactatataaccgtaggtttaaacacatccagctgA-AG--CA-----C-CG-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42076                      :                                                                                                                                                                                                                                         A-AG--CA-----C-CG-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACtttccagctgaactaccgtctcacatttgttaacgtgtataactgtaggtttaaac
gi|42079                      :                                                                                                                                                                                aagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactgtaggtttaaacnnnnnnnnnngA-AG--TA-----C-TG-TC-TCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42078                      :                                                                                                                                                                                                                                         A-AG--TA-----C-TG-TC-TCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------annnnnnnnnnacacttccagctggagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactatataactataggtttaaaca
gi|42064                      :                                                                                                                                                                                                                                            A--TA-----T-CC-TC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTannnnnnnnnnacacttccagctggagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactatataactataggtttaaaca
gi|42084                      :                                                                                                                                                                           aagcttgaagttcctctcacatttattaacatatacatgtacaactgcatgttcaaacagtcaaagttac-----T-CC-CC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
gi|42094                      :                                                                                                                                                                                        tcccctcacatttattaacatgtacaactgcatgttcaatcagtcaaagctaggggt-----T-CC-CC-TCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGC
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consensus                     :                                           AAGCTAGAGGTT------CC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--AA----------CACAT----A---G----AGGTT-----TCC-TCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :                                           AAGCTNGAAGTT------CC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--AAA-TATCCTCTCACATTT--AGC-G----AAGTTAAATATCC-TCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
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gi|42052                      :                                 aagttacataAAGCTAGAACTT------CC-TTTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--A------------------------G----GGGTT------CC-CCTCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
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gi|42065                      :                                                      T------CA-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCGAAG-TT--AAA-TATCCTCTCACATTT--A
gi|42065                      :                                     aagttaaataTCGAAGTTAAATATCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------AT--------ACAACTGCAGGATAAAACttaacgtatacaactgcaggataaaac
gi|42066                      : aagttaaatatcatctcacatttattaacgtgtacaactgcatgttcaaacagT------CA-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCGAAG-TT--AAA-TATCCT--------------------------------C-TCTCA--TTTATTAACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      :                                 aagttaaataAAGCTTGAAGTT------CC-TCTCACATTT--------ATTAACATATACATGT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-TT--AAA-TATCCTCTCACATNN--NNN-NNNNNAAGTTAAATATCC-TCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                                                                                                                                                                   ----AAGTTAAATATCC-TCTCACATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42068                      :                                                      T------CC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------AT--------ACAACTGCAGGATAAAACGCTTCCAG-CTG-GAG-CCTCGTCTCACATgcttccagctggagcctcgtctcacat
gi|42069                      :                                                                                                                                                         aagttaaata----AAGTTAAATATCC-TCTCTCATTTATTAACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42069                      :                                                      T------CC-TCTCTCATTT--------ATTAACGT------AT--------ACAACTGCAGGATAAAACGCTTCCAG-CTG-GAG-CGTCGTCTCACATgcttccagctggagcgtcgtctcacat
gi|42070                      :                                                     aagttaaata-TCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-TT--AAA-TATCCTCTCACATTT--A------------TAA---------------------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42071                      :                                                   agctgattaccg-TCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-TT--AAA-TATCCTCTCACATTT--A------------TAA---------------------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :                                agctgattaccgAGCT-GAACTA------CCGTCTCACATTT--------GTTAACGT------GT--------ATAACTGTAGGTTTAAAC-------------------TTTTC-------C--AGCTG----AAG-----TACCG-TCTCACATTTGTTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :                                                                                                                                                                        AGCTGATTACCG-TCTCACATTAATTAACGTGT--------AGAACTGTATAAATGTAGATTTAAACA
gi|42073                      :                                                               -TCTCACATTA--------ATTAACGT------GT--------AGAACTGTAT----AAAT-GT-AGAT-TT--AAA-CA--CTGCC--------AGC---------TTGAGT-TCCGTCTCACATTTATAAACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACActgccagcttgagttccgtctcacatttataaacgtgtataactgtataactgtcagtttaaaca
gi|42074                      :                                                                                                                                                            agctgattaccgAGCTGATTACCG-TCTCACATTAATTAACGTGT--------AGAACTGTATAACTGTAGATTTAAACA
gi|42074                      :                                                               -TCTCACATTA--------ATTAACGT------GT--------AGAACTGTAT-----AACTGT-AGAT-TT--AAA---------CACTTCC--AGCTG----GAGT------TCCGTCTCACATTTATAATCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACActtccagctggagttccgtctcacatttataatcgtgtataactgtataactgtcagtttaaaca
gi|42075                      :                                      agctgattaccgAAGTA------CCGTCTCACATTT--------GTTAACGT------GT--------ATAACTGTAGGTTTAAACA-------------------CTTC---CAGCT--GGA-G----NNNNNNNNNNACCGTCTCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                                                               -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAGGTTTAAACNNNNNNNN-NNG-AAG-CACCGTCTCACATTT--A-----------TTA----------------------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                                                       aagcaccg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAGGTTTAAACTTTC-CAG-CT--GAACTACCGTCTCACATTT-------------GTT----------------------AACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                                                                                                                                                                    aagcaccgAAGTACTG-TCTCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42078                      :                                                               -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GA--------ATAACTGTAT----------------------AN-NNNNNNNNNACACTTCCAGCTG----GAG-----CACCG-TCTCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACAannnnnnnnnnacacttccagctggagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactatataactataggtttaaaca
gi|42079                      :                                                                                                                                                                    aagtactgAAGTACTG-TCTCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42079                      :                                                               -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GA--------ATAACTGTAT----------------------AN-NNNNNNNNNACACTTCCAGCTG----GAG-----CACCG-TCTCACATTTATTAACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACAannnnnnnnnnacacttccagctggagcaccgtctcacatttattaacgtgtataactatataactataggtttaaaca
gi|42080                      :                                           aagtactgAGTA------CCGTCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTATAT-----AACCGT--AGGTTT--AAA---------CACATCC--AGCTG----AAG-----TACTG-TCTCACATTTATTAACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :                                                      T------CC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--A------------------------G----AGGT------TCC-TCTCACATTGATTAACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                                                      T------CC-CCTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-C---------------------T--AGT-G------GTT------CC-CCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                                                      T------CC-TCTCACATTG--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--A------------------------G----AGGT------TCC-TCTCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                                                      T------CC-CCTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTCAATCAGTCAAAG-CT--A------------------------G----GGGTT------CC-CCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                                                      T------CC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTTAAATTGTCAAAG-CT--A------------------------G----AGGT------TCT-CCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                                                      T------CC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCATGTTTAAATTGTCAAAG-CT--A------------------------G----AGGT------TCT-CCTCACATTTATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
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gi|42088                      :                                                      T------CC-CCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT-----------------NNNN--NNN-N----NNGT------TCC-TCTCACATTGATTAACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42089                      :                                                      T------CC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCATGTTCAAACAGTCAAAG-CT--A-----------------------------GAGTT-----TCC-TGTCACATTTATTAACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
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Alignments
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consensus                     :           AAGCTAGAGGTTCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--A--------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :           AAGCTAGAGGTTCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--AA---------CACAT--------A---GAGGTT-----TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42044                      :                      TCC-TCTCACATTT--------ATAAACGT------GT--------ACAATTGTAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGCT--A---------------------------GAGGTT-----CCC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42045                      :            aagttaaataTCC-TCTCACATTT--------ATAAACGT------GT--------ACAATTGTAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGCT--A---------------------------GAGGTT-----CCC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42046                      :            aagttaaataTCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTGAACA-GTCAAAGT------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-CCTCACATTGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGCT
gi|42047                      : aagttaaataAAGTTAAATATTC--TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTTAACA-GTCAAAGCT--A---------------------------GAGGTT-----CCC--CTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42048                      :           AAGTTAAATATTC--TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGCT--A---------------------------GTGGTT-----CCC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42049                      :                      TCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42050                      :            aagttaaataTCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42051                      :            aagttaaataTCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGT------------------T--------A---GAGG-C-----TCC-CCTCACAATGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGCT
gi|42052                      : aagttacataAAGCTAGAACTTCC-TTTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GGGG-T-----TCC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42053                      :           AAGCTAGAACTTCC-TTTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GGGG-T-----TCC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAATCAGTCAAAGCT
gi|42054                      :           AAGCTAGAACTTCC-TTTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42055                      :           AAGCTAGAGGTTCT-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--AG---------AAC-------------------T-----TCC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42056                      :           AAGCTAGAGGTTCT-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--AG---------AAC-------------------T-----TCC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42057                      :           AAGGTAGAGGTTCT-CCTCACATTT--------ATTAAAGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--AG---------AAC-------------------T-----TCC-TTTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42058                      :           AAGTTAGAGGTTCC-CCTCACATTG--------ATTAACAT------GT--------AGAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAGAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCT-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42059                      :           AAGTTAGAGGCTCC-CCTCACAATG--------ATTAACAT------GT--------AGAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-ATCAGAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCA-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42060                      :           AAGCTAGAGTTTCC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAA--------T--------TTTAAACA-GTCAAAGCT-----------------T--------G---AAG--T-----TCC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42061                      :           AAGCT-TAGTTTCC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAA--------T--------TTTAAACA-GTCAAAGCT-----------------T--------G---AAG--T-----TCC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42062                      :           AAGCTAGAGATTCC-TCTCACATTT--------ATTAACTT------GA--------TCAACTGCAT--------G--------TTCAAACG-GTCAAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42063                      :           AAGCTAGAGATTCC-TCTCACATTT--------ATTAACTT------GA--------TCAACTGCAT--------G--------TTCAAACG-GTCAAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42064                      :           AAGCTTGAAGTTCC-TCTCACATTT--------ATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGTT--A------------CAT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTT
gi|42065                      :                      TCA-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42066                      :            aagttaaataTCA-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCTCATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      : aagttaaataAAGCTTGAAGTTCC-TCTCACATTT--------ATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGTT--AAATATCCTCTCACATNNNNNNNNN---NAAGTTAAATATCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                      TCC-TCTCACATTT--------ATTAACGT------AT--------ACAACTGCAG--------G--------ATAAAACG-CTTCCAGCT------------------------------GGAGCC-----TCG-TCTCACAT
gi|42069                      :            aagttaaataTCC-TCTCTCATTT--------ATTAACGT------AT--------ACAACTGCAG--------G--------ATAAAAC
gi|42070                      :               aagttaaata-TCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCTgcttccagctggagcgtcgtctcacat
gi|42071                      :             agctgattaccg-TCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :             agctgattaccg-TCTCACATTT--------GTTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAACT-TTTCCAGCT------------------------------GAAGTA-----CCG-TCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :            agctgaactaccg-TCTCACATTA--------ATTAACGT------GT--------AGAACTGTAT--------AAATGTAGATTTAAACA-CT----GCC--AG---------C---T--------T---GAG--T-----TCCGTCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42074                      :             agctgattaccg-TCTCACATTA--------ATTAACGT------GT--------AGAACTGTAT--------AACTGTAGATTTAAACA-CTTCCAGCT------------------------------GGAGTT-----CCG-TCTCACATTTATAA------TCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42075                      :             agctgattaccg-TCTCACATTT--------GTTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAACA-CTTCCAGCT--GG---------AGNNN--------N---NNNNNN-----ACCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                 aagtaccg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAACN-NNNNNNNNN--GA---------AGCA-------------------------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                 aagcaccg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAACT-TTC-CAGCT--GA----------AC-T--------A---------------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                 aagcaccg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GA--------ATAACTGTATANNNN---N--------NNNNNACA-CTTCCAGCTGGAG---------CAC--------------------------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42079                      :                 aagtactg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GA--------ATAACTGTATANNNN---N--------NNNNNACA-CTTCCAGCTGGAG---------CAC--------------------------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42080                      :                 aagtactg-TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTATAT---------------------AACC-GT--AGGTTTAAA---------CACATCC------AGCTGAAGTA-----CTG-TCTCACATTTATTA------ACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :               agtaccgTCC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TCTCACATTGATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--A---------------------------GTGGTT-----CCC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                      TCC-TCTCACATTG--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GAGG-T-----TCC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAATCA-GTCAAAGCT--A---------------------------GGGGTT-----CCC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                      TCC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAATT-GTCAAAGCT--A---------------------------GAGGTT-----CTC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                      TCC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAATT-GTCAAAGCT--A---------------------------GAGGTT-----CTC--CTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42087                      :                      TCC-TGTCACATTT--------ATTAACAT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAATA-GTCAAAG------------------GT--------A---GAGGTT-----CTC--CTCACATTTATTA------AAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42088                      :                      TCC-CCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT--NN---------NNNNN--------N---NNG--T-----TCC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42089                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGC------------------T--------A---GA-GTT-----TCC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42090                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTAAAAGC------------------T--------A---GAGA-T-----TCC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42091                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTTAAACA-GTAAAAGC------------------T--------A---GAGA-T-----TCC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42092                      :                      TCC-TCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42093                      :                      TCC-TCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TCA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42094                      :                      TCC-CCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCAAAGCT-----------------T--------A------GTT-----TCC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42095                      :                      TCT-TCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------AAAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TTC-TCTCA--TTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42096                      :                      TCA-TCTCACATTG--------ATTAACGT------GT--------ACAACTGCAT--------G--------TTCAAACA-GTCGAAGTT--AA------------AT--------A--------------TTC-TCT--CATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTTAACAGTCAAAGCT
gi|42097                      :                         -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAACA-CTTCAAGCT------------------------------GGAGTA-----CCG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACCGTAGGTTTAAACA
gi|42098                      :                         -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTATATAACTATAGG--------TTTAAACA-CTTCCAGCT--------------------------------GATT-----ACCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42099                      :                         -TCTCACACTT--------ATTAACGT------GTATAACATAATAACTGTAT--------G--------TTTGAACA-CTTCTAGCT--------------------------------GATT-----ACCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42100                      :                         -TCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTATATAACTATAGG--------TTTAAACA-CTTCCAGCT------------------------------GGAGTA-----CTG-TCTCACACTTATTA------ACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACA
gi|42101                      :                                               AAC-T------AT--------ATAACCGTAG--------G--------TTTAAACACATCCA-GCT--GA---------AGCA-------------------------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42101                      :            AGCT-GAAGCACCGTCTCACATTT--------ATTAACGT------GT--------ATAACTGTAG--------G--------TTTAAAC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                             11111111                                               3333                                                               11111111                  
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consensus                     :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTA-AGAG----GTT------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTATAGAG----GTT------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42044                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42045                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42046                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTGAACA------GTCAAA----------------GTTA--GAG----GTT------CC-CCTCACATTGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGCT
gi|42047                      : aagttaaataAAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTTAACA------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CC-CCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42048                      :           AAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GTG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42049                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAG----GTT------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42050                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAG----GTT------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42051                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GT--TAGAG----GCT------CC-CCTCACAATGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGCT
gi|42052                      : aagttacataAAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGGG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42053                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGGG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAATCAGTCAAAGCT
gi|42054                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAG----GTT------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42055                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAA----CTT------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42056                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAA----CTT------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42057                      :           AAGGTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAAAGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GC--TAGAA----CTT------CC-TTTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42058                      :           AAGTTAGAGGTTCCCCTCACATTG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAGA----------------GC--TAGAG----GTT------CT-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42059                      :           AAGTTAGAGGCTCCCCTCACAATG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------ATCAGA----------------GCTA--GAG----GTT------CA-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42060                      :           AAGCTAGAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GCT-T-GAA----GTT------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42061                      :           AAGCT-TAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA----------------GCT-T-GAA----GTT------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42062                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42063                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42064                      :           AAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GTTACATA-------T------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTT
gi|42065                      :                      TCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42066                      :            aagttaaataTCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCTCATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      : aagttaaataAAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACAGTCAAAGTTAAATATCCTCTCACATNNNNNNNNNNAA----GTTAAATATCC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA----------------GC--TGGAG----CCT------CG-TCTCACAT
gi|42069                      :            aagttaaataTCCTCTCTCATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA----------------GC--TGGAG----CGT------CG-TCTCACAT
gi|42070                      :               aagttaaataTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42071                      :             agctgattaccgTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GTTAAATA-------T------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTTCCA----------------GCT---GAA----GTA------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :            agctgaactaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTAT--------AAATGTAGATTTAAACACT----GCCA------------------GCT-T-GAG-----TT------CCGTCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42074                      :             agctgattaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTATAACTGTAGA--------TTTAAACA------CTTCCA----------------GCT---GGA----GTT------CCGTCTCACATTTATAA------TCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42075                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCCA----------------GCTGGAGNN----NNNNNNNNACCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                 aagtaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAAC---------NNNN----------------NNNNNNGAA----GCA------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTC-CA----------------GCT---GAA----CTA------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA----------------GCTG--GAG----CAC------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42079                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA----------------GCTG--GAG----CAC------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42080                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACCGTAGG--------TTTAAACAC-----ATC-CA----------------GCT---GAA----GTA------CTGTCTCACATTTATTA------ACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :               agtaccgTCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CC-TCTCACATTGATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GTG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAATCA------GTCAAA----------------GCTA--GGG----GTT------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA----------------GCTA--GAG----GTT------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42087                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATA------GTCAAA----------------G--GTAGAG----GTT------CT-CCTCACATTTATTA------AAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42088                      :                      TCCCCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA----------------GCTNNNNNNNNNNGTT------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
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gi|42097                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCAA----------------GCT---GGA----GTA------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACCGTAGGTTTAAACA
gi|42098                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA----------------GCT-----G----ATTA-----CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42099                      :                         TCTCACACTT--------ATTAACGT------GTATAACATAATAACTGTAT--------G--------TTTGAACA------CTTCTA----------------GCT-----G----ATTA-----CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42100                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA----------------GCT---GGA----GTA------CTGTCTCACACTTATTA------ACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACA
gi|42101                      :                                              AAC-T------ATATAAC--------CGTAG--------G--------TTTAAACAC-----ATCCA-----------------GCT---GAA----GCA------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC





Alignments
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consensus                     :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42044                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42045                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42046                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTGAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGCT
gi|42047                      : aagttaaataAAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTTAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42048                      :           AAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42049                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42050                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42051                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GC-T--------CC-CCTCACAATGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGCT
gi|42052                      : aagttacataAAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42053                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAATCAGTCAAAGCT
gi|42054                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42055                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42056                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42057                      :           AAGGTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAAAGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42058                      :           AAGTTAGAGGTTCCCCTCACATTG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAGA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CT-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42059                      :           AAGTTAGAGGCTCCCCTCACAATG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------ATCAGA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CA-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42060                      :           AAGCTAGAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42061                      :           AAGCT-TAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42062                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42063                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42064                      :           AAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTACAT-A---------T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTT
gi|42065                      :                      TCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42066                      :            aagttaaataTCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCTCATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      : aagttaaataAAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACAGTCAAAGTTAAATATCCTCTCACATNNNNNNNN-NN-AA-----GT-TAAATAT--CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CC-T--------CG-TCTCACAT
gi|42069                      :            aagttaaataTCCTCTCTCATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CG-T--------CG-TCTCACAT
gi|42070                      :               aagttaaataTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42071                      :             agctgattaccgTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTTCCA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :            agctgaactaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTAT--------AAATGTAGATTTAAACACT----GCCA-------------------GCTT--G-AG------T-T--------CCGTCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42074                      :             agctgattaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTATAACTGTAGA--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-T--------CCGTCTCACATTTATAA------TCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42075                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----NN-NNNNNNNNACCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                 aagtaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAAC--------NNNNN-----------------NNNN-NG-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTC-CA-----------------GCT---G-AA-----CT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42079                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42080                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACCGTAGG--------TTTAAACAC-----ATC-CA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CTGTCTCACATTTATTA------ACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :               agtaccgTCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAATCA------GTCAAA-----------------GCTA-GG--G-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42087                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATA------GTCAAA-----------------GGTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------AAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42088                      :                      TCCCCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTN-NN-NNNNNNNGT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42089                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42090                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42091                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42092                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42093                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42094                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT---T-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42095                      :                      TCTTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTAAAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A--AT-----AT-T--------C--TCTCA--TTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
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gi|42097                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCAA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACCGTAGGTTTAAACA
gi|42098                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42099                      :                         TCTCACACTT--------ATTAACGT------GTATAACATAATAACTGTAT--------G--------TTTGAACA------CTTCTA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42100                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CTGTCTCACACTTATTA------ACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACA
gi|42101                      :                                              AAC-T------ATATAAC--------CGTAG--------G--------TTTAAACAC-----ATCCA------------------GCT---G-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC





Alignments
lowQualScore                  :                                                                             11111111                                                 22222                                                                  11111111                  
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consensus                     :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42044                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42045                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42046                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTGAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGCT
gi|42047                      : aagttaaataAAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTTAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42048                      :           AAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42049                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42050                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42051                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GC-T--------CC-CCTCACAATGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGCT
gi|42052                      : aagttacataAAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42053                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAATCAGTCAAAGCT
gi|42054                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42055                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42056                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42057                      :           AAGGTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAAAGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42058                      :           AAGTTAGAGGTTCCCCTCACATTG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAGA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CT-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42059                      :           AAGTTAGAGGCTCCCCTCACAATG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------ATCAGA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CA-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42060                      :           AAGCTAGAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42061                      :           AAGCT-TAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42062                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42063                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42064                      :           AAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTACAT-A---------T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTT
gi|42065                      :                      TCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42066                      :            aagttaaataTCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCTCATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      : aagttaaataAAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACAGTCAAAGTTAAATATCCTCTCACATNNNNNNNN-NN-AA-----GT-TAAATAT--CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CC-T--------CG-TCTCACAT
gi|42069                      :            aagttaaataTCCTCTCTCATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CG-T--------CG-TCTCACAT
gi|42070                      :               aagttaaataTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42071                      :             agctgattaccgTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTTCCA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :            agctgaactaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTAT--------AAATGTAGATTTAAACACT----GCCA-------------------GCTT--G-AG------T-T--------CCGTCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42074                      :             agctgattaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTATAACTGTAGA--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-T--------CCGTCTCACATTTATAA------TCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42075                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----NN-NNNNNNNNACCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                 aagtaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAAC--------NNNNN-----------------NNNN-NG-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTC-CA-----------------GCT---G-AA-----CT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42079                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42080                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACCGTAGG--------TTTAAACAC-----ATC-CA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CTGTCTCACATTTATTA------ACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :               agtaccgTCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAATCA------GTCAAA-----------------GCTA-GG--G-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42087                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATA------GTCAAA-----------------GGTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------AAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42088                      :                      TCCCCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTN-NN-NNNNNNNGT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42089                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42090                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42091                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42092                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42093                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42094                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT---T-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42095                      :                      TCTTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTAAAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A--AT-----AT-T--------C--TCTCA--TTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42096                      :                      TCATCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A--AT-----AT-T---------C-TCT--CATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTTAACAGTCAAAGCT
gi|42097                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCAA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACCGTAGGTTTAAACA
gi|42098                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42099                      :                         TCTCACACTT--------ATTAACGT------GTATAACATAATAACTGTAT--------G--------TTTGAACA------CTTCTA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42100                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CTGTCTCACACTTATTA------ACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACA
gi|42101                      :                                              AAC-T------ATATAAC--------CGTAG--------G--------TTTAAACAC-----ATCCA------------------GCT---G-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC


blockSeqs                     :                    A              NNNNNNNN        ATACAT       ATAATAAC     AACTGTAG AATGTAGA        GTCAAA      TATCCTCTCACATNNNN   ACAT  NNNNNN  A NNNNNNNA  G              ACATAT      ATAACATA          AACTGTCA
blockSeqs                     :                    C              NNNNNNNN        ATACAT       .            AACCGTAG .               CT          .                   AAAT  G       A AAATAT    G              ACATAT      .                 AACTGTCA
blockSeqs                     :                    C              .               .            .            AACTATAG .               C           .                   AAAT  G       A A         G              .           .                 AACTATAG
blockSeqs                     :                    C              .               .            .            AACTATAG .               C           .                   NNN   G       A A         G              .           .                 AACTATAG
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            ANNNN    .               .           .                   NNG   G       A .         G              .           .                 AACCGTAG
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            ANNNN    .               .           .                   AGG   G       A .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            .        .               .           .                   NNN   G       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    T              .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    T              .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    A              .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         G              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    A              .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                    G              .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   TG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   TG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AA    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AA    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AA    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AA    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   GG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   GG    A       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   TG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   GG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   GG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   GG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    G       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    T       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AG    T       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   AA    A       . .         .              .           .                 .       
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blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   G     A       . .         .              .           .                 .       
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blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   G     .       . .         .              .           .                 .       
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blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   G     .       . .         .              .           .                 .       
blockSeqs                     :                                   .               .            .            .        .               .           .                   .     .       . .         .                                                    
blockSeqs                     :                                                   .            .            .        .               .           .                   .     .       . .         .                                                    


blockSeqCons                  :           
originalCons                  :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
finalCons                     :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT





Alignments
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lowQualScore                  :                    .              ........        ......       ........     ........ ........        ......      .................   ..... ......  . ........  .              ......      ........          ........                  
lowQualScore                  :                    8              11111111        000000       55555555     44444444 55555555        333333      88888888888888888   00000 888888  1 99999999  3              111111      66666666          99999999                  
consensus                     :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
Reference ( family-418 )      :           AAGCTAGAGGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA-AG-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42044                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42045                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATAAACGT------GTACAAT--------TGTAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTAAAAGCT
gi|42046                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTGAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAGAGCT
gi|42047                      : aagttaaataAAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTTAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-CCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42048                      :           AAGTTAAATATTC-TCTCA--TTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42049                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATAGTCAAAG
gi|42050                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42051                      :            aagttaaataTCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GTT--AG-AG-----GC-T--------CC-CCTCACAATGATTA------ACATGT--------AGAACTGCAT--------GTTCAAACAATCAGAGCT
gi|42052                      : aagttacataAAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42053                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-GG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAATCAGTCAAAGCT
gi|42054                      :           AAGCTAGAACTTCCTTTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAATTGTCAAAGCT
gi|42055                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42056                      :           AAGCTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42057                      :           AAGGTAGAGGTTCTCCTCACATTT--------ATTAAAGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AA-----CT-T--------CC-TTTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42058                      :           AAGTTAGAGGTTCCCCTCACATTG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAGA-----------------GCT--AG-AG-----GT-T--------CT-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------AAAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42059                      :           AAGTTAGAGGCTCCCCTCACAATG--------ATTAACAT------GTAGAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------ATCAGA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CA-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42060                      :           AAGCTAGAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42061                      :           AAGCT-TAGTTTCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAA--------T--------TTTAAACA------GTCAAA-----------------GCT--TG-AA-----GT-T--------CC-TCTCACATTTATTAACATATACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGTT
gi|42062                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42063                      :           AAGCTAGAGATTCCTCTCACATTT--------ATTAACTT------GATCAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACG------GTCAAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42064                      :           AAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTACAT-A---------T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGTT
gi|42065                      :                      TCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCACATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42066                      :            aagttaaataTCATCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CC-TCTCTCATTTATTA------ACGTAT--------ACAACTGCAG--------GATAAAAC
gi|42067                      : aagttaaataAAGCTTGAAGTTCCTCTCACATTT--------ATTAACATATACATGTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACAGTCAAAGTTAAATATCCTCTCACATNNNNNNNN-NN-AA-----GT-TAAATAT--CC-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTGAACAGTCAAAGTT
gi|42068                      :                      TCCTCTCACATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CC-T--------CG-TCTCACAT
gi|42069                      :            aagttaaataTCCTCTCTCATTT--------ATTAACGT------ATACAAC--------TGCAG--------G--------ATAAAACG------CTTCCA-----------------GCT--GG-AG-----CG-T--------CG-TCTCACAT
gi|42070                      :               aagttaaataTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42071                      :             agctgattaccgTCTCACATNNNNNNNNNNATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GTTA-AATA---------T--------CC-TCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ACAATTGTAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42072                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTTCCA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACA
gi|42073                      :            agctgaactaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTAT--------AAATGTAGATTTAAACACT----GCCA-------------------GCTT--G-AG------T-T--------CCGTCTCACATTTATAA------ACGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42074                      :             agctgattaccgTCTCACATTA--------ATTAACGT------GTAGAAC--------TGTATAACTGTAGA--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-T--------CCGTCTCACATTTATAA------TCGTGT--------ATAACTGTATAACTGTCAGTTTAAACA
gi|42075                      :             agctgattaccgTCTCACATTT--------GTTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----NN-NNNNNNNNACCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAACACTTCAAGCT
gi|42076                      :                 aagtaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAAC--------NNNNN-----------------NNNN-NG-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42077                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACT------TTC-CA-----------------GCT---G-AA-----CT-A--------CCGTCTCACATTTGTTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC
gi|42078                      :                 aagcaccgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42079                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GAATAAC--------TGTATANNNN---N--------NNNNNACA------CTTCCA-----------------GCTG--G-AG-----CA-C--------CG-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACTATAGGTTTAAACA
gi|42080                      :                 aagtactgTCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACCGTAGG--------TTTAAACAC-----ATC-CA-----------------GCT---G-AA-----GT-A--------CTGTCTCACATTTATTA------ACGTGA--------ATAACTGTAT--------
gi|42081                      :               agtaccgTCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACATGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42082                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-TG-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42083                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42084                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAATCA------GTCAAA-----------------GCTA-GG--G-----GT-T--------CC-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42085                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42086                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATT------GTCAAA-----------------GCTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42087                      :                      TCCTGTCACATTT--------ATTAACAT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAATA------GTCAAA-----------------GGTA--G-AG-----GT-T--------CT-CCTCACATTTATTA------AAGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCAAAGCT
gi|42088                      :                      TCCCCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCTN-NN-NNNNNNNGT-T--------CC-TCTCACATTGATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42089                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT--AG-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42090                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42091                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTTAAACA------GTAAAA-----------------GCT--AG-AG-----AT-T--------CC-TCTCACATTTATTA------ACTTGA--------TCAACTGCAT--------GTTCAAACGGTCAAAGTT
gi|42092                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42093                      :                      TCCTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A---------ATAT--------CA-TCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTCAAACAGTCGAAGTT
gi|42094                      :                      TCCCCTCACATTT--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCAAA-----------------GCT---T-AG-----TT-T--------CC-TGTCACATTTATTA------ACATGT--------ACAACTGCAA--------TTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42095                      :                      TCTTCTCACATTG--------ATTAACGT------GTAAAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A--AT-----AT-T--------C--TCTCA--TTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTAAACAGTCAAAGCT
gi|42096                      :                      TCATCTCACATTG--------ATTAACGT------GTACAAC--------TGCAT--------G--------TTCAAACA------GTCGAA-----------------GTTA-A--AT-----AT-T---------C-TCT--CATTTATTA------ACGTGT--------ACAACTGCAT--------GTTTTAACAGTCAAAGCT
gi|42097                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TGTAG--------G--------TTTAAACA------CTTCAA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTATATAACCGTAGGTTTAAACA
gi|42098                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42099                      :                         TCTCACACTT--------ATTAACGT------GTATAACATAATAACTGTAT--------G--------TTTGAACA------CTTCTA-----------------GCT------G-----AT-TA-------CCGTCTCACATTAATTA------ACGTGT--------AGAACTGTAT--------
gi|42100                      :                         TCTCACATTT--------ATTAACGT------GTATAAC--------TATATAACTATAGG--------TTTAAACA------CTTCCA-----------------GCT---G-GA-----GT-A--------CTGTCTCACACTTATTA------ACGTGTATAACATAATAACTGTAT--------GTTTGAACA
gi|42101                      :                                              AAC-T------ATATAAC--------CGTAG--------G--------TTTAAACAC-----ATCCA------------------GCT---G-AA-----GC-A--------CCGTCTCACATTTATTA------ACGTGT--------ATAACTGTAG--------GTTTAAAC